#Database name Gene systematic ID FYPO ID Allele description Expression Parental strain Strain name (background) Genotype description Gene symbol Allele name Allele synonym Allele type Evidence Condition Penetrance Severity Extension Reference Taxon Date Annotation comment PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0008393 Fus1 chimera with the IDR replaced by the human Fused-in-Sarcoma low complexity region with a 12E mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-FUS(12E)-fus1(792-1372) other ECO:0001232 PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4E and F) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000044 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:27481777 4896 2016-08-04 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000044 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002244 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 6) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002488 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104,FYECO:0000332 high PMID:29319508 4896 2018-01-22 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-17 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 1B) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000082 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 medium PMID:36779416 4896 2023-03-02 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- pho7 pho7delta 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PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1271.09) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.09c) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.05) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC330.06c) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.13) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:36779416 4896 2023-03-05 non detectable Fig. 1. Phosphate starvation induces ecl3+ expression in a pho7+-dependent manner. PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36779416 4896 2023-03-05 non detectable Fig. 1. Phosphate starvation induces ecl3+ expression in a pho7+-dependent manner. PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:36779416 4896 2023-03-05 non detectable Fig. 1. Phosphate starvation induces ecl3+ expression in a pho7+-dependent manner. PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002304 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002304 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1393.10) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002304 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0003032 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.07c) PMID:23231582 4896 2021-02-03 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:39105351 4896 2024-10-01 We found that, similar to a phosphate-depleted environment (Ohtsuka et al., 2023), the expression levels in Δpho7 cells were significantly reduced under sulfur- depleted conditions (Figure 4). PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:39105351 4896 2024-10-01 We found that, similar to a phosphate-depleted environment (Ohtsuka et al., 2023), the expression levels in Δpho7 cells were significantly reduced under sulfur- depleted conditions (Figure 4). PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho7 pho7delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 3C) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001315 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0001232 PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000064 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000016,FYECO:0000332 PMID:29319508 4896 2018-01-22 An increased resistance to cell lysis induced by the presence of higher concentration of 2-deoxyglucose in the vegetative growth phase of cell PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000064 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 high PMID:36779416 4896 2023-03-02 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000064 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 high PMID:27481777 4896 2016-08-04 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000064 deletion 972 h- pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pho7 pho7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 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SPAC6F6.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC6F6.11c SPAC6F6.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F6.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6F6.11c SPAC6F6.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6F6.11c SPAC6F6.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0000705 1-1299,1852-2812 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1-HR-25-36 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:15964794 4896 2016-06-17 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 K234A,K235A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-K234A,K235A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0002134 K234A,K235A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-K234A,K235A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001407 R165A,R168A,K176E,K181E Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-R165A,R168A,K176E,K181E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001509 R165A,R168A,K176E,K181E Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-R165A,R168A,K176E,K181E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.05c) PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001098 R165A,R168A,K176E,K181E Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-R165A,R168A,K176E,K181E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 R165A,R168A,K176E,K181E Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-R165A,R168A,K176E,K181E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 R165A,R168A,K176E,K181E Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-R165A,R168A,K176E,K181E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 R165A,R168A,K176E,K181E Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-R165A,R168A,K176E,K181E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC1919.05 FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- ski3 ski3+ SPCC1919.05+ wild_type ECO:0001232 PMID:22624651 4896 2012-06-18 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SB5 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SB5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SB5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001894 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000705 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:21217703 4896 2023-02-16 An arginine substitution of Ile379 or Leu383 of Taz1 or Ile655 of SpRap1 at the center of the hydrophobic interface completely abolished the Taz1RBM-SpRap1RCT interaction (Fig. 6a). PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002702 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002907 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:21217703 4896 2023-02-16 Three mutants (Taz1 I379R, Taz1 L383R, and Rap1 I655R) with no detectable Taz1-SpRap1 interaction clearly exhibited altered mobility bands representing intra-chromosome fusions (Fig. 6e). PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001324 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0001807 high PMID:21217703 4896 2023-02-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002908 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002908 I655R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I655R amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAPB1E7.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph gde1 gde1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 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PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0002386 K5R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K4R amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 4F) PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0004237 K5R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K4R amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 1F) PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0004237 K5R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K4R amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 4D) PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0002837 K5R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K4R amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 1E) PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0003235 K5R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K4R amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 4A) PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0002389 K5R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K4R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 4B) PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001490 C814CGTTGTTTGACATTCGATCCTTCCGTCTTCGGAAGACTAACTTATTGTAGCCTCGTGTTTTGAAAAAGGCACCTTCAACTCATTCCCCCCAATTATCTGTTCCCTCAAAGACATCGACAATC Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-R25 cst1-R25 nucleotide_insertion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 C814CGTTGTTTGACATTCGATCCTTCCGTCTTCGGAAGACTAACTTATTGTAGCCTCGTGTTTTGAAAAAGGCACCTTCAACTCATTCCCCCCAATTATCTGTTCCCTCAAAGACATCGACAATC Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-R25 cst1-R25 nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002060 C814CGTTGTTTGACATTCGATCCTTCCGTCTTCGGAAGACTAACTTATTGTAGCCTCGTGTTTTGAAAAAGGCACCTTCAACTCATTCCCCCCAATTATCTGTTCCCTCAAAGACATCGACAATC Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-R25 cst1-R25 nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004745 Y451N Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451N amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005843 Y451N Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451N amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005848 Y451N Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451N amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005850 Y451N Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451N amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 Y451N Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451N amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000703 Y451N Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451N amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c),assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002561 T517A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-T517A amino_acid_mutation ECO:0001232 complete assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:21376600 4896 2024-04-09 Plo1 localization to the contractile ring was abolished in the Mid1-T517A mutant (Figures S1C and S1D; 0 of 66 mitotic T517A cells with Plo1-GFP at the contractile ring compared to 26 of 58 in control mitotic cells) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001838 T517A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-T517A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 1C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001645 T517A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-T517A amino_acid_mutation ECO:0006030 medium assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 1E) PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 E198EGRSRGRSRGTG Not assayed or wild type 972 h- uba1 ptr3-LiL amino_acid_insertion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1250.03) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 E198EGRSRGRSRGTG Not assayed or wild type 972 h- uba1 ptr3-LiL amino_acid_insertion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.04c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 E198EGRSRGRSRGTG Not assayed or wild type 972 h- uba1 ptr3-LiL amino_acid_insertion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 E198EGRSRGRSRGTG Not assayed or wild type 972 h- uba1 ptr3-LiL amino_acid_insertion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 E198EGRSRGRSRGTG Not assayed or wild type 972 h- uba1 ptr3-LiL amino_acid_insertion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 E198EGRSRGRSRGTG Not assayed or wild type 972 h- uba1 ptr3-LiL amino_acid_insertion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC211.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000705 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12),assayed_using(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002699 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001253 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000650 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000650 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000118 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002559 378-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM3 pxl1-deltaLIM3|pxl1delta3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPNCRNA.650 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.650 SPNCRNA.650+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.650 FYPO:0009025 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.650 SPNCRNA.650+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000278 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(Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC338.14) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC2F12.03c) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC1393.08) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC1795.03) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC215.05) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC688.04c) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBPB8B6.05c) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007409 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC14G10.04) PMID:34389684 4896 2022-01-13 ( . (Figs. 3-5 collectively fortify the case for seb1-G476S as a gain-of-function mutation in Seb1 that elicits precocious lncRNA termination dependent on lncRNA PAS and cleavage/polyadenylation factors.) PomBase SPAC222.09 FYPO:0000080 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC222.09 FYPO:0000080 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:34389684 4896 2022-01-13 (Figure 1C) PomBase SPAC222.09 FYPO:0000080 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 8A) PomBase SPAC222.09 FYPO:0002243 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 Pho1 expression is therefore derepressed in seb1-G476S cells (Fig. 2B). , 3B PomBase SPAC222.09 FYPO:0002243 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34389684 4896 2022-01-13 (Figure 1A) PomBase SPAC222.09 FYPO:0002243 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 8B) PomBase SPAC222.09 FYPO:0007407 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34389684 4896 2022-01-17 (Fig. 4B), Pho1 expression from the wild-type plasmid was increased sevenfold in seb1-G476S cells versus seb1-WT cells thereby echoing the derepressive effect of seb1-G476S on pho1 expression from the chromosomal prt-pho1 locus. PomBase SPAC222.09 FYPO:0006614 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:34389684 4896 2022-01-13 PomBase SPAC222.09 FYPO:0001357 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 10) PomBase SPAC222.09 FYPO:0001357 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 10) PomBase SPAC222.09 FYPO:0001234 G476S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G476S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:34389684 4896 2022-01-17 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 L532A,L533A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-LL532.533AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000703 L532A,L533A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-LL532.533AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 L532A,L533A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-LL532.533AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006108 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-972)-fus1(869-1372),with fus1_R1054E mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-fus1(FH2,R1054E)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-972)-fus1(869-1372),with fus1_R1054E mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-fus1(FH2,R1054E)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0008002 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-972)-fus1(869-1372),with fus1_R1054E mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-fus1(FH2,R1054E)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 medium PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0001740 K10A Not assayed or wild type 972 h- H3-H4x1 (hht1delta hht3delta hhf1delta hhf3delta) mat2-3delta hht2 hht2-K9A H3K9A amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0006518 K10A Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K9A H3K9A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. S2) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000611 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-3 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0003128 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-3 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001357 842-911 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-c70 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18753627 4896 2014-11-20 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001357 842-911 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-c70 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18753627 4896 2014-11-20 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001357 842-911 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-c70 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18753627 4896 2014-11-20 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000088 842-911 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-c70 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18753627 4896 2014-11-20 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0006809 1-70 Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-delta71 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph tif51 tif51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- tif51 tif51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC26H5.10c 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leu1-32 ade6-M210 win1 win1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- win1 win1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9693384 4896 2014-01-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 win1 win1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 H67R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-H67R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:9622480 4896 2015-12-01 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brr6 brr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brr6 brr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- brr6 brr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brr6 brr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0008434 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:40427588 4896 2025-06-10 Moreover, the deletion significantly reduced the association with assembled mitoribosomes and impaired mitoribosome assembly. Specifically, a distinct mitoribosome peak was observed in fraction 11 in the wild-type cells (Figure 4a) but was markedly diminished in the mti2∆insertion cells (Figure 4b), indicating a defect in mitoribosome assembly. PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000684 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:40427588 4896 2025-06-09 Compared to wild-type cells, the growth of mti2∆insertion and ∆mti2 cells was only marginally reduced in glucose media but was significantly impaired in glycerol media (Figure 2b). This result suggests that mitochondrial respiration is similarly inhibited in both mutants. PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007525 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.15c) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Notably, deletion of the insertion domain resulted in a greatly decreased associ- ation of the translation initiation factors Mti2 and Mti3 with the mtSSU. PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007525 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Notably, deletion of the insertion domain resulted in a greatly decreased associ- ation of the translation initiation factors Mti2 and Mti3 with the mtSSU. PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, including cob1 (complex III), cox1, cox2 and cox3 (complex IV) and atp6, atp8 and atp9 (ATP synthase). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.11) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.04) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.07) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.09) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.10) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.02) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.01) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001317 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.08) PMID:40427588 4896 2025-06-10 However, the RNA level of var1, which encodes a mitochondrial ribosomal protein, remained stable in both mutants (Figure 2c) PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001357 443-477 Knockdown 972 h- mti2 mti2 insertion domain deletion mti2∆insertion partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:40427588 4896 2025-06-09 Compared to wild-type cells, the growth of mti2∆insertion and ∆mti2 cells was only marginally reduced in glucose media but was significantly impaired in glycerol media (Figure 2b). This result suggests that mitochondrial respiration is similarly inhibited in both mutants. PomBase SPBC21.04 FYPO:0002282 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 med8 med8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- med8 med8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 med8 med8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 PMID:40668835 4896 2025-08-18 The aah1∆, aah2∆, and aah4∆ cells grew like wildtype at all temperatures tested, and aah3∆ cells were cold- sensitive (SI Appendix, Fig. S1). PomBase SPCC757.12 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- aah1 aah1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah1 aah1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah1 aah1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.12 FYPO:0002104 deletion 972 h- aah1 aah1delta deletion ECO:0005638 PMID:40668835 4896 2025-08-26 cells had an average length-to-width ratio of ~4.5 indicative of their rod shape (Fig. 2 A and B). PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001343 deletion 972 h- mcm4 mcm4delta deletion ECO:0005580 PMID:8631307 4896 2012-03-14 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000314 deletion 972 h- mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 PMID:8631307 4896 2012-03-14 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000839 deletion 972 h- mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 PMID:8631307 4896 2012-03-16 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcm4 mcm4delta deletion ECO:0005638 PMID:8631307 4896 2012-03-14 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0003012 deletion 972 h- mcm4 mcm4delta deletion ECO:0001232 PMID:8631307 4896 2012-06-21 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ufd2 ufd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0000470 deletion 972 h- ufd2 ufd2delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0001327 deletion 972 h- ufd2 ufd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 5) PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0001327 deletion 972 h- ufd2 ufd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_protein(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure S5) PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- ufd2 ufd2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.10 FYPO:0003824 deletion 972 h- ufd2 ufd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 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h- ski7 ski7delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAP8A3.05 FYPO:0007281 deletion 972 h- ski7 ski7delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1556.06) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAP8A3.05 FYPO:0003620 deletion 972 h- ski7 ski7delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 primarily mediated in the nucleus, as the deletion of ski7, which encodes a cytosolic-specific exosome cofactor, did not perturb rpl30-2 expression (Figure 2A, lane 9, and Figures 2B and 2C). 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PMID:29136238 4896 2018-02-12 and observed a preferential association of Swi6 with Y41F over Y41p peptide, suggesting that phosphorylation of H3Y41 counteracts the interaction of Swi6 with histone H3 (Supplementary Figure S6A). PomBase SPAC56F8.05c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mug64 mug64delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.05c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mug64 mug64delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC56F8.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mug64 mug64delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mug64 mug64delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug64 mug64delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.05c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph mug64 mug64delta deletion ECO:0005638 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Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-Y612G amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:28134253 4896 2018-01-17 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000089 Y612G Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-Y612G amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:28134253 4896 2018-01-17 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000268 Y612G Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-Y612G amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:28134253 4896 2018-01-17 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0003412 fep1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 fep1 fep1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC1105.02c FYPO:0008054 Q364R Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-Q364R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20089861 4896 2023-02-16 Indeed, the R288K and Q364R mutations in SpHCS confer diminished sensitivity to feedback inhibition by L-lysine in vitro and in vivo (Table 2 and Fig. 4) PomBase SPCC1672.07 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp21 utp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- utp21 utp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1672.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp21 utp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0005467 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2D-E) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001368 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0004097 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007828 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001760 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0006008 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 3) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0004083 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2D and F) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001903 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A and C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002253 T346E,S367E,T384E,S397E,S402E,T426E,S451E,T467E,S490E,S511E,T531E Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S3B-C) PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0001407 C470S Overexpression 972 h- pyp1 pyp1-C470S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0000012 C470S Overexpression 972 h- pyp1 pyp1-C470S amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:7501024 4896 2014-01-09 PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0001492 C470S Overexpression 972 h- pyp1 pyp1-C470S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001357 1-62 Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-(63-488) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 8) PomBase SPAC3A12.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- vps53 vps53delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A12.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps53 vps53delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A12.15 FYPO:0002451 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps53 vps53delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC405.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC405.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC405.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC405.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC405.03c SPBC405.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 M13R Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-M13R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22437499 4896 2024-11-28 This mutation dissociated Mad3 from a Cdc20-C-Mad2 heterodimer when size-exclusion chromatography was performed (Supplementary Fig. 4). PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 M13R Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-M13R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC821.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22437499 4896 2024-11-28 This mutation dissociated Mad3 from a Cdc20-C-Mad2 heterodimer when size-exclusion chromatography was performed (Supplementary Fig. 4). PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000921 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005801 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0004131 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005801 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0001537 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0000335 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0001164 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0001164 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:15796926 4896 2014-08-06 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0001409 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0004132 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005801 PMID:20085751 4896 2014-12-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0002692 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0001457 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- grx2 grx2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grx2 grx2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grx2 grx2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007178 69-81 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES1 deltaNES1-mid1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10930468 4896 2023-03-02 DNES1-mid1p had a clear defect in nuclear export- in contrast to wild-type mid1p, which exits the nucleus during mitosis, it remained in the nucleus throughout the cell cycle, although some faint rings were occasionally seen (Figure 6, A-B). PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001920 69-81 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES1 deltaNES1-mid1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10930468 4896 2023-03-02 DNES1-mid1p had a clear defect in nuclear export- in contrast to wild-type mid1p, which exits the nucleus during mitosis, it remained in the nucleus throughout the cell cycle, although some faint rings were occasionally seen (Figure 6, A-B). PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004293 69-81 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES1 deltaNES1-mid1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 20.5 PMID:10930468 4896 2023-03-02 DNES1-mid1p had a clear defect in nuclear export- in contrast to wild-type mid1p, which exits the nucleus during mitosis, it remained in the nucleus throughout the cell cycle, although some faint rings were occasionally seen (Figure 6, A-B). PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000705 195-336 Not assayed or wild type 972 h- scm3 scm3(1-194) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0005660 deletion 972 h- sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 3C, Table S4) PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0002485 deletion 972 h- sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 3B, Table S4) PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0003179 deletion 972 h- sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 3A, Table S4) PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0004993 deletion 972 h- sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 3D, Table S4) PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sws1 sws1delta sws1-23 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r2-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29) rpb1-CTD-S5.S5A|rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2)|rpb1-S5-S5A(1-29)|rpb1-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 3B) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r2-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29) rpb1-CTD-S5.S5A|rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2)|rpb1-S5-S5A(1-29)|rpb1-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 7B) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001357 CTD-S5A(r2-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29) rpb1-CTD-S5.S5A|rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2)|rpb1-S5-S5A(1-29)|rpb1-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 7A) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-M51 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-M51 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-M51 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-M51 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0001983 784-885 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtH partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) but failed to detect fragment B, D, E, H, J or K. PomBase SPAC1705.03c FYPO:0006836 784-885 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtH partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPBC1289.06c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ppr8 ppr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.06c FYPO:0000251 deletion 972 h- ppr8 ppr8delta deletion ECO:0005638 PMID:21727087 4896 2011-08-03 PomBase SPBC1289.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ppr8 ppr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1289.06c FYPO:0000442 deletion 972 h- ppr8 ppr8delta deletion ECO:0005638 PMID:21727087 4896 2011-08-23 PomBase SPBC1289.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ppr8 ppr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.06c FYPO:0001621 deletion 972 h- ppr8 ppr8delta deletion ECO:0000335 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ppa2-D (Table 2). PomBase SPAC1782.05 FYPO:0000648 deletion 972 h- ypa2 ypa2delta ypa2-delta deletion ECO:0001232 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Figure 4b) PomBase SPAC1782.05 FYPO:0004103 deletion 972 h- ypa2 ypa2delta ypa2-delta deletion ECO:0001232 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Figure 4b) PomBase SPAC1782.05 FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypa2 ypa2delta ypa2-delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1782.05 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ypa2 ypa2delta ypa2-delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1782.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- ypa2 ypa2delta ypa2-delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1782.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypa2 ypa2delta ypa2-delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 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PomBase SPBC2G2.01c FYPO:0001739 wild type Overexpression 972 h- liz1 liz1+ wild_type ECO:0000335 PMID:15075270 4896 2012-12-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0000082 R401A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R401A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002060 R401A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R401A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0001117 231 nt promoter and transcription start site deletion Null 972 h- prt2 prt2delta-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0002243 231 nt promoter and transcription start site deletion Null 972 h- prt2 prt2delta-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0000825 231 nt promoter and transcription start site deletion Null 972 h- prt2 prt2delta-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0000825 231 nt promoter and transcription start site deletion Null 972 h- prt2 prt2delta-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0003338 wild type Overexpression 972 h- ain1 ain1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002023 wild type Overexpression 972 h- ain1 ain1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002027 wild type Overexpression 972 h- ain1 ain1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001390 wild type Overexpression 972 h- ain1 ain1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 medium 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2017-03-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 D152N Overexpression 972 h- cdc2 cdc2-D152N cdc2-N152 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:7593289 4896 2017-03-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 D152N Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152N cdc2-N152 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 Table 1 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 D152N Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152N cdc2-N152 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8437586 4896 2018-04-03 Table 1 PomBase SPCC757.04 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPCC757.04 SPCC757.04+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC211.04c FYPO:0001424 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0000059 low PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S9B) PomBase SPBC211.04c FYPO:0000455 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:18180284 4896 2015-11-27 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000972 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000786 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-16 PomBase SPBC211.04c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11973289 4896 2015-06-15 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000783 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-268 mcm6-268 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000783 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 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972 h- nc-pho1 prt-5delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 No change in pho1 expression could be detected for either prt-4Δ or prt-5Δ (Figure 3B, lanes 5 and 6). 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assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- rrp41 rrp41+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- rrp41 rrp41+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- rrp41 rrp41+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC1442.14c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0001234 wild type Knockdown 972 h- rrp41 rrp41+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000106 high PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC947.14c FYPO:0003730 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000148 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1A) PomBase SPBC947.14c FYPO:0006978 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0000335 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPBC947.14c FYPO:0003915 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 2C) Thus, virtually all of the Cytb protein synthesized in the Δcbp6 mutant is degraded PomBase SPBC947.14c FYPO:0007623 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0000059 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1B) PomBase SPBC947.14c FYPO:0007623 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0000059 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 2D) In both Δcbp6 and control Δcytb mitochondria, complex III was completely lacking (lanes 3 and 4) PomBase SPBC947.14c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC947.14c FYPO:0001437 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1A) PomBase SPBC947.14c FYPO:0004960 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 2A) Both the cytb and cox2 mRNAs were present at normal levels in the Δcbp6 mutant PomBase SPBC947.14c FYPO:0004960 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 2A) Both the cytb and cox2 mRNAs were present at normal levels in the Δcbp6 mutant PomBase SPBC947.14c FYPO:0004529 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1C) PomBase SPBC947.14c FYPO:0004529 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1C) PomBase SPBC947.14c FYPO:0004529 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1C) PomBase SPBC947.14c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.14c FYPO:0004325 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPBC947.14c FYPO:0000102 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC947.14c FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC947.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC947.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC947.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp6 cbp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000446 G57E 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1538696 4896 2012-04-25 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 G57E 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:1538696 4896 2012-04-25 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- vps3844 vps3844delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:39477503 4896 2024-11-07 Growth of the vps3844Δ strain was significantly inhibited at low temperature (Fig. 2B). PomBase SPBC1709.03 FYPO:0005547 deletion 972 h- vps3844 vps3844delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:39477503 4896 2024-11-07 To confirm that SPBC1709.03 is a VPS gene, extracellular leakage of CPY was assessed 17 by colony blot assay (Fig. 1C). Relative to wild type (WT), the SPBC1709.03 deletion strain 18 showed higher chemiluminescence intensity of CPY, indicating an increased occurrence of 19 CPY mis-sorting to the cell surface. PomBase SPBC1709.03 FYPO:0001423 deletion 972 h- vps3844 vps3844delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 assayed_protein(PomBase:SPAC4A8.04) PMID:39477503 4896 2024-11-08 Although the Vps3844 protein is important for the transport of 26 CPY into the vacuole, Isp6-GFP and Psp3-GFP were found to localize in the vacuolar lumen 27 in vps3844Δ cells (Fig. S5). PomBase SPBC1709.03 FYPO:0001423 deletion 972 h- vps3844 vps3844delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.01) PMID:39477503 4896 2024-11-08 Although the Vps3844 protein is important for the transport of 26 CPY into the vacuole, Isp6-GFP and Psp3-GFP were found to localize in the vacuolar lumen 27 in vps3844Δ cells (Fig. S5). PomBase SPBC1709.03 FYPO:0002476 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps3844 vps3844delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- vps3844 vps3844delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps3844 vps3844delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 R150E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R150E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002019 R150E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R150E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 R150E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R150E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 R150E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R150E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-s16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:30928696 4896 2019-05-01 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0000453 wild type Overexpression 972 h- drc1 drc1+ wild_type ECO:0005580 PMID:11937031 4896 2014-12-15 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- drc1 drc1+ wild_type ECO:0001232 PMID:11937031 4896 2012-02-23 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- drc1 drc1+ wild_type ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2014-12-15 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 1-392,S402A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A B2d7-S402A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S402A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A B2d7-S402A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 U88G,84-88,131 nucleotides inserted after nt83 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U88G,delta84-88,omega131nt other ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 U88G,84-88,131 nucleotides inserted after nt83 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U88G,delta84-88,omega131nt other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0000705 218-295 Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-delta218-295 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.06) PMID:19502236 4896 2024-08-09 (Fig. 9A) PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2A9.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC2A9.03 SPBC2A9.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.05c FYPO:0000085 H278G,Y279F,P280G Not assayed or wild type 972 h- brc1 brc1-H278G,Y279F,P280G brc1-H307G,Y308F,P309G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23656778 4896 2013-07-09 PomBase SPBC582.05c FYPO:0000088 H278G,Y279F,P280G Not assayed or wild type 972 h- brc1 brc1-H278G,Y279F,P280G brc1-H307G,Y308F,P309G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23656778 4896 2013-07-09 PomBase SPBC582.05c FYPO:0000091 H278G,Y279F,P280G Not assayed or wild type 972 h- brc1 brc1-H278G,Y279F,P280G brc1-H307G,Y308F,P309G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23656778 4896 2013-07-09 PomBase SPBC26H8.09c FYPO:0005844 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf59 snf59-CDx2 Snf59-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5D, 5G) PomBase SPBC26H8.09c FYPO:0002827 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf59 snf59-CDx2 Snf59-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000049 96.57 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5C, 5F, 5H) PomBase SPBC26H8.09c FYPO:0004577 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf59 snf59-CDx2 Snf59-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S5B) PomBase SPBC26H8.09c FYPO:0008416 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf59 snf59-CDx2 Snf59-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5I) PomBase SPBC26H8.09c FYPO:0004377 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf59 snf59-CDx2 Snf59-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1620.14c) PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5B) PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC14C4.07 SPAC14C4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.12c SPAC23H3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.12c SPAC23H3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.12c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.12c SPAC23H3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.12c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.12c SPAC23H3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 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PMID:2798130 4896 2014-01-16 PomBase SPBC21.05c FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- ral2 ral2-mutant unknown ECO:0005638 PMID:3071741 4896 2013-02-26 PomBase SPBC21.05c FYPO:0000024 unknown Not assayed or wild type 972 h- ral2 ral2-mutant unknown ECO:0001232 PMID:3071741 4896 2013-02-26 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0007335 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0007334 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 ers1Δ mutant is completely defective in the silencing of ura4+ genes placed in the inner or outer repeats of cen1. PomBase SPCC1393.05 FYPO:0003744 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 As shown in Fig. 1C, recruitment of RITS to both sites was abolished in ers1Δ cells. PomBase SPCC1393.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0003412 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000878 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 We found that ers1Δ cells display a defect in both H3 Lys9 dimethylation and trimethylation (both normalized for nucleosome density) at the endogenous dh and dg regions of the centromeric outer repeats (Fig. 1B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000888 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 We found that ers1Δ cells display a defect in both H3 Lys9 dimethylation and trimethylation (both normalized for nucleosome density) at the endogenous dh and dg regions of the centromeric outer repeats (Fig. 1B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000884 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 We found that ers1Δ cells display a defect in both H3 Lys9 dimethylation and trimethylation (both normalized for nucleosome density) at the endogenous dh and dg regions of the centromeric outer repeats (Fig. 1B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000890 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 We found that ers1Δ cells display a defect in both H3 Lys9 dimethylation and trimethylation (both normalized for nucleosome density) at the endogenous dh and dg regions of the centromeric outer repeats (Fig. 1B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0006599 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:22474355 4896 2024-03-13 The localizations of Hrr1-Flag and Rdp1-Flag at centromeric repeats were also found to be severely compromised in both ers1Δ and swi6Δ mutant cells (Fig. 5 A and B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0006599 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:22474355 4896 2024-03-13 The localizations of Hrr1-Flag and Rdp1-Flag at centromeric repeats were also found to be severely compromised in both ers1Δ and swi6Δ mutant cells (Fig. 5 A and B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ers1 ers1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002567 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 nalysis revealed robust accumulation of the centromeric dg transcript in ers1Δ cells (Fig. 2A). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002336 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 no defect in silencing of ura4+ reporter genes placed at mat3M or tel2R, where RNAi- dependent mechanisms act redundantly with RNAi-independent silencing mechanisms. PomBase SPCC1393.05 FYPO:0003555 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 no defect in silencing of ura4+ reporter genes placed at mat3M or tel2R, where RNAi- dependent mechanisms act redundantly with RNAi-independent silencing mechanisms. PomBase SPCC1393.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ers1 ers1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ers1 ers1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0006076 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0000049 PMID:18658154 4896 2024-06-09 We observed an apparently complete defect in siRNA production (Fig. 2B). PomBase SPCC1393.05 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ers1 ers1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- ers1 ers1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ers1 ers1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000459 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K21 unknown ECO:0005638 PMID:11069892 4896 2016-09-13 PomBase 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deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002827 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002827 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 (Table 1) PomBase SPAC110.02 FYPO:0002827 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0000231 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000877 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31278118 4896 2020-05-06 cells revealed that H3K9me2 was notably decreased at centromeres and telomeres in pds5D (Figure 3, A and B). PomBase SPAC110.02 FYPO:0002355 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31278118 4896 2020-05-06 PomBase SPAC110.02 FYPO:0004137 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31278118 4896 2020-05-06 cells revealed that H3K9me2 was notably decreased at centromeres and telomeres in pds5D (Figure 3, A and B). PomBase SPAC110.02 FYPO:0005845 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 (Fig. 2B) (Figure S1B and Table S2). This variegated staining pattern is a characteristic of mutants that are known to be defective in the maintenance of heterochromatin and that show a reduction, but not loss, of H3K9me levels (Taneja et al. 2017). Indeed, ChIP analyses of H3K9 di- and trimethylation (H3K9me2/3) showed a reduction in heterochromatic H3K9 marks at or near mat2P in pds5D (Figure 2B). PomBase SPAC110.02 FYPO:0000581 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 5B) PomBase SPAC110.02 FYPO:0001861 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 high PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 4A) PomBase SPAC110.02 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC110.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0005422 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0001232 high PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 2A) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000228 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0001232 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 PMID:21300781 4896 2013-07-04 PomBase SPAC110.02 FYPO:0006670 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 15 PMID:31278118 4896 2020-05-06 (Fig. 1D, 1E) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000838 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 7C) PomBase SPAC110.02 FYPO:0004422 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:28438891 4896 2017-11-01 (Fig. 3C) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002578 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 2B) PomBase SPAC110.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC110.02 FYPO:0004325 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC110.02 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000095 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 medium PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 2B) PomBase SPAC110.02 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC110.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 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ECO:0005638 medium PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 2B) PomBase SPAC110.02 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 medium PMID:28343969 4896 2018-06-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 high PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 3A) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000268 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 high PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 2) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000925 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 5A) PomBase SPAC110.02 FYPO:0003241 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 4B) PomBase SPAC110.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- pds5 pds5delta deletion ECO:0005638 PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 1) PomBase SPAC110.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pds5 pds5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006295 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000127 PMID:31941401 4896 2020-02-21 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006295 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:31941401 4896 2020-02-25 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0007447 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 complete PMID:37553386 4896 2024-04-02 (Fig. 1B and C) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0008084 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000265 complete PMID:37553386 4896 2024-04-02 (Fig. 1B and C) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 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ECO:0001232 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. S2G and H) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006376 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000265 high assayed_protein(PomBase:SPBC1709.05) PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 2C) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006376 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.11c) PMID:25803873 4896 2018-01-12 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001422 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.11c) PMID:25803873 4896 2018-01-12 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000584 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001178 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000240 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001178 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 low PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0003750 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 2D) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000590 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000208 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001357 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0007629 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001245 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figures 2C, 2D, and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000843 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006579 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000279 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figures 2C, 2D, and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000116 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000173 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figures 2C, 2D, and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000280 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006784 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 60 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figures 2A and 2B) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0002060 deletion 972 h- atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg8 atg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC139.01c FYPO:0007225 D32A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ overexpression mkt1 mkt1-D32A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:31822915 4896 2020-01-08 PomBase SPBP4H10.15 FYPO:0004530 1-806 Overexpression 972 h- aco2 aco2(807-902) aco2-ribosomal-domain only partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:25724335 4896 2015-03-27 PomBase SPBP4H10.15 FYPO:0002061 1-806 Overexpression 972 h- aco2 aco2(807-902) aco2-ribosomal-domain only partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:25724335 4896 2015-03-27 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000731 deletion 972 h- cdc4 cdc4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:21376595 4896 2012-02-08 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000731 deletion 972 h- cdc4 cdc4delta deletion ECO:0001232 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SPCC1906.01 FYPO:0001009 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0001232 PMID:16049679 4896 2013-01-25 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0003171 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0001232 PMID:22416758 4896 2013-01-24 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0000446 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0005580 PMID:16049679 4896 2013-01-25 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0001407 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22416758 4896 2013-01-24 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0001407 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22416758 4896 2013-01-24 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0001911 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:16049679 4896 2013-02-07 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0001911 wild type Knockdown 972 h- mpg1 mpg1+ wild_type ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:22416758 4896 2013-02-01 PomBase SPCC1906.01 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2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0008088 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:33529549 4896 2023-06-08 PomBase SPAC589.08c FYPO:0008099 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:33529549 4896 2023-06-08 Anaphase A chromosome movement is completely abolished and only anaphase B chromosome movement occurs. PomBase SPAC589.08c FYPO:0005365 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:18256284 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0001270 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:24239120 4896 2022-04-25 (Fig. 3) PomBase SPAC589.08c FYPO:0003165 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 high PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0001407 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0005423 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:20624975 4896 2016-05-27 (Fig. 5C) PomBase SPAC589.08c FYPO:0007112 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-08 (Fig. 2b-d) PomBase SPAC589.08c FYPO:0002638 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0004023 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:16079915 4896 2014-12-16 PomBase SPAC589.08c FYPO:0003003 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0003003 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0004101 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:24239120 4896 2022-05-13 (Fig. 3) PomBase SPAC589.08c FYPO:0000733 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0004307 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 low PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPAC589.08c FYPO:0001387 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dam1 dam1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000283 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 high PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000324 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 high PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. S1) PomBase SPAC589.08c FYPO:0000324 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC589.08c FYPO:0002688 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 20-25 PMID:18262494 4896 2016-04-05 PomBase SPAC589.08c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dam1 dam1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC589.08c FYPO:0004214 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Fig. 4d) PomBase SPAC589.08c FYPO:0002901 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000943 deletion 972 h- dam1 dam1delta deletion ECO:0001232 PMID:33529549 4896 2023-06-12 PomBase SPAC589.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph dam1 dam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dam1 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assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000616 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8065367 4896 2013-06-11 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000670 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000131 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8065367 4896 2013-06-11 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0002568 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.05) PMID:12006658 4896 2014-03-03 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000229 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 22 PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 6B) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001055 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003165 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 34 PMID:38780300 4896 2024-09-06 (Fig. 6B) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003165 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003165 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8065367 4896 2013-06-11 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000082 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12553909 4896 2013-04-29 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000082 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:8065367 4896 2013-06-11 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0004056 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:11084332 4896 2016-01-25 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0004332 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0004332 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000158 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8065367 4896 2013-06-11 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000836 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39473973 4896 2025-03-27 (Fig. S4A) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001327 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 4e) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001327 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-14 We confirmed it by microscopy as well. Fig 2A and B. We found that GFP-Bqt4 degradation was suppressed in cut8-563 cells shifted to the nonpermissive temperature of 36°C (Fig. 2A,B). PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000252 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8065367 4896 2021-02-15 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0002303 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8065367 4896 2013-08-08 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000783 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.13c) PMID:21976488 4896 2012-11-15 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000784 S201P Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.05) PMID:12006658 4896 2014-02-18 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0001074 unknown Not assayed or wild type 972 h- itr2 itr2-IM49 unknown ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:9560432 4896 2012-06-12 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- itr2 itr2-IM49 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000111,FYECO:0000126 PMID:9560432 4896 2012-05-17 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- itr2 itr2-IM49 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9560432 4896 2012-05-17 PomBase SPBP4H10.05c FYPO:0001914 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spe2 spe2delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBP4H10.05c FYPO:0000583 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spe2 spe2delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBP4H10.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spe2 spe2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spe2 spe2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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ALSO Figure 4B for severity PomBase SPAC1142.08 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fhl1 fhl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0000303 deletion 972 h- fhl1 fhl1delta deletion ECO:0001232 PMID:18059475 4896 2012-02-19 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0001152 deletion 972 h- fhl1 fhl1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph fhl1 fhl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph fhl1 fhl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph fhl1 fhl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0000223 deletion 972 h- fhl1 fhl1delta deletion 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2013-02-19 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000833 A393T Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-M17 cdc10-M15|cdc10-M4|cdc10-M71 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000658 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. 4) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001645 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30503780 4896 2019-10-07 ( PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Figures 5A and 5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004093 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. S5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005612 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. S5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000590 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:30503780 4896 2019-10-07 ( PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002687 K83E,K106E,R107E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-B amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. S5B) PomBase SPBC119.11c FYPO:0000082 A346V,A347V Overexpression 972 h- pac1 pac1-A346V,A347V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001147 A346V,A347V Overexpression 972 h- pac1 pac1-A346V,A347V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPCC548.07c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ght1 ght1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase 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nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000659 K93A,K94A,R95A,K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-7A sfr1-WI amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:32204793 4896 2020-04-15 (Figure 6—Figure supplement 1) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000705 K93A,K94A,R95A,K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-7A sfr1-WI amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:32204793 4896 2020-04-15 (Figure 5B) Figure 5—Figure supplement 1C PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0007360 K93A,K94A,R95A,K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-7A sfr1-WI amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 PMID:32204793 4896 2020-05-01 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0001645 K93A,K94A,R95A,K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-7A sfr1-WI amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC644.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:39174851 4896 2024-09-24 (Fig. 3A) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0007346 K93A,K94A,R95A,K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-7A sfr1-WI amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:32204793 4896 2020-04-23 (Figure 7A,B) PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258,P97R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-P97R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 130-258,P97R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-P97R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBC337.16 FYPO:0000031 deletion 972 h- cho1 cho1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPBC337.16 FYPO:0000128 deletion 972 h- 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assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-C2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000228 high PMID:10880469 4896 2015-02-09 PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007160 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 high PMID:38376141 4896 2024-07-10 In contrast, when we complemented the depleted extract with SpCAF-1 mutant complexes SpCAF-1-ED*, SpCAF-1-KER*, SpCAF- 1-ΔWHD we did not detect the supercoiled form I. This indicates that these mutants cannot promote nucleosome assembly (Figure 5). PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0003412 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 7A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007158 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 2 supplement 1A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007159 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 PMID:38376141 4896 2024-07-12 (Fig. 2 supplement 1A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0004709 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 7B and C) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0001571 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 6) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0005116 Y340A,W348A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-ED* amino_acid_mutation ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.03) PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 6C and D) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0003725 wild type Overexpression 972 h- aps1 aps1+ wild_type ECO:0005801 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- aps1 aps1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001494 wild type Overexpression 972 h- aps1 aps1+ wild_type ECO:0001232 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0000021 wild type Overexpression 972 h- aps1 aps1+ wild_type ECO:0001232 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002377 wild type Overexpression 972 h- aps1 aps1+ wild_type ECO:0001232 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 (pfh1-M21A,M170L,M265A,M320A)-NES Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-mt* fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:18725402 4896 2025-04-14 when this strain was grown at 18°C, the pfh1-mt* allele did not complement pfh1D (402/ 407 His+ cells; Table 2, line 7). PomBase SPBC887.14c FYPO:0000095 (pfh1-M21A,M170L,M265A,M320A)-NES Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-mt* fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:18725402 4896 2025-04-14 (Fig. 7A) PomBase SPBC887.14c FYPO:0000088 (pfh1-M21A,M170L,M265A,M320A)-NES Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-mt* fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:18725402 4896 2025-04-14 (Fig. 7A) PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0005758 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000291 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0000705 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17),assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0005937 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:24656819 4896 2017-02-21 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0003803 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0003803 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001645 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0002019 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 low PMID:29774234 4896 2018-06-08 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001357 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-08 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001357 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001357 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001357 V41A,F43A,I65A,L66A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-PP1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000190 deletion 972 h- cap1 cap1delta deletion ECO:0001232 PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000035 deletion 972 h- cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPCC306.09c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0005173 deletion 972 h- cap1 cap1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC119.05c) PMID:26542710 4896 2016-01-20 PomBase SPCC306.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC306.09c FYPO:0001864 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cap1 cap1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph cap1 cap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0002634 deletion 972 h- h- 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amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 K47N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K47N amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 K47N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K47N amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 K47N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K47N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC337.16 FYPO:0000663 unknown Not assayed or wild type 972 h- cho1 cho1- unknown ECO:0005801 PMID:1324908 4896 2016-06-28 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001838 S187A,T363A,T382A,T388A,T453A,S479A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:16950131 4896 2015-01-28 PomBase SPBC17D11.05 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SPAC13C5.07 FYPO:0000268 T517I Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-T517I rad32-T517I amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:9826747 4896 2016-04-13 PomBase SPAC22E12.07 FYPO:0000664 R74K Not assayed or wild type 972 h- rna1 rna1-R74K amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:10394366 4896 2014-09-03 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0006303 G688V Not assayed or wild type 972 h- myp2 myp2-G688V amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.05c) PMID:26092938 4896 2015-08-18 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001214 G688V Not assayed or wild type 972 h- myp2 myp2-G688V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26092938 4896 2015-08-18 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0000029 deletion 972 h- ies4 ies4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 10 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0000029 deletion 972 h- ies4 ies4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 10 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0005314 deletion 972 h- ies4 ies4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:30134042 4896 2018-11-07 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0005318 deletion 972 h- ies4 ies4delta deletion ECO:0000049 PMID:30134042 4896 2018-11-07 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0005318 deletion 972 h- ies4 ies4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:30134042 4896 2018-11-07 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 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SPAC23G3.04 FYPO:0001986 deletion 972 h- ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ies4 ies4delta deletion ECO:0005638 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mitosis. An asynchronous population of the cdc1-7 mutant was shifted from 25°C to the restrictive temperature of 36°C to inactivate the gene and the number of cells that went on to divide was measured PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:8887553 4896 2013-02-08 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001840 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000969 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000088 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000088 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000088 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:10757807 4896 2015-05-07 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000089 D389G Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-P13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004056 2-41,M1MPKKKRKV,1200-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-1-40/SV-delta-Sph amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002060 2-41,M1MPKKKRKV,1200-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-1-40/SV-delta-Sph amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPAC57A10.05c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof1 pof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- pof1 pof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A10.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof1 pof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.01c FYPO:0000969 deletion 972 h- rhp16 rhp16delta deletion ECO:0005638 PMID:8879272 4896 2013-02-05 PomBase SPCC330.01c FYPO:0000969 deletion 972 h- rhp16 rhp16delta deletion ECO:0005638 PMID:10446227 4896 2015-04-13 PomBase SPCC330.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- rhp16 rhp16delta deletion ECO:0005638 PMID:8879272 4896 2013-02-05 PomBase SPCC330.01c FYPO:0000102 deletion 972 h- rhp16 rhp16delta deletion ECO:0005638 PMID:8879272 4896 2013-02-05 PomBase SPCC330.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- rhp16 rhp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC330.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rhp16 rhp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rhp16 rhp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC839.08c FYPO:0003412 its8::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 its8 its8::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002060 S369D,S369D Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-2SD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-22 As predicted, the 4KRA mutant did not restore lethality upon shut-off, whereas the other three mutants did (Fig. 4C) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008195 F61A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-F61A amino_acid_mutation ECO:0000059 low PMID:19362535 4896 2024-02-13 The observed affinities ranged from close to wild-type to complete loss of specific binding. The F61A mutant showed little reduction in binding affinity compared with wild-type Chp1. A PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 F61A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-F61A amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002837 F61A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-F61A amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 F61A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-F61A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPCC188.03 FYPO:0000214 Y669N Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-Y669N amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 Y669N Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-Y669N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC32H8.01c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32H8.01c SPBC32H8.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.01c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32H8.01c SPBC32H8.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.01c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32H8.01c SPBC32H8.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.01c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32H8.01c SPBC32H8.01cdelta deletion ECO:0005638 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nc-1343-Adelta other ECO:0005638 PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000964 long partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Adelta other ECO:0005638 PMID:25428589 4896 2022-12-01 Truncations of nc-1343 (that is, AD and BD) that retain its 50 end did not result in the drug-sensitivity phenotype presented by 1343D cells (Fig. 3b) and, similarly, did not induce tgp1þ expression (Fig. 3c) PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001317 long partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Adelta other ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001317 long partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Adelta other ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2025-01-20 PomBase SPCC1919.02 FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC17H9.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rdl1 rdl1delta rdl1-25 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC17H9.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rdl1 rdl1delta rdl1-25 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC17H9.03c FYPO:0004993 deletion 972 h- rdl1 rdl1delta rdl1-25 deletion ECO:0005638 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 3D, Table S4) PomBase SPAC17H9.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rdl1 rdl1delta rdl1-25 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rdl1 rdl1delta rdl1-25 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.03c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph rdl1 rdl1delta rdl1-25 deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPAC19G12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC19G12.09 SPAC19G12.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC19G12.09 SPAC19G12.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC19G12.09 SPAC19G12.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.12 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0000239 deletion 972 h- gpd3 gpd3delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC354.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 gpd3 gpd3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC354.12 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 gpd3 gpd3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC354.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- gpd3 gpd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC354.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpd3 gpd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- gpd3 gpd3delta deletion ECO:0005638 PMID:36174923 4896 2022-11-06 (Fig. S5) PomBase SPBC354.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpd3 gpd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.02c FYPO:0000705 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-N-5a amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15),assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:20739936 4896 2020-02-11 Bir1-N-5A abolished the interaction with Sgo2, whereas Bir1-N-5D retained the interaction (Fig. 2h) PomBase SPCC962.02c FYPO:0007244 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-N-5a amino_acid_mutation ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 2a, 2b, S5) PomBase SPBC336.12c FYPO:0000705 S196A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-S196A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c),assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:9201720 4896 2018-06-09 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000705 460-505 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPID partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000705 460-505 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPID partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02),assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004604 460-505 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPID partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 460-505 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPID partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 460-505 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPID partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC188.07) PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 460-505 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPID partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000940 Y344R Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-20 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:29021344 4896 2018-02-01 (Figure S5D) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002023 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:27385337 4896 2016-10-02 (Figure 5D,6) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0005289 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002488 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:27385337 4896 2016-09-19 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0003440 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0003440 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000005 high PMID:41144523 4896 2025-11-27 rga7Δ cells had severe lysis and negligible growth on plates with Phloxine B (a red dye accumulated in lysed or unhealthy cells because they cannot pump it out) at both 25 and 36°C (Fig 6A–6D). PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0003440 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 10 PMID:30840879 4896 2019-06-24 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0003440 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 50 PMID:30840879 4896 2019-06-24 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000082 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000334 medium PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000835 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001324 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC16.01) PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002869 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Ync13 levels at the division site measured by fluorescence intensity were significantly reduced (>85%) in both rga7Δ and rng10Δ cells (Fig 3A and 3B), PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002869 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 The time-lapse movies showed that the Bgs4 intensity at division site was significantly reduced in rng10Δ and rng10Δ ync13-19 cells, and Bgs4 did not accumulate in the center of the division plane compared to ync13-19 cells (Fig 4F). Consistently, Bgs4 levels at the division site were significantly lower in rga7Δ, rng10Δ, and rng10Δ rga7Δ cells (Fig 4G). PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002869 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000025 assayed_protein(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 In rga7Δ, rng10Δ, and rga7Δ rng10Δ (shifting from medium with sorbitol to the one without sorbitol) cells, Trs120 intensity at division site decreased significantly, while it increased in ync13Δ cells (Fig 5A and 5B; arrowheads), consistent with the Bgs4 intensity (Fig 4F and 4G). PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002869 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Figure 4F) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002869 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Fig. 5a) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002869 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0005551 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0005551 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001365 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0006448 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004653 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0005903 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001724 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC16.01) PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000836 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004655 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001038 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001489 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001266 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0006187 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0002085 deletion 972 h- rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 low PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rga7 rga7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- 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SPBC336.04 FYPO:0002061 C1040A Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-C1040A C1038A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:15173383 4896 2015-06-08 PomBase SPCC285.09c FYPO:0002003 C(-68)A,G(-67)T Not assayed or wild type 972 h- cgs2 cgs2-p.CRE-mut cgs2-CRE promoter binding site mutant nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC21E11.03c),assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01),assayed_using(SO:0001843) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPCC285.09c FYPO:0000711 C(-68)A,G(-67)T Not assayed or wild type 972 h- cgs2 cgs2-p.CRE-mut cgs2-CRE promoter binding site mutant nucleotide_mutation ECO:0005580 PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPCC285.09c FYPO:0001152 C(-68)A,G(-67)T Not assayed or wild type 972 h- cgs2 cgs2-p.CRE-mut cgs2-CRE promoter binding site mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC285.09c) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPCC285.09c FYPO:0001152 C(-68)A,G(-67)T Not assayed or wild type 972 h- cgs2 cgs2-p.CRE-mut cgs2-CRE promoter binding site mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPBC418.01c FYPO:0002068 unknown Not assayed or wild type 972 h- his4 his4- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0000703 1-180 Not assayed or wild type 972 h- mts4 mts4-Ndelta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.12),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- trz1 trz1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC119.06 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 sco1 sco1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC119.06 FYPO:0006141 deletion 972 h- sco1 sco1delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPBC119.06 FYPO:0001934 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assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0000091 H94R,L121Q Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000684 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 low PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A and Fig. S6B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000519 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0005801 low PMID:38272226 4896 2024-12-11 (Fig. 5B and 5C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPBP23A10.16) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC737.02c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC338.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0002768 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 3D) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001117 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001117 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBP23A10.16) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001117 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPCC737.02c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001117 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPCC338.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001117 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hul6 hul6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0003914 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 3A and 3E) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hul6 hul6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 PMID:38272226 4896 2024-12-11 Δhul6 cells show a progressive loss of viability, starting at 72 h (Fig. S6B). PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001814 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000409 PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hul6 hul6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000829 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0005825 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 low PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A and Fig. S6B) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph hul6 hul6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- hul6 hul6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hul6 hul6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hul6 hul6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0000608 1-52 Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-140-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0001324 1-52 Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-140-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.12c) PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0001324 1-52 Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-140-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0001324 1-52 Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-140-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0001838 1-52 Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-140-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0002700 1-52 Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-140-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0002059 disruption Null 972 h- rna14 rna14::disruption disruption ECO:0000059 PMID:26581324 4896 2015-12-04 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0000062 wild type Overexpression 972 h- mcb1 mcb1+ wild_type ECO:0001232 PMID:21813639 4896 2011-08-10 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0001508 wild type Overexpression 972 h- mcb1 mcb1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:21813639 4896 2016-01-12 PomBase 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2012-07-26 PomBase SPCC4G3.18 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- rix1 rix1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:21385875 4896 2012-06-08 PomBase SPBC25H2.04c FYPO:0000320 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim22 tim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.04c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim22 tim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- tim22 tim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25H2.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim22 tim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.23 FYPO:0007596 deletion 972 h- mim2 mim2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-08 Consistent with this, mitophagy was impaired in the mim1D and mim2D mutants (Figure 5D) PomBase SPBC409.23 FYPO:0007038 deletion 972 h- mim2 mim2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-08 In the absence of Mim1 or Mim2, the GFP-Atg43 signal at the mitochondria was severely decreased (Figure 5C) PomBase SPBC409.23 FYPO:0007038 deletion 972 h- mim2 mim2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.12) PMID:33138913 4896 2021-01-11 We confirmed that Mim1 and Mim2 are required for stable localization of Tom70 on mitochondria in fission yeast (Figure 5—Figure supplement 1H PomBase SPBC409.23 FYPO:0001355 deletion 972 h- mim2 mim2delta deletion ECO:0005638 PMID:33138913 4896 2021-01-08 (Figure 5, Figure supplement 1F) PomBase SPBC409.23 FYPO:0001355 deletion 972 h- mim2 mim2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21270388 4896 2021-10-07 PomBase SPBC409.23 FYPO:0002061 deletion 972 h- mim2 mim2delta deletion ECO:0005638 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2016-09-06 PomBase SPAC23C4.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC23C4.04c SPAC23C4.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC23C4.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- SPAC23C4.04c SPAC23C4.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004481 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0005887 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0000226 PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Figure 2D) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 wild type Overexpression 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003009 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003009 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003011 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004380 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23936074 4896 2015-02-13 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003010 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003010 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003410 wild type Overexpression 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 3C) spreading is still within the central domain, to the flanking tRNAs PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- cnp1 cnp1+ CENP-A-Cnp1|CENPA(cnp1+)|nmt1-CENP-A-Cnp1 wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24710126 4896 2015-11-18 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 F124FRGTPF Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-F49 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004067 wild type Overexpression 972 h- fcp1 fcp1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004068 wild type Overexpression 972 h- fcp1 fcp1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0001838 wild type Overexpression 972 h- fcp1 fcp1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:11839823 4896 2015-01-14 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- fcp1 fcp1+ wild_type ECO:0005638 PMID:11839823 4896 2015-01-14 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0000107 wild type Overexpression 972 h- fcp1 fcp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC926.03 FYPO:0001368 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0004300 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000038 assayed_enzyme(PomBase:SPCC645.05c) PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0005906 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002559 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0000703 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC926.03),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0005899 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0004895 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC926.03 FYPO:0005904 S35D,S36D Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-DD Rlc1p-DD|Rlc1p-Rlc1p-S35D-S36D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC2F3.05c SPAC2F3.05cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0006150 C746A,C749A Not assayed or wild type 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2-2CA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28552615 4896 2017-07-19 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0006809 1-247 Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-delta248 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0001645 369-429 Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-delta369-429 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPAC890.02c),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:25472718 4896 2017-10-28 (Fig. 4E) reduced by >70% PomBase SPAC890.02c FYPO:0000703 369-429 Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-delta369-429 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:25472718 4896 2017-10-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000069 369-429 Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-delta369-429 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:25472718 4896 2017-10-28 (Fig. 3A) PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0000035 deletion 972 h- pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0001309 deletion 972 h- pro2 pro2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pro2 pro2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pro2 pro2delta 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SPCC1739.07 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0002546 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph cti1 cti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cti1 cti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cti1 cti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0003412 cbp3::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 cbp3 cbp3::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 E238A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-E238A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 E238A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-E238A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 L6E,D389N,E390Q,E392Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-NQQ amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 L6E,D389N,E390Q,E392Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-NQQ amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003825 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-UV1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10704373 4896 2014-10-23 PomBase SPCC1672.10 FYPO:0000705 1-33 Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16delta1-33 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC27B12.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1672.10) PMID:29804820 4896 2023-04-03 However, the interaction is significantly diminished when either L32 (Mis16D1-32), or both L32 (Mis16D1-32) and L32/W33 (Mis16D1-33), are deleted (Figures 6A and 6B). In contrast, the Mis16-H4a1 interaction was only mildly affected in the context of the Mis16D1-33 truncation. These findings strongly suggest that Mis16 L32 and W33 participate in specific interactions with Eic1 but not histone H4. To verify these observations in vivo, we performed PomBase SPCC1672.10 FYPO:0000703 1-33 Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16delta1-33 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.12),assayed_protein(PomBase:SPCC1672.10) PMID:29804820 4896 2023-04-03 However, the interaction is significantly diminished when either L32 (Mis16D1-32), or both L32 (Mis16D1-32) and L32/W33 (Mis16D1-33), are deleted (Figures 6A and 6B). In contrast, the Mis16-H4a1 interaction was only mildly affected in the context of the Mis16D1-33 truncation. These findings strongly suggest that Mis16 L32 and W33 participate in specific interactions with Eic1 but not histone H4. To verify these observations in vivo, we performed PomBase SPCC1672.10 FYPO:0000703 1-33 Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16delta1-33 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC1672.10) PMID:29804820 4896 2023-04-03 However, the interaction is significantly diminished when either L32 (Mis16D1-32), or both L32 (Mis16D1-32) and L32/W33 (Mis16D1-33), are deleted (Figures 6A and 6B). In contrast, the Mis16-H4a1 interaction was only mildly affected in the context of the Mis16D1-33 truncation. These findings strongly suggest that Mis16 L32 and W33 participate in specific interactions with Eic1 but not histone H4. To verify these observations in vivo, we performed PomBase SPCC1672.10 FYPO:0000703 1-33 Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16delta1-33 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC1672.10) PMID:29804820 4896 2023-04-03 However, the interaction is significantly diminished when either L32 (Mis16D1-32), or both L32 (Mis16D1-32) and L32/W33 (Mis16D1-33), are deleted (Figures 6A and 6B). In contrast, the Mis16-H4a1 interaction was only mildly affected in the context of the Mis16D1-33 truncation. These findings strongly suggest that Mis16 L32 and W33 participate in specific interactions with Eic1 but not histone H4. To verify these observations in vivo, we performed PomBase SPAC16E8.03 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gna1 gna1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.03 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gna1 gna1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- gna1 gna1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16E8.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gna1 gna1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000819 W247* 972 h- h- sxa2 sxa2-563 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:7900424 4896 2012-03-16 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000703 434-461 Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-N433 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c),assayed_using(PomBase:SPAC26A3.02) PMID:15533944 4896 2016-03-03 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000703 434-461 Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-N433 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1952.07),assayed_using(PomBase:SPAC26A3.02) PMID:15533944 4896 2016-03-03 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cao2 cao2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cao2 cao2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cao2 cao2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- cao2 cao2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cao2 cao2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cao2 cao2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001645 P277A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-P277A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c),assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 2D) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0006148 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 The mRNA level of isp5+ (S6A Fig) as well as the basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion as measured by Renilla luciferase reporter (S6B Fig) were also decreased in npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001324 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001324 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0010009 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0004457 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also impairs the nuclear localization of Gaf1-YFP induced by nitrogen depletion (S6C Fig) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001117 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 The mRNA level of isp5+ (S6A Fig) as well as the basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion as measured by Renilla luciferase reporter (S6B Fig) were also decreased in npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 (Fig. S2A) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 (Fig. S2A) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 (Fig. S2A) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Exogenous addition of arginine to the EMM plates enhanced the cell growth of Δlam2 cells, Δgtr2 cells, Δgtr1 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells as well as wild-type cells, but did not rescue the defective cell growth of these mutant cells to the level of wild-type cells (S5 Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0000825 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001545 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with rapamycin and caffeine partially canceled, and Torin1 treatment fully canceled, cannavanine resistance in Δnpr2 cells and Δnpr3 cells (S4D Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0008372 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 TORC1 inhibition by rapamycin and caf- feine abolished the internalization of Cat1 and increases the signal at the cell surface (S4B Fig, Rapamycin + caffeine). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001029 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001029 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::kanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with rapamycin and caffeine partially canceled, and Torin1 treatment fully canceled, cannavanine resistance in Δnpr2 cells and Δnpr3 cells (S4D Fig). PomBase SPCC1739.14 FYPO:0002563 74-143 Not assayed or wild type 972 h- npp106 npp106delta74-143 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1739.14) PMID:9372936 4896 2014-09-01 PomBase SPBC29A3.16 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrs1 rrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.16 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrs1 rrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- rrs1 rrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A3.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrs1 rrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.04 FYPO:0000121 (-284)-(-278) Not assayed or wild type 972 h- spo6 spo6-DF spo6DF 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mad1-EDD/QNN amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Fig. 3F) PomBase SPCC338.07c FYPO:0002667 F533A Not assayed or wild type 972 h- naa15 naa15-F533A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0000705 D417A,E420A Not assayed or wild type 972 h- nup120 nup120-D417A,E420A nup120PD amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.18),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.16c) PMID:22955883 4896 2014-04-17 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002032 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:24798735 4896 2014-06-12 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0003444 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:24798735 4896 2014-06-12 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0006503 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC4H3.14c) PMID:28410370 4896 2021-03-09 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myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0000118 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 low PMID:24798735 4896 2014-06-12 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0004807 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:25825517 4896 2015-08-10 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002487 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-08-12 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001294 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0000426 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:11509236 4896 2024-06-12 After 15 min, vacuoles were visible in all three strains, and this observation demonstrates that, as in budding yeast [8, 9], endocytosis does not require a functional type V myosin. PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002559 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4H3.14c) PMID:24798735 4896 2014-06-12 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002559 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.02) PMID:24798735 4896 2014-06-12 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001587 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001587 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:23051734 4896 2013-07-30 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0004895 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002253 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Fig. 5A) PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001315 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001357 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 PMID:11112691 4896 2024-06-11 Myo51 were indistinguishable from an isogenic wild-type strain (Fig. 2A,B). PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001125 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- myo51 myo51delta deletion ECO:0005638 PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPBC2D10.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo51 myo51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.14c FYPO:0001357 deletion 972 h- aah2 aah2delta deletion ECO:0005638 PMID:40668835 4896 2025-08-18 The aah1∆, aah2∆, and aah4∆ cells grew like wildtype at all temperatures tested, and aah3∆ cells were cold- sensitive (SI Appendix, Fig. S1). PomBase SPAC23D3.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- aah2 aah2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC23D3.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- aah2 aah2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPAC23D3.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- aah2 aah2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPAC644.16 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rna15 rna15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.16 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rna15 rna15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- rna15 rna15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC644.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rna15 rna15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc48 cdc48delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0003759 deletion 972 h- cdc48 cdc48delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc48 cdc48delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc48 cdc48delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.18 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mdm35 mdm35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.18 FYPO:0002061 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Y307 mutation abolished the ability of Epe1 to destabilize heterochromatic silencing (Figure 6A). PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rrp2 rrp2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0005433 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0000049 PMID:30373637 4896 2020-02-06 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0002778 deletion 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2delta deletion ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:28552615 4896 2017-07-19 (Fig. 3a) PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rrp2 rrp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0002082 deletion 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2delta deletion ECO:0006030 low assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:28552615 4896 2017-07-19 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000969 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000969 deletion 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 PMID:28552615 4896 2017-07-16 (Fig. S1B) PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0001689 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-11-06 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0001690 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-11-06 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0001690 deletion 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 PMID:28552615 4896 2017-07-16 (Fig. S1B) PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0001164 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000963 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000963 deletion 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 PMID:28552615 4896 2017-07-16 (Fig. S1B) PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000957 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000957 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000957 deletion 972 h- pmd1delta rrp2 rrp2delta deletion ECO:0005638 PMID:28552615 4896 2017-07-16 (Fig. S1B) PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0001124 deletion 972 h- rrp2 rrp2delta deletion ECO:0001232 PMID:19185548 4896 2012-10-23 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2010-04-06 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp2 rrp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp2 rrp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0000705 1-1036 Not assayed or wild type 972 h- wis4 wis4-1037-1401 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0006589 201-234 Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-deltaCT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0006588 201-234 Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-deltaCT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high 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plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 K69R Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000276 K69R Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001315 K69R Overexpression 972 h- plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 1B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0003161 K69R Overexpression 972 h- plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000381 assayed_transcript(PomBase:SPAC3F10.15c) PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 1B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0003161 K69R Overexpression 972 h- plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000381 assayed_transcript(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 1B) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002679 S640A,S683A,S688A,S693A Not assayed or wild type 972 h- ase1 ase1-S640A,S683A,S688A,S693A ase1-S>A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:19686686 4896 2016-04-01 (fig. 4B) PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002239 T78A Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-T78A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC144.09c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfc2 sfc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- sfc2 sfc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC144.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfc2 sfc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.03 FYPO:0000747 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade2 ade2- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002098 411-426 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9delta411-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002098 411-426 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9delta411-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T328) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 411-426 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9delta411-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 411-426 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9delta411-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(S604) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 411-426 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9delta411-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000089 411-426 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9delta411-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006811 K165R,K167R Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3-KR mlo3KR amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPBC543.09 FYPO:0005419 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0001232 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000359 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0001232 PMID:20621843 4896 2014-08-14 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000499 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000499 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 PomBase SPBC543.09 FYPO:0003811 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-29 Interestingly, the short-lived mutant yta12Δ displayed aggregated mitochondria at the cell poles similar to msp1Δ cells, suggesting that this matrix protease may participate in the regulation of mitochondrial fusion (Fig. 5D, E). PomBase SPBC543.09 FYPO:0002008 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005801 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000054,FYECO:0000102 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000342 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000081 high PMID:35820914 4896 2023-11-08 (0.08% Glu) that promote respiratory metabolism (Fig. 4A). We observed that the short-lived mutants lon1Δ and yta12Δ showed a severe growth defect in respiratory-prone media, comparable to that detected in cox6Δ lacking a subunit of the ETC complex IV PomBase SPBC543.09 FYPO:0000342 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 cells lacking Lon1 or Yta12 displayed decreased respiratory capacity in high and low glucose (Fig. 4B) PomBase SPBC543.09 FYPO:0004944 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2024-12-30 we detected a significant loss of ΔΨ in yta12Δ mutant and increased ΔΨ in yme1Δ cells, both results in consonance with our previous findings (Fig. 4C, Additional file 4: Fig. S1). PomBase SPBC543.09 FYPO:0000835 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPBC543.09 FYPO:0000835 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPBC543.09 FYPO:0000835 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPBC543.09 FYPO:0000835 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPBC543.09 FYPO:0004130 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005801 medium PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0002006 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000335 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0003004 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 (vw: increased hydrogen peroxide formation) In contrast, the yta12Δ strain displayed enhanced levels of basal probe oxidation (OxD0 of 0.46) at the mitochondrial matrix compared to the wild-type strain (OxD0 of 0.4), indicative of higher steady-state levels of H2O2 (Additional file 5: Fig. S2). Cells lacking Lon1 displayed a slight increase in basal oxidation of MTS-Hyper7, suggesting that both short-lived mutants show enhanced production of mitochondrial ROS (Additional file 5: Fig. S2). PomBase SPBC543.09 FYPO:0003004 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005580 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0005420 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000291 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0002664 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000291 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001327 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1718.06) PMID:20621843 4896 2014-08-14 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2023-11-08 Moreover, cells lacking the protease Yme1 displayed increased lifespan in a similar manner to mgr3Δ mutant, whereas the loss of the protease Yta12 resulted in a significant reduction of longevity (Fig. 3B). PomBase SPBC543.09 FYPO:0003820 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0001232 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000674 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001164 deletion 972 h- yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph 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prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph yta12 yta12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.09 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PMID:27966061 4896 2017-01-04 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000703 78-195 Not assayed or wild type 972 h- bag101 bag101-UBL partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.11c),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:27966061 4896 2017-01-04 PomBase SPBC1778.09 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1778.09 SPBC1778.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.09 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1778.09 SPBC1778.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1778.09 SPBC1778.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.09 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1778.09 SPBC1778.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mok12 mok12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mok12 mok12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mok12 mok12delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mok12 mok12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mok12 mok12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mok12 mok12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- mok12 mok12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mok12 mok12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- mok12 mok12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10087262 4896 2020-09-25 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mok12 mok12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0000082 G276R Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-G276R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 4D) PomBase SPBC1734.11 FYPO:0003157 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:24146635 4896 2014-03-03 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0004481 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29866182 4896 2018-06-18 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0008363 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 PMID:37446379 4896 2025-01-08 (Figure 7b) the absence of Mas5 also blocked the accumulation of Hsp104-GFP into NuRs (Figure 7b) PomBase SPBC1734.11 FYPO:0007300 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 PMID:32075773 4896 2020-03-22 (Fig. 2B, S2B-D) PomBase SPBC1734.11 FYPO:0007300 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000103 PMID:33225241 4896 2020-12-01 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002859 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0003228 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:33225241 4896 2021-01-28 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002348 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 PMID:32075773 4896 2020-03-27 (Fig. 3D) Lack of Mas5 abolishes both PAC formation and the assembly of stress granules. PomBase SPBC1734.11 FYPO:0001326 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0000291 PMID:24146635 4896 2014-03-03 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0002835 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000137 PMID:29866182 4896 2018-06-18 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0004862 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph mas5 mas5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0000082 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33946513 4896 2021-05-12 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0000082 deletion 972 h- mas5 mas5delta deletion ECO:0005638 PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mas5 mas5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1734.11 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- 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assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC3A12.14) PMID:38985524 4896 2024-07-29 We found that mNG-Cam1 could not localize to the SPB marked by Sad1-mCherry in pcp1-14 cells at the restrictive temperature (Figure 4D). PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000082 K846R,L1187P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:24937146 4896 2014-07-11 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000082 K846R,L1187P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38985524 4896 2024-07-29 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000835 K846R,L1187P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-14 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:24937146 4896 2014-07-11 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000835 K846R,L1187P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-14 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:24937146 4896 2015-08-10 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0002822 K846R,L1187P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:24937146 4896 2014-07-11 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0002061 K846R,L1187P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 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2017-12-25 normal processing, complements partially sde2Δ PomBase SPBC725.10 FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- tsp0 tsp0+ wild_type ECO:0005638 PMID:23640107 4896 2013-05-07 PomBase SPCC1183.10 FYPO:0001357 Wtf10 with aa (73-142) replaced by Wtf5 aa (73-142) tethered to a deubiquitinase using the GFP-GBP interaction Ectopic 972 h- wtf10 wtf10(73-142)-swap-wtf5(73-142)-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2025-01-07 (Fig. S6C) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 D332R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-D332R amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003107 D332R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-D332R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:33378677 4896 2021-10-24 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 trk2 trk2delta deletion ECO:0001232 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FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0002637 deletion 972 h- trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-14 (Figure 3C) PomBase SPAC1639.02c FYPO:0005947 deletion 972 h- trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:34349749 4896 2024-12-14 Nonetheless, we compared the growth of trk1delta and trk2delta with that of cfr1delta in the presence of high K+ concentrations. Additionally, we constructed double and triple mutants to determine whether cfr1+ acts in the same functional pathways as trk1+ and/or trk2+. The results showed that while cfr11 was sensitive to potassium salts, neither trk11, trk21 nor trk11 trk21 (denoted by trk11 in the figure) exhibited sensitivity (Figure 2A). PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000064 deletion 972 h- trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000095 deletion 972 h- trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph trk2 trk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1639.02c FYPO:0001719 deletion 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SPCC645.04 FYPO:0000703 A218G Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-A218G amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-sp1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-sp1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC16.03c FYPO:0001012 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura2 ura2- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005048 S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-7D Atf1.7D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-7D Atf1.7D amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:28652406 4896 2020-04-06 Strains expressing wild-type Atf1 or Atf1.7M or Atf1.7D mutants displayed the same patterns of tolerance to peroxides and activation of stress genes as the constitutive amino-terminally tagged versions (supplemental Fig S4, B and C). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-7D Atf1.7D amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000962 S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-7D Atf1.7D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28652406 4896 2020-05-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007382 S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-7D Atf1.7D amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:28652406 4896 2020-04-06 Atf1.7M-HA are constitutively bound to the gpd1 and hsp9 promoters both before and after stress PomBase SPAC607.10 FYPO:0000346 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo3 spo3-S3 unknown ECO:0001232 PMID:18397994 4896 2024-08-15 (Fig. 6A) PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0001101 deletion 972 h- trm9 trm9delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0001324 deletion 972 h- trm9 trm9delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0001116 deletion 972 h- trm9 trm9delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph trm9 trm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph trm9 trm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph trm9 trm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph trm9 trm9delta deletion ECO:0005638 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assayed or wild type 972 h- bpb1 bpb1-R128E,R130E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC962.06c),residue(S131,S133) PMID:26167880 4896 2024-07-04 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 501-1372 Overexpression 972 h- fus1delta fus1 fus1-N(1-500) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3D) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003527 501-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(1-500) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0001885 1-236,262-1401 Not assayed or wild type 972 h- wis4 wis4deltaCMiN partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0001645 1-236,262-1401 Not assayed or wild type 972 h- wis4 wis4deltaCMiN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 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FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F12.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F12.06c FYPO:0001491 deletion 972 h- SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC1F12.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC1F12.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F12.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F12.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1F12.06c SPAC1F12.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 E397L Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E397L nhe1-R3479L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0004142 5-59 Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-5-59 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(SO:0001851) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000825 5-59 Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-5-59 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Overexpression 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:28652406 4896 2020-04-06 allows stress-dependent activation of ctt1 and srx1 to the same extent as wild-type cells; however, it constitutively induces expression of gpd1 and hsp9 (Fig. 2A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Overexpression 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 allows stress-dependent activation of ctt1 and srx1 to the same extent as wild-type cells; however, it constitutively induces expression of gpd1 and hsp9 (Fig. 2A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000962 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Overexpression 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:28652406 4896 2020-04-06 Concomitantly, although expression of HA-Atf1.10M was not able to suppress the sensitivity to peroxides of strain Δatf1 (supplemental Fig. S1C and Fig. 1G), expression of HAAtf1.10D alleviated this phenotype (Fig. 1G). PomBase SPCC16C4.14c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc4 sfc4-hmt5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPCC16C4.14c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc4 sfc4-hmt5 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPCC16C4.14c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc4 sfc4-hmt5 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPCC16C4.14c FYPO:0003031 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc4 sfc4-hmt5 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPCC16C4.14c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc4 sfc4-hmt5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0005695 pcp1::pcp1-XTEN16-3×sAID:kanMX6 Knockdown 972 h- pcp1 pcp1-AID fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000437 PMID:37783794 4896 2023-10-05 Extended Data Fig. 5G PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0008126 pcp1::pcp1-XTEN16-3×sAID:kanMX6 Knockdown 972 h- pcp1 pcp1-AID fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:37783794 4896 2023-10-05 Extended Data Fig. B,C PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000276 pcp1::pcp1-XTEN16-3×sAID:kanMX6 Knockdown 972 h- pcp1 pcp1-AID fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000437 low PMID:37783794 4896 2023-10-05 Extended Data Fig. 5I PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0004429 pcp1::pcp1-XTEN16-3×sAID:kanMX6 Knockdown 972 h- pcp1 pcp1-AID fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000437 PMID:37783794 4896 2023-10-05 Extended Data Fig. 5G PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0006174 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Figure 1A) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0003186 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12) PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Figure S2) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0002638 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 3) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0003307 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 3) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0005411 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0001232 33 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 3) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0002061 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Figure S1) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0007123 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 high PMID:31615768 4896 2019-10-24 (Figure 1E) PomBase SPAC3G9.12 FYPO:0003241 L797P Not assayed or wild type 972 h- peg1 cls1-28 peg1-104 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 85 PMID:31615768 4896 2019-10-24 (Fig. 3a) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 high PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC660.13c FYPO:0000095 L35Q,P39T,N56I,G142V Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-19 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000277 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000268 L35Q,P39T,N56I,G142V Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-19 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000315 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPAP8A3.09c FYPO:0001876 L566P Not assayed or wild type 972 h- paa1 paa1-L566P amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPAP8A3.09c FYPO:0001876 L566P Not assayed or wild type 972 h- paa1 paa1-L566P amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0002679 S192A Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1-S192A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_substrate(PomBase:SPCC24B10.14c) PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0000783 D1767A,E1779V Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-D1767A,E1779V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9635190 4896 2016-04-05 (Fig. 5) PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- pfl8 fta5+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 3) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001529 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. 4B) PomBase SPCC645.07 FYPO:0006776 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 3E) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001324 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 3H) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000929 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. 3F) PomBase SPCC645.07 FYPO:0005798 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1223.06) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. S1D) PomBase SPCC645.07 FYPO:0005798 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. 4A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001645 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01),assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 4C) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002848 772-1003 Knockdown 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 60 PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. 4E) PomBase SPBC713.02c FYPO:0005678 wild type Overexpression 972 h- ubp15 ubp15+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044777) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0005678 wild type Overexpression 972 h- ubp15 ubp15+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000049732) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPBC1718.04 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sct1 sct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sct1 sct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- sct1 sct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1718.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sct1 sct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000088 S322D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-S322D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0001038 1-958 Overexpression 972 h- wis4 wis4-deltaN1-958 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9321395 4896 2019-10-26 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002377 1-958 Overexpression 972 h- wis4 wis4-deltaN1-958 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9321395 4896 2019-10-26 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002128 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004250 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001575 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001575 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000046 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000250 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0010009 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Whereas Cat1-GFP was present at the cell surface in wild-type cells, it was localized to intracellular punctate structures in Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 3B, EMM). PomBase SPBC337.13c FYPO:0004457 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr2 cells and Δgtr1 cells, the nuclear localization of Gaf1-YFP was not observed within 30 min after nitrogen depletion. Although a subset of these mutant cells showed the nuclear locali- zation of Gaf1-YFP at 60 and 120 min, its nuclear localization appeared to be partial, compared with wild-type cells (Fig 4C). PomBase SPBC337.13c FYPO:0004457 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004780 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001838 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:22344254 4896 2021-02-07 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001117 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr2 cells and Δgtr1 cells, the mRNA level of isp5+ was decreased, compared with wild- type cells (Fig 4A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001117 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 we generated new strains of Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, and found that these mutant cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates, similarly to Δlam2 cells (Fig 1A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 we generated new strains of Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, and found that these mutant cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates, similarly to Δlam2 cells (Fig 1A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 we generated new strains of Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, and found that these mutant cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates, similarly to Δlam2 cells (Fig 1A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Exogenous addition of arginine to the EMM plates enhanced the cell growth of Δlam2 cells, Δgtr2 cells, Δgtr1 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells as well as wild-type cells, but did not rescue the defective cell growth of these mutant cells to the level of wild-type cells (S5 Fig). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2D) PomBase SPBC337.13c FYPO:0006345 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001043 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:31641022 4896 2019-12-16 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells showed increased Rps6 phosphorylation under nitrogen depletion, compared with wild-type cells, especially at 15 min (Fig 5). PomBase SPBC337.13c FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells showed increased Rps6 phosphorylation under nitrogen depletion, compared with wild-type cells, especially at 15 min (Fig 5). PomBase SPBC337.13c FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001038 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.02c) PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, the mRNA level of cat1+ was increased compared with wild-type cells (Fig 3A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC337.13c FYPO:0003031 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1B, 1C) respectively Gtr2, and in particular Gtr1, inhibit sexual differentiation in rich medium. PomBase SPBC337.13c FYPO:0001522 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001545 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 The canava- nine resistance of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells was completely canceled by Torin1 treatment (Fig 3E, canavanine + Torin). PomBase SPBC337.13c FYPO:0002672 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0008372 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 These intracellular punctate structures were abolished upon TORC1 inhibition by the com- bined treatment of rapamycin and caffeine (Fig 3B, Rapamycin + caffeine) PomBase SPBC337.13c FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.17) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.05c) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC222.19) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23D3.16) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A7.11) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC337.13c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δlam2 cells, tetO7-lam2 cells, Δgtr2 cells, tetO7-gtr2 cells and Δgtr1 cells showed canavanine resistance (Fig 3D). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 The canavanine resistance of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells was partially canceled by rapamycin treatment (Fig 3E, canavanine + Rapamy- cin). PomBase SPBC337.13c FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001453 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000099 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000111 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1A) Loss of Gtr1 or Gtr2 resulted in the inability of the cells to grow properly, and they divided with a doubling time longer than that of wild-type cells PomBase SPBC337.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- leu1-32 gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000226 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1A) Loss of Gtr1 or Gtr2 resulted in the inability of the cells to grow properly, and they divided with a doubling time longer than that of wild-type cells PomBase SPBC337.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- gtr1 gtr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000272 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1A) Loss of Gtr1 or Gtr2 resulted in the inability of the cells to grow properly, and they divided with a doubling time longer than that of wild-type cells PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.07c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBPB2B2.07c SPBPB2B2.07cdelta deletion 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PomBase SPBC106.19 FYPO:0003730 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC737.02c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.18) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.04) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC338.10c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.08c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.08) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC16H5.06) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005826 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC1739.09c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0001117 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0001919 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0001232 high PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 2A) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005760 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0002006 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003004 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 3C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0000377 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-01 PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.01) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC1742.01) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC977.07c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.06) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC947.04) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC359.04c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005505 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAPB15E9.01c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 4, Table 3) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC947.05c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.03c) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.03) PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Table 2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005420 disruption Null 972 h- ppr10 ppr10::KanMX6 disruption ECO:0000291 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972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 76 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 2) PomBase SPAC630.08c FYPO:0004738 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 70 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 6C) PomBase SPAC630.08c FYPO:0004738 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000356,FYECO:0000381 45 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 6C) PomBase SPAC630.08c FYPO:0000805 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 80 assayed_protein(PomBase:SPAC630.08c) PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. S1E, S1F) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 75 assayed_protein(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 2) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 4A) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 4B) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 4C) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 5A) PomBase SPAC630.08c FYPO:0007677 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 1C) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002318 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 high PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 1D) PomBase SPAC630.08c FYPO:0002318 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000356,FYECO:0000381 high PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. S6) PomBase SPAC630.08c FYPO:0003210 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 85 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 1) PomBase SPAC630.08c FYPO:0003210 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381,FYECO:0000450 10 PMID:31217286 4896 2024-03-22 Phenotype of Erg25 overexpression is suppressed by Erg11 inhibition. Fig. 1E PomBase SPAC630.08c FYPO:0008169 wild type Overexpression 972 h- erg25 erg25+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000964 SV40\NLS-swi6 Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6+SV40NLS fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPCC550.14 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC550.14 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0001387 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Figure 4) PomBase SPCC550.14 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC550.14 FYPO:0001383 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005580 complete PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Fig. 1) PomBase SPCC550.14 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC550.14 FYPO:0001487 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Figure 8A and B) PomBase SPCC550.14 FYPO:0002350 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Fig. 6c) PomBase SPCC550.14 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0004325 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC550.14 FYPO:0005488 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Fig. 5e) PomBase SPCC550.14 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vgl1 vgl1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC550.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0003559 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 low PMID:22172946 4896 2016-10-27 (Fig. 1a) PomBase SPCC550.14 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPCC550.14 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC550.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vgl1 vgl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0005638 PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Fig. 1) PomBase SPCC550.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vgl1 vgl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- vgl1 vgl1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:20547592 4896 2016-10-27 (Fig. 1) PomBase SPCC970.08 FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kcs1 kcs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- kcs1 kcs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC970.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kcs1 kcs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 R262A,R264A Not assayed or wild type 972 h- vtc4 vtc4-R262A,R264A vtc4-R262A-R264A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.04c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Fig. 2) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 R262A,R264A Not assayed or wild type 972 h- vtc4 vtc4-R262A,R264A vtc4-R262A-R264A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Fig. 2) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 R262A,R264A Not assayed or wild type 972 h- vtc4 vtc4-R262A,R264A vtc4-R262A-R264A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.06) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Fig. 2) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001357 R262A,R264A Not assayed or wild type 972 h- vtc4 vtc4-R262A,R264A vtc4-R262A-R264A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. S4) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007820 R262A,R264A Not assayed or wild type 972 h- vtc4 vtc4-R262A,R264A vtc4-R262A-R264A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. S6) PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 1-521,553-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-552) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000705 1-521,553-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-552) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000705 1-521,553-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-552) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0007447 1-521,553-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-552) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000703 1-521,553-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-552) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0004585 msh2::his3 972 h- msh2 msh2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:9858548 4896 2018-07-13 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0006568 msh2::his3 972 h- msh2 msh2::his3 disruption ECO:0000059 PMID:9858548 4896 2018-07-13 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000581 msh2::his3 972 h- msh2 msh2::his3 disruption ECO:0005638 PMID:9858548 4896 2018-07-13 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0006622 msh2::his3 972 h- msh2 msh2::his3 disruption ECO:0000059 PMID:9858548 4896 2018-07-13 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000256 msh2::his3 972 h- msh2 msh2::his3 disruption ECO:0000059 PMID:9858548 4896 2018-07-13 PomBase SPBC17D11.04c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nto1 nto1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC17D11.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph 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tpz1 tpz1-L449R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:25330395 4896 2014-11-09 Tpz1-L449R disrupts interaction with Ccq1 but retain interactions with Pot1 and Poz1 based on co-IP experiments. In combination with poz1 deletion, telomeres become unprotected and cells survive by circularizing chromosomes. Telomerase cannot be recruited to telomeres since Rad3/Tel1-dependent phosphorylation of Ccq1 Thr93, essential for promoting Ccq1-Est1 interaction and telomerase recruitment, is eliminated by tpz1-L449R. PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003106 L449R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-L449R amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000102 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0001492 L449R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-L449R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001343 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0000049 PMID:21725325 4896 2012-02-24 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002835 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0000291 PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000082 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0005638 PMID:21725325 4896 2011-08-10 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002834 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0005638 PMID:21725325 4896 2011-08-10 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0003096 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0000226 PMID:21725325 4896 2012-02-24 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002909 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1071.02) PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002909 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC970.07c) PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001645 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1071.02),assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001645 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c),assayed_using(PomBase:SPCC970.07c) PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004982 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0000291 PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000268 unknown 972 h- cdc20 cdc20-P7 unknown ECO:0005638 PMID:21725325 4896 2011-08-11 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 P329A Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-A6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0006141 deletion 972 h- cox8 cox8delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0007618 deletion 972 h- cox8 cox8delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0007612 deletion 972 h- cox8 cox8delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.16c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph cox8 cox8delta deletion ECO:0005638 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tnr3 tnr3-D460N tnr3-Asp460Asn amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0001234 D460N Not assayed or wild type 972 h- tnr3 tnr3-D460N tnr3-Asp460Asn amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0005934 A129V Not assayed or wild type 972 h- hus5 hus5.62 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:11600706 4896 2017-07-21 (Figure 1C) PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0003165 A129V Not assayed or wild type 972 h- hus5 hus5.62 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:9092625 4896 2014-05-13 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002775 A129V Not assayed or wild type 972 h- hus5 hus5.62 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12597774 4896 2013-10-11 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002778 A129V Not assayed or wild type 972 h- hus5 hus5.62 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.10) PMID:12597774 4896 2013-10-11 PomBase SPAC30D11.13 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or wild type 972 h- hus5 hus5.62 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7768995 4896 2014-05-19 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0001492 A129V Not assayed or wild type 972 h- hus5 hus5.62 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12597774 4896 2013-10-11 PomBase SPAC1399.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1399.01c SPAC1399.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1399.01c SPAC1399.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1399.01c SPAC1399.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.01c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1399.01c SPAC1399.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002969 1-260 Overexpression 972 h- ppc89 ppc89-M+C(261-783) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:38985524 4896 2024-07-29 The Sid4 C-terminus interacts with the Ppc89 C-terminus (Rosenberg et al., 2006). Sid4- mCherry colocalized with endogenous Ppc89-GFP when FL or M+C were overexpressed, both forming enlarged SPBs (Figure 2). This is consistent with the idea that as additional Ppc89 C-termini becomes available at the SPB, more Sid4 can interact and localize there. PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002969 1-260 Overexpression 972 h- ppc89 ppc89-M+C(261-783) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:38985524 4896 2024-07-29 Similarly, we would expect overexpressed GFP-M+C to bind endogenous Pcp89 at the SPB to form larger SPBs and this was also observed (Supplemental Figure S1B). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 1-260 Overexpression 972 h- ppc89 ppc89-M+C(261-783) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38985524 4896 2024-07-29 (Figure 1B) PomBase SPBC336.01 FYPO:0007101 D485N Not assayed or wild type 972 h- fbh1 fbh1-D485N amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22292001 4896 2019-10-11 PomBase SPBC336.01 FYPO:0001407 D485N Not assayed or wild type 972 h- fbh1 fbh1-D485N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:22292001 4896 2019-10-11 PomBase SPBC336.01 FYPO:0000085 D485N Not assayed or wild type 972 h- fbh1 fbh1-D485N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22292001 4896 2019-10-11 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 L641P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-L641P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:30914423 4896 2019-05-17 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0003641 wild type Overexpression 972 h- adk1 adk1+ wild_type ECO:0005801 PMID:8496185 4896 2014-08-04 PomBase 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vac8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vac8 vac8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0006326 G2A Not assayed or wild type 972 h- arf6 arf6-G2A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:34958661 4896 2022-06-30 The resulting arf6 alleles reduced node localization and instead enriched at the cytoplasm (Fig. S2, H and I) PomBase SPCC1020.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mmt1 mmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- mmt1 mmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmt1 mmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmt1 mmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0002269 unknown Not assayed or wild type 972 h- gln1 gln1-45 unknown ECO:0005801 PMID:2900077 4896 2013-06-13 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0002271 unknown Not assayed or wild type 972 h- gln1 gln1-45 unknown ECO:0005638 PMID:2900077 4896 2013-06-13 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0001018 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0001232 PMID:19431238 4896 2012-06-22 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0007139 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:34958661 4896 2022-06-30 Further, Arf6 localization to nodes was lost upon deletion of its GEF Syt22 (Fig. 2 G PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0002033 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:34958661 4896 2022-06-30 The slower-migrating, hyperphosphorylated form of Wee1 was lost in arf6Δ and syt22Δ, similar to cdr2Δ (Fig. 1 H). We conclude that activated Arf6 functions in the Cdr2 pathway to control cell size at division through inhibition of Wee1. PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0001019 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0001232 PMID:19431238 4896 2012-06-22 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000899 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0001232 PMID:19431238 4896 2012-04-26 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000644 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.08) PMID:19431238 4896 2012-04-26 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000644 deletion 972 h- syt22 syt22delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21D10.05c) PMID:21107719 4896 2012-04-26 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph syt22 syt22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.11c 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prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph sxa2 sxa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- sxa2 sxa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sxa2 sxa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sxa2 sxa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004492 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0000186) PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000502 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 PMID:18344406 4896 2024-01-21 Wild-type cells showed a peak of septation approximately 80 min after release, whereas the hst4Δ cells showed a delayed peak of septation at 120 min (see Fig. S2 in the supplemental material). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000080 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003217 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000291 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003217 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003411 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000291 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003411 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003411 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003412 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000291 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003412 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004604 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000291 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004604 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004491 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000226 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002902 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC126.02c) PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figure 6E) H3K56 acetylation antagonizes Tf clustering at centromeres. binding of Ku was reduced and enhanced in hst4Δ and rtt109Δ cells, respectively PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002902 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC543.03c) PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figure 6E). H3K56 acetylation antagonizes Tf clustering at centromeres. binding of Ku was reduced and enhanced in hst4Δ and rtt109Δ cells, respectivelyWe examined how H3K56 acetylation antagonizes Tf clustering at centromeres. Remarkably, binding of Ku was reduced and enhanced in hst4Δ and rtt109Δ cells, respectively, suggesting that H3K56 acetylation has an inhibitory effect on Ku binding to Tf elements (Figure 6E). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0005545 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figures 6A, 6B) PomBase SPAC1783.04c FYPO:0007270 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figures 6A, 6B) hst4Δ and clr6-1 HDAC mutations, but not other HDAC mutations, significantly compromised Tf clustering and the association of Tf cluster with centromeres; Figures 6A and 6B) PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34608864 4896 2021-11-05 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004928 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 PMID:18344406 4896 2024-01-21 Our fluorescence microscopic analysis also clearly indicated that a significant percentage of the hst4Δ cells in culture had fragmented DNA (see Fig. S1 in the supplemental material). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0008162 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 PMID:18344406 4896 2024-01-21 In cells lacking Hst4, Chk1 was phosphorylated even in the absence of MMS exposure, and this phosphorylation did not significantly increase upon exposure to MMS (Fig. 2B). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0008270 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000112 PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 2A) PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000332 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000059 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004489 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000291 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001861 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000340 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000239 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0004672 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 33 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0007142 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 high PMID:18344406 4896 2024-01-21 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hst4 hst4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001925 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 PMID:18344406 4896 2024-01-21 hst4Δ cells behaved as wild-type cells did and were able to survive exposure to gamma irradiation (Fig. 1C). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002336 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000291 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hst4 hst4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000963 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 PMID:18344406 4896 2024-01-21 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0010017 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000112 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 4A) PomBase SPAC1783.04c FYPO:0008160 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000226 PMID:18344406 4896 2024-01-21 The hst4Δ mutant did not show significant changes in the acetylation levels of histone H3 K9 or K14 and histone H4 K16 compared to the wild-type control (Fig. 4A). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003223 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000226 PMID:18344406 4896 2024-01-21 The hst4 mutant did not show significant changes in the acetylation levels of histone H3 K9 or K14 and histone H4 K16 compared to the wild-type control (Fig. 4A). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0008161 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0000226 PMID:18344406 4896 2024-01-21 The hst4Δ mutant did not show significant changes in the acetylation levels of histone H3 K9 or K14 and histone H4 K16 compared to the wild-type control (Fig. 4A). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000085 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 high PMID:18344406 4896 2024-01-21 Interestingly, hst4Δ cells were sensitive to MMS and CPT (Fig. 1A) PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 high PMID:18344406 4896 2024-01-21 Interestingly, hst4Δ cells were sensitive to MMS and CPT (Fig. 1A) PomBase SPAC1783.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000268 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 low PMID:18344406 4896 2024-01-21 (Fig. 1B). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000268 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001234 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0005638 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0003481 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 PMID:18344406 4896 2024-01-21 Like hst4Δ cells, both histone H3 mutant cells were very elongated, and a percentage of these cells exhibited abnormal DAPI staining (Fig. 7A). PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- hst4 hst4delta deletion ECO:0001232 PMID:10512858 4896 2015-05-19 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0003849 deletion 972 h- pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0003852 deletion 972 h- pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0000979 deletion 972 h- pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0003851 deletion 972 h- pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0003850 deletion 972 h- pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0003719 deletion 972 h- pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21297349 4896 2014-08-19 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pdr1 pdr1delta deletion ECO:0005638 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2025-04-17 (Fig. 4D) PomBase SPAC821.12 FYPO:0006746 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 PMID:29689193 4896 2018-11-08 (Figure 2F) PomBase SPAC821.12 FYPO:0002557 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002557 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005638 FYECO:0000229 high PMID:38442865 4896 2024-05-31 (Fig. 1D) PomBase SPAC821.12 FYPO:0002021 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002021 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPAC821.12 FYPO:0001949 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:36200871 4896 2023-02-02 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17317928 4896 2017-08-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000650 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000650 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC821.12 FYPO:0007390 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000227 high PMID:18495844 4896 2020-04-16 (Fig. 3B) PomBase SPAC821.12 FYPO:0002187 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002401 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:38442865 4896 2024-05-29 (Fig. S1E and F) PomBase SPAC821.12 FYPO:0007388 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000227 high PMID:18495844 4896 2020-04-16 (Fig. 3B, C) As expected, the range of SPB trajectory angles was much wider than in wild-type cells (Fig. 2C, Fig. 3B,C PomBase SPAC821.12 FYPO:0000012 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:12234926 4896 2017-08-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000012 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:12234926 4896 2017-08-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0001221 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17998401 4896 2012-07-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0003076 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0000279 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002442 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002558 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002967 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0003330 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC821.12 FYPO:0008003 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC821.12 FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005638 FYECO:0000227 high PMID:38442865 4896 2024-05-29 (Fig. S1) PomBase SPAC821.12 FYPO:0000021 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000228 18 PMID:12646585 4896 2017-08-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000021 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000024 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000024 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC821.12 FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 PMID:25422470 4896 2016-10-28 PomBase SPAC821.12 FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPAC821.12 FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9636183 4896 2016-03-07 PomBase SPAC821.12 FYPO:0001491 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC926.04c FYPO:0002061 E34A Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-E34A hsp90-EA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37120429 4896 2023-05-11 Sz. pombe cells expressing SpHsp90-EA had an osmolyte-remediated temperature sensitivity phenotype, which strongly suggested conservation of EA-specific phenotypes (Fig. 3b). PomBase SPAC926.04c FYPO:0001357 E34A Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-E34A hsp90-EA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000025 PMID:37120429 4896 2023-05-11 Sz. pombe cells expressing SpHsp90-EA had an osmolyte-remediated temperature sensitivity phenotype, which strongly suggested conservation of EA-specific phenotypes (Fig. 3b). PomBase SPAC926.04c FYPO:0002060 E34A Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-E34A hsp90-EA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37120429 4896 2023-05-11 Using this system, we observed that SpHsp90-EA supported viability of Sz. pombe cells (Fig. 1b). PomBase SPAC9E9.05 FYPO:0001355 V302A Not assayed or wild type 972 h- sor1 sor1-V302A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38830897 4896 2024-11-12 Mutating three other conserved residues in the Sororin domain of Sor1 (F299A, V302A and Y305A) resulted in a similar phenotype (Fig. 2e). PomBase SPCC1281.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ole1 ole1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- ole1 ole1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1281.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ole1 ole1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000303 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000708 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002134 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:28765164 4896 2017-10-13 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002134 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:28765164 4896 2017-10-13 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002134 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:28765164 4896 2017-10-13 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000584 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000838 R351E Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-R351E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:28765164 4896 2017-10-13 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0005547 2-318 Not assayed or wild type 972 h- vps3844 vps3844-delta2-318 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:39477503 4896 2024-11-08 1 showed that the signal peptide and the transmembrane including DUF3844 domain were 2 essential for this function (Fig. 4A). PomBase SPBC902.05c FYPO:0008022 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 PMID:7903653 4896 2022-10-27 PomBase SPBC902.05c FYPO:0008023 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 PMID:7903653 4896 2022-10-27 PomBase SPBC902.05c FYPO:0008021 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 high PMID:7903653 4896 2022-10-27 PomBase SPBC902.05c FYPO:0000249 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 PMID:7903653 4896 2022-09-19 PomBase SPBC902.05c FYPO:0005877 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBC902.05c FYPO:0005877 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 PMID:7903653 4896 2022-09-19 PomBase SPBC902.05c FYPO:0008018 unknown Not assayed or wild type 972 h- idh2 glu2- unknown ECO:0005638 PMID:7903653 4896 2022-10-27 PomBase SPAC29E6.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC29E6.06c SPAC29E6.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29E6.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- SPAC29E6.06c SPAC29E6.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29E6.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC29E6.06c SPAC29E6.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9E9.05 FYPO:0001355 Y305A Not assayed or wild type 972 h- sor1 sor1-Y305A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38830897 4896 2024-11-12 Mutating three other conserved residues in the Sororin domain of Sor1 (F299A, V302A and Y305A) resulted in a similar phenotype (Fig. 2e). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002159 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005801 FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:22891259 4896 2014-03-11 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001968 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005801 FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001084 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005801 PMID:9401022 4896 2012-06-12 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001089 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005801 FYECO:0000115 PMID:9401022 4896 2012-06-12 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001494 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0001232 FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22891259 4896 2014-03-11 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001078 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005801 PMID:9401022 4896 2012-06-12 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001079 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005801 PMID:9401022 4896 2012-06-12 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001075 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:9401022 4896 2012-06-12 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001075 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000034,FYECO:0000137 PMID:9401022 4896 2012-06-12 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002442 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001587 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002967 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001190 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001823 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:1524835 4896 2012-11-30 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000101 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:1524835 4896 2012-11-30 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001824 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-12 bgs1-12 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:1524835 4896 2012-11-30 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000703 297-367 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1deltaP1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.05c),assayed_using(PomBase:SPCC306.09c) PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-244,536-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-244,536-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001779 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23166349 4896 2012-12-11 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001791 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:28619713 4896 2018-01-18 (Fig. 6C) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0000941 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:25253718 4896 2015-05-15 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002772 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 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A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 38 PMID:28619713 4896 2018-01-18 (Fig. 6C) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001221 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31015410 4896 2019-05-28 (Fig. 1 supp data) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001221 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:31015410 4896 2019-05-28 (Fig. 1 supp data) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0000732 A323V Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.1 sad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:7744953 4896 2013-12-19 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0000708 C(-95)A Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-10 nft-10|nft-205 nucleotide_mutation ECO:0001232 low PMID:15189983 4896 2022-11-09 For cgs1-1 mutant cells, pregrowth on YEA medium results in a nearly 100- fold loss of mating efficiency, as expected. More surprisingly, we found that pregrowth of the cgs1-1 strain on PM medium reduces the mating efficiency defect to only fourfold (Table 2). PomBase SPBC119.02 FYPO:0001910 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC947.10) PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC119.02 FYPO:0003585 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPBC119.02 FYPO:0003585 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPBC119.02 FYPO:0000082 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:21324894 4896 2012-03-12 PomBase SPBC119.02 FYPO:0006810 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:34292936 4896 2021-07-30 PomBase SPBC119.02 FYPO:0004198 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:12724408 4896 2014-12-01 PomBase SPBC119.02 FYPO:0003935 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1486.02c) PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC119.02 FYPO:0004102 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:12724408 4896 2014-12-01 PomBase SPBC119.02 FYPO:0001422 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPBC119.02 FYPO:0001740 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000059 low PMID:34292936 4896 2021-07-30 PomBase SPBC119.02 FYPO:0003594 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:23442800 4896 2014-07-24 PomBase SPBC119.02 FYPO:0002448 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC119.02 FYPO:0001357 P61S Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-P61S ubc4t|ubcP1-P61S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:21324894 4896 2012-03-12 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 L389P Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-L389P amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 KRK298AAA Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P4 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) 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gpd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000703 773-2386 Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3(1-772) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.05),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPCC790.03 FYPO:0000835 G246R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G246R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PR:000046672),assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 8) PomBase SPCC790.03 FYPO:0001422 G246R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G246R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-09-30 (Fig. 8C, 8D) Western blot analysis show Sre1 cleavage defect under low oxygen PomBase SPCC790.03 FYPO:0001645 G246R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G246R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1565.08),assayed_using(PomBase:SPCC790.03) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 7A, lanes 4-6) PomBase SPCC790.03 FYPO:0001245 G246R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G246R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 8A) PomBase SPCC550.13 FYPO:0000274 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:31000521 4896 2020-03-03 (Fig. 2C) PomBase SPCC550.13 FYPO:0001740 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 high PMID:31000521 4896 2020-02-18 (Fig. 7) PomBase SPCC550.13 FYPO:0004742 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31000521 4896 2020-02-19 (Fig. 7B) PomBase SPCC550.13 FYPO:0004742 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31000521 4896 2020-02-19 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004310 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:31000521 4896 2020-02-18 Rad21 locates to centromere in dfp1-3A mutants. PomBase SPCC550.13 FYPO:0001839 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:31000521 4896 2020-02-20 PomBase SPCC550.13 FYPO:0002574 P448A,V450A,I452A Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31000521 4896 2020-03-03 (Fig. 5C) PomBase SPBC1539.04 FYPO:0003778 83-193 Not assayed or wild type 972 h- tts1 tts1-2TM-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.04) PMID:25103238 4896 2014-09-03 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002699 1-122 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1deltaCH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001214 1-122 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1deltaCH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPCC1620.02 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(Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC23G7.13c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPB24D3.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1289.14) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC2E1P3.05c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.04c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.03c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC757.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1861.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.12c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC15E1.02c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 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ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.08c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC5H10.03) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC584.16c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC548.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.06) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.18) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.02) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.14) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.08) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.17) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB21E7.04c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.01) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1739.08c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.12c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4H10.10) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1A6.04c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC56F2.06) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC4H3.03c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC17A2.11) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.03c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB21E7.11) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPB8E5.05) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1348.14c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.10c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001357 D996A,E997A Not assayed or wild type 972 h- snf22 snf22-D996A-E997A snf22-STF6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 3A, 4A) PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003467 T8C Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-T8C nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:1617727 4896 2014-06-27 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0001355 T8C Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-T8C nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:1617727 4896 2014-06-20 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004201 E23V,V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V,V24M amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 E23V,V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V,V24M amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19362535 4896 2024-02-13 Interestingly, cells expressing most of the mutant alleles of chp1 showed no defect in heterochromatin assembly as measured in this assay (Figure 3A), with the exception of the double mutant E23V V24M and the V24R chp1 mutant, which did show silencing defects. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008195 E23V,V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V,V24M amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:19362535 4896 2024-02-13 A third class showed a more profound reduction in binding affinity: the E23V,V24M mutant reduced binding affinity 40 fold PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 E23V,V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V,V24M amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 E23V,V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V,V24M amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003066 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003378 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 ~65 PMID:14972679 4896 2021-02-15 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003379 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 30 PMID:14972679 4896 2021-02-15 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000476 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000581 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003611 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003614 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000488 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003613 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000678 D369R,D370R,R373E,E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RDRD separase-refractory amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 Q110E Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-Q110E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000611 H350L,V523A Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U05 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000839 H350L,V523A Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U05 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0002061 H350L,V523A Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U05 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0001357 H350L,V523A Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U05 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0003957 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0000059 PMID:10611485 4896 2014-10-21 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0003957 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0000059 PMID:37805140 4896 2023-10-23 the D201A mutant showed the same lack of modification of nuclear- and mitochondrial-encoded tRNAs as trm1∆ cells transformed with an empty vector, despite similar levels of protein accumulation as the wild type overexpressed isoform (Figure 1D). PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0004529 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0000059 PMID:37805140 4896 2023-10-23 pulse labeling revealed no defects in mitochondrial translation upon Trm1 deletion (Figure S1) PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0000590 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0000059 PMID:10611485 4896 2014-10-21 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0006253 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:28977649 4896 2017-10-25 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0006253 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:28977649 4896 2017-10-25 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:28977649 4896 2017-10-25 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:28977649 4896 2017-10-25 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0005638 PMID:10611485 4896 2014-10-21 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm1 trm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- trm1 trm1delta deletion ECO:0001232 PMID:10611485 4896 2014-10-21 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm1 trm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001874 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 5) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000168 deletion 972 h- nda- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004953 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 4) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004953 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.06c) PMID:20980623 4896 2020-02-11 several types of defects in FSM development in dma1+ cells (Figure 6B). These defects roughly fell into three classes: (1) initially FSM formation was normal and appeared as sphere structure, but subsequently it became smaller or collapsed (asterisks in Figure 6B); (2) crescent-shaped structures did not properly develop into cup-like structures (open arrows in Figure 6B); and (3) crescent-shaped structures broke into multiple GFP-Psy1- contaning structures which could not develop into round mature FSMs (arrows in Figure 6B). PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000117 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003066 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 60 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2A) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003066 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 ~75-80 PMID:20980623 4896 2020-02-11 (Figure 3B,4B) the initiation of spore formation was delayed for +2 h compared with wild-type cells, and also the efficiency of spore formation was dramatically dropped with only +60% of cells containing spores PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004077 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 8 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2A) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000681 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 17 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2A) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004318 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000059 PMID:34674264 4896 2022-04-08 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0008404 deletion 972 h- pat1-114 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.06c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 7B) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000912 deletion 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:34674264 4896 2022-01-12 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005781 deletion 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Fig. 1A) I'm modelling this as decreased because nda3 is providing microtubule damage. Checkpoint would be expected to be o in WT in this scenario. cells failed to maintain the microtubule damage-induced checkpoint arrest and began to aberrantly form septa PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001382 deletion 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005801 FYECO:0000079 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Fig. 6) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006531 deletion 972 h- pat1-114 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 6A) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006531 deletion 972 h- pat1-114 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 6B) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006531 deletion 972 h- pat1-114 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 6C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000587 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:20980623 4896 2020-02-11 the initiation of spore formation was delayed for +2 h compared with wild-type cells, and also the efficiency of spore formation was dramatically dropped with only +60% of cells containing spores (Figure 3B). PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0008033 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000170 medium PMID:36138017 4896 2022-10-04 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005414 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.06c) PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 6) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001571 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.12),assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01) PMID:36138017 4896 2022-11-08 More interestingly, in the presence of HU, the binding between Tea4 and Tip1 was elevated in dma1Δ cells and in wild-type cells treated with deubiquitinating enzyme USP2 to remove Tip1 ubiquitination (Fig. 4f), this is consistent with increased polar growth in dma1Δ cells (Fig. 4b). PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004537 deletion 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:24055157 4896 2022-09-28 cells bypassed the arrest after 5 hrs (Figure 2C). PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003563 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:20980623 4896 2020-02-11 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003798 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 PMID:20980623 4896 2020-02-11 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0007245 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.06c) PMID:20980623 4896 2020-02-11 Supplemental Figure S3 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0007170 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 99 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2B) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003541 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.06c) PMID:20980623 4896 2020-02-11 Supplemental Figure S3 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006055 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 5) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006055 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 5) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006055 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 5) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002966 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.02c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002965 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.02c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006824 deletion 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Fig. 1B) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006824 deletion 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Fig. 5) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dma1 dma1delta dma1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004550 T412A,S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A,S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 1) PomBase SPAC664.07c FYPO:0002098 T412A,S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A,S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T328) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c 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PomBase SPAC222.14c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0007448 deletion 972 h- sey1 sey1delta deletion ECO:0000112 PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sey1 sey1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.14c FYPO:0003182 deletion 972 h- sey1 sey1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:36650056 4896 2023-02-06 PomBase SPAC222.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- sey1 sey1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC222.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sey1 sey1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC222.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sey1 sey1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.02 FYPO:0000927 1-298 Overexpression 972 h- num1 mcp5deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16585273 4896 2019-11-19 (Fig. 4E) PomBase SPBC216.02 FYPO:0007171 1-298 Overexpression 972 h- num1 mcp5deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16585273 4896 2019-11-19 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP brr6 brr6+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC4F10.15c FYPO:0006116 wild type Knockdown 972 h- wsp1 wsp1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC4F10.15c FYPO:0002561 wild type Knockdown 972 h- wsp1 wsp1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC4F10.15c FYPO:0001357 wild type Knockdown 972 h- wsp1 wsp1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC4F10.15c FYPO:0002177 wild type Knockdown 972 h- wsp1 wsp1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001252 577-710 Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2deltaC577 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:37723847 4896 2023-10-15 Although C-terminal deleted cells (mCh-pkd2ΔC) did not affect to the growth under the normal condition, the strain was hypersensitive to CaCl2 (Figure 3c) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000644 577-710 Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2deltaC577 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.03) PMID:37723847 4896 2023-10-15 Localizations of Pkd2ΔN170, Pkd2ΔC577, or Pkd2TM were identical to full length Pkd2 (Figures 2b and S2A). PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000783 577-710 Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2deltaC577 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.03) PMID:37723847 4896 2023-10-15 whereas C-terminus of Pkd2 (Pkd2C) displayed a uniform cytoplasmic pattern (Figures 2b and S2A). PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000098 577-710 Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2deltaC577 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:37723847 4896 2023-10-15 Although C-terminal deleted cells (mCh-pkd2ΔC) did not affect to the growth under the normal condition, the strain was hypersensitive to CaCl2 (Figure 3c) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002060 577-710 Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2deltaC577 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:37723847 4896 2023-10-15 (Figure 3b) PomBase SPAC7D4.15c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost4 ost4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC7D4.15c FYPO:0002482 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost4 ost4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC7D4.15c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost4 ost4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC7D4.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- ost4 ost4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC7D4.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost4 ost4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000513 1266-4196 Not assayed or wild type 972 h- dhc1 dhc1(1-1266) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:25869666 4896 2022-05-16 (Fig. 4) PomBase SPAC31A2.11c FYPO:0000705 L349A,L352A,I355A,L358A Not assayed or wild type 972 h- cuf1 cuf1-NESmut2 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1805.17),assayed_using(PomBase:SPAC31A2.11c) PMID:17384198 4896 2015-05-12 PomBase SPAC31A2.11c FYPO:0004647 L349A,L352A,I355A,L358A Not assayed or wild type 972 h- cuf1 cuf1-NESmut2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1393.10) PMID:17384198 4896 2015-05-12 PomBase SPAC31A2.11c FYPO:0002073 L349A,L352A,I355A,L358A Not assayed or wild type 972 h- cuf1 cuf1-NESmut2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.11c) PMID:17384198 4896 2015-05-12 PomBase SPAC31A2.11c FYPO:0000103 L349A,L352A,I355A,L358A Not assayed or wild type 972 h- cuf1 cuf1-NESmut2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17384198 4896 2015-05-12 PomBase SPBC146.11c FYPO:0000348 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPBC146.11c FYPO:0003066 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPBC146.11c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.11c FYPO:0001686 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0000964 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0003702 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC146.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug97 mug97delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0002768 K217R Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-K217R amino_acid_mutation ECO:0006030 medium assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 2D) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0003914 K217R Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-K217R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 2C) PomBase SPCC613.06 FYPO:0000031 deletion 972 h- rpl902 rpl902delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 96 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPCC613.06 FYPO:0000470 deletion 972 h- rpl902 rpl902delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPCC613.06 FYPO:0001309 deletion 972 h- rpl902 rpl902delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC613.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rpl902 rpl902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC613.06 FYPO:0001034 deletion 972 h- rpl902 rpl902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPCC613.06 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rpl902 rpl902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC613.06 FYPO:0002476 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl902 rpl902delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl902 rpl902delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC613.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl902 rpl902delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005057 C226Y Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003179 C226Y Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0002150 C226Y Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005060 C226Y Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000085 C226Y Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000089 C226Y Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 D190N Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-D190N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001645 R605P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-R605P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 R605P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-R605P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 R605P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-R605P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 R605P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-R605P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sld5 sld5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0000141 deletion 972 h- sld5 sld5delta deletion ECO:0005638 PMID:16199877 4896 2020-06-30 (Fig. S1B) PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0007401 deletion 972 h- sld5 sld5delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:16199877 4896 2020-06-30 (Fig. S1C) PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0006640 deletion 972 h- sld5 sld5delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:16199877 4896 2020-06-30 (Fig. S1C) PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0000316 deletion 972 h- sld5 sld5delta deletion ECO:0005638 PMID:16199877 4896 2020-06-30 (Fig. S1A) PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sld5 sld5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0002061 deletion 972 h- sld5 sld5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sld5 sld5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.21c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sld5 sld5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pdr16 pdr16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0006628 deletion 972 h- pdr16 pdr16delta deletion ECO:0001232 100 medium PMID:39110593 4896 2024-11-05 We found that both the PM and Golgi pools of PI4P decreased significantly in sec14D cells. PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pdr16 pdr16delta deletion ECO:0005638 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mag2-NATMX-rpt6 pdr16 pdr16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- pdr16 pdr16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdr16 pdr16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC23B6.04c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdr16 pdr16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002561 S199D,T205D,S207D,S231D,S235D,T262D,301-1489 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-Ns-6D Rng2Ns-phosphomimetic amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:33131769 4896 2021-01-04 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-SE3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-SE3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0003704 371-386 Not assayed or wild type 972 h- pst2 pst2-delta371-386 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC36.05c) PMID:37459529 4896 2024-02-13 Deletion of the active center loop compromised the HDAC activity of Clr6S (Fig. 6G), consistent with a role of the loop in catalytic activity, although a secondary effect, due to perturbation of the protein structure could not be excluded. PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0000826 wild type Knockdown 972 h- pcf11 pcf11+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.07) PMID:27582274 4896 2018-03-19 PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0000826 wild type Knockdown 972 h- pcf11 pcf11+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC576.08c) PMID:27582274 4896 2018-03-19 PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- pcf11 pcf11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000106 medium PMID:27582274 4896 2018-03-21 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0000141 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0000082 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0003740 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0003217 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000126,FYECO:0000370 medium PMID:35970865 4896 2022-10-05 (Figure 4) PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0008014 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:35970865 4896 2022-10-05 Defective in CENP-A maintenance. Mis15 localises to the inner regions of centromeres as does Mis6, while Mis12 and Nuf2 localise to the outer regions relative to Mis6, and Mis6 localised to centromeres in the mis12 and nuf2 mutants but not in the mis15 mutant (Supplementary Fig. 6)In the mis15-68 mutants, signal intensities of Cnp1 at centromeres during mitotic arrest were decreased like in the mis6-302 mutant, whereas not in the mis12-537 and nuf2-2 mutants (Fig. 2h-j and Supplementary Figs. 5b-d and 7) PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0002902 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0002902 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0002902 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC21.01) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0002902 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.03) PMID:16855021 4896 2014-12-17 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0007295 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0000284 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15369671 4896 2014-08-26 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0007234 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBP22H7.09c FYPO:0000091 W113R Not assayed or wild type 972 h- mis15 mis15-68 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC17G9.04c FYPO:0000082 E166K 972 h- nup85 ptr5-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22240020 4896 2012-03-22 PomBase SPBC17G9.04c FYPO:0000911 E166K 972 h- nup85 ptr5-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22240020 4896 2012-04-05 PomBase SPBC17G9.04c FYPO:0000771 E166K 972 h- nup85 ptr5-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22240020 4896 2012-03-22 PomBase SPBC17G9.04c FYPO:0000644 E166K 972 h- nup85 ptr5-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22240020 4896 2012-03-22 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000611 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-2 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0003128 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-2 unknown ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0006784 386-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-385 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1B, 2B) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 R580A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/ALA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. 1F) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005300 R580A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/ALA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. 1 C,D) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000703 R580A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/ALA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Figure 1H) PomBase SPBC902.05c FYPO:0008128 deletion 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frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000249 PMID:35079912 4896 2022-03-31 PomBase SPBC947.05c FYPO:0006786 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000344 PMID:35079912 4896 2022-03-31 PomBase SPBC947.05c FYPO:0003507 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000404 PMID:35079912 4896 2022-03-31 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000842 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000087 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC947.05c FYPO:0005825 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000186 medium PMID:35079912 4896 2022-03-31 (Figure 3A) Fe2(SO4)3 was added to YES media for a final concentration of 2.75 mM. PomBase SPBC947.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC947.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.05c FYPO:0000115 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC947.05c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 frp2 frp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC947.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- frp2 frp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC947.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 frp2 frp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 frp2 frp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003602 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003602 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003602 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003602 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003602 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003602 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0000082 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0004201 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:18948543 4896 2024-01-30 Moreover, mutants that alleviated cen1:ade6+ silencing also displayed increased levels of noncoding centromeric otr transcripts and concomitant reductions in centromeric siRNA accumulation, with prp10-1 showing the most severe silencing defects (Fig. 1C PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003412 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003096 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:18948543 4896 2024-01-30 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) revealed that splicing mutants cwf10-1 and prp10-1 (but not prp2-1) exhibited only a modest decrease in levels of H3K9me2 associated with both centromere repeats and cen1:ura4+ (Fig. 3A and fig. S3). PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003029 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 low assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003029 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003029 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_transcript(PomBase:SPAC664.06) PMID:32168916 4896 2021-06-25 (Figure 4) PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003029 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_transcript(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:32168916 4896 2021-06-25 (Figure 4) PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0006599 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000049 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18948543 4896 2024-01-30 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) revealed that splicing mutants cwf10-1 and prp10-1 (but not prp2-1) exhibited only a modest decrease in levels of H3K9me2 associated with both centromere repeats and cen1:ura4+ (Fig. 3A and fig. S3). PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003041 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0000220 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0000220 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0001908 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0001908 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0001908 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0001908 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0001908 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0001908 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0002107 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0003619 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 However, at the permissive temperature of 25°C (at which centromeric silencing was alleviated), splicing efficiency was similar to that in wild-type cells (Fig. 2A). PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0000091 A1050V,S1058F Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-1 A1089V,S1097F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000230 69-81,798-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES deltaNES1+2-mid1|mid1-deltaNES1+2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 85 PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 2A and C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004293 69-81,798-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES deltaNES1+2-mid1|mid1-deltaNES1+2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 74.6 PMID:10930468 4896 2023-03-02 DNES1-mid1p had a clear defect in nuclear export- in contrast to wild-type mid1p, which exits the nucleus during mitosis, it remained in the nucleus throughout the cell cycle, although some faint rings were occasionally seen (Figure 6, A-B). PomBase SPBC106.10 FYPO:0001259 unknown Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1- unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:11453251 4896 2013-09-03 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0005419 deletion 972 h- mic10 mic10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:38692277 4896 2024-06-26 the absence of MICOS subunits caused characteristic alterations in mitochondrial morphology (Figure 1A). PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000443 deletion 972 h- mic10 mic10delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1610.04) PMID:38692277 4896 2024-06-27 In contrast, in the absence of Mic10 and Mic26, which are constituents of a second MICOS subcomplex, Mmc1 lost its semi-punctate appearance and was more uniformly localized throughout the mitochondrial network (Figures 3A and 3B). PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0003393 deletion 972 h- mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:38692277 4896 2024-06-26 disruption of cristae architecture through loss of the core MICOS subunit Mic60 caused a growth defect specifically on media that requires respiration (Figure 1D). PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mic10 mic10delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mic10 mic10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- mic10 mic10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic10 mic10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPJ691.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic10 mic10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc28 cdc28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc28 cdc28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc28 cdc28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc28 cdc28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc28 cdc28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc28 cdc28delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001972 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002159 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002159 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002159 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000082 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002265 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001911 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002021 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002021 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002021 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0003133 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001968 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0003134 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001406 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001406 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001406 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000961 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001201 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001190 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000105 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002077 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0004256 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 (Fig. 2) PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0004256 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002903 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2019-07-11 (Fig. 2) PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002903 W400* Not assayed or wild type 972 h- pmr1 cps5-138 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2019-07-11 (Fig. 2) PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0008112 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 PMID:37403782 4896 2023-07-10 Importantly, co-migration of Pof8 with U6 was lost upon deletion of Bmc1 (Figure 1B), as well as co-migration of Bmc1 with U6 upon deletion of Pof8 (Supplementary Figure S1C). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0002133 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2A9.10),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.25) PMID:37403782 4896 2023-07-10 Further supporting the idea that U6 complex formation is contingent on the presence of all three proteins, we observed a loss of snoZ30 binding to Bmc1 upon knockout of any member of the complex (Supplementary Figure S2A). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0003244 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBC543.05c) PMID:37403782 4896 2023-07-10 Still, as mean intron retention values indeed showed an increase upon Bmc1 deletion (Figure 5A), we chose several representative intron retention events to validate with semi-quantitative RT-PCR (one of which, intron 1 of pud1, displayed a statistically significant increase upon Bmc1 deletion at 32 ̊C in our RNA Seq dataset). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0002134 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC1861.04c),assayed_transcript(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:37403782 4896 2023-07-06 Deletion of snoZ30 and sno530 resulted in a loss of 2′-O-methylation at A41 and A64, respectively, suggesting that sno530 is indeed the A64 U6-modifying snoRNA (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0005540 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0005801 PMID:35277511 4896 2022-05-23 PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0006848 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:35277511 4896 2022-05-23 PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0008110 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 PMID:37403782 4896 2023-07-06 reproducible decrease in modification at several other sites, most notably A64 (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0008113 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPAC4C5.01) PMID:37403782 4896 2023-07-06 Still, as mean intron retention values indeed showed an increase upon Bmc1 deletion (Figure 5A), we chose several representative intron retention events to validate with semiquantitative RT-PCR (one of which, intron 1 of pud1, displayed a statistically significant increase upon Bmc1 deletion at 32 ̊C in our RNA Seq dataset). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0008113 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000337 PMID:37403782 4896 2023-07-10 Still, as mean intron retention values indeed showed an increase upon Bmc1 deletion (Figure 5A), we chose several representative intron retention events to validate with semi-quantitative RT-PCR (one of which, intron 1 of pud1, displayed a statistically significant increase upon Bmc1 deletion at 32 ̊C in our RNA Seq dataset). PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0002239 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0000059 PMID:35277511 4896 2022-05-18 PomBase SPBC2A9.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- bmc1 bmc1delta deletion ECO:0005638 PMID:35277511 4896 2022-05-18 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000705 665-731 Not assayed or wild type 972 h- ase1 ase1-deltaC67 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12),assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:18061564 4896 2019-11-14 (Figure 6F) PomBase SPBC409.12c FYPO:0001355 L198S Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-75 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPBC409.12c FYPO:0002019 L198S Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-75 amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 2) PomBase SPBC409.12c FYPO:0001357 L198S Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-75 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0002779 1-360 Not assayed or wild type 972 h- rrp2 rrp2deltaN360 rrp2-N360delta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23E6.02) PMID:28552615 4896 2017-07-19 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000705 1-360 Not assayed or wild type 972 h- rrp2 rrp2deltaN360 rrp2-N360delta partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c),assayed_using(PomBase:SPBC23E6.02) PMID:28552615 4896 2017-07-16 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0000705 1-360 Not assayed or wild type 972 h- rrp2 rrp2deltaN360 rrp2-N360delta partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC23E6.02),assayed_using(PomBase:SPBC365.06) PMID:28552615 4896 2017-07-19 (Fig. 2h) PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0003858 1-360 Not assayed or wild type 972 h- rrp2 rrp2deltaN360 rrp2-N360delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:28552615 4896 2017-07-19 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0000838 1-199 Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-deltaN199-EGFP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.10) PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0004041 deletion 972 h- cox17 cox17delta deletion ECO:0005801 PMID:18723604 4896 2014-12-16 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cox17 cox17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 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4896 2016-04-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19686686 4896 2016-04-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 3) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 high PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 2A) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005706 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005706 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 3) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005684 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 high PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 2A; Figure S3A) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0001837 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure S3B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp9 klp9delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000324 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 2A; Figure S3A) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000324 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2E) PomBase 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assayed_using(PomBase:SPBC725.12) PMID:28178520 4896 2018-07-25 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006641 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:28178520 4896 2018-07-25 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006641 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28178520 4896 2018-07-25 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003349 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12) PMID:28178520 4896 2018-07-25 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003349 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:28178520 4896 2018-07-25 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0007865 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC736.14) PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000703 deletion 972 h- cdc25-22 klp9 klp9delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 5B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0007304 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0004395 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 PMID:22264609 4896 2015-02-13 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp9 klp9delta deletion ECO:0005638 PMID:19686686 4896 2016-04-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp9 klp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0000325 unknown 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 3 PMID:17004072 4896 2016-03-02 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0000030 unknown 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 30 PMID:17004072 4896 2016-03-02 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003241 unknown 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17004072 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,P510L Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,P510L Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001357 1-30 Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-(31-488) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 8) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0005773 G204A,K205A Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-G204A,K205A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105 high PMID:9739083 4896 2017-06-28 (Fig. 2A) PomBase SPBC725.17c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrn11 rrn11delta deletion 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Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-E177A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 E177A Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-E177A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36574843 4896 2023-12-18 In contrast, Tet-based overexpression of cdr2(E177A) increased the size of dividing cells, consistent with dominant-negative effects for PomBase SPBC336.04 FYPO:0000611 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7700230 4896 2014-08-28 PomBase SPBC336.04 FYPO:0000611 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPBC336.04 FYPO:0004520 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:9794798 4896 2015-04-09 PomBase SPBC336.04 FYPO:0004387 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:9794798 4896 2015-04-09 mutant Cdc6 is not positively regulated by PCNA to the same extent as Cdc6+ PomBase SPBC336.04 FYPO:0002019 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000228 medium PMID:12697806 4896 2015-02-16 PomBase SPBC336.04 FYPO:0000839 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:7700230 4896 2014-08-28 PomBase SPBC336.04 FYPO:0000839 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002061 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPBC336.04 FYPO:0001387 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000229 low PMID:7700230 4896 2014-08-28 PomBase SPBC336.04 FYPO:0000256 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 medium PMID:9891047 4896 2015-04-08 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002060 AP143VS Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-ts1 poldelta-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001355 F368A,F369A Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-FF368AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000969 F368A,F369A Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-FF368AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000088 F368A,F369A Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-FF368AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000089 F368A,F369A Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-FF368AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001492 F368A,F369A Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-FF368AA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005018 1-191,K873A,K877A Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-C-A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000337 PMID:33176147 4896 2020-12-01 (Fig. 1F) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005555 1-191,K873A,K877A Not assayed or wild type 972 h- mis4-242 mis4 mis4-C-A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 PMID:33176147 4896 2020-12-03 (Figure 2c,3B and S3B Figures 4C and 4D) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005555 1-191,K873A,K877A Not assayed or wild type 972 h- mis4-242 mis4 mis4-C-A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 medium PMID:33176147 4896 2020-12-04 (Figures 4E and 4F) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001387 1-191,K873A,K877A Not assayed or wild type 972 h- mis4-242 mis4 mis4-C-A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:33176147 4896 2020-12-03 (Fig. 2A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0007544 1-191,K873A,K877A Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-C-A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 PMID:33176147 4896 2020-12-01 (Fig. 1E) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002061 T3E,S52A Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1-T3E,S52A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 2c) PomBase SPBC342.05 FYPO:0004870 K619M Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K619M amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000305 PMID:20679485 4896 2018-09-14 PomBase SPBC342.05 FYPO:0004869 K619M Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K619M amino_acid_mutation ECO:0000092 FYECO:0000305 medium PMID:20679485 4896 2018-09-13 PomBase SPBC342.05 FYPO:0002679 K619M Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K619M amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000137,FYECO:0000305 medium assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:20679485 4896 2018-09-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0004455 M21A Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-m21 pfh1-mt amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC887.14c) PMID:18725402 4896 2025-04-14 (Fig. 2A) PomBase SPBC887.14c FYPO:0002060 M21A Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-m21 pfh1-mt amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18725402 4896 2025-04-14 the pfh1-mt allele (mt) did complement pfh1D (Table 2, line 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000703 1-486 Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1(487-978) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:31206516 4896 2024-01-01 However, consistent with the previous report [13], the C-terminal half of Epe1 (487-948 amino acids region) interacted with Swi6 in the yeast two-hybrid system, but the N-terminal half (1-486) did not (S4I Fig). PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002869 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-ts unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.04) PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Fig. 4E) PomBase SPBC725.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000035 deletion 972 h- maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPBC725.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000238 deletion 972 h- maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:31641022 4896 2019-11-20 PomBase SPBC725.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000085,FYECO:0000126 PMID:31641022 4896 2019-12-13 PomBase SPBC725.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000357 PMID:31641022 4896 2019-12-13 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC725.01 FYPO:0006660 deletion 972 h- maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph maa1 maa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.01 FYPO:0007928 deletion 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Overexpression 972 h- puf2 puf2+ wild_type ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 6a) PomBase SPBP35G2.14 FYPO:0007320 wild type Overexpression 972 h- puf2 puf2+ wild_type ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 PomBase SPBP35G2.14 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- puf2 puf2+ wild_type ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 7) PomBase SPBC16H5.02 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph pfk1 pfk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.02 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pfk1 pfk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.02 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pfk1 pfk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.02 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pfk1 pfk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 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ace2 ace2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 2C) PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ace2 ace2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0005115 wild type Overexpression 972 h- ace2 ace2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 2A) PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0005301 wild type Overexpression 972 h- ace2 ace2+ wild_type ECO:0000291 PMID:15195092 4896 2017-03-07 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- ace2 ace2+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000381 high assayed_protein(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 1E) PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- ace2 ace2+ wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC645.06c) PMID:16291723 4896 2021-12-29 To determine whether Rgf3p production was controlled by Ace2p, we examined whether Rgf3p levels were altered in cells lacking or overproducing Ace2p. Overproduction of Ace2p led to increased Rgf3p levels whereas Rgf3p was less abundant in cells lacking Ace2p (Fig. 7B PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0007028 wild type Overexpression 972 h- ace2 ace2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 2B) PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0000648 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ace2 ace2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- ace2 ace2+ wild_type ECO:0001232 PMID:15195092 4896 2017-03-07 PomBase SPBC17G9.13c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cup1 cup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- cup1 cup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17G9.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cup1 cup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000705 1-311,593-830 Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1(312-592) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,P649S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,P649S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPCC970.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- wtf9 wtf9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:8918880 4896 2016-09-13 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000229 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 6 PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 6C) PomBase SPBC106.09 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 8 PMID:38780300 4896 2024-09-06 (Fig. 6C) PomBase SPBC106.09 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBC106.09 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:8918880 4896 2016-09-13 PomBase SPBC106.09 FYPO:0004332 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11683390 4896 2016-10-24 (Fig. 6) Cdc13YFP and Cdc2YFP remain associated with spindle, SPB. Cdc13 is not recognised by defective APC PomBase SPBC106.09 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:8918880 4896 2016-09-13 (Fig. 1) PomBase SPBC106.09 FYPO:0000096 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000096 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 PMID:8918880 4896 2016-09-13 PomBase SPBC106.09 FYPO:0001245 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 PMID:8918880 4896 2016-09-13 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000751 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 PMID:8918880 4896 2016-09-13 PomBase SPBC106.09 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:8918880 4896 2016-09-13 (Fig. 1) PomBase SPBC106.09 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8918880 4896 2016-09-13 (Fig. 1) PomBase SPBC106.09 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-533 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:8918880 4896 2016-09-13 (Fig. 1) PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0003734 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005801 PMID:15040954 4896 2014-08-21 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0001407 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:15040954 4896 2014-08-21 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000470 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0001117 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:24003116 4896 2014-01-02 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0004163 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000434 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0000335 PMID:15040954 4896 2014-08-21 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0001317 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC13B11.01) PMID:15040954 4896 2014-08-21 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0007928 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000089 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000089 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0001234 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:15040954 4896 2014-08-21 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- adh4 adh4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adh4 adh4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5H10.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adh4 adh4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17D1.05 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2013-11-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002774 K29A,Q76A Not assayed or wild type 972 h- rpn12 rpn12-K29A,Q76A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:22906049 4896 2013-11-14 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000674 K29A,Q76A Not assayed or wild type 972 h- rpn12 rpn12-K29A,Q76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22906049 4896 2013-11-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002141 K29A,Q76A Not assayed or wild type 972 h- rpn12 rpn12-K29A,Q76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22906049 4896 2013-11-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001164 K29A,Q76A Not assayed or wild type 972 h- rpn12 rpn12-K29A,Q76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22906049 4896 2013-11-05 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002678 S2A,S6A Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-S2A,S6A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:10364209 4896 2020-12-30 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 D363A,E364A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-D363A,E364A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 D363A,E364A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-D363A,E364A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 D363A,E364A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-D363A,E364A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0000705 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4d) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0000835 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Trt1 expression level detected by western blot is reduced in ter1∆ cells. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Based on ChIP, ter1∆ cause loss of telomerase (Trt1) localization at telomeres. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Est1 binding to telomeres is reduced to near no binding in ter1∆, based on ChIP assay. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 1e) Localization of Pof8 at telomeres is reduced but not eliminated in ter1∆. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002980 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c),assayed_using(SO:0000105) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Lsm3 binding was detected at ars2004, non-ARS, ade6+ and his1+ loci. In ter1∆ cells, Lsm3 binding to those non-telmeric sites were increased. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004656 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4f) Lsm3 binding at telomeres is increased by ter1∆. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004083 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Est1 expression level detected by western in ter1∆ cells was similar to Est1 level in ter1+ (wild-type) cells. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004083 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Pof8 expression level was not altered in ter1∆ cells. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004083 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Lsm3 protein level was not affected by ter1∆. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004083 25-1135 Null 972 h- ter1 ter1-delta(25-1135)::ura4+-tk partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001779 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 38 PMID:25253718 4896 2015-05-15 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001779 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001779 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:23669133 4896 2013-07-11 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000030 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 56 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. S1D) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000168 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:23166349 4896 2012-12-11 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000443 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.11c) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 6) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000941 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.07c) PMID:25253718 4896 2015-05-15 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006825 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 3) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000227 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:23166349 4896 2012-11-26 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006800 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 35 medium assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 7B and C) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006800 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 8 PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006800 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 high PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000450 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC12D12.01) PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000940 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0004648 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:25253718 4896 2015-05-15 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0003566 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 2) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001846 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:23166349 4896 2012-11-26 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0005371 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0000340 FYECO:0000021,FYECO:0000137 PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 2D) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0005371 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0000340 FYECO:0000021,FYECO:0000263 PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 2D) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001861 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0000059 PMID:23166349 4896 2012-11-26 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0002969 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC26A3.15c) PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 6E) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000228 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 6) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 csi1 csi1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000276 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 95 PMID:25253718 4896 2015-05-15 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0002360 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0000049 PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 csi1 csi1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000969 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001690 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000963 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000957 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0005779 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 3) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0002966 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:25253718 4896 2015-05-15 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0005602 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 3) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0004325 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 csi1 csi1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0003840 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001245 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000089 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-11-08 (Figure S1A) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 csi1 csi1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000091 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph csi1 csi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009114 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csi1 csi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004473 deletion 972 h- cdc20 cdc20delta deletion ECO:0005580 PMID:9356477 4896 2015-03-17 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002379 deletion 972 h- cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9605404 4896 2015-03-19 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002379 deletion 972 h- cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9356477 4896 2015-03-17 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc20 cdc20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9605404 4896 2015-03-19 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004474 deletion 972 h- cdc20 cdc20delta deletion ECO:0001232 PMID:9356477 4896 2015-03-17 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001324 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC776.13) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5A, 5C) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1652.02) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC644.09) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.08c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.16) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC776.13) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.03c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.10) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1289.04c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000826 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.04c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001890 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.09) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 3D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000833 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5A) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000833 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.03) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5A) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0000833 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5A) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001317 834-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-deltaaj3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5B) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0004212 A552T Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-A552T amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.07c) PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0001645 A552T Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-A552T amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:31366733 4896 2019-09-23 (Fig. 7) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0001513 A552T Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-A552T amino_acid_mutation ECO:0000340 PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0002901 A552T Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-A552T amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.12) PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0005634 A552T Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-A552T amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000703 415-466 Not assayed or wild type 972 h- hob1 hob1-1-414 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000303 H389I Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-H389I amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0004325 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002640 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 1) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0006581 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0003853 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002641 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0003358 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000086 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0005252 G115D Not assayed or wild type 972 h- ccr1 ccr1-1 cls1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBP35G2.05c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- cki2 cki2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPBP35G2.05c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- cki2 cki2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000166 high PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPBP35G2.05c FYPO:0001120 wild type Overexpression 972 h- cki2 cki2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPBP35G2.05c FYPO:0000021 wild type Overexpression 972 h- cki2 cki2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPAC23G3.09 FYPO:0003412 taf4::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 taf4 taf4::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000658 L115P Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-L115P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0000727 wild type Overexpression 972 h- cdc3 cdc3+ wild_type ECO:0001232 PMID:8207058 4896 2012-04-25 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001009 wild type Overexpression 972 h- cdc3 cdc3+ wild_type ECO:0001232 PMID:8207058 4896 2012-07-30 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0000779 wild type Overexpression 972 h- cdc3 cdc3+ wild_type ECO:0001232 PMID:8207058 4896 2012-04-25 PomBase SPBC15D4.06 FYPO:0007841 Y27A Not assayed or wild type 972 h- naa30 naa30-Y27A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:34019809 4896 2021-09-05 PomBase SPCC895.07 FYPO:0005694 C450R Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:31618856 4896 2019-10-24 (Figure 2D) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005681 C450R Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:31618856 4896 2019-10-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0006336 C450R Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:31618856 4896 2019-10-24 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0009009 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000331 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0005261 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000289 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0009031 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPATRNAALA.03 FYPO:0001164 deletion 972 h- scn1 scn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:15126629 4896 2014-05-15 PomBase SPATRNAALA.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- scn1 scn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:15126629 4896 2014-05-15 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0006326 3-10 Not assayed or wild type 972 h- arf6 arf6-N3-S10 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:34958661 4896 2022-06-30 The resulting arf6 alleles reduced node localization and instead enriched at the cytoplasm (Fig. S2, H and I) PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000196 377-416 Not assayed or wild type 972 h- meu10 meu10-C40delta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:11895484 4896 2024-06-12 Like the meu10∆mutant (Fig. 3C), mature ascospores were not generatedby this mutant. PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003611 E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RD1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000478 E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RD1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003612 E379R,E381R,R384E Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-RD1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000280 GFP-tor1 Not assayed or wild type 972 h- tor1 GFP-tor1 GFP-tor1|tor1-N-termGFP fusion_or_chimera ECO:0000059 PMID:18076573 4896 2015-11-20 PomBase SPAC18B11.10 FYPO:0000705 299-614 Not assayed or wild type 972 h- tup11 tup11-N(1-298) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.10),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:12637515 4896 2015-01-14 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002059 pcn1delta::HA-ubi1-pcn1-K164R Knockdown 972 h- pcn1 HA-ubi1-pcn1-K164R HA-Ub-PCNA-K164R|pcn1-HA-Ub-PCNA-K164R fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20452294 4896 2016-04-05 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000141 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1C) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000177 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1C) PomBase SPAC890.02c FYPO:0006173 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPAC890.02c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-08 PomBase SPAC890.02c FYPO:0005343 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002638 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1A) inferred from increased duration of mitosis PomBase SPAC890.02c FYPO:0000274 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1A) PomBase SPAC890.02c FYPO:0005842 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 4D) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002966 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 4D) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002966 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 4F) PomBase SPAC890.02c FYPO:0006048 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-738 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 1C rows 2 and 3) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 S66A,S84A,T104A,S118A,S143A,S332A,T351A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-7A amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 4b) PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0001327 deletion 972 h- pib1 pib1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:28765280 4896 2017-08-14 (Fig. 6G). PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pib1 pib1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pib1 pib1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pib1 pib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- pib1 pib1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pib1 pib1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36B7.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pib1 pib1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0007439 deletion 972 h- ltc1 ltc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 PMID:32320462 4896 2020-07-27 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0007440 deletion 972 h- ltc1 ltc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 PMID:32320462 4896 2020-07-27 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ltc1 ltc1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0000135 deletion 972 h- ltc1 ltc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:32320462 4896 2020-08-03 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0001309 deletion 972 h- ltc1 ltc1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0001357 deletion 972 h- ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:32320462 4896 2020-07-27 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0002642 deletion 972 h- ltc1 ltc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:32320462 4896 2020-07-27 PomBase SPBC20F10.07 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Overexpression 972 h- mot2 mot2-C45A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004194 I84A Knockdown 972 h- cds1 cds1-I84A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000703 I84A Knockdown 972 h- cds1 cds1-I84A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 I84A Knockdown 972 h- cds1 cds1-I84A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002336 T77A,S115A,T204I,T249I Ectopic 972 h- atf1 atf1-4A/I atf1(4A/I) amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 PMID:38289024 4896 2024-04-02 (Figure 6B) PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0003771 S53L Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-S53L amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:25157670 4896 2014-09-04 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0003770 S53L Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-S53L amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:25157670 4896 2014-09-03 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007971 wild type Knockdown 972 h- ase1 ase1+ wild_type ECO:0001232 low PMID:35293864 4896 2022-04-14 (Fig. 5 supp 3E) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0005342 wild type Knockdown 972 h- ase1 ase1+ wild_type ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 6) PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0008210 1165-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_region(SO:0000167) PMID:38181050 4896 2024-04-19 Notably, the localizations of Lsd1 and Lsd2 are diminished at the promoter regions in the absence of a functional C-terminus (Fig 1C). This result demonstrates that the C-terminal domains of Lsd1 and Lsd2 are involved in their chromatin binding at these regions. PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0008211 1165-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Intriguingly, about 72% of downregulated genes in lsd1-ΔHMG, lsd2-ΔC, and set1Δ are antisense non-coding RNAs (S1 Table) PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0000836 1165-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:38181050 4896 2024-05-06 PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0000703 1165-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.07c) PMID:38181050 4896 2024-04-19 Additionally, we established that the loss of the HMG-domain of Lsd1 does not affect the interaction between Lsd1 and Phf1 (Fig 1D) or Phf2 (Fig 1E) PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0000703 1165-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02),assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.08c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Additionally, we established that the loss of the HMG-domain of Lsd1 does not affect the interaction between Lsd1 and Phf1 (Fig 1D) or Phf2 (Fig 1E) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002061 disruption Null 972 h- ypt3 ypt3delta::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:2328721 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25H1.03 FYPO:0001645 F29R Not assayed or wild type 972 h- atg101 atg101-F29R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC25H1.03),assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:26030876 4896 2019-08-13 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0001127 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 variable severity PMID:19363481 4896 2023-03-01 slow growth phenotype and heterogeneity in cell length; reflecting elevated levels of spontaneous DNA damage and “constitutive” activation of the DNA damage checkpoint in these cells (Fig. 4a and data not shown). PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000705 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.13),assayed_protein(PomBase:SPBC16H5.03c) PMID:19363481 4896 2023-03-01 Strikingly, a GST-Rad60 SLD2E380R construct did not detectably interact with Ubc9-TAP (Fig. 3a) PomBase SPBC1921.02 FYPO:0001355 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19363481 4896 2023-03-01 slow growth phenotype and heterogeneity in cell length; reflecting elevated levels of spontaneous DNA damage and “constitutive” activation of the DNA damage checkpoint in these cells (Fig. 4a and data not shown). PomBase SPBC1921.02 FYPO:0001355 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0005629 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:21444718 4896 2023-03-30 The rad60E380R mutant exhibits elevated SUMO conjugates before and after HU treatment, which, based on the foregoing results, is most likely the result of replicative stress in the sickly rad60E380R strain. Therefore PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000085 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19363481 4896 2023-03-01 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000085 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21444718 4896 2023-03-30 Interestingly, rad60E380R mutant cells are hypersensitive to the same DNA-damaging agents as nse2-SA cells (Fig. 4A). PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000088 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19363481 4896 2023-03-01 slow growth phenotype and heterogeneity in cell length; reflecting elevated levels of spontaneous DNA damage and “constitutive” activation of the DNA damage checkpoint in these cells (Fig. 4a and data not shown). PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000088 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21444718 4896 2023-03-30 Interestingly, rad60E380R mutant cells are hypersensitive to the same DNA-damaging agents as nse2-SA cells (Fig. 4A). PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000088 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000089 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19363481 4896 2023-03-01 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000089 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21444718 4896 2023-03-30 Interestingly, rad60E380R mutant cells are hypersensitive to the same DNA-damaging agents as nse2-SA cells (Fig. 4A). PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000268 E380R Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-E380R rad60-SLD2-E380R|rad60E380R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPCC1393.10 FYPO:0001934 deletion 972 h- ctr4 ctr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:10593913 4896 2014-11-25 PomBase SPCC1393.10 FYPO:0003690 deletion 972 h- ctr4 ctr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000139 PMID:11274192 4896 2015-07-14 PomBase SPCC1393.10 FYPO:0004039 deletion 972 h- ctr4 ctr4delta deletion ECO:0005801 PMID:18723604 4896 2014-12-16 PomBase SPCC1393.10 FYPO:0002128 deletion 972 h- ctr4 ctr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1142.05) PMID:11274192 4896 2015-07-14 PomBase SPCC1393.10 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ctr4 ctr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.10 FYPO:0003743 deletion 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SPBC146.09c FYPO:0007339 934-1000,K603A,K604A Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-ao-deltaC amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(SO:0001905) PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPBC146.09c FYPO:0006110 934-1000,K603A,K604A Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-ao-deltaC amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPBC11B10.08 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph wwm1 wwm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.08 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 wwm1 wwm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC11B10.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph wwm1 wwm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- 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ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Other potential Ca2+-effectors, including putative Rab GTPases Gyp2 and Gyp4, which are implicated in vesi- cle trafficking, were also not required for hypotonic PM expansion (Additional file 1: Fig. S2E). PomBase SPBC215.01 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC215.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC215.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph gyp4 gyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- gyp4 gyp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC215.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gyp4 gyp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC215.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gyp4 gyp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000941 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC800.09) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.02c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC1861.02) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC26H5.05) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001645 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.06) PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 2B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 D625A,H626A,K628A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000082 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:39471327 4896 2024-11-01 ppc89-2, ppc89-3 and ppc89-4 grow 19 similarly to wild-type at 25°C but do not form colonies at 36°C (Figure 1B PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 In contrast, Ppc89-4-mNG showed a ~50% reduction in SPB 12 fluorescence intensity at both temperatures compared to wild-type (Figures 1E, F and 13 S1A). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 At 25°C, Sid4-GFP SPB intensity was reduced by 4 approximately 30% in ppc89-3 and 60% in ppc89-4 compared to wild-type (Figures 2A 5 and S2A). At 36°C, Sid4-GFP SPB intensity was further reduced by ~90% in ppc89-3 6 and ppc89-4 compared to wild-type (Figure 2A,B). These results indicate that the Sid4- 7 Ppc89 interaction is disrupted in both ppc89-3 and ppc89-4 cells at restrictive 8 temperatu re. PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 As expected, Dma1- 22 mNG, Cdc11-GFP and Mto1-mNG were lost from SPBs in ppc89-3 and ppc89-4 cells at 23 restrictive temperature, but Mto1-mNG localized normally to SPBs in ppc89(1-707) cells (Figures 4A-G; S2B and C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 As expected, Dma1- 22 mNG, Cdc11-GFP and Mto1-mNG were lost from SPBs in ppc89-3 and ppc89-4 cells at 23 restrictive temperature, but Mto1-mNG localized normally to SPBs in ppc89(1-707) cells (Figures 4A-G; S2B and C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC417.07c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 As expected, Dma1- 22 mNG, Cdc11-GFP and Mto1-mNG were lost from SPBs in ppc89-3 and ppc89-4 cells at 23 restrictive temperature, but Mto1-mNG localized normally to SPBs in ppc89(1-707) cells (Figures 4A-G; S2B and C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC902.06) PMID:39471327 4896 2024-11-01 we also observed a reduction 3 in Mto2-mNG SPB signal at 36 ̊C in ppc89-3 and ppc89-4 compared to wild-type (Figure 4 S2D,E). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 Pcp1 showed ~50% 9 reduction in pcp89-4 cells (Figure S3C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0001475 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:39471327 4896 2024-11-01 In ppc89-3 cells at the restrictive temperature, we noticed an increased proportion 14 of cells displaying 2 or 4 Ppc89-3-mNG and Sad1-mCherry foci, indicative of cytokinesis 15 failure (Figure 1G,H). In contrast, ppc89-4 cells displayed 3, 4, or ≥5 Ppc89-4-mNG and 16 Sad1-mCherry foci (Figure 1G,H), indicating that the integrity of the SPB as a whole is 17 disrupted in ppc89-4 cells whereas it appears to remain intact in ppc89-3 cells. PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0007652 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:39471327 4896 2024-11-01 . A 2 portion of ppc89-4 cells at 36°C showed an additional abnormal phenotype - cells with 3 a septum but only one nucleus (Figure 1C,D). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 N175D,E276G,E383G,S616G,S709G,L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-4 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.05c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 Neither Sfi1-mCherry nor 7 Sad1-mCherry signal were reduced in ppc89-3 or ppc89-4 cells (Figure S3A,B). PomBase SPBC31F10.11c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf4 cwf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.11c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf4 cwf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- cwf4 cwf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31F10.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf4 cwf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- cwf4 cwf4delta deletion ECO:0005638 PMID:10409726 4896 2014-07-21 PomBase SPCC162.09c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hmg1 hmg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC162.09c FYPO:0002151 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h- pdc1 pdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20G4.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdc1 pdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdc1 pdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 K251E Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K251E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K251E Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K251E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K251E Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K251E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K251E Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K251E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC17G6.14c FYPO:0003119 wild type Knockdown 972 h- uap56 uap56+ wild_type ECO:0000291 PMID:15990877 4896 2015-03-11 PomBase SPCC70.12c FYPO:0002780 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0001232 PMID:19352039 4896 2015-03-31 PomBase SPCC70.12c FYPO:0002143 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0001232 PMID:19352039 4896 2015-03-31 PomBase SPCC70.12c FYPO:0004085 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:39910760 4896 2025-02-13 In addition, Ecl1 fusion protein overexpression slowed the growth rate, similar to a previous report of Ecl1- overexpression (Ohtsuka et al., 2024a) (Figure 1c). PomBase SPCC70.12c FYPO:0002173 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0002172 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0002664 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0002989 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0001043 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC16E9.16c) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1105.14) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3H1.11) PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:18422613 4896 2014-08-21 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000588 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:21072667 4896 2015-04-13 PomBase SPCC70.12c FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- ecl1 ecl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:39910760 4896 2025-02-13 Furthermore, the overexpression of the Ecl1 fusion protein using this plasmid led to CLS extension, suggesting that the protein was functional (Figure 1c). 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Fig. 2C. Table 1 PomBase SPBC409.03 FYPO:0000470 deletion 972 h- swi5 swi5delta deletion ECO:0000059 high PMID:22042869 4896 2024-07-11 (Fig. 2A and B) PomBase SPBC409.03 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0000199 deletion 972 h- swi5 swi5delta deletion ECO:0000049 PMID:17304215 4896 2009-02-10 PomBase SPBC409.03 FYPO:0001821 deletion 972 h- swi5 swi5delta deletion ECO:0000059 PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPBC409.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC409.03 FYPO:0003530 deletion 972 h- swi5 swi5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPBC409.03 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:34208949 4896 2021-07-15 PomBase SPBC409.03 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.03 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Msmt0 swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPBC409.03 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Pdelta17 swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPBC409.03 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPBC409.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- swi5 swi5delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1B1.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pan3 pan3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B1.04c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pan3 pan3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B1.04c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph pan3 pan3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B1.04c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pan3 pan3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B1.04c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pan3 pan3delta 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PomBase SPAC644.14c FYPO:0004142 G(-231)T,G(-210)T Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-ATGTG nucleotide_mutation ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPAC1B1.01),assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0001934 deletion 972 h- mek1 mek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- mek1 mek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mek1 mek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mek1 mek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0002485 deletion 972 h- mek1 mek1delta deletion ECO:0000059 PMID:20123974 4896 2014-07-14 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0002485 deletion 972 h- mek1 mek1delta 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bqt4-R48E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure S4A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006515 R48E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-R48E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Supplementary Figure S5B) PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 L62LGVPLL Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-J3 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001946 R28A,L31A Overexpression 972 h- cut2 cut2-dm1 cut2dm1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9312055 4896 2017-02-02 (Fig. 1c) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0003165 R28A,L31A Overexpression 972 h- cut2 cut2-dm1 cut2dm1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9312055 4896 2017-02-02 (Fig. 1c) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001234 R28A,L31A Overexpression 972 h- cut2 cut2-dm1 cut2dm1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:9312055 4896 2017-02-02 (Fig. 1b) PomBase SPAC22G7.09c FYPO:0003412 nup45::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 nup45 nup45::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 atg17 atg17delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0000380 deletion 972 h- h- leu1-32 CFP-atg8::leu1+ atg17 atg17delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000127 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg17 atg17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph atg17 atg17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg17 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Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 atg17 atg17delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg17 atg17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0003075 deletion 972 h- atg17 atg17delta deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg17 atg17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph atg17 atg17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.11c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph atg17 atg17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 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SPBC14C8.07c FYPO:0000836 142-577 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(1-141) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 3) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0003075 142-577 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(1-141) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9739083 4896 2017-07-03 data not shown PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000703 142-577 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(1-141) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 3) PomBase SPBC23E6.08 FYPO:0001838 C1017T Not assayed or wild type 972 h- rgp1 sat1-11 nucleotide_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0003902 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP tbf1 tbf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000655 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0000325 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000957 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004498 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000703 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000268 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000268 E259A,E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-25 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 501-791 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1delta(501-791) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0008002 501-791 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1delta(501-791) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 501-791 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1delta(501-791) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high low assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3F and G) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 M82MGYPLM Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K9 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC83.18c FYPO:0002871 K22A,K27A Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-K22A,K27A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:32878942 4896 2020-09-11 (Figure 2D,E) PomBase SPBC83.18c FYPO:0001396 K22A,K27A Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-K22A,K27A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32878942 4896 2020-09-11 (Figure 2F-H) PomBase SPBC83.18c FYPO:0002559 K22A,K27A Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-K22A,K27A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:32878942 4896 2020-09-11 (Figure 2I) PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0000082 H201N Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-H201N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 1D) PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0001355 H201N Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-H201N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 1D) PomBase SPAC20G4.03c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph hri1 hri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.03c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph hri1 hri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.03c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hri1 hri1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC20G4.03c FYPO:0001236 deletion 972 h- hri1 hri1delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0004322 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0003557 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000291 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002913 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000291 PMID:25122751 4896 2014-09-11 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0003937 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) In cultures without TSA, the hrp1D cells grew slightly faster than wt cells as reported previously (48). PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000636 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9520266 4896 2014-04-29 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0008062 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000226 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 3) There was a 4- fold reduction of Cnp1 at cnt2 in hrp1D cells PomBase SPAC1783.05 FYPO:0004542 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000049 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 1) PomBase SPAC1783.05 FYPO:0006843 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0007314 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 3) PomBase SPAC1783.05 FYPO:0007313 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 3) PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001840 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000059 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0007656 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000059 PMID:17510629 4896 2023-07-05 Hence, from these results it was evident that Hrp1, Hrp3 and Nap1 occupancy in vivo generally correlated with increased nucleosome densities in the corresponding mutants, and that this effect was most pronounced in promoter regions. PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000228 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 15 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000228 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 12 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000284 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 2.1 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) Further examination of the IF samples revealed that hrp1D single and hrp1D hrp3D double mutants cells showed elevated numbers of asymmetric segregation (large and small nuclei) in late anaphase cells PomBase SPAC1783.05 FYPO:0004331 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000049 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 1) PomBase SPAC1783.05 FYPO:0005517 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001164 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001164 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002620 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000268 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002390 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 PMID:32277274 4896 2020-04-27 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000857 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000059 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0005949 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001103 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 PMID:37956308 4896 2024-02-21 On the contrary, deletion of hrp1 yielded a strain resistant to H2 O2 , almost to the same extent as Δtop1 (Figure 6B). PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0004325 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000091 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2A) In contrast, both of the single mutants were hypersensitive to this concentration of TBZ, showing a 5- to 25-fold growth reduction compared with wt PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph hrp1 hrp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp1 hrp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC110.02 FYPO:0005634 unknown Not assayed or wild type 972 h- h+ cdc2-M35 mat3-M cen1-GFP ura4-D18 (haploid meiosis inducing) pds5 pds5- unknown ECO:0005638 high PMID:16325576 4896 2021-05-13 (Figure 1) PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002239 EKRI74AAAA Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-EKRI74A4 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000705 284-810 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-N tea4N partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000705 284-810 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-N tea4N partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001645 284-810 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-N tea4N partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003482 1-139,793-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(140-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003527 1-139,793-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(140-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high low assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000080 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0007531 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000226 low assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0007350 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:31811152 4896 2020-04-09 (Figure 1b) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002932 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002932 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002932 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.40) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002932 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.28) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002932 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.16) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002937 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 RNA level expressed from the ribosomal protein-coding gene, rpl30-2, was increased by 4.5-fold in the absence of Pab2 (Lemay et al., 2010). To independently validate this result, we compared rpl30-2 mRNA levels between wild-type and pab2D strains by northern analysis and confirmed a 3-fold incemperature-dependent upregulation of rpl30-2 required Pab2, as it was not observed in a pab2D strain that is defective in pre-mRNA decay (Figure 4A, lanes 3 and 4, and Figure 4B). PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:17213188 4896 2017-07-14 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 medium PMID:17213188 4896 2017-07-14 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0008148 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 In contrast, deletion or mutation alleles of the MTREC complex lead to significant accumulation of all types of CUTs and also meiotic mRNAs. This effect is comparable to the level of CUT accumulation in the nuclear exosome subunit rrp6 deletion (Fig. 2a,b) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0008148 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 In contrast, deletion or mutation alleles of the MTREC complex lead to significant accumulation of all types of CUTs and also meiotic mRNAs. This effect is comparable to the level of CUT accumulation in the nuclear exosome subunit rrp6 deletion (Fig. 2a,b) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 PMID:20512112 4896 2015-05-26 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1556.06) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.12c) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPAC1556.06) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0005995 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0007355 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:31811152 4896 2020-04-13 (Figure 1c) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002931 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002931 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002931 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.40) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002931 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.28) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002931 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.16) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002931 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 PMID:17213188 4896 2017-07-14 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 RNA level expressed from the ribosomal protein-coding gene, rpl30-2, was increased by 4.5-fold in the absence of Pab2 (Lemay et al., 2010). To independently validate this result, we compared rpl30-2 mRNA levels between wild-type and pab2D strains by northern analysis and confirmed a 3-fold increase of rpl30-2 mRNA in pab2 null cells (Figure 1A, lanes 1 and 2). The use of an intron-specific probe confirmed that the slowermigrating rpl30-2 transcript is the unspliced pre-mRNA (Figure 1A, lane 4). PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC16E8.16) PMID:21981922 4896 2023-11-21 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.18c) PMID:21981922 4896 2023-11-21 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC13G6.12c) PMID:21981922 4896 2023-11-21 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC3H7.06c) PMID:21981922 4896 2023-11-21 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC6G9.13c) PMID:21981922 4896 2023-11-21 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.52) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.47) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.37) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.40) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.50) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.46) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.34) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003700 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.25) PMID:20129053 4896 2014-08-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0005859 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0001232 18 PMID:24920274 4896 2019-11-08 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000674 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000674 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001164 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002928 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC13B11.01) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002928 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC4H3.10c) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003620 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC9G1.03c) PMID:21981922 4896 2023-11-21 specific to one of the two rpl30 paralogs, as the expression of rpl30-1 was unchanged in pab2D cells (Figure 1A). PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0005083 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0006080 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.01) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 1A) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001357 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003701 deletion 972 h- pab2 pab2delta deletion ECO:0001232 PMID:20129053 4896 2014-08-19 snoRNAs with extended poly(A) tails accumulate in these foci PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pab2 pab2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pab2 pab2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 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sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen1 sen1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007735 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 2) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007735 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC330.13) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 2) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007016 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC651.08c) PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 4) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007016 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.08c) PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 4) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007015 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC651.08c) PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 4) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007015 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.08c) PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 4) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007011 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC330.13) PMID:31294478 4896 2019-07-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0004032 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2G5.07c) PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 3) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0004033 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2G5.07c) PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 3) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0004033 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC2G5.07c) PMID:25392932 4896 2014-11-19 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000825 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1271.06c) PMID:22912768 4896 2013-03-19 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCTRNATHR.10) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPRRNA.37) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPATRNAPRO.02) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCTRNAARG.10) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBTRNATYR.04) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006984 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCTRNASER.09) PMID:31294478 4896 2019-07-26 AL fig 4. and 5c PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sen1 sen1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sen1 sen1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0001134 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007012 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007014 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007013 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007732 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC21H7.05) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 2b) Importantly, the accumulation of condensin in sen1Δ cells could not be caused by an accumulation of either TFIIIC or Tbp1 because their levels on chromatin remained largely unaffected in the absence of Sen1, as shown by ChIP with a GFP-tagged version of Tbp1 and a myc-tagged version of the TFIIIC component Sfc6 (Figs 2B and S1). PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007732 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006279 deletion 972 h- sen1 sen1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:27401558 4896 2018-03-26 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.10c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph sen1 sen1delta deletion ECO:0005638 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2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0001117 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.10) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0001117 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.03) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0001117 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC2E1P3.05c) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0001117 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB7E8.01) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0000155 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0005638 PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1861.02) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.02) 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ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAPB24D3.07c) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPAC688.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- srb8 srb8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.01) PMID:12738880 4896 2019-10-24 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 Y247P Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-Y247P amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPAC1486.05 FYPO:0002060 Nup98 portion of Nup189,plus 33aa tail,with S965A mutation Not assayed or wild type 972 h- nup189 nup98-tail(uncleavable) fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:26137436 4896 2017-10-20 PomBase SPAC20H4.02 FYPO:0001245 L226* Not assayed or wild type 972 h- dsc3 dsc3-226* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001864 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-sam9 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:37788281 4896 2023-12-13 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc5 cdc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000444 deletion 972 h- cdc5 cdc5delta deletion ECO:0005580 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000141 deletion 972 h- cdc5 cdc5delta deletion ECO:0001232 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000316 deletion 972 h- cdc5 cdc5delta deletion ECO:0001232 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc5 cdc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000839 deletion 972 h- cdc5 cdc5delta deletion ECO:0001232 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc5 cdc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC644.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc5 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cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000227 17 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0000877 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002355 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0004198 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. 5C) PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003681 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003681 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0005102 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0005004 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c) PMID:9264466 4896 2015-11-18 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0005004 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.01c) PMID:9264466 4896 2015-11-18 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0005004 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.01c) PMID:9264466 4896 2015-11-18 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0001355 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 high PMID:8978689 4896 2024-12-05 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0001861 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005,FYECO:0000227 20 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0004157 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:12724408 4896 2014-12-01 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0001327 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002303 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7798319 4896 2014-05-14 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002061 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7798319 4896 2014-05-15 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0006339 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 60-70 PMID:33506191 4896 2021-02-03 (Fig. 1) PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003166 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7798319 4896 2014-05-15 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0000833 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 We constructed mutants of E3 ligases and their components that have been suggested to localize to or function in the ER and nucleus, namely ......... The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003250 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7798319 4896 2014-05-15 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003241 A535T Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-665 amino_acid_mutation ECO:0005638 60-65 PMID:35970865 4896 2022-10-06 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 E173D Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-E173D amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000957 S26A,S33A,S52A,T73A,S109A,T114A,S135A,S147A,T152A,S155A,S165A,S175A,S253A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-13A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34208949 4896 2021-07-15 PomBase SPAC823.15 FYPO:0001759 ppa1::ura4 Null 972 h- ppa1 ppa1::ura4+ disruption ECO:0005801 PMID:2170029 4896 2013-02-05 PomBase SPAC823.15 FYPO:0001491 ppa1::ura4 Null 972 h- ppa1 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GFP-Ppc89(267-550-K299A) was diffuse in the cytoplasm and nucleus or present in foci that did not overlap with the SPB (Figure 6C). PomBase SPBC215.12 FYPO:0002061 2-135 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-2-135delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:24014766 4896 2024-07-09 Although cwf10 2-135Δ aligns with snu114ΔN (Fig. 1B), the S. pombe allele did not support growth at either 25°C or 32°C when integrated at the endogenous locus (data not shown), while the S. cerevisiae allele is viable at temperatures below 40°C (30). PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004811 D516N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-exo- dis3 exo- amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004811 D516N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-exo- dis3 exo- amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003049 D516N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-exo- dis3 exo- amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001234 D516N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-exo- dis3 exo- amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106 medium PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- wis1 sty2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001420 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unknown Not assayed or wild type 972 h- ade4 ade4-31 unknown ECO:0000106 FYECO:0000021,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC343.12) PMID:7565608 4896 2012-07-20 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000268 R359E,R360E Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-RREE amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPCC790.03 FYPO:0000836 G246R Overexpression 972 h- rbd2 rbd2-G246R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PR:000046671),assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 9A) PomBase SPCC790.03 FYPO:0001668 G246R Overexpression 972 h- rbd2 rbd2-G246R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 9A) PomBase SPBC30B4.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph sqs1 sqs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph sqs1 sqs1delta deletion ECO:0005638 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2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001974 Q479A,Q480A,K481A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-58 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000650 Q479A,Q480A,K481A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-58 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002061 Q479A,Q480A,K481A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-58 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000705 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_protein(PomBase:SPBC725.08) PMID:36002457 4896 2024-01-12 Using Y2H assays, we could show that the Red1 E32R mutation is sufficient to prevent the interaction with Ars2 in the context of full-length proteins (Fig. 5f). mportantly, while Red1-TAP and Ars2-GFP interact, as expected, this interaction was lost in cells expressing Red1-E32R-TAP (Fig. 5g). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:36002457 4896 2024-01-12 A similar growth defect was visible for the red1-E32R-TAP mutant cells grown on minimal medium, suggesting that Red1-Ars2 interaction, depending on the growth conditions, can be important for the normal growth of the cell population (Fig. 5h). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007280 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC725.08) PMID:36002457 4896 2024-01-12 Interestingly, quantification of the intensity of the signal within each nucleus showed a reduction of Ars2-GFP nuclear signal in red1-E32R mutant cells compared to wild-type cells, suggesting that some of Ars2-GFP proteins diffuse to the cytoplasm (Supplementary Fig. 8e). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0008152 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.4748) PMID:36002457 4896 2024-01-12 However, no significant changes were observed for several meiotic mRNAs and PROMPTs/CUTs MTREC targets (Supplementary Fig. 8b, c) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003747 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.09c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 However, no significant changes were observed for several meiotic mRNAs and PROMPTs/CUTs MTREC targets (Supplementary Fig. 8b, c) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003747 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:36002457 4896 2024-01-12 However, no significant changes were observed for several meiotic mRNAs and PROMPTs/CUTs MTREC targets (Supplementary Fig. 8b, c) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003747 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1952.15c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 However, no significant changes were observed for several meiotic mRNAs and PROMPTs/CUTs MTREC targets (Supplementary Fig. 8b, c) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001317 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We examined the possible effect of red1-E32R mutation on pho1 and byr2 mRNAs. However, no significant changes in pho1 and byr2 mRNA levels were observed between wild-type and red1-E32R mutant cells (Supplementary Fig. 8d). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001317 E32R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-E32R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We examined the possible effect of red1-E32R mutation on pho1 and byr2 mRNAs. However, no significant changes in pho1 and byr2 mRNA levels were observed between wild-type and red1-E32R mutant cells (Supplementary Fig. 8d). PomBase SPAC1250.04c FYPO:0000658 R69A Not assayed or wild type 972 h- atl1 atl1-R69A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1250.04c) PMID:23112169 4896 2016-07-18 PomBase SPAC1250.04c FYPO:0001813 R69A Not assayed or wild type 972 h- atl1 atl1-R69A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23112169 4896 2016-07-18 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000765 C529S 972 h- crm1 crm1-K1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10430904 4896 2012-03-06 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000766 C529S 972 h- crm1 crm1-K1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:10430904 4896 2012-03-06 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002470 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000085 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000089 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000268 R117E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R117E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPBC1711.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mat3-Mc mat3-Mcdelta deletion 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PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003660 R32A,K41A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R32A,K41A amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001355 R32A,K41A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R32A,K41A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000972 R32A,K41A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R32A,K41A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005221 R32A,K41A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R32A,K41A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000085 R32A,K41A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R32A,K41A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000267 R32A,K41A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R32A,K41A amino_acid_mutation 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC11C11.01 SPBC11C11.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0003412 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure 3A,B) PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0007213 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure 5B) the iss1-DC mutation significantly reduced H3K9me2 at both ssm4 and mei4). PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0007213 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure 5B) the iss1-DC mutation significantly reduced H3K9me2 at both ssm4 and mei4). PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0001645 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.10),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure 5F) the iss1-DC truncation did disrupt its interaction with Mmi1. PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0005420 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Fig. 4e) The 73 genes with increased expression in the iss1-DC mutant were evaluated for common functions and were strongly enriched for factors important for iron assimilation GO:0033212. PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0002173 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Fig. 4g,S4, Figure 5A) PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0002173 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Fig. 4g,S4, Figure 5A) PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0003049 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 low PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure 4C,S3) Although the percentage of total reads was relatively small, the iss1-DC mutation caused a reproducible and statistically significant extension of the 30 end of transcripts by about 200 nt. PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0000703 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.01),assayed_using(PomBase:SPAC22G7.10) PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure S5) However, the truncation did not reduce Iss1 interaction with Rrp6 PomBase SPAC22G7.10 FYPO:0001357 327-344 Not assayed or wild type 972 h- iss1 iss1-deltaC38 iss1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:32101745 4896 2020-08-04 (Figure 3A) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 S43D,S332D,S353D,S357D,S361D,S405D,S408D,T419D,S443D,T474D,S496D,S511D,S523D,S546D,S605D,S636D,S639D,S702D,S732D,S743D,S752D,S763D,S774D,S785D,S786D,S840D,T898D Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-27D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001365 S43D,S332D,S353D,S357D,S361D,S405D,S408D,T419D,S443D,T474D,S496D,S511D,S523D,S546D,S605D,S636D,S639D,S702D,S732D,S743D,S752D,S763D,S774D,S785D,S786D,S840D,T898D Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-27D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003532 S43D,S332D,S353D,S357D,S361D,S405D,S408D,T419D,S443D,T474D,S496D,S511D,S523D,S546D,S605D,S636D,S639D,S702D,S732D,S743D,S752D,S763D,S774D,S785D,S786D,S840D,T898D Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-27D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31591131 4896 2019-10-16 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001587 S43D,S332D,S353D,S357D,S361D,S405D,S408D,T419D,S443D,T474D,S496D,S511D,S523D,S546D,S605D,S636D,S639D,S702D,S732D,S743D,S752D,S763D,S774D,S785D,S786D,S840D,T898D Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-27D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002674 S43D,S332D,S353D,S357D,S361D,S405D,S408D,T419D,S443D,T474D,S496D,S511D,S523D,S546D,S605D,S636D,S639D,S702D,S732D,S743D,S752D,S763D,S774D,S785D,S786D,S840D,T898D Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-27D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC1834.03c FYPO:0007324 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf2+ hhf3+ hhf1 hhf1-KR hhf1-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:30992049 4896 2020-04-09 PomBase SPAC1834.03c FYPO:0000085 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf2+ hhf3+ hhf1 hhf1-KR hhf1-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:30992049 4896 2020-03-31 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0002169 1-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaN1-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-17 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0001690 1-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaN1-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0002168 1-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaN1-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-17 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000962 1-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaN1-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000957 1-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaN1-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPCC645.07 FYPO:0005503 1003-1334 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaCNH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001018 1003-1334 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaCNH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001473 1003-1334 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaCNH partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000079 1003-1334 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaCNH partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000088 1003-1334 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaCNH partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000303 H351I Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-H351I amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPCC825.02 FYPO:0007797 Q407E Not assayed or wild type 972 h- gbs1 gbs1-Q407E gbs1-Q408E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC825.02) PMID:19605557 4896 2021-05-26 (Figure 6) PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 G300E Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G300E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30072439 4896 2019-06-26 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 G300E Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G300E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30072439 4896 2023-01-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0003743 G300E Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G300E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001178 G300E Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G300E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006579 G300E Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G300E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000279 high PMID:31201205 4896 2019-06-21 (Figure 4) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001930 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1d) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0005438 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 5) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003844 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1g) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003165 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22645654 4896 2016-07-12 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0004385 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 5) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0004031 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1f) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002573 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 3a-g) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22645654 4896 2016-07-12 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001387 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000110 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1h) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006279 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1705.03c),assayed_using(PomBase:SPAC19B12.02c) PMID:31615333 4896 2020-09-22 (Figure 2 and S3) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000085 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1d) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000088 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1d) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000089 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 1d) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000268 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 2d, e, f) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001234 L543S Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-Y1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22645654 4896 2016-07-12 PomBase SPAC630.03 FYPO:0002061 P249M Not assayed or wild type 972 h- arp3 arp3-P249M amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21676862 4896 2019-10-17 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 S134A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-S134A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 S134A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-S134A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 idp1 idp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0008128 deletion 972 h- idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high 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SPAC6G10.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.08 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph idp1 idp1delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001234 713-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-1-712 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 6B, 6C) PomBase SPCC1795.11 FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000126 PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0002020 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:19682301 4896 2014-11-24 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0000833 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11711540 4896 2015-07-17 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0000776 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0001486 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0002479 wild type Overexpression 972 h- sum3 sum3+ wild_type ECO:0001232 PMID:10395922 4896 2014-06-30 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000141 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 Our analysis revealed that mutant strains display defects in the segregation, resolution and/or condensation of chromosomes during mitosis (Figure 6A), and mis-segregated the mini-chromosome Ch16 (a 530 kb derivative of chromosome 3; Niwa et al., 1986) at a signi®cantly higher rate than wild-type cells (Figure 6C). PomBase SPBC36.05c FYPO:0000082 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:12773392 4896 2024-02-20 and irreversible temperature-sensitive (Ts±) growth defects (Figure 5B±D). PomBase SPBC36.05c FYPO:0001407 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:29844133 4896 2018-07-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000250 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000246 high PMID:20404084 4896 2025-09-23 Prw1 is a subunit of the Clr6-containing HDAC; we therefore looked at the growth phenotype of a strain carrying the clr6-1 mutant allele (11). clr6-1 mutant cells grew slightly more slowly in ammonia, but their growth was severely impaired in proline, thus showing growth characteristics opposite to those of oca2 , cha4 , and ago1 . PomBase SPBC36.05c FYPO:0003411 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC36.05c FYPO:0003412 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 low PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. 4C) PomBase SPBC36.05c FYPO:0003412 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC36.05c FYPO:0003571 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0006321 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000170 medium assayed_protein(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0006321 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000211 medium assayed_protein(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7C) PomBase SPBC36.05c FYPO:0001128 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000260 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPBC36.05c FYPO:0005545 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figures 6A, 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0007270 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figures 6A, 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0007270 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:23084836 4896 2020-03-07 (Figures 6A, 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0001355 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 low PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0001355 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002019 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC36.05c FYPO:0003557 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005315 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005315 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0003547 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000274 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1D) PomBase SPBC36.05c FYPO:0005522 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0001740 G269D Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPBC36.05c FYPO:0010012 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 4A) PomBase SPBC36.05c FYPO:0002363 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 The results presented in Figure 5E demonstrate that mutant strains show a signi®cant increase in histone acetylation levels compared with the wild-type control. Mutation in clr6 results in elevated acetylation levels at all residues tested on the histone H3 and H4 tails. PomBase SPBC36.05c FYPO:0007307 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 3) PomBase SPBC36.05c FYPO:0005310 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005310 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0004238 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15483052 4896 2015-10-27 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005063 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000893 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 3) PomBase SPBC36.05c FYPO:0004690 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000892 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000892 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000892 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000892 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 2A) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000892 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000892 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15483052 4896 2015-10-27 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000887 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0006987 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0006361 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002365 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 The results presented in Figure 5E demonstrate that mutant strains show a signi®cant increase in histone acetylation levels compared with the wild-type control. Mutation in clr6 results in elevated acetylation levels at all residues tested on the histone H3 and H4 tails. PomBase SPBC36.05c FYPO:0002365 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15483052 4896 2015-10-27 PomBase SPBC36.05c FYPO:0007306 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 3) PomBase SPBC36.05c FYPO:0007631 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0007631 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0007631 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000246 assayed_region(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 PomBase SPBC36.05c FYPO:0008174 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0007632 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0007632 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0007305 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 3) PomBase SPBC36.05c FYPO:0008172 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 6B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0005309 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005309 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005309 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005308 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005308 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002172 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPBC36.05c FYPO:0001840 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000233 PMID:29844133 4896 2018-07-12 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002095 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000260 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0010016 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000260 high PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 4D) PomBase SPBC36.05c FYPO:0005523 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005917 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPBC36.05c FYPO:0005917 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000594 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002061 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002061 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000228 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 19 PMID:12526748 4896 2020-03-25 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002336 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21253571 4896 2015-05-18 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002336 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9755190 4896 2019-05-10 PomBase SPBC36.05c FYPO:0003555 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000963 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21211723 4896 2024-01-17 However, both Asf1 and Clr6 complex-II mutants were not sensitive to hydoxyurea (Figure S6) PomBase SPBC36.05c FYPO:0002390 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 1.4 PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Figure 1e) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000856 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0001317 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:29618061 4896 2024-01-24 No detectable increase in either tgp1 or nc-tgp1 was observed in sir2Δ, strains harbouring a clr6 mutation (Supplementary Figure S3A, lanes 6-8) PomBase SPBC36.05c FYPO:0001317 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:29618061 4896 2024-01-24 No detectable increase in either tgp1 or nc-tgp1 was observed in sir2Δ, strains harbouring a clr6 mutation (Supplementary Figure S3A, lanes 6-8) PomBase SPBC36.05c FYPO:0004325 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 medium PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. S2) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000095 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000095 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000277 high PMID:29844133 4896 2018-07-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000095 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000085 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000085 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000088 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000088 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000089 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000089 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000089 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000091 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000091 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 1) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000268 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9755190 4896 2019-05-10 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000268 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000268 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000315 PMID:29844133 4896 2018-07-03 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000268 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000268 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Figure 1B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0000268 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Figure 1B) PomBase SPBC36.05c FYPO:0001234 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000254 low PMID:20404084 4896 2025-09-23 Prw1 is a subunit of the Clr6-containing HDAC; we therefore looked at the growth phenotype of a strain carrying the clr6-1 mutant allele (11). clr6-1 mutant cells grew slightly more slowly in ammonia, but their growth was severely impaired in proline, thus showing growth characteristics opposite to those of oca2 , cha4 , and ago1 . PomBase SPBC36.05c FYPO:0001492 G269D Not assayed or wild type 972 h- clr6 clr6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph bit2 bit2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bit2 bit2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph bit2 bit2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph bit2 bit2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- bit2 bit2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bit2 bit2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.03c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bit2 bit2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.01 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcv3 gcv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- gcv3 gcv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP19A11.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcv3 gcv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.01 FYPO:0002451 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcv3 gcv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001512 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gsf1 gsf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0003335 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:23311928 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0003335 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23236291 4896 2016-07-08 (Figure 8D) PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0005505 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0000291 PMID:23236291 4896 2016-07-08 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0003776 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 PMID:23236291 4896 2016-07-08 (Figure 8D) PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0000825 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1742.01) PMID:23311928 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0000825 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC317.01) PMID:23311928 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- gsf1 gsf1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000103,FYECO:0000176 PMID:23311928 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gsf1 gsf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 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2025-06-26 (Table S2) PomBase SPAC12G12.07c FYPO:0001117 deletion 972 h- cpn1 cpn1delta deletion ECO:0000226 assayed_transcript(PomBase:SPBPB10D8.03) PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Table S2) PomBase SPAC12G12.07c FYPO:0007322 deletion 972 h- cpn1 cpn1delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 4D, 4E) PomBase SPAC12G12.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cpn1 cpn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cpn1 cpn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- cpn1 cpn1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Table S1) PomBase SPAC12G12.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- cpn1 cpn1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.774) PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Table S1) PomBase 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SPAC6G9.09c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2401 rpl2401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.15c FYPO:0005593 A196V Not assayed or wild type 972 h- sur2 sur2-L1 amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:34114004 4896 2021-06-17 PomBase SPBC887.15c FYPO:0001309 A196V Not assayed or wild type 972 h- sur2 sur2-L1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:34114004 4896 2021-06-17 PomBase SPBC887.15c FYPO:0000097 A196V Not assayed or wild type 972 h- sur2 sur2-L1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:34114004 4896 2021-06-17 PomBase SPBC887.15c FYPO:0001214 A196V Not assayed or wild type 972 h- sur2 sur2-L1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:34114004 4896 2021-06-17 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002679 S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-S551A,S556A,S590A dis1-C3A|dis1C3A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0000964 S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-S551A,S556A,S590A dis1-C3A|dis1C3A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2B) The sensitivities of Dis1N3A and Dis1C3A were similar to that of the wild-type. PomBase SPCC736.14 FYPO:0001839 S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-S551A,S556A,S590A dis1-C3A|dis1C3A amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2C) .... whereas Dis1N3A and Dis1C3A had loss rates that were comparable to those of the wild-type Dis1 integrant. PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000229 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 8.1 PMID:39473973 4896 2025-03-27 (Fig. S2E) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000082 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0005638 high PMID:39473973 4896 2025-03-27 (Fig. S2C) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0004056 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC2E12.02) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3F) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S2B and C) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0002774 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0000112 PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S2G) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3D) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3D) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3G) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3G) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000099 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0005638 high PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3E) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000021 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S2A) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ump1 ump1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 V17G,P37A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G,P37A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000151 Q559* Not assayed or wild type 972 h- atg7 atg7-m54 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:26696398 4896 2017-01-04 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85Y Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGYGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, complements partially sde2Δ PomBase SPAC2E1P3.04 FYPO:0004041 H621A Not assayed or wild type 972 h- cao1 cao1-H621A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18723604 4896 2014-11-20 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0004248 280-293 Not assayed or wild type 972 h- pib2 pib2deltatail partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPBC9B6.03) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 3C) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0000776 280-293 Not assayed or wild type 972 h- pib2 pib2deltatail partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 4B) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0001357 280-293 Not assayed or wild type 972 h- pib2 pib2deltatail partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 4A) PomBase SPBC1289.05c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vma10 vma10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.05c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vma10 vma10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- vma10 vma10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1289.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vma10 vma10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002060 L238R Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9857180 4896 2014-09-24 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002060 L238R Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9857180 4896 2014-09-24 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002177 L238R Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10226032 4896 2016-01-11 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001122 T58A Not assayed or wild type 972 h- pREP81X rum1 rum1-T58A rum1-A58 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106 medium PMID:9430640 4896 2021-03-22 (Fig. 3) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008004 32-282 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaSTRdeltaWSC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 In sharp contrast, Wsc1DSTR-GFP, Wsc1DWSC-GFP and Wsc1DSTRDWSC-GFP cells were completely devoid of any clustering phenotype, with an enrichment at contacts close to $2 (Figures 5D, 5E, and S2F-S2H). PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008012 32-282 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaSTRdeltaWSC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:34666001 4896 2022-06-30 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009065 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC29A3.12 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph rps902 rps902delta deletion ECO:0005638 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sre2-K743A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPBC354.05c FYPO:0001422 W771L Overexpression 972 h- sre2 sre2-W771L amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPBC1198.14c FYPO:0001934 unknown Not assayed or wild type 972 h- fbp1 fbp1-16 fbp-16 unknown ECO:0005638 PMID:2987220 4896 2015-01-06 PomBase SPBC409.07c FYPO:0007620 M395A Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-M395A.3pk amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Although, both Wis1M395G and Wis1M395A were expressed at wild-type levels, Sty1 phosphorylation was very low and minimally increased even in response to 6 mM H2O2 in these cells (Figure 4D). PomBase SPBC409.07c FYPO:0007620 M395A Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-M395A.3pk amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC409.07c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Strikingly, the stress-induced phosphorylation of Wis1M395G and Wis1M395A was also compromised, strongly suggesting that Wis1 kinase activity was required for the stress-induced phosphorylation and activation of Wis1 (Figure 4D). PomBase SPBC409.07c FYPO:0001122 M395A Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-M395A.3pk amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:37572670 4896 2024-01-22 Indeed, consistent with the requirement of Wis1-dependent phosphorylation of Sty1 for timely entry into mitosis, cells expressing Wis1M395G or Wis1M395A were elongated (Figure S6B). PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004308 deletion 972 h- mis6 mis6delta deletion ECO:0000337 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001779 deletion 972 h- mis6 mis6delta deletion ECO:0001232 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mis6 mis6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000316 deletion 972 h- mis6 mis6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000316 deletion 972 h- mis6 mis6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mis6 mis6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002061 deletion 972 h- mis6 mis6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mis6 mis6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mis6 mis6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0004544 deletion 972 h- iec5 iec5delta deletion ECO:0000049 PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0006373 deletion 972 h- iec5 iec5delta deletion ECO:0000226 PMID:33378674 4896 2021-07-19 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0007001 deletion 972 h- iec5 iec5delta deletion ECO:0000059 PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0000856 deletion 972 h- iec5 iec5delta deletion ECO:0000059 assayed_region(SO:0001797) PMID:33378674 4896 2021-07-14 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0002389 deletion 972 h- iec5 iec5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC29B12.01) PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0000703 deletion 972 h- iec5 iec5delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC10F6.08c),assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph iec5 iec5delta deletion ECO:0005638 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(Fig. 4B) PomBase SPBC106.11c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 plg7 plg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC106.11c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 plg7 plg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC106.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph plg7 plg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.11c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph plg7 plg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph plg7 plg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph plg7 plg7delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001084 wild type Overexpression 972 h- ags1 ags1+ wild_type ECO:0005638 high PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- ags1 ags1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001120 wild type Overexpression 972 h- ags1 ags1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0007294 wild type Overexpression 972 h- ags1 ags1+ wild_type ECO:0005638 12 PMID:10087262 4896 2020-03-18 (also Figure 7) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0002779 1-465 Overexpression 972 h- cbf12 cbf12(D1-465) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1223.13) PMID:23555033 4896 2013-05-16 PomBase SPCC962.02c FYPO:0003241 1-112 Overexpression 972 h- bir1 bir1-deltaN112 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPBC646.06c FYPO:0001971 deletion 972 h- agn2 agn2delta deletion ECO:0001232 low 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PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001934 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000256 PMID:20536828 4896 2014-06-23 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001934 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0003743 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001407 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000342 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000708 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 high PMID:1340462 4896 2013-02-14 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0002009 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001645 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.13c),assayed_using(PomBase:SPCC1753.02c) PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001645 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.02c),assayed_using(PomBase:SPAC23H3.13c) PMID:24297439 4896 2014-08-13 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001117 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:19266076 4896 2014-12-07 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0003120 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:11014802 4896 2017-09-28 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001661 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:11461899 4896 2018-03-07 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001664 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000126 low PMID:1340462 4896 2013-02-14 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0004164 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19266076 4896 2014-12-07 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0006296 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001571 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.13c),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.03) PMID:15831585 4896 2017-07-20 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000825 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000245 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:20536828 4896 2014-06-23 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0004162 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19266076 4896 2014-12-07 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0004165 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19266076 4896 2014-12-07 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000087 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000108 R176H Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-R176H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19266076 4896 2014-12-08 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002033 S479A,S491A,S501A,S533A,S561A Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-5A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),residue(S479A),residue(S491A),residue(S501A),residue(S533A),residue(S561A) PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001122 S479A,S491A,S501A,S533A,S561A Not assayed or wild type 972 h- cdc16-116 cdc3-124 nak1 nak1-5A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:24972934 4896 2025-04-17 (Fig. 5C) PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002104 S479A,S491A,S501A,S533A,S561A Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-5A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPNCRNA.1064 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.1064 SPNCRNA.1064delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0001645 L397A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-L397A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4—Figure supplement 1B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004248 L397A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-L397A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004247 L397A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-L397A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4C,D) PomBase SPAC23G3.06 FYPO:0003305 wild type Overexpression 972 h- nop58 nop58+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC589.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph noc12 noc12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- noc12 noc12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC589.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc12 noc12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC589.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc12 noc12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC83.03c FYPO:0002566 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 PMID:14704433 4896 2024-01-18 Further, chromatin immunoprecipitation (ChIP) showed that Tas3 was required for H3-K9 methylation and Swi6 localization of a ura4+ reporter gene inserted at each of the above loci (Fig. 2E). PomBase SPBC83.03c FYPO:0003744 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:14704433 4896 2024-01-18 Deletion of tas3+ abolished the association of Chp1-Flag with otr1::ura4+, as well as with native cen sequences (Fig. 4C). PomBase SPBC83.03c FYPO:0003074 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 1B) PomBase SPBC83.03c FYPO:0000705 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 3B) PomBase SPBC83.03c FYPO:0002835 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPBC83.03c FYPO:0002834 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 PMID:14704433 4896 2024-01-18 A tas3 deletion strain carrying the ura4+ reporter gene inserted at innermost (imr) or outermost (otr) centromeric repeats of chromosome 1 (imr1R::ura4+ and otr1R::ura4+, respectively) displayed a loss of silencing of both reporter genes (Fig. 2D) to an extent similar to that of the deletion of sir2, chp1, or ago1 (Fig. 2D) PomBase SPBC83.03c FYPO:0003411 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3) tas3-TAM Mutations Cause a Dramatic Loss of ura4+ Silencing at imr1 but Only a Modest Loss at otr1 PomBase SPBC83.03c FYPO:0003412 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPBC83.03c FYPO:0002827 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000453 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPBC83.03c FYPO:0000888 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000226 medium PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5C and E) PomBase SPBC83.03c FYPO:0003571 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000453 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPBC83.03c FYPO:0006599 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 We also assessed the localization of Chp1-6xmyc and Tas3- 13xmyc in cells lacking tas3 and chp1, respectively (Fig. 6A). In cells with tas3 deleted, Chp1 was delocalized, with a cloud of small foci of staining that mainly accumulated over the nucleolus (Fig. 6A) PomBase SPBC83.03c FYPO:0003573 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000453 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPBC83.03c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0007339 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000231 medium PMID:21211723 4896 2024-01-17 We also found that double mutants carrying mutations in clr3 or mit1 along with either asf1-1 or hip1Δ showed cumulative derepression of repeat elements (Figure 3A and S4), indicating overlapping functions for Asf1/HIRA and SHREC. PomBase SPBC83.03c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 tas3 tas3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC83.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000049 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPBC83.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 tas3 tas3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC83.03c FYPO:0005865 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000226 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPBC83.03c FYPO:0004378 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPBC83.03c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004325 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004325 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. S2) PomBase SPBC83.03c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph tas3 tas3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.03c FYPO:0006076 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0000337 PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPBC83.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- tas3 tas3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC83.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tas3 tas3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tas3 tas3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002577 R707* 972 h- cdc10 cdc10-C4 cdc10-MBC4 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:24006488 4896 2013-12-06 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002981 R707* 972 h- cdc10 cdc10-C4 cdc10-MBC4 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:24006488 4896 2013-12-06 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000825 R707* 972 h- cdc10 cdc10-C4 cdc10-MBC4 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0002835 S234P Not assayed or wild type 972 h- ers1 ers1-C62 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:22474355 4896 2024-03-13 defective siRNA production (Fig. 1C) PomBase SPCC1393.05 FYPO:0003412 S234P Not assayed or wild type 972 h- ers1 ers1-C62 amino_acid_mutation ECO:0000049 high assayed_using(SO:0001899) PMID:22474355 4896 2017-07-30 derepression of a ura4+ marker gene integrated into the outermost Fig. 1. (otr) pericentromeric repeat of chromosome 1 (otr1R::ura4+) (Fig. 1a) PomBase SPCC1393.05 FYPO:0006599 S234P Not assayed or wild type 972 h- ers1 ers1-C62 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 In contrast, EGFP-Ers1C62 showed a more diffuse signal with weak nuclear dots (Fig. 4B and Fig. S4 C and D), suggesting that the correct localization of Ers1 was impaired by the C62 mutation. PomBase SPCC1393.05 FYPO:0001645 S234P Not assayed or wild type 972 h- ers1 ers1-C62 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 Moreover, the interaction between Ers1 and Swi6 was weakened by the presence of the C62 mutation (Fig. 4 D and E). Taken together, these results suggested that Ers1 associates with both Hrr1 and Swi6, and that the C62 mutation impairs both associations. PomBase SPCC1393.05 FYPO:0000220 S234P Not assayed or wild type 972 h- ers1 ers1-C62 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:22474355 4896 2024-03-13 increased levels of noncoding centromeric transcripts (Fig. 1B) PomBase SPCC1442.10c FYPO:0002212 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb3 rpb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpb3 rpb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb3 rpb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R95A,R101A Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-S4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0001800 1-296 Not assayed or wild type 972 h- sle1 sle1delta1-296 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1A6.07) PMID:22869600 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0001775 1-296 Not assayed or wild type 972 h- sle1 sle1delta1-296 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1A6.07) PMID:22869600 4896 2012-11-22 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0001776 1-296 Not assayed or wild type 972 h- sle1 sle1delta1-296 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.15) PMID:22869600 4896 2012-11-22 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0001777 1-296 Not assayed or wild type 972 h- sle1 sle1delta1-296 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22869600 4896 2012-11-22 PomBase SPAC4G9.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- mug133 mug133delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC4G9.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug133 mug133delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC4G9.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug133 mug133delta deletion 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Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 6) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0007985 P41L Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 2) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0003337 P41L Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 2) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0007983 P41L Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 1) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000339 P41L Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 1) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0003302 P41L Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 30 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 1) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0007982 P41L Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 60 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 1) PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0001309 deletion 972 h- mug176 mug176delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mug176 mug176delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mug176 mug176delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug176 mug176delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug176 mug176delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3H7.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug176 mug176delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000705 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_protein(PomBase:SPAC7D4.14c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 Using these cells, reciprocal co-immunoprecipitation experiments showed that the Red1-L205R mutation also compromised Red1 association with Iss10 in S. pombe (Fig. 3a and Supplementary Fig. 3a). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:36002457 4896 2024-01-12 Importantly, red1-L205R cells showed a similar growth defect, when grown on minimal medium, suggesting that Red1-Iss10 interaction can be important for Red1-dependent cell growth function depending on the environmental conditions (Fig. 3b). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007280 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC7D4.14c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.09c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1952.15c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002964 L205R Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-L205R amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009007 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009032 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0000725 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0009044 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mpv17 mpv17delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0000115 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mpv17 mpv17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- mpv17 mpv17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpv17 mpv17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G6.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpv17 mpv17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0000983 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005801 PMID:7851743 4896 2012-04-24 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0000916 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005801 PMID:7851743 4896 2012-04-24 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005638 FYECO:0000087,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005638 FYECO:0000088,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005638 FYECO:0000089,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005638 FYECO:0000084,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-32 unknown ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0000921 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2014-09-30 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000620 mph1-ndc80 Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-ndc80 mph1-ndc80-fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:22184248 4896 2019-07-11 As shown in Fig. 3A, expression of Mph1-Ndc80-GFP from pREP81 caused an arrest in the wild-type background. PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm7 trm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- trm7 trm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm7 trm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0000040 unknown Not assayed or wild type 972 h- met9 met9-3 unknown ECO:0005638 PMID:12112238 4896 2013-09-18 PomBase SPCC1682.02c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm3 mcm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.02c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm3 mcm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.02c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm3 mcm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm3 mcm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- mcm3 mcm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1682.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcm3 mcm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 450-506,S15A,S24A,T34A,S46A,S62A,S95A,T517A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm-6AlaT517A mid1-nsm-6Ala-517 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 50 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. S3H) PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0001164 157-162 Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-stem6 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPCC777.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC777.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.12c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.12c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC777.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC777.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC777.12c SPCC777.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004306 T243A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-T243A amino_acid_mutation ECO:0005801 high PMID:14701811 4896 2015-01-22 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation 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amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20739936 4896 2020-02-11 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000091 E255G Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-M7 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0006809 1-321 Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-delta322 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2) PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 V125I Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-V125I amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0004357 S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S206A,S221A,S236A,T240A,T255A,S257A,S289A,S344A,S379A,S399A,T411A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-18A amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:22065639 4896 2013-09-19 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002649 S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S206A,S221A,S236A,T240A,T255A,S257A,S289A,S344A,S379A,S399A,T411A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-18 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0001840 S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S206A,S221A,S236A,T240A,T255A,S257A,S289A,S344A,S379A,S399A,T411A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-18A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0000228 S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S206A,S221A,S236A,T240A,T255A,S257A,S289A,S344A,S379A,S399A,T411A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002651 S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S206A,S221A,S236A,T240A,T255A,S257A,S289A,S344A,S379A,S399A,T411A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-18 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002650 S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S206A,S221A,S236A,T240A,T255A,S257A,S289A,S344A,S379A,S399A,T411A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-18 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003217 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003412 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0002061 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000228 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 5 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000228 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 26 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000091 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003241 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0002060 G622E Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-38 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000705 1-499,801-971 Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-(500-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:22952839 4896 2013-08-27 PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0000531 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0005580 PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0001974 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 4A) cells block normally with 1C DNA content even when cig2 is over expressed PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0000836 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 4B) cig2 over expression also occurs when cells blocked with HU PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0000836 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 3C) PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0001489 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106 medium PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 3) data not shown cell viability is reduced at late time points PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0001383 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 3B) no G1 peak is observed showing that S phase onset is not delayed PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- cig2 cig2+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 3A, D) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 I480R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I480R amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 4F) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 I480R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I480R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 I480R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I480R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 I480R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-I480R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC409.07c FYPO:0006549 R234E,R235E,R260E,R261E Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-4RE amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 4) PomBase SPBC409.07c FYPO:0001645 R234E,R235E,R260E,R261E Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-4RE amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 4) PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph nas2 nas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- nas2 nas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nas2 nas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2H10.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nas2 nas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 492-749 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1delta(492-749) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0008002 492-749 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1delta(492-749) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 492-749 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1delta(492-749) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3F and G) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S162A,S165A 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ade6-M210 prr1 prr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8C9.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prr1 prr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000941 W900* Overexpression 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001315 W900* Overexpression 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001315 W900* Overexpression 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001355 rga7::ura4 Null 972 h- rga7 rga7::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 low PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000659 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A,Q320A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A+CSD3A chp2-mut5 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 Interestingly, when amino acid substitutions in the hinge and CSD were combined, the resulting Chp2 mutants (Chp2-mut3 and Chp3-mut5) no longer bound DNA (Fig. 3K and M, and Supplementary Fig. S2F) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0005929 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A,Q320A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A+CSD3A chp2-mut5 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:37400983 4896 2023-09-04 Chp2 mutants lacking DNA-binding activities associated with both the hinge and the N-terminus of CSD (mut 3 and mut 5) exhibited reduced heterochromatin association compared to wild-type Chp2 at representative heterochromatic regions (centromeric dg, the mating-type cenH, telomere and mat3M::ura4+), and the reduction was more severe for Chp2-mut3 compared to Chp2-mut5 (Fig. 6A). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A,Q320A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A+CSD3A chp2-mut5 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:37400983 4896 2023-09-04 | combined mutations of the hinge and one of the mutations in the N-terminus of CSD (mut3 and mut5) showed a silencing defect (Fig. 4C) PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apl4 apl4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apl4 apl4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0001800 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000225 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0007588 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPBC947.02) PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 5) PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002128 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000082 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 low PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0007059 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPAP27G11.06c) PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 5) PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000233 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apl4 apl4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low low PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002401 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apl4 apl4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000703 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC947.02),assayed_using(PomBase:SPBP16F5.07) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 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2021-01-04 (Fig. 2b) whereas that of Dapl4 and Daps1 cells was partially inhibited PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 low PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph apl4 apl4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000281 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0000024 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apl4 apl4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apl4 apl4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCP1E11.06 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl4 apl4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0002243 L225S Not assayed or wild type 972 h- rad24 anr5-13 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000021 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:1394510 4896 2014-04-01 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000705 301-670 Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-dC300 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1805.08),assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. S4A) PomBase SPAC1B3.09c FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ noc202 noc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAC1B3.09c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc202 noc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc202 noc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- noc202 noc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1B3.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc202 noc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.09c FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc202 noc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- pat1 pat1-hmt8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- pat1 pat1-hmt8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000658 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. 4) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Figures 5A and 5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004093 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. S5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005612 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. S5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000703 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30503780 4896 2019-10-07 ( PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000590 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:30503780 4896 2019-10-07 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002687 K83E,R94E,R97E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-3E-A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. S5B) PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 80-120 Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-delta80-120 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPNCRNA.311 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPNCRNA.311 SPNCRNA.311delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.311 FYPO:0009012 deletion 972 h- SPNCRNA.311 SPNCRNA.311delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.311 FYPO:0000099 deletion 972 h- SPNCRNA.311 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PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001489 E33V,E69V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E0 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001489 E33V,E69V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E0 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001489 E33V,E69V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E0 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002061 E33V,E69V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E0 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002061 E33V,E69V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E0 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002061 E33V,E69V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E0 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 aig1 aig1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph aig1 aig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- aig1 aig1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aig1 aig1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPJ4664.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aig1 aig1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.04 FYPO:0000039 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys12 lys12- unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17622533 4896 2013-09-20 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002061 C13Y,E368K Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-C13Y-E368K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 PMID:24663817 4896 2020-02-22 We found that combinations of the previously reported E368K mutation [47] with K56R or F303S were lethal suggesting a defect in DNA replication. PomBase SPAC343.19 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lsb6 lsb6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC343.19 FYPO:0006628 deletion 972 h- lsb6 lsb6delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-10 (Fig. 5A) PomBase SPAC343.19 FYPO:0006627 deletion 972 h- lsb6 lsb6delta deletion ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC343.19 FYPO:0002253 deletion 972 h- lsb6 lsb6delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 1B) PomBase SPAC343.19 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph lsb6 lsb6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.19 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lsb6 lsb6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.19 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph lsb6 lsb6delta deletion ECO:0005638 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Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001035 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9491802 4896 2020-08-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001035 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8887550 4896 2013-02-01 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001035 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29689193 4896 2018-11-08 (Figure 3B) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002700 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:24498240 4896 2024-07-03 Rho1 GTPase might modulate the activity Pmk1 by acting upstream of Pck2 because it has been described that overexpression of wild type or a constitutively active allele of rho1+ (G15V mutant) induced a marked hyperactivation of Pmk1 (Figure 1B PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001038 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 6D) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0004495 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:9491802 4896 2020-08-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0003333 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9491802 4896 2020-08-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002482 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001489 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002061 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9491802 4896 2020-08-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002061 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887550 4896 2014-01-07 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002061 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000224 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8887550 4896 2014-01-07 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001190 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0006196 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000646 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8887550 4896 2013-02-01 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000647 G15V Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887550 4896 2014-01-07 PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0003412 trm7::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 trm7 trm7::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC794.03 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC794.03 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009032 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009032 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009032 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009035 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPCC794.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000412 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0009010 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0007808 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC794.03 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.03 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC794.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC794.03 SPCC794.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 Y279A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-Y279A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 Y279A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-Y279A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002555 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002555 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10837231 4896 2025-01-28 In all of the sid mutants, sid1, sid2, spg1, sid4 cdc7,cdc11 and cdc14, GFP-Mob1p could not localize to themedial region (Figure 4a-c and data not shown) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007246 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:20980623 4896 2020-02-11 At anaphase II, however, many of the Dma1-GFP signals did not accumulate at SPBs (Fig 2 B&C) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10775265 4896 2020-12-30 Cdc7p cannot localize to the SPB(s) in cdc11 (Figure 4; Table I) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_protein(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 At 36°C, Spg1p-GFP was detected at SPBs in wild-type cells but was absent from SPBs in the cdc11 mutant strains (Figure 4B). PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0006825 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:15132994 4896 2020-12-21 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000705 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000272 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0001382 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0006317 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.06c) PMID:18411246 4896 2017-05-25 (Fig. 3A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0006317 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_protein(PomBase:SPCC417.06c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 3G) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0006317 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC417.06c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 3G) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000940 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000940 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:16085489 4896 2015-03-03 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000940 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10837231 4896 2025-01-28 SPB was unaffected in sid1, sid2, spg1 and cdc14 mutants (Figure 4a and data not shown), but was severely affected in sid4, cdc7 and cdc11 mutants. PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000940 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 Examination of these cells following 12 h of growth in thiamine-containing medium also showed that most cells (59%) contained Byr4 at all SPBs (Table II). In contrast to sid3-106 mutants, though, the amount of Byr4 localized to SPBs in cells depleted of Spg1 using the conditional promoter was greatly reduced (data not shown) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-19 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9254700 4896 2015-12-10 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0003028 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000833 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000833 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 Western analysis showed that this decrease was not due to reduced Byr4 amounts PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:24055157 4896 2022-09-28 Although Dma1-GFP still localized to SPBs in sid4(T275A) mutant cells (Figure S1F) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 R947H,T1041I Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-123 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004056 43-75,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(42-74)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002061 43-75,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(42-74)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0000089 K536R,K1200R Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-K536R,K1200R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29898918 4896 2018-07-03 PomBase SPAC16E8.02 FYPO:0002421 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpo1 mpo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- mpo1 mpo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16E8.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpo1 mpo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-340 unknown ECO:0005638 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPAC806.04c FYPO:0004303 D248A Overexpression 972 h- duf8901 duf8901-D248A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC806.04c) PMID:35314193 4896 2022-10-21 (Figure 8) PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0005106 F403W Not assayed or wild type 972 h- sst2 sst2-F403W amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:26368668 4896 2015-12-03 PomBase SPAC13A11.04c FYPO:0003412 ubp8::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ubp8 ubp8::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC869.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph SPAC869.03c SPAC869.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph 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2024-07-10 (Fig. 1C) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0004062 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001327 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000050251) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001038 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002190 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002424 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PR:000044799),assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 Figure 4E, polarization localization to both cell ends PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000644 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:21849474 4896 2018-06-13 (Fig. 4B) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000644 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:21849474 4896 2018-06-13 (Fig. 4B) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001587 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. S1D) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001266 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001315 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 PMID:19646873 4896 2012-02-21 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000094 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002720 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000107 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006836 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006836 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000021 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 PMID:30279276 4896 2021-03-31 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000024 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Figure 4E) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006617 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1A) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002106 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26960792 4896 2020-03-23 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002106 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 low PMID:30279276 4896 2021-03-25 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002106 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 low PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 7D) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002106 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001491 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006616 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1B) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006616 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-04-10 Table 1 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006616 deletion 972 h- rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 PMID:30639107 4896 2024-07-10 (Fig. 1B) PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga4 rga4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0004936 deletion 972 h- mbx1 mbx1delta deletion ECO:0000337 PMID:15509866 4896 2015-11-22 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph mbx1 mbx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.06 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PomBase SPBC119.16c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph den11 den11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.16c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph den11 den11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- den11 den11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC119.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 den11 den11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 den11 den11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003315 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-ts cdc8ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9765059 4896 2015-04-14 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001493 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-ts cdc8ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9765059 4896 2015-04-14 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0008275 1-10 Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-(11-210) aps1-Ndelta10 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_enzyme(PomBase:SPAC13G6.14) PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 3A) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0007586 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15517003 4896 2020-12-30 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0003839 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0005713 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:15265986 4896 2016-10-06 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002555 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000941 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000082 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000082 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 A spot assay showed that the cdc14-E2 allele was comparable in its temperature sensitivity to cdc14-118 (Figure 1C). PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000082 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0001382 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0001128 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0001355 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000158 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:8334307 4896 2014-08-12 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000133 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-19 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000133 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 While cdc14-118 cells showed the classic sin phenotype of multinucleation and cell elongation at the non-permissive temperature, cdc14-E2 cells arrested uniformly at a very late stage of septation and frequently lysed (Figure 1B). PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002061 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0003028 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0001368 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0001470 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0006004 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-21 data not shown PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0007579 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15517003 4896 2020-12-30 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000833 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002559 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.06c) PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002442 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:11694585 4896 2017-05-11 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002967 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0005709 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 Similar results were obtained in cdc14-118, sid1-239, and cdc11-136 mutants (not shown). PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0003126 S213P Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-118 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-21 data not shown PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.07 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph SPAC9G1.07 SPAC9G1.07delta deletion 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phenotype was observed when the mutations were combined (Fig. 4B), suggesting that Sfp1, Ifh1, and Fhl1 function in the same pathway that regulates cell proliferation. Consistently, like the Dsfp1 mutation (Fig. 1I), the Difh1 and Dfhl1 mutations were also able to ameliorate the growth defect caused by the absence of the functional GATOR1 complex (Fig. 4C). PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 crf1 crf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0006926 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 crf1 crf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crf1 crf1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0004325 deletion 972 h- crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 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deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph crf1 crf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crf1 crf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- crf1 crf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crf1 crf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crf1 crf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:8898367 4896 2015-03-31 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0001232 PMID:28513584 4896 2022-05-09 (Fig. S1) PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0001232 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- pkl1 pkl1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:8898367 4896 2015-03-31 PomBase SPCC297.05 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph SPCC297.05 SPCC297.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC297.05 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPCC297.05 SPCC297.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC297.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- SPCC297.05 SPCC297.05delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC297.05 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC297.05 SPCC297.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC297.05 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ 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h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0000161 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30201262 4896 2019-11-25 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003338 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0002998 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003371 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.06c) PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0007200 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30201262 4896 2019-12-13 (Fig. 1) PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0005430 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006029 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000248 high PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006029 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000248 low PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006207 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-08 (Fig. 3D) PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001365 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0000745 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:20705466 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0002061 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004652 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0002999 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:22024167 4896 2017-12-18 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001357 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001904 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30201262 4896 2019-11-25 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001904 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0002060 L57S Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002687 E116R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-E116R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0004854 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002852 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.06c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC146.13c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC926.03) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002127 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.02) PMID:20603077 4896 2023-10-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002999 S332A,S353A,S357A,S361A,S408A,S443A,S511A,S702A,S732A,S774A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc15 cdc15-S11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:25688133 4896 2015-07-22 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 S21G,Y36A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-S21G,Y36A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc6 emc6delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc6 emc6delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000164 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc6 emc6delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 emc6 emc6delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000237 PMID:40124504 4896 2025-04-12 Likewise, the deletion of genes encoding the above predicted components of the S. pombe EMC (emc3D, emc5D and emc6D) renders a cold- sensitive phenotype too (Figure 1D). PomBase SPCC1020.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 emc6 emc6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 emc6 emc6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 emc6 emc6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.11c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph emc6 emc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 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W27S Not assayed or wild type 972 h- rib4 rib4-W27S amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11856310 4896 2013-10-11 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pht1 pht1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0003556 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000227 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 Knockout or depletion of H2A.Z in Sc 15 or mammalian cells 5 leads to increased rates of chromosome loss. This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004516 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000354 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007710 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000354 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007199 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000006 high PMID:28446597 4896 2019-12-17 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007199 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000006 high assayed_using(PomBase:SPBPJ4664.05) PMID:28446597 4896 2019-12-17 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 medium PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009012 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0005887 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 14 PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Figure 5A) PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0006372 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 (iii) entanglement leading to breakage, where broken pieces of chromatin with no kinetochore lag on the spindle (Fig. 4b). PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0003557 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19693008 4896 2024-01-15 (Delta)pht1 caused a disproportionate increase in antisense transcripts at many (,5-8%) euchromatic loci (Fig. 1e-g and Supplementary Fig. 5), as confirmed by PCR with strand-specific reverse transcription (RT-PCR; Fig. 1f). PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0003557 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0002664 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004342 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001840 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000340 PMID:7808414 4896 2014-08-01 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0006741 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000231 PMID:30134042 4896 2018-11-08 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pht1 pht1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0003105 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2015-04-15 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 PMID:7808414 4896 2014-08-01 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004163 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004343 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2015-04-15 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001404 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 PMID:7808414 4896 2014-08-01 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pht1 pht1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0005231 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000123,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000283 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 (iii) entanglement leading to breakage, where broken pieces of chromatin with no kinetochore lag on the spindle (Fig. 4b). PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0002360 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0002336 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0003555 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24957674 4896 2014-07-16 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001383 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pht1 pht1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007328 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007711 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001357 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000067 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001029 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009047 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000371 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001453 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0002047 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 PMID:7808414 4896 2014-08-01 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0001583 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pht1 pht1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0009039 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000077 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0005266 deletion 972 h- pht1 pht1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 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SPBC3D6.03c FYPO:0006783 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.03c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0006783 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0006783 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.16c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0006783 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.11) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC947.05c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.02c),assayed_using(PomBase:SPAC8C9.12c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.03) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC61.01c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.03c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005420 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.03c) PMID:30393157 4896 2018-12-04 Table2 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005823 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 1A) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0005638 PMID:30393157 4896 2018-11-15 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0000224 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0003810 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 4) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0000021 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0001232 PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- trz2 trz2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000340 PMID:30393157 4896 2018-12-04 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 L315E Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-L315E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:39945308 4896 2025-03-27 (Fig. S1E) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000705 L315E Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-L315E amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 2C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006268 L315E Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-L315E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 5) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006268 L315E Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-L315E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 5) PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0001384 T318A,T322A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-T318A,T322A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0002485 T318A,T322A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-T318A,T322A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0003179 T318A,T322A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-T318A,T322A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPSNRNA.07 FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- snu32 snu32+ wild_type ECO:0005638 PMID:18522942 4896 2014-08-15 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000705 1-71,397-1148 Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1-72-396 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000705 1-71,397-1148 Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1-72-396 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12),assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0004608 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-B4 unknown ECO:0001232 PMID:8203159 4896 2015-05-05 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0001915 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-B4 unknown ECO:0001232 PMID:8203159 4896 2015-05-05 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-B4 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000478 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-B4 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0000121 deletion 972 h- sec31 sec31delta deletion ECO:0001232 PMID:11839792 4896 2023-12-11 PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0000582 deletion 972 h- sec31 sec31delta deletion ECO:0001232 37 PMID:11839792 4896 2023-12-11 PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec31 sec31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec31 sec31delta deletion ECO:0005638 PMID:11839792 4896 2023-12-11 None of the colonies or microcolonies was ura4-positive, providing further evidence that sec31 is an essential gene. 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PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002088 I370T,L543P,T700A,K993I,F1158V Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-ts1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:27082518 4896 2016-07-16 (Fig. 7A) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002240 I370T,L543P,T700A,K993I,F1158V Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-ts1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:27082518 4896 2016-07-03 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0005041 D323A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D323A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004304 D272A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D272A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:12556522 4896 2015-01-14 PomBase SPBC4.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC4.02c SPBC4.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 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aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph aha1 aha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- aha1 aha1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aha1 aha1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aha1 aha1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC106.19 FYPO:0008316 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:34119521 4896 2024-10-22 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU (Fig. 2, B-D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000562 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000252 PMID:34119521 4896 2024-10-21 Deletion of the PPR motifs in Ppr10 moderately affected the growth of S. pombe cells on glucose-containing media but severely impaired the growth on glycerol-containing media (Fig. 1E) PomBase SPBC106.19 FYPO:0000705 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:34119521 4896 2024-10-21 The level of Ppr10ΔPPR-Myc is reduced compared with that of WT protein (Fig. 1B). We found that only the full-length Ppr10-Myc coimmunoprecipitated with Mpa1 from whole-cell extract, whereas the mutant Ppr10 did not (Fig. 1C). PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34119521 4896 2024-10-21 deletion of PPR motifs in Ppr10 severely reduced the steady-state levels of Cob1 (subunit of the cytochrome bc 1 complex), the core subunits of cytochrome c oxidase (Cox1, Cox2, Cox3), and Atp6 (subunit of ATP synthase) (Fig. 1D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34119521 4896 2024-10-21 deletion of PPR motifs in Ppr10 severely reduced the steady-state levels of Cob1 (subunit of the cytochrome bc 1 complex), the core subunits of cytochrome c oxidase (Cox1, Cox2, Cox3), and Atp6 (subunit of ATP synthase) (Fig. 1D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:34119521 4896 2024-10-21 deletion of PPR motifs in Ppr10 severely reduced the steady-state levels of Cob1 (subunit of the cytochrome bc 1 complex), the core subunits of cytochrome c oxidase (Cox1, Cox2, Cox3), and Atp6 (subunit of ATP synthase) (Fig. 1D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:34119521 4896 2024-10-21 deletion of PPR motifs in Ppr10 severely reduced the steady-state levels of Cob1 (subunit of the cytochrome bc 1 complex), the core subunits of cytochrome c oxidase (Cox1, Cox2, Cox3), and Atp6 (subunit of ATP synthase) (Fig. 1D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:34119521 4896 2024-10-21 deletion of PPR motifs in Ppr10 severely reduced the steady-state levels of Cob1 (subunit of the cytochrome bc 1 complex), the core subunits of cytochrome c oxidase (Cox1, Cox2, Cox3), and Atp6 (subunit of ATP synthase) (Fig. 1D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0007525 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.15c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU and reduced the association of Mti2 and Mti3 with mitoribosomes (Fig. 2, B-D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0007525 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:34119521 4896 2024-10-21 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU and reduced the association of Mti2 and Mti3 with mitoribosomes (Fig. 2, B-D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000703 253-322 Knockdown 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBP4H10.15) PMID:34119521 4896 2024-10-21 The PPR motifs of Ppr10 are not involved in the association of Ppr10 with a subset of mitoribosomal proteins PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001972 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 39 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001791 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:28242692 4896 2017-04-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001733 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:28242692 4896 2017-04-28 (Fig. 2B) PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000769 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 80 PMID:28242692 4896 2017-04-28 (Fig. 1D-F) PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0003973 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:28242692 4896 2017-05-03 and the NPCs that were present were localized to regions that were largely free of karmellae and tubulo-vesicular structures (Fig. 4D). PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001894 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 high PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000278 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 high PMID:28242692 4896 2017-05-03 (Fig. 1A) PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0006018 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:28242692 4896 2017-05-03 (Fig. 4B) asterisk PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0006434 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:34382912 4896 2021-09-05 (Figure 2) PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000584 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001475 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:22682253 4896 2012-08-30 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0006019 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:28242692 4896 2017-05-03 4B, arrowheads, and Fig. 5B PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001390 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 1 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0003166 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 30 PMID:28242692 4896 2017-05-03 (Fig. S1A,B) PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000516 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 high PMID:28242692 4896 2017-05-03 cells with abnormal NE morphology at the beginning of the experiment, by contrast, lost nuclear GFP completely over the time course (Fig. S3B). Thus, cytoplasmic GFP resulted from loss of nuclear integrity rather than from defects in nuclear import. PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0008456 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Such hypothetical PM repair does not require Ca2+-dependent ESCRT-III/Vps4 machinery [44], as no apparent defects were seen in hypotonic PM expansion in protoplasts lacking related key play- ers (Additional file 1: Fig. S2E). PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000772 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 PMID:28242692 4896 2017-04-28 Fig. 3B, arrow; Fig. 3 C and D, quantification, Figure 4 B PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vps4 vps4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vps4 vps4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vps4 vps4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vps4 vps4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2G11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps4 vps4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000121 D182N Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-D182N amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11739743 4896 2026-01-04 We ex- pressed these mutant genes under the control of the nmt1 promoter in a spo4 mutant. As Fig. 2C shows, none of these mutant spo4 genes complement the sporulation defect of the spo4 mutant. PomBase SPCC188.04c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc25 spc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.04c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc25 spc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- spc25 spc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC188.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc25 spc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.04c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc25 spc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0005233 1-95 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:12604790 4896 2016-02-03 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0004921 1-95 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000703 1-95 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1347.10),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002060 1-95 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000276 G145D Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6-ds1 amino_acid_mutation ECO:0001232 88 PMID:22042620 4896 2020-06-25 (Fig. 1, A and B) PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002328 G145D Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6-ds1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22042620 4896 2020-12-18 (Fig. S5B) PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002328 G145D Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6-ds1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22042620 4896 2020-12-18 (Fig. S5B) PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf18 cwf18delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph cwf18 cwf18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- cwf18 cwf18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf18 cwf18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP1E11.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf18 cwf18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 V42VGVPLL,42-46 Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K33deltaK22 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0005097 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:36481249 4896 2023-04-12 having 1C and 2C DNA peak (Fig. 3C, upper panel) with a majority of cells having 1C DNA peak indicating a G1 arrest while only 2C DNA peak was observed in wild type cells grown under similar conditions PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000031 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 94 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 wat1 wat1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 wat1 wat1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0004481 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002678 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001807 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:36481249 4896 2023-04-11 The phosphorylation of Psk1 and Rps602 was completely abolished in wat1Δ, wat1-17, and tor2-287 mutants after shifting the cells at non-permissive temperature (Fig. 4A, upper and middle panel). PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002678 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001807 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:36481249 4896 2023-04-12 The phosphorylation of Psk1 and Rps602 was completely abolished in wat1Δ, wat1-17, and tor2-287 mutants after shifting the cells at non-permissive temperature (Fig. 4A, upper and middle panel). PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002033 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002033 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:29699848 4896 2019-04-03 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000705 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:29699848 4896 2019-04-03 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000708 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29699848 4896 2019-02-07 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001382 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000208 low assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000826 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000227,FYECO:0000229 assayed_transcript(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:36481249 4896 2023-04-11 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001130 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:36481249 4896 2023-04-11 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001890 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000227,FYECO:0000229 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:36481249 4896 2023-04-11 Real-time quantitative PCR analysis revealed the up-regulation of transcripts of per1 and isp5 genes and down regulation of cat1 gene in wat1Δ, wat1-17, and tor2-287 mutant background at the non-permissive temperature (Fig. 4B) PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001890 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000227,FYECO:0000229 assayed_transcript(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:36481249 4896 2023-04-11 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001309 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:39910760 4896 2025-02-13 If CLS extension by Ecl1 is mediated by the same pathway as TORC1, no additive CLS extension would be observed if Ecl1 was overexpressed in a TORC1 subunit-deficient cell. Although wat1+ deletion or ecl1+ overexpression extended the CLS, overexpression of ecl1+ in the wat1-deficient cells did not result in further CLS extension, suggesting that Ecl1 and Wat1 function in CLS extension through the same pathway. (However, because Wat1 is a component of TORC1 and TORC2 (Ahamad et al., 2018), further experiments are required to clarify whether Ecl1-induced CLS extension is exclusively mediated by TORC1) PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 wat1 wat1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002401 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 wat1 wat1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low low PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 wat1 wat1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000776 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000703 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC4C5.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:21035342 4896 2016-07-08 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000703 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001029 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:36481249 4896 2023-04-11 cells were unable to grow on the plates containing canavanine (Fig. 4C). Interestingly, wat1Δ, wat1-17, and tor2-287 mutant cells exhibited resistance to canavanine (Fig. 4C) suggesting that disruption of wat1 leads to inactivation of the TORC1 pathway resulting in the defect in amino acid uptake PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000726 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000456 PMID:33437930 4896 2025-01-02 The spotting assay revealed the enhanced pyrogallol sensitivity of wat1/pop3 delete cells as compared to wild type cells (Fig. 1A) PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000271 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000207 PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002788 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 PMID:29699848 4896 2019-02-07 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001492 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:36481249 4896 2023-04-12 wat1Δ and wat1-17 mutant cells were a little elongated with an average size of 18.5 μm (Fig. 3A and 3B). PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0000648 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:36481249 4896 2023-04-12 In contrast, under the same condition, the wat1Δ and wat1-17 mutant cells became shorter in size with a round morphology having an average cell length of 7.7 and 8.3 μm, respectively (Fig. 3A and 3B) PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wat1 wat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- wat1 wat1delta deletion ECO:0005638 PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 wat1 wat1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1620.07c FYPO:0006927 wild type Overexpression 972 h- lnp1 lnp1+ lnp1+X2 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000126 low PMID:31015410 4896 2019-06-06 (Fig. 3f) PomBase SPCC1620.07c FYPO:0000887 wild type Overexpression 972 h- lnp1 lnp1+ lnp1+X2 wild_type ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 7B) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 disruption Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-D1 disruption ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:9843572 4896 2017-04-19 (Figure 3B) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 disruption Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-D1 disruption ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:9843572 4896 2017-04-19 (Figure 3B) PomBase SPBC839.08c FYPO:0004561 wild type Overexpression 972 h- its8 its8+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0004213 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000082 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0005300 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0009057 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:36435910 4896 2023-04-14 (Figure 2a) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0002638 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001387 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000324 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0002688 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000091 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0004366 T307A,E379G,L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000705 98-113 Not assayed or wild type 972 h- yep1Δ hva22 yep1delta(98-113) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 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rng2-Ns Rng2Ns-non-phosphorylatable|rng2Ns partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:38041816 4896 2024-07-01 Strikingly, the Rng2 fragment (aa 1-300), previously called Rng2Ns,44 began to localize to the division site at the onset of anaphase and constricted during cytokinesis (Figure 4D and Video S3) PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0001382 S462A Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-S462A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:26804917 4896 2017-12-15 PomBase SPCC188.06c FYPO:0000082 E277A,H278A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E277A,H278A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002060 E277A,H278A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E277A,H278A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPAC26A3.11 SPAC26A3.11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.11 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph 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prototroph mtl3 mtl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- mtl3 mtl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC215.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtl3 mtl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC215.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtl3 mtl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0002894 (-130)-(-102) Not assayed or wild type 972 h- ncs1 ncs1-mec1-promoter-delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.04) PMID:20018864 4896 2014-12-15 PomBase SPAC328.08c FYPO:0000082 R209P Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0000091 R209P Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000227 K6Q,K8Q,K13Q,K17Q Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KQ K5Q,K7Q,K12Q,K16Q amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 Knockout or depletion of H2A.Z in Sc 15 or mammalian cells 5 leads to increased rates of chromosome loss. This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0006742 K6Q,K8Q,K13Q,K17Q Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KQ K5Q,K7Q,K12Q,K16Q amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:30134042 4896 2018-11-08 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0000825 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC713.12) PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0007559 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0007558 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0000979 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0002343 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0007557 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0000087 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0000089 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0002476 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1802 rps1802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- rps1802 rps1802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1259.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1802 rps1802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000705 157-325 Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-N(1-156) Nstn1|stn1N(1-156) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC365.06),assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000703 157-325 Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-N(1-156) Nstn1|stn1N(1-156) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC409.12c),assayed_using(PomBase:SPCC1393.14) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000088 F660A,I661A Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-F660A,I661A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPBC4F6.04 FYPO:0003412 rpl2502::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpl2502 rpl2502::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000703 G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160A srp7-A-160 nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160A srp7-A-160 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 medium PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160A srp7-A-160 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160A srp7-A-160 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160A srp7-A-160 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001309 deletion 972 h- btf3 btf3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0007391 deletion 972 h- kanR btf3 btf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22737087 4896 2020-05-12 (Fig. 1, Table 1) PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 btf3 btf3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 btf3 btf3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0004325 deletion 972 h- btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- btf3 btf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btf3 btf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- btf3 btf3delta deletion ECO:0005638 PMID:17211518 4896 2020-11-26 PomBase SPAC4F10.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btf3 btf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 S7SGVPHS Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-J12 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003919 591-775 Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-(1-590)(deltaKA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000017 591-775 Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-(1-590)(deltaKA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36574843 4896 2023-12-18 neither Cdr2(1-330) nor Cdr2(1-590) truncations reduced cell size or formed cytoplasmic clusters (Fig. 7, B-D) despite expression of all constructs to similar levels (Fig. S3A). PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002680 591-775 Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-(1-590)(deltaKA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0005487 C29A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-C29A amino_acid_mutation ECO:0005801 low PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 3) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000826 C29A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-C29A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000409 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 5) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0007933 C29A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-C29A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000409 PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 4) PomBase SPAC19B12.01 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ceo5 ceo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ceo5 ceo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- ceo5 ceo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19B12.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ceo5 ceo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0003412 ubc13::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ubc13 ubc13::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001324 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3A12.14) PMID:2690071 4896 2013-05-30 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000584 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:2690071 4896 2013-05-30 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002277 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3A12.14) PMID:2690071 4896 2013-06-13 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000760 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:2690071 4896 2013-05-30 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000478 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:2690071 4896 2013-05-30 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001317 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3A12.14) PMID:2690071 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001420 R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-F116 cam1-116F amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2690071 4896 2013-05-30 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0005970 580-681 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtF partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPAC1705.03c FYPO:0004083 580-681 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtF partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) The immunoblot analysis detected an appreciable amount of Ecm33 fragments A, C, F, G, and I PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007594 deletion 972 h- atg43 atg43delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-07 (Figure 1D) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 high PMID:33138913 4896 2021-01-08 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg43 atg43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.01c 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0000087 deletion 972 h- mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0000797 deletion 972 h- mrpl39 mrpl39delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0002546 deletion 972 h- mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- mrpl39 mrpl39delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4F6.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl39 mrpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000161 450-506,S15A,S24A,T34A,S46A,S62A,S95A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm-6Ala amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 10 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 3C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 450-506,S15A,S24A,T34A,S46A,S62A,S95A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm-6Ala amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 30 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 3D) PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0001490 csc1-R31A-SPB constitutive Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A-GFP-pcp89-GBP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:38865179 4896 2024-07-10 died as single elongated cells, consistent with SIN inactivation (Figure S2, C and D) PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0002061 csc1-R31A-SPB constitutive Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A-GFP-pcp89-GBP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:38865179 4896 2024-07-10 Interestingly, we found that cells producing both Csc1-GFP and either Ppc89-GBP-mCherry (Figure S2A) or Sid4-GBP-mCherry (Figure 3A) were inviable. PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001384 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000082 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:33137119 4896 2021-04-13 As previously described [33], mutating both Tor1-dependent phosphorylation sites, S546 and S527, to alanine, abolished the ability of cells to grow at high temperature or in the presence of osmotic stress (Fig 3B) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000082 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000708 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000088 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:33137119 4896 2021-04-13 Additionally, the phosphorylation sites of Gad8 are required for genotoxic stress, since gad8-S527A/S546A mutant alleles are also sensitive to DNA damage and DNA replication stress (S5B Fig). PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001214 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:33137119 4896 2021-04-13 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000271 S527A,S546A Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527A,S546A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0000705 1-407 Not assayed or wild type 972 h- mts4 mts4-Ndelta2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.12),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPBC3B9.07c FYPO:0002061 C88S,P98T,L106M,N142S,F152L,A171E Not assayed or wild type 972 h- rpa43 rpa43-ts1248 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12207036 4896 2018-05-29 PomBase SPCC285.14 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs130 trs130delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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PomBase SPAC17H9.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- mtl1 mtl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17H9.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtl1 mtl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17H9.02 FYPO:0002451 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtl1 mtl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0003564 deletion 972 h- spo5 spo5delta deletion ECO:0000337 PMID:16896214 4896 2014-07-17 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0001914 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spo5 spo5delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0003561 deletion 972 h- spo5 spo5delta deletion ECO:0001232 PMID:16896214 4896 2014-07-17 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0003549 deletion 972 h- spo5 spo5delta deletion 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partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. S1E) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003482 793-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(1-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003482 793-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(1-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high low assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 793-1372 Overexpression 972 h- fus1delta fus1 fus1-N(1-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3A) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003527 793-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(1-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1E, F and G) PomBase SPCC1223.02 FYPO:0001907 unknown Not assayed or wild type 972 h- nmt1 thi3-1 unknown ECO:0005801 PMID:1868574 4896 2015-03-12 PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0002061 391-396 Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-3'END partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0001309 deletion 972 h- glm2 glm2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 glm2 glm2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 glm2 glm2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 glm2 glm2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph glm2 glm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- glm2 glm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glm2 glm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glm2 glm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0007206 1-145,365-504 Not assayed or wild type 972 h- reb1 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4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002679 331-775 Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-1-330(deltaC-KA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000017 331-775 Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2-1-330(deltaC-KA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36574843 4896 2023-12-18 neither Cdr2(1-330) nor Cdr2(1-590) truncations reduced cell size or formed cytoplasmic clusters (Fig. 7, B-D) despite expression of all constructs to similar levels (Fig. S3A). PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000007 disruption Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1::ura4 disruption ECO:0005580 FYECO:0000260 PMID:9566891 4896 2019-11-07 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0005704 disruption Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1::ura4 disruption ECO:0005638 PMID:9566891 4896 2019-11-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0007142 disruption Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1::ura4 disruption ECO:0005638 PMID:9566891 4896 2019-11-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0005705 disruption Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1::ura4 disruption ECO:0005638 PMID:9566891 4896 2019-11-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001492 disruption Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1::ura4 disruption ECO:0001232 20 PMID:9566891 4896 2019-11-07 PomBase SPCC16C4.22 FYPO:0000705 L10A,I18A,L35A,F43A,L47A,F80A Not assayed or wild type 972 h- dpb3 dpb3-6A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.09),assayed_using(PomBase:SPCC16C4.22) PMID:29109278 4896 2017-12-04 PomBase SPCC16C4.22 FYPO:0000705 L10A,I18A,L35A,F43A,L47A,F80A Not assayed or wild type 972 h- dpb3 dpb3-6A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c),assayed_using(PomBase:SPCC16C4.22) PMID:29109278 4896 2017-12-04 PomBase SPCC16C4.22 FYPO:0003412 L10A,I18A,L35A,F43A,L47A,F80A Not assayed or wild type 972 h- dpb3 dpb3-6A amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:29109278 4896 2017-11-15 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 R22E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R22E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 R22E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R22E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 R22E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R22E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0003131 R22E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R22E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000089 R22E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R22E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000268 R22E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-R22E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000705 I370E Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-I370E amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10),assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 2D) PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0002678 T180A,S192A Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1.AA S192A|xlf1-T180A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_substrate(PomBase:SPCC24B10.14c) PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0003912 T180A,S192A Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1.AA S192A|xlf1-T180A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0000482 T180A,S192A Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1.AA S192A|xlf1-T180A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25533340 4896 2015-07-28 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0003584 T180A,S192A Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1.AA S192A|xlf1-T180A amino_acid_mutation ECO:0000340 PMID:25533340 4896 2015-07-28 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000969 W436A Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-W436A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28134253 4896 2018-01-18 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0001690 W436A Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-W436A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28134253 4896 2018-01-18 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0001164 W436A Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-W436A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28134253 4896 2018-01-18 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000703 W436A Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-W436A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPCC5E4.06) PMID:28134253 4896 2018-01-18 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001839 S317E,S329E,S484E,S487E,S496E,S497E,S538E Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-7E amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31131414 4896 2020-03-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 S317E,S329E,S484E,S487E,S496E,S497E,S538E Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-7E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:31131414 4896 2020-03-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001357 S317E,S329E,S484E,S487E,S496E,S497E,S538E Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-7E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31131414 4896 2020-03-24 PomBase SPBC1289.02c FYPO:0000703 710-1277 Not assayed or wild type 972 h- uap2 uap2-deltaRRM2 partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1289.02c),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:9371883 4896 2014-06-30 PomBase SPAC22H10.12c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gdi1 gdi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- gdi1 gdi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22H10.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gdi1 gdi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 N153S Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-RD1R-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004376 wild type Overexpression 972 h- swi6 swi6+ wild_type ECO:0000049 PMID:11387218 4896 2015-02-13 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004377 wild type Overexpression 972 h- swi6 swi6+ wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11387218 4896 2015-02-13 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004742 wild type Overexpression 972 h- swi6 swi6+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000964 wild type Overexpression 972 h- swi6 swi6+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004743 wild type Overexpression 972 h- swi6 swi6+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 wild type Overexpression 972 h- swi6 swi6+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002827 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0005638 PMID:8138176 4896 2014-08-12 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002141 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0001839 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0000059 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0004910 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002687 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-E22 unknown ECO:0000337 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000704 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Co-immunoprecipitation experiments using anti-Myc beads revealed that loss of sls1 abolished the association of Mrh5-Myc with Prp4-CBP and Mtf2-HA (Fig. 2C). PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000704 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Co-immunoprecipitation experiments using anti-Myc beads revealed that loss of sls1 abolished the association of Mrh5-Myc with Prp4-CBP and Mtf2-HA (Fig. 2C). PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000835 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Δsls1 cells lacked spectral a+a3 peak, were devoid of Cox1 and very depleted in Cox2 (Figure 11B, C). PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001324 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of sls1 resulted in a drastic reduction in the protein level of Mtf2 (Fig. 1B). A PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000833 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 (Fig. 1A) PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000833 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001983 deletion 972 h- sls1 sls1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Δsls1 cells lacked spectral a+a3 peak, were devoid of Cox1 and very depleted in Cox2 (Figure 11B, C). PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph sls1 sls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.14c FYPO:0001719 deletion 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wdr44 wdr44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- wdr44 wdr44delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3H5.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wdr44 wdr44delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wdr44 wdr44delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000912 K3R,K10R,K22R,K26R,K54R,K82R,K121R,K124R,K162R,K164R,K174R,K217R,K237R,K262R Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-14KR amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:29975113 4896 2018-07-31 (Figure 2G) PomBase SPBC649.05 FYPO:0000940 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000244 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5A) plo1 localisation to SPB is dependent on fin1 activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1D, E) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-10-06 (Fig. 1C) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007184 G71V Not assayed or wild type 972 h- cdc2-33 cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 Kinase assays of these mitotic samples indicated that the cut12.s11 mutation promoted a 1.6 (±0.18; n = 5) in-crease in Plo1-specific activity during mitosis(Fig. 2D). PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 G71V Not assayed or wild type 972 h- cdc2-33 cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 Plo1-associated kinase activity of extracts from arrested cdc2.33 cut12.s11 cells was 2.4-fold(±0.35;n=6)higher than that of the control cdc2.33 cut12+ cells (Fig. 4D). This established that cut12.s11 increased Plo1 activity ininterphase. PomBase SPBC649.05 FYPO:0002969 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:15917811 4896 2016-09-07 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0002061 G71V Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:12815070 4896 2019-11-28 This established that mutating plo1 in a way that did not affect cell viability compromised the ability of cut12.s11 to suppress cdc25.22. Fig 9A. cdc25.22 and cdc25.22 plo1.ts19 cells, on the other hand, could not form colonies on this medium at this temperature, but cdc25.22 cut12.s11 cells could PomBase SPBC649.05 FYPO:0001927 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPBC649.05 FYPO:0000644 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11683390 4896 2016-10-24 Data not shown. PomBase SPBC649.05 FYPO:0002967 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5A) plo1 localisation to SPB is dependent on fin1 activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0000703 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:12815070 4896 2019-11-28 (Figs. 1A,4C) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001357 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:2245912 4896 2020-06-01 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001357 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:2245912 4896 2023-01-25 PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12065422 4896 2020-12-26 PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12065422 4896 2020-12-26 PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5B) premature recruitment of protein to the mitotic SPB PomBase SPBC649.05 FYPO:0000088 G71V Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12.s11 cut12-G71V|cut12-s11|stf1-1|stf1.1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:1549179 4896 2013-01-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0002060 R528N Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-R528N prp10-K666N amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32168916 4896 2021-06-25 (Figure S4) PomBase SPAC13G7.11 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mba1 mba1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC13G7.11 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mba1 mba1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.11 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mba1 mba1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC13G7.11 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mba1 mba1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mba1 mba1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC13G7.11 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mba1 mba1delta deletion 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PMID:31072933 4896 2019-05-17 (Figure 6c) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0002061 S626P Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-S626P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0000268 S626P Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-S626P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31072933 4896 2019-05-17 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000252 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-13A unknown ECO:0001232 38 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000760 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-13A unknown ECO:0005638 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-13A unknown ECO:0001232 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000400 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003485 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2024-03-18 DNA synthesis and cell number increase were rapidly inhibited (data not given but similar to the mitotic mutant cdc 2 in Fig. 5 of Nurse et al. 1976) PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000446 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 cdc28-P8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006521 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7A-B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001122 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003075 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000170 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000069 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 W128R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E39 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0003267 1-240 Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004481 1320-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-1320-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001880 1320-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-1320-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0003209 1320-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-1320-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000644 1320-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-1320-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002106 1320-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-1320-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPBC24C6.09c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBC24C6.09c SPBC24C6.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph SPBC24C6.09c SPBC24C6.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.09c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph SPBC24C6.09c SPBC24C6.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.09c 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PomBase SPBC660.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- wwm2 wwm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC660.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wwm2 wwm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wwm2 wwm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.04 FYPO:0001645 I572A Not assayed or wild type 972 h- sup35 sup35-I572A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:19417105 4896 2016-10-30 Supplemental Table S1; Supplemental Fig. S3 PomBase SPBC83.18c FYPO:0000674 T178A,S241A,P257A Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-2A-P257A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 3B) PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001274 A11D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-A11D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001645 A11D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-A11D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000833 A11D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-A11D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001245 A11D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-A11D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPAC18B11.10 FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- tup11 tup11+ wild_type ECO:0000059 PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC18B11.10 FYPO:0003776 wild type Overexpression 972 h- tup11 tup11+ wild_type ECO:0005638 PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002666 Y139A Not assayed or wild type 972 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assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 1b) PomBase SPBC409.05 FYPO:0007880 unknown Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A4 skp1.A4 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC1783.04c) PMID:34608864 4896 2021-11-05 PomBase SPBC409.05 FYPO:0002635 unknown Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A4 skp1.A4 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 3) PomBase SPCC31H12.05c FYPO:0000444 313-322,A312ATPPRKNKTGNSK Overexpression 972 h- sds21 sds21-TPPR amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7957097 4896 2015-12-04 PomBase SPCC31H12.05c FYPO:0004922 313-322,A312ATPPRKNKTGNSK Overexpression 972 h- sds21 sds21-TPPR amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7957097 4896 2015-12-04 PomBase SPCC31H12.05c FYPO:0001234 313-322,A312ATPPRKNKTGNSK Overexpression 972 h- sds21 sds21-TPPR amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 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PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0005523 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0003906 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0000957 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPBC12C2.10c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- pst1 pst1-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-03 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0001734 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000290,FYECO:0000300 high PMID:20967237 4896 2020-02-24 (Fig. 6D,E) in presence of LatA + MBC there is no SPB separation compared to + MBC only where SPBs can separate PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002561 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007862 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000290,FYECO:0000300 PMID:20967237 4896 2019-10-30 (Fig. 5A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000290 PMID:20967237 4896 2019-10-22 (Fig. 3C) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-19 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002024 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0001493 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15957215 4896 2015-04-21 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15957215 4896 2015-04-21 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9254700 4896 2015-12-10 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002004 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000290 PMID:20967237 4896 2019-10-22 (Fig. 3B) just a short microtubule stub remains PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007858 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0005580 FYECO:0000137,FYECO:0000290,FYECO:0000300 high PMID:20967237 4896 2019-07-01 (Fig. 1C) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0006004 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 1A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007579 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 PMID:15517003 4896 2020-12-30 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002442 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1289.01c) PMID:22905165 4896 2020-02-27 (Fig. 1B) in which the SIN signal does not turn off, Cfh3p localized to the edge of the growing septa and it remained at the septal area after the septa had been completed. Thus, Cfh3p can arrive at the cell midzone in the absence of the SIN pathway but it requires that the SIN signal must be turned off for it to be removed from the cell equator after mitosis PomBase SPCC1739.11c FYPO:0005779 unknown Not assayed or wild type 972 h- h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:20967237 4896 2019-07-02 (Fig. 2A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002558 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007859 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000290 PMID:20967237 4896 2019-10-22 (Fig. 3D) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007859 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 30 PMID:20967237 4896 2019-10-22 (Fig. 3E) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0003126 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 1A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007861 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000290,FYECO:0000300 73 PMID:20967237 4896 2019-10-30 (Fig. 4B) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007861 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000290,FYECO:0000300 high PMID:20967237 4896 2019-10-30 data not shown PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007861 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000290,FYECO:0000300 70 PMID:20967237 4896 2019-10-30 (Fig. 4C) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007860 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-119 R947H,T1041I unknown ECO:0001232 FYECO:0000290,FYECO:0000300 high PMID:20967237 4896 2019-10-30 (Fig. 4A) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002061 1-170,577-710 Overexpression 972 h- pkd2 pkd2-TM pkd2TM partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:37723847 4896 2023-10-15 Interestingly, the internal transmembrane region was sufficient to induce both CDRE activation and growth inhibition (Figure 1a,d). PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000644 1-170,577-710 Overexpression 972 h- pkd2 pkd2-TM pkd2TM partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.03) PMID:37723847 4896 2023-10-15 Localizations of Pkd2ΔN170, Pkd2ΔC577, or Pkd2TM were identical to full length Pkd2 (Figures 2b and S2A). PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002290 S530A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-S530A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. S1) PomBase SPAC323.01c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pos5 pos5delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC323.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pos5 pos5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPAC323.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000035 deletion 972 h- pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPAC323.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pos5 pos5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC323.01c FYPO:0002673 deletion 972 h- pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPAC323.01c FYPO:0002253 deletion 972 h- pos5 pos5delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Fig. S2C) PomBase SPAC323.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pos5 pos5delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC323.01c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC323.01c FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pos5 pos5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPAC323.01c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.01c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pos5 pos5delta deletion ECO:0005638 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PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001324 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2F) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0005467 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2D-E) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001365 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) However, imp2-17E cells exhibited slower CR constriction. In fact, CR remnants remained in 62% of imp2-17E cells for the duration of our observation. PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002562 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 3) Imp2-11E-mNG was not recruited to the CR later than Imp2-mNG but its peak accumulation was delayed compared to wild-type (Fig. 3A, B, and C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001368 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007828 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001760 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001903 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002253 S383E,S396E,T438E,S454E,S456E,S469E,S480E,S503E,S520E,S524E,T554E,T560E,S564E,S565E,S584E,T595E,S596E Knockdown 972 h- imp2 imp2-17E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S3B-C) PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003338 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003444 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004562 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0002656 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006307 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003339 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006305 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004895 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001904 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 10 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0005475 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006308 K23A,S24A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0005220 L68S Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-L68S amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004392 L68S Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-L68S amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L68S Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-L68S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L68S Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-L68S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L68S Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-L68S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002336 S2A,S4A,T77A,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-10A/I atf1(10A/I) amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 PMID:38289024 4896 2024-03-21 (Figure 3 S2A,B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000703 S2A,S4A,T77A,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-10A/I atf1(10A/I) amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:38289024 4896 2024-04-05 Binding affinity between Atf1 and Swi6HP1 is maintained for non-phosphorylatable Atf1(10A/I) at 37°C, but disrupted for phosphomimetic Atf1(10D/E) even at 30°C. PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005159 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 PMID:16849602 4896 2015-12-21 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000170,FYECO:0000229 PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0002097 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c),assayed_substrate(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:16849602 4896 2015-12-17 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15194812 4896 2014-09-10 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15194812 4896 2014-09-10 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005160 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000260 PMID:16849602 4896 2015-12-21 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005160 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000260 PMID:16849602 4896 2015-12-21 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0003800 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:15194812 4896 2014-09-19 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0003800 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:15194812 4896 2014-09-19 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000963 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:16849602 4896 2015-12-16 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc45 sna41-928 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:15194812 4896 2014-09-10 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-673,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-673,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-673,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-673,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-673,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-673,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1348.07 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1348.07 SPBC1348.07delta deletion ECO:0005638 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assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c),assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 2D) PomBase SPCC895.07 FYPO:0003614 C450R Knockdown 972 h- hht1-CFP mCherry-atb2 alp14 alp14-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000135,FYECO:0000141 PMID:34346498 4896 2021-09-12 (Figure 6B) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0006606 32-117 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaWSC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 increased lateral diffusion in membrane. Finally, Wsc1DWSC-GFP and Wsc1DSTR-GFP, which are incapable of clustering, exhibited much smaller half-times—closer to that of mCherry-Psy1 (Figures 6A, 6B, and S6A). PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008004 32-117 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaWSC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 In sharp contrast, Wsc1DSTR-GFP, Wsc1DWSC-GFP and Wsc1DSTRDWSC-GFP cells were completely devoid of any clustering phenotype, with an enrichment at contacts close to $2 (Figures 5D, 5E, and S2F-S2H). PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008012 32-117 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaWSC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:34666001 4896 2022-06-30 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258,N63R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-N63R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258,N63R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-N63R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 plb3 plb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph plb3 plb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.03c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph plb3 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2016-01-20 (Fig. 1a) PomBase SPAC144.13c FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001128 wild type Overexpression 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0001232 PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000836 wild type Overexpression 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:10921876 4896 2016-01-20 (Fig. 1a) PomBase SPAC144.13c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0005638 PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPCP31B10.08c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl35A01 rpl35A01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP31B10.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpl35A01 rpl35A01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 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PomBase SPAC1783.03 FYPO:0000964 S2A,S7A,S10A,S15A,S16A,S17A,S18A,S21A,S23A Not assayed or wild type 972 h- fta2 fta2-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:39016088 4896 2024-10-05 (Fig. 2) PomBase SPAC1296.02 FYPO:0006141 deletion 972 h- cox4 cox4delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPAC1296.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0008128 deletion 972 h- cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0007618 deletion 972 h- cox4 cox4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0007612 deletion 972 h- cox4 cox4delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- cox4 cox4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cox4 cox4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- cox4 cox4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox4 cox4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1296.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox4 cox4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002861 H336N Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-H336N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:22608966 4896 2013-11-10 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001118 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 20 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0008263 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 high assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:24498240 4896 2024-07-03 Pmk1 activation induced by hypo- and hyper-osmotic stress totally depends upon the signaling mediated by Rho2 (Figure 2A) PomBase SPAC16.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001382 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 low assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:24498240 4896 2024-07-03 On the contrary, MAPK activation triggered by oxidative (hydrogen peroxide) and cell wall (Caspofungin) stresses is only partially dependent on this GTPase (Figure 2B and C) PomBase SPAC16.01 FYPO:0001885 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:18793338 4896 2013-02-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001838 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001838 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009007 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC16.01 FYPO:0005197 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000104 high assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPAC16.01 FYPO:0005197 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000104 high assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPAC16.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC16.01 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC16.01 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rho2 rho2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0002229 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2014-07-24 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000644 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:27385337 4896 2016-09-28 Supplemental Figure S4B PomBase SPAC16.01 FYPO:0000776 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000776 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPAC16.01 FYPO:0003503 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0001232 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC16.01 FYPO:0009030 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001884 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18793338 4896 2013-02-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001103 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0005969 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 low PMID:24498240 4896 2024-07-03 As seen in Figure 1E, rho2D cells showed a partial VIC phenotype in medium supplemented with 0.2 M MgCl2 and became VIC negative in the presence of 0.3 M MgCl2. PomBase SPAC16.01 FYPO:0005969 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000214 low PMID:24498240 4896 2024-07-03 As seen in Figure 1E, rho2D cells showed a partial VIC phenotype in medium supplemented with 0.2 M MgCl2 and became VIC negative in the presence of 0.3 M MgCl2. PomBase SPAC16.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC16.01 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001379 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001473 deletion 972 h- rho2 rho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000214 high PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 2B) 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.17c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC22A12.17c SPAC22A12.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC22A12.17c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC22A12.17c SPAC22A12.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC22A12.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC22A12.17c SPAC22A12.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22A12.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22A12.17c SPAC22A12.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22A12.17c SPAC22A12.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001181 D676N Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-D676N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-09 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003730 deletion 972 h- cob1-Δ-intron cox1-Δ-intron mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 We found that Δmrh5 was essential for respiratory growth, even in Δi background, suggesting that if Mrh5 is involved in intron excision, it also has another role. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001934 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000342 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000252 PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000470 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003423 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003423 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.02) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002056 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Whereas newly-synthesized Cox2 and Cox3 were radioactively labeled, Cox1 synthesis was abolished although the mature cox1 mRNA was only slightly decreased in Δi cells, showing that Mrh5 is required for cox1 translation. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002056 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000059 PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000835 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Cytb level was partly decreased in Δmrh5 and only slightly in the point mutant. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001324 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Additionally, the Mtf2 protein level was moderately reduced in Δmrh5 cells (Fig. 1A). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0008128 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0006446 deletion 972 h- cob1-Δ-intron cox1-Δ-intron mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000291 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34634819 4896 2025-03-31 In Δi cells, the mature cox1 mRNA was absent in Δmrh5 and the precursor RNA containing both cox1 introns accumulated PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0006446 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000291 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34634819 4896 2025-03-31 In Δi cells, the mature cox1 mRNA was absent in Δmrh5 and the precursor RNA containing both cox1 introns accumulated PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001437 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 The Δmrh5 mutation did not impair growth on antimycin containing medium, showing that ATPase activity is not affected (Figure 9A). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.11) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.04) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.07) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.09) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.10) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.08) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0004960 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000833 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mrh5 did not reduce the protein level of Ppr4 (Fig. 1A) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000833 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 (Fig. 1A) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000703 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c),assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mrh5 did not impair the interaction among Prp4-CBP, Sls1-FLAG, and Mtf2-HA (Fig. 2D). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000703 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12),assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mrh5 did not impair the interaction among Prp4-CBP, Sls1-FLAG, and Mtf2-HA (Fig. 2D). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001983 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Western blot analysis was performed on the Δmrh5 and mrh5-G230E mutants, as well as the tagged Mrh5-cMyc strain (Figure 9C). The results showed that Mrh5 is a mitochondrial protein and that Cox1 and Cox2 were undetectable in both mutants. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001983 deletion 972 h- mrh5 mrh5delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Western blot analysis was performed on the Δmrh5 and mrh5-G230E mutants, as well as the tagged Mrh5-cMyc strain (Figure 9C). The results showed that Mrh5 is a mitochondrial protein and that Cox1 and Cox2 were undetectable in both mutants. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mrh5 mrh5delta deletion ECO:0005638 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sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 PMID:16502473 4896 2012-10-30 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0000073 deletion 972 h- sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0001103 deletion 972 h- sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sib1 sib1delta deletion ECO:0005638 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sib1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sib1 sib1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23G3.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sib1 sib1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005369 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6A, S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000082 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6A, S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6A, S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 1A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002085 C643Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C643Y STF-5|STF5|STF8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3A) PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0003304 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25375240 4896 2017-08-04 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0000634 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:25375240 4896 2017-07-27 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0000634 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:25375240 4896 2017-07-27 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0000634 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC970.12) PMID:25375240 4896 2017-07-27 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0000634 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02) PMID:25375240 4896 2017-08-04 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0001270 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25375240 4896 2017-07-27 (Figure 4G) PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0005215 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:25375240 4896 2017-07-27 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0002638 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02) PMID:25375240 4896 2017-08-04 indicated by increased mad2 on unattached kinetochores PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0001489 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25375240 4896 2017-07-27 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0006172 R65C Not assayed or wild type 972 h- mis19 kis1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 32 PMID:25375240 4896 2017-07-27 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000499 49-203 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007594 49-203 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-07 (Figure 1) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0001355 49-203 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 low PMID:33138913 4896 2021-01-11 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000245 49-203 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0000059 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003768 49-203 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3 Supp 1B&C) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007448 49-203 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 1) PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000189 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000291 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0006020 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28366642 4896 2017-05-09 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0006020 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:28366642 4896 2017-05-09 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0004126 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000112 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0004067 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:28366642 4896 2017-05-09 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0004161 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28366642 4896 2017-05-09 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0001117 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000291 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0005229 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0002913 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000291 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0005061 spt5-degron Knockdown 972 h- spt5 spt5-degron fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:28366642 4896 2017-05-09 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 L478A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L478A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 4F) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 L478A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L478A amino_acid_mutation ECO:0000337 low PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5A) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0005917 L478A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L478A amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11),assayed_transcript(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5B) PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0003535 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0003535 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000470 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000155 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0000334 PMID:9559556 4896 2012-02-22 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000155 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 PMID:9450029 4896 2012-02-17 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0003532 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0003532 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000590 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 PMID:9559556 4896 2012-02-22 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0007931 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000411 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000841 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000091 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srb10 srb10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srb10 srb10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001355 cdc20delta::cdc20-dpb2 Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-dpb2 cdc20+-dpb2+ fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:22718908 4896 2018-11-30 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0009032 deletion 972 h- mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0007928 deletion 972 h- mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mug163 mug163delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug163 mug163delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug163 mug163delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1620.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug163 mug163delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP4C9.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- emc5 emc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAP4C9.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- emc5 emc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000237 high PMID:40124504 4896 2025-04-11 Likewise, the deletion of genes encoding the above predicted components of the S. pombe EMC (emc3D, emc5D and emc6D) renders a cold- sensitive phenotype too (Figure 1D). PomBase SPAP4C9.02 FYPO:0000095 deletion 972 h- emc5 emc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAP4C9.02 FYPO:0001188 deletion 972 h- emc5 emc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAP4C9.02 FYPO:0001491 deletion 972 h- emc5 emc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAP4C9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- emc5 emc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002050 K42A,R63A,R115A,R119A,K163A,R177A,K181A,K185A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-core4A,tip-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26702831 4896 2016-02-02 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005307 K42A,R63A,R115A,R119A,K163A,R177A,K181A,K185A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-core4A,tip-4A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC1902.01 FYPO:0000583 wild type Overexpression 972 h- gaf1 gaf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:22900017 4896 2014-07-31 PomBase SPCC1902.01 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 gaf1 gaf1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC1902.01 FYPO:0003902 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP gaf1 gaf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 zip1 zip1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0001407 deletion 972 h- zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:28388826 4896 2019-10-04 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph zip1 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deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph zip1 zip1delta deletion ECO:0005638 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amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16291723 4896 2021-12-29 with lysis (these are not chained cells) (Fig. 2C).....cells septum degradation appeared to initiate at a single position around the cell circumference and the entire cell wall disappeared from this area PomBase SPCC645.06c FYPO:0001880 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC645.06c) PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Figure 5C) PomBase SPCC645.06c FYPO:0003440 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 95 PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Fig. 1A) All cells lysed while undergoing division and the daughter cells remained attached to one another. PomBase SPCC645.06c FYPO:0001366 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Fig. 1A) All cells lysed while undergoing division and the daughter cells remained attached to one another. PomBase SPCC645.06c FYPO:0002442 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Figure 5C) PomBase SPCC645.06c FYPO:0002442 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:16291723 4896 2021-12-29 asked whether Rho1p was able to localize correctly to the medial region of the cell in the lad1-1 strain that we had shown lacks medially placed Rgf3p (Fig. 5C). We found that it did (Fig. 6B). PomBase SPCC645.06c FYPO:0003369 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:16291723 4896 2021-12-29 PomBase SPCC645.06c FYPO:0001234 F867S Not assayed or wild type 972 h- rgf3 lad1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Fig. 1A) PomBase SPCC962.01 FYPO:0008455 266-471 Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1deltaSMP partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000161 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc8 cdc8-A15 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc8 cdc8-A15 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc8 cdc8-A15 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 W498R,I501R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 3D) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0002061 E109K Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-E109K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30026545 4896 2019-08-13 PomBase SPBC32C12.03c 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PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001946 unknown Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001270 unknown Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPBC15C4.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- mrs6 mrs6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC15C4.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrs6 mrs6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15C4.03 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrs6 mrs6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.12c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph png3 png3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.12c 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h- cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 FYECO:0000263 assayed_using(SO:0000105) PMID:33434270 4896 2021-02-03 (Figure 5A) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0007517 wild type Knockdown 972 h- cdc2-asM17 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 PMID:33153481 4896 2020-11-15 (Fig. 2, S5) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000972 wild type Knockdown 972 h- cdc2-asM17 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 PMID:33153481 4896 2020-11-16 (Fig. 6b-d); PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0007518 wild type Knockdown 972 h- cdc2-asM17 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 PMID:33153481 4896 2020-11-15 (Fig. 6b-d) Rad52 foci quantification, G2 arrested cells by cdc2-asM17, + Thiolutin PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0007519 wild type Knockdown 972 h- cdc2-asM17 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 FYECO:0000373 PMID:33153481 4896 2020-11-16 (Fig. 2e) 3D quantification of DAPI stained DNA, G2 arrested cells by cdc2-asM17) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001221 wild type Knockdown 972 h- cdc2-asM17 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 PMID:33153481 4896 2020-11-15 (Fig. S2) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0007328 wild type Knockdown 972 h- cdc2-asM17 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0001232 FYECO:0000373 PMID:33153481 4896 2020-11-18 (Fig. 6b-d) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006279 wild type Knockdown 972 h- skp1- AtTIR1-NLS cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1705.03c),assayed_using(PomBase:SPAC19B12.02c) PMID:31615333 4896 2020-09-19 (Figure 2 and S3) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0005740 wild type Knockdown 972 h- skp1- AtTIR1-NLS, nda3-KM311 cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0000231 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.02c),assayed_using(PomBase:SPAC926.04c) PMID:31615333 4896 2020-09-19 (Figure S1) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0005740 wild type Knockdown 972 h- skp1- AtTIR1-NLS cut14 cut14+ cut14+-aid|cut14-SO|cut14SO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000339 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.02c),assayed_using(PomBase:SPAC926.04c) PMID:31615333 4896 2020-09-19 (Figure 2) PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0001491 deletion 972 h- fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBPB8B6.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- fex2 fex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC227.18 FYPO:0000039 G200E,D299N Not assayed or wild type 972 h- lys3 lys3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17622533 4896 2013-09-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001911 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPBC947.10) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001422 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000134,FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001422 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001571 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1565.08),assayed_using(PomBase:SPBC16A3.09c) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000833 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1565.08) PMID:28821619 4896 2017-10-12 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001245 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001234 R758C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 ade6-M210 his3-D1 leu1-32 cdc48 cdc48-R758C cdc48-10|ntC2346T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC1834.01 FYPO:0001645 F288A Not assayed or wild type 972 h- erf1 erf1-F288A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:19417105 4896 2016-10-30 (Supplemental Table S1). PomBase SPCC736.12c FYPO:0002134 347-488 Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1deltaYTH partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:28765164 4896 2017-10-13 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000214 L662P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L662P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 L662P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L662P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001206 E484A Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-E484A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-24 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 D656A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-D656A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001933 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-11C unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 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FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 7) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000634 1-237 Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 7) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000634 1-237 Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.03c) PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 7) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001355 1-237 Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000381 high PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 6B) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0002574 1-237 Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000106 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:38084929 4896 2025-08-28 CT shows normal localization (Fig. 5B) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001357 1-237 Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000106 PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 6B) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0003241 1-237 Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000381 80 PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 6C-D) PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:8598051 4896 2014-12-05 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000252 PMID:8598051 4896 2014-12-05 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8598051 4896 2014-12-05 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8598051 4896 2014-12-05 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rnp24 rnp24delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rnp24 rnp24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- rnp24 rnp24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnp24 rnp24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G6.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnp24 rnp24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002003 Y335A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-Y335A amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000140 assayed_region(SO:0002216) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 Y335A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-Y335A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 Y335A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-Y335A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 Y335A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-Y335A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 Y335A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-Y335A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0008120 F292A,I293A,E294A,N295A Not assayed or wild type 972 h- spt20 spt20-FIEN amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 complete assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0000088 F292A,I293A,E294A,N295A Not assayed or wild type 972 h- spt20 spt20-FIEN amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPAC3C7.08c FYPO:0000784 Q863* Not assayed or wild type 972 h- elf1 elf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 5-10 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.08c) PMID:12110682 4896 2018-12-15 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0007299 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 PMID:32075773 4896 2020-03-22 (Fig. 2B, S2B-D) PomBase SPBC1709.05 FYPO:0007299 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 PMID:32075773 4896 2020-03-22 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0003706 deletion 972 h- sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 PMID:9161410 4896 2015-02-16 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0005252 deletion 972 h- sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 low PMID:35172472 4896 2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPBC1709.05 FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0001234 deletion 972 h- sks2 sks2delta deletion ECO:0005638 PMID:9161410 4896 2015-02-16 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0001492 deletion 972 h- sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 PMID:9161410 4896 2015-02-16 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sks2 sks2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.04c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1250.03) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC211.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC3B9.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph oms1 oms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.04 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr oms1 oms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3B9.04 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph oms1 oms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr oms1 oms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3B9.04 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 oms1 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SPBC106.17c FYPO:0000037 G426D Not assayed or wild type 972 h- cys2 cys2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17622533 4896 2013-09-20 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007478 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0004904 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0004904 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC18E5.03c) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007480 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0005887 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0000226 PMID:27666591 4896 2016-12-28 (Figure 1B, Figure S1F) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0005887 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0000226 12 PMID:27666591 4896 2016-12-28 (Figure 1B, Figure S1F) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0005887 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 12 PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Figure 1A, S1C-S1E) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0004948 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0000059 PMID:27666591 4896 2016-12-28 (Figure S1G) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001870 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Figures S1A and S1B) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000964 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007234 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007234 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007234 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.09c) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007234 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.03) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007234 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0002574 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Figure 4D) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0002574 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-07-01 We next checked the distribution of CENP-TCnp20-GFP in ccp1Δ and found that its centromere localization was unaffected in the mutant (Fig. 2 G-I). PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0002965 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC140.02) PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29899117 4896 2020-10-07 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccp1 ccp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ccp1 ccp1delta deletion ECO:0005638 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SPBC2F12.12c FYPO:0003029 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003029 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003029 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003029 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003029 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003029 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003244 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000231 PMID:28947618 4896 2017-12-30 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000835 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000835 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.04c) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000835 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.09) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000835 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC428.06c) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001324 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001117 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001117 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0008118 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000049 PMID:36095128 4896 2023-08-28 Among the mutants studied, Δcay1 and Δtls1 strains also showed splicing defects specific for rap1 intron 2 (Supplementary Figure S10A). PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0002019 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000337 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0004575 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000226 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000880 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000226 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0004342 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cay1 cay1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cay1 cay1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC825.05c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0005917 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0004573 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0003105 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cay1 cay1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0007035 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000833 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001317 deletion 972 h- cay1 cay1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph cay1 cay1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.12c FYPO:0009067 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PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002663 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0005801 PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0003535 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0000082 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph wis4 wis4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0006978 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0001232 low PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0001324 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002376 deletion 972 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(Figure 4) PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0001492 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0001232 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- wis4 wis4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wis4 wis4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wis4 wis4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.780 FYPO:0009022 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.780 SPNCRNA.780+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000278 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.780 FYPO:0000073 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.780 SPNCRNA.780+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.780 FYPO:0002578 wild type 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wild_type ECO:0005638 PMID:10467002 4896 2012-06-15 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001147 wild type Overexpression 972 h- ste20 ste20+ wild_type ECO:0005638 PMID:10467002 4896 2012-06-15 PomBase SPBC1709.14 FYPO:0000705 1-15 Not assayed or wild type 972 h- ngl1 ngl1deltaH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(PomBase:SPBC1709.14),assayed_using(PomBase:SPBC4F6.15c) PMID:18279662 4896 2012-02-21 PomBase SPBC1709.14 FYPO:0000686 1-15 Not assayed or wild type 972 h- ngl1 ngl1deltaH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:18279662 4896 2012-02-21 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008197 115-130 Not assayed or wild type 972 h- hva22 rop1delta115-130 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 medium PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 5B) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000843 115-130 Not assayed or wild type 972 h- hva22 rop1delta115-130 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 low PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 5A) PomBase SPAPB1E7.05 FYPO:0001357 E846A,D848A Not assayed or wild type 972 h- gde1 gde1-E846A,D848A gde1-(gde1-(met1)E845A-D847A|gde1-(met1)E845A,D847A|gde1-(met1)E845A-D847A|gde1-E845A,D847A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. S3) PomBase SPBC409.07c FYPO:0007620 M395G Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-M395G.3pk amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Although, both Wis1M395G and Wis1M395A were expressed at wild-type levels, Sty1 phosphorylation was very low and minimally increased even in response to 6 mM H2O2 in these cells (Figure 4D). PomBase SPBC409.07c FYPO:0007620 M395G Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-M395G.3pk amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC409.07c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Strikingly, the stress-induced phosphorylation of Wis1M395G and Wis1M395A was also compromised, strongly suggesting that Wis1 kinase activity was required for the stress-induced phosphorylation and activation of Wis1 (Figure 4D). PomBase SPBC409.07c FYPO:0001122 M395G Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-M395G.3pk amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:37572670 4896 2024-01-22 Indeed, consistent with the requirement of Wis1-dependent phosphorylation of Sty1 for timely entry into mitosis, cells expressing Wis1M395G or Wis1M395A were elongated (Figure S6B). PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 L608P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-L608P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31072933 4896 2019-05-26 (Figure S8) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 L608P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-L608P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:30914423 4896 2019-05-17 PomBase SPBC1685.01 FYPO:0001962 C158S 972 h- pmp1 pmp1-C158S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1685.01),assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:9427748 4896 2012-02-18 PomBase SPAC10F6.03c FYPO:0006518 unknown Not assayed or wild type 972 h- cts1 cts1-901 unknown ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006029 E132K,K133M,R136C Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-KMC adf1KMC amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000248 medium PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006029 E132K,K133M,R136C Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-KMC adf1KMC amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000248 medium PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001365 E132K,K133M,R136C Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-KMC adf1KMC amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 E132K,K133M,R136C Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-KMC adf1KMC amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004652 E132K,K133M,R136C Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-KMC adf1KMC amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001357 E132K,K133M,R136C Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-KMC adf1KMC amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16467379 4896 2017-06-30 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 map1 map1+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 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PomBase SPAC521.05 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps802 rps802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC521.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps802 rps802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC521.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps802 rps802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002061 R199A,R200A Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9917066 4896 2014-08-05 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002060 R199A,R200A Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9917066 4896 2014-08-05 PomBase SPAC23C11.08 FYPO:0000580 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 php3 php3delta deletion ECO:0001232 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assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.04c),assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:20603077 4896 2023-09-29 Cdc12 pulls down only 27% as much Cdc15 in a similar block and release experiment (Supp. Fig. 1B) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0005343 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC330.05c) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC23G7.10c) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC513.03) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.02) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_transcript(PomBase:SPCC330.05c) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_transcript(PomBase:SPAC513.03) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_transcript(PomBase:SPBC23G7.10c) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.02) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph clp1 clp1delta flp1delta deletion 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(Fig. 4) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0005955 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000059 PMID:28103117 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001043 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000127 PMID:32361273 4896 2020-08-05 (Fig. 1) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001840 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000340 PMID:15525536 4896 2014-09-25 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0000836 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:34133210 4896 2021-07-11 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004355 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004355 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:15128870 4896 2015-01-27 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004354 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta 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deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:15128870 4896 2015-01-27 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001903 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 PMID:16950131 4896 2015-01-28 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0000590 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 high PMID:17032733 4896 2015-01-21 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001357 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001904 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001904 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004471 deletion 972 h- clp1 clp1delta flp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0009038 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hfl1delta386-409 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1B, 2B) PomBase SPAC6F6.15 FYPO:0001001 C209R Not assayed or wild type 972 h- ypt5 ypt5-909 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC6F6.15 FYPO:0001002 C209R Not assayed or wild type 972 h- ypt5 ypt5-909 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC6F6.15 FYPO:0001283 C209R Not assayed or wild type 972 h- ypt5 ypt5-909 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC6F6.15 FYPO:0001178 C209R Not assayed or wild type 972 h- ypt5 ypt5-909 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC6F6.15 FYPO:0000997 C209R Not assayed or wild type 972 h- ypt5 ypt5-909 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0001896 wild type Overexpression 972 h- pdc2 pdc2+ wild_type ECO:0001232 PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 4B,4D) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0006002 wild type Overexpression 972 h- pdc2 pdc2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A7.04c) PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Figure 6F) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005289 wild type Knockdown 972 h- cdc15 cdc15+ wild_type ECO:0001232 PMID:36287824 4896 2024-11-04 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 wild type Knockdown 972 h- cdc15 cdc15+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:36287824 4896 2024-11-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001365 wild type Knockdown 972 h- cdc15 cdc15+ wild_type ECO:0001232 PMID:36287824 4896 2024-11-04 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000620 Y84N Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-A5 fin1.A5 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12065422 4896 2020-12-24 (Figure 2B and C) PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000338 Y84N Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-A5 fin1.A5 amino_acid_mutation ECO:0001232 26 PMID:12065422 4896 2020-12-24 (Figures 1C and 2C) PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0006917 Y84N Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 fin1 fin1-A5 fin1.A5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227,FYECO:0000291 PMID:15132994 4896 2020-12-21 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0007570 Y84N Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 fin1 fin1-A5 fin1.A5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227,FYECO:0000291 PMID:15132994 4896 2020-12-21 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0003481 Y84N Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-A5 fin1.A5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:12065422 4896 2020-12-24 (Figure 2A; Table II) PomBase SPAC16E8.10c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsm7 rsm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- rsm7 rsm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16E8.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsm7 rsm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0009028 II:complement(339484..340003) Overexpression 972 h- sme2 sme2(9-528) SPNCRNA.1341OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0001029 II:complement(339484..340003) Overexpression 972 h- sme2 sme2(9-528) SPNCRNA.1341OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0002578 II:complement(339484..340003) Overexpression 972 h- sme2 sme2(9-528) SPNCRNA.1341OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0007808 II:complement(339484..340003) Overexpression 972 h- sme2 sme2(9-528) SPNCRNA.1341OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0007158 40-80 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 6H) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0007159 40-80 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 6H) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0007599 40-80 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 6F) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000703 40-80 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.19) PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 6G) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000703 40-80 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC609.05) PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 6G) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000703 40-80 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.02c) PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 6I) PomBase SPAC24C9.11 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgd1 sgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24C9.11 FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgd1 sgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24C9.11 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgd1 sgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24C9.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- sgd1 sgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24C9.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgd1 sgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.02c FYPO:0002068 unknown Not assayed or wild type 972 h- his7 his7- his7 mutant unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPAC607.03c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snu13 snu13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC607.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- snu13 snu13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC607.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snu13 snu13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 390-397 Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-DEL6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 390-397 Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-DEL6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 medium PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008107 Y15E Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-Y15E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:37128864 4896 2023-06-20 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002020 unknown Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-B71 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:3025190 4896 2013-03-08 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000337 R179E,R231E Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-RERE amino_acid_mutation ECO:0001232 43 PMID:11882285 4896 2018-05-02 (Fig. 5a) PomBase SPCC338.17c FYPO:0004310 R179E,R231E Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-RERE amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11882285 4896 2018-05-02 PomBase SPCC338.17c FYPO:0005779 R179E,R231E Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-RERE amino_acid_mutation ECO:0001232 ~1-2 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:11882285 4896 2018-05-02 (Fig. 5a) PomBase SPAC3F10.10c FYPO:0000302 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Knockdown 972 h- hsf1 hsf1+ purg1-hsf1 OFF wild_type ECO:0001232 FYECO:0000117 PMID:33176152 4896 2021-04-27 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- hsf1 hsf1+ purg1-hsf1 OFF wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:24146635 4896 2014-02-25 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0000703 1-470,670-933 Not assayed or wild type 972 h- rga4 rga4-471-670 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c),assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 1) PomBase SPBC2F12.11c FYPO:0001001 wild type Overexpression 972 h- rep2 rep2+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:7588609 4896 2013-03-13 PomBase SPBC2F12.11c FYPO:0004630 wild type Overexpression 972 h- pat1-114 rep2 rep2+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC2F12.11c FYPO:0004630 wild type Overexpression 972 h- pat1-114 rep2 rep2+ wild_type ECO:0000291 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972 h- cdc2 cdc2-T14A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000315,FYECO:0000346 PMID:7626804 4896 2021-03-17 (Fig. 8) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000648 T14A Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-T14A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:7626804 4896 2021-03-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC146.07 FYPO:0001357 FY506AA Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-FY506AA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14730023 4896 2014-08-05 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0006279 D166N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-endo- dis3 endo- amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0006279 D166N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-endo- dis3 endo- amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0006279 D166N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-endo- dis3 endo- amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002085 D166N Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-endo- dis3 endo- amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106 PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPCC1442.06 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre8 pre8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre8 pre8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- pre8 pre8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre8 pre8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 S6F,S16L,V32R,Q52P,N153S,E168D Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 A154G,G155A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A154G,G155A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0000067 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0009038 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0000725 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0001188 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0000099 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0000087 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0000087 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0007924 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1670 FYPO:0007924 deletion 972 h- SPNCRNA.1670 SPNCRNA.1670delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC330.04c FYPO:0000703 Tdk1 fused to a trimerisation domain Not assayed or wild type 972 h- tdk1 CCtri-tdk1 fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485800 4896 2025-01-08 (Fig. 3A) PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0003730 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 PMID:37164017 4896 2023-05-18 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0006141 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001934 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001934 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:37164017 4896 2023-05-18 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001563 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0000335 PMID:37164017 4896 2024-07-09 The non-respiring S. pombe cox6D mutant did not upregulate G3P synthesis as compared with the wild-type. S. japonicus also maintained a larger pool of G3P than S. pombe (Figure S1G) PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox6 cox6delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0002009 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0002009 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:37164017 4896 2023-05-18 Whereas the deletion of cox6 critically decreased oxygen consumption in S. pombe, we observed no such effect in S. japonicus (Figure 1A). PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000134 low PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:37164017 4896 2023-05-18 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0007618 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0003004 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0007612 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37164017 4896 2023-05-18 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:37164017 4896 2024-07-09 Surprisingly, the growth defect of S. pombe cox6D mutants in EMM could be rescued by arginine but not glutamate or glutamine (Figure 2H). PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0004325 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000098 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 PMID:26891792 4896 2023-06-21 (Fig. 1) PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000102 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000087 deletion 972 h- cox6 cox6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1B2.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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PomBase SPAC2G11.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC2G11.09 SPAC2G11.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC2G11.09 SPAC2G11.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.16 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scl1 scl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.16 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scl1 scl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- scl1 scl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC646.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scl1 scl1delta deletion ECO:0001232 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2014-05-13 PomBase SPCC830.05c FYPO:0002430 405-557 Not assayed or wild type 972 h- epl1 epl1-DCt partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 100 PMID:37550452 4896 2023-08-31 Extended Data Figure 9e PomBase SPCC70.12c FYPO:0006331 C24S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C24S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2B) PomBase SPCC70.12c FYPO:0000245 C24S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C24S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0003690 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000139 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0001712 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000335 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0001712 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000335 PMID:14519123 4896 2020-11-26 (Fig. 3) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0001116 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:18808426 4896 2014-08-14 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000246 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000037 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000335 PMID:14519123 4896 2020-11-26 (Fig. 3) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0003270 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000335 PMID:14519123 4896 2020-11-26 (Fig. 4) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262699 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:37156397 4896 2023-05-25 (Figs. 2B, S1B) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000103 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000103 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:14519123 4896 2020-11-26 (Fig. 4) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:14519123 4896 2020-11-26 (Fig. 4) PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- dlp1 dlp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000179 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dlp1 dlp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.12 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dlp1 dlp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0000705 1-249,1038-1401 Not assayed or wild type 972 h- wis4 wis4-250-1037 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPBC577.05c FYPO:0003891 K57E Not assayed or wild type 972 h- rec27 rec27-243 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0001382 wild type Overexpression 972 h- isp7 isp7+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0002679 wild type Overexpression 972 h- isp7 isp7+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:24344203 4896 2014-03-23 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0002681 wild type Overexpression 972 h- isp7 isp7+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:24344203 4896 2014-03-09 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0007197 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 PMID:37590302 4896 2023-08-30 (Figure 1F and 1G) Analysis by live-cell microscopy further showed that both fission and fusion frequencies increased significantly in cells lacking Yta4 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0007197 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000436 PMID:37590302 4896 2023-08-30 (Figure 1F and 1G) Analysis by live-cell microscopy further showed that both fission and fusion frequencies increased significantly in cells lacking Yta4 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0008122 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 PMID:37590302 4896 2023-08-30 (Figure 1F and 1G) Analysis by live-cell microscopy further showed that both fission and fusion frequencies increased significantly in cells lacking Yta4 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0007194 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 PMID:37590302 4896 2023-08-30 (Figure 1) PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0000833 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC12C2.08) PMID:37590302 4896 2023-08-30 Quantification showed that the expression levels of endogenous Dnm1 were comparable in WT and yta4Δ cells (Fig 3B) PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph yta4 yta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0003810 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 PMID:37590302 4896 2023-08-30 (Figure 1) PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yta4 yta4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001968 wild type Overexpression 972 h- rgf1 rgf1+ wild_type ECO:0000335 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 6B) GS activity increased during rgf1+ overexpression. This activity was fourfold higher than that observed in the wild-type strain PomBase SPCC645.07 FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- rgf1 rgf1+ wild_type ECO:0000335 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:16421249 4896 2022-01-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001038 wild type Overexpression 972 h- rgf1 rgf1+ wild_type ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 6D and Fig. 7A) PomBase SPAC607.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC607.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC607.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC607.07c SPAC607.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 300-350 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta300-350 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 80 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. S2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002557 300-350 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta300-350 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000703 300-350 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta300-350 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000784 300-350 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta300-350 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2C) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000705 C13Y,K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-C13Y-K56R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:24663817 4896 2020-03-09 C13Y-K56R mutation abolished the interaction with Crb2 (Fig. 5C), not Rad9 (Fig. 5A and B). PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000703 C13Y,K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-C13Y-K56R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:24663817 4896 2020-03-09 C13Y-K56R mutation abolished the interaction with Crb2 (Fig. 5C), not Rad9 (Fig. 5A and B). PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000089 C13Y,K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-C13Y-K56R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 medium PMID:24663817 4896 2020-02-22 PomBase SPAC1834.08 FYPO:0001116 disruption Null 972 h- mak1 mak1::ura4 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:11179424 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1834.08 FYPO:0001281 disruption Null 972 h- mak1 mak1::ura4 disruption ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:11179424 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1834.08 FYPO:0001281 disruption Null 972 h- mak1 mak1::ura4 disruption ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:11179424 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1834.08 FYPO:0001246 disruption Null 972 h- mak1 mak1::ura4 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:11179424 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1834.08 FYPO:0001246 disruption Null 972 h- mak1 mak1::ura4 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:11179424 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1834.08 FYPO:0000648 disruption Null 972 h- mak1 mak1::ura4 disruption ECO:0001232 low PMID:11179424 4896 2017-08-04 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0004494 wild type Overexpression 972 h- pof10 pof10+ wild_type ECO:0001232 PMID:11820777 4896 2015-05-20 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- pof10 pof10+ wild_type ECO:0005638 PMID:11820777 4896 2015-05-20 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000082 148-186 Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-deltaN/M partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S437A,T438A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S437A,T438A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 S437A,T438A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S437A,T438A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph meu7 meu7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.13 FYPO:0009067 deletion 972 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Not assayed or wild type 972 h- puf2 puf2(712-1065) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000210 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 5C) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001357 S4A,S9A,S28A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000094 S4A,S9A,S28A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPAC144.08 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- jac1 jac1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:26545917 4896 2016-05-11 (Fig. 2c) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006521 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7A-B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001382 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000170 high assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001645 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001355 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001122 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001122 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000972 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0001232 50 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001234 L112R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-NBT7 swi3-L112R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 low PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 4) PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0005749 deletion 972 h- jmj1 jmj1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 4) PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0002335 deletion 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 jmj1 jmj1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 (Fig. S5) PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- jmj1 jmj1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- jmj1 jmj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 jmj1 jmj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25H1.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 jmj1 jmj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000705 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.10),assayed_using(PomBase:SPCC330.10) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 1a) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000705 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_using(PomBase:SPBC32F12.06) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 1a) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000080 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2c) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006927 386-591 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 (Fig. 6) The nuclear envelope is marked with Cut11-GFP PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006631 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC330.10) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 4A, B) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006631 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.06) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 4A, B) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002679 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2d) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001355 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2c) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002980 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 4d PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002150 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16428435 4896 2024-03-22 Thus, the carboxyl terminus of Cdk9 [...] is required for cell viability. Table 2 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003075 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_substrate(PomBase:SPBC32H8.10) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 1e) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004083 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.06) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 3B) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004083 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC330.10) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 3B) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003670 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2c) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006821 386-591 Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2b) PomBase SPBC582.03 FYPO:0003593 1-67 Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13delta1-67 cdc13-delta67|cdc13-delta67N|cdc13delta67N|deltaN-cdc13 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004705 1-67 Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13delta1-67 cdc13-delta67|cdc13-delta67N|cdc13delta67N|deltaN-cdc13 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:26527280 4896 2020-06-16 In contrast, there was only a very slight delay in sister chromatid separation (Figures 2A and 2B). PomBase SPBC582.03 FYPO:0000274 1-67 Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13delta1-67 cdc13-delta67|cdc13-delta67N|cdc13delta67N|deltaN-cdc13 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:26527280 4896 2020-06-16 (Figure 2A) Plo1 to SPBs persisted for more than 20 min PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB8E5.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB8E5.08 SPAPB8E5.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.16 FYPO:0004099 deletion 972 h- SPBC887.16 SPBC887.16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. S2D) PomBase SPBC887.16 FYPO:0001420 deletion 972 h- SPBC887.16 SPBC887.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5G) PomBase SPBC336.14c FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ppk26 ppk26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0000082 deletion 972 h- ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0006978 deletion 972 h- ppk26 ppk26delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPBC336.14c FYPO:0001355 deletion 972 h- ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0007391 deletion 972 h- kanR ppk26 ppk26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22737087 4896 2020-05-04 data not shown PomBase SPBC336.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0001034 deletion 972 h- ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC336.14c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.14c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ppk26 ppk26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 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G1541A Not assayed or wild type 972 h- mcm4 rid2-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:20799962 4896 2015-11-26 PomBase SPBC25H2.02 FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs1 ths1-hmt unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. 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ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clu1 clu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clu1 clu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001838 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 3d) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001838 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 5E) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001645 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0005258 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 1) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001147 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0004248 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 4c) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000776 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC31G5.12c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 5D) These observations indicate that the mip1 mutation does not affect the TORC1-dependent phosphorylation of Sck1, Sck2 and Maf1. PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000776 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1B9.02c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000776 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.14c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 1) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000111 Y533A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-Y533A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 3c) PomBase SPAC821.10c FYPO:0002753 deletion 972 h- sod1 sod1delta deletion ECO:0005638 PMID:12073089 4896 2015-07-15 PomBase SPAC821.10c FYPO:0003360 deletion 972 h- sod1 sod1delta deletion ECO:0000337 PMID:12073089 4896 2015-07-15 PomBase SPAC821.10c FYPO:0003360 deletion 972 h- sod1 sod1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPAC821.10c) PMID:28572514 4896 2017-07-25 (Fig. 9) PomBase SPAC821.10c FYPO:0003238 deletion 972 h- h- 972 sod1 sod1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000134 high PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC821.10c FYPO:0000278 deletion 972 h- sod1 sod1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16299000 4896 2012-11-08 PomBase SPAC821.10c FYPO:0000278 deletion 972 h- sod1 sod1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000179,FYECO:0000199 PMID:16299000 4896 2012-11-08 PomBase SPAC821.10c FYPO:0000249 deletion 972 h- h- 972 sod1 sod1delta deletion ECO:0005638 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2024-05-28 (Fig. 6C and E) PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 W498R,I501R Knockdown 972 h- tpz1 tpz1-W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0004604 W498R,I501R Knockdown 972 h- tpz1 tpz1-W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003803 W498R,I501R Knockdown 972 h- tpz1 tpz1-W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002019 W498R,I501R Knockdown 972 h- tpz1 tpz1-W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:25330395 4896 2014-11-09 Tpz1-W498R,I501R disrupts interaction with Poz1 but retain interactions with Pot1 and Ccq1 based on co-IP experiments. In combination with ccq1 deletion, telomeres become unprotected and cells survive by circularizing chromosomes. Telomerase recruitment to telomeres is increased since Rad3/Tel1-dependent phosphorylation of Ccq1 Thr93, essential for promoting Ccq1-Est1 interaction and telomerase recruitment, is increased in tpz1-W498R,I501R cells. PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0004656 W498R,I501R Knockdown 972 h- tpz1 tpz1-W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP its3 its3+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000174 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0001232 PMID:7929623 4896 2014-08-04 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0003535 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000082 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000080 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0006978 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0003532 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0002700 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0000112 high assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:24498240 4896 2024-07-03 (Figure 3A) indicates that deletion of rho2+ gene alleviated the increased Pmk1 basal phosphorylation present in pck1D cells. PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001192 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001238 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0008003 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001103 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000107 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001214 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000271 deletion 972 h- pck1 pck1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:20624220 4896 2015-09-29 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0000841 deletion 972 h- pck1 pck1delta 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Figure 1 PomBase SPBC839.17c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c 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PomBase SPBC839.17c FYPO:0001420 deletion 972 h- fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 PMID:11335722 4896 2015-03-30 PomBase SPBC839.17c FYPO:0000073 deletion 972 h- fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23551936 4896 2014-02-07 PomBase SPBC839.17c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph fkh1 fkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.17c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- 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However, in contrast to the previous study, we observe that the KMT domain is sufficient to mediate this regulatory mechanism. 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4896 2012-03-08 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0001499 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000167 PMID:9532803 4896 2012-09-05 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:10036242 4896 2014-11-21 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000068 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7642144 4896 2012-03-08 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000068 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000167 PMID:9532803 4896 2012-08-30 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000767 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7642144 4896 2012-03-08 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000767 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000167 PMID:9532803 4896 2012-08-30 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000767 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 PMID:7769002 4896 2013-01-28 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000069 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7642144 4896 2012-03-08 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000830 wild type Overexpression 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7642144 4896 2012-04-03 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0000316 deletion 972 h- itr2 itr2delta deletion ECO:0005638 PMID:9560432 4896 2012-06-01 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 itr2 itr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 itr2 itr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- itr2 itr2delta deletion ECO:0005638 PMID:9560432 4896 2015-09-17 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001045 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 3A, 9C) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007620 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),residue(Rpb1/Phos:(YSPTSPS-5S)) PMID:33410907 4896 2021-01-22 In line with these results, Ser2 phosphorylation of Rpb1-CTD, which facilitated transcription elongation, was reduced in pin1 mutant as a secondary effect derived from defect in transcription initiation to elongation (Figure 3A and B). PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 3B, Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 3B, Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 3B) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPJ695.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1B3.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC645.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1709.14) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC725.10) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC354.12) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11E3.06) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC11C11.06c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB8B6.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC977.16c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC2H10.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC713.05) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1709.13c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC15E1.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC336.05c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC343.12) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC16A3.13) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC3A11.07) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1703.13c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1685.17) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1782.07) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC83.13) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.08c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC23E6.03c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1861.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPACUNK4.17) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC56F8.15) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.03c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC530.10c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC428.07) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29A3.18) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC622.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1399.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC18G6.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC12D12.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1565.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC2G2.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC688.06c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC513.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.14c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000826 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP23A10.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001116 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:33410907 4896 2021-01-21 (Figure 1C) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001116 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:33410907 4896 2021-01-21 (Figure 1C) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001116 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:33410907 4896 2021-01-21 (Figure 1C) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0003004 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000078 PMID:33410907 4896 2021-01-22 the intracellular level of ROS was elevated in pin1 and ssu72 mutants (Figure 6H) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0004333 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:33410907 4896 2021-01-13 (Fig. 2a) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007621 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:33410907 4896 2021-01-22 Intriguingly, upon oxidative stress, the association between Rpb1 and Sty1 was decreased in wild type cells and up regulated in the pin1 mutant with reduced phosphorylation of Ser2 (Figure 4B). PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC750.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23H3.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC9E9.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11D3.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC25B8.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC18B5.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1020.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC947.04) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13G7.13c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC569.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13D6.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.11c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13A11.06) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001890 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pin1 pin1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001383 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005580 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pin1 pin1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0003906 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000963 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007535 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),residue(CTD S2) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0005061 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),residue(CTD S5) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0008034 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000112 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007539 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),residue(CTD T4) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007619 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:33410907 4896 2021-01-22 In the absence of Pin1, Ser5 phosphorylated Rpb1 was associated and accumulated at the promoter region following H2O2 stress but was defective in entering elongation to generate transcripts of the corresponding genes (Figure 1C) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007619 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:33410907 4896 2021-01-22 (Figure 2c) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007619 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:33410907 4896 2021-01-22 (Figure 2c) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0002085 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:32282918 4896 2022-11-28 (Figure 1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0006819 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:33410907 4896 2021-01-12 (Figure 1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001420 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000105 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:33410907 4896 2021-01-12 (Figure 1) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0003907 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0005889 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:33410907 4896 2021-01-12 (Figure 5e) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000268 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0005638 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pin1 pin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- pin1 pin1delta deletion ECO:0001232 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pin1 pin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002023 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000272 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000825 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000381 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC3F10.15c) PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 1B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000825 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000381 low assayed_transcript(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 1B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002151 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002002 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001315 D625A,H626A,K628A Overexpression 972 h- plo1 plo1-DHK625AAA plo1-D625A,H626A,K628A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 1B) PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000085 S365E Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365E amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Moreover, the rad52-S365D/E-YFP displayed higher sensitivities to HU, CPT, and MMS rather than cisPt (Figure 5a). PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 S365E Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365E amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Moreover, the rad52-S365D/E-YFP displayed higher sensitivities to HU, CPT, and MMS rather than cisPt (Figure 5a). PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 S365E Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365E amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Moreover, the rad52-S365D/E-YFP displayed higher sensitivities to HU, CPT, and MMS rather than cisPt (Figure 5a). PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SB10 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SB10 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SB10 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001168 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:2832071 4896 2012-08-16 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001168 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:2891694 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001168 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:1396704 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001407 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2891694 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001241 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-16 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001437 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001439 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001236 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-16 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001435 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000979 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-16 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001438 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001436 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000833 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:1396704 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001433 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001431 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001432 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001434 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2832071 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000830 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:2832071 4896 2012-08-16 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000830 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2891694 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000830 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:1396704 4896 2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000722 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:1833395 4896 2012-12-11 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001488 G268D Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:2832071 4896 2012-09-24 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000164 wild type Overexpression 972 h- rtn1 rtn1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:8873452 4896 2013-02-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000174 wild type Overexpression 972 h- rtn1 rtn1+ wild_type ECO:0000335 PMID:8873452 4896 2013-02-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0001077 wild type Overexpression 972 h- rtn1 rtn1+ wild_type ECO:0000335 PMID:8873452 4896 2013-02-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0001077 wild type Overexpression 972 h- rtn1 rtn1+ wild_type ECO:0000335 PMID:8873452 4896 2013-02-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000647 wild type Overexpression 972 h- rtn1 rtn1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8873452 4896 2013-02-01 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003411 1171-1215 Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-delta45 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 6F) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008010 1171-1215 Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-delta45 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high assayed_enzyme(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 6E) PomBase SPCC737.08 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mdn1 mdn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC737.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mdn1 mdn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC737.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- mdn1 mdn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC737.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mdn1 mdn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0004565 Q256L Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-Q256L amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:15580593 4896 2015-04-16 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0004754 NLS-Cut7(444-1085),P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 NLS-cut7-ST22 NLS-Cut7ST22 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:25348260 4896 2022-05-31 (Fig. 3) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0006825 NLS-Cut7(444-1085),P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 NLS-cut7-ST22 NLS-Cut7ST22 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:25348260 4896 2022-05-31 (Fig. 3) PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0006233 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPBC24C6.08c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 (Figure S3) Bhd1 and Fnp1 localize to vacuoles in response to amino acid starvation and that this localization is largely independent of the presence of the other protein. PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0002679 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 (Figures 2G and S4), demonstrating that the BFC, is required for efficient activation of TORC1 following amino acid supplementation. PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000636 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000401 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0001159 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 PMID:34805795 4896 2021-12-18 (Figure 4d) PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0007907 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0001309 deletion 972 h- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0006266 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 PMID:34805795 4896 2021-12-23 (Figure S1A) PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000077 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34805795 4896 2021-12-02 (Figure S1A) PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000756 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34805795 4896 2021-12-18 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0001987 deletion 972 h- ade, ura-, leu- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0005638 low PMID:34805795 4896 2021-12-18 (Figure 4F) PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 fnp1 fnp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30C2.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fnp1 fnp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0003153 C17R Overexpression 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:37446379 4896 2025-01-07 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003179 unknown Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rec9-104 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:2806887 4896 2014-07-31 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000089 unknown Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rec9-104 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:2806887 4896 2014-07-31 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rec9-104 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:2806887 4896 2014-07-31 PomBase SPBC409.04c FYPO:0000082 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000082 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000082 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000674 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000674 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000674 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S4B PomBase SPBC409.04c FYPO:0001513 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 11 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 17 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 11 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 mis12-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS mis12 mis12-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 13 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0001245 Y83H Not assayed or wild type 972 h- dap1 dap1-Y83H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000311 high PMID:36090151 4896 2022-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002336 TerR-swi6-CD(mating type localized) Ectopic 972 h- swi6 TerR-swi6-CD fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000227 PMID:38289024 4896 2024-04-05 indicating full rescue of silencing defects at the mat locus under heat stress. PomBase SPAC664.01c FYPO:0002336 TerR-swi6-CD(mating type localized) Ectopic 972 h- swi6 TerR-swi6-CD fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000227 PMID:38289024 4896 2024-04-05 demonstrating that tethering Swi6HP1 to the mat locus was sufficient to rescue heat stress-induced defective epigenetic maintenance of heterochromatin. PomBase SPAC222.18 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.18 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC222.18 SPAC222.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC70.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC70.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC70.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC70.04c SPCC70.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 clr5 clr5delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0001407 deletion 972 h- clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0002173 deletion 972 h- clr5 clr5delta deletion ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0002172 deletion 972 h- clr5 clr5delta deletion ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0005917 deletion 972 h- clr5 clr5delta deletion ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 clr5 clr5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 clr5 clr5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0007035 deletion 972 h- clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0002358 deletion 972 h- clr5 clr5delta deletion ECO:0000226 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPAC29B12.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph clr5 clr5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.08 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PomBase SPAC1952.07 FYPO:0002345 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad19-M9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0004407 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad19-M9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad19-M9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad19-M9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0006901 F335S,S408P,N521D,M530V,S534G,Q543E,I555T,I571T,N675K,T676Y,D677* Not assayed or wild type 972 h- pkd2::pkd2-B42-ura4+-hist5+ leu1-32 pkd2 pkd2-B42 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000300 20 medium PMID:35099006 4896 2022-04-12 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000082 F335S,S408P,N521D,M530V,S534G,Q543E,I555T,I571T,N675K,T676Y,D677* Not assayed or wild type 972 h- pkd2::pkd2-B42-ura4+-hist5+ leu1-32 pkd2 pkd2-B42 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229,FYECO:0000300 high PMID:35099006 4896 2022-04-12 The growth rate of pkd2-B42 at the restrictive temperature of 36C or higher is 80% lower than wild-type cells. PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001197 F335S,S408P,N521D,M530V,S534G,Q543E,I555T,I571T,N675K,T676Y,D677* Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2-B42 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004 PMID:36200871 4896 2023-02-03 At 36°C, the average calcium level of pkd2-B42 cells was 34% lower than that of wild type cells (Figure 3, C and D). PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0008063 F335S,S408P,N521D,M530V,S534G,Q543E,I555T,I571T,N675K,T676Y,D677* Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2-B42 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 PMID:36200871 4896 2023-02-03 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0003306 F335S,S408P,N521D,M530V,S534G,Q543E,I555T,I571T,N675K,T676Y,D677* Not assayed or wild type 972 h- pkd2::pkd2-B42-ura4+-hist5+ leu1-32 pkd2 pkd2-B42 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000300 high PMID:35099006 4896 2022-04-12 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000650 F335S,S408P,N521D,M530V,S534G,Q543E,I555T,I571T,N675K,T676Y,D677* Not assayed or wild type 972 h- pkd2::pkd2-B42-ura4+-hist5+ leu1-32 pkd2 pkd2-B42 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000229,FYECO:0000300 medium PMID:35099006 4896 2022-04-12 Increased percentage of septated cells at both permissive and restrictive temperature. PomBase SPBC359.05 FYPO:0001852 T(-202)G,T(-201)A,A(-200)C,T(-199)G,C(-198)G,A(-197)C Not assayed or wild type 972 h- abc3 abc3-M1 GATA promoter mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC359.05) PMID:19915076 4896 2019-05-27 PomBase SPAC824.06 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim14 tim14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC824.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim14 tim14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003217 T74M Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-76 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004313 T74M Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-76 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 T74M Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-76 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 T74M Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-76 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 T74M Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-76 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004331 T74M Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-76 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 3A) EXP says increased, but is normal compared to WT (i.e ura4 insertion derepresses) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0007598 9-151 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaalpha(1-3) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 6F) PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp2 dbp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0001110 deletion 972 h- dbp2 dbp2delta deletion ECO:0005638 PMID:1996094 4896 2012-07-16 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp2 dbp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0000238 deletion 972 h- dbp2 dbp2delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- dbp2 dbp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp2 dbp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0006660 deletion 972 h- dbp2 dbp2delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 dbp2 dbp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPBP8B7.16c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 dbp2 dbp2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0000712 1-88 Overexpression 972 h- puc1 puc1-delta88 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:8006074 4896 2018-06-09 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0000477 1-88 Overexpression 972 h- puc1 puc1-delta88 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:8006074 4896 2018-06-09 (Fig. 8) PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0003481 1-88 Overexpression 972 h- puc1 puc1-delta88 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:8006074 4896 2018-06-09 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002134 C149A Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-C149A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002061 C149A Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-C149A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0001645 479-488 Not assayed or wild type 972 h- nup120 nup120delta479-488 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.18),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.16c) PMID:22955883 4896 2014-04-17 PomBase SPCC794.12c FYPO:0001117 (-170),T(-175)A,G(-174)T,A(-173)C,C(-172)G Not assayed or wild type 972 h- mae2 mae2-UAS2 nucleotide_deletion_and_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:10187772 4896 2014-06-06 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0004753 461-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta172C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 461-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta172C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000703 1-143 Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-Ct nse4-144-300|nse4-C-terminal partial_amino_acid_deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000703 1-143 Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-Ct nse4-144-300|nse4-C-terminal partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 1b) PomBase SPAC1952.13 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ned1 ned1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.13 FYPO:0000278 deletion 972 h- ned1 ned1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPAC1952.13 FYPO:0005584 deletion 972 h- ned1 ned1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:36695178 4896 2023-03-02 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high PMID:26063574 4896 2017-11-08 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swd1 swd1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swd1 swd1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0002917 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0003352 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0000470 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 loss of most members of the COMPASS complex, including Set1, Spp1, Swd1, Swd3, Swd2, and Ash2 leads to a significantly decreased amount of Lsd1 protein (Fig 3A) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 A similar pattern was observed in the Lsd2 samples, although the Lsd2 protein levels also decreased with shg1Δ (Fig 3B). PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd1 swd1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0004689 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0005917 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swd1 swd1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0002401 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swd1 swd1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low low PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0002360 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0008252 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000231 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001317 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0004325 deletion 972 h- swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph swd1 swd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.05c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ 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FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cka1 cka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- cka1 cka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cka1 cka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cka1 cka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0004418 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0002239 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-GK3 unknown ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPCC736.15 FYPO:0006330 deletion 972 h- pil1 pil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:32023460 4896 2020-02-22 PomBase SPCC736.15 FYPO:0008455 deletion 972 h- pil1 pil1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 low PMID:40629316 4896 2025-09-01 However, unlike the previous study showing limited expansion of eisosome-deficient pil1Δ protoplasts after mild hypoosmotic shocks (ΔC=−0.4 M or−0.2 M sorbitol) [5], we found pil1Δ protoplasts exhibited WT-like hypotonic PM expansion, with only a minor reduction in cell surface area increment (Addi- tional file 1: Fig. S2B). PomBase SPCC736.15 FYPO:0000929 deletion 972 h- pil1 pil1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1685.13) PMID:21900489 4896 2012-07-10 PomBase SPCC736.15 FYPO:0007273 deletion 972 h- pil1 pil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Fig. 2) the cortical tubular ER pattern changes faster than wild type PomBase SPCC736.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- pil1 pil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC736.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pil1 pil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pil1 pil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.02 FYPO:0001418 wild type Overexpression 972 h- cps3 cps3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 S2A,S4A,T77I,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Overexpression 972 h- atf1 atf1-10M Atf1.10M amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC106.02c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 2A,cells expressing the hypophosphorylation mutant HA-Atf1.10M are not able to fully trigger the ctt1 and srx1 genes after H2O2 stress PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 S2A,S4A,T77I,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Overexpression 972 h- atf1 atf1-10M Atf1.10M amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000087 S2A,S4A,T77I,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Overexpression 972 h- atf1 atf1-10M Atf1.10M amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:28652406 4896 2020-04-06 the HA-Atf1.1M mutant was fully able to suppress the sensitivity to peroxides of strain Δatf1, expression of the HA-Atf1.10M and 11M mutants did not alleviate this phenotype (supplemental Fig. S1C). PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0001522 G2623-K2676 from Tra1 replaced with G2698-K2751 from S. cerevisiae Tra1 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sctra1 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31748520 4896 2023-09-04 whereas tra1-Sctra1 strains show no growth defects, as compared with wild-type cells (Fig. 5d). PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000963 G2623-K2676 from Tra1 replaced with G2698-K2751 from S. cerevisiae Tra1 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sctra1 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31748520 4896 2023-09-04 whereas tra1-Sctra1 strains show no growth defects, as compared with wild-type cells (Fig. 5d). PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0001216 G2623-K2676 from Tra1 replaced with G2698-K2751 from S. cerevisiae Tra1 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sctra1 fusion_or_chimera ECO:0006030 FYECO:0000137 PMID:31748520 4896 2023-09-05 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0001855 G2623-K2676 from Tra1 replaced with G2698-K2751 from S. cerevisiae Tra1 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sctra1 fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126 PMID:31748520 4896 2023-09-05 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0001645 D303A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-D303A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003631 D303A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-D303A amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0001355 D303A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-D303A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0001355 D303A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-D303A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 high PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 L248A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L248A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 L248A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L248A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002002 D125A Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-D125A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9203579 4896 2013-03-08 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000705 1-274,415-466 Not assayed or wild type 972 h- hob1 hob1-275-414 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) 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PomBase SPBC342.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph gas4 gas4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- gas4 gas4delta deletion ECO:0005638 PMID:38511077 4896 2024-04-04 PomBase SPBC342.03 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph gas4 gas4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gas4 gas4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.03 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph gas4 gas4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.03 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph gas4 gas4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.03 FYPO:0009043 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PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000268 H134N Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-H134N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001234 H134N Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-H134N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000646 H134N Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-H134N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPCC777.14 FYPO:0001357 E314A,E316A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-E314A,E316A mut2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9102632 4896 2013-09-25 PomBase SPCC1795.11 FYPO:0001245 A1265T Not assayed or wild type 972 h- sum3 sum3-A1265T nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0002060 S198G Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-S198G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0001355 N106K Not assayed or wild type 972 h- mis19 eic1-N106K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29804820 4896 2023-04-01 PomBase SPBC106.01 FYPO:0003307 mph1-mis12 Not assayed or wild type 972 h- Pnmt81 GFP mph1 mph1-mis12 mph1-mis12-fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:22825872 4896 2020-06-02 Forced recruitment of wild-type Mph1 to kinetochores lead to apronounced delay in mitosis and a growth defect (Fig. 1E,F) PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0007130 D403N Not assayed or wild type 972 h- met6 met6-D403N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16216079 4896 2019-10-30 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000674 L296F Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-L296F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:39916665 4896 2025-03-05 (Fig. 1C) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001357 L296F Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-L296F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. 1C) PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0000969 wild type Overexpression 972 h- top3 top3+ wild_type ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- top3 top3+ wild_type ECO:0001232 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPCC584.14 FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo7-7 mug160 mug160+ wild_type ECO:0005638 low PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 3C,F; Figure 6A,C,E) PomBase SPCC584.14 FYPO:0002105 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo7-7 mug160 mug160+ wild_type ECO:0001232 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 7) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002033 S215A,S233A,S237A,S248A,S265A,S285A,S299A,S303A,S325A,S334A,S434A,S503A Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-S12A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Extended Data Fig. 2a, c PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000703 151-877 Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-1-150(deltaC) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-03 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002133 1794-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-3 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S5) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-514 unknown ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2015-09-02 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000446 D152K Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152K cdc2-K152 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 5) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 D152K Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152K cdc2-K152 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 Table 1, Fig 4 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 D152K Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152K cdc2-K152 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8437586 4896 2018-04-03 Table 1, Fig 4 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000255 1-18 Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-deltaN18 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 5) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002926 139-166 Not assayed or wild type 972 h- pab2 pab2-delta-C28 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:17213188 4896 2017-07-14 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPACUNK4.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPACUNK4.09 SPACUNK4.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC9B6.09c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mdl1 mdl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC9B6.09c FYPO:0003849 deletion 972 h- mdl1 mdl1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC9B6.09c FYPO:0003852 deletion 972 h- mdl1 mdl1delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4C5.03 SPAC4C5.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4C5.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4C5.03 SPAC4C5.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0005043 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:17369398 4896 2015-11-13 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0007803 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000126 PMID:33534698 4896 2021-06-28 (Fig. 4e) In order to test whether the Gcn2 kinase induces autophagy through phosphorylation of eIF2a, we constructed a strain that expresses eIF2a with its phosphorylation site Ser52 substituted by alanine (eIF2a-S52A). PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0006398 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:33534698 4896 2021-07-09 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0000708 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:23687372 4896 2014-02-24 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0002798 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:23687372 4896 2014-02-24 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0007826 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:33534698 4896 2021-07-09 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0000712 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000127 PMID:23687372 4896 2014-02-24 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0002352 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000207 PMID:21098141 4896 2013-07-18 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0000998 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:23687372 4896 2014-02-24 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0005214 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26493332 4896 2016-01-19 PomBase SPAC3G9.09c FYPO:0005230 S52A Not assayed or wild type 972 h- tif211 tif211-S52A eIF2alpha-S52A|tif211-unphosphorylatable amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26493332 4896 2016-01-19 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002060 ER31AA Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-ER31AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001186 D355N Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-D355N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-24 PomBase SPCC737.08 FYPO:0001355 E1637Q Not assayed or wild type 972 h- mdn1-ts26 mdn1 mdn1-B5 mdn1-E1637Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:27667686 4896 2018-11-29 PomBase SPAC25H1.04 FYPO:0008059 Q215A Not assayed or wild type 972 h- mug105 mug105-Q215A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC25H1.04) PMID:35058438 4896 2024-04-21 (Figure 1j) PomBase SPAPB1A10.03 FYPO:0003412 nxt1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 nxt1 nxt1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ags1 ags1delta mok1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ags1 ags1delta mok1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- ags1 ags1delta mok1delta deletion ECO:0001232 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- ags1 ags1delta mok1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ags1 ags1delta mok1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0003202 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24165938 4896 2014-03-18 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002027 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24165938 4896 2014-03-10 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001082 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:1828464 4896 2012-06-12 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0003889 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 PMID:29689193 4896 2018-11-08 (Fig. 3C) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001088 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:1828464 4896 2012-06-12 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0003201 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24165938 4896 2014-03-18 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001084 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:1828464 4896 2012-06-12 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001390 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24165938 4896 2014-03-10 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001086 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000115 PMID:1828464 4896 2012-06-12 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002442 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 mutants. Neither Rga7 nor Rng10 localization showed defects in bgs4 temperature-sensitive mutants cwg1-1 and cwg1-2 (S6F and S6G Fig), PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002442 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC688.07c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 mutants. Neither Rga7 nor Rng10 localization showed defects in bgs4 temperature-sensitive mutants cwg1-1 and cwg1-2 (S6F and S6G Fig), PomBase SPCC1840.02c FYPO:0008003 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000647 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:24165938 4896 2014-03-03 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000647 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000298 PMID:26749213 4896 2016-07-06 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000969 1-534,754-778 Overexpression 972 h- crb2 crb2-BRCT partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0004604 F170A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F170A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 low PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 F170A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F170A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0000620 wild type Overexpression 972 h- mes1 mes1+ wild_type ECO:0001232 PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0004157 wild type Overexpression 972 h- mes1 mes1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0004635 wild type Overexpression 972 h- mes1 mes1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- mes1 mes1+ wild_type ECO:0005638 PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPCC306.03c FYPO:0003970 S5A,S52A Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-2A-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 20-50 PMID:21540296 4896 2016-05-24 (Fig. 7a) PomBase SPAC1565.04c FYPO:0000705 1-160 Not assayed or wild type 972 h- ste4 ste4-deltaN-terminus partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 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PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0000108 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22646093 4896 2014-02-14 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0002692 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22646093 4896 2014-02-14 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0002546 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 phx1 phx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 phx1 phx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC32A11.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- phx1 phx1delta deletion ECO:0001232 PMID:22646093 4896 2014-02-14 PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0003914 171-274 Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-delta171-274 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 2B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001933 wild type Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 24 PMID:7774573 4896 2016-09-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001052 wild type Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 Table 1, Fig 4 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002700 wild type Overexpression 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2038306 4896 2016-09-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000333 wild type Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 5) increased duration of G1 phase PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003075 wild type Overexpression 972 h- cdc2::CDC2Hs ade6-607 leu1-32 his3-27 cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002176 wild type Overexpression 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-28 Figure 3C PomBase SPCC970.09 FYPO:0001972 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:24947517 4896 2016-08-22 (Fig. 6B) PomBase SPCC970.09 FYPO:0000034 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16141239 4896 2018-01-22 PomBase SPCC970.09 FYPO:0006497 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high low PMID:27852900 4896 2018-04-30 (Fig. 4) PomBase SPCC970.09 FYPO:0001370 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:41171630 4896 2025-12-10 At the restrictive temperature, although Spn1 localized as a ring at the division site before septation, a fraction of Spn1 abnormally spread onto the division plane following furrow ingression in sec3-913 and sec8-1 mutants (Figure 1F, red boxes; and Figure 1—figure supplement 1B, middle focal plane). PomBase SPCC970.09 FYPO:0004481 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPCC970.09 FYPO:0003209 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPCC970.09 FYPO:0006558 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854409 4896 2018-05-18 PomBase SPCC970.09 FYPO:0006558 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854409 4896 2018-05-18 (Fig. 2, 3) PomBase SPCC970.09 FYPO:0003440 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854409 4896 2018-05-18 (Fig. 2, 3) PomBase SPCC970.09 FYPO:0001407 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC970.09 FYPO:0006330 Q977* Not assayed or wild type 972 h- orb6-as1 sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000223 PMID:29290560 4896 2018-01-11 (Figure 1F) ER-PM uncoupling PomBase SPCC970.09 FYPO:0004572 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:30044717 4896 2019-05-10 PomBase SPCC970.09 FYPO:0005736 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:27630265 4896 2016-10-06 (Supplemental Figure S11) PomBase SPCC970.09 FYPO:0002869 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.03) PMID:27898700 4896 2016-12-12 (Fig. S3B) PomBase SPCC970.09 FYPO:0001586 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1739.10) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001586 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.03) PMID:27898700 4896 2016-12-12 (Fig. S3B) PomBase SPCC970.09 FYPO:0005552 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27082518 4896 2016-07-19 (Fig. 7E) PomBase SPCC970.09 FYPO:0000538 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC970.09 FYPO:0002088 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. 2H, 7A) PomBase SPCC970.09 FYPO:0002088 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:41171630 4896 2025-12-11 During septum formation, seven- and twofold more secretory vesicles accumulated at the division site in sec8-1 and spn1Δ cells, respectively, compared to WT (Figure 6A, B PomBase SPCC970.09 FYPO:0001494 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. 5b) PomBase SPCC970.09 FYPO:0006556 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 >40 PMID:11854409 4896 2018-05-18 (Fig. 1A) PomBase SPCC970.09 FYPO:0002061 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC970.09 FYPO:0002061 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854409 4896 2018-05-18 PomBase SPCC970.09 FYPO:0002444 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1739.10) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC970.09 FYPO:0002487 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-08-16 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001294 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-08-16 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001294 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2023-01-25 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001368 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854409 4896 2018-05-18 PomBase SPCC970.09 FYPO:0004097 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854409 4896 2018-05-18 PomBase SPCC970.09 FYPO:0007689 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001164 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPCC970.09 FYPO:0000833 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1739.10) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC970.09 FYPO:0000644 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. S4E) PomBase SPCC970.09 FYPO:0000644 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001587 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001587 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPCC970.09 FYPO:0002558 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.17) PMID:24947517 4896 2016-08-22 (Fig. 3F) PomBase SPCC970.09 FYPO:0008003 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC970.09 FYPO:0002060 Q977* Not assayed or wild type 972 h- sec8 sec8-1 sec8-Q992* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24947517 4896 2016-08-22 (Fig. 6B) PomBase SPAC105.02c FYPO:0000422 wild type Overexpression 972 h- ank1 ank1+ Ank1OE wild_type ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure 3B) Furthermore, in cells overproducing ank1+, ~10% of Fim1-mCherry patches internalized compared to ~95% of Fim1-mCherry patches internalized in the control cells (Fig. 3B) PomBase SPAC105.02c FYPO:0006552 wild type Overexpression 972 h- ank1 ank1+ Ank1OE wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC146.13c) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure 3A) in myo1-mNG fim1-mCherry cells overproducing Ank1, while Fim1-mCherry was at patches, almost all Myo1-mNG was cytoplasmic (Fig. 3A). PomBase SPAC105.02c FYPO:0000644 wild type Overexpression 972 h- ank1 ank1+ Ank1OE wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure 3A) PomBase SPBC31E1.03 FYPO:0002060 73,Y71A Not assayed or wild type 972 h- hub1 hub1-AY Y71A,delta73 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15620657 4896 2014-08-13 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-126 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-126 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-126 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB1E7.08c SPAPB1E7.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ure7 ure7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- ure7 ure7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ure7 ure7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCPB16A4.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ure7 ure7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.07 FYPO:0000581 rrm1 and rrm3 domains deleted Not assayed or wild type 972 h- mug28 mug28-rrm1delta,rrm3delta other ECO:0005638 PMID:20410137 4896 2015-10-08 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0005739 H152Y Not assayed or wild type 972 h- cka1 cka1-372 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229,FYECO:0000342 PMID:30635402 4896 2019-01-25 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001838 H152Y Not assayed or wild type 972 h- cka1 cka1-372 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c),residue(S1363) PMID:30635402 4896 2019-02-06 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001838 H152Y Not assayed or wild type 972 h- cka1 cka1-372 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c),residue(S1364) PMID:30635402 4896 2019-02-06 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0002000 H152Y Not assayed or wild type 972 h- cka1 cka1-372 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229,FYECO:0000342 PMID:30635402 4896 2019-02-06 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0000129 H152Y Not assayed or wild type 972 h- cka1 cka1-372 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30635402 4896 2019-01-25 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0006822 H152Y Not assayed or wild type 972 h- cka1 cka1-372 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30635402 4896 2019-01-25 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000444 wild type Knockdown 972 h- rae1 rae1+ wild_type ECO:0005580 PMID:9301023 4896 2018-06-07 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000771 wild type Knockdown 972 h- rae1 rae1+ wild_type ECO:0001232 PMID:9301023 4896 2018-06-07 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.04 SPAC1039.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.04 SPAC1039.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.04 SPAC1039.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.04 SPAC1039.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.04 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2010-04-06 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1039.04 SPAC1039.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1039.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1039.04 SPAC1039.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005369 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000082 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 6A,D) (STF6) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 2, Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438,FYECO:0000439 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 9) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 4C, 6E) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 4C, Fig. S3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008277 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 high PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008279 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 high PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 5) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 5) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 5) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.06c) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.01) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPAC23D3.12) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002061 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002061 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:35012333 4896 2022-11-23 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008285 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 2, Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 386-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000155,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S5) PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdu1 sdu1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sdu1 sdu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.06 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cis4 cis4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0003192 deletion 972 h- cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPBC146.03c FYPO:0001382 deletion 972 h- cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut3 cut3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.03 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP tif471 tif471+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 S604A,S637A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S604A,S673A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC110.03 FYPO:0008299 cdc42(1-134)-linker-mCherry-linker-cdc42(135-188)-3xritC Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-3ritC fusion_or_chimera ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC110.03) PMID:39333500 4896 2024-10-02 (Fig. 2B) PomBase SPAC110.03 FYPO:0002059 cdc42(1-134)-linker-mCherry-linker-cdc42(135-188)-3xritC Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-3ritC fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39333500 4896 2024-10-02 (Fig. 2G) PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0002133 1667-2812 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1-4 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03),assayed_transcript(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0001645 1667-2812 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1-4 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03),assayed_protein(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure 2H) PomBase SPAC821.12 FYPO:0004105 M170A Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 high PMID:30726745 4896 2019-05-14 PomBase SPAC821.12 FYPO:0004572 M170A Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 high PMID:30726745 4896 2019-05-14 (Figure 2, Figure 3) PomBase SPAC821.12 FYPO:0006637 M170A Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:30726745 4896 2019-08-02 PomBase SPAC821.12 FYPO:0002191 M170A Not assayed or wild type 972 h- orb6 orb6-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 high PMID:30726745 4896 2019-05-14 PomBase SPAC57A7.04c FYPO:0001645 577-653 Not assayed or wild type 972 h- pabp pabpdeltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC57A7.04c),assayed_using(PomBase:SPCC31H12.08c) PMID:29932902 4896 2018-12-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G139C,G144C,A162C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G139C,G144C,A162C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G139C,G144C,A162C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G139C,G144C,A162C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G139C,G144C,A162C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G139C,G144C,A162C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 low PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000703 1-164 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN164(C80) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c),assayed_using(PomBase:SPBC409.23) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 6B) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0001357 1-164 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN164(C80) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3I) PomBase SPCC1739.03 FYPO:0008235 deletion 972 h- hrr1 hrr1delta deletion ECO:0000059 PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Table 1) PomBase SPCC1739.03 FYPO:0008011 deletion 972 h- hrr1 hrr1delta deletion ECO:0000059 PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3D) PomBase SPCC1739.03 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0002834 deletion 972 h- hrr1 hrr1delta deletion ECO:0000231 high PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPCC1739.03 FYPO:0003411 deletion 972 h- hrr1 hrr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 2A) PomBase SPCC1739.03 FYPO:0002386 deletion 972 h- hrr1 hrr1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 2C and D) PomBase SPCC1739.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0003576 deletion 972 h- hrr1 hrr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 In contrast, a high level of Ers1 was detected at telomeres in hrr1Δ cells (Fig. S5C). PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hrr1 hrr1delta deletion ECO:0005638 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PMID:37694715 4896 2023-11-15 We constructed mutants of E3 ligases and their components that have been suggested to localize to or function in the ER and nucleus, namely ......... The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPAC15A10.11 FYPO:0001357 deletion 972 h- ubr11 ubr11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPAC15A10.11 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ubr11 ubr11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.11 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ubr11 ubr11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.11 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ubr11 ubr11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.11 FYPO:0002766 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr11 ubr11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC15A10.11 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4896 2017-01-17 (Figure 5) PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0005908 deletion 972 h- opi10 opi10delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:24768994 4896 2017-01-17 PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 opi10 opi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 opi10 opi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- opi10 opi10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24768994 4896 2017-01-17 PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0005907 deletion 972 h- opi10 opi10delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1739.13) PMID:24768994 4896 2017-01-17 PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0001487 deletion 972 h- opi10 opi10delta deletion ECO:0000291 PMID:24768994 4896 2017-01-17 PomBase SPBC21H7.06c FYPO:0004720 deletion 972 h- opi10 opi10delta 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4896 2020-10-26 (Figure 5E, Figure 5—Figure supplement 1). Replacement of T262 by an alanine abolished in vitro Rad21 phosphorylation by Pef1-GFP PomBase SPCC338.17c FYPO:0007499 T262A Not assayed or wild type 972 h- cdc10-129 rad21 rad21-T262A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPAC31A2.05c) PMID:31895039 4896 2020-07-02 (Fig. 7) The phenotype is exacerbated by pph3 deletion and rescued by pef1 deletion PomBase SPCC338.17c FYPO:0007499 T262A Not assayed or wild type 972 h- cdc10-129 rad21 rad21-T262A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.05c) PMID:31895039 4896 2020-10-16 (Fig. 2) PomBase SPBC3B8.01c FYPO:0006435 A28G Not assayed or wild type 972 h- arh1 arh1-A28G amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18399988 4896 2018-03-08 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0003165 C510CNPLIVC Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26.a14 amino_acid_insertion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 medium PMID:9154809 4896 2015-03-26 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0002169 C510CNPLIVC Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26.a14 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9154809 4896 2015-03-26 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0000969 C510CNPLIVC Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26.a14 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9154809 4896 2015-03-26 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0000088 C510CNPLIVC Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26.a14 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9154809 4896 2015-03-26 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0003823 C510CNPLIVC Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26.a14 amino_acid_insertion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:9154809 4896 2015-03-26 PomBase SPCC962.01 FYPO:0008455 485-583 Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1deltaC2A partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003078 D312E Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-D312E cds1-kd amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PR:000037297) PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006440 D312E Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-D312E cds1-kd amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:16618806 4896 2018-04-11 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 D312E Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-D312E cds1-kd amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 D312E Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-D312E cds1-kd amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002899 D312E Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-D312E cds1-kd amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PR:000037296) PMID:19357077 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 D312E Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-D312E cds1-kd amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC83.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rvb2 rvb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC83.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- rvb2 rvb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC83.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rvb2 rvb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pus4 pus4delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pus4 pus4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pus4 pus4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- pus4 pus4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pus4 pus4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pus4 pus4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1952.10c SPAC1952.10cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP1E11.08 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nsa2 nsa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP1E11.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nsa2 nsa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP1E11.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- nsa2 nsa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCP1E11.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nsa2 nsa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0003165 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 22 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0006431 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0001232 PMID:38985524 4896 2024-07-29 Ppc89 and Ppc89 M+C expressing cells exhibited the enlarged SPB phenotype (Figure 1D), as observed previously for FL Ppc89 (Rosenberg et al., 2006). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0006431 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 22 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002969 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:38985524 4896 2024-07-29 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002969 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:38985524 4896 2024-07-29 Pcp1 accumulated in enlarged Ppc89-containing structures upon overproduction of FL Ppc89 (Figure 3). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002969 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:38985524 4896 2024-07-29 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 PMID:38985524 4896 2024-07-29 (Figure 1B) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 PMID:16775007 4896 2018-03-07 (Figure 7A) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC2F3.03c FYPO:0002061 387-425 Not assayed or wild type 972 h- rpa49 rpa49-deltaC38 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:12893961 4896 2020-11-26 (Fig. 4) PomBase SPAC167.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0000470 deletion 972 h- hul5 hul5delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC167.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC167.07c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC167.07c FYPO:0007301 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP hul5 hul5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:32075773 4896 2020-03-27 (Fig. S2) PomBase SPAC167.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPAC167.07c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph hul5 hul5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- hul5 hul5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC167.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hul5 hul5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC167.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hul5 hul5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.05 FYPO:0003412 ers1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ers1 ers1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC1450.13c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ rib5 rib5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPCC1450.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- rib5 rib5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1450.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rib5 rib5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1450.13c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rib5 rib5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0001384 T318A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-T318A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0005578 T318A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-T318A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0003891 T318A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-T318A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC2F3.03c FYPO:0002060 367-425 Not assayed or wild type 972 h- rpa49 rpa49-deltaC18 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:12893961 4896 2020-11-26 (Fig. 4) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0003267 N299A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-N299A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0003267 N299A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-N299A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004417 N299A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-N299A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 N299A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-N299A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002442 I930A Not assayed or wild type 972 h- for3 for3-I930A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 2A) PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000082 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:15616156 4896 2024-06-09 At 38 C, however, the growth rate of both JY741/tfg3::ura4 and JY741/tfg3D was significantly reduced than JY741, and only small-sized colonies were detected after prolonged incubation, indicating that tfg3+ was essential for cell growth at elevated temperatures. PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000082 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000238 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0006660 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000094 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0000096 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 high PMID:15616156 4896 2024-06-09 (Figure 2I). PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 high PMID:15616156 4896 2024-06-09 When S.pombe cells that lacked Tfg3 were streaked on a plate that contained 0.9 M KCl, they did not grow. In contrast, tfg3+ cells were able to grow (Figure 2G). PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tfg3 tfg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 PMID:15616156 4896 2024-06-09 our spores from each tetrad grew (Figure 2B) and each tetrad contained two Ura+ and two Ura− spores (data not shown), indicating that tfg3+ was nonessential for cell growth under the conditions employed. PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- tfg3 tfg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC22H12.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tfg3 tfg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC106.09 FYPO:0003570 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-ts cut4ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:11950879 4896 2015-03-18 ...majority of the Mad2-GFP was localized to the spindle PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-4373 unknown ECO:0005638 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-4373 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0005990 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC458.04c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 3B, Fig. S3B) PomBase SPBC1347.12 FYPO:0000928 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC458.04c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0001894 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 13 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPBC1347.12 FYPO:0000927 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 13 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. 1C; supplementary material Fig. S1C) PomBase SPBC1347.12 FYPO:0005988 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 PMID:25736293 4896 2017-07-18 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0001645 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC216.02),assayed_using(PomBase:SPBC646.17c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 6a) PomBase SPBC1347.12 FYPO:0000903 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 7F; supplementary material Table S1) PomBase SPBC1347.12 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp1 arp1delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0000964 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPBC1347.12 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- arp1 arp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPCC188.06c FYPO:0003447 wild type Knockdown 972 h- srp54 srp54+ wild_type ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000216 medium assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0003447 wild type Knockdown 972 h- srp54 srp54+ wild_type ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000216 low assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0003446 wild type Knockdown 972 h- srp54 srp54+ wild_type ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000216 medium assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0003446 wild type Knockdown 972 h- srp54 srp54+ wild_type ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000216 low assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 wild type Knockdown 972 h- srp54 srp54+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000216 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001234 wild type Knockdown 972 h- srp54 srp54+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000217 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0006825 deletion 972 h- csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC2C4.10c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 We found that this is also true for Csc4. Csc4-GFP was not detected at SPBs in csc1∆, csc2∆, csc3∆ or ppa3∆ cells (Figure S1A). PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0000016 deletion 972 h- csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 PMID:22682253 4896 2012-08-23 PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0001876 deletion 972 h- csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0006833 deletion 972 h- csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 5E) Timely activation of septum synthesis does not depend on SIN asymmetry. Defective SIN-Inhibitory Phosphatase (SIP) complex csc2Δ cells were examined. The data of cells of C, D and E are developed in S2 Table. PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC27B12.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csc2 csc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.21 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1687.21 SPAC1687.21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0006181 L615A Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-L615A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.07) PMID:24790093 4896 2022-06-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0006181 L615A Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-L615A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:24790093 4896 2022-06-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0006004 L615A Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-L615A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24790093 4896 2022-06-01 PomBase SPAC29B12.07 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec16 sec16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29B12.07 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec16 sec16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29B12.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- sec16 sec16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29B12.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec16 sec16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.08 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph pdt1 pdt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.08 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph pdt1 pdt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.08 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pdt1 pdt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.08 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pdt1 pdt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.08 FYPO:0001237 deletion 972 h- pdt1 pdt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000175 PMID:35079912 4896 2022-03-31 PomBase SPAC27F1.08 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More surprisingly, we found that pregrowth of the cgs1-1 strain on PM medium reduces the mating efficiency defect to only fourfold (Table 2). PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0003032 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:7862141 4896 2015-08-26 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0001152 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:7862141 4896 2015-08-26 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0001152 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:1657594 4896 2017-07-20 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0000781 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000138,FYECO:0000210 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0003160 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0001232 PMID:1657594 4896 2015-01-07 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0000245 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0005638 PMID:7862141 4896 2015-08-26 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0000245 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0005638 PMID:1657594 4896 2015-01-07 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0001865 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0004263 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0005638 PMID:1657594 4896 2015-01-07 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1-1 unknown ECO:0001232 PMID:7862141 4896 2015-08-26 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0000453 T154E,T99E,T74E,T60E,S87E Knockdown 972 h- drc1 drc1-CD5E amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:11937031 4896 2012-02-23 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0003762 G601A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-G601A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S4a) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005212 G601A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-G601A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S4a) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000608 K69Q Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-K69Q amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000276 K69Q Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-K69Q amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000088 F24S Not assayed or wild type 972 h- hus5 ubc9-F24S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 In addition, we identified two mutations, P21L and F24S, at the noncovalent Ubc9:SLD2 interface that also result in HU sensitivity (Fig. 2C). PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0007720 S130D Not assayed or wild type 972 h- smn1 smn1-S130D amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:33754639 4896 2021-04-13 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0001355 S130D Not assayed or wild type 972 h- smn1 smn1-S130D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33754639 4896 2021-04-09 PomBase SPBC1105.02c FYPO:0000664 E167A Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-E167A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:19776021 4896 2016-10-31 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001894 457-512 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-deltaPz partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002702 457-512 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-deltaPz partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002702 457-512 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-deltaPz partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 457-512 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-deltaPz partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002908 457-512 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-deltaPz partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002908 457-512 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-deltaPz partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC16H5.10c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp43 prp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.10c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp43 prp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- prp43 prp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16H5.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp43 prp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000655 K217A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-K217A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 L380R Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-L380R amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000669 S200A Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-S200A amino_acid_mutation ECO:0000325 PMID:10792724 4896 2012-11-26 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006302 cut14-AID Knockdown 972 h- slp1-shutoff cut14 cut14-AID cut14SO fusion_or_chimera ECO:0000059 PMID:28825727 4896 2017-10-11 (Fig. 2b) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006302 cut14-AID Knockdown 972 h- slp1-shutoff cut14 cut14-AID cut14SO fusion_or_chimera ECO:0000059 PMID:28825727 4896 2017-10-11 (Fig. 3) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006248 cut14-AID Knockdown 972 h- slp1-shutoff cut14 cut14-AID cut14SO fusion_or_chimera ECO:0000059 PMID:28825727 4896 2017-10-11 Fig. 3C fig 2d increased mitotic intra centromere connection PomBase SPBC902.02c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- ctf18 ctf18+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC776.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ste13 ste13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC776.09 FYPO:0000280 deletion 972 h- ste13 ste13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:8078473 4896 2014-05-02 PomBase SPBC776.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- ste13 ste13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC776.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste13 ste13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste13 ste13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC557.03c FYPO:0000082 unknown 972 h- pim1 pim1-46 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:21324894 4896 2012-03-12 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0003165 T45A Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-42 dre3-42 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15466421 4896 2013-12-23 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000453 T45A Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-42 dre3-42 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15466421 4896 2013-12-23 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0006889 deletion 972 h- pcl1 pcl1delta deletion ECO:0000335 PMID:19915076 4896 2019-05-27 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0001987 deletion 972 h- pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 PMID:28882432 4896 2018-01-17 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph pcl1 pcl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- 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concentration of amino acids) compared to WT strains, or bhd1Δ and ypt71Δ strains (Fig. 5b). PomBase SPBC405.04c FYPO:0004968 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000112,FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-09 PomBase SPBC405.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 PMID:28656962 4896 2023-06-08 (Figure 5b) PomBase SPBC405.04c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000077 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:28656962 4896 2023-04-03 To determine whether these proteins are related to TORC1 signalling, we treated bhd1Δ, ypt71Δ, ypt7Δ and double deletion strains with 200 ng ml−1 of rapamycin and found that all of the strains grew better than WT cells (Fig. 5b). PomBase SPBC405.04c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0004325 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ypt7 ypt7delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000098 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0003494 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ypt7 ypt7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC405.04c FYPO:0000346 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 PMID:16357443 4896 2014-07-21 PomBase SPBC405.04c FYPO:0003590 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 PMID:16357443 4896 2014-07-21 PomBase SPBC405.04c FYPO:0002792 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000100 PMID:9443913 4896 2015-07-15 PomBase SPBC405.04c FYPO:0002792 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPBC405.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC405.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC405.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypt7 ypt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000674 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000674 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000674 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000674 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000674 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000674 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S1B PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001513 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 13 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 12 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 16 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 15 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 mis6-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS mis6 mis6-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 14 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPNCRNA.12 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- prl12 prl12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.12 FYPO:0009030 wild type Overexpression 972 h- prl12 prl12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000251 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.12 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- prl12 prl12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.12 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- prl12 prl12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.12 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- prl12 prl12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 A195AGVPLA Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K1 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SA6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SA6 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SA6 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC336.07 FYPO:0004081 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc3 sfc3-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC21H7.05) PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC336.07 FYPO:0004081 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc3 sfc3-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC2G5.07c) PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC336.07 FYPO:0001310 unknown Not assayed or wild type 972 h- sfc3 sfc3-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-08 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0004325 deletion 972 h- SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 SPAC13C5.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13C5.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13C5.04 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FYPO:0002557 400-450 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta400-450 mid1delta400-450 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001645 400-450 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta400-450 mid1delta400-450 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000784 400-450 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta400-450 mid1delta400-450 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2C) PomBase SPAC23E2.03c FYPO:0000302 unknown Not assayed or wild type 972 h- sms1 ste7-JM83 unknown ECO:0001232 PMID:1934121 4896 2013-02-01 PomBase SPAC23E2.03c FYPO:0000822 unknown Not assayed or wild type 972 h- sms1 ste7-JM83 unknown ECO:0001232 PMID:1934121 4896 2013-02-01 PomBase SPAC23E2.03c FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- sms1 ste7-JM83 unknown ECO:0000059 PMID:3185514 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1D4.11c FYPO:0001129 K391R Not assayed or wild type 972 h- lkh1 lkh1-K391R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.11c) PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC1D4.11c FYPO:0001384 K391R Not assayed or wild type 972 h- lkh1 lkh1-K391R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1D4.11c),assayed_substrate(PomBase:SPAC1D4.11c) PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC1D4.11c FYPO:0001384 K391R Not assayed or wild type 972 h- lkh1 lkh1-K391R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1D4.11c),assayed_substrate(PomBase:SPAC18B11.10) PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC1D4.11c FYPO:0001384 K391R Not assayed or wild type 972 h- lkh1 lkh1-K391R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1D4.11c),assayed_substrate(PomBase:SPAC630.14c) PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC1D4.11c FYPO:0000155 K391R Not assayed or wild type 972 h- lkh1 lkh1-K391R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:20200159 4896 2017-07-14 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000658 M513I Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-K33 amino_acid_mutation ECO:0001807 high assayed_using(PomBase:SPAC25B8.19c) PMID:24831008 4896 2014-06-12 (Fig. 4) PomBase SPBC1A4.07c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sof1 sof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.07c FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sof1 sof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- sof1 sof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1A4.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sof1 sof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.07c FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sof1 sof1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0004077 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 68 PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 5C, D) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0001424 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:22268381 4896 2019-10-30 GFP-Rdp1 was not detected in the nuclei of most cells (Figure 1B). PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000446 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 FYECO:0000127 complete PMID:12399381 4896 2020-07-28 (Figure 1) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0007435 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 FYECO:0000127 complete PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 1) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000838 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:22268381 4896 2019-10-30 localization of Dcr1-GFP and GFP-Ago1 was not affected by the loss of Sal3 activity (Figure S1). PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000838 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:22268381 4896 2019-10-30 localization of Dcr1-GFP and GFP-Ago1 was not affected by the loss of Sal3 activity (Figure S1). PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0000291 PMID:22268381 4896 2019-10-30 (Fig. 4) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 high PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 1) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0003481 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-33 unknown ECO:0001232 complete PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 1) PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001206 D647A Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-D647A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-24 PomBase SPBC23E6.02 FYPO:0003858 D539A,E540A Not assayed or wild type 972 h- rrp2 rrp2-DEAA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28552615 4896 2017-06-15 PomBase SPAC4H3.08 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fox2 fox2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fox2 fox2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- fox2 fox2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4H3.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fox2 fox2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000089 Q88* Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-Q88->stop slr8- partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12944481 4896 2014-10-13 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000280 S402A,S566A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S402A,S566A,S654A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 6I) PomBase SPAC458.05 FYPO:0001118 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-20 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000082 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000993 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0000325 PMID:7772832 4896 2012-04-27 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000994 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0000325 PMID:7772832 4896 2012-04-27 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000123 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-20 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000674 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000271 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000031,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000271 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000092,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000271 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000038,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000271 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000034,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0000271 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPAC458.05 FYPO:0003656 disruption Not assayed or wild type 972 h- pik3 pik3::ura4 pik3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7772832 4896 2012-04-23 PomBase SPBPB21E7.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBPB21E7.09 SPBPB21E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBPB21E7.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.09 SPBPB21E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.09 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.09 SPBPB21E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.09 SPBPB21E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.09 SPBPB21E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.09 SPBPB21E7.09delta deletion ECO:0005638 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assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPBC660.08 FYPO:0000703 1-72,213-424 Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38(73-212) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC660.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 1G) PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 oct1 oct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oct1 oct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.10c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph oct1 oct1delta deletion ECO:0005638 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wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-15 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002700 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 Pyp2 protein levels increased +2 times in the mutant background (Fig. 5C), but they were of a lower magnitude than that in rnc1􏰂 versus wild-type cells (+8 to 9 times) (Fig. 2C PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-15 PomBase SPCC757.09c FYPO:0004083 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000840 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000840 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0006822 K111D,A112D,R196D,N197D,R338D,G339D Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(m3KH) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000611 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H30 orp5-H30 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003004 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H30 orp5-H30 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003004 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H30 orp5-H30 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000377 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H30 orp5-H30 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC16A3.18 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cip1 cip1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 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unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC1D4.12 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad15 rad5-158 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPAC1D4.12 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad15 rad5-158 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000705 L383R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L383R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:21217703 4896 2023-02-16 An arginine substitution of Ile379 or Leu383 of Taz1 or Ile655 of SpRap1 at the center of the hydrophobic interface completely abolished the Taz1RBM-SpRap1RCT interaction (Fig. 6a). PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002907 L383R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L383R amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:21217703 4896 2023-02-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 L383R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L383R amino_acid_mutation ECO:0001807 high PMID:21217703 4896 2023-02-16 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0006221 1-360 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-360) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001586 1-360 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-360) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0006944 1-360 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-360) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-12-23 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 K210M Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-K210M amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006108 R1054E Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1-R1054E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph qcr10 qcr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- qcr10 qcr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qcr10 qcr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.08 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qcr10 qcr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 T303A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T303A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 T303A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T303A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0000230 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001009 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0000417 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004747 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004042 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0005689 wild type Knockdown 972 h- adf1 adf1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPCC70.12c FYPO:0000644 T7D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-T7D amino_acid_mutation ECO:0001232 complete assayed_protein(PomBase:SPCC70.12c) PMID:39910760 4896 2025-02-13 This suggested that phosphorylation of the N-terminus of Ecl1 was unlikely to significantly affect the intracellular localization of Ecl1. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000776 T7D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-T7D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39910760 4896 2025-02-13 Furthermore, the Ecl1-overexpression reduced TORC1 activity regardless of the presence or absence of sulfur (Figure 5e,f). In other words, even during the logarithmic growth phase, when Thr7 is phosphorylated and Ecl function is suppressed, Ecl1 overexpression sufficiently reduces TORC1 activity. These results indicated that phosphorylation of the N-terminus of Ecl1 had little effect on TORC1 repression and that the expression of Ecl1, rather than starvation conditions, was important for TORC1 repression. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000703 T7D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-T7D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC70.12c) PMID:39910760 4896 2025-02-13 We investigated the effect of phosphorylation mutations of Ecl1 on the binding of TORC1 subunit Mip1 to Ecl1 (Figure 5i). Mip1-HA protein did not coprecipitate with GFP but did coprecipitate wild-type Ecl1 and with Ecl1 proteins with mutations at Thr7 or Ser22. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000280 T7D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-T7D amino_acid_mutation ECO:0001232 complete PMID:39910760 4896 2025-02-13 First, we investigated the conjugation rate in the stationary phase. Overexpression of wild-type Ecl1 and Ecl1-22D, but not the empty vector or Ecl1-7D, rescued the conjugation defect in the stationary phase of Δecls cells (Figure 3b), suggesting a significant loss of activity in Ecl1-7D. PomBase SPCC962.06c FYPO:0002678 P132G,P134G Not assayed or wild type 972 h- bpb1 bpb1-P132G,P134G amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC962.06c),residue(S131,S133) PMID:26167880 4896 2024-07-04 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mug130 mug130delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug130 mug130delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug130 mug130delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8F11.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug130 mug130delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP25A2.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tho1 tho1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP25A2.03 FYPO:0002242 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tho1 tho1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP25A2.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- tho1 tho1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCP25A2.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tho1 tho1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.21 FYPO:0002060 deletion 972 h- tpi1 tpi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC24B10.21 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpi1 tpi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 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SPAC1687.04 FYPO:0000444 2-53 Not assayed or wild type 972 h- mcb1 mcb1-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:21813639 4896 2011-08-23 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0001492 2-53 Not assayed or wild type 972 h- mcb1 mcb1-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:21813639 4896 2013-06-03 PomBase SPCC31H12.05c FYPO:0003412 sds21::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 sds21 sds21::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-1 unknown ECO:0000059 PMID:26167880 4896 2024-07-04 Importantly, introns retained in a temperature-sensitive mutant of the S. pombe U2AF65 ortholog prp2 (prp2-1) (2,873 introns retained, ~62%) (Supplementary Fig. 3b) did not result in a consistent positive correlation with suboptimal cis-regulatory sequences (Fig. 4a and Supplementary Fig. 3a). PomBase SPBC146.07 FYPO:0003244 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000229 PMID:38833506 4896 2024-12-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0004742 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 we surveyed several additional ts lethal splicing mutants for silencing defects at the permissive temperature (11-14). Only particular splicing mutants affected silencing. Silencing of a centromeric cen1:ade6+ marker gene (Fig. 1A) remained intact in the presence of prp1 (Prp6Sc/Hs), prp2 (U2AFHs), prp3 (Prp3Sc/PRPF3Hs), or prp4 (PRPF4BHs) mutations PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000835 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-ts nuc2ts unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9383050 4896 2012-06-29 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000705 W3660A,L3661A Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000781 W3660A,L3661A Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-AA amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 high PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000847 W3660A,L3661A Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-AA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 6J) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000703 W3660A,L3661A Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 7A) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0002357 W3660A,L3661A Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000088 W3660A,L3661A Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure 6B) PomBase SPBC409.05 FYPO:0003165 L113F Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 16 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Table 1) PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002927 F332A Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-F332A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24322298 4896 2015-11-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0005101 F332A Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-F332A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24322298 4896 2015-12-03 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001045 C125A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-C125A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 6B) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 C125A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-C125A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S2) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 C125A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-C125A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC16C4.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S2) PomBase SPAC186.01 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pfl9 pfl9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC186.01 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pfl9 pfl9delta 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This phenotype is reminiscent of the mitochondrial morphology defect observed in S. cerevisiae deleted for MGM1 [18]. PomBase SPCC191.08 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lto1 lto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC191.08 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lto1 lto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC191.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lto1 lto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC191.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- lto1 lto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC191.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lto1 lto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 M700F Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-as8 wee1.as8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Table 1; Fig. 3A) PomBase SPAC821.08c FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-C348 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPBC342.05 FYPO:0001933 deletion 972 h- crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9928931 4896 2015-04-22 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003489 deletion 972 h- cdc25-22 crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22792081 4896 2014-07-02 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003489 deletion 972 h- crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9153313 4896 2019-08-28 PomBase SPBC342.05 FYPO:0004254 deletion 972 h- crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9928931 4896 2015-04-22 PomBase SPBC342.05 FYPO:0004254 deletion 972 h- crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9928931 4896 2015-04-22 PomBase SPBC342.05 FYPO:0004254 deletion 972 h- crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 high PMID:14739927 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deletion 972 h- crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000211 12 PMID:9928931 4896 2015-04-22 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- cdc25-22 crb2 crb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000305 medium PMID:22792081 4896 2014-07-02 PomBase SPBC342.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph crb2 crb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.05 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph crb2 crb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.05 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph crb2 crb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph crb2 crb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 crb2 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hcs1-143 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC683.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph 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SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC683.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC683.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC683.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC683.03 SPAC683.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001009 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 50 PMID:16687577 4896 2018-02-28 (Fig. 5) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0004481 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0004481 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9742395 4896 2018-02-23 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001880 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000941 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0006825 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:15132994 4896 2020-12-21 Fin1 failed to bind to the SPB when byr4+ was deleted (Table 1). PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0005055 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10381387 4896 2021-02-26 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0005055 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10775265 4896 2020-12-30 After shift to restrictive temperature, cdc16-116 cells display two phenotypes termed type I and type II cells (Minet et al., 1979; Cerutti and Simanis, 1999). Type I cells have two nuclei and make multiple septa. Type II cells have a single nucleus and a septa. It has been proposed that the type II cells immediately septate again after division because they inherit the SPB that contains active Spg1p (Cerutti and Simanis, 1999). In support of this hypothesis, Sid1p was present at the SPB in type II cells (Figure 3A; see arrow). PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0005055 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:762020 4896 2012-07-16 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0005055 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19736319 4896 2021-01-02 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0005055 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15537703 4896 2015-11-09 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001875 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001876 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:9420333 4896 2021-04-12 (Fig. 6A) in late anaphase cdc7 is normally localized only one SPB PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000082 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:23874188 4896 2014-02-24 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000082 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 All temperature-sensitive alleles grew less than wild-type at 36°C with the cdc16-C1 allele showing the greatest temperature-sensitivity (Figure 1I). PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000082 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0007575 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:25501814 4896 2020-12-26 (Fig. 2g) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0005718 R105C Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8334988 4896 2021-02-08 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003331 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 medium assayed_enzyme(PomBase:SPAC821.12) PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002527 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1289.01c) PMID:22905165 4896 2020-02-27 (Fig. 1B) in which the SIN signal does not turn off, Cfh3p localized to the edge of the growing septa and it remained at the septal area after the septa had been completed. Thus, Cfh3p can arrive at the cell midzone in the absence of the SIN pathway but it requires that the SIN signal must be turned off for it to be removed from the cell equator after mitosis PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001837 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:25501814 4896 2020-12-27 Cdc7p-GFP never disappeared from the old SPB (Sohrmann et al., 1998) and the type 1 nodes did not reform (Fig. 3B; supplementary material Movie 3) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000651 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:762020 4896 2012-07-09 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001130 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 1H, 1I) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003337 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:16772338 4896 2014-05-13 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0004355 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1A) In a mob1-R4 byr4::ura4Δ mutant, and also in cdc16-116 grown for 5 hr at 36+C, cdc11p accumulated in the hyperphosphorylated (3) form. Later: in mutants such as cdc16-116 or byr4::ura4Δ, in which cdc7p is present on both spindle pole bodies, the hyperphosphorylated form (3) of cdc11p is more abundant. PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001038 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:22419817 4896 2013-08-23 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003501 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10775265 4896 2020-12-30 After shift to restrictive temperature, cdc16-116 cells display two phenotypes termed type I and type II cells (Minet et al., 1979; Cerutti and Simanis, 1999). Type I cells have two nuclei and make multiple septa. Type II cells have a single nucleus and a septa. It has been proposed that the type II cells immediately septate again after division because they inherit the SPB that contains active Spg1p (Cerutti and Simanis, 1999). In support of this hypothesis, Sid1p was present at the SPB in type II cells (Figure 3A; see arrow). PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001226 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10381387 4896 2021-02-26 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001226 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:762020 4896 2012-07-16 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002000 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19736319 4896 2021-01-02 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000118 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8505375 4896 2019-01-31 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002002 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 (Figure 1H) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001368 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 50 PMID:16687577 4896 2018-02-28 (Fig. 5) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002141 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003075 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:11250892 4896 2017-07-24 (Fig. 7) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003075 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC21.06c) PMID:9420333 4896 2021-04-07 (Fig. 2A) loss of cdc16 function does not affect cdc7 kinase activity PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002559 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002442 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000079 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:12186944 4896 2014-09-22 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002967 R105C Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002967 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 The CAA20785 GFP fusion protein localized normally in cdc16-116, spg1-106, cdc7-24, and sid2-250 temperature-sensitive mutants...(Figure 3) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002967 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002967 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001357 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0001357 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002721 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002177 R105C Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-116 cdc16.116 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC4.04c FYPO:0001277 615-724 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D9 mcm2-D9 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001424 615-724 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D9 mcm2-D9 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 615-724 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D9 mcm2-D9 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 615-724 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D9 mcm2-D9 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 615-724 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D9 mcm2-D9 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000783 615-724 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D9 mcm2-D9 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPCC162.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr urk1 urk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC162.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr urk1 urk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC162.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 urk1 urk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC162.11c FYPO:0001986 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urk1 urk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPCC162.11c FYPO:0005253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urk1 urk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC162.11c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 urk1 urk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC162.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- urk1 urk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC162.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urk1 urk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC162.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urk1 urk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SB3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SB3 unknown 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PomBase SPAC4A8.04 FYPO:0001043 wild type Overexpression 972 h- isp6 isp6+ wild_type ECO:0005638 PMID:16550352 4896 2013-10-15 PomBase SPBC1734.14c FYPO:0000681 wild type Overexpression 972 h- suc1 suc1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:16453733 4896 2015-08-25 PomBase SPBC1734.14c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- suc1 suc1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16453733 4896 2015-08-25 PomBase SPBC1734.14c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- suc1 suc1+ wild_type ECO:0001232 PMID:3031478 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph clg1 clg1delta 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clg1delta mug80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clg1 clg1delta mug80delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R95A,R165A Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-S5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- pin1 pin1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001645 wild type Overexpression 972 h- pin1 pin1+ wild_type ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_using(PomBase:SPCC16C4.03) PMID:33410907 4896 2021-01-13 fig? PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001974 wild type Overexpression 972 h- pin1 pin1+ wild_type ECO:0005580 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 V17G,S92P Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-RD17-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000705 111-534 Not assayed or wild type 972 h- gpl1 gpl1(N)1-110 gpl1(N): 1-110 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.06c),assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.09) PMID:36361590 4896 2022-11-28 (Figure 3) PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000705 111-534 Not assayed or wild type 972 h- gpl1 gpl1(N)1-110 gpl1(N): 1-110 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC713.05) PMID:36361590 4896 2022-11-28 (Figure 3) PomBase SPCC594.01 FYPO:0004780 wild type Overexpression 972 h- duc1 duc1+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:39239853 4896 2024-09-08 Live-cell imaging revealed that over-production of Duc1 indeed reduced Opy1-mNG at the PM by ~35% (Fig. 5C,D). PomBase SPCC594.01 FYPO:0000339 wild type Overexpression 972 h- duc1 duc1+ wild_type ECO:0001232 PMID:39239853 4896 2024-09-08 Further, we noticed that over-production of Duc1, like overproduction of Opy1 (Snider et al., 2020), resulted in cells with off-centered septation (Fig. 5E,F), consistent with both of these proteins associating with PI(4,5)P2 and out-competing CR anchoring proteins for a limiting amount of PI(4,5)P2. PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K121R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K121R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K121R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K121R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 I96P Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-I96P amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPCC18.08 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msk1 msk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- msk1 msk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC18.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msk1 msk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18.04 FYPO:0001861 unknown Not assayed or wild type 972 h- pof6 sin4- unknown ECO:0000340 PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPCC777.14 FYPO:0001357 S112I,S114L,S116A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-SX2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:9102632 4896 2013-09-25 PomBase SPBC887.15c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph sur2 sur2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.15c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph sur2 sur2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.15c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph sur2 sur2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.15c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph sur2 sur2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.15c FYPO:0008261 deletion 972 h- sur2 sur2delta deletion ECO:0000335 PMID:20388730 4896 2024-06-26 Interestingly, a significant amount of IPC accumulated and MIPC decreased in sur2 cells. The scs7 mutation also caused a reduction in MIPC content. These results suggest that Imt proteins exhibit weak activity towards dihydroceramide-containing IPC, such that a reduction in MIPC was observed in sur2 and scs7 mutants. 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assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:33137119 4896 2021-01-05 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004422 K263C Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K263C amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:33137119 4896 2021-04-15 (Fig. 3A) To our surprise, Gad8-K263C was phosphorylated at S546 in wild type cells, as well as in Δtor1 cells (S546-P, Fig 3A).This finding suggests that the Gad8-K263C mutant is phosphorylated by a kinase that normally does not recognize Gad8 as a substrate. PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004422 K263C Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K263C amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:33137119 4896 2021-04-15 (Fig. 3A) affecting substrate Fkh2 in vitro PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001266 K263C Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K263C amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:33137119 4896 2021-04-13 (Fig. 3A) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001266 K263C Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K263C amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:33137119 4896 2021-04-15 (Fig. 3A) Gad8-K263C was also phosphorylated at S546 under conditions that compromise Tor1 activity, such as osmotic or low glucose stress (S3A Fig), further supporting Tor1-independent phosphorylation of Gad8-K263C by an as yet unknown kinase. PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000085 K263C Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K263C amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:33137119 4896 2020-11-09 (Fig. 6b) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000088 K263C Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K263C amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:33137119 4896 2020-11-09 (Fig. 6b) PomBase SPAC19A8.08 FYPO:0003918 Y545A,E548A,F748A,E751A Not assayed or wild type 972 h- upf2 upf2-4GH1,2 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:11073994 4896 2014-10-27 PomBase SPCC1223.08c FYPO:0003325 wild type Overexpression 972 h- dfr1 dfr1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8088538 4896 2014-05-05 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ura1 ura1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0001012 deletion 972 h- ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 PMID:23555823 4896 2013-11-09 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0001188 deletion 972 h- ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:23555823 4896 2013-11-11 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.06c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ura1 ura1delta deletion ECO:0005638 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ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtg2 mtg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP8A3.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- mtg2 mtg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP8A3.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtg2 mtg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003080 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000337 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003084 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000337 PMID:12840005 4896 2016-04-08 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0005356 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000337 PMID:12840005 4896 2016-04-12 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000059 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0002827 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:11387218 4896 2015-02-13 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000059 FYECO:0000005 high PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006602 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000337 PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006603 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0000337 PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 4) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0005638 medium PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 6) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23071723 4896 2018-03-02 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23071723 4896 2018-03-02 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-146 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23071723 4896 2018-03-02 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0004056 1-394,466-963 Overexpression 972 h- cbf12 cbf12-395-465 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1223.13) PMID:23555033 4896 2013-05-17 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0004346 (-819)-(-630) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 prt-3delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29618061 4896 2024-01-24 In the case of prt-3Δ, this phenotype is likely a result of lost Mmi1 recruitment since this mutant lacks the DSR motifs we previously mapped ((5,37), Figure 3A, Mmi1 CRAC). We tested Mmi1 recruitment to the prt locus in this mutant and it is indeed defective (data not shown). PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0000825 (-819)-(-630) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 prt-3delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Interestingly, elevated pho1 levels were observed in prt-1Δ, prt-2Δ, and prt-3Δ (Figure 3B, lanes 1- 4) suggesting that element(s) responsible for pho1 silencing are located within the 5′ part of prt. PomBase SPAC1952.05 FYPO:0006452 341-454 Not assayed or wild type 972 h- gcn5 gcn5deltabromodomain partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1952.05) PMID:26401015 4896 2018-03-26 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0006449 341-454 Not assayed or wild type 972 h- gcn5 gcn5deltabromodomain partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:26401015 4896 2018-03-26 PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0008358 S100A Not assayed or wild type 972 h- tbf1 tbf1-S100A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.13) PMID:38677290 4896 2024-12-13 Furthermore, we found that all S100A, T104A, and N107A mutant proteins formed aggregation easily during concentration in our purification process, indicating that these three mutations also resulted in protein instability of spTbf1TRFH PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K48Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K48Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K48Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K48Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0000117 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0006221 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Pos1 directly binds Spa2 and promotes Spa2 localization PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0001586 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pos1 pos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0001496 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:25428987 4896 2015-02-12 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0006617 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0006822 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pos1 pos1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- pos1 pos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 I102A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-I102A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0001645 I102A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-I102A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,R363P Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,R363P Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002702 D743A Not assayed or wild type 972 h- trt1 trt1-D743A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:18160711 4896 2016-06-29 PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0005394 D743A Not assayed or wild type 972 h- trt1 trt1-D743A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18160711 4896 2016-06-29 PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0005404 D743A Not assayed or wild type 972 h- trt1 trt1-D743A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:18160711 4896 2016-06-29 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003481 pom1-cdr2(252-352)-GFP Not assayed or wild type 972 h- pom1 pom1-cdr2C-GFP Pom1-Cdr2C-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:19474792 4896 2017-04-27 Table 1, Fig. 2d PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0000121 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 PMID:9150257 4896 2014-09-25 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0003066 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 33 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0003263 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 1 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0004077 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 22 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0000185 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0000059 PMID:24943839 4896 2014-07-18 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0000513 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 PMID:9150257 4896 2014-09-25 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0003580 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 PMID:24943839 4896 2014-08-01 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 kms1 kms1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 kms1 kms1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0001221 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31015410 4896 2019-05-28 (Fig. 1 supp data) PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- kms1 kms1delta deletion ECO:0005638 PMID:9150257 4896 2014-09-25 PomBase SPAC3A11.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kms1 kms1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000082 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 ppc89-2, ppc89-3 and ppc89-4 grow 19 similarly to wild-type at 25°C but do not form colonies at 36°C (Figure 1B PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 At 25°C, Sid4-GFP SPB intensity was reduced by 4 approximately 30% in ppc89-3 and 60% in ppc89-4 compared to wild-type (Figures 2A 5 and S2A). At 36°C, Sid4-GFP SPB intensity was further reduced by ~90% in ppc89-3 6 and ppc89-4 compared to wild-type (Figure 2A,B). These results indicate that the Sid4- 7 Ppc89 interaction is disrupted in both ppc89-3 and ppc89-4 cells at restrictive 8 temperatu re. PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 As expected, Dma1- 22 mNG, Cdc11-GFP and Mto1-mNG were lost from SPBs in ppc89-3 and ppc89-4 cells at 23 restrictive temperature, but Mto1-mNG localized normally to SPBs in ppc89(1-707) cells (Figures 4A-G; S2B and C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 As expected, Dma1- 22 mNG, Cdc11-GFP and Mto1-mNG were lost from SPBs in ppc89-3 and ppc89-4 cells at 23 restrictive temperature, but Mto1-mNG localized normally to SPBs in ppc89(1-707) cells (Figures 4A-G; S2B and C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC417.07c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 As expected, Dma1- 22 mNG, Cdc11-GFP and Mto1-mNG were lost from SPBs in ppc89-3 and ppc89-4 cells at 23 restrictive temperature, but Mto1-mNG localized normally to SPBs in ppc89(1-707) cells (Figures 4A-G; S2B and C) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000940 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC902.06) PMID:39471327 4896 2024-11-01 we also observed a reduction 3 in Mto2-mNG SPB signal at 36 ̊C in ppc89-3 and ppc89-4 compared to wild-type (Figure 4 S2D,E). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 Ppc89-3-mNG localized to the 10 SPB at both permissive and restrictive temperatures similarly to Ppc89-mNG (Figures 11 1E, F and S1A). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.05c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 Neither Sfi1-mCherry nor 7 Sad1-mCherry signal were reduced in ppc89-3 or ppc89-4 cells (Figure S3A,B). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0003245 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 At 36°C, ppc89-2 and ppc89-3 displayed an increased proportion of binucleate cells with “kissing” nuclei in which nuclei return to the cell center after a failed cytokinesis as well as cell lysis (Figure 1C,D) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000647 S634P,V654A,C676R Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 At 36°C, ppc89-2 and ppc89-3 displayed an increased proportion of binucleate cells with “kissing” nuclei in which nuclei return to the cell center after a failed cytokiness as well as cell lysis (Figure 1C,D) PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smi1 smi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002061 deletion 972 h- smi1 smi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smi1 smi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smi1 smi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0005738 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11792803 4896 2016-10-12 (Figure 2b) PomBase SPCC320.13c FYPO:0001946 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11792803 4896 2016-10-12 PomBase SPCC320.13c FYPO:0005739 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11792803 4896 2016-10-12 (Figure 2b) PomBase SPCC320.13c FYPO:0000229 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11861551 4896 2019-11-07 (Fig. 7a) PomBase SPCC320.13c FYPO:0000316 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0005638 complete PMID:11792803 4896 2016-10-12 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0004255 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11792803 4896 2016-10-12 (Figure 2b) PomBase SPCC320.13c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0005638 PMID:11792803 4896 2016-10-12 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11861551 4896 2019-11-07 (Fig. 7a) PomBase SPCC320.13c FYPO:0003758 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11792803 4896 2016-10-12 (Figure 2a) ( stretched chromaitn along elongating spindle at anaphase B) PomBase SPCC320.13c FYPO:0000276 deletion 972 h- ark1 ark1delta deletion ECO:0001232 PMID:11792803 4896 2016-10-12 (Figure 2b) chromsome detached from spindle PomBase SPBC244.01c FYPO:0000912 T275A Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-T275A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:24055157 4896 2022-09-28 Although mutating S278 to alanine abolished Sid4 ubiquitination (Figure 1D) PomBase SPBC244.01c FYPO:0004537 T275A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 sid4 sid4-T275A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24055157 4896 2022-09-28 cells bypassed the arrest after 5 hrs (Figure 2C). ......These data indicate that mutating T275 eliminates Dma1-dependent checkpoint signaling. PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 T275A Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-T275A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:24055157 4896 2022-09-28 Although Dma1-GFP still localized to SPBs in sid4(T275A) mutant cells (Figure S1F) PomBase SPBC216.07c FYPO:0005097 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:36481249 4896 2023-04-12 The tor2-287 mutant cells also showed a similar phenotype after shifting at 36 ◦C (Fig. 3C, upper panel), indicating the G1 arrest. PomBase SPBC216.07c FYPO:0001430 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000201 PMID:18076573 4896 2015-11-20 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004481 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:22645648 4896 2016-08-04 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004481 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18076573 4896 2015-11-20 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002678 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:36481249 4896 2023-04-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002678 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:36481249 4896 2023-04-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000082 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001407 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22084378 4896 2015-02-16 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001407 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001407 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000208 medium PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC216.07c FYPO:0007317 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0007317 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000162 PMID:31833215 4896 2020-04-20 PomBase SPBC216.07c FYPO:0003694 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:37913773 4896 2024-01-15 Our result indicated that the total amount of 18S rRNA transcripts was reduced by half in the tor2-287 mutant, even under nutrient-rich conditions (Figure 3A). PomBase SPBC216.07c FYPO:0002583 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0006748 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0005746 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000210 assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:26443240 4896 2021-03-24 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001382 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c) PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001382 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c) PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000835 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC16.05c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 In the tor2-287 and tor2-13 mutants, the Sfp1 protein dramatically decreased within 2h after shifting to the restrictive temperature (Fig. 2A) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001324 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001324 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:37913773 4896 2024-01-15 we found that the intracellular Atf1 protein levels were significantly reduced in the tor2-287 mutants when detected with an anti-Atf1 antibody (Figures 3G and 3H). PomBase SPBC216.07c FYPO:0002391 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.04c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 5C) PomBase SPBC216.07c FYPO:0002391 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:37913773 4896 2024-01-15 Furthermore, we discovered that this reduction was caused by the dissociation of RNA polymerase I from the rDNA region (Figures 3B and S3B). PomBase SPBC216.07c FYPO:0002391 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:37913773 4896 2024-01-15 heterochromatin formation in rDNA is prompted by the dissociation of the stress- responsive transcription factor Atf1 and the accumulation of the histone chaperone FACT, which maintains H3K9 methylation,40 in addition to the RNAi-dependent pathway.14 We therefore performed ChIP-qPCR targeting Atf1 and FLAG-tagged Pob3 (a component of FACT), and found that Atf1 diminished from the entire rDNA region, while Pob3-FLAG selectively accumulated between rDNA repeats (Figures 3D and 3E). PomBase SPBC216.07c FYPO:0002391 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC1952.05) PMID:37913773 4896 2024-01-15 we conducted ChIP-qPCR targeting Gcn5-HA and found that it diminished from rDNA in the tor2-287 mutant compared with wild-type (Figure S3D). PomBase SPBC216.07c FYPO:0004455 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.11c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 or the tor2-287 mutation (Fig. 6E), the nuclear accumulation of Ifh1 was largely lost while no change in the Ifh1 protein levels was observed (Fig. 6B), implying that TORC1 promotes the nuclear localization of Ifh PomBase SPBC216.07c FYPO:0002679 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.11c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 When TORC1 was inactivated in the tor2-13 or tor2-287 mutants at the restrictive temperature, the electrophoretic mobility of Ifh1 was notably decreased (Fig. 6A). The slow migrating form of Ifh1 was also observed when TORC1 was inactivated in wild-type cells starved of nitrogen (Fig. 6B). Phosphatase treatment experiments confirmed that slow-migrating Ifh1 was its phosphorylated form (Fig. 6B). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001117 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 (Fig 3A) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001117 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001117 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.18c) PMID:37913773 4896 2024-01-15 We performed RT-qPCR and found that transcription of selected ribosome-related genes (rpl102+, rlp7+, and gar2+) was reduced in the tor2-287 mutant (Figure 4A). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001117 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_transcript(PomBase:SPAC664.06) PMID:37913773 4896 2024-01-15 We performed RT-qPCR and found that transcription of selected ribosome-related genes (rpl102+, rlp7+, and gar2+) was reduced in the tor2-287 mutant (Figure 4A). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001117 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_transcript(PomBase:SPAC140.02) PMID:37913773 4896 2024-01-15 We performed RT-qPCR and found that transcription of selected ribosome-related genes (rpl102+, rlp7+, and gar2+) was reduced in the tor2-287 mutant (Figure 4A). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001117 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000228 medium PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000228 medium PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0006074 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:37913773 4896 2024-01-15 To investigate this, we performed ChIP-qPCR targeting H3K9 methylation, a marker of heterochromatin formation, in both wild-type and tor2-287 cells. We found that tor2-287 cells exhibited a marked increase in H3K9me2 levels, accompanied by a slight increase in histone H3 occupancy in the rDNA region (Figures 3C and S3C). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001974 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004032 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC609.05),assayed_region(SO:0001860) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002082 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC18H10.20c) PMID:35639710 4896 2022-06-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000825 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 (Fig 4A). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001309 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000162 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000951 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22645648 4896 2016-08-08 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002482 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22084378 4896 2015-02-16 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001164 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001164 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0007705 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000210 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:26443240 4896 2021-03-24 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002674 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000776 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000228 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2C) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000227 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001420 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001420 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18076573 4896 2015-11-20 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001029 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004513 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004375 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:22645648 4896 2016-08-04 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:18076573 4896 2015-11-20 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002701 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002701 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0003859 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000648 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:36481249 4896 2023-04-12 Interestingly, the average cell size of tor-287 mutant cells also decreases from 18.2 μm at 25 ◦C to 7.0 μm at 36 ◦C (Fig. 3A and 3B PomBase SPBC216.07c FYPO:0001877 L2048S Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2048S tor2-287|tor2-S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C69T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C69U nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C69T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C69U nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC651.08c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc1 rpc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC651.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpc1 rpc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC651.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc1 rpc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0002780 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005580 PMID:18182845 4896 2013-10-10 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0002143 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005580 PMID:18182845 4896 2013-10-10 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0003965 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005801 PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0001517 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0000763 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0001109 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPCC1450.06c FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- grx3 grx3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15796926 4896 2014-08-06 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000031 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0006669 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 10 PMID:30089908 4896 2018-09-04 Extended Data Fig. 5e, f, Supplementary Video 9; see also ref. 1 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000510 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 high PMID:35512546 4896 2023-02-17 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002044 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:7520368 4896 2014-01-23 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0001915 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002962 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000583 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mei2 mei2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000581 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 high PMID:9778252 4896 2019-11-07 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mei2 mei2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0003747 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0003747 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0005040 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:22144909 4896 2015-11-04 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mei2 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2019-06-18 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mei2 mei2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mei2 mei2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0007357 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.130) PMID:31811152 4896 2020-04-13 (Fig. 2) PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mei2 mei2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cki1 cki1delta deletion ECO:0005638 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4896 2012-02-23 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000658 S489F Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-25 amino_acid_mutation ECO:0001807 high assayed_using(PomBase:SPAC25B8.19c) PMID:24831008 4896 2014-06-12 (Fig. 4) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007050 S489F Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-25 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24831008 4896 2014-06-12 (Fig. 2) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000117 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000705 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 4) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000080 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 PMID:31269446 4896 2019-12-23 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0007212 deletion 972 h- epe1delta ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0007213 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0007213 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0006860 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000337 PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 3) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0006859 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000337 PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 3) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0006612 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000044738) PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003803 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 3) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002019 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000337 medium PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 1) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003004 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000078 PMID:33410907 4896 2021-01-22 the intracellular level of ROS was elevated in pin1 and ssu72 mutants (Figure 6H) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002836 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002173 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002664 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0004656 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 1) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0004656 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 2) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001038 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 1) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0005402 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000337 PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 2, S2) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003049 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003049 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000862 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000703 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC409.12c),assayed_using(PomBase:SPCC1393.14) PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 4) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0006415 deletion 972 h- ssu72 ssu72delta deletion ECO:0001232 PMID:38886153 4896 2024-09-27 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ssu72 ssu72delta deletion 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SPBP19A11.03c FYPO:0004944 L636P Not assayed or wild type 972 h- rho0 mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:41068765 4896 2025-10-10 Figure 3D PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0000668 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(GO:0000502) PMID:41068765 4896 2025-10-10 These experiments revealed a consistent and sig- nificant (p < 0.01, Student’s t test) decrease in MG132- sensitive peptidase activity of between 30 and 40% in the mts4L636P mutant extracts, both in rich media (Fig. 2A, Additional file 1) and in EtBr media (Fig. 2B, Additional file 2). PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0000668 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137,FYECO:0000460,FYECO:0000467 assayed_enzyme(GO:0000502) PMID:41068765 4896 2025-10-10 These experiments revealed a consistent and sig- nificant (p < 0.01, Student’s t test) decrease in MG132- sensitive peptidase activity of between 30 and 40% in the mts4L636P mutant extracts, both in rich media (Fig. 2A, Additional file 1) and in EtBr media (Fig. 2B, Additional file 2). PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0005142 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000137 PMID:41068765 4896 2025-10-10 Figure 2D PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0004344 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000240 PMID:41068765 4896 2025-11-06 Surprisingly, the viability of the mts4L636P mutants did not decrease even after pro- longed culture and exceeded the viability of the WT after very long exposure to media without nitrogen. PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0003881 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000137,FYECO:0000460,FYECO:0000467 high PMID:41068765 4896 2025-10-10 Figure 1D D ρ0 growth assay after CRISPR mutagenesis to revert and induce the mts4L636P mutation. In the ptp1-1 and mts4L636P plates a section of each plate is amplified to show the growth of petite colonies. PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0001409 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:41068765 4896 2025-10-10 Both mutants grow normally in glucose-rich media. However, while mts4L636P mutants show normal growth in glycerol respiratory media, the atp3R282C mutant exhibited very slow growth (Fig. 3A). PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0007629 L636P Not assayed or wild type 972 h- mts4 ptp1-1 mts4-L636P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:41068765 4896 2025-10-10 Surprisingly, the viability of the mts4L636P mutants did not decrease even after pro- longed culture and exceeded the viability of the WT after very long exposure to media without nitrogen. PomBase SPAC1805.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph fmt1 fmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph fmt1 fmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.09c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph fmt1 fmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr fmt1 fmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1805.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph fmt1 fmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.09c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph fmt1 fmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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pmr1 pmr1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000098 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:34349749 4896 2024-12-15 pmr11 was sensitive to 100 mM CaCl2 while pmr11 cfr11 was not (Supplementary Figure 4) PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001201 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001190 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0004512 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 PMID:14723709 4896 2020-01-22 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000087 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0006579 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:14723709 4896 2020-01-22 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0006579 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000279 low PMID:31201205 4896 2019-06-23 (Figure 4) PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 high PMID:34349749 4896 2024-12-15 pmr1delta was more sensitive to KCl than cfr1delta, and the double mutants were the most sensitive (Supplementary Figure 4). PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0006935 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000104,FYECO:0000229 PMID:31201205 4896 2019-06-23 (Figure 7B) small, viable PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002903 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0001232 PMID:31201205 4896 2019-06-21 (Figure 5) (vw: changed to pear, descendent of spherical) PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002106 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:14723709 4896 2020-01-22 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- pmr1 pmr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmr1 pmr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.02c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmr1 pmr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0000711 wild type Overexpression 972 h- tip41 tip41+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000230 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002021 wild type Overexpression 972 h- tip41 tip41+ wild_type ECO:0001232 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0001758 wild type Overexpression 972 h- tip41 tip41+ wild_type ECO:0005801 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0004104 wild type Overexpression 972 h- tip41 tip41+ wild_type ECO:0001232 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP tip41 tip41+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- tip41 tip41+ wild_type ECO:0005638 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- tip41 tip41+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000230 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0004118 deletion 972 h- pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC2C4.11c FYPO:0003612 deletion 972 h- pno1 pno1delta rbp28delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC29A10.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph atp7 atp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph atp7 atp7delta deletion ECO:0005638 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- atp7 atp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A10.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp7 atp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp7 atp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005727 46-50,111-115 Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7(PP1-deltaAB) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Fig. 2b) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002061 46-50,111-115 Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7(PP1-deltaAB) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:21664573 4896 2016-10-18 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0004753 399-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta234C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 399-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta234C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC409.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph meu18 meu18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.11 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph meu18 meu18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu18 meu18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.11 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 meu18 meu18delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC409.11 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 meu18 meu18delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC409.11 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph meu18 meu18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.11 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph meu18 meu18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- meu18 meu18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC409.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu18 meu18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu18 meu18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002550 857-872 Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-deltaC16 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10779336 4896 2018-03-02 PomBase SPCC576.09 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps20 rps20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC576.09 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps20 rps20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC576.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- rps20 rps20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC576.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps20 rps20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.13c FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- psu1 psu1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 8D) PomBase SPAC1002.13c FYPO:0003493 wild type Overexpression 972 h- psu1 psu1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10462482 4896 2014-06-30 PomBase SPNCRNA.808 FYPO:0009019 deletion 972 h- SPNCRNA.808 SPNCRNA.808delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.808 FYPO:0007808 deletion 972 h- SPNCRNA.808 SPNCRNA.808delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.808 FYPO:0001501 deletion 972 h- SPNCRNA.808 SPNCRNA.808delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC428.13c FYPO:0004562 wild type Overexpression 972 h- mob1 mob1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:10769201 4896 2025-10-20 Next, we examined the effect of increased expression of the mob1 gene from the full-strength nmt1 promoter in wild-type cells. Approximately 6 generations at 25°C (26 hours) after removal of thiamine from the medium (the promoter is turned on after 3-3.5 generations), cells displayed a variety of abnormalities of both septum formation and mitosis, including failure to septate (Fig. 3A; cells marked 1) PomBase SPBC428.13c FYPO:0001252 wild type Overexpression 972 h- mob1 mob1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:10769201 4896 2025-10-20 formation of one or more septa without cell cleavage (Fig. 3A; cells marked 2), PomBase SPAC323.06c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uba5 uba5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC323.06c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uba5 uba5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC323.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- uba5 uba5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC323.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uba5 uba5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.09 FYPO:0005878 unknown Not assayed or wild type 972 h- trp3 trp3- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0000107 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal52 dal52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- dal52 dal52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal52 dal52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1773.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal52 dal52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003542 deletion 972 h- spo13 spo13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.07c) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Figure 5C, S4B) PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003542 deletion 972 h- spo13 spo13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Figure 6A, S3) PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003542 deletion 972 h- spo13 spo13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Figure 6A, S3) PomBase SPCC1183.12 FYPO:0006051 deletion 972 h- spo13 spo13delta deletion ECO:0001232 PMID:28011631 4896 2017-05-24 (Figure S3) LP clustering at nucleus PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003541 deletion 972 h- spo13 spo13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Supplemental Figure S11B) PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003541 deletion 972 h- spo13 spo13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.04) PMID:21775631 4896 2016-09-06 (Figure S2A) PomBase SPCC1183.12 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph spo13 spo13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000214 Q588P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-Q588P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 Q588P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-Q588P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPAC1071.09c FYPO:0008272 1-94 Not assayed or wild type 972 h- djc9 djc9-(95-255) djc9-(122-282) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. 2E) PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000156 mcl1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-4 fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000156 mcl1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-4 fusion_or_chimera ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0007160 mcl1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-4 fusion_or_chimera ECO:0000226 medium PMID:38285941 4896 2024-04-08 Thus, although both mutants affect the retention of parental histones, Mcl1 plays a more critical role in the process. PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0001357 mcl1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-4 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPCC794.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mae2 mae2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPCC794.12c FYPO:0000785 deletion 972 h- mae2 mae2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPCC794.12c FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mae2 mae2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPCC794.12c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mae2 mae2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPCC794.12c FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mae2 mae2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC794.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- mae2 mae2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC794.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mae2 mae2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0008439 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0000112 low PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001690 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000084 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000095 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 D68A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 set1 set1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002330 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPCC306.04c FYPO:0000468 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 low PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 6C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0000468 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000337 low PMID:35908934 4896 2025-03-27 (Fig. 4C, Fig. 6C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 set1 set1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC306.04c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set1 set1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004125 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0001232 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0002917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004126 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004126 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004126 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1) PomBase SPCC306.04c FYPO:0008211 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Intriguingly, about 72% of downregulated genes in lsd1-ΔHMG, lsd2-ΔC, and set1Δ are antisense non-coding RNAs (S1 Table) PomBase SPCC306.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph set1 set1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002834 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1D) PomBase SPCC306.04c FYPO:0006993 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000049 low PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 1C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0002827 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 low PMID:38181050 4896 2024-06-21 (Fig. S1E) PomBase SPCC306.04c FYPO:0001458 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0001458 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002368 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0001442 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0005014 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0005012 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0003151 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 However, without Set1, Lsd1/2 protein levels are no longer upregulated during heat stress (Fig 4C and 4D), which implies that Set1 is required to elevate the protein levels of Lsd1 and Lsd2 under heat stress. PomBase SPCC306.04c FYPO:0003151 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-07 However, without Set1, Lsd1/2 protein levels are no longer upregulated during heat stress (Fig 4C and 4D), which implies that Set1 is required to elevate the protein levels of Lsd1 and Lsd2 under heat stress. PomBase SPCC306.04c FYPO:0001324 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPCC306.04c FYPO:0001324 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 In contrast, the protein levels of Lsd1-FTP and Lsd2-FTP show a notable decrease in the absence of Set1 (Fig 2I). PomBase SPCC306.04c FYPO:0001324 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 In contrast, the protein levels of Lsd1-FTP and Lsd2-FTP show a notable decrease in the absence of Set1 (Fig 2I). PomBase SPCC306.04c FYPO:0006631 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 To our surprise, clr4Δ increases the enrichments of Lsd1/2 while set1Δ decreases the enrichments of Lsd1 at its enriched genomic loci (Figs 2G, 2H, S6 and S7). PomBase SPCC306.04c FYPO:0003573 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 5B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph set1 set1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph set1 set1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.04c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph set1 set1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.04c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph set1 set1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004689 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1E) PomBase SPCC306.04c FYPO:0006987 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 5C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0007509 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 5D) PomBase SPCC306.04c FYPO:0002774 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Under heat stress (37 ̊C), it was consistently found that ubiquitination of Lsd1 and Lsd2 is drastically enhanced in set1Δ cells, even without mts2-1 as a background (Fig 4F) PomBase SPCC306.04c FYPO:0002774 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Under heat stress (37 ̊C), it was consistently found that ubiquitination of Lsd1 and Lsd2 is drastically enhanced in set1Δ cells, even without mts2-1 as a background (Fig 4F) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004342 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004342 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set1 set1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC306.04c FYPO:0004237 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 1F) PomBase SPCC306.04c FYPO:0000825 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 . Interestingly, deletion of the H3K4 methyltransferase Set1 leads to derepression of pho1 (Figure 3C). In contrast, deletion of the H3K36 methyltransferase Set2 only had a minor effect on pho1 derepression, suggesting that the mechanism underlying pho1 silencing primarily relies on histone methylation by Set1 PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1F) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.04c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.06) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC750.01) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 deletion 972 h- set1 set1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.18) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC306.04c 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prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 btb2 btb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- btb2 btb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btb2 btb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btb2 btb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003350 501-541 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-deltaCC2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Fig. 5B, C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006919 501-541 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-deltaCC2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Fig. 5B, C) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000703 GGAAAC159CTTCGG Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-STL2-1 nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 GGAAAC159CTTCGG Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-STL2-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 medium PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 GGAAAC159CTTCGG Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-STL2-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007725 D132A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-D132A stx8(D132A)|fsv1-D132A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001575 S17L Not assayed or wild type 972 h- gtr2 gtr2-S17L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0001324 S630D,S632D Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ppk32 ppk32-DD amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.10) PMID:27191590 4896 2016-07-04 (Fig. 6B) PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0005193 S630D,S632D Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ppk32 ppk32-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-04 (Fig. 6C) PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0001501 S630D,S632D Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ppk32 ppk32-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-04 (Fig. 6C) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 1-21,151-254 Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1delta1-21,151-254 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 L77D,L154K Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-L77D,L154K amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0007681 P75D,Y245A Not assayed or wild type 972 h- rnh201 rnh201-RED amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:33568651 4896 2021-03-09 Rnh201-RED mutant, based on the S. cerevsiae equivalent, is unable to remove single rNMPs from DNA but, buy genetic analysis, is able to remove runs of rNMPs. PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0007680 P75D,Y245A Not assayed or wild type 972 h- rnh201 rnh201-RED amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:33568651 4896 2021-03-15 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0004964 1,E2R Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-REE R-act1 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 PMID:41236477 4896 2025-12-16 Phalloidin staining in the wt background visually revealed a decrease in the area occupied by actin patches in the REEact1 strain as opposed to the MEEEact1 strain (Fig. 4 D). To analyze patches in greater detail, we generated fimbrin-GFP strains that mark patches but not cables or rings. The patches were counted manually in 3D. This analysis showed that the number of patches in the REEact1 strain is less than that in the MEEEact1 strain per cell (Fig. 4 E (i)). PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001365 1,E2R Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-REE R-act1 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 PMID:41236477 4896 2025-12-16 The ring constriction took longer in the REEact1 strain, reflecting the reduced average rate of constriction (ring diameter divided by the time for constriction). Overall, the total time taken for cytokinesis from node appearance to the end of CAR constriction was increased in the REEact1 strain. (Fig. 5A, 5B) PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0006822 1,E2R Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-REE R-act1 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 80 low PMID:41236477 4896 2025-11-25 There was no obvious difference in the viability of REEact1 and MEEEact1 strains in spot assays (Fig. 4 A). To test if there were any size differences between the strains, we analyzed septated cells. The REEact1 cells were shorter and wider with lower volumes and surface area (Fig. 4 C). PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0005335 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000104 PMID:26804466 4896 2016-03-04 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000710 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19417002 4896 2016-01-13 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001931 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0005206 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000126,FYECO:0000220,FYECO:0000300 PMID:24047646 4896 2018-05-29 (Fig. 6) shows wee1-50 cells at restrictive temperature have lost G2-M size control PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000141 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228,FYECO:0000307 64.9 PMID:26869222 4896 2016-09-08 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000502 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:1464318 4896 2013-01-30 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0004701 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000219,FYECO:0000229,FYECO:0000232 PMID:689088 4896 2015-07-07 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000835 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8799851 4896 2018-10-16 Data not shown cdc13 protein level in asynchronous culture of wee1-50 cells at restrictive temperature is reduced by 40% compared to asynchronous culture of WT cells PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003268 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006846 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:1165770 4896 2019-02-27 (Table 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006848 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:1165770 4896 2019-02-27 (Table 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006031 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000346 PMID:872890 4896 2019-05-30 Table 1, Fig1 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006031 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000346 high PMID:1165770 4896 2019-02-27 (Figure 3) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006834 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29813053 4896 2019-03-05 (Fig. 3) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002020 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000825 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000650 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1549179 4896 2013-01-30 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006909 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000346 PMID:872890 4896 2019-04-25 Table 1, DNA replication initiated at low protein content PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000333 G850E Not assayed or wild type 972 h- leu1-32, his7-366, pJL(his7+ adh-tk (herpes simplex thymidine kinase), pFS181(leu1+ adh1-hENT1(human nucleoside transporter)) wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:19487461 4896 2018-06-09 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000333 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:21118960 4896 2014-04-30 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001929 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001929 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0004646 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:2186047 4896 2015-05-11 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0004310 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006905 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000294,FYECO:0000346 PMID:872890 4896 2019-05-10 (Fig. 2) This suggests that wee1-50 only has an indirect effect on the G1-S transition because when wee1-50 is shifted to the permissive temperature cells are still small, this is not affected by the presence of active wee1 and cells enter S-phase at the same size as they did at the restrictive temperature PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006907 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:872890 4896 2019-04-25 (Fig. 6, Table 2) cell size measure by protein content per cell, cells need to reach ~7pg/cell. This measurement is also the same for wild type cells which are small after nitrogen starvation (Fig5) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006908 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:872890 4896 2019-05-10 (Fig. 4, Table 2) cell size measure by protein content per cell, cells need to reach ~7pg/cell. This measurement is also the same for wild type cells which are small after spore germination (Fig3) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006906 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000126,FYECO:0000294,FYECO:0000346 PMID:872890 4896 2019-05-10 (Fig. 2) This shows that wee1-50 has a direct effect on the G2-M transition because cells now at the permissive temperature (active wee1) detect that they are too small to enter mitosis and the G2/M transition is inhibited PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001513 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:18077559 4896 2018-03-01 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003750 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 2B) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003750 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 2B) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001221 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17998401 4896 2012-07-16 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006021 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002559 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002558 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000776 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:1703321 4896 2016-10-04 (Figure 4D) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000776 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:3058333 4896 2013-02-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003530 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:15297457 4896 2014-09-11 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.01) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1002.19) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.01) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.08c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007671 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC887.04c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001124 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1464319 4896 2013-02-19 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002516 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 3C) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002516 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:1165770 4896 2019-02-27 Table 1, Figure 2 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002516 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006832 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 2) The start of septation scales with anaphase B progression and cell size in fission yeast and correlates linearly with the cell length. PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006758 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8799851 4896 2018-10-16 Uses elutriation synchrony. Fig5 cdc13 protein level in synchronous culture of wee1-50 cells at restrictive temperature is absent during longer G1 phase PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000267 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1549179 4896 2013-01-30 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000089 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 low PMID:15297457 4896 2014-09-11 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000365 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000228 100 PMID:26869222 4896 2016-09-12 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003241 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 7 PMID:38166399 4896 2024-01-11 s shown in Figure 5, the wee1 mutants with no functional spindle checkpoint indeed failed in accurate chromosome segregation and generated two sister cells with unequal nuclear size. PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003241 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 9 PMID:38166399 4896 2024-01-11 s shown in Figure 5, the wee1 mutants with no functional spindle checkpoint indeed failed in accurate chromosome segregation and generated two sister cells with unequal nuclear size. PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000648 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:1703321 4896 2016-10-04 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000219,FYECO:0000229,FYECO:0000232 PMID:689088 4896 2015-07-07 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:672898 4896 2013-07-16 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1464319 4896 2013-02-19 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 high PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Table 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:1756736 4896 2013-02-15 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000263 PMID:17952063 4896 2016-01-14 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- leu1-32, his7-366, pJL(his7+ adh-tk (herpes simplex thymidine kinase), pFS181(leu1+ adh1-hENT1(human nucleoside transporter)) wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19487461 4896 2018-05-14 (Fig. 1A) BrdU incorporation wee1-50 strain analysed at 32°C PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:1165770 4896 2019-02-27 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:1165770 4896 2019-02-27 (Table 1) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:1464318 4896 2013-01-29 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 high high PMID:9843572 4896 2017-04-19 (Figure 8) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:3442828 4896 2015-06-16 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:3442828 4896 2015-06-16 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002060 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:2406029 4896 2014-09-19 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002060 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002060 G850E Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-50 cdc9-50|wee1.50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000674 L2045G Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPAC1783.03 FYPO:0008202 S2D,S7D,S10D,S15D,S16D,S17D,S18D,S21D,S23D Not assayed or wild type 972 h- fta2 fta2-9D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 low low PMID:39016088 4896 2024-09-26 Fig 3C. PomBase SPAC1783.03 FYPO:0000964 S2D,S7D,S10D,S15D,S16D,S17D,S18D,S21D,S23D Not assayed or wild type 972 h- fta2 fta2-9D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:39016088 4896 2024-10-05 (Fig. 2) PomBase SPBC16C6.03c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph rsa1 rsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.03c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph rsa1 rsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.03c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rsa1 rsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.03c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rsa1 rsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.03c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rsa1 rsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 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prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0007478 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004578 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000112 PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0005368 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000470 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 high PMID:21211723 4896 2024-01-17 Defective mating-type switching in heterochromatin mutants results in poor iodine staining of colonies, in contrast to the dark staining of wild-type colonies (Jia et al., 2004). asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F). PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0005433 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000049 PMID:30373637 4896 2020-02-06 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0000186) PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0001901) PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0001898) PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1783.06c) PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004491 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001324 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.03) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001324 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.14c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S7E) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003557 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003557 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:26582768 4896 2016-01-20 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003557 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:26582768 4896 2016-01-20 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0007339 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000231 low PMID:21211723 4896 2024-01-17 Consistent with both TGS and cis-PTGS contributing to heterochromatin silencing, combining asf1-1 or hip1Δ with tas3Δ resulted in synergistic defects in heterochromatic silencing (Figure 3A). PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000231 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004347 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Based on the genetic analyses, it was possible that Asf1/HIRA facilitate histone deacetylation by Clr6. Asf1 co-immunoprecipitated with Clr6 complex subunits Alp13 and Clr6 (Figure 3B). Moreover, asf1-1 and hip1Δ exhibited a substantial increase in bulk H3K9ac levels, in a manner similar to alp13Δ (Figure 3C).). To confirm this further, we performed ChIP-chip analyses of H3K9ac. Both alp13Δ and asf1-1 mutants showed widespread increase in H3K9ac, as compared to the wild-type cells. Notably, although 30% of the probes in our microarray correspond to intergenic regions, nearly all probes affected by asf1-1 and alp13Δ reside in coding regions (Figure 3D and 3E). PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006414 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1834.03c) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006414 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.03c) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006414 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1105.12) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006414 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006414 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006414 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004342 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004342 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004342 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0004342 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0005917 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Moreover, asf1-1 and hip1Δ showed upregulation of sense and antisense transcripts corresponding to subtelomeric genes located within heterochromatic domains (Figure S5A). PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0005917 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003105 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003105 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 high assayed_transcript(SO:0002208) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 5F) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000228 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0001232 9 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hip1 hip1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hip1 hip1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001164 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001164 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0003235 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Whereas asf1-1 cells showed slight reduction in levels of H3K9me, Swi6 and Chp2, the levels of these factors in hip1Δ appeared comparable to wild type (Figure 2A and 2B). PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001317 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC23E2.01) PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001317 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.03) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0005253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hip1 hip1delta deletion 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prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0005750 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S7G) PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002239 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0000337 low PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18077559 4896 2011-09-02 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001492 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0001232 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001492 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0001232 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hip1 hip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- hip1 hip1delta deletion ECO:0001232 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2020-09-01 (Figure 8A). Arp2-E316K mutant protein had a reduced affinity for ATP compared with wild type Arp2p PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0001324 E316K Not assayed or wild type 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 8B & C) These results clearly establish that the mutant Arp2-E316K protein turns over more rapidly than wild-type Arp2 protein PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0004967 E316K Not assayed or wild type 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000112,FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-09 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0007579 E316K Not assayed or wild type 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15517003 4896 2020-12-30 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0000383 deletion 972 h- hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0000049 PMID:26624998 4896 2016-01-28 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0002616 deletion 972 h- hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hsp3102 hsp3102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC18.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC18.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.03 SPCC18.03delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002033 331-775 Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-1-330(deltaC-KA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-02 (Fig. 1C) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000703 331-775 Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-1-330(deltaC-KA1) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-03 (Fig. 2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002561 1-800 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(801-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 1-800 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(801-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001424 1-800 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(801-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-800 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(801-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 81 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 1-800 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(801-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 66 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPAC1687.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- rce1 rce1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rce1 rce1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.02 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rce1 rce1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0003555 I162R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-I162R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 I162R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-I162R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0000705 1-479 Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-480-699 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0000703 1-479 Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-480-699 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPBC146.03c FYPO:0004422 1-279 Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:25520186 4896 2015-07-29 PomBase SPAC4F8.10c FYPO:0000032 wild type Overexpression 972 h- stg1 stg1+ wild_type ECO:0001232 PMID:16256112 4896 2014-08-18 PomBase SPAC4F8.10c FYPO:0003001 wild type Overexpression 972 h- stg1 stg1+ wild_type ECO:0001232 PMID:16256112 4896 2014-08-18 PomBase SPAC4F8.10c FYPO:0002051 wild type Overexpression 972 h- stg1 stg1+ wild_type ECO:0001232 PMID:16256112 4896 2014-08-18 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001382 L312D Not assayed or wild type 972 h- ssp2 ssp2-L312D amino_acid_mutation ECO:0005801 low assayed_enzyme(PomBase:SPCC74.03c) PMID:19474788 4896 2023-02-15 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 K383R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K383R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 K383R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K383R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 K383R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K383R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 K383R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K383R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0006503 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PR:000036979) PMID:29453312 4896 2018-04-19 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0006503 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.10c) PMID:29453312 4896 2018-04-19 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0006503 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.13) PMID:29453312 4896 2018-04-19 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0005791 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 PMID:23200991 4896 2016-11-15 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0006505 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PR:000036979) PMID:29453312 4896 2018-04-19 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0007563 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000137 PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 high PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 PMID:23200991 4896 2016-11-15 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0003770 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0000049 PMID:19285552 4896 2015-04-16 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000587 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0002020 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000825 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0004581 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0000291 PMID:10417652 4896 2014-07-21 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0004581 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0000049 PMID:12172965 4896 2017-07-12 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0004796 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0001357 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 PMID:10417652 4896 2011-10-24 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0004795 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0001112 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005580 PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000280 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0005638 PMID:10417652 4896 2012-02-17 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- rgs1 rgs1delta deletion ECO:0001232 PMID:11554925 4896 2018-07-13 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000963 C216S,R188E Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C216S,R188E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35011726 4896 2022-10-17 Interestingly, the addition of nse1- C216S mutation suppressed the R188E phenotypes (Figure 3A), suggesting that it leads to a ubiquitin-ligase-independent outcome. PomBase SPCC550.05 FYPO:0000957 C216S,R188E Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C216S,R188E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35011726 4896 2022-10-17 Interestingly, the addition of nse1- C216S mutation suppressed the R188E phenotypes (Figure 3A), suggesting that it leads to a ubiquitin-ligase-independent outcome. PomBase SPBC14F5.09c FYPO:0002243 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade8 ade8-106 unknown ECO:0000335 FYECO:0000021 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:1394510 4896 2014-04-01 PomBase SPBC14F5.09c FYPO:0000741 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade8 ade8-106 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000178,FYECO:0000192 is_bearer_of(PATO:0001262) PMID:499806 4896 2016-06-30 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0009060 deletion 972 h- thi2 thi2delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 thi2 thi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- thi2 thi2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thi2 thi2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thi2 thi2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000731 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.20) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003389 cdr2(1-774)-GSlinker-GFP-(PGAGAGAGS)-tea4(1-521) Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 cdr2-tea4N cdr2-GFP-tea4N,cdr2-CFP-tea4N,cdr2-mCherry-tea4N|tea4N-cdr2 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 55 PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPCC757.03c FYPO:0003407 wild type Overexpression 972 h- hsp3101 hsp3101+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPCC757.03c FYPO:0003406 wild type Overexpression 972 h- hsp3101 hsp3101+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPBC1773.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph omh4 omh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph omh4 omh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph omh4 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We interpret the data as indicating that F-actin is first correctly localized to the tip in all fus1 mutants, but is then redistributed after a defective attempt to fuse. Thus, it is likely that Fus1 is required for the correct organization and stabilization of polarized F-actin at the tip, but is no PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000573 ura4+@AA270 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:9606213 4896 2021-02-04 (Fig. 1) PomBase SPCC757.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph dug2 dug2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- dug2 dug2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC757.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dug2 dug2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dug2 dug2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC5E4.03c FYPO:0001489 614-643 Not assayed or wild type 972 h- taf5 taf5delta614-643 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9224658 4896 2014-09-11 PomBase SPBC1289.01c FYPO:0000190 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high PMID:22905165 4896 2020-02-21 PomBase SPBC1289.01c FYPO:0000032 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high PMID:22905165 4896 2020-02-21 PomBase SPBC1289.01c FYPO:0001401 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:22905165 4896 2020-02-21 (Fig. S1) PomBase SPBC1289.01c FYPO:0001401 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:22905165 4896 2020-02-21 (Fig. S1) PomBase SPBC1289.01c FYPO:0001401 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:22905165 4896 2020-02-21 (Fig. S1) PomBase SPBC1289.01c FYPO:0001401 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:22905165 4896 2020-02-21 (Fig. S1) PomBase SPBC1289.01c FYPO:0006220 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC14C4.09) PMID:22905165 4896 2020-02-21 PomBase SPBC1289.01c FYPO:0002869 wild type Overexpression 972 h- chr4 cfh3+ wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:22905165 4896 2020-02-26 (Figure S2) PomBase SPAC30D11.12 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rpl3802 rpl3802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.12 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rpl3802 rpl3802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.12 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rpl3802 rpl3802delta deletion ECO:0005638 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We found that Duc1-mNG was excluded from the cell division site in all four strains, as in wild-type cells (Fig. S2A). PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0000089 deletion 972 h- hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0000089 deletion 972 h- hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph hob2 hob2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- hob2 hob2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob2 hob2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob2 hob2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.09c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob2 hob2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.14 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC144.14 FYPO:0005706 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-11 Table 2 Figures 5a-d and S2) PomBase SPAC144.14 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp8 klp8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC144.14 FYPO:0003717 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Figure S1a) PomBase SPAC144.14 FYPO:0004097 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Figure S1a) PomBase SPAC144.14 FYPO:0004652 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Figure S1a) PomBase SPAC144.14 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp8 klp8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC144.14 FYPO:0003702 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Figure S1a) PomBase SPAC144.14 FYPO:0006259 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPAC144.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph klp8 klp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC144.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Figure S1a) PomBase SPAC144.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp8 klp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0008455 deletion 972 h- tcb1 tcb1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000025,FYECO:0000150,FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 In contrast, both tcb1Δ and tcb3Δ single mutants showed compromised PM expansion similar to tcb1Δtcb3Δ double mutant under acute hypoosmotic shock (Fig. 3B), implying that they may function together. PomBase SPCC962.01 FYPO:0008198 deletion 972 h- tcb1 tcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000025,FYECO:0000150,FYECO:0000466 assayed_protein(PomBase:SPAPYUK71.03c) PMID:40629316 4896 2025-09-01 Interestingly, the accumulation of Tcb1 and Tcb3 at ER-PM contacts is mutually depend- ent: Tcb3 delocalized to the perinuclear ER in tcb1Δ, while Tcb1 levels in the cortical ER decreased in tcb3Δ. Their localization remained unchanged in tcb2Δ (Fig. 3C and Additional file 1: Fig. S3A). PomBase SPCC962.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0001408 deletion 972 h- tcb1 tcb1delta deletion ECO:0001232 PMID:40629316 4896 2025-08-31 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0002077 deletion 972 h- tcb1 tcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-08-31 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph tcb1 tcb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC962.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- tcb1 tcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC962.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tcb1 tcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tcb1 tcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-96 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-96 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M72 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9201720 4896 2018-06-09 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M72 unknown ECO:0006030 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c),assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:9201720 4896 2018-06-09 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pxa1 pxa1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000339 deletion 972 h- pxa1 pxa1delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. S2E) PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.07c FYPO:0003612 deletion 972 h- pxa1 pxa1delta deletion ECO:0005638 PMID:15189449 4896 2015-02-27 PomBase SPAC5D6.07c 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2016-01-21 PomBase SPBC16H5.13 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wdr7 wdr7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC16H5.13 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph wdr7 wdr7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.13 FYPO:0007928 deletion 972 h- wdr7 wdr7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16H5.13 FYPO:0000087 deletion 972 h- wdr7 wdr7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16H5.13 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph wdr7 wdr7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- wdr7 wdr7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 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PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0005947 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 3B) PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0001317 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1A6.04c) PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 4A) PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0001357 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 1A) PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0001190 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 7B) PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0000087 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38424265 4896 2024-05-20 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0000087 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000078,FYECO:0000137 medium PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 3C) PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0000841 F92I Not assayed or wild type 972 h- plb1 plb1-98 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 medium PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 7A) PomBase SPCC285.11 FYPO:0001245 477-1422 Not assayed or wild type 972 h- dsc5 dsc5-K97-T411delete partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001690 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007074 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000091 F70L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-F69L amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000705 D7A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-D7A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 D7A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-D7A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 D7A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-D7A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 D7A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-D7A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0003013 disruption Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2::ura4 disruption ECO:0005638 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mad3 mad3-ABBA1mut amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 high PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Fig. 1B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0000708 I2229T Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-I2229T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17360675 4896 2016-01-18 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 P247A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-P247A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 P247A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-P247A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0009061 M460A Not assayed or wild type 972 h- shk1 shk1-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36749320 4896 2023-03-14 (Figure 5A) PomBase SPBC1734.14c FYPO:0002724 disruption Not assayed or wild type 972 h- suc1 suc1::leu disruption ECO:0001232 PMID:3031478 4896 2013-11-01 PomBase SPBC1734.14c FYPO:0001991 disruption Not assayed or wild type 972 h- suc1 suc1::leu disruption ECO:0001232 PMID:3031478 4896 2013-09-24 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swd3 swd3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd3 swd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.03 FYPO:0002917 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPBC354.03 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0002834 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPBC354.03 FYPO:0001324 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001324 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPBC354.03 FYPO:0001324 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 loss of most members of the COMPASS complex, including Set1, Spp1, Swd1, Swd3, Swd2, and Ash2 leads to a significantly decreased amount of Lsd1 protein (Fig 3A) PomBase SPBC354.03 FYPO:0001324 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 A similar pattern was observed in the Lsd2 samples, although the Lsd2 protein levels also decreased with shg1Δ (Fig 3B). PomBase SPBC354.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC354.03 FYPO:0004689 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPBC354.03 FYPO:0005917 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPBC354.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swd3 swd3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC354.03 FYPO:0008252 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000231 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPBC354.03 FYPO:0001317 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPBC354.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC354.03 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swd3 swd3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC354.03 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swd3 swd3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0003384 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swd3 swd3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph swd3 swd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.03 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd3 swd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- swd3 swd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC354.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd3 swd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001228 wild type Overexpression 972 h- wis1 wis1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC409.07c FYPO:0005041 wild type Overexpression 972 h- wis1 wis1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:22144909 4896 2015-11-04 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- wis1 wis1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- wis1 wis1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:8649397 4896 2013-06-04 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP wis1 wis1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- wis1 wis1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9321395 4896 2019-10-26 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002061 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2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000080 R569C,E658G,L807S Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 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2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt2 spt2delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt2 spt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002061 340-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4delta340-383 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-19 The deletion mutants D340 to 383 and D364 to 383, but not D340 to 363, showed growth defect in the lem2-shut-off bqt4D strain (Fig. 1E) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 340-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4delta340-383 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:38825008 4896 2025-04-24 All these fragments as well as wild-type Bqt4 (FL) were localized to the NE (Fig. 1C), suggesting that the lethality was not caused by the loss of NE localization. PomBase SPAC664.07c FYPO:0002098 S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002098 S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T328) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001838 S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S423A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000089 S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S423A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC19B12.02c FYPO:0001309 G287S Knockdown 972 h- gas1 gas1-287 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:31601154 4896 2019-11-22 PomBase SPAC19B12.02c FYPO:0001190 G287S Knockdown 972 h- gas1 gas1-287 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:31601154 4896 2019-11-23 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 R16A Overexpression 972 h- cnp1 cnp1-R16A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Figure S1A and B) PomBase SPBC25B2.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph hbs1 hbs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.01 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph hbs1 hbs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hbs1 hbs1delta deletion ECO:0005638 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prototroph SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.08c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC16H5.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16H5.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.08c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC16H5.08c SPBC16H5.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003835 wild type Knockdown 972 h- cdc25 cdc25+ pADH:cdc25.5 wild_type ECO:0001232 PMID:25492408 4896 2015-10-16 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001045 H169A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-H169A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 6B) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 H169A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-H169A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S2) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 H169A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-H169A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC16C4.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S2) PomBase SPAP7G5.04c FYPO:0000039 unknown 972 h- lys1 lys1-131 unknown ECO:0005638 PMID:16491385 4896 2012-04-24 PomBase SPCC594.01 FYPO:0000782 Y374A,F375A Not assayed or wild type 972 h- duc1 duc1-Y374A,F375A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC594.01) PMID:39239853 4896 2024-09-08 As anticipated if these mutations successfully disrupted Duc1 association with Scs2 and Scs22, Duc1-Y374A,F375A-mNG localized at the division site (Fig. 4H). PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0002023 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0005853 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0000134 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001117 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPBC14C8.17c) PMID:19473263 4896 2018-05-01 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001117 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPAPJ760.03c) PMID:19473263 4896 2018-05-01 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001117 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:19473263 4896 2018-05-01 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0000581 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001355 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0003717 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0000962 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0000961 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0006213 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0004263 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0002047 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001408 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0006836 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001214 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0005889 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001234 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0000280 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0003500 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19473263 4896 2018-05-01 PomBase SPBC14C8.17c FYPO:0001496 1067 Not assayed or wild type 972 h- spt8 sep9-307 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19473263 4896 2018-05-01 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001118 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 69 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001382 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 high assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001645 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0000112 variable severity assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0002150 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005373 HD134LV Knockdown 972 h- cdc10-M17 mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000211,FYECO:0000291 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000088 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000267 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000089 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001234 HD134LV Knockdown 972 h- mre11 mre11-H134L,D135V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002050 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 3b) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001082 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 3d) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001949 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0000049 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001460 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0000049 FYECO:0000261 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 PMID:37723847 4896 2023-10-15 In accordance with previous observation, the colony did not form under the inducible condition of pkd2+ overexpression (Figure 1b). PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001190 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 3c) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000647 wild type Overexpression 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 3b) PomBase SPCC830.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- grc3 grc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC830.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grc3 grc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC830.03 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grc3 grc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.02 FYPO:0003412 cwf11::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 cwf11 cwf11::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 D488R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D488R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 D488R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D488R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 D488R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D488R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001933 240-242 Not assayed or wild type 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL50 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000170 high PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002033 CTD-S5A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002280 CTD-S5A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001991 CTD-S5A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000581 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec12 rec12-delta171 unknown ECO:0005638 PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000510 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:35512546 4896 2023-02-17 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002926 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:7520368 4896 2014-05-07 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002044 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:7520368 4896 2014-01-23 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0007146 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:9778252 4896 2019-11-07 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000583 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:7520368 4896 2014-05-07 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000583 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:9062192 4896 2015-01-12 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0001571 F644A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-F644A mei2-FA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:11818066 4896 2021-01-11 PomBase SPNCRNA.784 FYPO:0000725 deletion 972 h- SPNCRNA.784 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prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- adn2 adn2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 adn2 adn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1289.10c FYPO:0000946 deletion 972 h- h+ 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of Bqt4 were detected in bqt3Δ cells and were enriched in both bqt3+ and bqt3Δ cells when proteasomal activity was inhibited (Fig. 1E), suggesting that Bqt4 was targeted to the proteasome by polyubiquitin modification. PomBase SPCC594.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- bqt3 bqt3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 GFP-Bqt4 fluorescence in the nuclei of both bqt3+ and bqt3Δ cells was elevated (Fig. 1A) PomBase SPCC594.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- bqt3 bqt3delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 To confirm this result, we measured protein levels by western blotting, which consistently showed an increase in GFP-Bqt4 protein levels in these strains upon proteasomal inhibition by BZ Fig. 1B PomBase SPCC594.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bqt3 bqt3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC594.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bqt3 bqt3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC594.07c FYPO:0001420 deletion 972 h- bqt3 bqt3delta deletion ECO:0005638 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h- cdr2 cdr2-K39R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24508166 4896 2015-02-23 PomBase SPBC26H8.08c FYPO:0001355 276-283 Not assayed or wild type 972 h- grn1 grn1-deltaG1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:16251348 4896 2017-09-14 PomBase SPBC26H8.08c FYPO:0006217 276-283 Not assayed or wild type 972 h- grn1 grn1-deltaG1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16251348 4896 2017-09-14 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0002386 A112D,R113D Not assayed or wild type 972 h- php5 php5-A112D,R113D amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC3B8.02) PMID:39747188 4896 2025-06-23 Remarkably, we observed that in both mutants, the binding of PhpC subunits Php3 and Php5 at cenH and dh heterochromatic repeats was drastically reduced (Fig. 4e–g, Supplementary Fig. 5b),....... Indeed, site- specific ChIP-qPCR analysis revealed a ~ 90% reduction in Php3 and a ~ 80% reduction in Php5 in HFD mutants compared to WT (Fig. 4g, Supplementary Fig. 5b). PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000838 A112D,R113D Not assayed or wild type 972 h- php5 php5-A112D,R113D amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC3B8.02) PMID:39747188 4896 2025-06-23 while the nuclear localization of both TFs was preserved (Fig. 4h, Supplementary Fig. 5c) PomBase SPAC9.10 FYPO:0003646 E81K Not assayed or wild type 972 h- thi9 ptr1-E81K ptr1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18201975 4896 2014-08-05 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0004254 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000059 PMID:17369398 4896 2015-11-05 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0005179 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:28771613 4896 2018-02-14 The preRC- loading delay was abolished in the irradiated gcn1Δ cells (Fig 3C) PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0006474 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 PMID:29432178 4896 2018-03-12 Ribosome profiling and matching RNA-seq in gcn2Δ cells treated or untreated with 3-AT revealed that the majority of the translationally induced genes did not respond to amino acid starvation (Fig. 2B) PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0005043 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000059 PMID:17369398 4896 2015-11-13 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0006444 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 PMID:29432178 4896 2018-03-12 the expression of most genes induced by amino acid starvation in wild-type cells was not up-regulated, confirming that Gcn2 is the major mediator of this response PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0007803 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000126 PMID:33534698 4896 2021-06-28 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0007803 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:33534698 4896 2021-07-09 Moreover, the autophagy defect of the gcn2D mutant was complemented by TORC1 inactivation by the TORC1 inhibitors, rapamycin and caffeine (Figure 5B). PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002898 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:28771613 4896 2018-02-14 (Figure 1E) PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0006232 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:28771613 4896 2018-02-09 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0006398 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:33534698 4896 2021-07-09 In contrast, Psk1 remained phosphorylated even after the starvation in the gcn2D, eIF2a-S52A, and fil1D mutant strains (Figure 5A), suggesting that TORC1 inactivation in leucine-starved cells is mediated by the Gcn2-eIF2a-Fil1 pathway. PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0006398 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:28771613 4896 2018-02-14 (Figure 2B) PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002033 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002446 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:19033384 4896 2013-12-10 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002993 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:19033384 4896 2013-12-10 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0004228 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:26493332 4896 2016-01-19 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0004228 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:17369398 4896 2015-11-05 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC418.01c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC56E4.03) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPCC364.07) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.13c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.10) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC1002.09c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC227.18) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.16c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.04) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0000712 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:23687372 4896 2014-02-24 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcn2 gcn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcn2 gcn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0006294 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000337 PMID:33534698 4896 2021-06-28 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002996 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005580 PMID:19033384 4896 2013-12-10 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002997 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005580 PMID:19033384 4896 2013-12-10 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0005214 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000059 PMID:26493332 4896 2016-01-19 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0005230 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0000059 PMID:26493332 4896 2016-01-19 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002991 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0001232 PMID:19033384 4896 2013-12-10 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001097 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000251 PMID:32841241 4896 2020-12-21 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001214 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0000091 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0003491 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0005638 PMID:17369398 4896 2015-11-05 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001492 deletion 972 h- gcn2 gcn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:17952063 4896 2016-01-14 PomBase SPCC320.03 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rgt1 rgt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC320.03 FYPO:0000470 deletion 972 h- rgt1 rgt1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPCC320.03 FYPO:0009007 deletion 972 h- rgt1 rgt1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC320.03 FYPO:0003938 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PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K156Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K156Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K156Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K156Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000705 1-110,260-534 Not assayed or wild type 972 h- gpl1 gpl1(M)111-259 gpl1(M): 111–259 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC713.05) PMID:36361590 4896 2022-11-28 (Figure 3) PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001696 F117A Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as2 orb5.as2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 medium PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 2B) orb5.as2 displayed moderate sensitivity to 30 mM of 3BrB-PP1, whereas orb5.as1 showed none PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001696 F117A Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as2 orb5.as2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000223 medium PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 2B) orb5.as2 displayed moderate sensitivity to 30 mM of 3BrB-PP1, whereas orb5.as1 showed none PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0003412 kin1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 kin1 kin1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0002159 A202T Not assayed or wild type 972 h- cwg2 cwg2-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000025,FYECO:0000261 PMID:8262067 4896 2015-05-11 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0004641 A202T Not assayed or wild type 972 h- cwg2 cwg2-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:8262067 4896 2015-05-11 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0001081 A202T Not assayed or wild type 972 h- cwg2 cwg2-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:1828464 4896 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972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.11c) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 6) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001131 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003066 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 29 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007334 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 PMID:11242054 4896 2024-01-28 loss of association of Swi6 with centromeres should result in expression of a normally silent marker gene embedded in centromeric chromatin. Figure 4e shows that this is indeed the case. On indicator plates, wild-type strains silence the centromeric ade6+ marker, which results in red, repressed colonies13; however, in strains lacking Clr4 (D) or strains defective in Clr4 methylase activity (G341D), this ade6+ gene is clearly expressed, resulting in the formation of white colonies. PomBase SPBC428.08c FYPO:0004170 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 PMID:26582768 4896 2016-01-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005554 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005554 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004745 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004745 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 7D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004745 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004136 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:23771057 4896 2013-11-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004136 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004136 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:25245948 4896 2014-12-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003097 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 (Fig. 3A and fig. S3). PomBase SPBC428.08c FYPO:0003097 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008212 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006813 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005843 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004312 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 4A and B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000634 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003744 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 Moreover, the nuclear dot localization of EGFP-Ers1WT was completely abolished in clr4Δ cells (Fig. 4C), indicating that the activity of Clr4 was also required for Ers1 localization in the nucleus. PomBase SPBC428.08c FYPO:0008153 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 6B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 7B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 7A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC830.03) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1393.06c) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.08c) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.12c) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001132 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.18) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003074 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003074 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 1B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003074 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC110.02) PMID:31278118 4896 2020-04-30 (Fig. 5B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003074 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003109 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:27451393 4896 2018-01-30 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000705 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Table 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000705 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09),assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0008011 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002835 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002835 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002835 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:20299449 4896 2024-07-19 (Fig. 1E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004201 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 3A and B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006684 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002834 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 (Figure 2,4) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002834 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 high PMID:19136623 4896 2024-07-02 The extent of the silencing defects in ckb1D cells was comparable with that caused by disruption of other heterochromatic genes, including clr4, a histone H3K9-specific histone methyltransferase; clr3, a histone deacetylase and a subunit of SHREC; and swi6, a HP1 homolog (Fig. 1B). PomBase SPBC428.08c FYPO:0003411 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006993 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 high PMID:28682306 4896 2025-10-23 Similar to ∆ clr4 cells, clr4F449Y cells displayed increased growth on plateslacking uracil and grew poorly on FOA plates (Fig. 1e, left) indicatinga loss of otr1R::ura4+ silencing. (Fig. 1f, g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 high PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 1B,C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 high PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 PMID:25774602 4896 2015-07-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:15947136 4896 2013-07-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 high PMID:38285941 4896 2024-04-08 (Fig. S1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000021,FYECO:0000286 PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 low assayed_using(PomBase:SPMTR.01) PMID:29632066 4896 2018-11-11 (Fig. S1B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004604 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004604 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003352 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003101 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.04) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003101 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003101 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007009 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 4) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002609 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002611 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5 and Fig. S5) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:28231281 4896 2017-04-11 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007213 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006269 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007642 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002355 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003096 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003096 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:15372076 4896 2024-01-23 Interestingly, we found that, although deletion of either swi6 þ or chp2 þ did not affect the H3-K9 methylation at MAT (K-R) and TEL (E12) in the Dchp1 background, the methylation level in these regions was severely decreased in the triple-mutant strain (Figure 5D, Dchp1Dchp2Dswi6). Again, these results demonstrate that Swi6 and Chp2 are required for the maintenance of H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions, and also indicate that Swi6 and Chp2 have overlapping functions in the maintenance of H3-K9 methylation. PomBase SPBC428.08c FYPO:0003096 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions (CEN- dg223, MAT-K-R, or TEL-E12) was reduced to a level comparable to that in Dclr4 (Figure 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003096 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003571 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003571 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions (CEN- dg223, MAT-K-R, or TEL-E12) was reduced to a level comparable to that in Dclr4 (Figure 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003572 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003572 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions (CEN- dg223, MAT-K-R, or TEL-E12) was reduced to a level comparable to that in Dclr4 (Figure 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000890 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000890 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005845 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000470 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 high PMID:21211723 4896 2024-01-17 Defective mating-type switching in heterochromatin mutants results in poor iodine staining of colonies, in contrast to the dark staining of wild-type colonies (Jia et al., 2004). asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F). PomBase SPBC428.08c FYPO:0000470 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005931 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004313 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30089114 4896 2021-07-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000450 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.05c) PMID:20661445 4896 2013-08-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000450 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000450 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002842 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006599 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006599 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006599 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006599 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.12c) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006599 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.18) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006631 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:37400983 4896 2023-09-08 As previously reported, in wild-type cells, Swi6 was present in both the soluble (S) and chromatin-enriched pellet (P) fractions, with approximately 40% of the total Swi6 protein detected in the pellet fraction, and most of the Swi6 in the pellet fraction was redistributed to the soluble fraction in clr4∆ cells (Fig. 1A). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002391 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:27451393 4896 2018-01-30 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002391 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:40132111 4896 2025-08-13 (Fig. 3E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002474 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC637.12c) PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.12c) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.18) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 ChIP analyses showed that Ers1 localization at the mating type locus (cenH) and telomeres was severely decreased in swi6Δ and clr4Δ cells (Fig. S5A). PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.04c) PMID:33693625 4896 2021-05-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005918 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005918 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005918 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 (Figure 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005918 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 ChIP analyses showed that Ers1 localization at the mating type locus (cenH) and telomeres was severely decreased in swi6Δ and clr4Δ cells (Fig. S5A). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002387 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002387 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.05c) PMID:20661445 4896 2013-08-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001645 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001645 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.04) PMID:21436456 4896 2024-01-15 This interaction was not sensitive to DNase I and RNase A treatment but was severely compromised upon loss of Clr4 (Fig. 1C), suggesting that Clr4 connects Mlo3 to RNA interference (RNAi). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002624 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002624 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.05c) PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008369 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 4C and D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004205 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000337 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000581 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 medium PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007322 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 5D, 5E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002649 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:17627824 4896 2015-02-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002019 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000337 low PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003045 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:24013502 4896 2013-12-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003557 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19693008 4896 2024-01-15 When Dpht1 was combined with mutant alleles of clr4 or rik1—components of the Clr4-containing methyltransferase complex (ClrC)7—the resultant double mutants showed severe growth defects and a large, synergistic increase in antisense RNAs at .20% of genes (Fig. 2a and Supplementary Figs 5 and 7a, b). Consistent with ClrC directly participating in antisense suppression, Rik1 was found at the convergent loci (Supplementary Fig. 7c). PomBase SPBC428.08c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004689 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004689 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:39747188 4896 2025-06-23 As expected, we observed increased cenH transcript levels in clr4Δ26 (Fig. 5a, b and Supplementary Fig. 6a, b). Interestingly, the lack of PhpC significantly decreased cenH transcript levels in clr4Δ (Fig. 5a, b). PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 high PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 medium PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Fig. 7A, 7B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 low PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Fig. 7C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 high PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 high PMID:16762840 4896 2024-01-17 Indeed, in a situation wherein heterochromatin has been completely abolished, such as in a Dclr4 background, loss of Epe1 had no detectable effect on transcript levels (Figure 5D). PomBase SPBC428.08c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004761 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006815 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000966 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000966 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000966 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002331 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002369 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000893 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000893 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:25002536 4896 2015-01-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000893 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006681 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006814 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006814 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007468 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000127 assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 2A, 2B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0010014 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 PMID:28682306 4896 2025-10-23 We also detected high levels of H3K9me1 in both clr4+ and ∆clr4 cells (Extended Data Fig. 6b) PomBase SPBC428.08c FYPO:0007310 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007311 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005535 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007308 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007309 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001742 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000337 PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002354 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002664 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000006 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001840 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007227 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 medium PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Fig. 7D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003152 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Protein levels of Lsd1 and Lsd2 are similar between wild-type and clr4Δ cells at 37 ̊C, indicating that Clr4 is not responsible for Lsd1/2 upregulation in this condition (Fig 4C and 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001327 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 that without Clr4, both Lsd1-FTP and Lsd2-FTP show an increase in protein levels, compared to the wild-type cells (Fig 2I). PomBase SPBC428.08c FYPO:0001327 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 that without Clr4, both Lsd1-FTP and Lsd2-FTP show an increase in protein levels, compared to the wild-type cells (Fig 2I). PomBase SPBC428.08c FYPO:0001327 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Fig 5A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005893 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 To our surprise, clr4Δ increases the enrichments of Lsd1/2 while set1Δ decreases the enrichments of Lsd1 at its enriched genomic loci (Figs 2G, 2H, S6 and S7). PomBase SPBC428.08c FYPO:0005893 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-07 To our surprise, clr4Δ increases the enrichments of Lsd1/2 while set1Δ decreases the enrichments of Lsd1 at its enriched genomic loci (Figs 2G, 2H, S6 and S7). PomBase SPBC428.08c FYPO:0004237 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.10) PMID:31269446 4896 2025-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004237 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2025-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004237 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:30652128 4896 2025-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004237 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 1F) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004377 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.10) PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004377 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:39747188 4896 2025-06-23 RNAPII occu- pancy increased at cenH in clr4Δ (Fig. 5e, f and Supplementary Fig. 6c). Removal of PhpC or Moc3, or the introduction of CCAATmut mutation in clr4Δ cells, resulted in a considerable reduction in RNAPII levels at cenH (Fig. 5e, f). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002541 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001130 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000181 assayed_protein(PomBase:SPAC12G12.07c) PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 6D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001130 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000181 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.04c) PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 6C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004380 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:16762840 4896 2024-01-17 Deletion of clr3 results in a dramatic increase in Pol II occupancy at cenH element within silent mat domain. PomBase SPBC428.08c FYPO:0002082 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30089114 4896 2021-07-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005523 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0006030 high PMID:21436456 4896 2024-01-15 However, mlo3Δ resulted in a considerable increase in the levels of centromeric repeat transcripts, although to a lesser extent than in clr4Δ (Fig. 1B). PomBase SPBC428.08c FYPO:0001890 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006270 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003033 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.18c) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003033 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC664.06) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003033 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC140.02) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0000286) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001905) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008423 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 PhpC and Moc3 peaks at cenH and dh elements were mostly unchanged in cells lacking Clr4Suv39h (Fig. 4a–d and Supplementary Fig. 4a, b). PomBase SPBC428.08c FYPO:0005978 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000337 PMID:28231281 4896 2017-04-11 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007320 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 5 high PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 5A, 5B, 5E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005917 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005917 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 high PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005917 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005917 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004573 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:17512405 4896 2024-01-18 we observed 7-fold and a 25-fold increases in tlh1+ transcript levels in rrp6D and dis3-54 cells, respectively, and 33- and 100- fold increases in cid14D and clr4D cells, respectively (Figures 4G and S3) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001489 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000006 3 PMID:32269268 4896 2021-02-18 (Fig. 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 8.7 PMID:19362535 4896 2024-02-14 The efficiency of chromosome segregation was also monitored in clr4+ reintroduction chp1 mutant cells (Table S4) and closely correlated with Chp1’s binding efficiency. Mutants with>5-fold reduction in H3K9me-binding efficiency that cannot establish centromeric heterochromatin exhibited elevated rates of chromosome missegregation. PomBase SPBC428.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006660 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006670 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 55 PMID:31278118 4896 2020-05-06 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004382 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:20935472 4896 2015-02-18 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002837 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003800 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003800 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006992 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000049 PMID:21892171 4896 2024-01-16 (Supplementary Fig. 1) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002336 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003082 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000337 PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001164 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18923422 4896 2012-11-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000963 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18923422 4896 2012-11-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000957 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18923422 4896 2012-11-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002613 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007147 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:24920274 4896 2019-11-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003153 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Protein levels of Lsd1 and Lsd2 are similar between wild-type and clr4Δ cells at 37 ̊C, indicating that Clr4 is not responsible for Lsd1/2 upregulation in this condition (Fig 4C and 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003153 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Protein levels of Lsd1 and Lsd2 are similar between wild-type and clr4Δ cells at 37 ̊C, indicating that Clr4 is not responsible for Lsd1/2 upregulation in this condition (Fig 4C and 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002574 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2013-09-11 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008154 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-22 PhpC and Moc3 peaks at cenH and dh elements were mostly unchanged in cells lacking Clr4Suv39h (Fig. 4a–d and Supplementary Fig. 4a, b). PomBase SPBC428.08c FYPO:0006163 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 In contrast, Chp2 was preferentially present in the chromatin-enriched pellet fraction in wild-type cells, and the Chp2 in this fraction was not altered by the clr4+ depletion (Fig. 1B). PomBase SPBC428.08c FYPO:0005079 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005082 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005082 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005083 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005083 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005084 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005084 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005086 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005086 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005085 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005085 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005087 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002625 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.05c) PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002625 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PR:000044738) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0007278 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC110.02) PMID:31278118 4896 2020-05-06 However, the localization of Pds5 to euchromatic locations was unaffected in heterochromatin-deficient cells (Figure 5E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005080 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002389 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23936074 4896 2014-01-06 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002389 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21151114 4896 2015-11-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002389 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC29B12.01) PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004378 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-22 PhpC and Moc3 peaks at cenH and dh elements were mostly unchanged in cells lacking Clr4Suv39h (Fig. 4a–d and Supplementary Fig. 4a, b). PomBase SPBC428.08c FYPO:0004378 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 PhpC and Moc3 peaks at cenH and dh elements were mostly unchanged in cells lacking Clr4Suv39h (Fig. 4a–d and Supplementary Fig. 4a, b). PomBase SPBC428.08c FYPO:0001317 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2022-12-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001317 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-02 In addition, the transcript levels of tgp1þ, nc-tgp1, nc-1343, pho1þ and nc-pho1 were unaffected by loss of RNAi (for example, ago1D or dcr1D) or heterochromatin components (for example, clr4D or swi6D) (Fig. 5b; Supplementary Fig. 7a PomBase SPBC428.08c FYPO:0001317 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:29618061 4896 2024-01-24 clr4Δ, or the double mutant clr3Δclr4Δ (Supplementary Figure S3A, lane 4 and 5), also revealed no change in mRNA expression levels. These results indicate that unlike pho1, tgp1 repression PomBase SPBC428.08c FYPO:0001317 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:29618061 4896 2024-01-24 clr4Δ, or the double mutant clr3Δclr4Δ (Supplementary Figure S3A, lane 4 and 5), also revealed no change in mRNA expression levels. These results indicate that unlike pho1, tgp1 repression PomBase SPBC428.08c FYPO:0003530 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006842 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 PMID:36200823 4896 2023-01-17 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000943 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 37 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008414 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. S7B, S7C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005527 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:26205977 4896 2016-07-13 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004579 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0000291 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007629 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004431 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004434 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004325 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004325 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 3) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000084 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 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ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 clr4 clr4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- mat2-3delta clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. S4) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24662054 4896 2017-02-06 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18923422 4896 2012-11-07 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004433 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002650 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 PMID:17627824 4896 2015-02-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- clr4 clr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr4 clr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 Y133A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 Y133A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 Y133A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 Y133A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 Y133A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000089 Y133A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001645 56-171 Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-delta56-171 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 low assayed_protein(PomBase:SPAC12B10.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 3C) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 red1 red1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003748 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.02) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003748 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC725.08) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0008155 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Loss of the MTREC subunit Red1 resulted in the accumulation of longer readthrough transcripts (referred to as prt-L and nam1-L) (Fig. 1a), as was also observed in mmi1Δ and rrp6Δ cells (Fig. 1a and Supplementary Fig. 1a)6,7,11. PomBase SPAC1006.03c FYPO:0008155 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1459) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Loss of the MTREC subunit Red1 resulted in the accumulation of longer readthrough transcripts (referred to as prt-L and nam1-L) (Fig. 1a), as was also observed in mmi1Δ and rrp6Δ cells (Fig. 1a and Supplementary Fig. 1a)6,7,11. PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003551 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007530 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007530 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003042 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.14c) PMID:23980030 4896 2013-12-02 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000705 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.01),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 3A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000082 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000082 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 medium PMID:36002457 4896 2024-01-12 While red1Δ cells showed only a moderate growth defect on solid rich medium at 30°C, this defect was more pronounced at lower temperature of 25 or 18°C (Supplementary Fig. 3b), as published previously1 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:36002457 4896 2024-01-12 While red1Δ cells showed only a moderate growth defect on solid rich medium at 30°C, this defect was more pronounced at lower temperature of 25 or 18°C (Supplementary Fig. 3b), as published previously14,34 or when the cells were grown on minimal medium (Supplementary Fig. 3c). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26942678 4896 2016-12-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003094 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 low PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002174 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002174 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000049 PMID:23658229 4896 2013-05-17 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0006269 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003230 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000226 PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003230 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000226 PMID:24713849 4896 2014-08-14 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 red1 red1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001324 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.14c) PMID:23980030 4896 2013-12-02 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007280 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.01) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 1A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007280 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.10) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 1A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0007280 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.14c) PMID:32012158 4896 2020-03-26 (Figure 1A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB10D8.03) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC359.02) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.19c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.01c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC750.07c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.08c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1565.04c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001117 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.05) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:36002457 4896 2024-01-12 While red1Δ cells showed only a moderate growth defect on solid rich medium at 30°C, this defect was more pronounced at lower temperature of 25 or 18°C (Supplementary Fig. 3b), as published previously1 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000223 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003557 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1365) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) COULD ALSO ADD TO ANTISENS RPL402, BUT NOT ANNOTATED IN GENOME PomBase SPAC1006.03c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0008148 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 In contrast, deletion or mutation alleles of the MTREC complex lead to significant accumulation of all types of CUTs and also meiotic mRNAs. This effect is comparable to the level of CUT accumulation in the nuclear exosome subunit rrp6 deletion (Fig. 2a,b) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0008113 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Similar to previous reports, we detected significantly increased intronic reads in the exosome mutant rrp6D strain (Fig. 4a,b). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.09c) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:22912768 4896 2013-03-19 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22912768 4896 2013-03-19 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:22912768 4896 2013-03-19 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22912768 4896 2013-03-19 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPAC1952.15c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPCC70.09c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 In contrast, deletion or mutation alleles of the MTREC complex lead to significant accumulation of all types of CUTs and also meiotic mRNAs. This effect is comparable to the level of CUT accumulation in the nuclear exosome subunit rrp6 deletion (Fig. 2a,b) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.09c) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC70.09c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1271.06c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.04) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1223.12c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.06) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24210919 4896 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and red1D, but not in wild-type cells (Fig. 2e,f; Supplementary Fig. 4). PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000825 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.488) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000825 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.405) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000825 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.247) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000825 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003237 deletion 972 h- red1 red1delta deletion ECO:0000291 PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph red1 red1delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0002321 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0005801 PMID:17276356 4896 2024-05-02 ...contained a reduced amount of ergosterol and elevated amounts of the ergosterol biosynthetic intermediates 24-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, consistent with defects at the Erg11 and Erg5 enzymatic steps (Figure 1B). PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0008296 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0005801 PMID:17276356 4896 2024-10-01 elevated amounts of the ergosterol biosynthetic intermediates 2. upon loss of Dap1, cells accumulated 24-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, substrates for Erg11 and Erg5. 4-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, Figure 1B. Ergosta-5,7-dienol is not a normal pathway intermediate, but forms when Erg5 is inhibited (Figure S1) PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0008297 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0005801 PMID:17276356 4896 2024-05-02 elevated amounts of the ergosterol biosynthetic intermediates 2. upon loss of Dap1, cells accumulated 24-methylene lanosterol, ergosta5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, substrates for Erg11 and Erg5. 4-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, Figure 1B. Ergosta-5,7-dienol is not a normal pathway intermediate, but forms when Erg5 is inhibited (Figure S1) PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0008298 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0005801 PMID:17276356 4896 2024-10-01 elevated amounts of the ergosterol biosynthetic intermediates 2. upon loss of Dap1, cells accumulated 24-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, substrates for Erg11 and Erg5. 4-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7-dienol, Figure 1B. Ergosta-5,7-dienol is not a normal pathway intermediate, but forms when Erg5 is inhibited (Figure S1) PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009071 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 PMID:17276356 4896 2024-05-02 sensitive to the inhibitors of sterol synthesis itraconazole and CoCl2 (Figure 1D). PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dap1 dap1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- dap1 dap1delta deletion ECO:0005638 PMID:17276356 4896 2024-05-02 dap1D cells were viable under normal growth conditions but ..... 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from Meu10-C120∆-GFP were detected. (Fig. 8B, Cii) PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.18c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBP4H10.18c SPBP4H10.18cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.17 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC977.17 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC977.17 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC977.17 FYPO:0001454 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 PMID:16254446 4896 2025-09-01 PomBase SPAC977.17 FYPO:0001021 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000435 PMID:15031652 4896 2025-09-01 Surprisingly, the S. pombe spac977.17 2 mutants survived both the hyper- and hypo-osmotic shocks in a similar way as the wild-type cells. PomBase SPAC977.17 FYPO:0001164 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 PMID:15031652 4896 2025-09-01 Deletion of the S. pombe spac977.17 gene did not cause any observable growth defect on glucose or glycerol as a sole carbon source (not shown). PomBase SPAC977.17 FYPO:0001409 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 PMID:15031652 4896 2025-09-01 The patterns and kinetics of glycerol release in the mutant were similar to those in the wild type (Figure 3A) suggesting that the export process is independent of the S. pombe spac977.17 gene. PomBase SPAC977.17 FYPO:0008456 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Curiously, protoplasts lacking the only putative water channel Aqp1 (encoded by SPAC977.17) exhibited normal Ca2+ influx and WT- like hypoosmotic PM expansion (Additional file 1: Fig. S1E). PomBase SPAC977.17 FYPO:0001071 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 PMID:15031652 4896 2025-09-01 PomBase SPAC977.17 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC977.17 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC977.17 FYPO:0004325 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC977.17 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 aqp1 aqp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC977.17 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph aqp1 aqp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC977.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- aqp1 aqp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC977.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aqp1 aqp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aqp1 aqp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 cha4 cha4+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0008420 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0000059 PMID:34851357 4896 2025-06-24 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0002447 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0000335 PMID:20854854 4896 2019-10-30 (Fig. 3) PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000080 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0002637 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0001232 PMID:20854854 4896 2019-10-30 (Fig. 1c) PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0001420 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0001232 PMID:20854854 4896 2019-10-30 (Fig. 1b) PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0001120 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0001232 low PMID:20854854 4896 2019-10-30 (Fig. 1a) PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000094 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000095 deletion 972 h- alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.06c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph alg3 alg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 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2014-04-17 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0003312 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-6 unknown ECO:0005801 PMID:24186301 4896 2014-04-24 PomBase SPAC821.07c FYPO:0002779 34-73 Not assayed or wild type 972 h- moc3 moc3-deltaZF partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC821.07c) PMID:16273369 4896 2014-10-29 PomBase SPAC821.07c FYPO:0000708 34-73 Not assayed or wild type 972 h- moc3 moc3-deltaZF partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16273369 4896 2014-10-29 PomBase SPCC1223.14 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aro2 aro2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- aro2 aro2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1223.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aro2 aro2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0002825 K590A Not assayed or wild type 972 h- sgo2 sgo2-K590A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC736.14 FYPO:0003350 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:34080538 4896 2023-07-26 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002678 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- rep1-mad2 dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.14),residue(S551) PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 1B) PomBase SPCC736.14 FYPO:0007244 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0001232 99.2 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:16920624 4896 2021-04-19 PomBase SPCC736.14 FYPO:0001861 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 high PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2C) The loss rate of CN2 minichromosome in Dis16A was much higher than that of the wild-type integrant... PomBase SPCC736.14 FYPO:0000228 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0001232 13 PMID:16920624 4896 2021-04-19 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002141 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2A) PomBase SPCC736.14 FYPO:0004310 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16920624 4896 2021-04-19 Measurements of the durations of phase 1 (prophase to metaphase), 2 (metaphase to anaphase), and 3 (anaphase B) on each of the 30 movies of Dis1WT, Dis16A, and Dis16E strains indicated that the timing of mitosis did not seem to be affected by any mutations because measured differences were within the boundaries of experimental error (Figure S1C) PomBase SPCC736.14 FYPO:0006641 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:16920624 4896 2021-04-19 PomBase SPCC736.14 FYPO:0000091 T279A,S293A,S300A,S551A,S556A,S590A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6A dis16A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85Q Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGQGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, protein very stable, complements partially sde2Δ PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0005258 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 SPNCRNA.1651((-9)-95) SPNCRNA.515OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0009028 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 SPNCRNA.1651((-9)-95) SPNCRNA.515OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0001103 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 SPNCRNA.1651((-9)-95) SPNCRNA.515OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0002578 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 SPNCRNA.1651((-9)-95) SPNCRNA.515OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0002578 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 SPNCRNA.1651((-9)-95) SPNCRNA.515OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0005266 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 SPNCRNA.1651((-9)-95) SPNCRNA.515OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1651 FYPO:0007808 II:3962690..3962794 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1651 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2014-11-24 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004728 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-07-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004619 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:19001497 4896 2016-09-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004619 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-07-20 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002827 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPCC417.07c FYPO:0006921 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:31483748 4896 2019-11-08 Recombination rates were decreased by 10-fold in mto1∆ strains in both recombination substrates (Figure 4B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000185 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000059 PMID:24943839 4896 2014-07-18 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000185 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:31483748 4896 2019-11-08 Recombination rates were decreased by 10-fold in mto1∆ strains in both recombination substrates (Figure 4B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005386 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31483748 4896 2019-11-08 Reduced Rad21 binding to chromosome arms PomBase SPCC417.07c FYPO:0006182 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.05c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 5I) PomBase SPCC417.07c FYPO:0007209 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-11-08 PomBase SPCC417.07c FYPO:0005691 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:19001497 4896 2016-09-27 supplementary material Movies 2-4). PomBase SPCC417.07c FYPO:0005691 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000235 PMID:18495844 4896 2020-04-19 (Fig. 2B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000584 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:24196444 4896 2014-04-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0008006 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:21444751 4896 2022-08-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002638 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000059 PMID:17881496 4896 2014-09-05 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0007191 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-12-06 (Figure 3A, 3B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000972 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-11-08 (Figure 3A, 3B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0003580 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:24943839 4896 2014-08-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002852 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15772152 4896 2015-07-21 PomBase SPCC417.07c FYPO:0006897 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009102 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004511 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 1E) PomBase SPCC417.07c FYPO:0004511 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003787 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004724 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:15772152 4896 2015-07-21 Consistent with this, we observed that the nuclear envelope formed thin protrusions that grew and shrank (Figure 4, G and H, Supplementary Movie 8). Such intranuclear MTs and nuclear envelope distortions were notobserved in wild-type cells. Several criteria confirmed that these cells with intranuclear MTs were in interphase and not in mitosis PomBase SPCC417.07c FYPO:0002444 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_protein(PomBase:SPBC902.06) PMID:38442865 4896 2024-05-31 ((Fig. 3B and C)) PomBase SPCC417.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mto1 mto1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003061 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:24196444 4896 2015-04-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002818 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:38442865 4896 2024-05-31 (Fig. 3D, E and F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005686 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 91 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0001369 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000339 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 39 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000339 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0007388 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high high PMID:18495844 4896 2020-04-14 (Fig. 1B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0007388 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 2) PomBase SPCC417.07c FYPO:0007388 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:18562692 4896 2024-07-15 (Fig. 2) PomBase SPCC417.07c FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 1.5 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000324 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000059 PMID:17881496 4896 2014-09-05 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000324 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:18562692 4896 2024-07-15 (Fig. 1) PomBase SPCC417.07c FYPO:0003717 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC417.07c FYPO:0006995 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000049 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0004742 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPCC417.07c FYPO:0003555 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPCC417.07c FYPO:0004310 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mto1 mto1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002826 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:21444751 4896 2022-08-01 Collectively, these results indicate that in fission yeast, a ?-TuRC- like complex exists as a stable structure in vivo independent of the Mto1/2 complex PomBase SPCC417.07c FYPO:0000969 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-12-06 (Fig. 2) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000963 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-12-06 (Fig. 2) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000957 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-11-08 (Fig. 2) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000957 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-12-06 (Fig. 2) PomBase SPCC417.07c FYPO:0006004 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 90 PMID:18061564 4896 2019-11-14 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004726 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-07-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004722 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-07-21 PomBase SPCC417.07c FYPO:0006917 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 1) PomBase SPCC417.07c FYPO:0003332 deletion 972 h- 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003332 deletion 972 h- 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.12) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000833 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC902.06) PMID:15800064 4896 2016-09-23 (Fig. 5B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0004731 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15772152 4896 2015-07-21 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004731 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:15772152 4896 2015-07-21 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000703 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC211.06),assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:21444751 4896 2022-08-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000703 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC806.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:21444751 4896 2022-08-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000703 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.19) PMID:21444751 4896 2022-08-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004429 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003302 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:17881496 4896 2014-09-05 (Fig. 1B) PomBase SPCC417.07c FYPO:0003302 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 37 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003302 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 69 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003302 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0006338 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:37099380 4896 2023-06-30 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003264 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:24196444 4896 2014-04-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0003126 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0004730 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15772152 4896 2015-07-21 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mto1 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4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 PMID:24943839 4896 2014-07-07 PomBase SPCC417.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0001457 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase 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deletion ECO:0001232 high PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 1C) PomBase SPCC417.07c FYPO:0002112 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 26 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002112 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 31 PMID:15772152 4896 2015-04-27 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002456 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC417.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto1 mto1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0001759 1-234 Not assayed or wild type 972 h- pyp1 pyp1deltaN234 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000140 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001946 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2023-06-28 PomBase SPBC19F8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps401 rps401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19F8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps401 rps401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19F8.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps401 rps401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0007713 44-61 Not assayed or wild type 972 h- emr1 emr1deltaC erm1(N) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.06c) PMID:33483504 4896 2021-04-06 As shown in Fig. 6b, c, Emr1-FL and Emr1-ΔN, but not Emr1-ΔC, restored the normal number of Mdm12 foci, confirming that the C-terminus of Emr1 is required for regulating the number of ERMES foci. PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0003768 44-61 Not assayed or wild type 972 h- emr1 emr1deltaC erm1(N) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.19) PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Figure 3a) PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0001234 44-61 Not assayed or wild type 972 h- emr1 emr1deltaC erm1(N) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 3d) PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0007611 44-61 Not assayed or wild type 972 h- emr1 emr1deltaC erm1(N) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 3b) PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0002485 K124I Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-236 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13),assayed_using(PomBase:SPCC777.09c) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0003179 K124I Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-236 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0004058 K124I Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-236 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0001384 D281A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-KD amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0002485 D281A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-KD amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0003179 D281A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-KD amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0005650 D281A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-KD amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0004993 D281A Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-KD amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0001645 T113A,S131A,S148A,S160A,T169A,T175A,S176A,S180A,S186A,S187A,S193A,S197A,T198A,T216A,S225A Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-15A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC110.02),assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:38448160 4896 2024-03-21 (Fig. 2F) PomBase SPBC31E1.03 FYPO:0002060 73,Y71G,Y72G Not assayed or wild type 972 h- hub1 hub1-GG YY71GG,delta73 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 PMID:15620657 4896 2014-08-13 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 etf1 etf1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.06 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph etf1 etf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 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prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph pha2 pha2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pha2 pha2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- pha2 pha2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pha2 pha2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.16 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ 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SPAC6F12.16c FYPO:0003620 wild type Knockdown 972 h- mtr4 mtr4+ wild_type ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 Similar results were obtained with a conditional strain in which the genomic copy of mtr4 is expressed from the thiamine-sensitive nmt1+ promoter: depletion of Mtr4 did not affect rpl30-2 premRNA and mRNA levels (Figure 2D, compare lanes 3 and 7) PomBase SPAC6F12.16c FYPO:0006279 wild type Knockdown 972 h- mtr4 mtr4+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC1442.14c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC6F12.16c FYPO:0006279 wild type Knockdown 972 h- mtr4 mtr4+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC6F12.16c FYPO:0006279 wild type Knockdown 972 h- mtr4 mtr4+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC31A2.15c FYPO:0005634 unknown Not assayed or wild type 972 h- h+ cdc2-M35 mat3-M cen1-GFP ura4-D18 (haploid meiosis inducing) dcc1 dcc1- unknown ECO:0005638 high PMID:16325576 4896 2021-05-13 (Figure 1) PomBase SPAC3A12.16c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim17 tim17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A12.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- tim17 tim17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A12.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim17 tim17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC297.06c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph SPCC297.06c SPCC297.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC297.06c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPCC297.06c SPCC297.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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4896 2024-05-20 (Fig. 1E) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004201 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 5C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006993 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006993 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 4I) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(SO:0001898) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(SO:0001899) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006269 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003573 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) 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assayed_protein(PomBase:SPCC736.11),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC736.11),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003822 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_enzyme(PomBase:SPCC736.11) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000291 high PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 3C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002331 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004237 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC736.11),assayed_region(SO:0001898) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004237 D580A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-D580A ago1(D580A) amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPCC736.11),assayed_region(SO:0001899) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2B) PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0006518 D215N Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-67 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004318 1-302 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-302) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22825872 4896 2020-05-31 PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 1-302 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-302) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.01) PMID:22825872 4896 2020-05-31 abolished both kinetochore localization and SAC signaling (Fig. 1C,D), suggesting that kinetochore localization is crucial for SAC activity. PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 1-302 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-302) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 1-302 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-302) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4C) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 K289A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K289A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 K289A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K289A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004142 K289A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K289A-TAP amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(SO:0002216) PMID:30212894 4896 2018-10-29 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 K289A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K289A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC1271.06c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mug96 mug96delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.06c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mug96 mug96delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.06c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph mug96 mug96delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug96 mug96delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug96 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assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-F503R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Supplementary Figure S5B) PomBase SPCC1739.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph met1 met1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph met1 met1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph met1 met1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.06c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph met1 met1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.06c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph met1 met1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph SPCC594.02c SPCC594.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC594.02c SPCC594.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC594.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC594.02c SPCC594.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC594.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC594.02c SPCC594.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.09 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec8 sec8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.09 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec8 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set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004689 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1E) PomBase SPCC306.04c FYPO:0008257 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000226 low PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 6C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0008254 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 6B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004380 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 2C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1F) PomBase SPCC306.04c FYPO:0000594 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002360 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000231 assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1D) PomBase SPCC306.04c FYPO:0008250 set1-3xFLAG Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-F set1-3xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c),assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 2A) PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001514 176-768,M20A Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-1-175/M20A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0003768 176-768,M20A Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-1-175/M20A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPBC1685.03 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec11 sec11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- sec11 sec11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC1685.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- sec11 sec11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1685.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec11 sec11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.05 FYPO:0007104 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Fig. 2) PomBase SPBC409.05 FYPO:0000141 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 >30 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Fig. 1A,B) PomBase SPBC409.05 FYPO:0003779 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 90 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Fig. 4) abnormally segregating nuclear membrane #2863 PENDING PomBase SPBC409.05 FYPO:0005811 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 90 PMID:15147872 4896 2016-12-04 PomBase SPBC409.05 FYPO:0000913 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Figure 1a) PomBase SPBC409.05 FYPO:0001978 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Figure 5c) PomBase SPBC409.05 FYPO:0007101 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-03 (Figure 1d) PomBase SPBC409.05 FYPO:0005721 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 >30 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Fig. 1C, 2) PomBase SPBC409.05 FYPO:0003165 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 8 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Fig. 1A,B) PomBase SPBC409.05 FYPO:0000082 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Figure 5) PomBase SPBC409.05 FYPO:0006419 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Fig. 3d) PomBase SPBC409.05 FYPO:0007105 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Fig. 3e) PomBase SPBC409.05 FYPO:0001327 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:24006256 4896 2014-02-13 PomBase SPBC409.05 FYPO:0005722 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 >30 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Fig. 2) PomBase SPBC409.05 FYPO:0007102 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Figure 1d) PomBase SPBC409.05 FYPO:0006426 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Fig. 2) PomBase SPBC409.05 FYPO:0001164 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22292001 4896 2019-10-11 PomBase SPBC409.05 FYPO:0005342 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15147872 4896 2016-10-12 (Fig. 3A) PomBase SPBC409.05 FYPO:0007103 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Figure 1d) PomBase SPBC409.05 FYPO:0000678 I110T Not assayed or wild type 972 h- skp1 skp1-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Fig. 2) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 1-392,S402A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A,S650A,S654A B2d7-S402A-S650A-S654A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 1-392,S402A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A,S650A,S654A B2d7-S402A-S650A-S654A amino_acid_deletion_and_mutation 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SPCC1739.14 FYPO:0000085 deletion 972 h- npp106 npp106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC1739.14 FYPO:0000102 deletion 972 h- npp106 npp106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC1739.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph npp106 npp106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.14 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph npp106 npp106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.14 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npp106 npp106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPCC1739.14 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph npp106 npp106delta deletion ECO:0005638 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ECO:0005638 PMID:18716626 4896 2022-04-15 (Fig. 1a) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000964 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-sm1 unknown ECO:0005638 PMID:18716626 4896 2022-04-15 (Fig. 1a-d) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003176 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-sm1 unknown ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Supplementary Fig. 4). The transcriptional silencing of Swi6 is not relevant to this function, because swi6-sm1 cells have intact meiotic chromosome segregation PomBase SPAC664.01c FYPO:0001513 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-sm1 unknown ECO:0001232 PMID:31000521 4896 2020-03-03 The swi6-sm1 allele disrupts silencing without lagging chromosomes (Yamagishi et al. 2008) (Figure S4, A and B). We observed a similar frequency of lagging chromosomes in wild-type (1%) and swi6-sm1 mutants (1.03%). PomBase SPAC664.01c FYPO:0001513 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-sm1 unknown ECO:0005638 PMID:18716626 4896 2022-04-15 (Fig. 1a-d) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002574 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-sm1 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31000521 4896 2020-03-03 Rad21-GFP enrichment at the centromere is unaffected in swi6-sm1 (Figure S4C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0005072 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-sm1 unknown ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:18716626 4896 2022-04-15 (Fig. 1a-d) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002059 701-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-delta1-700 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:31509478 4896 2019-12-31 (Figure 1) PomBase SPCC830.08c FYPO:0000354 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC830.08c) PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Figure 2A and 2B) PomBase SPCC830.08c FYPO:0003778 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC31A8.01c) PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Figure 2A and 2B) PomBase SPCC830.08c FYPO:0003210 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0001232 ~20 PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Fig. 3) PomBase SPCC830.08c FYPO:0001030 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPCC830.08c FYPO:0003780 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0001232 PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPCC830.08c FYPO:0007448 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0000112 PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPCC830.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- yop1 yop1delta deletion ECO:0005638 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPCC830.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph yop1 yop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.08c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph yop1 yop1delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- SPAC1687.17c SPAC1687.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1687.17c SPAC1687.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1687.17c SPAC1687.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001339 deletion 972 h- spa2 spa2delta deletion ECO:0005638 PMID:40931936 4896 2025-11-21 After nitrogen starvation at 32°C for 48 h, wild-type and spa2Δ cells arrested growth at the same short size (Fig. 7A,B). Upon re-feeding at 32°C, we observed that wildtype cells began to adopt a typical cylindrical shape by 6 h. In contrast, spa2Δ cells maintained a shorter, rounded morphology for significantly longer before resuming cylindrical growth by 24 h (Fig. 7A,B). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001584 deletion 972 h- spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:40931936 4896 2025-11-21 We found that not only were the Exo70–mNG and Sec3–mNG distributions broader in spa2Δ cells than in wild-type cells, but Exo70–mNG and Sec3–mNG lacked the medial peak of focused localization observed in wild-type cells (Fig. 6C,D). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001584 deletion 972 h- spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC106.20) PMID:40931936 4896 2025-11-21 We found that not only were the Exo70–mNG and Sec3–mNG distributions broader in spa2Δ cells than in wild-type cells, but Exo70–mNG and Sec3–mNG lacked the medial peak of focused localization observed in wild-type cells (Fig. 6C,D). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001584 deletion 972 h- spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.16) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Therefore, we expected the tip distribution of Bud6–GFP3 to mirror that of Exo70–mNG and Sec3–mNG and to be broader in spa2Δ cells. This is what we observed (Fig. 6C,D), PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000117 deletion 972 h- spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0003209 deletion 972 h- spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.09c) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Gyp3–mNG localization to cell tips and division sites was lost in spa2Δ cells (Fig. 5A), PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph spa2 spa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spa2 spa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph spa2 spa2delta deletion 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We found that Fzo1 protein was not degraded at late time points in the ∆rsv2 mutant PomBase SPBC1105.14 FYPO:0004557 deletion 972 h- rsv2 rsv2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1105.14 FYPO:0004557 deletion 972 h- rsv2 rsv2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1105.14 FYPO:0009008 deletion 972 h- rsv2 rsv2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1105.14 FYPO:0009008 deletion 972 h- rsv2 rsv2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1105.14 FYPO:0009008 deletion 972 h- rsv2 rsv2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1105.14 FYPO:0009008 deletion 972 h- rsv2 rsv2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1105.14 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with a bulky methionine, and substituting Ser for the Cdh1 equivalents of Asp 173, Asp 457 and Glu 458 at the putative Arg-binding site, eliminated the ability of Cdh1 to stimulate APC/C activity (Fig. 4e and Supplementary Fig. 6) but had no affect on co-activator binding to the APC/C (Supplementary Fig. 7) PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 bag101 bag101delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 bag101 bag101delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 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PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bag101 bag101delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph bag101 bag101delta deletion 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PomBase SPCC576.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC576.02 SPCC576.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007471 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0005580 PMID:31315658 4896 2020-09-22 In sharp contrast, the H3K9me2 levels remained constant in leo1∆ cells throughout G0 phase (Fig. 2; Additional file 2: Fig. S2 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0003094 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000291 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004748 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007004 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.03) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007004 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007004 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC4H3.10c) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007004 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006997 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006998 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007473 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:31315658 4896 2020-09-25 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005533 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005534 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005226 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPCC622.09) PMID:26518661 4896 2019-07-23 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0001324 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005531 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC631.02) PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005531 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC637.12c) PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005286 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000049 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005286 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000049 PMID:25972440 4896 2015-07-31 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006985 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-21 (Figure 1) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004541 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004542 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004542 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta leo1 leo1delta deletion ECO:0000049 low PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000875 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:25972440 4896 2015-07-31 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000875 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006369 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006373 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006268 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC13A11.03) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006268 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.09c) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006268 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006268 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006268 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC70.09c) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006987 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-24 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006361 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004138 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004138 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006988 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007468 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:31315658 4896 2020-09-21 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007469 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:31315658 4896 2020-09-30 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0004749 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:25972440 4896 2015-07-31 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 leo1 leo1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0005580 PMID:31315658 4896 2020-09-21 (Fig. 1c) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006996 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PBO:0000992) PMID:26518661 4896 2019-07-25 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 leo1 leo1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0007003 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0008380 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 5C) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000862 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000472 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000337 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 4E) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0005529 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0001317 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0006991 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.14) PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0001125 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0001232 PMID:26518661 4896 2019-07-21 (Figure 1) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 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List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 leo1 leo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- leo1 leo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 leo1 leo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 leo1 leo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000280 389-606 Not assayed or 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4896 2018-10-14 (Fig. 3a) PomBase SPCC736.14 FYPO:0004099 wild type Overexpression 972 h- dis1 dis1+ wild_type ECO:0005638 high PMID:9078390 4896 2018-10-14 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph shm1 shm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph shm1 shm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph shm1 shm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph shm1 shm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph shm1 shm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.12c 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h- shm1 shm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shm1 shm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24C9.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shm1 shm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0004069 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0002779 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC530.13) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0000705 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F3.15),assayed_using(PomBase:SPBC530.13) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0005061 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0000838 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F3.15) PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0000107 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC2F3.15 FYPO:0000107 K306R Not assayed or wild type 972 h- lsk1 lsk1-K306R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001943 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22134091 4896 2019-10-30 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000338 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 ~40 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. 2B) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000903 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. 3) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003566 Q89R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:22134091 4896 2019-10-30 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000274 Q89R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. S3A) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0007132 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:22134091 4896 2019-11-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0007131 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:22134091 4896 2019-11-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002059 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30973898 4896 2019-04-24 (Figure 3A) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0004439 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 ~5 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. 2A,B) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000964 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. S2) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001400 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0001232 ~5 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. 2) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001357 Q89R Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R mal3-89R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22134091 4896 2019-10-30 PomBase SPCC16A11.06c FYPO:0001991 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi10 gpi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi10 gpi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- gpi10 gpi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC16A11.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi10 gpi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.06c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi10 gpi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0005288 E184D Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-E184D amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0003786 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 6A) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000634 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 5B) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0007853 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 7) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0007853 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 7) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0007853 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.03c) PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 7) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001357 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000381 PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 6B) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001357 1-237,H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-CT-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106 PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 6B) PomBase SPBC337.12 FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- red5 red5+ SPBC337.12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 D656N Endogenous 972 h- cut14 cut14-85 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC17A2.13c FYPO:0000674 E184V Not assayed or wild type 972 h- rad25 rad25-E184V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC17A2.13c FYPO:0000674 E184V Not assayed or wild type 972 h- rad25 rad25-E184V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 4) PomBase SPAC17A2.13c FYPO:0001357 E184V Not assayed or wild type 972 h- rad25 rad25-E184V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC17A2.13c FYPO:0001357 E184V Not assayed or wild type 972 h- rad25 rad25-E184V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 4) PomBase SPBC1105.02c FYPO:0005762 R163Q Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-R163Q amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:19776021 4896 2016-10-31 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000705 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC926.03),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0007603 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000006 high PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002562 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0004652 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000703 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000703 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001315 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001357 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001357 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002177 791-813 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ2 myo2-deltaIQ2|myo2::delta-IQ2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0000805 deletion 972 h- gls1 gls1delta deletion ECO:0001232 PMID:30389790 4896 2019-07-23 (Fig. 10) PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- gls1 gls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:30389790 4896 2021-04-16 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- gls1 gls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 medium PMID:30389790 4896 2021-04-16 (Fig. 2b) PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- gls1 gls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 medium PMID:30389790 4896 2021-04-16 (Fig. 5b) PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0001035 deletion 972 h- gls1 gls1delta deletion ECO:0000335 PMID:30389790 4896 2019-07-23 (Fig. 10) PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0006980 deletion 972 h- gls1 gls1delta deletion ECO:0000335 PMID:30389790 4896 2019-07-23 (Fig. 3b) PomBase SPAC6G10.09 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gls1 gls1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.09 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is_bearer_of(PATO:0001262) PMID:499806 4896 2016-06-30 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 149 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7delta149 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 149 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7delta149 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0001357 T(-1)TAT Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-5'-extension nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPBC19G7.09 FYPO:0006995 GFP-Nup107-HM-Ulp1 fusion Not assayed or wild type 972 h- ulp1 nup107-ulp1 fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000137 PMID:37970674 4896 2024-03-07 PomBase SPBC19G7.09 FYPO:0000964 GFP-Nup107-HM-Ulp1 fusion Not assayed or wild type 972 h- ulp1 nup107-ulp1 fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:37970674 4896 2024-03-07 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0000470 deletion 972 h- cts2 cts2delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph cts2 cts2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cts2 cts2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- cts2 cts2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB1E7.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cts2 cts2delta deletion ECO:0001232 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recovery (Fig 4A) PomBase SPAC11E3.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl22 rpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11E3.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl22 rpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl22 rpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K101Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K101Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K101Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K101Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC18E5.03c FYPO:0002902 wild type Knockdown 972 h- sim4 sim4+ wild_type ECO:0001232 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SPBC530.13 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph lsc1 lsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.13 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph lsc1 lsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.13 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph lsc1 lsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.13 FYPO:0001234 deletion 972 h- lsc1 lsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 low PMID:22144909 4896 2015-11-04 PomBase SPBC530.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- lsc1 lsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC530.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsc1 lsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsc1 lsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000135 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22042620 4896 2021-01-06 (Fig. 7) PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0007426 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22042620 4896 2020-06-25 (Fig. 3, S3) for comparative images of an inserted pro-metaphase wild-type SPB, see Fig. S1 B PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002018 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 ~60-70 PMID:22042620 4896 2020-06-25 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000276 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 90 PMID:22042620 4896 2020-06-25 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0005380 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22042620 4896 2020-06-25 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0003750 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22042620 4896 2020-06-25 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000771 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22042620 4896 2020-06-25 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0000772 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22042620 4896 2020-06-25 PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002237 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22042620 4896 2020-12-18 (Fig. S5B) PomBase SPAC8F11.06 FYPO:0002328 C194G Not assayed or wild type 972 h- brr6 brr6.ts8 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22042620 4896 2020-12-18 (Fig. S5B) PomBase SPBC83.18c FYPO:0000674 P174A,P177A Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-P174,177A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure S2) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 Y392F Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-Y392F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 Y392F Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-Y392F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 C221S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-C221S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000478 S212A,S213A,S236A,S329A,S348A,S350A,T354A,S357A,T358A,S374A,T378A,S380A,S387A,S389A,S408A,S410A,S418A,S422A,S453A,S456A,S461A,S489A,S497A,S509A,S510A,S512A,S513A,S538A,S549A,S552A,T561A,S562A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-32A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26058898 4896 2015-08-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004093 S212A,S213A,S236A,S329A,S348A,S350A,T354A,S357A,T358A,S374A,T378A,S380A,S387A,S389A,S408A,S410A,S418A,S422A,S453A,S456A,S461A,S489A,S497A,S509A,S510A,S512A,S513A,S538A,S549A,S552A,T561A,S562A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-32A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26058898 4896 2015-08-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000590 S212A,S213A,S236A,S329A,S348A,S350A,T354A,S357A,T358A,S374A,T378A,S380A,S387A,S389A,S408A,S410A,S418A,S422A,S453A,S456A,S461A,S489A,S497A,S509A,S510A,S512A,S513A,S538A,S549A,S552A,T561A,S562A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-32A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26058898 4896 2015-08-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 S212A,S213A,S236A,S329A,S348A,S350A,T354A,S357A,T358A,S374A,T378A,S380A,S387A,S389A,S408A,S410A,S418A,S422A,S453A,S456A,S461A,S489A,S497A,S509A,S510A,S512A,S513A,S538A,S549A,S552A,T561A,S562A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-32A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26058898 4896 2015-08-20 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002239 C226A,G227C,T228C,G229C,G235C Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-8 nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0006799 1-25,53-643,E44A Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-26-52-E44A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 PMID:29180432 4896 2019-01-02 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002561 1-235 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1deltaABD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPCC613.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph meu23 meu23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.11c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph meu23 meu23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.11c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph meu23 meu23delta deletion 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.11c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph meu23 meu23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.11c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph meu23 meu23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- meu23 meu23delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPCC613.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- meu23 meu23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC613.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu23 meu23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu23 meu23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC649.05 FYPO:0007427 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 our ability to identify cells in which an active SPB had apparently lost its association with the membrane completely and fallen into the middle of the nucleus (Fig. 3 E) and the proximity of the SPB to these gaps in the membrane (Fig. 3, A-C). PomBase SPBC649.05 FYPO:0007427 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 our ability to identify cells in which an active SPB had apparently lost its association with the membrane completely and fallen into the middle of the nucleus (Fig. 3 E) and the proximity of the SPB to these gaps in the membrane (Fig. 3, A-C). PomBase SPBC649.05 FYPO:0007426 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 (Figure 1 and 2) We conclude that it is the new SPB that fails to activate and insert into the nuclear envelope in cut12.1 mutants. PomBase SPBC649.05 FYPO:0000583 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:22438582 4896 2020-02-20 (Figure S6) PomBase SPBC649.05 FYPO:0003165 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 80 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPBC649.05 FYPO:0007428 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 89 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPBC649.05 FYPO:0007428 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1D) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1C) increased interaction in 2 hybrid PomBase SPBC649.05 FYPO:0002061 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPBC649.05 FYPO:0006592 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 89 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPBC649.05 FYPO:0006592 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-07-07 PomBase SPBC649.05 FYPO:0005717 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_substrate(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 (Fig. 2A) PomBase SPBC649.05 FYPO:0005717 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_substrate(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 (Fig. 2B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0000772 R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-1 cut12.1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 80 PMID:19487457 4896 2020-06-24 gapped membrane distortions in the nuclear envelope of cut12.1 cells at 36°C (Fig. 3, A-D). 7D PomBase SPAC1002.17c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 urg2 urg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0001309 deletion 972 h- urg2 urg2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 urg2 urg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph urg2 urg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- urg2 urg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urg2 urg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urg2 urg2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.05c FYPO:0000164 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tlg2 tlg2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.05c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tlg2 tlg2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC823.05c FYPO:0000010 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tlg2 tlg2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPAC823.05c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph tlg2 tlg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph tlg2 tlg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.05c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph tlg2 tlg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.05c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph tlg2 tlg2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 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2018-05-29 (Fig. 5) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000651 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22573890 4896 2018-05-29 (Fig. 6) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007774 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 4C) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0003532 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 4A) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0003776 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102 PMID:23093943 4896 2021-03-26 Cells lacking Fic1 or its interacting partners Cyk3 or Imp2 were significantly more invasive than wild-type cells (Figure 9A-9B). PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000650 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22573890 4896 2018-05-29 (Fig. 6) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0004076 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 10-20 PMID:22573890 4896 2018-05-29 (Fig. 2a) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000674 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 3C) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0006187 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22573890 4896 2018-05-29 (Fig. 5) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0004895 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22573890 4896 2018-05-29 (Fig. 5) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cyk3 cyk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000021 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 20 PMID:22573890 4896 2018-05-29 (Fig. 2a) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cyk3 cyk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000444 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:9108295 4896 2013-11-22 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001931 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001933 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0004481 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:1464319 4896 2013-02-15 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003379 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000941 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000446 C532Y Not assayed or wild type 972 h- h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000137,FYECO:0000290,FYECO:0000300 high PMID:20967237 4896 2019-07-01 (Fig. 1D) microtubules absent PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000446 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:1464318 4896 2013-01-29 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003165 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229,FYECO:0000355 25 PMID:9348105 4896 2019-11-05 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000082 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 1C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003380 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-06-03 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001382 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001382 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000835 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9383050 4896 2012-06-29 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0006288 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003201 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29813053 4896 2019-03-05 (Fig. 3) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001355 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 1C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0006831 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 2) The start of septation scales with anaphase B progression and cell size in fission yeast and correlates linearly with the cell length. PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007380 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 high PMID:9679144 4896 2020-04-23 (Fig. 2A) cdc25-22 arrest released cells ie post NETO do not branch PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0006543 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9755169 4896 2018-04-19 (Fig. 4E) cdc18 lacking cdc2 phosphorylation sites accumulates immediately as cells progress into mitosis PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001327 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2534559 4896 2014-02-18 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007958 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0009019 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000324 PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 2D) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001490 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000263 PMID:17952063 4896 2016-01-14 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001490 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:3442828 4896 2015-06-16 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0002061 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 3c) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0004310 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001396 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003750 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 2C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003750 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 2C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003750 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000336 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 2C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001221 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001221 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17998401 4896 2012-07-16 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0006021 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003332 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC821.12) PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001587 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC16.01) PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001587 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 2C) protein localised to both cell tips PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000838 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000838 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05) PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000776 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8319772 4896 2016-07-22 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000776 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8319772 4896 2016-07-22 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.01) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1002.19) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.01) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.08c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0007671 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC887.04c) PMID:32059768 4896 2021-03-31 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001357 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Figure 1C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0004073 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 1) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:1464319 4896 2013-02-15 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:2004705 4896 2015-05-11 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1464318 4896 2013-01-30 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001492 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:3442828 4896 2015-06-16 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 3) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Table 1) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 C532Y Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-22 cdc25-ts|cdc25.22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 1D) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0004422 701-921 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-delta1-710 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:31509478 4896 2020-01-07 (Fig. S3C) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002060 701-921 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-delta1-710 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:31509478 4896 2020-01-07 (Fig. 1) PomBase SPAC1687.01 FYPO:0005371 wild type Overexpression 972 h- rpc19 rpc19+ wild_type ECO:0000059 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPAC1687.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- rpc19 rpc19+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPCC330.10 FYPO:0002061 R152A Overexpression 972 h- pcm1 pcm1-R152A pcm1-R181A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17284461 4896 2012-06-18 PomBase SPAC22E12.18 FYPO:0000031 deletion 972 h- SPAC22E12.18 SPAC22E12.18delta 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.11c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1A4.11c SPBC1A4.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- SPBC1A4.11c SPBC1A4.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1A4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1A4.11c SPBC1A4.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcf11 pcf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- pcf11 pcf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ 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nse3-200-307 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC645.04) PMID:36793083 4896 2023-03-06 PomBase SPAC6F6.10c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arc2 arc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.10c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arc2 arc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- arc2 arc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F6.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arc2 arc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000912 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0000337 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PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005781 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 high PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Fig. 1B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005784 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:26882497 4896 2016-11-08 (Figure 4a) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005784 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-08 (Figure 4a) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001645 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Figure 4D) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001645 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Fig. 4C) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001571 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Fig. 3a) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001571 K271A,E272A,N273A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN2-AAA mad3-KEN2mut amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Fig. 3a) PomBase SPAC144.09c FYPO:0000659 268-349 Not assayed or wild type 972 h- sfc2 sfc2-deltaF9/S sfc2deltaF9 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC144.09c) PMID:12888341 4896 2021-01-02 PomBase SPCC622.08c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph hta1 hta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.08c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hta1 hta1delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC622.08c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph hta1 hta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.08c FYPO:0001309 deletion 972 h- hta1 hta1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC622.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hta1 hta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC622.08c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph hta1 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SPBC646.17c FYPO:0000933 deletion 972 h- dic1 dic1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1093.06c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPBC646.17c FYPO:0000940 deletion 972 h- dic1 dic1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPBC646.17c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dic1 dic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC646.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- dic1 dic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC646.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dic1 dic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dic1 dic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000135 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 4A) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006221 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000126,FYECO:0000160 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006221 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000126,FYECO:0000160 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002871 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:39156640 4896 2025-02-28 (Fig. 2A) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002719 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1281.01) PMID:39156640 4896 2025-02-28 (Fig. 2A) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002021 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 4A, 4B, Fig. S5B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002652 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 6B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0004495 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000126 high PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0004495 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 PMID:26132084 4896 2017-09-16 (Fig. 3C) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000281 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126 high PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 7A, C, D and E) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0007436 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 high PMID:39156640 4896 2025-02-28 (Fig. 1A and B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0007436 wild type Knockdown 972 h- bgs1 bgs1+ 81X-bgs1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000025,FYECO:0000106,FYECO:0000126 low PMID:39156640 4896 2025-02-28 (Fig. 1A and C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-Y1F Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-Y1F rpb1-CTD-Y1F29|rpb1-Y1F(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-Y1F Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-Y1F rpb1-CTD-Y1F29|rpb1-Y1F(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c),assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08),assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c),assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003903 CTD-Y1F Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-Y1F rpb1-CTD-Y1F29|rpb1-Y1F(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:33711009 4896 2022-10-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001357 CTD-Y1F Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-Y1F rpb1-CTD-Y1F29|rpb1-Y1F(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 5C) PomBase SPSNRNA.07 FYPO:0001355 299-452 Overexpression 972 h- snu32 snu32-153 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 PMID:18522942 4896 2014-08-15 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0002962 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0007496 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure 3) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0007496 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure 3) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0000584 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0000059 high PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003056 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:24920274 4896 2019-11-08 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0001996 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0001996 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003161 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003161 A1274G,A1467G,A1485G,A1501G,A1527G,A1538G,A1551G,A1560G Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-DSRless nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPAC1039.07c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.07c SPAC1039.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.07c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC1039.07c SPAC1039.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 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PomBase SPBC146.01 FYPO:0000134 unknown Not assayed or wild type 972 h- med15 gal11-879 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPBC146.01 FYPO:0000223 unknown Not assayed or wild type 972 h- med15 gal11-879 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004917 1-335 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del8 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0002061 1-335 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del8 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-06 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0000082 C15A Not assayed or wild type 972 h- spt4 spt4-C15A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:19460865 4896 2015-11-26 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- rga4 rga4+ wild_type ECO:0000112 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rga4 rga4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP rga4 rga4+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002380 wild type Overexpression 972 h- rga4 rga4+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002110 wild type Overexpression 972 h- rga4 rga4+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002110 wild type Overexpression 972 h- rga4 rga4+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC14C8.02 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim44 tim44delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- tim44 tim44delta deletion ECO:0001232 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2019-11-06 PomBase SPBC776.12c FYPO:0004550 S314I Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-1312 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:11027263 4896 2019-11-06 PomBase SPBC776.12c FYPO:0003165 S314I Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-1312 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14508607 4896 2015-01-15 PomBase SPBC776.12c FYPO:0001250 S314I Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-1312 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:18799612 4896 2012-07-26 PomBase SPBC776.12c FYPO:0002909 S314I Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-1312 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.02c) PMID:15643072 4896 2014-11-03 PomBase SPBC776.12c FYPO:0004056 S314I Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-1312 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:11027263 4896 2019-11-05 PomBase SPBC776.12c FYPO:0002098 S314I Not assayed or wild 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PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000826 390-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta390-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003555 390-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta390-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 390-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta390-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 390-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta390-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 390-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta390-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003106 390-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta390-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6) pof8-∆[390-402] cells show as short telomere as pof8∆ cells. PomBase SPBC244.01c FYPO:0000168 sid4(1-305)-ppc89(280-783) Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4N-ppc89C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000117 sid4(1-305)-ppc89(280-783) Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4N-ppc89C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPBC244.01c FYPO:0006824 sid4(1-305)-ppc89(280-783) Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4N-ppc89C fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPBC19C7.09c FYPO:0000256 disruption Not assayed or wild type 972 h- uve1 uve1::ura4 disruption ECO:0000049 medium PMID:10373519 4896 2025-07-10 (Table 2) PomBase SPAC144.11 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1102 rps1102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.11 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rps1102 rps1102delta deletion ECO:0001232 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leu1-32 ade6-M216 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:12034771 4896 2016-11-17 (Fig. 5B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004700 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR ade6-M216 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:12034771 4896 2016-11-17 (Fig. 5B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005798 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR leu1-32 ade6-M210 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-17 (Fig. 4B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001586 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR leu1-32 ade6-M216 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-16 (Fig. 3C) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003702 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR ade6-M216 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:12034771 4896 2016-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003702 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR leu1-32 ade6-M216 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:12034771 4896 2016-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004731 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR leu1-32 ade6-M210 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-16 (Fig. 4B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003185 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR leu1-32 ade6-M216 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-16 (Fig. 3C) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005827 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- kanR leu1-32 ade6-M210 ura4-D18 tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-16 (Fig. 4A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007379 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 12.5 PMID:14663827 4896 2023-07-15 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 947-1147 Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1delta-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 6 PMID:14663827 4896 2023-07-15 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0004608 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001915 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 95 PMID:20833892 4896 2016-05-12 (Fig. 3B) WT 10% PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003542 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1183.12) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003542 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.06c) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003542 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.14) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000583 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0004991 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.06c) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003541 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003541 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003541 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC12D12.01) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003541 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003541 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 D22Y,R117F Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-22,117 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20833892 4896 2016-05-12 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003672 K468A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-GAT amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:14713954 4896 2014-08-15 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003630 K468A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-GAT amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:14713954 4896 2014-08-14 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 Y58* Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K14 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC2A9.04c FYPO:0003412 san1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 san1 san1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000010 wild type Overexpression 972 h- cbf11 cbf11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:19101542 4896 2012-08-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0003165 wild type Overexpression 972 h- cbf11 cbf11+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 low PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 cbf11 cbf11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- cbf11 cbf11+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 cbf11 cbf11+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC736.08 FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- cbf11 cbf11+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 low PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 1-260,551-783 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-M(261-550) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:38985524 4896 2024-07-30 GFP-Ppc89(261-550) localized to SPBs marked by Sad1-mCherry PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001645 I276A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-I276A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c),assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 2D) PomBase SPBC365.06 FYPO:0006800 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Overexpression 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPBC365.06 FYPO:0000964 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Overexpression 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37970674 4896 2023-11-17 PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-3 unknown ECO:0000049 high PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. S3) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-3 unknown ECO:0005638 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. S3) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000338 wild type Knockdown 972 h- gtb1 gtb1+ wild_type ECO:0001232 PMID:1770000 4896 2013-09-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0002018 wild type Knockdown 972 h- gtb1 gtb1+ wild_type ECO:0001232 PMID:1770000 4896 2013-09-23 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001382 N345A Not assayed or wild type 972 h- ssp2 ssp2-N345A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_enzyme(PomBase:SPCC74.03c) PMID:19474788 4896 2023-02-15 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0004903 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0000291 PMID:30102332 4896 2019-04-30 (Figures 4, 5) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000650 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0001232 PMID:30102332 4896 2019-04-29 (Figure 5) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001926 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 2) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001021 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 2a) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001689 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 2) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0005517 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 PMID:17150956 4896 2018-12-15 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000089 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-10-25 (Fig. 2b, c) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002550 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-10-25 (Fig. 2) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 1) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 1, 3b) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eaf1 eaf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- eaf1 eaf1delta deletion ECO:0005638 PMID:17150956 4896 2018-12-15 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eaf1 eaf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1906.04 FYPO:0001357 Wtf20 tethered to a deubiquitinase using the GFP–GBP interaction Ectopic 972 h- wtf20 wtf20-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2024-12-26 (Fig. S6A) PomBase SPBC119.02 FYPO:0002768 D28A Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-D28A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004839 unknown Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-ts gad8ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-18 The Ght5 protein, which is localized on the plasma membrane in the WT, fails to be localized on the plasma membrane, accumulating in the cytoplasm. PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0003743 unknown Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-ts gad8ts unknown ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001103 W33A Overexpression 972 h- pin1 pin1-W33A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:33410907 4896 2021-01-12 (Figure 5) PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0003950 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:22718908 4896 2018-11-09 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0006729 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:22718908 4896 2018-11-09 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0006733 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 high PMID:22718908 4896 2018-11-09 inferred from localization of proteins distal to origin PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:22718908 4896 2018-11-09 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1753.01c) PMID:22718908 4896 2018-11-09 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0006732 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:22718908 4896 2018-11-09 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0006732 1-1217 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1753.01c) PMID:22718908 4896 2018-11-09 PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0002933 11-510 Not assayed or wild type 972 h- mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 2D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003700 11-510 Not assayed or wild type 972 h- mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S2D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003700 11-510 Not assayed or wild type 972 h- mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S2D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0000833 11-510 Not assayed or wild type 972 h- mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0006976 11-510 Not assayed or wild type 972 h- pat1-as mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 5C) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0006976 11-510 Not assayed or wild type 972 h- pat1-as mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 5C) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003058 11-510 Not assayed or wild type 972 h- mamRNA mamRNA(11-510)delta partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 2D) PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0000470 deletion 972 h- ubp14 ubp14delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ubp14 ubp14delta deletion ECO:0005638 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lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-2SA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-22 As predicted, the 4KRA mutant did not restore lethality upon shut-off, whereas the other three mutants did (Fig. 4C) PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 M630G Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M630G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22144917 4896 2015-11-04 PomBase SPAC1420.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- cox1101 cox1101delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1420.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox1101 cox1101delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1420.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox1101 cox1101delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC61.05 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC61.05 SPCC61.05delta deletion ECO:0001232 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SPCC61.05 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC61.05 SPCC61.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC61.05 SPCC61.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC61.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC61.05 SPCC61.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC61.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC61.05 SPCC61.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1565.02c FYPO:0001118 unknown Not assayed or wild type 972 h- rga10 rga10-R123P&GAPinactive unknown ECO:0001232 PMID:34006635 4896 2021-09-05 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0003533 S112A Not assayed or wild type 972 h- gef1 gef1-S112A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31591131 4896 2019-10-16 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002527 S112A Not assayed or wild type 972 h- gef1 gef1-S112A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0004977 S112A Not assayed or wild type 972 h- gef1 gef1-S112A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0003084 G183E Not assayed or wild type 972 h- RTS1-mat1-SspI::inv-RTS1 (RTS1 moved to cenII-distal side of mat1 and inverted) rtf1 rtf1-G183E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:18723894 4896 2016-04-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006657 C292A,C295A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C292A,C295A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000263,FYECO:0000337 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000082 C292A,C295A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C292A,C295A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000080 C292A,C295A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C292A,C295A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001407 C292A,C295A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C292A,C295A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-17 PomBase SPAC821.12 FYPO:0006637 unknown 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000071 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:19646873 4896 2019-01-30 (Fig. S2) PomBase SPAC821.12 FYPO:0000024 unknown 972 h- orb6 orb6-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:19646873 4896 2012-02-21 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000708 1-229 Not assayed or wild type 972 h- rgs1 rgs1-230-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:11554925 4896 2020-12-16 PomBase SPBC3F6.03 FYPO:0001324 (-891)-(-499) Not assayed or wild type 972 h- trr1 trr1-pYUTR30 partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 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SPNCRNA.538OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1501 FYPO:0005266 II:2301759..2303132 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1501 SPNCRNA.1501(1098-2471) SPNCRNA.538OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1501 FYPO:0001214 II:2301759..2303132 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1501 SPNCRNA.1501(1098-2471) SPNCRNA.538OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1501 FYPO:0000841 II:2301759..2303132 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1501 SPNCRNA.1501(1098-2471) SPNCRNA.538OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC644.04 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pct1 pct1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.04 FYPO:0002430 deletion 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SPAC3C7.12 FYPO:0000014 wild type Overexpression 972 h- tip1 tip1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000126 PMID:11007487 4896 2016-10-28 (Fig. 1) PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006294 1-507 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(508-926) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000794 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000072,FYECO:0000075 PMID:20396879 4896 2012-03-16 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 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4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0005231 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000123,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000073 PMID:20396879 4896 2012-02-27 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000268 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000115 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- gld1 gld1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gld1 gld1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gld1 gld1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000031 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006503 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PR:000036979) PMID:29453312 4896 2018-04-19 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0004804 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 PMID:34382996 4896 2021-08-26 no assembly of vesicles by (Because cell fusion completely fails when both partner cells lack fus1) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0004804 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 PMID:25825517 4896 2015-08-10 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 deletion 972 h- h+ fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000383 PMID:34382996 4896 2021-10-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007874 deletion 972 h- h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 PMID:34382996 4896 2021-10-01 (Fig. 6,A-C) The density of vesicles was strongly reduced in the fus1Δ cells, whether this was h+ or h−, while WT h+ cells showed slightly higher vesicle density than h− cells, as in previous analysis () PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007874 deletion 972 h- h+ fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 high PMID:34382996 4896 2021-10-04 (Fig. 6, A-C) The density of vesicles was strongly reduced in the fus1Δ cells, whether this was h+ or h−, while WT h+ cells showed slightly higher vesicle density than h− cells, as in previous analysis () PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007876 deletion 972 h- h+ fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 PMID:34382996 4896 2021-10-04 Interestingly, the reduction in local secretion correlates with a strong loss of the wPM phenotype (Fig. 6, A and B; Fig. S4, E and F; and Fig. S5): only 4% of h+ fus1Δ cells (1/27) showed wPM, whereas 73% (16/22) and 20% (4/20) of h+ WT showed wPM in WT × WT and WT × fus1Δ crosses, respectively PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006587 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:34382996 4896 2021-10-01 (Fig. 6 E and Fig. S4 D) By LM, Myo52 and Exo84 also showed strong signal reduction in fus1Δ . PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006587 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:34382996 4896 2021-10-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006587 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.08c) PMID:34382996 4896 2021-10-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006589 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2017-12-22 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006081 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC631.01c) PMID:31495586 4896 2019-10-25 Figure S2 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000573 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 PMID:9606213 4896 2021-02-04 (Fig. 1) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:19627505 4896 2014-02-19 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph fus1 fus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006672 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 low PMID:30089908 4896 2018-09-04 (Fig. 1a) type IIIb PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- fus1 fus1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20G4.02c 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PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000421 P116W,G117W Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-P116G117/WW amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 4896 2014-08-01 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0002768 P116W,G117W Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-P116G117/WW amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.20c) PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0002127 P116W,G117W Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-P116G117/WW amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000099 P116W,G117W Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-P116G117/WW amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0006289 wild type Overexpression 972 h- elo2 elo2+ wild_type ECO:0000335 PMID:30975915 4896 2019-05-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 M2171* Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9356477 4896 2015-03-17 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-332 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27(333-372) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-332 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27(333-372) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 1-332 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27(333-372) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001147 R113A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R113A amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure S2B) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000776 R113A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R113A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 R113A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R113A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000111 R113A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R113A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 low PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0004811 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:30076928 4896 2020-09-26 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0000227 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:30076928 4896 2020-09-26 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0000229 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 22 PMID:30076928 4896 2020-09-28 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0003029 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:30076928 4896 2020-09-26 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0003029 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:30076928 4896 2020-09-26 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0003049 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:30076928 4896 2020-09-28 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0002061 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:30076928 4896 2020-09-28 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0001387 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30076928 4896 2020-09-26 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0001357 A394E Not assayed or wild type 972 h- rna14 rna14-A394E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30076928 4896 2020-09-28 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 H12R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-H12R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:9622480 4896 2015-12-01 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001645 174-188 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 cyr1delta174-188 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC23H3.13c),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.03) PMID:15831585 4896 2017-07-20 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001023 S365A Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 The rad52-S365A-YFP was slightly sensitive to HU and CPT, but not to MMS and cisPt. PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000957 S365A Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 The rad52-S365A-YFP was slightly sensitive to HU and CPT, but not to MMS and cisPt. PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000085 S365A Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 The rad52-S365A-YFP was slightly sensitive to HU and CPT, but not to MMS and cisPt. PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 S365A Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 The rad52-S365A-YFP was slightly sensitive to HU and CPT, but not to MMS and cisPt. PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000941 G505A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-G505A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000118 G505A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-G505A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0005174 deletion 972 h- fur4 fur4delta deletion ECO:0000335 PMID:26536126 4896 2016-01-20 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0001986 deletion 972 h- fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 PMID:9730284 4896 2013-02-14 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0001986 deletion 972 h- fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 PMID:26536126 4896 2015-12-30 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph fur4 fur4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1399.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- fur4 fur4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1399.03 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PomBase SPBC582.03 FYPO:0003350 1-81 Overexpression 972 h- cdc13 cdc13delta1-81 cdc13-delta81|cdc13delta81 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:16824200 4896 2014-05-13 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004332 1-81 Overexpression 972 h- cdc13 cdc13delta1-81 cdc13-delta81|cdc13delta81 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11683390 4896 2016-10-24 (Fig. 6) Cdc2YFP and non-degradable Cdc13YFP remain associated with spindle, SPB.Cdc13 degradation is abolished rather than delayed PomBase SPBC582.03 FYPO:0003351 1-81 Overexpression 972 h- cdc13 cdc13delta1-81 cdc13-delta81|cdc13delta81 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:16824200 4896 2014-05-13 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003349 1-81 Overexpression 972 h- cdc13 cdc13delta1-81 cdc13-delta81|cdc13delta81 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:16824200 4896 2014-05-13 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2023-06-28 PomBase SPAC1039.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.03 SPAC1039.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.03 SPAC1039.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.03 SPAC1039.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1039.03 SPAC1039.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1039.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1039.03 SPAC1039.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1039.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. 2A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S7A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A rpb1-CTD-S7A29|rpb1-S7A|rpb1-S7A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 7B) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S7A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A rpb1-CTD-S7A29|rpb1-S7A|rpb1-S7A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 3A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S7A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A rpb1-CTD-S7A29|rpb1-S7A|rpb1-S7A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 5) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S7A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A rpb1-CTD-S7A29|rpb1-S7A|rpb1-S7A(1-29) 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gms2 gms2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.17 FYPO:0006613 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 rna14 rna14+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000339 assayed_using(PomBase:SPAC1705.03c),assayed_using(PomBase:SPAC19B12.02c) PMID:31615333 4896 2020-09-19 (Figure 2 and 3) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003440 L916H,W1048C Not assayed or wild type 972 h- ync13 ync13-19 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:30044717 4896 2019-05-03 (Fig. S4C) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003440 L916H,W1048C Not assayed or wild type 972 h- ync13 ync13-19 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:30044717 4896 2019-05-03 (Fig. S4C) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 N50NRGTPN Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K3 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0006141 deletion 972 h- coa5 coa5delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 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2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.16 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph coa5 coa5delta deletion ECO:0005638 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assayed or wild type 972 h- hmg1 hmg1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:23145048 4896 2013-06-20 PomBase SPCC162.09c FYPO:0002060 W234* Not assayed or wild type 972 h- hmg1 hmg1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000025 PMID:19486165 4896 2016-10-31 (Fig. 5A) PomBase SPBC216.06c FYPO:0006436 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:23071723 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.06c FYPO:0006436 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0005580 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPBC216.06c FYPO:0003080 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0000337 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPBC216.06c FYPO:0003084 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0000337 PMID:12840005 4896 2016-04-08 PomBase SPBC216.06c FYPO:0005356 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown 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unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0000337 PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 4) PomBase SPBC216.06c FYPO:0006437 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:23071723 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.06c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6D) PomBase SPBC216.06c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6D) PomBase SPBC216.06c FYPO:0000085 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000085 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown ECO:0005638 high PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 6) PomBase SPBC216.06c FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-111 unknown 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h- mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9852154 4896 2012-10-11 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002027 S873F Not assayed or wild type 972 h- Pnmt1-mad2 mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000381 85 PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 4) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006023 S873F Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:40161431 4896 2025-04-08 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002061 S873F Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 S873F Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002060 S873F Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC962.02c FYPO:0000964 bir1-CFP-swi6(69-215) Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-8D-CD fusion_or_chimera ECO:0005638 high PMID:20739936 4896 2020-02-11 suppressed at comparable level to Bir1-CD, These results indicate that once they are tethered at centromeres, the functionality is indistinguishable between Bir1 and Bir1-8A. Supporting this conclusion, complex formation of the CPC was intact in bir1-8A cells (Supplementary Fig. 7). PomBase SPAC890.02c FYPO:0001944 300-474 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1-1-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0006725 300-474 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1-1-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPAC1486.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npt1 npt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1486.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- npt1 npt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1486.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npt1 npt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.09c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kin17 kin17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kin17 kin17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- kin17 kin17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC365.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kin17 kin17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0002223 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0001914 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0000681 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 PMID:8082199 4896 2014-08-08 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003379 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0000112 PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003379 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 PMID:21389117 4896 2016-04-22 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0000583 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0000583 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0004633 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003550 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0004632 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0004631 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mes1 mes1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mes1 mes1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0004634 deletion 972 h- mes1 mes1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mes1 mes1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mes1 mes1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mes1 mes1delta deletion ECO:0005638 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wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-231 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1020.04c) PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0006812 M231T Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-231 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.01) PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0006812 M231T Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-231 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.15) PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0001234 M231T Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-231 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPAC688.10 FYPO:0005330 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta rev3 rev3delta deletion ECO:0000049 high PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPAC688.10 FYPO:0005331 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta rev3 rev3delta deletion ECO:0000049 low PMID:20453833 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PMID:34019809 4896 2021-09-05 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0008290 F77A Not assayed or wild type 972 h- spo13 spo13-F77A F79A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1183.12) PMID:20130084 4896 2024-08-12 The pull-down assay revealed that GST- SpSpo13F79A still bound to the nucleotide-free form of ScSec4 but at a lower level than wild-type GST-SpSpo13 (Figure 5A). In the GEF assay, adding GST-SpSpo13F79A did not stimulate mant-GDP dissociation, indicating that the mutant protein has lost GEF activity in vitro (Figure 5B). PomBase SPCC1183.12 FYPO:0001915 F77A Not assayed or wild type 972 h- spo13 spo13-F77A F79A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1183.12) PMID:20130084 4896 2024-08-12 . Growing FSMs were observed adjacent to each of the SPBs in 100% of the cells expressing wild-type Spspo13+ (n = 20), but no FSMs were formed in cells expressing Spspo13-F79A (Figure 7) (n = 20). The GEF activity of SpSpo13 is therefore required for FSM assembly in S. pombe. PomBase SPCC1183.12 FYPO:0003541 F77A Not assayed or wild type 972 h- spo13 spo13-F77A F79A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1183.12) PMID:20130084 4896 2024-08-12 The localization of SpSpo13F79A-mRFP was indistinguishable from the wild-type protein (Figure 6C), indicating that the mutant protein is expressed and properly localized. PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0000082 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0005638 PMID:24035542 4896 2014-12-10 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0001407 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0005638 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph hsp104 hsp104delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000004 PMID:25543137 4896 2015-07-30 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0004809 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000004 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0000888 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0007299 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP hsp104 hsp104delta deletion ECO:0001232 PMID:32075773 4896 2020-03-22 (Fig. 2B, S2B-D) PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0004810 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:25543137 4896 2015-07-30 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0007784 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0001232 PMID:33946513 4896 2021-05-15 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16D10.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- hsp104 hsp104delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 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PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000941 1-633 Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-634-683 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 1-633 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-634-683 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 1-633 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-634-683 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 1-633 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-634-683 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC800.09) PMID:12615979 4896 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lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0007917 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0000335 PMID:35008733 4896 2022-01-18 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lac1 lac1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0007916 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0000335 PMID:35008733 4896 2022-01-18 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0005593 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0000335 PMID:35008733 4896 2022-01-17 Additionally, the pattern of complex sphingolipids in Lac1-depleted cells shows a strong accumulation of IPC and the appearance of new bands that might correspond to different IPC species PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0006133 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0000335 PMID:35008733 4896 2022-01-17 (Fig. 5b) We detected an accumulation of PHS and sphingoid bases-1-phosphate levels (PHS-1P or DHS-1P) PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000650 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000239 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000245 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0006378 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1A6.09c) PMID:35008733 4896 2022-01-18 (Fig. 3) Live cell imaging revealed that GFP-Lac1 and Lag1-GFP remain localized at the ER in the absence of Lag1 or Lac1 respectively, indicating that their ER localizations are not interdependent. PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0004325 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph lac1 lac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0006823 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103 high PMID:35008733 4896 2022-01-17 Live cell imaging revealed that GFP-Lac1 and Lag1-GFP remain localized at the ER in the absence of Lag1 or Lac1 respectively, indicating that their ER localizations are not interdependent. PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3E7.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lac1 lac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC9B6.09c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP mdl1 mdl1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003997 E586A Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-E586A amino_acid_mutation ECO:0005801 low PMID:16720577 4896 2014-11-13 PomBase SPAC7D4.08 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.08 SPAC7D4.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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mti3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0001309 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mti3 mti3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0001409 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0001409 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0000962 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0005638 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0007121 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000186 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0004529 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:31350787 4896 2019-10-29 (Fig. 5) PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- mti3 mti3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mti3 mti3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18E5.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mti3 mti3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000303 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000476 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000255 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000067 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000073 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000087 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 caf2-3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC409.21 FYPO:0002107 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec66 sec66delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.21 FYPO:0002061 deletion 972 h- sec66 sec66delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC409.21 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec66 sec66delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003481 pom1delta(10-303)-cdr2(252-352) Not assayed or wild type 972 h- pom1 pom1delta305N-cdr2C-chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:24316795 4896 2014-03-11 PomBase SPNCRNA.1039 FYPO:0005258 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1039 SPNCRNA.1039+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1039 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1039 SPNCRNA.1039+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1039 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1039 SPNCRNA.1039+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1039 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1039 SPNCRNA.1039+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1039 FYPO:0000077 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1039 SPNCRNA.1039+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1039 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1039 SPNCRNA.1039+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC405.01 FYPO:0000747 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade1 ade1- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBC887.07 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl38 mrpl38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- mrpl38 mrpl38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC887.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl38 mrpl38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.07 FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl38 mrpl38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.02 FYPO:0003891 S188A Not assayed or wild type 972 h- rec14 rec14-cdk-site2 rec14-cdk2 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:30640914 4896 2019-02-04 PomBase SPBC4B4.09 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp39 prp39-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBC4B4.09 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp39 prp39-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBC4B4.09 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp39 prp39-1 unknown ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 However, at the permissive temperature of 25°C (at which centromeric silencing was alleviated), splicing efficiency was similar to that in wild-type cells (Fig. 2A). PomBase SPAC10F6.01c FYPO:0000037 unknown Not assayed or wild type 972 h- sir1 sir1- unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17622533 4896 2013-09-20 PomBase SPAC10F6.01c FYPO:0000040 unknown Not assayed or wild type 972 h- sir1 sir1- unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17622533 4896 2013-09-20 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 G160A,C164A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160A,C164A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003542 deletion 972 h- mob1-R4 cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:24838944 4896 2025-04-15 (Fig. 2C) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000941 deletion 972 h- cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10381387 4896 2021-02-26 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0003541 deletion 972 h- mob1-R4 cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:24838944 4896 2025-04-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002967 deletion 972 h- cdc16 cdc16delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10381387 4896 2021-02-26 PomBase SPBC1E8.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1E8.03c SPBC1E8.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1E8.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1E8.03c SPBC1E8.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1E8.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1E8.03c SPBC1E8.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 1-368 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-C369-432 bqt4C369-432 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 The Bqt4 fragment containing the helix domain and the adjacent intrinsically disordered sequence (Bqt4C369-432) reproduced the behavior of full-length Bqt4 (Fig. 1A), that is, localization to the NE and responses to BZ, both in the presence and absence of Bqt3 (Fig. 6A, Bqt4C369-432). PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001592 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:18357653 4896 2015-01-08 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0005226 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC18H10.20c) PMID:35639710 4896 2022-06-14 Second, Any1R175C does not show an increase but rather a strong decrease in its ubiquitination level. PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000425 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000208 assayed_protein(PomBase:SPAC869.11) PMID:35639710 4896 2022-06-14 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0002714 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC869.11) PMID:36626373 4896 2023-02-26 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001029 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18357653 4896 2013-09-18 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001029 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:36626373 4896 2023-02-22 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001029 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000253 high PMID:35639710 4896 2022-06-14 (Figure 1) PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001029 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:2020549 4896 2012-05-16 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001029 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:2020549 4896 2012-05-16 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001029 R175C Not assayed or wild type 972 h- any1 can1-1 any1-R175C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:35300005 4896 2022-03-24 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001690 K78R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K78R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 K78R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K78R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 K78R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K78R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 K78R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K78R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 K78R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-K78R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPCC553.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0005324 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta kpa1 kpa1delta deletion ECO:0000049 low PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPCC553.07c FYPO:0005331 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta kpa1 kpa1delta deletion ECO:0000049 low PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPCC553.07c FYPO:0003445 deletion 972 h- kpa1 kpa1delta deletion ECO:0001232 PMID:20404181 4896 2014-06-11 PomBase SPCC553.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC553.07c FYPO:0005329 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta kpa1 kpa1delta deletion ECO:0000049 PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPCC553.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC553.07c FYPO:0001420 deletion 972 h- kpa1 kpa1delta deletion ECO:0001232 PMID:20404181 4896 2014-06-13 PomBase SPCC553.07c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0007330 deletion 972 h- kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:32034465 4896 2020-03-31 PomBase SPCC553.07c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 kpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph kpa1 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972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kpa1 kpa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC553.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kpa1 kpa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001422 G84V Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GVKGG) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 G84V Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GVKGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 processing defective, does not complement sde2Δ PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000620 1-80 Overexpression 972 h- cut2 cut2delta80N cdc2-delta80N|cut2-delta80N|cut2-deltaN80|cut2delta80 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16483313 4896 2016-04-19 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002061 1-80 Overexpression 972 h- cut2 cut2delta80N cdc2-delta80N|cut2-delta80N|cut2-deltaN80|cut2delta80 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16483313 4896 2016-04-19 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002061 1-80 Overexpression 972 h- cut2 cut2delta80N cdc2-delta80N|cut2-delta80N|cut2-deltaN80|cut2delta80 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9312055 4896 2017-02-02 (Fig. 1b) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 wild type Overexpression 972 h- chp2 chp2+ clo2 wild_type ECO:0000049 high PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 9A) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003573 wild type Overexpression 972 h- chp2 chp2+ clo2 wild_type ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 9C) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007633 wild type Overexpression 972 h- chp2 chp2+ clo2 wild_type ECO:0000226 PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 9D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001859 wild type Overexpression 972 h- chp2 chp2+ clo2 wild_type ECO:0000049 PMID:11129054 4896 2023-07-02 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000087,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000088,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000089,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000138 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001355 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000085,FYECO:0000138 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001357 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000085,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001357 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001357 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000086,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001357 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000084,FYECO:0000137 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC30D10.13c FYPO:0001357 unknown 972 h- pdb1 agg1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000084,FYECO:0000138 PMID:7851743 4896 2012-03-22 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000032 506-695 Not assayed or wild type 972 h- rga7 rga7-FBD-AH1-3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 Fig 3 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0005551 506-695 Not assayed or wild type 972 h- rga7 rga7-FBD-AH1-3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000647 506-695 Not assayed or wild type 972 h- rga7 rga7-FBD-AH1-3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000658 K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-4A amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:32204793 4896 2020-04-15 (Figure 6—Figure supplement 1) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0001645 K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-4A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:32204793 4896 2020-04-15 (Figure 5B; Figure 5—Figure supplement 1C) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0007346 K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:32204793 4896 2020-04-23 (Figure 7A,B) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0004502 K157A,R158A,K160A,R161A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-4A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 PMID:32204793 4896 2020-05-01 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0004964 wild type Overexpression 972 h- gmf1 gmf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-20 (Fig. 1B) PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0005430 wild type Overexpression 972 h- gmf1 gmf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-08 (Fig. 1B) PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0007151 wild type Overexpression 972 h- gmf1 gmf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-08 (Fig. 1B) oreover, actin cables often significantly overgrew in these cells while the actin ring formation seemed to be unaffected. PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0004652 wild type Overexpression 972 h- gmf1 gmf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-08 (Fig. 1B) PomBase SPBC36.12c FYPO:0005288 S345SSYTESNGTALSTNWKDVKS Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-93 amino_acid_insertion ECO:0000049 PMID:12456004 4896 2017-07-26 PomBase SPBC36.12c FYPO:0000094 S345SSYTESNGTALSTNWKDVKS Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-93 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12456004 4896 2017-07-26 PomBase SPBC36.12c FYPO:0006822 S345SSYTESNGTALSTNWKDVKS Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-93 amino_acid_insertion ECO:0001232 PMID:12456004 4896 2017-07-26 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0003770 unknown Not assayed or wild type 972 h- spk1 spk1-sterile unknown ECO:0000049 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPMTR.02) PMID:7975894 4896 2012-09-25 PomBase SPBC582.07c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn7 rpn7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.07c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn7 rpn7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- rpn7 rpn7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC582.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpn7 rpn7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC582.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn7 rpn7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 120-176 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaMyb partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:26063574 4896 2017-11-08 PomBase SPAC630.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC630.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC630.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC630.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC630.07c SPAC630.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.06 FYPO:0007841 Y135A Not assayed or wild type 972 h- naa30 naa30-Y135A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:34019809 4896 2021-09-05 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0002177 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf2 rgf2-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19189958 4896 2022-01-06 As expected, over-expression of the rgf2-PTTRD mutant in a pREP3X vector produced viable cells and no multiseptated phenotype was seen, even at very long times of derepresion in the absence of thiamine (Figure 4A). PomBase SPAC22E12.06c FYPO:0006807 gmh3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gmh3 gmh3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:9839953 4896 2019-07-24 PomBase SPAC22E12.06c FYPO:0006806 gmh3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gmh3 gmh3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:9839953 4896 2019-07-24 PomBase SPAC22E12.06c FYPO:0001357 gmh3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gmh3 gmh3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:9839953 4896 2019-01-09 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001164 GFP-pps1 Not assayed or wild type 972 h- pps1 GFP-pps1 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17905925 4896 2012-09-27 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001690 T78A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T78A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000957 T78A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T78A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003183 T78A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T78A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001357 T78A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T78A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0000190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp42 arp42delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp42 arp42delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 arp42 arp42delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0000082 deletion 972 h- arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0000080 deletion 972 h- arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph arp42 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SPAC23D3.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- arp42 arp42delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 arp42 arp42delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC23D3.09 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp42 arp42delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 L185A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L185A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 L185A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L185A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC409.04c FYPO:0004308 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 (Fig. 6D): Mis12 is thus required for maintaining the inner centromere structure. PomBase SPBC409.04c FYPO:0004481 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC409.04c FYPO:0001269 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 4a) PomBase SPBC409.04c FYPO:0001269 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:17442892 4896 2014-12-19 PomBase SPBC409.04c FYPO:0001269 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB17E12.06) PMID:22711988 4896 2012-07-27 PomBase SPBC409.04c FYPO:0000082 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPBC409.04c FYPO:0000082 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:12535531 4896 2018-02-28 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002902 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1805.07c) PMID:17352737 4896 2015-02-11 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002902 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC688.02c) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC409.04c FYPO:0001837 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPBC409.04c FYPO:0000786 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-16 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002061 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 1a) PomBase SPBC409.04c FYPO:0006715 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2021-12-20 (Figure 1A,B) PomBase SPBC409.04c FYPO:0000284 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC409.04c FYPO:0000284 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC409.04c FYPO:0006190 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 (Figure 1A,B) PomBase SPBC409.04c FYPO:0003787 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 PomBase SPBC409.04c FYPO:0001387 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002141 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002360 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:35970865 4896 2022-10-06 . These results demonstrate that kinetochore mutants with the intact inner kinetochore architecture retained the ability to silence transcription at the central core region. PomBase SPBC409.04c FYPO:0001164 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 3a) PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 3a) PomBase SPBC409.04c FYPO:0000964 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC409.04c FYPO:0004314 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPBC409.04c FYPO:0008025 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35970865 4896 2022-10-06 during M-phase Mis15 localises to the inner regions of centromeres as does Mis6, while Mis12 and Nuf2 localise to the outer regions relative to Mis6, and Mis6 localised to centromeres in the mis12 and nuf2 mutants but not in the mis15 mutant (Supplementary Fig. 6) PomBase SPBC409.04c FYPO:0007234 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002574 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002901 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002901 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002901 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.14) PMID:12242294 4896 2016-03-02 data not shown PomBase SPBC409.04c FYPO:0002901 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:10864871 4896 2015-01-15 PomBase SPBC409.04c FYPO:0002901 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:10398680 4896 2021-12-20 (Figure 6) Hence, mis6-HA could interact with the centromere in the absence of functional Mis12. PomBase SPBC409.04c FYPO:0003788 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 (Fig. 1a) PomBase SPBC409.04c FYPO:0000678 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 18.3 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC409.04c FYPO:0003241 G52E Not assayed or wild type 972 h- mis12 mis12-537 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 (Figure 1F,7B) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002527 S121D,S122D,S264D,S345D,S418D Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-S5D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:22419817 4896 2013-09-05 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001352 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0001232 PMID:12944481 4896 2014-10-13 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0003661 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000059 PMID:10373582 4896 2014-08-07 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mre11 mre11delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mre11 mre11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005268 deletion 972 h- cdc10-M17 mre11 mre11delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000137,FYECO:0000288 PMID:12944482 4896 2016-05-11 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005268 deletion 972 h- cdc10-M17 mre11 mre11delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211,FYECO:0000291 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000006 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000112 PMID:21098122 4896 2014-06-24 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000913 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0001232 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001118 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 68 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005453 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000337 PMID:17724078 4896 2016-06-24 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005140 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000337 PMID:15238514 4896 2015-12-11 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0003486 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0003486 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:29851556 4896 2019-05-08 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005616 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:29851556 4896 2019-05-08 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005451 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-24 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000278 deletion 972 h- h90 mre11 mre11delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 the h90 rad50D or h90 mre11D (data not shown) mutant forms small colonies. However, these colonies contain many dead cells and few spores. 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ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Pdelta17 mre11 mre11delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0005638 PMID:7885834 4896 2014-04-24 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- mre11 mre11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mre11 mre11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mre11 mre11delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC56F2.08c FYPO:0001896 wild type Overexpression 972 h- puf1 puf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 6a) PomBase SPBC56F2.08c FYPO:0007320 wild type Overexpression 972 h- puf1 puf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 PomBase SPBC56F2.08c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- puf1 puf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 7) PomBase SPBC56F2.08c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP puf1 puf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0008228 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000059 PMID:37949217 4896 2024-05-08 Xpr1-dependent Pi export is accelerated by either Δpqr1 or Δvtc4. Importantly, the elevation of Pi export activity in Δpqr1 and Δvtc4 is synergistic. In Δpqr1Δvtc4, exported Pi was far greater than that in the single mutant (Fig. 5D PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC16E9.16c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1289.14) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c 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vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC15E1.02c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC354.12) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC21C3.19) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.14) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC637.03) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC725.10) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC23G7.13c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC660.06) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.09c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23H3.15c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.01c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB8B6.04c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC737.04) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC839.15c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC22A12.17c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC26H5.09c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC24C6.09c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23A1.10) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC338.12) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1815.01) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC26F1.14c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1805.10) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.01) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1020.06c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0008269 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000335 medium PMID:37949217 4896 2024-05-08 (Figure 1A) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0008027 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005801 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 12B) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.04c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Fig. 2) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Fig. 2) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.06) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Fig. 2) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.06) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC750.01) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.04c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.13) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000825 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.15c) PMID:36820394 4896 2023-04-11 (Table 1) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0003267 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 11B) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0002801 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127,FYECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0004083 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC1827.07c) PMID:37949217 4896 2024-05-08 We found that Xpr1-GFP did not increase in Δpqr1, Δvtc4, or Δpqr1Δvtc4 (Fig. 5G). Accelerated Pi export in these mutants may not be caused by increased amounts of Xpr1 protein. PomBase SPCC1322.14c FYPO:0005572 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC1827.07c) PMID:37949217 4896 2024-05-08 In the mutants, Xpr1- GFP was similarly localized to the cell periphery, suggesting that accelerated Pi export in these mutants may not be caused by dynamic alteration of the localization of the exporter, Xpr1 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001357 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 11A) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007629 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007820 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-16 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007820 deletion 972 h- vtc4 vtc4delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 13) PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph vtc4 vtc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.14c 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2023-06-28 PomBase SPBC25H2.03 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph vac14 vac14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph vac14 vac14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph vac14 vac14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph vac14 vac14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph vac14 vac14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.03 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vac14 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partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 101-400,801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 6 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001368 101-400,801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 2H) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000644 101-400,801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000703 101-400,801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. S2A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002253 101-400,801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC330.04c FYPO:0001645 I235M,R255K Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-BIRm amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 4C) PomBase SPCC330.04c FYPO:0001645 I235M,R255K Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-BIRm amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC631.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. S9D) PomBase SPCC338.13 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog4 cog4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- cog4 cog4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC338.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog4 cog4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-375,782-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,782-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-375,782-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,782-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-375,782-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,782-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0003310 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-20 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PomBase SPCC417.07c FYPO:0004511 DNLRKEVFG259AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 1E) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005707 DNLRKEVFG259AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0002967 DNLRKEVFG259AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005709 DNLRKEVFG259AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0002112 DNLRKEVFG259AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 1C) PomBase SPAC1556.01c 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rad50 rad50S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:19150433 4896 2017-02-01 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000267 K81I Not assayed or wild type 972 h- rad50 rad50S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:19150433 4896 2017-02-01 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000089 K81I Not assayed or wild type 972 h- rad50 rad50S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:19150433 4896 2017-02-01 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000089 K81I Not assayed or wild type 972 h- rad50 rad50S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:19150433 4896 2017-02-01 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,Q775* Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-18 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,Q775* Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-18 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,P510S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,P510S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003066 191-268 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaRF dma1-RFm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 ~60 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000583 191-268 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaRF dma1-RFm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 ~20 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005781 191-268 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaRF dma1-RFm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12479804 4896 2019-01-30 Table1 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000940 191-268 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaRF dma1-RFm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 20 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 3E, 3F) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002442 191-268 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaRF dma1-RFm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 3E, 3F) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000703 191-268 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaRF dma1-RFm partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 4C) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003055 1058-1586 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2deltaE partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003049 1058-1586 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2deltaE partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) 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assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-mini mini_cnx1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 PMID:25803873 4896 2018-02-09 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0004164 23-437 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-mini mini_cnx1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 PMID:25803873 4896 2018-02-09 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0000539 23-437 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-mini mini_cnx1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0001387 23-437 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-mini mini_cnx1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0000245 23-437 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-mini mini_cnx1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:25803873 4896 2018-02-09 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0001178 23-437 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-mini mini_cnx1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:25803873 4896 2018-01-12 PomBase 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0006978 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001422 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000135,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.10) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.07) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.14c) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0008128 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001919 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 high PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 2A) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0005760 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1B) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002006 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0003004 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 3C) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000377 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-01 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0003335 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000034,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-19 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0006597 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-26 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0006596 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-26 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0005823 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-14 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0005824 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-14 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0003776 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-19 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001437 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1B) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPRRNA.01) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000441 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1A) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000441 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22349564 4896 2021-01-27 Similarly to the Δcbp3 and Δcbp6 mutants, Δmss51 cells were resistant to antimycin A on glucose medium, showing that they contain a functional complex V PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001103 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000440 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1B) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000440 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 PMID:21727087 4896 2011-08-23 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000098 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001245 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0005825 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-14 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0001214 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0003810 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 high PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 3A) PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC11E10.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr6 ppr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0003020 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0003329 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002859 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0003327 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001382 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 high PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001382 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17317928 4896 2017-08-16 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002557 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002557 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001838 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002021 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000650 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002187 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002061 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002401 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:38442865 4896 2024-05-29 (Fig. S1E and F) PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0003328 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0003326 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002442 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0003330 T198I Not assayed or wild type 972 h- 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000091 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 high PMID:38442865 4896 2024-05-29 (Fig. S1) PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000021 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000024 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001491 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002060 T198I Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-125 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0004656 wild type Overexpression 972 h- tel1 tel1+ wild_type ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0002687 wild type Overexpression 972 h- tel1 tel1+ 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FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000091 deletion 972 h- msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0003241 deletion 972 h- msd1 msd1delta deletion ECO:0000340 1.8 PMID:17486116 4896 2014-09-05 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- msd1 msd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msd1 msd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- msd1 msd1delta deletion ECO:0005638 PMID:17486116 4896 2014-09-05 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msd1 msd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- msd1 msd1delta deletion ECO:0001232 high PMID:17486116 4896 2014-09-05 PomBase SPBC1289.03c FYPO:0002901 unknown Not assayed or wild type 972 h- spi1 spi1-25 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:15371542 4896 2014-12-19 PomBase SPBC106.01 FYPO:0008164 cnp3C fusion Overexpression 972 h- mph1 cnp3C-mph1 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 1E) PomBase SPBC106.01 FYPO:0002638 cnp3C fusion Overexpression 972 h- mph1 cnp3C-mph1 fusion_or_chimera ECO:0000059 PMID:22660415 4896 2016-07-19 The expression of this fusion protein impairs normal cell growth because of robust SAC activation (Supplementary Fig. S1b,c) PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0006505 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 mam2 mam2- unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:9606213 4896 2021-02-24 Therefore, in a h90 mam2 strain, the P cells will attempt mating, but the M cells will be unable to respond due to the lack of the P-factor receptor and so the cells will fail to initiate fusion PomBase SPBC336.16 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.16 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC336.16 SPBC336.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.09 FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen54 sen54delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- sen54 sen54delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC613.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sen54 sen54delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.02c FYPO:0001972 wild type Overexpression 972 h- bir1 bir1+ Pnmt1-81::bir1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10571085 4896 2014-09-29 PomBase SPCC962.02c FYPO:0003165 wild type Overexpression 972 h- bir1 bir1+ Pnmt1-81::bir1+ wild_type ECO:0001232 4 PMID:10571085 4896 2014-09-29 PomBase SPCC962.02c FYPO:0001253 wild type Overexpression 972 h- bir1 bir1+ Pnmt1-81::bir1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10571085 4896 2014-09-29 PomBase SPCC962.02c FYPO:0000284 wild type Overexpression 972 h- bir1 bir1+ Pnmt1-81::bir1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPCC962.02c FYPO:0003241 wild type Overexpression 972 h- bir1 bir1+ Pnmt1-81::bir1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000004 40 PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000620 deletion 972 h- nda3-KM311 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000059 PMID:9864354 4896 2019-10-30 indicated by high level of H1 kinase activity PomBase SPAC664.01c FYPO:0000156 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000217 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000059 PMID:38285941 4896 2024-04-08 Compared to WT, swi6Δ cells showed a considerable decrease in BrdU incorporation across mat, which persisted through the time course (Fig. 2D and SI Appendix, Fig. S3). Mcm2 was still detected, although with more defined peaks, likely reflecting licensed, but not activated, replication ori­ gins across the domain (Fig. 2D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000468 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000059 low PMID:11780129 4896 2024-04-12 (Fig. 3b, data not shown) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000468 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000231 high PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 5C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003659 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC664.01c FYPO:0001131 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003066 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 8 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0007334 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 PMID:39945308 4896 2025-03-18 (Fig. 1F) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000634 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31000521 4896 2020-03-03 (Fig. 5B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000634 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.03) PMID:20929775 4896 2011-12-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000634 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.02) PMID:20929775 4896 2011-12-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003744 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03),assayed_region(SO:0001898) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003744 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 To test the hypothesis that the nuclear dot localization of Ers1 was attributable to an interaction with H3K9me-bound CD proteins, EGFP-Ers1WT localization was next examined in swi6Δ, chp1Δ, and chp2Δ cells. The localization of EGFP-Ers1WT was clearly abolished in swi6Δ cells similar to that observed in clr4Δ, whereas WT localization patterns were retained in the chp1Δ and chp2Δ cells (Fig. 4C and Fig. S4C). PomBase SPAC664.01c FYPO:0008153 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 Interestingly, Swi6 was required for the localization of Chp2 to the mating-type region or telomeres but not to the centromeres (Figure 2B, Dswi6). PomBase SPAC664.01c FYPO:0008153 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0008153 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:16762840 4896 2024-01-17 Moreover, ChIP analysis revealed that mutation in Swi6 or an H3K9-specific methyltransferase Clr4 abolished Epe1 localization at centromeres, telomeres, and the mat locus, concurrent with loss of Swi6 at these loci (Figure 3B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:16762840 4896 2024-01-17 In swi6 mutant background, Epe1-GFP was no longer localized to discrete spots at the nuclear periphery (Figure 3A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC830.03) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1393.06c) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.08c) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.12c) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001132 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.18) PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003074 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC31F10.13c) PMID:21211723 4896 2024-01-17 ChIP-chip showed that Hip1 was enriched throughout heterochromatin domains in the wild-type cells (Figure 2D, 2E, and S3). In the absence of Swi6, Hip1 localization was restricted to transcribed dg/dh repeats, and it failed to spread outward to the surrounding sequences (Figure 2D, 2E, and S3). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003074 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPAC110.02) PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003074 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:16762840 4896 2024-01-17 Moreover, ChIP analysis revealed that mutation in Swi6 or an H3K9-specific methyltransferase Clr4 abolished Epe1 localization at centromeres, telomeres, and the mat locus, concurrent with loss of Swi6 at these loci (Figure 3B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0005396 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 Interestingly, Swi6 was required for the localization of Chp2 to the mating-type region or telomeres but not to the centromeres (Figure 2B, Dswi6). PomBase SPAC664.01c FYPO:0005396 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0005396 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:16762840 4896 2024-01-17 Moreover, ChIP analysis revealed that mutation in Swi6 or an H3K9-specific methyltransferase Clr4 abolished Epe1 localization at centromeres, telomeres, and the mat locus, concurrent with loss of Swi6 at these loci (Figure 3B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000273 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006362 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 6) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003094 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004201 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 medium PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 3A and B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0004201 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 6) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006684 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006684 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002834 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 high PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 5A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002834 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 high PMID:19136623 4896 2024-07-02 The extent of the silencing defects in ckb1D cells was comparable with that caused by disruption of other heterochromatic genes, including clr4, a histone H3K9-specific histone methyltransferase; clr3, a histone deacetylase and a subunit of SHREC; and swi6, a HP1 homolog (Fig. 1B). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003411 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003411 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:31000521 4896 2020-02-19 (Fig. 7B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 low PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. 1) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 low assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 low assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 2A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 high PMID:39945308 4896 2025-03-18 (Fig. 4C and 4E) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 high PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 high PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1G) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 complete high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 1) PomBase SPAC664.01c FYPO:0004604 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 high PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004604 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004604 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:26205977 4896 2016-07-13 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003352 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC664.01c FYPO:0007009 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 4) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002611 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000877 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002355 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:22683269 4896 2013-07-19 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002355 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002355 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:26438724 4896 2018-02-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004137 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:26438724 4896 2018-02-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000470 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000460 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:20929775 4896 2011-08-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000460 deletion 972 h- cut9- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 32 PMID:12526748 4896 2020-03-25 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003681 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC106.09) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003681 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000450 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:19454013 4896 2013-09-12 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002842 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.20) PMID:11780129 4896 2024-04-12 Psc3 localization was strikingly disrupted in the swi6∆ strain at both loci (Fig. 1b). PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c),assayed_region(SO:0001898) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:22474355 4896 2024-03-13 The localizations of Hrr1-Flag and Rdp1-Flag at centromeric repeats were also found to be severely compromised in both ers1Δ and swi6Δ mutant cells (Fig. 5 A and B). PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:22474355 4896 2024-03-13 The localizations of Hrr1-Flag and Rdp1-Flag at centromeric repeats were also found to be severely compromised in both ers1Δ and swi6Δ mutant cells (Fig. 5 A and B). PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:22474355 4896 2024-03-13 In swi6Δ cells, Chp1 association with the centromeric dg or dh repeat locus decreased partially (70- 80%) but was still much greater than that observed in clr4Δ cells (Fig. 5 A and B). PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:22474355 4896 2024-03-13 This was in contrast to Hrr1 or Rdp1, whose association was severely reduced in swi6Δ cells (10-20%) to levels comparable to those of clr4Δ cells. PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:22474355 4896 2024-03-13 This was in contrast to Hrr1 or Rdp1, whose association was severely reduced in swi6Δ cells (10-20%) to levels comparable to those of clr4Δ cells. PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:19136623 4896 2024-07-02 In wild-type cells, both Clr3 and Mit1 were enriched on centromeric repeats; this localization was decreased in swi6D or chp2D cells, though substantial Mit1 was retained in swi6D cells, as reported previously (Sadaie et al. 2008). PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19136623 4896 2024-07-02 In wild-type cells, both Clr3 and Mit1 were enriched on centromeric repeats; this localization was decreased in swi6D or chp2D cells, though substantial Mit1 was retained in swi6D cells, as reported previously (Sadaie et al. 2008). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.20) PMID:11780129 4896 2024-04-12 Psc3 localization was strikingly disrupted in the swi6∆ strain at both loci (Fig. 1b). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 6D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:39945308 4896 2025-03-27 (Fig. 4F) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 7A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 ChIP analyses showed that Ers1 localization at the mating type locus (cenH) and telomeres was severely decreased in swi6Δ and clr4Δ cells (Fig. S5A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0004212 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 2e) Sgo1 localization is impaired in swi6D cells PomBase SPAC664.01c FYPO:0008422 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 6D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002386 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002386 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC31A2.05c) PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. S3A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002386 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. S3A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002386 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. S3B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002386 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 1B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002386 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC3G6.01) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005918 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 4C), Levels of Clr3 and Mit1 were dramatically reduced at subtelomeres in swi6 mutant strains PomBase SPAC664.01c FYPO:0005918 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 ChIP analyses showed that Ers1 localization at the mating type locus (cenH) and telomeres was severely decreased in swi6Δ and clr4Δ cells (Fig. S5A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0002387 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c),assayed_region(PomBase:SPBCPT2R1.07c) PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 6D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002387 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002387 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 7A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0004205 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000337 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000581 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 medium PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005286 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Figure 4a) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003045 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Figure 4a) PomBase SPAC664.01c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002638 deletion 972 h- nda3-KM311 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000059 PMID:9864354 4896 2019-10-30 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003557 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 medium PMID:19693008 4896 2024-01-15 When Dpht1 was combined with mutant alleles of clr4 or rik1—components of the Clr4-containing methyltransferase complex (ClrC)7—the resultant double mutants showed severe growth defects and a large, synergistic increase in antisense RNAs at .20% of genes (Fig. 2a and Supplementary Figs 5 and 7a, b). Consistent with ClrC directly participating in antisense suppression, Rik1 was found at the convergent loci (Supplementary Fig. 7c). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000220 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 low PMID:12193640 4896 2024-01-19 These transcripts were also found in swi6- (Fig. 1D) but at a much lower lev PomBase SPAC664.01c FYPO:0000220 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Supp. Fig. 1b) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000274 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 high PMID:31000521 4896 2020-03-03 (Fig. 2C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0001740 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 medium PMID:31000521 4896 2020-02-18 (Fig. 7) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000966 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006681 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006373 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:16762840 4896 2024-01-17 A similar increase in H3K9me2 levels was also observed in swi6 mutant cells defective in Epe1 recruitment to meiotic genes (Figure 6E). PomBase SPAC664.01c FYPO:0006268 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 5) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006268 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 5) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006361 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:26438724 4896 2018-02-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006361 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26438724 4896 2018-02-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002354 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000112 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000471 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:8200530 4896 2014-09-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001840 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:31000521 4896 2020-02-19 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001840 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 ~1 PMID:11780129 4896 2024-04-12 psc3-1T also displays the lagging-chromosome phenotype and mis-segregated the mini-chromosome Ch16 (ref. 17) at a higher rate than the wild type, mimicking the swi6∆ phenotype (Fig. 2a, b). PomBase SPAC664.01c FYPO:0001840 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 23 PMID:11780129 4896 2024-04-12 (Fig. 2a, b). PomBase SPAC664.01c FYPO:0005868 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:19158664 4896 2020-12-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006300 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 low assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000825 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0000286) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000825 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000825 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000825 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006110 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0006030 high PMID:39747188 4896 2025-06-23 On the other hand, loss of Swi6HP1, which causes an increase in heterochromatic repeat transcription (Supplementary Fig. 7a), showed a corresponding increase in cenH siRNAs. PomBase SPAC664.01c FYPO:0004749 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Figure 4a) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000780 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000231 FYECO:0000230 high assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.02) PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2C) PomBase SPAC664.01c FYPO:0007391 deletion 972 h- kanR swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22737087 4896 2020-05-04 data not shown PomBase SPAC664.01c FYPO:0000228 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 13.5 PMID:31000521 4896 2020-02-18 (Figure 3B) Increase the frequency of mitotic cells showing lagging chromosomes. Rad21 fails to accumulate at centromere in the absence of Swi6. PomBase SPAC664.01c FYPO:0000228 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:11780129 4896 2024-04-12 Moreover, the psc3+-GFP swi6∆ cells showed increased mini-chromosome loss and exhibited a high incidence of lagging chromosome and other chromosome segregation abnormalities (Fig. 2c) PomBase SPAC664.01c FYPO:0000228 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 48.8 PMID:7660126 4896 2015-03-12 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000228 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 30 high PMID:18716626 4896 2022-04-15 (Figure 1g) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19158664 4896 2020-12-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006660 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006996 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 medium PMID:19693008 4896 2024-01-15 However, antisense RNAs did not accumulate extensively in Dswi6 cells and the synergistic increase in antisense RNAs observed in the Dclr4 Dpht1 mutant was not observed in the Dswi6 Dpht1 mutant (Fig. 2a). Thus, ClrC and Ago1 contribute to antisense suppression by a new mechanism(s). PomBase SPAC664.01c FYPO:0000674 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000674 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002141 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001383 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC664.01c FYPO:0007425 deletion 972 h- rad51delta swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 assayed_using(SO:0001795) PMID:32355220 4896 2020-06-27 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006811 deletion 972 h- mat2-3delta swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001164 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002610 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002613 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004743 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:26438724 4896 2018-02-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002359 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:22683269 4896 2013-07-19 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006683 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003235 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:15372076 4896 2024-01-23 n Dswi6 or Dchp2 cells, the three heterochromatic regions were enriched in K9-methylated H3 at the same level as in wild-type cells (Figure 5B). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003235 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003613 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 complete PMID:34851403 4896 2023-08-11 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004093 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003246 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000059 PMID:38285941 4896 2024-04-08 (Fig. 2D and E and SI Appendix, Figs. S2A-D and S3). Mcm2 mapping was performed 60 min after release from the cdc25-22 block. A similar septation index for WT and swi6Δ cells indicated normal progression of swi6Δ cells through S phase (SI Appendix, Fig. S2B). PomBase SPAC664.01c FYPO:0000833 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 6E) PomBase SPAC664.01c FYPO:0005072 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that the association of Chp1-13myc with the three heterochromatic regions (CEN, MAT, and TEL) was not affected in the absence of swi6 þ or chp2 þ (Figure 2A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0005072 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 Interestingly, Swi6 was required for the localization of Chp2 to the mating-type region or telomeres but not to the centromeres (Figure 2B, Dswi6). PomBase SPAC664.01c FYPO:0007278 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:17289569 4896 2020-03-12 In contrast to heterochromatic loci, SHREC recruitment to euchromatic sites was unaffected in the absence of Swi6, as shown by Clr3 and Mit1 localization at a locus encoding a noncoding RNA and an intergenic region (Figure 4D). PomBase SPAC664.01c FYPO:0007278 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC800.03) PMID:17289569 4896 2020-03-12 In contrast to heterochromatic loci, SHREC recruitment to euchromatic sites was unaffected in the absence of Swi6, as shown by Clr3 and Mit1 localization at a locus encoding a noncoding RNA and an intergenic region (Figure 4D). PomBase SPAC664.01c FYPO:0007278 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC110.02) PMID:31278118 4896 2020-05-06 However, the localization of Pds5 to euchromatic locations was unaffected in heterochromatin-deficient cells (Figure 5E) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002389 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004378 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that the association of Chp1-13myc with the three heterochromatic regions (CEN, MAT, and TEL) was not affected in the absence of swi6 þ or chp2 þ (Figure 2A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0003576 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that the association of Chp1-13myc with the three heterochromatic regions (CEN, MAT, and TEL) was not affected in the absence of swi6 þ or chp2 þ (Figure 2A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0001317 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2022-12-02 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001317 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-02 In addition, the transcript levels of tgp1þ, nc-tgp1, nc-1343, pho1þ and nc-pho1 were unaffected by loss of RNAi (for example, ago1D or dcr1D) or heterochromatin components (for example, clr4D or swi6D) (Fig. 5b; Supplementary Fig. 7a PomBase SPAC664.01c FYPO:0003530 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000943 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 66 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005527 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:26205977 4896 2016-07-13 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002687 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000337 PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004579 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000291 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0007629 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000416 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:21300781 4896 2013-07-04 PomBase SPAC664.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC664.01c FYPO:0004325 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000084 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 high PMID:9864354 4896 2019-10-30 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001457 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC664.01c FYPO:0007304 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 high PMID:31000521 4896 2020-02-20 (Fig. 2A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003182 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 ~40 PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 2a, 2b) As with sgo1D cells, swi6D cells undergo intact meiosis I but suffer a nondisjunction of sister chromatids in meiosis II PomBase SPAC664.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0005638 PMID:8200530 4896 2014-09-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi6 swi6delta swi6::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.13c FYPO:0000625 psf2-HBD Not assayed or wild type 972 h- psf2 psf2-HBD fusion_or_chimera ECO:0005580 FYECO:0000218 PMID:19109429 4896 2012-05-22 PomBase SPBC725.13c FYPO:0000012 psf2-HBD Not assayed or wild type 972 h- psf2 psf2-HBD fusion_or_chimera ECO:0005580 FYECO:0000218 PMID:19109429 4896 2012-05-22 PomBase SPBC725.13c FYPO:0000783 psf2-HBD Not assayed or wild type 972 h- psf2 psf2-HBD fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000218 PMID:19109429 4896 2012-05-22 PomBase SPBC725.13c FYPO:0000783 psf2-HBD Not assayed or wild type 972 h- psf2 psf2-HBD fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000218 PMID:19109429 4896 2012-05-22 PomBase SPBC106.01 FYPO:0003307 mph1delta(1-302)-mis12 Not assayed or wild type 972 h- Pnmt81 GFP mph1 mph1delta(1-302)-mis12 mph1-delta(1-302)-mis12-fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 medium PMID:22825872 4896 2020-06-02 (Fig. 1E,F). PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0006709 1-644 Overexpression 972 h- rga4 rga4deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC28E12.03 FYPO:0002110 1-644 Overexpression 972 h- rga4 rga4deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph grp1 grp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- grp1 grp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grp1 grp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grp1 grp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B1.01 FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 deb1 deb1+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1B1.01 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 deb1 deb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1B1.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP deb1 deb1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC1B1.01 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 deb1 deb1+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007334 G341D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G341D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:11242054 4896 2024-01-28 loss of association of Swi6 with centromeres should result in expression of a normally silent marker gene embedded in centromeric chromatin. Figure 4e shows that this is indeed the case. On indicator plates, wild-type strains silence the centromeric ade6+ marker, which results in red, repressed colonies13; however, in strains lacking Clr4 (D) or strains defective in Clr4 methylase activity (G341D), this ade6+ gene is clearly expressed, resulting in the formation of white colonies. PomBase SPBC428.08c FYPO:0002566 G341D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G341D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:11242054 4896 2024-01-28 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001678 G341D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G341D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11242054 4896 2024-01-28 whereas the Clr4-G341D strain shows loss of localization from the nuclear periphery and accumulation of more diffuse staining over the nucleolus (Fig. 4c). PomBase SPBC342.05 FYPO:0004357 T235A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T235A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PR:000037316),residue(T187) PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003129 T235A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T235A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0001357 T235A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T235A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003130 T235A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T235A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000267 T235A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T235A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 T235A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T235A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0003770 G223S Not assayed or wild type 972 h- gpa1 gpa1-G223S amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19285552 4896 2015-04-16 PomBase SPAC10F6.13c FYPO:0007207 Q26* Not assayed or wild type 972 h- caa1 caa1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:31641022 4896 2019-11-20 PomBase SPAC10F6.13c FYPO:0000111 Q26* Not assayed or wild type 972 h- caa1 caa1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:31641022 4896 2019-11-20 PomBase SPAC10F6.13c FYPO:0006821 Q26* Not assayed or wild type 972 h- caa1 caa1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31641022 4896 2019-11-20 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000141 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0007174 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 2I) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0007174 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 2I) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0007174 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:22660415 4896 2024-04-22 (Fig. 2I) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001268 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 Strikingly, in spc7-12E cells, Bub1 localized at kinetochores throughout the entire cell cycle. Fig. 2H, I and S3C PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000705 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000705 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0008165 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005780 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0001232 40 PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005232 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 However, the coexpression of Bub1 and Bub3 enabled this complex to interact with Spc7-12E. Fig. 4C PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000091 T77E,S221E,T257E,T338E,T366E,T395E,T413E,T422E,T453E,T507E,T529E,T552E Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12E amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5E) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000708 S527D,S546D Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S527D,S546D amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC63.03 FYPO:0009007 deletion 972 h- mib1 mib1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC63.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.03 FYPO:0004162 deletion 972 h- mib1 mib1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC63.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC63.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.03 FYPO:0005266 deletion 972 h- mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC63.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mib1 mib1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mib1 mib1delta 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deletion ECO:0001232 PMID:22042620 4896 2020-06-25 (Fig. S5B) PomBase SPBC428.04 FYPO:0003779 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32502403 4896 2020-06-17 PomBase SPBC428.04 FYPO:0004622 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 20 PMID:32502403 4896 2020-06-15 PomBase SPBC428.04 FYPO:0007546 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 20 PMID:32502403 4896 2020-06-17 A failed mitotic nuclear division is a cell phenotype observed at the end of mitosis during the vegetative life cycle in which the nuclear division does not occur and the two DNA masses remain linked by the internuclear membrane bridge. This can result in the coalescence of both DNA masses into one nucleus. PomBase SPBC428.04 FYPO:0007549 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000248 complete PMID:32502403 4896 2020-12-07 When these cells were left in this condition, daughter nuclei began to move closer to each other until they finally merged into one single nucleus (Figure 4E). This phenotype can be promoted if spindles are forced to disassemble by treating the cells with 30 mg/mL MBC, resulting in 35% (n = 34) of nuclear coalescence events. PomBase SPBC428.04 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0000238 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC428.04 FYPO:0006660 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC428.04 FYPO:0003788 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 8 PMID:32502403 4896 2020-06-17 PomBase SPBC428.04 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 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prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- apq12 apq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC428.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC428.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apq12 apq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 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ecm33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ecm33 ecm33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- ecm33 ecm33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22848669 4896 2024-06-27 We constructed a null mutation in the ecm33+ and gaz2+ genes, respectively (see Materials and Methods) and found that the gaz2 deletion mutant was also viable (Figure 2A, upper panel), indicating that Gaz2 is not essential for cell viability. PomBase SPAC1705.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ecm33 ecm33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.13c FYPO:0003218 deletion 972 h- ctu2 ctu2delta deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0000265) PMID:23874237 4896 2014-03-05 PomBase SPBC19C2.13c FYPO:0003218 deletion 972 h- ctu2 ctu2delta deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0000260) PMID:23874237 4896 2014-03-05 PomBase SPBC19C2.13c FYPO:0003218 deletion 972 h- ctu2 ctu2delta deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0000259) PMID:23874237 4896 2014-03-05 PomBase SPBC19C2.13c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph ctu2 ctu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.13c FYPO:0000082 deletion 972 h- ctu2 ctu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18391219 4896 2016-01-07 PomBase SPBC19C2.13c FYPO:0001101 deletion 972 h- ctu2 ctu2delta deletion ECO:0000112 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SPBC19C2.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ctu2 ctu2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0002872 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0001232 low PMID:23041194 4896 2013-11-15 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0007449 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32735772 4896 2020-08-07 (Figure 3D) PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0007444 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0006294 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0002674 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC594.01) PMID:39239853 4896 2024-09-08 We also examined if Scs2 or Scs22 alone was responsible for preventing Duc1 division site localization but, as in wild-type cells, Duc1- mNG was excluded from the cell division site in both single deletion strains (Fig. S2B). PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0000843 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 6A) PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- scs22 scs22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scs22 scs22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scs22 scs22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T101C,A136C,G149C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U101C,A136C,G149C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T101C,A136C,G149C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U101C,A136C,G149C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 aly2 aly2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.04 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph aly2 aly2delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0004371 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000170 PMID:11027257 4896 2015-02-13 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002097 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spp2 spp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spp2 spp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0001924 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0004255 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spp2 spp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11027257 4896 2015-02-09 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000333 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000110 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000776 deletion 972 h- spp2 spp2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005726 V683A,F685A,V694A,F696A Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5(PP1mut) amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Figure 4E). PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000705 V683A,F685A,V694A,F696A Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5(PP1mut) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Figure 5B) PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0008139 S7N,E72K,G80D Not assayed or wild type 972 h- sec31 sec31-1 sns-B2 amino_acid_mutation ECO:0001232 68 PMID:11839792 4896 2023-12-30 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0008140 S7N,E72K,G80D Not assayed or wild type 972 h- sec31 sec31-1 sns-B2 amino_acid_mutation ECO:0001232 68 PMID:11839792 4896 2023-12-30 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0001784 S7N,E72K,G80D Not assayed or wild type 972 h- sec31 sec31-1 sns-B2 amino_acid_mutation ECO:0001232 68 PMID:11839792 4896 2023-12-11 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0002061 S7N,E72K,G80D Not assayed or wild type 972 h- sec31 sec31-1 sns-B2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11839792 4896 2023-12-11 PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0000509 S7N,E72K,G80D Not assayed or wild type 972 h- sec31 sec31-1 sns-B2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:11839792 4896 2023-12-11 Pap1p was localized predominantly to the cytoplasm in wild-type cells (Fig. 5A) as well as in the sar1-1, sec31-1 and pmm1- 1 mutants grown at the restrictive temperature, suggesting that nuclear protein export was not adversely affected in these cells (Fig. 5C,E,G). PomBase SPBC8D2.20c FYPO:0000516 S7N,E72K,G80D Not assayed or wild type 972 h- sec31 sec31-1 sns-B2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:11839792 4896 2023-12-11 Pap1p was localized predominantly to the cytoplasm in wild-type cells (Fig. 5A) as well as in the sar1-1, sec31-1 and pmm1- 1 mutants grown at the restrictive temperature, suggesting that nuclear protein export was not adversely affected in these cells (Fig. 5C,E,G). PomBase SPAC890.02c FYPO:0006606 151-300 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1delta151-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0005558 151-300 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1delta151-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0003269 151-300 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1delta151-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0007986 151-300 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1delta151-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0002818 151-300 Not assayed or wild type 972 h- alp7 mia1delta151-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19879140 4896 2022-06-01 PomBase SPBC1539.09c FYPO:0005878 unknown Not assayed or wild type 972 h- trp1 trp1- unknown 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2012-01-01 PomBase SPBC713.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- tim16 tim16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC713.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim16 tim16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0000082 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0000080 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0001355 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0001098 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000326 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0000108 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000303 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0000089 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000211 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0003670 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000388 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0002550 1-74 Not assayed or wild type 972 h- rpb9 rpb9-75-113 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000315 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPCC11E10.02c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi8 gpi8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC11E10.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi8 gpi8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC11E10.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- gpi8 gpi8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC11E10.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi8 gpi8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.04 FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- rpl1701 rpl1701+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:12237855 4896 2014-02-20 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fhl1 fhl1+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fhl1 fhl1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fhl1 fhl1+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC106.16 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- pre6 mts7-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC106.16 FYPO:0000067 unknown Not assayed or wild type 972 h- pre6 mts7-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC106.16 FYPO:0000073 unknown Not assayed or wild type 972 h- pre6 mts7-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC106.16 FYPO:0004025 unknown Not assayed or wild type 972 h- pre6 mts7-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC106.16 FYPO:0000767 unknown Not assayed or wild type 972 h- pre6 mts7-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC1709.02c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vrs1 vrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vrs1 vrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- vrs1 vrs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20106903 4896 2012-11-01 PomBase SPBC1709.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- vrs1 vrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1709.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vrs1 vrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007050 Y468* Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-15 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24831008 4896 2014-06-12 (Fig. 2) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000303 1014-1274 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:9606213 4896 2021-02-24 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003626 1014-1274 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:9606213 4896 2021-02-24 (slightly increased- In fact, more cells had staining at their tips than wild-type cells, probably indicating a prolonged attempt to conjugate, after which the protein delocalizes) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007658 1014-1274 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9606213 4896 2021-02-24 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mug100 mug100delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug100 mug100delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug100 mug100delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16E9.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug100 mug100delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000705 1-166,297-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-167-296 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC306.09c),assayed_using(PomBase:SPCC306.09c) PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000659 1-308 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LuC lem2LuC|lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 3) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000705 1-308 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LuC lem2LuC|lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 2) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006995 1-308 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LuC lem2LuC|lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000137 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000964 1-308 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LuC lem2LuC|lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002967 1-308 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LuC lem2LuC|lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 5) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005612 1-308 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LuC lem2LuC|lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 5) PomBase SPBC409.07c FYPO:0002679 S605SPKKKRKV Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-NLS amino_acid_insertion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 PomBase SPBC1826.01c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mot1 mot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1826.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- mot1 mot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1826.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mot1 mot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.08 FYPO:0000705 K483D,F490D Not assayed or wild type 972 h- pir2 pir2-K483D,F490D ars2-K483D,F490D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_protein(PomBase:SPBC725.08) PMID:36002457 4896 2024-01-12 In Strep-tag pull down assays, both mutations (K483D, F490D) essentially disrupted the Red1 binding (Supplementary Fig. 7d, lanes 3, 4). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008195 N59A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-N59A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:19362535 4896 2024-02-13 A second class of mutants showed a 5- to 17-fold reduction in binding affinity for H3K9me2 compared with the wild-type Chp1 chromodomain (V21A, E23V, N59A, and V24M). A PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 N59A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-N59A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 N59A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-N59A amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002837 N59A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-N59A amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 N59A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-N59A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPCC330.11 FYPO:0001309 deletion 972 h- btb1 btb1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC330.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph btb1 btb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.11 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph btb1 btb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.11 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph btb1 btb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.11 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph btb1 btb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph btb1 btb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- btb1 btb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC330.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btb1 btb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.11 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btb1 btb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000141 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001407 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003190 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000903 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-06 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003226 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003227 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003225 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 klp5(1-404)-Klp6(411-784) Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp5N/klp6C Klp5N/klp6C chimera fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0000141 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33125111 4896 2021-03-05 (Fig. 3). PomBase SPBC1706.03 FYPO:0000177 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33125111 4896 2021-03-05 (Fig. 3). PomBase SPBC1706.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0002401 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33125111 4896 2021-03-05 (Fig. 1C). PomBase SPBC1706.03 FYPO:0000056 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33125111 4896 2021-03-05 (Fig. 1A). PomBase SPBC1706.03 FYPO:0007208 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33125111 4896 2021-03-05 (Fig. 1C). PomBase SPBC1706.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph fzo1 fzo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33125111 4896 2021-03-05 (Fig. 1B). PomBase SPBC1706.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1706.03 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fzo1 fzo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph uga1 uga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph uga1 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amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 Q140A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-Q140A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003371 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003371 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000705 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c),assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:33357436 4896 2021-01-08 (Fig. 2B) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000705 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005289 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 51 PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0004594 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005467 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:33357436 4896 2021-01-08 (Figure 3A) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001365 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33357436 4896 2021-01-08 (Figures 3C, 3D) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005903 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 12.5 PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0007528 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 PMID:33357436 4896 2021-01-08 (Figure S2C) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:33357436 4896 2021-01-13 (Figure S2E) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005221 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33357436 4896 2021-01-08 (Figure S2B) of purified Cdc15 F-BAR domain PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0006187 D255A,E256A,E259A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001645 D84H Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-D84H amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000972 D84H Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-D84H amino_acid_mutation ECO:0001232 45 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 D84H Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-D84H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 D84H Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-D84H amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 D84H Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-D84H amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 D84H Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-D84H amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001206 D481N Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-D481N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-24 PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0002687 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000085 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21444718 4896 2023-03-30 Interestingly, rad60E380R mutant cells are hypersensitive to the same DNA-damaging agents as nse2-SA cells (Fig. 4A). PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000085 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:39786922 4896 2025-01-31 (Fig. S1A) PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000085 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:25002536 4896 2015-01-23 PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000088 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21444718 4896 2023-03-30 Interestingly, rad60E380R mutant cells are hypersensitive to the same DNA-damaging agents as nse2-SA cells (Fig. 4A). PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000088 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39786922 4896 2025-01-31 (Fig. S1A) PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000088 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:25002536 4896 2015-01-23 PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000089 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:21444718 4896 2023-03-30 Interestingly, rad60E380R mutant cells are hypersensitive to the same DNA-damaging agents as nse2-SA cells (Fig. 4A). PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000089 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:39786922 4896 2025-01-31 (Fig. S1A) PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000268 C195S,H197A Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2-SA nse2-C195S-H197A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:25002536 4896 2015-01-23 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007725 DGNDPDPINV142AAAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-142-151A fsv1-142-152A|stx8(142-152)A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0000703 DGNDPDPINV142AAAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-142-151A fsv1-142-152A|stx8(142-152)A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c),assayed_using(PomBase:SPCC777.13) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005119 S596D,S598D,S605D,S611D Not assayed or wild type 972 h- klp9 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klp9(4SD) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures 1J) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003349 S596D,S598D,S605D,S611D Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-S596D,S598D,S605D,S611D klp9(4SD) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC336.15) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures 1J) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003349 S596D,S598D,S605D,S611D Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-S596D,S598D,S605D,S611D klp9(4SD) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures 1J) PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002702 L449R,W498R,I501R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-L449R,W498R,I501R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:25330395 4896 2015-05-20 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0003767 D226N Not assayed or wild type 972 h- cce1 cce1-D226N amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.02) PMID:9837990 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 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ppr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000256 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:27664110 4896 2019-10-16 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0004529 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:22349564 4896 2021-01-27 As expected, Δppr4 cells clearly lacked Cox1 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, the deletion of ppr4 and mtf2 did not or only moderately affect the protein levels of other Mrh5C subunits (Fig. 1, C and D). PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, the deletion of ppr4 and mtf2 did not or only moderately affect the protein levels of other Mrh5C subunits (Fig. 1, C and D). PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, the deletion of ppr4 and mtf2 did not or only moderately affect the protein levels of other Mrh5C subunits (Fig. 1, C and D). PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000703 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Similarly, deletion of ppr4 did not impair the interaction among Mrh5-Myc, Sls1-FLAG, and Mtf2-HA (Fig. 2E). PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000703 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12),assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Similarly, deletion of ppr4 did not impair the interaction among Mrh5-Myc, Sls1-FLAG, and Mtf2-HA (Fig. 2E). PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.07) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.14c) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr4 ppr4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.09) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPAC8C9.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ppr4 ppr4delta deletion ECO:0005638 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h- rsp1 rsp1-(1-486) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.05c),assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 5A) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0006182 487-494 Not assayed or wild type 972 h- rsp1 rsp1-(1-486) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 Therefore, we concluded that Rsp1 is required to prevent excessive accumulation of Mto1 PomBase SPAC637.12c FYPO:0000227 L271P Not assayed or wild type 972 h- mst1 mst1-L271P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 Knockout or depletion of H2A.Z in Sc 15 or mammalian cells 5 leads to increased rates of chromosome loss. This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPAC637.12c FYPO:0000331 L271P Not assayed or wild type 972 h- mst1 mst1-L271P amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.10c) PMID:19915592 4896 2023-11-15 reduction in Pht1Ac (Fig. 1d), indicating that Pht1 acetylation is Mst1-dependent. PomBase SPAC637.12c FYPO:0002061 L271P Not assayed or wild type 972 h- mst1 mst1-L271P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19915592 4896 2023-11-15 (Fig. 1c). PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001120 wild type Overexpression 972 h- shk2 shk2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9660818 4896 2019-10-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- shk2 shk2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9660817 4896 2018-05-11 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0002197 wild type Overexpression 972 h- shk2 shk2+ wild_type ECO:0001232 PMID:9660817 4896 2018-05-11 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0006026 1-107 Not assayed or wild type 972 h- fim1 fim1-A12 fim1A12 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:21642440 4896 2017-07-07 PomBase SPBC651.09c FYPO:0007386 458-560 Not assayed or wild type 972 h- prf1 prf1delta458 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 medium PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPBC1347.05c FYPO:0007299 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP scj1 scj1delta deletion ECO:0001232 PMID:32075773 4896 2020-03-21 (Fig. 2B, S2B-D) PomBase SPBC1347.05c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scj1 scj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- scj1 scj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1347.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scj1 scj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.05c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scj1 scj1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.14c FYPO:0001355 disruption Null 972 h- dsk1 dsk1::ura4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:8485317 4896 2014-12-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002177 disruption Null 972 h- dsk1 dsk1::ura4 disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8485317 4896 2014-12-03 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 F235A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F235A amino_acid_mutation ECO:0000049 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PomBase SPCC645.04 FYPO:0001357 F235A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F235A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0001357 F235A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F235A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC13F5.02c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf7 taf7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13F5.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf7 taf7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13F5.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- taf7 taf7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13F5.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf7 taf7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.03c FYPO:0007324 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf1+ hhf3+ hhf2 hhf2-KR hhf2-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:30992049 4896 2020-04-09 PomBase SPBC8D2.03c FYPO:0007255 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf1+ hhf3+ hhf2 hhf2-KR hhf2-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000314 PMID:30992049 4896 2020-04-03 PomBase SPBC8D2.03c FYPO:0005296 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf1+ hhf3+ hhf2 hhf2-KR hhf2-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30992049 4896 2020-04-03 PomBase SPBC8D2.03c FYPO:0000963 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf2 hhf2-KR hhf2-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPBC8D2.03c FYPO:0002620 K6R,K9R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- hhf1+ hhf3+ hhf2 hhf2-KR hhf2-K5/8/12/16R amino_acid_mutation ECO:0005638 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SPCC736.12c FYPO:0000836 Y352F Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1-Y352F amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:33536434 4896 2023-03-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001890 Y352F Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1-Y352F amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPCC736.12c) PMID:33536434 4896 2023-03-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0004910 Y352F Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1-Y352F amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c) PMID:33536434 4896 2023-03-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001317 Y352F Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1-Y352F amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mpd1 mpd1delta deletion 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph mpd1 mpd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- mpd1 mpd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpd1 mpd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13F5.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpd1 mpd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.13c FYPO:0001053 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 5 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. S12) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002897 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000211 assayed_protein(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002098 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6B) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002098 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000170 high assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002098 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0009109 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000434 low PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002899 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000211 assayed_protein(PomBase:SPCC1259.13) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000095 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000277 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000085 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000314 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000088 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000089 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000211 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 6) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000268 K33E,Y264H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000315 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 642-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-641) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 8) PomBase SPBC660.08 FYPO:0001645 176-181 Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38delta176-181 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC660.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:31941401 4896 2020-03-01 (Figure 1G) PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 R341E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R341E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 R341E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R341E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPBC12C2.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp5 dbp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12C2.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- dbp5 dbp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC12C2.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp5 dbp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000082 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000082 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000082 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000082 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000082 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000674 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000964 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3B) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000964 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3B) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000964 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3B) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000964 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3B) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000964 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3B) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000964 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 3B) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001513 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0003241 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 9 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0003241 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 9 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0003241 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 11 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0003241 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 12 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0003241 ndc80-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS ndc80 ndc80-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 13 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPBC1604.01 FYPO:0003518 wild type Overexpression 972 h- egt1 egt1+ wild_type ECO:0000335 PMID:24828577 4896 2014-07-02 PomBase SPBC1604.01 FYPO:0003519 wild type Overexpression 972 h- egt1 egt1+ wild_type ECO:0000335 PMID:24828577 4896 2014-07-02 PomBase SPBC1604.01 FYPO:0003520 wild type Overexpression 972 h- egt1 egt1+ wild_type ECO:0000335 PMID:24828577 4896 2014-07-02 PomBase SPBC1604.01 FYPO:0003516 wild type Overexpression 972 h- egt1 egt1+ wild_type ECO:0000335 PMID:24828577 4896 2014-07-02 PomBase SPBC1604.01 FYPO:0003517 wild type Overexpression 972 h- egt1 egt1+ wild_type ECO:0000335 PMID:24828577 4896 2014-07-02 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 M292Y Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-M292Y cdc48-M298Y amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPAC110.03 FYPO:0006497 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-1625 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high medium PMID:27852900 4896 2018-04-18 PomBase SPAC110.03 FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-1625 unknown ECO:0005638 PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC110.03 FYPO:0001586 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-1625 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:22768263 4896 2012-09-24 PomBase SPAC110.03 FYPO:0001586 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-1625 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPAC110.03 FYPO:0001586 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-1625 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002904 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-1625 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC7D4.09c FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ dfg10 dfg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAC7D4.09c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dfg10 dfg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC7D4.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- dfg10 dfg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC7D4.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dfg10 dfg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000705 1-105 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(106-251) EAF(106-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.14c),assayed_using(PomBase:SPCC1223.10c) PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Table 3) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002876 1-105 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(106-251) EAF(106-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 4) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001234 1-105 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(106-251) EAF(106-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 3b) PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000303 unknown Not assayed or wild type 972 h- h+ sxa1 sxa1-454 unknown ECO:0001232 FYECO:0000090 PMID:1549128 4896 2013-08-13 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000022 unknown Not assayed or wild type 972 h- sxa1 sxa1-454 unknown ECO:0001232 FYECO:0000090 PMID:1549128 4896 2013-08-13 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 S87A,T94A,S402A,S566A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S402A,S566A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 S87A,T94A,S402A,S566A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S402A,S566A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPCC622.12c FYPO:0005472 unknown Not assayed or wild type 972 h- gdh1 gdh1-2 unknown ECO:0005801 PMID:7773104 4896 2016-06-29 PomBase SPBC146.03c FYPO:0004418 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- pfl7 pfl7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 3) PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0005333 wild type Knockdown 972 h- pcn1 pcn1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:16407242 4896 2016-03-31 PomBase SPAC22E12.09c FYPO:0001422 K81A,R82A,R102A Not assayed or wild type 972 h- krp1 krp1-K81A,R82A,R102A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.09c) PMID:9418887 4896 2012-02-23 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0001364 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-03 (Fig. 6A,B) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0003440 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-03 (Fig 6AB) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0001042 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 high PMID:27082518 4896 2016-07-15 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-15 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0001368 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. 6A,B) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0000644 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. S4F and S4G) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0001904 deletion 972 h- trs120 trs120delta deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. 6A,B) PomBase SPAC607.10 FYPO:0001914 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:18550796 4896 2015-12-18 PomBase SPAC607.10 FYPO:0001914 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAC607.10 FYPO:0001914 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000583 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000583 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0000059 PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPAC607.10 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC607.10 FYPO:0003563 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPAC607.10 FYPO:0003798 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:18550796 4896 2015-12-18 PomBase SPAC607.10 FYPO:0003798 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPAC607.10 FYPO:0003541 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:20980623 4896 2020-02-11 (Fig. S1) PomBase SPAC607.10 FYPO:0003845 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1347.03) PMID:12759375 4896 2015-03-11 PomBase SPAC607.10 FYPO:0003845 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 1F PomBase SPAC607.10 FYPO:0001420 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000346 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:18550796 4896 2015-12-18 PomBase SPAC607.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC607.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC607.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC607.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- spo3 spo3delta spo3-D-null deletion ECO:0001232 PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0001921 L111W Not assayed or wild type 972 h- oxs1 oxs1-L111W amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.12) PMID:30181192 4896 2020-12-15 PomBase SPCC63.07 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thg1 thg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC63.07 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thg1 thg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC63.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- thg1 thg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC63.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thg1 thg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0002430 W3654A,L3655A Not assayed or wild type 972 h- tra2 tra2-AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 6I) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 cut5-401 unknown ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2015-09-02 PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0001407 C357A,T360A Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-Pt1-9 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0001387 C357A,T360A Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-Pt1-9 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPBC428.16c FYPO:0002061 T38M Overexpression 972 h- rhb1 rhb1-T38M rhb1-T35M amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10835385 4896 2021-01-22 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0001324 N30Y Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-30 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0001234 N30Y Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-30 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004328 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-205 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:17032733 4896 2015-01-21 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0005075 deletion 972 h- hcn1 hcn1delta deletion ECO:0000059 PMID:16950791 4896 2015-11-18 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hcn1 hcn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hcn1 hcn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0002151 deletion 972 h- hcn1 hcn1delta deletion ECO:0005638 PMID:16950791 4896 2015-11-18 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- hcn1 hcn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hcn1 hcn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000611 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-5 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0003128 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-5 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8537450 4896 2014-09-18 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 150-200 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta150-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 30 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. S2B) PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 F369R Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-F369R amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007336 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 PMID:37400983 4896 2023-09-04 | combined mutations of the hinge and one of the mutations in the N-terminus of CSD (mut3 and mut5) showed a silencing defect (Fig. 4C) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0008153 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:39945308 4896 2025-03-27 (Fig. 4F) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0008153 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0008153 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:16246721 4896 2024-01-25 Remarkably, loss of Swi6 and Chp2 but not Chp1 completely abolished the localization of Clr3 at Kint2::ura4+ (Figure 1) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0005396 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003094 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002834 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 5A) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002834 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 PMID:14704433 4896 2024-01-18 A tas3 deletion strain carrying the ura4+ reporter gene inserted at innermost (imr) or outermost (otr) centromeric repeats of chromosome 1 (imr1R::ura4+ and otr1R::ura4+, respectively) displayed a loss of silencing of both reporter genes (Fig. 2D) to an extent similar to that of the deletion of sir2, chp1, or ago1 (Fig. 2D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. 1) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 PMID:30110338 4896 2018-08-22 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 low PMID:39945308 4896 2025-03-03 (Fig. 4C and 4E) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004604 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003231 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:37400983 4896 2023-09-04 Chp2 mutants lacking DNA-binding activities associated with both the hinge and the N-terminus of CSD (mut 3 and mut 5) exhibited reduced heterochromatin association compared to wild-type Chp2 at representative heterochromatic regions (centromeric dg, the mating-type cenH, telomere and mat3M::ura4+), and the reduction was more severe for Chp2-mut3 compared to Chp2-mut5 (Fig. 6A). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006599 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c),assayed_region(SO:0001898) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4A) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006599 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC800.03),assayed_region(SO:0001898) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006599 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:19136623 4896 2024-07-02 In wild-type cells, both Clr3 and Mit1 were enriched on centromeric repeats; this localization was decreased in swi6D or chp2D cells, though substantial Mit1 was retained in swi6D cells, as reported previously (Sadaie et al. 2008). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006599 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19136623 4896 2024-07-02 In wild-type cells, both Clr3 and Mit1 were enriched on centromeric repeats; this localization was decreased in swi6D or chp2D cells, though substantial Mit1 was retained in swi6D cells, as reported previously (Sadaie et al. 2008). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003573 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4A) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002386 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. 3D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002387 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 4A) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002387 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 7B) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000966 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006681 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006300 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004237 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2025-07-02 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004237 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2025-07-02 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004377 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000825 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 chp2 chp2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002567 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 chp2 chp2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006811 deletion 972 h- mat2-3delta chp2 chp2delta deletion ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000964 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006683 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003235 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:15372076 4896 2024-01-23 Intriguingly, we found that, even in the Dchp1 cells, histone H3 in native centromeric heterochromatin (CEN-dg223 locus) remained methylated at lysine 9 (Figure 4B, Dchp1). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003235 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001513 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:31000521 4896 2020-02-18 (Figure 3B) Chp1 fails to accumulate at noncentromeric location in the absence of Chp2 and Swi6. PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001513 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 1.3 PMID:31000521 4896 2020-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0005072 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that the association of Chp1-13myc with the three heterochromatic regions (CEN, MAT, and TEL) was not affected in the absence of swi6 þ or chp2 þ (Figure 2A). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0005072 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 To test the hypothesis that the nuclear dot localization of Ers1 was attributable to an interaction with H3K9me-bound CD proteins, EGFP-Ers1WT localization was next examined in swi6Δ, chp1Δ, and chp2Δ cells. The localization of EGFP-Ers1WT was clearly abolished in swi6Δ cells similar to that observed in clr4Δ, whereas WT localization patterns were retained in the chp1Δ and chp2Δ cells (Fig. 4C and Fig. S4C). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004378 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that the association of Chp1-13myc with the three heterochromatic regions (CEN, MAT, and TEL) was not affected in the absence of swi6 þ or chp2 þ (Figure 2A). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004378 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003576 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that the association of Chp1-13myc with the three heterochromatic regions (CEN, MAT, and TEL) was not affected in the absence of swi6 þ or chp2 þ (Figure 2A). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007629 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1A) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007629 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007629 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000094 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0006935 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001491 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 chp2 chp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.15c FYPO:0003412 deletion 972 h- pub2 pub2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000233 PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC1805.15c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pub2 pub2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.15c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pub2 pub2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1805.15c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pub2 pub2delta deletion ECO:0005580 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leu1-32 ade6-M210 rpl2801 rpl2801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2801 rpl2801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002133 1-74,140-328 Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-chromo partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000054 low PMID:35658118 4896 2023-12-15 As shown in Fig. 1B, acb1Δ grew slightly slower on fermentable medium than acb1+ cells and much slower on nonfermentable medium. PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0007610 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:35658118 4896 2023-12-28 (Figure 2c) PomBase SPBC1539.06 FYPO:0002009 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0000335 PMID:35658118 4896 2023-12-15 Three independent experiments consistently showed that the oxygen consumption rate of acb1Δ cells was significantly decreased when the cells were cultured in nutrient-rich medium (i.e. YE) (Fig. 3B). PomBase SPBC1539.06 FYPO:0008137 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:35658118 4896 2023-12-15 Intriguingly, the size of lipid droplets became larger and the number of lipid droplets became less as acb1+ and acb1Δ+acb1 cells grew older in nutrient-rich medium (Fig. 4C,D). By contrast, the size and number of lipid droplets did not change as acb1Δ cells grew older in nutrient-rich medium (Fig. 4C,D). PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:35658118 4896 2023-12-15 (Figure 1b, 3c) PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009007 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:35658118 4896 2023-12-28 Therefore, increased cell death rather than abnormal cell division was the consequence of the impaired cell proliferation caused by the absence of Acb1 (Fig. 3D). PomBase SPBC1539.06 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001489 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0000059 9 PMID:35658118 4896 2023-12-15 Therefore, increased cell death rather than abnormal cell division was the consequence of the impaired cell proliferation caused by the absence of Acb1 (Fig. 3D). PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000833 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC12C2.08) PMID:35658118 4896 2023-12-15 he expression of Dnm1 was comparable in wild-type and acb1Δ cells (Fig. 2E). PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001357 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:35658118 4896 2023-12-15 (Figure 1b, 3C) PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph acb1 acb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0007193 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:35658118 4896 2023-12-15 Microscopic observation showed that mitochondria were tubular in acb1+ cells but became fragmented in acb1Δ cells (Fig. 1A). PomBase SPBC1539.06 FYPO:0007193 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 medium PMID:35658118 4896 2023-12-15 We noticed that mitochondrial fragmentation caused by the absence of Acb1 was more apparent when cells were cultured in nutrient-rich medium than in minimal medium. PomBase SPBC1539.06 FYPO:0007611 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 74 PMID:35658118 4896 2023-12-15 By contrast, mitochondria became fragmented/aggregated (74.4%) PLUS This result indicates that mitochondrial mass/biogenesis was reduced by the absence of Acb1 or Dnm1. Note that dnm1-deletion in acb1Δ cells did not restore mitochondrial mass (Fig. 2C) PomBase SPBC1539.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1539.06 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acb1 acb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph lcb4 lcb4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- lcb4 lcb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lcb4 lcb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lcb4 lcb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0003334 deletion 972 h- adg1 adg1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3A) PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0001491 deletion 972 h- adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- adg1 adg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- adg1 adg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adg1 adg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPJ760.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adg1 adg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0001910 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC947.10) PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0003935 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11839792 4896 2023-12-11 In sar1-1 cells, acid phosphatase accumulated in its 72 kDa core glycosylated form (arrow) even at 25°C (Fig. 2A, lane 5), and this form increased in abundance upon incubation at 36°C (Fig. 2A, lanes 6-8), indicating a block in its secretion from the ER PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0003935 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11839792 4896 2023-12-11 The glycosylation profile of acid phosphatase in sec31-1 cells also revealed a block in secretion from the ER (Fig. 2B). In sec31-1 cells at 25°C (Fig. 2B, lane 3), a low level of the 72 kDa form of acid phosphatase (arrow) and high molecular weight smears indicated normal protein secretion. However, sec31-1 cells incubated at 36°C for 4 hours, accumulated a high level of the 72 kDa ER form of acid phosphatase (Fig. 2B, lane 4), indicating that protein secretion from the ER is inhibited PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0008139 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001232 56 PMID:11839792 4896 2023-12-11 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0008140 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001232 56 PMID:11839792 4896 2023-12-11 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0001784 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001232 56 PMID:11839792 4896 2023-12-11 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0002061 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11839792 4896 2023-12-11 PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0000516 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:11839792 4896 2023-12-11 Pap1p was localized predominantly to the cytoplasm in wild-type cells (Fig. 5A) as well as in the sar1-1, sec31-1 and pmm1- 1 mutants grown at the restrictive temperature, suggesting that nuclear protein export was not adversely affected in these cells (Fig. 5C,E,G). PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0008138 G27S Not assayed or wild type 972 h- sar1 sar1-1 sns-A10 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:11839792 4896 2023-12-11 Pap1p was localized predominantly to the cytoplasm in wild-type cells (Fig. 5A) as well as in the sar1-1, sec31-1 and pmm1- 1 mutants grown at the restrictive temperature, suggesting that nuclear protein export was not adversely affected in these cells (Fig. 5C,E,G). PomBase SPBC365.13c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- hba1 hba1+ wild_type ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:12896976 4896 2012-07-19 PomBase SPBC365.13c FYPO:0001246 wild type Overexpression 972 h- hba1 hba1+ wild_type ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:12896976 4896 2012-07-19 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000784 wild type Overexpression 972 h- hba1 hba1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:12896976 4896 2012-07-19 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000784 wild type Overexpression 972 h- hba1 hba1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:12896976 4896 2012-07-19 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000067 wild type Overexpression 972 h- hba1 hba1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8621569 4896 2014-07-31 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000073 wild type Overexpression 972 h- hba1 hba1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:12896976 4896 2019-05-21 PomBase SPBC106.09 FYPO:0002346 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4- sng2-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000156 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4- sng2-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0004418 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4- sng2-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000877 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4- sng2-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0002355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4- sng2-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0003681 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4- sng2-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0003681 unknown Not assayed or 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assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c),assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:29180432 4896 2019-01-02 (Fig. 6) PomBase SPAC15A10.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pun1 pun1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pun1 pun1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pun1 pun1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.09c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pun1 pun1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pun1 pun1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPBC776.14 FYPO:0003960 deletion 972 h- plh1 plh1delta lro1delta deletion ECO:0005801 PMID:12963726 4896 2014-10-28 PomBase SPBC776.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 plh1 plh1delta lro1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC776.14 FYPO:0002236 deletion 972 h- plh1 plh1delta lro1delta deletion ECO:0000335 PMID:12963726 4896 2014-10-28 PomBase SPBC776.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph plh1 plh1delta lro1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph plh1 plh1delta lro1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph plh1 plh1delta lro1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.14 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2012-01-01 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- nda2 nda2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:3785193 4896 2013-10-16 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- nda2 nda2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:3785193 4896 2013-10-16 PomBase SPCC1840.01c FYPO:0000082 W79R Not assayed or wild type 972 h- mog1 mog1-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:17651922 4896 2015-02-23 PomBase SPCC1840.01c FYPO:0002522 W79R Not assayed or wild type 972 h- mog1 mog1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17651922 4896 2015-02-23 PomBase SPBC530.12c FYPO:0001355 373-602 Not assayed or wild type 972 h- pdf1 pdf1delta(373-602) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:15075260 4896 2011-12-05 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003743 431-438 Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1delta431-438 ssp1-stretch deletion partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 PMID:18201975 4896 2014-08-05 PomBase SPAC9.10 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph thi9 thi9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.10 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph thi9 thi9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.10 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph thi9 thi9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph thi9 thi9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph thi9 thi9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- thi9 thi9delta deletion ECO:0001232 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FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp12 prp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp12 prp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002435 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-08-16 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000538 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000639 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002021 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-08-16 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002021 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2023-01-25 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000650 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001406 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002061 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000224 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001234 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000024 N17P,C577R Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-916 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPCC1494.05c FYPO:0005226 wild type Overexpression 972 h- ubp12 ubp12+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044777) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPCC1494.05c FYPO:0005226 wild type Overexpression 972 h- ubp12 ubp12+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000049732) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002779 F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Fig. 4A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006326 F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 medium assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Fig. 4A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 50 medium PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 33 medium PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 47 medium PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001324 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000090 medium assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0005034 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1718.07c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 5E) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001838 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1718.07c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 5E) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0004582 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 medium PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 3C, 7A) shows that zfs1delta shows high mating efficiency at nitrogen levels which suppress mating in wild type cells wild type cells PomBase SPBC1718.07c FYPO:0004084 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001096 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001317 S141A,S151A,S154A,S155A,S164A,T165A Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 6A) PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007721 122-151 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8delta122-151 stx8(D122-151)|fsv1delta122-151 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0001645 122-151 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8delta122-151 stx8(D122-151)|fsv1delta122-151 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c),assayed_using(PomBase:SPCC777.13) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0005489 122-151 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8delta122-151 stx8(D122-151)|fsv1delta122-151 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPBC3D6.09 FYPO:0003412 17-80 Not assayed or wild type 972 h- dpb4 dpb4-deltaHF partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:29109278 4896 2017-11-16 PomBase SPBC3D6.09 FYPO:0003412 17-80 Not assayed or wild type 972 h- dpb4 dpb4-deltaHF partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 PMID:29109278 4896 2017-11-16 PomBase SPBC3D6.09 FYPO:0001357 17-80 Not assayed or wild type 972 h- dpb4 dpb4-deltaHF partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29109278 4896 2017-12-04 PomBase SPBC8D2.06 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 irs1 irs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 irs1 irs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- irs1 irs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC8D2.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 irs1 irs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.01c FYPO:0002061 cut20::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cut20 cut20::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10082519 4896 2015-10-23 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0004608 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0001915 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0004610 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15569158 4896 2015-07-20 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0001489 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0002061 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0003176 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0004606 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC3H8.10) PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0004095 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC3H8.10) PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0004609 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15569158 4896 2015-07-20 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0001491 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0002060 T170I Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20-H6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15569158 4896 2015-04-27 PomBase SPBC3B9.11c FYPO:0006613 Y260* Not assayed or wild type 972 h- ctf1 ctf1-Tyr260Stop ctf1-70 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:11389847 4896 2024-08-20 (Fig. 2) PomBase SPBC211.06 FYPO:0004626 wild type Overexpression 972 h- gfh1 gfh1+ wild_type ECO:0001232 PMID:15004232 4896 2015-07-20 PomBase SPBC211.06 FYPO:0002411 wild type Overexpression 972 h- gfh1 gfh1+ wild_type ECO:0001232 low PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0004255 wild type Overexpression 972 h- gfh1 gfh1+ wild_type ECO:0001232 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0005187 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC869.10c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0005187 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0005187 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0005187 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000826 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4H10.11c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC1786.01c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC22A12.06c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC926.09c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1450.16c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000825 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0001007 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0001420 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0000085 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Knockdown 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000314 high PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4C) PomBase SPCC417.09c FYPO:0007500 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000180 PMID:39105351 4896 2024-10-01 (Figure 2a). However, in ΔSPCC417.09c cells, sulfur depletion did not induce the cleavage of GFP-Atg8, indicating that autophagy was not induced. PomBase SPCC417.09c FYPO:0008321 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:39105351 4896 2024-10-01 In contrast, in Δsdr1 diploid cells, almost no sporulation occurred under nitrogen or sulfur starvation, and the sporulation rate during phosphate starvation was also significantly less. PomBase SPCC417.09c FYPO:0007087 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000180 PMID:39105351 4896 2024-10-01 In contrast, in Δsdr1 diploid cells, almost no sporulation occurred under nitrogen or sulfur starvation, and the sporulation rate during phosphate starvation was also significantly less. PomBase SPCC417.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC417.09c FYPO:0007084 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:39105351 4896 2024-10-02 Additionally, we confirmed gene expressions that showed significant differences due to the deletion of sdr1+ through a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay (Figure 3a). PomBase SPCC417.09c FYPO:0008065 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000112 PMID:39105351 4896 2024-10-01 PomBase SPCC417.09c FYPO:0007086 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000180 PMID:39105351 4896 2024-10-01 PomBase SPCC417.09c FYPO:0008427 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPBC2F12.09c) PMID:39105351 4896 2024-10-01 Additionally, we confirmed gene expressions that showed significant differences due to the deletion of sdr1+ through a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay (Figure 3a). PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPBC839.06) PMID:39105351 4896 2024-10-01 Additionally, we confirmed gene expressions that showed significant differences due to the deletion of sdr1+ through a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay (Figure 3a). PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPCC417.10) PMID:39105351 4896 2024-10-01 However, dal51+ is an adjacent gene to sdr1+ (Figure S1). Therefore, the increased expression of dal51+ in Δsdr1 cells was potentially due to the loss of the regulatory sequence of dal51+ expression rather than the deletion of the sdr1+. PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:39105351 4896 2024-10-01 These include mei2+, which encodes the master meiosis-regulator (Harigaya et al., 2006; Sugiyama et al., 2016), and phosphate depletion-responsive genes ecl3+, pho1+, and pho84+ PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:39105351 4896 2024-10-01 These include mei2+, which encodes the master meiosis-regulator (Harigaya et al., 2006; Sugiyama et al., 2016), and phosphate depletion-responsive genes ecl3+, pho1+, and pho84+ PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:39105351 4896 2024-10-01 These include mei2+, which encodes the master meiosis-regulator (Harigaya et al., 2006; Sugiyama et al., 2016), and phosphate depletion-responsive genes ecl3+, pho1+, and pho84+ PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:39105351 4896 2024-10-01 Additionally, we confirmed gene expressions that showed significant differences due to the deletion of sdr1+ through a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay (Figure 3a). PomBase SPCC417.09c FYPO:0007085 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPBC1289.14) PMID:39105351 4896 2024-10-01 Additionally, we confirmed gene expressions that showed significant differences due to the deletion of sdr1+ through a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay (Figure 3a). PomBase SPCC417.09c FYPO:0000825 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPCC417.10) PMID:39105351 4896 2024-10-01 (Figure 3a). However, dal51+ is an adjacent gene to sdr1+ (Figure S1). Therefore, the increased expression of dal51+ in Δsdr1 cells was potentially due to the loss of the regulatory sequence of dal51+ expression rather than the deletion of the sdr1+. PomBase SPCC417.09c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC417.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC417.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 PMID:39105351 4896 2024-10-01 PomBase SPCC417.09c FYPO:0008317 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:39105351 4896 2024-10-02 In this regard, we also confirmed that the sdr1+ deletion mutant exhibited a shorter CLS than the wild-type during the stationary phase in our assay system (Figure 6). PomBase SPCC417.09c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC417.09c FYPO:0007592 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:39105351 4896 2024-10-01 autophagy was triggered in ΔSPCC417.09c cells under nitrogen depletion but not under sulfur depletion. PomBase SPCC417.09c FYPO:0008318 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPCC63.08c) PMID:39105351 4896 2024-10-01 Contrary to our prediction, the presence or absence of sdr1+ did not have significant effect on atg1+ and atg20+ induction by sulfur starvation. PomBase SPCC417.09c FYPO:0008318 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000180 assayed_transcript(PomBase:SPCC16A11.08) PMID:39105351 4896 2024-10-01 Contrary to our prediction, the presence or absence of sdr1+ did not have significant effect on atg1+ and atg20+ induction by sulfur starvation. PomBase SPCC417.09c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph sdr1 sdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC417.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdr1 sdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000080 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0002930 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0000059 medium PMID:39333464 4896 2024-11-13 (Fig. 4F) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001919 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:27168121 4896 2016-08-29 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001919 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:27168121 4896 2016-09-02 (Figure 3C) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001861 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 PMID:27168121 4896 2016-09-02 (Figure 3D) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0008335 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0000059 medium PMID:39333464 4896 2024-11-13 (Fig. 4F) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000972 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:27168121 4896 2016-09-02 (Figure 3C) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000324 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:27168121 4896 2016-09-02 (Figure 3E) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0002578 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000095 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001188 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0000091 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001492 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-23 (Figure 3B) PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0001491 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC18G6.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 edc1 edc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000655 C229A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-C229A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 S637T,T645A,T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S637T,T645A,T653A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0001645 1-159,493-972 Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1(NRDE-2) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.02),assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.05) PMID:34209806 4896 2021-07-30 The interactions of the Nrl1(NRDE-2) and the Nrl1(C-term) domain constructs with Mtl1 were significantly lower PomBase SPCC162.08c FYPO:0000134 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000103,FYECO:0000217 PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Figure 3B) Some cells appeared abnormally round, curved, bulged, or branched, indicating that Nup211 plays a role in maintaining proper cell shape (Fig 3B). Interestingly, nup211 shut-off cells also showed severe defects in septation and cytokinesis. These defects varied widely: some cells failed to develop a septum during division (Fig 3B- a), while others developed thicker (Fig 3B-b), misplaced (Fig 3B-c), or multiple septa (Fig 3B- d). Furthermore, septa were sometimes seen in shorter cells (Fig 3B-c), while other phenotypes like bulging (Fig 3B-c, 3B-e), branching (Fig 3B-e), curving, and swelling (Fig 3B-f) were also observed. PomBase SPCC162.08c FYPO:0000826 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPAPJ760.03c) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0000826 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPAC14C4.09) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0000826 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPBC646.06c) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0000950 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:39666777 4896 2025-03-05 some cells failed to develop a septum during division (Fig 3B- a) PomBase SPCC162.08c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPBC19G7.06) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPBC11C11.05) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0000231 FYECO:0000103,FYECO:0000106,FYECO:0000217 assayed_transcript(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 7) Nup211 regulates the expression of several genes involved in cytokinesis. PomBase SPCC162.08c FYPO:0001406 wild type Knockdown 972 h- ura4+ leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000217 PMID:39666777 4896 2025-03-05 Compared with wild type cells, a higher percentage of nup211 shut-off cells contained multiple and/or thicker septa (Fig 3C). PomBase SPCC162.08c FYPO:0003752 wild type Knockdown 972 h- nup211 nup211+ P81nmt1-nup211|nup211-so wild_type ECO:0001232 PMID:19557351 4896 2014-12-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 C174CRGTPC Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-F42 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPCC895.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC895.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC895.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC895.08c SPCC895.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000082 W804G Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-W804G amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002141 W804G Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-W804G amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002360 W804G Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-W804G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002336 W804G Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-W804G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0001164 W804G Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-W804G amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph nrk1 nrk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPBC216.07c FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 tor2 tor2-51 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.10) PMID:27191590 4896 2016-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001130 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001038 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.16) PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001890 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:20634885 4896 2016-01-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001890 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:20634885 4896 2016-01-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000780 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000780 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c) PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0008380 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1D) PomBase SPBC216.07c FYPO:0008380 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1D) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001501 unknown Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 tor2 tor2-51 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27165118 4896 2017-04-11 PomBase SPBC216.07c FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:17046992 4896 2017-02-07 (Comment: cells stop growing at high temperature, but remain viable and resume growth and division when returned to standard temperature PomBase SPBC216.07c FYPO:0002177 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-51 unknown ECO:0001232 PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S225A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S225A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 S225A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S225A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0009099 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph psr1 psr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- psr1 psr1delta deletion ECO:0001232 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Mid1p localization in these PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- mid1 mid1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10930468 4896 2023-03-01 and the generation time of the population was increased approximately two-fold (Figure 1C top). PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003389 wild type Overexpression 972 h- mid1 mid1+ wild_type ECO:0001232 40 PMID:10930468 4896 2023-03-01 Cells carrying pREP41Xmid1 exhibited a striking phenotype: they formed bulges near the cell center (Figure 1B). Medial bulges were exhibited in 40% of the cells 20 h after removal of thiamine (Figure 1C middle). Cells were longer than normal, suggestive of a cell cycle delay in interphase (Figure 1B) PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0003657 1-224 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-TM fsv1delta1-224|fsv1-TM partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC4B3.13 SPCC4B3.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 met9 met9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- met9 met9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- met9 met9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 met9 met9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000658 L32S Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-L32S amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001357 T154D,T99D,T74D,T60D,S87D Not assayed or wild type 972 h- drc1 drc1-CD5D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2011-11-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 1-242,421-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1(243-420) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- drc1 drc1-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11937031 4896 2014-12-15 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002917 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0002834 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1D) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004689 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1E) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004342 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004066 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c),assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 2A) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1F) PomBase SPCC306.04c FYPO:0000594 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPCC306.04c FYPO:0008154 SET domain delta Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-SET set1-SETdelta fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 2C) PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0000674 R10A Not assayed or wild type 972 h- spt4 spt4-R10A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19460865 4896 2015-11-26 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0001972 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 28 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vps25 vps25delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0004482 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0001232 PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0003577 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000265 assayed_using(PomBase:SPBC359.03c) PMID:22194353 4896 2014-07-09 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0000272 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 8 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0001460 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0000049 PMID:29856841 4896 2018-06-13 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0000339 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 1 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0000118 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 1 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0001986 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0006580 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:29856841 4896 2018-06-15 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0002634 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0001583 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0005969 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0005968 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0005253 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.06 FYPO:0002642 deletion 972 h- vps25 vps25delta deletion ECO:0005638 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prototroph rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC926.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC926.03 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC926.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rlc1 rlc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rlc1 rlc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11069761 4896 2017-01-25 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPAC926.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rlc1 rlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:11056543 4896 2017-01-25 PomBase SPAC926.03 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rlc1 rlc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- fis1 fis1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 we have found that deletion of the fission genes dnm1 or fis1 caused a significant increase of longevity whereas the loss of the fusion GTPase Msp1 had no effect on lifespan (Fig. 5C). PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.01 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph fis1 fis1delta deletion ECO:0005638 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(Fig. 2) PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0002014 C(-188)A,C(-187)A,A(-186)C,A(-185)C,T(-184)G Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-p.CCAAT fep1 CCAAT promoter mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC13A11.02c) PMID:18223116 4896 2019-05-23 (Fig. 2) PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0002014 C(-188)A,C(-187)A,A(-186)C,A(-185)C,T(-184)G Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-p.CCAAT fep1 CCAAT promoter mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.14c) PMID:18223116 4896 2019-05-23 (Fig. 2) PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0002014 C(-188)A,C(-187)A,A(-186)C,A(-185)C,T(-184)G Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-p.CCAAT fep1 CCAAT promoter mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:18223116 4896 2019-05-23 (Fig. 2) PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0002014 C(-188)A,C(-187)A,A(-186)C,A(-185)C,T(-184)G Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-p.CCAAT fep1 CCAAT promoter mutant nucleotide_mutation ECO:0000291 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PomBase SPAPB17E12.04c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csn2 csn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAPB17E12.04c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph csn2 csn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.04c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph csn2 csn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph csn2 csn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph csn2 csn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.04c FYPO:0004983 deletion 972 h- csn2 csn2delta deletion ECO:0005638 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ECO:0001232 PMID:1550959 4896 2012-12-27 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0003160 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0001232 PMID:1863602 4896 2014-02-26 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001842 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000151 PMID:1863602 4896 2014-02-26 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001842 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0005801 PMID:2172964 4896 2013-02-05 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001661 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0000335 PMID:1863602 4896 2014-02-26 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001666 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0000335 PMID:2172964 4896 2013-02-05 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:16273369 4896 2014-10-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- cyr1 cyr1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000125 PMID:1863602 4896 2014-02-26 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0003674 K38I Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-WA psm3-K38I amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(GO:0030892) PMID:26583750 4896 2016-05-25 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0005556 K38I Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-WA psm3-K38I amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(GO:0030892) PMID:24291789 4896 2016-11-25 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002098 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:16618806 4896 2018-04-11 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007479 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. S1I) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000957 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002099 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(S604) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002099 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000703 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. S1I) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPBC3D6.12 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dip2 dip2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.12 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dip2 dip2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- dip2 dip2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3D6.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dip2 dip2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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The scs7 mutation also caused a reduction in MIPC content. These results suggest that Imt proteins exhibit weak activity towards dihydroceramide-containing IPC, such that a reduction in MIPC was observed in sur2 and scs7 mutants. 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scs7 scs7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC19G12.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph scs7 scs7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph scs7 scs7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- scs7 scs7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scs7 scs7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scs7 scs7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0000147 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 PMID:14506270 4896 2016-06-23 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0005503 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 high assayed_protein(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:39012625 4896 2024-07-30 (Fig. 5A) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0005503 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227,FYECO:0000356 medium assayed_protein(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:39012625 4896 2024-07-30 The pak1-ts cells are characteristically monopolar; however, we unexpectedly found that around 40% of these cells treated with CK-666 showed bipolar localization of Scd1-mNG (Fig. 5 A, asterisks). PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001018 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001018 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:12764130 4896 2016-12-01 (Fig. 7A) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0003314 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 95 PMID:12764130 4896 2016-12-01 (Fig. 7B, C) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0005721 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 PMID:11972773 4896 2022-06-17 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0000422 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:39012625 4896 2024-07-30 (Fig. 9) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0005801 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0004109 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0002852 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-11-10 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001019 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9636183 4896 2016-03-09 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001397 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade6-M216 leu1-32 shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113 70 PMID:10574765 4896 2017-04-12 (Figure 3) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001395 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade6-M216 leu1-32 shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000113,FYECO:0000229 68 PMID:10574765 4896 2017-04-12 (Figure 2c) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001221 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17998401 4896 2012-07-16 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0006008 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 assayed_protein(PR:000050473) PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 4) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001587 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 2D) Protein localised to both cell tips during monopolar growth PomBase SPBC1604.14c FYPO:0007829 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_protein(PR:000050473) PMID:37039135 4896 2024-07-27 (Fig. 4) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0003250 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 7) PomBase SPBC1604.14c FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0005638 PMID:11972773 4896 2022-06-17 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8187760 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8187760 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-34 pak1-ts unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8187760 4896 2014-12-04 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000082 R542G,D582G,E659G,H677P,L683S Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 ppc89-2, ppc89-3 and ppc89-4 grow 19 similarly to wild-type at 25°C but do not form colonies at 36°C (Figure 1B PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0003245 R542G,D582G,E659G,H677P,L683S Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 At 36°C, ppc89-2 and ppc89-3 displayed an increased proportion of binucleate cells with “kissing” nuclei in which nuclei return to the cell center after a failed cytokiness as well as cell lysis (Figure 1C,D) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000647 R542G,D582G,E659G,H677P,L683S Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 At 36°C, ppc89-2 and ppc89-3 displayed an increased proportion of binucleate cells with “kissing” nuclei in which nuclei return to the cell center after a failed cytokiness as well as cell lysis (Figure 1C,D) PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 V160VGGTPV Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-J16 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0005989 fus1delta::fus1(1-792)-BamHIsite-cdc12(888-1841) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1N-cdc12C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 fus1delta::fus1(1-792)-BamHIsite-cdc12(888-1841) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1N-cdc12C fusion_or_chimera ECO:0001232 40 PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 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SPBC18H10.13 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph rps1402 rps1402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.13 FYPO:0009060 deletion 972 h- rps1402 rps1402delta deletion ECO:0001232 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972 h- end4 end4-delta-THATCH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC688.11) PMID:35024575 4896 2022-06-24 Conclusion is dawn by comparing Fig. 1H and Fig. 1I in https://www.micropublication.org/journals/biology/micropub-biology-000508. PomBase SPBC36B7.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dus1 dus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC36B7.04 FYPO:0001147 deletion 972 h- dus1 dus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:34798057 4896 2021-12-02 PomBase SPBC36B7.04 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph dus1 dus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.04 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph dus1 dus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dus1 dus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36B7.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dus1 dus1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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2017-04-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0005032 M630F Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M630F amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22144917 4896 2015-11-04 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001234 M630F Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M630F amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:22144917 4896 2015-11-04 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0006798 61-643 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-1-60 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29180432 4896 2019-01-02 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- smn1 smn1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10816558 4896 2014-07-25 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0000636 wild type Overexpression 972 h- smn1 smn1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10749974 4896 2015-12-01 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- smn1 smn1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10749974 4896 2015-12-01 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000141 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 6 PMID:30635289 4896 2019-02-07 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002711 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 PMID:7926774 4896 2014-08-05 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000625 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0005580 PMID:7926774 4896 2014-08-05 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004988 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 6C) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0003066 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 PMID:7926774 4896 2014-08-05 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000659 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001807 FYECO:0000005 assayed_using(GO:0030907),assayed_using(SO:0001855) PMID:9303312 4896 2018-05-03 (Fig. 8B) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002044 deletion 972 h- pat1-114 res2 res2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000127 PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0005460 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_region(PomBase:SPCC338.08),assayed_using(PomBase:SPBC16A3.07c) PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001443 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:7909513 4896 2014-07-11 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000826 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002975 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004630 deletion 972 h- pat1-114 res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004630 deletion 972 h- pat1-114 res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.01c) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0006613 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000049 high PMID:11389847 4896 2024-08-20 (Fig. 5A) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0003970 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 3 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001974 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:7926774 4896 2014-08-05 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000972 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 7 PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0005026 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2024-07-23 Through the visual screen, we identified that three mutants, nrm1D, yox1D, and res2D, showed abnormal CENP-A distribution patterns (Figure 2A). In these mutants, Cnp1-GFP at centromeres tends to be brighter and also gives a high nucleoplasmic signal (Figure 2A), suggesting an increase in Cnp1-GFP levels. PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000260 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 5A, B) level of cdc18 transcript does not decreased after release from HU block PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004191 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000825 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 6C) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000825 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000239 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000228 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 2 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 res2 res2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0003031 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000254 52 PMID:7909513 4896 2014-07-11 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002360 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 (Figure 1 G) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002336 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0003555 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 (Figure 1 G) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 res2 res2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000760 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 PMID:7926774 4896 2014-08-05 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0005180 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0005580 PMID:15498101 4896 2016-01-18 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0006739 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.04) PMID:30134042 4896 2018-11-08 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001317 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0002843 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2019-02-07 Through the visual screen, we identified that three mutants, nrm1D, yox1D, and res2D, showed abnormal CENP-A distribution patterns (Figure 2A). In these mutants, Cnp1-GFP at centromeres tends to be brighter and also gives a high nucleoplasmic signal (Figure 2A), suggesting an increase in Cnp1-GFP levels. PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0006975 deletion 972 h- pat1-114 res2 res2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0004325 deletion 972 h- res2 res2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC22F3.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph res2 res2delta deletion 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Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0002555 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000941 L12P Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0006825 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2024-07-10 In sharp contrast, on a cdc7-24 or sid1-239 mutant background, no Pmo25 was detected at the mitotic SPB(s) (Figure 8B and C). PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000272 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001876 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:22419817 4896 2013-08-23 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000082 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001382 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001382 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17317928 4896 2017-08-16 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0003331 L12P Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0003331 L12P Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.12) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0004044 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0002061 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001294 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0003028 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001368 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001368 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000833 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0002967 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0005709 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 Similar results were obtained in cdc14-118, sid1-239, and cdc11-136 mutants (not shown). PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0004082 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1D) The hyperphosphorylated form (3) of cdc11p was observed during mitosis in both sid2-250 and sid1- 239 mutants PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001904 L12P Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0002060 L12P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid1 sid1-239 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAPB1A10.08 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAPB1A10.08 SPAPB1A10.08delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAPB1A10.08 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A10.08 SPAPB1A10.08delta deletion ECO:0005638 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assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 Remarkably, the Wsc1DCC-GFP lacking a large fraction of the cytoplasmic C-terminal tail, and thus presumably defective in downstream signal transduction was dispensable for clustering. This finding reinforces the notion that Wsc1 clustering occurs independently of downstream CWI signaling. 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ade6-M210 cmt1 cmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.03c FYPO:0006836 unknown Not assayed or wild type 972 h- cis4 cis4-1 unknown ECO:0005638 high PMID:22848669 4896 2024-06-26 The cis4-1 mutant cells grew well in rich YPD medium, however, in the presence of 0.15 M MgCl2, the cis4-1 cells failed to grow, whereas wild-type cells grew well (Figure 1A). PomBase SPAC17D4.03c FYPO:0000086 unknown Not assayed or wild type 972 h- cis4 cis4-1 unknown ECO:0005638 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 Likewise, these three genes complemented the FK506-sensitive phenotype of the cis4-1 mutant (Figure 1A). PomBase SPCC794.02 FYPO:0001489 Wtf5 with aa (73-171) replaced by Wtf10 aa (73-160) tethered to a deubiquitinase using the GFP-GBP interaction Ectopic 972 h- wtf5 wtf5(73-171)-swap-wtf10(73-160)-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2025-01-07 (Fig. S6C) PomBase SPAC19G12.10c FYPO:0001423 S661A Not assayed or wild type 972 h- cpy1 cpy1(S661A) cpy1(S609A) amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:9209031 4896 2018-10-10 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000611 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000444 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0003165 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 low PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001128 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001490 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002061 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000703 K571A,R572A Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-51 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:17531813 4896 2017-11-01 (Fig. 4A) PomBase SPBC146.13c FYPO:0003452 I748A,Q749A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-IQ2-AA myo1-IQ2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC29A4.05) PMID:21693583 4896 2019-11-08 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000744 I748A,Q749A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-IQ2-AA myo1-IQ2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC146.13c) PMID:21693583 4896 2019-11-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000021 I748A,Q749A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-IQ2-AA myo1-IQ2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21693583 4896 2019-11-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002060 I748A,Q749A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-IQ2-AA myo1-IQ2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21693583 4896 2019-11-11 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0002999 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 orb2-ts unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, S3a) PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0001068 unknown 972 h- pho1 pho1-187 unknown ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:3447747 4896 2012-05-16 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002687 K75R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75R amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPATRNASER.03 FYPO:0003956 G35T Not assayed or wild type 972 h- sup3 sup3-G35T sup3-5|sup3-e|sup3-i nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:6370683 4896 2014-10-29 PomBase SPATRNASER.03 FYPO:0003911 G35T Not assayed or wild type 972 h- sup3 sup3-G35T sup3-5|sup3-e|sup3-i nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:6818425 4896 2014-10-21 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000339 wild type Knockdown 972 h- kin1 kin1+ wild_type ECO:0001232 PMID:19597328 4896 2024-11-27 In Kin1 downregulating cells, we observed that septa were orthogonal to the long cell axis but their positions seemed to be frequently eccentric (Kin1 OFF, Fig. 3A). PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0001125 wild type Knockdown 972 h- kin1 kin1+ wild_type ECO:0001232 PMID:19597328 4896 2024-11-27 Cell shape or interphase F-actin polarity defects were not observed (Suppl. Fig. S1) conversely to the deletion strain. PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0003302 wild type Knockdown 972 h- kin1 kin1+ wild_type ECO:0001232 PMID:19597328 4896 2024-11-27 of the nucleus relative to the cell ends in late G2 cells (≥10 μm) and we observed that a higher proportion of nuclei were misplaced towards the new cell end PomBase SPBC336.15 FYPO:0000705 1-764,925-1018 Not assayed or wild type 972 h- pic1 pic1-765-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC336.15),assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11950927 4896 2020-06-30 Pic1-765-924, which lacks the IN box, failed to bind Ark1p PomBase SPBC216.02 FYPO:0000927 846-968 Not assayed or wild type 972 h- num1 num1-deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPBC216.02 FYPO:0000930 846-968 Not assayed or wild type 972 h- num1 num1-deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPCC18.01c FYPO:0000239 deletion 972 h- adg3 adg3delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPCC18.01c FYPO:0003334 deletion 972 h- adg3 adg3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC18.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph adg3 adg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- adg3 adg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC18.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adg3 adg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adg3 adg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC222.09 FYPO:0002577 R442A,H443A,F445A,K447A Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-RRMmut amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC222.09) PMID:27401558 4896 2018-03-20 PomBase SPAC222.09 FYPO:0001355 R442A,H443A,F445A,K447A Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-RRMmut amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106 PMID:27401558 4896 2018-03-20 PomBase SPAC222.09 FYPO:0001355 R442A,H443A,F445A,K447A Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-RRMmut amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC576.08c) PMID:27401558 4896 2018-03-26 PomBase SPAC222.09 FYPO:0003049 R442A,H443A,F445A,K447A Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-RRMmut amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:27401558 4896 2018-03-20 PomBase SPAC222.09 FYPO:0003049 R442A,H443A,F445A,K447A Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-RRMmut amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC576.08c) PMID:27401558 4896 2018-03-20 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- pus3 pus3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- pus3 pus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 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mrc1-1-535,674-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-535,674-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1(536-673) mrc1-1-535,674-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-535,674-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1(536-673) mrc1-1-535,674-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22024164 4896 2016-06-07 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002957 R184F,D185T Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-216 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17A5.18c) PMID:28469148 4896 2017-09-29 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002485 R184F,D185T Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-216 amino_acid_mutation ECO:0000049 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FYPO:0001677 wild type Overexpression 972 h- tea1 tea1+ nmt1-tea1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 3A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006103 wild type Overexpression 972 h- tea1 tea1+ nmt1-tea1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 6D) PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0004250 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.05) PMID:33534698 4896 2021-07-09 Consistently, in the absence of intact GATOR1, the vacuolar localization of Sea3 (Figure 1E) was lost and the protein diffused throughout the cytosol (Figure 3I, Figure 3—Figure supplement 1A) PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0000705 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.05),assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 The binding of Sea3 to GATOR1 is dependent on the integrity of the GATOR1 complex, and the absence of any one of the GATOR1 subunits disrupted the Sea3-GATOR1 association (Figure 3F,G and H). PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38051102 4896 2023-12-15 Notably, the absence of Sfp1 modestly alleviates the growth defect of the mutants lacking functional GATOR1 (Fig. 1I); the absence of GATOR1 causes a severe growth defect due to deregulated TORC1 activation,28 and therefore, the observed genetic interaction corroborates a functional link between Sfp1 and TORC1. PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0004780 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 2b) PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0006345 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 2g) PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0006345 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001038 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.02c) PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001522 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0002672 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0004248 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0004248 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001029 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iml1 iml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.819 FYPO:0009020 deletion 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ED668 vta1 vta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC13F5.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 vta1 vta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC13F5.04c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph vta1 vta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph vta1 vta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph vta1 vta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13F5.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- vta1 vta1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13F5.04c 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2023-06-28 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- plb1 plb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- plb1 plb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- plb1 plb1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph plb1 plb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph plb1 plb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.04c FYPO:0000271 deletion 972 h- plb1 plb1delta deletion ECO:0005638 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4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPCC330.10 FYPO:0003031 unknown Not assayed or wild type 972 h- pcm1 pcm1-hmt7 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPCC330.10 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- pcm1 pcm1-hmt7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 S873F 972 h- mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21376595 4896 2011-12-09 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0000320 deletion 972 h- mpg1 mpg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16049679 4896 2013-01-25 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpg1 mpg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0002025 deletion 972 h- mpg1 mpg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16049679 4896 2017-05-05 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- mpg1 mpg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1906.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpg1 mpg1delta deletion 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ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002061 E33V,E69V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002061 E33V,E69V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC1687.22c FYPO:0006809 1-62 Not assayed or wild type 972 h- puf3 puf3-delta63 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 low PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPAC1006.09 FYPO:0000705 1-845,1124-1436 Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-846-1123 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0000963 deletion 972 h- mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37615341 4896 2024-04-08 (Fig. 2-S1A) PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0000957 deletion 972 h- mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000211 PMID:37615341 4896 2024-04-08 (Fig. 2-S1A) PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0002799 deletion 972 h- mud1 mud1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC1D4.09c) PMID:37615341 4896 2024-04-08 This further suggests that Mud1 is not playing the same role in regulating Rtf2 in S. pombe as has been observed for DDI1/2 in human cells. Fig. 2-S1B PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37615341 4896 2024-04-08 (Fig. 2-S1A) PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mud1 mud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- mud1 mud1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mud1 mud1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mud1 mud1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0001934 deletion 972 h- coq10 coq10delta 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ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_enzyme(PomBase:SPAC13G6.14) PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 4A) PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0003730 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1C) PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0003730 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1C) PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0000082 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 PMID:21727087 4896 2011-08-03 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0000251 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 PMID:21727087 4896 2011-08-03 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ppr3 ppr3delta deletion 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SPBC19G7.07c FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0001919 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0001232 high PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 2A) PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0005760 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1B) PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0002006 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0003004 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0001232 high PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 3C) PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0000377 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-01 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0003335 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000034,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-19 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0006597 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-26 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0006596 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-26 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0005823 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-14 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0005824 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion ECO:0001232 PMID:27886462 4896 2016-12-14 PomBase SPBC19G7.07c FYPO:0003776 deletion 972 h- ppr3 ppr3delta deletion 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FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Figure 3A) PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0002674 deletion 972 h- opy1 opy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC577.06c) PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Figure S2) PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph opy1 opy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph opy1 opy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph opy1 opy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph opy1 opy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0009085 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PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph coa3 coa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph coa3 coa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph coa3 coa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph coa3 coa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph coa3 coa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph coa3 coa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.21 FYPO:0002924 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(Figure 5) PomBase SPBC13E7.08c FYPO:0001839 disruption Not assayed or wild type 972 h- leo1 leo1::Hermes disruption ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPAC821.08c FYPO:0003066 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC821.08c FYPO:0004481 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC821.08c FYPO:0000705 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC821.08c FYPO:0000584 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC821.08c FYPO:0001355 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:36108046 4896 2023-01-20 PomBase SPAC821.08c FYPO:0001327 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC821.08c FYPO:0001984 W376* Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-362 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBPB8B6.04c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 S7SGVPHS Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J12 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 S7SGVPHS Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J12 amino_acid_insertion ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 S7SGVPHS Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J12 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPCC18.09c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hnt3 hnt3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC18.09c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hnt3 hnt3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC18.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hnt3 hnt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hnt3 hnt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hnt3 hnt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.09c FYPO:0001098 deletion 972 h- 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hnt3 hnt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23E6.08 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rgp1 rgp1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC23E6.08 FYPO:0002033 deletion 972 h- rgp1 rgp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPBC23E6.08 FYPO:0002033 deletion 972 h- rgp1 rgp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPBC23E6.08 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rgp1 rgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.08 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rgp1 rgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.08 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4896 2015-01-15 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001575 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001407 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0006345 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001038 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:22344254 4896 2021-02-07 vam6D mutant cells showed similar Rps6 phosphorylation levels to that of wild-type cells in the absence of amino acids. However, in contrast to wild-type cells, vam6D cells did not show an increase in Rps6 phosphorylation in the presence of amino acids. PomBase SPBC337.13c FYPO:0001522 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002672 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002716 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22344254 4896 2021-02-07 FM4-64 stained only small vesicles in the cytoplasm of vam6D cells, confirming a defect in vacuolar fusion in these cells. PomBase SPBC337.13c FYPO:0001029 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001453 Q61L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0003549 1-288 Not assayed or wild type 972 h- spo5 spo5-C spo5C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:16896214 4896 2014-07-17 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0002708 1-288 Not assayed or wild type 972 h- spo5 spo5-C spo5C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16896214 4896 2014-07-17 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0002150 1-288 Not assayed or wild type 972 h- spo5 spo5-C spo5C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16896214 4896 2014-07-17 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- cdt2 cdt2+ wild_type ECO:0000279 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2013-09-03 PomBase SPAC30C2.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mmd1 mmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.02 FYPO:0005838 deletion 972 h- mmd1 mmd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14767070 4896 2017-05-18 PomBase SPAC30C2.02 FYPO:0005838 deletion 972 h- mmd1 mmd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:14767070 4896 2017-05-18 PomBase SPAC30C2.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- mmd1 mmd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC30C2.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmd1 mmd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30C2.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmd1 mmd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001018 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 97 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001128 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001494 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-11 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0002525 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-11 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7628434 4896 2013-08-20 PomBase SPCC553.02 FYPO:0008446 wild type Knockdown 972 h- qns1 qns1+ wild_type ECO:0005801 PMID:39378339 4896 2025-08-14 Given that Qns1 converts NaAD to NAD, amounts of these metabolites were expected to be altered in qns1-KD cells. Therefore, these metabolites were quantified in the qns1-KD strain. After induction of CRISPRi, qns1-KD and nonsense control cells were broken down in methanol, and their watersoluble metabolites were quantified by liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) (Fig. 5 B). In qns1- KD cells, the amount of NAD was reduced to about one-fifth of that in control cells, whereas the amount of NaAD increased by 23.5-fold in a specific manner (Fig. S5 B), consistent with the predicted function of Qns1. NAD is consumed by enzymes and converted to nicotinamide (NAM), which is utilized to regenerate NAD through the Preiss-Handler pathway after conversion to NA (Castro-Portuguez and Sutphin, 2020; Preiss and Handler, 1958a, 1958b). NAM and NA also accumulated after the knockdown of qns1+ (Fig. 5 B) PomBase SPCC553.02 FYPO:0008444 wild type Knockdown 972 h- qns1 qns1+ wild_type ECO:0005801 PMID:39378339 4896 2025-08-14 Given that Qns1 converts NaAD to NAD, amounts of these metabolites were expected to be altered in qns1-KD cells. Therefore, these metabolites were quantified in the qns1-KD strain. After induction of CRISPRi, qns1-KD and nonsense control cells were broken down in methanol, and their watersoluble metabolites were quantified by liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) (Fig. 5 B). In qns1- KD cells, the amount of NAD was reduced to about one-fifth of that in control cells, whereas the amount of NaAD increased by 23.5-fold in a specific manner (Fig. S5 B), consistent with the predicted function of Qns1. NAD is consumed by enzymes and converted to nicotinamide (NAM), which is utilized to regenerate NAD through the Preiss-Handler pathway after conversion to NA (Castro-Portuguez and Sutphin, 2020; Preiss and Handler, 1958a, 1958b). NAM and NA also accumulated after the knockdown of qns1+ (Fig. 5 B) PomBase SPCC553.02 FYPO:0008445 wild type Knockdown 972 h- qns1 qns1+ wild_type ECO:0005801 PMID:39378339 4896 2025-08-14 Given that Qns1 converts NaAD to NAD, amounts of these metabolites were expected to be altered in qns1-KD cells. Therefore, these metabolites were quantified in the qns1-KD strain. After induction of CRISPRi, qns1-KD and nonsense control cells were broken down in methanol, and their watersoluble metabolites were quantified by liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) (Fig. 5 B). In qns1- KD cells, the amount of NAD was reduced to about one-fifth of that in control cells, whereas the amount of NaAD increased by 23.5-fold in a specific manner (Fig. S5 B), consistent with the predicted function of Qns1. NAD is consumed by enzymes and converted to nicotinamide (NAM), which is utilized to regenerate NAD through the Preiss-Handler pathway after conversion to NA (Castro-Portuguez and Sutphin, 2020; Preiss and Handler, 1958a, 1958b). NAM and NA also accumulated after the knockdown of qns1+ (Fig. 5 B) PomBase SPAP27G11.15 FYPO:0007141 R34A,E74A Not assayed or wild type 972 h- slx1 slx1-R34A,E74A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAP27G11.15) PMID:14528010 4896 2019-11-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T101C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U101C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T101C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U101C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 F286L Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-F286L amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPBC8D2.09c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msl1 msl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.09c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ msl1 msl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. 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deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPMTR.02) PMID:30089908 4896 2018-09-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0006673 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005580 PMID:30089908 4896 2018-09-04 (Figure 1c) PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0004807 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 PMID:30089908 4896 2018-08-19 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001357 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9660818 4896 2019-10-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001357 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9660818 4896 2019-10-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001357 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9660818 4896 2019-10-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001983 deletion 972 h- M cell (h-) shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC119.04) PMID:30089908 4896 2018-09-04 Fig. 2a, Supplementary Video 5, Fig. 2b, Supplementary Video 2a Importantly, mei3 was also asymmetrically expressed in WT...zygotes first express the meiotic inducer Mei3 from the P genome. PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000073 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001103 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000095 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001188 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000113,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000107 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000091 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0006672 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 high PMID:30089908 4896 2018-09-04 (Fig. 1a) type IIIb PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0006672 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 PMID:30089908 4896 2018-09-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0000678 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 PMID:30089908 4896 2018-09-04 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shk2 shk2delta deletion ECO:0001232 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mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mpd2 mpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- mpd2 mpd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpd2 mpd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpd2 mpd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0008244 1-117 Not assayed or wild type 972 h- meu10 (meu10-N117delta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1223.12c) PMID:11895484 4896 2024-06-12 Moreover, Meu10-N117∆-GFP signals in the abnormally shaped ascospores werenot detected (Fig. 8Ciii), indicating that this domain isessential for the spore wall localization of Meu10 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0002150 1-117 Not assayed or wild type 972 h- meu10 (meu10-N117delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:11895484 4896 2024-06-12 Like the meu10∆ mutant, the spores from this mutantwere not viable (Fig. 8B) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006785 G116A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-G116A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0006786 G116A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-G116A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000279 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 2D and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0003507 G116A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-G116A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000173 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figure 2D and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0004247 G116A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-G116A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figure 2—Figure supplement 1D) PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0000339 G1032E 972 h- rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21376595 4896 2011-12-09 PomBase SPAC144.08 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph jac1 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jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph jac1 jac1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.08 FYPO:0000799 deletion 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PomBase SPBC17G9.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sib3 sib3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sib3 sib3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.06c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sib3 sib3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.06c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sib3 sib3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.06c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sib3 sib3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.06c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph sib3 sib3delta deletion 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assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:21217703 4896 2023-02-16 An arginine substitution of Ile379 or Leu383 of Taz1 or Ile655 of SpRap1 at the center of the hydrophobic interface completely abolished the Taz1RBM-SpRap1RCT interaction (Fig. 6a). PomBase SPAC637.10c FYPO:0000703 194-243 Not assayed or wild type 972 h- rpn10 rpn10-Cdelta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC637.10c),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPAC637.10c FYPO:0000703 194-243 Not assayed or wild type 972 h- rpn10 rpn10-Cdelta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC637.10c),assayed_using(PomBase:SPBC106.09) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPAC637.10c FYPO:0000703 194-243 Not assayed or wild type 972 h- rpn10 rpn10-Cdelta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC637.10c),assayed_using(PomBase:SPBC17D11.07c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPAC637.10c FYPO:0000703 194-243 Not assayed or wild type 972 h- rpn10 rpn10-Cdelta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC637.10c),assayed_using(PomBase:SPBC4.07c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPAC637.10c FYPO:0000703 194-243 Not assayed or wild type 972 h- rpn10 rpn10-Cdelta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC637.10c),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001669 K659E,K685E Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M3 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000134,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:25771684 4896 2015-07-20 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001645 K659E,K685E Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M3 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.15c) PMID:25771684 4896 2015-07-20 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001245 K659E,K685E Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25771684 4896 2015-07-20 PomBase SPAPB15E9.01c FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- pfl2 pfl2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 3) PomBase SPCC338.08 FYPO:0000581 Q120H,F232L Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-11 amino_acid_mutation ECO:0005638 10 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0000537 G299D Not assayed or wild type 972 h- pho1 pho1-232 amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:2381421 4896 2013-05-20 PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0001911 G299D Not assayed or wild type 972 h- pho1 pho1-232 amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:2381421 4896 2013-05-20 PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004248 E393A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-E393A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000703 E393A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-E393A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 4—Figure supplement 1B) PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0006013 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11D3.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.06 SPAC11D3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.16 FYPO:0000705 1-448 Not assayed or wild type 972 h- res1 res1delta448 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c),assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:7739540 4896 2014-08-07 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0004565 S288P Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-S288P amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:15580593 4896 2015-04-16 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000659 R644H Overexpression 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1223.13),assayed_using(SO:0001839) PMID:23555033 4896 2013-05-16 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000838 R644H Overexpression 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1223.13) PMID:23555033 4896 2013-05-17 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000173 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0003923 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:34228709 4896 2021-09-14 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001355 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34228709 4896 2021-09-14 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000614 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000126 PMID:34228709 4896 2021-07-21 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001707 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002573 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0000092 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000141 PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000256 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 medium PMID:34228709 4896 2021-07-21 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0005753 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002578 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34228709 4896 2021-09-14 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001098 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 high PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000095 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000089 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 high PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000268 P287R Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-P287R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000168 R64A Not assayed or wild type 972 h- nda- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000117 R64A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001880 R64A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 3E, 3F) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000941 R64A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 3E, 3F) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000912 R64A Not assayed or wild type 972 h- mts3-1 dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:36138017 4896 2023-01-18 Strikingly, Tip1 ubiquitination was abolished in both dma1 mutants (Fig. 2d), demonstrating that both functional FHA and RF domains in Dma1 are required for Tip1 ubiquitination in vivo. PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000705 R64A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:36138017 4896 2022-11-08 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000705 R64A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_using(PomBase:SPBC25D12.02c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005781 R64A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-R64A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12479804 4896 2019-01-30 Table1 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 1-478 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-479-508 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 1-478 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-479-508 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 1-478 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-479-508 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC30.01c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0005252 deletion 972 h- sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 medium PMID:35172472 4896 2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPAC30.01c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sec72 sec72delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- sec72 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SPAC18G6.10 FYPO:0004886 317-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-Nterm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 5b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003411 317-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-Nterm partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 low PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6d) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004604 317-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-Nterm partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 medium PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6e) PomBase SPAC10F6.17c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ptc5 ptc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.17c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ptc5 ptc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.17c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ptc5 ptc5delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPAC1834.09 FYPO:0007925 deletion 972 h- whr1 whr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1834.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- whr1 whr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1834.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 whr1 whr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1834.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 whr1 whr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC631.01c FYPO:0006120 244-268 Not assayed or wild type 972 h- acp2 acp2deltat partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC631.01c) PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 5) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007097 244-268 Not assayed or wild type 972 h- acp2 acp2deltat 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PMID:35536002 4896 2022-10-19 (Fig. 8) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008013 386-920,K341A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)K341A asp1-(1-385)K341A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPAC1093.03 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph fig4 fig4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.03 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph fig4 fig4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph fig4 fig4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.03 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph fig4 fig4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 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2023-06-28 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph rmt3 rmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rmt3 rmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph rmt3 rmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph rmt3 rmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rmt3 rmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rmt3 rmt3delta 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deletion 972 h- rmt3 rmt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rmt3 rmt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- rmt3 rmt3delta deletion ECO:0005638 PMID:15175657 4896 2018-06-22 data not shown PomBase SPBC8D2.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rmt3 rmt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC106.01 FYPO:0003762 1-150 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-150) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22825872 4896 2020-05-31 The shorter truncation (Mph1-D1-150) maintained kinetochore localization and SAC signaling PomBase SPBC106.01 FYPO:0005212 1-150 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-150) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.01) PMID:22825872 4896 2020-05-31 The shorter truncation (Mph1-D1-150) maintained kinetochore localization and SAC signaling PomBase SPBC106.01 FYPO:0005212 1-150 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-delta(1-150) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4C). PomBase SPAC631.02 FYPO:0001357 Y430F Not assayed or wild type 972 h- bdf2 bdf2-Y430F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0000082 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 medium PMID:30355493 4896 2018-11-14 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001645 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001645 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.11c) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001645 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPAC821.06) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001645 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001645 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 4) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001122 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30355493 4896 2018-11-14 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001571 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.16),assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001571 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBC1703.07) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001571 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPCC1739.08c) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001571 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.16),assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001571 D54* Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-deltahelix partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBC1703.07) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 2d) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004067 S499A,T542V,K544A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-S499A,T542V,K544A fcp1-S499A/T542V/K544A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0005061 S499A,T542V,K544A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-S499A,T542V,K544A fcp1-S499A/T542V/K544A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 1-545,584-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(546-583) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000705 1-545,584-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(546-583) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000703 1-545,584-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(546-583) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000703 1-545,584-926 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(546-583) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPCC306.03c FYPO:0003286 L103P Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-ae9 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23263988 4896 2014-04-04 PomBase SPAC458.03 FYPO:0003814 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000162 high PMID:31332096 4896 2019-10-05 | PomBase SPAC458.03 FYPO:0000229 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:31332096 4896 2019-10-14 PomBase SPAC458.03 FYPO:0001324 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:31332096 4896 2019-10-17 PomBase SPAC458.03 FYPO:0001324 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:31332096 4896 2019-10-17 PomBase SPAC458.03 FYPO:0003803 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:31332096 4896 2019-10-17 PomBase SPAC458.03 FYPO:0003803 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC458.03) PMID:31332096 4896 2019-10-17 PomBase SPAC458.03 FYPO:0001645 C307Y Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-C307Y tel2-hus227 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC458.03),assayed_using(PomBase:SPCC622.13c) 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amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:31332096 4896 2019-10-17 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004481 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0005850 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC222.04c) PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0005850 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC144.02) PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001269 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-02-13 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001269 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:19758558 4896 2014-12-18 (Fig. S3D) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000082 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003217 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 low PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004313 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC222.04c) PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC144.02) PMID:28904333 4896 2019-03-07 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 low assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:34810257 4896 2022-07-01 whereas the localization of GFP-Ccp1 at centromeres only has a mild reduction in the CENP-A ts mutant, cnp1-1 (SI Appendix, Fig. S4). PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 low assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-07-01 whereas the localization of GFP-Ccp1 at centromeres only has a mild reduction in the CENP-A ts mutant, cnp1-1 (SI Appendix, Fig. S4). PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002902 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPBP22H7.09c) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002902 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002902 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPBC21.01) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002902 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPCC970.12) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0005072 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:19217404 4896 2016-03-01 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002901 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002901 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1805.07c) PMID:17352737 4896 2015-02-11 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001984 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:12535531 4896 2018-02-28 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003559 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000678 L87Q Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K68Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K68Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K68Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K68Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000703 440-2386 Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3(1-439) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.05),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPCC1739.06c FYPO:0000040 unknown Not assayed or wild type 972 h- met1 met1- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0000245 W344* Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-W344->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC2G11.07c FYPO:0001757 ptc3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- ptc3 ptc3::ura4+ disruption ECO:0005638 medium PMID:7859738 4896 2017-07-21 PomBase SPAC2G11.07c FYPO:0006822 ptc3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- ptc3 ptc3::ura4+ disruption ECO:0005638 medium PMID:7859738 4896 2017-07-21 PomBase SPAC2G11.07c FYPO:0002060 ptc3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- ptc3 ptc3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:7859738 4896 2017-07-21 (Figure 4) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 T15V,K56E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T15V,K56E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000085 T15V,K56E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T15V,K56E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000268 T15V,K56E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T15V,K56E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPBC839.15c FYPO:0001118 wild type Overexpression 972 h- tef103 tef103+ wild_type ECO:0001232 PMID:10526238 4896 2014-07-30 PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0007505 215-343 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaSET partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.11c),assayed_region(PomBase:SPCC1393.10) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 4D) PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0004742 215-343 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaSET partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 2) PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0008245 215-343 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaSET partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.11c),assayed_region(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 4D) PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0008245 215-343 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaSET partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.11c),assayed_region(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 4D) PomBase SPBC83.18c FYPO:0003532 S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-S241D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32878942 4896 2020-09-11 PomBase SPBC83.18c FYPO:0003776 S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-S241D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:32878942 4896 2020-10-07 (Fig. 4H,I and S3F,G) PomBase SPBC83.18c FYPO:0000674 S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-S241D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure S1) PomBase SPAC24H6.07 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rps901 rps901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.07 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rps901 rps901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.07 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rps901 rps901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.07 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rps901 rps901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.07 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rps901 rps901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAC22F8.11 FYPO:0001045 P708L Not assayed or wild type 972 h- plc1 plc1-P708L amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 5B) PomBase SPAC22F8.11 FYPO:0002141 P708L Not assayed or wild type 972 h- plc1 plc1-P708L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 5A) PomBase SPAC22F8.11 FYPO:0001357 P708L Not assayed or wild type 972 h- plc1 plc1-P708L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 5A) PomBase SPAC22F8.11 FYPO:0001357 P708L Not assayed or wild type 972 h- plc1 plc1-P708L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 5A) PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258,D81R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-D81R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 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2016-11-02 PomBase SPAC15A10.03c FYPO:0005371 K300R Not assayed or wild type 972 h- rad54 rad54-KR rad54KA amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPAC15A10.03c FYPO:0000972 K300R Not assayed or wild type 972 h- rad54 rad54-KR rad54KA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPAC15A10.03c FYPO:0000703 K300R Not assayed or wild type 972 h- rad54 rad54-KR rad54KA amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.03c),assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:27697832 4896 2016-11-17 PomBase SPAC15A10.03c FYPO:0000085 K300R Not assayed or wild type 972 h- rad54 rad54-KR rad54KA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPAC15A10.03c FYPO:0000088 K300R Not assayed or wild type 972 h- rad54 rad54-KR rad54KA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPAC15A10.03c FYPO:0000089 K300R Not assayed or wild type 972 h- rad54 rad54-KR rad54KA amino_acid_mutation ECO:0005638 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PomBase SPCC622.08c FYPO:0004212 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119D amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPCC622.08c FYPO:0002679 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119D amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Te recombinant proteins of fssion yeast H2A (SpHta1) were also purifed. An in vitro kinase assay using these recombinant proteins showed that the H2A-K119D and the H2A-K119E mutants, as well as the H2A-S121A mutant, were not signifcantly phosphorylated by Bub1, whereas H2A-K119R mutant proteins were phosphorylated by Bub1 (Fig. 4B). PomBase SPCC622.08c FYPO:0000091 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29769606 4896 2024-04-24 We found that malonyl-mimetic K119D and K119E mutants showed sensitivity to a microtubule depolymerizing agent (TBZ) in the same way the H2A-S121A mutant had (Fig. S3B) PomBase SPCC622.08c FYPO:0005633 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29769606 4896 2024-04-24 Consistently, sister chromatid non-disjunction at meiosis II was signifcantly increased in the K119D and K119E mutants PomBase SPNCRNA.399 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.399 SPNCRNA.399delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000703 S187N Not assayed or wild type 972 h- mad2 mad2-S187N amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003674 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005929 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003412 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6A) both clr3D232N and mit1K587A mutant alleles alleviated silencing of a marker gene inserted at pericentromeric repeats PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003412 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002827 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6B) PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0004604 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6B) PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005931 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000703 K587A Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-K587A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.10),assayed_using(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0003066 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:15862318 4896 2014-08-18 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0003066 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0001232 PMID:15277753 4896 2015-10-20 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0006492 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0005801 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0000584 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0001232 high PMID:15862318 4896 2014-08-18 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0000584 deletion 972 h- chs1 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deletion ECO:0001232 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0001420 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0001420 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0001420 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0001420 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0001420 deletion 972 h- chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:10632879 4896 2018-04-08 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G6.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph chs1 chs1delta deletion ECO:0005638 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2019-01-30 (Figure 2A) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001382 wild type Overexpression 972 h- dma1 dma1+ wild_type ECO:0001232 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 2D) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005716 wild type Overexpression 972 h- cdc25-22 dma1 dma1+ wild_type ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8978687 4896 2016-10-06 (Fig. 6c) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000729 wild type Overexpression 972 h- cdc25-22 dma1 dma1+ wild_type ECO:0000112 PMID:8978687 4896 2016-10-06 (Fig. 6a) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004648 wild type Overexpression 972 h- cdc25-22 dma1 dma1+ wild_type ECO:0000112 PMID:8978687 4896 2016-10-06 (Fig. 6a) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002049 wild type Overexpression 972 h- cdc25-22 dma1 dma1+ wild_type ECO:0000112 PMID:8978687 4896 2016-10-06 (Fig. 7) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004106 wild type Overexpression 972 h- dma1 dma1+ wild_type ECO:0001232 PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 2) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002061 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4896 2017-04-28 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mde3 mde3delta deletion 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SPBC8D2.19 FYPO:0000112 deletion 972 h- mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0000091 deletion 972 h- mde3 mde3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0002060 deletion 972 h- mde3 mde3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mde3 mde3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.19 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mde3 mde3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007446 114-130 Not assayed or wild type 972 h- yep1Δ hva22 yep1delta(114-130) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Fig. 3K) PomBase SPCC736.12c FYPO:0001357 1-93 Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-(94-488) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 8) PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0003810 wild type Overexpression 972 h- atg44 atg44+ wild_type ECO:0001232 PMID:37192628 4896 2023-06-13 Overexpression of Atg44 in both species caused mitochondrial fragmentation not only in wild-type cells but also in Dnm1-deficient cells (Figures 3E and 3F). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0000468 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-4T unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:11780129 4896 2024-04-12 we found that cohesin mutants (psc3-1T, psc3-2T, psc3-4T and rad21-K1) produced switching-defective colonies at a rate nearly 100-fold that of the wild type (Fig. 2a,b). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-4T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.20) PMID:11780129 4896 2024-04-12 shown), and the association with otr and KR was much reduced (Fig. 1d). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0002360 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-4T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11780129 4896 2024-04-12 We consistently observed that psc3-4T and the other psc3 mutant alleles had no detectable effect on the silencing of a marker gene inserted at either centromeric (otr1R::ura4+) repeats or in the silent mating-type (Kint2::ura4+) region (see Supplementary Information). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0002336 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-4T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11780129 4896 2024-04-12 We consistently observed that psc3-4T and the other psc3 mutant alleles had no detectable effect on the silencing of a marker gene inserted at either centromeric (otr1R::ura4+) repeats or in the silent mating-type (Kint2::ura4+) region (see Supplementary Information). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0002336 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-4T unknown ECO:0005638 PMID:31278118 4896 2020-04-30 (Fig. 7) PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0002389 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-4T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11780129 4896 2024-04-12 However, this mutation did not affect Swi6 localization at otr and KR (Fig. 1e). PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S152A,S155A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S152A,S155A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 S152A,S155A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S152A,S155A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0004456 319-596 Not assayed or wild type 972 h- dri1 dri1delta278C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:33946513 4896 2021-05-15 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002626 319-596 Not assayed or wild type 972 h- dri1 dri1delta278C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33946513 4896 2021-05-12 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002957 G727E Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-144 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17A5.18c) PMID:28469148 4896 2017-09-29 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002485 G727E Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-144 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC227.18),assayed_using(PomBase:SPAC22G7.06c) PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002485 G727E Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-144 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.06c),assayed_using(PomBase:SPAC56F8.10) PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0003179 G727E Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-144 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0004058 G727E Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-144 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005042 631-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-deltakinase partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:12606573 4896 2021-09-21 (Figure 7A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000091 631-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-deltakinase partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000235 PMID:12606573 4896 2021-09-21 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001929 L20A,S21A,R22A,I23A,D25A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000963 L20A,S21A,R22A,I23A,D25A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 L20A,S21A,R22A,I23A,D25A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000268 L20A,S21A,R22A,I23A,D25A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC30.03c FYPO:0000705 V211* Not assayed or wild type 972 h- tsn1 tsn1-Y227stop partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:20081200 4896 2015-01-13 PomBase SPAC30.03c FYPO:0000705 V211* Not assayed or wild type 972 h- tsn1 tsn1-Y227stop partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC30.03c),assayed_using(PomBase:SPBC11C11.08) PMID:24382491 4896 2015-01-14 PomBase SPAC343.18 FYPO:0007532 deletion 972 h- rfp2 rfp2delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC343.18 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0006319 deletion 972 h- rfp2 rfp2delta deletion ECO:0000337 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC343.18 FYPO:0001357 deletion 972 h- rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPAC343.18 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC343.18 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.18 FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC343.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- rfp2 rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPAC343.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- rfp2 rfp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp2 rfp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.18 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp2 rfp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001407 T38A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-T38A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 T38A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-T38A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000963 S272A Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-S272A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000957 S272A Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-S272A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 csx1 csx1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0003038 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:14633985 4896 2020-11-12 (Figure 6B). decreased stability in response to oxidative stress PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0003038 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC21E11.03c) PMID:14633985 4896 2020-11-12 (Figure 6B) decreased stability in response to oxidative stress PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001101 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 high assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:14633985 4896 2020-11-12 This decrease correlated with a large drop in the amount of Atf1 protein (Figure 4C). PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001324 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001116 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 high assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:14633985 4896 2020-11-12 the large increase in atf1+ mRNA that is induced by H2O2 in wild-type cells was abolished in csx1D cells. PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001116 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 high assayed_using(PomBase:SPAC21E11.03c) PMID:14633985 4896 2020-11-12 The H2O2-induced increase in expression of pcr1+ mRNA, which encodes a binding partner of Atf1, was similarly eliminated in csx1D cells (Figure 4A PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001116 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:17612531 4896 2014-08-14 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001281 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173) PMID:14633985 4896 2020-11-12 As shown in Figure 2C, H2O2 induced robust phosphorylation of Spc1 in csx1D cells..... Csx1 is not necessary for Spc1 activation. PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001246 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:14633985 4896 2020-11-12 mRNA expression levels of two other transcription factor genes involved in oxidative stress, pap1+ and prr1+, were unaffected by the csx1D mutation (Figure 4A). PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001246 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.14) PMID:14633985 4896 2020-11-12 mRNA expression levels of two other transcription factor genes involved in oxidative stress, pap1+ and prr1+, were unaffected by the csx1D mutation (Figure 4A). PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001486 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:14633985 4896 2020-11-12 mRNA expression levels of two other transcription factor genes involved in oxidative stress, pap1+ and prr1+, were unaffected by the csx1D mutation (Figure 4A). PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0002350 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0001232 PMID:22328580 4896 2017-04-12 (Fig. 4D) PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0004052 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:14633985 4896 2020-11-12 (Fig. 1c) PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0003384 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000087 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 high PMID:14633985 4896 2020-11-12 (Fig. 1c) PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000087 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16914721 4896 2014-11-03 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000087 deletion 972 h- csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:17612531 4896 2014-08-14 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph csx1 csx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0007938 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2010-04-06 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csx1 csx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 csx1 csx1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC17A2.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csx1 csx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001645 1,141-432,R8E Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-2-140,R8E amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Figure 2D) PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- ppa2 ppa2+ wild_type ECO:0001232 PMID:8389306 4896 2016-06-20 PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- ppa2 ppa2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:8389306 4896 2016-06-20 PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0000118 wild type Overexpression 972 h- ppa2 ppa2+ wild_type ECO:0001232 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0004236 wild type Overexpression 972 h- ppa2 ppa2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0005419 deletion 972 h- mic26 mic26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:38692277 4896 2024-06-26 the absence of MICOS subunits caused characteristic alterations in mitochondrial morphology (Figure 1A). PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000443 deletion 972 h- mic26 mic26delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1610.04) PMID:38692277 4896 2024-06-27 In contrast, in the absence of Mic10 and Mic26, which are constituents of a second MICOS subcomplex, Mmc1 lost its semi-punctate appearance and was more uniformly localized throughout the mitochondrial network (Figures 3A and 3B). PomBase SPCC1442.05c FYPO:0003393 deletion 972 h- mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:38692277 4896 2024-06-26 disruption of cristae architecture through loss of the core MICOS subunit Mic60 caused a growth defect specifically on media that requires respiration (Figure 1D). PomBase SPCC1442.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0001309 deletion 972 h- mic26 mic26delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0002766 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0002767 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mic26 mic26delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- mic26 mic26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic26 mic26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic26 mic26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 E908G Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-513 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0003743 S240P Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S240P gad8ts-S240P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:34028542 4896 2021-06-18 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001277 C334S Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M1 mcm2-M1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001424 C334S Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M1 mcm2-M1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 C334S Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M1 mcm2-M1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 C334S Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M1 mcm2-M1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 C334S Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M1 mcm2-M1 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000783 C334S Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M1 mcm2-M1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000187 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000291 PMID:33693625 4896 2021-04-05 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002835 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000291 PMID:33693625 4896 2021-05-12 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0003412 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:33693625 4896 2021-04-05 PomBase 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2A,B) PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002386 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:33693625 4896 2021-05-12 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002386 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.07c) PMID:33693625 4896 2021-05-12 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002387 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.07c) PMID:33693625 4896 2021-05-12 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009007 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009014 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000414 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0005258 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 3) PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009011 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000220 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000231 PMID:33693625 4896 2021-05-12 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PMID:33693625 4896 2021-05-12 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000833 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC664.10) PMID:33946513 4896 2021-05-15 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000833 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:33946513 4896 2021-05-15 (Figure 2D) PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000833 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC664.10) PMID:33946513 4896 2023-01-25 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000833 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:33946513 4896 2023-01-25 (Figure 2D) PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0003627 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:33946513 4896 2021-05-18 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0003627 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1734.11) PMID:33946513 4896 2021-05-18 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0003627 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1734.11) PMID:33946513 4896 2023-01-25 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0003627 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:33946513 4896 2023-01-25 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002966 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:33946513 4896 2021-05-15 However, the Mal3 protein levels did not change in the presence or absence of Dri1 (Supplementary Figure S3A). Similarly, the levels of Mal3-GFP on the spindle MTs were almost the same both in wild-type and dri1∆ cells (Supplementary Figure S3B). PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 3) PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 3) PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000441 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000441 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000441 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009036 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000407 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009048 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000179 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009047 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000371 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009034 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002626 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33946513 4896 2021-05-12 (Figure 6) We found that the dri1∆ cells acquired tolerance to high temperature, as they could form colonies at 39 ◦C, whereas wild-type cells could not (Figure 6C). PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001103 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001103 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009049 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000178 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000725 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000725 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009039 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009039 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000077 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000077 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0005266 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0009042 deletion 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dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0007932 deletion 972 h- dri1 dri1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dri1 dri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.04c 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deletion 972 h- duf89 duf89delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1393.13 FYPO:0002085 deletion 972 h- duf89 duf89delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Figs. 1A, 5A, 6A, 7A, 8A) PomBase SPCC1393.13 FYPO:0002085 deletion 972 h- duf89 duf89delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:35314193 4896 2022-10-20 (Figure 12) PomBase SPCC1393.13 FYPO:0001357 deletion 972 h- duf89 duf89delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 2A) PomBase SPCC1393.13 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph duf89 duf89delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.13 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph duf89 duf89delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.13 FYPO:0009031 deletion 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ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2024-03-18 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000474 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004193 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3C) PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002098 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002098 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002098 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0007380 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 20 PMID:9679144 4896 2020-04-23 (Fig. 2B) cells were pre NETO after temperature block PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0005788 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad51delta cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000049 assayed_using(SO:0001795) PMID:32355220 4896 2020-06-27 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001038 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-10-22 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0006286 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7796804 4896 2017-10-26 Fig 5C the cyclin cdc13 cdc2 complex are detected when cells are blocked at G1/S with cdc20-M10 mutant, complex precipitated with p13 beads PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001532 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000260 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000963 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004083 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7796804 4896 2017-07-05 (Fig. 5B) PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002099 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002635 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PR:000044777) PMID:28481910 4896 2017-06-01 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002239 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M10 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:12697806 4896 2015-02-16 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0007029 148-391 Not assayed or wild type 972 h- asc1 asc1-1-147 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC30C2.04) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 2d) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001645 148-391 Not assayed or wild type 972 h- asc1 asc1-1-147 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 medium assayed_using(PomBase:SPAC30C2.04),assayed_using(PomBase:SPBC685.06) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 3a) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001645 148-391 Not assayed or wild type 972 h- asc1 asc1-1-147 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC30C2.04),assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (commnet: 312c8af6293e302e 41 MB+WxZqtLoWkmNqZLfwtd2DBEh8) (Fig. 6f) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 K282A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-K282A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0003267 K282A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-K282A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004417 K282A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-K282A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 K282A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-K282A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000659 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A chp2-mut1 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 when these were replaced by alanine (Fig. 3A), the resulting Chp2-H mutant (Chp2-H5A) no longer bound to DNA (Fig. 3B and C, and Supplementary Fig. S2A and S2D) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002336 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A chp2-mut1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:37400983 4896 2023-09-04 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 GGAAA159CTTCG Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-STL1-2 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0002061 G164T,G276R Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-G164T-G276R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 4D) PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0001407 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0003678 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0006229 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.02c) PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000095 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000096 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000085 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0003559 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000106 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000271 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000271 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0000271 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0006226 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC29A4.16 FYPO:0006225 S523F Not assayed or wild type 972 h- hal4 hal4-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0001645 1-130 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(131-735) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 1-130 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(131-735) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0000490 deletion 972 h- cce1 cce1delta deletion ECO:0000337 PMID:12823554 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0003766 deletion 972 h- cce1 cce1delta deletion ECO:0000337 PMID:10954073 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0003766 deletion 972 h- cce1 cce1delta deletion ECO:0001232 PMID:10954073 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0003769 deletion 972 h- cce1 cce1delta deletion ECO:0000059 PMID:12823554 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cce1 cce1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cce1 cce1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cce1 cce1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0000969 deletion 972 h- cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 PMID:10954073 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0000503 deletion 972 h- cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 PMID:10954073 4896 2014-09-02 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cce1 cce1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cce1 cce1delta 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assayed_protein(PomBase:SPAC2E12.02) PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. 4B) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000082 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. 2A and B) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0004545 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. 2) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0004545 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. 2D) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0006100 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. 5A) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0005382 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39473973 4896 2025-03-27 (Fig. 3A) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0004808 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC106.16) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. 2E) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. 4C and Fig. S4A) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. S3B) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. 4D) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000836 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:39473973 4896 2025-03-21 (Fig. 4E) PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0000099 L93* Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-ts partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. S3E) PomBase SPAC19A8.07c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp4 imp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.07c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp4 imp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.07c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp4 imp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.07c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp4 imp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- imp4 imp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19A8.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp4 imp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.05 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP dcr2 dcr2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 elp3 elp3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elp3 elp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0003218 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Figures S1C and S1D) PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0003218 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0000265) PMID:23874237 4896 2014-03-05 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0003218 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0000260) PMID:23874237 4896 2014-03-05 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0003218 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0000259) PMID:23874237 4896 2014-03-05 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0005177 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Figure S1C) PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000082 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Fig. 1A) PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000082 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23874237 4896 2014-03-17 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0002834 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Figure S4) PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001458 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000112 PMID:23874237 4896 2020-04-09 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001442 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000112 PMID:23874237 4896 2014-03-17 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 elp3 elp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000470 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001101 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001101 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC21E11.03c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001324 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001324 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001324 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:22768388 4896 2017-03-29 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001324 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:22768388 4896 2017-03-29 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001324 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:22768388 4896 2017-03-29 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001324 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:22768388 4896 2017-03-29 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001116 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001116 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001116 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC106.02c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001116 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001116 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0001355 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009007 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 elp3 elp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009011 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009008 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009008 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009008 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009008 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0009008 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0004163 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000233 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 elp3 elp3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low low PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0004162 deletion 972 h- elp3 elp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC29A4.20 FYPO:0000118 deletion 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medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC6B1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppk30 ppk30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC6B1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk30 ppk30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk30 ppk30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0006116 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10588653 4896 2020-09-01 In arp2-1 mutant cells grown at the restrictive temperature, the protein was not detected in patches. Rather, it appeared to be diffusely distributed throughout the cytoplasm (Figure 4C). PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0003440 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:10588653 4896 2020-09-01 DNS PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0001324 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10588653 4896 2020-09-01 suggesting that the mutant protein is likely less stable than the wild-type Arp2 protein (Figure 6B), a hypothesis confirmed below (see Figure 8C). PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0007453 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.06) PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 6) PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0007453 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.08c) PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 6D) PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0002021 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 1C) PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0000650 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 1) PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0001406 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 1) after 8 hours, medial region of the cells continued to accumulate excess cell wall material PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0001367 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10588653 4896 2020-09-01 DNS PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0001357 E316K Knockdown 972 h- arp2 arp2-E316K arp2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10588653 4896 2020-09-01 DNS PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002060 Q174* Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-Q174->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006649 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006651 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003674 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006655 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22347400 4896 2015-02-12 PomBase SPBC887.14c FYPO:0004787 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006653 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006654 L430P Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-L430P amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0008128 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000035 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0002723 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 is_bearer_of(PATO:0000324) PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000067 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0003824 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0004325 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000087 deletion 972 h- leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph leu5 leu5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.08 FYPO:0001214 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PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0000338 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0002822 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0002822 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC428.20c) PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0001514 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1786.03) PMID:33109728 4896 2022-06-27 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0002061 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:33109728 4896 2022-06-27 (Fig. 4B) PomBase SPAC1786.03 FYPO:0001387 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0000772 T498I Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-6 cut11-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002687 E74A Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-E74A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001669 G86A,G87A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGKAA) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 (Fig. 1B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 G86A,G87A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGKAA) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, complements partially sde2Δ PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000400 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6828164 4896 2017-11-24 (Fig. 1A) The cdc1 gene has a execution point of ~0.65 which means its function is completed just before entry into mitosis. An asynchronous population of the cdc1-7 mutant was shifted from 25°C to the restrictive temperature of 36°C to inactivate the gene and the number of cells that went on to divide was measured PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000625 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000474 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002019 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000228 medium PMID:12697806 4896 2015-02-16 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000256 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 low PMID:9891047 4896 2015-04-08 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000842 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000141 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fep1 fep1+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fep1 fep1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0003902 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP fep1 fep1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fep1 fep1+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001409 K25R,K121R,K126R,K156R,K175R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K25R,K121R,K126R,K156R,K175R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0003361 K25R,K121R,K126R,K156R,K175R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K25R,K121R,K126R,K156R,K175R amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPNCRNA.1698 FYPO:0000825 disruption Not assayed or wild type 972 h- nc-tgp1 nc-tgp1::ura4+ disruption ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1698 FYPO:0001317 disruption Not assayed or wild type 972 h- nc-tgp1 nc-tgp1::ura4+ disruption ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1698 FYPO:0001317 disruption Not assayed or wild type 972 h- nc-tgp1 nc-tgp1::ura4+ disruption ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1343) PMID:25428589 4896 2022-12-02 The size and levels of the nc-1343 transcript increased in exosome defective (rrp6D) cells, but not cells lacking Mmi1 or Red1 (Fig. 2c,d; Supplementary Fig. 4). T PomBase SPNCRNA.1698 FYPO:0000097 disruption Not assayed or wild type 972 h- nc-tgp1 nc-tgp1::ura4+ disruption ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1698 FYPO:0000088 disruption Not assayed or wild type 972 h- nc-tgp1 nc-tgp1::ura4+ disruption ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1698 FYPO:0000091 disruption Not assayed or wild type 972 h- nc-tgp1 nc-tgp1::ura4+ disruption ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 prevented nc-tgp1 transcription, induced tgp1þ expression to levels observed in 1343D levels and increased sensitivity of these cells to TBZ, HU and caffeine (Fig. 3b,c). These analyses demonstrate that it is nc-tgp1, not nc-1343, that is critical for repressing tgp1þ in the presence of phosphate. PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002678 E352Q,D353N,D354N,E356Q,D358N,E359Q,D360N Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-polyNQ amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000705 E352Q,D353N,D354N,E356Q,D358N,E359Q,D360N Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-polyNQ amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000703 E352Q,D353N,D354N,E356Q,D358N,E359Q,D360N Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-polyNQ amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rpl801 rpl801delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rpl801 rpl801delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000470 deletion 972 h- rpl801 rpl801delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000785 deletion 972 h- rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl801 rpl801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl801 rpl801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl801 rpl801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F7.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl801 rpl801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28E12.01c FYPO:0000141 wild type Knockdown 972 h- apc13 apc13+ wild_type ECO:0001232 PMID:12477395 4896 2014-07-21 PomBase SPBC28E12.01c FYPO:0003585 wild type Knockdown 972 h- apc13 apc13+ wild_type ECO:0000112 PMID:12477395 4896 2014-07-21 PomBase SPBC28E12.01c FYPO:0002066 wild type Knockdown 972 h- apc13 apc13+ wild_type ECO:0001232 PMID:12477395 4896 2014-07-21 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004918 1-335,481-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del12 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000705 1-335,481-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del12 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c),assayed_using(PomBase:SPCC550.13) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0002061 1-335,481-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del12 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-06 PomBase SPCC825.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC825.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph naa40 naa40delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPAC30D11.05 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph aps3 aps3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.05 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aps3 aps3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC30D11.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph aps3 aps3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- aps3 aps3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC30D11.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aps3 aps3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aps3 aps3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.08 FYPO:0000703 1-879 Not assayed or wild type 972 h- pdc1 pdc1-C(880-1076) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12),assayed_using(PomBase:SPAC20G4.08) PMID:23319050 4896 2013-01-22 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006040 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 20 PMID:27146110 4896 2017-05-17 (Figure 1, 2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006040 deletion 972 h- nda3-KM311 h− klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 20 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 3) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006179 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:12426374 4896 2017-08-07 (Figure 1B, rows 4±6) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000030 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:11870212 4896 2019-10-30 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007128 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:11870212 4896 2019-10-30 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000141 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:12426374 4896 2017-08-07 (Figure 1B) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001894 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 >95 PMID:11739790 4896 2016-06-02 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004077 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:11739790 4896 2016-06-02 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003186 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007072 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 low PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 7) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005682 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 high PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002825 deletion 972 h- leu1-32 ura4-D18 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c) PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 4) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005364 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006041 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006045 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 5) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004705 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 Figure 7 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006049 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 6) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006049 deletion 972 h- nda3-KM311 h− klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 6) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006039 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 35 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 1, 2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005872 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:25763975 4896 2024-06-11 Similarly, the division plane was positioned more asymmetrically in klp5Δ cells than in wild-type cells [Fig. 2(g)]. PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002638 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0008008 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:22363481 4896 2022-07-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001846 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 6) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000274 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1A) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000274 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:11870212 4896 2019-10-30 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006180 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001840 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1C) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003194 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-06 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007071 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 6) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000228 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 6) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000228 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 10-20 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1D) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004101 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 40 PMID:24239120 4896 2022-05-13 (Fig. 3) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004101 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 7) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004511 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 PMID:11739790 4896 2016-06-01 (Figure 4B and D) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004863 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 20 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1A) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007847 deletion 972 h- hht1-CFP mCherry-atb2 klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000135,FYECO:0000141 PMID:34346498 4896 2021-09-12 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006190 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004307 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0004021 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 Figure 2 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp5 klp5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000324 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. S1) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000324 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:16824200 4896 2014-05-13 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005960 deletion 972 h- nda3-KM311 h− klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 3) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000674 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002141 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp5 klp5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000899 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007198 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003627 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c) PMID:11739790 4896 2016-06-02 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005779 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003185 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c) PMID:18799626 4896 2014-03-04 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003349 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:16824200 4896 2014-05-13 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000838 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000243 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005342 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 (Fig. 1e) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0005342 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 7) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001357 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003302 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0001232 PMID:25763975 4896 2024-06-11 To test these theoretical predictions, we measured the movements of the nucleus and of the SPB in a klp5Δ strain, which lacks the kinesin-8 motor Klp5 [Fig. 2(d)]. We observed that the nucleus is typically found farther away from the cell center in klp5Δ than in wild-type cells, as shown by the 1.7-fold larger standard deviation of the distribution of the nuclear position in klp5Δ cells, which is consistent with the prediction of the model [Figs. 2(b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000072 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000069 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1e) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000069 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000069 deletion 972 h- klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006084 deletion 972 h- nda3-KM311 his3-D1 ura4-D18 leu1-32 h+ klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 PMID:27146110 4896 2017-05-17 (Table 1) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph klp5 klp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph klp5 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2012-01-01 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0005487 C29A,H66A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-C29A,H66A amino_acid_mutation ECO:0005801 high PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 3) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000826 C29A,H66A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-C29A,H66A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000409 high assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 5) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0007933 C29A,H66A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-C29A,H66A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000409 PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 4) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 mid1 mid1-DC1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 mid1 mid1-DC1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 mid1 mid1-DC1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC14F5.05c FYPO:0002705 wild type Overexpression 972 h- sam1 sam1+ wild_type ECO:0005638 high PMID:10620770 4896 2026-01-25 Overexpression of the sam1 gene causes methionine sensitive growth PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004250 deletion 972 h- hfl1 hfl1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hfl1 hfl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000385 deletion 972 h- hfl1 hfl1delta deletion ECO:0000112 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 2—Figure supplement 1A) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hfl1 hfl1delta deletion ECO:0005638 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2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0006141 deletion 972 h- rst2 rst2delta deletion ECO:0005638 PMID:11739717 4896 2017-07-14 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0002879 deletion 972 h- rst2 rst2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000104 PMID:24155978 4896 2014-02-14 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0001443 deletion 972 h- rst2 rst2delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:19056896 4896 2012-08-24 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0001443 deletion 972 h- rst2 rst2delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:19056896 4896 2012-08-24 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0003796 deletion 972 h- rst2 rst2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr rst2 rst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- rst2 rst2delta deletion ECO:0005638 PMID:11739717 4896 2017-07-14 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wild type 972 h- sap1 sap1-V191A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPCC790.03 FYPO:0001422 G128V Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G128V amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-09-30 (Fig. 8C, 8D) Western blot analysis show Sre1 cleavage defect under low oxygen PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mni1 mni1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009035 deletion 972 h- mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0001034 deletion 972 h- mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- mni1 mni1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mni1 mni1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- mni1 mni1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mni1 mni1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mni1 mni1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003412 mit1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 mit1 mit1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000705 461-480 Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1delta(461-480) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC1683.03c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 amf1 amf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 amf1 amf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- amf1 amf1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1683.03c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 amf1 amf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 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PomBase SPAC1F7.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1F7.10 SPAC1F7.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F7.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1F7.10 SPAC1F7.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 S666R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S666R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 the Ser666Arg and Cys663Arg mutants ran as monomeric species in gel filtration, indicative of disruption of their dimerization PomBase SPBC342.05 FYPO:0000703 S666R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S666R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Conversely, mutations disrupting dimerization did not disrupt -H2A.1 binding (Fig. 3C). PomBase SPBC342.05 FYPO:0000703 S666R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S666R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Conversely, mutations disrupting dimerization did not disrupt -H2A.1 binding (Fig. 3C). PomBase SPBC342.05 FYPO:0000085 S666R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S666R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000088 S666R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S666R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 S666R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S666R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBC660.08 FYPO:0000381 F157A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F157A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000127 medium PMID:34499173 4896 2021-10-21 PomBase SPBC660.08 FYPO:0001645 F157A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F157A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC458.05),assayed_protein(PomBase:SPBC660.08) PMID:34499173 4896 2021-10-25 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001384 K41R Not assayed or wild type 972 h- hhp2 hhp2-K41R hhp2-KD|hhp2-KR(kd) amino_acid_mutation 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FYPO:0001357 K41R Not assayed or wild type 972 h- hhp2 hhp2-K41R hhp2-KD|hhp2-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. S2B) PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000088 K41R Not assayed or wild type 972 h- hhp2 hhp2-K41R hhp2-KD|hhp2-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 high PMID:39387272 4896 2024-12-10 (Fig. S2B) PomBase SPAC3F10.10c FYPO:0000280 F214R Not assayed or wild type 972 h- map3 map3-F214R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25831518 4896 2016-06-08 PomBase SPBC14F5.05c FYPO:0000082 D36N Not assayed or wild type 972 h- sam1 sam1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:30240645 4896 2018-09-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003098 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000227 PMID:28231281 4896 2017-04-01 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0002835 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 PMID:28231281 4896 2017-04-07 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000080 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003412 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:28231281 4896 2017-04-07 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000888 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 PMID:28231281 4896 2017-04-07 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 medium assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 Q140* Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-2 prp14-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 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FYPO:0002060 deletion 972 h- saf4 saf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18H10.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 saf4 saf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 saf4 saf4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- rad51 rad51+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24741789 4896 2015-10-30 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000085 wild type Overexpression 972 h- rad51 rad51+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24741789 4896 2015-10-30 PomBase SPAC644.14c FYPO:0003858 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP rad51 rad51+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000088 wild type Overexpression 972 h- rad51 rad51+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24741789 4896 2015-10-30 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0008243 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 PMID:11895484 4896 2024-06-12 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000196 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 PMID:11895484 4896 2024-06-12 No mature ascospores were observed in the meu10∆mutant (Fig. 3C and see Fig. 4A). PomBase SPCC1223.12c FYPO:0008244 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC24C9.07c) PMID:11895484 4896 2024-06-12 As visualized by the goldparticles, 1,3-β-glucan was found at the inner layer ofthe spore wall in the wild-type ascospores but in meu10∆ascospores it was scattered throughout the spore wall(Fig. 7A).Thus, Meu10 is required for the accurate local-ization of 1,3-β-glucan in the spore wall PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000583 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 PMID:11895484 4896 2024-06-12 No mature ascospores were observed in the meu10∆mutant (Fig. 3C and see Fig. 4A). PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu10 meu10delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000587 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0002150 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 PMID:11895484 4896 2024-06-12 No mature ascospores were observed in the meu10∆mutant (Fig. 3C and see Fig. 4A). PomBase SPCC1223.12c FYPO:0004925 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 PMID:11895484 4896 2024-06-12 Moreover, the thickness of the walls of the meu10∆spores was not homogeneous. In some parts, the sporewall was approximately threefold thicker than wild-type spore walls and seemed to be composed of sparsematerial, whereas in other parts, they were abnormallythin and looked very weak. The enlarged image of anabnormal ascospore shows a scattered stripe structureacross the spore wall (Fig. 5C) that is not observed in thewall of wild-type ascospores. The abnormal spore wallseems fragile, as some of them appear to be broken,allowing the cytoplasmic material to leak out. In addi-tion, at the later time point (22 h), most of the ascosporewalls disappeared. This fragility of the ascospore walls islikely to be why the meu10∆ spore nuclei are stainingabnormally with Hoechst33342 (as seen in Fig. 4A). PomBase SPCC1223.12c FYPO:0003835 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0001232 PMID:11895484 4896 2024-06-12 ell and nucleishapes in meu10∆ cells during the horse-tail, meiosisI and meiosis II stages were normal (data not shownand uppermost panel at 8 h in Fig. 4A) PomBase SPCC1223.12c FYPO:0002043 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0005580 PMID:11895484 4896 2024-06-12 We next measured the DNA content of the meu10∆ and wild-type cells after nitrogenstarvation by flow cytometry. No apparent differencewas observed (data not shown), which indicates thatMeu10 is not required for pre-meiotic DNA synthesis.No mature ascospores were observed in the meu10∆mutant (Fig. 3C and see Fig. 4A). PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.12c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 meu10 meu10delta deletion ECO:0000336 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SPCC1223.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- meu10 meu10delta deletion ECO:0005638 PMID:11895484 4896 2024-06-12 Thus,the meu10+ gene is not essential for vegetative growth. 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2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 K47N,Y111C Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E68 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 K47N,Y111C Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E68 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPAC144.13c FYPO:0000760 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-4A unknown ECO:0005638 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPAC4A8.14 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.14 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.14 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 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h- h- prototroph SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4A8.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4A8.14 SPAC4A8.14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000708 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-s69 unknown ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-s69 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPBC216.07c FYPO:0006750 unknown Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-s69 unknown ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000221) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPCC1795.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph vcx1 vcx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 vcx1 vcx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1795.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph vcx1 vcx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.02c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph vcx1 vcx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph vcx1 vcx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 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PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004247 Y411A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-Y411A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4C,D) PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001934 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000442 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:37156397 4896 2023-05-24 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002009 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000835 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1687.12c) PMID:37156397 4896 2023-05-24 The amount of Coq4 was significantly reduced in ∆coq11 and ∆coq12 single mutants PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001355 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001355 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000134 low PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001355 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000179 low PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001355 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:37156397 4896 2023-05-25 We first noticed that ∆coq11 and ∆coq12 strains did not grow well on minimal medium, as was observed for CoQ-deficient S. pombe (Fig. 2A, S1A) PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000037 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:37156397 4896 2023-05-24 (Fig. 2A) By contrast, the ∆coq12 strain showed almost no growth on PMLU medium containing cysteine. PomBase SPAC1071.11 FYPO:0008092 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:37156397 4896 2023-05-24 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0003004 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001413 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 high PMID:37156397 4896 2023-05-24 (Fig. 4) The results revealed higher sulfide levels in both Δcoq11 and Δcoq12 strains PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001309 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:37156397 4896 2023-05-25 (Figs. 2B, S1B) PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 coq12 coq12delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000103 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37156397 4896 2023-05-24 (Figs. 3, S1C) Similar to the Δcoq2 (ppt1) strain, the Δcoq11 and Δcoq12 strains grew more slowly in the presence of 1 and 2 mM hydrogen peroxide or 0.5 mM CuSO4 than in its absence PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000087 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000087 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37156397 4896 2023-05-25 (Figs. 3, S1C) Similar to the Δcoq2 (ppt1) strain, the Δcoq11 and Δcoq12 strains grew more slowly in the presence of 1 and 2 mM hydrogen peroxide or 0.5 mM CuSO4 than in its absence PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 coq12 coq12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- coq12 coq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1071.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq12 coq12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.06c FYPO:0000470 deletion 972 h- SPAC23C11.06c SPAC23C11.06cdelta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC23C11.06c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC23C11.06c SPAC23C11.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 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PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0006187 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33357436 4896 2021-01-08 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 PMID:9427748 4896 2011-11-10 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:15657058 4896 2012-02-03 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0004560 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 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SPBP4H10.04 FYPO:0000115 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0000232 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 8 PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0000280 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0000059 PMID:7559598 4896 2019-11-08 data not shown PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppb1 ppb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppb1 ppb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBP4H10.04 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppb1 ppb1delta deletion ECO:0001232 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SPAC110.03 FYPO:0001355 cdc42(1-134)-linker-mCherry-linker-cdc42(135-188)-2xritC Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-2ritC fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:39333500 4896 2024-10-04 (Fig. 2H) PomBase SPAC110.03 FYPO:0001387 cdc42(1-134)-linker-mCherry-linker-cdc42(135-188)-2xritC Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-2ritC fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:39333500 4896 2024-10-02 (Fig. 2H) PomBase SPAC110.03 FYPO:0000021 cdc42(1-134)-linker-mCherry-linker-cdc42(135-188)-2xritC Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-2ritC fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:39333500 4896 2024-10-02 (Fig. 2E) PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0002061 G164T,H201N Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-G164T-H201N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 1D) PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002667 L22A Not assayed or wild type 972 h- naa10 naa10-L22A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPBC6B1.08c FYPO:0003251 wild type Overexpression 972 h- ofd1 ofd1+ wild_type ECO:0000049 PMID:24327658 4896 2014-03-27 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004067 K311E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-K311E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004068 K311E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-K311E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC23H3.04 SPAC23H3.04delta deletion ECO:0005638 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or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,F87L cut12-G71VF87L amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1E) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 G71V,F87L Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,F87L cut12-G71VF87L amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-06 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 G71V,F87L Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,F87L cut12-G71VF87L amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-06 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V,F87L Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,F87L cut12-G71VF87L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-06 (Fig. 5B) PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cnt6 cnt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- cnt6 cnt6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0000988 deletion 972 h- cnt6 cnt6delta deletion ECO:0005638 PMID:19076239 4896 2012-07-13 PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0001237 deletion 972 h- cnt6 cnt6delta deletion ECO:0005638 PMID:19076239 4896 2012-07-26 PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0001315 deletion 972 h- cnt6 cnt6delta deletion ECO:0001232 PMID:19076239 4896 2012-07-13 PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cnt6 cnt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.10 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cnt6 cnt6delta deletion ECO:0005638 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The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPBC21.01 FYPO:0000141 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC21.01 FYPO:0001269 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.09c) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC21.01 FYPO:0003740 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPBC21.01 FYPO:0000835 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC21.01) PMID:30967422 4896 2019-05-19 PomBase SPBC21.01 FYPO:0006238 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 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wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21445296 4896 2014-12-18 PomBase SPBC21.01 FYPO:0002061 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:30967422 4896 2019-05-19 PomBase SPBC21.01 FYPO:0000284 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 50 PMID:30967422 4896 2019-05-19 PomBase SPBC21.01 FYPO:0000284 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15369671 4896 2014-08-26 PomBase SPBC21.01 FYPO:0003241 S353P Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-362 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21445296 4896 2014-12-18 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-K9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9436991 4896 2015-12-14 PomBase SPBC32F12.03c FYPO:0001309 gpx1 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PomBase SPBC32F12.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pch1 pch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- pch1 pch1delta deletion ECO:0005638 PMID:9115279 4896 2014-07-07 PomBase SPCC320.05 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph sul3 sul3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.05 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph sul3 sul3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.05 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph sul3 sul3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.05 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sul3 sul3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.05 FYPO:0007931 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assayed_protein(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11861551 4896 2019-11-07 (Fig. 7) PomBase SPCC962.02c FYPO:0004101 wild type Knockdown 972 h- bir1 bir1+ Pnmt1-81::bir1+ wild_type ECO:0001232 PMID:11861551 4896 2019-11-07 (Fig. 4) PomBase SPBC3B9.12 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs23 trs23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- trs23 trs23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B9.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs23 trs23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000080 478-531 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-delta478-531 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 low PMID:31366733 4896 2019-09-23 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000091 478-531 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-delta478-531 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 high PMID:31366733 4896 2019-09-23 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0000838 1-138 Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-deltaN138-EGFP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.10) PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC216.06c FYPO:0001571 1-749 Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-(750-971) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:22952839 4896 2013-08-27 PomBase SPAC222.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- hem13 hem13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC222.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem13 hem13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC222.11 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem13 hem13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000082 G135E Knockdown 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:35970865 4896 2022-10-05 (Fig. 2a) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003217 G135E Knockdown 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000126,FYECO:0000370 high PMID:35970865 4896 2022-10-05 (Figure 4) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0008014 G135E Knockdown 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17),assayed_region(SO:0001795) PMID:35970865 4896 2022-10-05 (Fig. 2c, d) defective in CENP-A maintenance during M phase, as well as defective in CENP-A loading during interphase The GFP-Cnp1 intensity at centromeres decayed more rapidly in mis6-302 cells than in WT cells (Fig. 2f, g and Supplementary Figs. 4 and 5a). Taken together, these results suggest that Mis6, but not Scm3, is responsible for the maintenance of Cnp1 at centromeres during metaphase. PomBase SPAC1687.20c FYPO:0007295 G135E Knockdown 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0000703 2284-2812 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03),assayed_protein(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 In contrast, Tti2 and Tti1 interaction with tra1+ does not change in the absence of Tel2 (Figure 2I) PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0002357 2284-2812 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03),assayed_transcript(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0002177 R737* Not assayed or wild type 972 h- swr1 mod22-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:19160458 4896 2014-03-19 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007721 152-216 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSN stx8DSN|fsv1deltaSN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007059 152-216 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSN stx8DSN|fsv1deltaSN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 complete high assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:33788833 4896 2021-04-08 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0005489 152-216 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSN stx8DSN|fsv1deltaSN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0006836 152-216 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSN stx8DSN|fsv1deltaSN partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 medium PMID:33788833 4896 2021-04-08 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0001214 152-216 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSN stx8DSN|fsv1deltaSN partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 medium PMID:33788833 4896 2021-04-08 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002360 S192A,S212A,S220A,S268A,S274A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S192-S274A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:19136623 4896 2024-07-02 swi6-S192-274A mutations did not affect silencing at the centromere (imr::ura4), while swi6-S18-24A and S18- 117A mutants displayed decreases in silencing (Fig. 3C). PomBase SPAC664.01c FYPO:0004422 S192A,S212A,S220A,S268A,S274A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S192-S274A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19136623 4896 2024-07-02 Conversely, mutations at the five CK2 sites located in the C-terminal region of Swi6 (Fig. 3A) (swi6-S192-274A) did not influence the mobility of Swi6 (Fig. 3B). PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002876 1-59 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1-60-251 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:17150956 4896 2018-12-15 PomBase SPAC31A2.07c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp10 dbp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- dbp10 dbp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31A2.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp10 dbp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC825.02 FYPO:0007797 E456Q Not assayed or wild type 972 h- gbs1 gbs1-E456Q gbs1-E457Q amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC825.02) PMID:19605557 4896 2021-05-26 (Figure 6) PomBase SPBC354.05c FYPO:0001668 423-793 Overexpression 972 h- sre2 sre2(1-422) sre2truncation_423-793 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPCC584.14 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug160 mug160delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.14 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug160 mug160delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- mug160 mug160delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC584.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug160 mug160delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002373 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000161 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 PMID:11870208 4896 2022-09-18 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000161 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 30 PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000161 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 5 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003338 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002872 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 PMID:18184749 4896 2023-11-01 We observed a striking reduction in the number of cells exhibiting clear polarization of the tER in cdc15-140 cells already at the permissive temperature of 24°C (Figure 5A, bottom panel) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001401 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001009 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 95 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 PMID:15933715 4896 2022-09-29 However, in etd1-1 mutant cells, the medial ring marked with Cdc15p-GFP seems to fail constriction. To bette PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002561 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002561 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18272786 4896 2018-01-26 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002561 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001880 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S1F) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001880 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:24127216 4896 2013-12-11 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001880 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001880 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.08) PMID:15933715 4896 2022-09-29 We therefore analysed the localisation of Etd1p-GFP in cdc8-110 mutant cells and found that, at the restrictive temperature of 361C, Etd1p never formed a ring (Figure 3B upper panels). PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0007178 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.14) PMID:31276301 4896 2019-12-10 (Fig. 4e) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0007177 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.14) PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Fig. 4e) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002555 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002555 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:26776521 4896 2016-03-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.16) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002869 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 30 assayed_using(PomBase:SPBC1289.01c) PMID:22905165 4896 2020-02-27 (Fig. 1B) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002021 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003342 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000133 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-19 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003825 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003825 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 24 PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0007179 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-140 A100T unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Fig. 4e) 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2015-02-16 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0005801 FYECO:0000005 low assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000170 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0004255 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0005638 medium PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0003353 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0001807 FYECO:0000227 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 3C) PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0003353 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-14 unknown ECO:0001807 FYECO:0000229 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 3C) PomBase SPBC1539.09c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trp1 trp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1539.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trp1 trp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1539.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- trp1 trp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1539.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trp1 trp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000963 T159A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T159A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000957 T159A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T159A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000082 G178D Overexpression 972 h- pac1 pac1-G178D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001147 G178D Overexpression 972 h- pac1 pac1-G178D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0006080 2-195 Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-delta2-195 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 2) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006108 fus1delta::fus1(1-791)-for3(718-1265)-fus1(1278-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-for3(FH1)-for3(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 5) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 fus1delta::fus1(1-791)-for3(718-1265)-fus1(1278-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-for3(FH1)-for3(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 5) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007095 fus1delta::fus1(1-791)-for3(718-1265)-fus1(1278-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-for3(FH1)-for3(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 5) PomBase SPAC1250.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- sfc7 sfc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC1250.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- sfc7 sfc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC1250.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- sfc7 sfc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC1A4.06c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tam41 tam41delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- tam41 tam41delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1A4.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tam41 tam41delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC222.09 FYPO:0002335 I524V Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-I524V amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:24013500 4896 2024-06-10 We found that all three mutations are required to produce a silencing defect on 5- FOA medium (Fig. 1B). PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000786 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 mis1-64 unknown ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-16 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC622.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC622.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.01c SPCC622.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0001645 G159A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159A nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 G159A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 high PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G159A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPCC14G10.03c FYPO:0003865 unknown Not assayed or wild type 972 h- ump1 ump1-346 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M55 cdc2-M26 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:6828164 4896 2017-12-05 (Fig. 1A) The transition point for cdc2 is 0.65 using cdc2.M55 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M55 cdc2-M26 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M55 cdc2-M26 unknown ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:3322810 4896 2013-09-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M55 cdc2-M26 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M55 cdc2-M26 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c) PMID:3322810 4896 2013-09-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000842 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M55 cdc2-M26 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7845361 4896 2021-10-15 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000941 1-279 Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-280-365 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001382 1-279 Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-280-365 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004304 E238A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-E238A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:12556522 4896 2015-01-14 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002061 1-221 Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-(222-488) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0006001 290-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta290-741 dcp2-delta290-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3B9.21) PMID:22085934 4896 2023-02-16 (Figure 6A) PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0006001 290-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta290-741 dcp2-delta290-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:22085934 4896 2023-02-16 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0004083 290-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta290-741 dcp2-delta290-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:22085934 4896 2023-02-16 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC188.07 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccq1 ccq1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.07 FYPO:0003109 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:24013504 4896 2014-02-13 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002702 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000337 low PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5E) PomBase SPCC188.07 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004604 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000049 low PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPCC188.07 FYPO:0004604 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC188.07 FYPO:0005918 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC800.03) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 4B) clr3 at telomeres were reduced to the same extent in mutant strains disrupted for either Ccq1 or Taz1 PomBase SPCC188.07 FYPO:0003803 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 1e) Localization of Pof8 at telomeres is reduced but not eliminated in ccq1∆. PomBase SPCC188.07 FYPO:0003803 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-20 (Fig. 1E) PomBase SPCC188.07 FYPO:0003803 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002134 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 3a) Pof8-TER1 interaction is reduced but not eliminated in ccq1∆. PomBase SPCC188.07 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0001038 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002908 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002908 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004742 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000964 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004083 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Pof8 expression level is not affected in ccq1∆. PomBase SPCC188.07 FYPO:0000840 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-21 Supplementary Fig. 4 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004915 deletion 972 h- ccq1 ccq1delta deletion ECO:0000059 PMID:26305931 4896 2016-07-15 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ccq1 ccq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000763 deletion 972 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4896 2012-01-01 PomBase SPBC13G1.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 did2 did2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0001645 R386E Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-R386E amino_acid_mutation ECO:0000049 high assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:21217703 4896 2023-02-16 An arginine substitution of Ile379 or Leu383 of Taz1 or Ile655 of SpRap1 at the center of the hydrophobic interface completely abolished the Taz1RBM-SpRap1RCT interaction (Fig. 6a). PomBase SPAC1002.10c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgt1 sgt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.10c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgt1 sgt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- sgt1 sgt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1002.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgt1 sgt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- sgt1 sgt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16408318 4896 2021-10-04 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0004318 TetR-spc7Δ667-1364-T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 TetR-spc7(1-666)-9TA fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:28017606 4896 2020-07-21 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 453-479 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta453-579 M1-delta4 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Figure 4) PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0001357 deletion 972 h- mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 PMID:40668835 4896 2025-08-18 The aah1∆, aah2∆, and aah4∆ cells grew like wildtype at all temperatures tested, and aah3∆ cells were cold- sensitive (SI Appendix, Fig. S1). PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mde5 mde5delta deletion ECO:0005638 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fin1-ts1 sad44.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 76 PMID:12065422 4896 2020-12-24 (Figure 1A) We concluded that the severe phenotype of a ®n1.ts1 mutant is a transitory response to loss of Fin1 function. This implied that ®n1.D haploids adapted to loss of Fin1 after the ®rst division of a germinating spore. PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0001124 G188E Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-ts1 sad44.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:12065422 4896 2020-12-24 (Table II) PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0003164 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPAC17C9.08) PMID:17192844 4896 2023-07-03 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0002037 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0005801 FYECO:0000214 PMID:6090122 4896 2013-03-01 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0000969 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0005638 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0000488 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0000059 PMID:17192844 4896 2023-07-03 The wild-type cross yielded 81 ± 7.5% viable spores, the pnu1Δ cross 82 ± 3%. As far as tested, no change of meiosis and recombination was detected in mutants abolishing the function of the Pnu1 (End1) nuclease. PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0000943 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0000059 PMID:17192844 4896 2023-07-03 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0000590 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0005638 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- pnu1 end1-458 G200E unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPAC1142.04 FYPO:0003412 noc201::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 noc201 noc201::Tn-seq disruption ECO:0000049 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deletion 972 h- sft2 sft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1527.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sft2 sft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006357 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_region(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:18820678 4896 2024-01-29 Chromatin remodelling events and RNAPII loading around the TATA box are severely impaired in an atf12 mutant, demonstrating that the progression of ncRNA initiation events mediated by Atf1 is essential to convert chromatin to an RNAPII accessible state (Fig. 4B). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002623 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:11453251 4896 2013-09-03 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001259 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:11453251 4896 2013-09-03 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004171 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.4604) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the atf1- mutant, transcripts a and b are expressed normally, whereas transcripts c and d are absent (Fig. 4A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004171 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1326) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the atf1- mutant, transcripts a and b are expressed normally, whereas transcripts c and d are absent (Fig. 4A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0008156 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the atf1- mutant, transcripts a and b are expressed normally, whereas transcripts c and d are absent (Fig. 4A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0008156 unknown Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1325) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the atf1- mutant, transcripts a and b are expressed normally, whereas transcripts c and d are absent (Fig. 4A). PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0006660 T942K Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-T942K amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007629 T942K Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-T942K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000703 1-300 Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-dN300 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1805.08),assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. S4A) PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0000703 1-49,169-200 Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2delta1-49,169-200 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.06),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:8657565 4896 2014-06-27 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c 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PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0001234 deletion 972 h- SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19168988 4896 2012-08-31 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1672.11c SPCC1672.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.01 FYPO:0000249 R176* Not assayed or wild type 972 h- maa1 glu1-NS176 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000084,FYECO:0000254 high PMID:39502420 4896 2025-04-11 The glu1 mutant grew when glutamate was used as the sole nitrogen source, although glutamate poorly supported its growth in the presence of ammonium (Figures 1B and F). ( In general, their availability is regulated by nitrogen catabolite repression; thus, it is greatly affected by the presence of ammonium, a high-quality nitrogen source.) PomBase SPBC725.01 FYPO:0002271 R176* Not assayed or wild type 972 h- maa1 glu1-NS176 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 high high PMID:39502420 4896 2025-04-09 Arginine, glutamic acid, or proline weakly support growth with an ammonium nitrogen source. The mutant grows normally when these amino acids are used as the sole nitrogen source. The mutant cannot utilize aspartic acid and asparagine as the sole nitrogen source. PomBase SPBC725.01 FYPO:0001357 R176* Not assayed or wild type 972 h- maa1 glu1-NS176 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000085,FYECO:0000254 PMID:39502420 4896 2025-04-11 Interestingly, glutamine efficiently rescues the growth defect of the glu1 mutant compared to glutamate, even in the presence of ammonium (Figure 1F, Barel and MacDonald 1993). PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- nak1 nak1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12427731 4896 2017-07-18 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- nak1 nak1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- nak1 nak1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12427731 4896 2017-07-18 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- nak1 nak1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph nfs1 nfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- nfs1 nfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nfs1 nfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21D10.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nfs1 nfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0001147 (-249)-(-239) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1-deltaTR2 fus1-TR2 deleted partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 PMID:7791776 4896 2014-05-13 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0006638 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0000112 47 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 2C) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002679 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 1) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002830 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Fig. 1g) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:22174761 4896 2013-01-23 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001038 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:19474789 4896 2017-04-26 Supplementary Fig. 10 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001038 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001266 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000013 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 PMID:22174761 4896 2013-01-23 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000013 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002460 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 PMID:18197241 4896 2013-09-25 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003481 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:24316795 4896 2014-03-11 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003481 wild type Overexpression 972 h- pom1 pom1+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 3) PomBase SPBC11G11.03 FYPO:0003412 mrt4::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 mrt4 mrt4::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0000039 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 lys9 lys9delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- lys9 lys9delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0001164 deletion 972 h- lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- lys9 lys9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC3B8.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph lys9 lys9delta 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PMID:15194814 4896 2015-01-21 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0001324 deletion 972 h- ace2 ace2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC645.06c) PMID:16291723 4896 2021-12-29 To determine whether Rgf3p production was controlled by Ace2p, we examined whether Rgf3p levels were altered in cells lacking or overproducing Ace2p. Overproduction of Ace2p led to increased Rgf3p levels whereas Rgf3p was less abundant in cells lacking Ace2p (Fig. 7B PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0004268 deletion 972 h- ace2 ace2delta deletion ECO:0001232 PMID:15194814 4896 2015-01-21 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ace2 ace2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0001253 deletion 972 h- ace2 ace2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:18272786 4896 2018-01-29 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ace2 ace2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ace2 ace2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6G10.12c FYPO:0001984 deletion 972 h- ace2 ace2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.09) 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Y80A,Y89A Not assayed or wild type 972 h- mcm2 mcm2-2a amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 1E) PomBase SPBC4.04c FYPO:0000890 Y80A,Y89A Not assayed or wild type 972 h- mcm2 mcm2-2a amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 3D) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c 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loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000177 high PMID:29529046 4896 2019-02-03 (Fig. 5A,B) In this paper we used a high affinity zinc-responsive FRET sensor (ZapCY1) to measure zinc ion availability in the cytosol under conditions of zinc deficiency. Thus, in addition to accumulating high levels of total cellular zinc - this manuscript shows that loz1D cells also accumulate higher levels of zinc in the cytosol. This accumulation is also dependent upon Zrt1 as this phenotype is not observed in a loz1 zrt1 double mutant PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007052 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000173 assayed_using(PomBase:SPBC14F5.13c) PMID:31239353 4896 2019-08-06 Pho8 abundance is increased in high zinc in a loz1 deletion strain (Figure 2B and 2C) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0001547 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000177 low assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 1A) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007050 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000173 assayed_using(PomBase:SPBC14F5.13c) PMID:31239353 4896 2019-08-06 consistent with Loz1 facilitating the repression of pho8 gene expression in high zinc (Figure 2A) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000825 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24003116 4896 2014-01-02 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000825 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:24003116 4896 2014-01-02 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000825 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPBC1348.06c) PMID:24003116 4896 2014-01-02 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000825 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.19c) PMID:24003116 4896 2014-01-02 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000825 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1710) PMID:24003116 4896 2014-01-02 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000833 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.12) PMID:28667014 4896 2017-07-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000833 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000173 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.12) PMID:28667014 4896 2017-07-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.03c) PMID:29529046 4896 2019-02-05 (Fig. 8) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPBC16E9.14c) PMID:29529046 4896 2019-02-05 (Fig. 8) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.14) PMID:29529046 4896 2019-02-05 (Fig. 8) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000173 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-11 (Fig. 1A) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006829 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000177 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.03c) PMID:29529046 4896 2019-02-05 (Fig. 8) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006829 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000177 assayed_using(PomBase:SPBC16E9.14c) PMID:29529046 4896 2019-02-05 (Fig. 8) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006829 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000177 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.14) PMID:29529046 4896 2019-02-05 (Fig. 8) PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0001317 deletion 972 h- loz1 loz1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.12) PMID:28667014 4896 2017-07-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 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loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph loz1 loz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 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SPAC694.04c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.04c SPAC694.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.04c SPAC694.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.04c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.04c SPAC694.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.04c SPAC694.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.04c SPAC694.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.04c 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cut15- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPAC29A4.10 FYPO:0004506 unknown Not assayed or wild type 972 h- rrn5 rrn5-S6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17538026 4896 2016-10-06 (Fig. 1B) PomBase SPAC29A4.10 FYPO:0003688 unknown Not assayed or wild type 972 h- rrn5 rrn5-S6 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.02c) PMID:17538026 4896 2016-10-06 (Fig. 4) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 1013-1237 Knockdown 972 h- ync13 ync13(1-1130) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S2,E) PomBase SPCC74.03c FYPO:0001382 M316E Not assayed or wild type 972 h- ssp2 ssp2-M316E amino_acid_mutation ECO:0005801 low assayed_enzyme(PomBase:SPCC74.03c) PMID:19474788 4896 2023-02-15 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0006549 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000242,FYECO:0000254 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 Adding rapamycin to oca2 or cha4 cells that were grown with ammonia led to a reduction of transcripts B and C and to an increase of transcript A, a profile closer to the one displayed by wt cells grown with this nitrogen source (see Fig. S2B in the supplemental material). This observation could thus explain the improved growth phenotype of oca2 and cha4 in the presence of the drug PomBase SPBC1683.13c FYPO:0005014 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000254 assayed_region(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 We also looked at the profile of H4K12 acetylation in cha4 cells (Fig. 4B, right). In the presence of ammonia, levels of H4K12 acetylation over the per1 ORF were lower than the in wt strain, similar to the oca2 strain. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0005014 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000254 assayed_region(PomBase:SPAC869.10c) PMID:20404084 4896 2025-09-23 We also looked at the profile of H4K12 acetylation in cha4 cells (Fig. 4B, right). In the presence of ammonia, levels of H4K12 acetylation over the per1 ORF were lower than the in wt strain, similar to the oca2 strain. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0006548 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 In RNA from cha4 cells grown in ammonia, we de- tected transcripts A, B, and C, similar to oca2 (Fig. 3A, lanes 5, 11, and 17). However, cha4 cells grown in proline produced transcript A but only small amounts of transcripts B and C, a profile more similar to that of wt cells grown in ammonia. Therefore, cha4 cells showed aberrant expression of per1 in both nitrogen sources, whereas oca2 cells showed a defect only in ammonia. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0006548 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000246 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 In RNA from cha4 cells grown in ammonia, we de- tected transcripts A, B, and C, similar to oca2 (Fig. 3A, lanes 5, 11, and 17). However, cha4 cells grown in proline produced transcript A but only small amounts of transcripts B and C, a profile more similar to that of wt cells grown in ammonia. Therefore, cha4 cells showed aberrant expression of per1 in both nitrogen sources, whereas oca2 cells showed a defect only in ammonia. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0007631 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000246 assayed_region(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 We also looked at the profile of H4K12 acetylation in cha4 cells (Fig. 4B, right). In the presence of ammonia, levels of H4K12 acetylation over the per1 ORF were lower than the in wt strain, similar to the oca2 strain. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0007506 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000254 assayed_region(PomBase:SPAP7G5.06),assayed_using(GO:0005665) PMID:20404084 4896 2025-09-23 Chromatin from cha4 cells grown in either ammonia or proline gave a Pol II profile similar to that of oca2 cells, except that Pol II levels over probe 1 were lower (Fig. 4A, right). PomBase SPBC1683.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cha4 cha4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cha4 cha4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0000243 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000246 PMID:20404084 4896 2025-09-23 cha4 cells had a phenotype similar to that of oca2 cells, with slow growth in EMM containing ammonia as the nitrogen source but normal growth in proline. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0000077 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000242,FYECO:0000254 PMID:20404084 4896 2025-09-23 As with oca2 , cha4 and ago1 are resistant to rapamycin (see Fig. S2A in the supplemental material). PomBase SPBC1683.13c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 high PMID:20404084 4896 2025-09-23 cha4 cells had a phenotype similar to that of oca2 cells, with slow growth in EMM containing ammonia as the nitrogen source but normal growth in proline. PomBase SPBC1683.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- cha4 cha4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cha4 cha4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1683.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cha4 cha4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0007454 T12A Not assayed or wild type 972 h- arp2 arp2-T12A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.06) PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Figure 8A). T12A protein was also labeled by the ATP analogue, but to a much lesser degree than wild-type Arp2p PomBase SPNCRNA.463 FYPO:0001501 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.463 SPNCRNA.463+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.463 FYPO:0007931 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.463 SPNCRNA.463+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.463 FYPO:0000088 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.463 SPNCRNA.463+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph mug109 mug109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug109 mug109delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug109 mug109delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2E1P5.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug109 mug109delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.07 FYPO:0000189 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp1 prp1-127 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:2034223 4896 2017-11-21 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003098 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003094 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000291 PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0007223 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000049 75 high PMID:40063661 4896 2025-06-06 (Fig. 1F) PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003101 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.04) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003101 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003096 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000226 PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003103 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003103 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.04) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0002134 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003093 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000337 PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0006070 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:28541282 4896 2017-05-30 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003100 deletion 972 h- tri1 tri1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph tri1 tri1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.09c FYPO:0009088 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assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-E68A,E71A,D74A uaf2-E68A,E71A,E74A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0000227 find Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-deltaN other ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 Knockout or depletion of H2A.Z in Sc 15 or mammalian cells 5 leads to increased rates of chromosome loss. This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPBC1198.01 FYPO:0007615 deletion 972 h- fmd2 fmd2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000378 medium assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 2n) PomBase SPBC1198.01 FYPO:0005776 deletion 972 h- fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32034465 4896 2020-04-20 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0007331 deletion 972 h- fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32034465 4896 2020-04-20 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph fmd2 fmd2delta deletion ECO:0005638 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PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC965.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- alr1 alr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:11244061 4896 2014-08-05 PomBase SPCC965.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alr1 alr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002061 425-710 Overexpression 972 h- pkd2 pkd2-1-424 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:37723847 4896 2023-10-15 Overexpression of either construct inhibited the growth like full length (Figure 1d), indicating that each of them is capable of inducing cytotoxicity upon overexpression. PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0001971 1-335 Not assayed or wild type 972 h- mid2 mid2-336-704 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002797 1-335 Not assayed or wild type 972 h- mid2 mid2-336-704 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002558 1-335 Not assayed or wild type 972 h- mid2 mid2-336-704 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 7D) PomBase SPBC839.07 FYPO:0004303 R76A Not assayed or wild type 972 h- ibp1 ibp1-R76A ibp1-R75A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC839.07) PMID:14508607 4896 2015-01-15 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 K619E Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K619E crb2-L619E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Consistent with their observed structural roles, charge reversal mutations Arg616Glu, Lys617Glu, and Lys619Glu all abolished Crb2-BRCT2 interaction with the peptide (Fig. 3A) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 K619E Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K619E crb2-L619E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000703 K619E Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K619E crb2-L619E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Consistent with their observed structural roles, charge reversal mutations Arg616Glu, Lys617Glu, and Lys619Glu all abolished Crb2-BRCT2 interaction with the peptide (Fig. 3A) PomBase SPAC1F7.11c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F7.11c SPAC1F7.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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972 h- SPNCRNA.87 SPNCRNA.87delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.87 FYPO:0000115 deletion 972 h- SPNCRNA.87 SPNCRNA.87delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC2F12.17 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cox7 cox7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.17 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cox7 cox7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.17 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph cox7 cox7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.17 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph cox7 cox7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.17 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph cox7 cox7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.17 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cox7 cox7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0008056 D298A,D300A Not assayed or wild type 972 h- cid14 cid14-DADA Cid14DADA amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC12G12.13c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Importantly, Cid14 activity was completely abolished in Cid14DADA (Figure 5B) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004201 D298A,D300A Not assayed or wild type 972 h- cid14 cid14-DADA Cid14DADA amino_acid_mutation ECO:0000335 high PMID:17512405 4896 2024-01-18 Like cid14D, Cid14 active site mutations had dramatically reduced centromeric siRNA levels (Figure 6D) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004679 D298A,D300A Not assayed or wild type 972 h- cid14 cid14-DADA Cid14DADA amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPBC947.01 FYPO:0001585 1-350 Not assayed or wild type 972 h- knk1 knk1-C knk1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC947.01) PMID:25422470 4896 2017-02-07 PomBase SPBC947.01 FYPO:0004700 1-350 Not assayed or wild type 972 h- knk1 knk1-C knk1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25422470 4896 2017-02-07 PomBase SPBC947.01 FYPO:0001327 1-350 Not assayed or wild type 972 h- knk1 knk1-C knk1C partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC947.01) PMID:25422470 4896 2017-02-07 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0007950 1-392 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-deltaN-terminus B2d7 byr2-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 high PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 6D) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-deltaN-terminus B2d7 byr2-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 2) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-deltaN-terminus B2d7 byr2-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 2) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0007359 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 pck2-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000113 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 pck2-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0002485 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-111 unknown ECO:0005638 PMID:2806887 4896 2014-07-31 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0003179 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-111 unknown ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:9076725 4896 2018-06-07 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0003179 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-111 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:2806887 4896 2014-07-31 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0003179 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-111 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC330.05c) PMID:2806887 4896 2014-07-31 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0000485 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-111 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:8299939 4896 2014-07-29 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R95A,R165A Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-S5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0008455 434-555 Not assayed or wild type 972 h- tcb3 tcb3deltaC2A partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 medium PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- alp21 alp21+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10341216 4896 2014-07-07 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0000899 wild type Overexpression 972 h- alp21 alp21+ wild_type ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-07 PomBase SPAC12B10.10 FYPO:0002999 1-209 Not assayed or wild type 972 h- nod1 nod1(210-419) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC12B10.10 FYPO:0002999 1-209 Not assayed or wild type 972 h- nod1 nod1(210-419) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.16) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPBC1105.02c FYPO:0000039 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-95 unknown ECO:0005638 PMID:3142867 4896 2013-09-24 PomBase SPCC663.05c FYPO:0000082 A16T,L61P,E119K,L121P,N156S,E180G 972 h- asf1 asf1-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:21324894 4896 2012-03-09 PomBase SPCC663.05c FYPO:0000833 A16T,L61P,E119K,L121P,N156S,E180G 972 h- asf1 asf1-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:21324894 4896 2012-03-16 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0000747 S424P Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-424 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31900332 4896 2020-03-20 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0002068 S424P Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-424 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31900332 4896 2020-03-20 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 atp5 atp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0000470 deletion 972 h- atp5 atp5delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph atp5 atp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 atp5 atp5delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 atp5 atp5delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- atp5 atp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp5 atp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.06 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp5 atp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0006809 1-181 Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-delta182 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPAC8C9.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps5 rps5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8C9.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps5 rps5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8C9.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps5 rps5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 T652M Endogenous 972 h- cut14 cut14-90 cut14-173|cut14-179 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 T652M Endogenous 972 h- cut14 cut14-90 cut14-173|cut14-179 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0002170 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tra2 tra2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- tra2 tra2delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- tra2 tra2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tra2 tra2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.04c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrps28 mrps28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrps28 mrps28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11B10.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrps28 mrps28delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000502 chk1::ura4@(CU329672.1:1060123_1061101delins) Not assayed 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ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-08-02 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0000117 unknown Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-346 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-02-25 abnormal septum forms on the surface from one side of the cell and then extends in a disorganized manner into the interior PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0004735 unknown Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-346 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0004735 unknown Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-346 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002025 unknown Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-346 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-08-01 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002999 unknown Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-346 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000839 D213N Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-E8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:1316996 4896 2015-08-26 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002060 S369D,T395D Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-S369D,T395D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8039497 4896 2013-10-24 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc17 cdc17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc17 cdc17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc17 cdc17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc17 cdc17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc17 cdc17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0004159 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Defective chromosome segregation and reduced spore viability were also noted (Fig. 7a and Supplementary Videos 1-3) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003066 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:33574613 4896 2021-03-15 abnormal asci containing fewer than four, or no, spores were frequently generated (Fig. 7c). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0005121 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17A5.18c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Figure 6B) DSBs; for example, rec25, rec27 and mug20), which are critical for recombination and proper chromosome segregation during meiosis-I4 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0005121 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC577.05c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Figure 6B) DSBs; for example, rec25, rec27 and mug20), which are critical for recombination and proper chromosome segregation during meiosis-I4 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0005121 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.06c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Figure 6B) DSBs; for example, rec25, rec27 and mug20), which are critical for recombination and proper chromosome segregation during meiosis-I4 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000485 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17A5.18c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 Compared with the WT, cells expressing Pir1-SD showed a marked decrease in recombination frequency (Fig. 6f). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000485 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC577.05c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 Compared with the WT, cells expressing Pir1-SD showed a marked decrease in recombination frequency (Fig. 6f). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000485 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.06c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 Compared with the WT, cells expressing Pir1-SD showed a marked decrease in recombination frequency (Fig. 6f). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000581 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Defective chromosome segregation and reduced spore viability were also noted (Fig. 7a and Supplementary Videos 1-3) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0004966 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:33574613 4896 2021-03-15 cells showed impaired oscillation of chromosomes and a prolonged horsetail stage (approximately 160min compared with approximately 120min; Fig. 7a,b). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0007686 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Whereas Pir1-WT disappeared, Pir1-SD persisted during meiosis as multiple nuclear foci coinciding with Mmi1 and Erh1 foci (Fig. 5b,c). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0007685 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Intriguingly, cells expressing Pir1-SD, but not Pir1-WT or Pir1-SA, continued to divide on nutrient-limiting medium at a low temperature (Fig. 4a), suggesting that stabilized Pir1 supports cell proliferation under suboptimal growth conditions. PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0007687 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 restores the MTREC and Rrp6 association with Mmi1 and Erh1 during meiosis (Fig. 5d). PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0007687 S285D Not assayed or wild type 972 h- iss10 pir1-SD amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.17) PMID:33574613 4896 2021-03-15 restores the MTREC and Rrp6 association with Mmi1 and Erh1 during meiosis (Fig. 5d). 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sod2 sod2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.02c FYPO:0007303 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8978689 4896 2024-12-05 (Figure 3A) because the spindle elongates in the absence of sister chromatid separation. PomBase SPBC776.02c FYPO:0004022 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8978689 4896 2024-12-05 (Figure 3A) However, dis2-11 displayed an allele-specific mitotic phenotype with spindle elongation (Ohkura et al., 1989; see Figure 3A). PomBase SPBC776.02c FYPO:0000671 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001946 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001270 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2544298 4896 2013-01-25 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000080 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000080 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2170029 4896 2013-02-05 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002909 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),occurs_at(SO:0002213) PMID:29899453 4896 2018-07-06 extended data Figure 9 decreased RNA pol2 localization to chromatin (occurs at termination sites) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005801 high PMID:8389306 4896 2016-06-20 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.02c),assayed_substrate(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Fig. 1d, Extended Data Fig. 1d) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 medium PMID:2170029 4896 2013-02-05 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 high PMID:2170029 4896 2013-02-05 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001840 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000227 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001862 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000004 PMID:2544298 4896 2013-01-25 PomBase SPBC776.02c FYPO:0007534 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:30282034 4896 2020-11-01 PomBase SPBC776.02c FYPO:0006614 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000006 PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Figure 3e) Also increased termination index Fig. 4e PomBase SPBC776.02c FYPO:0002061 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002061 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:29899453 4896 2018-07-17 (Figure 3e) PomBase SPBC776.02c FYPO:0003086 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC12G12.14c) PMID:29899453 4896 2018-07-17 (Fig. 5c) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001164 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000964 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001761 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:1944266 4896 2012-11-22 PomBase SPBC776.02c FYPO:0004422 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c),residue(T316) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Fig. 1b) PomBase SPBC776.02c FYPO:0000097 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000097 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2544298 4896 2013-01-25 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001491 R245Q Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-11 dis2-R245Q|dis2cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:2544298 4896 2013-01-25 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppc89 ppc89delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000941 deletion 972 h- ppc89 ppc89delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.12) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000941 deletion 972 h- ppc89 ppc89delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1773.01) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppc89 ppc89delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- ppc89 ppc89delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppc89 ppc89delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- ppc89 ppc89delta deletion ECO:0005638 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC1687.03c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfc4 rfc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- rfc4 rfc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfc4 rfc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC359.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph pfl7 pfl7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- pfl7 pfl7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC359.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl7 pfl7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC359.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl7 pfl7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0003535 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000080 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gsk3 gsk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0009007 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0001122 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:28281664 4896 2021-05-11 (Figure 1b) divides longer than WT in the same conditions PomBase SPAC1687.15 FYPO:0003532 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0003532 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0009008 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-18 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:28281664 4896 2021-05-03 (Figure 1B) PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000674 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0000969 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 PMID:8524294 4896 2014-08-05 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0001829 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0001164 deletion 972 h- gsk3 gsk3delta deletion ECO:0005638 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fic1 fic1-2D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:37158439 4896 2024-02-13 (Figure 1) PomBase SPBC83.18c FYPO:0002559 T178D,S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-2D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:32878942 4896 2020-10-12 PomBase SPBC83.18c FYPO:0001587 T178D,S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-2D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:32878942 4896 2020-10-12 PomBase SPBC83.18c FYPO:0000703 T178D,S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-2D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:32878942 4896 2020-10-12 (Fig. S3A) PomBase SPBC83.18c FYPO:0000703 T178D,S241D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-2D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.02),assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:32878942 4896 2020-10-12 (Fig. S3A) PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000848 wild type Knockdown 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0001232 PMID:7769002 4896 2013-01-28 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0001492 wild type Knockdown 972 h- rpn11 rpn11+ wild_type ECO:0001232 PMID:7769002 4896 2013-01-28 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000256 V412L Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-V412L amino_acid_mutation ECO:0000059 low PMID:36626373 4896 2023-02-26 PomBase SPNCRNA.942 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.942 SPNCRNA.942delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.942 FYPO:0000067 deletion 972 h- SPNCRNA.942 SPNCRNA.942delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.942 FYPO:0001103 deletion 972 h- SPNCRNA.942 SPNCRNA.942delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 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deleted cells" PomBase SPBC20F10.10 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph psl1 psl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.10 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph psl1 psl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph psl1 psl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.10 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 psl1 psl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC20F10.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 psl1 psl1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC20F10.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 psl1 psl1delta deletion ECO:0005638 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SPCC24B10.07 FYPO:0002680 S546D Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S546D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_enzyme(PomBase:SPCC576.15c),assayed_substrate(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001147 S546D Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-S546D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 2-50 Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-Ndelta2-50 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:8887553 4896 2013-02-08 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0001324 L531P Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-L531P amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 (Figure S7A) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0002061 L531P Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-L531P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 atg11(532-583)-LZ Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(532-583)-LZ fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-17 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 atg11(532-583)-LZ Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(532-583)-LZ fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-17 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0000088 M880MLGVPL Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-52 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0000089 M880MLGVPL Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-52 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 M880MLGVPL Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-52 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPCC736.12c FYPO:0008155 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:32415063 4896 2024-01-22 as was also observed in mmi1Δ and rrp6Δ cells (Fig. 1a and Supplementary Fig. 1a) PomBase SPCC736.12c FYPO:0008155 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1459) PMID:32415063 4896 2024-01-22 as was also observed in mmi1Δ and rrp6Δ cells (Fig. 1a and Supplementary Fig. 1a) PomBase SPCC736.12c FYPO:0004851 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0004811 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1459) PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0004811 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0004811 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0004811 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0005861 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.17) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0007530 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0007530 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0005862 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.17) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0007215 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.10) PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPCC736.12c FYPO:0007214 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.10) PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001045 deletion 972 h- mei4-C125->STOP mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-26 In addition, using the prt-pho1 reporter plasmid to gauge Pho1 acid phosphatase expression, we found that Pho1 activity was lower in mmi1Δ cells than in wild-type cells (Fig. 6C) PomBase SPCC736.12c FYPO:0000303 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0006269 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0003230 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC13A11.03) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0003230 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0003230 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0003230 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.10) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0006612 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000044738) PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPCC736.12c FYPO:0007280 deletion 972 h- mei4Δ mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC1F3.01) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 1A) PomBase SPCC736.12c FYPO:0000826 deletion 972 h- mei4-C125->STOP mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-20 Northern blotting and primer extension, Figure 6 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000584 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Deletion of iss10 or mmi1 only affects meiotic mRNAs PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- mei4delta mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 deletion 972 h- mei4delta mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- mei4-P527 mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002173 deletion 972 h- mei4-P527 mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000836 deletion 972 h- mei4delta mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001327 deletion 972 h- mei4delta mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000825 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2022-12-01 Northern analysis identified that an B1.9kb nc-tgp1 RNA accumulates in rrp6D, mmi1D and red1D, but not in wild-type cells (Fig. 2e,f; Supplementary Fig. 4). PomBase SPCC736.12c FYPO:0000825 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:25428589 4896 2022-12-02 In contrast, nc-tgp1, nc-pho1 and sme2þ RNA levels were clearly elevated in cells lacking Mmi1-mediated exosome degradation (mmi1D and rrp6D). Th PomBase SPCC736.12c FYPO:0000316 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0005638 PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0005638 PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0005863 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.17) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0006996 deletion 972 h- mei4Δ mmi1 mmi1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1365) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) COULD ALSO ADD TO ANTISENS RPL402, BUT NOT ANNOTATED PomBase SPCC736.12c FYPO:0002336 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000049 PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S2D) PomBase SPCC736.12c FYPO:0000833 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.17) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002357 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6A) PomBase SPCC736.12c FYPO:0001317 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1343) PMID:25428589 4896 2022-12-01 The size and levels of the nc-1343 transcript increased in exosome defective (rrp6D) cells, but not cells lacking Mmi1 or Red1 (Fig. 2c,d; Supplementary Fig. 4). T PomBase SPCC736.12c FYPO:0001317 deletion 972 h- mei4delta mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:33536434 4896 2023-03-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001317 deletion 972 h- mei4delta mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001317 deletion 972 h- mmi1 mmi1delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S1A) PomBase SPCC736.12c FYPO:0002085 deletion 972 h- mei4-C125->STOP mmi1 mmi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure S1) PomBase SPAC13D6.02c FYPO:0003412 byr3::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 byr3 byr3::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC23H4.03c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erv25 erv25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.03c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erv25 erv25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- erv25 erv25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23H4.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erv25 erv25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004067 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19328067 4896 2014-11-24 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004068 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19328067 4896 2014-12-05 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004161 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.10) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004161 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC330.10) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004161 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0001117 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0001117 L87G Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-L87G mcs6as amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 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ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000081 291-665 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-(1-290) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0005371 GFP-cnp1 Not assayed or wild type 972 h- cnp1 GFP-cnp1 GFP-cnp1|cnp1(GFP-N) fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:18077559 4896 2018-03-01 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001686 GFP-cnp1 Not assayed or wild type 972 h- cnp1 GFP-cnp1 GFP-cnp1|cnp1(GFP-N) fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:18077559 4896 2018-03-01 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001357 GFP-cnp1 Not assayed or wild type 972 h- cnp1 GFP-cnp1 GFP-cnp1|cnp1(GFP-N) fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:18077559 4896 2018-03-01 PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002667 H72A Not assayed or wild type 972 h- naa10 naa10-H72A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000705 L522A,L525A,I529A,I532A,L536A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-LI->A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23E2.01),assayed_using(PomBase:SPAC23E2.01) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000825 L522A,L525A,I529A,I532A,L536A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-LI->A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000281 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000825 L522A,L525A,I529A,I532A,L536A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-LI->A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0004250 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC594.06c) PMID:25378562 4896 2015-01-06 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0004250 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:25378562 4896 2015-01-06 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0000544 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:21757403 4896 2013-05-22 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21757403 4896 2011-11-29 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:21757403 4896 2013-05-22 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0000539 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:21757403 4896 2013-05-22 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pep12 pep12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- pep12 pep12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31E1.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pep12 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SPBC32F12.01c FYPO:0005485 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 7b) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0005485 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 7b) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0005754 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high high PMID:11514435 4896 2016-12-04 (Fig. 6) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0005755 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high high PMID:11514435 4896 2016-12-04 (Fig. 6) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0001084 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high high PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 1, 3B; Table 2) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0004860 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high high PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 1, 3B; Table 2) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0001489 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 2a) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0002061 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 2a) PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0002061 G18R Not assayed or wild type 972 h- css1 css1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:11514435 4896 2016-10-27 (Figure 2a) PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0001889 unknown Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-K1 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1565.04c) PMID:1766866 4896 2013-02-01 PomBase SPBC577.15c FYPO:0000214 E207K Not assayed or wild type 972 h- sim3 sim3-205 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18158900 4896 2011-09-12 PomBase SPBC577.15c FYPO:0001270 E207K Not assayed or wild type 972 h- 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Table 1). PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001365 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 PMID:26092938 4896 2015-08-24 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001365 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001365 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 1) PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001365 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001365 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0003014 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:10769212 4896 2017-08-10 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0004653 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0004653 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:30928696 4896 2019-04-16 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0006831 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. S3D) The timing of septation onset depends on the AR function. The start of septation is delayed when the function of the AR unconventional type II myosin Myp2 is compromised. PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001253 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0000133 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 10 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0000133 deletion 972 h- myp2 myp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 90 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph myp2 myp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- 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prototroph rps502 rps502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.10c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph rps502 rps502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph rps502 rps502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rps502 rps502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rps502 rps502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rps502 rps502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC328.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- rps502 rps502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC328.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps502 rps502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC328.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps502 rps502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0001214 deletion 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007094 Fus1 chimera with the IDR replaced by the human Fused-in-Sarcoma low complexity region with the G156E mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-FUS(G156E)-fus1(792-1372) other ECO:0001232 low PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4F) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003267 CTD-∆(r17-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(CTD-16repeats) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S1) PomBase SPAC186.02c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC186.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC186.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC186.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC186.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC186.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC186.02c SPAC186.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.13c FYPO:0003440 H159Y Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-N1 mob1-J2|mob1-M17 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40385371 4896 2025-06-09 A percentage of lysed cells were also detected for mob1-N1 and mob1-R4 (Figure 1C-D). PomBase SPBC428.13c FYPO:0000082 H159Y Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-N1 mob1-J2|mob1-M17 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:40385371 4896 2025-06-09 mob1-N1 grew less well than wildtype at 36°C (Figure 1B). PomBase SPBC428.13c FYPO:0002822 H159Y Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-N1 mob1-J2|mob1-M17 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 At 25°C, sid2p-GFP spindle pole body staining was normal, but very few sid2p-GFP rings were detectable, and those which were seen were much fainter than in a wild-type background. We also noted that the spindle pole body signal of sid2p- GFP was absent, or greatly reduced in intensity at 36°C. PomBase SPBC428.13c FYPO:0005709 H159Y Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-N1 mob1-J2|mob1-M17 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 At 25°C, sid2p-GFP spindle pole body staining was normal, but very few sid2p-GFP rings were detectable, and those which were seen were much fainter than in a wild-type background. We also noted that the spindle pole body signal of sid2p- GFP was absent, or greatly reduced in intensity at 36°C. PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 P13A Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-P13A amino_acid_mutation ECO:0001232 13.6 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Fig. 1b, C, 3H) PomBase SPBC839.12 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc31 rpc31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC839.12 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc31 rpc31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC839.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpc31 rpc31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC839.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc31 rpc31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif224 tif224delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif224 tif224delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.06 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tif224 tif224delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPBC119.04 FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- mei3 mei3+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC607.10) PMID:11739793 4896 2015-03-31 PomBase SPBC119.04 FYPO:0001489 wild type Overexpression 972 h- mei3 mei3+ wild_type ECO:0005638 PMID:3034608 4896 2013-02-25 PomBase SPBC119.04 FYPO:0001886 wild type Overexpression 972 h- mei3 mei3+ wild_type ECO:0005638 PMID:3357510 4896 2013-02-26 PomBase SPBC119.04 FYPO:0001886 wild type Overexpression 972 h- mei3 mei3+ wild_type ECO:0001232 PMID:3034608 4896 2013-02-25 PomBase SPBC119.04 FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- mei3 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lem2NdeltaLEM partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 2) PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fkh2 fkh2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0004363 wild type Overexpression 972 h- fkh2 fkh2+ wild_type ECO:0000291 PMID:15195092 4896 2017-03-07 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 fkh2 fkh2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- fkh2 fkh2+ wild_type ECO:0005638 PMID:15302827 4896 2015-10-20 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000133 wild type Overexpression 972 h- fkh2 fkh2+ wild_type ECO:0001232 PMID:15302827 4896 2015-10-20 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- fkh2 fkh2+ wild_type ECO:0005638 PMID:15509866 4896 2015-11-22 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mfm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- mfm3 mfm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPJ4664.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mfm3 mfm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPJ4664.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mfm3 mfm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004306 R164A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-R164A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium PMID:14701811 4896 2015-01-22 PomBase SPBC887.14c FYPO:0004815 G1523A 972 h- pfh1 pfh1-R23 nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:25417108 4896 2015-07-31 PomBase SPBC887.14c FYPO:0004824 G1523A 972 h- pfh1 pfh1-R23 nucleotide_mutation ECO:0000231 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPAC222.09 FYPO:0001645 K124E Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-K124E amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC222.09),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28367989 4896 2018-02-01 PomBase SPAC222.09 FYPO:0001355 K124E Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-K124E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28367989 4896 2018-02-01 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000190 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 PMID:17905925 4896 2012-07-25 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000190 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000174 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:17905925 4896 2012-07-24 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0004964 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0006031 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Fig. 8d) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000134 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:17905925 4896 2012-07-20 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001292 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005801 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001407 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000155 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001407 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001407 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000155 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001285 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000325 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0006330 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000111 PMID:39110593 4896 2024-11-05 (Figures 4B and S4B) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0003150 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000154 44 PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Figure 8e) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0003771 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137,FYECO:0000154 low assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27852900 4896 2018-05-03 (Fig. 7) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0003771 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137,FYECO:0000154 medium assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:27852900 4896 2018-05-03 (Fig. 7) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17905925 4896 2012-07-20 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17905925 4896 2012-07-20 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0002297 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0006031 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Fig. 8d) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000038 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17905925 4896 2012-07-20 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001286 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000325 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0008330 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000334 PMID:39110593 4896 2024-11-05 We also saw augmented PM levels of PI4P and PI4,5P2 indicated by PHOsh2-GFP and PHNum1- GFP,5 respectively, in these cells (Figure S4A) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-07-25 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:17905925 4896 2012-07-25 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001294 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001293 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001164 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-09-27 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0002657 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000154,FYECO:0000310 95 PMID:27852900 4896 2018-04-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0004963 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Figure 5D) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0008294 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000334 PMID:39110593 4896 2024-11-05 ER-PM contact formation was however unaffected in pps1D (Figures 4B and S4B). PomBase SPCC1442.12 FYPO:0005168 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000154,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 6) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0005168 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000154,FYECO:0000261 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 6) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000154 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 6) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000154 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 5) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000154,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 5) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0005890 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000154 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 5) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001266 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000154,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 6) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001266 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000154,FYECO:0000261 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 6) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000776 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000154 assayed_protein(PomBase:SPBC106.10) PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 6) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001315 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-07-23 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001284 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000325 PMID:17905925 4896 2012-08-16 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0008329 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0000334 PMID:39110593 4896 2024-11-05 Indeed, as previously shown,31 the PM pool of PS marked by GFP-Lact-C234 was absent in pps1D (Figure S4A). PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000098 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000154 medium PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 1b) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001188 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-07-25 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001190 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-07-25 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001190 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:17905925 4896 2012-07-25 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000154 medium PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 1a) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0000647 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000154 PMID:17905925 4896 2012-07-23 PomBase SPCC1442.12 FYPO:0003481 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000154 high PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Fig. 8a) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0003481 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137,FYECO:0000154 high PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Fig. 8a) PomBase SPCC1442.12 FYPO:0002106 deletion 972 h- pps1 pps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000154 high PMID:27852900 4896 2018-04-16 (Fig. 8a) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 G397D Endogenous 972 h- cut14 cut14-71 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000091 G397D Endogenous 972 h- cut14 cut14-71 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC767.01c FYPO:0002788 K40A Not assayed or wild type 972 h- vps1 vps1-K40A GTPase-Dead|vps1-K42A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19643199 4896 2020-12-30 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 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PomBase SPAC22F3.13 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tsc1 tsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC22F3.13 FYPO:0000280 deletion 972 h- tsc1 tsc1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 high PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPAC22F3.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- tsc1 tsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22F3.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tsc1 tsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tsc1 tsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC685.02 FYPO:0003164 D207A Not assayed or wild type 972 h- exo5 exo5-D207A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC685.02) PMID:31563844 4896 2023-11-09 Consistent with these studies, mutation of either of the analogous active site aspartates to alanines (D176A, D207A), abrogated the nuclease activity of spExo5 (Supplementary Fig. S2A). PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006108 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-1390,E1168R)-fus1(1278-1372),with cdc12_E1168R mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-cdc12(FH2,E1168R)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-1390,E1168R)-fus1(1278-1372),with cdc12_E1168R mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-cdc12(FH2,E1168R)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 medium PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0008002 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-1390,E1168R)-fus1(1278-1372),with cdc12_E1168R mutation Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-cdc12(FH2,E1168R)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 medium PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 6) PomBase SPAC17C9.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tim13 tim13delta deletion ECO:0005638 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2010-04-06 PomBase SPCC1620.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsc2 lsc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1620.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsc2 lsc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000006 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 the Ser666Arg and Cys663Arg mutants ran as monomeric species in gel filtration, indicative of disruption of their dimerization PomBase SPBC342.05 FYPO:0000703 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Conversely, mutations disrupting dimerization did not disrupt -H2A.1 binding (Fig. 3C). PomBase SPBC342.05 FYPO:0000703 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Conversely, mutations disrupting dimerization did not disrupt -H2A.1 binding (Fig. 3C). PomBase SPBC342.05 FYPO:0000085 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000088 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 C663R Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-C663R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:18676809 4896 2023-02-15 (Fig. 4a) PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pan5 pan5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- pan5 pan5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pan5 pan5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPB2B2.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pan5 pan5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0003941 Y36A Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-Y36A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:27183195 4896 2016-08-03 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0006378 deletion 972 h- lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3E7.15c) PMID:35008733 4896 2022-01-18 (Fig. 3) Live cell imaging revealed that GFP-Lac1 and Lag1-GFP remain localized at the ER in the absence of Lag1 or Lac1 respectively, indicating that their ER localizations are not interdependent. PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph lag1 lag1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1A6.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lag1 lag1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0001489 S535P Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-23 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 S535P Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-23 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:30463883 4896 2019-05-19 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002060 S535P Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-23 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000079 PMID:30463883 4896 2019-05-18 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001043 1-241,391-1692 Overexpression 972 h- cyr1 cyr1-RAD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:15925945 4896 2017-09-21 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000705 336-342 Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1delta-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.09c),assayed_using(PomBase:SPBC365.06) PMID:22730331 4896 2016-08-16 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001690 336-342 Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1delta-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000963 336-342 Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1delta-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000703 336-342 Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1delta-Ct partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.09c),assayed_using(PomBase:SPBC1711.10c) PMID:22730331 4896 2016-08-16 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001357 336-342 Not assayed or wild type 972 h- ufd1 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assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-R18 cst4-R18 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002061 C2957T Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-R18 cst4-R18 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002060 C2957T Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-R18 cst4-R18 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003363 A22V Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-A22V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001234 A22V Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-A22V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0002128 88-151 Not assayed or wild type 972 h- byr2 byr2-delta(88-151) disrupted RBD domain partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:9514947 4896 2013-05-09 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006586 C74S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C74S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPBC4.01 FYPO:0000708 C74S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C74S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006541 C74S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C74S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006587 C74S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C74S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPAC212.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- tlh1 tlh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC212.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ 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FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lcp5 lcp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004259 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000277 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000229 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000277 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002897 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002470 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000838 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000095 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000268 S345A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S345A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0008455 170-192 Not assayed or wild type 972 h- tcb3 tcb3deltaTM partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPCC285.07c FYPO:0001489 Wtf18 tethered to a deubiquitinase using the GFP–GBP interaction Ectopic 972 h- wtf18 wtf18-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2024-12-26 (Fig. 6A) PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0004308 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:12242294 4896 2016-03-02 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0000141 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16855021 4896 2014-12-16 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001269 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001269 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.05c) PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001269 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.03) PMID:16855021 4896 2014-12-16 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001270 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0000082 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0003217 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:12242294 4896 2016-03-02 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001840 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001490 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8887647 4896 2016-03-02 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0002414 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0002061 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12242294 4896 2016-03-02 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0004307 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 12 PMID:12242294 4896 2016-03-02 (Figure 9) PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001387 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0000324 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:12242294 4896 2016-03-02 (Fig. 1a) PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001273 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001976 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8887647 4896 2013-02-08 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0000963 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001975 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:8887647 4896 2013-02-08 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0002390 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:12242294 4896 2016-03-02 (Fig. 1a) PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001905 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0002901 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:12242294 4896 2016-03-02 data not shown PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0002901 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:15371542 4896 2014-12-19 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0001420 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000103 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0000094 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0000091 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0003241 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0006031 62 PMID:12242294 4896 2016-03-02 PomBase SPAC25B8.14 FYPO:0003241 E277K Not assayed or wild type 972 h- mal2 mal2-1 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:8887647 4896 2013-02-05 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0002019 ura4+ @ 5' HindIII site Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1::ura4+ 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This allele showed similar delayed grow defect phenotype as trt1∆::his3+ allele that remove 99% of ORF. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0001490 trt1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- trt1 trt1::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9252327 4896 2017-08-16 This allele removes motif B' through E in reverse transcriptase domain of telomerase catalytic subunit. This allele showed similar extent of delayed cell elongation phenotype as trt1∆::his3+ allele that remove 99% of ORF. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002239 trt1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- trt1 trt1::ura4+ disruption ECO:0000337 high PMID:9252327 4896 2017-08-16 This allele removes motif B' through E in reverse transcriptase domain of telomerase catalytic subunit. This allele showed similar rate of telomere shortening as trt1∆::his3+ allele that remove 99% of ORF. PomBase SPBC23G7.12c FYPO:0003412 rpt6::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpt6 rpt6::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC1682.14 FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rpl1902 rpl1902delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1682.14 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl1902 rpl1902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.14 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rpl1902 rpl1902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.14 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rpl1902 rpl1902delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.14 FYPO:0009052 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Overexpression 972 h- SPNCRNA.1097 SPNCRNA.1097+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000416 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1097 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1097 SPNCRNA.1097+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1097 FYPO:0001029 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1097 SPNCRNA.1097+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1097 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1097 SPNCRNA.1097+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1097 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1097 SPNCRNA.1097+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1097 FYPO:0002546 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1097 SPNCRNA.1097+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBCPT2R1.08c FYPO:0007936 wild type Overexpression 972 h- tlh2 tlh2+ tlh2+-OE-nmt1promoter wild_type ECO:0005638 PMID:34464389 4896 2022-01-10 (Figure S7B) The proportion of junctions downstream of tlh2 was higher in the tlh2 overexpression strain compared to wild-type PomBase SPBCPT2R1.08c FYPO:0000245 wild type Overexpression 972 h- tlh2 tlh2+ tlh2+-OE-nmt1promoter wild_type ECO:0005638 FYECO:0000123 PMID:34464389 4896 2022-01-08 (Figure S7C) Moreover, the tlh2 overexpression strain was substantially shorter-lived than wild-type cells PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004303 D170E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D170E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:11934898 4896 2015-01-15 PomBase SPAC4D7.05 FYPO:0002904 wild type Knockdown 972 h- sum1 sum1+ wild_type ECO:0001232 PMID:9560390 4896 2014-05-22 PomBase SPAC4D7.05 FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- sum1 sum1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9560390 4896 2014-05-22 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007094 fus1delta::fus1(1-868)-fus1(792-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-fus1(2FH1)-fus1(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 low PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 4E) PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005742 S235A,S332A,S333A,S408A,S410A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S235A,S332A,S333A,S408A,S410A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005746 S235A,S332A,S333A,S408A,S410A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S235A,S332A,S333A,S408A,S410A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005749 S235A,S332A,S333A,S408A,S410A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S235A,S332A,S333A,S408A,S410A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPAC323.02c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pup2 pup2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC323.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- pup2 pup2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC323.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pup2 pup2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007376 W620* Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-W620* partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 1C) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 W620* Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-W620* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 1C) PomBase SPBC146.07 FYPO:0002061 3-189 Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2delta-L3-P189 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:15548596 4896 2014-08-11 PomBase SPCC613.04c FYPO:0004736 lacking AA330-655 Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3::ura4+ disruption ECO:0001232 complete PMID:10852821 4896 2019-10-30 PomBase SPCC613.04c FYPO:0000117 lacking AA330-655 Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3::ura4+ disruption ECO:0001232 complete PMID:10852821 4896 2019-10-30 PomBase SPCC613.04c FYPO:0003682 lacking AA330-655 Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3::ura4+ disruption ECO:0001232 complete PMID:10852821 4896 2019-10-30 PomBase SPCC613.04c FYPO:0002061 lacking AA330-655 Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:10852821 4896 2019-10-30 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0001512 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 medium PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 low assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000006,FYECO:0000201,FYECO:0000229 medium assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 low assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000006,FYECO:0000201,FYECO:0000229 medium assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0001122 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-1 prp14-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rhp14 rhp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rhp14 rhp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC649.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC649.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC649.03 FYPO:0001690 deletion 972 h- rhp14 rhp14delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPBC649.03 FYPO:0006679 deletion 972 h- rhp14 rhp14delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPBC649.03 FYPO:0001164 deletion 972 h- rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 rhp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC649.03 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph rhp14 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PomBase SPAC688.11 FYPO:0001019 deletion 972 h- KanMX leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 36 PMID:15827087 4896 2016-12-14 Table 2 PomBase SPAC688.11 FYPO:0001019 deletion 972 h- KanMX leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 9 PMID:15827087 4896 2016-12-14 Table 2 PomBase SPAC688.11 FYPO:0003028 deletion 972 h- KanMX leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 19 PMID:15827087 4896 2016-12-14 (Table 2) PomBase SPAC688.11 FYPO:0002424 deletion 972 h- KanMX leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 8 PMID:15827087 4896 2016-12-14 Table 2 PomBase SPAC688.11 FYPO:0000899 deletion 972 h- KanMX leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 medium PMID:15827087 4896 2016-12-16 (Fig. 1B) PomBase SPAC688.11 FYPO:0000833 deletion 972 h- end4 end4delta 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SPAC688.11 FYPO:0004447 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC663.03) PMID:21832151 4896 2015-02-19 PomBase SPAC688.11 FYPO:0004325 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC688.11 FYPO:0000098 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPAC688.11 FYPO:0001190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC688.11 FYPO:0001987 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPAC688.11 FYPO:0003494 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC688.11 FYPO:0003358 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:26749213 4896 2016-07-06 PomBase SPAC688.11 FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000200 high PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 end4 end4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC688.11 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 end4 end4delta deletion 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SPAC688.11 FYPO:0002903 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 end4 end4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low low PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002106 deletion 972 h- end4 end4delta deletion ECO:0001232 PMID:25422470 4896 2016-10-28 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 end4 end4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC688.11 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 end4 end4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000963 S191A Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-S191A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000957 S191A Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-S191A amino_acid_mutation ECO:0005638 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amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000268 K253A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-31 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 medium PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0002827 C515F Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ fft3 fft3-C515F amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 low PMID:38285941 4896 2024-04-08 (Fig. S1) PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002003 G(-1513)T Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-delta12M1 mei2--G1512T nucleotide_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:1657709 4896 2013-03-08 PomBase SPCC63.14 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 eis1 eis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC63.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 eis1 eis1delta deletion ECO:0005638 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SPBC365.06 FYPO:0005630 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC365.06) PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 3C) PomBase SPBC365.06 FYPO:0002339 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:39786922 4896 2025-01-31 (Fig. 4) PomBase SPBC365.06 FYPO:0007532 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPBC365.06 FYPO:0007537 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 5D and E) PomBase SPBC365.06 FYPO:0007537 K14R,K30R,K39R,K51R,K53R,K54R,K60R,K63R,K71R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-KallR SUMO-KallR amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:33159083 4896 2020-12-01 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0004481 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16483313 4896 2016-04-19 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0003165 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0005429 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15329725 4896 2016-06-03 (Fig. 1h) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0005428 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15329725 4896 2016-06-03 (Fig. 1f) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001490 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000315 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002061 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002102 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15329725 4896 2016-06-03 (Fig. 1d and Fig. 1h) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0005410 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000267 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000268 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002060 D122A,E124A Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-EA2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000227 PMID:15329725 4896 2016-06-03 PomBase 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mrh5-G230E srd11 amino_acid_mutation ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Cytb level was partly decreased in Δmrh5 and only slightly in the point mutant. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001983 G230E Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-G230E srd11 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Western blot analysis was performed on the Δmrh5 and mrh5-G230E mutants, as well as the tagged Mrh5-cMyc strain (Figure 9C). The results showed that Mrh5 is a mitochondrial protein and that Cox1 and Cox2 were undetectable in both mutants. PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0001983 G230E Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-G230E srd11 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Western blot analysis was performed on the Δmrh5 and mrh5-G230E mutants, as well as the tagged Mrh5-cMyc strain (Figure 9C). The results showed that Mrh5 is a mitochondrial protein and that Cox1 and Cox2 were undetectable in both mutants. PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000705 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:10523629 4896 2016-09-14 (Fig. 2a) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003165 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 35 PMID:10523629 4896 2016-09-14 (Fig. 3C) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0002679 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:10523629 4896 2016-09-14 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001838 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:15629716 4896 2015-01-21 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001128 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000211 35 PMID:10523629 4896 2016-09-14 (Fig. 4) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000089 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000211 high PMID:10523629 4896 2016-09-14 (Fig. 4) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000271 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18272791 4896 2017-10-13 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0002060 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0002177 S99A,S148A,S178A,S192A,S204A,S206A,T226A,S234A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPBC1734.14c FYPO:0000705 P90V,P92V Not assayed or wild type 972 h- suc1 suc1-P90V,P92V amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c) PMID:11434772 4896 2015-12-15 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 T84GCTGCAGC,T88G Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U88G,delta84-88,omega8nt nucleotide_insertion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 GAAA160CTTC Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-PTL1-2 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPAC20G4.03c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP hri1 hri1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 Y124YGGYPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-E9 = amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 Y124YGGYPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-E9 = amino_acid_insertion ECO:0000049 high assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 Y124YGGYPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-E9 = amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPCC5E4.03c FYPO:0001489 53-156 Not assayed or wild type 972 h- taf5 taf5delta53-156 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9224658 4896 2014-09-11 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0004763 T101A Not assayed or wild type 972 h- moa1 moa1-T101A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:25533956 4896 2015-07-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0005633 T101A Not assayed or wild type 972 h- moa1 moa1-T101A amino_acid_mutation ECO:0001232 ~30 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1D) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 G72A,G78A,G100A,G107A,G112A,G141A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G72A,G78A,G100A,G107A,G112A,G141A srp7-G72A,G78A,G100A,G107A,Gl12A,G141A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G72A,G78A,G100A,G107A,G112A,G141A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G72A,G78A,G100A,G107A,G112A,G141A srp7-G72A,G78A,G100A,G107A,Gl12A,G141A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000619 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000214 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004 PMID:9285594 4896 2016-06-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0005024 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21633354 4896 2015-10-29 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000141 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000229 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 32 PMID:38780300 4896 2024-09-06 (Fig. 6A) PomBase SPBC146.03c FYPO:0003165 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 25 PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 6A) PomBase SPBC146.03c FYPO:0003165 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBC146.03c FYPO:0003165 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC146.03c FYPO:0006993 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 medium PMID:26832414 4896 2024-03-19 (Fig. 4A) PomBase SPBC146.03c FYPO:0003096 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 low PMID:26832414 4896 2024-03-19 (Fig. 4B) PomBase SPBC146.03c FYPO:0003286 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000450 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 36 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:26832414 4896 2024-03-19 (Fig. 4F) PomBase SPBC146.03c FYPO:0002909 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002909 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002839 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC776.13) PMID:21633354 4896 2015-10-29 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002386 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 low assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_region(SO:0001799) PMID:26832414 4896 2024-03-19 (Fig. 4D) PomBase SPBC146.03c FYPO:0000288 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 low PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000288 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBC146.03c FYPO:0003970 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC146.03c FYPO:0001272 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:21633354 4896 2015-10-29 PomBase SPBC146.03c FYPO:0001387 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC146.03c FYPO:0001387 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC146.03c FYPO:0001387 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25392932 4896 2014-11-19 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002574 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.03) PMID:21633354 4896 2015-10-29 PomBase SPBC146.03c FYPO:0001509 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.04) PMID:21633354 4896 2015-10-29 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002625 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2D) PomBase SPBC146.03c FYPO:0002625 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2D) PomBase SPBC146.03c FYPO:0002625 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2D) PomBase SPBC146.03c FYPO:0004662 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002060 S1147P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-477 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000030 H126R,E149G Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-A8-ts amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:18262494 4896 2016-04-05 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000069 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gyp10 gyp10delta deletion ECO:0005638 low PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Fig. 3C). 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Cells are frequently binucleate, without a septum, and with the nuclei in a postmitotic configuration. PomBase SPBC428.13c FYPO:0003440 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40385371 4896 2025-06-09 A percentage of lysed cells were also detected for mob1-N1 and mob1-R4 (Figure 1C-D). PomBase SPBC428.13c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:40385371 4896 2025-06-09 mob1-R4 grew slightly less well than wildtype at both high (32°C and 36°C) and low (25°C) temperatures (Figure 1B). PomBase SPBC428.13c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPBC428.13c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 low PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC428.13c FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 low PMID:40385371 4896 2025-06-10 mob1-R4 grew slightly less well than wildtype at both high (32°C and 36°C) and low (25°C) temperatures (Figure 1B). PomBase SPBC428.13c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:22419817 4896 2013-08-23 PomBase SPBC428.13c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC428.13c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC428.13c FYPO:0001903 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC428.13c FYPO:0000647 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-R4 R155C unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0001382 T82A Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-T82A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c),assayed_substrate(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:28671615 4896 2017-07-21 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000849 P146D Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P146D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:19171118 4896 2012-10-29 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001037 P146D Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P146D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000166 PMID:19171118 4896 2012-10-29 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 P146D Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P146D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19171118 4896 2012-12-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000833 P146D Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P146D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:19171118 4896 2012-10-29 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 P146D Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P146D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:19171118 4896 2012-11-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0002061 F388A Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-F4A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18418055 4896 2015-09-14 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000443 940-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-940-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004481 940-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-940-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002106 940-1516 Not assayed or wild type 972 h- myo52 myo52-940-1516 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tad1 tad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tad1 tad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tad1 tad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tad1 tad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph tad1 tad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- tad1 tad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tad1 tad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tad1 tad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0006825 deletion 972 h- csc3 csc3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC2C4.10c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 We found that this is also true for Csc4. Csc4-GFP was not detected at SPBs in csc1∆, csc2∆, csc3∆ or ppa3∆ cells (Figure S1A). PomBase SPBC1773.01 FYPO:0000016 deletion 972 h- csc3 csc3delta deletion ECO:0001232 PMID:22682253 4896 2012-08-23 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0001876 deletion 972 h- csc3 csc3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0001876 deletion 972 h- csc3 csc3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph csc3 csc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph csc3 csc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph csc3 csc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.01 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph csc3 csc3delta deletion ECO:0005638 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amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:28552615 4896 2017-06-15 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007376 V752* Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-V752* partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 1F) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 V752* Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-V752* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 1F) PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0001934 deletion 972 h- mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.04c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mtg1 mtg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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1-78 Not assayed or wild type 972 h- hva22 yep1(79-166) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.09c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.09c) PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Fig. S5, S6) PomBase SPBC119.11c FYPO:0000082 87-150 Overexpression 972 h- pac1 pac1-deltaA/X partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPCC1322.11 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2302 rpl2302delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1322.11 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2302 rpl2302delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1322.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpl2302 rpl2302delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1322.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2302 rpl2302delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004217 Y220A Knockdown 972 h- set9 set9-Y220A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004218 Y220A Knockdown 972 h- set9 set9-Y220A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1) Expression of exogenous wt HA- tagged Set9 but not Set9Y220A was able to rescue H4- K20 methylation in set9Δ cells (Figure 1E). PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0008179 Y220A Knockdown 972 h- set9 set9-Y220A amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000085 Y220A Knockdown 972 h- set9 set9-Y220A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 3) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000265 Y220A Knockdown 972 h- set9 set9-Y220A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 3) PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G7.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC13G7.09c SPAC13G7.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-3423 unknown ECO:0005638 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-3423 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-3423 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:6090122 4896 2013-02-27 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0001355 1-597 Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1deltaN597 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10779336 4896 2018-03-02 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000969 1-597 Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1deltaN597 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10779336 4896 2018-03-02 PomBase SPCC74.02c FYPO:0005369 1-487 Not assayed or wild type 972 h- ppn1 ppn1-488-710 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:33711009 4896 2022-09-19 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007592 41-80 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN41-80 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3H) PomBase SPCC622.08c FYPO:0000450 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-S121A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPCC622.08c FYPO:0004212 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-S121A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPCC622.08c FYPO:0002679 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-S121A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Te recombinant proteins of fssion yeast H2A (SpHta1) were also purifed. An in vitro kinase assay using these recombinant proteins showed that the H2A-K119D and the H2A-K119E mutants, as well as the H2A-S121A mutant, were not signifcantly phosphorylated by Bub1, whereas H2A-K119R mutant proteins were phosphorylated by Bub1 (Fig. 4B). PomBase SPCC622.08c FYPO:0003182 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-S121A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29769606 4896 2024-04-24 Consistently, sister chromatid non-disjunction at meiosis II was signifcantly increased in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. S3D). PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009007 deletion 972 h- rnf13 rnf13delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph rnf13 rnf13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- rnf13 rnf13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnf13 rnf13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnf13 rnf13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0007505 (-240)-(-6) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1(pro2delta-6--240) prt-ncprodelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03),assayed_region(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 We found that, in the absence of non-coding transcription in a strain lacking the prt promoter (ncproΔ) (5), Clr3 recruitment to pho1 was reduced (Figure 2C). PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0005518 (-240)-(-6) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1(pro2delta-6--240) prt-ncprodelta partial_nucleotide_deletion ECO:0006030 assayed_region(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 H3K14ac levels were also increased in this strain (Figure 2D), similar to that seen in clr3Δ (Figure 1E) PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0004415 (-240)-(-6) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1(pro2delta-6--240) prt-ncprodelta partial_nucleotide_deletion ECO:0005801 PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0000825 (-240)-(-6) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1(pro2delta-6--240) prt-ncprodelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000229 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000082 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000080 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30810475 4896 2019-06-27 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003412 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1b) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1b) for dga1 normal splicing of inton 3, abnormal intron 2, Fig. S4 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC119.18) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1b) for dga1 normal splicing of inton 3, abnormal intron 2, Fig. S4 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1b) for dga1 normal splicing of inton 3, abnormal intron 2, Fig. S4 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC222.09),assayed_using(PomBase:SPBC19G7.17),assayed_using(PomBase:SPCC1235.15) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1b) for dga1 normal splicing of inton 3, abnormal intron 2, Fig. S4 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0003029 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC144.06) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 1b) for dga1 normal splicing of inton 3, abnormal intron 2, Fig. S4 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0001355 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30810475 4896 2019-07-07 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0001919 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000220 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.230) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. S6, 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000220 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.231) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. S6, 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000220 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.232) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. S6, 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000220 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.362) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. S6, 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0001917 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0006943 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1711.17) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 6) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0004300 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1711.17) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 6) PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000091 F528S Not assayed or wild type 972 h- prp16 prp16-F528S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:30810475 4896 2019-06-27 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1834.03c) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.03c) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC1105.12) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.06c) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC622.08c) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC776.12c FYPO:0000623 L339P,E403K,L416P 972 h- hsk1 hsk1-89 amino_acid_mutation ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC622.09) PMID:20230746 4896 2012-02-17 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 1-292,Q362V Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-V362 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 M119A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 M119A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000957 M119A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 M119A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 M119A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 M119A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPAC8C9.15c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif225 tif225delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8C9.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- tif225 tif225delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8C9.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif225 tif225delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000957 S604A,T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S604A,T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 S604A,T645A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S604A,T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001186 D218N Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-D218N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-24 PomBase SPAPB1A10.04c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwp1 cwp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1A10.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- cwp1 cwp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB1A10.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwp1 cwp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.30c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 thi5 thi5+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBP8B7.30c FYPO:0000303 wild type Overexpression 972 h- thi5 thi5+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:16874521 4896 2014-09-08 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004056 2-75,M1MPKKKRKV,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-1-74/SV-delta-Xba amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002061 2-75,M1MPKKKRKV,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-1-74/SV-delta-Xba amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0008455 217-422 Not assayed or wild type 972 h- tcb3 tcb3deltaSMP partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0003067 L1097S Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-L1097S dna2-ts|dna2ts amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170,FYECO:0000229 PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0000705 L1097S Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-L1097S dna2-ts|dna2ts amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC8F11.07c),assayed_using(PomBase:SPBC16D10.04c) PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0000185 L1097S Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-L1097S dna2-ts|dna2ts amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0004516 L1097S Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-L1097S dna2-ts|dna2ts amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0002474 L1097S Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-L1097S dna2-ts|dna2ts amino_acid_mutation 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PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0000227 deletion 972 h- swr1 swr1delta deletion ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 Knockout or depletion of H2A.Z in Sc 15 or mammalian cells 5 leads to increased rates of chromosome loss. This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph swr1 swr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph swr1 swr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0005433 deletion 972 h- swr1 swr1delta deletion ECO:0000049 PMID:30373637 4896 2020-02-06 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0003029 deletion 972 h- swr1 swr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004 low PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- swr1 swr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph swr1 swr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph swr1 swr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 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Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0006105 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000210 PMID:26443240 4896 2016-07-13 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000553 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:21869531 4896 2012-03-09 PomBase SPBC106.10 FYPO:0003194 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26443240 4896 2021-03-24 PomBase SPBC106.10 FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:12237855 4896 2014-02-20 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0005638 PMID:7828877 4896 2014-04-24 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8144551 4896 2013-10-23 PomBase SPBC106.10 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- pka1 pka1+ wild_type 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type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 1B, 2D, 5B, 6C, 7B, 7C) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 1B, 5B) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 1B, 5B) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 3, S1) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 3, S1) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure S1) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0004705 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:35320724 4896 2022-03-28 Consistent with the low levels of separase, we found that sister chromatid separation was delayed in cdc48- 353 mutant cells relative to the decline in CDK1 activity at mitotic exit (Figure 1C). PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002061 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0005410 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:35320724 4896 2022-03-28 (Figure 3a) However, the cellular degradation kinetics of securin-GFP were indistinguishable in cdc48+ and cdc48-353 mutant cells after normalizing for the reduced level (Figure 3A), suggesting that securin degradation was unaffected in the cdc48-353 mutant. PomBase SPAC1565.08 FYPO:0005410 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:35320724 4896 2022-03-28 (Figure 3a) Similar results were obtained for Cdc13-GFP (Figure S1). Hence securin and Cdc13 are still efficiently targeted for proteasomal degradation in the cdc48-353 mutant. PomBase SPAC1565.08 FYPO:0004395 G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure S6G) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S402A,S566A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A,S566A B2d7-S402A-S566A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S402A,S566A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A,S566A B2d7-S402A-S566A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPAC2F7.11 FYPO:0002135 T40A,T126A Not assayed or wild type 972 h- nrd1 nrd1-T40A,T126A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_enzyme(PomBase:SPAC2F7.11),assayed_substrate(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:19279143 4896 2019-11-20 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0003412 zas1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 zas1 zas1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0001407 R476K Not assayed or wild type 972 h- pyp1 pyp1-R476K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0001757 R476K Not assayed or wild type 972 h- pyp1 pyp1-R476K amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPCC188.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPCC188.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:26412298 4896 2016-01-04 PomBase SPCC188.08c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC188.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC188.08c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPCC188.08c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0001188 deletion 972 h- ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:26412298 4896 2016-01-04 PomBase SPCC188.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPCC188.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ubp5 ubp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC188.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.08c FYPO:0002104 deletion 972 h- ubp5 ubp5delta deletion ECO:0001232 PMID:26412298 4896 2016-01-04 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- isp5 isp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 isp5 isp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- isp5 isp5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:7954893 4896 2014-05-08 PomBase SPAC1039.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 isp5 isp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0005640 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 5B) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0003569 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figures 4D-E, S5B, S5D) sad1.2 cells exhibiting total centromere dissociation not only fail to insert but also appear to separate from the NE, dislodging into the cytoplasm PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001683 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 3D, E) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0006800 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 80 low PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 3DE) sad1.2 cells often show extra Mis6-GFP foci unassociated with the SPB, even at permissive temperature PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0006800 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 80 high PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 3D, E) At restrictive temperature, a population of sad1.2 cells emerges in which all three centromeres are clearly dissociated from the SPB PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002061 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 2c) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0004160 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 5C) spindle formation occurs normally at both MI and MII in sad1.2 meiosis PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0004093 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 5C) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0004367 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 3D, E) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0004367 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- Bqt1-GBP (ectopic) sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 6) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0005380 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 4B) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0003541 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC12D12.01) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 3A) Sad1.2-GFP remains stably associated with the SPB throughout interphase, in contrast to Sad1.1-GFP, which is destabilized at 36°C PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0003541 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figures 3B-C, S4A) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0003541 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figures 3B-C, S4A) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0003541 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure S4B) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0003541 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.05c) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure S4B) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002060 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 2c) PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002060 T3S,S52P Not assayed or wild type 972 h- Bqt1-GBP (ectopic) sad1 sad1.2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Fig. 6) PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000705 282-466 Not assayed or wild type 972 h- hob1 hob1-1-281 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.15c),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000703 282-466 Not assayed or wild type 972 h- hob1 hob1-1-281 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000703 282-466 Not assayed or wild type 972 h- hob1 hob1-1-281 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 hht1(1-40)-cnp1(21-120) Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-tailswap fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:25619765 4896 2015-12-30 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000450 hht1(1-40)-cnp1(21-120) Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-tailswap fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC800.13) PMID:25619765 4896 2015-12-30 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002574 hht1(1-40)-cnp1(21-120) Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-tailswap fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.03) PMID:25619765 4896 2016-01-05 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002574 hht1(1-40)-cnp1(21-120) Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-tailswap fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:25619765 4896 2016-01-05 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000091 hht1(1-40)-cnp1(21-120) Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-tailswap fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:25619765 4896 2016-01-05 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002060 hht1(1-40)-cnp1(21-120) Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-tailswap fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:25619765 4896 2015-12-30 PomBase SPRRNA.47 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPRRNA.47 SPRRNA.47delta deletion ECO:0005638 PMID:23874875 4896 2014-10-01 PomBase SPAC3A12.02 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ceo2 ceo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A12.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- ceo2 ceo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A12.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ceo2 ceo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.15 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srs1 srs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- srs1 srs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29A4.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srs1 srs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.15 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 srs1 srs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0002170 deletion 972 h- mzt1 mzt1delta deletion ECO:0001232 PMID:23885124 4896 2013-11-01 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0002170 deletion 972 h- mzt1 mzt1delta deletion ECO:0001232 low PMID:24006493 4896 2014-02-18 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0002462 deletion 972 h- mzt1 mzt1delta deletion ECO:0001232 PMID:23885124 4896 2013-11-01 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- mzt1 mzt1delta deletion ECO:0005638 PMID:23885124 4896 2013-11-01 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- mzt1 mzt1delta deletion ECO:0001232 PMID:24006493 4896 2014-02-18 PomBase SPCC1281.02c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf30 spf30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.02c FYPO:0002279 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf30 spf30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.02c FYPO:0002212 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf30 spf30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- spf30 spf30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1281.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf30 spf30delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.02c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC757.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC757.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC757.02c SPCC757.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 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h- h- prototroph atg3 atg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.06c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph atg3 atg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph atg3 atg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph atg3 atg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- atg3 atg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B9.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg3 atg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg3 atg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1321 FYPO:0001513 deletion 972 h- SPNCRNA.1321 SPNCRNA.1321delta deletion ECO:0001232 PMID:29735745 4896 2018-05-22 (Fig. 2B) PomBase SPNCRNA.1321 FYPO:0001357 deletion 972 h- SPNCRNA.1321 SPNCRNA.1321delta deletion ECO:0001232 PMID:29735745 4896 2018-05-22 (Fig. 2B) PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0003071 E560A Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-E560A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:22682245 4896 2014-02-12 PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0002263 E560A Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-E560A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22682245 4896 2014-02-12 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0000620 wild type Knockdown 972 h- ubc11 ubc11+ wild_type ECO:0001232 23 PMID:9154838 4896 2015-11-12 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003165 wild type Knockdown 972 h- ubc11 ubc11+ wild_type ECO:0001232 28 PMID:9154838 4896 2015-11-12 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0001327 wild type Knockdown 972 h- ubc11 ubc11+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9154838 4896 2015-11-12 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003875 wild type Knockdown 972 h- ubc11 ubc11+ wild_type ECO:0001232 6 PMID:9154838 4896 2015-11-12 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0004922 wild type Knockdown 972 h- ubc11 ubc11+ wild_type ECO:0001232 10 PMID:9154838 4896 2015-11-12 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0002303 wild type Knockdown 972 h- ubc11 ubc11+ wild_type ECO:0001232 low PMID:9154838 4896 2015-11-12 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0006502 F220G Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1-as1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCP1E11.04c) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Fig. 3B) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0002679 F220G Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1-as1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC4F6.06) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Fig. 2A) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0009061 F220G Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1-as1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000244 low assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36749320 4896 2023-03-14 (Figure 5A) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0003710 F220G Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1-as1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Fig. 2A) PomBase SPBC244.01c FYPO:0006825 unknown Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-K12 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:15132994 4896 2020-12-21 Fin1 binds Byr4. (A) Fin1 failed to associate withSPBs when the SIN was either inactive or hyperactive. Fin1 failed to bind to the SPB when byr4+ was deleted (Table 1). PomBase SPBC543.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC543.10 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC543.10 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 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prototroph get1 get1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- get1 get1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC543.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 get1 get1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 get1 get1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.09c FYPO:0000669 K81I,R82A,R102K Not assayed or wild type 972 h- krp1 krp1-K81I,R82A,R102K krp1-DR7 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000061 PMID:9418887 4896 2012-02-23 PomBase SPAC22E12.09c FYPO:0001668 K81I,R82A,R102K Not assayed or wild type 972 h- krp1 krp1-K81I,R82A,R102K krp1-DR7 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:9418887 4896 2012-02-23 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SPBC337.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rhn1 rhn1delta rtt103delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC337.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rhn1 rhn1delta rtt103delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rhn1 rhn1delta rtt103delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0001915 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:27630265 4896 2016-10-06 (Figure 1, S1) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0001586 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.10) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Supplemental Figure S10A) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002557 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.10) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Supplemental Figure S10A) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002772 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.10) PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Supplemental Figure S10A) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002061 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:27630265 4896 2016-10-06 (Figure 1) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0004609 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27630265 4896 2016-10-06 Supplemental Figure S12 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002060 A74V Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-ki8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:27630265 4896 2016-10-24 (Figure 1) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0001407 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:25806539 4896 2016-07-03 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0005654 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0000291 PMID:25806539 4896 2016-09-04 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000826 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000409 high assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 5) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0002042 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:24897379 4896 2016-08-24 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0007933 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000409 PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 4) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 fra2 fra2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0002015 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 low PMID:25806539 4896 2016-07-03 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0002015 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 PMID:24897379 4896 2016-08-24 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph fra2 fra2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- fra2 fra2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fra2 fra2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fra2 fra2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0008168 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC409.03) PMID:17304215 4896 2022-01-12 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0008153 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC409.03) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 5) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0003352 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000059 PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000470 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000470 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000059 high PMID:22042869 4896 2024-07-11 (Fig. 2B) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000470 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000059 high PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 1A) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001821 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000059 PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi2 swi2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0002360 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000049 PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. S1) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000049 PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. S1) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi2 swi2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0008070 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000226 PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. S1) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0005865 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0000226 PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. S1) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0004083 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC409.03) PMID:17304215 4896 2022-01-12 (Figure 1B) The absence of Swi2 or Sfr1 did not affect the cellular expression level of the Swi5-EGFP protein . PomBase SPAC1142.03c FYPO:0003530 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph swi2 swi2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- swi2 swi2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi2 swi2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swi2 swi2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1556.07 FYPO:0002280 deletion 972 h- pmm1 pmm1delta deletion ECO:0005638 PMID:11839792 4896 2023-12-11 These data confirm that pmm1 is an essential gene. Microscopic examination of the tetrad dissection plates revealed that, of 54 pmm1 null spores examined, 98% germinated. Of these, 52% formed single, rounded cells and 47% arrested as single, septated cells. PomBase SPAC1556.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- pmm1 pmm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1556.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmm1 pmm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1556.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- pmm1 pmm1delta deletion ECO:0005638 PMID:11839792 4896 2023-12-11 These data confirm that pmm1 is an essential gene PomBase SPAC1556.07 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmm1 pmm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000082 2188 Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-459 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40027523 4896 2025-04-06 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000133 2188 Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-459 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:40027523 4896 2025-04-06 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000650 2188 Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-459 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40027523 4896 2025-04-06 PomBase SPACUNK12.02c FYPO:0001118 T192D Overexpression 972 h- cmk1 cmk1-T192D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10617667 4896 2014-09-24 PomBase SPACUNK12.02c FYPO:0001407 T192D Overexpression 972 h- cmk1 cmk1-T192D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10617667 4896 2014-09-24 PomBase SPACUNK12.02c FYPO:0000098 T192D Overexpression 972 h- cmk1 cmk1-T192D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000261 PMID:25081204 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000168 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0001232 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000912 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:28366744 4896 2017-04-24 (Figure 3A). PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 deletion 972 h- cdc25-22 mad3 mad3delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S3B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0008165 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000786 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0000049 0.1 PMID:15509783 4896 2019-05-11 Table2 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001571 deletion 972 h- cdc25-22 mad3 mad3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Fig. S3B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mad3 mad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mad3 mad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000703 deletion 972 h- cdc25-22 mad3 mad3delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S3B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000069 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:11909965 4896 2019-05-11 (Fig. 2A) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000094 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure S3) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 medium PMID:26258632 4896 2016-01-19 (Fig. 1a) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001491 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000285 >95 PMID:11909965 4896 2019-05-11 (Fig. 2B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad3 mad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- mad3 mad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:11909965 4896 2019-05-11 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad3 mad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPACUNK12.02c FYPO:0000705 A321* Not assayed or wild type 972 h- cmk1 cmk1-delta320 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC3A12.14),assayed_using(PomBase:SPACUNK12.02c) PMID:10617667 4896 2014-09-24 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22G7.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22G7.03 SPAC22G7.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000280 S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 6J) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000468 G219A,R220A,P221A,G242A,R243A,P244A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-AT12-AA amino_acid_mutation ECO:0000231 high PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 5B and 5C) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0005018 G219A,R220A,P221A,G242A,R243A,P244A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-AT12-AA amino_acid_mutation ECO:0001807 high assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c),assayed_region(SO:0001789) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 3C) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0003573 G219A,R220A,P221A,G242A,R243A,P244A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-AT12-AA amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 6A) PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 R212RGVPLR Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J22 amino_acid_insertion ECO:0000049 high assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 R212RGVPLR Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J22 amino_acid_insertion ECO:0000049 high assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 R212RGVPLR Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J22 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000962 S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Overexpression 972 h- atf1 atf1-6D Atf1.6D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002033 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-R9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c) PMID:10921878 4896 2014-12-01 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph erm2 erm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0000668 deletion 972 h- erm2 erm2delta deletion ECO:0000337 PMID:16491466 4896 2016-02-15 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0000636 deletion 972 h- erm2 erm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:16491466 4896 2016-02-15 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 erm2 erm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- erm2 erm2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph erm2 erm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph erm2 erm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.12c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph erm2 erm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.12c 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SPCC622.18 FYPO:0004325 deletion 972 h- rpl6 rpl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC622.18 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph rpl6 rpl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.18 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rpl6 rpl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.18 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl6 rpl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.18 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl6 rpl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.18 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl6 rpl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl6 rpl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC622.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl6 rpl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC622.18 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl6 rpl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.03c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP msf1 msf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC750.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC750.03c SPAC750.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC750.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC750.03c SPAC750.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC750.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC750.03c SPAC750.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.15 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gem8 gem8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.15 FYPO:0002059 deletion 972 h- gem8 gem8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33754639 4896 2021-03-24 PomBase SPBC16H5.15 FYPO:0002411 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gem8 gem8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- gem8 gem8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16H5.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gem8 gem8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0002800 74-351 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1(1-73) pxd1-1-73 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPCC1322.02) PMID:32692737 4896 2020-08-19 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000703 74-351 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1(1-73) pxd1-1-73 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPCC1322.02) PMID:32692737 4896 2020-08-19 PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0006825 R31A Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:38865179 4896 2024-07-09 we did not detect Csc1-R31A-GFP on SPBs at any point in the cell cycle (Figure 1C). PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0006825 R31A Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC27B12.04c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 We also did not detect Csc2-GFP, Csc3-GFP or Csc4-GFP at SPBs in csc1-R31A cells although these proteins were detected at SPBs in wild-type cells (Figure S1B). PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0006825 R31A Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1773.01) PMID:38865179 4896 2024-07-09 We also did not detect Csc2-GFP, Csc3-GFP or Csc4-GFP at SPBs in csc1-R31A cells although these proteins were detected at SPBs in wild-type cells (Figure S1B). PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0006825 R31A Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC2C4.10c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 We also did not detect Csc2-GFP, Csc3-GFP or Csc4-GFP at SPBs in csc1-R31A cells although these proteins were detected at SPBs in wild-type cells (Figure S1B). PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0001875 R31A Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:38865179 4896 2024-07-09 we found that Cdc7 and Sid1 localized symmetrically to both SPBs during anaphase in contrast to its asymmetrical distribution to a single SPB in wild-type anaphase cells (Figure 2, A and B). PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0001875 R31A Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-R31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 we found that Cdc7 and Sid1 localized symmetrically to both SPBs during anaphase in contrast to its asymmetrical distribution to a single SPB in wild-type anaphase cells (Figure 2, A and B). PomBase SPAC664.02c FYPO:0000082 S60A,S62A,S75A,S87A Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:39387272 4896 2024-12-12 (Fig. 5E) PomBase SPAC664.02c FYPO:0004287 S60A,S62A,S75A,S87A Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8-4A amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5H) PomBase SPAC664.02c FYPO:0001355 S60A,S62A,S75A,S87A Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5E) PomBase SPAC664.02c FYPO:0004709 S60A,S62A,S75A,S87A Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 11 PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5G) PomBase SPAC664.02c FYPO:0000088 S60A,S62A,S75A,S87A Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5D) PomBase SPBC337.08c FYPO:0000584 74-382 Not assayed or wild type 972 h- ubi4 ubi4-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10623474 4896 2014-09-24 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000848 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000444 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000082 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12185500 4896 2012-11-15 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000082 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003352 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000229 high PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4D) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000470 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000227 low PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4B) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000470 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000229 complete PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4B) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001645 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC1347.10) PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 6) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001982 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000614 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000614 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000839 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000839 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001387 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003353 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000227 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4D) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001357 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6C) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001357 D232G,V265I Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-M36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6C) PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0003484 K434M Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-K434M amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-27 PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0000705 K434M Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-K434M amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PR:000027566),assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-25 PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0002825 K434M Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-K434M amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-27 PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0003129 K434M Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-K434M amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-25 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000082 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000082 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000082 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000082 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000674 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000674 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000964 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000964 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000964 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000964 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000964 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000964 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-04-06 Supplemental Figure S5B PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 17 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 12 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 13 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 spc7-GFP Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 14 PMID:34849791 4896 2022-04-06 (Figure 4) PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001407 R636K Overexpression 972 h- pyp2 pyp2-R636K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001492 R636K Overexpression 972 h- pyp2 pyp2-R636K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPBC2F12.10 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl35 mrpl35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- mrpl35 mrpl35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2F12.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl35 mrpl35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.10 FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl35 mrpl35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0006799 1-26,50-643 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-27-49 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29180432 4896 2019-01-02 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000669 C239S Not assayed or wild type 972 h- ubp15 ubp15(C239S) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC713.02c),assayed_substrate(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2017-12-30 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000777 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:1480481 4896 2012-11-21 PomBase SPCC338.17c FYPO:0004318 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000324 complete PMID:11460168 4896 2024-04-16 We found that a rad21-45 mutant was unable to arrest in the presence of Lat B. Fig. 2B and C PomBase SPCC338.17c FYPO:0001799 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:1480481 4896 2012-11-21 PomBase SPCC338.17c FYPO:0001407 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000708 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:7254221 4896 2015-12-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0001838 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:7706319 4896 2014-11-20 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000473 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:7254221 4896 2015-12-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0009019 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000324 high PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 2B) PomBase SPCC338.17c FYPO:0006660 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000324 high PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 2C) PomBase SPCC338.17c FYPO:0000969 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPCC338.17c FYPO:0004404 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0004410 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0004408 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0002687 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000102 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000267 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000267 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:11726502 4896 2016-04-15 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000267 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:1480481 4896 2012-11-21 PomBase SPCC338.17c FYPO:0004405 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000089 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:11726502 4896 2016-04-18 PomBase SPCC338.17c FYPO:0002345 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000268 I67T Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-45 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000703 P182A Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-P182A tea4-P170A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1105.05 FYPO:0007730 Inverted orientation Not assayed or wild type 972 h- exg1 exg1-WT-inverted fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_region(PomBase:SPBC1105.05),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 1) PomBase SPBC1105.05 FYPO:0007738 Inverted orientation Not assayed or wild type 972 h- exg1 exg1-WT-inverted fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 1) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000705 149-308 Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.07c),assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:11102508 4896 2016-04-20 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph tam11 tam11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.17 FYPO:0001492 deletion 972 h- tam11 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ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 3E, S9) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005780 264-299 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-deltaGLEBS partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 10 PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007399 264-299 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-deltaGLEBS partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 3E) PomBase SPAC31A2.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr atp25 atp25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC31A2.06 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph atp25 atp25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.06 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph atp25 atp25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.06 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deletion 972 h- ilv3 ilv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G8.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ilv3 ilv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ilv3 ilv3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000705 1-1632 Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3(1633-2386) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.05),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000082 E33V,E69V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E34 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001491 E33V,E69V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E34 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-03 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0006330 K36A,K38A,K43A Overexpression 972 h- scs22 scs22-3KA amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:39110593 4896 2024-11-08 Notably, mutations of three previously reported conserved lysine residues (K36/38/43A,20,21 hereafter referred to as 3KA) in the VAP consensus sequence (VCS) within the MSP domain of either Scs2 or Scs22 abolished their ER-PM tethering capacity (asterisked by large PM regions devoid of the cER in Figure 1C) PomBase SPCC550.13 FYPO:0001430 disruption Null 972 h- dfp1 dfp1delta::ura4+ him1delta::ura4+ disruption ECO:0005580 PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000062 disruption Null 972 h- dfp1 dfp1delta::ura4+ him1delta::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPCC550.13 FYPO:0003165 disruption Null 972 h- dfp1 dfp1delta::ura4+ him1delta::ura4+ disruption ECO:0001232 low PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000839 disruption Null 972 h- dfp1 dfp1delta::ura4+ him1delta::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPCC550.13 FYPO:0002061 disruption Null 972 h- dfp1 dfp1delta::ura4+ him1delta::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPAC10F6.17c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP ptc5 ptc5+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0002061 C2A Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-C2A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000962 C477S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C477S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-13 (Fig. 4B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0005947 C477S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C477S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-13 (Fig. 4B) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006626 wild type Ectopic 972 h- its3 its3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:39540318 4896 2025-02-05 (Fig. S6A) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0007526 wild type Ectopic 972 h- its3 its3+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000207 high assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-05 (Fig. 5B) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006616 wild type Ectopic 972 h- its3 its3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000137 variable severity PMID:39540318 4896 2025-02-05 (Fig. S7A) PomBase SPAPB17E12.11 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost3 ost3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB17E12.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost3 ost3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB17E12.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- ost3 ost3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB17E12.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ost3 ost3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pof2 pof2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- pof2 pof2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof2 pof2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof2 pof2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001929 93-114 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000963 93-114 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 93-114 Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mug106 mug106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26F1.05 FYPO:0009085 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PomBase SPAC6G9.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ebp1 ebp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ebp1 ebp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0005696 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000285 PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 4D) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000705 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC902.06),assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 4a) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000705 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.04),assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 4c) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005699 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000285 PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 4D) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000644 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 supplementary material Fig. S1) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000644 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 4F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0002112 523-537 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-334 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 4c) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000703 A161C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A161C srp7-C-161 nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A161C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A161C srp7-C-161 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A161C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A161C srp7-C-161 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A161C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A161C srp7-C-161 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000705 1261-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-4 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S4C) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002133 1261-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-4 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000941 551-783 Overexpression 972 h- ppc89 ppc89-1-550 ppc89-N+M(1-550) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:38985524 4896 2024-07-30 When untagged Ppc89 N+M was overproduced, Sid4 was lost from the SPBs of cells that formed multiple Ppc89 foci (Figure 2). This result is consistent with the idea that N+M acts as a dominant negative, outcompeting endogenous Ppc89 at SPBs and diluting the Sid4-mCherry signal to such an extent that it can no longer be detected. PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0001475 551-783 Overexpression 972 h- ppc89 ppc89-1-550 ppc89-N+M(1-550) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 28 PMID:38985524 4896 2024-07-29 In contrast, Ppc89 N+M expressing cells displayed multiple foci of endogenous Ppc89-GFP (Figure 1D). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 551-783 Overexpression 972 h- ppc89 ppc89-1-550 ppc89-N+M(1-550) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38985524 4896 2024-07-29 (Figure 1B) PomBase SPBC23G7.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cms1 cms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.07c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cms1 cms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cms1 cms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.07c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph cms1 cms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.07c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cms1 cms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 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amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:31575705 4896 2020-02-20 normal replciation restart/ HR-mediated fork restart RTS1-RFB assay. urprisingly, the induction of downstream RS in fft3-K418R-myc strain was similar to the one observed in wild-type cells (Fig 4D, bottom panel). This finding indicates that the lack of the ATPase activity does not impact the efficiency of HR-mediated fork restart. PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0000089 K418R Not assayed or wild type 972 h- fft3 fft3-K418R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:31575705 4896 2020-02-20 The fft3-K418R-myc strain exhibited similar sensitivity to CPT and MMS than fft3Δ cells, indicating that the ATPase activity is required to promote cell resistance to replication stress. PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0002711 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0001232 30 PMID:15210864 4896 2015-10-21 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0003066 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0001232 20 PMID:15210864 4896 2015-10-21 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0003066 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mcp7 mcp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mcp7 mcp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0000185 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0000059 PMID:15210864 4896 2015-10-21 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0002485 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0000059 PMID:15210864 4896 2015-10-21 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0003179 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0000059 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deletion 972 h- h- prototroph mcp7 mcp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcp7 mcp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp7 mcp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13A11.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp7 mcp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000350 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8774852 4896 2019-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000350 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8774852 4896 2019-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001418 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8774852 4896 2019-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000135 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:18346214 4896 2015-10-15 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003890 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0004060 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21832151 4896 2012-09-13 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0004445 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC825.03c) PMID:21832151 4896 2015-02-19 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000015 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0007562 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:32313168 4896 2020-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003889 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000422 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16141239 4896 2018-01-22 (Fig. 5A,B) PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003208 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000584 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21832151 4896 2012-09-13 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003344 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8292390 4896 2015-03-12 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003344 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1524835 4896 2015-03-11 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000133 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003888 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003004 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32313168 4896 2020-11-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002061 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8292390 4896 2015-03-12 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002630 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001387 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000229 medium PMID:8292390 4896 2015-03-12 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001387 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000229 medium PMID:8292390 4896 2015-03-12 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001387 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229,FYECO:0000230 high PMID:8292390 4896 2015-03-12 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000339 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0004294 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1524835 4896 2015-03-11 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000118 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0003702 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8774852 4896 2019-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0007561 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 low PMID:32313168 4896 2020-12-16 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0007561 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 high PMID:32313168 4896 2020-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001823 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:1524835 4896 2012-11-30 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000101 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:1524835 4896 2012-11-30 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000087 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 medium PMID:32313168 4896 2020-11-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000087 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32313168 4896 2020-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000087 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 medium PMID:32313168 4896 2020-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001824 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:1524835 4896 2012-11-30 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000130 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 25 PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 1E and F) PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0000646 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10547441 4896 2014-10-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0006167 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8774852 4896 2019-12-17 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002060 G273D Not assayed or wild type 972 h- act1 cps8-188 act1-G273D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000166 PMID:8292390 4896 2015-03-12 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 high PMID:39289458 4896 2024-09-28 The cell growth of the ∆shy1 mutant exhibited a notable decline when cultivated in glycerol medium in comparison to the wild-type (WT) strain (Fig. 5a). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shy1 shy1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003915 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the expression of Cob1, Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 were greatly reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5d). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003915 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the expression of Cob1, Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 were greatly reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5d). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003915 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.11) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the expression of Cob1, Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 were greatly reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5d). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003915 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.07) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the expression of Cob1, Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 were greatly reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5d). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003915 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.04) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the expression of Cob1, Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 were greatly reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5d). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0007624 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0001807 PMID:39289458 4896 2024-09-28 The levels of supercomplexes III2IV2 and III2IV were found to be lower in ∆shy1 cells compared to WT cells, while the abundance of COA complexes increased (Fig. 7a), indicating that the formation of supercomplexes involving complex IV is influenced by deletion of shy1. In contrast, the abundance of III2 and V complexes was largely unchanged in ∆shy1 cells (Fig. 7a). PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.11) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.07) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.09) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.10) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.01) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.02) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.04) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0003423 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.08) PMID:39289458 4896 2024-09-26 Our results showed that the levels of cob1, cox1, cox2, cox3, atp6, atp8 and atp9 RNAs were reduced in ∆shy1 cells (Fig. 5b). Furthermore, the abundance of mt-rRNAs (rns and rnl) was also reduced in shy1 deletion cells compared to WT cells, suggesting that deletion of shy1 affects the overall levels of the expression of the mtDNA-encoded genes. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0001940 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0005801 PMID:39289458 4896 2024-09-28 Our results revealed a slight decrease in complex III enzyme activity in ∆shy1 cells compared to WT cells (Supplementary Fig. S5 online), suggesting that shy1 affects complex III in ways other than its assembly. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0008128 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 shy1 shy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0008291 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0005801 low PMID:39289458 4896 2024-09-26 As shown in Fig. 5c, the mtDNA copy number is slightly increased in ∆shy1 cells compared to that of in WT strain, indicating the observed reduction in mitochondrial RNA is not attributed to a decrease in mtDNA levels. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 PMID:39289458 4896 2024-09-28 Conversely, the growth reduction was marginal when cultured in glucose medium, which supports fermentative growth and thus necessitates moderate respiratory activity43. PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph shy1 shy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph shy1 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PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0003627 L251W,Y417W,L419W Not assayed or wild type 972 h- tcb3 tcb3www amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000466 assayed_protein(PomBase:SPCC962.01) PMID:40629316 4896 2025-09-01 These mutations did not affect protein locali- zation but indeed led to compromised hypotonic PM expansion (Fig. 3F and Additional file 1: Fig. S3C). PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0003627 L251W,Y417W,L419W Not assayed or wild type 972 h- tcb3 tcb3www amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000466 assayed_protein(PomBase:SPAPYUK71.03c) PMID:40629316 4896 2025-09-01 These mutations did not affect protein locali- zation but indeed led to compromised hypotonic PM expansion (Fig. 3F and Additional file 1: Fig. S3C). PomBase SPBC649.04 FYPO:0003034 (-1223)-(-1183) Not assayed or wild type 972 h- uvi15 uvi15-proomoter-1183--1223 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:12074602 4896 2014-01-20 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-deltaSID unknown ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.12c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-deltaSID unknown ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.12c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-deltaSID unknown ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.17),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 6) PomBase SPCC736.12c FYPO:0000783 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-deltaSID unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.12c FYPO:0006862 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1-ts3 mmi1 mmi1-deltaSID unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 5) PomBase SPCC736.12c FYPO:0006862 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1-ts3 mmi1 mmi1-deltaSID unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 5) PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dad1 dad1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0001269 deletion 972 h- dad1 dad1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:16079914 4896 2015-01-22 PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0001269 deletion 972 h- dad1 dad1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.05c) PMID:16079914 4896 2015-01-22 PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0001269 deletion 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PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002061 364-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4deltaKSE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-19 The deletion mutants D340 to 383 and D364 to 383, but not D340 to 363, showed growth defect in the lem2-shut-off bqt4D strain (Fig. 1E) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 364-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4deltaKSE partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:38825008 4896 2025-04-19 All these fragments as well as wild-type Bqt4 (FL) were localized to the NE (Fig. 1C), suggesting that the lethality was not caused by the loss of NE localization. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000703 364-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4deltaKSE partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10),assayed_protein(PomBase:SPCC594.07c) PMID:38825008 4896 2025-04-19 and retained interaction with Bqt3 (Fig. S1B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004924 364-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4deltaKSE partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-19 and the telomere anchoring (Fig. S1C). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000772 364-383 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4deltaKSE partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-19 The DKSE mutant was expressed in lem2- shut-off bqt4D cells expressing GFP-GST-NLS, a nuclear protein marker, and nuclear protein leakage from the nucleus was assessed by calculating the fluorescence intensity ratio of the nucleus to the cytoplasm. Upon thiamine addition, GFP- GST-NLS severely leaked from the nucleus of DKSE mutant-expressing cells, but not from the nucleus of FL-expressing cells (Fig. 1, G and H), indicating NE rupture in the DKSE mutant-expressing cells. These results suggest that the KSE domain is vital for NE maintenance. 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PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000969 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000963 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005035 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:25639242 4896 2016-01-12 (Figure S2) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000776 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:1703321 4896 2016-10-04 (Figure 4D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001357 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001357 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002516 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 3C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000085 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:1703321 4896 2016-10-04 data not shown PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:3032459 4896 2015-09-10 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:672898 4896 2013-07-16 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000346 high PMID:872890 4896 2019-04-25 (Fig. 1) data not shown cdc2-1w is called wee 2-1 in this paper. Wee cells enter mitosis at a small cell size compared to wild type cells and thus daughter cells are born smaller than wild type cells. Wee cells have similar cell cycle timing (doubling time) to wild type cells PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 complete high PMID:7262540 4896 2016-10-10 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1756736 4896 2013-02-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:17952063 4896 2016-01-14 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:2674650 4896 2012-07-09 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002060 G146D Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-1w cdc2-2w|cdc2.1w|wee2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:2406029 4896 2014-09-19 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0001117 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-ts prp3ts unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:2798130 4896 2014-01-16 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-ts prp3ts unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:2798130 4896 2014-01-16 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0000785 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-ts prp3ts unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph aim22 aim22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- aim22 aim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aim22 aim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17A3.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aim22 aim22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003066 1-139 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA dma1-FHAm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 ~60 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001880 1-139 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA dma1-FHAm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 3E, 3F) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000941 1-139 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA dma1-FHAm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 3E, 3F) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000705 1-139 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA dma1-FHAm partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 4C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000583 1-139 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA dma1-FHAm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 ~20 PMID:20826461 4896 2019-11-19 (Fig. 2C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005781 1-139 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA dma1-FHAm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12479804 4896 2019-01-30 Table1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000230 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 80 PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 2A and C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000161 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 1A, B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001364 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 3A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003338 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001370 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 7) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002560 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000117 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 90 PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002561 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002561 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.10c) PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 7) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007177 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-14 (Fig. 6C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004735 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007115 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 5, I, J, and L) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007115 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 5, I, J, and L) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007115 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 5, I, J, and L) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002027 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:22918943 4896 2019-10-17 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002027 deletion 972 h- nda3-KM311 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 60 PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 5A, B and C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002027 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002027 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004594 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 7) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003203 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001407 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9852154 4896 2012-10-12 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001407 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9852154 4896 2012-10-12 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001407 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9852154 4896 2012-10-12 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002557 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006326 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000291 high assayed_protein(PomBase:SPAC926.03) PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 1A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006326 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000291 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 1A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006326 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000291 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 1A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006326 deletion 972 h- cdc25-22 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000291 high assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 1A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:22918943 4896 2019-10-17 (Figure 3A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001365 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:33496728 4896 2021-07-19 (Figure 1E,F) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003946 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figures 1,5) +5 min, a 15-min delay compared with wild-type cells PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003946 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003946 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007832 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004750 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004355 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006897 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 1E,F) The average constriction rate of Δmid1 contractile rings is 0.27 μm/min (Saha and Pollard, 2012a), but the distribution of constriction rates appears bimodal with fast and slow subpopulations. The type of strand that builds the contractile ring strongly correlates with its constriction rate, with contractile rings made from nascent strands constricting faster (0.32 μm/min) and contractile rings made from enduring strands constricting more slowly (0.20 μm/min; Fig. 1 E). PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004293 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 low PMID:32101481 4896 2020-05-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 95 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 3D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 83 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 high high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 98 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 99 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 high PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 ~90-95 PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Fig. 3) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 4G) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 64 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000061 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 7) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007831 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:33496728 4896 2021-07-19 (Fig. 4 C). Cdc12p distributed in a smaller zone in the R-nodes of Δmid1 cells...node dimensions in the R-nodes of constricting contractile rings..... PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007830 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 3) (Figure 4) (Figure S2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000674 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002141 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002442 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 unpublished observation PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0005212 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002558 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12654901 4896 2019-10-21 (Fig. 8) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, Supplementary Fig. 3a) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 100 assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 2) (Figure 3) (Figure 4) (Figure S2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001315 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid1 mid1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001357 deletion 972 h- mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000087 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph mid1 mid1delta deletion ECO:0005638 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fcp1 fcp1-I513E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004068 I513E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-I513E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPBC106.01 FYPO:0000141 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 high PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPBC106.01 FYPO:0008164 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:11909965 4896 2019-05-11 PomBase SPBC106.01 FYPO:0008166 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 1C) PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. S5) PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. S6) Indeed, Ark1 and Mph1 are fully or partially required for the kinetochore enrichment of all other SAC proteins (Fig. 4A; supplementary material Figs S5-S10). PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. S7) PomBase SPBC106.01 FYPO:0007383 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. S8) PomBase SPBC106.01 FYPO:0001269 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22521786 4896 2013-11-25 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001270 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 76 PMID:27697865 4896 2018-04-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000229 deletion 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 ~14 PMID:9601094 4896 2019-10-30 (Fig. 4B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0006978 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPBC106.01 FYPO:0003606 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 2B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0005781 deletion 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0005780 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 90 PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5A) PomBase SPBC106.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 low PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 5E) PomBase SPBC106.01 FYPO:0008202 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 ~10 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1a) PomBase SPBC106.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001840 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0000059 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001840 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0002303 deletion 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 ~14 PMID:9601094 4896 2019-10-30 (Fig. 4B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0002091 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 low PMID:23370392 4896 2013-05-15 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000228 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0003903 deletion 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:9601094 4896 2019-10-30 (Fig. 4B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mph1 mph1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC106.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mph1 mph1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004214 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 2B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0003576 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 3B) PomBase SPBC106.01 FYPO:0004082 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (see the Supplementary) Additional experiments indicated that neither mph1p nor fin1p regulate the phosphorylation of cdc11p PomBase SPBC106.01 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000094 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mph1 mph1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC106.01 FYPO:0003840 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000257 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000411 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.01 FYPO:0002167 deletion 972 h- mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000419 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mph1 mph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- gpt1 gpt1delta deletion ECO:0005638 PMID:22682253 4896 2012-08-24 PomBase SPBPJ4664.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gpt1 gpt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.06 FYPO:0006822 deletion 972 h- gpt1 gpt1delta deletion ECO:0005638 PMID:8631292 4896 2012-05-28 PomBase SPBPJ4664.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- gpt1 gpt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPJ4664.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpt1 gpt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPJ4664.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpt1 gpt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007050 280-522 Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-280-522 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000172 medium assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:24831008 4896 2020-02-08 RNA transcript expression is increased during the stress response to zinc ions, but the increase is less than the transcript levels seen with full de-repression PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 280-522 Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-280-522 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24831008 4896 2020-02-08 PomBase SPAC2E1P5.05 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp9 rrp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2E1P5.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- rrp9 rrp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2E1P5.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp9 rrp9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0001971 596-706 Not assayed or wild type 972 h- mid2delta mid2 mid2-1-595 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002555 596-706 Not assayed or wild type 972 h- mid2delta mid2 mid2-1-595 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPAC9.05 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0006920 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28586299 4896 2019-06-04 (Figure 4C) decreased frequency of gene conversions at direct repeat recombination reporter PomBase SPAC9.05 FYPO:0000581 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Table S2) PomBase SPAC9.05 FYPO:0000584 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPAC9.05 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000167 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28586299 4896 2019-06-04 (Figure 4C) increased frequency of deletions at direct repeat recombination reporter PomBase SPAC9.05 FYPO:0005659 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 1, Table S2) PomBase SPAC9.05 FYPO:0001740 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 PMID:28977643 4896 2017-11-09 PomBase SPAC9.05 FYPO:0002484 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000059 PMID:22723423 4896 2013-08-12 PomBase SPAC9.05 FYPO:0006280 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 PMID:28977643 4896 2017-11-09 PomBase SPAC9.05 FYPO:0005777 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-10 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000972 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-10 PomBase SPAC9.05 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0007007 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30667359 4896 2019-07-11 (Figure 6C) PomBase SPAC9.05 FYPO:0007331 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32034465 4896 2020-04-20 PomBase SPAC9.05 FYPO:0005578 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Table S2) PomBase SPAC9.05 FYPO:0003891 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Table S2) PomBase SPAC9.05 FYPO:0004993 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 PMID:31712578 4896 2021-06-28 Table S3 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 fml1 fml1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000102 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-10-27 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000102 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPAC9.05 FYPO:0007330 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:32034465 4896 2020-03-31 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000925 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 high PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPAC9.05 FYPO:0003612 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0005638 PMID:31712578 4896 2019-12-02 Table S3; spore viability similar to wild type PomBase SPAC9.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC9.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fml1 fml1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.06c FYPO:0003412 ubp14::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ubp14 ubp14::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC644.06c FYPO:0006721 460-482 Overexpression 972 h- cdr1 cdr1delta460-482 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-11-02 PomBase SPAC644.06c FYPO:0002290 460-482 Overexpression 972 h- cdr1 cdr1delta460-482 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-10-31 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 460-482 Overexpression 972 h- cdr1 cdr1delta460-482 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:28924043 4896 2018-10-31 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005780 cnp3C fusion Overexpression 972 h- bub1 cnp3C-bub1 fusion_or_chimera ECO:0001232 40 PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5A) PomBase SPBC3E7.08c FYPO:0002019 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad13 rad13-NRC3241 unknown ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPBC1709.15c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ cft2 cft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC1709.15c FYPO:0001991 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft2 cft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.15c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft2 cft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- cft2 cft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1709.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft2 cft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.15c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft2 cft2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0000705 1-353,466-533 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-465 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 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4896 2019-10-18 (Fig. 2) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0006015 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0000118 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 25 low PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3B, 3C) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0004097 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 PMID:12654901 4896 2019-10-18 (Fig. 3) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0004652 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 PMID:12654901 4896 2019-10-21 exhibited well-defined, normal actin rings PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0000674 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 PMID:12654901 4896 2019-10-21 DNS PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002141 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 PMID:12654901 4896 2019-10-21 DNS PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0001022 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:12654901 4896 2019-10-21 DNS PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0001037 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002459 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- mid2 mid2delta deletion ECO:0005638 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 1) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mid2 mid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC212.01c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC212.01c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.01c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC212.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC212.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC212.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC212.01c SPAC212.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001028 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 80 PMID:10545452 4896 2022-11-09 Microtubule staining confirmed that the drc1-191 cells were arrested in interphase since cells blocked predominantly either with interphase arrays of microtubules or with a postanaphase array of microtubules (Figure 3A, 4 hr). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003931 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10545452 4896 2022-11-09 (Figure 1, 4) hr PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002066 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 80 PMID:10545452 4896 2022-11-09 Upon prolonged incubation at the restrictive temperature (Figure 2, 8 hr), cells assumed a variety of shapes and 􏰍20% of cells were found to contain four nuclei with actomyosin rings, whereas the rest of the cells (80%) still contained only two interphase nuclei and detectable PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0004684 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 80 PMID:10545452 4896 2022-11-09 Upon prolonged incubation at the restrictive temperature (Figure 2, 8 hr), cells assumed a variety of shapes and 􏰍20% of cells were found to contain four nuclei with actomyosin rings, whereas the rest of the cells (80%) still contained only two interphase nuclei and detectable PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002024 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 80 PMID:10545452 4896 2022-11-09 Upon prolonged incubation at the restrictive temperature (Figure 2, 8 hr), cells assumed a variety of shapes and 􏰍20% of cells were found to contain four nuclei with actomyosin rings, whereas the rest of the cells (80%) still contained only two interphase nuclei and detectable PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001006 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10545452 4896 2022-11-09 (Figure 1, 8) hr PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006630 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 20 PMID:10545452 4896 2022-11-09 Upon prolonged incubation at the restrictive temperature (Figure 2, 8 hr), cells assumed a variety of shapes and 􏰍20% of cells were found to contain four nuclei with actomyosin rings, whereas the rest of the cells (80%) still contained only two interphase nuclei and detectable PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002061 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10545452 4896 2022-11-09 The drc1-191 mutation was found to be recessive, since cells of the genotype drc1Δ/drc1- 191 resembled wild-type cells and were capable of colony formation under conditions in which the drc1-191 mutant was unable to form colonies (data not shown). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001368 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10545452 4896 2022-11-09 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0004629 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10545452 4896 2022-11-09 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003308 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10545452 4896 2022-11-09 At the drc1-191 arrest point all binucleate cells were found to have Cdc7p staining localized at one SPB. Merged images of chromosomal staining with DAPI and Cdc7p staining with HA antibodies is shown in Figure 4. The drc1-191 mutant, therefore, arrests at a point in the cell cycle where the septum-promoting Cdc7p is located on one SPB. PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003710 D277N Not assayed or wild type 972 h- bgs1 bgs1-191 cps1|cps1-191|drc1-191 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:10545452 4896 2022-11-09 (Figure 1, 0) hr PomBase SPCC338.08 FYPO:0001690 T78A,T89A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T78A,T89A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000963 T78A,T89A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T78A,T89A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPAC14C4.06c FYPO:0002926 C184A Not assayed or wild type 972 h- nab2 nab2-C184A amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:24081329 4896 2013-12-02 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zas1 zas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001489 deletion 972 h- zas1 zas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 complete PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 2D) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- zas1 zas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zas1 zas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- zas1 zas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-22 (Fig. 2D) PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002060 1-1245 Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-C2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11416129 4896 2015-03-25 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000705 1-337 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3(338-643) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.12),assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000705 1-337 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3(338-643) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.03),assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPCC5E4.03c FYPO:0001491 242-271 Not assayed or wild type 972 h- taf5 taf5-delta242-271 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9224658 4896 2014-09-11 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0002169 249-408 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaKD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-17 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0001690 249-408 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaKD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0002168 249-408 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaKD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-17 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000962 249-408 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaKD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000957 249-408 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1deltaKD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0009035 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000830 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000830 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14F5.10c SPBC14F5.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tgp1 tgp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0000674 deletion 972 h- tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 9) PomBase SPBC1271.09 FYPO:0001357 deletion 972 h- tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 9) PomBase SPBC1271.09 FYPO:0001357 deletion 972 h- tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 9) PomBase SPBC1271.09 FYPO:0001357 deletion 972 h- tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 9) PomBase SPBC1271.09 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph tgp1 tgp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- 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ade6-M210 tgp1 tgp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G8.13c FYPO:0000703 1-399 Not assayed or wild type 972 h- prz1 prz1-400-681 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC4G8.13c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:22496451 4896 2013-11-18 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000172 1-262 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000705 1-262 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 1-262 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002003 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01),assayed_using(SO:0001843) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002003 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01),assayed_using(SO:0001843) PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002003 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:28652406 4896 2020-04-06 whether Atf1 binding to DNA is dependent on the presence of Pcr1; as shown in Fig. 4D, Atf1-GFP is not recruited to DNA in Δpcr1 cells, with the only exception of srx1 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000711 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005580 PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000711 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005580 high PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8552099 4896 2014-08-04 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002924 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000236 PMID:24224056 4896 2013-11-20 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002827 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000049 low low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 1) Similar to atf1 mutants, Δpcr1 showed reduced silencing, but the effect was weaker than that of Δatf1 or Δatf1Δpcr1 (Fig. 1B). PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:8552099 4896 2014-08-04 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001324 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002925 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000236 assayed_using(PomBase:SPBC14F5.08) PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0003573 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 2A) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0003573 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0004055 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9585506 4896 2014-11-21 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0004056 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:9585506 4896 2014-11-21 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000826 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000404 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:12050156 4896 2023-12-13 The abundance of zym1 transcripts was also reduced in cells lacking Pcr1, a bZIP transcription factor that in conjunction with Atf1 functions downstream of Sty1 (41, 42) (Fig. 3C). PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002287 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:15164362 4896 2019-10-29 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001116 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001116 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002304 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002304 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002304 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002304 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002304 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001152 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8552099 4896 2014-08-04 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001152 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC285.09c) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001152 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000781 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000236 assayed_using(PomBase:SPAPB24D3.10c) PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000781 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000236 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0007633 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0005063 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0004690 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0006752 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0008172 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0008173 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000780 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000230 low assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.02) PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2C) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001666 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000335 PMID:8552099 4896 2014-08-04 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000453 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 2A) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000268,FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 2B) PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0002336 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0001686 deletion 972 h- pcr1 pcr1delta deletion ECO:0005638 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2015-02-09 PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11685532 4896 2015-02-09 PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11685532 4896 2015-02-09 PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0002360 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:35970865 4896 2022-10-06 . These results demonstrate that kinetochore mutants with the intact inner kinetochore architecture retained the ability to silence transcription at the central core region. PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0003762 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11685532 4896 2015-02-09 PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0004396 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11685532 4896 2015-02-09 PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0004314 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0008025 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0001232 PMID:35970865 4896 2022-10-06 Mis15 localises to the inner regions of centromeres as does Mis6, while Mis12 and Nuf2 localise to the outer regions relative to Mis6, and Mis6 localised to centromeres in the mis12 and nuf2 mutants but not in the mis15 mutant (Supplementary Fig. 6) PomBase SPAC27F1.04c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuf2 nuf2-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.09 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC3E7.09 SPBC3E7.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0002485 65-129 Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-FHAD partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 low PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0003179 65-129 Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-FHAD partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 low PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0004628 65-129 Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-FHAD partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC14C4.03 FYPO:0004993 65-129 Not assayed or wild type 972 h- mek1 mek1-FHAD partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000171 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 low assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:31341193 4896 2019-08-01 PomBase SPCC794.11c FYPO:0007056 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 medium assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:31341193 4896 2019-08-01 (Fig. 3) Increased co-localization with Cfr1 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0001885 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 medium assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. 7F) PomBase SPCC794.11c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC794.11c FYPO:0003627 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPBC25H2.16c) PMID:31341193 4896 2019-08-02 PomBase SPCC794.11c FYPO:0003627 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPBC9B6.08) PMID:31341193 4896 2019-08-02 PomBase SPCC794.11c FYPO:0003627 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPBC31E1.04) PMID:31341193 4896 2019-08-02 PomBase SPCC794.11c FYPO:0003627 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPBP16F5.07) PMID:31341193 4896 2019-08-02 PomBase SPCC794.11c FYPO:0007058 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPAC16E8.07c) PMID:31341193 4896 2019-08-01 PomBase SPCC794.11c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000098 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 high PMID:34349749 4896 2024-12-15 ent3delta and apm3delta were slightly sensitive to high concentrations of KCl and KNO3 and were very sensitive to CaCl2. (Figure 8) PomBase SPCC794.11c FYPO:0003384 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000106 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) All mutants exhibited a degree of sensitivity to hygromycin B that was alleviated by KCl, an indication of membrane hyperpolarization. PomBase SPCC794.11c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.11c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0001214 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 low PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) We found that apm1delta, gga22delta, and gga21delta gga22delta (denoted by ggadeltadelta in the Figure 8) were sensitive to both high concentrations of K+ salts and sorbitol (Figure 8), which showed that they were defective in growth under osmotic stress. PomBase SPCC794.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.11c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2014-07-24 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC794.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent3 ent3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph meu31 meu31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- meu31 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amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:17875641 4896 2011-08-22 PomBase SPAP27G11.04c FYPO:0000104 S257N 972 h- tad3 tad3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17875641 4896 2011-08-05 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0002033 S321A Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-S321A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPNCRNA.6379 FYPO:0000441 deletion 972 h- SPNCRNA.6379 SPNCRNA.6379delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001424 801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006326 801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 8 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001368 801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 2H) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000838 801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002253 801-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPAC644.12 FYPO:0003029 wild type Knockdown 972 h- cdc5 cdc5+ wild_type ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:10409726 4896 2014-07-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0003041 wild type Knockdown 972 h- cdc5 cdc5+ wild_type ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:10409726 4896 2014-07-21 PomBase SPAPB17E12.08 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph eos1 eos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.08 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph eos1 eos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.08 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph eos1 eos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph eos1 eos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.08 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph eos1 eos1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB17E12.08 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph eos1 eos1delta deletion ECO:0005638 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S8). PomBase SPCC1494.05c FYPO:0001424 ubp12-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp12 ubp12-NES fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC1494.05c) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPCC1494.05c FYPO:0005674 ubp12-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp12 ubp12-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044777) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPCC1494.05c FYPO:0005674 ubp12-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp12 ubp12-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000049732) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPCC1494.05c FYPO:0000969 ubp12-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp12 ubp12-NES fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPCC1494.05c FYPO:0001689 ubp12-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp12 ubp12-NES fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase 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prototroph SPBC36.02c SPBC36.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC36.02c SPBC36.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC36.02c SPBC36.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC36.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC36.02c SPBC36.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC36.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC36.02c SPBC36.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC36.02c SPBC36.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0000245 E464K Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-E464K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0000741 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade3 min11-22 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000178,FYECO:0000192 is_bearer_of(PATO:0000323) PMID:499806 4896 2016-06-30 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 K83KGVPLK Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J8 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001571 K83KGVPLK Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J8 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 K83KGVPLK Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J8 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 D291A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-D291A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPNCRNA.784 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.784 SPNCRNA.784+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.784 FYPO:0000095 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.784 SPNCRNA.784+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001355 C226G,C229G Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-GxxG amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000085 C226G,C229G Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-GxxG amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000088 C226G,C229G Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-GxxG amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000267 C226G,C229G Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-GxxG amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPBC1778.08c FYPO:0000080 wild type Knockdown 972 h- arc3 arc3+ wild_type ECO:0005638 PMID:21449051 4896 2011-12-09 PomBase SPBC1778.08c FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- arc3 arc3+ wild_type ECO:0005638 PMID:21449051 4896 2011-12-09 PomBase SPBC1778.08c FYPO:0000021 wild type Knockdown 972 h- arc3 arc3+ wild_type ECO:0001232 PMID:21449051 4896 2011-12-08 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001430 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000260 PMID:10766248 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004359 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000170 high PMID:17531813 4896 2017-11-18 (Fig. 1C) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001508 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10747035 4896 2012-10-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002577 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Figure 2B) rad3 is not present in the chromatin fraction in the absence of cdc18 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002909 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10766248 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002909 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:10766248 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002909 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000260 high assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10766248 4896 2017-02-03 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002909 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000260 low assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:10766248 4896 2017-02-03 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002679 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Figure 2C) cds1 is no longer phosphorylated because rad3 is absent in absence of cdc18 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001838 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10766248 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001974 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000106 high PMID:17531813 4896 2017-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001974 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000170 high PMID:17531813 4896 2017-10-27 (Fig. 1C) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001490 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000170 high PMID:17531813 4896 2017-10-27 (Fig. 1C) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0003075 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Figure 2D) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004083 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Figure 2B) In the cytosol rad3 is present in absence of cdc18 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000838 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10747035 4896 2012-10-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0005107 wild type Knockdown 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000170 high PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Figure 3) Replication Structures Are Not Lost When Cdc18 Is Depleted) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-R1R2 unknown ECO:0000049 PMID:24013500 4896 2024-06-10 In contrast, a catalytically dead Dcr1 mutant (dcr1-R1R2) (Colmenares et al. 2007) displays a dramatic increase in dg and dh transcript levels (Fig. 2B). PomBase SPAC15A10.12c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tca17 tca17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15A10.12c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tca17 tca17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15A10.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- tca17 tca17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC15A10.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tca17 tca17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0003717 deletion 972 h- rga8 rga8delta deletion ECO:0001232 PMID:14506270 4896 2016-06-23 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 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prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rga8 rga8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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SPAC1705.02 FYPO:0003244 deletion 972 h- SPAC1705.02 SPAC1705.02delta deletion ECO:0000059 high PMID:38833506 4896 2024-12-30 the effect observed in the Δmpn1 strain was comparable to that observed in Δsaf5 cells. PomBase SPAC1705.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- SPAC1705.02 SPAC1705.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1705.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC1705.02 SPAC1705.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1705.02 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1705.02 SPAC1705.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC1705.02 FYPO:0009032 deletion 972 h- SPAC1705.02 SPAC1705.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1705.02 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1705.02 SPAC1705.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1705.02 FYPO:0001029 deletion 972 h- SPAC1705.02 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assayed_transcript(PomBase:SPATRNAMET.02) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPATRNATHR.03) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPATRNATHR.04) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPATRNATYR.01) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPATRNAVAL.01) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAASN.01) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAASN.02) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAASN.04) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAGLN.02) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAGLY.04) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAGLY.09) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAHIS.01) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAMET.05) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAMET.06) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAPRO.07) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNATHR.06) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNATRP.02) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBTRNATRP.03) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNAALA.12) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNAARG.10) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNAASN.05) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNAGLY.12) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNAHIS.03) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNAPHE.04) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCTRNATHR.10) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0001555 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPATRNAPRO.02) PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 6, 7, 9 and 10) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 maf1 maf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0006520 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000162 PMID:31833215 4896 2020-04-08 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0007329 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000226 PMID:31833215 4896 2020-03-31 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0002564 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000231 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0000972 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-08 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0008100 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.05) PMID:36794724 4896 2023-08-21 (Figure 6) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0008100 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.24) PMID:36794724 4896 2023-08-21 (Figure 6) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0008100 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.38) PMID:36794724 4896 2023-08-21 (Figure 6) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0008100 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.53) PMID:36794724 4896 2023-08-21 (Figure 6) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0006749 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000231 PMID:31833215 4896 2020-03-31 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0008102 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000337 PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 8) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0008123 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000005,FYECO:0000337 PMID:36794724 4896 2023-08-11 (Figure 5B) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-03-31 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- maf1 maf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000242 PMID:31833215 4896 2020-04-08 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 maf1 maf1delta deletion ECO:0001232 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000460 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 PMID:20929775 4896 2011-08-23 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0003002 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 4E) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0002825 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S6) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0006263 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(SO:0001997) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 5) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0005225 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(SO:0001997) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 5) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0005917 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0000291 PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 5A) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0004393 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 35 PMID:14972679 4896 2021-02-15 (Figures 1A and 2) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000228 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0000059 PMID:20929775 4896 2011-08-11 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000228 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0001164 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0005720 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000365 PMID:19680287 4896 2020-06-17 rarely showed a delay in bi-orienting chromosomes that had been pulled towards one SPB (Fig 3B,D; supplementary Fig S4F online). PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0006428 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000365 PMID:19680287 4896 2020-06-17 (Fig 3C), showed a similar fraction of mono-oriented chromosomes as wild-type cells PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0006645 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 4E) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0005968 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000091 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 4a) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0000091 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0003241 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000365 27 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S7) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0003241 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 1.1 PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 4c) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- sgo2 sgo2delta deletion ECO:0005638 PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 4a) PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo2 sgo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0000444 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 medium PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0004321 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0001270 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0003165 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0001382 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0000639 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0002061 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0001399 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0004396 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0000091 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37637271 4896 2023-08-30 (Figure 1H) PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0000091 G126D Not assayed or wild type 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9182666 4896 2015-05-06 PomBase SPBC21C3.04c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrx14 mrx14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrx14 mrx14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21C3.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrx14 mrx14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.04c FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrx14 mrx14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0004902 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0001232 PMID:25530312 4896 2015-09-30 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0001407 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:25530312 4896 2015-09-30 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0003125 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0000059 PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0004903 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0001232 PMID:25530312 4896 2015-09-30 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0001324 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.14c) PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0006944 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0000059 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-07 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-05 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0000650 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0001232 PMID:25530312 4896 2015-09-30 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0000104 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-05 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0000106 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPACUNK4.06c FYPO:0001234 wild type Knockdown 972 h- rpb7 rpb7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:25530312 4896 2015-09-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 T291A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T291A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 T291A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T291A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPCC16A11.13 FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 luc7 luc7delta deletion ECO:0001232 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Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC110.03 FYPO:0005906 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC110.03 FYPO:0004921 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1F5.09c) PMID:9660818 4896 2019-10-04 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002442 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002442 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044799) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC110.03 FYPO:0007239 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-12 PomBase SPAC110.03 FYPO:0007239 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044799) PMID:31719163 4896 2020-02-12 PomBase SPAC110.03 FYPO:0004103 G12V Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-G12V cdc42-V12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:11453249 4896 2025-10-23 Expression of the activated cdc42G12V allele in wild-type cells resulted in a growth defect (Fig. 2A) and a round cell morphology (Fig. 2B). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000093 unknown Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-A2 unknown ECO:0005638 PMID:19076239 4896 2012-07-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000096 unknown Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-A2 unknown ECO:0005638 PMID:19076239 4896 2012-07-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000087 unknown Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-A2 unknown ECO:0005638 PMID:19076239 4896 2012-07-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001214 unknown Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-A2 unknown ECO:0005638 PMID:19076239 4896 2012-07-13 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003096 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-375 unknown ECO:0000112 low PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-375 unknown ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPNCRNA.421 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.421 SPNCRNA.421delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC215.12 FYPO:0003412 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBC215.12 FYPO:0003096 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:18948543 4896 2024-01-30 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) revealed that splicing mutants cwf10-1 and prp10-1 (but not prp2-1) exhibited only a modest decrease in levels of H3K9me2 associated with both centromere repeats and cen1:ura4+ (Fig. 3A and fig. S3). PomBase SPBC215.12 FYPO:0003231 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:24210919 4896 2014-03-31 PomBase SPBC215.12 FYPO:0006599 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18948543 4896 2024-01-30 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) revealed that splicing mutants cwf10-1 and prp10-1 (but not prp2-1) exhibited only a modest decrease in levels of H3K9me2 associated with both centromere repeats and cen1:ura4+ (Fig. 3A and fig. S3). PomBase SPBC215.12 FYPO:0001645 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC725.08),assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Interestingly, this interaction was impaired in the cwf10- 1 mutant, indicating that splicing factors are required for association of Pir2 with Hrr1 (Fig. 4b) PomBase SPBC215.12 FYPO:0008424 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:39747188 4896 2025-06-23 A temperature-sensitive mutation in the conserved spliceosome component Cwf10EFTUD2 (cwf10-1)56 alone caused only a modest defect in the production of siRNAs that map to cenH (Sup- plementary Fig. 7c). PomBase SPBC215.12 FYPO:0004205 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:24210919 4896 2014-03-31 PomBase SPBC215.12 FYPO:0000220 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBC215.12 FYPO:0006548 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:32415063 4896 2024-01-22 A significant increase in the level of both pho1 and byr2 mRNAs in cwf10-1 as compared to WT confirmed that the splicing machinery indeed affects the expression of genes repressed by lncRNAs (Fig. 2c) PomBase SPBC215.12 FYPO:0006548 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 A significant increase in the level of both pho1 and byr2 mRNAs in cwf10-1 as compared to WT confirmed that the splicing machinery indeed affects the expression of genes repressed by lncRNAs (Fig. 2c) PomBase SPBC215.12 FYPO:0003619 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 However, at the permissive temperature of 25°C (at which centromeric silencing was alleviated), splicing efficiency was similar to that in wild-type cells (Fig. 2A). PomBase SPBC215.12 FYPO:0001408 C324Y Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:39747188 4896 2025-01-17 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0005883 deletion 972 h- h- 972 coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0003690 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000139 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0003323 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005801 PMID:8668131 4896 2014-05-02 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0003324 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000059 PMID:8668131 4896 2014-05-02 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001712 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000335 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001712 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000325 PMID:14695938 4896 2013-05-02 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001712 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000335 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0003238 deletion 972 h- h- 972 coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0003387 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000126 PMID:21818608 4896 2014-05-20 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0000249 deletion 972 h- h- 972 coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:27005325 4896 2016-12-29 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001407 deletion 972 h- h- 972 coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001407 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001407 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 PMID:8668131 4896 2014-04-24 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001570 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:21818608 4896 2014-05-20 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0000342 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:21818608 4896 2014-05-20 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001938 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005801 PMID:8668131 4896 2014-04-24 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0003321 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0005801 PMID:8668131 4896 2014-05-02 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0002009 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000059 PMID:8668131 4896 2014-04-24 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0000564 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000059 PMID:8668131 4896 2014-04-24 PomBase SPBC2D10.18 FYPO:0001116 deletion 972 h- coq8 coq8delta abc1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) 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C(-243)G,A(-242)G,T(-240)C,C(-239)A,A(-238)C,T(-237)C Not assayed or wild type 972 h- mae2 mae2-URS1 nucleotide_mutation ECO:0000291 PMID:10187772 4896 2014-06-06 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0000980 646-764 Overexpression 972 h- ltc1 ltc1-TMdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:32320462 4896 2020-08-03 PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0003412 5-49 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaPHD partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 medium PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 2) PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0007505 5-49 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaPHD partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.11c),assayed_region(PomBase:SPCC1393.10) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 4D) PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0007505 5-49 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaPHD partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.11c),assayed_region(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 4D) PomBase SPAC22E12.11c FYPO:0007505 5-49 Not assayed or wild type 972 h- set3 set3-deltaPHD partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.11c),assayed_region(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 4D) PomBase SPAC227.02c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp15 rrp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.02c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp15 rrp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- rrp15 rrp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC227.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp15 rrp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.09c FYPO:0000117 wild 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FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-PD11 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0002276 V148R Not assayed or wild type 972 h- tbf1 tbf1-V148R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.13) PMID:38677290 4896 2024-12-13 Surprisingly, arginine substitutions of the hydrophobic residues (L101R, L108R, V141R, and V148R) led to degradation and insolubility of mutant proteins of spTbf1TRFH (Figures S3) | Consistently, all L101R, L108R, V141R, and V148R mutations resulted in great degradation of spTbf1 in cells (Figure 2E). PomBase SPBC36.09 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sap61 sap61delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.09 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sap61 sap61delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- sap61 sap61delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC36.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sap61 sap61delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23G3.01 FYPO:0002061 H386L Not assayed or wild type 972 h- rpb2 rpb2-H386A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8569679 4896 2021-01-24 (Fig. 2) PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001645 EDE327AAA Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P7 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPCC830.03 FYPO:0002834 K344A Overexpression 972 h- grc3 grc3-K344A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21385875 4896 2012-06-08 PomBase SPCC830.03 FYPO:0002827 K344A Overexpression 972 h- grc3 grc3-K344A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21385875 4896 2012-06-08 PomBase SPCC622.04 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPCC622.04 SPCC622.04delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC622.04 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPCC622.04 SPCC622.04delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000962 C394S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C394S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-13 (Fig. 4B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0005947 C394S Not 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FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crt10 crt10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.07 FYPO:0002287 (-1091)-(-486) Not assayed or wild type 972 h- ntp1 ntp1-MVP5 fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:15164362 4896 2019-10-29 PomBase SPAC821.12 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- orb6 orb6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- orb6 orb6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:9636183 4896 2016-03-09 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0001327 K33R,N165A (but fin1 is not N at 165) Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-KD fin1.KD other ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 1b) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002678 L310H Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L310H amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000703 L310H Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L310H amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000081 L310H Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L310H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000081 L310H Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L310H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001972 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000113,FYECO:0000207 high PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000135 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 In summary, in the absence of exomer and in the presence of KCl, the distribution of sterols and PI(4,5)P2 was different from that of the WT, which might contribute to altered membrane polarization and ion homeostasis in the mutant. PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000443 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPBC31F10.16) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0008376 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 60 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S2B) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000082 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102 low PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001082 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000059 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0006625 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:39540318 4896 2025-02-05 (Fig. S6A) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004468 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S2C) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002376 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000025 high assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-01-28 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002376 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000459 medium assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-13 (Fig. 1C) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001885 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 medium assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-13 (Fig. 1A and Fig. 4A) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0003279 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004203 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 PMID:34349749 4896 2024-12-14 A close observation of the results indicated that under basal conditions (0′), the WT amount of GFP was significantly greater in cfr11 than in the WT, which suggested increased intracellular Ca2 + . | However, in cfr11 cells the amount of Ca2+ continued increasing for another 15 min, and reached a peak that was more than three-fold the value of the baseline (Figure 5B). The maximum Ca2+ level in cfr11 was 67% higher than in the WT | To understand whether the cytoplasmic calcium increase was produced by influx from the exterior or by movements from internal reservoirs, we analyzed the Ca2+ level in the presence of EGTA. We found that the presence of the chelator in the medium completely blocked the increase in Ca2+ levels in both the WT and the mutant cells (Figure 5B). In summary, we concluded that Cfr1 modulated the cellular Ca2+ response to KCl stress by regulating some aspect of Ca2 + influx. PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001084 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000059 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001505 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 variable severity PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. S9C) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001505 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 variable severity PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S9C) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0008346 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 PMID:34349749 4896 2024-12-14 The results showed that this content was significantly higher in the exomer mutant than in the WT (Figure 1D), data that confirmed that exomer plays a role in the regulation of K+ homeostasis. PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0008375 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 medium PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 6B and Fig. 7G) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0008348 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.03) PMID:34349749 4896 2024-12-15 Exposure to KCl resulted in a small but significant change in Pkd2 distribution, with a reduction in the number of dots that corresponded to the TGN and an increase in the number of dots that corresponded to the PVE. Pkd2 accumulation in the PVE in the presence of KCl was stronger in cfr11 than in the WT. Thus, the effect of potassium in Pkd2 intracellular distribution was enhanced by exomer deletion. PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0008347 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.03) PMID:34349749 4896 2024-12-15 In addition, there was intracellular Pkd2-GFP fluorescence. All cells exhibited a faint signal that corresponded to the vacuoles, which in S. pombe are small and numerous, and some cells exhibited at least one bright intracellular dot (denoted by an arrow in Figure 5D). In the WT, less than 20% of the cells exhibited bright intracellular dots, while this number was over 40% in cfr11 (Figure 5F). This difference was evident in the absence of KCl, showing that it was produced by a lack of exomer. Moreover, the dots were brighter in the mutant than in the control (Figure 5G). Western blotting showed that stronger fluorescence was not due to higher levels of the protein (Figure 5H). Quantitative colocalization analyses showed that most of these dots corresponded to the TGN and that fewer dots corresponded to the PVE (Figure 5I and Supplementary Figure 3). PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000539 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002141 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000426 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000961 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 PMID:34349749 4896 2024-12-14 In contrast, the mutant grew well in the presence of 1.2 M sorbitol, a medium with similar osmolarity to 0.6 M KCl. PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0008374 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. 7G) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0005168 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC1685.01) PMID:39540318 4896 2025-02-06 (Fig. S1C) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0005168 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.16c) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 6D) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC22E12.16c) PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. 6C and D) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0003627 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S2A) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0003627 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC11G7.01) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S2B) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0003627 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S2A) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0003627 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC11G7.01) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S2B) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC19B12.03) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC1289.01c) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC19B12.02c) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.08) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.08) PMID:27974503 4896 2017-01-03 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:27974503 4896 2017-01-03 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000644 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 assayed_using(PomBase:SPBP16F5.07) PMID:27974503 4896 2017-01-03 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0006385 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:19627505 4896 2018-02-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004181 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.12) PMID:24514900 4896 2014-12-10 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002674 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3F10.02c) PMID:34349749 4896 2024-12-14 GFP-Trk1 localized at the cell surface of the cell growing sites (cell poles and equator) in both, WT and cfr11 cells (Figure 2B), confirming proper Trk1 sorting in the absence of exomer. PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004422 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000392 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-13 (Fig. 1H) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004450 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000261 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-13 (Fig. 1G) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004154 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-01-28 (Fig. 1I) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002290 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000460 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-13 (Fig. 1E) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001266 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:39540318 4896 2025-02-07 (Fig. S1B) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0004247 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-04 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000098 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 Interestingly, deleting cch1+ suppressed cfr1delta sensitivity to CaCl2 (Supplementary Figure 4). PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000079 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000843 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000106 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 low PMID:34349749 4896 2024-12-14 cfr1delta was partially sensitive to hygromycin B and deleting cfr1+ enhanced the sensitivity of trk1delta, trk2delta, and trk1delta trk2delta strains (Figure 3C). PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 medium PMID:34349749 4896 2024-12-14 First, we determined whether cfr1delta sensitivity to high KCl concentrations was due to an inability to grow under ionic or osmotic stress. To do so, we analyzed cfr11 sensitivity to several potassium salts at different concentrations, which depended on the concentration that inhibited the growth of the WT, and to sorbitol (Figure 1A). cfr11 exhibited growth defects in the presence of 0.6 M potassium chloride (KCl), 0.6 M potassium nitrate (KNO3), and 0.02 M potassium acetate (CH3 CO2 K). cfr11 exhibited growth defects in the presence of 0.6 M potassium chloride (KCl), 0.6 M potassium nitrate (KNO3), and 0.02 M potassium acetate (CH3 CO2 K). |Interestingly, deleting cch1+ suppressed cfr1delta sensitivity to CaCl2 (Supplementary Figure 4). PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0007717 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 high PMID:34349749 4896 2024-12-14 The result was that overexpression of the extrusion pump alleviated the growth of cfr11 in the presence of high K+ concentrations (Figure 4C). PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000271 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 low PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000271 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000214 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0001457 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cfr1 cfr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cfr1 cfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0001371 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-01 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002555 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002026 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 low 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FYPO:0002869 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.04) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0001645 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10),assayed_using(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:23349808 4896 2013-08-15 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0004653 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 low PMID:31041892 4896 2019-11-12 (Figure 4) PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002562 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002562 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002562 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:31041892 4896 2019-11-14 (Figure 2) PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002562 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC428.13c) PMID:31041892 4896 2019-11-14 (Figure 3) PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0003946 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002558 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0000784 deletion 972 h- gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-01 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph gef2 gef2delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gef2 gef2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004478 mitochondrial ectopic Not assayed or wild type 972 h- rga7 Rga7-mEGFP fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 The ectopically targeted Rga7 and Rng10 were both able to recruit Ync13-tdTomato to the mitochondria (Fig 1B and Table 1). PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004478 mitochondrial ectopic Not assayed or wild type 972 h- rga7 Rga7-mEGFP fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Rga7-mEGFP and Rng10-mEGFP recruited tdTomato-tagged Trs120, which is a TRAPP-II-specific subunit [94,95], but not the exocyst subunit Sec3 [6,42,96], to mitochondria (Figs 1C and S3A). These data suggest that Rga7 and Rng10 selectively interact with the TRAPP-II complex to promote vesicle tethering during exocytosis along the cleavage furrow, rather than the exocyst complex, which is more concentrated at the rim of the division plane [6,42,96]. PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0004478 mitochondrial ectopic Not assayed or wild type 972 h- rga7 Rga7-mEGFP fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.17c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Consistently, Rga7 mistargeted tdTomato-tagged Smi1, which is an adaptor for Bgs4 [13], to mitochondria in cells expressing Tom20-GBP Rga7-mEGFP (Fig 1F). PomBase SPAC1687.22c FYPO:0006809 1-124 Not assayed or wild type 972 h- puf3 puf3-delta125 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 low PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001357 aa98-261 replaced by linker sequence in short cDNA allele Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-cLinker other ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 7B) PomBase SPCC1739.15 FYPO:0001489 Wtf21 tethered to a deubiquitinase using the GFP–GBP interaction Ectopic 972 h- wtf21 wtf21-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2024-12-26 (Fig. 6A) PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0000007 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:22681890 4896 2013-01-09 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002474 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0001309 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0001705 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dbl1 dbl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dbl1 dbl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dbl1 dbl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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SPCC2H8.05c FYPO:0000268 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0005638 PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbl1 dbl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph imt1 imt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph imt1 imt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph imt1 imt1delta deletion 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1-156,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1(157-879) mrc1-1-156,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002430 F2336A,W2337A Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 6I) PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 trm112 trm112delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph trm112 trm112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0001407 deletion 972 h- trm112 trm112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph trm112 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0006926 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 trm112 trm112delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0000833 deletion 972 h- trm112 trm112delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.11c) PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0000946 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm112 trm112delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph trm112 trm112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trm112 trm112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.02 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FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003338 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000025,FYECO:0000228 high PMID:22905165 4896 2020-02-21 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003338 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 PMID:26132084 4896 2017-09-16 (Fig. 2A,B) fragmented with RLC strands PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001009 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 58 PMID:16687577 4896 2018-02-28 (Figure 5, D and E) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003838 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 1B, C) Cells arrest with a stable actinomyosin ring and fail to undergo cytokinesis PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003838 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 low PMID:26132084 4896 2017-09-16 (Fig. 2D,2E) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006220 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:26132084 4896 2015-09-16 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006220 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:26132084 4896 2015-09-16 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002026 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 30-40 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3A) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002026 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000235,FYECO:0000291 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 4D) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002026 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 PMID:26132084 4896 2017-09-16 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:27974503 4896 2017-01-03 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002557 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3E) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000940 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:11448769 4896 2014-09-22 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006831 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:29813053 4896 2019-02-01 S5 Fig. The establishment of SIN asymmetry and the timely activation of septum synthesis do not depend on each other. (A, B) Early log-phase wild-type and thermosensitive cps1-191 (Bgs1) mutant cells were grown in YES at 25ÊC, shifted to 28ÊC for 1 h (A) or 32ÊC for 30 min (B) to produce a gradual delay in the onset of septum synthesis of cps1-191 mutant, and imaged as in Fig 5C. Anaphase B onset is considered as time zero (T = 0). White arrow: first CWstained detection of septum synthesis. Arrowheads: green, anaphase B onset; blue, septum deposition start (time immediately before septum detection with CW); red, complete asymmetry of SIN Cdc7, being Cdc7-GFP completely lost from one SPB. The data of this figure are developed in S2 Table. (C) The timing of septation onset is not related to the asymmetry of SIN. Early log-phase wild-type cells were grown in YES at 25ÊC, 28ÊC or 32ÊC, imaged as in Fig 5C and the timings of SIN asymmetry and of septation onset were determined with respect to the anaphase B onset (see also the data in S2 Table). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002652 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 6C, D and E) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001130 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3E) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000539 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0000092 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 7F and G) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000539 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0000092 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 7F and G) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003825 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10704373 4896 2014-09-20 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0005689 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 96 PMID:15800064 4896 2016-09-23 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0005689 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 1B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003303 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000235,FYECO:0000291 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 4D, E, F) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006005 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 4C) (displacemetn is supressed by inhibiting membrane trafficking PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0006005 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:19075108 4896 2024-04-16 (Fig. 2B) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002141 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3C) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3C) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3C) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3E,F) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229,FYECO:0000235 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 3C) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000776 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11448769 4896 2014-09-22 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001904 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 PMID:26132084 4896 2015-09-16 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000783 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:11448769 4896 2014-09-22 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0007868 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000356 low PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 6A) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000079 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:27974503 4896 2017-01-03 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000281 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 7B, C and D) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000646 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:39156640 4896 2025-02-28 (Fig. 3A) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003245 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 FYECO:0000235,FYECO:0000291 PMID:12791993 4896 2017-04-13 (Fig. 4D, E, F) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0005871 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-191 unknown ECO:0001232 PMID:26132084 4896 2017-09-19 (Fig. 4C) PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K175Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K175Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K175Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K175Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001645 1-147 Not assayed or wild type 972 h- asc1 asc1-148-391 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPAC17A5.15c),assayed_using(PomBase:SPAC30C2.04) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 1e) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001645 1-147 Not assayed or wild type 972 h- asc1 asc1-148-391 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPAC30C2.04),assayed_using(PomBase:SPBC17D11.05) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 3a) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 R267A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R267A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 R267A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R267A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005848 R320H Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-R320H clr4-689 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002834 R320H Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-R320H clr4-689 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 R320H Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-R320H clr4-689 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:8001791 4896 2013-11-13 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 R320H Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-R320H clr4-689 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003571 R320H Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-R320H clr4-689 amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase 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ade6-M210/M216 hem25 hem25delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000085 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000102 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAC823.10c FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC823.10c FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPAC823.10c FYPO:0003559 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAC823.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000089 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAC823.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC823.10c FYPO:0000091 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAC823.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- hem25 hem25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC823.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem25 hem25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem25 hem25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008155 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:32415063 4896 2024-01-22 as was also observed in mmi1Δ and rrp6Δ cells (Fig. 1a and Supplementary Fig. 1a) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008155 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1459) PMID:32415063 4896 2024-01-22 as was also observed in mmi1Δ and rrp6Δ cells (Fig. 1a and Supplementary Fig. 1a) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003551 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000121 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 94 PMID:32415063 4896 2024-01-22 We asked if Pir2 is also required for the repression of byr2 that is observed upon the accumulation of nam1 lncRNA in cells lacking Rrp6. Since byr2 is required for meiotic induction, cells lacking Rrp6 are defective in sporulation (Fig. 1f)11. PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004811 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1459) PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004811 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004811 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004811 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0007530 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0007530 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003042 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.10) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 5A) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003042 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.14c) PMID:32012158 4896 2020-03-26 (Figure 5A) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001407 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:29844133 4896 2018-07-03 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004604 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 we observed 7-fold and a 25-fold increases in tlh1+ transcript levels in rrp6D and dis3-54 cells, respectively, and 33- and 100- fold increases in cid14D and clr4D cells, respectively (Figures 4G and S3) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000888 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002355 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004137 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002932 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004304 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005801 PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008028 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 5A) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004416 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 5B) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004416 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 5B) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004205 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000337 low PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000781 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 (Fig. 5) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 high PMID:19693008 4896 2024-01-15 Deletion of exosome subunit rrp6 led to an antisense profile closely resembling that of Dclr4 Dpht1, with read-through antisense RNA covering entire ORFs at convergent genes (Fig. 3b). When Dpht1 was combined with mutant alleles of clr4 or rik1—components of the Clr4-containing methyltransferase complex (ClrC)7—the resultant double mutants showed severe growth defects and a large, synergistic increase in antisense RNAs at .20% of genes (Fig. 2a and Supplementary Figs 5 and 7a, b). Consistent with ClrC directly participating in antisense suppression, Rik1 was found at the convergent loci (Supplementary Fig. 7c). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC336.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PBO:0000992) PMID:26518661 4896 2019-07-25 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004982 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000049 low PMID:17512405 4896 2024-01-18 Consistent with a role for the exosome in degrading heterochromatic ura4+ transcripts, we observed elevated ura4+ transcript levels in rrp6D compared to wild-type cells (Figures 4C-4E). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008148 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 As previously reported, deletion of rrp6 leads to strong accumulation of CUTs and a small group of mRNAs that are mostly involved in meiosis16,23,25,29,30,35. PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008148 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005522 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 medium PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008426 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000059 high assayed_region(PomBase:SPAC4A8.05c) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 1, 4B) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008426 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000059 high assayed_region(PomBase:SPCC1442.04c) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 1, 4C) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008426 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000059 high assayed_region(PomBase:SPAPB15E9.03c) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 2, 4A) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006369 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 1D, 2B, 3B, 4) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006268 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003102 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBPB10D8.04c) PMID:24095277 4896 2014-02-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003102 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.12c) PMID:24095277 4896 2014-02-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003102 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.06c) PMID:24095277 4896 2014-02-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0008113 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Similar to previous reports, we detected significantly increased intronic reads in the exosome mutant rrp6D strain (Fig. 4a,b). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002960 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 As previously reported, deletion of rrp6 leads to strong accumulation of CUTs and a small group of mRNAs that are mostly involved in meiosis16,23,25,29,30,35. PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002960 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:28841135 4896 2018-03-02 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002960 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:28841135 4896 2018-03-02 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002960 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:28841135 4896 2018-03-02 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002960 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002960 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.29) PMID:29618061 4896 2024-01-24 In agreement with a previously demonstrated role for the nuclear exosome complex in the degradation of meiotic transcripts during mitosis, we observe increased levels of meu19 and meu31 in rrp6Δ (Figure 5B and C). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1A6.06c) PMID:29618061 4896 2024-01-24 In agreement with a previously demonstrated role for the nuclear exosome complex in the degradation of meiotic transcripts during mitosis, we observe increased levels of meu19 and meu31 in rrp6Δ (Figure 5B and C). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002173 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPAC1556.06) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005995 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002933 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003104 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.12c) PMID:24095277 4896 2014-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003104 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPB10D8.04c) PMID:24095277 4896 2014-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003104 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.06c) PMID:24095277 4896 2014-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003119 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0006031 high PMID:29844133 4896 2018-07-03 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002931 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.01) PMID:26670050 4896 2016-08-17 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002931 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0002931 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001908 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:26670050 4896 2016-08-17 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001908 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.16c) PMID:26670050 4896 2016-08-17 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001908 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.01) PMID:26670050 4896 2016-08-17 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001908 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001908 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 high assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 Northern blot analysis of RNA prepared from the rrp6D strain revealed robust upregulation of rpl30-2 mRNA and pre-mRNA, 5- and 18-fold, respectively (Figure 2A, lane 7, and Figures 2B and 2C) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001890 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 40 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006270 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 5C) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1343) PMID:25428589 4896 2022-12-01 The size and levels of the nc-1343 transcript increased in exosome defective (rrp6D) cells, but not cells lacking Mmi1 or Red1 (Fig. 2c,d; Supplementary Fig. 4). T PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2022-12-01 Northern analysis identified that an B1.9kb nc-tgp1 RNA accumulates in rrp6D, mmi1D and red1D, but not in wild-type cells (Fig. 2e,f; Supplementary Fig. 4). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:25428589 4896 2022-12-02 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.488) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.405) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.247) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1442.04c) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 3A, 4D) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPAPB15E9.03c) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 3A) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPAC14C4.08) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 3D) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPAC14C4.07) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 3D) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 3D) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 medium assayed_transcript(PomBase:SPAPB15E9.03c) PMID:23151475 4896 2025-06-23 (Fig. 4D) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.9001) PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000337 low assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S2E) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003237 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0004207 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 high assayed_transcript(PomBase:SPAPB15E9.03c) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 2A, 2E) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.04c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.06) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC750.01) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.18) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC977.02) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC1348.03) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0005917 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.05c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006109 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006849 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:35277511 4896 2022-05-23 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003049 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.14c) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003049 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.10) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003105 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 PMID:24095277 4896 2014-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006996 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000231 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 4 and Supplementary Fig S5) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0007281 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.06) PMID:29618061 4896 2024-01-24 However, mug14 is not affected in this exosome mutant, suggesting that the gene is likely to be regulated only at the transcriptional level (Figure 5a). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000833 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-03-02 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006080 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 5B) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006080 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 5B) PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0006279 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0003701 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0001232 PMID:20129053 4896 2014-08-19 snoRNAs with extended poly(A) tails accumulate in these foci PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001234 deletion 972 h- rrp6 rrp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29914874 4896 2018-11-26 Supplementary Fig. S3 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0007160 mcl1-3xHA Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcl1 mcl1-3 fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003044 mcl1-3xHA Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcl1 mcl1-3 fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003044 mcl1-3xHA Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcl1 mcl1-3 fusion_or_chimera ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0001357 mcl1-3xHA Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcl1 mcl1-3 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000611 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001430 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11854402 4896 2012-10-05 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001680 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11854402 4896 2012-10-05 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001681 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11854402 4896 2012-11-13 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001270 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000170,FYECO:0000229 14 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001270 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 13 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000229 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000170,FYECO:0000229 6 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0003165 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 8 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000476 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11854402 4896 2012-10-05 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000835 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:11854402 4896 2012-10-05 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0002993 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001740 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 low PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001840 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 medium PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0005068 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170,FYECO:0000229 high PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000455 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001387 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000833 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:11854402 4896 2012-10-05 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0007381 Ub-DHFRts-mcm4 Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-tstd mcm4-dg|mcm4-ts-td|mcm4-tsdg|mcm4td|mcm4ts-degron|mcm4ts-td|mcm4tstd fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004303 D170A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D170A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:11934898 4896 2015-01-15 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001324 441-900 Overexpression 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.02c) PMID:18276645 4896 2020-09-24 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0000825 441-900 Overexpression 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC17G6.02c) PMID:18276645 4896 2020-09-24 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0002224 1-173 Overexpression 972 h- mip1 mip1-15 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000303 1-173 Overexpression 972 h- mip1 mip1-15 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001152 1-173 Overexpression 972 h- mip1 mip1-15 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMTR.01) PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001152 1-173 Overexpression 972 h- mip1 mip1-15 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMTR.02) PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001868 G1474D Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-61 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001665 G1474D Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-61 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000310 PMID:8227198 4896 2020-10-22 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001666 G1474D Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-61 amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003216 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000049 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000049 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 We also detected intermediate phenotypes for the 8 ccr4∆ mutant, pointing to a partial contribution of this RNA deadenylase (Fig. 1g-h; 9 Supplementary Fig. 1b-d). PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000231 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000112 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000049 low PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S2D) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003230 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003572 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000872 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0005868 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000049 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001551 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000177 high assayed_protein(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 4B) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0005291 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000173 high assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 3A) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001547 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000177 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 3A) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0005917 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000291 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0006109 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000231 PMID:28404620 4896 2017-05-26 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0006992 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000049 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0006992 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000231 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003555 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000049 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003555 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000231 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003507 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:39761853 4896 2025-07-11 (Fig. 8C) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003235 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0005865 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0008441 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000173 assayed_protein(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-11 (Fig. 4B) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001986 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000069 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. S3) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000097 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000085 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000102 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001245 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0003559 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0007928 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000176 medium PMID:39761853 4896 2025-07-10 (Fig. 8C) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000087 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000088 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002546 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0004983 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002067 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 low PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 6D) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0001234 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 PMID:28031482 4896 2017-04-06 (Fig. 6D) PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- ccr4 ccr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC31H12.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr4 ccr4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0003771 G49L,S53L Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-G49L,S53L amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:25157670 4896 2014-09-04 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0003770 G49L,S53L Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-G49L,S53L amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:25157670 4896 2014-09-03 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 Y63R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-Y63R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 Y63R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-Y63R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 Y63R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-Y63R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 Y63R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-Y63R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPCC70.12c FYPO:0006331 C20S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C20S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2B) PomBase SPCC70.12c FYPO:0000245 C20S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C20S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2A) PomBase SPCC737.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC737.07c SPCC737.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC737.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPCC737.07c SPCC737.07cdelta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC737.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPCC737.07c SPCC737.07cdelta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC737.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC737.07c SPCC737.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC737.07c SPCC737.07cdelta deletion ECO:0005638 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prototroph dhm1 dhm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dhm1 dhm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph dhm1 dhm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dhm1 dhm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dhm1 dhm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.10 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph dhm1 dhm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP1E11.10 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FYPO:0003412 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:32499408 4896 2020-12-11 (Figure 1B-E, S1B) PomBase SPAC926.04c FYPO:0003216 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:32499408 4896 2020-12-11 (Figure 1B-E, S1B) PomBase SPAC926.04c FYPO:0002827 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:32499408 4896 2020-12-11 (Figure 1B-E, S1B) PomBase SPAC926.04c FYPO:0004604 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:32499408 4896 2020-12-11 (Figure 1B-E, S1B PomBase SPAC926.04c FYPO:0000835 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC83.03c) PMID:32499408 4896 2020-12-11 that the amount of Tas3 but not Ago1 was significantly reduced once the hsp90-G84C cells were shifted to restrictive temperature of 37 °C for 4 hours (Figure 4B) PomBase SPAC926.04c FYPO:0000835 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC140.03) PMID:32499408 4896 2020-12-11 It is noteworthy that the amount of Arb1 was also drastically decreased in hsp90-G84C cells at high temperatures (Figure 4E) PomBase SPAC926.04c FYPO:0000835 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPAC25A8.01c) PMID:32499408 4896 2020-12-13 (Fig. 5e) PomBase SPAC926.04c FYPO:0000835 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:32499408 4896 2020-12-13 (Figure 7A) PomBase SPAC926.04c FYPO:0008120 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPAC926.04c FYPO:0001645 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC83.03c),assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:32499408 4896 2020-12-11 We then examined how the altered protein level of Tas3 affects the RITS complex formation in vivo. Notably, the low level of Tas3 in hsp90-G84C cells could only recruit minimal amount of Ago1 detected by co-immunoprecipitation assay at elevated temperatures (Figure 4C). (Figure 4B) PomBase SPAC926.04c FYPO:0001645 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC140.03),assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:32499408 4896 2020-12-11 even at 25 °C, Arb1-associated Ago1 in the immunoprecipitates from hsp90-G84C cells was much reduced compared to wild-type samples (Figure 4E) PomBase SPAC926.04c FYPO:0001645 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPBC428.08c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:32499408 4896 2020-12-13 PomBase SPAC926.04c FYPO:0002482 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000103 PMID:7813446 4896 2014-11-24 PomBase SPAC926.04c FYPO:0002414 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000102 PMID:7813446 4896 2014-11-24 PomBase SPAC926.04c FYPO:0002061 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7813446 4896 2014-11-24 PomBase SPAC926.04c FYPO:0001387 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18430926 4896 2012-12-14 PomBase SPAC926.04c FYPO:0004083 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:32499408 4896 2020-12-11 (Figure 4B) PomBase SPAC926.04c FYPO:0001357 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:7813446 4896 2014-11-24 PomBase SPAC926.04c FYPO:0000647 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-G84C swo1-26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000102 PMID:7813446 4896 2014-11-24 PomBase SPAC926.04c FYPO:0006822 G84C Not assayed or wild type 972 h- hsp90 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2018-08-31 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000102 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC215.03c FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC215.03c FYPO:0003559 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 low PMID:25795664 4896 2016-07-01 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:25795664 4896 2016-08-26 PomBase SPBC215.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 csn1 csn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 csn1 csn1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC215.03c FYPO:0000091 deletion 972 h- 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assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-24 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-24 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-24 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-24 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E260A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-24 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 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upregulation of rpl30-2 after heat shock, we predicted that rpl30-2 expression from the intronless construct, which is insensitive to Pab2/Rrp6-mediated pre-mRNA decay (Figures 1B and 1C), would not respond to heat stress. Accordingly, a wild-type strain that expressed the intronless version of rpl30-2 showed no increase in mRNA levels after heat shock (Figure 4C, lanes 1 and 2, and Figure 4D). PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002029 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 medium PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 1C, 1D and 1E) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000906 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 medium PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 5C) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000907 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 low PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 5C) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000907 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:21856157 4896 2012-04-05 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0006896 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:30649994 4896 2019-05-29 (Fig. 3E) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0006895 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:30649994 4896 2019-05-29 (Fig. 3E) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000903 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:21856157 4896 2012-04-05 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0003194 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 2C) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002071 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 3B) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000895 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:36633091 4896 2023-02-02 (Fig. 1A, 1B, S1A) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000895 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:21856157 4896 2016-12-19 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007208 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 high PMID:30602572 4896 2019-12-03 (Figure 6B) PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0003702 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000897 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:21856157 4896 2012-04-05 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000898 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:21856157 4896 2012-04-05 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007276 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 PMID:31582398 4896 2020-03-14 To verify that the attachment to microtubules was not necessary for segregation during meiosis, we employed parental cells lacking the microtubule-mitochondrial linker protein Mmb1 (Fu et al., 2011). Additionally, one of the parental cells had its mitochondria fluorescently labeled. In zygotes and asci resulting from this cross, we observed that parental mitochondria continued to remain segregated (Fig. S2, C and D). PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0000091 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0003810 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 high high PMID:30602572 4896 2019-11-18 (Figure 6C, 6D) Increased mitochondrial numbers and decreased mitochondrial sizes with overall mitochondrial volume same as what is observed in wild-type cells PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001492 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25B2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmb1 mmb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0000440 deletion 972 h- SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0007931 deletion 972 h- SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0000842 deletion 972 h- SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c SPCC4G3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.12c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC4G3.12c 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PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001164 462-711 Overexpression 972 h- pyp2 pyp2-ND pyp2ND partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009103 R1056A,E1059A,E1061A Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-427 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009104 R1056A,E1059A,E1061A Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-427 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0009107 R1056A,E1059A,E1061A Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-427 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37099380 4896 2023-06-30 PomBase SPCC417.07c FYPO:0001368 R1056A,E1059A,E1061A Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-427 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0007828 R1056A,E1059A,E1061A Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-427 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-29 PomBase SPCC417.07c FYPO:0001400 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PomBase SPCC622.13c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- tti1 tti1-CKO wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000218 high PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPCC622.13c FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- tti1 tti1-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03) PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPCC622.13c FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- tti1 tti1-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPAC25B8.01 FYPO:0002321 Y138F Not assayed or wild type 972 h- dap1 dap1-Y138F amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:17276356 4896 2024-05-02 However, similar to dap1D, yeast carrying the HA-dap1 Y138F plasmid accumulated 24-methylene lanosterol, ergosta-5,7,24(28)-trienol, and ergosta-5,7- dienol, reflecting defects in Erg11 and Erg5 (Figure 3B). These data indicate that dap1 Y138F is a loss-of-function mutation and that Dap1 function requires bound heme. PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0003020 T818A,T823A Not assayed or wild type 972 h- gcn2 gcn2-T818A,T823A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.09) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0002033 T818A,T823A Not assayed or wild type 972 h- gcn2 gcn2-T818A,T823A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0003298 T818A,T823A Not assayed or wild type 972 h- gcn2 gcn2-T818A,T823A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.09) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0001097 T818A,T823A Not assayed or wild type 972 h- gcn2 gcn2-T818A,T823A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 184-738 Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-delta184-738 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000263,FYECO:0000337 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000082 184-738 Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-delta184-738 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000705 deletion 972 h- acl1 acl1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.16),assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02) PMID:30355493 4896 2018-11-14 (Fig. 3c) PomBase SPBC1703.07 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0006791 deletion 972 h- acl1 acl1delta deletion ECO:0001232 PMID:30355493 4896 2018-11-14 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000674 deletion 972 h- acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 PMID:30355493 4896 2018-11-14 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph acl1 acl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- acl1 acl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acl1 acl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acl1 acl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 T125A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-T125A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 T125A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-T125A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC222.09 FYPO:0002133 R472E Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-R472E amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:28367989 4896 2018-02-01 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000655 I254A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-33 amino_acid_mutation ECO:0000325 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004498 I254A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 I254A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 I254A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 I254A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000268 I254A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 low PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 hub1-(GGKGG)-sde2(85-263) Not assayed or wild type 972 h- sde2 hub1-GGKGG-sde2-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 (Fig. EV2B) processing defective, does not complement sde2Δ PomBase SPAC806.07 FYPO:0001998 C116Y Not assayed or wild type 972 h- ndk1 ndk1-dn amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:7499258 4896 2013-02-26 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0006661 D476A Overexpression 972 h- trz2 trz2-D476A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2E,F) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005823 D476A Overexpression 972 h- trz2 trz2-D476A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2C,D) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002061 D476A Overexpression 972 h- trz2 trz2-D476A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2B) PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0008337 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000059 high PMID:39333464 4896 2024-11-12 (Fig. 3C, Fig. S4) PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0004201 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000059 low PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0000888 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000226 PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0000470 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0006073 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000291 PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0000220 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000291 low PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC17H9.01 FYPO:0006995 deletion 972 h- cid16 cid16delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 Finally, deletion of the other four members of the fission yeast Cid14/Trf4/5 poly(A) polymerase family did not affect silencing of an imr1R::ura4+ reporter gene (Figure 2H). 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25˚C. PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002817 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0001232 PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0003378 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000112 PMID:17804800 4896 2015-10-13 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0003181 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000337 PMID:15238514 4896 2015-12-11 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0001915 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mei4 mei4delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000583 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mei4 mei4delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004986 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.04) PMID:21775631 4896 2012-11-16 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000303 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0005638 PMID:18059475 4896 2012-02-19 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0005122 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0006160 deletion 972 h- h90 mei4 mei4delta deletion ECO:0001232 PMID:21449049 4896 2019-10-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002937 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 complete assayed_transcript(PomBase:SPBC21C3.18) PMID:11739743 4896 2026-01-04 In conclusion, the transcription of spo4 is induced during mei- osis under the regulation of Mei4. PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004938 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:17804800 4896 2015-10-13 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0006145 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000230 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.16) PMID:24569997 4896 2017-07-25 fig2 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002959 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.09) PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002959 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.09c) PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002959 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC22F3.02) PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002959 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002959 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004937 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:17804800 4896 2015-10-13 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0008141 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC26H8.02c) PMID:16272747 4896 2023-12-11 As shown in Fig. 2A, accumulation of sec9 mRNA was completely abolished in the mei4Δ mutant. Furthermore, ectopic overexpression of mei4+ was found to induce sec9+ mRNA in vegetative cells (Fig. 2C). sec9+ has a consensus recognition sequence for Mei4, GTAAAYA (Horie et al., 1998) in the 5' upstream region. We conclude that transcription of sec9+ during meiosis is strictly regulated by Mei4. PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004630 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1347.03) PMID:12759375 4896 2015-03-11 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004630 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.04) PMID:17804800 4896 2015-10-13 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0001152 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0001152 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004966 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0001232 PMID:25492408 4896 2015-10-16 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0005124 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0003565 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:17804800 4896 2015-10-12 PomBase SPBC32H8.11 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mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.04) PMID:12786945 4896 2014-07-17 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0003579 deletion 972 h- mei4 mei4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.130) PMID:12786945 4896 2014-07-17 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mei4 mei4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mei4 mei4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mei4 mei4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mei4 mei4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0009043 deletion 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dps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBPJ4664.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- dps1 dps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBPJ4664.01 FYPO:0004983 deletion 972 h- dps1 dps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBPJ4664.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- dps1 dps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPJ4664.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- dps1 dps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPBPJ4664.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- dps1 dps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000179 PMID:24911838 4896 2016-10-21 PomBase SPBPJ4664.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dps1 dps1delta deletion ECO:0001232 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0008181 G164T,H201N Overexpression 972 h- ceg1 pce1-G164T-H201N amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 1G) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006521 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7A-B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001382 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000170 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001645 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001355 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001122 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001122 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000972 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0001232 45 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001234 N17I,W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E40 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC215.02 FYPO:0000303 wild type Overexpression 972 h- pfd5 bob1+ wild_type ECO:0005638 high PMID:11683500 4896 2018-04-28 PomBase SPBC215.02 FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- pfd5 bob1+ wild_type ECO:0001232 PMID:11683500 4896 2014-08-15 PomBase SPBC336.01 FYPO:0003674 K301A Not assayed or wild type 972 h- fbh1 fbh1-K301A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC336.01) PMID:25165823 4896 2014-10-22 PomBase SPBC336.01 FYPO:0000657 K301A Not assayed or wild type 972 h- fbh1 fbh1-K301A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:25165823 4896 2014-10-22 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0001236 deletion 972 h- SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-10-17 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0001164 deletion 972 h- SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-10-17 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0001795 deletion 972 h- SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 PMID:22840777 4896 2012-11-26 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1773.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1773.12 SPBC1773.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007092 Ppgk1DTATA-loz1-GFP Overexpression 972 h- loz1 Ppgk1-DTATA-loz1-GFP p.pgk1-DTATA-loz1-GFP other ECO:0000226 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:31515876 4896 2019-10-02 When Loz1 is expressed at a constant level inside of cells, it binds to the zrt1 promoter in high zinc conditions and not in low zinc conditions PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007092 Ppgk1DTATA-loz1-GFP Overexpression 972 h- loz1 Ppgk1-DTATA-loz1-GFP p.pgk1-DTATA-loz1-GFP other ECO:0000226 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:31515876 4896 2019-10-02 When Loz1 is expressed at a constant level inside of cells, it binds to the adh4 promoter in high zinc conditions and not in low zinc conditions (consistent with its role in gene repression in high zinc conditions PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007091 Ppgk1DTATA-loz1-GFP Overexpression 972 h- loz1 Ppgk1-DTATA-loz1-GFP p.pgk1-DTATA-loz1-GFP other ECO:0000049 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:31515876 4896 2019-10-02 Loz1 represses gene expression when zinc is in excess and growth in zinc deficient media leads to de-repression of its target genes. Expression from the pgk1DTATA promoter leads to higher levels of Loz1 accumulating inside of cells, which in turn leads to higher levels of gene repression under low zinc conditions (Figure 1B) PomBase SPAC3G9.13c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msw1 msw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- msw1 msw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3G9.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msw1 msw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000619 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (APC) activation occurred and chromosome cohesion was lost (Figure 1A and 1B). PomBase SPAC890.02c FYPO:0003738 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 7 PMID:17579515 4896 2018-01-23 PomBase SPAC890.02c FYPO:0001733 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 8E) PomBase SPAC890.02c FYPO:0004536 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (APC) activation occurred and chromosome cohesion was lost (Figure 1A and 1B). PomBase SPAC890.02c FYPO:0001734 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (Figure 3A and 3B, and Video S3) PomBase SPAC890.02c FYPO:0001978 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 8E) PomBase SPAC890.02c FYPO:0006195 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 8E) PomBase SPAC890.02c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 8E) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC890.02c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (Fig. S1) PomBase SPAC890.02c FYPO:0003787 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (Figure 2C) PomBase SPAC890.02c FYPO:0006351 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 50-60 PMID:17579515 4896 2018-01-23 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 7 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (Figure 1). PomBase SPAC890.02c FYPO:0004396 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (Figure S4) PomBase SPAC890.02c FYPO:0005380 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0005638 PMID:17579515 4896 2018-01-23 (Figure S4; Figure 3A,B; Video S3) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002400 wild type Overexpression 972 h- alp7 alp7+ wild_type ECO:0001232 PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 8E) PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0000089 deletion 972 h- SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC7D4.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC7D4.05 SPAC7D4.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000705 1-1196 Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-C(1197-2386) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Fig. 4A) PomBase SPBC1685.16 FYPO:0002021 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vma9 vma9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.16 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vma9 vma9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- vma9 vma9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sea4 sea4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sea4 sea4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 PMID:33534698 4896 2021-07-08 (Figure 2a) PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000242 PMID:33534698 4896 2021-07-08 (Figure 2a) PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sea4 sea4delta deletion ECO:0005638 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(Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001690 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007074 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S 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2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000091 P103S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102S amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC18.09c FYPO:0002493 H165A Not assayed or wild type 972 h- hnt3 hnt3-H165A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:21984210 4896 2013-08-12 PomBase SPNCRNA.900 FYPO:0000725 deletion 972 h- SPNCRNA.900 SPNCRNA.900delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC839.20 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph new14 new14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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4896 2023-06-28 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S566A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S566A,S654A B2d7-S566A-S654A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S566A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S566A,S654A B2d7-S566A-S654A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0001645 S219D Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-S219D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 3) PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000703 S219D Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-S219D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 3) PomBase SPAC6G10.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbc1 cbc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.07 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbc1 cbc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.07 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbc1 cbc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- cbc1 cbc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G10.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbc1 cbc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17H9.12c FYPO:0003412 cyc2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 cyc2 cyc2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC622.09 FYPO:0003486 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC644.14c) PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 5) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002340 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4F) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170 30 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2A and B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170,FYECO:0000211 30 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2C and D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170,FYECO:0000464 40 medium PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2C and D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 G53D Not assayed or wild type 972 h- cdc10-ts htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 10 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2I) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 G53D Not assayed or wild type 972 h- cdc10-ts htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000211,FYECO:0000291 15 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2J) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 G53D Not assayed or wild type 972 h- cdc10-ts htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291,FYECO:0000464 30 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2J) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003912 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000049 65 PMID:38718864 4896 2025-07-08 HR frequency goes from 20% in WT to 7% in mutant (Fig. 7I) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005608 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8I-N) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007386 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007386 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8A-H) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005677 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000211 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4F) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4G) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4H) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001355 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007881 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000464 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000972 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000464 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004066 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.04c),assayed_region(PomBase:SPAC18B11.07c) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004066 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.04c),assayed_region(PomBase:SPAC664.07c) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004066 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.04c),assayed_region(PomBase:SPCC970.10c) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004066 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.04c),assayed_region(PomBase:SPAC22F8.12c) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004066 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.04c),assayed_region(PomBase:SPAC1952.05) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000964 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0008250 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1919.15),assayed_region(PomBase:SPCC622.09) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0008250 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1919.15),assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0008250 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1919.15),assayed_region(PomBase:SPAC22F8.12c) PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 9A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000084 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000095 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-06-04 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000095 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003670 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 G53D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPAC3H8.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph img2 img2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph img2 img2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph img2 img2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph img2 img2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr img2 img2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC3H8.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph img2 img2delta deletion ECO:0005638 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PMID:30840879 4896 2019-06-24 (Fig. 3e) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0005307 321-695,K60E,K67E,K78E,K82E,R144D,K148E Knockdown 972 h- rga7 rga7(1-320)-PIP2+core amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 high PMID:30840879 4896 2019-06-24 (Fig. 3c) PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000835 321-695,K60E,K67E,K78E,K82E,R144D,K148E Knockdown 972 h- rga7 rga7(1-320)-PIP2+core amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:30840879 4896 2019-06-24 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002029 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 high PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 1C, ID and 1E) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000240 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea2 tea2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea2 tea2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0006502 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003329 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:11018050 4896 2016-11-23 (Fig. 8c) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003329 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 4E-H) Tip1YFP is expressed from endogenous tip1 gene tagged with YFP PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005817 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 4C) Tip1YFP is expressed from endogenous tip1 gene tagged with YFP PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004700 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125 18 PMID:11018050 4896 2016-10-27 (Fig. 2B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000082 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000125 PMID:11018050 4896 2016-10-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009001 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 high PMID:36633091 4896 2023-02-02 (Fig. 2A and 2C) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000470 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0001586 deletion 972 h- kanR, ura4-D18, ade6-M210 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 >95 high assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-15 (Figure 2A) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005494 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005494 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 4E-H) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003190 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 high PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 2A and 2C) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009000 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 high PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 2A and 2B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005463 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000513 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:25869666 4896 2022-05-16 (Fig. 1) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0006340 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 complete PMID:16141239 4896 2018-01-22 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0007197 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 high high PMID:30602572 4896 2019-12-03 (Figure 2C) the mitochondria have a fission frequency that is almost double that of wild-type PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002071 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 3B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0006636 deletion 972 h- tea3-GFP tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPAC6G10.02c) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 4C PomBase SPBC1604.20c FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 3.6 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0006259 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000833 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 4C) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0004731 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 1) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003185 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:15177031 4896 2016-11-02 (Fig. 6A,B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005827 deletion 972 h- kanR ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12034771 4896 2016-11-15 (Fig. 2C) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005828 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:15177031 4896 2016-11-02 (Fig. 6C,D) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003225 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005342 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 (Fig. 1e) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0001357 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:11018050 4896 2016-11-23 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 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SPBC1604.20c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph tea2 tea2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005809 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:11018050 4896 2016-10-28 Data not shown. PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002760 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea2 tea2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002760 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 1) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002760 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125 PMID:11018050 4896 2016-10-27 (Fig. 3) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0006103 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 high high PMID:30602572 4896 2019-12-03 (Figure 1B) the anti-parallel microtubule bundles are only about half the length of wild-type bundles PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003810 deletion 972 h- tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 high high PMID:30602572 4896 2019-11-18 (Figure 1C, 1D) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002848 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 75 PMID:11018050 4896 2016-10-28 (Fig. 4) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000013 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000013 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000125 9 PMID:11018050 4896 2016-10-28 (Fig. 2D) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea2 tea2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 40.2 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea2 tea2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 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To dissect the contribution of each class of ER-PM contact to Duc1-mNG localization, we analyzed its distribution in hob2Δ, ltc2Δ, ist2Δ, and tcb1Δ tcb2Δ tcb3Δ strains. We found that Duc1-mNG was excluded from the cell division site in all four strains, as in wild-type cells (Fig. S2A). 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PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000783 1-170 Not assayed or wild type 972 h- pkd2 pkd2deltaN170 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.03) PMID:37723847 4896 2023-10-15 N-terminus of Pkd2 (Pkd2N) localized to the cytoplasm and slightly to the ER PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004308 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10864871 4896 2015-01-15 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001779 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:12928332 4896 2015-01-22 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001779 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000640 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000640 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000141 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7865880 4896 2012-03-15 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001268 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:10864871 4896 2015-01-15 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004481 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:12535531 4896 2018-02-28 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004318 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0006174 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 20 high PMID:25375240 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003786 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003786 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:19217404 4896 2016-03-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000634 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC23H4.11c) PMID:17035632 4896 2023-05-18 In addition, their centromere localization depended on Mis6: Cnl2 and Fta7 proteins lost their centromere localization in a mis6-302 temperature-sensitive mutant at the restricted temperature of 36°C (Figure 1E) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000634 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.07) PMID:17035632 4896 2023-05-18 In addition, their centromere localization depended on Mis6: Cnl2 and Fta7 proteins lost their centromere localization in a mis6-302 temperature-sensitive mutant at the restricted temperature of 36°C (Figure 1E) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000634 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001269 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001269 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-02-13 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001269 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001269 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.05c) PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000082 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003740 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12719471 4896 2015-01-21 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003217 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:12719471 4896 2015-01-21 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004313 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004313 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004313 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004904 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004904 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002902 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002902 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1805.07c) PMID:17352737 4896 2015-02-11 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002902 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.09c) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002902 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC21.01) PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002902 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC18E5.03c) PMID:12719471 4896 2015-01-21 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002902 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.03) PMID:16855021 4896 2014-12-17 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004322 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 high PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0004322 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 medium PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001355 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001355 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23267073 4896 2018-02-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002639 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000786 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-16 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001489 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002061 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000284 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000284 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9230309 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0006190 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2021-12-20 (Figure 2) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003787 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001387 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0006172 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25375240 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000964 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002574 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02) PMID:25375240 4896 2017-08-04 (Figure 7D) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002901 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002901 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC409.04c) PMID:10398680 4896 2021-12-20 (Figure 6) Conversely, the mis6-302 strain integrated with the Mis12-HA gene was used. PomBase SPAC1687.20c FYPO:0002901 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12928332 4896 2015-01-22 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0005216 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:15930132 4896 2015-11-26 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0001357 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23267073 4896 2018-02-14 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000732 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 20 high PMID:25375240 4896 2017-08-04 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 66.7 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0003241 G135E Not assayed or wild type 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001645 1-300 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(301-580) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. 6A) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 1-300 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(301-580) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 1-300 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(301-580) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Fig. 6B) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002151 disruption Null 972 h- srp7 srp7.1 disruption ECO:0005638 PMID:16453822 4896 2014-06-10 PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0004811 unknown Not assayed or wild type 972 h- dhp1 dhp1-54 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A10.08c SPAC57A10.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007592 81-120 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN81-120 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3H) PomBase SPBC337.16 FYPO:0000128 unknown Not assayed or wild type 972 h- cho1 cho1-6 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9755189 4896 2015-04-14 PomBase SPCC1183.03c FYPO:0001164 2-11 Overexpression 972 h- fxn1 fxn1deltaMLS partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24997422 4896 2016-01-06 ). Interestingly, growth of transformants overexpressing truncated Fxn1 with a disrupted mitochondrial localization sequence (Fxn1Δ2-11) is similar to pREP3X at all concentrations of thiamine (Fig. 1A). These observations demonstrate that the growth inhibition resulting from Fxn1 overexpression is related to mitochondrial levels or improper processing of Fxn1. PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 608-778 Overexpression 972 h- crb2 crb2deltaC1-607 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.05),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000229 608-778 Overexpression 972 h- crb2 crb2deltaC1-607 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000315 PMID:14739927 4896 2016-01-14 PomBase SPBC342.05 FYPO:0001490 608-778 Overexpression 972 h- crb2 crb2deltaC1-607 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000315 PMID:14739927 4896 2016-01-18 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002061 K372A,K374A,K374A,R376A Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-4KRA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-22 As predicted, the 4KRA mutant did not restore lethality upon shut-off, whereas the other three mutants did (Fig. 4C) PomBase SPBC713.12 FYPO:0002643 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC713.12 FYPO:0002766 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC713.12 FYPO:0002767 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC713.12 FYPO:0005252 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001327 386-920 Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35536002 4896 2022-10-19 (Fig. 8, 12) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0004300 386-920 Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2024-08-13 (Fig. 1) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008013 386-920 Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385) STF6|asp1-(1-385) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 12) (Note how the levels are the same as when the pyrophosphatase is inactivated in the full-length protein) PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000476 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000255 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000067 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000073 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000073 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0002312 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-07-02 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000087 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000268 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000268 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001234 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001234 L522S Not assayed or wild type 972 h- pap1 caf3-89 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 A146T,G159T,148-150 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A146U,G159U,delta148-150 nucleotide_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0002023 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0005853 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0000134 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0000581 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0001886 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0003717 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0000962 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0000961 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0006213 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0004263 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0002047 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0001408 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0006836 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0001214 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0005889 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPCP31B10.03c FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- med31 sep10-412 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0000080 R50* 972 h- cdt2 cdt2-M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0001982 R50* 972 h- cdt2 cdt2-M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0001098 R50* 972 h- cdt2 cdt2-M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0000085 R50* 972 h- cdt2 cdt2-M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0000088 R50* 972 h- cdt2 cdt2-M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPAC17H9.19c FYPO:0001234 R50* 972 h- cdt2 cdt2-M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:12871901 4896 2013-12-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004791 S513E Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-S513E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001687 S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-S289A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure S3) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-380 unknown ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2015-09-02 PomBase SPBC1A4.06c FYPO:0007252 368-393 Not assayed or wild type 972 h- tam41 tam41-Cdelta25 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 medium assayed_enzyme(PomBase:SPBC1A4.06c) PMID:31178220 4896 2020-02-19 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005369 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000082 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 6D) (STF9) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 2, Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438,FYECO:0000439 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 9) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 4C, 6E) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 4C, S3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008277 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 high PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008279 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 high PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.06c) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.01) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000825 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPAC23D3.12) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002061 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 3) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002061 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:35012333 4896 2022-11-23 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008285 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 2, Fig. 4A, Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 493-920 Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1(1-492) STF9|asp1-(1-492) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000155,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S5) PomBase SPAC144.13c FYPO:0000302 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-B36 unknown ECO:0001232 PMID:1934121 4896 2013-02-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000822 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-B36 unknown ECO:0001232 PMID:1934121 4896 2013-02-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-B36 unknown ECO:0000059 PMID:3185514 4896 2013-02-05 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0002061 L112A Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-L112A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30026545 4896 2019-08-13 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006644 G296A Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-G296A klp9(SwII)|klp9-rigor amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003268 G296A Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-G296A klp9(SwII)|klp9-rigor amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2C, D) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 G296A Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-G296A klp9(SwII)|klp9-rigor amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28178520 4896 2018-07-13 (Fig. 3) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006917 G296A Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-G296A klp9(SwII)|klp9-rigor amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2E) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0003277 NLS-Cut7T(888-1085) Not assayed or wild type 972 h- cut7 NLS-cut7-T NLS-Cut7T fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:25348260 4896 2022-05-31 (Fig. 3) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0005709 NLS-Cut7T(888-1085) Not assayed or wild type 972 h- cut7 NLS-cut7-T NLS-Cut7T fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:25348260 4896 2022-05-31 (Fig. 3) PomBase SPAC17C9.03 FYPO:0002085 S882A,T884A,S886A,S896A,S896A,S912A,S919A,S921A,S1293A,S1300A,S1333A,S1349A,T1351A,S1353A,S1357A Not assayed or wild type 972 h- tif471 tif471-18A tif471_18A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:34296454 4896 2021-10-27 PomBase SPAC17C9.03 FYPO:0005193 S882A,T884A,S886A,S896A,S896A,S912A,S919A,S921A,S1293A,S1300A,S1333A,S1349A,T1351A,S1353A,S1357A Not assayed or wild type 972 h- tif471 tif471-18A tif471_18A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000263 medium PMID:34296454 4896 2021-10-27 (Fig. 5E, 5F) from paper for partial inhibition protein synthesis phenotype PomBase SPBC119.11c FYPO:0000303 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0005638 PMID:1989884 4896 2012-11-22 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0005638 PMID:1989884 4896 2017-02-07 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0001232 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0005638 PMID:2205842 4896 2014-05-06 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001152 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:2840284 4896 2014-05-02 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000584 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0005638 PMID:1989884 4896 2012-11-22 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.04) PMID:7616961 4896 2014-01-16 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.02) PMID:7616961 4896 2014-01-16 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.03) PMID:7616961 4896 2014-01-16 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(SO:0000252) PMID:7616961 4896 2014-01-16 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001315 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22496451 4896 2013-11-18 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0005638 PMID:1989884 4896 2012-11-22 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8144551 4896 2013-10-23 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- pac1 pac1+ wild_type ECO:0001232 PMID:2205842 4896 2014-05-06 PomBase SPAC2C4.14c FYPO:0002442 ppk11(305-312)-pmo25 Not assayed or wild type 972 h- ppk11 ppk11-delta8-pmo25 ppk11-delta8-pmo25-fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPBC646.04 FYPO:0002193 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pla1 pla1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- pla1 pla1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC646.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pla1 pla1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- pla1 pla1delta deletion ECO:0005638 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPCC1827.07c FYPO:0009094 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PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0003208 deletion 972 h- bud6 bud6delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.05) PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph bud6 bud6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph bud6 bud6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0000644 deletion 972 h- bud6 bud6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.08) PMID:18060866 4896 2012-04-27 PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0007451 deletion 972 h- bud6 bud6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0002442 deletion 972 h- bud6 bud6delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.05) PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPAC15A10.16 FYPO:0009031 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slp1(166-488) slp1 166-488 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPAC821.08c FYPO:0001645 1-165 Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1(166-488) slp1 166-488 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:15791259 4896 2015-05-06 PomBase SPCC330.08 FYPO:0003354 unknown Not assayed or wild type 972 h- alg11 gmd3- unknown ECO:0000335 PMID:11015724 4896 2015-10-13 PomBase SPCC330.08 FYPO:0003354 unknown Not assayed or wild type 972 h- alg11 gmd3- unknown ECO:0000335 PMID:11015724 4896 2015-10-26 PomBase SPCC330.08 FYPO:0004941 unknown Not assayed or wild type 972 h- alg11 gmd3- unknown ECO:0000335 PMID:11015724 4896 2015-10-26 PomBase SPCC330.08 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- alg11 gmd3- unknown ECO:0005638 FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:11015724 4896 2015-10-13 PomBase SPCC330.08 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PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 G505A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-G505A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000118 G505A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-G505A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003431 W54A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-W54A amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:22727667 4896 2014-06-11 PomBase SPAC821.08c FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-deltaC-box unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 Y124YGVPHY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J6 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 Y124YGVPHY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J6 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 Y124YGVPHY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J6 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0000135 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:37792890 4896 2023-10-05 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0004105 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0002627 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37792890 4896 2023-10-05 In the periplasmic space***** glucans were deposited between the PM and the cell wall at the restrictive temperature (Fig 1B). PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0005803 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:37792890 4896 2023-10-05 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0002127 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0003337 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC637.13c) PMID:37792890 4896 2023-10-05 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0002061 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0005465 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0000644 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.01) PMID:37792890 4896 2023-10-06 we predicted that the glucan synthases Ags1, Bgs1, Bgs3, and Bgs4 would localize normally and adjacent to the glucan deposits in css1-3 mutant cells. Indeed, all four proteins localized at tips and septa of css1-3, as in wild-type cells PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0000644 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0000644 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC19B12.03) PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPBC32F12.01c FYPO:0000644 A291V Knockdown 972 h- css1 css1-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 1-50 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta1-50 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 50 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 2B) PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001424 176-768,M20A,K62A,R63A,K64A Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-1-175/M20A/deltaNLS amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 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prototroph rnh1 rnh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC336.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- rnh1 rnh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC336.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnh1 rnh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC336.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnh1 rnh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006892 386-920,H204A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)H204A asp1-(1-385)H204A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPAC644.14c FYPO:0007532 R152A,R324A,K334A Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-II3A rad51-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC644.14c FYPO:0003589 R152A,R324A,K334A Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-II3A rad51-3A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28475874 4896 2017-06-22 PomBase SPAC644.14c FYPO:0006088 R152A,R324A,K334A Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-II3A rad51-3A amino_acid_mutation ECO:0006031 PMID:28475874 4896 2017-06-22 PomBase SPAC644.14c FYPO:0005236 R152A,R324A,K334A Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-II3A rad51-3A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28475874 4896 2017-06-22 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000095 R152A,R324A,K334A Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-II3A rad51-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:28475874 4896 2017-06-22 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000089 R152A,R324A,K334A Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-II3A rad51-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:28475874 4896 2017-06-22 PomBase SPBC776.12c FYPO:0002061 K129A Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-K129A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9705352 4896 2012-08-09 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001045 CTD-T4A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006658 CTD-T4A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 1) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0008028 CTD-T4A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S3) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-T4A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-T4A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-T4A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S2) PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 K23A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2B amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 K23A,R26A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M2B amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002061 F353D,F355D Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-F353D,F355D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15548596 4896 2014-08-11 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000085 F292A Overexpression 972 h- ctp1 ctp1-F292A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000314 high PMID:33836577 4896 2021-06-09 (Figure 3B) PomBase SPAC9G1.06c FYPO:0000674 W43S Not assayed or wild type 972 h- cyk3 cyk3-W43S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure S3) PomBase SPCC622.14 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC622.14 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC622.14 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC622.14 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion 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SPCC622.14 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC622.14 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC622.14 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPCC622.14 SPCC622.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.14 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- 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972 h- SPAC23C4.09c SPAC23C4.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C4.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC23C4.09c SPAC23C4.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC23C4.09c SPAC23C4.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0001531 G380D Not assayed or wild type 972 h- dnm1 dnm1-G380D amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:37590302 4896 2023-08-30 To reduce the complexity in analyzing Dnm1 GTPase activity, we performed colorimetric assays by using the assembly-defective version of Dnm1 (i.e., Dnm1(G380D), see S6A Fig). Interestingly, Dnm1(G380D) still exhibited a GTPase activity but has a very low rate of GTP hydrolysis (Km = 85.00 μM, Vmax = 1.02 μM/min, versus the control Dnm1(WT): Km = 126.59 μM, Vmax = 4.82 μM/min) (S8 Fig). PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 Y366F Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-Y366F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 Y366F Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-Y366F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002101 T543I Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rad12-502 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:12724426 4896 2013-05-09 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0004029 T543I Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rad12-502 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:7623848 4896 2014-11-20 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0004031 T543I Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rad12-502 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005 medium PMID:9092661 4896 2023-11-26 (Figure 5) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0004031 T543I Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rad12-502 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:7623848 4896 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(Fig. 6H) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 101-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-100) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 79 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 101-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-100) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 67 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC962.02c FYPO:0005366 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A,T393A,T831A,T908A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-8A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 1h) PomBase SPCC962.02c FYPO:0007244 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A,T393A,T831A,T908A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-8A amino_acid_mutation ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 1, S4, S5) PomBase SPCC962.02c FYPO:0007244 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A,T393A,T831A,T908A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-8A amino_acid_mutation ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 2a, 2b, S5) PomBase SPCC962.02c FYPO:0004382 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A,T393A,T831A,T908A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-8A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium medium PMID:20739936 4896 2020-02-06 (Fig. 1d, 1k) PomBase SPCC962.02c FYPO:0000091 S202A,S229A,S244A,S278A,S294A,T393A,T831A,T908A Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-8A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 1j) PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000583 E213* Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-E213->STOP crs5 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12827445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001096 E213* Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-E213->STOP crs5 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:12827445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001096 E213* Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-E213->STOP crs5 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 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PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000161 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure S1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000161 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000288 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure S1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001364 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000288 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure S1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002029 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-02-25 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002560 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:9105045 4896 2014-04-04 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25959226 4896 2017-05-06 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002026 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9105045 4896 2014-04-04 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002027 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8834798 4896 2013-03-21 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002156 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-02-25 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001223 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8834798 4896 2013-03-21 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001369 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-02-25 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001368 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure S1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007579 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15517003 4896 2020-12-30 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002442 G718D Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-366 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000703 386-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1-385 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.10) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0004478 mitochondrial ectopic Ectopic 972 h- ync13 mECitrine-Ync13 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Similarly, mECitrine-Ync13 could mistarget Bgs4 and Ags1 to mitochondria (S3B Fig). PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0004478 mitochondrial ectopic Ectopic 972 h- ync13 mECitrine-Ync13 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.01) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Similarly, mECitrine-Ync13 could mistarget Bgs4 and Ags1 to mitochondria (S3B Fig). PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0004478 mitochondrial ectopic Ectopic 972 h- ync13 mECitrine-Ync13 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC584.05) PMID:41144523 4896 2025-12-10 In addition, Ync13 was still able to mistarget Sec1 to mitochondria without Rng10 (S2G Fig). PomBase SPBC2G2.10c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mug110 mug110delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC2G2.10c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mug110 mug110delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC2G2.10c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug110 mug110delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.10c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug110 mug110delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.10c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug110 mug110delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.10c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mug110 mug110delta deletion ECO:0005638 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amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11252721 4896 2014-07-25 PomBase SPCC777.14 FYPO:0004742 C235Y Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-73 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 we surveyed several additional ts lethal splicing mutants for silencing defects at the permissive temperature (11-14). Only particular splicing mutants affected silencing. Silencing of a centromeric cen1:ade6+ marker gene (Fig. 1A) remained intact in the presence of prp1 (Prp6Sc/Hs), prp2 (U2AFHs), prp3 (Prp3Sc/PRPF3Hs), or prp4 (PRPF4BHs) mutations PomBase SPCC777.14 FYPO:0000785 C235Y Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-73 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPBC21.01 FYPO:0000141 221-440 Overexpression 972 h- mis17 mis17(1-220) N-Mis17 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:21445296 4896 2014-12-18 PomBase SPBC17G9.03c FYPO:0003412 krs1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 krs1 krs1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-645 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0004520 362-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-362-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 362-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-362-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001492 362-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-362-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002060 362-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-362-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mgr3 mgr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0000565 deletion 972 h- mgr3 mgr3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 In contrast, long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ displayed a normal growth in low glucose conditions (Fig. 4A). PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0008360 deletion 972 h- mgr3 mgr3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0001309 deletion 972 h- mgr3 mgr3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0001309 deletion 972 h- mgr3 mgr3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2023-11-08 Lack of the mitochondrial protease Lon1 reduced longevity whereas the absence of Mgr3, adaptor protein of the protease Yme1 [13], led to increased lifespan. PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mgr3 mgr3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mgr3 mgr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- mgr3 mgr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mgr3 mgr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mgr3 mgr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F8.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1F8.08 SPAC1F8.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007411 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007409 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007409 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007408 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.17) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007408 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC222.09) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0008037 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:32499400 4896 2023-01-03 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007407 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007407 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0007407 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:32499400 4896 2020-06-24 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0004066 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.11c) PMID:32499400 4896 2020-06-17 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006614 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:32499400 4896 2020-06-12 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006614 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC106.05c) PMID:32499400 4896 2020-06-12 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006614 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:32499400 4896 2020-06-12 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000084 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:32499400 4896 2020-06-12 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003670 N494D Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-N494D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:32499400 4896 2020-06-12 PomBase SPSNRNA.02 FYPO:0003597 GTTGACAG197TACTAGTA Not assayed or wild type 972 h- snu2 snu2-M2 nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.02) PMID:10445882 4896 2014-07-30 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000051 V348A Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-noD nda2noD amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34798057 4896 2021-12-02 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000708 V348A Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-noD nda2noD amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:34798057 4896 2021-12-02 Both mutants displayed meiosis defects with a reduction in gamete numbers and viability more marked in the nda2noD mutant (Figures 6A, 6B, and 6C). PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000836 V348A Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-noD nda2noD amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:34798057 4896 2021-12-02 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000309 V348A Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-noD nda2noD amino_acid_mutation ECO:0001232 75 PMID:34798057 4896 2021-12-02 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000091 V348A Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-noD nda2noD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:34798057 4896 2021-12-02 (Figure S7A) PomBase SPBP8B7.20c FYPO:0003412 nop2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 nop2 nop2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC23G7.16 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ctr6 ctr6delta deletion ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPAC1565.06c),assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001128 T42A Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-T42A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001919 T42A Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-T42A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000705 T527A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-TA amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:11818066 4896 2021-01-11 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002900 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004217 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:27098497 4896 2016-08-11 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004217 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000112 PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1, Figure 1D) shows that the modification is specifically Set9 dependent, as loss of Set9 but not Set1, Set2, Set6, or Clr4 resulted in essentially undetectable mono-, di-, and trimethylated H4-K20. PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004216 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004218 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004218 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000112 PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1, Figure 1D) shows that the modification is specifically Set9 dependent, as loss of Set9 but not Set1, Set2, Set6, or Clr4 resulted in essentially undetectable mono-, di-, and trimethylated H4-K20. PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004232 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC1834.03c) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002898 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000425 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 5) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002471 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004224 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000112 high PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 1) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0007272 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000425 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 5) Crb2 phosphorylation is markedly compromised in the absence of Set9, even at low IR doses (Figure 5A). PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002897 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000425 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1259.13) PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 4C) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004228 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004372 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000425 medium PMID:15550243 4896 2024-03-18 set9 cells arrested similar to wt but reentered mitosis markedly faster. Unlike wt, 20%-30% of set9 cells exhibited an abberant or “cut-like” mitotic phenotype. Fig. 4 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009008 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0003082 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000337 PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0001690 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24806815 4896 2014-06-26 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0001164 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24806815 4896 2014-06-26 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000964 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 PMID:15550243 4896 2024-03-25 Neither loss of Set9 protein, its catalytic activity, nor its H4-K20 substrate rendered cells hypersensitive to TBZ over a range of concentrations (10-30 μg/ml) or temperatures (18°C-36°C) (Figure 2D PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002601 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0003132 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-26 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000441 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009032 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009047 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000371 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0001453 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000725 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000725 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000725 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009039 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000077 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009042 deletion 972 h- set9 set9delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000830 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000085 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:15550243 4896 2024-03-18 resulted in cells hyper-sensitive to DNA damage induced by ultraviolent (UV) light, ionizing radiation (IR), and the topoisomerase I poison camptothecin (CPT) (Figure 3A). PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000265 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 3) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000267 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 medium PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0007925 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0000268 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 medium PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0009063 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 4D) PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set9 set9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- set9 set9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-11-03 PomBase SPCC4B3.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set9 set9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC830.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mug128 mug128delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug128 mug128delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug128 mug128delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.04c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mug128 mug128delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug128 mug128delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mug128 mug128delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug128 mug128delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC830.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug128 mug128delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC830.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug128 mug128delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007160 478-544 Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-deltaWHD partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000140 high PMID:38376141 4896 2024-07-10 In contrast, when we complemented the depleted extract with SpCAF-1 mutant complexes SpCAF-1-ED*, SpCAF-1-KER*, SpCAF- 1-ΔWHD we did not detect the supercoiled form I. This indicates that these mutants cannot promote nucleosome assembly (Figure 5). PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0004742 478-544 Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-deltaWHD partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:38376141 4896 2024-07-12 (Fig. 7A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007542 478-544 Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-deltaWHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 FYECO:0000140 assayed_using(GO:0033186) PMID:38376141 4896 2024-07-12 We observed the similar DNA binding property and IDR properties for SpCAF-1-ΔWHD and the WT complex (Table 1, Figure 3B, Figure 3—Figure supplement 2G, Figure 3—Figure supplement 3A-B). PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007328 478-544 Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-deltaWHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:38376141 4896 2024-07-12 (Fig. 7B and C) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0000703 478-544 Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-deltaWHD partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:38376141 4896 2024-07-12 (Fig. 6) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0004910 478-544 Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-deltaWHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.03) PMID:38376141 4896 2024-07-12 (Fig. 6C and D) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPBC660.13c) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002098 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 low assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000972 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000092 FYECO:0000103,FYECO:0000126 high PMID:20885790 4896 2018-09-25 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002573 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000092 FYECO:0000103,FYECO:0000126 high PMID:20885790 4896 2018-09-25 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0007479 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. S1B) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0007035 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002899 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0001807 FYECO:0000211 assayed_protein(PomBase:SPCC1259.13) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002899 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:20885790 4896 2018-09-27 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002099 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009110 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000434 low PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0003824 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0001103 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000097 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:20885790 4896 2018-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000102 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000102 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0003559 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25701403 4896 2015-03-27 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0003559 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 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SPCC23B6.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:20885790 4896 2018-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000091 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000268 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0000268 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:20885790 4896 2018-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0004983 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0001492 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:20885790 4896 2018-09-24 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- ssb3 ssb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC23B6.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssb3 ssb3delta deletion ECO:0001232 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The figure shows tubulin immunofluorescence and DAPI signals of cells 3 hours after release to reveal the characteristic ‘crows foot’ configuration of microtubules of cut7 mutants as the two halves of the mitotic spindle fail to interdigitate. 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PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0001324 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:19330768 4896 2016-03-09 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0001324 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:19330768 4896 2016-03-09 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0001324 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:19330768 4896 2016-03-09 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0001861 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:17004072 4896 2016-03-02 (Figure 2a) PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0005638 medium PMID:17004072 4896 2016-03-02 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0002080 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-t1 unknown ECO:0005638 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SPBC543.07 FYPO:0002133 T238A Not assayed or wild type 972 h- pek1 pek1-A pek1A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01),assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:12931193 4896 2013-05-09 PomBase SPBC543.07 FYPO:0001571 T238A Not assayed or wild type 972 h- pek1 pek1-A pek1A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC119.08),assayed_using(PomBase:SPBC543.07) PMID:10365961 4896 2014-07-29 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002138 T238A Not assayed or wild type 972 h- pek1 pek1-A pek1A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-09 PomBase SPBC543.07 FYPO:0001190 T238A Not assayed or wild type 972 h- pek1 pek1-A pek1A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10365961 4896 2014-07-29 PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- hta2 hta2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hta2 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prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sds23 sds23delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000470 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC646.13 FYPO:0003650 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001324 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001324 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005467 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005467 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005467 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0003032 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-13 the level of ght5 transcription, which increases in the WT during glucose limitation, fails to increase in this mutant cells in low-glucose medium. PomBase SPBC646.13 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001355 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBC646.13 FYPO:0008128 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:25411338 4896 2015-08-13 PomBase SPBC646.13 FYPO:0008128 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009007 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC646.13 FYPO:0004653 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0004653 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002562 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002562 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002562 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000133 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 PMID:8978689 4896 2024-12-05 The cell division rates of Asds23 at the permissive temperatures were exceedingly slow.The generation times in rich YPD medium were 5.7(3.3) and 4.3(2.2) h at2 6 and 33°C, respectively; the values in parenthesis are the generation times for the wild-type strain.) PomBase SPBC646.13 FYPO:0001122 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0003417 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0003417 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0003417 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001130 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000139,FYECO:0000142,FYECO:0000225,FYECO:0000226,FYECO:0000381 high high assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:35924983 4896 2023-07-06 (Figure 6) PomBase SPBC646.13 FYPO:0001309 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC646.13 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC646.13 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000238 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8978689 4896 2024-12-05 Heterozygous diploids verified by Southern hybridization (lower panel) yielded four viable spores at 26 or 33°C with Ade+ segregating 2+:2-, indicating that the sds23+ gene was not essential for viability. Colonies were not formed at 22 or 36°C, however (Figure 6B), indicating that the gene-disrupted Asds23 causes cold and temperature sensitivity. PomBase SPBC646.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:8978689 4896 2024-12-05 Heterozygous diploids verified by Southern hybridization (lower panel) yielded four viable spores at 26 or 33°C with Ade+ segregating 2+:2-, indicating that the sds23+ gene was not essential for viability. Colonies were not formed at 22 or 36°C, however (Figure 6B), indicating that the gene-disrupted Asds23 causes cold and temperature sensitivity. PomBase SPBC646.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC646.13 FYPO:0006660 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002071 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000339 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005905 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0006722 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0006876 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002999 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:31553675 4896 2020-07-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005035 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000776 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPBC646.13 FYPO:0006187 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 PMID:31553675 4896 2020-07-21 PomBase SPBC646.13 FYPO:0004841 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000271 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000031 PMID:21869531 4896 2011-09-28 PomBase SPBC646.13 FYPO:0000797 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC646.13 FYPO:0006821 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 PMID:8978689 4896 2024-12-05 The cell division rates of Asds23 at the permissive temperatures were exceedingly slow.The generation times in rich YPD medium were 5.7(3.3) and 4.3(2.2) h at2 6 and 33°C, respectively; the values in parenthesis are the generation times for the wild-type strain.) PomBase SPBC646.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- sds23 sds23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8978689 4896 2024-12-05 Heterozygous diploids verified by Southern hybridization (lower panel) yielded four viable spores at 26 or 33°C with Ade+ segregating 2+:2-, indicating that the sds23+ gene was not essential for viability. Colonies were not formed at 22 or 36°C, however (Figure 6B), indicating that the gene-disrupted Asds23 causes cold and temperature sensitivity. PomBase SPBC646.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sds23 sds23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F7.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 has1 has1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F7.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- has1 has1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F7.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 has1 has1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-535,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-535,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-535,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-535,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-535,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-535,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC110.03 FYPO:0004918 T17N Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-T17N cdc42-N17 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1F5.09c) PMID:9660818 4896 2019-10-04 PomBase SPAC110.03 FYPO:0000705 T17N Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-T17N cdc42-N17 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC110.03),assayed_using(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:7597098 4896 2014-08-12 PomBase SPAC110.03 FYPO:0000705 T17N Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-T17N cdc42-N17 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC110.03),assayed_using(PomBase:SPAC1F5.09c) PMID:9660817 4896 2018-05-11 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002060 T17N Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-T17N cdc42-N17 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10593886 4896 2015-12-02 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0000190 wild type Overexpression 972 h- vtc1 nrf1+ wild_type ECO:0001232 high PMID:10628977 4896 2019-06-14 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0002414 wild type Overexpression 972 h- vtc1 nrf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10628977 4896 2019-06-14 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- vtc1 nrf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10628977 4896 2019-06-14 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0000123 wild type Overexpression 972 h- vtc1 nrf1+ wild_type ECO:0001232 30 PMID:10628977 4896 2019-06-14 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 K120R,N153T Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001690 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 K78R,Y111N,R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPCC962.02c FYPO:0004412 842-997 Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-841 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008011 W44G Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-W44G amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7C) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003096 W44G Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-W44G amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003573 W44G Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-W44G amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002386 W44G Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-W44G amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005865 W44G Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-W44G amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7B) PomBase SPCC1393.13 FYPO:0004303 D290A Overexpression 972 h- duf89 duf89-D290A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1393.13) PMID:35314193 4896 2022-10-21 (Figures 1 and 3) PomBase SPSNORNA.53 FYPO:0003721 disruption Null 972 h- snR88 snR88::kanR(nt-249) disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:17222800 4896 2014-08-28 PomBase SPSNORNA.53 FYPO:0003721 disruption Null 972 h- snR88 snR88::kanR(nt-249) disruption ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000201 PMID:17222800 4896 2014-08-28 PomBase SPSNORNA.53 FYPO:0000633 disruption Null 972 h- snR88 snR88::kanR(nt-249) disruption ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201 PMID:17222800 4896 2014-08-28 PomBase SPSNORNA.53 FYPO:0003720 disruption Null 972 h- snR88 snR88::kanR(nt-249) disruption ECO:0000337 PMID:17222800 4896 2014-08-28 PomBase SPBC19G7.18c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPBC19G7.18c SPBC19G7.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.18c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph SPBC19G7.18c SPBC19G7.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.18c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBC19G7.18c SPBC19G7.18cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC19G7.18c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC19G7.18c SPBC19G7.18cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.18c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph 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2014-10-30 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000228 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:12455694 4896 2014-10-30 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003969 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:12455694 4896 2014-11-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003166 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:12455694 4896 2014-10-30 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000088 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:12455694 4896 2014-10-30 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000267 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:12455694 4896 2014-10-30 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000089 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:12455694 4896 2014-10-30 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000091 W109* Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:12455694 4896 2014-10-30 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001972 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-24 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000806 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1652.02) PMID:19543678 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000305 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002196 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2f) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002196 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1652.02) PMID:19543678 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0006899 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 (Fig. 5c) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0006901 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-24 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0003203 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001082 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 3d) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0004441 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:36200871 4896 2023-02-02 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0008063 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0000059 PMID:36200871 4896 2023-02-03 The peak amplitude of the calcium spikes in pkd2-B42 cells was similarly reduced by 62% (Figure 4D). PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0003339 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 low PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0005628 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2d) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002021 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000223 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 11 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2f) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0008115 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 low PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2e) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001327 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000298 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2g) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001130 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0006897 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:31116668 4896 2019-05-24 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000650 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001406 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001489 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 5 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2f) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2d) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000339 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001368 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0006005 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 (Fig. 4) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0006898 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0004078 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 low PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2e) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0005947 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 5C)) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002442 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002442 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002442 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002714 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1652.02) PMID:19543678 4896 2019-05-16 (Fig. 3c PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0008114 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 low PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2e) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000094 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 low PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2e) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000098 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 high PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 2e) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000098 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000261 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 5.) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001190 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:15537393 4896 2023-07-06 (Figure 3c) PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000271 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000271 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0000271 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0001496 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 10 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC1F7.03 FYPO:0002106 wild type Knockdown 972 h- pkd2 pkd2+ pkd2-81KD wild_type ECO:0001232 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003748 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003230 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Fig. 1a) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003230 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000226 PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003230 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000226 PMID:24713849 4896 2014-08-14 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:23980030 4896 2013-12-02 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC9.03c) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC4F8.12c) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPBC215.12) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPBC31F10.11c) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC644.12) PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001355 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:33574613 4896 2021-03-15 We indeed observed that pir1∆ cells exhibited a growth defect on minimal medium PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003557 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1365) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) COULD ALSO ADD TO ANTISENS RPL402, BUT NOT ANNOTATED PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC70.09c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1952.15c) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:36002457 4896 2024-01-12 We observed that the red1-L205R mutation had an effect on both Iss10 and Red1 localization by, respectively, inducing the disappearance of Iss10 nuclear foci and the increase in the number of Red1 foci per nucleus (Fig. 3c-e) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Deletion of iss10 or mmi1 only affects meiotic mRNAs PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.09c) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002960 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002173 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002173 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002173 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 iss10 iss10delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000674 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0002567 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000291 PMID:24713849 4896 2014-08-29 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 iss10 iss10delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001164 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003235 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000226 PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0003235 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0000226 PMID:24713849 4896 2014-08-14 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001357 deletion 972 h- iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33574613 4896 2021-03-15 We indeed observed that pir1∆ cells exhibited a growth defect on minimal medium PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.14c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph iss10 iss10delta deletion ECO:0005638 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2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 313-683 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-1-312 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 313-683 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-1-312 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 313-683 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-1-312 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC800.09) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 313-683 Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-1-312 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 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partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPCC1682.04 FYPO:0000608 E147K Knockdown 972 h- cdc31 cdc31-E147K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 (Figure 7) PomBase SPCC1682.04 FYPO:0003165 E147K Knockdown 972 h- cdc31 cdc31-E147K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 (Figure 6A) PomBase SPCC1682.04 FYPO:0005023 E147K Knockdown 972 h- cdc31 cdc31-E147K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 (Figure 7) (this protrusion is opposite side of nucleus to the SPB) PomBase SPCC1682.04 FYPO:0002061 E147K Knockdown 972 h- cdc31 cdc31-E147K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 (Figure 6A) PomBase SPCC1682.04 FYPO:0003788 E147K Knockdown 972 h- cdc31 cdc31-E147K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 (Figure 7) (this protrusion is opposite side of nucleus to the SPB) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000941 FN519AA Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-FN519AA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 FN519AA Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-FN519AA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000118 FN519AA Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-FN519AA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004562 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000110,FYECO:0000227 20 PMID:39916665 4896 2025-03-03 (Fig. 3C, 3D) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000082 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. 1C) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0009007 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000272 PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. 2A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004710 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000110,FYECO:0000126 PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. S2) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000228 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000201,FYECO:0000300 30 PMID:39916665 4896 2025-03-03 (Fig. 4C, 4D) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0006518 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0003166 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000110,FYECO:0000227 9.7 PMID:39916665 4896 2025-03-03 (Fig. 3C, 3D) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001357 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. 1C) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0003241 L296F,P368L Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-450 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000201,FYECO:0000300 25 PMID:39916665 4896 2025-03-03 (Fig. 4C, 4D) PomBase SPBC216.07c FYPO:0000708 L2233H Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-L2233H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17360675 4896 2016-01-18 PomBase SPAPB24D3.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.02c SPAPB24D3.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.02c SPAPB24D3.02cdelta deletion ECO:0005638 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SPAC2E12.02 FYPO:0000658 505-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta505-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2E12.02),assayed_using(SO:0001850) PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0001037 505-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta505-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0001037 505-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta505-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 505-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta505-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 505-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta505-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 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mre11-H134S nbs1 nbs1-RKAA amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000085 R27A,K45A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-RKAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000088 R27A,K45A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-RKAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000267 R27A,K45A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-RKAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug10 mug10delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug10 mug10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug10 mug10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug10 mug10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0000141 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:21965289 4896 2024-12-03 Nevertheless, we found that both Δnsk1 and Δdis2 cells missegregate chromosome 1, and that this is exacerbated in Δnsk1 Δdis2 double mutants (Figure 1C). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0000502 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0000059 PMID:21965289 4896 2012-11-13 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0006800 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 9 PMID:21965289 4896 2012-12-01 In 9.0% of interphase Δnsk1 cells, one pair of sister kinetochores failed to cluster near the SPB during interphase (Figure 7A). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0003216 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:40406582 4896 2025-06-09 For this, we monitored for de-repression of the ura4+ reporter gene that had been integrated into the normally silenced rDNA repeats (Jin et al., 2007; Thon and Verhein-Hansen, 2000). Depression of the ura4+ reporter in this context leads to enhanced growth on plates lacking exogenous uracil and increased sensitivity to 5-fluoroorotic acid (5-FOA). By this assay, we found that rDNA silencing was partially relieved in nsk1∆ cells (Figure 1A) and to the same extent as in dnt1∆ cells (Jin et al., 2007). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002636 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-19 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002638 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-19 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph nsk1 nsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph nsk1 nsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002639 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-19 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0001840 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0000059 1 PMID:21965289 4896 2024-12-05 Nevertheless, the chromosome loss rate was considerably worse in Δnsk1 Δmad2 cells than in Δnsk1 single mutant (Table 1). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0001861 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nsk1 nsk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0000324 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 10 PMID:21965289 4896 2024-12-03 We found that both Δnsk1 and Δdis2 cells are delayed in the timing of anaphase onset and that this effect is exacerbated in Δnsk1 Δdis2 double mutants (Figure 1D). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nsk1 nsk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0004329 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.20c) PMID:40406582 4896 2025-06-10 Time-lapse imaging of 21 nsk1+ and 42 nsk1∆ cells showed that Gar2-GFP segregated equally and without lagging in all cells (Figure 1E). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002965 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC140.02) PMID:40406582 4896 2025-06-09 Gar2-GFP, a nucleolar marker and ortholog of human nucleolin (Gulli et al., 1995; Rutherford et al., 2024), localized normally within the nucleolus of nsk1∆ cells, as did two other nucleolar proteins, Nop2, a rRNA methyltransferase involved in ribosome biogenesis (Rutherford et al., 2024), and Nuc1 (Hirano et al., 1989) (Figure 1D). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002965 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:40406582 4896 2025-06-09 Gar2-GFP, a nucleolar marker and ortholog of human nucleolin (Gulli et al., 1995; Rutherford et al., 2024), localized normally within the nucleolus of nsk1∆ cells, as did two other nucleolar proteins, Nop2, a rRNA methyltransferase involved in ribosome biogenesis (Rutherford et al., 2024), and Nuc1 (Hirano et al., 1989) (Figure 1D). PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0002965 deletion 972 h- nsk1 nsk1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.20c) PMID:40406582 4896 2025-06-09 Gar2-GFP, a nucleolar marker and ortholog of human nucleolin (Gulli et al., 1995; Rutherford et al., 2024), localized normally within the nucleolus of nsk1∆ cells, as did two other nucleolar proteins, Nop2, a rRNA methyltransferase involved in ribosome biogenesis (Rutherford et al., 2024), and Nuc1 (Hirano et al., 1989) (Figure 1D). 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2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 N50NRGTPN Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K3 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0007962 S22A Not assayed or wild type 972 h- byr1 byr1-S22A byr1.S22A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:33823663 4896 2022-03-08 PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0001147 S22A Not assayed or wild type 972 h- byr1 byr1-S22A byr1.S22A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:33823663 4896 2022-03-08 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 mei2(1-745)-(KKKRKVCRP) Overexpression 972 h- mei2 mei2-NLS fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 mei2(1-745)-(KKKRKVCRP) Overexpression 972 h- mei2 mei2-NLS fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 mei2(1-745)-(KKKRKVCRP) Overexpression 972 h- mei2 mei2-NLS fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 mei2(1-745)-(KKKRKVCRP) Overexpression 972 h- mei2 mei2-NLS fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002964 mei2(1-745)-(KKKRKVCRP) Overexpression 972 h- mei2 mei2-NLS fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12553909 4896 2013-04-25 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0004198 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. 4G, 4H) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001920 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:26527280 4896 2020-06-16 (Figure S2F export of CDK1 from the nucleus, which depends on cyclin B degradation ,, was delayed PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000274 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0001232 medium PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. 3E, 3F) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:17178839 4896 2016-06-13 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0001232 PMID:26527280 4896 2020-06-16 (Fig. 1I) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- cut2 cut2+ cut2-GFP OE wild_type ECO:0005638 PMID:9312055 4896 2017-02-02 (Fig. 1b) PomBase SPNCRNA.900 FYPO:0000251 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.900 SPNCRNA.900+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000289 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.900 FYPO:0009022 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.900 SPNCRNA.900+ wild_type ECO:0005638 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type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 5) PomBase SPBC4.07c FYPO:0000836 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 5) PomBase SPBC4.07c FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-03-02 PomBase SPBC4.07c FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000229,FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 1C) PomBase SPBC4.07c FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:23209828 4896 2016-11-29 PomBase SPBC4.07c FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-14 (Fig. S1) PomBase SPBC4.07c FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPBC4.07c FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 PMID:12553909 4896 2013-05-09 PomBase SPBC4.07c FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 Lsd1 (Fig 4A) or Lsd2 (Fig 4B) was detected in the presence of a temperature-sensitive 26S proteasome subunit mutant, mts2-1, which inactivates the proteasome at 33 ̊C [111] and thereby stabilizes Lsd1 and Lsd2 (Fig 4A and 4B). PomBase SPBC4.07c FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 Lsd1 (Fig 4A) or Lsd2 (Fig 4B) was detected in the presence of a temperature-sensitive 26S proteasome subunit mutant, mts2-1, which inactivates the proteasome at 33 ̊C [111] and thereby stabilizes Lsd1 and Lsd2 (Fig 4A and 4B). PomBase SPBC4.07c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:12553909 4896 2013-04-24 PomBase SPBC4.07c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPBC4.07c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4.07c FYPO:0003166 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0001232 40 PMID:8247131 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4.07c FYPO:0001133 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005580 PMID:8247131 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4.07c FYPO:0003027 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:18023413 4896 2014-09-01 PomBase SPBC4.07c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:12553909 4896 2013-04-24 PomBase SPBC4.07c FYPO:0000784 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.05) PMID:12006658 4896 2014-02-18 PomBase SPBC4.07c FYPO:0000067 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4.07c FYPO:0000073 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4.07c FYPO:0004025 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 PMID:8247131 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4.07c FYPO:0004025 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4.07c FYPO:0000767 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4.07c FYPO:0003241 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0001232 PMID:8247131 4896 2018-06-11 PomBase SPBC4.07c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 mts2-1 rpt2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000085 228-352 Not assayed or wild type 972 h- dsk1 dsk1-spacerdelta-5FLAG partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 In line with this, the spacer truncation mutant was also sensitive to CPT (Figure 1e). PomBase SPBC530.03c FYPO:0000082 1-121 Overexpression 972 h- bag102 bag102-BAG partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 medium PMID:27966061 4896 2017-01-04 PomBase SPAPB1A10.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A10.13 SPAPB1A10.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.13 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A10.13 SPAPB1A10.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.13 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAPB1A10.13 SPAPB1A10.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAPB1A10.13 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAPB1A10.13 SPAPB1A10.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAPB1A10.13 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A10.13 SPAPB1A10.13delta deletion 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SPCC1682.04 FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc31 cdc31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.04 FYPO:0000276 deletion 972 h- cdc31 cdc31delta deletion ECO:0005638 PMID:12857865 4896 2018-03-06 (Fig. 4) PomBase SPBC947.04 FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- pfl3 pfl3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 3) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000705 ATG(1-3)TAA Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-ATG nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0002133 ATG(1-3)TAA Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-ATG nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 2C) Abolished interaction between Tti2 protein and tra1 mRNA PomBase SPBC1604.21c FYPO:0008051 D813A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-D813A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1604.21c) PMID:28572513 4896 2023-02-20 PomBase SPAC806.04c FYPO:0004303 N249A Overexpression 972 h- duf8901 duf8901-N249A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC806.04c) PMID:35314193 4896 2022-10-21 (Figure 8) PomBase SPBC776.02c FYPO:0006020 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),occurs_at(SO:0002213) PMID:29899453 4896 2018-07-17 Extended Data Fig 10 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002679 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c),residue(T316) PMID:29899453 4896 2018-07-03 (Fig. 1b) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001838 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c),residue(T316) PMID:7957097 4896 2015-12-03 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002980 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Fig. 6a, b) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001327 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001759 T316A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-17 (Fig. 1d) PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr leu3 leu3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph leu3 leu3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph leu3 leu3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph leu3 leu3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph leu3 leu3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 leu3 leu3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC3E7.16c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph leu3 leu3delta deletion ECO:0005638 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(Fig. 1F ang G) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 730-1372 Overexpression 972 h- fus1delta fus1 fus1-N(1-730) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3D) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003527 730-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(1-730) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0000611 S811SIRGTP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-44 amino_acid_insertion ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0004481 S811SIRGTP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-44 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0005183 S811SIRGTP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-44 amino_acid_insertion ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 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SPAC227.07c FYPO:0006822 I228ITEVI Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-1 amino_acid_insertion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0000044 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001869 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0005801 PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001660 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000335 PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0002199 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 PMID:15189983 4896 2022-11-09 unlike JSP12 (git2􏰇 spc1-12) and JSP29 (git2􏰇 wis1-29), cells that elongate and die, cells of the parental strain FWP190 (git2􏰇) appear to simply arrest growth (Fig. 2) PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0000961 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 PMID:15189983 4896 2022-11-09 he FWP190 (git2􏰇) cells can grow in the presence of 2 M sorbitol, which is lethal to JSP12 (git2􏰇 spc1-12) and JSP29 (git2􏰇 wis1-29) cells. Therefore, the loss of adenylate cyclase appears to confer a salt-sensitive, but not an osmotically sensitive, growth defect. PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001865 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000056,FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0004325 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:15189983 4896 2022-11-09 (Figure 1) PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001214 1268-4057 Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-1 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 PMID:15189983 4896 2022-11-09 git2􏰇 strains themselves were severely defective for growth on YEA medium containing 1 M KCl (Fig. 1). PomBase SPBC11C11.08 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- srp1 srp1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9421507 4896 2015-09-30 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000444 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0001343 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003548 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000110,FYECO:0000229 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003165 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 7 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0001355 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 medium PMID:18414064 4896 2015-12-18 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003004 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003004 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000377 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000377 V43A,C71R,Y177C,P191S,I352T Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H19 orp5-H19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high 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etd1-1 unknown ECO:0001232 PMID:15933715 4896 2022-09-29 Spores deleted for etd1 (etd1D) germinated and accumulated multiple nuclei without septation, an identical phenotype to that of etd1-1 mutant cells under restrictive conditions (Figure 1C). PomBase SPAC1006.08 FYPO:0001493 unknown Not assayed or wild type 972 h- etd1 etd1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPAC1006.08 FYPO:0001493 unknown Not assayed or wild type 972 h- etd1 etd1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000212 PMID:15933715 4896 2022-09-29 (Figure 1A and B) PomBase SPAC1006.08 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- etd1 etd1-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPAC1006.08 FYPO:0000842 unknown Not assayed or wild type 972 h- etd1 etd1-1 unknown ECO:0001232 PMID:15933715 4896 2022-09-29 (Figure 1A and B) PomBase SPAC1006.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- etd1 etd1-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPCC70.12c FYPO:0001117 deletion 972 h- ecl1 ecl1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:24696293 4896 2015-04-17 PomBase SPCC70.12c FYPO:0007086 deletion 972 h- ecl1 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972 h- ecl1 ecl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24696293 4896 2015-04-17 PomBase SPAC14C4.04 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.04 SPAC14C4.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.04 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.04 SPAC14C4.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.04 SPAC14C4.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.04 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.04 SPAC14C4.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.04 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPAC14C4.04 SPAC14C4.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.04 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assayed_protein(PomBase:SPAC2C4.10c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 We found that this is also true for Csc4. Csc4-GFP was not detected at SPBs in csc1∆, csc2∆, csc3∆ or ppa3∆ cells (Figure S1A). 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SPBC839.19 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph new20 new20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.19 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph new20 new20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.19 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph new20 new20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.19 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph new20 new20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.19 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph new20 new20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.19 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph new20 new20delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho842 pho842delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002023 1-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2delta1-300 rng2-CHDdeltaCykFdelta|rng2-delta1-300|rng2deltaNs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 90 PMID:38041816 4896 2024-07-01 However, when both domains were deleted together (rng2-CHDΔ-CykFΔ), most cells showed strong defects in cytokinesis, especially at 36°C, where >90% of the cells formed cell chains with various abnormal septa, including some “catastrophic” structures (Figures 5B-5D). PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002023 1-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2delta1-300 rng2-CHDdeltaCykFdelta|rng2-delta1-300|rng2deltaNs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 50 PMID:38041816 4896 2024-07-01 However, when both domains were deleted together (rng2-CHDΔ-CykFΔ), most cells showed strong defects in cytokinesis, especially at 36°C, where >90% of the cells formed cell chains with various abnormal septa, including some “catastrophic” structures (Figures 5B-5D). PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0001008 1-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2delta1-300 rng2-CHDdeltaCykFdelta|rng2-delta1-300|rng2deltaNs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19713940 4896 2017-12-19 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002024 1-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2delta1-300 rng2-CHDdeltaCykFdelta|rng2-delta1-300|rng2deltaNs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19713940 4896 2017-12-19 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0006304 1-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2delta1-300 rng2-CHDdeltaCykFdelta|rng2-delta1-300|rng2deltaNs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19713940 4896 2017-12-19 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002060 1-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2delta1-300 rng2-CHDdeltaCykFdelta|rng2-delta1-300|rng2deltaNs partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- tea1 alp8-1146 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 unknown Not assayed or wild type 972 h- tea1 alp8-1146 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 low PMID:9658169 4896 2015-07-08 PomBase SPBC146.05c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf25 cwf25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.05c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf25 cwf25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- cwf25 cwf25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC146.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf25 cwf25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001355 L78P Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-8 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PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0003445 D147N Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-D147N amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20404181 4896 2014-06-11 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0005627 D147N Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-D147N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 medium medium PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 3C PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0001420 D147N Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-D147N amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20404181 4896 2014-06-13 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0005624 D147N Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-D147N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 high PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 3C PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000268 D147N Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-D147N amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20404181 4896 2014-06-11 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000620 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000324 PMID:11460168 4896 2024-04-16 Cells that lack Mad2 arrest in metaphase in the presence of Lat B (Fig. 3a) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004308 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0001796) PMID:11882285 4896 2018-05-02 (Fig. S1) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000151 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:26696398 4896 2016-08-09 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000141 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 complete PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000141 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 low PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15930132 4896 2016-11-11 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000290 high PMID:20967237 4896 2019-07-01 (Fig. 1A,B) In the presence of MBC the % cut cells in wild type is almost identical to mad2 Delta at 32 and 35°c suggesting that the spindle assembly checkpoint is not active or overidden above 32°C in wild type cells in presence of MBC. PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 deletion 972 h- nda3-KM311 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1A) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 deletion 972 h- cut7-446 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S2A) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 deletion 972 h- psc3-1T mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S2B) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 PMID:26258632 4896 2016-01-19 (Fig. 3 a,b) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000229 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0001055 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:12186944 4896 2014-09-22 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0003606 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. S4) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0005781 deletion 972 h- nda3-KM311 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0008165 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5B) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0007581 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000235 PMID:19736319 4896 2021-01-02 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000639 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000290 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 7) The spindle and the proximity of the nucleus to the division site are required for proper septum synthesis activation in fission yeast. (A) Scheme of the steps required to prevent nuclear separation and to maintain or separate the undivided nucleus from the cell middle and/or from the division site. (A-1 and C) Nucleus and division site are maintained in the cell middle; cells were treated for 90 min and imaged with methyl 2-benzimidazolecarbamate (or carbendazim, MBC, 50 μg ml-1) to avoid spindle assembly and nuclear separation. (A-2 and D) Nucleus and division site are relocated to a cell end; cells were treated for 45 min, centrifuged to displace the nucleus, treated 45 more min and visualized with MBC. (A-3 and E) The nucleus is relocated and separated from the division plane; cells were treated for 90 min, centrifuged and examined with MBC. (B) mad2Δ cells were grown and imaged without MBC as in Fig 1. The mad2Δ cells were used to avoid a delay caused by the activation of the spindle assembly checkpoint. (C-E) The premature and uncoupled septation start caused by the absence of the spindle depends on the position of the nucleus. mad2Δ cells were processed as in A to prevent nuclear separation and to maintain or separate the undivided nucleus from the cell middle and/or the division site. (C) The nucleus and division site are maintained in the cell middle. (F) The nucleus and division site are relocated to a cell end. (E) The nucleus is relocated and separated from the division plane. MBC-treated cells were imaged as in B. Anaphase A onset was considered as time zero. Graphs to the right are as in Fig 4. Dashed lines and arrowheads: green, anaphase A onset; dark blue, septum synthesis start; light blue septum ingression onset. White arrowhead: first CW-stained septum synthesis detection. White arrow: first CW-staining increase showing septum ingression. A.U., arbitrary units. (F) Uncoupled septum synthesis and ingression timing with MBC is restored to wild-type levels when the undivided nucleus is separated from the division site. Table showing the time between anaphase A (green) and septum synthesis start (dark blue) or septum ingression onset (light blue) in the indicated cells. Parenthesis: n, number of experiments and cells; T, delay in septum synthesis and ingression start with respect to control cells with MBC as in C. PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004101 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 low PMID:28455357 4896 2017-10-19 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004307 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 PMID:28455357 4896 2017-10-19 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mad2 mad2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000674 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000674 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002141 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0006257 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 PMID:28455357 4896 2017-10-19 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mad2 mad2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000969 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0001164 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:28567704 4896 2017-10-20 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0001164 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000957 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002442 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:12186944 4896 2014-09-22 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0006641 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:11909965 4896 2019-05-11 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0005212 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4A and S7) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0005212 deletion 972 h- nda3-KM311 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4B and S5) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0005212 deletion 972 h- nda3-KM311 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.01) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4A and S1) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002967 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12186944 4896 2014-09-22 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0001904 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000235 73 PMID:19736319 4896 2021-01-02 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0006832 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000290 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 7) The spindle and the proximity of the nucleus to the division site are required for proper septum synthesis activation in fission yeast. (A) Scheme of the steps required to prevent nuclear separation and to maintain or separate the undivided nucleus from the cell middle and/or from the division site. (A-1 and C) Nucleus and division site are maintained in the cell middle; cells were treated for 90 min and imaged with methyl 2-benzimidazolecarbamate (or carbendazim, MBC, 50 μg ml-1) to avoid spindle assembly and nuclear separation. (A-2 and D) Nucleus and division site are relocated to a cell end; cells were treated for 45 min, centrifuged to displace the nucleus, treated 45 more min and visualized with MBC. (A-3 and E) The nucleus is relocated and separated from the division plane; cells were treated for 90 min, centrifuged and examined with MBC. (B) mad2Δ cells were grown and imaged without MBC as in Fig 1. The mad2Δ cells were used to avoid a delay caused by the activation of the spindle assembly checkpoint. (C-E) The premature and uncoupled septation start caused by the absence of the spindle depends on the position of the nucleus. mad2Δ cells were processed as in A to prevent nuclear separation and to maintain or separate the undivided nucleus from the cell middle and/or the division site. (C) The nucleus and division site are maintained in the cell middle. (F) The nucleus and division site are relocated to a cell end. (E) The nucleus is relocated and separated from the division plane. MBC-treated cells were imaged as in B. Anaphase A onset was considered as time zero. Graphs to the right are as in Fig 4. Dashed lines and arrowheads: green, anaphase A onset; dark blue, septum synthesis start; light blue, septum ingression onset. White arrowhead: first CW-stained septum synthesis detection. White arrow: first CW-staining increase showing septum ingression. A.U., arbitrary units. (F) Uncoupled septum synthesis and ingression timing with MBC is restored to wild-type levels when the undivided nucleus is separated from the division site. Table showing the time between anaphase A (green) and septum synthesis start (dark blue) or septum ingression onset (light blue) in the indicated cells. Parenthesis: n, number of experiments and cells; T, delay in septum synthesis and ingression start with respect to control cells with MBC as in C. PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000094 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000091 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000091 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:28567704 4896 2017-10-20 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000091 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0005638 medium PMID:26258632 4896 2016-01-19 (Fig. 1a) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad2 mad2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001491 E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-03 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0007599 TetR-stc1delta(1-126) Not assayed or wild type 972 h- stc1 TetR-stc1-C TetR-stc1-C(1-126) fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPAC14C4.11 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- 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List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPAC6F12.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- tvp15 tvp15delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6F12.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- tvp15 tvp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F12.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tvp15 tvp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tvp15 tvp15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC663.01c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Figure 1a) PomBase SPCC663.01c FYPO:0000113 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Figure 1E) PomBase SPCC663.01c FYPO:0000113 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Figure 1E) PomBase SPCC663.01c FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 3a) PomBase SPCC663.01c FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 3a) PomBase SPCC663.01c FYPO:0003241 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 52 high PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Fig. 3b) PomBase SPCC663.01c FYPO:0002106 unknown Not assayed or wild type 972 h- ekc1 ekc1-163 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12773390 4896 2016-10-10 (Figure 1b) PomBase SPBC646.14c FYPO:0000400 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005580 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PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0005167 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0001355 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003004 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0003004 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000377 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000786 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000786 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000839 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0002061 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0001387 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBC646.14c FYPO:0001492 L266P,P375L Not assayed or wild type 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228 medium PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004917 1-222,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-motif-M-C partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004917 1-222,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-motif-M-C partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC776.12c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000703 1-222,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1-motif-M-C partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c),assayed_using(PomBase:SPCC550.13) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0000089 K536A Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-K536A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29898918 4896 2018-07-03 PomBase SPCC569.08c FYPO:0000747 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade5 ade5- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPCC569.08c FYPO:0002728 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade5 ade5- unknown ECO:0001232 PMID:2743431 4896 2013-11-02 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 N328A Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-A5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- plb2 plb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- plb2 plb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 plb2 plb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1786.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 plb2 plb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005555 1-191,K873A,K877A,K1420A,K1423A,K1427A Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-C-AB amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 medium high PMID:33176147 4896 2020-12-04 (Figures 4E and 4F) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0006775 117-198 Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-delta117-198 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0005736 117-198 Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-delta117-198 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0006777 117-198 Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-delta117-198 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002061 650-872 Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-deltaC223 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10779336 4896 2018-03-02 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006505 1-190,793-1372 Overexpression 972 h- fus1delta fus1 fus1-N(191-792) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3D) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 S256P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-S256P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 S256P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-S256P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 S256P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-S256P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 S256P Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-S256P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0002827 unknown Not assayed or wild type 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000049 medium PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S2D) PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0005948 unknown Not assayed or wild type 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0006030 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0005950 unknown Not assayed or wild type 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001485 S152A,S172A Overexpression 972 h- atf1 atf1-2A atf1.2A amino_acid_mutation 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deletion 972 h- git1 git1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Moreover, both Ync13 and Git1, the S. pombe homologs of Munc13 family which is one core......were dispensable for substantial hypotonic PM expansion (Additional file 1: Fig. S2E). PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0000833 deletion 972 h- git1 git1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.03) PMID:16489217 4896 2017-09-28 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0001788 deletion 972 h- git1 git1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.03) PMID:16489217 4896 2017-09-28 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph git1 git1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph git1 git1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph git1 git1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph git1 git1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0008198 deletion 972 h- tcb3 tcb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000025,FYECO:0000150,FYECO:0000466 assayed_protein(PomBase:SPCC962.01) PMID:40629316 4896 2025-09-01 Interestingly, the accumulation of Tcb1 and Tcb3 at ER-PM contacts is mutually depend- ent: Tcb3 delocalized to the perinuclear ER in tcb1Δ, while Tcb1 levels in the cortical ER decreased in tcb3Δ. Their localization remained unchanged in tcb2Δ (Fig. 3C and Additional file 1: Fig. S3A). PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tcb3 tcb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tcb3 tcb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph tcb3 tcb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph tcb3 tcb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tcb3 tcb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph tcb3 tcb3delta deletion ECO:0005638 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SPBC557.04 FYPO:0000112 deletion 972 h- ppk29 ppk29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC557.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- ppk29 ppk29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC557.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppk29 ppk29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC557.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk29 ppk29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC557.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk29 ppk29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002019 trt1-9xPK-tpz1 Not assayed or wild type 972 h- tpz1delta trt1 trt1-PK-tpz1 fusion_or_chimera ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002033 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:34674264 4896 2022-01-11 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003946 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-04-08 (Fig. 2A-C). Reduced contractile ring localization during mitosis. However, we observed that Dma1-6A was significantly more difficult to detect at the first instance of CR localization early in mitosis than either Dma1 or Dma1-6D/E PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005227 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:34674264 4896 2022-01-12 Although this assay is not quantitative, we found that Sid4 was ubiquitinated to similar levels as in wild-type in both dma1-6A and dma1-6D/E but was not ubiquitinated in dma1D (Fig. 2A). PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003762 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:34674264 4896 2022-04-08 (Fig. 4a) We observed that nda3-km311, dma1- 6A nda3-km311, and dma1-6D/E nda3-km311 cells delayed septation relative to wild-type cells and that dma1Δ cells did not PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003627 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-04-08 Localization to SPBs at the same level as wild-type during spindle stress PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002442 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-04-10 Normal localization to medial cortical nodes, SPB, and division septum as wild-type PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002967 S4A,T18A,S20A,S166A,S251A,S266A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-04-08 Normal localization to medial cortical nodes, SPB, and division septum as wild-type PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.18 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1235.18 SPCC1235.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001277 1-204 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D7 mcm2-D7 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001424 1-204 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D7 mcm2-D7 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 1-204 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D7 mcm2-D7 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 1-204 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D7 mcm2-D7 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 1-204 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D7 mcm2-D7 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000783 1-204 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D7 mcm2-D7 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC146.03c FYPO:0003286 L289F Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-m26 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23263988 4896 2014-04-04 PomBase SPCC70.12c FYPO:0006331 C9S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C9S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2B) PomBase SPCC70.12c FYPO:0006333 C9S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C9S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2B) PomBase SPCC70.12c FYPO:0000245 C9S Not assayed or wild type 972 h- ecl1 ecl1-C9S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:28160081 4896 2018-01-15 (Fig. 2A) PomBase SPBP8B7.21 FYPO:0003412 ubp3::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ubp3 ubp3::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 A162C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A162C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 low PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A162C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A162C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0009021 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000416 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000251 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000289 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000684 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000072 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0009022 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000278 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0007726 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000296 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0005258 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000099 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000799 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000088 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0002546 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.335 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.335 SPNCRNA.335+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004604 S496A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-S496A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:31131414 4896 2020-03-27 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0003803 S496A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-S496A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:31131414 4896 2020-03-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 S496A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-S496A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:31131414 4896 2020-03-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004791 S496A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-S496A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31131414 4896 2020-03-24 PomBase SPCC338.07c FYPO:0002668 F533A,F536A Not assayed or wild type 972 h- naa15 naa15-F533A,F536A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001425 pREP3X inducible overexpression Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-OP other ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:8121488 4896 2021-02-17 (Fig 1b) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001425 pREP3X inducible overexpression Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-OP other ECO:0005580 FYECO:0000126 PMID:8121488 4896 2021-02-26 (Fig. 1B) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002083 pREP3X inducible overexpression Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-OP other ECO:0001232 FYECO:0000126 high PMID:8121488 4896 2021-02-17 (Fig. 1A) Overreplicating haploid cells become highly enlarged (Fig. la, left) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000333 pREP3X inducible overexpression Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-OP other ECO:0000334 FYECO:0000126 high medium PMID:8121488 4896 2021-02-17 Table 1 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 Y25YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J2 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 Y25YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J2 amino_acid_insertion ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 Y25YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J2 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001355 dbr1::leu1 Not assayed or wild type 972 h- dbr1 dbr1::leu1+ disruption ECO:0005638 PMID:10982890 4896 2019-11-07 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001979 dbr1::leu1 Not assayed or wild type 972 h- dbr1 dbr1::leu1+ disruption ECO:0000337 PMID:10982890 4896 2019-11-07 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001492 dbr1::leu1 Not assayed or wild type 972 h- dbr1 dbr1::leu1+ disruption ECO:0005638 PMID:10982890 4896 2019-11-07 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 K283A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-K283A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:15797383 4896 2020-01-07 (Fig. 2 lane 11-12) PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 scp1 scp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph scp1 scp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- scp1 scp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scp1 scp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scp1 scp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0002019 wild type Overexpression 972 h- rad1 rad1+ wild_type ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPAC31G5.06 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrg8 rrg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- rrg8 rrg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31G5.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrg8 rrg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.04 FYPO:0002128 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0000705 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.05),assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 The binding of Sea3 to GATOR1 is dependent on the integrity of the GATOR1 complex, and the absence of any one of the GATOR1 subunits disrupted the Sea3-GATOR1 association (Figure 3F,G and H). PomBase SPBC543.04 FYPO:0006148 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 The mRNA level of isp5+ (S6A Fig) as well as the basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion as measured by Renilla luciferase reporter (S6B Fig) were also decreased in npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells. PomBase SPBC543.04 FYPO:0001575 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001575 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0000046 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 high PMID:38051102 4896 2023-12-15 Notably, the absence of Sfp1 modestly alleviates the growth defect of the mutants lacking functional GATOR1 (Fig. 1I); the absence of GATOR1 causes a severe growth defect due to deregulated TORC1 activation,28 and therefore, the observed genetic interaction corroborates a functional link between Sfp1 and TORC1. PomBase SPBC543.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPBC543.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPBC543.04 FYPO:0010009 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPBC543.04 FYPO:0004457 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also impairs the nuclear localization of Gaf1-YFP induced by nitrogen depletion (S6C Fig) PomBase SPBC543.04 FYPO:0004457 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0006233 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δnpr2 cells and Δnpr3 cells, vacuoles were smaller, and the intensities of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP at vacuolar membranes were decreased, compared with wild-type cells (Fig 8A and 8B). PomBase SPBC543.04 FYPO:0006233 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δnpr2 cells and Δnpr3 cells, vacuoles were smaller, and the intensities of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP at vacuolar membranes were decreased, compared with wild-type cells (Fig 8A and 8B). PomBase SPBC543.04 FYPO:0006233 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0006233 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0006233 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0006233 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001117 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 The mRNA level of isp5+ (S6A Fig) as well as the basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion as measured by Renilla luciferase reporter (S6B Fig) were also decreased in npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells. PomBase SPBC543.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 Similarly to Δlam2 cells, the growth of npr3::ura4+ cells and npr2::ura4+ cells was partially inhibited on EMM plate, and was completely inhibited on both YES and YPD plates (S2A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Similarly to Δlam2 cells, the growth of npr3::ura4+ cells and npr2::ura4+ cells was partially inhibited on EMM plate, and was completely inhibited on both YES and YPD plates (S2A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 Similarly to Δlam2 cells, the growth of npr3::ura4+ cells and npr2::ura4+ cells was partially inhibited on EMM plate, and was completely inhibited on both YES and YPD plates (S2A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Exogenous addition of arginine to the EMM plates enhanced the cell growth of Δlam2 cells, Δgtr2 cells, Δgtr1 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells as well as wild-type cells, but did not rescue the defective cell growth of these mutant cells to the level of wild-type cells (S5 Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0002681 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δnpr2 cells and Δnpr3 cells also showed increased Rps6 phosphorylation (S7 Fig), similarly to the loss of Lam2, Gtr1 or Gtr2. PomBase SPBC543.04 FYPO:0002681 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δnpr2 cells and Δnpr3 cells also showed increased Rps6 phosphorylation (S7 Fig), similarly to the loss of Lam2, Gtr1 or Gtr2. PomBase SPBC543.04 FYPO:0002681 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0002681 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0000825 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPBC543.04 FYPO:0000825 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC543.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPBC543.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001522 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001545 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with rapamycin and caffeine partially canceled, and Torin1 treatment fully canceled, cannavanine resistance in Δnpr2 cells and Δnpr3 cells (S4D Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0002672 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC543.04 FYPO:0008372 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 TORC1 inhibition by rapamycin and caf- feine abolished the internalization of Cat1 and increases the signal at the cell surface (S4B Fig, Rapamycin + caffeine). PomBase SPBC543.04 FYPO:0004248 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC543.04 FYPO:0004248 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC543.04 FYPO:0004248 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001029 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with rapamycin and caffeine partially canceled, and Torin1 treatment fully canceled, cannavanine resistance in Δnpr2 cells and Δnpr3 cells (S4D Fig). PomBase SPBC543.04 FYPO:0001029 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPBC543.04 FYPO:0001029 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001029 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC543.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC543.04 FYPO:0000281 deletion 972 h- npr3 npr3delta npr3::ura4+ deletion ECO:0001232 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC839.02 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC839.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph aly1 aly1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- aly1 aly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC839.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aly1 aly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC839.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aly1 aly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002223 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 high PMID:23370392 4896 2013-06-06 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0001914 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000121 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:11739743 4896 2026-01-04 The spo4 deletion mutant (spo4 ) was viable but displayed sporulation defects like the original spo4-B4 mu- tant (data not shown). PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0003451 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.07) PMID:20970342 4896 2014-06-18 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000583 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0001122 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-21 (Fig. 4) PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002221 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:23370392 4896 2013-06-06 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002222 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:23370392 4896 2013-06-06 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002219 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:23370392 4896 2013-06-06 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0004629 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:11739743 4896 2026-01-04 The DNA content of spo4 cells roughly doubled prior to meiotic nuclear division (Fig. 3A). PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002043 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:11739743 4896 2026-01-04 We observed a similar result with spo4 homozygous diploid cells cultured in nitrogen-free medium for the induction of meiosis (data not shown). We thus conclude that spo4 cells complete premeiotic DNA rep- lication normally. PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0001357 deletion 972 h- spo4 spo4delta deletion ECO:0001232 PMID:11739743 4896 2026-01-04 The spo4 deletion mutant (spo4 ) was viable but displayed sporulation defects like the original spo4-B4 mu- tant (data not shown). PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph spo4 spo4delta deletion ECO:0005638 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2012-01-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002085 E179R Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-E179R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000838 140-217 Overexpression 972 h- pol1 pol1-delta-BlockIII partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8590799 4896 2016-07-22 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000444 H362Y Not assayed or wild type 972 h- wee1-as8, cdc25-22 cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000338 PMID:23986474 4896 2022-11-11 The static FACS profiles established that replication was indeed inhibited in analogue-released cdc10.v50 wee1.as8 cdc25.22 cells after analogue addition (Fig. 7B, right panel). PomBase SPBC336.12c FYPO:0001430 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15297457 4896 2014-09-11 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001430 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:8631306 4896 2014-06-11 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000474 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002044 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002044 H362Y Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000127 PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0003437 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8631306 4896 2014-06-11 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001424 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11683390 4896 2016-10-24 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001424 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11683390 4896 2016-10-24 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000445 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000110,FYECO:0000229 high PMID:7796804 4896 2017-07-05 (Fig. 7A,8) PomBase SPBC336.12c FYPO:0000082 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006560 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8521500 4896 2018-04-16 (Fig. 1) PomBase SPBC336.12c FYPO:0005933 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAP14E8.02) PMID:19487461 4896 2018-05-14 (Fig. 1G) amount of tos1-GFP in nucleus is dependent on cdc10 PomBase SPBC336.12c FYPO:0004630 H362Y Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0004630 H362Y Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.01c) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0005773 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000110,FYECO:0000229 high PMID:7796804 4896 2017-10-27 (Fig. 6, Fig 7B panel 8) PomBase SPBC336.12c FYPO:0001038 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001397 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001395 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001221 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17998401 4896 2012-07-16 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000833 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPBC336.12c FYPO:0003530 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:15297457 4896 2014-09-11 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001984 H362Y Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:8657126 4896 2014-06-11 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006975 H362Y Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-V50 cdc19.v50 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC1734.06 FYPO:0003892 CSH44SGA Not assayed or wild type 972 h- rhp18 rhp18-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000211 PMID:17277362 4896 2016-03-31 PomBase SPBC1734.06 FYPO:0002768 CSH44SGA Not assayed or wild type 972 h- rhp18 rhp18-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:17277362 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PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0007336 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000291 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0007336 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0005580 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0007336 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000112 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0007336 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0005638 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0006993 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0004604 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000049 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0004604 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000231 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0002355 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000226 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c 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assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 4F) PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0002960 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 4F) PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0002173 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-03-02 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0004377 deletion 972 h- mot2 mot2delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mot2 mot2delta deletion 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AR function. The start of septation is delayed when the function of the AR F-BAR protein Cdc15 is compromised. PomBase SPAC140.04 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ctr1 ctr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0003040 deletion 972 h- ctr1 ctr1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC140.04 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0008113 deletion 972 h- ctr1 ctr1delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Similar to previous reports, we detected significantly increased intronic reads in the exosome mutant rrp6D strain (Fig. 4a,b). PomBase SPAC140.04 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ctr1 ctr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC140.04 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ctr1 ctr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC140.04 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0003233 deletion 972 h- ctr1 ctr1delta deletion ECO:0000226 PMID:24210919 4896 2014-03-27 PomBase SPAC140.04 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.04 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ctr1 ctr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PMID:15340008 4896 2024-03-14 (Fig. 3A) PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0008162 unknown Not assayed or wild type 972 h- top3 top3-134 unknown ECO:0000059 PMID:15340008 4896 2024-03-15 (Fig. 1,3,4) PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0003438 unknown Not assayed or wild type 972 h- top3 top3-134 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004 medium PMID:15340008 4896 2024-03-14 (Fig. 1) PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0001761 unknown Not assayed or wild type 972 h- top3 top3-134 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:15340008 4896 2024-03-14 (Fig. 2) PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0001513 unknown Not assayed or wild type 972 h- top3 top3-134 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:15340008 4896 2024-03-14 (Fig. 2) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005369 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:22645648 4896 2016-08-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001384 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation 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ECO:0001232 PMID:22645648 4896 2016-09-21 (Figure 4e) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001038 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001490 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22645648 4896 2016-08-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000339 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0001232 8 PMID:22645648 4896 2016-08-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000012 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000110 PMID:22645648 4896 2016-09-21 (Figure 4a, b) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001019 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22645648 4896 2017-07-21 (Figure 4d) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004652 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006142 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000110 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001164 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001420 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004513 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000111 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:22645648 4896 2016-08-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001492 L2045D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045D tor1-D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22084378 4896 2015-02-16 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001164 1-424 Overexpression 972 h- pyp2 pyp2deltaN(2) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- mok12 mok12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:16420355 4896 2020-10-21 PomBase SPBC32H8.13c FYPO:0003795 wild type Overexpression 972 h- mok12 mok12+ wild_type ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:16420355 4896 2020-10-21 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000619 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 50 PMID:9808627 4896 2016-04-01 (Fig. 2D) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000620 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:11882285 4896 2018-05-02 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000611 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 50 PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001127 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000110,FYECO:0000201,FYECO:0000227 22 PMID:39916665 4896 2025-03-05 (Fig. S3) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004308 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001796) PMID:11882285 4896 2018-05-02 (Fig. S1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0006174 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11882285 4896 2018-05-02 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0006174 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 (Figure 3) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001269 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004412 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004832 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11554922 4896 2015-08-18 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000082 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. S1A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000082 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005555 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:11069892 4896 2016-09-13 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002797 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:11882285 4896 2018-04-28 (Fig. 1C) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004833 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11554922 4896 2015-08-18 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001355 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. S1A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000639 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11882285 4896 2018-04-28 (Fig. 1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002638 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11882285 4896 2018-05-02 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000274 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11882285 4896 2018-04-28 (Fig. 1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001707 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0003307 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11882285 4896 2018-04-28 (Fig. 1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000786 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-16 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005735 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:11882285 4896 2018-05-02 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000839 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002090 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000110,FYECO:0000201,FYECO:0000227 12 PMID:39916665 4896 2025-03-05 (Fig. S3) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000228 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0004307 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:11882285 4896 2018-04-28 (Fig. 1) (3-4um normal metaphese lenght 2-2.5 um PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005345 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0007914 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10398680 4896 2021-12-20 (Figure 3) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002141 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001532 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11882285 4896 2018-04-28 (Fig. S1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002102 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000088 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000091 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11882285 4896 2018-05-02 (Fig. 2D) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000091 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0007304 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10398680 4896 2015-01-14 (Figure 3) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0003241 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005069 G1326E Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 50 PMID:9808627 4896 2016-04-01 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 reb1 reb1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0003088 deletion 972 h- reb1 reb1delta deletion ECO:0000337 PMID:21118960 4896 2014-12-18 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0007206 deletion 972 h- reb1 reb1delta deletion ECO:0000337 PMID:18794373 4896 2019-12-18 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0004233 deletion 972 h- reb1 reb1delta deletion ECO:0005580 PMID:21118960 4896 2012-02-24 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph reb1 reb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph reb1 reb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph reb1 reb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr reb1 reb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph reb1 reb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0001407 deletion 972 h- reb1 reb1delta deletion ECO:0005638 PMID:24463365 4896 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SPCC16C4.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pef1 pef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16C4.11 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pef1 pef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP23A10.07 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP rpa2 rpa2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC663.05c FYPO:0001645 D37A Not assayed or wild type 972 h- asf1 cia1-D37A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.13c),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPCC663.05c FYPO:0001645 D37A Not assayed or wild type 972 h- asf1 cia1-D37A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000705 487-948 Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1(1-486) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:31206516 4896 2024-01-01 However, consistent with the previous report [13], the C-terminal half of Epe1 (487-948 amino acids region) interacted with Swi6 in the yeast two-hybrid system, but the N-terminal half (1-486) did not (S4I Fig). PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0002042 wild type Knockdown 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:21531205 4896 2014-10-27 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0001117 wild type Knockdown 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000174 assayed_using(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:21531205 4896 2014-10-27 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:21531205 4896 2014-10-27 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0002937 wild type Overexpression 972 h- rpl3001 rpl3001+ wild_type ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-22 In agreement with the direct role of Rpl30-1 in the control of rpl30-2 expression, excess Rpl30-1 resulted in decreased levels of rpl30-2 mRNA (Figure 6D, lane 4). PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004418 L485I Not assayed or wild type 972 h- top2 ptr11-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 oxp1 oxp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0000470 deletion 972 h- oxp1 oxp1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 oxp1 oxp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0000238 deletion 972 h- oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0006660 deletion 972 h- oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 oxp1 oxp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0005968 deletion 972 h- oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0005253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph oxp1 oxp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- oxp1 oxp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxp1 oxp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11D3.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxp1 oxp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0003335 unknown Not assayed or wild type 972 h- gsf1 gsf1-AAD-1 unknown ECO:0000059 PMID:9973368 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0000674 unknown Not assayed or wild type 972 h- gsf1 gsf1-AAD-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9973368 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001945 unknown Not assayed or wild type 972 h- gsf1 gsf1-AAD-1 unknown ECO:0005801 PMID:9973368 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- gsf1 gsf1-AAD-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000176 PMID:9973368 4896 2014-04-28 PomBase SPBC15D4.02 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- gsf1 gsf1-AAD-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9973368 4896 2014-04-28 PomBase SPCC548.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph urm1 urm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC548.04 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 urm1 urm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC548.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 urm1 urm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC548.04 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 urm1 urm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC548.04 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph urm1 urm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC548.04 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph urm1 urm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC548.04 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph urm1 urm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC548.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph urm1 urm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1795.06 FYPO:0000705 88,156 Not assayed or wild type 972 h- map2+ map2 P-factorDeltaLeu partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04),assayed_using(PomBase:SPCC1795.06) PMID:22500108 4896 2012-04-27 PomBase SPCC1795.06 FYPO:0001141 88,156 Not assayed or wild type 972 h- map2+ map2 P-factorDeltaLeu partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:22500108 4896 2012-04-27 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006106 1-316 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:26744419 4896 2017-05-19 (Fig. 5c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006800 1-316 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6a) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002360 1-316 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6d) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003555 1-316 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6e) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005612 1-316 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 5b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004924 1-316 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6c) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007376 K785E Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-K785E amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 1F) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 K785E Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-K785E amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 1F) PomBase SPAC821.10c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- sod1 sod1+ wild_type ECO:0005638 PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPAC821.10c FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- sod1 sod1+ wild_type ECO:0005638 PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0002061 H161A Not assayed or wild type 972 h- elo2 elo2-H161A elo2-H168A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000263 PMID:30975915 4896 2019-05-04 (Figure 3) PomBase SPCC584.15c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 aly3 aly3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0000244 deletion 972 h- aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000090,FYECO:0000104 PMID:34028542 4896 2021-06-18 PomBase SPCC584.15c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC584.15c 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2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph aly3 aly3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- aly3 aly3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC584.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aly3 aly3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aly3 aly3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.09 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubx3 ubx3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.09 FYPO:0000348 deletion 972 h- ubx3 ubx3delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC343.09 FYPO:0003066 deletion 972 h- ubx3 ubx3delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC343.09 FYPO:0000470 deletion 972 h- ubx3 ubx3delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC343.09 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ubx3 ubx3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.09 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ubx3 ubx3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.09 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ubx3 ubx3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.09 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph ubx3 ubx3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.09 FYPO:0001245 deletion 972 h- ubx3 ubx3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC343.09 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ubx3 ubx3delta 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SPAC694.06c FYPO:0006602 A700T Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-A700T amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26201080 4896 2018-07-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000584 A700T Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-A700T amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPAC1486.03c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntr1 ntr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1486.03c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntr1 ntr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1486.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- ntr1 ntr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1486.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntr1 ntr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.16c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif303 tif303delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.16c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif303 tif303delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- tif303 tif303delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4A8.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif303 tif303delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.10 FYPO:0002698 wild type Overexpression 972 h- met11 met11+ wild_type ECO:0005801 PMID:12112238 4896 2013-09-20 PomBase SPAC9.05 FYPO:0000089 K99R Overexpression 972 h- fml1 fml1-K99R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPBC9B6.08 FYPO:0000082 W181* Not assayed or wild type 972 h- clc1 git9-232 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:2157626 4896 2016-12-21 PomBase SPBC9B6.08 FYPO:0005288 W181* Not assayed or wild type 972 h- clc1 git9-232 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000162 low PMID:2157626 4896 2016-12-21 PomBase SPBC9B6.08 FYPO:0000825 W181* Not assayed or wild type 972 h- clc1 git9-232 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:2157626 4896 2016-12-21 PomBase SPBC947.12 FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ kms2 kms2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC947.12 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kms2 kms2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.12 FYPO:0003529 deletion 972 h- kms2 kms2delta deletion ECO:0001232 PMID:24963130 4896 2014-07-17 PomBase SPBC947.12 FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kms2 kms2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.12 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kms2 kms2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kms2 kms2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.12 FYPO:0001491 deletion 972 h- kms2 kms2delta deletion ECO:0005638 PMID:24963130 4896 2014-07-17 PomBase SPBC947.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- kms2 kms2delta deletion ECO:0005638 PMID:24963130 4896 2014-07-17 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0004709 S365D Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365D amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Furthermore, a high percentage of spontaneous Rad52-YFP foci was observed in rad52-S365D-YFP, but not in rad52-YFP and rad52-S365A-YFP, suggesting genomic instability of rad52- S365D-YFP. PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000085 S365D Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Moreover, the rad52-S365D/E-YFP displayed higher sensitivities to HU, CPT, and MMS rather than cisPt (Figure 5a). PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 S365D Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Moreover, the rad52-S365D/E-YFP displayed higher sensitivities to HU, CPT, and MMS rather than cisPt (Figure 5a). PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 S365D Not assayed or wild type 972 h- rad52-YFP rad52 rad52-S365D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:39789818 4896 2025-05-15 Moreover, the rad52-S365D/E-YFP displayed higher sensitivities to HU, CPT, and MMS rather than cisPt (Figure 5a). PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 S21I Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-20 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0001120 G188E 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2010-08-24 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0000088 G188E 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2009-12-21 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0000024 G188E 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2010-08-24 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0006482 1-181 Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:29358048 4896 2018-04-03 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0002642 432-598 Overexpression 972 h- ltc1 ltc1-StARTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:32320462 4896 2020-08-03 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0007553 R523L Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-R523L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0007553 R523L Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-R523L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0007629 R523L Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-R523L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000069 R523L Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-R523L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 (Fig. S6) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001324 aa276-282 deleted in short cDNA Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-cdeltaTAD other ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC776.13) PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 7C) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001234 aa276-282 deleted in short cDNA Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-cdeltaTAD other ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 7B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000311 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assayed or wild type 972 h- hht1delta hht3delta hht2 hht2-K56R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c) PMID:34608864 4896 2021-11-05 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0001327 K57R Not assayed or wild type 972 h- hht1delta hht3delta hht2 hht2-K56R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.02c) PMID:34608864 4896 2021-11-05 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0001327 K57R Not assayed or wild type 972 h- hht1delta hht3delta hht2 hht2-K56R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_protein(PomBase:SPAC694.06c) PMID:34608864 4896 2021-11-05 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0000266 K57R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K56R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17369611 4896 2011-08-08 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0000267 K57R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K56R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17369611 4896 2011-08-08 PomBase SPBC17A3.05c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP SPBC17A3.05c SPBC17A3.05c+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000080 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001840 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0000059 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000228 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0001232 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004909 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001870 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0001232 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001164 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000833 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002687 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0000337 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004924 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0001232 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003840 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000091 disruption Null 972 h- rik1 rik1::LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8937982 4896 2015-10-01 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0007569 1-630 Overexpression 972 h- cdc11+ cdc11 cdc11-631-1045 GFP-Cdc11p(631–1045) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:11950932 4896 2023-11-06 Interestingly, we found that overproduction of GFP-Cdc11p(631-1045) gener-ated a sid phenotype (Figure 5A). PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 1-630 Overexpression 972 h- cdc11+ cdc11 cdc11-631-1045 GFP-Cdc11p(631–1045) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 Overproduction of Cdc11p(631-1045) had no effect on the localization of Sid4p-GFP but caused the loss of Cdc11p-GFP and Spg1p-GFP from SPBs (Figure 5B). This is consistent with the with the idea that Cdc11p(631-1045) saturates the SPB binding site for Cdc11p, thus eliminating the opportunity for the full-length protein to localize to the SPB. PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 1-630 Overexpression 972 h- cdc11+ cdc11 cdc11-631-1045 GFP-Cdc11p(631–1045) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 Overproduction of Cdc11p(631-1045) had no effect on the localization of Sid4p-GFP but caused the loss of Cdc11p-GFP and Spg1p-GFP from SPBs (Figure 5B). PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000190 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0005638 PMID:21885283 4896 2017-10-31 (Figures 2I - 2K and S3G - S3O) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000422 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0005638 PMID:21885283 4896 2017-10-31 (Figure 2A) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0006120 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0005638 70-80 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:21885283 4896 2017-10-31 (Figures 2L, S3P- S3R) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0006326 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000729 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000316 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0005638 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0005638 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:16687577 4896 2018-02-28 (Fig. 1) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003316 deletion 972 h- cdc15 cdc15delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27898700 4896 2016-12-12 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SPAC6F6.16c FYPO:0000703 1-154 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-155-508 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 1-154 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-155-508 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 1-154 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-155-508 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 K120R,P37A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-K120R,P37A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPAC821.13c FYPO:0000135 deletion 972 h- dnf1 dnf1delta deletion 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cell separation after septum assembly (not shown) PomBase SPCC645.06c FYPO:0007949 wild type Overexpression 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0001232 PMID:15546915 4896 2022-03-30 (1-3 beta D) As shown in Fig. 6C, there was an increase in the amount of β-glucan in cells that overexpressed rgf3+ compared with wild-type cells (16% and 10%, respectively) PomBase SPCC645.06c FYPO:0001968 wild type Overexpression 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0001232 PMID:15546915 4896 2022-03-30 (Fig. 6B)....an increase in enzymatic activity was detected in cells overexpressing rgf3+ compared with the activity observed in the wild-type strain PomBase SPCC645.06c FYPO:0001038 wild type Overexpression 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7A) PomBase SPCC645.06c FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPCC1827.01c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp25 utp25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1827.01c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp25 utp25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1827.01c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp25 utp25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1827.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- utp25 utp25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1827.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp25 utp25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC290.04 FYPO:0000705 1-143 Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-C1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04),assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC290.04 FYPO:0005047 1-143 Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-C1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC663.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC663.08c SPCC663.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC663.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC663.08c SPCC663.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC663.08c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPCC663.08c SPCC663.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.08c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPCC663.08c 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h- rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0007612 deletion 972 h- rip1 rip1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-19 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0006013 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rip1 rip1delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rip1 rip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0003020 K47R Not assayed or wild type 972 h- pat1 ran1-K47R pat1-K47R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.05) PMID:8945514 4896 2014-12-05 PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0001384 K47R Not assayed or wild type 972 h- pat1 ran1-K47R pat1-K47R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC19C2.05),assayed_substrate(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8945514 4896 2014-12-05 PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0001384 K47R Not assayed or wild type 972 h- pat1 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pat1-K47R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tel1 tel1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tel1 tel1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0004867 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000112 medium PMID:29851556 4896 2019-04-30 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0004867 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PR:000027551) PMID:15226425 4896 2015-09-15 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0008379 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 2C) PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tel1 tel1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0002097 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0005617 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0005577 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:21084840 4896 2016-07-05 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0005034 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000458 assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 3C) PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0002484 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000337 high PMID:30217891 4896 2019-10-17 (Fig. 3) PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0007237 deletion 972 h- tel1 tel1delta deletion ECO:0000337 high PMID:30217891 4896 2019-10-17 (Fig. 3) PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0007238 deletion 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assayed_protein(PomBase:SPCC338.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4C) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001117 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001117 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBP23A10.16) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001117 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC737.02c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001117 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC338.10c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001117 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4B) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0001814 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000409 PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0005825 wild type Overexpression 972 h- php4 php4+ wild_type ECO:0005638 medium PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 4A) PomBase SPBC106.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ada1 ada1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC106.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ada1 ada1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC106.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ada1 ada1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.04 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PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002702 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002907 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000080 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0007212 deletion 972 h- epe1delta taz1 taz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 PMID:9572142 4896 2015-04-24 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002485 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 PMID:9572143 4896 2014-07-10 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0003179 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 PMID:9572143 4896 2014-07-10 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005918 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC800.03) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 4B) clr3 at telomeres were reduced to the same extent in mutant strains disrupted for either Ccq1 or Taz1 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005918 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 4B) while the levels of Ccq1 at telomeres, relative to those in wild-type cells, were unchanged in clr3D cells but decreased in taz1D PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004716 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002387 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002387 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17) PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0003803 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17) PMID:31289327 4896 2019-08-28 (Fig. 4a) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000581 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000581 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 high PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:9572142 4896 2015-04-24 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18615848 4896 2015-02-13 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:11676924 4896 2015-05-27 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 high PMID:29422503 4896 2018-02-13 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 high PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:31289327 4896 2019-08-28 (Fig. S2) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001807 high PMID:21217703 4896 2023-02-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:17429064 4896 2016-06-24 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:9034194 4896 2014-07-09 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 PMID:27183912 4896 2016-08-09 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0003970 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 PMID:21633354 4896 2015-10-30 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005026 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:21633354 4896 2015-10-30 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005759 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000288 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:22987637 4896 2016-11-10 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0001038 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005917 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 3b) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005917 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001923) PMID:27183912 4896 2016-08-09 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005917 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001924) PMID:27183912 4896 2016-08-09 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0006109 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000231 PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0005402 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:12861005 4896 2016-05-05 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002908 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002908 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002151 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 95 PMID:9034194 4896 2014-07-09 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0001178 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23188080 4896 2020-10-15 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004742 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0001164 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000964 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002612 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000760 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 PMID:9572143 4896 2014-07-10 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0003790 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.06c) PMID:15654021 4896 2014-11-28 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0007234 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17) PMID:22279046 4896 2020-01-22 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004962 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17) PMID:22279046 4896 2020-01-22 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002901 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:21633354 4896 2015-10-30 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0003576 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 3B) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002887 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:18160711 4896 2016-06-29 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000943 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000590 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 ~18 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1B) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0001420 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0005638 PMID:9034194 4896 2014-07-09 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0006272 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000170 PMID:31289327 4896 2019-08-23 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0001492 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taz1 taz1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003228 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:33225241 4896 2021-01-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002827 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 low PMID:38289024 4896 2024-04-02 (Figure 3 S2A,B) More strikingly, Patf1-atf1(10D/E) also visibly compromised epigenetic silencing even at 30°C (Figure 3—Figure supplement 2A, B). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001645 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:38289024 4896 2024-04-05 Binding affinity between Atf1 and Swi6HP1 is maintained for non-phosphorylatable Atf1(10A/I) at 37°C, but disrupted for phosphomimetic Atf1(10D/E) even at 30°C. PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001103 S2D,S4D,T77E,S140D,S152D,S172D,T204E,T216E,S226D,T249E Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-10D/E Atf1.10D|atf1(10D/E)|atf1-10D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:33225241 4896 2021-01-28 PomBase SPBC27.02c FYPO:0005366 T136A Not assayed or wild type 972 h- ask1 ask1-T136A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0005017 G285D Not assayed or wild type 972 h- nat10 nat10-447 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25402480 4896 2015-10-28 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0005016 G285D Not assayed or wild type 972 h- nat10 nat10-447 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25402480 4896 2015-10-28 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0000082 G285D Not assayed or wild type 972 h- nat10 nat10-447 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:25402480 4896 2015-10-28 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0006518 G285D Not assayed or wild type 972 h- nat10 nat10-447 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0001234 G285D Not assayed or wild type 972 h- nat10 nat10-447 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25402480 4896 2015-10-28 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0001234 G285D Not assayed or wild type 972 h- nat10 nat10-447 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:25402480 4896 2015-10-28 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0003352 Q146* Not assayed or wild type 972 h- RTS1-mat1-SspI::inv-RTS1 (RTS1 moved to cenII-distal side of mat1 and inverted) rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:19416828 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0003085 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 medium PMID:19416828 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0005357 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 medium PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0005361 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 high PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0000969 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0001690 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0000963 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0000089 Q146* Not assayed or wild type 972 h- rtf2 rtf2-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c 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The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAC1006.02 FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asa1 asa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1006.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- asa1 asa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1006.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asa1 asa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.16 FYPO:0004555 unknown Not assayed or wild type 972 h- cho1 cho1-45 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9755189 4896 2015-04-14 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000214 H1133P Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-H1133P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC776.13 FYPO:0002061 H1133P Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-H1133P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31072933 4896 2019-05-26 (Figure 1c) PomBase SPBC776.13 FYPO:0002061 H1133P Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-H1133P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC11G11.06c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sme1 sme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11G11.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sme1 sme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11G11.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- sme1 sme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11G11.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sme1 sme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.01 FYPO:0000443 S48A,S71A,S103A,S113A,S140A,S171A,S195A,S236A,S304A,T381A,T437A Not assayed or wild type 972 h- nsk1 nsk1-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:21965289 4896 2024-12-05 FIGURE 5: Dephosphorylation of Nsk1 by Clp1 promotes its association to the kinetochore-SPB junction. PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000080 489-643 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-delta489-end partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 low PMID:31366733 4896 2019-09-21 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000091 489-643 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-delta489-end partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 high PMID:31366733 4896 2019-09-23 PomBase SPAC13G7.08c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crb3 crb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G7.08c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crb3 crb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G7.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- crb3 crb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13G7.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crb3 crb3delta deletion ECO:0001232 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ade6-M210 pmp3 pmp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.09c FYPO:0004481 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:17371846 4896 2024-06-21 (Fig. 2A) PomBase SPBC146.09c FYPO:0003080 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000337 PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPBC146.09c FYPO:0001326 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000291 PMID:17440621 4896 2016-01-25 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000888 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0007505 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17434129 4896 2020-11-06 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002387 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003085 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000337 high PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003090 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPBC146.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:17371846 4896 2024-06-21 (Fig. 4B) PomBase SPBC146.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17371846 4896 2024-06-21 (Fig. 2A) PomBase SPBC146.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000636 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 PMID:17440621 4896 2016-01-25 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000220 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 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FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17434129 4896 2020-11-06 PomBase SPBC146.09c FYPO:0004377 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003010 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000825 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 We further noted the striking similarity of the genome-wide transcription profiles of the lid2-j and lsd1Δ mutants (Figure 6C), suggest PomBase SPBC146.09c FYPO:0004948 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002837 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0004325 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- lsd1 lsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC146.09c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsd1 lsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000655 1-238,314-380 Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H chp2-hinge partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 The hinge and the N-terminal disordered regions of Chp2 (Chp2-H and Chp2-N) also bound DNA (Fig. 2H, J and M) PomBase SPBC530.04 FYPO:0007450 519-522 Not assayed or wild type 972 h- mod5 mod5-deltaCaaX partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPBC530.04 FYPO:0005798 519-522 Not assayed or wild type 972 h- mod5 mod5-deltaCaaX partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0007907 deletion 972 h- ypt71 ypt71delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:28656962 4896 2023-04-03 We observed that loss of Bhd1 and Ypt71, but not Ypt7, resulted in increased TORC1 activity, as determined by an increase in Rps6 and p70 S6K phosphorylation levels when cells were deprived of amino acids (Fig. 5a, compare lanes 1, 3, 5 and 7). PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0001357 deletion 972 h- ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 PMID:28656962 4896 2023-06-08 (Figure 5b) PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000084 deletion 972 h- ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ypt71 ypt71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.10c 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2012-01-01 PomBase SPBC8D2.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- sfc9 sfc9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC8D2.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfc9 sfc9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001490 A827ATCGACAATCGATAAGACTGACA Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-R39 cst1-R39 nucleotide_insertion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 A827ATCGACAATCGATAAGACTGACA Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-R39 cst1-R39 nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002060 A827ATCGACAATCGATAAGACTGACA Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-R39 cst1-R39 nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPCC1827.04 FYPO:0003412 vms1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 vms1 vms1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nur1 nur1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0003411 deletion 972 h- nur1 nur1delta deletion ECO:0000049 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 1B, D, E) PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0003411 deletion 972 h- nur1 nur1delta deletion ECO:0000049 low PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S2) PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- nur1 nur1delta deletion ECO:0000291 low PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S2) PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0004604 deletion 972 h- nur1 nur1delta deletion ECO:0000049 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 3E) PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000877 deletion 972 h- nur1 nur1delta deletion ECO:0000226 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 5A) PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 nur1 nur1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nur1 nur1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nur1 nur1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC825.05c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0005917 deletion 972 h- nur1 nur1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S2) PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 nur1 nur1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.11 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph nur1 nur1delta 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1834.13 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1834.13 SPAC1834.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1834.13 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1834.13 SPAC1834.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0007100 N136A Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 mei4 mei4-N136A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:21449049 4896 2019-10-03 mei4-N136A combined with pat1-114 was efficiently blocked at the meiosis I onset with telomere clustered at SPBs (in the bouquet configuration) at 32˚C, which arrest can be released by a temperature shift down to 25˚C. PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0006160 N136A Not assayed or wild type 972 h- h90 mei4 mei4-N136A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:21449049 4896 2019-10-09 PomBase SPBC660.08 FYPO:0000705 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC660.08),assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:34499173 4896 2021-10-25 PomBase SPBC660.08 FYPO:0000381 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000127 medium PMID:31941401 4896 2020-02-21 In contrast, Pho8Δ60 activity was only restored to about half of the wild-type level when expressing Atg38[AIM mut]. AND Tdh1-YFP processing assay PomBase SPBC660.08 FYPO:0000381 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000127 medium PMID:31941401 4896 2020-02-25 PomBase SPBC660.08 FYPO:0000381 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium PMID:31941401 4896 2020-02-25 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:31941401 4896 2020-02-21 (Figure 3A, B) PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPAC25A8.02) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 3A,B) but reduced the PAS accumulation of the ...t Atg14, ...s Atg18b and Atg24b, Atg2, Atg5, Atg16, and Atg8 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPBC405.05) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 3A,B) but reduced the PAS accumulation of the ...t Atg14, ...s Atg18b and Atg24b, Atg2, Atg5, Atg16, and Atg8 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPBC4B4.10c) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 3A,B) but reduced the PAS accumulation of the ...t Atg14, ...s Atg18b and Atg24b, Atg2, Atg5, Atg16, and Atg8 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPBC31E1.01c) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 3A,B) but reduced the PAS accumulation of the ...t Atg14, ...s Atg18b and Atg24b, Atg2, Atg5, Atg16, and Atg8 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPAC823.16c) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 3A,B) but reduced the PAS accumulation of the ...t Atg14, ...s Atg18b and Atg24b, Atg2, Atg5, Atg16, and Atg8 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002615 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg1delta atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium assayed_using(PomBase:SPBC1711.11) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 3A,B) but reduced the PAS accumulation of the ...t Atg14, ...s Atg18b and Atg24b, Atg2, Atg5, Atg16, and Atg8 PomBase SPBC660.08 FYPO:0001645 F178A,V181A Not assayed or wild type 972 h- atg38 atg38-F178A,V181A atg38-[AIM mut] amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC660.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 1E) PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000088 S322A Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-S322A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002998 1394-1526 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaCt myo2deltaCt-1-1393 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-13 (Fig. 1C) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002555 1394-1526 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaCt myo2deltaCt-1-1393 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-13 (Fig. 1C) PomBase SPCC645.05c FYPO:0000705 1394-1526 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaCt myo2deltaCt-1-1393 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-14 (Fig. 6F) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000240 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tip1 tip1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005464 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125 high assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:11007487 4896 2016-10-31 (Fig. 3) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tip1 tip1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0007998 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0006083 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 11 PMID:15509865 4896 2017-07-11 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0006502 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003329 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 5A,B) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005814 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 5A,B) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005794 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000110 70-80 PMID:11007487 4896 2016-10-28 (Fig. 3D) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0004700 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 >80 PMID:11007487 4896 2016-10-28 (Fig. 3B) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0007563 deletion 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-06-23 (Fig. 6B) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tip1 tip1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005799 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000125,FYECO:0000126 PMID:11007487 4896 2016-10-31 (Fig. 6) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001324 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 5C) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005798 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0006637 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001586 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:11007487 4896 2016-10-28 (Fig. 3H) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000933 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 5A,B) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005691 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:18495844 4896 2020-06-05 (Fig. 2A-C) This oscillatory movement was not perturbed by Latrunculin A treatment, but was lost in cells treated with MBC or in mto1Δ cells, and was reduced in tip1Δ cells PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000581 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000761 deletion 972 h- KanR h90 tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-06-01 (Fig. 6C) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003482 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 5E,F) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003194 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000125,FYECO:0000126 >70 PMID:11007487 4896 2016-10-31 (Fig. 6) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 5.3 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0003717 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001366 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:11007487 4896 2016-10-31 (Fig. 3I) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0007810 deletion 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-05-17 (Fig. 5 Table 3,4) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000957 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-12-06 (Fig. 2) PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001399 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:11007487 4896 2016-11-22 data not shown PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0007167 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0001402 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:12234926 4896 2017-08-16 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0004731 deletion 972 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 6A-C), PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0006501 deletion 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tip1 tip1delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0000102 deletion 972 h- pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0000102 deletion 972 h- pso2 pso2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0007330 deletion 972 h- pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:32034465 4896 2020-03-31 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0006347 deletion 972 h- pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pso2 pso2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0002480 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pso2 pso2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- pso2 pso2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pso2 pso2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pso2 pso2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007594 Y28A,I31A Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaAIM amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 Figure 3C PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007602 Y28A,I31A Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaAIM amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 By contrast, the atg7D and atg43DAIM mutants did not exhibit such an increased in superoxide (Figure 7D) PomBase SPCC970.01 FYPO:0004408 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC970.01 FYPO:0000102 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC970.01 FYPO:0000267 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 low PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPCC970.01 FYPO:0004402 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC970.01 FYPO:0004405 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC970.01 FYPO:0002345 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC970.01 FYPO:0004409 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPCC970.01 FYPO:0000268 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPCC970.01 FYPO:0000268 Q643* Not assayed or wild type 972 h- rad16 rad16-U partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC4G8.13c FYPO:0001921 1-240 Not assayed or wild type 972 h- prz1 prz1-241-681 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC4G8.13c) PMID:22496451 4896 2013-11-18 PomBase SPAC4G8.13c FYPO:0000703 1-240 Not assayed or wild type 972 h- prz1 prz1-241-681 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC4G8.13c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:22496451 4896 2013-11-18 PomBase SPCC777.14 FYPO:0001357 15-25 Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-delta-NLS partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:9102632 4896 2013-09-25 PomBase SPAC20G8.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- nat10 nat10delta 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F, G, and I PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000703 1-192 Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 5) PomBase SPAC5D6.05 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 med18 med18delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC5D6.05 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph med18 med18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.05 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph med18 med18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.05 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph med18 med18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.05 FYPO:0002924 deletion 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FYPO:0000158 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0005580 PMID:10589835 4896 2019-06-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0005773 wild type Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105 PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 2A) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 PMID:11937031 4896 2011-11-18 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 PMID:10589835 4896 2019-06-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000344 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000836 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000126 high high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:17690116 4896 2020-09-01 (Fig. 3) cdc18 expressed from pREP3X is at a high level. They argue that higher levels cdc18 lead to rereplication and lower levels lead to a rad3 dependent block but no rereplication PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000836 wild type Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 3) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004961 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 100 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:12419251 4896 2015-10-22 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004598 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:11532929 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004598 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11532929 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002994 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10747035 4896 2012-10-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002083 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:8643672 4896 2014-09-19 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002083 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 PMID:8521469 4896 2014-11-24 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000012 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:7916658 4896 2019-01-24 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004597 wild type Overexpression 972 h- cdc25-22 cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000004 medium PMID:11532929 4896 2015-05-07 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- cdc18 cdc18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7916658 4896 2019-01-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 1-119 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-C2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:26063574 4896 2017-11-08 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0001457 deletion 972 h- dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- dsd1 dsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsd1 dsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- dsd1 dsd1delta deletion ECO:0005638 PMID:12633877 4896 2014-04-30 PomBase SPBC3B8.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsd1 dsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.04 FYPO:0001645 S571A Not assayed or wild type 972 h- sup35 sup35-S571A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:19417105 4896 2016-10-30 Supplemental Table S1; Supplemental Fig. S3 PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000088 T174TGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-ext nse4/ext amino_acid_insertion ECO:0005638 high PMID:32546830 4896 2020-07-02 PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000089 T174TGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-ext nse4/ext amino_acid_insertion ECO:0005638 medium PMID:32546830 4896 2020-07-02 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002779 27-41,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(26-40)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002061 27-41,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(26-40)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-84 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-84 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000973 G373D Not assayed or wild type 972 h- gsa1 gsa1-G373D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10219997 4896 2012-04-27 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000974 G373D Not assayed or wild type 972 h- gsa1 gsa1-G373D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10219997 4896 2012-04-27 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000955 G373D Not assayed or wild type 972 h- gsa1 gsa1-G373D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10219997 4896 2012-04-27 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000954 G373D Not assayed or wild type 972 h- gsa1 gsa1-G373D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10219997 4896 2012-04-27 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000096 G373D Not assayed or wild type 972 h- gsa1 gsa1-G373D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:10219997 4896 2012-01-13 PomBase SPAC26F1.03 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pda1 pda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26F1.03 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pda1 pda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26F1.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- pda1 pda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC26F1.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pda1 pda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26F1.03 FYPO:0009060 deletion 972 h- pda1 pda1delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPCC306.04c FYPO:0000468 Y897A Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-Y897A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 4D) PomBase SPAC110.02 FYPO:0006521 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000141 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0005638 FYECO:0000291 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0003165 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0006522 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0005638 FYECO:0000291 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0006523 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-1 disruption ECO:0005638 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0003906 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0005638 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0004107 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0000112 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0006524 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0001232 FYECO:0000291 33 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0006525 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0001232 FYECO:0000291 49 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000268 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 pds5 pds5-1 disruption ECO:0005638 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPAC110.02 FYPO:0002060 pds5::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-1 disruption ECO:0005638 PMID:11598020 4896 2018-04-25 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001147 wild type Overexpression 972 h- rhb1 rhb1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10835385 4896 2021-01-22 PomBase SPBC428.16c FYPO:0005035 wild type Overexpression 972 h- rhb1 rhb1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:20144990 4896 2016-01-13 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- rhb1 rhb1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10835385 4896 2021-01-22 PomBase SPBC428.16c FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- rhb1 rhb1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10835385 4896 2021-01-22 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000237 high PMID:40124504 4896 2025-04-11 Likewise, the deletion of genes encoding the above predicted components of the S. pombe EMC (emc3D, emc5D and emc6D) renders a cold- sensitive phenotype too (Figure 1D). PomBase SPBC1711.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- emc3 emc3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0001489 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc3 emc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.03 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SPBC1711.03 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0009060 deletion 972 h- emc3 emc3delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph emc3 emc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- emc3 emc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc3 emc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc3 emc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002765 I237P,T238P,D239P,R240P Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-M3 spTrm10_M3 amino_acid_mutation ECO:0005801 low assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 P81A Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-P81A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPBC609.01 FYPO:0000320 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC609.01 SPBC609.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC609.01 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC609.01 SPBC609.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC609.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC609.01 SPBC609.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC609.01 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ECO:0001232 >90 PMID:10799520 4896 2021-10-17 PomBase SPAC222.10c FYPO:0001222 wild type Knockdown 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:10799520 4896 2021-10-17 PomBase SPAC222.10c FYPO:0001875 wild type Knockdown 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 >95 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 PomBase SPAC222.10c FYPO:0007646 wild type Knockdown 972 h- cdc10–129 byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106 75 PMID:10799520 4896 2021-10-17 (Figure 2E) These results show that Byr4 is required to prevent septation in G1 cells. PomBase SPAC2G11.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- urb2 urb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2G11.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urb2 urb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.02 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urb2 urb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ smn1 smn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0002059 deletion 972 h- smn1 smn1delta deletion ECO:0005638 PMID:10749974 4896 2015-12-01 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0002113 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smn1 smn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- smn1 smn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smn1 smn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- smn1 smn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10816558 4896 2014-07-25 PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0002061 20-22 Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-ST54B partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001117 A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 medium assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S4B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003040 A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 1B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001327 A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0005120 A736C,G737C Overexpression 972 h- pat1-as mamRNA mamRNA-3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 5D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003700 A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 1B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0006976 A736C,G737C Overexpression 972 h- pat1-as mamRNA mamRNA-3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 5D) PomBase SPAC19G12.10c FYPO:0001668 deletion 972 h- cpy1 cpy1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.11c) PMID:25803873 4896 2018-01-05 PomBase SPAC19G12.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- cpy1 cpy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cpy1 cpy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cpy1 cpy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 F93W Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-F93W amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0002578 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.18 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cox20 cox20delta deletion ECO:0005638 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(Figure 2A) PomBase SPCC663.11 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph saf1 saf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.11 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph saf1 saf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.11 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph saf1 saf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.11 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph saf1 saf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.11 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 saf1 saf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC663.11 FYPO:0001908 deletion 972 h- saf1 saf1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:25274039 4896 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2023-06-28 PomBase SPCC663.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl39 rpl39delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl39 rpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC663.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl39 rpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC663.04 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl39 rpl39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0001679 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC890.04c) PMID:36423630 4896 2024-02-09 By contrast, in fkbp39D cells, we detected Ytm1 on chromatin, primarily at the 30 end of the rDNA repeats, specifically enriched at the 30 ETS and the non-transcribed spacer (NTS) DNA sites (Figures 4A, S5A, and S5B). PomBase SPBC1347.02 FYPO:0005017 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0000291 PMID:36423630 4896 2024-02-09 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0002827 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 Table1 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0003694 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0000291 PMID:36423630 4896 2024-02-09 reduced levels of 18S and 25S rRNA and accumulation of 50 ETS RNA and unprocessed rRNA in the mutant compared with wild-type cells (Figures S5D and S5E). 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PomBase SPBC1347.02 FYPO:0006353 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0000291 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Fig. 4b) PomBase SPBC1347.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ani1 ani1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ani1 ani1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0003702 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0004008 deletion 972 h- ani1 ani1delta deletion ECO:0000291 PMID:36423630 4896 2024-02-09 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ani1 ani1delta deletion ECO:0005638 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Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000674 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000674 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000674 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000964 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000964 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000964 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000964 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000964 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0000964 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S2B PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0001513 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0003241 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0003241 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0003241 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 13 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0003241 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC16A10.05c FYPO:0003241 dad1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS dad1 dad1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 14 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0000854 deletion 972 h- spt6 spt6delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0000855 deletion 972 h- spt6 spt6delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0000082 deletion 972 h- spt6 spt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21844224 4896 2016-02-09 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph spt6 spt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spt6 spt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0001407 deletion 972 h- spt6 spt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21844224 4896 2012-02-17 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph spt6 spt6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 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sre2 sre2-R778A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0003659 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0003352 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0006810 deletion 972 h- rad51delta msh2 msh2delta deletion ECO:0000049 PMID:32355220 4896 2020-06-27 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000470 deletion 972 h- h90 msh2 msh2delta deletion ECO:0000059 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000470 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 msh2 msh2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 msh2 msh2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0007425 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0000049 PMID:32355220 4896 2020-06-27 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0007425 deletion 972 h- rad51delta msh2 msh2delta deletion ECO:0000049 PMID:32355220 4896 2020-06-29 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000969 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0001690 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000963 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000957 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- 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PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta msh2 msh2delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- msh2 msh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msh2 msh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msh2 msh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0007472 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 PMID:27268234 4896 2024-05-11 (Fig. S6) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005046 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 medium PMID:12773392 4896 2024-02-20 Our analysis revealed that mutant strains display defects in the segregation, resolution and/or condensation of chromosomes during mitosis (Figure 6A), and mis-segregated the mini-chromosome Ch16 (a 530 kb derivative of chromosome 3; Niwa et al., 1986) at a signi®cantly higher rate than wild-type cells (Figure 6C). PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000082 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12773392 4896 2024-02-20 and irreversible temperature-sensitive (Ts±) growth defects (Figure 5B±D). PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003412 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 high PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. 2D) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0007217 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Based on the genetic analyses, it was possible that Asf1/HIRA facilitate histone deacetylation by Clr6. Asf1 co-immunoprecipitated with Clr6 complex subunits Alp13 and Clr6 (Figure 3B). Moreover, asf1-1 and hip1Δ exhibited a substantial increase in bulk H3K9ac levels, in a manner similar to alp13Δ (Figure 3C).). To confirm this further, we performed ChIP-chip analyses of H3K9ac. Both alp13Δ and asf1-1 mutants showed widespread increase in H3K9ac, as compared to the wild-type cells. Notably, although 30% of the probes in our microarray correspond to intergenic regions, nearly all probes affected by asf1-1 and alp13Δ reside in coding regions (Figure 3D and 3E). PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0008183 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 We found that H3 Ser10 phosphorylation levels were considerably reduced in alp13, pst2 and clr6 mutant cells, except at 2±3 foci near the nuclear periphery, presumably representing heterochromatic loci (Figure 7) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0008224 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. S5B) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000470 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0001117 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0001117 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC336.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 PMID:27268234 4896 2024-05-08 (Fig. S6) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003557 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005315 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0003547 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005522 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 medium PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005522 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000291 medium PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005518 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005310 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Cells carrying Dalp13 were speci®cally defective in the removal of acetyl groups present on H3 Lys9 and Lys14, as well as H4 Lys5 and Lys8. PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005310 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:23032292 4896 2020-04-09 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0008219 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 high PMID:27268234 4896 2024-05-07 (Fig. 3A) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0004347 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Based on the genetic analyses, it was possible that Asf1/HIRA facilitate histone deacetylation by Clr6. Asf1 co-immunoprecipitated with Clr6 complex subunits Alp13 and Clr6 (Figure 3B). Moreover, asf1-1 and hip1Δ exhibited a substantial increase in bulk H3K9ac levels, in a manner similar to alp13Δ (Figure 3C).). To confirm this further, we performed ChIP-chip analyses of H3K9ac. Both alp13Δ and asf1-1 mutants showed widespread increase in H3K9ac, as compared to the wild-type cells. Notably, although 30% of the probes in our microarray correspond to intergenic regions, nearly all probes affected by asf1-1 and alp13Δ reside in coding regions (Figure 3D and 3E). PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0004347 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0004347 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000892 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000892 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Cells carrying Dalp13 were speci®cally defective in the removal of acetyl groups present on H3 Lys9 and Lys14, as well as H4 Lys5 and Lys8. PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000892 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000887 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0006987 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0006361 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0008220 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000226 high PMID:27268234 4896 2024-05-07 (Fig. 3B) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005309 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Cells carrying Dalp13 were speci®cally defective in the removal of acetyl groups present on H3 Lys9 and Lys14, as well as H4 Lys5 and Lys8. PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005308 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Cells carrying Dalp13 were speci®cally defective in the removal of acetyl groups present on H3 Lys9 and Lys14, as well as H4 Lys5 and Lys8. PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005523 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000969 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000963 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0008221 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. S5A) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0008222 deletion 972 h- cdc25-22 alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. S5B) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005336 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000112 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000857 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0000059 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0004325 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000095 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000095 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000085 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0000268 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0005750 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S7D) PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0002215 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23H4.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp13 alp13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0003933 L69S Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-P69S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:15671491 4896 2014-10-30 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0002061 L69S Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-P69S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15671491 4896 2014-10-30 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0003932 L69S Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-P69S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:15671491 4896 2014-10-30 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0000703 L69S Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-P69S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.21) PMID:15671491 4896 2014-10-30 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0001357 L69S Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-P69S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15671491 4896 2014-10-30 PomBase SPCC188.11 FYPO:0001991 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp45 prp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.11 FYPO:0002059 deletion 972 h- prp45 prp45delta deletion ECO:0005638 PMID:11414703 4896 2024-02-16 One of the diploid clones (C1) was allowed to sporulate and ;100 of the haploids obtained were tested for resistance to G418. We found no resistants, which implicates that spSNW1 is an essential gene in S. pombe. PomBase SPCC188.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp45 prp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp45 prp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC188.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp45 prp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.11 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp45 prp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1D4.06c FYPO:0000080 N284K,R285W,A286G Not assayed or wild type 972 h- csk1 csk1-N284K,R285W,A286G amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPAC1D4.06c FYPO:0002243 N284K,R285W,A286G Not assayed or wild type 972 h- csk1 csk1-N284K,R285W,A286G amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPAC2G11.14 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf1 taf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.14 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf1 taf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- taf1 taf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2G11.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf1 taf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0000468 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 3C) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0007334 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. S3) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0007336 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0006993 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:31468675 4896 2019-09-25 PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002827 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2E) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002827 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0004604 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000049 high PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0000888 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002355 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0004137 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003573 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003573 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC613.12c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003573 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC970.07c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003573 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003573 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 5A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002386 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002386 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC613.12c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002386 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC970.07c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002386 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002386 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 5A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002387 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002836 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000291 PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2C) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002331 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 4B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0001861 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 3B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003152 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Set1 significantly at 37 ̊C compared to that at 30 ̊C, which is due to the temperature sensitive nature of cul4-1. PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0001327 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 The western blot results suggest that the loss of any member of CLRC complex enhances the protein amount of Lsd1 (Fig 3C) or Lsd2 (Fig 3D). PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0001327 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 The western blot results suggest that the loss of any member of CLRC complex enhances the protein amount of Lsd1 (Fig 3C) or Lsd2 (Fig 3D). PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0004237 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2B and D) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0004377 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0000228 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0001232 17 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 3A) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0000833 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 5C) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0000833 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 5C) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0002389 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 5D) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0001357 marker gene insertion at 3'-UTR Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-1 fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. S3) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,V761A Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-21 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,V761A Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-21 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAPB17E12.06 FYPO:0001270 K264KIMRRYR Not assayed or wild type 972 h- sos7 sos7-+6 amino_acid_insertion ECO:0001232 PMID:22711988 4896 2012-07-27 PomBase SPAPB17E12.06 FYPO:0001271 K264KIMRRYR Not assayed or wild type 972 h- sos7 sos7-+6 amino_acid_insertion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22711988 4896 2012-07-27 PomBase SPAPB17E12.06 FYPO:0001273 K264KIMRRYR Not assayed or wild type 972 h- sos7 sos7-+6 amino_acid_insertion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22711988 4896 2012-07-27 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 otu1 otu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 otu1 otu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 otu1 otu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0001034 deletion 972 h- otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 otu1 otu1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph otu1 otu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- otu1 otu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 otu1 otu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24C9.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 otu1 otu1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0001571 Y42F Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-Y41F amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04),assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:29136238 4896 2018-02-12 and observed a preferential association of Swi6 with Y41F over Y41p peptide, suggesting that phosphorylation of H3Y41 counteracts the interaction of Swi6 with histone H3 (Supplementary Figure S6A). PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 V644G Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-as1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Table 1; Fig. 3A) PomBase SPBC646.14c FYPO:0002060 L266P,P375L Overexpression 972 h- orc5 orc5-H37 orp5-H37 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000227 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBCPT2R1.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBCPT2R1.02 SPBCPT2R1.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC691.05c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC691.05c FYPO:0002674 deletion 972 h- ist2 ist2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC594.01) PMID:39239853 4896 2024-09-08 To dissect the contribution of each class of ER-PM contact to Duc1-mNG localization, we analyzed its distribution in hob2Δ, ltc2Δ, ist2Δ, and tcb1Δ tcb2Δ tcb3Δ strains. We found that Duc1-mNG was excluded from the cell division site in all four strains, as in wild-type cells (Fig. S2A). PomBase SPBC691.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.05c FYPO:0001034 deletion 972 h- ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC691.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ist2 ist2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- ist2 ist2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC691.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ist2 ist2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC691.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ist2 ist2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.03 FYPO:0002061 73,Y71K,Y72K Not assayed or wild type 972 h- hub1 hub1-KK YY71KK,delta73 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 PMID:15620657 4896 2014-08-13 PomBase SPCC1840.04 FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- pca1 pca1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:17898859 4896 2014-12-02 PomBase SPCC1840.04 FYPO:0004129 wild type Overexpression 972 h- pca1 pca1+ wild_type ECO:0005801 PMID:17898859 4896 2014-12-02 PomBase SPCC1840.04 FYPO:0002004 wild 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972 h- sde2 sde2(GGMGG) sde2(GGM) amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 (Fig. 3C) decreased cell growth, normal processing, protein very stable, complements partially sde2Δ; over expression causes growth defect in hub1-1 strain, defective in telomeric silencing and genome stability PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008118 K85M Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGMGG) sde2(GGM) amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:36095128 4896 2023-08-30 (Figure 1) PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0003317 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:12234926 4896 2017-08-16 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-6 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-6 unknown ECO:0005638 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rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 complete PMID:18388861 4896 2024-07-12 Table 1. Further observation of the germinating spores showed that the mutated h90 cells elongated and eventually divided, but never formed visible colonies. Table 1 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002150 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:8290356 4896 2014-08-07 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003587 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0000337 PMID:23093942 4896 2014-07-24 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-08 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001929 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000260 PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0005945 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-10 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003891 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:11104907 4896 2014-10-13 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0007249 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15367656 4896 2020-02-18 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002554 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:12930957 4896 2016-02-29 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003530 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002687 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0000337 PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0005775 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-10-27 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000085 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000085 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-03 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000085 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 high PMID:39789818 4896 2025-05-15 The results of spot assays revealed that rad52Δ strain as a positive control grew slowly and exhibited pronounced sensitivities to all tested drugs. FIGURE 5 | The defective genotoxic and HR phenotypes of Rad52-Ser365 phosphorylation-defective and -mimicking mutants PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000102 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-03 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000102 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 high PMID:39789818 4896 2025-05-15 The results of spot assays revealed that rad52Δ strain as a positive control grew slowly and exhibited pronounced sensitivities to all tested drugs. FIGURE 5 | The defective genotoxic and HR phenotypes of Rad52-Ser365 phosphorylation-defective and -mimicking mutants PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0007330 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:32034465 4896 2020-03-31 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 medium PMID:9826747 4896 2016-04-13 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-03 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 high PMID:39789818 4896 2025-05-15 The results of spot assays revealed that rad52Δ strain as a positive control grew slowly and exhibited pronounced sensitivities to all tested drugs. FIGURE 5 | The defective genotoxic and HR phenotypes of Rad52-Ser365 phosphorylation-defective and -mimicking mutants PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000267 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:11726502 4896 2016-04-15 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000267 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000267 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:11104907 4896 2014-10-13 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000267 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 high PMID:9826747 4896 2016-04-13 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:11726502 4896 2016-04-18 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 high PMID:39789818 4896 2025-05-15 The results of spot assays revealed that rad52Δ strain as a positive control grew slowly and exhibited pronounced sensitivities to all tested drugs. FIGURE 5 | The defective genotoxic and HR phenotypes of Rad52-Ser365 phosphorylation-defective and -mimicking mutants PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:29898918 4896 2018-07-03 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:15336631 4896 2015-12-08 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002550 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:11104907 4896 2014-10-13 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:8290356 4896 2014-08-07 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001234 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0005455 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0000337 PMID:17724078 4896 2016-06-24 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003241 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0001232 14 PMID:28475874 4896 2017-06-27 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0005069 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000260 20 PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad52 rad52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Msmt0 rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 rhp22AD, rhp51D and rhp54D mutants do not form colonies in the wild-type h90 strain, as already shown for rhp22AD, although they are viable in mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 backgrounds. 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PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0001491 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad52 rad52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- rad52 rad52delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPCC24B10.13 FYPO:0000705 89-140 Not assayed or wild type 972 h- skb5 skb5-(1-88) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1604.14c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.13) PMID:10593886 4896 2015-12-02 PomBase SPBC17G9.04c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup85 nup85delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.04c FYPO:0004118 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PomBase SPAC56F8.08 FYPO:0008060 F330A Not assayed or wild type 972 h- mud1 mud1-F330A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:16138082 4896 2023-02-15 From these results, we conclude that the F330A mutation significantly reduces the affinity of the Mud1 UBA domain for K48-linked polyUb chains without significantly affecting monoUb binding. PomBase SPBC409.12c FYPO:0002019 wild type Overexpression 972 h- stn1 stn1+ wild_type ECO:0000337 medium PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. S3) PomBase SPCC965.10 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPCC965.10 SPCC965.10+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC965.10 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPCC965.10 SPCC965.10+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC9.13c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cwf16 cwf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.13c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cwf16 cwf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.13c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cwf16 cwf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003998 416-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-416-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:16720577 4896 2014-11-13 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001991 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 red5 red5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 red5 red5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- red5 red5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 red5 red5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 red5 red5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.01c FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg8 erg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.01c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg8 erg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- erg8 erg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg8 erg8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0000581 deletion 972 h- gle1 gle1delta deletion ECO:0001232 PMID:18758733 4896 2014-12-02 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gle1 gle1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0002263 deletion 972 h- gle1 gle1delta deletion ECO:0001232 PMID:18758733 4896 2014-12-02 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gle1 gle1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- gle1 gle1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gle1 gle1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31E1.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- gle1 gle1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18758733 4896 2014-12-02 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002346 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000156 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0007477 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 38.3 PMID:31206516 4896 2024-01-01 These results suggested that the white phenotype of W70 was not linked to otr1R::ade6+. The re-appearance of red colonies from epe1Δ W70 cells (Fig 1C) suggested that the white phenotype was due to epigenetic rather than genetic alterations. PomBase SPCC622.16c FYPO:0005530 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC631.02) PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003743 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 low PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC622.16c FYPO:0006712 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000335 low PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004201 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 low PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003412 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 low PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003412 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003412 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 low PMID:39945308 4896 2025-03-18 (Fig. 1F) PomBase SPCC622.16c FYPO:0003412 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004604 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000303 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 low PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0007478 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 6G) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000890 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0005533 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000059 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 epe1 epe1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002842 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1952.05) PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 6) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002842 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.11c) PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 6) PomBase SPCC622.16c FYPO:0005531 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC637.12c) PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0001514 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC736.11) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006710 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2e) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002446 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2c) PomBase SPCC622.16c FYPO:0005749 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2a) PomBase SPCC622.16c FYPO:0001885 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2d) PomBase SPCC622.16c FYPO:0001117 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:24013502 4896 2013-12-12 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000584 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0005286 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003045 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 PMID:24013502 4896 2013-12-12 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006985 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-21 (Figure 2) PomBase SPCC622.16c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006714 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0006713 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000335 low PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000220 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000231 low PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004541 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 7A) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004376 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000231 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004376 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 7A, 7B) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004544 deletion 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 Of the eight tested mutants, only epe1D consistently formed red-pink colonies on +AHT plates, indicating that 4xtetO-ade6+ can remain repressed without bound TetR-Clr4* (Fig. 4A and figs. S5 and S6). PomBase SPCC622.16c FYPO:0004544 deletion 972 h- tetR-clr4-I ura4delta::10xtetO-ade6+ clr4+ epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 2A) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000577 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:24013502 4896 2013-12-12 PomBase SPCC622.16c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 low PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000887 deletion 972 h- mat2-3delta epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000887 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32295063 4896 2020-10-01 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006373 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006373 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:16762840 4896 2024-01-17 We also tested the effect of Epe1 on heterochromatic markers at meiotic genes. Interestingly, loss of Epe1 resulted in considerable increase in H3K9me2 and H3K9me3 levels, concomitant with moderate increase in Swi6 binding at the ssm4 gene (Figures 6E and 6F). PomBase SPCC622.16c FYPO:0006361 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000873 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:25774602 4896 2015-07-23 PomBase SPCC622.16c FYPO:0007469 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 high PMID:40093821 4896 2025-04-10 (Fig. 1E) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000879 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 low PMID:40093821 4896 2025-04-10 (Fig. 1F) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004948 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0007953 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_region(SO:0002020) PMID:16762840 4896 2024-01-17 We next investigated the possible involvement of Epe1 in boundary function of the IRC elements. Remarkably, deletion of epe1 resulted in spreading of Swi6 and H3K9me into euchromatic regions surrounding cen1 (Figure 7D). PomBase SPCC622.16c FYPO:0001309 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:40093821 4896 2025-04-08 (Fig. 1A-D) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000228 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 epe1 epe1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006995 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0006995 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPCC622.16c FYPO:0006992 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002336 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000004 PMID:38289024 4896 2024-03-23 (Figure 8A) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002336 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC622.16c FYPO:0007479 deletion 972 h- tetR-clr4-I ura4delta::10xtetO-ade6+ epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 2) PomBase SPCC622.16c FYPO:0007479 deletion 972 h- tetR-clr4-I ura4delta::10xtetO-ade6+ clr4-deltaCD epe1 epe1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 3E) PomBase SPCC622.16c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 epe1 epe1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0001164 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:28600551 4896 2018-10-25 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004743 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004743 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 7C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000833 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002389 deletion 972 h- mat2-3delta epe1 epe1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000073 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32908306 4896 2021-04-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000852 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1c) PomBase SPCC622.16c FYPO:0005968 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 PMID:28600551 4896 2018-10-25 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0001098 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000326 high PMID:33533152 4896 2025-01-06 (Fig. 3D) PomBase SPCC622.16c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0001987 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1d) PomBase SPCC622.16c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000089 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000211 high PMID:33533152 4896 2025-01-06 (Fig. 3D) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000091 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002550 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000315 medium PMID:33533152 4896 2025-01-06 (Fig. 3D) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 epe1 epe1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007553 short deletion with a frameshift at codon 772,resulting in a different 772–814 C-terminus Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-del disruption ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-01-29 24h G0 cell microscopy PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007553 short deletion with a frameshift at codon 772,resulting in a different 772–814 C-terminus Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-del disruption ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0007629 short deletion with a frameshift at codon 772,resulting in a different 772–814 C-terminus Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-del disruption ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000069 short deletion with a frameshift at codon 772,resulting in a different 772–814 C-terminus Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-del disruption ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 (Fig. S6) PomBase SPAC644.06c FYPO:0000998 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr1 cdr1-37 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:3448096 4896 2013-07-18 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001219 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr1 cdr1-37 unknown ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:3448096 4896 2013-07-18 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr1 cdr1-37 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:3448096 4896 2013-07-18 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007178 763-773 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES2 deltaNES2-mid1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10930468 4896 2023-03-02 DNES2-mid1p had a weaker, but demonstrable nuclear export defect: it retained some weak cortical staining and weak rings in addition to nuclear staining (Figure 6C), but PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001920 763-773 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaNES2 deltaNES2-mid1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10930468 4896 2023-03-02 DNES2-mid1p had a weaker, but demonstrable nuclear export defect: it retained some weak cortical staining and weak rings in addition to nuclear staining (Figure 6C), but PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0003770 unknown Not assayed or wild type 972 h- byr1 byr1-sterile unknown ECO:0000049 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPMTR.02) PMID:7975894 4896 2012-07-27 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003749 W43A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-W43A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:22323607 4896 2014-09-02 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 W43A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-W43A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000038 PMID:16341225 4896 2014-10-30 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0004493 pol1::ura4 Null 972 h- pol1 pol1::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0004113 pol1::ura4 Null 972 h- pol1 pol1::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002379 pol1::ura4 Null 972 h- pol1 pol1::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002061 pol1::ura4 Null 972 h- pol1 pol1::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8367300 4896 2015-03-26 PomBase SPCC965.05c FYPO:0004280 I289P Not assayed or wild type 972 h- thp1 thp1-I289P amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18789404 4896 2015-01-12 PomBase SPCC965.05c FYPO:0004284 I289P Not assayed or wild type 972 h- thp1 thp1-I289P amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18789404 4896 2015-01-12 PomBase SPCC965.05c FYPO:0004278 I289P Not assayed or wild type 972 h- thp1 thp1-I289P amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18789404 4896 2015-01-12 PomBase SPCC965.05c FYPO:0004282 I289P Not assayed or wild type 972 h- thp1 thp1-I289P amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18789404 4896 2015-01-12 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000611 Q469R Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U01 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0001355 Q469R Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U01 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 medium PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000839 Q469R Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U01 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0002061 Q469R Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U01 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0001357 Q469R Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U01 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 579-798 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta579-798 M1-delta5 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 579-798 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta579-798 M1-delta5 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Figure 4) PomBase SPNCRNA.524 FYPO:0007726 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.524 SPNCRNA.524+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000296 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.524 FYPO:0000112 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.524 SPNCRNA.524+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0006661 H472A Overexpression 972 h- trz2 trz2-H472A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2E,F) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005823 H472A Overexpression 972 h- trz2 trz2-H472A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2C,D) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0005823 H472A Overexpression 972 h- trz2 trz2-H472A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2C,D) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002061 H472A Overexpression 972 h- trz2 trz2-H472A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Fig. 2B) PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0004670 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0000112 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0003139 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000380 deletion 972 h- h- leu1-32 CFP-atg8::leu1+ atg5 atg5delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000127 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000380 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0000049 PMID:26624998 4896 2016-01-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0006295 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0000112 PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0002759 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:26624998 4896 2016-01-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0004671 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.15c) PMID:27737912 4896 2018-04-17 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0004671 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC140.01) PMID:27737912 4896 2018-04-17 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0004671 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg5 atg5delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0002615 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000230 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:23950735 4896 2013-09-15 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000584 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0008427 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000238 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0006660 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0006293 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0007629 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0004325 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 atg5 atg5delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph atg5 atg5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4B4.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg5 atg5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000703 1-375,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000703 1-375,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-375,880-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,880-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000848 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001424 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000082 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001324 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001324 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001355 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000614 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000455 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:18180284 4896 2015-11-27 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000972 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000839 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001387 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001532 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11606526 4896 2012-09-17 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0001420 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0000783 G1931A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-98 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:11606526 4896 2012-09-11 PomBase SPAC664.09 FYPO:0001324 (-754)-(-156) Not assayed or wild type 972 h- ggt1 ggt1--156--754 partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC664.09) PMID:15765057 4896 2014-11-27 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000141 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0004481 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000711 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0006857 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:36200823 4896 2023-01-17 However, the sfh1-13 mutation had only a mild influence on H3K9me levels (Figure 1C), as we reported previously (12). PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000460 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:32277274 4896 2020-05-06 (Fig. a) PomBase SPAC1250.01 FYPO:0006599 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.08c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 4H and I) PomBase SPAC1250.01 FYPO:0005948 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0007209 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:32277274 4896 2020-04-27 (Fig. b) PomBase SPAC1250.01 FYPO:0006355 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0008035 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_region(SO:0001799) PMID:36200823 4896 2023-01-17 at pericentromeric heterochromatin When CENP-ACnp1 was expressed at wild-type levels, specific accumulation at pericentromeric heterochromatin domains of all centromeres (Figure 1A), but not at non-centromeric locations PomBase SPAC1250.01 FYPO:0001387 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- mad2delta snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0001387 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0006842 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:36200823 4896 2023-01-17 Furthermore, we observed ectopic CENP-ACnp1 deposition at pericentromeric heterochromatin domains in snf21-36 but not in rsc1 and rsc4 deletion mutants (Figure 1F) PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000091 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000091 V404A,E461K,S566L,I571V Not assayed or wild type 972 h- mad2delta snf21 snf21-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004550 R64A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-R64A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000705 R64A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-R64A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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2013-08-05 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 N130A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-N130A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 N130A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-N130A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 L511* Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ clr3 clr3-L511stop partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 high PMID:38285941 4896 2024-04-08 (Fig. S1) PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 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wdr83 (Figure S1) and performed the Western blot and RT-qPCR analyses. We detected no significant changes in the mRNA levels of gpl1, gih35 or wdr83 in the analyzed mu- no significant changes in the mRNA levels of gpl1, gih35 or wdr83 in the analyzed mutants tants (Figure 5a). PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000840 deletion 972 h- gpl1 gpl1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC20H4.09) PMID:36361590 4896 2022-11-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph gpl1 gpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- gpl1 gpl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpl1 gpl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpl1 gpl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP23A10.13 FYPO:0002061 1-435 Not assayed or wild type 972 h- orc4 orc4deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:11850415 4896 2013-12-19 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006995 K15R,K169R,K214R Not assayed or wild type 972 h- pli1 pli1-K3R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000137 PMID:37970674 4896 2023-11-17 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000964 K15R,K169R,K214R Not assayed or wild type 972 h- pli1 pli1-K3R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37970674 4896 2023-11-17 Similarly, both nup132Δ and pli1Δ cells showed sensitivity to the microtubule-stabilising drug thiabendazole (TBZ), consistent with defects in centromere function, and this TBZ sensitivity was also not rescued by the Pli1K3R mutation (Fig. 1C). T PomBase SPAC1687.10 FYPO:0003327 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 PMID:24530531 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0004862 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0000904 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 PMID:24530531 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp1 mcp1delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0003417 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 PMID:24530531 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0001686 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0000964 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0009065 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1687.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp1 mcp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0005951 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000078 PMID:37956308 4896 2024-12-29 15 min after stress imposition, only few nucleosomes were still partially evicted in a wild-type background, whereas the number of nucleosomes which remained significantly less occupied relative to untreated conditions was much higher in cells lacking Top1 (Figure 4D and E; Supplementary Table S5). Of note, the differences observed for the averaged nucleosome maps of the 494 stress genes between wild-type and Δtop1 strains was more dramatic for the highly expressed genes of the quartil 1, than for the genes of the other quartils (unpublished data). PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001355 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 PMID:2827111 4896 2013-01-25 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0004066 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPCC1442.10c),assayed_region(PomBase:SPCC757.07c) PMID:37956308 4896 2024-12-31 In cells lacking Top1, Pol II recruitment was more sustained than in wild-type cells (compare 60 min in both backgrounds in Figure 2B). PomBase SPBC1703.14c FYPO:0004032 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.06c) PMID:25392932 4896 2014-11-19 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0004571 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_transcript(PomBase:SPCC757.07c) PMID:37956308 4896 2024-12-31 We determined by northern blot that the ctt1, srx1 and hsp9 genes, coding for the anti-stress proteins catalase, sulfiredoxin and the chaperone Hsp9, respectively, were up-regulated in Δtop1 cells to a larger extent that in a wild-type strain upon H2O2 stress (Figure 1B and Supplementary Figure S1E) PomBase SPBC1703.14c FYPO:0004571 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c) PMID:37956308 4896 2024-12-31 We determined by northern blot that the ctt1, srx1 and hsp9 genes, coding for the anti-stress proteins catalase, sulfiredoxin and the chaperone Hsp9, respectively, were up-regulated in Δtop1 cells to a larger extent that in a wild-type strain upon H2O2 stress (Figure 1B and Supplementary Figure S1E) PomBase SPBC1703.14c FYPO:0004571 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_transcript(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:37956308 4896 2024-12-31 We determined by northern blot that the ctt1, srx1 and hsp9 genes, coding for the anti-stress proteins catalase, sulfiredoxin and the chaperone Hsp9, respectively, were up-regulated in Δtop1 cells to a larger extent that in a wild-type strain upon H2O2 stress (Figure 1B and Supplementary Figure S1E) PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001690 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001690 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 6) PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001164 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0008245 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:37956308 4896 2024-12-31 Similarly, we determined by ChIP that Atf1 recruitment to stress promoters was unaltered in Δtop1 cells (Figure 1D). PomBase SPBC1703.14c FYPO:0004422 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:37956308 4896 2024-12-31 Nevertheless, we showed by western blot that Atf1 phosphorylation was not exacerbated in cells lacking Top1 (Figure 1C). PomBase SPBC1703.14c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001032 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 top1 top1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001032 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19197239 4896 2015-07-13 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001032 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 PMID:37956308 4896 2024-12-31 In fact, the Top1 deficient strains displayed resistance to camptothecin, as expected (Supplementary Figure S1C): PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001032 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 PMID:2849043 4896 2013-02-25 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001032 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30992049 4896 2020-04-03 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001032 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30992049 4896 2020-04-03 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001103 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 PMID:37956308 4896 2024-02-21 To our surprise, cells lacking Top1 were resistant to H2O2 on plates, when compared to a wild-type strain (Figure 1A). PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 top1 top1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0002239 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 top1 top1delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 top1 top1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0001491 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0005638 PMID:2827111 4896 2016-10-06 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- top1 top1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 top1 top1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 top1 top1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0000082 C12A Not assayed or wild type 972 h- spt4 spt4-C12A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:19460865 4896 2015-11-26 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0003412 ani2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ani2 ani2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007447 I117D,F120D,L124D,A137D,V141D,L148D Not assayed or wild type 972 h- yep1Δ hva22 yep1APH1mutAPH2mut amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Fig. 3L) PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000681 G40A,K43E Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-KE amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9167972 4896 2015-11-04 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0003269 G40A,K43E Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-KE amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:9167972 4896 2013-01-30 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000933 G40A,K43E Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-KE amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1093.06c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000444 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005580 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003819 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:15302919 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003819 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:15302919 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003819 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 PMID:15302919 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001168 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:15302919 4896 2014-09-11 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001168 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:15302919 4896 2014-09-11 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001168 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 PMID:15302919 4896 2014-09-11 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000080 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005638 high PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001916 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 high PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001929 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001357 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000088 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000089 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0001492 T1373C Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-R20 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000227 low PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC428.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.13c FYPO:0001122 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 PMID:10769201 4896 2010-07-09 PomBase SPBC428.13c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.13c FYPO:0002294 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- mob1 mob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC428.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC428.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0005638 PMID:10837231 4896 2025-01-28 To examine the function of Mob1p in vivo, we deleted the mob1 gene (see Supplementary material) and found that it was essential for growth. PomBase SPBC428.13c FYPO:0002424 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 PMID:10769201 4896 2025-10-20 F-actin patches were present at the growing tips in interphase (Fig. 4C). PomBase SPBC428.13c FYPO:0007106 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 PMID:10769201 4896 2025-10-20 Staining of microtubules indicated that interphase arrays and mitotic spindles were present in the population (Fig. 4D) PomBase SPBC428.13c FYPO:0004328 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10769201 4896 2025-10-20 and ring formation in mitotic cells (Fig. 4E, left panels). PomBase SPBC428.13c FYPO:0004328 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.01) PMID:10769201 4896 2025-10-20 The spindle pole body component sad1p was visible on all nuclei (Fig. 4F) PomBase SPBC428.13c FYPO:0007028 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 the medial ring component cdc15p, which is essential for septation, also formed a ring in the absence of mob1p (Fig. 4H). PomBase SPBC428.13c FYPO:0007568 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 in anaphase cells, cdc7p was associated with the spindle pole bodies of half the nuclei (Fig. 4G), as described previously (Sohrmann et al., 1998). PomBase SPBC428.13c FYPO:0006919 deletion 972 h- mob1 mob1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10769201 4896 2025-10-20 Staining for mid1p showed the expected nuclear localisation in interphase (Fig. 4E, right panels) PomBase SPCC1183.09c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000674 deletion 972 h- pmp31 pmp31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0001164 deletion 972 h- pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0002637 deletion 972 h- pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000961 deletion 972 h- pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pmp31 pmp31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- pmp31 pmp31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmp31 pmp31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1183.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmp31 pmp31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000703 1,141-432 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-2-140 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Fig. 2D) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000703 1-228 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-C tea4C partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000703 1-228 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-C tea4C partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0007479 deletion 972 h- rtt106 rtt106delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rtt106 rtt106delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- rtt106 rtt106delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt106 rtt106delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.05 FYPO:0003412 knh1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 knh1 SPBC11C11.05::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0007274 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003811 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 Interestingly, the short-lived mutant yta12Δ displayed aggregated mitochondria at the cell poles similar to msp1Δ cells, suggesting that this matrix protease may participate in the regulation of mitochondrial fusion (Fig. 5D, E). PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000342 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0005801 PMID:9790976 4896 2014-09-12 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002430 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9790976 4896 2014-09-12 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9790976 4896 2014-09-12 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0005638 PMID:27664110 4896 2019-10-16 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0005638 low PMID:23521895 4896 2014-10-03 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003820 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 PMID:9790976 4896 2014-09-12 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003881 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 PMID:9790976 4896 2014-09-12 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 deletion 972 h- msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msp1 msp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16C4.19 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp21 rpp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16C4.19 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp21 rpp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16C4.19 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpp21 rpp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC16C4.19 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp21 rpp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r10-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)5(S5A)9(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPCC1393.13 FYPO:0004303 D252N Overexpression 972 h- duf89 duf89-D252N amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1393.13) PMID:35314193 4896 2022-10-21 (Figure 10) PomBase SPAC1952.01 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gab1 gab1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.01 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gab1 gab1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high 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FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.15c FYPO:0004483 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 PMID:12868054 4896 2020-03-17 (Fig. 3) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0000583 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 PMID:12868054 4896 2020-03-17 (Fig. 5) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0005547 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 PMID:12868054 4896 2020-03-17 (Fig. 6) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:12868054 4896 2020-03-17 While both wild-type and vps33Δ cells grew at 26 ◦ C, vps33􏰗 cells exhibited a temperature-sensitive growth at 37 ◦C (Figure 2A). PomBase SPBC1703.15c FYPO:0007286 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 PMID:12868054 4896 2020-03-17 (Fig. 7) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0000076 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 PMID:12868054 4896 2020-03-17 PomBase SPBC1703.15c FYPO:0000096 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 PMID:12868054 4896 2020-03-17 (Fig. 7a) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0000098 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 high PMID:12868054 4896 2020-03-17 strong sensitivity to 100 mM CaCl2 (Figure 4A) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0003656 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 PMID:12868054 4896 2020-03-17 PomBase SPBC1703.15c FYPO:0001234 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:12868054 4896 2020-03-17 n liquid YES medium at 27 ◦ C, the cells had a doubling time of ∼8 h, in contrast to 2 h 30 min for wild-type cells. PomBase SPBC1703.15c FYPO:0000281 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 PMID:21757403 4896 2011-11-29 PomBase SPBC1703.15c FYPO:0000369 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0005638 PMID:12868054 4896 2020-03-17 (Fig. 2b) PomBase SPBC1703.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1703.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.15c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps33 vps33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0001645 K522E,K526E Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K522E,K526E amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:22705791 4896 2014-02-26 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0002896 wild type Overexpression 972 h- ape2 ape2+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001865) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0002896 wild type Overexpression 972 h- ape2 ape2+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001843) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0001315 wild type Overexpression 972 h- ape2 ape2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22496451 4896 2013-11-18 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 A154C,G155A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A154C,G155A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPCC970.02 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- dcw1 dcw1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPCC970.02 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC970.02 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dcw1 dcw1delta 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assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004247 L386A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-L386A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4C,D) PomBase SPAC1834.04 FYPO:0002827 K10A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K9A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:31468675 4896 2019-09-25 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0002827 K10A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K9A amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0002355 K10A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K9A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0004237 K10A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K9A amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:31468675 4896 2025-07-02 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0004377 K10A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K9A amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000492 854-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta50 msp1deltaGED partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 (Fig. 4B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000636 854-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta50 msp1deltaGED partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 Time-course measurements of the doubling times of these cultures showed that at day 5 the growth rate of strains expressing Msp1pK276A, Msp1pD50 and Msp1pD25 was greatly increased... (Fig. 4A). PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 854-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta50 msp1deltaGED partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-05-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 854-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta50 msp1deltaGED partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 GTPase (Msp1pK276A) and coiledcoil deleted (Msp1pD25-D50) mutants did not support the function of Msp1p as they failed to complement the msp1+ gene deletion. PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 854-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta50 msp1deltaGED partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 On the contrary, even slight overexpression of Msp1pK276A, Msp1pD50 or Msp1pD25 induced mitochondrial fragmentation; in about 60% of the cells the mitochondria appeared as small more or less clustered individual dots. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000843 123-166 Not assayed or wild type 972 h- hva22 rop1delta123-166 rop1(1-123) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 low PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 5A) PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0002033 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000242 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0001592 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000335 PMID:24344203 4896 2014-03-20 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0001592 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0003257 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000335 PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0001838 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0001117 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24344203 4896 2014-03-20 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0003170 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000335 PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0003258 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000335 high PMID:24344203 4896 2014-03-23 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:24344203 4896 2014-03-20 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:24344203 4896 2014-03-20 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- isp7 isp7delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:24344203 4896 2014-03-20 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC25B8.13c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph isp7 isp7delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001868 unknown Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-13 unknown ECO:0005801 PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001660 unknown Not assayed or wild type 972 h- cyr1 git2-13 unknown ECO:0000335 PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPCC1739.02c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl22 mrpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrpl22 mrpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1739.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl22 mrpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.02c FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl22 mrpl22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002060 27-41 Not 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2012-11-30 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000830 K250T Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-2 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:1396704 4896 2012-11-30 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0002937 disruption Null 972 h- rpl3001 rpl3001::kanMX6 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:24081329 4896 2013-12-05 PomBase SPBC1348.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- SPBC1348.06c SPBC1348.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1348.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1348.06c SPBC1348.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1348.06c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1348.06c SPBC1348.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R95A Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 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Only two germinating spores from a tetrad were viable, confirming that lid2+ is an essential gene PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- lid2 lid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lid2 lid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lid2 lid2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 G71V,R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,R531stop amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000004,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1D) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 G71V,R536* Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,R531stop 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FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1002 rps1002delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP22H7.08 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rps1002 rps1002delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBP22H7.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1002 rps1002delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9E9.05 FYPO:0001355 F299A Not assayed or wild type 972 h- sor1 sor1-F299A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38830897 4896 2024-11-12 Mutating three other conserved residues in the Sororin domain of Sor1 (F299A, V302A and Y305A) resulted in a similar phenotype (Fig. 2e). PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-2 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0001117 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-2 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-2 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp3 prp3-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPAC139.03 FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe2 toe2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC139.03 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe2 toe2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC139.03 FYPO:0004389 wild type Overexpression 972 h- toe2 toe2+ wild_type ECO:0000291 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC139.03 FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- toe2 toe2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC139.03 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe2 toe2+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004830 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9802907 4896 2016-04-28 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0001055 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 85 PMID:2203537 4896 2016-09-06 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 10 PMID:38780300 4896 2024-09-06 (Fig. 6C) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 13 PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 6C) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0000476 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003611 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0000112 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SPCC5E4.04 FYPO:0004513 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0002080 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0000678 L739C Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-206 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:14532136 4896 2014-07-30 PomBase SPAC3H1.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph sdd3 sdd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.02c FYPO:0000636 deletion 972 h- sdd3 sdd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:16491466 4896 2016-02-15 PomBase SPAC3H1.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph sdd3 sdd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sdd3 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PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001130 unknown Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-310 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-01 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000951 unknown Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-310 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000684 C1614A Not assayed or wild type 972 h- hul6 hul6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0000519 C1614A Not assayed or wild type 972 h- hul6 hul6-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 low PMID:38272226 4896 2024-12-11 (Fig. 5B and 5C) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0001814 C1614A Not assayed or wild type 972 h- hul6 hul6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000409 PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A) PomBase SPAC12B10.01c FYPO:0005825 C1614A Not assayed or wild type 972 h- hul6 hul6-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 4A) PomBase SPAC1556.07 FYPO:0008139 unknown Not assayed or wild type 972 h- pmm1 pmm1-1 sns-B9 unknown ECO:0001232 50 PMID:11839792 4896 2023-12-30 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPAC1556.07 FYPO:0008140 unknown Not assayed or wild type 972 h- pmm1 pmm1-1 sns-B9 unknown ECO:0001232 50 PMID:11839792 4896 2023-12-30 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPAC1556.07 FYPO:0001784 unknown Not assayed or wild type 972 h- pmm1 pmm1-1 sns-B9 unknown ECO:0001232 50 PMID:11839792 4896 2023-12-11 56% of sar1-1, 68% of sec31-1, and 50% of pmm1-1 cells had accumulated ER membranes and dilated nuclear and ER lumens (Table 1). PomBase SPAC1556.07 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- pmm1 pmm1-1 sns-B9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11839792 4896 2023-12-11 PomBase SPAC1556.07 FYPO:0000509 unknown Not assayed or wild type 972 h- pmm1 pmm1-1 sns-B9 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:11839792 4896 2023-12-11 Pap1p was localized predominantly to the cytoplasm in wild-type cells (Fig. 5A) as well as in the sar1-1, sec31-1 and pmm1- 1 mutants grown at the restrictive temperature, suggesting that nuclear protein export was not adversely affected in these cells (Fig. 5C,E,G). PomBase SPAC1556.07 FYPO:0000516 unknown Not assayed or wild type 972 h- pmm1 pmm1-1 sns-B9 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:11839792 4896 2023-12-11 Pap1p was localized predominantly to the cytoplasm in wild-type cells (Fig. 5A) as well as in the sar1-1, sec31-1 and pmm1- 1 mutants grown at the restrictive temperature, suggesting that nuclear protein export was not adversely affected in these cells (Fig. 5C,E,G). PomBase SPCC576.13 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0003029 deletion 972 h- swc5 swc5delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPCC576.13 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0004325 deletion 972 h- swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 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SPCC576.13 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph swc5 swc5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- swc5 swc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC576.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swc5 swc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC576.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swc5 swc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23A1.08c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3401 rpl3401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23A1.08c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3401 rpl3401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23A1.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpl3401 rpl3401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23A1.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3401 rpl3401delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000400 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6828164 4896 2017-12-05 (Fig. 1A, Table 1) cdc13 transition point is 0.69 using a cdc13-117 mutant PomBase SPBC582.03 FYPO:0000608 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000104,FYECO:0000229 65-90 PMID:2908246 4896 2014-06-30 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000608 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000229 20 PMID:2908246 4896 2014-06-30 PomBase SPBC582.03 FYPO:0006101 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc15-140 cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000104,FYECO:0000229 high PMID:2908246 4896 2018-04-05 (Fig. 3) PomBase SPBC582.03 FYPO:0003738 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc15-140 cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000104,FYECO:0000229 high PMID:2908246 4896 2018-04-05 (Fig. 3) PomBase SPBC582.03 FYPO:0000444 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:3428262 4896 2014-06-12 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004596 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005580 high PMID:8087848 4896 2015-08-28 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003378 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003379 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000941 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1773.01) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000705 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001324 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-18 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001122 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002700 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000836 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:2320127 4896 2016-12-13 (Fig. 4a) Cells blocked in mitosis PomBase SPBC582.03 FYPO:0000650 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000650 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000104,FYECO:0000229 60-80 PMID:2908246 4896 2014-06-30 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000252 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000309 99 PMID:8087848 4896 2016-09-29 (Table 1) PomBase SPBC582.03 FYPO:0003529 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:3428262 4896 2014-06-12 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003128 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2847913 4896 2014-05-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002061 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:2847913 4896 2014-05-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004382 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 10 PMID:20739936 4896 2020-02-06 (Fig. 1c) PomBase SPBC582.03 FYPO:0001928 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:3428262 4896 2014-06-12 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001357 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Figure 1C) PomBase SPBC582.03 FYPO:0000842 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000091 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:2847913 4896 2014-05-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000091 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:16079915 4896 2014-11-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003481 C379Y Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-117 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 1b) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000705 1-34 Not assayed or wild type 972 h- hva22 yep1(35-166) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.09c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.09c) PMID:37939137 4896 2025-03-11 (Fig. S5; Fig S6) PomBase SPCC736.04c FYPO:0006807 gma12::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gma12 gma12::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:9839953 4896 2019-07-24 PomBase SPCC736.04c FYPO:0006806 gma12::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gma12 gma12::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:9839953 4896 2019-07-24 PomBase SPCC736.04c FYPO:0003447 gma12::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gma12 gma12::ura4+ disruption ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:9839953 4896 2019-01-09 PomBase SPCC736.04c FYPO:0002060 gma12::ura4 Not assayed or wild type 972 h- gma12 gma12::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:7522655 4896 2014-11-26 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0001987 deletion 972 h- str1 str1delta deletion ECO:0005638 PMID:28882432 4896 2018-01-17 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph str1 str1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- str1 str1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 str1 str1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4F6.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 str1 str1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006800 GFP-364-432 Overexpression 972 h- bqt4 bqt4-IDR-TM(364-432) other ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-22 Overexpression of the GFP-IDR and GFP-IDR-TM fragments, but not GFP and GFP-KSE, caused dissociation of the centromeres from the NE and their declustering (Fig. 3, A and B). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0008433 GFP-364-432 Overexpression 972 h- bqt4 bqt4-IDR-TM(364-432) other ECO:0000059 45 PMID:38825008 4896 2025-04-22 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0008431 GFP-364-432 Overexpression 972 h- bqt4 bqt4-IDR-TM(364-432) other ECO:0001232 63 PMID:38825008 4896 2025-04-22 Similar PA accumulation in the nucleus was observed in IDR-TM-overexpressing cells (IDR-TM in Figure 6, A and B for quantification). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 F197E,V198E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F197E,V198E FV197EE|pof8-F179E,V198E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 F197E,V198E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F197E,V198E FV197EE|pof8-F179E,V198E amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 F197E,V198E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F197E,V198E FV197EE|pof8-F179E,V198E amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 F197E,V198E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F197E,V198E FV197EE|pof8-F179E,V198E amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003107 F197E,V198E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F197E,V198E FV197EE|pof8-F179E,V198E amino_acid_mutation ECO:0000337 high high PMID:29422501 4896 2018-03-19 (Fig. 2) PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pdp3 pdp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0003411 deletion 972 h- pdp3 pdp3delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- pdp3 pdp3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0004742 deletion 972 h- pdp3 pdp3delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0002336 deletion 972 h- pdp3 pdp3delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0003555 deletion 972 h- pdp3 pdp3delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pdp3 pdp3delta deletion ECO:0005638 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ade6-M210 pdp3 pdp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000082 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:22891259 4896 2014-03-11 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001081 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001355 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0006802 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10087262 4896 2020-03-18 (Fig. 1a) 'delocalized actin' PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002482 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16420355 4896 2020-10-21 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002061 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0007359 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002720 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 high PMID:10087262 4896 2020-03-18 (Fig. 1c) PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000113 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000647 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23934882 4896 2013-09-19 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0004103 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002060 Y256F,R408H Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1-664 Y256F, R408H|ags1-664 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000025,FYECO:0000229 PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0002060 wild type Knockdown 972 h- mip1 mip1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC1B2.02c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ugo1 ugo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B2.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- ugo1 ugo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1B2.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0006357 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0000890 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000226 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0004491 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000059 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005524 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000059 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005525 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000059 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005516 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000059 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0003120 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22990236 4896 2016-07-05 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0003557 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000291 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002913 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000291 PMID:25122751 4896 2014-09-11 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002913 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000231 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 4 and Supplementary Fig S5) PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005518 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000226 PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Supplementary Fig S8) PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005518 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000226 low assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0004347 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000226 low assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0007656 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000059 PMID:17510629 4896 2023-07-05 Hence, from these results it was evident that Hrp1, Hrp3 and Nap1 occupancy in vivo generally correlated with increased nucleosome densities in the corresponding mutants, and that this effect was most pronounced in promoter regions. PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0000228 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0001232 9 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002837 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000291 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002620 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000268 PMID:15908586 4896 2023-02-13 (Figure 2) PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0004743 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0000226 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002390 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0001232 PMID:32277274 4896 2020-04-27 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005949 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0006030 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PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 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this concentration of TBZ, showing a 5- to 25-fold growth reduction compared with wt PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph hrp3 hrp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- hrp3 hrp3delta deletion ECO:0001232 PMID:25602522 4896 2016-04-07 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hrp3 hrp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.03c FYPO:0000614 deletion 972 h- noc3 noc3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:18606828 4896 2015-06-08 PomBase SPBC887.03c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc3 noc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.03c FYPO:0001385 deletion 972 h- noc3 noc3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:18606828 4896 2015-06-08 PomBase SPBC887.03c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc3 noc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- noc3 noc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC887.03c FYPO:0002061 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006617 deletion 972 h- asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002402 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- asp1 asp1delta deletion ECO:0005638 PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006616 deletion 972 h- asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006616 deletion 972 h- asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-04-10 Table 1 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asp1 asp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 G159T,A162T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159U,A162U nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPBC26H8.03 FYPO:0004555 unknown Not assayed or wild type 972 h- cho2 cho2-385 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9755189 4896 2015-04-14 PomBase SPBC776.12c FYPO:0002061 T291A Not assayed or wild type 972 h- hsk1 hsk1-T291A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9705352 4896 2012-08-09 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000703 Y307A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-Y307A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:16762840 4896 2024-01-17 ChIP analysis showed that mutant protein is recruited to heterochromatic loci (Figure 6B), consistent with data showing that Y307A mutation has no effect on Epe1 interaction with Swi6 in vitro (Figure 3D) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 C340S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-C340S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004303 487-723 Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1(1-486) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:11934898 4896 2015-01-15 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0005938 T20A,S23A,S31A,S45A,S50A,T70A,S88A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:24656819 4896 2017-02-21 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0002887 T20A,S23A,S31A,S45A,S50A,T70A,S88A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001357 T20A,S23A,S31A,S45A,S50A,T70A,S88A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPAC6F6.17 FYPO:0001357 T20A,S23A,S31A,S45A,S50A,T70A,S88A Not assayed or wild type 972 h- rif1 rif1-7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G144C,G149C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G144C,G149C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G144C,G149C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G144C,G149C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPAC14C4.06c FYPO:0001908 wild type Overexpression 972 h- nab2 nab2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:24081329 4896 2013-11-29 PomBase SPAC14C4.06c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- nab2 nab2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:24081329 4896 2013-12-05 PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- elo2 elo2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000263 PMID:30975915 4896 2019-05-14 (Figure 1) PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- syp1 syp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syp1 syp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- syp1 syp1delta deletion ECO:0005638 PMID:21885283 4896 2017-10-31 Table I PomBase SPBC4C3.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syp1 syp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0000708 1-313 Not assayed or wild type 972 h- rgs1 rgs1-314-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:11554925 4896 2020-12-16 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rem1 rem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- rem1 rem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rem1 rem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16E9.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rem1 rem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001645 W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-W95R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001355 W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-W95R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000972 W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-W95R amino_acid_mutation ECO:0001232 50 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-W95R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-W95R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 W95R Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-W95R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0007963 S21D Not assayed or wild type 972 h- byr1 byr1-S21D byr1.S21D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:33823663 4896 2022-03-08 DNS PomBase SPAC631.02 FYPO:0001357 A460D Not assayed or wild type 972 h- bdf2 bdf2-A460D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003106 I80A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-I80A amino_acid_mutation ECO:0001807 low PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0002568 345-352 Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-deltaC-term partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.05c) PMID:9301023 4896 2018-06-07 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0008181 R157E Overexpression 972 h- ceg1 pce1-R157E amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 1G) PomBase 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lacking uracil (Fig. 2D) PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0005066 deletion 972 h- rhp6 rhp6delta rhp6-1delta|rhp6::ura4+ deletion ECO:0006030 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0005065 deletion 972 h- rhp6 rhp6delta rhp6-1delta|rhp6::ura4+ deletion ECO:0006030 PMID:12417737 4896 2015-11-26 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0005064 deletion 972 h- rhp6 rhp6delta rhp6-1delta|rhp6::ura4+ deletion ECO:0006030 PMID:12417737 4896 2015-11-26 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- rhp6 rhp6delta rhp6-1delta|rhp6::ura4+ deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:12511578 4896 2016-02-10 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- rhp6 rhp6delta rhp6-1delta|rhp6::ura4+ deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rhp6 rhp6delta rhp6-1delta|rhp6::ura4+ deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC18B11.07c 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Yam8 (Ma et al., 2011). cch11 was sensitive to low KCl concentrations, and both cch11 cfr11 and yam81 cfr11 were more sensitive than any of the single mutants. 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PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 E569P Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp6-E569P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2f) PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002280 deletion 972 h- cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 PMID:7798319 4896 2014-05-15 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0001924 deletion 972 h- cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 PMID:7798319 4896 2014-05-15 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut9 cut9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cut9 cut9delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000326 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000365 20 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 3B,C) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000141 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 medium PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0008164 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:15509783 4896 2019-05-11 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0008164 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:11909965 4896 2019-05-11 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0004318 deletion 972 h- psc3-1T bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S2B) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0008166 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5B) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1B, S3) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1B, S3) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1B, S3) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1B, S3) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0001269 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0007244 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 3E, S9) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0005780 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 10 PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0008202 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 ~10 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1a) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0005684 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 2A) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000786 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0000049 0.2 PMID:15509783 4896 2019-05-11 Table2 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0000049 2.4 PMID:15509783 4896 2019-05-11 Table2 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0001839 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0003762 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1A) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0003762 deletion 972 h- cut7-446 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S2A) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0003762 deletion 972 h- psc3-1T bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S2B) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0003762 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 PMID:22825872 4896 2020-06-02 and the fraction of cells, in which a signal could be detected (supplementary material Fig. S1), were similar between bub3+ and bub3D cells PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0004396 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S10) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0007399 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 3E) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0005212 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.01) PMID:22825872 4896 2020-05-31 Mph1 localizes to unattached kinetochores in bub3D cells (Fig. 2A). PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0004434 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 bub3 bub3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 PMID:15509783 4896 2019-05-11 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- nda3-KM311 bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 high PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5E) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000091 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 high PMID:26258632 4896 2016-01-19 (Fig. 1a) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0004435 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0005633 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 ~5 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1a) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0003241 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000260 7 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 2B) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0003241 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000365 25 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 2B) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0005069 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 2 PMID:26258632 4896 2015-11-27 (Fig. 1b) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- bub3 bub3delta deletion ECO:0005638 PMID:15509783 4896 2019-05-11 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bub3 bub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.12 FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 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prw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000141 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0001232 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 Our analysis revealed that mutant strains display defects in the segregation, resolution and/or condensation of chromosomes during mitosis (Figure 6A), and mis-segregated the mini-chromosome Ch16 (a 530 kb derivative of chromosome 3; Niwa et al., 1986) at a signi®cantly higher rate than wild-type cells (Figure 6C). PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000082 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12773392 4896 2024-02-20 and irreversible temperature-sensitive (Ts±) growth defects (Figure 5B±D). PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0003411 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 low PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0003412 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000049 high PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 4B) PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0008183 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 We found that H3 Ser10 phosphorylation levels were considerably reduced in alp13, pst2 and clr6 mutant cells, except at 2±3 foci near the nuclear periphery, presumably representing heterochromatic loci (Figure 7) PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 low PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0005310 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Moreover, Dprw1 cells showed an increase in acetylation of H3 Lys9 and Lys14. PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000892 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Moreover, Dprw1 cells showed an increase in acetylation of H3 Lys9 and Lys14. PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0007631 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Interestingly, we noticed that Dprw1 causes an increase in the acetylation of H4 Lys5 and Lys12, a pattern of acetylation known to be associated with newly synthesized histones (Sobel et al., 1995). PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0005309 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 Interestingly, we noticed that Dprw1 causes an increase in the acetylation of H4 Lys5 and Lys12, a pattern of acetylation known to be associated with newly synthesized histones (Sobel et al., 1995). PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0002061 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 prw1 prw1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 prw1 prw1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0004325 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000095 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000095 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000085 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000088 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000089 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000089 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000268 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0000268 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prw1 prw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- prw1 prw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29A4.18 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prw1 prw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000620 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 (Figure 1B) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0004595 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0004159 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0003066 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0001232 80 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000229 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 (Figure 4) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0006195 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000903 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0006180 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0001489 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0002061 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 (Figure 1B) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000228 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 (Figure 4) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0004612 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0004511 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0004439 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10749926 4896 2017-08-29 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0003627 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.04) PMID:10749926 4896 2017-08-29 (Fig. 6) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0003627 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC3A11.14c) PMID:10749926 4896 2017-08-29 (Fig. 6) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000091 P302L Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-93 gtb1-P301L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPCC1840.01c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- mog1 mog1+ wild_type ECO:0005638 PMID:11686304 4896 2015-09-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000468 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC613.12c FYPO:0003659 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC613.12c FYPO:0007336 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 2C) PomBase SPCC613.12c FYPO:0005850 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001978 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 11 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002834 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 2A) PomBase SPCC613.12c FYPO:0002834 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000291 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 7) PomBase SPCC613.12c FYPO:0003412 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC613.12c FYPO:0003412 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 high PMID:26832414 4896 2024-03-19 (Fig. 3B) PomBase SPCC613.12c FYPO:0003412 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002827 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002827 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002827 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000291 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 7) PomBase SPCC613.12c FYPO:0002827 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 high PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1G) PomBase SPCC613.12c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 medium PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPCC613.12c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000291 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 7) PomBase SPCC613.12c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPCC613.12c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 high PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1H) PomBase SPCC613.12c FYPO:0003352 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC613.12c FYPO:0002355 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 8B) PomBase SPCC613.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000470 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPCC613.12c FYPO:0004904 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0004904 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0004904 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002386 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 We then determined whether Lid2 is required for the recruitment of Clr4 to heterochromatin. We carried out a ChIP experiment using lid2-j or clr8Δ containing a N-terminal FLAG-tagged Clr4. The localization of Clr4 at centromeres is abrogated in both mutants (Figure 3E). PomBase SPCC613.12c FYPO:0002386 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.06) PMID:18957202 4896 2020-04-07 As shown in Figure 5E, while Lid2 accumulated at centromeres in the WT, the centromere localization of Lid2 in the clr8 mutant is significantly decreased. PomBase SPCC613.12c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0006353 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000231 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002836 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0005063 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000226 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 8C) PomBase SPCC613.12c FYPO:0001840 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 Table 2 and Fig. 4 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001327 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001327 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001327 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 We found that the loss of any members in CLRC promotes the protein levels of Set1, both at 30 ̊C or 37 ̊C (Fig 5A), indicating that the intact CLRC restricts the amount of Set1. PomBase SPCC613.12c FYPO:0004909 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 (Figure 1A) PomBase SPCC613.12c FYPO:0004909 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 complete assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 5) PomBase SPCC613.12c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002837 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000969 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001690 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000963 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000957 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000833 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002574 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001357 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001357 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0004325 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC613.12c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.12c FYPO:0003241 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 17 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf1 raf1delta clr8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.05c FYPO:0000904 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0003841 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:16394105 4896 2016-09-22 (Figure 8A, B) PomBase SPBC800.05c FYPO:0000903 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2016-09-28 both the growth and shrinkage rates were decreased down to 33 and 60%, respectively PomBase SPBC800.05c FYPO:0005703 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2016-09-28 both the growth and shrinkage rates were decreased down to 33 and 60%, respectively PomBase SPBC800.05c FYPO:0005691 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16394105 4896 2016-09-22 (Figure 9) PomBase SPBC800.05c FYPO:0005706 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Fig. 4) PomBase SPBC800.05c FYPO:0005706 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2023-01-25 (Fig. 4) PomBase SPBC800.05c FYPO:0005684 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:16394105 4896 2016-12-04 (Fig. 4) PomBase SPBC800.05c FYPO:0005684 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2023-01-25 (Fig. 4) PomBase SPBC800.05c FYPO:0005683 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:16394105 4896 2016-12-04 (Fig. 4) PomBase SPBC800.05c FYPO:0005683 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2023-01-25 (Fig. 4) PomBase SPBC800.05c FYPO:0001861 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0000340 PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0003003 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 8 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Figure 1B) PomBase SPBC800.05c FYPO:0003003 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 4 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Figure 1B) PomBase SPBC800.05c FYPO:0002061 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000004 PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0002061 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000079 PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0000899 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0004083 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0004083 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPBC800.05c FYPO:0000833 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:16394105 4896 2016-09-22 (Figure 8C) PomBase SPBC800.05c FYPO:0003241 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 60 PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Fig. 3) PomBase SPBC800.05c FYPO:0003241 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 18 PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Fig. 3) PomBase SPBC800.05c FYPO:0003241 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 7 PMID:16394105 4896 2016-09-22 (Figure 6B, C) PomBase SPBC800.05c FYPO:0002060 V260I Not assayed or wild type 972 h- atb2 atb2-983 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16394105 4896 2016-09-21 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001001 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000272 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000444 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002455 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 20 PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 1B) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001371 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-15 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003919 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, Supplementary Fig. 3a) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003919 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, Supplementary Fig. 3a) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003919 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, Supplementary Fig. 3a) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003919 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, S3a) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0007139 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:34958661 4896 2022-06-30 Arf6 node localization required Cdr2 but not other node proteins (Figs. 2 E and S2 B). PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0007139 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 70 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 3B) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002033 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-02 (Fig. 1A) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002033 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:34958661 4896 2022-06-30 The slower-migrating, hyperphosphorylated form of Wee1 was lost in arf6Δ and syt22Δ, similar to cdr2Δ (Fig. 1 H). We conclude that activated Arf6 functions in the Cdr2 pathway to control cell size at division through inhibition of Wee1. PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001324 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 5A). In addition, the Cdc25 protein level decreased in Δppk21 and Δcdr2 cells as well, indicating the role of Ppk21 and Cdr2 on regulating Cdc25 protein level PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002557 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 1C) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000998 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000272 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0008309 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:30639107 4896 2024-07-10 (Fig. 1E) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0008308 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 high PMID:30639107 4896 2024-07-10 (Fig. 1E) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001327 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5F) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0007156 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-06-27 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001369 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 60 PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 3C,D) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003797 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0005947 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 PMID:28515144 4896 2018-10-29 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000411 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002801 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000272 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002559 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002290 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-10-31 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0004720 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0005549 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000784 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 1C) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0004325 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003840 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000411 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000268 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0005638 PMID:12589755 4896 2014-12-23 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001496 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 3) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Table 1) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5E) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 PMID:24508166 4896 2015-02-23 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S4F, S4G) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 low PMID:30639107 4896 2024-07-10 (Fig. 1E) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr2 cdr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0004162 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009047 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000371 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0000268 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4H3.04c SPAC4H3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC577.10 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre4 pre4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC577.10 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre4 pre4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC577.10 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre4 pre4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC577.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre4 pre4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC577.10 FYPO:0000829 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre4 pre4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1- unknown ECO:0001232 >30 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0000387 deletion 972 h- SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0001232 PMID:38399762 4896 2024-02-29 The extent of biofilm formed in SPBPJ4664.02∆ decreased by 40% as compared to WT (p < 0.05), indicating that SPBPJ4664.02 is required for biofilm formation. PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPJ4664.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBPJ4664.02 SPBPJ4664.02delta deletion 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FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001979 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.08) PMID:23754748 4896 2014-03-26 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001979 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9001235 4896 2013-02-14 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001979 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC664.06) PMID:9001235 4896 2013-02-14 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001979 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:9001235 4896 2013-02-14 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001979 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S1A) PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0000252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbr1 dbr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0003619 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 4) PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0000833 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S4C) PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001980 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9001235 4896 2013-02-14 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001980 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC664.06) PMID:9001235 4896 2013-02-14 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001980 deletion 972 h- dbr1 dbr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:9001235 4896 2013-02-14 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.02c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph dbr1 dbr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 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SPAC607.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mil1 mil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC607.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mil1 mil1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000284 G135E 972 h- mis6 mis6-302 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7865880 4896 2012-03-12 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0008076 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:25959226 4896 2023-02-28 which showed > 10-fold lower affinity to PI(4,5)P2 (Figure 3D). PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0008077 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:25959226 4896 2023-02-28 In contrast, monomerization only slightly reduced the affinity to PS. PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004780 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S3C, S3D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001645 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15),assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:25959226 4896 2023-02-28 Mutations of the hydrophobic C2-C2 interface shifted Mid1 into monomeric state (Figure 6A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0008075 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25959226 4896 2017-05-06 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004456 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25959226 4896 2017-05-06 In contrast, the monomeric Mid13A remained concentrated in the nucleus and its signals on the plasma membrane were more widespread, even reached the cell poles (Figure 6E PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006186 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25959226 4896 2023-02-28 However, contractile ring assembly was significantly faster in mid13A than in mid1+ cells (Figure S6, C-F) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006005 M616A,L618A,P619A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25959226 4896 2023-02-28 Indeed, the morphology and positioning of the contractile ring marked with myosin regulatory light chain Rlc1 were normal in mid13A cells (Figure S6, C-D) PomBase SPAC343.08c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrp17 mrp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrp17 mrp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrp17 mrp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.08c FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrp17 mrp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G139A,G141A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G139A,G141A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G139A,G141A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G139A,G141A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1921.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 130-258 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 130-258 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPCC970.12 FYPO:0001387 Y74A,Y90A,T105A,S107K,G117D Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-262+pocket amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26921242 4896 2019-06-02 PomBase SPCC970.12 FYPO:0001357 Y74A,Y90A,T105A,S107K,G117D Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-262+pocket amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26921242 4896 2019-06-02 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001826 deletion 972 h- nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta deletion ECO:0000335 PMID:9622480 4896 2015-12-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001826 deletion 972 h- nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta deletion ECO:0000335 PMID:9094438 4896 2013-10-25 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001826 deletion 972 h- nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta deletion ECO:0000335 PMID:1314171 4896 2012-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001407 deletion 972 h- nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001407 deletion 972 h- nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC977.10 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph nhe1 nhe1delta neh1delta|sod2delta|sod2delta neh1delta 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2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC216.01c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 psy2 psy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 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psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0001034 deletion 972 h- psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC216.01c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 psy2 psy2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC216.01c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph psy2 psy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- psy2 psy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC216.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 psy2 psy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 psy2 psy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000703 631-670 Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-dC630 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c),assayed_using(PomBase:SPCC11E10.03) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. S4B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0001265 1-200 Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1deltaN200 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173,T171) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Figure 2B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0000703 1-200 Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1deltaN200 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 3) PomBase SPBC146.07 FYPO:0002061 SRQARR195VALAEE Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9917066 4896 2014-08-05 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002060 SRQARR195VALAEE Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9917066 4896 2014-08-05 PomBase SPSNORNA.45 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR93 snR93delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201 PMID:15716270 4896 2014-08-15 PomBase SPSNORNA.45 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR93 snR93delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:15716270 4896 2014-08-15 PomBase SPSNORNA.45 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR93 snR93delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000201 PMID:15716270 4896 2014-08-15 PomBase SPSNORNA.45 FYPO:0003699 deletion 972 h- snR93 snR93delta deletion ECO:0000337 PMID:15716270 4896 2014-08-19 PomBase SPAC222.09 FYPO:0002335 R442G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-R442G amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:24013500 4896 2024-06-10 We found that all three mutations are required to produce a silencing defect on 5- FOA medium (Fig. 1B). PomBase SPBPB21E7.05 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.05 SPBPB21E7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.05 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.05 SPBPB21E7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.05 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.05 SPBPB21E7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.05 SPBPB21E7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.05 SPBPB21E7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.05 FYPO:0009060 deletion 972 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We found that the interaction between Cnp20-14D and Ccp1 was dramatically reduced (Fig. 5F). PomBase SPBC800.13 FYPO:0001571 S3D,T8D,S12D,S13D,S14D,T21D,S23D,T29D,S31D,S33D,T36D,S39D,T43D,T45D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-14D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.03),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-23 PomBase SPBC36.12c FYPO:0000044 A69E Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-235 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC36.12c FYPO:0000082 A69E Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-235 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:2157626 4896 2016-12-21 PomBase SPBC36.12c FYPO:0001665 A69E Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-235 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000310 PMID:8227198 4896 2020-10-22 PomBase SPBC36.12c FYPO:0005288 A69E Not assayed or wild type 972 h- git7 git7-235 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:12456004 4896 2017-07-26 PomBase SPBC36.12c FYPO:0005288 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2010-04-06 PomBase SPAC521.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wss1 wss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC521.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wss1 wss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-SD2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-SD2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC16H5.09c FYPO:0002626 deletion 972 h- omh2 omh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19054127 4896 2013-09-04 PomBase SPBC16H5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- omh2 omh2delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000636 K276A Overexpression 972 h- msp1 msp1-K276A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 Time-course measurements of the doubling times of these cultures showed that at day 5 the growth rate of strains expressing Msp1pK276A, Msp1pD50 and Msp1pD25 was greatly increased... (Fig. 4A). PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 K276A Overexpression 972 h- msp1 msp1-K276A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15710398 4896 2023-08-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 K276A Overexpression 972 h- msp1 msp1-K276A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 On the contrary, even slight overexpression of Msp1pK276A, Msp1pD50 or Msp1pD25 induced mitochondrial fragmentation; in about 60% of the cells the mitochondria appeared as small more or less clustered individual dots. PomBase SPBC839.06 FYPO:0001952 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000335 PMID:2145281 4896 2013-02-08 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001954 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000335 PMID:2145281 4896 2013-02-08 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001950 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000335 PMID:1323458 4896 2015-02-19 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001950 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000335 PMID:2145281 4896 2013-02-08 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001949 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000335 PMID:2145281 4896 2013-02-08 PomBase SPBC839.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001037 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001037 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001020 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:34349749 4896 2024-12-14 Since Cta3 was originally described as an ATP-dependent Ca2+ pump (Ghislain et al., 1990; Halachmi et al., 1992), we also analyzed growth on CaCl2 plates and found that cta3delta was only sensitive to high calcium concentrations, and only in the absence of the Tup regulators. PomBase SPBC839.06 FYPO:0008456 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Moreover, none of other putative non-essen- tial stretch-activated ion channels [29] or organellar Ca2+-ATPase [30] appeared to be crucial for control- ling Ca2+ flux or for acute hypotonic protoplast expan- sion (Additional file 1: Fig. S1E). PomBase SPBC839.06 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0000098 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 PMID:2145281 4896 2013-01-30 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001201 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 PMID:1323458 4896 2013-08-12 PomBase SPBC839.06 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001234 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31201205 4896 2019-06-23 PomBase SPBC839.06 FYPO:0001491 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:10428498 4896 2013-06-11 PomBase SPBC839.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC839.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cta3 cta3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC839.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:10428498 4896 2013-06-11 PomBase SPBC839.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- cta3 cta3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:31201205 4896 2019-06-23 PomBase SPBC839.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cta3 cta3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006658 CTD-Y1F(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-Y1F(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 1) PomBase SPAC9.05 FYPO:0000089 D196N Overexpression 972 h- fml1 fml1-D196N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph efm7 efm7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- efm7 efm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efm7 efm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8F11.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efm7 efm7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001779 2-29 Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1delta(2-29) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000941 2-29 Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1delta(2-29) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000705 2-29 Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1delta(2-29) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC12D12.01),assayed_using(PomBase:SPBC12D12.01) PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001861 2-29 Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1delta(2-29) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:23166349 4896 2012-11-26 PomBase SPCC663.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- wtf14 wtf14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC663.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wtf14 wtf14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC663.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wtf14 wtf14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003758 unknown Overexpression 972 h- cut1 cut1-K73 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16483313 4896 2016-04-19 PomBase SPCC16C4.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph sif2 sif2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph sif2 sif2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph sif2 sif2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.01 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph sif2 sif2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph sif2 sif2delta deletion ECO:0005638 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2023-02-23 PomBase SPNCRNA.628 FYPO:0005266 I:239730..240571 Overexpression 972 h- SPNCRNA.628 SPNCRNA.628(732-1573) SPNCRNA.145OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.628 FYPO:0003383 I:239730..240571 Overexpression 972 h- SPNCRNA.628 SPNCRNA.628(732-1573) SPNCRNA.145OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000304 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.628 FYPO:0000111 I:239730..240571 Overexpression 972 h- SPNCRNA.628 SPNCRNA.628(732-1573) SPNCRNA.145OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.628 FYPO:0002546 I:239730..240571 Overexpression 972 h- SPNCRNA.628 SPNCRNA.628(732-1573) SPNCRNA.145OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC645.04 FYPO:0001645 F130A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F130A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 F130A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F130A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0000581 G148T Not assayed or wild type 972 h- swi10 swi10-154 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:1475195 4896 2012-12-03 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0001122 G148T Not assayed or wild type 972 h- swi10 swi10-154 nucleotide_mutation ECO:0001232 low PMID:1475195 4896 2012-12-03 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0000267 G148T Not assayed or wild type 972 h- swi10 swi10-154 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:8621070 4896 2014-09-24 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0000268 G148T Not assayed or wild type 972 h- swi10 swi10-154 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:8621070 4896 2014-09-24 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 deletion 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1A) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 PMID:26258632 4896 2016-01-19 (Fig. 3 a,b) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0007383 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4A and S8) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0002568 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:11950879 4896 2015-03-18 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001645 deletion 972 h- cdc25-22 mad1 mad1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S3B) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001309 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mad1 mad1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001383 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mad1 mad1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0006641 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:11909965 4896 2019-05-11 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005212 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4A and S9) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004432 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mad1 mad1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0003840 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26900649 4896 2016-02-29 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mad1 mad1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26900649 4896 2016-02-29 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 high PMID:26258632 4896 2016-01-19 (Fig. 1a) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004433 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005069 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 2 PMID:26258632 4896 2015-11-27 (Fig. 1b) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0002104 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mad1 mad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007376 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Similarly, consistent with previous results using Clr4 ­ lackingits chromodomain27,28, replacement of clr4+ with clr4W31G abolishedheterochromatin maintenance (Fig. 4b). (Fig. 4c, 4d) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000705 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c),assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002834 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 6B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002827 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002355 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003096 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000112 low PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003571 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003571 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000890 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:28682306 4896 2025-10-23 In cells with stably expressed Clr4 carrying a W31G mutation in its chromodomain (Extended Data Fig. 1a), we observed a ­ drastic loss of H3K9me3, but not H3K9me2, throughout pericentro- meric DNA repeats, demonstrating that the interaction of Clr4 with the RNAi machinery was sufficient for its recruitment and H3K9me2 catalysis (Fig. 3g, h; Extended Data Fig. 9e, f). PomBase SPBC428.08c FYPO:0005845 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008195 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 4C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003151 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 Although no significant alterations were detected for Flag-Set1 protein levels between wild-type and clr4W31G cells at 30 ̊C, the elevated Flag-Set1 is less pronounced in clr4W31G compared to clr4Δ at 37 ̊C (Fig 5B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 6B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 5D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC613.12c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 5D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC970.07c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 5D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 6A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:28682306 4896 2025-10-23 ChIP experiments also revealed that in contrast to greatly reduced association of Clr4(W31G) with ­ chromatin, Clr4(F449Y) associated with pericentromeric DNA repeats at levels close to that of wild-type Clr4, demonstrating that Clr4 can bind to H3K9me2 via its chromodomain (Fig. 3i; Extended Data Fig. 9g). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 5C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC613.12c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 5C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC970.07c) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 5C) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001740 W31G Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000887 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 In cells with stably expressed Clr4 carrying a W31G mutation in its chromodomain (Extended Data Fig. 1a), we observed a ­ drastic loss of H3K9me3, but not H3K9me2, throughout pericentro- meric DNA repeats, demonstrating that the interaction of Clr4 with the RNAi machinery was sufficient for its recruitment and H3K9me2 catalysis (Fig. 3g, h; Extended Data Fig. 9e, f). PomBase SPBC428.08c FYPO:0000887 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 7E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002358 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006845 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008236 W31G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-W31G amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7A) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 T121A,T327A,T513A,S572A,S938A,T965A,S1000A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-N4,C3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002302 deletion 972 h- sog2 sog2delta deletion ECO:0001232 PMID:23649273 4896 2013-07-01 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sog2 sog2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002482 deletion 972 h- sog2 sog2delta deletion ECO:0001232 PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- sog2 sog2delta deletion ECO:0005638 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- sog2 sog2delta deletion ECO:0005638 PMID:23649273 4896 2014-01-07 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- sog2 sog2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sog2 sog2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- sog2 sog2delta deletion ECO:0005638 PMID:23649273 4896 2013-07-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc1 cdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001982 deletion 972 h- cdc1 cdc1delta deletion ECO:0005580 PMID:8887553 4896 2013-02-14 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000316 deletion 972 h- cdc1 cdc1delta deletion ECO:0005638 PMID:8887553 4896 2013-02-07 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc1 cdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc1 cdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000839 deletion 972 h- cdc1 cdc1delta deletion ECO:0005638 PMID:8887553 4896 2013-02-07 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc1 cdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc1 cdc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC359.03c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 aat1 aat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC359.03c FYPO:0000957 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6C) PomBase SPBC359.03c FYPO:0000964 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC359.03c FYPO:0003702 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC359.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6C) PomBase SPBC359.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6C) PomBase SPBC359.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0001032 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6C) PomBase SPBC359.03c FYPO:0004025 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC359.03c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0004752 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6C) PomBase SPBC359.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC359.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC359.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6C) PomBase SPBC359.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC359.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC359.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC359.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- aat1 aat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC359.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- aat1 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or wild type 972 h- cdc18 cdc18-DEAD amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10101168 4896 2019-05-09 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000062 DE286AA Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-DEAD amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 medium PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0003165 DE286AA Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-DEAD amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 medium PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000614 DE286AA Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-DEAD amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000839 DE286AA Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-DEAD amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 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fis1-GBP atg43 atg43-deltaC60-GFP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003768 184-244 Not assayed or wild type 972 h- fis1-GBP atg43 atg43-deltaC60-GFP partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 Atg43 was observed on mitochondria in the absence of Tom70 (Figure 5E) and vice versa (Figure 5—Figure supplement 1I) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003768 184-244 Not assayed or wild type 972 h- fis1-GBP atg43 atg43-deltaC60-GFP partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC713.08) PMID:33138913 4896 2021-01-11 Atg43 was observed on mitochondria in the absence of Tom70 (Figure 5E) and vice versa (Figure 5—Figure supplement 1I) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003768 184-244 Not assayed or wild type 972 h- fis1-GBP atg43 atg43-deltaC60-GFP partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC409.23) PMID:33138913 4896 2021-01-11 Atg43 was observed on mitochondria in the absence of Tom70 (Figure 5E) and vice versa (Figure 5—Figure supplement 1I) PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0004481 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001304 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005801 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001304 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005801 PMID:18071249 4896 2012-08-16 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001302 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005801 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001302 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005801 PMID:18071249 4896 2012-08-16 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001302 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005801 PMID:18071249 4896 2012-08-16 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001298 deletion 972 h- lcf1 lcf1delta deletion ECO:0005801 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PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rtf1 rtf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rtf1 rtf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- rtf1 rtf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtf1 rtf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtf1 rtf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.14 FYPO:0003125 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0000059 PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPBC337.14 FYPO:0001324 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.14c) PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPBC337.14 FYPO:0006944 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0000059 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPBC337.14 FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-05 PomBase SPBC337.14 FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0005638 PMID:11839823 4896 2015-01-14 PomBase SPBC337.14 FYPO:0000104 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-05 PomBase SPBC337.14 FYPO:0000106 wild type Knockdown 972 h- rpb4 rpb4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:30862564 4896 2019-07-06 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K195Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K195Q amino_acid_mutation ECO:0005638 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PomBase SPBP4H10.19c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBP4H10.19c SPBP4H10.19cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.19c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBP4H10.19c SPBP4H10.19cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002061 275-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-1-274 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 6B) PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002133 K110E,R121E,R127E Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-74-M4 spTrm10_74_M4 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002764 K110E,R121E,R127E Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-74-M4 spTrm10_74_M4 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004464 T227A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T227A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:21095590 4896 2015-02-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 347-488 Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1deltaYTH partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 347-488 Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1deltaYTH partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000836 347-488 Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1deltaYTH partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC736.12c FYPO:0001317 347-488 Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1deltaYTH partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:33536434 4896 2023-03-24 PomBase SPCC645.06c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-3PA unknown ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_using(PomBase:SPCC645.06c) PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPCC645.06c FYPO:0003440 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-3PA unknown ECO:0001232 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPCC645.06c FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-3PA unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPCC645.06c FYPO:0003946 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-3PA unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.06c) PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPCC645.06c FYPO:0000674 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-3PA unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPCC645.06c FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-3PA unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25428987 4896 2015-02-26 PomBase SPNCRNA.348 FYPO:0001501 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.348 SPNCRNA.348+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.348 FYPO:0007931 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.348 SPNCRNA.348+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.348 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.348 SPNCRNA.348+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.348 FYPO:0002546 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.348 SPNCRNA.348+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:6828164 4896 2017-12-05 (Fig. 1A) The transition point for cdc2 is 0.68 using cdc2.L7 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000444 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:1655416 4896 2016-03-08 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001425 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000117 high PMID:7796804 4896 2017-10-27 (Fig. 7C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001425 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000117 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:7796804 4896 2017-10-27 (Fig. 7C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001187 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000227 low PMID:37128864 4896 2023-06-07 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000082 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:3516412 4896 2014-08-13 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:3516412 4896 2014-08-13 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:3322810 4896 2013-09-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003151 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000110,FYECO:0000117 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:7796804 4896 2017-10-27 (Fig. 7B) It is the soluble form (upper panel) that disappears not the insoluble form (lower panel) which has implications for which form is allowing replication. I don't know whether to leave this annotation out PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC685.09) PMID:11486016 4896 2013-12-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-18 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-18 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001645 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c) PMID:3322810 4896 2013-09-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001645 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001645 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c) PMID:2569363 4896 2013-02-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001355 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003160 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000227 low PMID:37128864 4896 2023-06-07 Cell length increases during log and stationary phases at 32 degree. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0007517 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 medium PMID:37128864 4896 2023-06-17 Furthermore, the log phase chromosomes more actively fluctuated in cdc2-L7 cells than in WT cells, and despite a repression in chromosome fluctuation, fluctuation was still elevated in the stationary phase, as demonstrated by an upward shift of the cdc2-L7 MSD plot of the ade6 locus and a complete lack of an overlap of their 95% confidence intervals with those of the WT plot (Fig. 5H). PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2674650 4896 2013-04-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000245 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000227 medium PMID:37128864 4896 2023-06-07 Loss of viability is evident only when cells are exposed to 32 degree before and upon entry into stationary phase. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000333 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:1655416 4896 2016-03-08 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008097 P208S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-L7 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37128864 4896 2023-06-20 PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0002060 N171K Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-N171K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000082 D897G Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-A7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 D897G Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 D897G Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-A7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002553 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0000059 PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002474 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.10) PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002474 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.03c) PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002474 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20H4.07) PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002474 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002474 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.04c) PMID:23628481 4896 2013-08-20 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1952.07) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC2H8.05c FYPO:0002554 wild type Overexpression 972 h- dbl1 dbl1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:23628481 4896 2013-08-30 PomBase SPCC24B10.05 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim9 tim9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- tim9 tim9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC24B10.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tim9 tim9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0006060 deletion 972 h- spt7 spt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 30 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0001512 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt7 spt7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0000082 deletion 972 h- spt7 spt7delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0004903 deletion 972 h- spt7 spt7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.12c) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0004903 deletion 972 h- spt7 spt7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.09) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0004903 deletion 972 h- spt7 spt7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0004903 deletion 972 h- spt7 spt7delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPBC25H2.11c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt7 spt7delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 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separation defect as previously shown.22-24 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000650 deletion 972 h- kin1 kin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000650 deletion 972 h- kin1 kin1delta deletion ECO:0001232 PMID:14596912 4896 2014-08-18 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0003536 deletion 972 h- kin1 kin1delta deletion ECO:0001232 PMID:14596912 4896 2014-08-18 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000238 deletion 972 h- kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000224 deletion 972 h- kin1 kin1delta deletion ECO:0001232 PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Fig. 2A) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- 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972 h- kin1 kin1delta deletion ECO:0001232 PMID:19597328 4896 2024-11-27 Kin1Δ cells synthesize normal septa (Fig. 2A) but exhibit a high septation index and a small percentage of multi- septate cells (Fig. 2B), indicating a cell separation defect as previously shown.22-24 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph kin1 kin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000764 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PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0003392 L63A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A amino_acid_mutation ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.07) PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0000246 L63A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000118,FYECO:0000126 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0001413 L63A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0000141 S348P Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15466421 4896 2013-12-23 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003165 S348P Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15466421 4896 2013-12-23 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0002889 S348P Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-41 amino_acid_mutation ECO:0001232 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2020-04-10 Fig. 2A PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0003150 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 2) PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0003150 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 1B PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0006637 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0003532 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 high PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 1 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000339 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000113 high PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 1C PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000339 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113 high PMID:12007420 4896 2023-01-25 Fig. 1C PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0008131 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 1) Tea3 cells resumed growth from their old end after division, indicating that the cell inheriting a growing end had no difficulty in reidentifying it as the appropriate site for growth after division (Figure 1). PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000644 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.08) PMID:18060866 4896 2012-04-27 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000644 deletion 972 h- tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 3D PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0001587 deletion 972 h- tea1-GFP tea3 tea3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 4B PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G10.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tea3 tea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 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PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001082 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:23934882 4896 2013-09-17 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001531 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23934882 4896 2013-09-17 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001382 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0000112 medium assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:24498240 4896 2024-07-03 However, a careful examination of these experiments revealed that Pmk1 basal phosphorylation in rho1-596 rho2D cells was actually lower than in rho2D cells, and this difference was statistically significant (P,0.04; Figure 1C). On the contrary, basal Pmk1 activity was nearly identical in pck2D and rho1-596 pck2D cells (Figure 1D), strongly suggesting that enhanced Pmk1 activation in rho1-596 cells is transmitted to the MAPK cascade mainly through Pck2. PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0003151 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:32075773 4896 2020-03-27 (Figure 1B) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001758 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:23934882 4896 2013-09-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001038 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:23934882 4896 2013-09-19 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002061 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000214 low PMID:24498240 4896 2024-07-03 As expected, both wild type and rho1- 596 cells were VIC negative under any condition (Figure 1D). PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002674 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:32075773 4896 2020-03-27 (Figure 1B) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000086 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23934882 4896 2013-09-17 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000647 C17R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-596 rho1.C17R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23934882 4896 2013-09-17 PomBase SPBC215.08c FYPO:0000035 unknown Not assayed or wild type 972 h- arg4 arg4- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPAC926.04c FYPO:0002177 unknown Not assayed or wild type 972 h- hsp90 swo1-w1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:10581266 4896 2019-06-07 (Fig. 6) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002563 1259-1358 Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1delta16 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21847092 4896 2013-08-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4- unknown ECO:0005638 PMID:8290359 4896 2013-05-01 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004604 809-960 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1deltaC-809-960 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:22081013 4896 2023-02-16 In marked contrast, subtelomeric tlh transcripts (Figure 3a) accumulated in chp1ΔC strains (Figure 3b,e Supplementary Figure 9). PomBase SPBC23G7.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph SPBC23G7.10c SPBC23G7.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.10c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPBC23G7.10c SPBC23G7.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.10c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPBC23G7.10c SPBC23G7.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPBC23G7.10c SPBC23G7.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.10c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPBC23G7.10c SPBC23G7.10cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23G7.10c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC23G7.10c 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PomBase SPAC13F5.06c FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec10 sec10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13F5.06c FYPO:0006556 deletion 972 h- sec10 sec10delta deletion ECO:0005638 PMID:11854409 4896 2018-05-18 PomBase SPAC13F5.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec10 sec10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13F5.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec10 sec10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13F5.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec10 sec10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.13c FYPO:0004516 unknown Not assayed or wild type 972 h- ssb1 rpa1-ts rpa1ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPBC660.13c FYPO:0002474 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Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S78A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000705 S78A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S78A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004194 S78A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S78A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 S78A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S78A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPBC13E7.04 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph atp16 atp16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.04 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rga7delta475-499 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0006800 T28E Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-T28E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29180432 4896 2019-01-02 (Fig. 5B and D) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0005215 T28E Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-T28E amino_acid_mutation ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:29180432 4896 2019-01-02 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0002638 T28E Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-T28E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29180432 4896 2019-01-02 (Fig. 5f) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000228 T28E Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-T28E amino_acid_mutation ECO:0001232 16 PMID:29180432 4896 2019-01-02 (Fig. 5) (measured at 4 um spindle. WT has 6%) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000324 T28E Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-T28E amino_acid_mutation ECO:0001232 6 PMID:29180432 4896 2019-01-02 increased duration of metaphase Fig. 5E PomBase SPBC1604.21c FYPO:0000912 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1250.03) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.04c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F598A,F701A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F598A,F701A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC211.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0000088 G852GSRGTP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-46 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0000089 G852GSRGTP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-46 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 G852GSRGTP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-46 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPAC1071.09c FYPO:0003247 1-159,L234R,Y238R Not assayed or wild type 972 h- djc9 djc9-(160-255)-L234R/Y238R djc9-(187-282)-L261R/Y265R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S3B) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001825 wild type Overexpression 972 h- nhe1 nhe1+ sod2+ wild_type ECO:0000335 low PMID:9622480 4896 2015-12-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001825 wild type Overexpression 972 h- nhe1 nhe1+ sod2+ wild_type ECO:0000335 PMID:1314171 4896 2012-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001583 wild type Overexpression 972 h- nhe1 nhe1+ sod2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:10850973 4896 2013-10-14 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 wild type Overexpression 972 h- nhe1 nhe1+ sod2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A11.03 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FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1A11.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB1A11.03 SPAPB1A11.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003768 185-244 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1-184 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 4G) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000703 185-244 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-1-184 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3D) PomBase SPAC1F7.07c FYPO:0003412 fip1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 fip1 fip1::Tn-seq disruption 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A nonphosphorylatable GST-Rnc1 fusion [GST-Rnc1(S/T6A)] expressed in fission yeast was several times less effective than the wild type (GST-Rnc1) in binding wak1Δ, wis1Δ , atf1Δ , pyp1Δ , and pyp2Δ mRNAs in vitro (Fig. 5A) PomBase SPCC757.09c FYPO:0002134 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-15 A nonphosphorylatable GST-Rnc1 fusion [GST-Rnc1(S/T6A)] expressed in fission yeast was several times less effective than the wild type (GST-Rnc1) in binding wak1Δ, wis1Δ , atf1Δ , pyp1Δ , and pyp2Δ mRNAs in vitro (Fig. 5A) PomBase SPCC757.09c FYPO:0002134 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-15 A nonphosphorylatable GST-Rnc1 fusion [GST-Rnc1(S/T6A)] expressed in fission yeast was several times less effective than the wild type (GST-Rnc1) in binding wak1Δ, wis1Δ , atf1Δ , pyp1Δ , and pyp2Δ mRNAs in vitro (Fig. 5A) PomBase SPCC757.09c FYPO:0002134 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-15 A nonphosphorylatable GST-Rnc1 fusion [GST-Rnc1(S/T6A)] expressed in fission yeast was several times less effective than the wild type (GST-Rnc1) in binding wak1Δ, wis1Δ , atf1Δ , pyp1Δ , and pyp2Δ mRNAs in vitro (Fig. 5A) PomBase SPCC757.09c FYPO:0002134 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-15 A nonphosphorylatable GST-Rnc1 fusion [GST-Rnc1(S/T6A)] expressed in fission yeast was several times less effective than the wild type (GST-Rnc1) in binding wak1Δ, wis1Δ , atf1Δ , pyp1Δ , and pyp2Δ mRNAs in vitro (Fig. 5A) PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 5B) PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0003552 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002700 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 5C) PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-15 and enhanced expression of Wak1, Wis1, and Pyp1 proteins during unperturbed growth (Fig. 5C) PomBase SPCC757.09c FYPO:0004083 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000840 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000840 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0006822 T45A,T50A,T171A,T177A,S278A,S283A Not assayed or wild type 972 h- rnc1 rnc1(S/T6A) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 5e) PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0002827 deletion 972 h- dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0006670 deletion 972 h- dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 7 PMID:31278118 4896 2020-05-06 (Fig. 1D, 1E) PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17C9.15c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph dhm2 dhm2delta deletion 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2012-01-01 PomBase SPBC1604.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- pgi1 pgi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1604.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pgi1 pgi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.05 FYPO:0001645 1-109,181-232 Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-110-180 partial_amino_acid_deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC550.05) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC409.10 FYPO:0002728 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade7 ade7-L465 unknown ECO:0001232 PMID:2743431 4896 2013-11-02 PomBase SPBC30B4.08 FYPO:0002133 1-55 Not assayed or wild type 972 h- eri1 eri1-EXO partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC30B4.08) PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPBC30B4.08 FYPO:0003822 1-55 Not assayed or wild type 972 h- eri1 eri1-EXO partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC30B4.08) PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPBC336.12c FYPO:0003449 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:21118960 4896 2012-02-24 PomBase SPBC336.12c FYPO:0005097 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000229 PMID:8121488 4896 2021-02-26 (Fig. 4a) elongated cell, cells do not replicate DNA (never enter S phase), but keep growing PomBase SPBC336.12c FYPO:0000848 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 low PMID:7957098 4896 2014-11-20 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001430 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:9108295 4896 2013-11-22 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001430 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPBC336.12c FYPO:0004481 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001093 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:12972571 4896 2014-09-10 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001018 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002044 T429A Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000127 PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001508 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:10490657 4896 2012-09-05 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001508 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:10490657 4896 2012-09-05 PomBase SPBC336.12c FYPO:0003314 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000445 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:7796804 4896 2017-06-19 (Fig. 5A) PomBase SPBC336.12c FYPO:0000082 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPBC336.12c FYPO:0005711 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7796804 4896 2017-07-05 (Fig. 5C) cyclin cdc13 cdc2 complex are not detected when cells are blocked in G1 with cdc10-129 mutant complex precipitated with p13 beads PomBase SPBC336.12c FYPO:0000658 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC336.12c FYPO:0005933 T429A Not assayed or wild type 972 h- rum1-HA cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3A) PomBase SPBC336.12c FYPO:0005933 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7796804 4896 2017-10-27 (Fig. 5B) PomBase SPBC336.12c FYPO:0003950 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.14c) PMID:12925774 4896 2014-11-06 PomBase SPBC336.12c FYPO:0004630 T429A Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0004630 T429A Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.01c) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001117 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001117 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP14E8.02) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001117 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:7916658 4896 2019-01-24 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001117 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:8313888 4896 2014-09-18 PomBase SPBC336.12c FYPO:0004142 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(SO:0001855) PMID:1734281 4896 2019-04-26 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006544 T429A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229,FYECO:0000293 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9755169 4896 2018-04-19 (Fig. 3A) cdc10 is a cdc18 transcriptional regulator see Fig2C PomBase SPBC336.12c FYPO:0006831 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 2) The start of septation scales with anaphase B progression and cell size in fission yeast. and correlates linearly with the cell length. PomBase SPBC336.12c FYPO:0007380 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 35-40 PMID:9679144 4896 2020-04-23 (Fig. 1F,H) cells were pre NETO after temperature block PomBase SPBC336.12c FYPO:0004189 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8799851 4896 2018-11-15 (Fig. 10) PomBase SPBC336.12c FYPO:0004108 T429A Not assayed or wild type 972 h- rum1-HA cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3A) PomBase SPBC336.12c FYPO:0001327 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2534559 4896 2014-02-18 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000839 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000839 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001490 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002061 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7916658 4896 2019-01-24 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002061 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002061 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102 PMID:8887552 4896 2013-08-12 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002061 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:7739540 4896 2019-01-30 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001387 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21118960 4896 2011-10-28 PomBase SPBC336.12c FYPO:0003988 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 high PMID:9679144 4896 2020-04-28 (Fig. 6) F-actin localised to branch site in presence of TBZ PomBase SPBC336.12c FYPO:0001398 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000294 high PMID:9679144 4896 2020-04-28 (Fig. 8A-D) Actin relocalisation to old or new cell end after microtubule disruption PomBase SPBC336.12c FYPO:0001294 T429A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113 70 PMID:10574765 4896 2017-04-24 (Figure 3) PomBase SPBC336.12c FYPO:0001395 T429A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000113,FYECO:0000229 98 PMID:10574765 4896 2017-04-12 (Figure 2a) PomBase SPBC336.12c FYPO:0006561 T429A Not assayed or wild type 972 h- rum1-HA cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 4) PomBase SPBC336.12c FYPO:0005926 T429A Not assayed or wild type 972 h- rum1-HA cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3A) PomBase SPBC336.12c FYPO:0000833 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006876 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000294 medium assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:9679144 4896 2020-04-28 (Fig. 9) tea1 can relocalise to cell ends in absence of microtubules PomBase SPBC336.12c FYPO:0001587 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC16.01) PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0001587 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 2C) Protein localised to both cell tips during monopolar growth PomBase SPBC336.12c FYPO:0000838 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000838 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05) PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006506 T429A Not assayed or wild type 972 h- rum1-HA cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3B) PomBase SPBC336.12c FYPO:0006506 T429A Not assayed or wild type 972 h- rum1-HA cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 3B) PomBase SPBC336.12c FYPO:0001317 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c) PMID:7957098 4896 2014-11-20 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006279 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000229 PMID:11389847 4896 2024-08-20 (Fig. 5A) PomBase SPBC336.12c FYPO:0006758 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8799851 4896 2018-11-15 (Fig. 9) PomBase SPBC336.12c FYPO:0004072 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006975 T429A Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC336.12c FYPO:0006103 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 high high PMID:9679144 4896 2020-04-28 (Fig. 4) Short interphase microtubules located in the cell centre PomBase SPBC336.12c FYPO:0007379 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 PMID:9679144 4896 2020-04-28 (Fig. 6) abnormal septum in branched cell PomBase SPBC336.12c FYPO:0001492 T429A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-129 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079,FYECO:0000137,FYECO:0000294 high PMID:9679144 4896 2020-04-28 (Fig. 3A-C) pre NETO blocked cells do not branch if TBZ is added at shift down PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-150 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta1-150 M1-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 1-150 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta1-150 M1-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 C140S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-C140S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008388 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Figure 2) Taken together, the above findings demonstrate that Yep1 is required for the autophagosomal enclosure of ER-phagy/nucleophagy cargos. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000164 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 low PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 3C) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008083 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 high PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Figure 2) Taken together, the above findings demonstrate that Yep1 is required for the autophagosomal enclosure of ER-phagy/nucleophagy cargos. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008083 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 low PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Figure 2) Taken together, the above findings demonstrate that Yep1 is required for the autophagosomal enclosure of ER-phagy/nucleophagy cargos. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008385 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1H) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008086 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1I) Deletion of yep1 abolished the processing of Pus1-mECitrine in both DTT- and starvation-treated cells, indicating that Yep1 is essential for nucleophagy. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007447 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 complete PMID:37553386 4896 2024-04-02 (Fig. 1B and C) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007447 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1E) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007447 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1C) Consistent with this idea, deletion of yep1 severely diminished the relocalization of Ost4-CFP to the vacuole upon DTT treatment (+DTT) or nitrogen starvation treatment (−N) (Fig 1C). PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007447 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008084 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000265 complete PMID:37553386 4896 2024-04-02 (Fig. 1B and C) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008084 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1D) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008084 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1C) Consistent with this idea, deletion of yep1 severely diminished the relocalization of Ost4-CFP to the vacuole upon DTT treatment (+DTT) or nitrogen starvation treatment (−N) (Fig 1C). yep1Δ cells also exhibited a severe defect in the autophagic processing of GFP-tagged integral ER membrane protein Erg11 into free GFP (Fig 1D and 1E). PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000381 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000265 PMID:37553386 4896 2024-03-22 (Fig. 1D and E) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000381 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 low PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000470 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007596 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1G) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007596 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000526 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. S2G and H) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000526 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0006376 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000265 medium assayed_protein(PomBase:SPBC1709.05) PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 2C) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000355 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. S2D) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007444 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1J) In contrast to the severe ER-phagy and nucleophagy defects of yep1Δ cells, bulk autophagy in yep1Δ cells was largely normal as indicated by the processing of CFP-Atg8 (Fig 1J). PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0006294 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:37939137 4896 2025-03-01 (Fig. 1J) In contrast to the severe ER-phagy and nucleophagy defects of yep1Δ cells, bulk autophagy in yep1Δ cells was largely normal as indicated by the processing of CFP-Atg8 (Fig 1J). In addition, another readout of bulk autophagy, the processing of fluorescent protein-tagged cytosolic protein Tdh1 (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)) [43], was also largely unaffected in yep1Δ cells (S1E Fig). Consistent with the lack of bulk autophagy defects, transmission (TEM) analysis showed that autophagosome accumulation in the fsc1Δ mutant, which is defective in autophagosome-vacuole fusion [44], was not notably affected by the deletion of yep1 (S1F Fig). PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008387 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:37939137 4896 2025-03-04 In both wild-type and yep1Δ cells, Epr1 and Atg8 colocalized at punctate structures shortly after ER-phagy induction by DTT or starvation treatment (S2A Fig), indicating that Yep1 is not essential for the initial stage of ER-phagy during which Epr1 mediates a connection between the ER and Atg8-decorated autophagic membranes. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008387 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:37939137 4896 2025-03-04 In both wild-type and yep1Δ cells, Epr1 and Atg8 colocalized at punctate structures shortly after ER-phagy induction by DTT or starvation treatment (S2A Fig), indicating that Yep1 is not essential for the initial stage of ER-phagy during which Epr1 mediates a connection between the ER and Atg8-decorated autophagic membranes. PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0001357 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000843 deletion 972 h- hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph hva22 hva22delta rop1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0005487 H66A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-H66A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 3) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0000826 H66A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-H66A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000409 high assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 5) PomBase SPAC8C9.11 FYPO:0007933 H66A Not assayed or wild type 972 h- fra2 fra2-H66A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000409 PMID:37923140 4896 2024-06-19 (Fig. 4) PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0001914 deletion 972 h- vps5 vps5delta deletion ECO:0001232 PMID:15189449 4896 2015-02-27 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0004483 deletion 972 h- vps5 vps5delta deletion ECO:0001232 PMID:15189449 4896 2015-02-27 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0004481 deletion 972 h- vps5 vps5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:15189449 4896 2015-02-27 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 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SPCPJ732.01 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph vps5 vps5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vps5 vps5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph vps5 vps5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph vps5 vps5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph vps5 vps5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPJ732.01 FYPO:0001214 deletion 972 h- vps5 vps5delta deletion ECO:0005638 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type 972 h- cdc20 cdc20-ts unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23D3.02) PMID:11313455 4896 2016-02-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000141 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 5C) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003591 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 4C) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0004763 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:28497540 4896 2019-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0008166 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 2G) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0008166 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 Accordingly, Bub3 and Mad3 localized at kinetochores in a manner identical to Bub1 in spc7-12A and spc7-12E cells PomBase SPCC1020.02 FYPO:0008166 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 Accordingly, Bub3 and Mad3 localized at kinetochores in a manner identical to Bub1 in spc7-12A and spc7-12E cells PomBase SPCC1020.02 FYPO:0008166 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002678 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22660415 4896 2024-03-25 (Fig. 5E) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000705 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000705 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005781 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0006423 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 5C) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0004212 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:28497540 4896 2019-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005300 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001645 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Figures 4B, S4A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005780 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 90 PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 5A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001355 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5E) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001571 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Figures 4B, S4A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005042 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22660415 4896 2024-03-25 although the kinetochore localization of Spc7-12A protein was intact (Fig. 2f) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000091 T77A,S221A,T257A,T338A,T366A,T395A,T413A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-12TA amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 5E) PomBase SPCC737.08 FYPO:0006781 F1093S Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-F1093S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-12-03 PomBase SPAC3F10.07c FYPO:0002511 deletion 972 h- erf4 erf4delta deletion ECO:0000112 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PomBase SPBC2F12.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl1701 rpl1701delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2F12.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1701 rpl1701delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1701 rpl1701delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000303 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000476 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000255 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0004162 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0001178 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000230 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0002169 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0001310 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000784 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:12896976 4896 2012-07-19 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000067 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000073 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000073 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000087 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:14758541 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000268 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9894913 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0000268 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0001234 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPBC365.13c FYPO:0001234 E89* Not assayed or wild type 972 h- hba1 caf1-21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:9211790 4896 2013-06-12 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001696 C55V,L117A Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-as4 plo1.as4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 1) PomBase SPAC23H4.01c FYPO:0000223 wild type Overexpression 972 h- osh3 osh3+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 Also data not shown. PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0000470 deletion 972 h- sec71 sec71delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0009060 deletion 972 h- sec71 sec71delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sec71 sec71delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- sec71 sec71delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec71 sec71delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4D7.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec71 sec71delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001357 P10A,E11A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001357 P10A,E11A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0002399 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0001407 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0009007 deletion 972 h- rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0009007 deletion 972 h- rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.10 FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph rpl3202 rpl3202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 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ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 6B, 6C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000620 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 30 PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003738 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 11 PMID:7774573 4896 2016-09-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004719 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 76 PMID:7774573 4896 2016-09-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000444 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 80 PMID:7774573 4896 2016-09-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005710 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 20 PMID:7774573 4896 2016-09-15 abnormal mitotic arrest with 4C DNA content Cells undergo an extra round of DNA replication without undergoing cytokinesis. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000117 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 76 variable severity PMID:7774573 4896 2016-09-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 P162L Overexpression 972 h- cdc2::CDC2Hs ade6-704 leu1-32 his3-27 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003758 P162L Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL41 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 70 PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp3 prp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp3 prp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp3 prp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29E6.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp3 prp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0006153 66-128 Not assayed or wild type 972 h- rst2 rst2-deltaZF partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPBC83.18c FYPO:0000026 1-126 Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-C fic1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure 4A-4C, S3A-S3B) PomBase SPBC83.18c FYPO:0007031 1-126 Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-C fic1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure 3G) PomBase SPBC83.18c FYPO:0005465 1-126 Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-C fic1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure 3D-3F) PomBase SPBC83.18c FYPO:0002559 1-126 Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-C fic1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Fig. 3C) PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0002275 unknown Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-DK unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003593 unknown Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-DK unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-DK unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:21389117 4896 2016-04-22 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-DK unknown ECO:0000112 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ECO:0005638 FYECO:0000126 16 PMID:11134033 4896 2016-10-31 (Figure 1b) (I) PomBase SPBC646.09c FYPO:0000080 deletion 972 h- int6 int6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:11121040 4896 2015-07-08 PomBase SPBC646.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph int6 int6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.09c FYPO:0001407 deletion 972 h- int6 int6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:11121040 4896 2015-07-08 PomBase SPBC646.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph int6 int6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC646.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr int6 int6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC646.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph int6 int6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 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deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003094 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002834 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 high PMID:19136623 4896 2024-07-02 The extent of the silencing defects in ckb1D cells was comparable with that caused by disruption of other heterochromatic genes, including clr4, a histone H3K9-specific histone methyltransferase; clr3, a histone deacetylase and a subunit of SHREC; and swi6, a HP1 homolog (Fig. 1B). PomBase SPBC800.03 FYPO:0003217 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003411 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003411 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 high PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure S7) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003411 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-23 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S10) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003216 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0003216 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 high PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 5B) PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:11884604 4896 2021-02-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:11884604 4896 2021-02-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-23 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 medium PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7) PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 medium PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000231 assayed_using(SO:0001923) PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003352 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC800.03 FYPO:0007009 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. S1) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000877 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 medium PMID:24013500 4896 2024-06-20 To further test whether Seb1 functions in the same pathway as SHREC in promoting H3K9me, we compared H3K9me2 levels at dg and dh repeats of the seb1-1 clr3D double mutant with those of the corresponding single mutants. Significantly, the double and single mutants display very similar levels of H3K9me2, ;20%-30% of wild-type levels (Fig. 3B). PomBase SPBC800.03 FYPO:0002355 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005845 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0006030 PMID:16246721 4896 2024-01-25 ..... However, in clr3D cells, H3K9me3 was significantly reduced, while there was a substantial increase in H3K9me1. Furthermore, H3K9me2 levels were slightly elevated (Figure 5A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0005845 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S1E) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000470 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005931 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000059 PMID:24662054 4896 2017-02-06 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005516 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 We observed nucleosome free regions at 5′ ends of genes followed by positioned nucleosomes in open reading frames (Figure S7A). Comparison of nucleosome occupancy across heterochromatin domains in asf1, clr3 or asf1clr3 mutant cells to wild-type cells identified several sites showing depletion of nucleosomes in mutant cells. PomBase SPBC800.03 FYPO:0002842 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000059 low assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:23771057 4896 2013-11-10 PomBase SPBC800.03 FYPO:0006599 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:19136623 4896 2024-07-02 In wild-type cells, both Clr3 and Mit1 were enriched on centromeric repeats; this localization was decreased in swi6D or chp2D cells, though substantial Mit1 was retained in swi6D cells, as reported previously (Sadaie et al. 2008). PomBase SPBC800.03 FYPO:0006599 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19136623 4896 2024-07-02 In wild-type cells, both Clr3 and Mit1 were enriched on centromeric repeats; this localization was decreased in swi6D or chp2D cells, though substantial Mit1 was retained in swi6D cells, as reported previously (Sadaie et al. 2008). PomBase SPBC800.03 FYPO:0003573 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16246721 4896 2024-01-25 We next explored whether loss of Clr3 affects Swi6 binding at the mat locus. Deletion of clr3 resulted in severely reduced Swi6 levels at Kint2::ura4+ even though Swi6 expression was not affected (Figure 5C; Figure S3). PomBase SPBC800.03 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007339 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000231 low PMID:21211723 4896 2024-01-17 We also found that double mutants carrying mutations in clr3 or mit1 along with either asf1-1 or hip1Δ showed cumulative derepression of repeat elements (Figure 3A and S4), indicating overlapping functions for Asf1/HIRA and SHREC. PomBase SPBC800.03 FYPO:0000220 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000231 high PMID:16762840 4896 2024-01-17 Our analysis revealed that Epe1 is required for the increase in transcription of repeats in Dclr3 background, as suggested by the dramatic reduction in transcript levels in Depe1 Dclr3 double mutant compared to Dclr3 single mutant (Figures 5A and 5B). PomBase SPBC800.03 FYPO:0002836 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5E). Enhanced transcriptional-machinery occupancy at heterochromatic repeats in SHREC defective cells,..should result in elevated repeat transcripts ...corresponding increase in siRNA production. PomBase SPBC800.03 FYPO:0005522 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 high PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPBC800.03 FYPO:0006548 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 The loss of Clr3 or Pob3 caused an increase in pho1 transcript levels, consistent with their involvement in repression by lncRNA8,38, but the extent of upregulation was less than in pir2-1 (Fig. 5c). PomBase SPBC800.03 FYPO:0008416 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 3E) PomBase SPBC800.03 FYPO:0010012 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000112 low PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 4A) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5B) we found increases in H3K14ac levels and greater Pol II occupancy at the reporter embedded within pericentromeric heterochromatin in....strains lacking SHREC components PomBase SPBC800.03 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure S8) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005518 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0006030 assayed_region(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 an increase in the levels of H3K14ac could be detected by ChIP-qPCR (Figure 1E) PomBase SPBC800.03 FYPO:0007634 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007633 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007633 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:16246721 4896 2024-01-25 deletion of clr3 resulted in an increase in acetylation at H3K14 (H3K14ac) (Figure 6A), a mark of active chromatin that is absent at heterochromatic loci. PomBase SPBC800.03 FYPO:0005310 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005310 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11884604 4896 2021-02-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002369 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0006681 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPBC800.03 FYPO:0006814 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0006814 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure S8) PomBase SPBC800.03 FYPO:0007630 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11884604 4896 2021-02-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004690 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11884604 4896 2021-02-03 PomBase SPBC800.03 FYPO:0008158 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:16246721 4896 2024-01-25 Furthermore, the levels of H3S10 phosphorylation (H3S10ph), another modification mark associated with active chromatin as well as mitotic chromosomes (Nowak and Corces, 2004), were also increased at the mat locus (Figure 6A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0008158 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 low PMID:16246721 4896 2024-01-25 Similar changes were observed in the swi6 mutant; however, the effect on H3S10ph was weaker than in the clr3 mutant (Figure 6A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0007310 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007311 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007635 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007309 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007309 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003009 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:21892171 4896 2024-01-16 Mutant cells lacking SHREC subunit Clr3 show marked increase in RNAPII occupancy at centromeric repeats10,11,31 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007279 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 (Figure 1D). We found that loss of Clr3 leads to increased Pol II levels upstream of the pho1 promoter and particularly across the gene body. PomBase SPBC800.03 FYPO:0006300 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004237 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.28c) PMID:20211136 4896 2015-11-04 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004237 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2D) PomBase SPBC800.03 FYPO:0004237 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2025-07-02 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004377 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1620.14c) PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 3A, 3C) PomBase SPBC800.03 FYPO:0004377 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1250.01) PMID:39096900 4896 2025-06-23 (Fig. 3B, 3D) PomBase SPBC800.03 FYPO:0004380 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1250.01) PMID:36200823 4896 2023-01-17 (Figure 3E). As reported previously, deletion of clr3 increased the loading of Snf21 at pericentromeric repeats; however, we did not observe greater Snf21 occupancy in our sfh1-13 clr3Δ double mutant relative to a sfh1-13 single mutant, suggesting that sfh1-13 prevents the acetylation- dependent recruitment of Snf21 at pericentromeres, and that the elimination of misloaded CENP-ACnp1 in sfh1-13Δ clr3Δ cells is not due to the increase in Snf21 level. PomBase SPBC800.03 FYPO:0005523 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 medium PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000825 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Of the TSA-sensitive HDACs, Clr3 was the only one that had an effect on pho1 expression, with its deletion resulting in increased pho1 mRNA levels (Figure 1B). PomBase SPBC800.03 FYPO:0005917 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002567 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002336 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 PMID:21253571 4896 2015-05-19 PomBase SPBC800.03 FYPO:0006811 deletion 972 h- mat2-3delta clr3 clr3delta deletion ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000962 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23874237 4896 2014-03-17 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000963 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000957 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000964 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007529 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003235 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 PMID:19136623 4896 2024-07-02 Both H3K9me and Swi6 were enriched on centromeric repeats (dg223) in ckb1D cells similar to wild-type or clr3D cells (Fig. 1C). PomBase SPBC800.03 FYPO:0000856 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-03 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002389 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:17289569 4896 2020-03-12 The role of SHREC in transcriptional silencing could be decoupled from the cis-PTGS function of the RNAi machinery since impaired SHREC had no effect on the localization of RITS Agol subunit at heterochromatin (Figure 5D). PomBase SPBC800.03 FYPO:0003576 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 4B) while the levels of Ccq1 at telomeres, relative to those in wild-type cells, were unchanged in clr3D cells but decreased in taz1D PomBase SPBC800.03 FYPO:0001317 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Unlike at pho1, we found that deletion of clr3 has no discernible induction effect on tgp1 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005527 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 PMID:26205977 4896 2016-07-13 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002687 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0000337 PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003503 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPBC800.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11884604 4896 2021-02-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 low PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. S2) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000084 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPBC800.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000085 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 low PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC800.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr3 clr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 clr3 clr3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr3 clr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0003066 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0003181 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0002485 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:21429938 4896 2020-04-22 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0002485 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0003179 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0000581 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:21429938 4896 2020-04-22 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0003538 deletion 972 h- rec24 rec24delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rec24 rec24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rec24 rec24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0001583 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2012-01-01 PomBase SPAC1952.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec24 rec24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002917 pSET domain deletion Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-pSETdelta fusion_or_chimera ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0002834 pSET domain deletion Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-pSETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 low assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1D) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004689 pSET domain deletion Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-pSETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1E) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 pSET domain deletion Not assayed or wild type 972 h- set1 set1-pSETdelta fusion_or_chimera ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1F) PomBase 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FYECO:0000170,FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:30348841 4896 2019-05-23 (Fig. 1 a) brc1 mutant abolishes Nse4 nuclear foci in HU/MMS treated cells PomBase SPBC582.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 brc1 brc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC582.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 brc1 brc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC582.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 brc1 brc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC582.05c FYPO:0001164 deletion 972 h- brc1 brc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20661445 4896 2013-09-03 PomBase SPBC582.05c FYPO:0001164 deletion 972 h- brc1 brc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPBC582.05c 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wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003286 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23263988 4896 2014-04-04 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0005545 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 We found that Tf clustering and the association of Tf cluster with centromeres were significantly compromised in the cut14-208 condensin mutant Figures 4A and 4B) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0007270 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 We found that Tf clustering and the association of Tf cluster with centromeres were significantly compromised in the cut14-208 condensin mutant Figures 4A and 4B) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0004098 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7957061 4896 2014-12-03 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001387 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003758 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2014-10-30 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001399 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9802907 4896 2016-04-28 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006259 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9802907 4896 2021-12-20 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002901 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:18362178 4896 2015-02-13 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001487 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC926.04c) PMID:25847133 4896 2015-09-23 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0001487 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:25847133 4896 2015-09-23 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0006279 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1705.03c),assayed_using(PomBase:SPAC19B12.02c) PMID:31615333 4896 2020-09-22 (Figure 2 and S3) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0004662 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003241 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18362178 4896 2015-02-13 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003241 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 11.2 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002060 S861P Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-208 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:7957061 4896 2014-11-28 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001837 1-81 Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13delta1-81 cdc13-delta81|cdc13delta81 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1773.01) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC800.05c FYPO:0000930 unknown Not assayed or wild type 972 h- atb2 ban5-3 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPBC800.05c FYPO:0000016 unknown Not assayed or wild type 972 h- atb2 ban5-3 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC800.05c FYPO:0002760 unknown Not assayed or wild type 972 h- atb2 ban5-3 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPNCRNA.421 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.421 SPNCRNA.421+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.421 FYPO:0007931 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.421 SPNCRNA.421+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.421 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.421 SPNCRNA.421+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.421 FYPO:0000111 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.421 SPNCRNA.421+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000502 K33R Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-K33R cdc2-KD amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000502 K33R Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-K33R cdc2-KD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008107 K33R Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-K33R cdc2-KD amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:37128864 4896 2023-06-20 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 R977Q,G1042D Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-474 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2015-09-02 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003738 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000671 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 PMID:17178839 4896 2016-06-13 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0005436 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 high PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4C) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003074 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC576.10c) PMID:24710126 4896 2014-06-03 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003165 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000082 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:21091378 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000950 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 high PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4B) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0006926 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0003410 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0000226 PMID:24710126 4896 2014-06-03 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001705 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 high PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4B) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0005437 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 PMID:17178839 4896 2016-08-22 (Fig. 4D) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001357 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:21091378 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001103 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cut8 cut8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000095 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 medium PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4A) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cut8 cut8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cut8 cut8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000097 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cut8 cut8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 high PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4A) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000089 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 high PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4A) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0000268 deletion 972 h- cut8 cut8delta deletion ECO:0005638 medium PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 4A) PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut8 cut8delta deletion ECO:0001232 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FYECO:0000005,FYECO:0000278 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002060 T45D Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-T45D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001971 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A-B) there was no detectable defect in morphology or cell division in imp2-11A, imp2-11E, imp2-17E, imp2-28A or imp2-28E cells although some imp2-17A cells failed to separate, forming chains (Fig. S2A and B). PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0005289 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S3A) Interestingly, we noticed during imaging that imp2-17A rlc1-mNG sid4-mNG cells displayed CR sliding events where the CR formed in the middle of the cell but then slid towards one cell tip (6/18 cells) (Fig. S3A). PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001838 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 2G) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000339 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S3B-C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001368 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0004097 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007828 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002442 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2D-E) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001903 S383A,S396A,T438A,S454A,S456A,S469A,S480A,S503A,S520A,S524A,T554A,T560A,S564A,S565A,S584A,T595A,S596A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-17A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A and C) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000838 1-394 Overexpression 972 h- cbf12 cbf12delta1-394 cbf12(D1-394)|cbf12deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1223.13) PMID:23555033 4896 2013-05-15 PomBase SPCC330.04c FYPO:0000141 G119GSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-1L amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5E and F) PomBase SPCC330.04c FYPO:0001355 G119GSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-1L amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000381 high PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5D) PomBase SPCC330.04c FYPO:0001571 G119GSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-1L amino_acid_insertion ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5C) PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K87R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K87R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K87R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K87R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp2 arp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp2 arp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- arp2 arp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arp2 arp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- arp2 arp2delta deletion ECO:0005638 PMID:10588653 4896 2020-09-01 (DNS) In all tetrads, the viable colonies were Arp21 Ura2, indicating that arp21 is an essential gene PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.06 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph SPBC17A3.06 SPBC17A3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 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assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1584 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0000013 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1584 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 low PMID:9658169 4896 2015-07-08 PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0003730 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000082 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 2B, Fig. S3A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001162 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001176 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005371 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000229 medium PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005371 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000079,FYECO:0000227 medium PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001387 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000961 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0009039 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000842 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 medium PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000785 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000088 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000089 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005889 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6D) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000091 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000268 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0009063 C231Y,E333D Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4B) PomBase SPCC622.13c FYPO:0002430 deletion 972 h- tti1 tti1delta deletion ECO:0001232 PMID:27935167 4896 2019-11-30 PomBase SPCC622.13c FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tti1 tti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC622.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- tti1 tti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC622.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 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PomBase SPBC14C8.11c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.11c SPBC14C8.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.11c SPBC14C8.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.11c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.11c SPBC14C8.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.11c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.11c SPBC14C8.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.11c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.11c SPBC14C8.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.11c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.11c SPBC14C8.11cdelta 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4896 2018-11-02 (Fig. 3b) PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001164 C259S Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C259S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000962 C259S Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C259S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001789 C259S Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C259S amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPBPB21E7.01c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph eno102 eno102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph eno102 eno102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.01c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph eno102 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assayed_protein(PomBase:SPAC2E12.02) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. 5B) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0003783 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 complete high assayed_using(PomBase:SPAC1786.03) PMID:32848252 4896 2020-09-05 (Fig. 3g) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0004622 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 complete PMID:32502403 4896 2020-06-15 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0007546 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 complete PMID:32502403 4896 2020-06-17 A failed mitotic nuclear envelope division is a cell phenotype observed at the end of mitosis during the vegetative life cycle in which the nuclear division does not occur and the two DNA masses remain linked by the internuclear membrane bridge. This can result in the coalescence of both DNA masses into one nucleus. We found that wild-type cells showed timed NE division in the absence of actomyosin ring (Figures 4A and 4B), demonstrating that NE division is independent of cell division. However, 100% of imp1D cells (n = 126) completely failed to undergo NE division, resulting in cells with two nuclei linked by a long NE bridge (Figures 4A and 4B; Video S4). This result demonstrates that Imp1 is required for NE division. PomBase SPBC1604.08c FYPO:0004835 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:15937127 4896 2018-01-22 (Figure 4D) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0007549 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000248 complete PMID:32502403 4896 2020-12-07 The coalescence of daughter nuclei was also observed in apq12D cells that failed to undergo nuclear division (Figure 4F). PomBase SPBC1604.08c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp1 imp1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0003189 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 2E, 2F) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0004056 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:39473973 4896 2025-03-24 (Fig. 5A) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15937127 4896 2018-01-22 (Fig. 3) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0006559 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 complete high PMID:32848252 4896 2020-09-05 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0007545 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPAC1786.03) PMID:32502403 4896 2020-06-15 We found that, in imp1D cells, NPCs were detected at the MMD and the peripheral NPC component Nup60 was removed from this domain (Figure 4C); however, the removal of structural components such as Nup107 and the membrane nucleoporin Cut11 was not observed (Figures 4C, S3A, and S3B). PomBase SPBC1604.08c FYPO:0004884 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPBC428.01c) PMID:32502403 4896 2020-06-15 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp1 imp1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp1 imp1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC825.05c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0000836 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39473973 4896 2025-03-27 (Fig. S4A) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0004117 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0006339 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 2.1 PMID:15937127 4896 2018-01-22 (Fig. 3 B-2) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0003302 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 10.4 PMID:15937127 4896 2018-01-22 (Fig. 3 B-2) PomBase SPBC1604.08c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0003612 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0002476 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp1 imp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- imp1 imp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:15937127 4896 2018-01-22 (Fig. 3) PomBase SPAC222.09 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP seb1 seb1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC1494.03 FYPO:0002137 A1696C,A1700C Overexpression 972 h- arz1 arz1-B1 nucleotide_mutation ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPCC1494.03) PMID:18042546 4896 2014-01-10 PomBase SPBC725.06c FYPO:0001309 T(-579)TT Not assayed or wild type 972 h- Strain DY8531 (derivative of standard lab strain 972 h- engineered to feature the large inversion present in most other S. pombe strains (Hu et al. 2015)) ppk31 ppk31--579-T(5'-uORF) nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:30072377 4896 2018-11-26 (Fig. 3C, D; Fig. 4A,B) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0000783 1245-1828 Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1(1-1244) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9635190 4896 2016-04-05 (Fig. 5) PomBase SPCC825.02 FYPO:0000663 W432A Not assayed or wild type 972 h- gbs1 gbs1-W432A gbs1-W409A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1002.03c) PMID:23609449 4896 2023-02-17 (Figure 10) . Taken together, the results demonstrate that substitution of Trp-409 in the context of the full-length GIIβ has a moderate to high (60% inhibitory) effect on GII activity. PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.22 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29A4.22 SPAC29A4.22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC417.05c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cfh2 cfh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cfh2 cfh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- cfh2 cfh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC417.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cfh2 cfh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cfh2 cfh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- aro7 aro7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16E8.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aro7 aro7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16E8.04c FYPO:0002451 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aro7 aro7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nop10 nop10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ nop10 nop10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nop10 nop10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- nop10 nop10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nop10 nop10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nop10 nop10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.13c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 nop10 nop10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 L46Q Not assayed or wild type 972 h- byr2 byr2-FBS-7 byr2FBS-7 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1565.04c),assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:9315645 4896 2018-04-29 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0001983 1078-1179 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtK partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) but failed to detect fragment B, D, E, H, J or K. PomBase SPAC1705.03c FYPO:0006836 1078-1179 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtK partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0000636 wild type Overexpression 972 h- grx2 grx2+ wild_type ECO:0005638 PMID:15865206 4896 2014-11-06 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0003965 wild type Overexpression 972 h- grx2 grx2+ wild_type ECO:0005801 PMID:15865206 4896 2014-11-06 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0003965 wild type Overexpression 972 h- grx2 grx2+ wild_type ECO:0005801 PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC15E1.09 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- grx2 grx2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15796926 4896 2014-08-06 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph tah18 tah18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1296.06 FYPO:0001501 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PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0001018 deletion 972 h- arf6 arf6delta deletion ECO:0001232 PMID:18060866 4896 2012-07-27 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0007139 deletion 972 h- arf6 arf6delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:34958661 4896 2022-06-30 o explain this connection, we examined the localization of Wee1 and Cdr1 at cortical nodes in arf6Δ mutants. Wee1 localized to nodes in arf6Δ, but Cdr1 did not (Fig. 3, D and E; and Fig. S3 D) PomBase SPBC1539.08 FYPO:0002033 deletion 972 h- arf6 arf6delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:34958661 4896 2022-06-30 The slower-migrating, hyperphosphorylated form of Wee1 was lost in arf6Δ and syt22Δ, similar to cdr2Δ (Fig. 1 H). We conclude that activated Arf6 functions in the Cdr2 pathway to control cell size at division through inhibition of Wee1. PomBase SPBC1539.08 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph arf6 arf6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0003482 deletion 972 h- arf6 arf6delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:34958661 4896 2022-06-30 rf6Δ cells had cytoplasmic Cdr2 clusters that were absent in wild-type cells (Figs. 3 A and S2 J), indicating defects in cortical anchoring. 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SPAC18G6.10 FYPO:0003165 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 10 PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 7B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000278 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 low PMID:28242692 4896 2017-05-03 (Fig. 1C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006800 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002577 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.17) PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 7b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003411 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000049 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 1B, D, E) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003411 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000049 low PMID:26744419 4896 2017-05-18 (Fig. 1b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000291 low PMID:26744419 4896 2017-05-18 (Fig. 1c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000049 low PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S1E) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000291 low PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 1c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004604 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000049 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 3E) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004604 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000291 medium PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 1c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000877 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 5A) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000878 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 3C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000888 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0006030 low PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 3c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000888 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006927 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000336 medium PMID:31015410 4896 2019-05-29 (Fig. 2a,b,c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000835 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001324 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3A) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002909 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.17) PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 5C and D) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002339 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 4e) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001514 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPAC26A3.15c) PMID:22540024 4896 2012-09-13 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002386 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.17) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002387 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.17) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002098 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3A) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002098 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002098 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 low PMID:26744419 4896 2017-05-18 (Fig. 1b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002980 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 7b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005371 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000340 FYECO:0000021,FYECO:0000137 9.7 PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 2a) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004342 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000291 PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 1c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006926 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000243 medium PMID:31015410 4896 2019-06-06 supp data Fig 1b,c PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lem2 lem2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lem2 lem2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC825.05c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003009 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003011 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. 5C and D) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002969 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPAC26A3.15c) PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 6B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003010 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005917 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 1c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 lem2 lem2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003166 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 20 PMID:28242692 4896 2017-05-03 (Fig. S1C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003086 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S5A) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002336 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000049 PMID:32817556 4896 2021-02-10 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 lem2 lem2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006429 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0006030 PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 3d) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001513 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 PMID:22540024 4896 2012-09-14 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001380 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001221 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31015410 4896 2019-05-28 (Fig. 1 supp data) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001221 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319,FYECO:0000336 PMID:31015410 4896 2019-06-03 (Fig. 3a,b) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003627 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.03) PMID:36799444 4896 2023-06-08 Finally, we examined whether Lem2 affected their subcellular localization. GFP-Cho2, GFP-Ole1 and Erg11-GFP were localized in the cortical ER and NE (or perinuclear ER), and deletion of the lem2+ gene did not affect the localization (Fig. 2B), indicating that Lem2 is not necessary for their NE localization PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003627 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:36799444 4896 2023-06-08 Finally, we examined whether Lem2 affected their subcellular localization. GFP-Cho2, GFP-Ole1 and Erg11-GFP were localized in the cortical ER and NE (or perinuclear ER), and deletion of the lem2+ gene did not affect the localization (Fig. 2B), indicating that Lem2 is not necessary for their NE localization PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003627 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.02c) PMID:36799444 4896 2023-06-08 Finally, we examined whether Lem2 affected their subcellular localization. GFP-Cho2, GFP-Ole1 and Erg11-GFP were localized in the cortical ER and NE (or perinuclear ER), and deletion of the lem2+ gene did not affect the localization (Fig. 2B), indicating that Lem2 is not necessary for their NE localization PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004314 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 3D) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004314 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3D) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004314 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3D) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000838 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC26A3.15c) PMID:22540024 4896 2012-09-13 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002899 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 2B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002099 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 2C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001357 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000263 PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 2C) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006928 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000336 medium PMID:31015410 4896 2019-05-29 (Fig. 2d,e,f,g,h, S6B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000772 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 low PMID:28242692 4896 2017-05-03 Fig. 3B, arrow; Fig. 3 C and D, quantification PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000772 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:30975915 4896 2019-05-08 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004325 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 lem2 lem2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:26746798 4896 2016-08-01 (Fig. 1A) Defect in Checkpoint Signaling. PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000263 PMID:30975915 4896 2019-05-08 (Fig. 4B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-11-08 (Figure S1A) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000091 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0000049 PMID:27451393 4896 2018-01-30 (Fig. G) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000091 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 low PMID:26744419 4896 2017-05-18 (Fig. S1c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001234 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27334362 4896 2016-06-30 (Fig. 2B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001234 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:30975915 4896 2019-05-14 (Fig. 4A) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- lem2 lem2delta deletion ECO:0005638 PMID:22540024 4896 2012-09-13 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lem2 lem2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.18c 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PMID:10428959 4896 2021-05-25 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.13c) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0007793 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10428959 4896 2021-05-25 (Figure 7) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001122 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high medium PMID:28281664 4896 2021-05-07 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0005261 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SPAPYUG7.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001034 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0007794 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:10428959 4896 2021-05-25 (Figure 7) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000098 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:21035342 4896 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deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000089 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 PMID:10428959 4896 2021-05-25 (Figure 3b) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000207 PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000268 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000280 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 PMID:10428959 4896 2021-05-25 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000280 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0000059 PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000280 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001492 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0003481 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 high high PMID:10428959 4896 2021-05-25 (Figure 3) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sin1 sin1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- sin1 sin1delta deletion ECO:0005638 PMID:10428959 4896 2021-05-25 DNS PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 sin1 sin1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC651.01c FYPO:0003412 nog1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 nog1 nog1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC14F5.05c FYPO:0002421 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sam1 sam1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14F5.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- sam1 sam1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC14F5.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sam1 sam1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14F5.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- sam1 sam1delta deletion ECO:0005638 PMID:10620770 4896 2026-01-25 No correctly integrated transformants were obtained, suggesting that the disruption is lethal. This was veri®ed by transforming the diploid hx ade6-M210 ura4-D18/h+ ade6-M216 ura4-D18 strain with the construct mentioned above, proper integration of the fragment was con®rmed by Southern blot analysis and the diploids were sporulated. From four different transformants, altogether 96 tetrads were dissected on three different media (MMA+ura+ade+SAM; YEA+ura+ade; and YEA+ura+ade+SAM). In 85 tetrads two spores grew to colonies and in 11 tetrads only one spore or none developed to a colony. PomBase SPBC119.11c FYPO:0003556 unknown Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-ts unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.03) PMID:20609363 4896 2014-08-13 PomBase SPBC119.11c FYPO:0003556 unknown Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-ts unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.02) PMID:20152800 4896 2014-08-13 PomBase SPBC119.04 FYPO:0000583 TTACACG(-179)TAATCCC Not assayed or wild type 972 h- mei3 mei3-promoter-d3 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:9819418 4896 2017-09-06 PomBase SPBC19C2.03 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc10 rpc10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpc10 rpc10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C2.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc10 rpc10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1A10.15 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph arv1 arv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.15 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph arv1 arv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.15 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph arv1 arv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.15 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph arv1 arv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.15 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph arv1 arv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.15 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph arv1 arv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 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cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:22718908 4896 2018-11-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001645 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.14c) PMID:22718908 4896 2018-11-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001645 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.14c) PMID:22718908 4896 2018-11-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0003923 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000126,FYECO:0000229,FYECO:0000260,FYECO:0000295 PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001355 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0001355 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004961 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0006726 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:22718908 4896 2018-11-08 inferred from normal localization of CMG proteins at origin PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC227.16c) PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0004962 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:22718908 4896 2018-11-07 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000703 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:22718908 4896 2018-11-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000703 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c),assayed_using(PomBase:SPBP4H10.21c) PMID:22718908 4896 2018-11-08 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000703 Y1520N,D1625G,L1726S,S1904P Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc20 cdc20-ct1 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC227.16c),assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:22718908 4896 2018-11-08 PomBase SPAC750.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC750.02c SPAC750.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC750.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC750.02c SPAC750.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC750.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC750.02c SPAC750.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0002896 wild type Overexpression 972 h- tfs1 tfs1+ pREP41-ppr2 wild_type ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001865) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0002896 wild type Overexpression 972 h- tfs1 tfs1+ pREP41-ppr2 wild_type ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001843) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0001315 wild type Overexpression 972 h- tfs1 tfs1+ pREP41-ppr2 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22496451 4896 2013-11-18 PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0000091 wild type Overexpression 972 h- tfs1 tfs1+ pREP41-ppr2 wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:37052630 4896 2023-04-27 PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0000925 wild type Overexpression 972 h- tfs1 tfs1+ pREP41-ppr2 wild_type ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000263 3 PMID:37052630 4896 2023-04-27 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 340-363 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4delta340-363 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:38825008 4896 2025-04-24 All these fragments as well as wild-type Bqt4 (FL) were localized to the NE (Fig. 1C), suggesting that the lethality was not caused by the loss of NE localization. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002060 340-363 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4delta340-363 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-19 The deletion mutants D340 to 383 and D364 to 383, but not D340 to 363, showed growth defect in the lem2-shut-off bqt4D strain (Fig. 1E) PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0000303 D59T Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-D59T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3042386 4896 2013-02-25 PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0000584 D59T Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-D59T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3042386 4896 2013-02-25 PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0001420 D59T Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-D59T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:3042386 4896 2013-02-25 PomBase SPBC800.13 FYPO:0000141 S3A,T8A,S12A,S13A,S14A,T21A,S23A,T29A,S31A,S33A,T36A,S39A,T43A,T45A Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-14A amino_acid_mutation ECO:0000092 PMID:34810257 4896 2022-07-01 But most cnp20-14A cells display mitotic delay, and more than 12% of mutant cells failed to complete chromosome segregation within 30 min (Fig. 6 E and F) PomBase SPBC800.13 FYPO:0001645 S3A,T8A,S12A,S13A,S14A,T21A,S23A,T29A,S31A,S33A,T36A,S39A,T43A,T45A Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-14A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.03),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-23 However, we found that Spc25-GFP appeared not to attach to microtubules in ∼20% of cnp20-14A mitotic cells, indicating that dephosphorylation of the CIM domain leads to mislocalization of Ndc80C during mitosis (Fig. 7A). Importantly, our co-IP results indicated that the interaction between Cnp20-14A and Ndc80 is significantly reduced during mitosis (Fig. 7B). PomBase SPBC800.13 FYPO:0001571 S3A,T8A,S12A,S13A,S14A,T21A,S23A,T29A,S31A,S33A,T36A,S39A,T43A,T45A Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-14A amino_acid_mutation ECO:0000092 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-23 Cnp20-14A showed a strong interaction with Ccp1 (Fig. 5F) PomBase SPBC800.13 FYPO:0001796 S3A,T8A,S12A,S13A,S14A,T21A,S23A,T29A,S31A,S33A,T36A,S39A,T43A,T45A Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-14A amino_acid_mutation ECO:0000092 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:34810257 4896 2022-07-01 In contrast, we found that GFP-Ccp1 in all cnp20-14A mutant cells remains associated with centromeres during all the stages of the cell cycle (Fig. 6 B and C). PomBase SPBC800.13 FYPO:0000091 S3A,T8A,S12A,S13A,S14A,T21A,S23A,T29A,S31A,S33A,T36A,S39A,T43A,T45A Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-14A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:34810257 4896 2022-06-23 We found that cnp20-14A is highly sensitive to TBZ, even more strongly than the cnp20-ΔCIM mutant (Fig. 6D and SI Appendix, Fig. S16) PomBase SPBC336.04 FYPO:0005032 P311R Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-P311R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:34228709 4896 2021-08-27 PomBase SPAC890.02c FYPO:0006191 61-116 Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7delta61-116 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:24790093 4896 2022-06-01 PomBase SPAC12B10.10 FYPO:0002999 1-328 Not assayed or wild type 972 h- nod1 nod1(329-419) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC12B10.10 FYPO:0002999 1-328 Not assayed or wild type 972 h- nod1 nod1(329-419) 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prototroph SPCC737.04 SPCC737.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC737.04 SPCC737.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.04 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPCC737.04 SPCC737.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.04 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPCC737.04 SPCC737.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC737.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC737.04 SPCC737.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC188.09c FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- pfl4 pfl4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 3) PomBase SPBC3B9.07c FYPO:0003601 L6P,A111E Not assayed or wild type 972 h- rpa43 rpa43-ts296 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12207036 4896 2018-05-29 PomBase SPBC3B9.07c FYPO:0002061 L6P,A111E Not assayed or wild type 972 h- rpa43 rpa43-ts296 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12207036 4896 2018-05-29 PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0001384 511-891 Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1(1-510) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_enzyme(PomBase:SPBC4F6.06) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Figure S3F) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0005501 511-891 Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1(1-510) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_enzyme(PomBase:SPBC4F6.06) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Figure S3F) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0005501 511-891 Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1(1-510) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCP1E11.04c) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Figure S3F) PomBase SPBC4F6.06 FYPO:0000705 511-891 Not assayed or wild type 972 h- kin1 kin1(1-510) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.06),assayed_using(PomBase:SPCP1E11.04c) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Figure 3H) PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003217 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003412 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0002061 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000228 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000228 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 22.9 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000091 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0003241 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0002060 A574D Not assayed or wild type 972 h- mcl1 cos1-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18493607 4896 2015-02-06 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shg1 shg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0008248 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000231 low PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0001324 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0001324 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 A similar pattern was observed in the Lsd2 samples, although the Lsd2 protein levels also decreased with shg1Δ (Fig 3B). PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0008251 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0005071 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 shg1 shg1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 shg1 shg1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0005311 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000833 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0006163 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 However, the loss of Shg1 and Sdc1 seems to have little or no effect on Lsd1 protein levels. PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0001317 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0005602 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000087 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 shg1 shg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shg1 shg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- shg1 shg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G8.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shg1 shg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC737.08 FYPO:0001355 R1379A Not assayed or wild type 972 h- mdn1-ts26 mdn1 mdn1-R4-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:27667686 4896 2018-11-29 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 meu34 meu34delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 meu34 meu34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009007 deletion 972 h- meu34 meu34delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000833 deletion 972 h- meu34 meu34delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 We constructed mutants of E3 ligases and their components that have been suggested to localize to or function in the ER and nucleus, namely ......... The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph meu34 meu34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- meu34 meu34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu34 meu34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 meu34 meu34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001357 T74A Not assayed or wild type 972 h- drc1 drc1-T74A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2011-11-18 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000659 1-21,144-254 Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1delta1-21,144-254 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPBC106.10 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PMID:38598031 4896 2024-04-19 (Figure 4a) PomBase SPBC106.10 FYPO:0000544 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2011-09-30 PomBase SPBC106.10 FYPO:0002033 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPBC106.10 FYPO:0002033 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPBC106.10 FYPO:0002348 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000081 PMID:21098141 4896 2013-07-18 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000229 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 PMID:30973898 4896 2019-04-15 (Figure 4) DAPI staining PomBase SPBC106.10 FYPO:0003285 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000181 PMID:9245826 4896 2014-04-01 PomBase SPBC106.10 FYPO:0003535 deletion 972 h- pka1 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2014-04-01 PomBase SPBC106.10 FYPO:0001682 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:9202173 4896 2024-08-20 (Fig. 5) PomBase SPBC106.10 FYPO:0005688 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 PMID:30973898 4896 2019-04-15 PomBase SPBC106.10 FYPO:0001667 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000457 PMID:33829153 4896 2021-04-20 (Fig. 1A and B) PomBase SPBC106.10 FYPO:0006717 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:36112198 4896 2022-11-08 (Fig. S2) PomBase SPBC106.10 FYPO:0000961 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:34086083 4896 2021-06-10 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000961 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:36112198 4896 2022-11-08 PomBase SPBC106.10 FYPO:0005254 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:34086083 4896 2021-06-24 PomBase SPBC106.10 FYPO:0003896 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0001232 PMID:20655879 4896 2014-10-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0004083 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:30973898 4896 2019-04-23 (Figure S2A) PomBase SPBC106.10 FYPO:0000833 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000079,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.03c) PMID:37052630 4896 2023-04-27 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000833 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.12) PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. 7) PomBase SPBC106.10 FYPO:0000833 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC162.05) PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. 7) PomBase SPBC106.10 FYPO:0000833 deletion 972 h- pka1 pka1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.18) PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. 7) PomBase SPBC106.10 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2023-06-28 PomBase SPBC947.02 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph apl2 apl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.02 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph apl2 apl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.02 FYPO:0000115 deletion 972 h- apl2 apl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:19624755 4896 2021-01-04 Dapl2 and Dapm1 cells were more sensitive when exposed to 34 °C or to 5 mM VPA compared with those of Dapl4 and Daps1 cells PomBase SPBC947.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph apl2 apl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph apl2 apl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.02 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph apl2 apl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- apl2 apl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC947.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl2 apl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.02 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl2 apl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001971 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0001232 PMID:10504305 4896 2013-05-10 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000026 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0001232 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 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FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11016847 4896 2012-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001038 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 6D) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002462 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0001232 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9199286 4896 2014-05-02 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001079 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0000335 PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001192 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000150 PMID:11016847 4896 2012-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000767 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0005638 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000647 wild type Overexpression 972 h- pck2 pck2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11016847 4896 2012-07-03 PomBase SPAC227.07c FYPO:0006822 wild type Knockdown 972 h- pab1 pab1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC227.07c FYPO:0006822 wild type Knockdown 972 h- pab1 pab1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0000238 deletion 972 h- zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0006660 deletion 972 h- zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 zds1 zds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- zds1 zds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zds1 zds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 zds1 zds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC31F12.01 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zds1 zds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.13c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl32 mrpl32delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrpl32 mrpl32delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1604.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl32 mrpl32delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.13c FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl32 mrpl32delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.05c FYPO:0001514 wild type Overexpression 972 h- man1 man1+ wild_type ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC26A3.15c) PMID:22540024 4896 2012-09-13 PomBase SPAC14C4.05c FYPO:0001556 wild type Overexpression 972 h- man1 man1+ wild_type ECO:0001232 PMID:22540024 4896 2012-07-19 PomBase SPAC14C4.05c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP man1 man1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC14C4.05c FYPO:0000771 wild type Overexpression 972 h- man1 man1+ wild_type ECO:0001232 PMID:22540024 4896 2012-09-13 PomBase SPBC23G7.11 FYPO:0000695 D56A Not assayed or wild type 972 h- mag2 mag2-D56A mag2-A56S amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:23273506 4896 2023-03-09 (Figures 4B and 4C) Asp56Ser mutation endows Mag2 with the ability to excise εA at levels similar to Mag1. PomBase SPCC364.06 FYPO:0003449 wild type Overexpression 972 h- nap1 nap1+ wild_type ECO:0005580 PMID:18474252 4896 2014-07-14 PomBase SPCC364.06 FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- nap1 nap1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:18474252 4896 2014-07-14 PomBase SPCC364.06 FYPO:0000839 wild type Overexpression 972 h- nap1 nap1+ wild_type ECO:0001232 PMID:18474252 4896 2014-07-14 PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- mts4 mts4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12553909 4896 2013-04-25 PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0002081 wild type Overexpression 972 h- mts4 mts4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12553909 4896 2013-05-09 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0003066 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0006424 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1C) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0004763 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:25533956 4896 2015-07-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0002485 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0006423 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1B) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0006423 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 PMID:25579976 4896 2016-08-01 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0004212 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 2B) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0003537 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0005648 deletion 972 h- mat gene-induced haploid meiosis, nda3-K311 moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 PMID:34851403 4896 2023-06-10 Non-separated signals were found to be significantly or nearly significantly wider than in wild-type cells (Fig. 3E,F;) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0005634 deletion 972 h- h+ cdc2-M35 mat3-M cen1-GFP ura4-D18 (haploid meiosis inducing) moa1 moa1delta deletion ECO:0005638 high PMID:16325576 4896 2021-05-13 (Figure 1) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0005634 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 ~10 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1B) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0005633 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 30 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1B, 1D) PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15E1.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 moa1 moa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.10c FYPO:0002148 rfc3::ura4 Null 972 h- rfc3 rfc3::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:10588638 4896 2016-02-18 PomBase SPAC27E2.10c FYPO:0002061 rfc3::ura4 Null 972 h- rfc3 rfc3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10588638 4896 2016-02-18 PomBase SPBC2G2.16 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpi1 mpi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- mpi1 mpi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2G2.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpi1 mpi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0005234 424-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-CD2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:12604790 4896 2016-02-03 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0004921 424-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-CD2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000703 424-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-CD2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1347.10),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002060 424-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-CD2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- sal3 sal3-i2 unknown ECO:0001232 medium PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 1) PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003573 Mit1-CkIvV motif replaced by Epe1-FVI motif Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-FVI(epe1) fusion_or_chimera ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:39945308 4896 2025-03-27 (Fig. 4F) PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002336 Mit1-CkIvV motif replaced by Epe1-FVI motif Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-FVI(epe1) fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:39945308 4896 2025-03-21 (Fig. 4C, 4D and 4E) PomBase SPBC409.13 FYPO:0002785 W27I Not assayed or wild type 972 h- rib4 rib4-W27I amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11856310 4896 2013-10-11 PomBase SPBC409.13 FYPO:0002809 W27I Not assayed or wild type 972 h- rib4 rib4-W27I amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11856310 4896 2013-10-11 PomBase SPBC26H8.08c FYPO:0001355 326-329 Not assayed or wild type 972 h- grn1 grn1-deltaG3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:16251348 4896 2017-09-14 PomBase SPBC26H8.08c FYPO:0006217 326-329 Not assayed or wild type 972 h- grn1 grn1-deltaG3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16251348 4896 2017-09-14 PomBase SPBC17D1.07c FYPO:0003066 66-168 Not assayed or wild type 972 h- npg1 npg1deltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25146394 4896 2014-09-05 PomBase SPBC17D1.07c FYPO:0003790 66-168 Not assayed or wild type 972 h- npg1 npg1deltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC17D1.07c) PMID:25146394 4896 2014-09-05 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0001645 M574T Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-M574T amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:31366733 4896 2019-09-23 (Fig. 7) PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 F380A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F380A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 F380A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F380A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 F380A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F380A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 F380A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F380A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPCC1902.01 FYPO:0000659 1-685 Not assayed or wild type 972 h- gaf1 gaf1-C GAF1C partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 PMID:10438147 4896 2012-02-23 PomBase SPAP8A3.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 paa1 paa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP8A3.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- paa1 paa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP8A3.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 paa1 paa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0001894 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0001018 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 30 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure S5B) PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0003577 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 PMID:22194353 4896 2014-07-09 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0006274 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-11-16 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0006274 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.11c) PMID:26365378 4896 2017-11-16 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0000584 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0001123 deletion 972 h- sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph sst2 sst2delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sst2 sst2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000704 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Co-immunoprecipitation experiments with anti-FLAG beads showed that deletion of mtf2 abolished the interaction of Sls1- FLAG with Mrh5-Myc and Ppr4-CBP (Fig. 2A). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000704 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c),assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Co-immunoprecipitation experiments with anti-FLAG beads showed that deletion of mtf2 abolished the interaction of Sls1- FLAG with Mrh5-Myc and Ppr4-CBP (Fig. 2A). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000704 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Co-immunoprecipitation experiments with anti-FLAG beads showed that deletion of mtf2 abolished the interaction of Sls1- FLAG with Mrh5-Myc and Ppr4-CBP (Fig. 2A). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000704 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Mrh5C subunits no longer associate with each other. Mrh5 co-immunoprecipitated with the mtSSU as expected (Fig. 3A). Deletion of mtf2 dramatically reduced this association, suggesting that the whole complex is involved in mtSSU binding (Fig. 3A). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000704 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC2F7.15),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000470 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001324 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mtf2 or other subunits of Mrh5C dramatically reduced the levels of mtSSU proteins but not the large subunit of the mitoribosome (mtLSU) proteins tested (Figure 3, B and C) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001324 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC2F7.15) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mtf2 or other subunits of Mrh5C dramatically reduced the levels of mtSSU proteins but not the large subunit of the mitoribosome (mtLSU) proteins tested (Figure 3, B and C) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001324 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC23A1.18c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mtf2 or other subunits of Mrh5C dramatically reduced the levels of mtSSU proteins but not the large subunit of the mitoribosome (mtLSU) proteins tested (Figure 3, B and C) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0002134 deletion 972 h- Δpnu1[Δi] mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c),assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In control cells (Δpnu1[Δi]), the cox1 and cob1 mRNAs appeared in two peaks, a major peak (peak A) comigrating with the mtSSU and a second peak (peak B) comigrating with the mitoribosome (Fig. 4). In Δmtf2 cells, peak A was up-shifted to the lower-density regions and did not comigrate with the mtSSU, and peak B decreased dramatically (Fig. 4). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0002134 deletion 972 h- Δpnu1[Δi] mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c),assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In control cells (Δpnu1[Δi]), the cox1 and cob1 mRNAs appeared in two peaks, a major peak (peak A) comigrating with the mtSSU and a second peak (peak B) comigrating with the mitoribosome (Fig. 4). In Δmtf2 cells, peak A was up-shifted to the lower-density regions and did not comigrate with the mtSSU, and peak B decreased dramatically (Fig. 4). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007525 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, Mrh5C subunits no longer co-sedimented with the mtSSU in Δmtf2 cells (Fig. 3D) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007525 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, Mrh5C subunits no longer co-sedimented with the mtSSU in Δmtf2 cells (Fig. 3D) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007525 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, Mrh5C subunits no longer co-sedimented with the mtSSU in Δmtf2 cells (Fig. 3D) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, the deletion of ppr4 and mtf2 did not or only moderately affect the protein levels of other Mrh5C subunits (Fig. 1, C and D). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, the deletion of ppr4 and mtf2 did not or only moderately affect the protein levels of other Mrh5C subunits (Fig. 1, C and D). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 In contrast, the deletion of ppr4 and mtf2 did not or only moderately affect the protein levels of other Mrh5C subunits (Fig. 1, C and D). PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.03c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mtf2 or other subunits of Mrh5C dramatically reduced the levels of mtSSU proteins but not the large subunit of the mitoribosome (mtLSU) proteins tested (Figure 3, B and C) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000833 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.02c) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Deletion of mtf2 or other subunits of Mrh5C dramatically reduced the levels of mtSSU proteins but not the large subunit of the mitoribosome (mtLSU) proteins tested (Figure 3, B and C) PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph mtf2 mtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- mtf2 mtf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtf2 mtf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5D6.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtf2 mtf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000835 221-301 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2deltaCC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-12-23 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0006221 221-301 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2deltaCC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Spa2 lacking CC1 was reduced in abundance at the cell division site by ∼12%and at cell tips by ∼25%compared to levels of wild-type Spa2 (Fig. 2E,F; Fig. S2F). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001586 221-301 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2deltaCC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Spa2 lacking CC1 was reduced in abundance at the cell division site by ∼12%and at cell tips by ∼25%compared to levels of wild-type Spa2 (Fig. 2E,F; Fig. S2F). PomBase SPBC216.04c FYPO:0003421 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000291 PMID:24879348 4896 2014-06-06 PomBase SPBC216.04c FYPO:0003127 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000335 PMID:24879348 4896 2014-06-06 PomBase SPBC216.04c FYPO:0002780 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000335 PMID:24879348 4896 2014-06-06 PomBase SPBC216.04c FYPO:0002780 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000335 PMID:23456650 4896 2014-02-14 PomBase SPBC216.04c FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-14 PomBase SPBC216.04c FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-14 PomBase SPBC216.04c FYPO:0003420 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000335 PMID:24879348 4896 2014-06-06 PomBase SPBC216.04c FYPO:0001521 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000335 PMID:24879348 4896 2014-06-06 PomBase SPBC216.04c FYPO:0001521 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0000335 PMID:23456650 4896 2014-02-14 PomBase SPBC216.04c FYPO:0000763 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:24879348 4896 2014-06-06 PomBase SPBC216.04c FYPO:0000763 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-14 PomBase SPBC216.04c FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-13 PomBase SPBC216.04c FYPO:0003115 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-13 PomBase SPBC216.04c FYPO:0001109 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-13 PomBase SPBC216.04c FYPO:0003113 wild type Overexpression 972 h- mxr2 mxr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23456650 4896 2014-02-14 PomBase SPAC22E12.09c FYPO:0000669 K81I,R82A,R102K,S371A Not assayed or wild type 972 h- krp1 krp1-K81I,R82A,R102K,S371A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000061 PMID:9418887 4896 2012-02-23 PomBase SPBC211.04c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP mcm6 mcm6+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0000161 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 6) PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002393 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0003371 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002027 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000124 low PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002656 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:20807799 4896 2013-09-18 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002699 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:20807799 4896 2013-11-01 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002699 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.05c) PMID:20807799 4896 2013-11-01 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0001365 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high high PMID:33496728 4896 2021-06-30 (Figure 1) PomBase SPBC1215.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000124 PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0001253 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000124 PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0000650 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000006,FYECO:0000124 PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002170 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002657 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000124 PMID:20807799 4896 2013-09-18 PomBase SPBC1215.02c FYPO:0002459 deletion 972 h- naa25 naa25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000124 PMID:20807799 4896 2013-09-09 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K195R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K195R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K195R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K195R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0006148 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 The mRNA level of isp5+ (S6A Fig) as well as the basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion as measured by Renilla luciferase reporter (S6B Fig) were also decreased in npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001324 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001324 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0010009 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0004457 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also impairs the nuclear localization of Gaf1-YFP induced by nitrogen depletion (S6C Fig) PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0006233 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δnpr2 cells and Δnpr3 cells, vacuoles were smaller, and the intensities of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP at vacuolar membranes were decreased, compared with wild-type cells (Fig 8A and 8B). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0006233 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δnpr2 cells and Δnpr3 cells, vacuoles were smaller, and the intensities of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP at vacuolar membranes were decreased, compared with wild-type cells (Fig 8A and 8B). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001117 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 The mRNA level of isp5+ (S6A Fig) as well as the basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion as measured by Renilla luciferase reporter (S6B Fig) were also decreased in npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Similarly to Δlam2 cells, the growth of npr3::ura4+ cells and npr2::ura4+ cells was partially inhibited on EMM plate, and was completely inhibited on both YES and YPD plates (S2A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 Similarly to Δlam2 cells, the growth of npr3::ura4+ cells and npr2::ura4+ cells was partially inhibited on EMM plate, and was completely inhibited on both YES and YPD plates (S2A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 Similarly to Δlam2 cells, the growth of npr3::ura4+ cells and npr2::ura4+ cells was partially inhibited on EMM plate, and was completely inhibited on both YES and YPD plates (S2A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001355 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Exogenous addition of arginine to the EMM plates enhanced the cell growth of Δlam2 cells, Δgtr2 cells, Δgtr1 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells as well as wild-type cells, but did not rescue the defective cell growth of these mutant cells to the level of wild-type cells (S5 Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0002681 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δnpr2 cells and Δnpr3 cells also showed increased Rps6 phosphorylation (S7 Fig), similarly to the loss of Lam2, Gtr1 or Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0002681 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δnpr2 cells and Δnpr3 cells also showed increased Rps6 phosphorylation (S7 Fig), similarly to the loss of Lam2, Gtr1 or Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0000825 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001545 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with rapamycin and caffeine partially canceled, and Torin1 treatment fully canceled, cannavanine resistance in Δnpr2 cells and Δnpr3 cells (S4D Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0008372 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 TORC1 inhibition by rapamycin and caf- feine abolished the internalization of Cat1 and increases the signal at the cell surface (S4B Fig, Rapamycin + caffeine). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001357 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with both rapamycin and Torin1 rescued the growth defects of npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells and npr2::KanMX4 cells (S3A Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001029 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Treatment with rapamycin and caffeine partially canceled, and Torin1 treatment fully canceled, cannavanine resistance in Δnpr2 cells and Δnpr3 cells (S4D Fig). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001029 npr2 deletion Null 972 h- npr2 npr2::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Using npr3::ura4+ cells, npr2::ura4+ cells, and npr2::KanMX4 cells, we found that the loss of Npr2 or Npr3 also increases mRNA expression of Cat1 (S4A Fig), induces its internalization (S4B Fig, EMM), and causes canavanine resistance (S4C Fig), similarly to the loss of Lam2 as well as Gtr1 and Gtr2. PomBase SPAC13A11.02c FYPO:0002643 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg11 erg11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC13A11.02c FYPO:0002343 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg11 erg11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC13A11.02c FYPO:0002766 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg11 erg11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC13A11.02c FYPO:0003860 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP erg11 erg11+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC13A11.02c FYPO:0005252 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg11 erg11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002290 S301A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-S301A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. S1) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-11A3 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 4b) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0001645 G155A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G155A nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 G155A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G155A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 high PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000132 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0007386 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0002368 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:28366642 4896 2017-04-30 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000835 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPBC651.09c) PMID:32366382 4896 2020-06-04 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000118 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0006021 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28366642 4896 2017-05-09 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000089 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000091 801-990 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5delta-CTR partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- rpl2802 rpl2802+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:12237855 4896 2014-02-20 PomBase SPAC644.14c FYPO:0002003 AGGTG(-232)CTTCA,AGGTA(-211)CTTCG Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-CT2CA nucleotide_mutation ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPAC1B1.01),assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPAC644.14c FYPO:0003142 AGGTG(-232)CTTCA,AGGTA(-211)CTTCG Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-CT2CA nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPAC644.14c FYPO:0003034 AGGTG(-232)CTTCA,AGGTA(-211)CTTCG Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-CT2CA nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001317 AGGTG(-232)CTTCA,AGGTA(-211)CTTCG Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-CT2CA nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000089 AGGTG(-232)CTTCA,AGGTA(-211)CTTCG Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-CT2CA nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000268 AGGTG(-232)CTTCA,AGGTA(-211)CTTCG Not assayed or wild type 972 h- rad51 rad51-CT2CA nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004914 G235T Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-4 nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002239 G235T Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-4 nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPAC12B10.12c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP rhp41 rhp41+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC4G8.12c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smp3 smp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G8.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- smp3 smp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4G8.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smp3 smp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0007599 TetR-stc1delta(32-84) Not assayed or wild type 972 h- stc1 TetR-stc1-deltaZF1 TetR-stc1-deltaZF1(32-84) fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L154* Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-delta154-261 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L154* Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-delta154-261 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L154* Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-delta154-261 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPCC74.02c FYPO:0005369 497-710 Not assayed or wild type 972 h- ppn1 ppn1-1-496 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:33711009 4896 2022-09-19 PomBase SPCC74.02c FYPO:0000705 497-710 Not assayed or wild type 972 h- ppn1 ppn1-1-496 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC776.02c),assayed_protein(PomBase:SPCC74.02c) PMID:33711009 4896 2022-10-07 Neither the N-terminal segment from aa 1-496 nor the C-terminal fragment from 578-710 was able to bind to Dis2 or Swd22 in the 2-hybrid format (Fig 11A) PomBase SPCC74.02c FYPO:0000705 497-710 Not assayed or wild type 972 h- ppn1 ppn1-1-496 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC824.04),assayed_protein(PomBase:SPCC74.02c) PMID:33711009 4896 2022-10-07 Neither the N-terminal segment from aa 1-496 nor the C-terminal fragment from 578-710 was able to bind to Dis2 or Swd22 in the 2-hybrid format (Fig 11A) PomBase SPBC577.13 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 syj2 syj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC577.13 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC577.13 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC577.13 FYPO:0001383 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syj2 syj2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC577.13 FYPO:0002253 deletion 972 h- syj2 syj2delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 1B) PomBase SPBC577.13 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC577.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC577.13 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC577.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC577.13 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC577.13 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC577.13 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syj2 syj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC577.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- syj2 syj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC577.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syj2 syj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC577.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syj2 syj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB2B4.01c FYPO:0002148 deletion 972 h- 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yam8 ehs1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11016847 4896 2012-07-09 PomBase SPAC1F5.08c FYPO:0001190 P455S Not assayed or wild type 972 h- yam8 ehs1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11016847 4896 2012-07-09 PomBase SPAC1F5.08c FYPO:0001189 P455S Not assayed or wild type 972 h- yam8 ehs1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:11016847 4896 2012-07-09 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001357 76-151,D122A,E124A Overexpression 972 h- cut2 cut2(81-156),EA2 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16483313 4896 2016-04-19 PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000141 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:36200823 4896 2023-01-17 In addition, a low concentration of TBZ enhanced the chromosome segregation defects of the temperature-sensitive sfh1-13 mutant (Supplementary Figure S1A). PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0003730 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001270 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000082 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 2B, Fig. S3A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001162 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 medium PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001176 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 low PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0002842 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 4C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0006599 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 medium assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c),assayed_region(SO:0001898),assayed_region(SO:0001899) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 4F) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0004345 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 medium assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 5C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0008249 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 medium assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14),assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 5C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0008035 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_region(SO:0001799) PMID:36200823 4896 2023-01-17 at pericentromeric heterochromatin When CENP-ACnp1 was expressed at wild-type levels, specific accumulation at pericentromeric heterochromatin domains of all centromeres (Figure 1A), but not at non-centromeric locations PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005371 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000229 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005371 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000334 FYECO:0000079,FYECO:0000227 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0008036 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:36200823 4896 2023-01-17 Importantly, MNase protection at sites i, iii, and v, which are located between CENP-ACnp1 and heterochromatin domains, was elevated in sfh1-13 cells (site i: 1.5-fold, P-value = 0.027; site iii: 2.2-fold, P-value = 0.0001; site v: 1.2-fold, P-value = 0.02; left panel of Figure 5B), indicating that Sfh1/RSC contributes to chromatin decompaction at the boundary. PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000972 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000229 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S5) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0004380 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:36200823 4896 2023-01-17 In sfh1-13 mutant cells, a small but significant increase in the localization of CENP-CCnp3 and CENP- IMis6 was observed at surrounding pericentromeric repeats (Figure 2B and C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0004380 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:36200823 4896 2023-01-17 In sfh1-13 mutant cells, a small but significant increase in the localization of CENP-CCnp3 and CENP- IMis6 was observed at surrounding pericentromeric repeats (Figure 2B and C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0004922 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S2B, Fig. S3C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001387 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000961 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000863 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 4E) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0004743 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 4E) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0008457 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000229 assayed_region(SO:0000425) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 5E) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000833 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:36200823 4896 2023-01-17 Importantly, no significant difference in the level of Cnp1 protein or mRNA was seen in sfh1-13 cells (Figure 1E). PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005079 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 4C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005079 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 4C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005082 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 5C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0002389 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14),assayed_region(SO:0001898),assayed_region(SO:0001899) PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 4C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0004579 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000229 assayed_transcript(SO:0002208) PMID:30155942 4896 2025-09-01 (Fig. 5D) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000842 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000785 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000088 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000089 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4A) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0001214 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 medium PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6C) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0005889 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S6D) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000091 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:36200823 4896 2023-01-10 In addition, a low concentration of TBZ enhanced the chromosome segregation defects of the temperature-sensitive sfh1-13 mutant (Supplementary Figure S1A). PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000091 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 3B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0000268 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4B) PomBase SPCC16A11.14 FYPO:0009063 E225D,K254E,P292Q Not assayed or wild type 972 h- sfh1 sfh1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000228 high PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. S4B) PomBase SPBC1289.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pfl5 pfl5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.15 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pfl5 pfl5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.15 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pfl5 pfl5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1289.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- pfl5 pfl5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1289.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl5 pfl5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl5 pfl5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- iba57 iba57delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC21E11.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iba57 iba57delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.07 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iba57 iba57delta 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ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP SPAC2H10.01 SPAC2H10.01+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC2H10.01 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPAC2H10.01 SPAC2H10.01+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0003738 wild type Overexpression 972 h- fin1 fin1+ wild_type ECO:0001232 PMID:9490640 4896 2014-08-26 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0004702 wild type Overexpression 972 h- fin1 fin1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- fin1 fin1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9490640 4896 2014-08-26 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- fin1 fin1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- fin1 fin1+ wild_type ECO:0001232 PMID:12065422 4896 2020-12-26 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0005960 wild type Overexpression 972 h- fin1 fin1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC29A3.17 FYPO:0002555 270-525 Not assayed or wild type 972 h- gef3 gef3(1-270) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.17) PMID:25411334 4896 2015-07-23 PomBase SPBC29A3.17 FYPO:0002557 270-525 Not assayed or wild type 972 h- gef3 gef3(1-270) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.17) PMID:25411334 4896 2015-07-23 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 R342E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R342E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 R342E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R342E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPCC970.11c FYPO:0001489 Wtf9 tethered to a deubiquitinase using the GFP–GBP interaction Ectopic 972 h- wtf9 wtf9-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2024-12-26 (Fig. 6A) PomBase SPBC4.04c FYPO:0001028 unknown 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:8298187 4896 2012-03-16 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000080 unknown 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001122 unknown 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002060 1-20 Overexpression 972 h- cnp1 cnp1-deltatail partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:25619765 4896 2015-12-30 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0000753 C173A Not assayed or wild type 972 h- pcs2 pcs2-C173A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:12905027 4896 2012-02-23 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0000096 C173A Not assayed or wild type 972 h- pcs2 pcs2-C173A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:12905027 4896 2012-01-09 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002430 CTD-S2E(r5-r16) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S2E(r5-r16) rpb1-12xS2ECTD|rpb1-CTD-S2E(5-16) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0001407 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0002588 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0002588 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0002589 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0000096 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0001245 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0000103 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC17A2.14 FYPO:0001987 P153T Not assayed or wild type 972 h- mnr2 mnr2-GA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16444015 4896 2013-08-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0003013 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 24 PMID:39330407 4896 2024-10-04 During our investigation, we noticed that contractile ring shedding appeared premature and exaggerated in ∆ain1 ∆myo51 cells when compared to wild-type cells. In wild-type cells expressing mEGFP-Myo2p, shedding begins when the ring is 62% constricted (n = 38 cells), and the fragments that shed from the constricting contractile ring extend out along the septum without reaching the full width of the cell (Figures 2A and 3A-C) PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0003338 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002049 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000207 medium PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0006023 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000207 medium PMID:11294907 4896 2017-06-09 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0000339 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000207 medium PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001294 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0004097 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 PMID:39330407 4896 2024-11-05 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0006187 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001315 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15743909 4896 2017-09-13 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11294907 4896 2017-05-11 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11294907 4896 2017-05-11 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:11294907 4896 2017-05-11 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:11294907 4896 2017-05-11 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:11294907 4896 2017-05-11 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:11294907 4896 2017-05-11 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0007211 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 54 PMID:39330407 4896 2024-11-05 node clumping, Myo2p marker Figure 1A-D "The clumping phenotype suggests that nodes aggregate into clumps during contractile ring assembly in the absence of Ain1p." PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001904 deletion 972 h- ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:33131769 4896 2021-01-04 An fragile actomyosin contractile ring is an abnormal actomyosin contractile ring that disassemble by treatment with a low dose of Latrunculin A, an actin depolymerizing agent. PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph ain1 ain1delta ain1-delta1 deletion 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0003412 pas1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 pas1 pas1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003670 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000091 G104W Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G103W amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPAC17G8.01c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trl1 trl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- trl1 trl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G8.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trl1 trl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000325 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Table 3) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 low PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 ~25 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1B) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:11694582 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0001894 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 13 PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 7a) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003263 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 3 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0004077 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 9 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000681 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000927 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 2A) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000927 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. S3) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000927 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:10855500 4896 2014-09-23 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003542 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC458.04c) PMID:20298435 4896 2012-03-23 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0005814 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 6B,C). PomBase SPAC1093.06c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0004605 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 high PMID:24954111 4896 2018-02-02 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000485 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0000059 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1c) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000485 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0000059 PMID:20298435 4896 2012-03-23 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000940 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC646.17c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000940 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000513 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 low PMID:25869666 4896 2022-05-16 (Fig. 1) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000513 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0002638 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0000059 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0001846 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0007162 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:25869666 4896 2022-05-16 (Fig. S1) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0001861 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0000340 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0005411 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:18256284 4896 2015-11-12 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0004101 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 60 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0001368 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0004097 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:17561805 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003834 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:10855500 4896 2014-09-23 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0007276 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 high high PMID:31582398 4896 2020-03-12 (Figure. 5C, D) normal PomBase SPAC1093.06c FYPO:0006259 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003790 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.06c) PMID:15654021 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0003790 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:30649994 4896 2019-05-29 (Fig. S3) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0004764 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 6B,C). in meiotic cells, shmooing cells PomBase SPAC1093.06c FYPO:0005342 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 (Fig. 1e) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000590 deletion 972 h- dhc1 dhc1delta deletion ECO:0001232 ~75 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1B) PomBase SPAC1093.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1093.06c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dhc1 dhc1delta deletion ECO:0005638 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SPBC9B6.03 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0002830 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 1C) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0006345 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 1B) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009008 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009008 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0002672 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2A) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0002672 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2A) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0000776 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2C) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2A, 2B) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2A, 2B) PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0001029 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pib2 pib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC9B6.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- pib2 pib2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC9B6.03 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PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005555 1-191,K1420A,K1423A,K1427A Not assayed or wild type 972 h- mis4-242 mis4 mis4-C-B amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 medium PMID:33176147 4896 2020-12-04 (Figures 4E and 4F) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001387 1-191,K1420A,K1423A,K1427A Not assayed or wild type 972 h- mis4-242 mis4 mis4-C-B amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:33176147 4896 2020-12-03 (Fig. 2A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0007544 1-191,K1420A,K1423A,K1427A Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-C-B amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 PMID:33176147 4896 2020-12-01 (Fig. 1E) PomBase SPBC16G5.09 FYPO:0003858 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP kex1 kex1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002021 unknown Not assayed or wild type 972 h- wat1 wat1-803 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002061 46-50 Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7(PP1-deltaA) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:21664573 4896 2016-10-18 PomBase SPNCRNA.1164 FYPO:0009043 deletion 972 h- SPNCRNA.1164 SPNCRNA.1164delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002972 S276D,T278E,S279D Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-3D/E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02),assayed_using(PomBase:SPBC1604.21c),assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20),assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002061 F111D Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-F111D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000400 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 PMID:2847913 4896 2014-05-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004596 deletion 972 h- ade6- leu1-32 ura4-D18 cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000233 high PMID:8087848 4896 2015-08-28 FACS analysis of germinating haploid cdc13delta spores. Up to 32C DNA content was observed by 19 hour after referring spores to allow germination Figure 2 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 deletion 972 h- ade6- leu1-32 ura4-D18 cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000233 high PMID:8087848 4896 2016-09-29 cdc13delete cells were kept alive by episomal pSM2 cdc13. Cell phenotype was observed after plasmid loss. Figure 2C PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 medium PMID:9436991 4896 2015-12-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005580 PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005580 PMID:8552194 4896 2012-11-22 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001424 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2569363 4896 2013-02-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002033 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC685.09) PMID:11486016 4896 2013-12-20 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003331 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001122 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9436991 4896 2015-12-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000344 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 PMID:8552194 4896 2012-11-22 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002263 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 PMID:2847913 4896 2014-05-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000839 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 PMID:2847913 4896 2014-05-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001490 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002083 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002083 deletion 972 h- ade6- leu1-32 ura4-D18 cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000233 high PMID:8087848 4896 2015-08-28 germinating haploid cdc13delta spores, observed by 14 hour after spores allowed to germination (Figure 2b). cdc13delete cells kept alive by a multicopy plasmid, pSM2-cdc13. Cell phenotype was observed after plasmid loss same phenotype as in Figure 2b PomBase SPBC582.03 FYPO:0002083 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 PMID:8657126 4896 2014-06-11 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002083 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 high PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc13 cdc13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000579 deletion 972 h- cdc13 cdc13delta deletion ECO:0005638 PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0001914 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:18550796 4896 2015-12-18 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0001914 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12631727 4896 2014-10-16 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0001914 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:8203159 4896 2015-05-05 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0000583 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0000583 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0003029 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.01) PMID:12631727 4896 2014-10-16 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0001283 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.01) PMID:12631727 4896 2014-10-16 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0001324 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.01) PMID:12631727 4896 2014-10-16 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0000355 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0000478 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0003563 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0003798 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0003905 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:12631727 4896 2014-10-16 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0003904 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0002332 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.05c) PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0003541 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC825.03c) PMID:18550796 4896 2015-12-18 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0001420 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPBC3H7.01 FYPO:0002177 T1161A Not assayed or wild type 972 h- spo14 spo14-B221 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:12631727 4896 2014-10-15 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 TQATQEAPLHVS8TQPSQVDSLVPA Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T645A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001045 S201A Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-S201A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:30726745 4896 2019-05-14 (Figure 7A) PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001903 S201A Not assayed or wild type 972 h- sec3 sec3-S201A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30726745 4896 2019-05-14 (Figure 7C, 7D) PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut23 cut23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut23 cut23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- cut23 cut23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut23 cut23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut23 cut23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0003411 268-318 Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-phd1delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:18957202 4896 2020-04-07 silencing at the imr region in lid2-phd2 and lid2-phd3 mutants was significantly impaired while lid2-phd1 showed only a slight defect (Figure 7A). PomBase SPAC3H8.06 FYPO:0002904 unknown Not assayed or wild type 972 h- aur1 aur1-22 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9472078 4896 2014-08-26 PomBase SPAC3H8.06 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- aur1 aur1-22 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9472078 4896 2014-08-26 PomBase SPCC790.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0001324 deletion 972 h- rbd2 rbd2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:28821619 4896 2017-10-12 PomBase SPCC790.03 FYPO:0001422 deletion 972 h- rbd2 rbd2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-09-30 (Fig. 2B) "Sre1 cleavage defect under low oxygen" PomBase SPCC790.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC790.03 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph rbd2 rbd2delta deletion 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assayed_protein(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 At 36°C, Spg1p-GFP was detected at SPBs in wild-type cells but was absent from SPBs in the cdc11 mutant strains (Figure 4B). PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000941 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000082 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000082 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38865179 4896 2024-07-09 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-19 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9254700 4896 2015-12-10 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0001368 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0008403 N767M Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 4E) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002442 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:11694585 4896 2017-05-11 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 (Figure 6) PomBase SPCC1739.11c FYPO:0005709 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 Similar results were obtained in cdc14-118, sid1-239, and cdc11-136 mutants (not shown). PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000086 N767M Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-136 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC20G4.08 FYPO:0000705 751-1076 Not assayed or wild type 972 h- pdc1 pdc1deltaCC&C-term partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.08),assayed_using(PomBase:SPAC20G4.08) PMID:23319050 4896 2013-01-22 PomBase SPAC20G4.08 FYPO:0001899 751-1076 Not assayed or wild type 972 h- pdc1 pdc1deltaCC&C-term partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:23319050 4896 2013-03-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001265 1-100 Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1deltaN100 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173,T171) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Figure 2B) PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0000760 deletion 972 h- pfa3 pfa3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0004795 deletion 972 h- pfa3 pfa3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pfa3 pfa3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- pfa3 pfa3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfa3 pfa3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.15c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfa3 pfa3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.08c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cct3 cct3delta deletion ECO:0001232 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Finally, deletion of the other four members of the fission yeast Cid14/Trf4/5 poly(A) polymerase family did not affect silencing of an imr1R::ura4+ reporter gene (Figure 2H). PomBase SPAC821.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- cid13 cid13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:12062100 4896 2021-09-23 PomBase SPAC821.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cid13 cid13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cid13 cid13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.04c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cid13 cid13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.04c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph cid13 cid13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph cid13 cid13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 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2023-06-28 PomBase SPAC3H1.12c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 snt2 snt2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC3H1.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 snt2 snt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3H1.12c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 snt2 snt2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC3H1.12c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 snt2 snt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3H1.12c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph snt2 snt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.12c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph snt2 snt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 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prototroph pek1 pek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- pek1 pek1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC543.07 FYPO:0007474 deletion 972 h- KanMX6, ade6-M210, ura4-D18, leu1-32 h+ pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33419777 4896 2021-02-02 (Fig. 1B, C Table 1) PomBase SPBC543.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pek1 pek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPBC543.07 FYPO:0001496 deletion 972 h- pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 PMID:10365961 4896 2014-07-28 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002106 deletion 972 h- pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:10365961 4896 2014-07-28 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pek1 pek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- pek1 pek1delta deletion ECO:0005638 PMID:10365961 4896 2014-07-28 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002150 GFP-act1 Knockdown 972 h- act1 GFP-act1 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20587778 4896 2017-09-07 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000381 P52A,R67A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-P52A,R67A atg8[AB mut] amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000127 medium PMID:31941401 4896 2020-02-21 (Fig. S3A). PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0000381 P52A,R67A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-P52A,R67A atg8[AB mut] amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 medium PMID:31941401 4896 2020-02-25 (Fig. S3A). PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001645 P52A,R67A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-P52A,R67A atg8[AB mut] amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC660.08),assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:34499173 4896 2021-10-25 PomBase SPBP8B7.24c FYPO:0001645 P52A,R67A Not assayed or wild type 972 h- atg8 atg8-P52A,R67A atg8[AB mut] amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC660.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:31941401 4896 2020-02-29 (Figure 1F) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007160 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 high PMID:38376141 4896 2024-07-10 In contrast, when we complemented the depleted extract with SpCAF-1 mutant complexes SpCAF-1-ED*, SpCAF-1-KER*, SpCAF- 1-ΔWHD we did not detect the supercoiled form I. This indicates that these mutants cannot promote nucleosome assembly (Figure 5). PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0000705 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 6A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0003412 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 7A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0005018 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000140 medium assayed_using(GO:0033186) PMID:38376141 4896 2024-07-10 The KER* mutation was then introduced in the full complex SpCAF-1-KER* (Figure 1—Figure supplement 1B, Figure 2— Figure supplement 2B) and we confirmed by MST and EMSA its lower affinity for dsDNA (Figure 3B, Figure 3—Figure supplement 2G, Table 1). PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0002624 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.03) PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 6C and D) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0004709 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 7B and C) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0008272 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:38376141 4896 2024-07-12 In addition, the NMR signals of all IDR for this mutant with or without histones were close to that of the WT (Figure 3—Figure supplement 3A-B) indicating that the KER* mutation did not impair histone binding. PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0008273 R147E,K150E,K154E,R161E,K168E Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-KER* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:38376141 4896 2024-07-12 In addition, the NMR signals of all IDR for this mutant with or without histones were close to that of the WT (Figure 3—Figure supplement 3A-B) indicating that the KER* mutation did not impair histone binding. PomBase SPAC4A8.08c FYPO:0004481 W523* Not assayed or wild type 972 h- vrs2 vrs2-642 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33823662 4896 2021-04-16 PomBase SPAC4A8.08c FYPO:0003743 W523* Not assayed or wild type 972 h- vrs2 vrs2-642 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:33823662 4896 2021-04-16 PomBase SPAC4A8.08c FYPO:0004944 W523* Not assayed or wild type 972 h- vrs2 vrs2-642 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000126 PMID:33823662 4896 2021-04-16 PomBase SPAC4A8.08c FYPO:0007610 W523* Not assayed or wild type 972 h- vrs2 vrs2-642 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:33823662 4896 2021-04-27 PomBase SPAC4A8.08c FYPO:0002199 W523* Not assayed or wild type 972 h- vrs2 vrs2-642 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33823662 4896 2021-04-27 PomBase SPAC4A8.08c FYPO:0006660 W523* Not assayed or wild type 972 h- vrs2 vrs2-642 partial_amino_acid_deletion 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PMID:17515930 4896 2015-02-17 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001705 T225C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T225C amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:17515930 4896 2015-02-17 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 T225C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T225C amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 1) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000085 T225C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T225C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:21095590 4896 2015-02-24 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 T225C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T225C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000089 T225C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T225C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 P13A Overexpression 972 h- cnp1 cnp1-P13A amino_acid_mutation 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PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 2b) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0005781 R133A,Q134A Not assayed or wild type 972 h- mad2 mad2-R133A,Q134A mad2-non-dimer amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPCC24B10.20 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.20 SPCC24B10.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.20 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.20 SPCC24B10.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.20 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.20 SPCC24B10.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.20 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.20 SPCC24B10.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.20 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PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph isp3 isp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph isp3 isp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph isp3 isp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph isp3 isp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0000584 deletion 972 h- isp3 isp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:7954893 4896 2014-05-08 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- isp3 isp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0003563 deletion 972 h- isp3 isp3delta deletion ECO:0001232 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4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- mug174 mug174delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1682.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug174 mug174delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002835 E23V Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V E23Vchp1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008195 E23V Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V E23Vchp1 amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:19362535 4896 2024-02-13 A second class of mutants showed a 5- to 17-fold reduction in binding affinity for H3K9me2 compared with the wild-type Chp1 chromodomain (V21A, E23V, N59A, and V24M). A PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 E23V Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V E23Vchp1 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002837 E23V Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V E23Vchp1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004742 E23V Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V E23Vchp1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19362535 4896 2024-02-13 Interestingly, cells expressing most of the mutant alleles of chp1 showed no defect in heterochromatin assembly as measured in this assay (Figure 3A), with the exception of the double mutant E23V V24M and the V24R chp1 mutant, which did show silencing defects. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 E23V Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-E23V E23Vchp1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0005156 deletion 972 h- pms1 pms1delta deletion ECO:0001232 PMID:9258673 4896 2018-06-07 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0006568 deletion 972 h- pms1 pms1delta deletion ECO:0000059 PMID:9258673 4896 2018-06-07 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0001893 deletion 972 h- pms1 pms1delta deletion ECO:0001232 PMID:9258673 4896 2018-06-07 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0000581 deletion 972 h- pms1 pms1delta deletion ECO:0005638 PMID:9258673 4896 2018-06-07 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0006689 deletion 972 h- pms1 pms1delta deletion ECO:0000049 low PMID:14599746 4896 2018-10-15 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pms1 pms1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0000256 deletion 972 h- pms1 pms1delta deletion ECO:0000059 PMID:9258673 4896 2018-06-07 PomBase SPAC19G12.02c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pms1 pms1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 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2018-01-25 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0001407 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0001407 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0001522 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0002672 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0004248 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A7.11) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0004248 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC29A10.17 FYPO:0001029 deletion 972 h- lam1 lam1delta deletion ECO:0005638 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Importantly, the elevation of Pi export activity in Δpqr1 and Δvtc4 is synergistic. In Δpqr1Δvtc4, exported Pi was far greater than that in the single mutant (Fig. 5D PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0005178 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0004671 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_protein(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0004671 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_protein(PomBase:SPAC23D3.12) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001045 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 4) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002798 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001422 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007818 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_protein(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007818 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_protein(PomBase:SPAC23D3.12) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0008028 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005801 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 12A) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007816 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007816 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 13) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0008226 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000335 medium PMID:37949217 4896 2024-05-08 (Figure 1a) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007822 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-16 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-06-29 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007817 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002801 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127,FYECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0004083 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC1827.07c) PMID:37949217 4896 2024-05-08 We found that Xpr1-GFP did not increase in Δpqr1, Δvtc4, or Δpqr1Δvtc4 (Fig. 5G). Accelerated Pi export in these mutants may not be caused by increased amounts of Xpr1 protein. PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0005572 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC1827.07c) PMID:37949217 4896 2024-05-08 In the mutants, Xpr1- GFP was similarly localized to the cell periphery, suggesting that accelerated Pi export in these mutants may not be caused by dynamic alteration of the localization of the exporter, Xpr1 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0006380 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002085 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. S6A) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 4) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007629 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127,FYECO:0000337 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0004325 deletion 972 h- pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pqr1 pqr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pqr1 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000705 3629-3661 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-1 tra1delta3667-3699 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000703 3629-3661 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-1 tra1delta3667-3699 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure 3C) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0002357 3629-3661 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-1 tra1delta3667-3699 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 3E) PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad52 rad22- rad22 unknown ECO:0000059 PMID:2598273 4896 2012-11-21 PomBase SPCC962.06c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bpb1 bpb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.06c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bpb1 bpb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- bpb1 bpb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC962.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bpb1 bpb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 D152N Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152N cdc2-N152 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 D152N Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D152N cdc2-N152 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8437586 4896 2018-04-03 Table 1 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008195 V21A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V21A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:19362535 4896 2024-02-13 A second class of mutants showed a 5- to 17-fold reduction in binding affinity for H3K9me2 compared with the wild-type Chp1 chromodomain (V21A, E23V, N59A, and V24M). A PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 V21A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V21A amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002837 V21A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V21A amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 V21A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V21A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPCC126.11c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC126.11c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.11c SPCC126.11cdelta deletion 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cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 I954T Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:30463883 4896 2019-05-19 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0006339 I954T Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 60-70 PMID:33506191 4896 2021-02-03 (Fig. 1) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000276 I954T Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2145514 4896 2013-01-24 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000276 I954T Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26258632 4896 2016-01-19 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002060 I954T Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000079 PMID:30463883 4896 2019-05-18 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003329 S384F Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 4A, B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005817 S384F Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15177031 4896 2016-11-01 (Fig. 4A, B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0007563 S384F Not assayed or wild type 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-06-23 (Fig. 6B) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000761 S384F Not assayed or wild type 972 h- h90 tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-06-01 (Fig. 6C) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0007810 S384F Not assayed or wild type 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-05-17 (Fig. 5, Table 3,4) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0007451 S384F Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0006501 S384F Not assayed or wild type 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000039,FYECO:0000126 high PMID:11950884 4896 2021-05-17 (Fig. 6A) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002760 S384F Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000013 S384F Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-1 tea2.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0000705 deletion 972 h- ipk1 ipk1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.12),assayed_using(PomBase:SPAPB17E12.04c) PMID:32047038 4896 2020-09-28 (Fig. 5G) The IP6-binding pocket formed between CSN2 and Rbx1 is remarkably conserved from yeasts to plants and humans (Figs. 2D and 3D). Deleting ipk1, the yeast IP6 synthase, abolishes Csn2 interaction with Cul1 in Schizosaccharomyces pombe PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ipk1 ipk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ipk1 ipk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ipk1 ipk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ipk1 ipk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ipk1 ipk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.10c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ipk1 ipk1delta 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4896 2019-05-17 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000141 410-960 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1(1-409) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:15743828 4896 2024-02-29 These cells exhibited high levels of chromosome segregation defects (Fig. 3C) and defects in centromeric silencing (Fig. 3B). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001508 410-960 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1(1-409) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 Consistent with this result, immunolocalization of 3xHA- chp11-409 with anti-HA antibody revealed that the truncated protein was diffusely localized throughout the chromatin and nucleolus (Fig. 3D). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 410-960 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1(1-409) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:15743828 4896 2024-02-29 These cells exhibited high levels of chromosome segregation defects (Fig. 3C) and defects in centromeric silencing (Fig. 3B). PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0004585 deletion 972 h- rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:12665553 4896 2015-05-14 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0004585 deletion 972 h- rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:25579976 4896 2016-08-02 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0003181 deletion 972 h- rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0000337 PMID:16043696 4896 2014-07-30 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0002485 deletion 972 h- rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0000059 PMID:16043696 4896 2014-07-30 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0002485 deletion 972 h- rec11 rec11delta rec11::kanMX6 deletion ECO:0005638 PMID:25579976 4896 2016-08-02 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4896 2015-11-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002927 K144A Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-K144A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24322298 4896 2015-11-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0005100 K144A Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-K144A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24322298 4896 2015-12-03 PomBase SPAC1D4.12 FYPO:0002061 rad15delta::LEU2(nt483-1668) Null 972 h- rad15 rad15delta::LEU2 rhp3delta::LEU2 disruption ECO:0005638 PMID:1534406 4896 2012-12-27 PomBase SPCC11E10.07c FYPO:0001097 frameshift at L43 Not assayed or wild type 972 h- gcn3 tif221-2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000251 PMID:32841241 4896 2021-01-14 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000705 I261A,E262Q Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-I261A,E262Q amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC26A3.02),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.10) PMID:24559510 4896 2014-03-20 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0003240 I261A,E262Q Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-I261A,E262Q 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Fig 3C and D. We also measured the amount of GFP-Bqt4 in mutants lacking Ubc6 and Ubc7, which are E2 ubiquitin-conjugating enzymes associated with Doa10 (Swanson et al., 2001). We found that GFP-Bqt4 levels increased to some extent in ubc6Δ and ubc7Δ single and ubc6Δ ubc7Δ double mutants (Fig. 3C,D). PomBase SPAC10F6.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ubc6 ubc6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC10F6.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ubc6 ubc6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC10F6.05c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph ubc6 ubc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.05c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ubc6 ubc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.05c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ubc6 ubc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC10F6.05c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph ubc6 ubc6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 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PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC119.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npa3 npa3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.07c FYPO:0000705 1-234 Not assayed or wild type 972 h- rsd1 rsd1-RRM123 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.07c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0005709 unknown Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1(FHA) unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:38865179 4896 2024-07-10 GFP-Csc1(FHA) localized to SPBs in mitotic cells (Figure 1D). PomBase SPAC23C4.15 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb5 rpb5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.15 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb5 rpb5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpb5 rpb5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C4.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb5 rpb5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001324 S141E,S151E,S154E,S155E,S164E,T165E Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6E amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002681 S141E,S151E,S154E,S155E,S164E,T165E Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6E amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1718.07c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 5E) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001038 S141E,S151E,S154E,S155E,S164E,T165E Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6E amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1718.07c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 5E) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0004084 S141E,S151E,S154E,S155E,S164E,T165E Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6E amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001096 S141E,S151E,S154E,S155E,S164E,T165E Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6E amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001317 S141E,S151E,S154E,S155E,S164E,T165E Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-6E amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 6A) PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-159 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-DF6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 1-159 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-DF6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPAC1F3.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- tsr3 tsr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K173R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K173R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K173R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K173R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 S1518E Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-S1518E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002442 S1518E Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-S1518E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-14 (Fig. 4F) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 T412C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412C amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 3) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 T412C Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412C amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 3) PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001523 E299K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11318103 4896 2012-09-06 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000073 E299K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11318103 4896 2012-09-06 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000767 E299K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11318103 4896 2012-09-06 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001420 591-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-1-590 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 6B, 6C) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0001420 591-845 Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-1-590 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 6B, 6C) PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002061 aa9-17 deleted in short cDNA Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-cdeltaNLS other ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 2D) PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf12 cwf12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwf12 cwf12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwf12 cwf12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000470 deletion 972 h- cwf12 cwf12delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0003029 deletion 972 h- cwf12 cwf12delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0003244 deletion 972 h- cwf12 cwf12delta deletion ECO:0000059 high PMID:38833506 4896 2024-12-29 Among the 41 tested strains, three showed a markedly low YFP/RFP ratio when compared to the wild type strain: Δcwf12, Δsaf5 and Δsaf1. (Figure 2A) PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0006013 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwf12 cwf12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwf12 cwf12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000077 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4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.05c FYPO:0000785 deletion 972 h- cwf12 cwf12delta deletion ECO:0005638 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leu1-32 ade6-M210 SPBC1198.03c SPBC1198.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC1198.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1198.03c SPBC1198.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1198.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1198.03c SPBC1198.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1198.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1198.03c SPBC1198.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif52 tif52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.03 FYPO:0002251 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif52 tif52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- tif52 tif52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC56F8.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif52 tif52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.20c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nop2 nop2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.20c FYPO:0002061 deletion 972 h- nop2 nop2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP8B7.20c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nop2 nop2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000088 K14E Not assayed or wild type 972 h- hus5 ubc9-K14E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 K14E at the E1 binding site, which caused HU sensitivity (Fig. 2C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-ts unknown ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-ts unknown ECO:0005638 PMID:17178839 4896 2016-06-13 (Fig. 1A) PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 PG292AA Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-A9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPCC594.01 FYPO:0005289 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 PMID:39239853 4896 2024-09-08 However, a quantification of the ratio of short-to-long duc1Δ cells at septation demonstrated a significant fraction of duc1Δ cells divided asymmetrically (Fig. 6A,B). Wildtype cells formed a medial CR that slid in 1/13 cells examined, but duc1Δ cells formed a medial CR that slid along the cortex towards one cell end in 12/15 cells observed (Fig. 6C). Thus, Duc1 promotes proper CR anchoring. PomBase SPCC594.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0006625 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 PMID:39239853 4896 2024-09-08 In contrast, lateral PM and septum PI(4,5)P2 levels, indicated by the GFP-2xPHPlc biosensor, were 36% and 48%, respectively, in duc1Δ compared to wild-type (Fig. 6D-F). PomBase SPCC594.01 FYPO:0004780 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:39239853 4896 2024-09-08 We detected no change in lateral cortex Efr3-mNG but a ~30% decrease in lateral cortex Its3-mNG in duc1Δ compared to wild-type cells (Fig 6G,H and Fig. S4C,D) PomBase SPCC594.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC594.01 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC594.01 FYPO:0000339 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 PMID:39239853 4896 2024-09-08 PomBase SPCC594.01 FYPO:0006629 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 PMID:39239853 4896 2024-09-08 There was no significant change in lateral cortex or septum PI4P levels, as determined by the GFP-P4CSidC biosensor (Fig. 6D-F). PomBase SPCC594.01 FYPO:0007441 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:39239853 4896 2024-09-08 The localizations of Scs2-mNG, Scs22-mNG and mCherry-AHDL all appeared unchanged in duc1Δ cells compared to wild-type cells (Figure S4B). PomBase SPCC594.01 FYPO:0007441 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17C9.12) PMID:39239853 4896 2024-09-08 The localizations of Scs2-mNG, Scs22-mNG and mCherry-AHDL all appeared unchanged in duc1Δ cells compared to wild-type cells (Figure S4B). PomBase SPCC594.01 FYPO:0002674 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC794.08) PMID:39239853 4896 2024-09-08 We detected no change in lateral cortex Efr3-mNG but a ~30% decrease in lateral cortex Its3-mNG in duc1Δ compared to wild-type cells (Fig 6G,H and Fig. S4C,D) PomBase SPCC594.01 FYPO:0003414 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:39239853 4896 2024-09-11 There was no change in Its3-mNG septum intensity in duc1Δ cells compared to wild-type, as expected (Fig. S4E). PomBase SPCC594.01 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 duc1 duc1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC594.01 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 duc1 duc1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC594.01 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 duc1 duc1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC594.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph duc1 duc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC594.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC594.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 duc1 duc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB21E7.10 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB21E7.10 SPBPB21E7.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 D48S,D51S Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-D48S,D51S amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002837 D48S,D51S Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-D48S,D51S amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 D48S,D51S Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-D48S,D51S amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- ckb1 ckb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:8264625 4896 2016-03-04 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001253 wild type Overexpression 972 h- ckb1 ckb1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8264625 4896 2016-03-04 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- ckb1 ckb1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8264625 4896 2016-03-04 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0007317 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000162 PMID:31833215 4896 2020-04-20 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0007317 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-20 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0008411 deletion 972 h- h90 psk1 psk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S235) PMID:39705284 4896 2025-04-01 (Fig. 5D) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0008411 deletion 972 h- h90 psk1 psk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S236) PMID:39705284 4896 2025-04-01 (Fig. 5D) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0008411 deletion 972 h- h90 psk1 psk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S235) PMID:39705284 4896 2025-04-03 (Fig. 5D) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0008411 deletion 972 h- h90 psk1 psk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S236) PMID:39705284 4896 2025-04-03 (Fig. 5D) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000674 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000674 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002672 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 5A) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001134 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0000291 PMID:37913773 4896 2024-01-15 Although the downstream S6K kinase Psk1 in the TORC1 pathway has been implicated in RP phosphorylation,39 our finding demonstrated that rRNA abundance was unaffected in the psk1D strain (Figure S3A) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000644 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0004423 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001310 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-08 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0007931 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000411 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- psk1 psk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 psk1 psk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 psk1 psk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 At 36° both mutant strains displayed the classical “cut” phenotype, like that seen in the TPCK-sensitive strain cut1-206 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 Slightly elongated cells with condensed chromosomes (Figure 4D, panel b) peaked at about 4 hr, followed by a peak in cells that had a septum but in which nuclear division had been abnormal (Figure 4D, panels c–g). PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 Strains containing the tsm1-512 mutation failed to grow at 36° on YES medium but could grow, albeit slowly, on minimal medium with supplements (data not shown). This phenotype is also exhibited by two other mitotic mutants of S. pombe: cut2-364 and cut4-533 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003166 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0000964 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0002080 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003429 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003429 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003241 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 tsm1-512 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0005036 100-201 Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1delta100-201 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1718.07c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 5B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000029 A48V Overexpression 972 h- leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 5 PMID:2038306 4896 2016-09-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000444 A48V Overexpression 972 h- leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-20 Data not shown. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001430 A48V Overexpression 972 h- leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 6 PMID:2038306 4896 2016-09-20 Data not shown. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 A48V Overexpression 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2038306 4896 2016-09-28 (Figure 4A) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 A48V Overexpression 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2038306 4896 2016-09-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004255 A48V Overexpression 972 h- leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-20 Figure 2. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004255 A48V Overexpression 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-28 Same phenotype as shown in Figure 2 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005023 A48V Overexpression 972 h- leu1-32 cdc2 cdc2-DL5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-20 (Figure 2) . PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0007045 deletion 972 h- pho2 pho2delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000177 high PMID:31239353 4896 2019-08-09 (Fig. 1) PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0007044 deletion 972 h- pho2 pho2delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000173 PMID:31239353 4896 2019-08-01 (Fig. 1) PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pho2 pho2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pho2 pho2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001103 deletion 972 h- pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000097 deletion 972 h- pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph pho2 pho2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- pho2 pho2delta deletion ECO:0001232 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assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000941 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0006825 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 high assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:11514436 4896 2021-12-18 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000272 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000272 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001394 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38938413 4896 2024-07-10 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001382 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002049 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:10799520 4896 2021-10-17 As expected, most sid3-106 mutant cells (71%) contained four or more nuclei showing that there was insufficient Spg1 function in these cells for septation. PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002024 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002024 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11514436 4896 2021-12-18 (Figure 2B). PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11514436 4896 2021-12-18 (Figure 2A). PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000012 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0003028 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001368 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000833 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002967 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 The CAA20785 GFP fusion protein localized normally in cdc16-116, spg1-106, cdc7-24, and sid2-250 temperature-sensitive mutants...(Figure 3) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002967 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001357 T97I Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002060 T97I Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 spg1-106 sid3-106|sid3-106-ts|spg1-PD20|spg1-T97I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000794 wild type Overexpression 972 h- gld1 gld1+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000075,FYECO:0000126 PMID:20396879 4896 2012-03-16 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- gld1 gld1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000054 PMID:20396879 4896 2012-02-27 PomBase SPAC13F5.03c FYPO:0000796 wild type Overexpression 972 h- gld1 gld1+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000074,FYECO:0000126 PMID:20396879 4896 2012-03-16 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP msn5 msn5+ SPAC328.01c+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002896 wild type Overexpression 972 h- msn5 msn5+ SPAC328.01c+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001865) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002896 wild type Overexpression 972 h- msn5 msn5+ SPAC328.01c+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000126 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PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0004310 1-80 Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2delta80N cdc2-delta80N|cut2-delta80N|cut2-deltaN80|cut2delta80 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:26527280 4896 2020-06-16 chromosomes failed to split, but Plo1 was removed from SPBs with timing similar to that in wild-type cells (Figures 2A and 2C). PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000703 1-80 Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2delta80N cdc2-delta80N|cut2-delta80N|cut2-deltaN80|cut2delta80 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c),assayed_using(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:9635190 4896 2016-04-01 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000705 1-138 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(139-735) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r12-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)7(S5A)7(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S5A(r12-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)7(S5A)7(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S5A(r12-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)7(S5A)7(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4A) PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000608 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-KM52 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:24173154 4896 2014-04-23 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-KM52 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102 PMID:6327053 4896 2013-09-30 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0001783 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-KM52 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000079 PMID:6887245 4896 2014-01-10 PomBase SPBC16A3.15c FYPO:0002303 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda2 nda2-KM52 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006 high 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deletion ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-02-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000427 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000427 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000217 medium PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004814 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004812 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25417108 4896 2015-07-31 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004813 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001934 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001093 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0001799) PMID:21151114 4896 2013-09-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001093 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(SO:0001798) PMID:21151114 4896 2013-09-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0005554 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0006112 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 1G) PomBase SPCC188.13c FYPO:0006111 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 1G) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002566 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:21847092 4896 2013-08-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003744 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c),assayed_region(SO:0001898) PMID:14704433 4896 2024-01-18 Furthermore, deletion of ago1+, dcr1+, or rdp1+ abolished the association of Chp1-Flag and Tas3-TAP with otr1::ura4+, as well as with centromeric repeat sequences (Fig. 4, A and B). PomBase SPCC188.13c FYPO:0005850 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003074 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003074 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000705 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c),assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000705 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Table 1) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000705 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC1739.03) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000705 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09),assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0008011 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0008011 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3D) PomBase SPCC188.13c FYPO:0008011 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000337 PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 4B). We found that, whereas siRNAs could be readily detected in the affinity-purified fraction of RITS from wild-type cells, there were no detectable RITS- associated siRNAs present in rdp1D903A, rdp1Δ, or dcr1Δ cells PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 2A and B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:28231281 4896 2017-04-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000273 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:21847092 4896 2013-08-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000273 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000082 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:12482946 4896 2026-01-26 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000080 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 high PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004201 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004201 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 high PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002577 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c),assayed_using(SO:0000624) PMID:21151114 4896 2013-08-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002577 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c),assayed_using(SO:0001789) PMID:21151114 4896 2013-08-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002834 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 (Figure 2,4) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002834 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003411 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 1) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:12193640 4896 2024-01-19 Two transgenes located centromere distal to the tRNA genes were de-repressed in ago1- , dcr1- , and rdp1- , but a transgene located within the central region remained silent. Similar results were obtained in all three mutant strains, as assayed by growth on medium lacking uracil and by Northern blots (Fig. 1, B) (21). PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 PMID:21847092 4896 2013-08-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(SO:0001899) PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 3E) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:15947136 4896 2013-07-24 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 PMID:35194019 4896 2022-03-09 (Figure 5C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000453 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 high PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 1F) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000288 PMID:38289024 4896 2024-04-05 cells at 37°C restored gene silencing rapidly at normal temperature 30°C after being re-plated on medium containing limited adenine (Figure 2A and B). However, when this re-plating assay was applied to dcr1Δ, one of the RNAi mutants, a considerable proportion of cells still emerged as variegated colonies (designated as dcr1ΔV), which was in sharp contrast to wild type cells (Figure 2B). PomBase SPCC188.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000268,FYECO:0000370 high PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0004604 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 1F) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003101 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_region(PomBase:SPCC1442.04c) PMID:40063661 4896 2025-06-06 (Fig. 2G) PomBase SPCC188.13c FYPO:0007009 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 4) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000877 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC188.13c FYPO:0007643 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 variable severity PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 high PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 1E) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5 and Fig. S5) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27334362 4896 2016-07-26 (Fig. 3C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:28231281 4896 2017-04-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0007213 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 low PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006269 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC188.13c FYPO:0007644 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 variable severity PMID:27738016 4896 2021-02-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003096 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193640 4896 2024-01-19 In contrast, levels of K9 were greatly reduced. PomBase SPCC188.13c FYPO:0003096 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:18948543 4896 2024-01-30 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) revealed that splicing mutants cwf10-1 and prp10-1 (but not prp2-1) exhibited only a modest decrease in levels of H3K9me2 associated with both centromere repeats and cen1:ura4+ (Fig. 3A and fig. S3). PomBase SPCC188.13c FYPO:0003096 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003571 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000453 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003571 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 high PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000890 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 3F) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003103 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:25417108 4896 2015-07-31 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004821 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000835 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000450 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002842 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002842 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006599 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12193640 4896 2024-01-19 As expected, Swi6, which depends on histone modification for chromatin binding, was delocalized from the ura4+ transgenes (Fig. 3C). PomBase SPCC188.13c FYPO:0002391 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003573 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000453 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003573 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 4) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003573 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.28c) PMID:20211136 4896 2015-11-04 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. 2D) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC126.04c) PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002387 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001645 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002134 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:24095277 4896 2014-02-07 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004817 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004817 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:25417108 4896 2015-07-31 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004818 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:25417108 4896 2015-07-31 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:33511417 4896 2026-01-26 (Fig. 5) PomBase SPCC188.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 (Fig. S4) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000429 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000998 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000127,FYECO:0000217 12 PMID:35194019 4896 2022-03-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004808 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 PMID:25543137 4896 2015-07-30 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 high PMID:12193640 4896 2024-01-19 However, three major transcripts that hybridized to the repeats were found to accumulate at high levels in each of the RNAi mutants (Fig. 1C). PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 high PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002836 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004982 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:21725325 4896 2016-02-08 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002980 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC342.05),assayed_using(SO:0001272) PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0008148 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0007639 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004761 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25774602 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004761 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:33378674 4896 2021-08-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002331 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0007337 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193640 4896 2024-01-19 dcr1- , rdp1- , and ago1- cells had increased levels of K4 in the centromeric region in comparison to actin controls (Fig. 3B). PomBase SPCC188.13c FYPO:0000893 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006814 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 high PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1E) PomBase SPCC188.13c FYPO:0007640 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0007468 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000127 assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 2E, 2F) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002354 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000112 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002664 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0005995 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002564 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:21847092 4896 2013-08-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001840 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:28231281 4896 2017-04-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004822 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004819 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25417108 4896 2015-07-31 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004820 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004710 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 50 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004032 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004032 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003010 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001890 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0001890 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:25543137 4896 2015-08-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0000286) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1683.06c) PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0005978 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000337 PMID:28231281 4896 2017-04-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004573 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 low assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:17512405 4896 2024-01-18 we observed a 3-fold increase in tlh1+ RNA levels in dcr1D cells and a 10-fold increase in mtr4-1 cells (Figures 4F and 4H), indicating that both RNAi and TRAMP contribute to the full silencing of this subtelomeric gene. PomBase SPCC188.13c FYPO:0000228 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 16 PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 2A) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000228 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 13 PMID:35194019 4896 2022-03-10 (Figure 5D) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000228 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 23 PMID:28231281 4896 2017-04-07 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1A) PomBase SPCC188.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006660 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006996 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 4 and Supplementary Fig S5) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000674 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004331 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:12193640 4896 2024-01-19 Two transgenes located centromere distal to the tRNA genes were de-repressed in ago1- , dcr1- , and rdp1- , but a transgene located within the central region remained silent. Similar results were obtained in all three mutant strains, as assayed by growth on medium lacking uracil and by Northern blots (Fig. 1, B) (21). PomBase SPCC188.13c FYPO:0002336 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002336 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002336 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002336 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002336 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:15947136 4896 2013-07-24 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003555 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003555 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1H) PomBase SPCC188.13c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0005866 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0005865 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0005865 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000472 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 5) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000472 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000337 PMID:35908934 4896 2025-03-27 (Fig. 5C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000644 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.11c) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 6) PomBase SPCC188.13c FYPO:0002625 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PR:000044738) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4A) PomBase SPCC188.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 4) PomBase SPCC188.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC188.13c FYPO:0003576 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 Surprisingly, however, other foci of Chp1-6xmyc and Tas3- 13xmyc persisted in ago1Δ cells. Similar results were obtained in cells from which Dicer was deleted (Fig. 5A and B, right panels). PomBase SPCC188.13c FYPO:0003576 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 Surprisingly, however, other foci of Chp1-6xmyc and Tas3- 13xmyc persisted in ago1Δ cells. Similar results were obtained in cells from which Dicer was deleted (Fig. 5A and B, right panels). PomBase SPCC188.13c FYPO:0001317 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2022-12-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001317 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-02 In addition, the transcript levels of tgp1þ, nc-tgp1, nc-1343, pho1þ and nc-pho1 were unaffected by loss of RNAi (for example, ago1D or dcr1D) or heterochromatin components (for example, clr4D or swi6D) (Fig. 5b; Supplementary Fig. 7a PomBase SPCC188.13c FYPO:0006368 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000596 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-12 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004826 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 1D) PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15947136 4896 2013-07-02 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006076 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000291 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 2D) PomBase SPCC188.13c FYPO:0006076 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000049 PMID:28541282 4896 2017-06-09 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006076 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000337 PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-02-03 (Fig. S15) PomBase SPCC188.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12482946 4896 2020-03-14 (Fig. 1C) PomBase SPCC188.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29914874 4896 2018-11-26 Supplementary Table S3 PomBase SPCC188.13c FYPO:0004825 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0000231 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dcr1 dcr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001645 S99A,S192A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-3A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:9774107 4896 2016-09-21 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001645 S99A,S192A,S359A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-3A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:10523629 4896 2016-09-14 (Fig. 2a) PomBase SPCC18.05c FYPO:0000705 E105D Not assayed or wild type 972 h- rsa4 rsa4-E105D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC18.05c),assayed_using(PomBase:SPCC737.08) PMID:27667686 4896 2018-11-29 PomBase SPCC18.05c FYPO:0001357 E105D Not assayed or wild type 972 h- rsa4 rsa4-E105D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-11-29 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003630 unknown Not assayed or wild 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wild type 972 h- krp1 krp1-S590* partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.09c) PMID:9418887 4896 2012-02-23 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0003179 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0000049 low assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:30640914 4896 2019-01-31 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0001974 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005580 67 PMID:1829983 4896 2014-06-20 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0000333 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005580 PMID:1829983 4896 2014-06-20 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0000333 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005580 PMID:1829983 4896 2014-06-20 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0005578 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC21H7.07c) PMID:30640914 4896 2019-01-31 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0000760 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 PMID:1829983 4896 2013-03-19 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0005650 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005580 PMID:30640914 4896 2019-02-08 (Figure S2) PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0004993 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 PMID:30640914 4896 2019-02-08 (Figure S1A) PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0002052 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 PMID:1829983 4896 2013-03-19 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0001315 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0001232 PMID:1829983 4896 2013-03-19 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0001420 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 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4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph cig1 cig1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- cig1 cig1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig1 cig1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig1 cig1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000059 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assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:22042869 4896 2024-07-11 (Fig. 6C) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004345 deletion 972 h- mat1-Msmt0 cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC23G7.09) PMID:22042869 4896 2024-07-11 (Fig. 6A) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004345 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 5B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0008249 deletion 972 h- mat1-Msmt0 cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC23G7.09),assayed_region(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:22042869 4896 2024-07-11 (Fig. 6A and B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0002391 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 1C, Fig. 3E) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0002391 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC306.03c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 1E) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005154 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0003340 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000465 40 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 5F) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004009 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0000407) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 1B, Fig. 3D) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004009 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(SO:0000653) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 1B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005545 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 Interestingly, Tf clustering was impaired by pku70Δ and pku80Δ at a level similar to that observed in abp1Δ cells (Figure 2A). PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:9024682 4896 2014-08-31 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp1 cbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:40132111 4896 2025-08-13 (Fig. 3C) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:17112379 4896 2015-06-30 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:17112379 4896 2015-06-30 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp1 cbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001272 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 low PMID:9024682 4896 2014-08-31 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0006079 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000049 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 3C) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0007634 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. S2A) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0006077 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 3A, 3B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0007467 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000273 high PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 5D) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004342 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004342 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001840 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000021,FYECO:0000126 PMID:9024682 4896 2014-08-31 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0007655 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000059 assayed_region(SO:0001637) PMID:40132111 4896 2025-08-12 MNase-qPCR (Fig. 2C) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005153 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000059 low PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004032 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PR:000044738) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4A) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004032 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC1834.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2A, Fig. 3F) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004032 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2A, Fig. 3F) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004032 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2A, Fig. 3F) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004032 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4C) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004032 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4D) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0003105 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 medium assayed_transcript(SO:0002208) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 5D) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0000594 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0001309 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0002336 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0003353 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000059 PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0000963 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17112379 4896 2015-06-30 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005079 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 4B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005080 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 4B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0002389 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC16A11.14),assayed_region(SO:0001898),assayed_region(SO:0001899) PMID:30155942 4896 2025-08-14 (Fig. 4B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004378 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC36.05c) PMID:18354497 4896 2015-12-15 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0004824 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000231 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2B) PomBase SPBC1105.04c FYPO:0005353 deletion 972 h- cbp1 cbp1delta deletion ECO:0000337 PMID:29610759 4896 2018-05-04 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph cbp1 cbp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- 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was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPBC26H8.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cyc3 cyc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- cyc3 cyc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC26H8.12 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph cyc3 cyc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.12 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cyc3 cyc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.12 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cyc3 cyc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.12 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph cyc3 cyc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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2016-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0005466 unknown Not assayed or wild type 972 h- pom1 pom1-as unknown ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:25720772 4896 2016-06-23 PomBase SPCC737.08 FYPO:0001355 E969Q Not assayed or wild type 972 h- mdn1-ts26 mdn1 mdn1-B3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:27667686 4896 2018-11-29 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0004056 R256E,R257L Not assayed or wild type 972 h- sla1 sla1-R256E,R257L sla1-R266E,R267L|sla1FL-RERL amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.10c) PMID:14665462 4896 2013-05-23 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0007599 TetR-stc1delta(32-126) Not assayed or wild type 972 h- stc1 TetR-stc1-deltaZF1+2 TetR-stc1-deltaZF1+2(32-126) fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPAC644.06c FYPO:0002999 mEGFP=cdr2 binding peptide Not assayed or wild type 972 h- cdr2-GBP-mCherry cdr1 mEGFP-cdr1(delta460-482) fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:31644361 4896 2020-02-19 (Figure 5B) We tested the effects of artificially recruiting mEGFP-cdr1(∆460-482) back to nodes using cdr2-GFPbinding peptide (GBP)-mCherry, which contains the GBP. In this system, mEGFP-cdr1(∆460-482) colocalized with cdr2-GBP-mCherry at nodes. PomBase SPAC644.06c FYPO:0006822 mEGFP=cdr2 binding peptide Not assayed or wild type 972 h- cdr2-GBP-mCherry cdr1 mEGFP-cdr1(delta460-482) fusion_or_chimera ECO:0000059 medium PMID:31644361 4896 2020-02-19 Along with enhanced Wee1 hyperphosphorylation, these cells divided at a smaller size than wild-type cells. These results show that Cdr1 localization to nodes is a limiting factor for phosphorylation of Wee1 and cell size at division PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4A,G9A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4A,G9A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4A,G9A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4A,G9A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4A,G9A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4A,G9A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 high PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S402A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S402A,S650A B2d7-S402A-S650A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 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(Fig. 4A) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001355 K40R Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-K40R hhp1-KD|hhp1-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001355 K40R Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-K40R hhp1-KD|hhp1-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0006532 K40R Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-K40R hhp1-KD|hhp1-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:20383139 4896 2018-04-26 (Fig. 5B) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002967 K40R Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-K40R hhp1-KD|hhp1-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002635 K40R Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-K40R hhp1-KD|hhp1-KR(kd) amino_acid_mutation ECO:0000112 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fusion_or_chimera ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 (Figure 1) Strikingly, Sty1 phosphorylation was increased in cells expressing either Sty1-Tpx1 or Sty1-Tpx1C48S (Figure 1D) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002680 Sty1-Tpx1-C48S@sty1 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-tpx1-C48S fusion_or_chimera ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:37572670 4896 2024-01-26 By contrast, cells expressing Sty1-Tpx1C48S contained substantially increased levels of lower mobility and phosphorylated Pyp2 (p-Pyp2), even prior to addition of H2O2. Together these data strongly support the conclusion that the Sty1-Tpx1 and Sty1-Tpx1C48S fusion proteins are constitutively hyperactive compared with wild-type Sty1 (Figures 1F and 1G). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006822 Sty1-Tpx1-C48S@sty1 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-tpx1-C48S fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:37572670 4896 2024-01-26 This revealed that Sty1- Tpx1- and Sty1-Tpx1C48S-expressing cells both divided at a significantly smaller size than wild-type cells (Figure 1F). PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.04c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1250.03) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC211.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002082 V949D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-V949D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005018 1-20 Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-deltaN20 ctp1-N20|ctp1-Ndelta20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 low PMID:30626735 4896 2020-05-04 PomBase SPCC1494.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph tfb6 tfb6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.09c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph tfb6 tfb6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.09c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph tfb6 tfb6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.09c 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4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPCC18.11c FYPO:0001324 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPCC18.11c FYPO:0004689 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPCC18.11c FYPO:0005071 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPCC18.11c FYPO:0005917 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPCC18.11c FYPO:0005311 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPCC18.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 However, the loss of Shg1 and Sdc1 seems to have little or no effect on Lsd1 protein levels. PomBase SPCC18.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- sdc1 sdc1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPCC18.11c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph sdc1 sdc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sdc1 sdc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.11c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph sdc1 sdc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.11c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph sdc1 sdc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.11c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph sdc1 sdc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 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SPAC14C4.08 FYPO:0000705 deletion 972 h- mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.12) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Figure S2C) PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0000903 deletion 972 h- mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 7F; supplementary material Table S1) PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0000964 deletion 972 h- mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0001034 deletion 972 h- mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mug5 mug5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- mug5 mug5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 R194Q Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R194Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 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rad4-1-190 rad4-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000836 unknown 972 h- crm1 crm1-3R unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:8569688 4896 2012-03-16 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000714 unknown 972 h- crm1 crm1-3R unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8569688 4896 2012-03-14 PomBase SPAC6G9.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pcd1 pcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.05 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcd1 pcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC6G9.05 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pcd1 pcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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2) PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0007146 K497A,R498A,K499A,K500A,K516A,N517A,K518A,K519A Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-AlaA,AlaB(NLS) rec10-299 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:33526714 4896 2021-12-08 (Figure 2) PomBase SPNCRNA.817 FYPO:0000725 deletion 972 h- prl59 prl59delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0006274 2-14 Not assayed or wild type 972 h- ape2 ape2-N-terdelta2-14 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-11-16 PomBase SPAC14C4.15c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dpp1 dpp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.15c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dpp1 dpp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.15c FYPO:0002693 deletion 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List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 K324A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K324A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 K324A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K324A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004142 K324A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K324A-TAP amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(SO:0002216) PMID:30212894 4896 2018-10-29 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 K324A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-K324A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPCC330.04c FYPO:0001355 K184KSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-2L amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000381 high PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5D) PomBase SPCC330.04c FYPO:0001571 K184KSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-2L amino_acid_insertion ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5C) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007472 M755A,F758A,L774A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A,L774A mrc1-3A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. 5J) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007376 M755A,F758A,L774A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A,L774A mrc1-3A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4C, Fig. S4G) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007158 M755A,F758A,L774A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A,L774A mrc1-3A amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4B) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007159 M755A,F758A,L774A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A,L774A mrc1-3A amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4B) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 M755A,F758A,L774A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A,L774A mrc1-3A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4C) PomBase SPAC4F8.04 FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpf1 rpf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F8.04 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpf1 rpf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F8.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpf1 rpf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F8.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpf1 rpf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4F8.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpf1 rpf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.17 FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 met7 met7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- met7 met7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1709.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 met7 met7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000046 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Fig. 4h) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0003125 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0000059 PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Fig. 4) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0007029 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC17A5.15c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 2d) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0007029 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC17A3.04c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 2d) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001645 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPAC17A5.15c),assayed_using(PomBase:SPBC17A3.04c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 1d) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001645 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0006030 medium assayed_using(PomBase:SPBC17D11.05),assayed_using(PomBase:SPBC685.06) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 3e) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000833 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17A5.15c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 2d) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000833 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC17A3.04c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 2d) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000776 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Fig. 6) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000703 deletion 972 h- asc1 asc1delta deletion ECO:0006030 medium assayed_using(PomBase:SPAC17C9.03),assayed_using(PomBase:SPBC685.06) PMID:31285271 4896 2019-07-31 (Figure 3e) PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 asc1 asc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30C2.04 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph asc1 asc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 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Overexpression 972 h- hsp9 hsp9+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22182414 4896 2015-05-07 PomBase SPAP8A3.04c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- hsp9 hsp9+ wild_type ECO:0001232 PMID:22182414 4896 2015-05-07 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0004056 229-298 Not assayed or wild type 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.10c) PMID:14665462 4896 2013-05-23 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0001886 229-298 Not assayed or wild type 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:14745200 4896 2013-02-01 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0000838 229-298 Not assayed or wild type 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.05) PMID:14745200 4896 2013-01-17 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0003730 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 high PMID:34634819 4896 2025-03-31 The deletion of the cbp8 gene in both ∑i and Δi backgrounds yielded respiratory deficient but antimycin resistant cells showing that ATP synthase was not affected (Figure 3D and not shown). PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0001621 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:32896087 4896 2020-09-29 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0007623 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000059 high PMID:34634819 4896 2025-03-31 The deletion of the cbp8 gene in both ∑i and Δi backgrounds yielded respiratory deficient but antimycin resistant cells showing that ATP synthase was not affected (Figure 3D and not shown). PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0003423 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 In brief, Δcbp8 looked similar to Δcbp7 since complex III was barely detectable in BN-PAGE, cytochrome b and c1 were not spectrally detected and a low level of cytb RNA was observed PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0002797 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 However, as with Δcbp7 cells, the newly synthesized Cytb protein showed an aberrant degradation pattern compared to the wild-type since it remained stable for up to 20 h in a chase experiment (Supplementary Figure S5). PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0008128 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000035 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 medium PMID:32896087 4896 2020-09-29 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0001437 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 The deletion of the cbp8 gene in both ∑i and Δi backgrounds yielded respiratory deficient but antimycin resistant cells showing that ATP synthase was not affected (Figure 3D and not shown). PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cbp8 cbp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- cbp8 cbp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp8 cbp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 D94E Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-D94E amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0006330 T39A,T40A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-T39A,T40A amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:39110593 4896 2024-11-05 (Figure S3A) (left panel), ER-PM tethering is reduced in Scs2-2TA mutant at native locus PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0008328 T39A,T40A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-T39A,T40A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:39110593 4896 2024-11-01 (Figure 3D) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0008077 T39A,T40A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-T39A,T40A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:39110593 4896 2024-11-01 (Figure 3D) PomBase SPBC577.08c FYPO:0001645 110-290 Not assayed or wild type 972 h- txl1 txl1-PITH-domain partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC577.08c),assayed_using(PomBase:SPBP35G2.02) PMID:21091378 4896 2013-08-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 fmo1 fmo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- fmo1 fmo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fmo1 fmo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fmo1 fmo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8E4.01c FYPO:0001045 TATATATA(-184)CGCGCGCG Not assayed or wild type 972 h- pho84 pho84-TATA-box-mutant nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPAC22E12.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22E12.02 SPAC22E12.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.02 FYPO:0000741 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22E12.02 SPAC22E12.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.02 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22E12.02 SPAC22E12.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- SPAC22E12.02 SPAC22E12.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22E12.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC22E12.02 SPAC22E12.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0003730 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000148 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 4B) A deletion mutants showed a clear growth defect on galactose medium PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0001938 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001807 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 5E) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0003915 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Cox2 was detectable in Δmss51 purified mitochondria, although its level was greatly reduced (Figure 5C), consistent with the reduced 35S labeling (Figure 5A) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0003915 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Cox1 was clearly less stable in the Δmss51 mutant than in the wild-type, while Cox2 was poorly labeled in the mutant even before starting the chase, as noted before (Figure 5C). PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mss51 mss51delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0004960 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Northern blots revealed no defect in the accumulation of mature messengers (Figure 5B) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0004960 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Northern blots revealed no defect in the accumulation of mature messengers (Figure 5B) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0004529 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Cytb, Cox1, 2 and 3 were clearly visible, although Cox2 was less strongly labeled in both mutants, especially Δmss51 (Figure 5A) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0004529 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Cytb, Cox1, 2 and 3 were clearly visible, although Cox2 was less strongly labeled in both mutants, especially Δmss51 (Figure 5A) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0004529 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:22349564 4896 2021-01-27 Cytb, Cox1, 2 and 3 were clearly visible, although Cox2 was less strongly labeled in both mutants, especially Δmss51 (Figure 5A) PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- mss51 mss51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mss51 mss51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mss51 mss51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002666 E24A Not assayed or wild type 972 h- naa10 naa10-E24A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002670 E24A Not assayed or wild type 972 h- naa10 naa10-E24A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cid14 cid14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000361 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0001232 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0007335 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 We found that deletion of cid14+ resulted in a complete loss of ura4+ silencing at all the tested loci as assayed by growth on 5-FOA-containing medium (Figures 2A-2C). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0007334 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 We found that deletion of cid14+ resulted in a complete loss of ura4+ silencing at all the tested loci as assayed by growth on 5-FOA-containing medium (Figures 2A-2C). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0007336 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 We found that deletion of cid14+ resulted in a complete loss of ura4+ silencing at all the tested loci as assayed by growth on 5-FOA-containing medium (Figures 2A-2C). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001270 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0001232 35 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000080 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004201 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000335 high PMID:17512405 4896 2024-01-18 While we were not able to detect any centromeric siRNAs in cid12D cells, centromeric siRNAs were about 22-fold reduced in cid14D compared to wild-type cells (Figure 6B). and However, centromeric siRNAs from cid14D were barely detectable on total RNA northern blots (Figure 6A). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004201 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000059 low PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002834 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 (Figure 2,4) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002827 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004604 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20403971 4896 2013-07-18 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000878 deletion 972 h- mat2-3delta cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- mat2-3delta cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000888 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003231 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 low PMID:17512405 4896 2024-01-18 In addition, while H3K9 methylation was lost in clr4D cells, only a slight reduction in H3K9 methylation was observed in cid14D cells (Figures 3A and 3B) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004681 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000337 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001117 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004205 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006073 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0005318 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003557 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19693008 4896 2024-01-15 When Dpht1 was combined with mutant alleles of clr4 or rik1—components of the Clr4-containing methyltransferase complex (ClrC)7—the resultant double mutants showed severe growth defects and a large, synergistic increase in antisense RNAs at .20% of genes (Fig. 2a and Supplementary Figs 5 and 7a, b). Consistent with ClrC directly participating in antisense suppression, Rik1 was found at the convergent loci (Supplementary Fig. 7c). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000220 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 low PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0008148 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006074 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:28541282 4896 2017-05-31 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0005995 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006075 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002933 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001840 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0001232 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001908 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.01) PMID:26670050 4896 2016-09-16 (Fig. S4B) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006360 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Supp. Fig. 1b) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001923) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001925) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000337 low assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S2E) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004207 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:28541282 4896 2017-06-08 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006069 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:28541282 4896 2017-05-30 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004573 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:17512405 4896 2024-01-18 we observed 7-fold and a 25-fold increases in tlh1+ transcript levels in rrp6D and dis3-54 cells, respectively, and 33- and 100- fold increases in cid14D and clr4D cells, respectively (Figures 4G and S3) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002360 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:22683269 4896 2013-07-19 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0008152 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Surprisingly, deletion of the S. pombe Trf4/5 orthologue, cid14, showed only a minor effect on CUTs at a genome-wide level (Fig. 2a,b) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006811 deletion 972 h- mat2-3delta cid14 cid14delta deletion ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002358 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 PMID:22683269 4896 2013-07-19 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002359 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 PMID:22683269 4896 2013-07-19 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003747 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 PMID:20512112 4896 2015-05-26 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0007281 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0007281 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0007281 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1556.06) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002390 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0001232 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004682 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000337 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003620 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 Analysis of RNA from cid14D cells showed normal levels of rpl30-2 pre-mRNA and mRNA (Figure 2A, lane 3, and Figures 2B and 2C) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002389 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Surprisingly, in cid14D cells, neither Chp1 nor Swi6 binding was significantly reduced at several heterochromatic loci, including mat3M::ura4+, imr1R::ura4+, the subtelomeric tlh1+ gene, and cen-dg and cen-dh repeats, as assayed by chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP) (Figures 3A and 3B). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002389 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Surprisingly, in cid14D cells, neither Chp1 nor Swi6 binding was significantly reduced at several heterochromatic loci, including mat3M::ura4+, imr1R::ura4+, the subtelomeric tlh1+ gene, and cen-dg and cen-dh repeats, as assayed by chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP) (Figures 3A and 3B). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0002389 deletion 972 h- mat2-3delta cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Surprisingly, in cid14D cells, neither Chp1 nor Swi6 binding was significantly reduced at several heterochromatic loci, including mat3M::ura4+, imr1R::ura4+, the subtelomeric tlh1+ gene, and cen-dg and cen-dh repeats, as assayed by chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP) (Figures 3A and 3B). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Surprisingly, in cid14D cells, neither Chp1 nor Swi6 binding was significantly reduced at several heterochromatic loci, including mat3M::ura4+, imr1R::ura4+, the subtelomeric tlh1+ gene, and cen-dg and cen-dh repeats, as assayed by chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP) (Figures 3A and 3B). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004378 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Furthermore, consistent with a CTGS model for silencing of mat3M::ura4+, none of the tested mutants affected RNApII occupancy at this locus (Figure 3C). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003576 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Surprisingly, in cid14D cells, neither Chp1 nor Swi6 binding was significantly reduced at several heterochromatic loci, including mat3M::ura4+, imr1R::ura4+, the subtelomeric tlh1+ gene, and cen-dg and cen-dh repeats, as assayed by chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP) (Figures 3A and 3B). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0003576 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:17512405 4896 2024-01-18 Surprisingly, in cid14D cells, neither Chp1 nor Swi6 binding was significantly reduced at several heterochromatic loci, including mat3M::ura4+, imr1R::ura4+, the subtelomeric tlh1+ gene, and cen-dg and cen-dh repeats, as assayed by chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP) (Figures 3A and 3B). PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001317 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001924) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0001317 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001926) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006986 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 2) PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006279 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006279 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC1442.14c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0006279 deletion 972 h- cid14 cid14delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC12G12.13c FYPO:0004679 deletion 972 h- cid14 cid14delta 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2023-06-28 PomBase SPCC1259.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph iec3 iec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.04 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph iec3 iec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.04 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph iec3 iec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.04 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph iec3 iec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.04 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph iec3 iec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.04 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph iec3 iec3delta deletion ECO:0005638 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1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007074 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000069 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 E76Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E75Q amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000082 E129K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11318103 4896 2012-09-06 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001523 E129K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11318103 4896 2012-09-06 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000073 E129K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11318103 4896 2012-09-06 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000767 E129K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-RC1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 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hypotonic protoplast expan- sion (Additional file 1: Fig. S1E). 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FYPO:0003165 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 52.5 PMID:33506191 4896 2021-02-10 (Fig. 2) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0006886 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.10) PMID:30463883 4896 2019-05-19 (Figure 2A,B) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000252 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000363 ~10 PMID:33506191 4896 2021-02-10 (Fig. 7) These results indicate that first, the main reason for lethality of cut7 is derived from the cut phenotype; second, some cells could escape from cut by displacing the nucleus from the middle of the cell axis; and finally, these cut7 survivors could resume cell division as diploid progenies at the permissive temperature. PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000252 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000363 ~25 PMID:33506191 4896 2021-02-10 (Fig. 7) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0001489 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:30463883 4896 2026-01-30 (Figure 4A) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0006339 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 60-70 PMID:33506191 4896 2021-02-03 (Fig. 1) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0006339 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 47.5 PMID:33506191 4896 2021-02-10 (Fig. 2) PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0006884 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:30463883 4896 2019-05-18 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002060 P1021S Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000079 PMID:30463883 4896 2019-05-18 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0004835 C501A Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C501A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001116 C501A Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C501A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:12100563 4896 2013-05-08 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001164 C501A Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C501A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001788 C501A Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C501A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12100563 4896 2013-05-08 PomBase SPAC1783.07c 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prototroph SPBC15D4.13c SPBC15D4.13cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC15D4.13c SPBC15D4.13cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC15D4.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC15D4.13c SPBC15D4.13cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC15D4.13c SPBC15D4.13cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC794.08 FYPO:0003278 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 "localization The PI(4,5)P2 sensor GFP-2×PH(PLCδ) (Stefan et al., 2002) was reduced at the cell cortex and the division site in efr3Δ compared with WT (Fig. 1 D), indicating that PIP PM abundance is reduced in efr3Δ" PomBase SPCC794.08 FYPO:0002126 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC637.04) PMID:28784611 4896 2017-09-11 (Figure 1C) PomBase SPCC794.08 FYPO:0002126 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC577.06c) PMID:28784611 4896 2017-09-11 (Figure 1C) PomBase SPCC794.08 FYPO:0005289 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 40 PMID:28784611 4896 2017-09-11 (Fig. 2A-C) PomBase SPCC794.08 FYPO:0005289 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2020-01-16 PomBase SPCC794.08 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0006625 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 5C) PomBase SPCC794.08 FYPO:0006628 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-10 (Fig. 5A) PomBase SPCC794.08 FYPO:0001324 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 3H) PomBase SPCC794.08 FYPO:0000929 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure 3E) PomBase SPCC794.08 FYPO:0005798 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2024-12-17 (Fig. 3G) PomBase SPCC794.08 FYPO:0008198 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC594.01) PMID:39239853 4896 2024-09-08 We found that Duc1-mNG PM localization along the lateral cell cortex was diminished by ~25% in efr3Δ cells compared to wild-type (Fig. 5A,B). PomBase SPCC794.08 FYPO:0002719 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure 3C) PomBase SPCC794.08 FYPO:0002719 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure 3D) PomBase SPCC794.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:29975157 4896 2018-07-17 PomBase SPCC794.08 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002127 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC637.13c) PMID:37792890 4896 2023-10-06 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000339 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 23 PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000339 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 medium PMID:29975157 4896 2018-07-16 (Fig. 1B) PomBase SPCC794.08 FYPO:0000339 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure 1A) PomBase SPCC794.08 FYPO:0005020 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure S2A, S2B) PomBase SPCC794.08 FYPO:0006216 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-09-11 PomBase SPCC794.08 FYPO:0005905 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure S2A, S2B) PomBase SPCC794.08 FYPO:0003627 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1289.04c) PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure S2E) PomBase SPCC794.08 FYPO:0002442 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure 3B) PomBase SPCC794.08 FYPO:0002442 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:28784611 4896 2017-09-11 (Fig. 3A) (in table, data not shown) PomBase SPCC794.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph efr3 efr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC794.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efr3 efr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16H5.15 FYPO:0007719 1-58 Not assayed or wild type 972 h- gem8 gem8deltaN58 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:33754639 4896 2021-04-13 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 53-102 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-deltaZZ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 53-102 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-deltaZZ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 53-102 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-deltaZZ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1921.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 53-102 Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-deltaZZ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002926 R139A,R141A,R143A,R145A,R147A,R149A,R151A,R153A,R157A,R159A,R161A Not assayed or wild type 972 h- pab2 pab2-R-to-A amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21981922 4896 2023-11-21 Similarly, a Pab2 variant in which the 11 arginine residues within the arginine/glycine-rich domain were substituted to alanine (R-to-A) showed no poly(A) binding (Figure S3) PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 R139A,R141A,R143A,R145A,R147A,R149A,R151A,R153A,R157A,R159A,R161A Not assayed or wild type 972 h- pab2 pab2-R-to-A amino_acid_mutation ECO:0000291 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 Importantly, Pab2 variants F75R and R-to-A did not rescue the increased levels of rpl30-2 transcripts observed in the pab2D strain (Figure 3E, lanes 2-4), although the two Pab2 variants defective in poly(A) binding were expressed at levels similar to wild-type Pab2 (Figure 3F). PomBase SPCC830.09c FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pop5 pop5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC830.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- pop5 pop5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC830.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pop5 pop5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 I341E,I342E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-I341E,I342E II341EE amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 I341E,I342E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-I341E,I342E II341EE amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 I341E,I342E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-I341E,I342E II341EE amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003107 I341E,I342E Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-I341E,I342E II341EE amino_acid_mutation ECO:0000337 high high PMID:29422501 4896 2018-03-19 (Fig. 2) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001645 S476A,S502A,S503A,S553A,S556A Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1-5A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:26525038 4896 2015-12-08 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003532 S476A,S502A,S503A,S553A,S556A Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1-5A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26525038 4896 2015-12-08 PomBase SPCC1393.13 FYPO:0001045 wild type Overexpression 972 h- duf89 duf89+ wild_type ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36882296 4896 2023-04-18 (Fig. 13) PomBase SPBC14C8.14c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pol5 pol5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.14c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pol5 pol5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- pol5 pol5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC14C8.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pol5 pol5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- pol5 pol5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:16816948 4896 2021-01-22 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002687 ccq1(131-735)-13xMyc-est1 Not assayed or wild type 972 h- ccq1+ est1 ccq1(131-735)-13xMyc-est1 fusion_or_chimera ECO:0000337 PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 R127A,R128A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R127A,R128A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 R127A,R128A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R127A,R128A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 R127A,R128A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R127A,R128A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPBC2G2.04c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmf1 mmf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- mmf1 mmf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2G2.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mmf1 mmf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- mmf1 mmf1delta deletion ECO:0005638 PMID:12185840 4896 2016-10-31 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0003659 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0004126 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0002834 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0003352 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0002366 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000112 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0000470 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 loss of most members of the COMPASS complex, including Set1, Spp1, Swd1, Swd3, Swd2, and Ash2 leads to a significantly decreased amount of Lsd1 protein (Fig 3A) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 A similar pattern was observed in the Lsd2 samples, although the Lsd2 protein levels also decreased with shg1Δ (Fig 3B). PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 swd2 swd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0004689 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000231 low PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0005917 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0000963 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0005638 PMID:12589755 4896 2014-12-23 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0008252 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000231 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0001317 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd2 swd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0007358 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- swd2 swd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd2 swd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swd2 swd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC737.08 FYPO:0006781 E1187K Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-E1187K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-12-03 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0000245 G310D Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-E4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0000245 G310D Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-E4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0000245 G310D Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-E4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001164 G310D Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-E4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPBC18H10.02 FYPO:0001420 G310D Not assayed or wild type 972 h- lcf1 lcf1-E4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0001896 wild type Knockdown 972 h- dcp2 dcp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23319050 4896 2013-03-07 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0001895 wild type Knockdown 972 h- dcp2 dcp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23319050 4896 2013-03-07 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A172T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A172U nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A172T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A172U nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dcd1 dcd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0001407 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0002571 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0000325 PMID:22927644 4896 2013-08-29 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0002572 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0000325 PMID:22927644 4896 2013-08-29 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dcd1 dcd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0002570 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0000325 PMID:22927644 4896 2013-08-29 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0002569 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0000325 PMID:22927644 4896 2013-08-29 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 dcd1 dcd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0001974 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005580 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0000972 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0001232 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0002573 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0001232 PMID:22927644 4896 2013-08-29 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0001038 deletion 972 h- dcd1 dcd1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0001221 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 dcd1 dcd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- 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SPBC2G2.13c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.13c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph dcd1 dcd1delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- mei3 mei3delta pmei3.15'Δ1 deletion ECO:0001232 PMID:3034608 4896 2013-02-25 PomBase SPBC119.04 FYPO:0006014 deletion 972 h- P cell genome mei3 mei3delta pmei3.15'Δ1 deletion ECO:0001232 PMID:30089908 4896 2018-09-04 (Fig. 2c) PomBase SPBC119.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mei3 mei3delta pmei3.15'Δ1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mei3 mei3delta pmei3.15'Δ1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.04 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mei3 mei3delta pmei3.15'Δ1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.04 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mei3 mei3delta pmei3.15'Δ1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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prototroph der1 der1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- der1 der1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC365.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 der1 der1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 der1 der1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4.05 FYPO:0003412 mlo2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 mlo2 mlo2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC458.06 FYPO:0004670 deletion 972 h- atg1803 atg1803delta deletion ECO:0000112 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Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPAC458.06 FYPO:0002616 deletion 972 h- atg1803 atg1803delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000230 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:23950735 4896 2013-10-01 PomBase SPAC458.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC458.06 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC458.06 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 atg1803 atg1803delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC458.06 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC458.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph atg1803 atg1803delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC458.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- atg1803 atg1803delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC458.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg1803 atg1803delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC458.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg1803 atg1803delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0006330 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs22 scs22-3KA amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:39110593 4896 2024-11-05 Notably, mutations of three previously reported conserved lysine residues (K36/38/43A,20,21 hereafter referred to as 3KA) in the VAP consensus sequence (VCS) within the MSP domain of either Scs2 or Scs22 abolished their ER-PM tethering capacity (asterisked by large PM regions devoid of the cER in Figure 1C) PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0008328 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs22 scs22-3KA amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:39110593 4896 2024-11-01 Scs2N bound specifically to PI and PS, and Scs2N2TA showed weaker binding to both, whereas Scs2N3KA exhibited significantly lower affinities for both (Figures 3C, S3D, and S3E). (liposome binding assay) PomBase SPAC17C9.12 FYPO:0008077 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs22 scs22-3KA amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC17C9.12) PMID:39110593 4896 2024-11-01 Scs2N bound specifically to PI and PS, and Scs2N2TA showed weaker binding to both, whereas Scs2N3KA exhibited significantly lower affinities for both (Figures 3C, S3D, and S3E). (Liposome binding assay) PomBase SPAC2C4.07c FYPO:0005101 D217A Not assayed or wild type 972 h- dis32-D461N dis32 dis32-D217A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.07c) PMID:26057668 4896 2016-04-04 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001179 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3- unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:10087262 4896 2020-03-18 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001911 L68P,G226D Knockdown 972 h- ufd1 ufd1-7 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPBC947.10) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001422 L68P,G226D Knockdown 972 h- ufd1 ufd1-7 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000134,FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001422 L68P,G226D Knockdown 972 h- ufd1 ufd1-7 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPBC16A3.09c 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assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1delta11-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-17 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000962 11-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1delta11-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000957 11-48 Not assayed or wild type 972 h- pnk1 pnk1delta11-48 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005743 S235A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S235A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005748 S235A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S235A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC965.05c FYPO:0004280 G288M Not assayed or wild type 972 h- thp1 thp1-G288M amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18789404 4896 2015-01-12 PomBase SPCC965.05c FYPO:0004284 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showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. 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PomBase SPAP27G11.04c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- tad3 tad3-hmt3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPAC16.04 FYPO:0003412 dus3::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 dus3 dus3::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pcs2 pcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0003505 deletion 972 h- pcs2 pcs2delta deletion ECO:0005801 PMID:10369673 4896 2014-07-02 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0002829 deletion 972 h- pcs2 pcs2delta deletion ECO:0000335 PMID:10368185 4896 2014-07-02 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pcs2 pcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 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implicated in vesi- cle trafficking, were also not required for hypotonic PM expansion (Additional file 1: Fig. S2E). PomBase SPCC1259.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph gyp2 gyp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gyp2 gyp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gyp2 gyp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.11c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph gyp2 gyp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gyp2 gyp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gyp2 gyp2delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC887.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC887.17 SPBC887.17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC887.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC887.17 SPBC887.17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- SPBC887.17 SPBC887.17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC887.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC887.17 SPBC887.17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000421 K263R Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-K263R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 4896 2014-08-01 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001645 K263R Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-K263R amino_acid_mutation ECO:0000112 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(Fig. S1) PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rdh54 rdh54delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rdh54 rdh54delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0004994 deletion 972 h- rdh54 rdh54delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2017-12-11 PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rdh54 rdh54delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0006372 deletion 972 h- rdh54 rdh54delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0004610 deletion 972 h- rdh54 rdh54delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-07 PomBase SPAC22F3.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rdh54 rdh54delta 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(Figure 2) PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0007146 497-500 Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10deltaA(NLS) rec10-289 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:33526714 4896 2021-12-08 (Figure 2) PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0003615 497-500 Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10deltaA(NLS) rec10-289 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:33526714 4896 2021-12-08 PomBase SPAC18G6.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr shm2 shm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC18G6.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr shm2 shm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC18G6.04c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph shm2 shm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph shm2 shm2delta deletion 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SPBC365.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grp2 grp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 grp2 grp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0006825 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:9420333 4896 2021-04-12 (Fig. 5A) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38938413 4896 2024-07-10 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4B) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002822 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 The spindle pole body signal was greatly reduced in intensity in cdc7-24, spg1-B8, and sid4-SA1 mutants at 36°C. PomBase SPAC1565.06c FYPO:0004357 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1G) No significant hyperphosphorylation of cdc11p occurred at 36+C. PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001368 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11870208 4896 2022-09-18 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001368 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000227 PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0003075 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC21.06c) PMID:9420333 4896 2021-04-07 (Fig. 2A) loss of spg1 function does not affect cdc7 kinase activity PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000086 F127S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B8 spg1-F127S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006657 C311A,C318A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C311A,C318A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000263,FYECO:0000337 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000082 C311A,C318A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C311A,C318A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000080 C311A,C318A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C311A,C318A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001407 C311A,C318A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-C311A,C318A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-17 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0001991 suc22::ura4 Null 972 h- suc22 suc22::ura4+ disruption ECO:0001232 medium PMID:8479429 4896 2014-08-31 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0002151 suc22::ura4 Null 972 h- suc22 suc22::ura4+ disruption ECO:0001232 medium PMID:8479429 4896 2014-08-31 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0002061 suc22::ura4 Null 972 h- suc22 suc22::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:8479429 4896 2014-08-31 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph set8 set8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph set8 set8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph set8 set8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph set8 set8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph set8 set8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- set8 set8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set8 set8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3C7.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set8 set8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 S49SKGYP,49-57 Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K23deltaK14 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC29A4.08c FYPO:0000705 59-488 Not assayed or wild type 972 h- prp19 prp19(1-58) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC29A4.08c),assayed_protein(PomBase:SPAC29A4.08c) PMID:15601865 4896 2023-07-03 As expected from the two-hybrid results, neither the U-box (His6-Prp19p 1-58) nor the C terminus containing the WD40 repeats (His6-Prp19p 165-503) was able to tetramerize (data not shown). PomBase SPCC31H12.07 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec2301 sec2301delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- sec2301 sec2301delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC31H12.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec2301 sec2301delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 L483R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L483R amino_acid_mutation ECO:0000059 medium assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 4F) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 L483R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L483R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 L483R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L483R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 L483R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L483R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001696 C55V,L117G Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-as3 plo1.as3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 1) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002678 L364S Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L364S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000703 L364S Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L364S amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000081 L364S Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L364S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000081 L364S Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L364S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 nap2 nap2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0007478 deletion 972 h- nap2 nap2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:18474252 4896 2014-07-14 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nap2 nap2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nap2 nap2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- nap2 nap2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nap2 nap2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- nap2 nap2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18474252 4896 2014-07-14 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nap2 nap2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2D10.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- nap2 nap2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:18474252 4896 2014-07-14 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 Y220A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-Y220A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0007317 deletion 972 h- rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 Polysome profiling of three of these mutants provides additional evidence for a defect in translation in the mutants (Fig 7C). PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0006037 deletion 972 h- rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 Moreover, both rplΔ mutant profiles, but not the WT, exhibit substantial populations of halfmers, monosomes and polysomes with an additional 40S subunit PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0001234 deletion 972 h- rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 Consistent with a defect in translation due to loss of ribosomal protein paralogs, we find that each of four rplΔ mutants and three rpsΔ mutants has a substantially reduced growth rate (increased generation time) relative to that of the WT strain in YES media at 30 ̊C (Fig 7A and 7B and S1 Table). PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC5E4.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl2802 rpl2802delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0005579 L95G Knockdown 972 h- nda3-K311 pat1 pat1-as1(L95G) amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:34851403 4896 2023-08-11 PomBase SPBC19C2.05 FYPO:0005648 L95G Knockdown 972 h- nda3-K311 pat1 pat1-as1(L95G) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34851403 4896 2023-06-10 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 1-232 Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2(233-778) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 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PomBase SPAC29B12.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29B12.13 SPAC29B12.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29B12.13 SPAC29B12.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29B12.13 SPAC29B12.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29B12.13 SPAC29B12.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC29B12.13 SPAC29B12.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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SPBC3D6.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 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4896 2015-03-23 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0002067 deletion 972 h- lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 low PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 6D) PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0001234 deletion 972 h- lsm1 lsm1delta deletion ECO:0005638 PMID:28031482 4896 2017-04-06 (Fig. 6D) PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsm1 lsm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsm1 lsm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- lsm1 lsm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lsm1 lsm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0008126 ppc89::pcp89-XTEN16-3×sAID:kanMX6 Knockdown 972 h- ppc89 ppc89-AID fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:37783794 4896 2023-10-05 Extended Data Fig. 5E,F PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0004429 ppc89::pcp89-XTEN16-3×sAID:kanMX6 Knockdown 972 h- ppc89 ppc89-AID fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000437 PMID:37783794 4896 2023-10-05 Extended Data Fig. 5H PomBase SPBC800.05c FYPO:0006102 unknown Not assayed or wild type 972 h- atb2 ban5-996 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 88 PMID:8876193 4896 2018-10-17 (Fig. 2) PomBase SPBC800.05c FYPO:0000732 unknown Not assayed or wild type 972 h- atb2 ban5-996 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 1 PMID:8876193 4896 2018-10-17 (Fig. 2) 1% of cells still have a short mitotic spindle after 5h at restrictive temperature PomBase SPAC31G5.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- hem4 hem4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31G5.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem4 hem4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.08 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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SPBC19G7.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1701) PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1702) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1708) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.5748) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1703) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1706) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1704) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005995 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1705) PMID:28031482 4896 2017-05-10 (Fig. 6C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0000239 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005993 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 PMID:28031482 4896 2017-04-12 (Figure 2D) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0005994 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.02c) PMID:28031482 4896 2017-04-12 (Figure 2D) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0001897 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000210 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Figure 6E) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0001895 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 2B) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0000784 deletion 972 h- pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.08c) PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 5C) PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph pdc2 pdc2delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC644.06c FYPO:0002289 K41A Not assayed or wild type 972 h- cdr1 cdr1-K41A nim1-K41A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-10-31 PomBase SPAC644.06c FYPO:0006723 K41A Not assayed or wild type 972 h- cdr1 cdr1-K41A nim1-K41A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 high assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-11-02 PomBase SPAC644.06c FYPO:0002679 K41A Not assayed or wild type 972 h- cdr1 cdr1-K41A nim1-K41A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:31644361 4896 2020-02-19 (Figure 1D) Phosphorylation of Wee1 in fission yeast cells was reduced in the catalytically inactive mutant cdr1(K41A) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001357 I72L,K74R Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-I72L,K74R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPCC550.02c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ 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wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(T387) PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPCC576.15c FYPO:0000446 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0000082 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0000082 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0000708 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001382 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figures 4A, 4B) we found that the protein level of Cdr2 in ksg1-208 cells was significantly lower than that in wild-type cells PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 5A) Western blot analysis showed that the level of Cdc25 protein was dramatically lower in ksg1-208 cells than that in wild-type cells, indicating that Ksg1 played a crucial role in the accumulation of Cdc25 protein PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001128 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 2B) ...which was recovered by the overexpression of ppk21+ PomBase SPCC576.15c FYPO:0000584 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001355 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001355 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 1A) PomBase SPCC576.15c FYPO:0002527 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 4c) In contrast, a fraction of ksg1-208 cells showed septum or division site localized Cdr2-mEGFP in the dividing cells at 27◦C, indicating the cortex dissociation of Cdr2 was hindered. PomBase SPCC576.15c FYPO:0000590 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001357 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001357 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:10071224 4896 2012-06-13 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001882 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000126 PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPCC576.15c FYPO:0000647 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPCC576.15c FYPO:0003481 G159E Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-208 ksg1-358 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 2A) significantly longer than that of wild-type cells at 27◦C PomBase SPBC83.03c FYPO:0000705 283-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3(1-282) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC736.11) PMID:17531816 4896 2023-03-05 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0002253 deletion 972 h- ymr1 ymr1delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 1B) PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ymr1 ymr1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0002546 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ymr1 ymr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- ymr1 ymr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ymr1 ymr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ymr1 ymr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0003412 uaf2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 uaf2 uaf2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC589.12 FYPO:0002196 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30072439 4896 2019-06-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000417 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:30072439 4896 2019-06-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000082 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high PMID:30072439 4896 2019-06-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000082 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000025 low PMID:30072439 4896 2019-06-26 PomBase SPAC589.12 FYPO:0003743 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006967 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006971 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006970 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006700 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006969 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006973 G753R Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-G753R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 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SPBC4.01 FYPO:0001645 C74S,C85S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C74SC85S amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07),assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-20 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0002485 L90P Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-237 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13),assayed_using(PomBase:SPCC777.09c) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0003179 L90P Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-237 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0004058 L90P Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-237 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0000963 T32A,S39A,S62A,S72A,S444A Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26-T32A,S39A,S62A,S72A,S444A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC9E9.08 FYPO:0000957 T32A,S39A,S62A,S72A,S444A Not assayed or wild type 972 h- rad26 rad26-T32A,S39A,S62A,S72A,S444A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 G159T,C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159T,C164T srp7-T-159,T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 medium PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G159T,C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159T,C164T srp7-T-159,T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G159T,C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159T,C164T srp7-T-159,T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G159T,C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159T,C164T srp7-T-159,T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0001645 1-492 Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1(C-term)493-972 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.02),assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.05) PMID:34209806 4896 2021-07-30 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.16 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4H3.16 SPAC4H3.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPATRNASER.03 FYPO:0008130 G35C Not assayed or wild type 972 h- sup3 sup3-G35C sup3-5 nucleotide_mutation ECO:0000049 PMID:37805140 4896 2023-10-23 We found that both wild type and catalytically inactive nuclear-targeted (M24) Trm1 promoted suppression of the tRNA SerUCA allele in a sla1∆ background, suggesting that modification is not strictly required for suppression activity and that Trm1 promotes pre-tRNA maturation even in the absence of catalysis (Figure 3A, B). PomBase SPBC13G1.05 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emp65 emp65delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13G1.05 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emp65 emp65delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13G1.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- emp65 emp65delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC13G1.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emp65 emp65delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000470 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001117 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000126,FYECO:0000371 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC830.08c) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 2A) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001117 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000126,FYECO:0000371 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC29A10.08) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 2A) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001355 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001355 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000412 medium PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 2B) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0003004 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0001232 PMID:38360270 4896 2024-03-15 ((Fig. 1) As shown in Figure 1, D and E, mitochondrial ROS was higher in erd2Δ cells than in WT cells.) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0004166 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000335 PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 1C) Moreover, the oxygen consumption rate of erd2Δ cells was higher than that of WT cells (Figs. 1C and S1A), suggesting that mitochondrial respiration was increased in erd2Δ cells. PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 variable severity assayed_transcript(PomBase:SPAC14C4.14) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPAC222.12c) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC1739.09c) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 variable severity assayed_transcript(PomBase:SPBC16H5.06) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBC725.11c) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000825 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC3B8.02) PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 4) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001164 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 PMID:38360270 4896 2024-03-14 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001103 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000097 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000085 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000091 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0008194 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 high PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 5) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001457 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0001457 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 PMID:38360270 4896 2024-03-15 Paradoxically, erd2Δ cells, in which UPR was activated (Fig. 2A), also grew poorly on EMM plates containing tunicamycin. PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph erd2 erd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0007193 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 60 PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 1) Intriguingly, we observed that the absence of erd2 caused mitochondrial fragmentation (Fig. 1, A and B) PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0002060 deletion 972 h- erd2 erd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP8B7.22 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd2 erd2delta deletion 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assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T215A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000267 T215A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T215A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:12023299 4896 2016-04-28 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 T215A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T215A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0009063 T215A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T215A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 5B) PomBase SPBC800.08 FYPO:0008451 deletion 972 h- trm6 trm6delta deletion ECO:0000059 PMID:40829803 4896 2025-09-17 The m6A model resulted in elevated KL divergence at i6A37 positions in wt/tit1Δ (Fig. 5A) and at m1A58 in wt/trm6Δ (Fig.5B),t PomBase SPBC800.08 FYPO:0001773 deletion 972 h- trm6 trm6delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(GO:0031515),assayed_substrate(PomBase:SPBTRNAMET.06) PMID:35901126 4896 2024-02-23 Similarly, poison primer extension showed that tRNAiMet(CAU) was nearly completely modified with m1A58 in WT cells (97%), but not visibly modified in trm6Δ and trm61Δ mutants (although quantification with the high background gave 2.0% for trm6Δ and 2.8% in trm61Δ). PomBase SPBC800.08 FYPO:0000082 deletion 972 h- trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 high PMID:35901126 4896 2024-02-22 (Fig. S1) PomBase SPBC800.08 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC800.08 FYPO:0002583 deletion 972 h- trm6 trm6delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004 high assayed_transcript(PomBase:SPBTRNAMET.06) PMID:35901126 4896 2024-02-23 The northern analysis revealed that tRNAiMet(CAU) levels were substantially reduced in the S. pombe trm6Δ mutants, both at 30 ̊C and 38.5 ̊C. At 30 ̊C, tRNAiMet(CAU) levels were 49% of those in WT cells, whereas each of the other eight tRNAs had levels between 82% and 121% of those in WT cells (Figs 2A, 2B and S3). PomBase SPBC800.08 FYPO:0001772 deletion 972 h- trm6 trm6delta deletion ECO:0005801 high assayed_enzyme(GO:0031515),assayed_substrate(PomBase:SPBTRNAMET.06) PMID:35901126 4896 2024-02-23 Examination by HPLC of the nucleoside composition of purified tRNATyr(GUA) from trm6Δ and trm61Δ mutants revealed that m1A levels were less than 0.03 moles/mole, compared to 0.60 moles/mole in WT cells, whereas levels of C, m5C, and m7G were very similar in the tRNATyr(GUA) from both mutant and WT cells (Fig 1B and 1C) PomBase SPBC800.08 FYPO:0001309 deletion 972 h- trm6 trm6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC800.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC800.08 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.08 FYPO:0006933 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 trm6 trm6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC800.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.08 FYPO:0001032 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 trm6 trm6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC800.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.08 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph trm6 trm6delta deletion ECO:0005638 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SPAC4A8.10 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph rog1 rog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- rog1 rog1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rog1 rog1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rog1 rog1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0000354 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 high high PMID:25318672 4896 2021-04-29 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0000356 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 high high PMID:25318672 4896 2021-04-29 At the restrictive temperature of 36C, cells accumulate very large lipid droplets surrounded by the endoplasmic reticulum. These lipid droplets arise from persistent growth rather than fusion. PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0007763 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC13A2.03) PMID:25318672 4896 2021-04-29 At high temperature (36C), the mutant protein appeared to bind PA nearly as well as the wild-type enzyme but exhibited a strongly decreased rate of catalysis. PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0007764 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 high high PMID:25318672 4896 2021-05-14 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0002227 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000137,FYECO:0000229 high high PMID:25318672 4896 2021-04-29 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0002552 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 high high PMID:25318672 4896 2021-04-29 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0000674 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:25318672 4896 2021-04-29 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0000674 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000155,FYECO:0000229 PMID:25318672 4896 2021-05-10 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0000674 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000154,FYECO:0000229 PMID:25318672 4896 2021-05-10 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0006934 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000137,FYECO:0000155,FYECO:0000229 PMID:25318672 4896 2021-05-10 PomBase SPBC13A2.03 FYPO:0001234 C287R Not assayed or wild type 972 h- bbl1 bbl1-9 cds1-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:25318672 4896 2021-04-29 Slow population growth rate can be rescued by supplementing the minimal medium with choline or ethanolamine, the precursors required for phospholipid biosynthesis through the de novo Kennedy pathway PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8E11.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC8E11.10 SPAC8E11.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002290 S61A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-S61A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. S1) PomBase SPCC126.01c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC126.01c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0001034 deletion 972 h- SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPCC126.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC126.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC126.01c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.01c SPCC126.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0007879 353-415 Not assayed or wild type 972 h- hst4 hst4deltaC Cdelta-hst4 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1783.04c) PMID:34608864 4896 2021-11-04 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0001355 353-415 Not assayed or wild type 972 h- hst4 hst4deltaC Cdelta-hst4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:34608864 4896 2021-11-04 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000838 353-415 Not assayed or wild type 972 h- hst4 hst4deltaC Cdelta-hst4 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1783.04c) PMID:34608864 4896 2021-11-04 PomBase SPAC1783.04c FYPO:0000089 353-415 Not assayed or wild type 972 h- hst4 hst4deltaC Cdelta-hst4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34608864 4896 2021-11-04 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000705 V242E Not assayed or wild type 972 h- sgo1 sgo1-VE amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 3c) Accordingly, the replacement of Val 242 with Glu (VE) in Sgo1 abolished the interaction with Swi6 while preserving the interaction with Par1, a subunit of PP2A. An immunoprecipitation assay also supports the loss of the interaction of Sgo1-VE with Swi6 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0007993 V242E Not assayed or wild type 972 h- sgo1 sgo1-VE amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 3c) Accordingly, the replacement of Val 242 with Glu (VE) in Sgo1 abolished the interaction with Swi6 while preserving the interaction with Par1, a subunit of PP2A. An immunoprecipitation assay also supports the loss of the interaction of Sgo1-VE with Swi6 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000703 V242E Not assayed or wild type 972 h- sgo1 sgo1-VE amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC188.02) PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 3c) Accordingly, the replacement of Val 242 with Glu (VE) in Sgo1 abolished the interaction with Swi6 while preserving the interaction with Par1, a subunit of PP2A. An immunoprecipitation assay also supports the loss of the interaction of Sgo1-VE with Swi6 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001722 T144A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-T144A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 T144A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-T144A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 T144A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-T144A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 T144A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-T144A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000214 G984R Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-G984R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:25764183 4896 2019-05-30 PomBase SPBC776.13 FYPO:0001122 G984R Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-G984R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000085 G984R Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-G984R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000088 G984R Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-G984R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000940 wild type Knockdown 972 h- spg1 spg1+ Prad21-spg1 wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 Examination of these cells following 12 h of growth in thiamine-containing medium also showed that most cells (59%) contained Byr4 at all SPBs (Table II). In contrast to sid3-106 mutants, though, the amount of Byr4 localized to SPBs in cells depleted of Spg1 using the conditional promoter was greatly reduced (data not shown) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- spg1 spg1+ Prad21-spg1 wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 Western analysis showed that the reduction in Byr4 localization to SPBs in cells depleted of Spg1 was not due to reduced Byr4 protein amounts (data not shown). PomBase SPCC188.07 FYPO:0004604 442-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-441) partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 assayed_using(SO:0001923) PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPCC188.07 FYPO:0004604 442-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-441) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPCC188.07 FYPO:0001645 442-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-441) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002019 442-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-441) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 low PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPCC188.07 FYPO:0001571 442-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-441) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC800.03),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 442-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-441) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0001013 21-60 Not assayed or wild type 972 h- rtn1Δ yop1Δ spo7-aid*-HA hva22 hva22-deltaC21-60 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:37191320 4896 2023-06-13 (Fig. S4E) revealed that the ER-shaping activities of the ΔC21-60 and ΔN29 mutants were partially and severely impaired, respectively (Fig. S4E) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007445 21-60 Not assayed or wild type 972 h- rtn1Δ yop1Δ spo7-aid*-HA hva22 hva22-deltaC21-60 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:37191320 4896 2023-06-13 (Fig. S4F), the ΔC21-60 and ΔN29 mutants exhibited partial and severe defects in reticulophagy, respectively, whereas the both mutant proteins were detectable on the ER (Fig. S4G) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004059 S2A,S4A,T77A,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I,S438A Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-11M-T77A atf1-11M amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19436749 4896 2014-11-21 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000031 deletion 972 h- cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 99 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 deletion 972 h- cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30072439 4896 2019-06-26 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 deletion 972 h- cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30072439 4896 2023-01-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0004481 deletion 972 h- cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 PMID:30072439 4896 2019-06-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0006933 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cwh43 cwh43delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC589.12 FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC589.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC589.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- cwh43 cwh43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC589.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwh43 cwh43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001128 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0001232 PMID:8838655 4896 2012-06-11 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPBC4.04c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001133 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0000337 PMID:8838655 4896 2012-06-11 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1682.02c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- mcm2 mcm2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9383050 4896 2012-06-29 PomBase SPCC1235.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- nad1 nad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1235.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nad1 nad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1235.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nad1 nad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 1-150,393-659 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d4 B2d4 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 2) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 1-150,393-659 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d4 B2d4 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 2) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0007962 1-150,393-659 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d4 B2d4 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 low PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Table 2) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A163T,C169T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A163T,C169T srp7-A163U,C169U6 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A163T,C169T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A163T,C169T srp7-A163U,C169U6 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A163T,C169T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A163T,C169T srp7-A163U,C169U6 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 low PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005929 unknown Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1deltaPHD unknown ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1deltaPHD unknown ECO:0000049 PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005931 unknown Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1deltaPHD unknown ECO:0000059 PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1deltaPHD unknown ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.10),assayed_using(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0006268 W104A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-W104A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 5) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006268 W104A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-W104A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:26438724 4896 2018-02-02 (Fig. 5) PomBase SPCC417.06c FYPO:0001914 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18411246 4896 2017-05-25 (Fig. 5B) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003561 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18411246 4896 2017-05-25 PomBase SPCC417.06c FYPO:0003139 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 51 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 5A and B) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 80 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 4C) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPCC417.06c FYPO:0006058 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18411246 4896 2017-05-25 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000581 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 4D) PomBase SPCC417.06c FYPO:0005737 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 5E) PomBase SPCC417.06c FYPO:0004952 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18411246 4896 2017-05-25 enclosure arrow in Figs 4Ci,ii) PomBase SPCC417.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC417.06c FYPO:0006053 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:28011631 4896 2017-05-24 (Fig. 3B) PomBase SPCC417.06c FYPO:0006003 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:28011631 4896 2017-05-24 (Fig. 3B) normal lipid droplet localization to FSM leading edge PomBase SPCC417.06c FYPO:0003790 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F3.06c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S2) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003790 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S2) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003541 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S1A) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003541 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S1A) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003541 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S1A) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003541 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S1A) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003541 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. S1A) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003845 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1347.03) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 5C) PomBase SPCC417.06c FYPO:0003845 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC825.03c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 5D) PomBase SPCC417.06c FYPO:0006777 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 4H) PomBase SPCC417.06c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0002167 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000419 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000107 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC417.06c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.06c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000346 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18411246 4896 2017-05-25 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000346 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 50 PMID:18411246 4896 2017-05-25 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000346 deletion 972 h- h90 mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18397994 4896 2024-08-15 PomBase SPCC417.06c FYPO:0000346 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 4A and B) PomBase SPCC417.06c FYPO:0000346 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPCC417.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC417.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug27 mug27delta mug27-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC830.06 FYPO:0002643 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cnb1 cnb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC830.06 FYPO:0002940 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cnb1 cnb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC830.06 FYPO:0005254 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cnb1 cnb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPCC830.06 FYPO:0002343 wild type Overexpression 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cnb1 cnb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002290 T528A,S529A,S530A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-T528A,S529A,S530A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. S1) PomBase SPCC736.10c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrps8 mrps8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrps8 mrps8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC736.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrps8 mrps8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.07 FYPO:0001487 (-1091)-(-627) Not assayed or wild type 972 h- ntp1 ntp1-MVP7 fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:15164362 4896 2019-10-29 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0001274 wild type Overexpression 972 h- tom70 tom70+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:24327658 4896 2014-03-27 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0003251 wild type Overexpression 972 h- tom70 tom70+ wild_type ECO:0000049 PMID:24327658 4896 2014-03-27 PomBase SPBC685.02 FYPO:0001122 D207A Overexpression 972 h- exo5 exo5-D207A amino_acid_mutation ECO:0005638 high high PMID:31563844 4896 2023-11-09 Examination of the cell morphology revealed that the cells were elongated, indicative of checkpoint activation [17] (Fig. 4B PomBase SPBC685.02 FYPO:0002061 D207A Overexpression 972 h- exo5 exo5-D207A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31563844 4896 2023-11-09 This lethality was not due to the nuclease activity of the protein, since overexpression of the nuclease-deficient mutant (exo5-D207A) showed similar lethality. PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0001645 DP303AA Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-AALD amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003631 DP303AA Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-AALD amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0003496 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005801 PMID:12761200 4896 2014-06-30 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0001164 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12761200 4896 2014-06-30 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0003824 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0003383 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0001034 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000412 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0003494 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12761200 4896 2014-06-30 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0003494 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:15300681 4896 2015-10-20 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph aca1 aca1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- aca1 aca1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC21E11.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aca1 aca1delta 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FYPO:0003210 1-68,82-149 Not assayed or wild type 972 h- mid1 NES-mid1-delta1 NES-M1-delta1|mid1-NES-delta1-150 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 1-68,82-149 Not assayed or wild type 972 h- mid1 NES-mid1-delta1 NES-M1-delta1|mid1-NES-delta1-150 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Figure 4) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 R580A,L581A,K582A Not assayed or wild type 972 h- mad1 mad1-RLK/AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig 1F) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0007383 R580A,L581A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. 1A, C-E) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0007383 R580A,L581A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. 1A, C-E) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005212 R580A,L581A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S1B) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005212 R580A,L581A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S1B) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0000703 R580A,L581A,K582A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-RLK/AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Fig. S1A and D) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002060 Q790* Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1-h2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10497270 4896 2019-02-22 PomBase SPCC306.03c FYPO:0003970 S5A,S41A Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-2A-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 20-50 PMID:21540296 4896 2016-05-24 (Fig. 7a) PomBase SPCC622.08c FYPO:0000450 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119E amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPCC622.08c FYPO:0004212 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119E amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPCC622.08c FYPO:0002679 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119E amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Te recombinant proteins of fssion yeast H2A (SpHta1) were also purifed. An in vitro kinase assay using these recombinant proteins showed that the H2A-K119D and the H2A-K119E mutants, as well as the H2A-S121A mutant, were not signifcantly phosphorylated by Bub1, whereas H2A-K119R mutant proteins were phosphorylated by Bub1 (Fig. 4B). PomBase SPCC622.08c FYPO:0000091 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29769606 4896 2024-04-24 We found that malonyl-mimetic K119D and K119E mutants showed sensitivity to a microtubule depolymerizing agent (TBZ) in the same way the H2A-S121A mutant had (Fig. S3B) PomBase SPCC622.08c FYPO:0003182 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29769606 4896 2024-04-24 Consistently, sister chromatid non-disjunction at meiosis II was signifcantly increased in the K119D and K119E mutants PomBase SPBC1709.08 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft1 cft1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft1 cft1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- cft1 cft1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1709.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cft1 cft1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0000708 C58S,C68S,C75S Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-C58S,C68S,C75S dni1-C58SC68SC75S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0006587 C58S,C68S,C75S Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-C58S,C68S,C75S dni1-C58SC68SC75S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0006588 C58S,C68S,C75S Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-C58S,C68S,C75S dni1-C58SC68SC75S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007334 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000021,FYECO:0000370 PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001899) PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001898) PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000876 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137 high PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000883 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137 high PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004577 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137 high PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005847 D253G,P254G,N255S,F256G Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-GS253 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_substrate(PR:000050217) PMID:34524082 4896 2021-11-08 (Figure1 3F) PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0004413 (-346)-(-1) Not assayed or wild type 972 h- pho1 pho1(pro1delta-1--346) partial_nucleotide_deletion ECO:0005801 PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0001117 (-346)-(-1) Not assayed or wild type 972 h- pho1 pho1(pro1delta-1--346) partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001276 K540A Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M6 mcm2-M6 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001645 K540A Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M6 mcm2-M6 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-28 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001645 K540A Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M6 mcm2-M6 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-28 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001645 K540A Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M6 mcm2-M6 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-28 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000783 K540A Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-M6 mcm2-M6 amino_acid_mutation ECO:0001232 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PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002869 S824A,S1523A,S1543A,S1811A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:24115772 4896 2014-02-25 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0001838 S824A,S1523A,S1543A,S1811A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-4A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:24115772 4896 2014-02-25 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0001365 S824A,S1523A,S1543A,S1811A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25688133 4896 2015-07-22 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002969 S824A,S1523A,S1543A,S1811A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:24115772 4896 2014-02-25 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002060 S824A,S1523A,S1543A,S1811A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24115772 4896 2014-02-25 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000611 G311R,S314P Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U14 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0001355 G311R,S314P Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000839 G311R,S314P Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0002061 G311R,S314P Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPCC553.09c FYPO:0002061 G311R,S314P Not assayed or wild type 972 h- spb70 spb70-U14 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:15314153 4896 2014-10-27 PomBase SPAC1687.15 FYPO:0001838 S335A Not assayed or wild type 972 h- gsk3 gsk3-S335A amino_acid_mutation ECO:0000112 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wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(T171) PMID:10398679 4896 2014-07-31 PomBase SPCC4F11.02 FYPO:0005134 wild type Overexpression 972 h- ptc1 ptc1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC530.03c FYPO:0000705 122-206 Not assayed or wild type 972 h- bag102 bag102-UBL partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC530.03c),assayed_using(PomBase:SPCC1739.13) PMID:27966061 4896 2017-01-04 PomBase SPBC530.03c FYPO:0000703 122-206 Not assayed or wild type 972 h- bag102 bag102-UBL partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC530.03c),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:27966061 4896 2017-01-04 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0003066 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 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FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0003411 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C-E) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0003412 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C-E) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0003412 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000291 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C-E) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- spd1delta ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1D, 1E) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 high PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000291 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004604 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C-E) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0003571 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0006030 PMID:25274039 4896 2014-12-15 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0005182 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:17039252 4896 2016-01-18 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0005194 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.02) PMID:32692737 4896 2020-08-17 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001645 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c),assayed_using(PomBase:SPBC215.03c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:32692737 4896 2020-08-20 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000453 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005580 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000832 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 PMID:12181326 4896 2014-08-20 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0006661 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 PMID:12181326 4896 2014-08-20 data not shown PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002836 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000291 PMID:25274039 4896 2014-12-15 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004966 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 PMID:25492408 4896 2015-08-07 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000255 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:17039252 4896 2016-01-13 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000255 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:17039252 4896 2016-01-13 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004189 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:16407242 4896 2016-03-09 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004189 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.03) PMID:16407242 4896 2016-03-09 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004189 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.19) PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0005333 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:16407242 4896 2016-03-31 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001327 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:16407242 4896 2016-03-09 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001327 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.03) PMID:16407242 4896 2016-03-09 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001327 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.19) PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001327 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 Loss of Ddb1 slightly enhances the Lsd1-FTP level, while having no significant effect on the Lsd2-FTP level (Fig 3E). PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001327 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 Both cul4-1 or ddb1Δ enhanced the amount of Set1 protein, indicating that both CLRC and CRL4 complexes modulate Set1 levels (Fig 5C) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001038 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000239 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000228 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 PMID:12181326 4896 2014-08-20 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002229 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2014-07-24 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0001164 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0007001 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0007002 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0007000 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000059 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 7) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0006989 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 4) PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002800 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0002554 deletion 972 h- ddb1 ddb1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC343.17c) PMID:27098497 4896 2016-08-10 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.10c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ddb1 ddb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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2020-12-11 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cda1 cda1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cda1 cda1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cda1 cda1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph cda1 cda1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cda1 cda1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- cda1 cda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cda1 cda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cda1 cda1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003055 (-1030)-582 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2deltaB partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0001971 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0001971 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 PMID:12654901 4896 2019-10-18 (Fig. 2) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0001018 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 60 PMID:23093943 4896 2021-03-26 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0007027 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0007027 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12654901 4896 2019-10-18 (Fig. 7a) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0006060 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 5) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0006060 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC821.06) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 5) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0006060 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 5) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000705 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.11c),assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 1H, Table 1) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0006772 deletion 972 h- h90 spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000223 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 ~4 PMID:12654901 4896 2019-10-18 (Fig. 2) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0003213 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:41171630 4896 2025-12-11 (Table 2) PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0006880 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC1183.01) PMID:41171630 4896 2025-12-10 the deletion of spn1 or spn4 led to mislocalization of Sec15 on the division plane in ~75% of cells with a septum while Sec15 in ~90% of WT cells PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000650 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000118 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0004807 deletion 972 h- h90 spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 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2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 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4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0001496 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 PMID:15385632 4896 2017-05-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- spn4 spn4delta deletion ECO:0001232 PMID:15385632 4896 2017-05-28 PomBase SPAC9G1.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h90 spn4 spn4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000703 1-467 Not assayed or wild type 972 h- ase1 ase1-468-731 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12),assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:18061564 4896 2019-11-14 (Figure 6F) PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0007600 W165A,F166A Overexpression 972 h- yta4 yta4(AA) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC12C2.08) PMID:37590302 4896 2023-08-30 As shown in Figs 4D and S1C, overexpression of WT Yta4 impaired the formation of Dnm1 foci on mitochondria but did not change the tubular mitochondrial morphology. PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0003768 W165A,F166A Overexpression 972 h- yta4 yta4(AA) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11G11.01) PMID:37590302 4896 2023-08-30 showed that the delocalized GFP-Fis1 appeared to be present in the cytoplasm of Yta4-overexpressing cells, while GFP-Fis1 in Yta4(AA)-overexpressing or Yta4 (EQ)-overexpressing cells was still present on mitochondria, which were clearly separated from the ER (S1D and S2 Figs). PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0002485 N36D,L137P Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-234 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13),assayed_using(PomBase:SPCC777.09c) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0003179 N36D,L137P Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-234 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPAC17A5.18c FYPO:0004058 N36D,L137P Not assayed or wild type 972 h- rec25 rec25-234 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28469148 4896 2017-09-21 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0005781 S189D Not assayed or wild type 972 h- mad2 mad2-S189D amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002890 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0000172 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0003567 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:24954111 4896 2018-02-02 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0000121 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0003066 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0001894 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0006366 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 PMID:24954111 4896 2018-02-02 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0004605 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 low PMID:24954111 4896 2018-02-02 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002485 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002485 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0003179 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002772 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0000581 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0000581 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 high PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0006363 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 36 PMID:24954111 4896 2018-02-02 (Fig. 1) PomBase SPAC1002.06c FYPO:0003541 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.13c) PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0004569 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 38 PMID:24954111 4896 2018-02-02 (Fig. 1) In wild-type cells, monopolar or nonpolar spindles were not observed (Fig. 4C). PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002687 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002905 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 bqt2 bqt2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph bqt2 bqt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0006364 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 27 PMID:24954111 4896 2018-02-02 (Fig. 1) PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bqt2 bqt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4D7.09 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif223 tif223delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4D7.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- tif223 tif223delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4D7.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif223 tif223delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000029 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 35 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000029 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 30 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000031 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000141 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 24 PMID:30635289 4896 2019-02-07 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0004988 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0004988 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0006349 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC21B10.13c),assayed_region(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19714215 4896 2024-07-24 This analysis revealed that Yox1p binding to the cdc22 promoter depends on both of the MBF components tested, Res2p and Nrm1p (Figure 2C). We conclude that Yox1p can bind to MBF- regulated promoters only via intact MBF. PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003165 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000470 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005314 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005314 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005314 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001253 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001122 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 high,variable severity PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003970 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 13 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001707 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000972 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 27 PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005026 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2024-07-23 Through the visual screen, we identified that three mutants, nrm1D, yox1D, and res2D, showed abnormal CENP-A distribution patterns (Figure 2A). In these mutants, Cnp1-GFP at centromeres tends to be brighter and also gives a high nucleoplasmic signal (Figure 2A), suggesting an increase in Cnp1-GFP levels. PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0006740 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1952.05) PMID:31260531 4896 2020-01-01 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001038 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2019-02-07 Deletion of nrm1 or yox1 resulted in a $5-6-fold increase in cnp1 mRNA levels, whereas res2 deletion led to a more modest twofold increase (Figure 3A). PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000239 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000228 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 ~6 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000964 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. S3) PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002843 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2019-02-07 Through the visual screen, we identified that three mutants, nrm1D, yox1D, and res2D, showed abnormal CENP-A distribution patterns (Figure 2A). In these mutants, Cnp1-GFP at centromeres tends to be brighter and also gives a high nucleoplasmic signal (Figure 2A), suggesting an increase in Cnp1-GFP levels. PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001986 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000098 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 PMID:26891792 4896 2023-06-21 (Fig. 1) PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000102 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001245 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000088 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000091 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002546 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph nrm1 nrm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0003241 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 5 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16A3.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nrm1 nrm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gid7 gid7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC343.04c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gid7 gid7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gid7 gid7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- gid7 gid7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gid7 gid7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gid7 gid7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC902.06 FYPO:0004766 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 PMID:15800064 4896 2016-09-23 (Figure 4) PomBase SPBC902.06 FYPO:0004624 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3A,3C) PomBase SPBC902.06 FYPO:0002555 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3) PomBase SPBC902.06 FYPO:0002555 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC428.20c) PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3) PomBase SPBC902.06 FYPO:0002555 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3B) PomBase SPBC902.06 FYPO:0005441 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:15837798 4896 2022-06-13 mto2 deletion strain, which yielded viable but slightly bent cells (Fig. 3 A) PomBase SPBC902.06 FYPO:0001548 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC902.06 FYPO:0004700 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 38 PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3A) PomBase SPBC902.06 FYPO:0004700 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 PMID:15837798 4896 2022-06-13 mto2 deletion strain, which yielded viable but slightly bent cells (Fig. 3 A) PomBase SPBC902.06 FYPO:0003327 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC902.06 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC902.06 FYPO:0007980 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 PMID:15837798 4896 2022-06-15 PomBase SPBC902.06 FYPO:0007979 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 PMID:15837798 4896 2022-06-15 PomBase SPBC902.06 FYPO:0004611 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3A) PomBase SPBC902.06 FYPO:0002444 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_protein(PomBase:SPCC417.07c) PMID:38442865 4896 2024-05-31 ((Fig. 3A and C)) PomBase SPBC902.06 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mto2 mto2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC902.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC902.06 FYPO:0002818 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:38442865 4896 2024-05-31 (Fig. 3D, E and F) PomBase SPBC902.06 FYPO:0005686 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 83 PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3A) PomBase SPBC902.06 FYPO:0005686 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 PMID:15837798 4896 2022-06-15 The average number of MT bundles in mto2Δ cells (n = 1.3 ± 0.7 SD; Fig. 3 E) was significantly lower than in wild-type cells (3.6 ± 0.9) PomBase SPBC902.06 FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 5.3 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC902.06 FYPO:0003717 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC902.06 FYPO:0005688 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3A) PomBase SPBC902.06 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mto2 mto2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC902.06 FYPO:0000957 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-12-06 (Fig. 2) PomBase SPBC902.06 FYPO:0003302 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0001232 PMID:15837798 4896 2022-06-15 PomBase SPBC902.06 FYPO:0003126 deletion 972 h- mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 PMID:15800064 4896 2016-09-22 (Figure 3A,3C) PomBase SPBC902.06 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC902.06 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC902.06 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mto2 mto2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC902.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC902.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC902.06 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph mto2 mto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC902.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- 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deletion 972 h- fin1 fin1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:11927555 4896 2020-12-20 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- fin1 fin1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 fin1 fin1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium 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Since Epe1 physically interacts with the bromodomain protein Bdf2, which is required for heterochromatin-euchromatin boundary formation [14], we predicted that Bdf2 would recruit Epe1 to the target sites. However, bdf2Δ cells showed an almost uniform red phenotype in the ade6-m210 background (S4H Fig), suggesting that Bdf2 was not related to suppression of variegation and ectopic heterochromatin formation. PomBase SPAC631.02 FYPO:0000963 deletion 972 h- bdf2 bdf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPAC631.02 FYPO:0000957 deletion 972 h- bdf2 bdf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPAC631.02 FYPO:0008380 deletion 972 h- bdf2 bdf2delta deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 5B) PomBase SPAC631.02 FYPO:0004548 deletion 972 h- bdf2 bdf2delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:22095079 4896 2018-06-22 PomBase SPAC631.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- bdf2 bdf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-22 PomBase SPAC631.02 FYPO:0007629 deletion 972 h- bdf2 bdf2delta deletion ECO:0005638 PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPAC631.02 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph bdf2 bdf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 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FYPO:0003044 D79V,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-2 amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:38285941 4896 2024-03-15 , mcm2-1 and mcl1-4 cells failed to maintain heterochromatin, as indicated by white colony color and loss of the H3K9me3 mark (SI Appendix, Fig. S7). Thus, both Mcl1 and Mcm2 are required for propagation of heterochromatin at an ectopic site. PomBase SPBC4.04c FYPO:0002827 D79V,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-2 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 PMID:38285941 4896 2024-03-15 The other two mutants showed defective silencing of the mat2P::ura4+ reporter and haploid meiosis (Fig. 4C), as well as detectable levels of the mat2P transcript (Fig. 4D). PomBase SPBC4.04c FYPO:0007158 D79V,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-2 amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:38285941 4896 2024-03-24 (Fig. 4E and F). PomBase SPBC4.04c FYPO:0007159 D79V,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-2 amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:38285941 4896 2024-03-24 (Fig. 4E and F). PomBase SPBC4.04c FYPO:0001357 D79V,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38285941 4896 2024-03-15 PomBase SPAC664.07c FYPO:0003118 wild type Overexpression 972 h- rad9 rad9+ wild_type ECO:0000335 PMID:17725619 4896 2014-12-03 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004133 wild type Overexpression 972 h- rad9 rad9+ wild_type ECO:0000335 PMID:17725619 4896 2014-12-03 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001420 wild type Overexpression 972 h- rad9 rad9+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:17725619 4896 2014-12-03 PomBase SPAC664.07c FYPO:0003376 wild type Overexpression 972 h- rad9 rad9+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:17725619 4896 2014-12-03 PomBase SPAC664.07c FYPO:0003113 wild type Overexpression 972 h- rad9 rad9+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:17725619 4896 2014-12-03 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb1 rpb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000825 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001690 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 P103T Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102T amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001245 G956A Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-G319D nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003467 C7G Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-C7G nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:1617727 4896 2014-06-27 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0002061 C7G Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-C7G nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:1617727 4896 2014-06-20 PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0000703 1-940,1033-2812 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1-HR-17-18 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:15964794 4896 2016-06-17 PomBase SPAC1834.01 FYPO:0000705 1-102,417-433 Not assayed or wild type 972 h- erf1 erf1-deltaN1deltaC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:9701287 4896 2019-01-09 PomBase SPCC364.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cif1 cif1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.01 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph cif1 cif1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cif1 cif1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cif1 cif1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC364.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cif1 cif1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC364.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- cif1 cif1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC364.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cif1 cif1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC364.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cif1 cif1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0002687 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1-S5 unknown ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPBP18G5.02 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pgs1 pgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP18G5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- pgs1 pgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP18G5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pgs1 pgs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0001645 D391A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-D391A amino_acid_mutation ECO:0000059 medium assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4—Figure supplement 1B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004247 D391A Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-D391A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4C,D) PomBase SPAC664.07c FYPO:0001929 N42A,S43A,S44A,R45A,S46A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000963 N42A,S43A,S44A,R45A,S46A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 N42A,S43A,S44A,R45A,S46A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPCC790.03 FYPO:0000835 G244R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G244R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PR:000046672),assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 8) PomBase SPCC790.03 FYPO:0001422 G244R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G244R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:27655872 4896 2016-09-30 (Fig. 8C, 8D) Western blot analysis show decreased Sre1 cleavage activation under low oxygen PomBase SPCC790.03 FYPO:0001245 G244R Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-G244R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 8A) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002033 K259D Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K259D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000776 K259D Not assayed or wild type 972 h- gad8 gad8-K259D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000268 D65N Overexpression 972 h- mre11 mre11-D65N rad32-D65N amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:9826747 4896 2016-04-13 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001838 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001645 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPBC216.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 4b) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0005258 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 1) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001147 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0004248 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000703 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 4B) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 1) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 3C) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000111 R358A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R358A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 3c) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000705 1-375,536-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,536-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001645 1-375,536-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,536-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 1-375,536-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-1-375,536-1019 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19422421 4896 2018-04-12 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258,L66R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-L66R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 130-258,L66R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-L66R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T88G,T84TTCGA Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U88G,omegaUCGA nucleotide_insertion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T88G,T84TTCGA Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U88G,omegaUCGA nucleotide_insertion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 E25A,E26A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E25A,E26A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 E25A,E26A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E25A,E26A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 E25A,E26A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E25A,E26A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002294 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002912 deletion 972 h- cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 PMID:8334307 4896 2014-08-12 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc14 cdc14delta deletion ECO:0005638 PMID:8334307 4896 2014-08-12 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- cdc14 cdc14delta deletion ECO:0001232 PMID:8334307 4896 2014-08-12 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 1-154,214-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-155-213 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 1-154,214-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-155-213 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 1-154,214-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-155-213 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC23D3.06c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP nup146 nup146+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC23D3.06c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP nup146 nup146+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC4A8.04 FYPO:0001669 D221S,H253S,S409A Not assayed or wild type 972 h- isp6 isp6-D221S,H253S,S409A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.04) PMID:21153812 4896 2016-02-03 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005494 G223E Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G223E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005494 G223E Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G223E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:12894167 4896 2016-07-14 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0003185 G223E Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G223E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000013 G223E Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G223E amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002112 G223E Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G223E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPAPB1E7.12 FYPO:0002033 S235A,S236A Not assayed or wild type 972 h- rps602 rps602-S235A,S236A rps602-SSAA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:20144990 4896 2016-01-13 PomBase SPAC6F12.15c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut9 cut9-98 unknown ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2015-09-02 PomBase SPBC23G7.06c FYPO:0003858 wild type Overexpression 972 h- 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PomBase SPBP23A10.07 FYPO:0003166 G1143D Not assayed or wild type 972 h- rpa2 rpa2-G1143D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:35783577 4896 2022-09-27 PomBase SPBP23A10.07 FYPO:0000091 G1143D Not assayed or wild type 972 h- rpa2 rpa2-G1143D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:35783577 4896 2022-09-28 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000705 1-266,346-577 Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-267-345 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001571 S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S136A,S402A,S566A,S650A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mta1 mta1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC16C9.02c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph mta1 mta1delta deletion ECO:0005638 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ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC1347.02) PMID:36423630 4896 2024-02-09 Although the overall Fkbp39 protein levels are slightly reduced in fkbp41D total lysates (Figure S7E), there was a marked reduction of Fkbp39 localization specifically at 25S rDNA in those cells compared with wild- type (Figures 6A, 6B, and S7F). PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0006353 deletion 972 h- ani2 ani2delta deletion ECO:0000291 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Fig. 4b) PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ani2 ani2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0007479 deletion 972 h- ani2 ani2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ani2 ani2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0003241 deletion 972 h- ani2 ani2delta deletion ECO:0001232 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Fig. 4a) PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- ani2 ani2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ani2 ani2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ani2 ani2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0000444 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:29316864 4896 2018-02-09 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0004594 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:29316864 4896 2018-01-22 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0003327 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:29316864 4896 2018-01-22 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0001407 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:29316864 4896 2018-01-22 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0001919 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29316864 4896 2018-01-22 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0006979 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:31030285 4896 2019-07-12 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0001974 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29316864 4896 2018-02-09 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0004083 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29316864 4896 2018-01-22 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0000021 70-97 Overexpression 972 h- rst2 rst2-C2H2delta rst2 (C2H2delta) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:29316864 4896 2018-02-09 PomBase SPBC3B9.18c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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PomBase SPBC83.18c FYPO:0002559 P257A Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-P257A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Fig. S3F) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 H424R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-H424R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:9622480 4896 2015-12-01 PomBase SPBC32F12.07c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr SPBC32F12.07c SPBC32F12.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC32F12.07c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr SPBC32F12.07c SPBC32F12.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC32F12.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32F12.07c SPBC32F12.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32F12.07c SPBC32F12.07cdelta 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cdc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc2 cdc2delta deletion ECO:0001232 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000838 deletion 972 h- cdc2 cdc2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 deletion 972 h- CDC2HS his3-27 leu1-32 cdc2 cdc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:2038306 4896 2016-09-28 PomBase SPCC330.04c FYPO:0001645 Tdk1 fused to a tetramerisation domain Not assayed or wild type 972 h- tdk1 CCtet-tdk1 fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485800 4896 2025-01-08 (Fig. 3A) PomBase SPCC550.05 FYPO:0000082 C199A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C199A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:18667531 4896 2022-11-07 The 􏰂RING, C197A, C199A, and C197A/C199A mutants were mildly temperature sensitive but grew normally at 25°C (Figure 2A and data not shown) PomBase SPCC550.05 FYPO:0001357 C199A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C199A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:18667531 4896 2022-11-07 The 􏰂RING, C197A, C199A, and C197A/C199A mutants were mildly temperature sensitive but grew normally at 25°C (Figure 2A and data not shown) PomBase SPCC550.05 FYPO:0000088 C199A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C199A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000089 C199A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C199A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000268 C199A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C199A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002030 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0006108 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0003338 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0000742 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0000742 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 4) PomBase SPAC631.01c FYPO:0000742 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.20) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 4) PomBase SPAC631.01c FYPO:0001584 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0002023 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 20 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002023 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000325 15 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0003066 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0006116 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC126.06) PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0006215 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001512 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 low PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0007096 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC646.06c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007096 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC106.20) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007096 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.08c) PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007096 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007096 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23D3.10c) PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007096 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0006207 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000248 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001365 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000325 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004653 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000325 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002021 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002021 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002021 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002021 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007097 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 high PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 3) PomBase SPAC631.01c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acp2 acp2delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC631.01c FYPO:0008400 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 2) PomBase SPAC631.01c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0007094 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 high PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 1) PomBase SPAC631.01c FYPO:0006081 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 4 and 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0006081 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.14c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 4 and 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007095 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 Figure2 PomBase SPAC631.01c FYPO:0007095 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 2) PomBase SPAC631.01c FYPO:0007095 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 2) PomBase SPAC631.01c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC631.01c FYPO:0000339 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000325 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001368 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004097 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004652 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004652 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0004652 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0000744 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0001587 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0001587 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0002253 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0006213 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15743909 4896 2017-09-13 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15743909 4896 2017-09-13 PomBase SPAC631.01c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0002445 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0002445 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:31495586 4896 2019-09-26 (Figure 4 and 6) PomBase SPAC631.01c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c FYPO:0005968 deletion 972 h- acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPAC631.01c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph acp2 acp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC631.01c 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2A) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001357 deletion 972 h- aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37772819 4896 2023-10-06 (Fig. 7) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001357 deletion 972 h- aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 7A) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001420 deletion 972 h- aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001420 deletion 972 h- aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0007474 deletion 972 h- KanMX6, ade6-M216, ura4-D18, leu1-32 h+ aps1 aps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33419777 4896 2021-02-02 (Fig. 1B, C Table 1) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0003612 deletion 972 h- aps1 aps1delta deletion ECO:0005638 PMID:12387729 4896 2014-08-20 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- aps1 aps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002060 deletion 972 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC637.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- ypp1 ypp1delta deletion ECO:0000059 PMID:28784611 4896 2017-08-22 (Figure S1C) PomBase SPAC637.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- ypp1 ypp1delta deletion ECO:0005638 PMID:28784611 4896 2017-09-11 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPCC338.10c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0006978 deletion 972 h- cox5 cox5delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPCC338.10c FYPO:0000470 deletion 972 h- cox5 cox5delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPCC338.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c 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2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.10c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph cox5 cox5delta deletion ECO:0005638 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SPBC1A4.05 FYPO:0006098 rga4delta(622-760)-blt1 Overexpression 972 h- rga4delta blt1 rga4delta(622-760)-blt1 rga4delta622-760-blt1-fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:21849474 4896 2024-03-29 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0006536 rga4delta(622-760)-blt1 Overexpression 972 h- rga4delta blt1 rga4delta(622-760)-blt1 rga4delta622-760-blt1-fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:21849474 4896 2018-06-27 (Fig. 7A,B) localisation of rga4 by blt1+ is more extensive than wild type rga4 localisation but rescues the wide cell phenotype of the rga4 deletion PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0001146 deletion 972 h- ubc7 ubc7delta deletion ECO:0000112 PMID:22083275 4896 2015-03-31 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0001327 deletion 972 h- ubc7 ubc7delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-14 We confirmed it by microscopy as well. Fig 3C and D. We also measured the amount of GFP-Bqt4 in mutants lacking Ubc6 and Ubc7, which are E2 ubiquitin-conjugating enzymes associated with Doa10 (Swanson et al., 2001). We found that GFP-Bqt4 levels increased to some extent in ubc6Δ and ubc7Δ single and ubc6Δ ubc7Δ double mutants (Fig. 3C,D). PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ubc7 ubc7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- ubc7 ubc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubc7 ubc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubc7 ubc7delta deletion ECO:0001232 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gst1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC191.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph gst1 gst1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gst1 gst1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- gst1 gst1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12063243 4896 2014-11-20 PomBase SPCC191.09c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph gst1 gst1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph gst1 gst1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph 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ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gst1 gst1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC191.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gst1 gst1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 P6PRGTPP Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K10 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002373 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000190 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 15 PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 3) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000240 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea1 tea1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005464 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea1 tea1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000147 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:14506270 4896 2016-06-23 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006547 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:27852900 4896 2018-05-03 (Figure 3, A and E) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005503 deletion 972 h- KanR ura4+ ura4-D18 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC688.11) PMID:15827087 4896 2016-12-19 data not shown, same as Fig 4C PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001018 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001018 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001018 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:26525038 4896 2015-12-08 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006502 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003209 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:15936270 4896 2020-06-12 The specific localization of Wsh3-GFP was lost in the Δtea1 mutant and the Wsh3-GFP signal was diffused throughout the cytoplasm (Figure 4A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003209 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002859 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1739.10) PMID:21652630 4896 2013-11-12 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002859 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.02c) PMID:21652630 4896 2013-11-12 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002859 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.16) PMID:21652630 4896 2013-11-12 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002859 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:21652630 4896 2013-11-12 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007995 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.05) PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000705 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12),assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001394 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 low PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 1) about 14% from new end In contrast, 14% of tea1 cells and 30% of pom1 cells failed to resume growth from a previously growing end (Figure 1). PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003314 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0008389 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000461 PMID:34523683 4896 2025-03-07 (Fig. S4) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004700 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000113 35 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 1C iii) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007563 deletion 972 h- cyr1delta LEU2+ sxa2delta ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-06-23 (Fig. 6B) All three mutants were able to detect and respond to pheromone by arresting in G1, as shown by FACS analysis (Fig. 6B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003150 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 3) Our tea1 result differs from that of Rupes et al. (1999), who found that tea1 cells did not switch to bipolar growth after a LatA pulse. This may be due to differences in scoring or temperature between the experiments. PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005798 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:11007487 4896 2016-11-22 (Figure 4I) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005798 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000113 20 PMID:9200612 4896 2018-04-30 (Fig. 1C iii) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006637 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001586 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:21703453 4896 2016-11-11 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002871 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:23041194 4896 2013-11-15 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002556 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, S3a) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002556 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Fig. 2a) and data not shown PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002679 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 1D) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003532 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:26525038 4896 2015-12-08 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006874 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002870 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:23041194 4896 2013-11-15 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004511 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 1H) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004611 deletion 972 h- ura4+ ura4-D18 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:12034771 4896 2016-11-17 (Fig. 3C, 5A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005880 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 15 PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 4) shows that tea1 cells at high temperatures displayed microtubules bending round the cell ends in accordance with previously published results (Mata and Nurse, 1997). PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005880 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 10-15 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 6D) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006636 deletion 972 h- tea3-GFP tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPAC6G10.02c) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 4A PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007388 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:18495844 4896 2020-04-16 (Fig. 3B, C) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 6.3 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001019 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007997 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000674 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003797 deletion 972 h- ura4+ ura4-D18 h90 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000039,FYECO:0000104 medium PMID:11950884 4896 2021-05-17 (Fig. 6C) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007810 deletion 972 h- cyr1delta LEU2+ sxa2delta ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-05-17 (Fig. 5 Table 4) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000964 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 PMID:11972773 4896 2022-06-17 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007412 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:18495844 4896 2020-04-16 (Fig. 3B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002559 deletion 972 h- KanR ura4+ ura4-D18 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC688.11) PMID:15827087 4896 2016-12-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002442 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.05) PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003316 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.06c) PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003316 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004731 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:11007487 4896 2016-11-22 (Figure 4I) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0008003 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001357 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0006501 deletion 972 h- cyr1delta LEU2+ sxa2delta ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000039,FYECO:0000126 high PMID:11950884 4896 2021-05-17 (Fig. 6A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003527 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 1SE) to cell cortex of (new) cell tip from medial cortex PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003595 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 4.8 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0004325 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007868 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000356 low PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 6A) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002848 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 80 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 2B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002848 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 85 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 2B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002848 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000235 88 PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007379 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 20 PMID:15936270 4896 2020-06-12 (penetrance from 6B) nWe found that high osmolarity stress by 0.6 M KCl also promotes appearance of T-shaped cells in the Δtea1 strain, to the levels comparable to the Δwsh3 mutant (Figure 6B). PomBase SPCC1223.06 FYPO:0007379 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 11 PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 5) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:25422470 4896 2016-10-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 65 PMID:39509469 4896 2024-12-17 (Fig. 5B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- cdc11-119 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 2C) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 5 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 5C) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 25 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. S5B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000025 40 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. S5B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 33 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. S5B) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000113 20 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 1C iii) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002215 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000113 30 PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 1C ii) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002112 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:25422470 4896 2016-10-28 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 41.7 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002112 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0003481 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 low PMID:19474789 4896 2017-04-26 Supplementary Table 2 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- tea1 tea1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000113 30 PMID:9200612 4896 2018-04-30 (Fig. 1C ii) PomBase SPCC1223.06 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea1 tea1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0000214 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-587 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002033 C55V,L117G,M170F Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-as8 plo1.as8 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:24963130 4896 2014-07-17 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001696 C55V,L117G,M170F Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-as8 plo1.as8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 1) Chronic exposure to analogue through growth on solid medium reiterated the acute impact of analogue inhibition in liquid culture (Fig. 1A) and established that plo1.as8 is most effectively inhibited by 3BrB- PP1 (Fig. 1B). PomBase SPCC61.02 FYPO:0000082 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0004604 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0000049 medium PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPCC61.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0004742 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:30573453 4896 2019-06-28 PomBase SPCC61.02 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC61.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0000099 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-16 PomBase SPCC61.02 FYPO:0001207 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-16 PomBase SPCC61.02 FYPO:0000111 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPCC61.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- spt3 spt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC61.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt3 spt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC61.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt3 spt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.06c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1B3.06c 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PomBase SPAC1B3.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1B3.06c SPAC1B3.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3C7.12 FYPO:0000703 1-245 Not assayed or wild type 972 h- tip1 tip1deltaN(1-245) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:36138017 4896 2023-01-18 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003838 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-551 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0001355 P1021S 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18418055 4896 2015-09-11 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 P1021S 972 h- cut7 cut7-22 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:18418055 4896 2015-09-11 PomBase SPBC4C3.12 FYPO:0003028 unknown Not assayed or wild type 972 h- sep1 sep1-1 unknown ECO:0001232 PMID:10491317 4896 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2010-04-06 PomBase SPBP8B7.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp201 rpp201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp201 rpp201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0006060 wild type Overexpression 972 h- spt20 spt20+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 10 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0000223 wild type Overexpression 972 h- spt20 spt20+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0001164 T360A Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-Pt1-2 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPAC29B12.10c FYPO:0001570 disruption Not assayed or wild type 972 h- pgt1 pgt1::KanMX4 disruption ECO:0000335 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:19180638 4896 2014-08-05 PomBase SPAC29B12.10c FYPO:0002061 disruption Not assayed or wild type 972 h- pgt1 pgt1::KanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000180 PMID:19180638 4896 2014-08-05 PomBase SPAC29B12.10c FYPO:0002061 disruption Not assayed or wild type 972 h- pgt1 pgt1::KanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000118,FYECO:0000126,FYECO:0000180 PMID:19180638 4896 2014-08-05 PomBase SPAC29B12.10c FYPO:0002060 disruption Not assayed or wild type 972 h- pgt1 pgt1::KanMX4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:19180638 4896 2014-08-05 PomBase SPAC458.03 FYPO:0008117 tel2-AID Knockdown 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0006030 PMID:31748520 4896 2023-09-01 See Figure 3a, 3b Describes the biogenesis of a multisubunit complex from nascent proteins. PomBase SPAC458.03 FYPO:0001355 tel2-AID Knockdown 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0000450 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119D amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0004212 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119D amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0002679 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119D amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Te recombinant proteins of fssion yeast H2A (SpHta1) were also purifed. An in vitro kinase assay using these recombinant proteins showed that the H2A-K119D and the H2A-K119E mutants, as well as the H2A-S121A mutant, were not signifcantly phosphorylated by Bub1, whereas H2A-K119R mutant proteins were phosphorylated by Bub1 (Fig. 4B). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0000091 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29769606 4896 2024-04-24 We found that malonyl-mimetic K119D and K119E mutants showed sensitivity to a microtubule depolymerizing agent (TBZ) in the same way the H2A-S121A mutant had (Fig. S3B) PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0003182 K120D Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29769606 4896 2024-04-24 Consistently, sister chromatid non-disjunction at meiosis II was signifcantly increased in the K119D and K119E mutants PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56E4.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC56E4.07 SPAC56E4.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000705 1-377,426-432 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-C369-425 bqt4C369-425 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10),assayed_protein(PomBase:SPCC594.07c) PMID:37694715 4896 2023-11-15 The results of the yeast-two-hybrid assay showed that the fragments lacking the last seven residues did not bind to Bqt3 (Fig. 6B). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000835 1-377,426-432 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-C369-425 bqt4C369-425 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 The fragment Bqt4C369-425 lost its dependency on Bqt3 for degradation and exhibited similar behaviors in the presence or absence of Bqt3 (Fig. 6A, Bqt4C369-425): PomBase SPCC61.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC61.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC61.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 nnr2 nnr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC61.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- nnr2 nnr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC61.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nnr2 nnr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC61.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nnr2 nnr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC688.07c FYPO:0001880 1-200,751-1030 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(201-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Fig. 3C) PomBase SPAC688.07c FYPO:0001880 1-200,751-1030 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(201-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-10-02 Table 1, fig 3 C PomBase SPAC688.07c FYPO:0002488 1-200,751-1030 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(201-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 >20 PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Figure 3F) PomBase SPAC688.07c FYPO:0000836 1-200,751-1030 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(201-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Table 1) PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 egd2 egd2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0002800 deletion 972 h- egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 PMID:17211518 4896 2020-11-26 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0001029 deletion 972 h- egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 PMID:17211518 4896 2020-11-26 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 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prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.05 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph egd2 egd2delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPCC594.06c FYPO:0004247 deletion 972 h- vsl1 vsl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25378562 4896 2015-01-06 PomBase SPCC594.06c FYPO:0002717 deletion 972 h- vsl1 vsl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25378562 4896 2015-01-06 PomBase SPCC594.06c FYPO:0002716 deletion 972 h- vsl1 vsl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25378562 4896 2015-01-06 PomBase SPCC594.06c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph vsl1 vsl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.06c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph vsl1 vsl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.06c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph vsl1 vsl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- 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PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005300 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002902 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002902 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002679 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22521786 4896 2013-11-26 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001840 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000324 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002901 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22521786 4896 2013-11-26 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001357 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000091 T257A,T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-9TA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPBC106.09 FYPO:0002346 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000206 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0000156 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0003352 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000227 17 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0003681 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0001861 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000340 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:19117951 4896 2015-12-02 PomBase SPBC106.09 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut4 cut4-553 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001425 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8978688 4896 2014-09-01 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000705 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c),assayed_using(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:9635190 4896 2016-04-01 (Fig. 1i) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001055 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2203537 4896 2013-01-24 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0003165 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000082 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 low PMID:30072439 4896 2019-07-09 Suppression of temperature sensitivity by 1.2M sorbitol PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000082 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000229 high PMID:30072439 4896 2019-07-09 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001645 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c),assayed_using(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:9635190 4896 2016-04-01 (Fig. 1i) PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0000344 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8978688 4896 2014-09-01 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001489 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8978688 4896 2014-09-01 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0003758 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0003758 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8978688 4896 2014-09-01 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0003166 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 10 PMID:2203537 4896 2016-09-06 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001357 R262* Not assayed or wild type 972 h- cut2 cut2-364 cut2-R267->stop cut2-R262* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000227 PMID:30072439 4896 2019-07-09 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001033 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000969 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000957 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001380 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001357 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000094 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000088 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000267 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0002176 disruption Null 972 h- hhp2 hhp2::m-TN3-LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8026462 4896 2015-09-04 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002687 R76A Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-R76A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000703 1-338 Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 1C) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000703 1-338 Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08),assayed_using(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:32735772 4896 2020-08-07 (Figure 3C) The 42-amino-acid Epr1-C region (residues 339-380), which is capable of Atg8 binding and contains the predicted FFAT motif, is sufficient for interacting with VAPs PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000703 1-338 Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.12),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:32735772 4896 2020-08-07 (Figure 3C) The 42-amino-acid Epr1-C region (residues 339-380), which is capable of Atg8 binding and contains the predicted FFAT motif, is sufficient for interacting with VAPs PomBase SPBC119.11c FYPO:0000082 E251K Overexpression 972 h- pac1 pac1-E251K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001147 E251K Overexpression 972 h- pac1 pac1-E251K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPAC8F11.03 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- msh3 swi4- unknown ECO:0005638 PMID:6587363 4896 2014-05-07 PomBase SPAC8F11.03 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- msh3 swi4- unknown ECO:0005638 PMID:24719968 4896 2014-06-18 PomBase SPAC8F11.03 FYPO:0003353 unknown Not assayed or wild type 972 h- msh3 swi4- unknown ECO:0000337 PMID:6587363 4896 2014-05-07 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0003338 myo3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- myp2 myo3::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:9459302 4896 2016-06-28 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0003338 myo3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- myp2 myo3::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 8 PMID:9459302 4896 2016-06-28 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0005476 myo3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- myp2 myo3::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103 high PMID:9459302 4896 2016-06-28 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001406 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prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001407 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-03 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001407 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21504829 4896 2012-07-12 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000835 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-12-02 (Fig. 2B, lanes 5-13) PomBase SPBC947.10 FYPO:0003935 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1486.02c) PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001422 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001422 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:21504829 4896 2012-08-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001422 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-12-02 (Fig. 2B) "Sre1 cleavage defect under low oxygen" PomBase SPBC947.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000836 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000046671),assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:27655872 4896 2016-12-02 (Fig. 3D, compare lanes 3 and 4) PomBase SPBC947.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21504829 4896 2012-07-12 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000833 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 We constructed mutants of E3 ligases and their components that have been suggested to localize to or function in the ER and nucleus, namely ......... The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPBC947.10 FYPO:0002332 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1734.04) PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001423 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:21504829 4896 2012-08-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000601 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:21504829 4896 2012-08-16 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001357 deletion 972 h- dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dsc1 dsc1delta 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E39K Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Cs3-39 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0002243 C(-33)T Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-5'-UTR-uAUG nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G181C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G181C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G181C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G181C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000705 F206A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-F206A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:22669973 4896 2013-01-24 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001913 F206A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-F206A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:22669973 4896 2013-02-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000940 F206A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-F206A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:22669973 4896 2013-01-24 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000703 1-592 Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1(593-830) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000703 498-648 Overexpression 972 h- rad4 rad4-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:24663817 4896 2020-03-09 (Fig. 5A and B) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000725 498-648 Overexpression 972 h- rad4 rad4-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000162 PMID:24663817 4896 2020-02-22 Interestingly, the DC mutant with the deletion of the whole C-terminus between amino acid 498 and 648 was resistant to HU and MMS almost like the wild type cells (Fig. 1D and 2B). The only difference we could readily find for the DC mutant was that the protein level was higher than in the wild type cells (Fig. 2C), suggesting that the C-terminus may not contain a robust AAD (see below). 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h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000226 PMID:24806966 4896 2014-06-11 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0002254 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:18615848 4896 2015-02-13 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0005453 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000337 PMID:17724078 4896 2016-06-24 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0005140 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000337 PMID:15238514 4896 2015-12-11 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0003486 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:29851556 4896 2019-05-08 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad50 rad50delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0005451 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-24 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000278 deletion 972 h- h90 rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 the h90 rad50D or h90 mre11D (data not shown) mutant forms small colonies. However, these colonies contain many dead cells and few spores. Table 1. PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000278 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0004287 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000126 PMID:28292918 4896 2017-04-11 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0004287 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000059 PMID:23188080 4896 2020-10-15 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000185 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-21 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0004867 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30104346 4896 2018-08-29 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0005431 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000049 PMID:12019258 4896 2016-06-17 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0005388 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:12861005 4896 2016-05-04 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0005388 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:12023299 4896 2016-05-04 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0001645 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:29851556 4896 2019-05-08 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0003589 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29215009 4896 2018-01-05 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0003589 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 PMID:23093942 4896 2014-07-24 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0000581 deletion 972 h- rad50 rad50delta deletion ECO:0005638 high PMID:15238514 4896 2015-12-10 PomBase 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PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000799 I107A Not assayed or wild type 972 h- oxs1 oxs1-I107A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30181192 4896 2020-12-15 PomBase SPAC22F3.05c FYPO:0000338 L36Q Not assayed or wild type 972 h- alp41 alp41-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC22F3.05c FYPO:0000016 L36Q Not assayed or wild type 972 h- alp41 alp41-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC22F3.05c FYPO:0000082 L36Q Not assayed or wild type 972 h- alp41 alp41-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC22F3.05c FYPO:0002462 L36Q Not assayed or wild type 972 h- alp41 alp41-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC22F3.05c FYPO:0002004 L36Q Not assayed or wild type 972 h- alp41 alp41-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:32896087 4896 2020-09-29 PomBase SPBC1652.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1652.02 SPBC1652.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1652.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1652.02 SPBC1652.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1652.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1652.02 SPBC1652.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.06 FYPO:0005351 D248K Not assayed or wild type 972 h- tif224 tif224-D248K amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(GO:0005851) PMID:26901872 4896 2016-04-05 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0001571 S26A,S33A,S109A,S155A,S165A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-5A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.03c),assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:34208949 4896 2021-07-15 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0005681 S147E,S151E Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-S147E,S151E mal3-147E/151E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000140 PMID:22134091 4896 2019-10-30 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002636 S147E,S151E Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-S147E,S151E mal3-147E/151E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. 7F) PomBase SPCC645.05c FYPO:0001122 1-780 Overexpression 972 h- myo2 myo2-tail myo2t-781-1526 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15184401 4896 2019-12-13 (Fig. 1E) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002133 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000835 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-16 Trt1 binding is reduced to ~58% of pof8+ cells, but not as severely reduced as pof8∆ cells (~35%). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000826 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003555 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003106 Y330A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-Y330A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6) pof8-Y330A cells show as short telomere as pof8∆ cells. PomBase SPBC16G5.12c FYPO:0004355 wild type Knockdown 972 h- Pnmt41+thiamine top3 top3+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1259.13) PMID:15340008 4896 2024-03-14 (Fig. 4C) PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- mlo3 mlo3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003166 wild type Overexpression 972 h- mlo3 mlo3+ wild_type ECO:0001232 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPCC188.06c FYPO:0000082 R398A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R398A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002060 R398A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R398A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPAC823.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC823.09c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0001029 deletion 972 h- SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC823.09c FYPO:0000725 deletion 972 h- SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC823.09c FYPO:0000725 deletion 972 h- SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC823.09c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0007932 deletion 972 h- SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC823.09c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC823.09c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC823.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC823.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC823.09c SPAC823.09cdelta deletion ECO:0001232 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PomBase SPBC17D1.06 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dbp3 dbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dbp3 dbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.06 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph dbp3 dbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dbp3 dbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.06 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dbp3 dbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.06 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph dbp3 dbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 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SPBC146.09c FYPO:0000888 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32295063 4896 2020-10-01 PomBase SPBC146.09c FYPO:0002355 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32295063 4896 2020-10-01 PomBase SPBC146.09c FYPO:0004137 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32295063 4896 2020-10-01 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000584 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000015 high PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPBC146.09c FYPO:0007339 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:32295063 4896 2020-07-28 PomBase SPBC146.09c FYPO:0006110 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 high PMID:32295063 4896 2020-07-28 PomBase SPBC146.09c FYPO:0005917 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 high PMID:32295063 4896 2020-07-28 PomBase SPBC146.09c FYPO:0001252 841-1000 Knockdown 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003074 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002827 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0005638 PMID:8138176 4896 2014-08-12 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003096 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0000112 high PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003571 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0000112 high PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003573 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000584 unknown Not assayed or wild type 972 h- rik1 rik1-304 unknown ECO:0005638 PMID:15197176 4896 2015-10-21 PomBase SPAC227.07c FYPO:0000775 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:24634168 4896 2016-06-22 PomBase SPAC227.07c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 low PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 2A) PomBase SPAC227.07c FYPO:0001407 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000335 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24634168 4896 2016-06-22 PomBase SPAC227.07c FYPO:0005458 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000335 FYECO:0000025 PMID:24634168 4896 2016-06-22 PomBase SPAC227.07c FYPO:0001117 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:24634168 4896 2016-06-22 PomBase SPAC227.07c FYPO:0002021 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0001232 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 6A) PomBase SPAC227.07c FYPO:0007388 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0001232 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 6A) PomBase SPAC227.07c FYPO:0007568 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 3A) PomBase SPAC227.07c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 1A and B) PomBase SPAC227.07c FYPO:0001214 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000335 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:24634168 4896 2017-01-10 PomBase SPAC227.07c FYPO:0000271 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000335 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:24634168 4896 2016-06-22 PomBase SPAC227.07c FYPO:0000841 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 1B) PomBase SPAC227.07c FYPO:0000112 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0000335 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24634168 4896 2016-06-22 PomBase SPAC227.07c FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-4 ret1-4 unknown ECO:0001232 PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 1A) PomBase SPCC970.12 FYPO:0001269 unknown Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02) PMID:24774534 4896 2014-06-25 PomBase SPCC970.12 FYPO:0001269 unknown Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC776.16) PMID:24774534 4896 2014-06-25 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000801 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 PMID:39509469 4896 2025-01-27 (Fig. S5C) PomBase SPCC645.07 FYPO:0006745 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 PMID:29689193 4896 2018-11-11 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000031 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 99 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPCC645.07 FYPO:0005189 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000059 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001018 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0003535 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 high PMID:19189958 4896 2022-01-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0003535 deletion 972 h- cdc10-129 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 3B) 55% of cdc10-129 cells displayed bipolar growth, whereas only 4% of cdc10-129 rgf1+ cells were bipolar PomBase SPCC645.07 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0007182 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 PMID:39509469 4896 2024-12-17 (Fig. 1G) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001529 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 4B) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001529 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:19037094 4896 2025-02-03 (Fig. 6A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0007450 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 1A, B and F) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000470 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001324 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000335 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:16421249 4896 2022-01-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0005798 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1223.06) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 1C) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002679 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000025 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002679 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000392 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4C) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002376 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4B) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001885 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0003946 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PR:000050473) PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 6) PomBase SPCC645.07 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC645.07 FYPO:0003545 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000059 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000972 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0007526 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 5) PomBase SPCC645.07 FYPO:0004511 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:39509469 4896 2024-12-17 (Fig. 1H) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001397 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 3A) As shown in Figure 3A, the rgf1 mutants showed a defect in actin organization in that they organized actin patches mostly at one end of the cell only PomBase SPCC645.07 FYPO:0001366 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 3A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001367 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 PMID:16291723 4896 2021-12-29 (Fig. 6) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001789 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:39509469 4896 2025-01-27 (Fig. S5G) PomBase SPCC645.07 FYPO:0008003 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC645.07 FYPO:0004422 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:39509469 4896 2025-01-27 (Fig. S5H) PomBase SPCC645.07 FYPO:0004422 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4E) PomBase SPCC645.07 FYPO:0004422 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 5) PomBase SPCC645.07 FYPO:0003214 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4F) PomBase SPCC645.07 FYPO:0004154 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 4D) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001357 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 2B) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC645.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC645.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001473 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001473 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 2A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPCC645.07 FYPO:0002720 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 PMID:19037094 4896 2025-02-03 (Fig. 2B) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000079 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000079 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 1, Fig. 2D and Fig. 3) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000079 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 PMID:16421249 4896 2022-01-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000088 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPCC645.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001234 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2A The resulting strain, rgf1+, showed a slow growth pattern at 28°C PomBase SPCC645.07 FYPO:0002848 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 55 PMID:39509469 4896 2024-12-17 (Fig. 2B) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 30-35 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2B) regardless of the growth temperature 30 -35% of the cells were lysed PomBase SPCC645.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 30-35 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2B) regardless of the growth temperature 30 -35% of the cells were lysed PomBase SPCC645.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- cdc10-129 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 30-45 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2B) regardless of the growth temperature 30 -35% of the cells were lysed PomBase SPCC645.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 55 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 >90 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2B) regardless of the growth temperature 30 -35% of the cells were lysed PomBase SPCC645.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC645.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- rgf1 rgf1delta deletion ECO:0005638 PMID:16291723 4896 2021-12-29 PomBase SPCC645.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rgf1 rgf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrm2 mrm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0004325 deletion 972 h- mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 low PMID:24223771 4896 2024-12-06 (Fig. 6C) PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mrm2 mrm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- mrm2 mrm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrm2 mrm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrm2 mrm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 E97A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 E97A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000957 E97A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E97A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E97A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 E97A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- cdc12 cdc12+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15743909 4896 2017-09-13 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0003824 deletion 972 h- ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ggg1 ggg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- ggg1 ggg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ggg1 ggg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ggg1 ggg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0006745 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 PMID:29689193 4896 2018-11-11 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008012 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 PMID:34666001 4896 2022-06-30 In microchannels, where clusters form at high frequency, due to larger and more frequent compressive mechanical stresses onto the CWs, the survival behavior was markedly different. First, wsc1D cells exhibited a much higher yield of death of $28%. Second, all alleles exhibited a high yield of death around $25% including wsc1DWSC PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000114 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:23907979 4896 2022-07-01 GTP bound modified form . Interestingly, mtl2D and wsc1D mutants contained much less Rho1p-GTP than wild-type cells when the cultures were grown in the presence of 0.1 lg/mL of Csp for 16 h prior to harvesting (Fig. 4C) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000760 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 PMID:23907979 4896 2022-07-01 The mating rate was not affected in mtl2Δh+ × mtl2Δh− or wsc1Δh+ × wsc1Δh− homozygous crosses PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0003627 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:23907979 4896 2022-07-01 . Interestingly, mtl2D and wsc1D mutants contained much less Rho1p-GTP than wild-type cells when the cultures were grown in the presence of 0.1 lg/mL of Csp for 16 h prior to harvesting (Fig. 4C) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0003627 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.06) PMID:23907979 4896 2022-07-01 . Interestingly, mtl2D and wsc1D mutants contained much less Rho1p-GTP than wild-type cells when the cultures were grown in the presence of 0.1 lg/mL of Csp for 16 h prior to harvesting (Fig. 4C) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0003627 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC645.06c) PMID:23907979 4896 2022-07-01 . Interestingly, mtl2D and wsc1D mutants contained much less Rho1p-GTP than wild-type cells when the cultures were grown in the presence of 0.1 lg/mL of Csp for 16 h prior to harvesting (Fig. 4C) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0001315 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 PMID:23907979 4896 2022-07-01 wsc1D and mtl2D cells did not exhibit any evident morphological changes (Fig. 1B) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23907979 4896 2023-01-25 The wsc1D and mtl2D mutants grew well under standard growth conditions at both 28 and 37°C and entered the stationary phase at the same time as the wild-type cultures. PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:23907979 4896 2022-07-01 The wsc1D and mtl2D mutants grew well under standard growth conditions at both 28 and 37°C and entered the stationary phase at the same time as the wild-type cultures. PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0005253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000105 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:23907979 4896 2022-07-01 wsc1D cell growth was inhibited above 2 lg/mL of Csp (Fig. 1C) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph wsc1 wsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000647 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 8 PMID:23907979 4896 2022-07-01 ~8% of the cells in the wsc1D mutant and 15% of the cells in mtl2D were lysed (Fig. 1B) PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0000647 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 26 PMID:34666001 4896 2022-06-30 n these videos, we did not detect any lysis in WT red cells, but a high incidence of dying wsc1DCC-GFP of $26% PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wsc1 wsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.06c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC777.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC777.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC777.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC777.06c SPCC777.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0002170 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssl1 ssl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssl1 ssl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- ssl1 ssl1delta deletion ECO:0005638 PMID:10077189 4896 2014-09-11 PomBase SPCC1682.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- ssl1 ssl1delta 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PMID:31341193 4896 2019-08-01 (Fig. 5) PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0001214 deletion 972 h- gga21 gga21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 low PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) We found that apm1delta, gga22delta, and gga21delta gga22delta (denoted by ggadeltadelta in the Figure 8) were sensitive to both high concentrations of K+ salts and sorbitol (Figure 8), which showed that they were defective in growth under osmotic stress. PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- gga21 gga21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga21 gga21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F3.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga21 gga21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0001645 W519R Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-W519R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0002019 W519R Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-W519R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0002887 W519R Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-W519R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0002887 W519R Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-W519R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0005553 W519R Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-W519R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-08-03 PomBase SPBC215.03c FYPO:0002890 Q9* Not assayed or wild type 972 h- csn1 csn1-E46 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25492408 4896 2015-08-07 PomBase SPBC215.03c FYPO:0004966 Q9* Not assayed or wild type 972 h- csn1 csn1-E46 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25492408 4896 2015-08-07 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0004867 554-613 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-c60-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 medium PMID:29851556 4896 2019-04-30 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0004656 554-613 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-c60-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0001690 554-613 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-c60-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:29851556 4896 2019-04-30 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0002887 554-613 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-c60-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0002887 554-613 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-c60-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0002687 554-613 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-c60-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC557.03c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP pim1 pim1+ wild_type ECO:0005638 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2024-12-31 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- mpc1 mpc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mpc1 mpc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0000067 deletion 972 h- mpc1 mpc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0003824 deletion 972 h- mpc1 mpc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpc1 mpc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- mpc1 mpc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1235.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpc1 mpc1delta 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2024-07-25 (Fig. 8A) PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 8A) PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 9) PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37772819 4896 2023-10-06 (Fig. 7) PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 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siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph siw14 siw14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- siw14 siw14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 siw14 siw14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 siw14 siw14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0004007 (-365)-(-234) Not assayed or wild type 972 h- gsa1 gsa1--365--234 partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.04) PMID:15529002 4896 2014-11-20 PomBase SPCC794.12c FYPO:0002622 unknown Not assayed or wild type 972 h- mae2 mae2- unknown ECO:0005801 PMID:11453251 4896 2013-09-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000705 1-300 Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1deltaN300 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 3) PomBase SPBC409.07c FYPO:0003075 1-300 Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1deltaN300 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173,T171) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 3) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0008198 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Fig. 2D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001130 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 Cter-GFP mutated in the helix (Helix* Cter-GFP) was concentrated in the nucleus, even during mitosis (arrow in Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fal1 fal1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27365210 4896 2024-01-16 While viable, pfal1Δ showed a strong growth defect at all three temperatures tested (Fig. 1A). PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:27365210 4896 2024-01-16 While viable, pfal1Δ showed a strong growth defect at all three temperatures tested (Fig. 1A). PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:27365210 4896 2024-01-16 While viable, pfal1Δ showed a strong growth defect at all three temperatures tested (Fig. 1A). PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0007086 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000180 PMID:39105351 4896 2024-10-01 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0002960 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:27365210 4896 2024-01-16 We chose to study mei4 + and ssm4 + transcripts because they both contain a DSR region (.........we observed an increase in mei4 + and ssm4 + transcripts during vegetative growth in cells containing red5-2 (Fig. 1D). PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0002960 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 low assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:27365210 4896 2024-01-16 We chose to study mei4 + and ssm4 + transcripts because they both contain a DSR region (.........we observed an increase in mei4 + and ssm4 + transcripts during vegetative growth in cells containing red5-2 (Fig. 1D). PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0008427 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fal1 fal1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0008319 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000180 PMID:39105351 4896 2024-10-01 In Δfal1 cells, sulfur depletion induced the cleavage of GFP-Atg8, resulting in free-GFP, which confirms the occurrence of autophagy (Figure 2a). PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F5.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fal1 fal1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000963 S562A Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-S562A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000957 S562A Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-S562A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 K75E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 K75E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 K75E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 K75E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003106 K75E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0000470 deletion 972 h- rpl302 rpl302delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB8E5.06c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph rpl302 rpl302delta deletion ECO:0005638 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atg101 atg101delta mug66delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. 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List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPAC22E12.14c FYPO:0007938 deletion 972 h- sck2 sck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC22E12.14c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sck2 sck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.14c FYPO:0000091 deletion 972 h- sck2 sck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC22E12.14c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph sck2 sck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.14c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph sck2 sck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.14c FYPO:0000268 deletion 972 h- sck2 sck2delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001586 391-497 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2deltaFAT1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Spa2 lacking FAT1 did not have a change in cell division site localization but was decreased in abundance at cell tips by ∼32% compared to levels of wild-type Spa2 (Fig. 2E,F; Fig. S2F). PomBase SPAC30D11.01c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gto2 gto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30D11.01c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph gto2 gto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.01c FYPO:0001175 deletion 972 h- gto2 gto2delta deletion ECO:0005638 PMID:24224056 4896 2013-11-20 PomBase SPAC30D11.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gto2 gto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.01c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph gto2 gto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph gto2 gto2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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SPAC30D11.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gto2 gto2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0003440 Nak1-Mor2 fusion protein Not assayed or wild type 972 h- mor2 nak1-mor2 fusion_or_chimera ECO:0001232 20 PMID:24972934 4896 2025-04-17 (Fig. 1) PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0003440 Nak1-Mor2 fusion protein Not assayed or wild type 972 h- mor2 nak1-mor2 fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000025 3 PMID:24972934 4896 2025-04-17 (Fig. 1) PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0008401 Nak1-Mor2 fusion protein Not assayed or wild type 972 h- mor2 nak1-mor2 fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:24972934 4896 2025-04-17 (Fig. 3) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 Y167F Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-Y167F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 Y167F Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-Y167F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001245 857-1097 Not assayed or wild type 972 h- dsc1 dsc1-delta857-1097 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001355 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000085 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000088 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000267 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000268 L77K,L154D Knockdown 972 h- mre11 mre11-L77K,L154D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 K231A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-K231A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0002134 K231A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-K231A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004250 362-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-361 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-13 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004248 362-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-361 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c) PMID:30451685 4896 2018-12-13 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0006784 362-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-361 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-13 (Figure 3—Figure supplement 1B, 2B) PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rnh201 rnh201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnh201 rnh201delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0001690 deletion 972 h- rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 PMID:29622660 4896 2018-04-12 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0005680 deletion 972 h- rnh201 rnh201delta deletion ECO:0006031 PMID:29622660 4896 2018-04-12 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 low PMID:29622660 4896 2018-04-12 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph rnh201 rnh201delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- rnh201 rnh201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnh201 rnh201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnh201 rnh201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0002223 unknown Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1- unknown ECO:0001232 PMID:3861929 4896 2014-04-04 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000168 I194A Not assayed or wild type 972 h- nda1- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000117 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0008404 I194A Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.06c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 7C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000912 I194A Not assayed or wild type 972 h- mts3-1 dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:36138017 4896 2023-01-18 (Fig. 2d) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000912 I194A Not assayed or wild type 972 h- mts3-1 dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:29975113 4896 2018-07-31 (Figure 2D) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001876 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:29975113 4896 2018-07-17 (DNS) Dma1-I194A constitutively localizes to SPB throughout the cell cycle. Dma1-I194A localizes more intensely at one of the two SPBs for most of mitosis PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005226 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000112 complete high assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-01-12 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0007946 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-01-12 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000836 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:29975113 4896 2018-07-17 (Figure 2B and C) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000836 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:29975113 4896 2018-07-17 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002657 I194A Not assayed or wild type 972 h- mts3-1 dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:36138017 4896 2023-01-20 (Fig. 4) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0004601 I194A Not assayed or wild type 972 h- mts3-1 dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:36138017 4896 2023-01-20 though HU treatment caused equally efficient arrest at S phase in both wild-type and dma1Δ cells (Supplementary Fig. 4) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0001017 I194A Not assayed or wild type 972 h- mts3-1 dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000170 PMID:36138017 4896 2023-01-20 (Fig. 4) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0006824 I194A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-I194A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:21131906 4896 2013-08-15 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0001045 H71A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-H71A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 6B) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 H71A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-H71A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S2) PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000833 H71A Not assayed or wild type 972 h- pin1 pin1-H71A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC16C4.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S2) PomBase SPBC409.07c FYPO:0007332 C458S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C458S amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:31932483 4896 2020-10-01 (Fig. 6F) PomBase SPBC409.07c FYPO:0004333 C458S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C458S amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31932483 4896 2020-10-07 (Fig. 4A) PomBase SPBC409.07c FYPO:0005947 C458S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C458S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-13 (Fig. 4B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0003075 C458S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C458S amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC409.07c),assayed_substrate(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31932483 4896 2020-10-08 (Fig. 2) PomBase SPBC409.07c FYPO:0000087 C458S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C458S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-12 (Fig. 4B) PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.05c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vps41 vps41delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000082 T164A Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-L2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 A spot assay revealed that sid1-L2 had an intermediate restrictive temperature compared to sid1-125 and sid1-239 (Figure 1F). PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp5 prp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp5 prp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp5 prp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp5 prp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp5 prp5delta deletion ECO:0005638 PMID:10409726 4896 2014-07-21 PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0003412 sgf11::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 sgf11 sgf11::Tn-seq disruption ECO:0000049 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PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0002061 D70N Not assayed or wild type 972 h- ppa2 ppa2-D70N ppa2-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:22267499 4896 2023-02-04 ppa2-6 is cold sensitive and undergoes only a few divisions after a shift to 19 (Table S1, Figure 1, A and B). PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0000339 D70N Not assayed or wild type 972 h- ppa2 ppa2-D70N ppa2-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 26.2 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Table 2) PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0000339 D70N Not assayed or wild type 972 h- ppa2 ppa2-D70N ppa2-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 23.1 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Table 2) PomBase SPBC16H5.07c FYPO:0000648 D70N Not assayed or wild type 972 h- ppa2 ppa2-D70N ppa2-6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Figure 4b) PomBase SPAC977.07c FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- pfl6 pfl6+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 3) PomBase SPBC3D6.11c FYPO:0000141 unknown Not assayed or wild type 972 h- slx8 slx8-29 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228 32 PMID:27398807 4896 2016-08-25 PomBase SPBC3D6.11c FYPO:0005630 unknown Not assayed or wild type 972 h- slx8 slx8-29 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:26221037 4896 2016-08-26 PomBase SPBC3D6.11c 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assayed_using(PomBase:SPAC11E3.08c),assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 7A) PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000703 226-836 Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-heads partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC651.10) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 6B, lane 3) PomBase SPCC663.12 FYPO:0000220 D77A,D79A Not assayed or wild type 972 h- cid12 cid12-DADA cid12DADA amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:16738311 4896 2014-12-23 PomBase SPCC663.12 FYPO:0000228 D77A,D79A Not assayed or wild type 972 h- cid12 cid12-DADA cid12DADA amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:16738311 4896 2014-12-23 PomBase SPCC663.12 FYPO:0000091 D77A,D79A Not assayed or wild type 972 h- cid12 cid12-DADA cid12DADA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:16738311 4896 2014-12-23 PomBase SPCC23B6.02c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ecm1 ecm1delta deletion ECO:0005638 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SPCC23B6.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ecm1 ecm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC23B6.02c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ecm1 ecm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC23B6.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- ecm1 ecm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC23B6.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ecm1 ecm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC23B6.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ecm1 ecm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000674 551-580 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(1-550) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Fig. 6D) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 551-580 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(1-550) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Fig. 6D) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000354 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC830.08c) PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Figure 2A and 2B) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0003779 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0003783 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0006433 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 PMID:37553386 4896 2024-03-22 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0007572 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 PMID:19571115 4896 2020-12-18 (Fig. 5a) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0007268 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Figure S3C). the cortical tubular ER pattern changes slower than wild type PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0003778 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.04) PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Figure 2A and 2B) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0003778 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC830.08c) PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Figure 2A and 2B) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0003210 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0001232 >40 PMID:20434336 4896 2018-03-08 (Fig. 3) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0000411 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 PMID:19571115 4896 2020-12-18 (Fig. 5B) PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0007448 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0000112 PMID:37191320 4896 2023-06-04 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8873452 4896 2013-02-01 PomBase SPBC31A8.01c FYPO:0001357 deletion 972 h- rtn1 rtn1delta 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PomBase SPCC736.15 FYPO:0007273 267-351 Not assayed or wild type 972 h- pil1 pil1-Nter pil1N partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Figure S5G). the cortical tubular ER pattern changes faster than wild type PomBase SPAC8C9.14 FYPO:0001043 D418N Not assayed or wild type 972 h- prr1 prr1-D418N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000254 PMID:12723602 4896 2014-09-25 PomBase SPAC8C9.14 FYPO:0001043 D418N Not assayed or wild type 972 h- prr1 prr1-D418N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:12723602 4896 2014-09-25 PomBase SPAC8C9.14 FYPO:0001043 D418N Not assayed or wild type 972 h- prr1 prr1-D418N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:12723602 4896 2014-09-25 PomBase SPAC8C9.14 FYPO:0002020 D418N Not assayed or wild type 972 h- prr1 prr1-D418N amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:12723602 4896 2014-09-25 PomBase SPAC8C9.14 FYPO:0002020 D418N Not assayed or wild type 972 h- prr1 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Spt20 is therefore essential for Tra1 incorporation into SAGA. 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puf3 puf3-delta181 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000356 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000769 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1C) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006667 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 3C) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000062 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:31015410 4896 2019-06-06 (Fig. 3c) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0003783 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high high assayed_using(PomBase:SPAC1786.03) PMID:32848252 4896 2020-09-05 Extended Data Fig. 4 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0007547 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 high PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 3E) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0005584 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0005585 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006664 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 ~6 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4E) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001556 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 complete high PMID:32848252 4896 2020-09-05 (Fig. 4, 6) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001556 deletion 972 h- KanMX6 nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33419777 4896 2021-02-24 (Fig. 4A) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0007457 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high high PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006662 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 ~40 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4A,E) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006345 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1952.13) PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 3) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0008171 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 3D) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006665 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 ~52 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4E) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006926 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 medium PMID:31015410 4896 2019-06-03 (Fig. 3c) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006926 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6? nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0002703 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.02c) PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4C) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0007974 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 PMID:35293864 4896 2022-04-14 (Fig. 4) Figure supplement 2 We found that in both les1Δ and nem1Δ cells microtubule growth speed inside the nuclear bridge was faster than in wild-type cells PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000238 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0002552 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0000112 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 3) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0002552 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006660 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001673 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 ~2 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4E) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0004467 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 5G) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001266 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 5H) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0004725 deletion 972 h- nem1 nem1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high high PMID:32848252 4896 2020-09-05 (Fig. 4,6) PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph nem1 nem1delta deletion ECO:0005638 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4896 2016-07-13 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0007472 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000226 PMID:27268234 4896 2024-05-11 (Fig. S6) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006403 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006403 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006403 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006403 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13D6.02c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006403 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.09) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002919 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:30773398 4896 2019-04-13 (Figure 1E) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002919 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:16087749 4896 2024-02-15 As shown in Fig. 4A, deletion of set2+ resulted in a complete abolishment of K36 methylation (mono-, di-, and trimethylation), but not K4 methylation or H3 K9 acetylation, in bulk histones PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006402 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006402 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006402 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006402 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13D6.02c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006402 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.09) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006401 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004604 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0005638 PMID:26205977 4896 2016-07-13 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006857 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:30773398 4896 2019-04-13 (Figure 1E) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000470 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004193 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000110 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004193 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000110 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004193 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000288,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004193 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000288,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005314 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002387 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:26804021 4896 2016-03-01 (Fig. 4c) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002975 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002975 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAP14E8.02) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPAP14E8.02) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000277 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.07c) PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005528 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:26205977 4896 2016-07-01 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 PMID:16087749 4896 2024-02-15 set2Δ cells grew normally on rich YEA medium, they showed a strong growth defect in synthetic medium (EMM), which is nutrient depleted compared to YEA (Fig. 4B). PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0003557 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0003557 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC336.07) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0003557 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0003557 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000291 PMID:27268234 4896 2024-05-08 (Fig. S6) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0003557 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002913 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000231 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 4 and Supplementary Fig S5) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000220 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 low PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000614 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000110 PMID:28903048 4896 2018-02-20 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000614 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000288,FYECO:0000291 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005518 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Supplementary Fig S8) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005518 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005310 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 low PMID:23032292 4896 2020-04-09 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0008219 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000226 medium PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. 3A) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004347 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000892 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 low PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0008220 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000226 medium PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. 3B) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006400 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006400 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000006 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 5A) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000291 PMID:26205977 4896 2016-07-13 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 set2 set2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 set2 set2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 set2 set2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0008221 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. S5A) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0008222 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. S5B) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0008223 deletion 972 h- cdc25-22 set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:27268234 4896 2024-05-13 (Fig. S5B) PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005336 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0004474 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000857 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000059 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005614 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0005614 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002099 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0003530 deletion 972 h- set2 set2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph set2 set2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph 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PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set2 set2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.22 FYPO:0000359 deletion 972 h- pog1 pog1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:17868468 4896 2015-02-25 PomBase SPCC24B10.22 FYPO:0001934 deletion 972 h- pog1 pog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000054 PMID:17868468 4896 2015-02-25 PomBase SPCC24B10.22 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph pog1 pog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.22 FYPO:0003769 deletion 972 h- pog1 pog1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 high PMID:17868468 4896 2015-02-25 PomBase SPCC24B10.22 FYPO:0001355 deletion 972 h- pog1 pog1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:17868468 4896 2015-02-25 PomBase SPCC24B10.22 FYPO:0001406 deletion 972 h- pog1 pog1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 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(Figure 3a) PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000760 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0001232 PMID:8943016 4896 2014-12-09 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0006437 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0000112 PMID:37237082 4896 2023-06-09 Normal Chk1 phosphorylation and cell cycle arrest PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0003075 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC821.12),assayed_substrate(PomBase:SPAC821.12) PMID:12646585 4896 2017-08-16 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0002442 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC821.12) PMID:12646585 4896 2017-08-16 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000703 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC890.07c),assayed_using(PomBase:SPBC16E9.12c) PMID:17213188 4896 2017-07-14 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000590 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 PMID:8943016 4896 2014-12-09 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0001234 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:8943016 4896 2014-12-09 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 skb1 skb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0006822 deletion 972 h- skb1 skb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:9843966 4896 2014-09-04 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0003612 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2017-12-01 PomBase SPCC63.08c FYPO:0007500 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0000112 PMID:33064910 4896 2020-10-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0004671 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.11c) PMID:25803873 4896 2018-01-12 PomBase SPCC63.08c FYPO:0004671 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPCC63.08c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph atg1 atg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000303 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0001232 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0001232 high PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPCC63.08c FYPO:0002798 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0000059 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPCC63.08c FYPO:0006376 deletion 972 h- atg1 atg1delta deletion ECO:0000112 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2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1259.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1259.08 SPCC1259.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0008157 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:16246721 4896 2024-01-25 mutant cells are defective in histone deacetylation and silencing at the mat2/3 locus (see Figure S1 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000853 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6E) PomBase SPBC800.03 FYPO:0007336 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 97.89 PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 1C, 1D) PomBase SPBC800.03 FYPO:0001168 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6D) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003217 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003411 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000291 medium PMID:19443688 4896 2024-08-22 (Fig. 4C) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6A) both clr3D232N and mit1K587A mutant alleles alleviated silencing of a marker gene inserted at pericentromeric repeats PomBase SPBC800.03 FYPO:0003412 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:9755190 4896 2019-05-11 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:8001791 4896 2013-11-13 PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6B) PomBase SPBC800.03 FYPO:0002827 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9755190 4896 2019-05-10 PomBase SPBC800.03 FYPO:0004604 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6B) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003704 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 6D) PomBase SPBC800.03 FYPO:0005845 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 1E, 1F) PomBase SPBC800.03 FYPO:0005154 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:39096900 4896 2025-06-26 (Fig. 1G) PomBase SPBC800.03 FYPO:0003573 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:16246721 4896 2024-01-25 These data, together with results showing defects in Swi6 localization at the mat locus in clr3-735 cells (see below; Figure S2) PomBase SPBC800.03 FYPO:0007891 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:16246721 4896 2024-01-25 ChIP analysis revealed that the Clr3 mutant protein was mainly restricted to the nucleation site adjacent to the mat3 locus and the spreading of Clr3 across the mat2/3 region was severely affected (Figure 2A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0007891 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000226 high PMID:16246721 4896 2024-01-25 Surprisingly, except for a small but reproducible enrichment of Clr3 at the nucleation site, Clr3 was virtually absent from the entire mat2/3 region in a sir2D strain (Figure 2A). PomBase SPBC800.03 FYPO:0005310 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0000487 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8001791 4896 2013-11-18 PomBase SPBC800.03 FYPO:0005311 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPBC800.03 FYPO:0003223 D232N Not assayed or wild type 972 h- clr3 clr3-735 clr3-D232N|clr3D232N amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:12193658 4896 2016-03-01 PomBase SPCC645.07 FYPO:0003208 1-303 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaNterm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0005338 1-303 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaNterm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001130 1-303 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaNterm partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000963 1-303 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-deltaNterm partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001355 316-1150 Overexpression 972 h- rga1 rga1-N1(1-315) rga1N1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001315 316-1150 Overexpression 972 h- rga1 rga1-N1(1-315) rga1N1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC32H8.04c FYPO:0007065 wild type Knockdown 972 h- utp24 utp24+ wild_type ECO:0000291 PMID:29641590 4896 2019-08-13 (Fig. 3) PomBase SPBC32H8.04c FYPO:0007069 wild type Knockdown 972 h- utp24 utp24+ wild_type ECO:0000291 PMID:29641590 4896 2019-08-13 PomBase SPBC32H8.04c FYPO:0007064 wild type Knockdown 972 h- utp24 utp24+ wild_type ECO:0000291 PMID:29641590 4896 2019-08-13 (Fig. 3) PomBase SPBC32H8.04c FYPO:0007063 wild type Knockdown 972 h- utp24 utp24+ wild_type ECO:0000291 PMID:29641590 4896 2019-08-13 (Fig. 3) PomBase SPBC32H8.04c FYPO:0001135 wild type Knockdown 972 h- utp24 utp24+ wild_type ECO:0000291 PMID:29641590 4896 2019-08-13 (Fig. 3) PomBase SPBC32H8.04c FYPO:0007066 wild type Knockdown 972 h- utp24 utp24+ wild_type ECO:0000291 PMID:29641590 4896 2019-08-13 PomBase SPBC3B9.21 FYPO:0003941 W107A Not assayed or wild type 972 h- dcp1 dcp1-W107A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:27183195 4896 2016-08-03 PomBase SPSNRNA.04 FYPO:0002061 GCTAGT59CGATCG Not assayed or wild type 972 h- snu4 snu4-7 snu4.7 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:1441744 4896 2014-06-19 PomBase SPAC56E4.04c 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2023-06-28 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph eti1 eti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph eti1 eti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eti1 eti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 eti1 eti1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- eti1 eti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eti1 eti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC12G12.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eti1 eti1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000705 1-898 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-899-990 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.08c) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000705 1-898 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-899-990 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0000705 V287D Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-V287D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007688 K762M Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-K762M bub1-KD(b) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:16360688 4896 2024-04-24 Similarly, we found that Sgo1 was mislocalized in a different allele (Figure 1D, K762M [6]) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008202 K762M Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-K762M bub1-KD(b) amino_acid_mutation ECO:0001232 ~22 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1c) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004214 K762M Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-K762M bub1-KD(b) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16360688 4896 2024-04-24 However, we found that Bub1K762M was properly localized in metaphase I cells and that the amount of protein at centromeres was close to wild-type levels (Figure S1). PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005633 K762M Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-K762M bub1-KD(b) amino_acid_mutation ECO:0001232 ~25 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1c) a high frequency of sister-chromatid nondisjunction during MII (Figure 1C), consistent with Sgo1’s being largely nonfunctional in this mutant background. 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2018-01-22 An increased resistance to cell lysis induced by the presence of higher concentration of 2-deoxyglucose in the vegetative growth phase of life cycle of cell PomBase SPBC215.10 FYPO:0000064 wild type Overexpression 972 h- odr1 odr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:27481777 4896 2016-08-04 PomBase SPBC215.10 FYPO:0000064 wild type Overexpression 972 h- odr1 odr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000104 high PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.08 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph ubp6 ubp6delta deletion ECO:0005638 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typo) PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002967 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-140 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10837231 4896 2025-01-28 GFP-Mob1p localization to the SPB was unaffected in sid1, sid2, spg1 and cdc14 mutants (Figure 4a and data not shown) PomBase SPBC317.01 FYPO:0003318 deletion 972 h- mbx2 mbx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 1B) PomBase SPBC317.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mbx2 mbx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC317.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mbx2 mbx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC317.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mbx2 mbx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC317.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mbx2 mbx2delta 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph atp20 atp20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- atp20 atp20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp20 atp20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp20 atp20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.08c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ism1 ism1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- ism1 ism1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC18B5.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ism1 ism1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC342.05 FYPO:0004870 S548A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S548A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000305 PMID:20679485 4896 2018-09-14 PomBase SPBC342.05 FYPO:0004869 S548A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S548A amino_acid_mutation ECO:0000092 FYECO:0000305 medium PMID:20679485 4896 2018-09-13 PomBase SPBC342.05 FYPO:0002679 S548A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-S548A amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000137,FYECO:0000305 medium assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:20679485 4896 2018-09-14 PomBase SPBC4.04c FYPO:0007160 D87G,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:38285941 4896 2024-03-24 PomBase SPBC4.04c FYPO:0003044 D87G,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:38285941 4896 2024-03-15 , mcm2-1 and mcl1-4 cells failed to maintain heterochromatin, as indicated by white colony color and loss of the H3K9me3 mark (SI Appendix, Fig. S7). Thus, both Mcl1 and Mcm2 are required for propagation of heterochromatin at an ectopic site. PomBase SPBC4.04c FYPO:0003247 D87G,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:38285941 4896 2024-03-24 (Fig. 4E and F). PomBase SPBC4.04c FYPO:0008187 D87G,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:38285941 4896 2024-03-24 (Fig. 4E and F). PomBase SPBC4.04c FYPO:0002827 D87G,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 PMID:38285941 4896 2024-03-15 The other two mutants showed defective silencing of the mat2P::ura4+ reporter and haploid meiosis (Fig. 4C), as well as detectable levels of the mat2P transcript (Fig. 4D). PomBase SPBC4.04c FYPO:0001357 D87G,D112G Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mcm2 mcm2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38285941 4896 2024-03-15 PomBase SPCC1259.09c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP pdx1 pdx1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC11D3.07c FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe4 toe4+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC11D3.07c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe4 toe4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC11D3.07c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe4 toe4+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000234 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 PMID:30427751 4896 2019-05-26 (Figure 1G,H) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0005558 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 PMID:30427751 4896 2019-05-26 (Figure 1) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004090 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 2A) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004090 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 2A) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0007984 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 30 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 2) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0005441 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 6) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0006182 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 Therefore, we concluded that Rsp1 is required to prevent excessive accumulation of Mto1 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002818 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 10 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 1) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004083 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 2B) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004083 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC902.06) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 2B) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004083 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 2B) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0003302 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 10 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 1) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rsp1 rsp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph rsp1 rsp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsp1 rsp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 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972 h- rng10 rng10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 16 PMID:27385337 4896 2016-07-20 PomBase SPAC688.07c FYPO:0003440 deletion 972 h- rng10 rng10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 50 PMID:27385337 4896 2016-09-28 PomBase SPAC688.07c FYPO:0002869 deletion 972 h- rng10 rng10delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Ync13 levels at the division site measured by fluorescence intensity were significantly reduced (>85%) in both rga7Δ and rng10Δ cells (Fig 3A and 3B), PomBase SPAC688.07c FYPO:0002869 deletion 972 h- rng10 rng10delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 The time-lapse movies showed that the Bgs4 intensity at division site was significantly reduced in rng10Δ and rng10Δ ync13-19 cells, and Bgs4 did not accumulate in the center of the division plane compared to ync13-19 cells (Fig 4F). Consistently, Bgs4 levels at the division site were significantly lower in rga7Δ, rng10Δ, and rng10Δ rga7Δ cells (Fig 4G). PomBase SPAC688.07c FYPO:0002869 deletion 972 h- rng10 rng10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000025 assayed_protein(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 In rga7Δ, rng10Δ, and rga7Δ rng10Δ (shifting from medium with sorbitol to the one without sorbitol) cells, Trs120 intensity at division site decreased significantly, while it increased in ync13Δ cells (Fig 5A and 5B; arrowheads), consistent with the Bgs4 intensity (Fig 4F and 4G). 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1-413 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-C414-432 bqt4C414-432 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 The TMD alone (Bqt4C414-432) showed even weaker localization at the NE with diffusion to the cytoplasm, but showed the same responses, that is, degradation in the absence of Bqt3 and increased levels upon BZ treatment (Fig. 6A, Bqt4C414-432). PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001974 240-242 Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL50 partial_nucleotide_deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:7774573 4896 2016-09-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001046 240-242 Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL50 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006822 240-242 Overexpression 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 cdc2 cdc2-DL50 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:7774573 4896 2016-09-16 PomBase SPBC1105.19 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tam12 tam12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.19 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph tam12 tam12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.19 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo1 mlo1delta SPCC31H12.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000909 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.06) PMID:19756689 4896 2012-05-03 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000544 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:19756689 4896 2012-03-30 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0005934 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 (Figure 2) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0005934 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC188.03) PMID:31072933 4896 2019-05-17 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0005934 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0005630 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000337 PMID:21444718 4896 2023-03-24 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006800 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 3 medium assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 7B and C) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006800 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 low PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003217 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 low PMID:15359282 4896 2024-03-14 (Fig. 4C) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:26221037 4896 2016-08-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 high PMID:15359282 4896 2024-03-14 (Fig. 4C) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000137 medium PMID:37970674 4896 2023-11-17 , deletion of either nup132+ or pli1+ results in reduced growth in the presence of 5-FOA, indicating increased expression of ura4+ and hence loss of silencing (Fig. 1C). PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003412 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002827 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002775 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000112 high PMID:15359282 4896 2024-03-14 (Fig. 3A) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000485 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 PMID:19756689 4896 2012-03-30 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002778 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:28552615 4896 2017-07-19 (Fig. S1C, 3A) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001645 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c),assayed_using(PomBase:SPBC23E6.02) PMID:28552615 4896 2017-07-16 (Fig. S1E) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0007532 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000584 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 PMID:19756689 4896 2012-03-30 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0004003 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000260 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002019 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000337 low PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002019 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:15359282 4896 2024-03-14 (Fig. 6B) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0004251 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000226 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000614 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000260 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001840 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000137 high PMID:15359282 4896 2024-03-14 (Fig. 4B) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000473 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000059 PMID:17515930 4896 2015-02-17 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pli1 pli1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003555 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pli1 pli1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001690 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 However, like pli1 cells, SUMOD81R mutants are not appreciably sensitive to genotoxins (Fig. 4A) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000963 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 However, like pli1 cells, SUMOD81R mutants are not appreciably sensitive to genotoxins (Fig. 4A) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000957 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 However, like pli1 cells, SUMOD81R mutants are not appreciably sensitive to genotoxins (Fig. 4A) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006033 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:28481910 4896 2017-06-01 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006320 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0000049 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pli1 pli1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000085 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:26221037 4896 2016-08-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000102 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 PMID:31563844 4896 2023-11-09 Exo5Δ and pli1Δ show synergistic interactions indicating that they operate in different, competing pathways (Fig. 5F). PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000102 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0003559 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 low PMID:28552615 4896 2017-07-16 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:26221037 4896 2016-08-26 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0006149 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 low PMID:28552615 4896 2017-07-16 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000091 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:15359282 4896 2024-03-14 (Fig. 4A) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000091 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:37970674 4896 2023-11-16 Similarly, both nup132Δ and pli1Δ cells showed sensitivity to the microtubule-stabilising drug thiabendazole (TBZ), consistent with defects in centromere function, and this TBZ sensitivity was also not rescued by the Pli1K3R mutation (Fig. 1C). T PomBase SPAC1687.05 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph pli1 pli1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pli1 pli1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007721 E134A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-E134A stx8(E134A)|fsv1-E134A amino_acid_mutation ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0001645 E134A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-E134A stx8(E134A)|fsv1-E134A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c),assayed_using(PomBase:SPCC777.13) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0005489 E134A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-E134A stx8(E134A)|fsv1-E134A amino_acid_mutation ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC1002.14 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 itt1 itt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 itt1 itt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 itt1 itt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- itt1 itt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 itt1 itt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 itt1 itt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001645 L357A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L357A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPAC105.02c FYPO:0000422 156-170 Not assayed or wild type 972 h- ank1 ank1(1-155) Ank1(1-155) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure 3E) PomBase SPAC105.02c FYPO:0001645 156-170 Not assayed or wild type 972 h- ank1 ank1(1-155) Ank1(1-155) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC105.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC146.13c) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure 3C) PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0002835 89-126 Not assayed or wild type 972 h- stc1 stc1-deltaZF2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0006993 89-126 Not assayed or wild type 972 h- stc1 stc1-deltaZF2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000137 high PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0000888 89-126 Not assayed or wild type 972 h- stc1 stc1-deltaZF2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 medium PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0007339 89-126 Not assayed or wild type 972 h- stc1 stc1-deltaZF2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 medium PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPAC343.07 FYPO:0000581 rrm2 and rrm3 domains deleted Not assayed or wild type 972 h- mug28 mug28-rrm2delta,rrm3delta other ECO:0005638 PMID:20410137 4896 2015-10-08 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0004670 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0000112 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0004670 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0000059 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0003139 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000380 deletion 972 h- h- leu1-32 CFP-atg8::leu1+ atg13 atg13delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000127 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0006295 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0000112 PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000082 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 low PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 2) PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg13 atg13delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 high PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0002798 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0000059 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000584 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg13 atg13delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0008427 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000238 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0006660 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0001178 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 low PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000674 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 2) PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0003075 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 we found that in S. pombe, Atg1 from atg13D, atg17D, or atg101D mutant exhibited autophosphorylation activities similar to that of Atg1 from wild type PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0006293 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000590 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000208 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 2) PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 2) PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0007629 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph atg13 atg13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0000280 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 PMID:17295836 4896 2016-01-07 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg13 atg13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001357 T154E,T99E,T74E,T60E,S87E Not assayed or wild type 972 h- drc1 drc1-CD5E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2011-11-18 PomBase SPAC11D3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11D3.08c SPAC11D3.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11D3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.08c SPAC11D3.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11D3.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.08c SPAC11D3.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0007336 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000049 PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S1D) PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003094 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003411 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003412 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003216 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0004604 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0004604 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0004604 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005931 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000059 PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002386 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:24662054 4896 2017-02-06 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002019 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000337 low PMID:29216371 4896 2017-12-11 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000220 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002836 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5E). Enhanced transcriptional-machinery occupancy at heterochromatic repeats in SHREC defective cells,..should result in elevated repeat transcripts ...corresponding increase in siRNA production. PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000966 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5B) we found increases in H3K14ac levels and greater Pol II occupancy at the reporter embedded within pericentromeric heterochromatin in....strains lacking SHREC components PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000966 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0006681 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003011 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5B) we found increases in H3K14ac levels and greater Pol II occupancy at the reporter embedded within pericentromeric heterochromatin in....strains lacking SHREC components PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0006300 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0004237 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2025-07-02 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000825 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Northern blot (Supplementary Figure S1A). Compared to wild-type pho1 mRNA levels, a slight accumulation was detected for all strains. However, this is less pronounced than in clr3Δ, indicating that Clr3 is unlikely to entirely depend on Clr2 or other components of SHREC for recruitment to pho1. PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005917 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 low PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mit1 mit1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002567 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005930 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:24662054 4896 2017-02-03 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mit1 mit1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003235 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005865 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0005864 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000226 PMID:24662054 4896 2017-02-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002390 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 PMID:32277274 4896 2020-04-27 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000857 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0000059 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mit1 mit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mit1 mit1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6C3.09 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp40 rpp40delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6C3.09 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp40 rpp40delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6C3.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpp40 rpp40delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC824.08 FYPO:0001478 wild type Overexpression 972 h- gda1 gda1+ wild_type ECO:0005801 PMID:14612233 4896 2012-09-24 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0006628 deletion 972 h- spo20 spo20delta deletion ECO:0001232 100 medium PMID:39110593 4896 2024-11-01 We found that both the PM and Golgi pools of PI4P decreased significantly in sec14D cells. PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- spo20 spo20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000551 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 spo20 spo20delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 spo20 spo20delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo20 spo20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- spo20 spo20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spo20 spo20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003449 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 1D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6828164 4896 2017-12-05 (Fig. 1A) The transition point for cdc2 is 0.65 using cdc2.M26 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006563 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000229 high PMID:9303312 4896 2018-05-04 (Fig. 8C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000474 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003378 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002044 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002044 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003437 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000110,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 1B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000556 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000082 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004111 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c) PMID:10921878 4896 2014-12-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001355 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2674650 4896 2013-04-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005993 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000126,FYECO:0000229,FYECO:0000300 high PMID:10725227 4896 2018-07-24 (Fig. 5B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003246 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000229,FYECO:0000260 PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 4D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000703 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c) PMID:3322810 4896 2013-09-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006506 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000110,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 1A, C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000842 P137S Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M26 cdc2-M55 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPNCRNA.1459 FYPO:0001147 wild type Overexpression 972 h- nam1 nam1+ wild_type ECO:0001232 PMID:28765164 4896 2018-02-09 PomBase SPAC19A8.05c FYPO:0004955 R193A Not assayed or wild type 972 h- sst4 sst4-R193A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC19A8.05c FYPO:0004954 R193A Not assayed or wild type 972 h- sst4 sst4-R193A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC19A8.05c FYPO:0002052 R193A Not assayed or wild type 972 h- sst4 sst4-R193A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17951524 4896 2015-10-14 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.22 FYPO:0002060 deletion 972 h- cmc4 cmc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21270388 4896 2021-10-07 PomBase SPAC2F3.04c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rim1 rim1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- rim1 rim1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2F3.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rim1 rim1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.04c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rim1 rim1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 F689A Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-F689A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001384 K415R,K416R Not assayed or wild type 972 h- shk1 shk1-K415R,K416R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001234 K415R,K416R Not assayed or wild type 972 h- shk1 shk1-K415R,K416R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0002479 K415R,K416R Not assayed or wild type 972 h- shk1 shk1-K415R,K416R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000141 2-79 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1deltaCD(2-79) deltaCDchp1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:15743828 4896 2024-02-29 Importantly, cells lacking only the Chp1 chromodomain (ΔCDchp1-6xmyc) behaved similar to the chp1 null strain, with elevated transcription of the centromeric marker gene (Fig. 2C) and numerous mitotic chromosome segregation defects (Fig. 2D) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001508 2-79 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1deltaCD(2-79) deltaCDchp1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 In contrast, ΔCDchp1-6xmyc exhibited a diffuse faint spotty staining pattern throughout the nucleoplasm and was not associated with chromatin (Fig. 2E). Thus, the chromodomain, but not the RRM, is essential for Chp1 localization to all sites of heterochromatin and for normal Chp1 function at centromeric sequences. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002835 2-79 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1deltaCD(2-79) deltaCDchp1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 2-79 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1deltaCD(2-79) deltaCDchp1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:15743828 4896 2024-02-29 Importantly, cells lacking only the Chp1 chromodomain (ΔCDchp1-6xmyc) behaved similar to the chp1 null strain, with elevated transcription of the centromeric marker gene (Fig. 2C) and numerous mitotic chromosome segregation defects (Fig. 2D) PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB7E8.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBPB7E8.02 SPBPB7E8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 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2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPBC651.10 FYPO:0006631 deletion 972 h- nse5 nse5delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000211 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:30348841 4896 2022-09-09 Notably, however, deletion of either Nse5 or Nse6 strongly reduced Nse4 residence at all binding sites tested, which was most evident under conditions of genotoxic stress that stimulate de novo Smc5-Smc6 loading PomBase SPBC651.10 FYPO:0006631 deletion 972 h- nse5 nse5delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:30348841 4896 2022-09-09 Notably, however, deletion of either Nse5 or Nse6 strongly reduced Nse4 residence at all binding sites tested, which was most evident under conditions of genotoxic stress that stimulate de novo Smc5-Smc6 loading PomBase SPBC651.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nse5 nse5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC651.10 FYPO:0001355 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2023-06-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC20G8.02 SPAC20G8.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005046 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 50 PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000634 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 PMID:31000521 4896 2020-02-19 (Fig. 5B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008153 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:16246721 4896 2024-01-25 Remarkably, loss of Swi6 and Chp2 but not Chp1 completely abolished the localization of Clr3 at Kint2::ura4+ (Figure 1) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005850 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003074 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 1B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002835 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002835 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001270 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003094 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004201 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 3A and B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003411 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 high PMID:29136238 4896 2018-02-12 (Fig. 2) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 high PMID:26832414 4896 2024-03-19 (Fig. 3B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:22727667 4896 2014-06-10 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 high PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:16738311 4896 2014-12-23 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 PMID:22081013 4896 2023-02-16 (Fig. 3g) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002827 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000453 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002827 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 PMID:15743828 4896 2024-02-29 Nonetheless, deletion of chp1+ or ago1+ only slightly alleviated silencing (20, 38), as revealed by the presence of pink colonies compared with the red, fully repressed colonies (Fig. 8A). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004604 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 high PMID:29136238 4896 2018-02-12 (Fig. 2) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0007009 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. S1) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000888 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 low PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5C and E) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003571 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000453 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001324 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC83.03c) PMID:22727667 4896 2014-06-11 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:15372076 4896 2024-01-23 In contrast, the centromeric localization of Swi6 or Chp2-13myc was specifically decreased in the Dchp1 cells (Figures 2B and C, Dchp1) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15372076 4896 2024-01-23 In contrast, the centromeric localization of Swi6 or Chp2-13myc was specifically decreased in the Dchp1 cells (Figures 2B and C, Dchp1) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003573 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000453 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2C) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002386 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.28c) PMID:20211136 4896 2015-11-04 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001645 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004205 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001271 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001840 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9722643 4896 2021-01-02 Table 2 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004377 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000825 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000825 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000228 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 7.8 PMID:9722643 4896 2021-01-02 Fig. 3 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004331 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 PMID:10766735 4896 2015-01-22 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004742 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 assayed_transcript(SO:0001905) PMID:22081013 4896 2023-02-16 Real time PCR analyses of transcripts derived from the dg or dh outer repeats of the centromere (Figure 3a) demonstrated that whereas cells lacking Chp1 displayed strong accumulation of transcripts, centromeric heterochromatin was unaffected by the loss of the PIN domain in chp1ΔC strains (Figure 3b,c,d Supplementary Figure 9). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002336 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000049 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003555 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003235 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 PMID:15372076 4896 2024-01-23 Intriguingly, we found that, even in the Dchp1 cells, histone H3 in native centromeric heterochromatin (CEN-dg223 locus) remained methylated at lysine 9 (Figure 4B, Dchp1). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005865 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000472 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9722643 4896 2021-01-02 Fig. 2 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001513 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 50 PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0005072 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1393.05) PMID:22474355 4896 2024-03-13 To test the hypothesis that the nuclear dot localization of Ers1 was attributable to an interaction with H3K9me-bound CD proteins, EGFP-Ers1WT localization was next examined in swi6Δ, chp1Δ, and chp2Δ cells. The localization of EGFP-Ers1WT was clearly abolished in swi6Δ cells similar to that observed in clr4Δ, whereas WT localization patterns were retained in the chp1Δ and chp2Δ cells (Fig. 4C and Fig. S4C). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004378 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004378 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003576 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 4B) However, defect in RNAi pathway had no impact on Ccq1 localization PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004579 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000291 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001984 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 Tas3-13xmyc protein was essentially lost in chp1Δ cells, whereas it was present at normal levels in the ago1Δ cells (Fig. 6B). To address whether loss of Tas3-13xmyc protein in chp1Δ cells was due to suppression of tas3-13xmyc+ transcription, we performed quantitative RT-PCR using RNA prepared from wild-type, chp1Δ, and ago1Δ backgrounds. Deletion of chp1+ had no effect on tas3-13xmyc+ transcript levels (Fig. 6C); therefore, the loss of Tas3 protein in chp1 null cells is a posttranscriptional effect. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000084 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:29136238 4896 2018-02-12 (Fig. 7) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 chp1 chp1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9722643 4896 2021-01-02 Fig. 5 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003241 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 23 PMID:19362535 4896 2024-02-13 Unlike chp1 null cells, which showed 23% of mitotic cells undergoing chromosome missegregation, the chromodomain point-mutated strains, with the exception of V24Rchp1, showed few cells undergoing aberrant mitoses (Table S3). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- chp1 chp1delta deletion ECO:0005638 PMID:9722643 4896 2021-01-02 Fig. 1 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 chp1 chp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000118 L577A Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-L577A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001355 M84G Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000223 low PMID:39387272 4896 2024-12-04 (Fig. 2E) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000085 M84G Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000223,FYECO:0000314 high PMID:39387272 4896 2024-12-04 (Fig. 2E) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000085 M84G Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000314 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 2E) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000088 M84G Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000223 high PMID:39387272 4896 2024-12-04 (Fig. 2E) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000088 M84G Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 2E) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000089 M84G Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000223 high PMID:39387272 4896 2024-12-04 (Fig. 2E) PomBase SPBC887.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwf29 cwf29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC887.05c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph cwf29 cwf29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.05c 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assayed_enzyme(PomBase:SPBC19C2.05),assayed_substrate(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0004600 wild type Overexpression 972 h- cpc2 cpc2+ wild_type ECO:0000049 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- cpc2 cpc2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000648 wild type Overexpression 972 h- cpc2 cpc2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0002827 I11R Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-I11R amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:39945308 4896 2025-03-03 (Fig. 4C and 4E) PomBase SPBP35G2.10 FYPO:0006163 I11R Not assayed or wild type 972 h- mit1 mit1-I11R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 Interestingly, we found that Chp2 in the chromatin-enriched pellet fraction was not affected by the Mit1I11R mutation (Fig. 1B). PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000711 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127,FYECO:0000272 PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004427 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002700 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002680 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002681 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000674 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001020 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001164 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000961 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004423 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001103 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000852 T1972A Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002003 R332A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-R332A amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000140 assayed_region(SO:0002216) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 R332A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-R332A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 R332A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-R332A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004416 R332A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-R332A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 R332A Not assayed or wild type 972 h- pho7-TAP pho7 pho7-R332A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31010807 4896 2022-01-13 PomBase SPBC337.14 FYPO:0002430 deletion 972 h- rpb4 rpb4delta deletion ECO:0001232 PMID:10523639 4896 2014-06-30 PomBase SPBC337.14 FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb4 rpb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.14 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb4 rpb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC337.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpb4 rpb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC337.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpb4 rpb4delta deletion ECO:0005638 PMID:10523639 4896 2014-06-30 PomBase SPBC337.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpb4 rpb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000659 R318H Overexpression 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC736.08),assayed_using(SO:0001839) PMID:23555033 4896 2013-05-16 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000838 R318H Overexpression 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC736.08) PMID:23555033 4896 2013-05-17 PomBase SPAC19A8.09 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yos1 yos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.09 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yos1 yos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- yos1 yos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19A8.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yos1 yos1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26518661 4896 2019-07-21 (Figure 2) PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0005286 deletion 972 h- cdc73 cdc73delta deletion ECO:0000049 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005580 PMID:31315658 4896 2020-09-21 Additional file 1: Fig. S1b, c PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0006986 deletion 972 h- cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-21 (Figure 2) PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 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SPBC17G9.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph cdc73 cdc73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- cdc73 cdc73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17G9.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc73 cdc73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0007599 TetR-stc1(ectopic chromatin tether) Not assayed or wild type 972 h- stc1 TetR-stc1 fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- klp2 klp2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC664.10 FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- klp2 klp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:29167352 4896 2018-06-11 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0004337 1-31 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta31 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0000838 1-31 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta31 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001357 1-31 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta31 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001492 1-31 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta31 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 S255A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-S255A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 S255A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-S255A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004067 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-as unknown ECO:0000112 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004068 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-as unknown ECO:0000112 FYECO:0000244 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:23122962 4896 2024-02-22 In addition, while the inactivation of the welldescribed CTD serine 5 or serine 2 kinases (Mcs6 [Cdk7] and Lsk1 [Cdk12], respectively) specifically decreased the phosphorylation level of these two residues in vivo, the absence of cdk11 had no effect (Figure 1F). PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0004068 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-as unknown ECO:0000112 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-as unknown ECO:0005638 FYECO:0000244 PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002030 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-06-20 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000801 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 PMID:11112691 4896 2024-06-11 Loss of cell shape in myo52∆ was accompanied by the depolarisation of the actin cytoskeleton whereas no change in actin organisation could be detected in myo51∆ (Fig. 3A). PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002089 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 10 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. 3B) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004802 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:25825517 4896 2015-08-10 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004481 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001585 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001585 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12),assayed_using(PomBase:SPBC106.20),assayed_using(PomBase:SPCC622.10c) PMID:22768263 4896 2012-09-24 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001585 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001407 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002699 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002699 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002869 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001586 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1739.10) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0006589 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2017-12-22 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000538 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005801 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002441 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-08-07 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000729 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11359928 4896 2021-01-02 (Figure 4A) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002021 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-07-30 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002086 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11359928 4896 2021-01-02 (Fig. 3a) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004806 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:25825517 4896 2015-08-10 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0005543 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:27082518 4896 2016-07-15 (Fig. S3B) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000650 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 PMID:11112691 4896 2024-06-11 septation index of 20%, twice that of wild type (Fig. 2A). PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004097 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11359928 4896 2021-01-02 (Figure 4A) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0005465 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11359928 4896 2021-01-02 (Fig. 2c) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000426 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:11509236 4896 2024-06-12 After 15 min, vacuoles were visible in all three strains, and this observation demonstrates that, as in budding yeast [8, 9], endocytosis does not require a functional type V myosin. PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000644 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002442 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001587 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:23051734 4896 2013-07-30 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001587 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0008003 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004895 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001357 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:30201262 4896 2019-12-13 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001357 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:30201262 4896 2019-12-13 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001120 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009065 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0004325 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002438 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:23051734 4896 2013-08-07 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 PMID:11112691 4896 2024-06-11 At this temperature myo52∆ cells grew more slowly (Fig. 2B) and had an altered morphology, being shorter and PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001234 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 high PMID:11112691 4896 2024-06-11 myo52∆ cells showed extremely slow growth at 36°C (Fig. 2C). PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002792 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:11509236 4896 2024-06-12 vacuoles in myo52Δ were smaller (0.21 ± 0.14 μm). (Figure 1) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000021 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11359928 4896 2021-01-02 (Fig. 2c) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0000024 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0005638 PMID:11112691 4896 2024-06-11 At this temperature myo52∆ cells grew more slowly (Fig. 2B) and had an altered morphology, being shorter and PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002106 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 PMID:16421926 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0006616 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21849474 4896 2018-07-10 (Fig. 1B) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0006616 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-07-10 Table 1 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0006616 deletion 972 h- myo52 myo52delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-07-10 (Fig. 1A) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 E135A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-E135A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 E135A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-E135A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC1006.08 FYPO:0002869 wild type Knockdown 972 h- etd1 etd1+ 41X-GFP-etd1 wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.08) PMID:15933715 4896 2022-09-29 Etd1p-GFP failed to localise to the medial ring at the restrictive temperature. Instead, these mutant cells accumulated Etd1-GFP in a broad band at the plasma membrane overlying the site of cytokinesis (Figure 6A, upper panel PomBase SPAC1006.08 FYPO:0006831 wild type Knockdown 972 h- etd1 etd1+ 41X-GFP-etd1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 6) The levels of Etd1 and Rho1 regulate the timing of septation start. (A) The timing of septum deposition onset correlates with the start of increase of Etd1 in the cell middle. Cells were grown inMMwithout thiamine (GFP-etd1+ induced) at 25ÊC for 24 h and imaged as in Fig 1. (B) The increase of Etd1 in the cell middle and concomitant initiation of septation are delayed in long cells. Cells were analyzed as in A after 3.5 h of cell cycle arrest at 36ÊC. Graphs to the right show the total fluorescence of GFP-Etd1 at the cell poles and middle in the series to the left. A.U., arbitrary units. Arrow, cortical localization of Etd1 in the cell middle. Dashed outlines indicate the ROIs used to measure the total fluorescence of GFP-Etd1 in the corresponding regions of the cell. (C) The timing of septation onset is dependent on the level of etd1+. Cells expressing endogenous etd1+ and 41X-GFP-etd1+ grown at 32ÊC for 24 h either in the absence (ON, high etd1+ level; n = 4, 34 cells) or in the presence of thiamine (OFF, wild-type etd1+ level; n = 2, 11 cells), and cells expressing etd1Δ 81X-etd1+ grown for 15 h with thiamine (OFF, very low etd1+ level; n = 3, 23 cells), just before the emergence of SIN phenotype were analyzed as in A. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000446 E51R Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-E51R amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 5) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 E51R Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-E51R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 4) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 E51R Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-E51R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 4) PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0001324 L515P Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-L515P amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 (Figure 6c) PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0002061 L515P Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-L515P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0000611 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0000062 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 20 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0000062 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 30 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.10c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.10c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 20 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 30 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001324 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.10c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001324 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.10c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 medium assayed_substrate(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2018-06-28 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001645 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC17D11.06) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001645 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC17D11.06) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0004372 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 medium PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002019 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000228 high PMID:12697806 4896 2015-02-16 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005801 FYECO:0000005 low assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002700 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000170 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0004255 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6B12.10c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp1 spp1-21 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:11160827 4896 2015-02-13 PomBase SPAC20H4.02 FYPO:0001245 G97* Not assayed or wild type 972 h- dsc3 dsc3-G97* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC29A4.14c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pex3 pex3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.14c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pex3 pex3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.14c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph pex3 pex3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph pex3 pex3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pex3 pex3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pex3 pex3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.14c 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deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001164 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC119.08 FYPO:0005970 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001238 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC119.08 FYPO:0003896 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0001232 PMID:20655879 4896 2014-10-14 PomBase SPBC119.08 FYPO:0005477 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPBC119.08 FYPO:0003214 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPBC119.08 FYPO:0003214 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-15 (Fig. 1B) cell length at division either of pmk1􏰂 cells or in a mutant strain lacking the dual-specificity phosphatase Pmp1 that dephosphorylates and inactivates Pmk1 in vivo (14), ... was similar to that of wild-type cells (Fig. 1B) PomBase SPBC119.08 FYPO:0004154 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002290 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. S3B) PomBase SPBC119.08 FYPO:0000776 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000776 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001169 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000335 PMID:9762918 4896 2017-03-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001310 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0007359 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001103 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0005969 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 high PMID:9762918 4896 2017-03-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000852 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0005968 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:9762918 4896 2017-03-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0007521 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000214 PMID:34198697 4896 2021-07-07 (Figure 1B) PomBase SPBC119.08 FYPO:0007521 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000112 high PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 2A) PomBase SPBC119.08 FYPO:0001473 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000214 high PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001473 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:19037094 4896 2025-02-03 (Fig. 2A) PomBase SPBC119.08 FYPO:0001473 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000207 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001473 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001473 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000214 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pmk1 pmk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002720 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002720 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 PMID:19037094 4896 2025-02-03 (Fig. 2B) PomBase SPBC119.08 FYPO:0002720 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 high PMID:10591634 4896 2015-12-14 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002720 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 1C) PomBase SPBC119.08 FYPO:0002720 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC119.08 FYPO:0002720 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000095 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001501 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC119.08 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmk1 pmk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC119.08 FYPO:0000085 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PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Fig. S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0003809 P18A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A+AxxA6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000248 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0006187 P18A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A+AxxA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:35108037 4896 2022-02-14 (Figure S3A) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001903 P18A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A+AxxA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2A-C) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001357 P18A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A+AxxA6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2D) (25,29,32) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002177 P18A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A+AxxA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2A-C) PomBase 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mde4-12A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19523829 4896 2015-02-16 PomBase SPBC6B1.04 FYPO:0000228 S147A,S242A,S247A,S252A,S270A,T275A,S290A,S295A,S316A,S349A,S354A,S401A Not assayed or wild type 972 h- mde4 mde4-12A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19523829 4896 2015-02-16 PomBase SPBC6B1.04 FYPO:0000228 S147A,S242A,S247A,S252A,S270A,T275A,S290A,S295A,S316A,S349A,S354A,S401A Not assayed or wild type 972 h- mde4 mde4-12A amino_acid_mutation ECO:0001232 31 PMID:19523829 4896 2015-02-16 PomBase SPBC6B1.04 FYPO:0002901 S147A,S242A,S247A,S252A,S270A,T275A,S290A,S295A,S316A,S349A,S354A,S401A Not assayed or wild type 972 h- mde4 mde4-12A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.03) PMID:19523829 4896 2015-02-16 PomBase SPBC6B1.04 FYPO:0004383 S147A,S242A,S247A,S252A,S270A,T275A,S290A,S295A,S316A,S349A,S354A,S401A Not assayed or wild type 972 h- mde4 mde4-12A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19523829 4896 2015-02-16 PomBase SPAC3A12.11c FYPO:0003412 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003482 wild type Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:36574843 4896 2023-12-18 (Figure 3) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003482 wild type Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:36574843 4896 2023-12-18 (Figure 3) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003482 wild type Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0000059 high PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 3C). In addition, the cdr2+ overexpressed wild-type cells showed a higher septation index than cdr2+ non-overexpressed wild-type cells at 35◦C PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003413 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9843577 4896 2019-11-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0007133 wild type Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC644.06c) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0007133 wild type Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:36574843 4896 2023-12-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001124 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:24316795 4896 2014-03-11 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:24316795 4896 2014-03-11 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000648 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:35082773 4896 2022-04-11 It should be noted that cdr2+ overexpressed wild-type cells showed a shorter cell length at 27◦C, but a longer cell length at 35◦C than cdr2+ non-overexpressed wild-type cells (Figure 3B). PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000648 wild type Overexpression 972 h- Tet Promoter cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high medium PMID:36574843 4896 2023-12-18 Addition of Tet to PTet-cdr2 cells caused a marked and significant decrease in cell length at division (Fig. 2, A and B) PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- cdr2 cdr2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:24316795 4896 2014-03-11 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 Q287A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-Q287A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 Q287A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-Q287A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004142 Q287A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-Q287A-TAP amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(SO:0002216) PMID:30212894 4896 2018-10-29 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 Q287A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-Q287A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPAC1006.08 FYPO:0007582 wild type Overexpression 972 h- etd1 etd1+ 41X-GFP-etd1 wild_type ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:19736319 4896 2021-01-02 (Fig. 4D) PomBase SPAC1006.08 FYPO:0002024 wild type Overexpression 972 h- etd1 etd1+ 41X-GFP-etd1 wild_type ECO:0001232 PMID:15933715 4896 2022-09-29 Under derepressed conditions ( thiamine), Etd1p overproduction generated elongated and multinucleate cells in both etd1-1 mutant and wild-type backgrounds (Figure 1D and data not shown). Thus, the phenotypic defect caused by an excess of Etd1p was identical to that produced by a deficiency of this protein, suggesting that Etd1p functions in a stoichiometric protein complex. PomBase SPAC1006.08 FYPO:0006832 wild type Overexpression 972 h- etd1 etd1+ 41X-GFP-etd1 wild_type ECO:0001232 FYECO:0000105 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 6) The levels of Etd1 and Rho1 regulate the timing of septation start. (A) The timing of septum deposition onset correlates with the start of increase of Etd1 in the cell middle. Cells were grown inMMwithout thiamine (GFP-etd1+ induced) at 25ÊC for 24 h and imaged as in Fig 1. (B) The increase of Etd1 in the cell middle and concomitant initiation of septation are delayed in long cells. Cells were analyzed as in A after 3.5 h of cell cycle arrest at 36ÊC. Graphs to the right show the total fluorescence of GFP-Etd1 at the cell poles and middle in the series to the left. A.U., arbitrary units. Arrow, cortical localization of Etd1 in the cell middle. Dashed outlines indicate the ROIs used to measure the total fluorescence of GFP-Etd1 in the corresponding regions of the cell. (C) The timing of septation onset is dependent on the level of etd1+. Cells expressing endogenous etd1+ and 41X-GFP-etd1+ grown at 32ÊC for 24 h either in the absence (ON, high etd1+ level; n = 4, 34 cells) or in the presence of thiamine (OFF, wild-type etd1+ level; n = 2, 11 cells), and cells expressing etd1Δ 81X-etd1+ grown for 15 h with thiamine (OFF, very low etd1+ level; n = 3, 23 cells), just before the emergence of SIN phenotype were analyzed as in A. PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0003312 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-10 unknown ECO:0005801 PMID:24186301 4896 2014-04-17 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0002555 unknown Not assayed or wild type 972 h- spn1 spn1-5 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.17) PMID:24947517 4896 2016-08-22 (Figure 3C) PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0001949 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000261 PMID:16928959 4896 2015-02-27 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0001460 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0000049 PMID:16928959 4896 2015-02-27 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0001020 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion 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2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0009062 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000098 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19168988 4896 2012-08-31 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000098 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:16928959 4896 2015-02-27 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000098 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 Interestingly, deleting cch1+ suppressed cfr1delta sensitivity to CaCl2 (Supplementary Figure 4). PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000098 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000098 deletion 972 h- pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:15470240 4896 2014-02-19 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pmc1 pmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2B4.04c 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FYECO:0000005 PMID:31201205 4896 2019-06-23 PomBase SPAPB2B4.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmc1 pmc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29B12.03 FYPO:0000444 wild type Overexpression 972 h- spd1 spd1+ wild_type ECO:0005580 medium PMID:8887552 4896 2013-02-05 PomBase SPAC29B12.03 FYPO:0001430 wild type Overexpression 972 h- spd1 spd1+ wild_type ECO:0005580 medium PMID:8887552 4896 2013-02-05 PomBase SPAC29B12.03 FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- spd1 spd1+ wild_type ECO:0001232 PMID:8887552 4896 2013-02-05 PomBase SPAC29B12.03 FYPO:0000614 wild type Overexpression 972 h- spd1 spd1+ wild_type ECO:0001232 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC29B12.03 FYPO:0001974 wild type Overexpression 972 h- spd1 spd1+ wild_type ECO:0005580 PMID:8887552 4896 2013-02-08 PomBase SPAC29B12.03 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- spd1 spd1+ wild_type ECO:0001232 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC589.08c FYPO:0001164 T139A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-T139A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0004082 T139A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-T139A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC688.07c FYPO:0001880 201-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:30840879 4896 2019-06-24 PomBase SPAC688.07c FYPO:0000705 201-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.02c),assayed_protein(PomBase:SPAC688.07c) PMID:41144523 4896 2025-12-06 Except Rng10-(1-200) (S4D Fig), all other Rga7 and Rng10 truncations, even the Rng10 C-terminal (751-1038) could mistarget Ync13-tdTomato to mitochondria (S4 Fig), PomBase SPAC688.07c FYPO:0002488 201-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 >15 PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Figure 3F) PomBase SPAC688.07c FYPO:0002869 201-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Table 1) PomBase SPAC688.07c FYPO:0000836 201-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Table 1) PomBase SPAC688.07c FYPO:0000644 201-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-28 (Fig. 3C) PomBase SPNCRNA.475 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.475 SPNCRNA.475delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000468 G1116E Not assayed or wild 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PomBase SPAC15A10.15 FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP sgo2 sgo2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 250-300 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta250-300 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 30 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. S2B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006893 D258A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D258A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:36468882 4896 2023-02-17 PomBase SPBC365.15 FYPO:0000608 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp4 alp4-1891 unknown ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0003972 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp4 alp4-1891 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:11080156 4896 2015-03-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0003972 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp4 alp4-1891 unknown ECO:0001232 PMID:11952833 4896 2015-03-23 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2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 res1 res1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.16 FYPO:0004988 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 6B) PomBase SPBC725.16 FYPO:0000659 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001807 FYECO:0000005 assayed_using(GO:0030907),assayed_using(SO:0001855) PMID:9303312 4896 2018-05-03 (Fig. 8) PomBase SPBC725.16 FYPO:0006349 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC21B10.13c),assayed_region(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19714215 4896 2024-07-24 This analysis revealed that Yox1p binding to the cdc22 promoter depends on both of the MBF components tested, Res2p and Nrm1p (Figure 2C). We conclude that Yox1p can bind to MBF- regulated promoters only via intact MBF. PomBase SPBC725.16 FYPO:0004516 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC725.16 FYPO:0000826 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000260 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 5A, B) decreased cdc18 transcript in HU block and on release PomBase SPBC725.16 FYPO:0002975 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPBC725.16 FYPO:0002975 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPBC725.16 FYPO:0001117 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 6B) PomBase SPBC725.16 FYPO:0001117 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPBC725.16 FYPO:0001117 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11781565 4896 2018-08-07 (Fig. 1B) PomBase SPBC725.16 FYPO:0001117 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:7909513 4896 2014-07-11 the basal level of the 3.2 kb transcript was lower than that in h90 wild type cells, but the 3 kb transcript was properly induced upon nitrogen starvation PomBase SPBC725.16 FYPO:0000239 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-03 PomBase SPBC725.16 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 res1 res1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002262 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 PMID:1464317 4896 2013-09-20 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002379 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0001490 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002151 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 PMID:1464317 4896 2013-09-20 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0005638 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0001864 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0003031 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000254 55 PMID:7909513 4896 2014-07-11 PomBase SPBC725.16 FYPO:0005650 deletion 972 h- pat1-114 res1 res1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000127 PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC725.16 FYPO:0006976 deletion 972 h- pat1-114 res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC725.16 FYPO:0006976 deletion 972 h- pat1-114 res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC725.16 FYPO:0006976 deletion 972 h- pat1-114 res1 res1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.01c) PMID:14648198 4896 2019-08-07 PomBase SPBC725.16 FYPO:0006279 deletion 972 h- res1 res1delta deletion ECO:0000049 PMID:11389847 4896 2024-08-20 (Fig. 5A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001045 CTD-T4A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-T4A(r5-r29) rpb1-CTD-T4A(5-29)|rpb1-T4A-CTD amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002060 CTD-T4A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-T4A(r5-r29) rpb1-CTD-T4A(5-29)|rpb1-T4A-CTD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30282034 4896 2020-11-27 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000468 G219A,R220A,P221A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-AT1-A amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 5B) PomBase SPAC1142.03c FYPO:0005018 G219A,R220A,P221A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-AT1-A amino_acid_mutation ECO:0001807 low assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c),assayed_region(SO:0001789) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 3C) PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002765 T244A Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-T244A spTrm10_T244A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0001093 P293H Not assayed or wild type 972 h- sgo1 sgo1-P293H amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 4G) PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002561 Q10A,T13A,R216E Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1-R216E-ABS1-2A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000206 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000208 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001583 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000166 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-16 unknown ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000205 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0007614 deletion 972 h- cir2 cir2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-19 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cir2 cir2delta deletion 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To avoid the negative effects of the FLAG tag, we created a dsk1-K110A mutant without the tag, and it also showed the sensitivity of CPT (Figure S1e) PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002061 783-872 Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-deltaC90 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10779336 4896 2018-03-02 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R165A Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-S3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC543.07 FYPO:0001645 S234D,T238D Not assayed or wild type 972 h- pek1 pek1-DD P.act1- pek1-S234D|pek1DD amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC119.08),assayed_using(PomBase:SPBC543.07) PMID:10365961 4896 2014-07-29 PomBase SPBC543.07 FYPO:0002137 S234D,T238D Not assayed or wild type 972 h- pek1 pek1-DD P.act1- pek1-S234D|pek1DD amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-09 PomBase SPBC543.07 FYPO:0001038 S234D,T238D Not 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PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0006715 wild type Knockdown 972 h- fas2 fas2+ wild_type ECO:0001232 40-60 PMID:39378339 4896 2025-08-12 This phenotype was identical to that observed in fas2/lsd1 temperaturesensitive mutant cells (Saitoh et al., 1996) (Fig. 4 B). PomBase SPBC119.02 FYPO:0002635 K128A Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-K128A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 194-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-1-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 194-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-1-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 194-508 Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-1-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPCC24B10.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.03 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PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0001365 191-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CykFdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:38041816 4896 2024-07-01 The removal of GFP-Rng2-CykFΔ was also slowed down (Figures 5E and 5F), and its rate of constriction was reduced by ~30% compared with GFP-Rng2 (Figure 5H, p < 0.01) PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0000729 191-300 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CykFdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:38041816 4896 2024-07-01 The rng2-CykFΔ cells also assembled actin rings (Figures 6A and 6B), but the ring emergence and removal were significantly delayed (Figures 6B-6D) PomBase SPAC1002.20 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1002.20 SPAC1002.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.20 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC1002.20 SPAC1002.20delta deletion ECO:0005638 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1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 201-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-200) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 65 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003803 I77R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-I77R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0001645 I77R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-I77R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 I77R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-I77R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 I77R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-I77R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003107 I77R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-I77R amino_acid_mutation ECO:0000337 low PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 R839K Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-40 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R101A,R165A Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-S6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0000636 deletion 972 h- cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19168988 4896 2012-08-31 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0008456 deletion 972 h- cta5 cta5delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Moreover, none of other putative non-essen- tial stretch-activated ion channels [29] or organellar Ca2+-ATPase [30] appeared to be crucial for control- ling Ca2+ flux or for acute hypotonic protoplast expan- sion (Additional file 1: Fig. S1E). PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0002060 deletion 972 h- cta5 cta5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cta5 cta5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0002060 deletion 972 h- cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:31201205 4896 2019-06-23 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0002060 deletion 972 h- cta5 cta5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31201205 4896 2019-06-23 PomBase SPAC29A4.19c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cta5 cta5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0001971 1-596 Not assayed or wild type 972 h- mid2delta mid2 mid2-596-704 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0002555 1-596 Not assayed or wild type 972 h- mid2delta mid2 mid2-596-704 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 5) PomBase SPCC1322.02 FYPO:0004253 A155D,E172A Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1-A155D,E172A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC970.01) PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0001645 A155D,E172A Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1-A155D,E172A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.15c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.02),assayed_using(PomBase:SPCC970.01) PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPBC119.02 FYPO:0002768 L30A Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-L30A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002265 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001355 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-01 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001970 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001969 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001406 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0004893 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001120 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000025 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005152 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005150 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001963 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001963 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001965 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005151 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001966 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001190 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005149 W760S Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002019 S79A Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-S79A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005487 C663S Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C663S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:26422458 4896 2016-07-04 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005483 C663S Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-C663S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:26422458 4896 2016-07-04 PomBase SPCC338.08 FYPO:0007807 H274A,R275A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-RAA amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:33836577 4896 2021-06-18 (Figure 2E) PomBase SPCC330.10 FYPO:0002061 D116A Overexpression 972 h- pcm1 pcm1-D116A pcm1-D145A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17284461 4896 2012-06-18 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0002521 deletion 972 h- sxa1 sxa1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000090 PMID:1549128 4896 2013-08-16 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000470 deletion 972 h- sxa1 sxa1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0001668 deletion 972 h- sxa1 sxa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.11c) PMID:25803873 4896 2018-01-05 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0004600 deletion 972 h- h+ sxa1 sxa1delta deletion ECO:0000049 PMID:9191273 4896 2018-07-05 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sxa1 sxa1delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0001368 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:24790095 4896 2015-10-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0004646 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:24790095 4896 2015-10-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0004646 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:31041892 4896 2019-11-12 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0005019 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:24790095 4896 2015-11-05 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0005905 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:31041892 4896 2019-11-14 (Figure 4) PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002559 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002559 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.16) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0007181 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC144.14) PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Fig. 4b) PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002999 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, Supplementary Fig. 3a) PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002999 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, S3a) PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000703 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10),assayed_using(PomBase:SPAC31A2.16) PMID:23349808 4896 2013-08-15 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0004895 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:24790095 4896 2015-10-29 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0001492 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 low PMID:31041892 4896 2019-11-14 (Fig. 1) PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0003481 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Supplementary Table 1) PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0001491 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 blt1 blt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0001645 A5D Not assayed or wild type 972 h- rps23 rps23-A5D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.02c),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000444 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000446 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPAC644.12 FYPO:0002251 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:8313892 4896 2014-05-21 PomBase SPAC644.12 FYPO:0000785 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc5 cdc5-120 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-14 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-15-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 1-14 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-15-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 1-14 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-15-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002033 2303-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1deltaFATC partial_nucleotide_deletion ECO:0000337 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:29699848 4896 2019-04-03 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000705 2303-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1deltaFATC partial_nucleotide_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.05c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:29699848 4896 2019-02-07 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 E476K Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E476K amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 4F) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 E476K Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E476K amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5A) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0005917 E476K Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E476K amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11),assayed_transcript(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5B) PomBase SPAC9E9.07c FYPO:0005737 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt2 ypt2-VN unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 38.2 PMID:27630265 4896 2016-10-06 (Figure 3, Table 2) PomBase SPAC9E9.07c FYPO:0003541 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt2 ypt2-VN unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1183.12) PMID:27630265 4896 2016-10-24 Supplemental Figure S5A PomBase SPAC9E9.07c FYPO:0003541 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt2 ypt2-VN unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:27630265 4896 2016-10-24 Supplemental Figure S5A PomBase SPAC9E9.07c FYPO:0003541 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt2 ypt2-VN unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27630265 4896 2016-10-24 Supplemental Figure S5A PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000703 477-628 Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2delta477-628 T2NM|tea2-NM partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15),assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15665379 4896 2016-09-27 (Fig. 2) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-2 unknown ECO:0000049 high PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. S3) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-2 unknown ECO:0005638 PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. S3) PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0003119 W26* Not assayed or wild type 972 h- dss1 dss1-49 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 medium PMID:15990877 4896 2015-03-11 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0000268 W26* Not assayed or wild type 972 h- dss1 dss1-49 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:15990877 4896 2015-03-11 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0001491 W26* Not assayed or wild type 972 h- dss1 dss1-49 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:15990877 4896 2015-03-11 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph opt3 opt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0001578 deletion 972 h- opt3 opt3delta deletion ECO:0005638 PMID:22226946 4896 2012-11-23 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0001579 deletion 972 h- opt3 opt3delta deletion ECO:0005638 PMID:22226946 4896 2012-11-23 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph opt3 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SPCC1840.12 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph opt3 opt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph opt3 opt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- opt3 opt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 opt3 opt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 opt3 opt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001974 S153L,L309P Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-41 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12006645 4896 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPAC821.06 FYPO:0002088 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 low PMID:41171630 4896 2025-12-11 During septum formation, seven- and twofold more secretory vesicles accumulated at the division site in sec8-1 and spn1Δ cells, respectively, compared to WT (Figure 6A, B PomBase SPAC821.06 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC1183.01) PMID:41171630 4896 2025-12-10 Both Sec15 and Sec5 spread more or less to the whole division plane in ~50% of spn2Δ cells with obvious septa (Figure 5A–D). Unlike in spn1Δ or spn4Δ cells, a fraction of Sec15 and Sec5 still localized to the rim in spn2Δ cells with a septum (Figure 5A, C). PomBase SPAC821.06 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC622.10c) PMID:41171630 4896 2025-12-10 Both Sec15 and Sec5 spread more or less to the whole division plane in ~50% of spn2Δ cells with obvious septa (Figure 5A–D). Unlike in spn1Δ or spn4Δ cells, a fraction of Sec15 and Sec5 still localized to the rim in spn2Δ cells with a septum (Figure 5A, C). PomBase SPAC821.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC821.06 FYPO:0004807 deletion 972 h- h90 spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-19 PomBase SPAC821.06 FYPO:0000478 deletion 972 h- h90 spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC821.06 FYPO:0003845 deletion 972 h- h90 spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 assayed_using(PomBase:SPBC1347.03) PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC821.06 FYPO:0003334 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPAC821.06 FYPO:0003334 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPAC821.06 FYPO:0003334 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.11c) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPAC821.06 FYPO:0006324 deletion 972 h- spn2 spn2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPAC821.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.06 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph spn2 spn2delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0001586 869-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-deltaSH3869 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001365 869-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-deltaSH3869 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001368 869-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-deltaSH3869 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0004376 KK823AA Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-KK-823-AA lsd2-KK861AA|lsd2m amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0001357 KK823AA Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-KK-823-AA lsd2-KK861AA|lsd2m amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17434129 4896 2020-11-05 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002128 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0004250 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0006148 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, in Δlam2 cells and Δgtr2 cells, basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion were abolished (Fig 4B). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001575 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001575 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000046 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000250 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPCC777.05 FYPO:0010009 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Whereas Cat1-GFP was present at the cell surface in wild-type cells, it was localized to intracellular punctate structures in Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 3B, EMM). PomBase SPCC777.05 FYPO:0004457 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr2 cells and Δgtr1 cells, the nuclear localization of Gaf1-YFP was not observed within 30 min after nitrogen depletion. Although a subset of these mutant cells showed the nuclear locali- zation of Gaf1-YFP at 60 and 120 min, its nuclear localization appeared to be partial, compared with wild-type cells (Fig 4C). PomBase SPCC777.05 FYPO:0004457 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr2 cells and Δgtr1 cells, the mRNA level of isp5+ was decreased, compared with wild- type cells (Fig 4A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0005118 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000781 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 we generated new strains of Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, and found that these mutant cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates, similarly to Δlam2 cells (Fig 1A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 we generated new strains of Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, and found that these mutant cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates, similarly to Δlam2 cells (Fig 1A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 we generated new strains of Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, and found that these mutant cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates, similarly to Δlam2 cells (Fig 1A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Exogenous addition of arginine to the EMM plates enhanced the cell growth of Δlam2 cells, Δgtr2 cells, Δgtr1 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells as well as wild-type cells, but did not rescue the defective cell growth of these mutant cells to the level of wild-type cells (S5 Fig). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2D) PomBase SPCC777.05 FYPO:0006345 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells showed increased Rps6 phosphorylation under nitrogen depletion, compared with wild-type cells, especially at 15 min (Fig 5). PomBase SPCC777.05 FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells showed increased Rps6 phosphorylation under nitrogen depletion, compared with wild-type cells, especially at 15 min (Fig 5). PomBase SPCC777.05 FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002681 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001038 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.02c) PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, the mRNA level of cat1+ was increased compared with wild-type cells (Fig 3A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.05 FYPO:0003031 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1B, 1C) respectively Gtr2, and in particular Gtr1, inhibit sexual differentiation in rich medium. PomBase SPCC777.05 FYPO:0001522 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001545 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 The canava- nine resistance of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells was completely canceled by Torin1 treatment (Fig 3E, canavanine + Torin). PomBase SPCC777.05 FYPO:0002672 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0008372 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 These intracellular punctate structures were abolished upon TORC1 inhibition by the com- bined treatment of rapamycin and caffeine (Fig 3B, Rapamycin + caffeine) PomBase SPCC777.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.17) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPCC777.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.05c) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPCC777.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC222.19) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPCC777.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23D3.16) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPCC777.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A7.11) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001420 deletion 972 h- leu1-32 gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000226 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1A) Loss of Gtr1 or Gtr2 resulted in the inability of the cells to grow properly, and they divided with a doubling time longer than that of wild-type cells PomBase SPCC777.05 FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δlam2 cells, tetO7-lam2 cells, Δgtr2 cells, tetO7-gtr2 cells and Δgtr1 cells showed canavanine resistance (Fig 3D). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 The canavanine resistance of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells was partially canceled by rapamycin treatment (Fig 3E, canavanine + Rapamy- cin). PomBase SPCC777.05 FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001029 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001453 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000099 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPCC777.05 FYPO:0000111 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 PMID:23934889 4896 2013-09-16 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001234 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1A) Loss of Gtr1 or Gtr2 resulted in the inability of the cells to grow properly, and they divided with a doubling time longer than that of wild-type cells PomBase SPCC777.05 FYPO:0001234 deletion 972 h- gtr2 gtr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000272 PMID:22344254 4896 2021-02-07 (Fig. 1A) Loss of Gtr1 or Gtr2 resulted in the inability of the cells to grow properly, and they divided with a doubling time longer than that of wild-type cells PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 L363A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L363A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 L363A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L363A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 L363A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L363A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 F245R Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-F245R amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPBC839.07 FYPO:0004303 C70S Not assayed or wild type 972 h- ibp1 ibp1-C70S ibp1-C69S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC839.07) PMID:14508607 4896 2015-01-15 PomBase SPCC1672.10 FYPO:0000705 1-32 Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16delta1-32 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC27B12.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1672.10) PMID:29804820 4896 2023-04-01 However, the interaction is significantly diminished when either L32 (Mis16D1-32), or both L32 (Mis16D1-32) and L32/W33 (Mis16D1-33), are deleted (Figures 6A and 6B). In contrast, the Mis16-H4a1 interaction was only mildly affected in the context of the Mis16D1-33 truncation. These findings strongly suggest that Mis16 L32 and W33 participate in specific interactions with Eic1 but not histone H4. To verify these observations in vivo, we performed PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0003029 wild type Knockdown 972 h- uaf2 uaf2+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.08c) PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0001908 wild type Knockdown 972 h- uaf2 uaf2+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.08c) PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- uaf2 uaf2+ wild_type ECO:0000279 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000903 S147A,T149A,S151A Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-3A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22134091 4896 2019-10-30 (Fig. 3) PomBase SPBC19C2.07 FYPO:0007367 wild type Knockdown 972 h- fba1 fba1+ wild_type ECO:0005801 PMID:39378339 4896 2025-08-12 However, contrary to expectations, fba1-KD did not reduce the level of the product, G3P (Fig. 5 D). PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000665 K309A Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-K309A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC1795.06) PMID:10792724 4896 2012-01-17 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0001668 K309A Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-K309A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC1296.03c) PMID:10792724 4896 2011-10-12 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0006296 S149F Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-S149F amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPBC11C11.08 FYPO:0001908 64-275 Overexpression 972 h- srp1 srp1-RBD partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:9421507 4896 2015-09-30 PomBase SPBC11C11.08 FYPO:0002061 64-275 Overexpression 972 h- srp1 srp1-RBD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9421507 4896 2015-09-30 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 R6E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R6E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 R6E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R6E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 R6E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R6E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 R6E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R6E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 R6E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R6E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 R6E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R6E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000940 unknown Overexpression 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001315 unknown Overexpression 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001315 unknown Overexpression 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph 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prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.18c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rpl102 rpl102delta deletion ECO:0005638 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at the restrictive temperature, while it behaved like the wild-type at permissive temperature PomBase SPBC1718.06 FYPO:0001407 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:27664110 4896 2019-10-16 severe growth delay on both fermentable (Glucose) and respiratory (Ethanol Glycerol) media at the restrictive temperature, while it behaved like the wild-type at permissive temperature PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000442 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000139 high PMID:27664110 4896 2019-10-16 severe growth delay on both fermentable (Glucose) and respiratory (Ethanol Glycerol) media at the restrictive temperature, while it behaved like the wild-type at permissive temperature PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003805 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000139 high PMID:27664110 4896 2019-10-16 severe growth delay on both fermentable (Glucose) and respiratory (Ethanol Glycerol) media at the restrictive temperature, while it behaved like the wild-type at permissive temperature PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003769 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1D) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003769 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1D) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003769 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:27664110 4896 2019-10-16 (Fig. 2) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002009 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000139 PMID:27664110 4896 2019-10-16 (Fig. 1c) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0001355 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003004 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004 PMID:27664110 4896 2019-10-16 (Fig. 3) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000256 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:27664110 4896 2019-10-16 (Fig. 3) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0006911 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-06-12 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0006913 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-06-12 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0006914 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-06-12 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0006910 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0006034 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148,FYECO:0000348 PMID:30658998 4896 2019-05-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0006034 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148,FYECO:0000349 PMID:30658998 4896 2019-06-04 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1C) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30658998 4896 2019-05-17 (Fig. 1C) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 P300S Not assayed or wild type 972 h- msp1 msp1-P300S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:27664110 4896 2019-10-16 (Fig. 2) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 K139T Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-K139T amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPCC1223.06 FYPO:0001587 unknown Not assayed or wild type 972 h- tea1 tea1- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC16.01) PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 C64D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C64D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 C64D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C64D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 C64D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C64D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 C64D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C64D amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ucp12 ucp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC895.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- ucp12 ucp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC895.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ucp12 ucp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ucp12 ucp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002699 190-1489 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHD rng2CHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:38041816 4896 2024-07-01 whereas the CHD (aa 1-190) localized to all F-actin structures including actin cables, actin patches, and the actin ring (Figure 4C and Video S3).44,45 PomBase SPAC644.06c FYPO:0003075 355-593 Not assayed or wild type 972 h- cdr1 nim1(1-354) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:9135149 4896 2014-12-30 PomBase SPAC644.06c FYPO:0000703 355-593 Not assayed or wild type 972 h- cdr1 nim1(1-354) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c),assayed_using(PomBase:SPBC23G7.04c) PMID:9135149 4896 2014-12-30 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0008120 R297A,R298A,K299A,R300A Not assayed or wild type 972 h- spt20 spt20-RRKR amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 complete assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0000088 R297A,R298A,K299A,R300A Not assayed or wild type 972 h- spt20 spt20-RRKR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPBC1105.11c FYPO:0002567 K10M,K15R Not assayed or wild type 972 h- hht3 hht3-K9M,K14R amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPBC1105.11c FYPO:0006992 K10M,K15R Not assayed or wild type 972 h- hht3 hht3-K9M,K14R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:34010645 4896 2021-05-27 PomBase SPBC1105.11c FYPO:0003234 K10M,K15R Not assayed or wild type 972 h- hht3 hht3-K9M,K14R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_region(SO:0001899) PMID:34010645 4896 2021-05-27 H3K9me3 levels at pericentric dh repeats and dh RNA levels in hht3-K9MK14R cells are similar to those in wild-type cells, comparing with hht3-K9M. PomBase SPBC1105.11c FYPO:0002389 K10M,K15R Not assayed or wild type 972 h- hht3 hht3-K9M,K14R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000413 wild type Knockdown 972 h- cdc8 cdc8+ wild_type ECO:0001232 PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000779 wild type Knockdown 972 h- cdc8 cdc8+ wild_type ECO:0001232 PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002459 wild type Knockdown 972 h- cdc8 cdc8+ wild_type ECO:0001232 PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPBC646.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cct6 cct6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- cct6 cct6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC646.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cct6 cct6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.11 FYPO:0005252 deletion 972 h- cct6 cct6delta deletion ECO:0005638 high PMID:35172472 4896 2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/ Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPAC664.07c FYPO:0004410 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004408 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000102 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 PMID:1563349 4896 2013-02-15 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004402 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004405 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002345 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-192 rad9.192 unknown ECO:0005638 PMID:1852603 4896 2013-01-24 PomBase SPCC18.06c FYPO:0008056 D53A Not assayed or wild type 972 h- caf1 caf1-D53A caf1-D50A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:19307292 4896 2023-02-15 PomBase SPBC649.05 FYPO:0002821 G71V,T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75A,T78A cut12.G71VT75AT78A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5A) No increase in recruitment of plo1 to SPB when fin1 is active if T75 T78 mutated to A PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 G71V,T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75A,T78A cut12.G71VT75AT78A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000244 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 G71V,T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75A,T78A cut12.G71VT75AT78A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V,T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75A,T78A cut12.G71VT75AT78A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPAC31G5.11 FYPO:0001996 wild type Overexpression 972 h- pac2 pac2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8536311 4896 2014-09-25 PomBase SPAC31G5.11 FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- pac2 pac2+ wild_type ECO:0005638 PMID:8536311 4896 2014-09-25 PomBase SPAC31G5.11 FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- pac2 pac2+ wild_type ECO:0005638 PMID:8144551 4896 2013-10-23 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002023 Ub-DHFRts-myo2 Not assayed or wild type 972 h- myo2 N-degron:myo2+ degron-myo2 fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30928696 4896 2019-04-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001009 Ub-DHFRts-myo2 Not assayed or wild type 972 h- myo2 N-degron:myo2+ degron-myo2 fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30928696 4896 2019-05-01 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0001357 L470A Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-L470A pol1-S470A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9693370 4896 2015-02-13 PomBase SPAC6G10.11c FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- ubi3 ubi3+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:12237855 4896 2014-02-20 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0002972 T259E,T262E,T265E,S276D,T278E,S279D,S289D Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-7D/E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02),assayed_using(PomBase:SPBC1604.21c),assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20),assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0007035 deletion 972 h- dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000102 deletion 972 h- dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0004983 deletion 972 h- dph2 dph2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- dph2 dph2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dph2 dph2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17D1.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dph2 dph2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004201 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 5C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006993 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0006030 low PMID:17531816 4896 2023-03-05 F276A-ago1 (Figure S3B) caused a slight defect in silencing of the dg cen::ura4+ reporter (Figure S3C). PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC736.11),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006992 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004743 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004743 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002389 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC736.11),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002389 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1+ ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002389 F276A Not assayed or wild type 972 h- ago1delta ago1 ago1-F276A F276A-ago1|F276Aago1|ago1(F276A) amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPBC14C8.16c FYPO:0000342 bot1-GFP Not assayed or wild type 972 h- bot1 bot1-GFP fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000289 PMID:18245278 4896 2015-11-18 PomBase SPBC14C8.16c FYPO:0000342 bot1-GFP Not assayed or wild type 972 h- bot1 bot1-GFP fusion_or_chimera ECO:0000059 FYECO:0000126 PMID:18245278 4896 2015-11-18 PomBase SPBC14C8.16c FYPO:0002056 bot1-GFP Not assayed or wild type 972 h- bot1 bot1-GFP fusion_or_chimera ECO:0000337 PMID:18245278 4896 2015-11-18 PomBase SPBC14C8.16c FYPO:0002009 bot1-GFP Not assayed or wild type 972 h- bot1 bot1-GFP fusion_or_chimera ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:18245278 4896 2015-11-18 PomBase SPBC14C8.16c FYPO:0002009 bot1-GFP Not assayed or wild type 972 h- bot1 bot1-GFP fusion_or_chimera ECO:0000335 FYECO:0000289 PMID:18245278 4896 2015-11-18 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0009009 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000331 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000181 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0005258 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0009031 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0001029 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0000111 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0007910 wild type Knockdown 972 h- P81nmt mtl2 mtl2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23907979 4896 2022-07-01 Repression of mtl2+ promoted cell lysis and the cells shrunk without the release of cytoplasmic material. PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000647 wild type Knockdown 972 h- P81nmt mtl2 mtl2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23907979 4896 2022-07-01 Repression of mtl2+ promoted cell lysis and the cells shrunk without the release of cytoplasmic material. PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002817 K81Q Not assayed or wild type 972 h- mei4 mei4-K81Q mei4-K85Q amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0009021 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000416 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000684 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000072 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0009022 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000278 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0007726 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000296 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0007317 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0000059 FYECO:0000126 low PMID:39358553 4896 2024-10-27 (Fig. 4G) PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0004706 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0000059 PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 4A and C) PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0008324 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0000059 PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 4E and F) PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0001117 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC56F2.02) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 5D) PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0000059 FYECO:0000126 medium PMID:39358553 4896 2024-10-21 (Fig. 1C) PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0001097 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000251 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000099 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000799 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000088 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000841 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0002546 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:39358553 4896 2024-10-27 (Fig. 1D) PomBase SPNCRNA.1530 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- aal1 aal1+ aal1-pOE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 high PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. EV2) PomBase SPCC584.16c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPCC584.16c SPCC584.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC584.16c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPCC584.16c SPCC584.16cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC584.16c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.16c SPCC584.16cdelta deletion ECO:0005638 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We found that the Rpb1 interaction with both capping enzymes persisted when the AD fusion contained little more than the CTD repeats per se. PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000703 1-1515 Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1(1516-1752) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_protein(PomBase:SPBC2F12.08c) PMID:11387325 4896 2024-02-29 To gauge the role of the non-reiterated protein segment, we constructed an AD-Rpb1(1516 -1752) fusion clone and tested it in a directed two-hybrid assay paired with BD-Pce1 and BD- Pct1. We found that the Rpb1 interaction with both capping enzymes persisted when the AD fusion contained little more than the CTD repeats per se. PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 F368A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F368A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 F368A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F368A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 F368A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F368A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 F368A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-F368A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000082 wild type Overexpression 972 h- bag101 bag101+ wild_type ECO:0005638 medium PMID:27966061 4896 2016-12-19 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0001645 wild type Overexpression 972 h- bag101 bag101+ 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ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0001894 deletion 972 h- jnm1 jnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 11 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000927 deletion 972 h- jnm1 jnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 13 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. 1C; supplementary material Fig. S1C) PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000705 deletion 972 h- jnm1 jnm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.12) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Figure S2C) PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000903 deletion 972 h- jnm1 jnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 7F; supplementary material Table S1) PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000964 deletion 972 h- jnm1 jnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph jnm1 jnm1delta deletion ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPBC1711.01c) PMID:9710635 4896 2016-02-23 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000825 G159T Not assayed or wild type 972 h- rhp6 sng1- nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMTR.01) PMID:9710635 4896 2016-02-23 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0001886 G159T Not assayed or wild type 972 h- rhp6 sng1- nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:9710635 4896 2016-02-23 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0003353 G159T Not assayed or wild type 972 h- rhp6 sng1- nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:9710635 4896 2016-02-23 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000268 G159T Not assayed or wild type 972 h- rhp6 sng1- nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:9710635 4896 2016-02-23 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0000705 F520A Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-F520A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0002019 F520A Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-F520A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0002887 F520A Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-F520A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06) PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0002887 F520A Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-F520A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPAC26H5.06 FYPO:0005553 F520A Not assayed or wild type 972 h- pot1 pot1-F520A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-08-03 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002894 unknown Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-A324T unknown ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001865) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002896 unknown Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-A324T unknown ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001865) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002896 unknown Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-A324T unknown ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001843) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007021 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-07-29 (Table 2) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007022 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007024 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007025 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007026 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:25404562 4896 2019-07-29 PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC56E4.03) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC1773.13) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0001890 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC1105.02c) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007023 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0006249 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0000267) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0007017 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0001357 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:25404562 4896 2019-07-29 (Fig. 3A) PomBase SPAC4F10.03c FYPO:0001234 wild type Knockdown 972 h- trm7delta trm7 trm7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:25404562 4896 2019-07-29 (Fig. 2A) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000255 alp7-SV40\NLS Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-NLS 480394fd534ef4bd|alp7+NLS fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:19696784 4896 2017-08-07 (Fig 3B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000255 alp7-SV40\NLS Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-NLS 480394fd534ef4bd|alp7+NLS fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:19696784 4896 2017-08-07 (Fig 3B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0004539 alp7-SV40\NLS Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-NLS 480394fd534ef4bd|alp7+NLS fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:19696784 4896 2017-08-07 (Fig 3B) PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0001927 K75A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-K75A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:8846774 4896 2013-10-29 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 T634A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T634A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000703 T634A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T634A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001278 137-143 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D3 mcm2-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000838 137-143 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D3 mcm2-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000703 137-143 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D3 mcm2-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000703 137-143 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D3 mcm2-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000703 137-143 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D3 mcm2-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0003029 S122A,S131A Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1-S122A,S131A amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F3.09) PMID:34209806 4896 2021-07-30 PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0000825 S122A,S131A Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1-S122A,S131A amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.01) PMID:34209806 4896 2021-07-30 PomBase SPBC4.03c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ sfb3 sfb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC4.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- sfb3 sfb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfb3 sfb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4.03c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfb3 sfb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.09c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1711.09c SPBC1711.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001645 1-71 Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18delta71 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001492 1-71 Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18delta71 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002060 1-71 Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18delta71 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001978 wild type Overexpression 972 h- cut12 cut12+ wild_type ECO:0001232 PMID:9531532 4896 2019-01-03 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0002806 267-410 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta267-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 267-410 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta267-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 267-410 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta267-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000844 267-410 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta267-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPBC354.05c FYPO:0001668 492-793 Overexpression 972 h- sre2 sre2(1-491) sre2truncation_492-793 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0007253 1-207 Not assayed or wild type 972 h- opy1 opy1(aa208-end) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:33172987 4896 2020-11-19 (Figure 1C) PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0002126 1-207 Not assayed or wild type 972 h- opy1 opy1(aa208-end) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Figure S1) PomBase SPCC736.12c FYPO:0002061 Y352A Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-Y352A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 PomBase SPCC962.01 FYPO:0008455 I300W,Y468W Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1ww amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000466 medium PMID:40629316 4896 2025-09-01 These mutations did not affect protein locali- zation but indeed led to compromised hypotonic PM expansion (Fig. 3F and Additional file 1: Fig. S3C). PomBase SPCC962.01 FYPO:0003627 I300W,Y468W Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1ww amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000466 assayed_protein(PomBase:SPAPYUK71.03c) PMID:40629316 4896 2025-09-01 These mutations did not affect protein locali- zation but indeed led to compromised hypotonic PM expansion (Fig. 3F and Additional file 1: Fig. S3C). PomBase SPCC962.01 FYPO:0003627 I300W,Y468W Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1ww amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000466 assayed_protein(PomBase:SPCC962.01) PMID:40629316 4896 2025-09-01 These mutations did not affect protein locali- zation but indeed led to compromised hypotonic PM expansion (Fig. 3F and Additional file 1: Fig. S3C). PomBase SPAC1805.17 FYPO:0006743 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:29900664 4896 2018-11-13 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0006744 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:29900664 4896 2018-11-13 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001357 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001357 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000073 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0006735 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0006735 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000088 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0006736 H467Y Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-467 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 522-583 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11-delta522-583 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 522-583 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11-delta522-583 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-17 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0001384 522-583 Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11-delta522-583 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPCC550.06c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hsp10 hsp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- hsp10 hsp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC550.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hsp10 hsp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.14c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 orc5 orc5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC646.14c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 orc5 orc5delta deletion ECO:0001232 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2024-09-28 (Fig. 4I and K) PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0004416 deletion 972 h- gpa2 gpa2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:21169418 4896 2015-02-16 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000581 deletion 972 h- gpa2 gpa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:11180454 4896 2015-07-15 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph gpa2 gpa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph gpa2 gpa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph gpa2 gpa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph gpa2 gpa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0004167 deletion 972 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cwf2 prp3-4 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 medium assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC3A12.11c FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- cwf2 prp3-4 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 low assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC3A12.11c FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- cwf2 prp3-4 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC3A12.11c FYPO:0002107 unknown Not assayed or wild type 972 h- cwf2 prp3-4 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAC22F8.11 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- plc1 plc1-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:8590474 4896 2022-09-18 PomBase SPAC22F8.11 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- plc1 plc1-1 unknown ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002679 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 2G) However, mutation of 3 additional Cdk1 consensus sites abolished Imp2 phosphorylation by Cdk1 (Imp2-11A, Fig. 2C). PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001368 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0004097 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007828 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 4) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001760 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0004083 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2D and F) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002559 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2D-E) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001903 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure SA and C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002253 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S3B-C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007829 T346A,S367A,T384A,S397A,S402A,T426A,S451A,T467A,S490A,S511A,T531A Not assayed or wild type 972 h- imp2 imp2-11A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 3) Imp2-11A-mNG was recruited to the CR earlier (ca. 4 minutes) than Imp2-mNG (Fig. 3A, B, and C). PomBase SPCC895.07 FYPO:0005842 642-695 Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14deltatubBD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.07) PMID:24790093 4896 2022-06-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002966 642-695 Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14deltatubBD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC895.07) PMID:24790093 4896 2022-06-01 PomBase SPAC110.03 FYPO:0005803 cdc42(1-134)-linker-GFP-linker-cdc42(135-188,193-195)-psy1(248-284) Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-psy1TM fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPAC110.03 FYPO:0005801 cdc42(1-134)-linker-GFP-linker-cdc42(135-188,193-195)-psy1(248-284) Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-psy1TM fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPAC110.03 FYPO:0001357 cdc42(1-134)-linker-GFP-linker-cdc42(135-188,193-195)-psy1(248-284) Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-psy1TM fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:25837586 4896 2016-11-24 PomBase SPAC110.03 FYPO:0001357 cdc42(1-134)-linker-GFP-linker-cdc42(135-188,193-195)-psy1(248-284) Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-psy1TM fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25837586 4896 2016-11-24 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002377 cdc42(1-134)-linker-GFP-linker-cdc42(135-188,193-195)-psy1(248-284) Not assayed or wild type 972 h- cdc42 cdc42-mCherrySW-psy1TM fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:25837586 4896 2015-10-29 PomBase SPBC3H7.09 FYPO:0002507 C212A Not assayed or wild type 972 h- erf2 erf2-DHHA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.09c) PMID:23843742 4896 2013-08-12 PomBase SPAC56F8.07 FYPO:0001420 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo1-9,ceo1-11 ema19 ema19+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 4B,D, 6B,D,E) PomBase SPAC56F8.07 FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo1-9 ema19 ema19+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 4B,D) PomBase SPAC56F8.07 FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo1-11 ema19 ema19+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 4B,D) PomBase SPAC56F8.07 FYPO:0002104 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo1-9,ceo1-11 ema19 ema19+ wild_type ECO:0001232 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 7) PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L79* Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-delta79-261 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L79* Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-delta79-261 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 L79* Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-delta79-261 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9592143 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 V42VGVPQV Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K33 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 S487A,D488A,S489A,E490A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-4A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 4F) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0005917 S487A,D488A,S489A,E490A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-4A amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11),assayed_transcript(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5B) PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0001424 35-376 Knockdown 972 h- lsd2 lsd2-N5 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0004085 35-376 Knockdown 972 h- lsd2 lsd2-N5 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0002061 35-376 Knockdown 972 h- lsd2 lsd2-N5 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32295063 4896 2020-09-30 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000350 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002399 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009112 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000139,FYECO:0000142,FYECO:0000225,FYECO:0000226,FYECO:0000381 high PMID:35924983 4896 2023-07-06 (Figure 7) PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000912 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:23209828 4896 2016-11-29 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000846 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000846 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:22017871 4896 2017-11-30 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000846 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000028992) PMID:22017871 4896 2017-11-30 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002768 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002960 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002960 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002960 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001327 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001327 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001327 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000081,FYECO:0000142,FYECO:0000225,FYECO:0000226,FYECO:0000381 high high assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:35924983 4896 2023-07-06 (Figure 6) PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001327 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000139,FYECO:0000142,FYECO:0000225,FYECO:0000226,FYECO:0000381 high high assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:35924983 4896 2023-07-06 (Figure 6) PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000650 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002401 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001578 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 PMID:22226946 4896 2012-11-23 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0003299 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:23348717 4896 2014-04-24 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000833 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 We constructed mutants of E3 ligases and their components that have been suggested to localize to or function in the ER and nucleus, namely ......... The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000551 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000073 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0004025 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000829 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0004325 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0007358 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000088 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2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000200 high PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ubr1 ubr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C7.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubr1 ubr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0006233 deletion 972 h- ade, ura-, leu- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPAC30C2.07) PMID:34805795 4896 2021-12-23 (Figure S3) Bhd1 and Fnp1 localize to vacuoles in response to amino acid starvation and that this localization is largely independent of the presence of the other protein. PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0002679 deletion 972 h- ade, ura-, leu- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 (Figures 2G and S4), demonstrating that the BFC, is required for efficient activation of TORC1 following amino acid supplementation. PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000636 deletion 972 h- ade, ura-, leu- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000401 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001566 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000335 PMID:17556368 4896 2014-11-03 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001568 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000335 PMID:17556368 4896 2014-11-03 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001569 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000335 PMID:17556368 4896 2014-11-03 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0007907 deletion 972 h- ade, ura-, leu- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34805795 4896 2021-12-23 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0007907 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:28656962 4896 2023-04-03 We observed that loss of Bhd1 and Ypt71, but not Ypt7, resulted in increased TORC1 activity, as determined by an increase in Rps6 and p70 S6K phosphorylation levels when cells were deprived of amino acids (Fig. 5a, compare lanes 1, 3, 5 and 7). PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001573 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:17556368 4896 2012-11-23 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001573 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:17556368 4896 2012-11-23 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001573 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:17556368 4896 2012-11-23 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001573 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:17556368 4896 2012-11-23 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC22F3.13) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.08c) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000825 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPBC354.12) PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0007909 deletion 972 h- ade, ura-, leu- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0001232 PMID:34805795 4896 2021-12-18 (Figure 4d) PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001545 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 PMID:17556368 4896 2014-11-03 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0006266 deletion 972 h- ade, ura-, leu- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0001232 PMID:34805795 4896 2021-12-23 (Figure S1A) PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 PMID:28656962 4896 2023-06-08 (Figure 5b) PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0001557 deletion 972 h- bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 PMID:17556368 4896 2012-09-13 PomBase SPBC24C6.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph bhd1 bhd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 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asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11E3.06) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB8B6.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC977.16c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC2H10.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC713.05) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC3A11.07) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1861.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC56F8.15) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC530.10c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC18G6.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000826 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC513.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002638 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008278 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000335 high PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000274 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 5c) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005976 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 5) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC750.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23H3.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11D3.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC25B8.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC18B5.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1020.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC569.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13D6.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000228 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 6E) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0004438 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0003328 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25254656 4896 2019-05-20 (Figure S15) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000324 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 5c) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006475 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 18 PMID:27697865 4896 2018-04-03 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002085 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 1A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure S3) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0003840 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000091 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005567 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0004236 D333A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-D333A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 1A) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000769 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 36 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000941 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000941 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000941 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0003165 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 15 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002024 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 6 PMID:16775007 4896 2018-03-07 (Fig. 5D) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0006430 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 68 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 PMID:16775007 4896 2018-03-07 (Figure 5, A and B) PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0005686 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 14 high PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000276 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 <7 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0001400 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 79 PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000647 wild type Knockdown 972 h- ppc89 ppc89+ wild_type ECO:0005638 high PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001645 522-810 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-1-521 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01),assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007074 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000964 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002578 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 E35K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34K amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPBC19G7.01c FYPO:0000581 unknown Not assayed or wild type 972 h- msh2 mut3-25 unknown ECO:0005638 PMID:9858548 4896 2018-07-13 PomBase SPCC1450.07c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dao1 dao1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dao1 dao1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1450.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph dao1 dao1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dao1 dao1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dao1 dao1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAC19D5.04 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptr1 ptr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19D5.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- ptr1 ptr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19D5.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptr1 ptr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002679 S598A,S605A,S611A Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-S>A klp9-3A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:19686686 4896 2016-04-01 (fig. 5B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003349 S598A,S605A,S611A Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-S>A klp9-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 5) PomBase SPAC926.03 FYPO:0005906 wild type Overexpression 972 h- rlc1 rlc1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC926.03 FYPO:0006187 wild type Overexpression 972 h- rlc1 rlc1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-15 PomBase SPAC926.03 FYPO:0004895 wild type Overexpression 972 h- rlc1 rlc1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001645 1-245,318-578 Not assayed or wild type 972 h- bdf1 bdf1(246-317) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 4D) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001696 L117G Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-as1 plo1.as1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 1) Chronic exposure to analogue through growth on solid medium reiterated the acute impact of analogue inhibition in liquid culture (Fig. 1A) and established that plo1.as8 is most effectively inhibited by 3BrB- PP1 (Fig. 1B). PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001696 L117G Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-as1 plo1.as1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000223 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 1) PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 E74A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E74A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001357 E74A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E74A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPAC18G6.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp11 utp11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- utp11 utp11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC18G6.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp11 utp11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC649.05 FYPO:0003541 pcp1-hrs1 Not assayed or wild type 972 h- cut12 pcp1-hrs1 Hrs1-Pcp1|pcp-hrs1 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 5) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007256 pcp1-hrs1 Not assayed or wild type 972 h- cut12 pcp1-hrs1 Hrs1-Pcp1|pcp-hrs1 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 5A) PomBase SPCC1494.03 FYPO:0001317 A1696G,A1700G Overexpression 972 h- arz1 arz1-MuA nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1494.03) PMID:18042546 4896 2014-01-10 PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0002020 CCC(-2642)TGA Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-CORE2 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0000825 CCC(-2642)TGA Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-CORE2 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0002817 K16R,K46R,K54R,K55R,K57R,K58R,K86R,K90R Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-K1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003611 K16R,K46R,K54R,K55R,K57R,K58R,K86R,K90R Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-K1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0003611 K16R,K46R,K54R,K55R,K57R,K58R,K86R,K90R Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-K1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0001571 K16R,K46R,K54R,K55R,K57R,K58R,K86R,K90R Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-K1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.01c),assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC5D6.08c FYPO:0001571 K16R,K46R,K54R,K55R,K57R,K58R,K86R,K90R Not assayed or wild type 972 h- mes1 mes1-K1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0004335 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPAC4A8.03c) PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0000342 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0002009 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0004339 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0001422 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.03c) PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0004333 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0001409 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0000087 R8A,R10A,R27A Not assayed or wild type 972 h- ptc4 ptc4-R8A,R10A,R27A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- ubc13 ubc13delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0006811 deletion 972 h- ubc13 ubc13delta deletion ECO:0000059 PMID:34292936 4896 2021-08-11 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0001690 deletion 972 h- ubc13 ubc13delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0006679 deletion 972 h- ubc13 ubc13delta deletion ECO:0000336 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PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3D) PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ubc13 ubc13delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0000268 deletion 972 h- ubc13 ubc13delta deletion ECO:0005638 low PMID:16641370 4896 2012-06-11 PomBase SPAC11E3.04c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph ubc13 ubc13delta 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prototroph hst2 hst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC132.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph hst2 hst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC132.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph hst2 hst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC132.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph hst2 hst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC132.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- hst2 hst2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC132.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst2 hst2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC132.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hst2 hst2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005934 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:37970674 4896 2023-11-17 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001870 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0008178 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0006995 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000137 PMID:37970674 4896 2023-11-17 (Figure 3D) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000964 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37970674 4896 2023-11-17 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000833 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002967 K50R,K64R,K72R,K83R,K92R,K121R,K150R Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-K7R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000775 T356A Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000081 assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000705 T356A Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000081 assayed_using(PomBase:SPBC106.10),assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000588 T356A Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21879336 4896 2011-09-30 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000271 T356A Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000031,FYECO:0000126 PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r5-r17-2),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S5A.S5(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPCC576.15c FYPO:0000705 409-592 Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1delta409-592 ksg1cat|ksg1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.14c),assayed_using(PomBase:SPCC576.15c) PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPCC576.15c FYPO:0000705 409-592 Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1delta409-592 ksg1cat|ksg1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC12D12.04c),assayed_using(PomBase:SPCC576.15c) PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPBC18E5.12c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mas2 mas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18E5.12c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mas2 mas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18E5.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- mas2 mas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18E5.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mas2 mas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0002890 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007080 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 59 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1E) and all (n=50, p<0.01) those SPBs failing to recruit Alp4 show SPB separation problems and failed spindle nucleation (Figure 1E). PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000151 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000734 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000737 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 57 PMID:17632059 4896 2018-02-11 Table S3 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0006388 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 53 PMID:17632059 4896 2018-02-11 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0004094 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:29123917 4896 2018-02-09 (Fig. 6) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000121 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0000059 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0003066 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 ~58 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1B) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0003066 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0001894 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000927 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. S3) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007081 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 75.5 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1C) In contrast, in the absence of the bouquet, the duplicated SPBs often fail to separate. Indeed, 75.5% of bqt1Δ cells with defective meiosis show problems in SPB separation at MI PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007081 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 24.5 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1C) In contrast, in the absence of the bouquet, the duplicated SPBs often fail to separate . Indeed, 75.5% of bqt1Δ cells with defective meiosis show problems in SPB separation at MI PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007485 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 100 PMID:27889481 4896 2020-10-13 In 100% of the bqt1Δ cells that show monopolar spindles (n=11), those spindles are nucleated specifically from the old SPB (Figure S1I). Hence, failed spindle nucleation in the absence of the bouquet is specific to the new SPB. PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0006366 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007487 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1C, 1F, 1G) We previously observed a tendency for the SPB to dissociate from the NE just prior to meiotic spindle formation in the bqt1Δ setting (Fennell et al., 2015; Tomita and Cooper, 2007); indeed, SPBs showing problems in separation typically appear to dislodge into the cytoplasm (Figure 1C, yellow arrowheads PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0003542 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1002.06c) PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0003054 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 high PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0002485 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0002485 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0003179 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000485 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0000059 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1c) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0005736 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007482 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 59 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1E) In contrast, Alp4 localization is defective (ie one or both SPB signals lack any detectable Alp4 colocalization at MI onset) in 59% of bqt1Δ meiocytes (n= 100, p<0.01) from the onset of MI onwards PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000581 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0004994 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2017-12-11 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0006405 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:17632059 4896 2018-02-11 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0004610 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0006365 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:17632059 4896 2018-02-11 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0006363 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:27889481 4896 2020-10-13 (Figure 1) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007486 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 PMID:27889481 4896 2020-10-22 (Figure 1) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0000590 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 ~42 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1B) PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0002905 deletion 972 h- bqt1 bqt1delta deletion ECO:0000337 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SPAC6G9.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bqt1 bqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.15c FYPO:0005909 2356-2366 Not assayed or wild type 972 h- bip1 bip1-deltaTTAACTGGTG\C partial_nucleotide_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC22A12.15c FYPO:0001457 2356-2366 Not assayed or wild type 972 h- bip1 bip1-deltaTTAACTGGTG\C partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC31G5.01 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sap49 sap49delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.01 FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 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prp8-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0004201 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 Moreover, mutants that alleviated cen1:ade6+ silencing also displayed increased levels of noncoding centromeric otr transcripts and concomitant reductions in centromeric siRNA accumulation, with prp10-1 showing the most severe silencing defects (Fig. 1C PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 low assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 medium assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 low assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 medium assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0001908 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 However, at the permissive temperature of 25°C (at which centromeric silencing was alleviated), splicing efficiency was similar to that in wild-type cells (Fig. 2A). PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0003620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPBC19C2.01 FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc28 prp8-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0002962 1-507 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-3' meiRNA-3' partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0002133 1-507 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-3' meiRNA-3' partial_nucleotide_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:24920274 4896 2019-11-08 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0001152 1-507 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-3' meiRNA-3' partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0001152 1-507 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-3' meiRNA-3' partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure S1) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0000584 1-507 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2-3' meiRNA-3' partial_nucleotide_deletion 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PomBase SPCC188.08c FYPO:0000669 C222S Not assayed or wild type 972 h- ubp5 ubp5(C222S) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPCC188.08c),assayed_substrate(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2017-12-30 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000088 R268A,H269A Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-R268A,H269A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPAC16E8.18c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tam5 tam5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.18c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tam5 tam5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.18c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tam5 tam5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.18c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tam5 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2023-06-28 PomBase SPAC26F1.10c FYPO:0001492 R476K Overexpression 972 h- pyp1 pyp1-R476K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPBC800.12c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.12c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC800.12c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPBC800.12c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.12c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph SPBC800.12c SPBC800.12cdelta 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.12c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC800.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC800.12c SPBC800.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.09c FYPO:0001668 668-709 Not assayed or wild type 972 h- krp1 krp1-R667* partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:9418887 4896 2012-02-23 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K7R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K7R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K7R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K7R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000969 K76A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0001690 K76A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000963 K76A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0003183 K76A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0001357 K76A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000089 K76A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-K76A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19804756 4896 2017-03-17 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003179 Y98F Not assayed or wild type 972 h- rec12 rec12-Y98F amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:10882124 4896 2020-09-15 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002219 Y98F Not assayed or wild type 972 h- rec12 rec12-Y98F amino_acid_mutation ECO:0001232 <98.2 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Fig. 1D) although sister kinetochore sometimes split, segregation ends up mostly normal PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005634 Y98F Not assayed or wild type 972 h- rec12 rec12-Y98F amino_acid_mutation ECO:0001232 1.8 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Fig. 1D) PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005633 Y98F Not assayed or wild type 972 h- rec12 rec12-Y98F amino_acid_mutation ECO:0001232 40 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Fig. 1D) PomBase SPBC609.05 FYPO:0000164 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pob3 pob3delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000854 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000059 PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000854 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000059 low PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPBC609.05 FYPO:0007376 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. S1F) PomBase SPBC609.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2A) PomBase SPBC609.05 FYPO:0000080 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2A) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003217 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 high PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 6A) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003217 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 low PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2B) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPBC609.05 FYPO:0003411 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 medium PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2B) PomBase SPBC609.05 FYPO:0006993 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 low PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2B) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003412 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 low PMID:34731638 4896 2021-11-23 PomBase SPBC609.05 FYPO:0003412 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPBC609.05 FYPO:0002827 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 high PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3F) PomBase SPBC609.05 FYPO:0002827 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 high assayed_transcript(PomBase:SPMTR.01) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3H) PomBase SPBC609.05 FYPO:0002827 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC609.05 FYPO:0002827 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 medium PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0004604 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 high PMID:34731638 4896 2021-11-23 (Figure 1B) In contrast, there was a substantial reduction of H3K9me2 at the mating-type locus, in agreement with a previous study (Holla et al., 2020) (Figure S1A), and at the subtelomeres PomBase SPBC609.05 FYPO:0007478 deletion 972 h- epe1delta pob3 pob3delta deletion ECO:0005580 medium PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 6B, C and D) PomBase SPBC609.05 FYPO:0005222 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000004 PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPBC609.05 FYPO:0004137 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 low PMID:34731638 4896 2021-11-23 (Figures 1B, 1C, S1D) only a subtle change of H3K9me2 at pericentromere PomBase SPBC609.05 FYPO:0008185 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 medium PMID:38479839 4896 2024-03-25 (Fig. 6A) PomBase SPBC609.05 FYPO:0000883 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 low PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 6A and Fig. S6B) PomBase SPBC609.05 FYPO:0005845 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 6A and Fig. S6B) PomBase SPBC609.05 FYPO:0004578 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000112 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPBC609.05 FYPO:0004491 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000059 PMID:23032292 4896 2016-03-31 PomBase SPBC609.05 FYPO:0007837 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000059 PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001324 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:34731638 4896 2021-11-26 PomBase SPBC609.05 FYPO:0006599 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 4C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0002387 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-26 Although degradation of Epe1 still occurs in pob3Δ in S phase, we found increased steady-state levels of Epe1 in cycling cells (Figure S3A). PomBase SPBC609.05 FYPO:0002387 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.04) PMID:34731638 4896 2021-11-26 (Figures S4A-S4C) Histone H3 ChIP-seq revealed a small but reproducible reduction of H3 at subtelomeres in pob3Δ PomBase SPBC609.05 FYPO:0002387 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000229 low assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:34731638 4896 2021-11-26 (Figures S4A-S4C) Histone H3 ChIP-seq revealed a small but reproducible reduction of H3 at subtelomeres in pob3Δ PomBase SPBC609.05 FYPO:0002387 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000229 low assayed_protein(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:34731638 4896 2021-11-26 (Figures S4A-S4C) Histone H3 ChIP-seq revealed a small but reproducible reduction of H3 at subtelomeres in pob3Δ PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC926.05c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1709.06) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC644.05c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC965.14c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC622.19) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC5D6.05) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP22H7.08) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP23A10.03c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC29B12.04) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC146.08c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC3B9.10) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC694.03) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC8E11.10) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0005849 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_region(SO:0001789) PMID:34731638 4896 2021-11-23 (Figure 2C) Conversely, in the pob3Δ strain, the orange reporter was also fully derepressed in the majority of cells, yet the green reporter remained silenced or mildly derepressed. This result implies that pob3Δ cells have a heterochromatin spreading defect PomBase SPBC609.05 FYPO:0005528 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0001232 high PMID:31837996 4896 2021-07-16 PomBase SPBC609.05 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pob3 pob3delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC609.05 FYPO:0002913 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 high PMID:31837996 4896 2021-07-16 PomBase SPBC609.05 FYPO:0005372 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000334 56 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 3C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0007892 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 PMID:34731638 4896 2021-11-23 Nonetheless, the pob3Δ mutant exhibited increased incorporation of H3-T7 at the TEL1L region (Figure 4G), implying that the H3 turnover rate is increased at subtelomeric heterochromatin. PomBase SPBC609.05 FYPO:0007895 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 PMID:34731638 4896 2021-12-08 (Figures 1E and S1D) we found increased signals of elongating RNAPII (RNAPII Ser2P) and H2B ubiquitination (H2Bub), a histone mark associated with active transcription PomBase SPBC609.05 FYPO:0007894 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 PMID:34731638 4896 2021-11-26 (Figures 1E and S1D) we found increased signals of elongating RNAPII (RNAPII Ser2P) and H2B ubiquitination (H2Bub), a histone mark associated with active transcription PomBase SPBC609.05 FYPO:0005371 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000334 1 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 3C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003033 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.18c) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC609.05 FYPO:0003033 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC664.06) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC609.05 FYPO:0003033 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC140.02) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC6F6.08c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1782.01) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC27B12.03c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC11H11.05c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC965.07c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC144.14) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC9E9.03) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC17C9.02c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.01) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC338.12) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC557.03c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC365.20c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1921.06c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC637.10c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC22F8.08) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC22F8.12c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC19B12.09) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.03c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1002.19) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1002.17c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC29A4.06c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC212.06c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC212.08c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC750.07c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1834.10c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC9E9.04) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBPJ4664.02) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC22F8.05) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC1739.08c) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAPB1A11.03) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC19G12.09) PMID:17614284 4896 2024-06-20 Table S1 PomBase SPBC609.05 FYPO:0005917 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000291 PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001309 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000228 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0001232 10 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 3A, B) PomBase SPBC609.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pob3 pob3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC609.05 FYPO:0008265 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0003555 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000049 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pob3 pob3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001164 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPBC609.05 FYPO:0004743 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 4C) PomBase SPBC609.05 FYPO:0004314 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:35970865 4896 2022-10-05 PomBase SPBC609.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. 2A) PomBase SPBC609.05 FYPO:0007834 deletion 972 h- pob3 pob3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.19) PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPBC609.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC609.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC609.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC609.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pob3 pob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC609.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pob3 pob3delta 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SPCC550.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph nmd5 nmd5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- nmd5 nmd5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC550.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nmd5 nmd5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nmd5 nmd5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 I99IRGTPI Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K20 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPCC645.07 FYPO:0004188 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001529 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 6A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0005798 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. 4A) PomBase SPCC645.07 FYPO:0001885 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 6C) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000703 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01),assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 4D) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000079 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16421249 4896 2022-01-08 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000088 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0002848 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 45 PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. 4E) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000647 589-592 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-PTTRdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 30-35 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2B) regardless of the growth temperature 30 -35% of the cells were lysed PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000705 E476R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E476R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 E476R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E476R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 E476R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E476R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC821.07c FYPO:0003066 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0001232 PMID:16273369 4896 2014-10-29 PomBase SPAC821.07c FYPO:0008153 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Moreover, the localization of PhpC subunits was compro- mised in moc3Δ cells (Fig. 3a, b and Supplementary Fig. 3b, c). PomBase SPAC821.07c FYPO:0003074 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Moreover, the localization of PhpC subunits was compro- mised in moc3Δ cells (Fig. 3a, b and Supplementary Fig. 3b, c). PomBase SPAC821.07c FYPO:0001407 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC821.07c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000230 PMID:16273369 4896 2014-10-29 PomBase SPAC821.07c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 moc3 moc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC821.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC821.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.07c FYPO:0009008 deletion 972 h- moc3 moc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 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h- alp4 alp4-C(566-784) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 71 PMID:16611237 4896 2015-10-19 PomBase SPBC365.15 FYPO:0004511 1-565 Overexpression 972 h- alp4 alp4-C(566-784) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-19 PomBase SPBC365.15 FYPO:0001870 1-565 Overexpression 972 h- alp4 alp4-C(566-784) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16611238 4896 2015-10-19 PomBase SPBC365.15 FYPO:0004367 1-565 Overexpression 972 h- alp4 alp4-C(566-784) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0004974 1-565 Overexpression 972 h- alp4 alp4-C(566-784) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16611238 4896 2015-10-26 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 1-70,181-659,S87A,T94A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d2-S87A,T94A B2d2-S87A-T94A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 3) PomBase SPCC338.08 FYPO:0000655 R192A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R192A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0001326 deletion 972 h- kanR not3 not3delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22737087 4896 2020-05-12 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- natR, chromosome 3 disomy not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:22737087 4896 2020-05-12 (Fig. 3A) PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002937 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 not3 not3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0007392 deletion 972 h- natR, chromosome 3 disomy not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:22737087 4896 2020-05-12 (Fig. 3B) ( PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0007391 deletion 972 h- kanR not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22737087 4896 2020-05-04 (Fig. 1 Table 1) PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0007391 deletion 972 h- kanR not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22737087 4896 2020-05-12 (Fig. 4) PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 not3 not3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0006992 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0000049 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0006992 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0000231 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002336 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0000049 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002336 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0000231 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0003555 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0000049 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0003555 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0000231 PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 not3 not3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 not3 not3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0000267 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 not3 not3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0006464 L431R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L431R amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:26088418 4896 2023-02-19 Indeed, yeast cells expressing the L431R and L445R mutants exhibited significant loss of function in telomere length regulation and showed long and highly heterogenous telomeres that were as severe as that in taz1Δ cells (Figure 1K) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000705 L431R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L431R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26088418 4896 2023-02-19 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004083 L431R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L431R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26088418 4896 2023-02-19 Mutant proteins were expressed at a comparable level as wild-type Taz1 (data not shown). PomBase SPAC688.06c FYPO:0002037 deletion 972 h- slx4 slx4delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAP27G11.15) PMID:14528010 4896 2019-11-06 PomBase SPAC688.06c FYPO:0005777 deletion 972 h- slx4 slx4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-10 PomBase SPAC688.06c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 slx4 slx4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC688.06c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 slx4 slx4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC688.06c FYPO:0000969 deletion 972 h- slx4 slx4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14528010 4896 2019-11-06 PomBase SPAC688.06c FYPO:0000963 deletion 972 h- slx4 slx4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14528010 4896 2019-11-06 PomBase SPAC688.06c FYPO:0001357 deletion 972 h- slx4 slx4delta deletion ECO:0005638 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph uba2 uba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.03c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph uba2 uba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.03c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph uba2 uba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- uba2 uba2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16H5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uba2 uba2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001424 1-580 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(581-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006638 1-580 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(581-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-580 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(581-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 46 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 1-580 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(581-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 49 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004418 T1099A,T1117A Not assayed or wild type 972 h- cut1 ptr4-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14511667 4896 2015-02-16 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003119 T1099A,T1117A Not assayed or wild type 972 h- cut1 ptr4-1 nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9168469 4896 2015-03-11 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0002303 T1099A,T1117A Not assayed or wild type 972 h- cut1 ptr4-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14511667 4896 2015-02-16 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004397 T1099A,T1117A Not assayed or wild type 972 h- cut1 ptr4-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:14511667 4896 2015-04-23 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004121 T1099A,T1117A Not assayed or wild type 972 h- cut1 ptr4-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:14511667 4896 2015-02-16 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004121 T1099A,T1117A Not assayed or wild type 972 h- cut1 ptr4-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9168469 4896 2015-03-11 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000580 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002890 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003659 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003659 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000337 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000172 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001131 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000348 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 75 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003066 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 50 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0005850 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003411 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 high PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C, 1E) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003411 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003412 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 high PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C, 1E) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003412 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003412 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002827 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002827 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 high PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C, 1E) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002827 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002827 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004604 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 high PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 1C, 1E) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004604 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003352 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003096 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions (CEN- dg223, MAT-K-R, or TEL-E12) was reduced to a level comparable to that in Dclr4 (Figure 6A) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003571 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions (CEN- dg223, MAT-K-R, or TEL-E12) was reduced to a level comparable to that in Dclr4 (Figure 6A) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003572 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15372076 4896 2024-01-23 We found that H3-K9 methylation at the three heterochromatic regions (CEN- dg223, MAT-K-R, or TEL-E12) was reduced to a level comparable to that in Dclr4 (Figure 6A) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000470 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002842 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.20) PMID:11780129 4896 2024-04-12 Psc3 localization was strikingly disrupted in the swi6∆ strain at both loci (Fig. 1b). PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003573 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.20) PMID:11780129 4896 2024-04-12 Psc3 localization was strikingly disrupted in the swi6∆ strain at both loci (Fig. 1b). PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004205 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000581 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000584 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:15197176 4896 2015-10-21 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007322 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 5D, 5E) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003557 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19693008 4896 2024-01-15 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta rik1 rik1delta deletion ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001742 deletion 972 h- mat2-3delta rik1 rik1delta deletion ECO:0000337 PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001327 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 The western blot results suggest that the loss of any member of CLRC complex enhances the protein amount of Lsd1 (Fig 3C) or Lsd2 (Fig 3D). PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001327 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 The western blot results suggest that the loss of any member of CLRC complex enhances the protein amount of Lsd1 (Fig 3C) or Lsd2 (Fig 3D). PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001327 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 We found that the loss of any members in CLRC promotes the protein levels of Set1, both at 30 ̊C or 37 ̊C (Fig 5A), indicating that the intact CLRC restricts the amount of Set1. PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002541 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11069763 4896 2015-11-05 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007320 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 4 low PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 5A, 5B, 5E) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000238 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rik1 rik1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0006660 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0006660 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002837 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003797 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rik1 rik1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000943 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 25 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0008414 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. S7B, S7C) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004579 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0000291 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007629 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004325 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0004325 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. S2) PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000084 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0005252 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 high PMID:35172472 4896 2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rik1 rik1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph rik1 rik1delta 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PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 N842A Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-41 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004318 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- psc3-1T bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 2C) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001384 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1322.12c),assayed_substrate(PomBase:SPAC19G12.06c),assayed_substrate(PomBase:SPCC622.08c) PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004763 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig 4B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006455 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006455 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006455 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.02) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S6) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006456 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S5) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006456 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0002033 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1322.12c),assayed_substrate(PomBase:SPAC19G12.06c),assayed_substrate(PomBase:SPCC622.08c) PMID:19965387 4896 2024-05-13 phosphorylation was completely abolished in bub1-KD cells, although a similar amount of H2A was detected (Fig. 1G). PomBase SPCC1322.12c FYPO:0002577 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 4G) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006423 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 5C) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006423 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- mes1delta bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0002825 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0002825 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S6) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000228 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001687 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001164 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000091 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0003182 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 2F) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005634 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 20 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005634 K762R,D900N Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-KD bub1-kd|bub1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. 2E) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 chp1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 chp1 chp1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mug161 mug161delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0001029 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000725 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000725 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007808 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007926 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007926 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007924 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0000797 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0003656 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug161 mug161delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug161 mug161delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F3.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug161 mug161delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000935 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 6A,C) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004624 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 7) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0006220 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 7) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0004511 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 6D) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0002818 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 7) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0005686 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:30427751 4896 2019-05-31 (Figure 6A,C) PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC11B10.05c FYPO:0003302 wild type Overexpression 972 h- rsp1 rsp1+ wild_type ECO:0001232 70 PMID:15068790 4896 2022-06-17 (Fig. 7) PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0004325 deletion 972 h- cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.08 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph cox16 cox16delta deletion ECO:0005638 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SPBC14F5.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0001387 deletion 972 h- kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0003903 deletion 972 h- kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0001513 deletion 972 h- kap123 kap123delta deletion ECO:0000291 PMID:22268381 4896 2019-10-30 (Fig. 5) PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0004121 deletion 972 h- kap123 kap123delta deletion ECO:0001232 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 kap123 kap123delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- kap123 kap123delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap123 kap123delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- kap123 kap123delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC14F5.03c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap123 kap123delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.10c FYPO:0001234 S31L Not assayed or wild type 972 h- rpb3 rpb3-Ts3-31 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10503538 4896 2019-01-19 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0006464 D258A,E259A,E260A,D261A Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-4A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26088418 4896 2023-02-19 taz1-4A cells still exhibited extremely heterogeneous telomeres similar to taz1Δ and taz1-4R cells (Figure 1E). PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004083 D258A,E259A,E260A,D261A Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-4A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26088418 4896 2023-02-19 Both mutant proteins were expressed at near wild-type levels, suggesting that these acidic residues are not required for protein stability (data not shown). PomBase SPCC364.04c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coy1 coy1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC364.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC364.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph coy1 coy1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC364.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- coy1 coy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC364.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coy1 coy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC364.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coy1 coy1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F12.02c FYPO:0001178 deletion 972 h- Prototroph of ED668 tma19 tma19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1F12.02c FYPO:0001178 deletion 972 h- Prototroph of ED668 tma19 tma19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1F12.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- tma19 tma19delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F12.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tma19 tma19delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F12.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tma19 tma19delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000209 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000620 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000671 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003551 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001946 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000080 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000080 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000229 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003217 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003411 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003412 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002827 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003822 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003822 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000826 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0006613 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:31615333 4896 2020-09-19 (Figure S3) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001355 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001355 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20129053 4896 2014-08-15 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002638 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000220 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0008148 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002173 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002173 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC1556.06) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0005995 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001840 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000227 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004678 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:16478992 4896 2015-05-29 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001908 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.01) PMID:26670050 4896 2016-09-16 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001908 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 whereas rpl30-2 mRNA and pre-mRNA were upregulated 1.5- and 3.5- fold, respectively, using RNA from the dis3 mutant (Figure 2A, lane 5, and Figures 2B and 2C). PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003003 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003003 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000825 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000825 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004573 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000049 low assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:17512405 4896 2024-01-18 we observed 7-fold and a 25-fold increases in tlh1+ transcript levels in rrp6D and dis3-54 cells, respectively, and 33- and 100- fold increases in cid14D and clr4D cells, respectively (Figures 4G and S3) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002061 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:1944266 4896 2015-06-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000733 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002688 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002837 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0007281 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:20622014 4896 2020-11-13 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001761 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:1944266 4896 2012-11-22 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004680 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:16478992 4896 2015-05-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001759 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 PMID:1944266 4896 2012-11-22 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001357 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000097 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000091 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3409871 4896 2014-05-21 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000091 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0000091 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17380189 4896 2014-09-12 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0002060 P509L Not assayed or wild type 972 h- dis3 dis3-54 dis3.54 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1944266 4896 2015-06-12 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002373 cdc12::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:9105045 4896 2014-04-17 PomBase SPAC4C5.02c FYPO:0001571 G23A Not assayed or wild type 972 h- ryh1 ryh1-G23A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1851.04c),assayed_using(PomBase:SPAC4C5.02c) PMID:21035342 4896 2016-07-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cpc2 cpc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003345 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000058 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007803 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000126 PMID:33534698 4896 2021-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003020 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.09) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0008334 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 PMID:39379376 4896 2024-10-29 We then used in situ cryo-ET to assess whether ribosomal tethering to mitochondria was affected in the Δcpc2 strain. The tomograms showed fragmented circular mitochondria, as observed in WT cells, while no ribosome tethering was observed after 7 days of cells growing at low glucose concentrations (Fig. 5c, d, Supplementary Fig. 10 and Supplementary Movie 3). PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000569 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000058 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000711 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000082 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000082 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 1C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 PMID:12972434 4896 2020-11-21 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC106.18) PMID:12972434 4896 2020-11-21 These data indicate that the decrease in ribosomal protein L25-A observed in cpc2::ura4 cells is probably due to a defect in recruitment of its mRNA to polyribosomes. The decreased amounts of both sam1 and thi2 RNAs are sufficient to account for the lowered protein abundance of each in cpc2::ura4 cells. In contrast, the decline in the level of ribosomal protein Rpl25 in cpc2::ura4 cells is not likely to be caused by an inability to accumulate its mRNA transcript. PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.04) PMID:12972434 4896 2020-11-21 These data indicate that the decrease in ribosomal protein L25-A observed in cpc2::ura4 cells is probably due to a defect in recruitment of its mRNA to polyribosomes. The decreased amounts of both sam1 and thi2 RNAs are sufficient to account for the lowered protein abundance of each in cpc2::ura4 cells. In contrast, the decline in the level of ribosomal protein Rpl25 in cpc2::ura4 cells is not likely to be caused by an inability to accumulate its mRNA transcript. PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000708 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003151 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4c) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007523 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4c) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003930 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003930 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003930 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000207 medium assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 5A) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 3D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 5A) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0004056 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.05) PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001838 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC418.01c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC56E4.03) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPCC364.07) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.13c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC4G9.10) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC1002.09c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC227.18) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.16c) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.04) PMID:23671279 4896 2014-04-17 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003770 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000049 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 1C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009007 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:39379376 4896 2024-10-29 While Δcpc2 cells did not display discernible growth defects under nutrient-rich conditions, significant growth impairments were evident when these cells were cultivated in defined EMM media supplemented with either 2% or 0.5% glucose concentrations. PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0004038 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC576.03c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 7) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0004038 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 7) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0004038 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 7) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007524 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 6c,d) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001327 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 low assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 4C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001327 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000257 medium assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 4C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0002680 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 2A) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0002680 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 3D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000118 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0001232 low PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001037 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 6a) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007520 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 1C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007520 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 2B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000961 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 6a) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000961 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 PMID:11263963 4896 2024-04-16 (Fig. 3D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003075 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC19C2.05),assayed_substrate(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005168 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005168 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005168 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.07c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005168 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 5B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005168 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 5B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 3D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 3D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.07c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 3D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 4B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5A) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000833 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC644.06c) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003296 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.09) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001486 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 5B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000325 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 5B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 4C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC644.06c) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001317 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0002883 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000049 PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0005117 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000049 PMID:10805744 4896 2015-12-09 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001357 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 PMID:11263963 4896 2024-04-16 (Fig. 3B and D) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001310 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10805744 4896 2015-12-08 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001984 deletion 972 h- cpc2 cpc2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1795.11) PMID:19682301 4896 2014-11-24 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph cpc2 cpc2delta deletion ECO:0005638 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2018-05-14 (Fig. 1) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 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deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.07c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 5D-G) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0002339 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPAC1786.03) PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 4C) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0006583 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0000092 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. S3C) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0007532 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 high PMID:38917328 4896 2024-07-15 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0003589 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 2B) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0002649 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 PMID:28974540 4896 2018-06-06 fig 1e PomBase SPAC1486.04c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alm1 alm1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000344 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 3A and B) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0002638 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 PMID:28974540 4896 2018-05-14 (Fig. S3) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0006353 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 3) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC576.12c) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC800.13) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.04) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.12) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.03) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001327 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC18E5.03c) PMID:28974540 4896 2018-05-14 fig 3A-C PomBase SPAC1486.04c FYPO:0002151 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 PMID:10660053 4896 2014-08-04 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000228 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 31 PMID:28974540 4896 2018-05-14 (Fig. S2A, S1E) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000284 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 1C) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000324 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 PMID:28974540 4896 2018-05-14 (Fig. S2B) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001383 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alm1 alm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0006319 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0000337 PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 2D) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0004367 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 40 PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. S2) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0003751 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 40 PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 1) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000833 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.13c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 5b) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0004314 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 3G) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0005779 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0000092 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. S3E) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0005779 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0000092 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. S3G, S3H) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001317 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:28974540 4896 2018-06-18 fig 3E PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001317 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 fig 3E PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000095 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1A) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000085 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1A) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 high PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1A) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1486.04c FYPO:0000089 deletion 972 h- alm1 alm1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1A) PomBase SPAC1486.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph alm1 alm1delta deletion 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h- nup37 nup37-R210S amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.18),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.16c) PMID:22955883 4896 2014-04-17 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0004754 R32A,K34A,K35A Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-nls amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC13E7.06) PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0004754 R32A,K34A,K35A Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-nls amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3A11.14c) PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0003192 R32A,K34A,K35A Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-nls amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC13E7.06) PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0003192 R32A,K34A,K35A Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-nls amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3A11.14c) PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0004753 R32A,K34A,K35A Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-nls amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC13E7.06) PMID:25987607 4896 2015-07-29 PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0004753 R32A,K34A,K35A Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-nls amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3A11.14c) PMID:25987607 4896 2015-07-29 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0001018 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 60 PMID:23093943 4896 2021-03-26 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0002555 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.17) PMID:25411334 4896 2015-07-23 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006060 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.11c) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 5C) PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006060 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC821.06) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 5) PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006060 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 5) PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006060 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.11c) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006060 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.10c) PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006772 deletion 972 h- h90 spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0003213 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:41171630 4896 2025-11-27 (Table 2) PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:41171630 4896 2025-12-10 During septation, however, the exocyst spread across the division plane as a disk in spn1Δ cells while it remained at the rim in WT cells (Figure 2A, Figure 2—figure supplement 1A, B, red boxes). PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC970.09) PMID:41171630 4896 2025-12-10 During and after septum formation, the levels of all three exocyst components were significantly reduced at the division site (except Exo70 in cells with forming septum) and almost absent at the rim in spn1Δ cells (Figure 2A, B; Figure 2—figure supplement 1A–C). These results were confirmed in cells expressed Sec8-GFP and myosin light chain Rlc1 as a contractile ring marker (Figure 2D, E). PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC1183.01) PMID:41171630 4896 2025-12-10 the deletion of spn1 or spn4 led to mislocalization of Sec15 on the division plane in ~75% of cells with a septum while Sec15 in ~90% of WT cells PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:41171630 4896 2025-12-11 Consistently, secretory vesicle markers Rab11 GTPase Ypt3 and vSNARE Syb1 accumulated more in the center of the division plane but diminished from the rim in spn1Δ cells (Figure 6C, D). PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0006880 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:41171630 4896 2025-12-11 Consistently, secretory vesicle markers Rab11 GTPase Ypt3 and vSNARE Syb1 accumulated more in the center of the division plane but diminished from the rim in spn1Δ cells (Figure 6C, D). PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0003776 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102 PMID:23093943 4896 2021-03-26 In addition to these strains, we found other cytokinesis mutants exhibiting high degrees of monopolar growth (spn1D, cdc7-24, and vps24D) to also be highly invasive and to form pseudohyphal projections into 2% agar (Figure 9A-9B and Figure S7A) PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0000650 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0000118 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0004807 deletion 972 h- h90 spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-19 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0002559 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.05c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0008003 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0000590 deletion 972 h- h90 spn1 spn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0004325 deletion 972 h- spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC4F10.11 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph spn1 spn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 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The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. 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SPAC1527.03 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 slr1 slr1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph slr1 slr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- slr1 slr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 slr1 slr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1527.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 slr1 slr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0003066 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 20 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Table 3) PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0003066 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 low PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0003066 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0001894 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 13 PMID:25736293 4896 2017-04-11 (Fig. S1B) PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000681 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 PMID:9167972 4896 2013-01-30 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000927 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 2A) PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0005814 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 6B,C) PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ssm4 ssm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0003025 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 42 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Table 3) assayed using pairing of his2 loci PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0003179 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Table 2).leu1 and his2 loc, reduced 12 fold PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000929 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC458.04c),assayed_using(PomBase:SPBC646.17c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000937 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC458.04c),assayed_using(PomBase:SPBC646.17c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000933 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC646.17c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000933 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1093.06c) PMID:20298435 4896 2012-04-05 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0001645 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC216.02),assayed_using(PomBase:SPBC646.17c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 6a) PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ssm4 ssm4delta deletion 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PMID:15509865 4896 2017-07-11 data not shown PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0004764 deletion 972 h- ssm4 ssm4delta deletion ECO:0001232 PMID:15509865 4896 2017-07-11 (Fig. 6B,C). 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2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0004950 NES-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NES-alp4-C(566-784) NES-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 72 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0002852 NES-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NES-alp4-C(566-784) NES-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0002085 NES-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NES-alp4-C(566-784) NES-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0003503 NES-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NES-alp4-C(566-784) NES-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0001357 T66N Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-N66 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9862966 4896 2015-04-09 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004550 S78A,H81A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-FHA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000705 S78A,H81A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-FHA amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000229 S78A,H81A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-FHA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 72 PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005338 S78A,H81A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-FHA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAP14E8.02) PMID:31719112 4896 2020-03-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001513 S78A,H81A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-FHA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0000620 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut23 cut23-194 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0001055 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut23 cut23-194 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 23 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0003166 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut23 cut23-194 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut23 cut23-194 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPAC6F12.14 FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut23 cut23-194 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:10526233 4896 2015-10-26 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 K177R Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-K177R amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S650A,S654A B2d7-S650A-S654A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S650A,S654A B2d7-S650A-S654A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002243 E89A,E93A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A,E93A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 8B) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002243 E89A,E93A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A,E93A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. S7B) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002085 E89A,E93A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A,E93A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. S7A) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001357 E89A,E93A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A,E93A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 8A) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0001357 E89A,E93A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A,E93A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 8A) PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0003890 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:34910579 4896 2022-02-08 We confirmed the defects in septa ....... In cells with closed septa, the primary septum was uneven (Figure 3, red arrows) and thinner in smi1-1 cells than in WT (Figure 3A). PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0003440 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:34910579 4896 2022-02-08 (Figure 1C,D) PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0001324 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002869 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002869 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBP22H7.03) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002869 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002869 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.08c) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002869 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC14C4.09) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0005840 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:34910579 4896 2022-02-08 We confirmed the defects in septa ....... In cells with closed septa, the primary septum was uneven (Figure 3, red arrows) and thinner in smi1-1 cells than in WT (Figure 3A). PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0004655 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.05) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0000650 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34910579 4896 2022-03-14 Figure 1F PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0004740 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0003627 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0002442 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.01) PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0001188 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:34910579 4896 2022-02-08 (Figure 2A) PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0000841 D307G,E331G,N426S Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:34910579 4896 2022-02-08 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0001355 rga7::kanMX6 Null 972 h- rga7 rga7::kanMX6 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 low PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPCC622.16c FYPO:0007477 1-171 Overexpression 972 h- epe1 epe1deltaN171 epe1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 20 PMID:31206516 4896 2024-01-01 We introduced Epe1ΔN into ade6-m210 cells to examine the effect of the ΔN mutation on the suppression of ectopic heterochromatin formation. Epe1ΔN cells formed pink/white colonies with a slightly lower frequency than epe1Δ cells (Fig 4K), indicating that the NTA domain contributed to the suppression of ectopic heterochromatin-mediated variegation. PomBase SPCC622.16c FYPO:0002876 1-171 Overexpression 972 h- epe1 epe1deltaN171 epe1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:31206516 4896 2024-01-01 We found that deletion of the N-terminal 171 amino acids (Epe1ΔN) abolished transcriptional activation by Epe1 and the N-terminal 208 amino acids (Epe1N208) activated transcription of the HIS3 reporter independently of JmjC (Fig 4I), suggesting that the N-terminal 171 amino acids region is required for the transcriptional activation activity. PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000267 W2A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-W2A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000268 W2A Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-W2A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- drc1 drc1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11937031 4896 2014-12-15 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0005503 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:39012625 4896 2024-07-30 (Fig. 4A) PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0005503 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PR:000044799) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0007242 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 18 PMID:31719163 4896 2020-02-12 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0007241 deletion 972 h- gef1 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SPAC24H6.09 FYPO:0006009 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0006009 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0008389 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000461 3.4 PMID:34523683 4896 2025-03-07 (Fig. 5) PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0006939 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 11 PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0003535 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 PMID:31719163 4896 2020-01-31 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph gef1 gef1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gef1 gef1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002869 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 15 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002869 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 15 assayed_using(PR:000044799) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002869 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 8 assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002869 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000248 assayed_using(PR:000044799) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002719 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0005803 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0004653 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0004653 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0003946 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000044799) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0003946 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0003946 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PR:000044799) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002021 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 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deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0005020 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0004646 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0006007 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000044799) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0007243 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 6 PMID:31719163 4896 2020-02-12 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0005905 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0005905 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0006008 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 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ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002559 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002559 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0002559 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:30709916 4896 2019-07-03 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0001587 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-11-10 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0007239 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-12 PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0004895 deletion 972 h- gef1 gef1delta deletion ECO:0001232 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PMID:39387272 4896 2024-12-10 (Fig. 2E) PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0000088 M85G Not assayed or wild type 972 h- hhp2 hhp2-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 2E) PomBase SPAC23D3.04c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph gpd2 gpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr gpd2 gpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC23D3.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gpd2 gpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.04c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph gpd2 gpd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23D3.04c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph gpd2 gpd2delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 4) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000082 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 4) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000080 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2c) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0008170 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 high assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 2D) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006927 T212A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 h+ cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 (Fig. 6) The nuclear envelope is marked with Cut11-GFP PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006927 T212A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 h+ cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-29 (Fig. 6) The nuclear envelope is marked with Cut11-GFP PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002679 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2d) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001838 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 high assayed_protein(PomBase:SPBC32H8.10) PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 2C and D) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001355 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 4) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001355 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 4) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001355 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2c) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002243 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. 4B) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002243 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 6) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002980 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 4d PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001164 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18231579 4896 2015-11-12 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003670 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 2c) MPA exacerbates growth impairment in mutants defective in transcript elongation (8, 11, 50), although the precise mechanism of this effect is unknown (34) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000268 T212A Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212A cdk9 T loop|cdk9T212A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:18231579 4896 2015-11-12 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003267 CTD-∆(r27-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(CTD-26repeats) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S1) PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004229 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000089 D120A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 G407P Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-G407P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwf19 cwf19delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cwf19 cwf19delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0003029 deletion 972 h- cwf19 cwf19delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0003244 deletion 972 h- cwf19 cwf19delta deletion ECO:0000059 PMID:38833506 4896 2024-12-30 Of these candidates, only 4 were already known to be involved in the regulation of splicing (Cwf12, Saf5, Cwf19 and SPAC1705.02), whereas the remaining 33 were unrelated or not clearly assigned to the regulation of splicing PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 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SPAC30D11.09 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cwf19 cwf19delta deletion ECO:0005638 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Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001880 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001880 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0007178 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 However, we noted that mob1p rings were scarcely detectable in sid2-250 even at 25°C (Fig. 6C) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000941 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000941 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000705 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:16085489 4896 2015-03-03 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000705 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:16085489 4896 2015-03-03 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000272 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000272 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001394 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003440 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001876 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:22419817 4896 2013-08-23 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000082 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:22891259 4896 2014-03-11 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000082 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4B) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000082 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000082 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0004441 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:36200871 4896 2022-12-02 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001382 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:10837231 4896 2025-01-28 Kinase activity was associated with 13Myc-Mob1p prepared from wild-type cells, but Mob1p-associated kinase activity was reduced in sid2-250 cells (Figure 1c). PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001355 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002636 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23087209 4896 2014-03-26 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002636 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23087209 4896 2014-04-01 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0006831 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 5B) Septation start is delayed when the function of Sid2 is compromised. Cells were grown in YES at 25C shifted to 28C for 4 h and imaged as in Fig 1. The data are developed in Table 1 and Table 3. PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0004044 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001837 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001837 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000228 assayed_using(PomBase:SPBC887.09c) PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002700 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17317928 4896 2017-08-16 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0006291 E314K Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 1g) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002969 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001571 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S4C, S4D) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002024 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11514436 4896 2021-12-18 (Figure 3b) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002061 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000012 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003028 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001368 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001368 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11870208 4896 2022-09-18 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001368 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001470 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4B) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003332 E314K Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003332 E314K Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.12) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000644 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:11448769 4896 2014-09-22 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002559 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:10775265 4896 2020-12-30 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 The CAA20785 GFP fusion protein localized normally in cdc16-116, spg1-106, cdc7-24, and sid2-250 temperature-sensitive mutants...(Figure 3) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:16085489 4896 2015-03-03 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002967 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10837231 4896 2025-01-28 GFP-Mob1p localization to the SPB was unaffected in sid1, sid2, spg1 and cdc14 mutants (Figure 4a and data not shown) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0005709 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 No effect upon spindle pole body localisation during mitosis was observed in sid2-250 (Fig. 6C). PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0004082 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1D) The hyperphosphorylated form (3) of cdc11p was observed during mitosis in both sid2-250 and sid1- 239 mutants PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001904 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0001904 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003187 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.10) PMID:23087209 4896 2014-03-26 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000346 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 6A) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002051 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000248 PMID:16085489 4896 2015-03-03 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003245 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23087209 4896 2014-03-26 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0000647 E314K Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002060 E314K Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid2 sid2-250 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001574 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2017-08-16 (Figure 1A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0000141 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2017-08-16 (Figure 1A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0000131 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2015-01-16 (Figure 1A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0004317 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2015-01-16 (Figure 1A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0001734 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2017-08-16 (Figure 1C) PomBase SPCC895.07 FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPCC895.07 FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000015 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 low PMID:9658169 4896 2015-07-08 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000276 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2017-08-16 (Figure 1C) PomBase SPCC895.07 FYPO:0006196 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-1270 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11432827 4896 2017-08-16 (Figure 1C) PomBase SPCC553.04 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC553.04 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0000303 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 cyp9 cyp9delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPCC553.04 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.04 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cyp9 cyp9delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase 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h- rad52 rad22-67 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad52 rad22-67 unknown ECO:0005638 PMID:8290356 4896 2014-08-07 PomBase SPAC30D11.10 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad52 rad22-67 unknown ECO:0005638 low PMID:7623848 4896 2014-11-20 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0003085 R293K Not assayed or wild type 972 h- RTS1-mat1-SspI::inv-RTS1 (RTS1 moved to cenII-distal side of mat1 and inverted) rtf1 rtf1-R293K amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:18723894 4896 2016-04-08 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002019 ccq1(1-441)-13xMyc-est1 Not assayed or wild type 972 h- ccq1+ est1 ccq1(1-441)-13xMyc-est1 fusion_or_chimera ECO:0000337 low PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 L528A,R529A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-LR528.529AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000703 L528A,R529A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-LR528.529AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 L528A,R529A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-LR528.529AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPCC306.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- 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SPCC306.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.02c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph yip3 yip3delta deletion ECO:0005638 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972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gcn20 gcn20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gcn20 gcn20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- gcn20 gcn20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcn20 gcn20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcn20 gcn20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC543.09 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP yta12 yta12+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0000705 1-260 Not assayed or wild type 972 h- ceg1 ceg1-261-402 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.08c) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0000705 1-260 Not assayed or wild type 972 h- ceg1 ceg1-261-402 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.08c) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPCC5E4.03c FYPO:0001489 491-574 Not assayed or wild type 972 h- taf5 taf5-delta491-574 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9224658 4896 2014-09-11 PomBase SPBC26H8.04c FYPO:0001357 R854A Not assayed or wild type 972 h- iml1 iml1-R854A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 3—Figure supplement 3A), indicating that Arg854 of S. pombe Iml1 is not essential for the GATOR1 function. PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001245 T827C Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-L276S nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPCC74.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sly1 sly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC74.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- sly1 sly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC74.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sly1 sly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0007588 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPBC947.02) PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 5) PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0002128 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0000082 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 low PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0007059 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPCP1E11.06) PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 5) PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0000035 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0000703 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC947.02),assayed_using(PomBase:SPBP16F5.07) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0007589 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.09c) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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SPAP27G11.06c FYPO:0000115 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 low PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.06c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vas2 vas2delta aps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 M20A Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-M20A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007447 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 medium PMID:37553386 4896 2024-04-02 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0008386 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 PMID:37939137 4896 2025-03-04 The loss of the ER-phagy receptor Epr1 diminished the processing of Pus1-mECi- trine, suggesting that Epr1 also acts as a nucleophagy receptor PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007446 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 2B, 2G, 2H) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 epr1 epr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 epr1 epr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000385 deletion 972 h- Atg8-Scs2 fusion epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 PMID:32735772 4896 2020-08-07 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0006294 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-04 (Figure S1E) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0006294 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-04 (Figure S1E) nitrogen starvation-induced ER-phagy appeared to be normal in epr1D PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007448 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000265 PMID:37553386 4896 2024-04-02 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32735772 4896 2020-08-04 (Fig. S1B) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000843 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000843 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 6A) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph epr1 epr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 epr1 epr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.12 FYPO:0005119 L482V Not assayed or wild type 972 h- par2 par2-L482V amino_acid_mutation ECO:0000059 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sec39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC7D4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec39 sec39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC7D4.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec39 sec39delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000705 H20D Not assayed or wild type 972 h- hus5 ubc9-H20D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.13),assayed_protein(PomBase:SPBC1921.02) PMID:21444718 4896 2023-03-24 We tested in vitro interaction between His6-SLD2 and recombinant wild-type GST-Ubc9 or GST-Ubc9H20D by GSH-Sepharose pulldown and Western analysis, revealing that GST-Ubc9H20D abolishes the interaction (Fig. 2A). PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000705 H20D Not assayed or wild type 972 h- hus5 ubc9-H20D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.13),assayed_protein(PomBase:SPBC365.06) PMID:21444718 4896 2023-03-30 We confirmed this hypothesis through in vitro binding assays of recombinant SUMO and Ubc9/ Ubc9H20D (Fig. 3A). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004604 R923A,R924A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-R923A,R924A amino_acid_mutation ECO:0000049 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:22081013 4896 2023-02-16 (Fig. 3f) In marked contrast, subtelomeric tlh transcripts (Figure 3a) accumulated in chp1ΔC strains (Figure 3b,e Supplementary Figure 9). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004742 R923A,R924A Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-R923A,R924A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_transcript(SO:0001905) PMID:22081013 4896 2023-02-16 (Fig. 3f) PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 M52R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-M52R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 M52R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-M52R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 M52R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-M52R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 M52R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-M52R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC222.09 FYPO:0003411 G76S,R442G,I524V Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G76S,R442G,I524V amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:24013500 4896 2024-06-20 We found that all three mutations are required to produce a silencing defect on 5- FOA medium (Fig. 1B). However, the mutant with the three amino acid changes (triple mutant) has a milder silencing defect on 5-FOA when compared with the original seb1-1 mutant. PomBase SPAC222.09 FYPO:0002837 G76S,R442G,I524V Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G76S,R442G,I524V amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:24013500 4896 2024-06-10 seb1-1 displays normal levels of pericentromeric siRNA accumulation (Fig. 2A) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S388A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S388A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 S388A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S388A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0002126 1-122 Not assayed or wild type 972 h- opy1 opy1(aa123-end) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Figure S1) PomBase SPAC3H8.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC3H8.04 SPAC3H8.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3H8.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3H8.04 SPAC3H8.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3H8.04 SPAC3H8.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC3H8.04 SPAC3H8.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3H8.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3H8.04 SPAC3H8.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H8.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3H8.04 SPAC3H8.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G6.09 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prototroph rps1801 rps1801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rps1801 rps1801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.11c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph rps1801 rps1801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.11c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph rps1801 rps1801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.11c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph rps1801 rps1801delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rps1801 rps1801delta deletion ECO:0005638 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L281S Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0002061 L281S Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000085 L281S Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 high PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000088 L281S Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 high PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000089 L281S Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 high PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC336.04 FYPO:0001122 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-123 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPBC800.13 FYPO:0000634 1-55 Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-D55 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:34810257 4896 2022-07-01 But GFP-Ccp1 is completely disassociated from centromeric regions in cnp20-ΔCIM at all stages of the cell cycle (Fig. 4 C and D and SI Appendix, Fig. S13). PomBase SPBC800.13 FYPO:0000705 1-55 Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-D55 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-24 (Fig. 3) Our results indicate that the first 55 amino acids of CENP-TCnp20 are the minimal interaction domain with Ccp1, which we named the Ccp1- interacting motif (CIM). Yeast two hybrid PomBase SPBC800.13 FYPO:0001645 1-55 Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-D55 partial_amino_acid_deletion ECO:0000092 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-23 (Fig. 3) Our results indicate that the first 55 amino acids of CENP-TCnp20 are the minimal interaction domain with Ccp1, which we named the Ccp1- interacting motif (CIM). PomBase SPBC800.13 FYPO:0000091 1-55 Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-D55 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:34810257 4896 2022-06-23 (Fig. 4 E and F). PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 L177R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L177R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 L177R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L177R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002687 L177R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L177R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002699 258-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM1,2,3 N-pxl1|pxl1delta1,2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001253 258-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM1,2,3 N-pxl1|pxl1delta1,2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000650 258-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM1,2,3 N-pxl1|pxl1delta1,2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000650 258-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM1,2,3 N-pxl1|pxl1delta1,2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000118 258-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM1,2,3 N-pxl1|pxl1delta1,2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:30332655 4896 2019-03-06 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002559 258-438 Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1deltaLIM1,2,3 N-pxl1|pxl1delta1,2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPCC18.09c FYPO:0002493 S142A Not assayed or wild type 972 h- hnt3 hnt3-S142A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:21984210 4896 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mug184 mug184delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug184 mug184delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug184 mug184delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug184 mug184delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mug184 mug184delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug184 mug184delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug184 mug184delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug184 mug184delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1773.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug184 mug184delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.13c FYPO:0001810 unknown Not assayed or wild type 972 h- hpt1 pur1- pur 1 unknown ECO:0000335 PMID:14008 4896 2012-11-30 PomBase SPAC23C11.13c FYPO:0001812 unknown Not assayed or wild type 972 h- hpt1 pur1- pur 1 unknown ECO:0000335 PMID:14008 4896 2012-11-30 PomBase SPAC23C11.13c FYPO:0001805 unknown Not assayed or wild type 972 h- hpt1 pur1- pur 1 unknown ECO:0000335 PMID:14008 4896 2012-11-30 PomBase SPAC23C11.13c FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- hpt1 pur1- pur 1 unknown ECO:0005638 PMID:14008 4896 2012-11-22 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0004604 L216R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-L216R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002019 L216R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-L216R amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000705 1-183 Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18delta183 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002061 1-183 Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18delta183 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000082 E185V Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-E185V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 low PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001645 E185V Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-E185V amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. 4C) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0005258 E185V Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-E185V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0003153 E185V Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-E185V amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure S6) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001357 E185V Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-E185V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 4) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001357 E185V Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-E185V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 4) PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001645 Q532R Not assayed or wild type 972 h- bdf1 bdf1-Q532R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 4K) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 H249A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-H249A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 H249A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-H249A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001357 T99A Not assayed or wild type 972 h- drc1 drc1-T99A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2011-11-18 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000674 C219A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C219A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:18667531 4896 2022-11-07 The C219A mutant was not temperature sensitive (Figure 2A). PomBase SPCC550.05 FYPO:0000963 C219A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C219A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000957 C219A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C219A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPAC926.04c FYPO:0001234 E34A,T172A Not assayed or wild type 972 h- hsp90 hsp90-EATA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37120429 4896 2023-05-11 The suppressive effect of TA and EK on EA defects in non-essential functions were not specific to S. cerevisiae, as these mutations also rescued SpHsp90-EA mediated temperature sensitivity in Sz. pombe (Fig. 5d). PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 S93P Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38938413 4896 2024-07-10 PomBase SPBC215.12 FYPO:0003029 2-23 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-2-23delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24014766 4896 2024-07-09 The ratio of mature to premature signal for the tbp1_a intron was almost identical for the two truncations (2.1 ± 0.2 for cwf10-ΔNTE versus 2.0 ± 0.3 for cwf10 2-23Δ), while the ratio in the wild-type strain was 9.7 ± 1.5 (Fig. 6H). Th PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0004213 371-476 Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80delta371-476 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000141 371-476 Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80delta371-476 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 30 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001645 371-476 Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80delta371-476 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.03),assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0003307 371-476 Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80delta371-476 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 45 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPBC582.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pex11 pex11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC582.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- pex11 pex11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC582.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pex11 pex11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pex11 pex11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.10 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cca2 cca2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- cca2 cca2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC645.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cca2 cca2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000658 S481D Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-S481D amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:26804917 4896 2017-12-15 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000581 S481D Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-S481D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26804917 4896 2017-12-15 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000479 S481D Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-S481D amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:26804917 4896 2017-12-15 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 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PomBase SPCC1393.03 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rps1501 rps1501delta deletion 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2023-06-28 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps1501 rps1501delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1501 rps1501delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1393.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1501 rps1501delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 M214A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-M214A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 M214A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-M214A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 P370A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P370A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 P370A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P370A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 P370A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-P370A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0008439 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8H) PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0000674 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7F) PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0000969 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7F) PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0003906 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7F) PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0003183 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7F) PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0001357 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7F) PomBase SPAC57A10.14 FYPO:0000089 R85A Not assayed or wild type 972 h- sgf11 sgf11-R85A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7F) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0002872 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:23041194 4896 2013-11-15 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0006330 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:29290560 4896 2018-01-11 (Figures 1C and S1C) ER-PM contact removal PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0006330 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0001232 high PMID:39110593 4896 2024-11-05 A previous study has shown that Scs2 plays a dominant role in ER-PM tethering over Scs22 in fission yeast,5 manifested by apparent ER-PM dissociation indicated by the luminal ER marker mCherry-ADEL18 in scs2D cells (see also Figure 1A). PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0007446 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 5A) reduced in scs2D and abolished in scs2D scs22D PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001030 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0006294 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0002674 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC594.01) PMID:39239853 4896 2024-09-08 We also examined if Scs2 or Scs22 alone was responsible for preventing Duc1 division site localization but, as in wild-type cells, Duc1- mNG was excluded from the cell division site in both single deletion strains (Fig. S2B). PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 1F) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph scs2 scs2delta deletion ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0001008 G1032E Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 62 PMID:19713940 4896 2017-12-19 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0001008 G1032E Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9635188 4896 2018-01-05 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0000082 G1032E Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229,FYECO:0000334 high PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002699 G1032E Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:19713940 4896 2017-12-19 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0003339 G1032E Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 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rng2 rng2-D5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227,FYECO:0000334 low PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003165 W789* Not assayed or wild type 972 h- rqh1 hus2-22 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000088 W789* Not assayed or wild type 972 h- rqh1 hus2-22 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000268 W789* Not assayed or wild type 972 h- rqh1 hus2-22 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 medium PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000268 W789* Not assayed or wild type 972 h- rqh1 hus2-22 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-01 PomBase SPAC926.04c FYPO:0001338 L654R Not assayed or wild type 972 h- hsp90 swo1-21 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:18430926 4896 2012-12-14 PomBase 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fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000674 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000674 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000964 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000964 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000964 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000964 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000964 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000964 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S3B PomBase SPBC1861.01c FYPO:0001513 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0003241 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0003241 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 11 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0003241 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 11 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0003241 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 14 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0003241 cnp3-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp3 cnp3-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0003709 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0001232 PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0002521 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0001232 high PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0000708 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0005638 PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0000584 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0001232 PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0001867 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0001232 PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0003708 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0001232 PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0000022 deletion 972 h- map4 map4delta deletion ECO:0001232 PMID:16857197 4896 2014-08-16 PomBase SPBC21D10.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- map4 map4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002779 1-54,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(1-53)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002061 1-54,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(1-53)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0004456 237-318 Not assayed or wild type 972 h- dri1 dri1deltaRRM partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:33946513 4896 2021-05-15 PomBase SPAC17H9.04c FYPO:0002626 237-318 Not assayed or wild type 972 h- dri1 dri1deltaRRM partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33946513 4896 2021-05-12 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 fft1 fft1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 fft1 fft1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0005517 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0001237 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0000957 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 PMID:31575705 4896 2020-02-20 (Figure 1A) PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0005947 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0000961 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC20G8.08c FYPO:0001357 deletion 972 h- fft1 fft1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 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PomBase SPBC725.02 FYPO:0006616 deletion 972 h- mpr1 mpr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-04-10 Table 1 PomBase SPNCRNA.1696 FYPO:0000799 wild type Overexpression 972 h- nam3 nam3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1696 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- nam3 nam3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1696 FYPO:0000111 wild type Overexpression 972 h- nam3 nam3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1734.06 FYPO:0003892 unknown Not assayed or wild type 972 h- rhp18 rhp18-40 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000211 PMID:17277362 4896 2016-03-31 PomBase SPBC1734.06 FYPO:0002768 unknown Not assayed or wild type 972 h- rhp18 rhp18-40 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:17277362 4896 2016-03-31 PomBase SPBC1734.06 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2010-04-06 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 agl1 agl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 agl1 agl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph efm3 efm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- efm3 efm3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph efm3 efm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph efm3 efm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph efm3 efm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph efm3 efm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- efm3 efm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efm3 efm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efm3 efm3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001407 1-345 Overexpression 972 h- pyp2 pyp2deltaN(1) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001492 1-345 Overexpression 972 h- pyp2 pyp2deltaN(1) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 G71V,T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75D,T78D cut12.G71VT75DT78D amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 G71V,T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75D,T78D cut12.G71VT75DT78D amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 G71V,T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75D,T78D cut12.G71VT75DT78D amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V,T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75D,T78D cut12.G71VT75DT78D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000244 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 5A) No change in recruitment of plo1 to SPB when fin1 is inactivated T75 T78 mutated to D PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V,T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-G71V,T75D,T78D cut12.G71VT75DT78D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC342.06c FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rtt109 rtt109delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0002834 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000059 low PMID:17369611 4896 2024-02-29 However, H3-K56R, rtt109Δ, and the H3-K56R/rtt109Δ mutant cells formed colonies of variable pink indicating a slight decrease in silencing at centromeres (Fig. 4A). This might indicate a cross-talk of H3 Lys-56-Ac with the establishment or the maintenance of other activating or repressing histone modifications required for proper centromeric heterochromatin formation. PomBase SPBC342.06c FYPO:0004240 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:39878217 4896 2025-02-17 (Fig. 1F) PomBase SPBC342.06c FYPO:0004240 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000112 high PMID:31584934 4896 2019-11-15 PomBase SPBC342.06c FYPO:0004240 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000112 PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 2A) PomBase SPBC342.06c FYPO:0007272 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC126.02c) PMID:23084836 4896 2020-02-27 We observed that Ku localization was diffuse after DNA damage, but this diffusion was inhibited by rtt109Δ (Figure 7D) PomBase SPBC342.06c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC342.06c FYPO:0003003 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC126.02c) PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figure 6E). H3K56 acetylation antagonizes Tf clustering at centromeres. binding of Ku was reduced and enhanced in hst4Δ and rtt109Δ cells, respectively PomBase SPBC342.06c FYPO:0003003 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC543.03c) PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figure 6E). H3K56 acetylation antagonizes Tf clustering at centromeres. binding of Ku was reduced and enhanced in hst4Δ and rtt109Δ cells, respectively PomBase SPBC342.06c FYPO:0001038 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:31260531 4896 2020-01-01 PomBase SPBC342.06c FYPO:0007271 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000059 PMID:23084836 4896 2020-02-27 Moreover, only the rtt109Δ HAT mutations, but not other HAT mutations, significantly promoted the association of Tf cluster with centromeres, whereas none of the HAT mutations affected Tf clustering (Figures 6C and 6D). PomBase SPBC342.06c FYPO:0007479 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC342.06c FYPO:0001690 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39878217 4896 2025-02-17 (Fig. 1E) PomBase SPBC342.06c FYPO:0001357 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39878217 4896 2025-02-17 (Fig. 1E) PomBase SPBC342.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC342.06c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC342.06c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtt109 rtt109delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC342.06c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC342.06c FYPO:0003384 deletion 972 h- rtt109 rtt109delta deletion ECO:0000336 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caf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22737087 4896 2020-05-12 (Fig. 1, Table 1) PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 caf16 caf16delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0003555 deletion 972 h- caf16 caf16delta deletion ECO:0000231 PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 caf16 caf16delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph caf16 caf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph caf16 caf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph caf16 caf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph caf16 caf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph caf16 caf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph caf16 caf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- caf16 caf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 caf16 caf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 caf16 caf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.02c FYPO:0002061 uap2::ura4 Null 972 h- uap2 uap2::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:9371883 4896 2014-06-30 PomBase SPAC167.01 FYPO:0005909 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0007447 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure S6B), indicating that Ire1 is dispensable for DTT-induced bulk autophagy but is essential for DTT-induced ER-phagy. PomBase SPAC167.01 FYPO:0000082 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0005285 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005801 PMID:19606215 4896 2016-02-10 PomBase SPAC167.01 FYPO:0005910 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:32735772 4896 2020-08-04 (Figure 7B) We found that DTT-induced increase of Epr1 was severely diminished in ire1D (Figure 7B), indicating that Epr1 upregulation requires Ire1. PomBase SPAC167.01 FYPO:0005910 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001128 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000412 high PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 2B) PomBase SPAC167.01 FYPO:0001456 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:22682253 4896 2012-08-24 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001456 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.08) PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001456 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC830.08c) PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0005283 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 PMID:19606215 4896 2016-02-10 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 PMID:38360270 4896 2024-03-14 PomBase SPAC167.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ire1 ire1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001188 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000113,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0003840 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000843 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 PMID:22682253 4896 2012-08-23 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000843 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 6A) PomBase SPAC167.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0002167 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000419 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000107 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001214 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000112 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0000091 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 PMID:22682253 4896 2012-08-24 PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 medium PMID:39601909 4896 2025-01-02 The spotting assay analysis revealed that the bsd1Δ cells exhibit sensitivity against tunicamycin (Fig. 1c) PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 PMID:38360270 4896 2024-03-15 (Fig. 5) Cells defective in UPR are sensitive to tunicamycin (32). Consistently, ire1Δ cells failed to grow on EMM plates containing tunicamycin (Fig. 2B) PomBase SPAC167.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPAC167.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- ire1 ire1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC167.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ire1 ire1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC167.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ire1 ire1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002967 I190R Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-I190R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPAC24H6.08 FYPO:0003066 deletion 972 h- h90 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assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Figure 2D) PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0009021 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000416 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0000251 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000289 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0000684 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000072 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0009023 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000417 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0007726 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000296 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 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4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1154 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1154 SPNCRNA.1154+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001037 E397Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E397Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000166 PMID:19171118 4896 2012-10-29 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 E397Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E397Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:19171118 4896 2012-12-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 E397Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E397Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19171118 4896 2012-12-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000833 E397Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E397Q amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:19171118 4896 2012-10-29 PomBase SPBC800.13 FYPO:0000634 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.03) PMID:34810257 4896 2022-07-01 Consistent with the key role of CENP-TCnp20 in the assembly of the Ndc80 complex, we found that the association of Ndc80-GFP with centromeres is lost in cnp20-9 at the restrictive temperature (Fig. 2 C and D). PomBase SPBC800.13 FYPO:0000634 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:34810257 4896 2022-07-01 We found that GFP-Ccp1 was delocalized from centromeres at the restrictive temperature in cnp20-9 at all stages of the cell cycle (Fig. 2 E and F and SI Appendix, Fig. S3) PomBase SPBC800.13 FYPO:0000450 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:34810257 4896 2022-07-01 In addition, we found that CENP-ACnp1-GFP partially reduced its centromere localization in cnp20-9 at the restrictive temperature (SI Appendix, Fig. S6). PomBase SPBC800.13 FYPO:0001645 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0000092 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-23 PomBase SPBC800.13 FYPO:0001645 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0000092 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.03),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-23 PomBase SPBC800.13 FYPO:0001387 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:34810257 4896 2022-06-23 PomBase SPBC800.13 FYPO:0002060 S160C,T197S,L394W,A433D Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:34810257 4896 2022-07-01 PomBase SPCC550.13 FYPO:0003165 154-193 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1delta154-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 low PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPCC550.13 FYPO:0003165 154-193 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1delta154-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 medium PMID:10409743 4896 2014-09-16 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000088 154-193 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1delta154-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPCC550.13 FYPO:0001491 154-193 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1delta154-193 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10409743 4896 2012-09-05 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0000380 deletion 972 h- h- leu1-32 CFP-atg8::leu1+ atg14 atg14delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000127 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0006295 deletion 972 h- atg14 atg14delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:31941401 4896 2020-02-21 (Fig. S2) PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0006295 deletion 972 h- atg14 atg14delta deletion ECO:0000112 PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg14 atg14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph atg14 atg14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph atg14 atg14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg14 atg14delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0002615 deletion 972 h- atg14 atg14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:23950735 4896 2013-09-15 PomBase SPAC25A8.02 FYPO:0008427 deletion 972 h- atg14 atg14delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. 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for3 for3delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:11696322 4896 2019-10-17 (Figure 3b-g,i) PomBase SPCC895.05 FYPO:0000742 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:31495586 4896 2019-10-25 (Figure S6) PomBase SPCC895.05 FYPO:0000928 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC354.13) PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002998 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 77 PMID:32915139 4896 2020-10-15 (Fig. 3b) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001585 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:23051734 4896 2013-06-21 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001585 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPCC895.05 FYPO:0006447 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPCC895.05 FYPO:0003315 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:12214236 4896 2019-08-21 PomBase SPCC895.05 FYPO:0003315 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-17 (Figure 3b-g) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001394 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC895.05 FYPO:0000016 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-17 (Figure 3) PomBase SPCC895.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001407 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 2A) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001365 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:32915139 4896 2020-10-15 explicit delay in ring constriction and disassembly (21 ± 0.6 min in wild-type cells vs 36 ± 1.6 min in for3D cells; Figure 2—Figure supplement 5 PomBase SPCC895.05 FYPO:0003014 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 2A) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 low PMID:15184402 4896 2022-06-20 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002021 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:17085965 4896 2014-04-24 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002021 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-17 (Figure 3b-g,i) PomBase SPCC895.05 FYPO:0002655 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:21899677 4896 2013-09-27 PomBase SPCC895.05 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC895.05 FYPO:0000224 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-17 PomBase SPCC895.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002401 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-18 (Figure 4, table 1) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001368 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:12214236 4896 2019-08-21 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001368 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:24127216 4896 2013-12-11 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001368 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-17 (Figure 3f,g) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001367 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 PMID:11696322 4896 2019-10-17 (Figure 3f,g) PomBase SPCC895.05 FYPO:0007708 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC110.03) PMID:39012625 4896 2024-07-30 (Fig. 1) PomBase SPCC895.05 FYPO:0000426 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 PMID:16141239 4896 2018-01-22 (Fig. 5A,B) PomBase SPCC895.05 FYPO:0001164 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 for3 for3delta 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SPCC895.05 FYPO:0001587 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12),assayed_using(PomBase:SPBC106.20),assayed_using(PomBase:SPCC622.10c) PMID:22768263 4896 2012-09-24 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001587 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:22891259 4896 2014-03-10 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001587 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPCC895.05 FYPO:0001587 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002999 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, S3a) PomBase SPCC895.05 FYPO:0008003 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) 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deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 for3 for3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- for3 for3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003044 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000226 PMID:25245948 4896 2014-11-26 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003044 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000049 PMID:25245948 4896 2014-11-26 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0004136 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000226 PMID:25245948 4896 2014-12-10 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003109 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) 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2023-08-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003244 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000231 PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000835 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000835 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.04c) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000835 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.09) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000835 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC428.06c) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0001324 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0001324 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0008118 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000049 PMID:36095128 4896 2023-08-28 Among the mutants studied, Δcay1 and Δtls1 strains also showed splicing defects specific for rap1 intron 2 (Supplementary Figure S10A). PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tls1 tls1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002019 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tls1 tls1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0008113 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBC582.04c) PMID:36095128 4896 2023-08-28 ; Intron retention observed in absence of sde2, cay1 and tls1 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0008113 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.09) PMID:36095128 4896 2023-08-28 ; Intron retention observed in absence of sde2, cay1 and tls1 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002360 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000049 PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002336 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000049 PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003619 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0003619 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002887 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002887 deletion 972 h- tls1 tls1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06) PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph tls1 tls1delta deletion ECO:0005638 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SPCC74.02c FYPO:0000703 R586A,Y588A,K589A Not assayed or wild type 972 h- ppn1 ppn1-RYK-AAA amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC776.02c),assayed_protein(PomBase:SPCC74.02c) PMID:33711009 4896 2022-10-07 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0003165 wild type Knockdown 972 h- hcn1 hcn1+ wild_type ECO:0001232 PMID:16950791 4896 2015-11-18 PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0002768 K274R Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-K274R amino_acid_mutation ECO:0006030 medium assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-10 (Fig. 2D) PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0003914 K274R Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-K274R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 2C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000839 D242N Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-E9 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:1316996 4896 2015-08-26 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000118 spg1-GFP Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004915 A237T Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-6 nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002239 A237T Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-6 nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0003830 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0001232 PMID:16085489 4896 2015-03-02 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001931 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0001232 PMID:8036497 4896 2015-04-23 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0004472 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:16085489 4896 2015-03-02 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0004188 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000229 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000170 27 PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000082 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 medium PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001324 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC297.03) PMID:24451546 4896 2015-02-24 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0002243 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 11B) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0002243 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:34967420 4896 2022-10-20 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0002243 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 Production of full-length interfering prt lncRNA is inhibited in rad24∆ cells (31) concomitant with increased production of pho1 mRNA and greatly increased Pho1 activity (as in Fig. 2B). PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0005258 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001043 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0001232 PMID:10788621 4896 2015-12-02 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0001043 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:15166138 4896 2014-05-06 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000825 deletion 972 h- rad24 rad24delta deletion 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K8A,T9A,Y10A,G11A Not assayed or wild type 972 h- hrk1 hrk1-pim amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC110.02),assayed_using(PomBase:SPAC23C4.03) PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 1B) PomBase SPAC23C4.03 FYPO:0004382 K8A,T9A,Y10A,G11A Not assayed or wild type 972 h- hrk1 hrk1-pim amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 15 PMID:28343969 4896 2018-06-24 (Fig. 2C, 2D, 2G) PomBase SPAC23C4.03 FYPO:0000091 K8A,T9A,Y10A,G11A Not assayed or wild type 972 h- hrk1 hrk1-pim amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:28343969 4896 2018-06-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-ts unknown ECO:0001232 high PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 3) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 G136L Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-G136L amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC1687.08 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC1687.08 SPAC1687.08delta 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mnn9 mnn9delta deletion ECO:0005638 PMID:32650974 4896 2020-07-22 PomBase SPAC4F10.10c FYPO:0007436 deletion 972 h- mnn9 mnn9delta deletion ECO:0001232 PMID:32650974 4896 2020-07-22 PomBase SPAC4F10.10c FYPO:0003710 deletion 972 h- mnn9 mnn9delta deletion ECO:0001232 high PMID:32650974 4896 2020-07-22 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0005528 K37R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K36R amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:31837996 4896 2021-07-16 PomBase SPAC22A12.05 FYPO:0006983 F32S Not assayed or wild type 972 h- rpc11 rpc11-F32S C11-F32S amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(SO:0000269) PMID:21450810 4896 2020-04-03 C11-F32S was more active in yJI1 than in yYH1, while wild-type C11 had no effect (Sector 4). PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0001382 T88A Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-T88A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c),assayed_substrate(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:28671615 4896 2017-07-21 PomBase SPAC644.04 FYPO:0000705 1-76 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-77-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC644.04 FYPO:0000705 1-76 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-77-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC644.04),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rpl502 rpl502delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0002827 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 low PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0007317 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 Polysome profiling of three of these mutants provides additional evidence for a defect in translation in the mutants (Fig 7C). PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0006037 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 Moreover, both rplΔ mutant profiles, but not the WT, exhibit substantial populations of halfmers, monosomes and polysomes with an additional 40S subunit PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000470 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph 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PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0007556 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0007555 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0000087 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rpl502 rpl502delta deletion ECO:0005638 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2015-01-29 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl502 rpl502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl502 rpl502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11C11.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl502 rpl502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002133 Y466F Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1-Y466F amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:33536434 4896 2023-03-19 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002133 Y466F Overexpression 972 h- mei4delta mmi1 mmi1-Y466F amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:33536434 4896 2023-03-19 PomBase SPCC736.12c 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FYPO:0002488 451-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-450) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 >15 PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Figure 3F) PomBase SPAC688.07c FYPO:0002869 451-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-450) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c) PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Table 1) PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0003730 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 Cbp7 deletion prevented growth on non-fermentable medium in both contexts (Figure 2C and not shown) PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbp7 cbp7delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0007623 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0000059 high PMID:34634819 4896 2025-03-31 Cytochrome spectra showed strongly decreased peaks for cytochromes b and c1 of complex III but normal to increased absorbance for cytochrome a + a3 of complex IV (Figure 2D). PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0003423 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 First, the cytb mRNA was significantly, although never fully, destabilized (Figure 2F) whereas other mRNAs were not affected. PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0002797 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 Cytb showed a clear pattern of degradation over a 20 h chase in the wt, but appeared repeatedly resistant to degradation in the Δcbp7 mutant in several independent experiments (Figure 2H). This unexpected degradation pattern could indicate that in Δcbp7 cells, the newlysynthetized Cytb might escape recognition and/or accessibility by mitochondrial proteases (65), possibly because of misfolding, aggregation and/or defective membrane insertion. PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000835 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34634819 4896 2025-03-31 This absence of degradation was surprising since Cytb steady state seemed dramatically decreased in the mutant compared to the wt, as revealed in purified mitochondria (Figure 2E) as well as in the total protein chase samples (Supplementary Figure S3) using our in-house antibody. We have no definitive solution to this paradox; the answer might lie with a particularity of our Cytb antibody. This only recognizes Cytb in non-boiled samples, suggesting that the epitope recognised by the antibody is a small structural motif, rather than a linear sequence. Thus, if the neo-synthesized Cytb cannot be correctly folded and inserted into the membrane, the epitope recognised by our antibody may no longer be present. PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0008128 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0001437 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 but grew normally on fermentable medium containing antimycin, showing that the ATP synthase (complex V) is not strongly affected by the mutation (Figure 2C) PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0004751 deletion 972 h- cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:34634819 4896 2025-03-31 (Figure 2C) PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28E12.04 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph cbp7 cbp7delta deletion ECO:0005638 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wild type 972 h- ctp1 ctp1-SxxS amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000267 C226S,C229S Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-SxxS amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002033 R183A,D184A Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-R183A,D184A act1(RADA)|act1-RADA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002022 R183A,D184A Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-R183A,D184A act1(RADA)|act1-RADA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 3) PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0006917 R183A,D184A Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-R183A,D184A act1(RADA)|act1-RADA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 4) PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0004083 R183A,D184A Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-R183A,D184A act1(RADA)|act1-RADA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002060 R183A,D184A Not assayed or wild type 972 h- act1 act1-R183A,D184A act1(RADA)|act1-RADA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15537703 4896 2015-11-09 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-272,353-372 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27(273-352) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 P27PRGTPP Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K17 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000172 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 3B and Supplementary Figure S6) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001894 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 3) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004886 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 2E and Supplementary Figure S4B) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30462301 4896 2019-10-07 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004791 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 3A) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004791 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30503780 4896 2018-12-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0006515 D499A,E500A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D499A,E500A rap1-D499A/E500A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Supplementary Figure S5B) PomBase SPCC777.14 FYPO:0006518 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-434 unknown ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0004159 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 PMID:20040574 4896 2015-10-08 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000151 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0003139 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 PMID:20040574 4896 2015-10-08 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000913 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4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0006920 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28586299 4896 2019-06-04 (Figure 4B) decreased frequency of deletions at direct repeat recombination reporter PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0003660 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0005660 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-09-07 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000185 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0006810 deletion 972 h- rad51delta mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 PMID:32355220 4896 2020-06-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002485 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000059 PMID:20040574 4896 2015-10-08 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002485 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000059 PMID:22723423 4896 2013-08-12 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0004244 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19037101 4896 2015-01-08 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002993 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000581 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 PMID:25414342 4896 2016-09-06 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000581 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 high PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000584 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29898918 4896 2018-07-03 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3I) PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15367656 4896 2020-02-18 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002913 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-12 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0005788 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 PMID:27697832 4896 2016-11-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001740 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000126 low PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001742 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000337 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0005371 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001840 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001840 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000004,FYECO:0000126 low PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0005334 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15367656 4896 2020-02-18 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000972 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002430 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 high PMID:18388861 4896 2024-07-12 Table 1, Fig. 3A and B PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002150 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000309 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mus81 mus81delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mus81 mus81delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0007007 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30667359 4896 2019-07-11 (Figure 6c) PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mus81 mus81delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0003082 deletion 972 h- nmt1-mat1-P mat2delta mat3delta mus81 mus81delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000106 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Fig. 5) PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001023 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0005136 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000337 PMID:15238514 4896 2015-12-11 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001098 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 medium PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:20040574 4896 2015-10-08 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0003384 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 low PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000267 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 medium PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:20040574 4896 2015-10-08 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:17307401 4896 2015-04-17 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3I) PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph mus81 mus81delta deletion 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the control of the nmt1 promoter in a spo4 mutant. As Fig. 2C shows, none of these mutant spo4 genes complement the sporulation defect of the spo4 mutant. PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0000080 deletion 972 h- tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000254 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0001407 deletion 972 h- tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000254 PMID:16297994 4896 2016-10-02 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0001164 deletion 972 h- tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000274 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0001112 deletion 972 h- tip41 tip41delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000230 PMID:16297994 4896 2015-01-21 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002578 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.16 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph tip41 tip41delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 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PomBase SPBC649.05 FYPO:0007475 T75A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0000703 T75A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-20 (Fig. 2I) single mutant cut12. T75A binds dis2 PomBase SPBC649.05 FYPO:0000703 T75A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPAC11E3.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pyp3 pyp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pyp3 pyp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC11E3.09 FYPO:0004099 deletion 972 h- pyp3 pyp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. S2D) PomBase SPAC11E3.09 FYPO:0001420 deletion 972 h- pyp3 pyp3delta deletion ECO:0005638 PMID:1464318 4896 2013-01-30 PomBase SPAC11E3.09 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pyp3 pyp3delta deletion ECO:0005638 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C375A,C378A Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-MZF amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC290.04 FYPO:0006412 C375A,C378A Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-MZF amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC622.09) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC290.04 FYPO:0006412 C375A,C378A Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-MZF amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC622.08c) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC290.04 FYPO:0005047 C375A,C378A Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-MZF amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC290.04 FYPO:0006422 C375A,C378A Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-MZF amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:27901072 4896 2018-03-01 (Fig. 1d) PomBase SPCC290.04 FYPO:0000703 C375A,C378A Not assayed or wild type 972 h- ams2 ams2-MZF amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04),assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:27901072 4896 2018-03-01 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000080 W112A Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-W112A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:30651569 4896 2019-12-23 PomBase SPCC736.12c FYPO:0003230 W112A Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-W112A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30651569 4896 2019-12-23 PomBase SPCC736.12c FYPO:0000708 W112A Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-W112A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:30651569 4896 2019-12-23 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 W112A Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-W112A amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:30651569 4896 2019-12-23 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r9-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)4(S5A)10(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0000470 deletion 972 h- SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB24D3.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB24D3.08c SPAPB24D3.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000703 401-670 Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-dC400 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1805.08),assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. S4A) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000658 158-254 Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1delta158-254 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4- unknown ECO:0001232 PMID:1417417 4896 2013-09-20 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0003563 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4- unknown ECO:0001232 PMID:8203159 4896 2015-05-01 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 R748A Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-35 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0005451 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000185 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0003584 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001742 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0005371 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:27697832 4896 2016-11-02 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001357 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000085 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000088 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000089 160-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001665 P180A Not assayed or wild type 972 h- cyr1 cyr1-P180A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:15831585 4896 2017-07-20 PomBase SPBC19C7.03 FYPO:0001645 P180A Not assayed or wild type 972 h- cyr1 cyr1-P180A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC23H3.13c),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.03) PMID:15831585 4896 2017-07-20 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 K617E Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K617E crb2-L617E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Consistent with their observed structural roles, charge reversal mutations Arg616Glu, Lys617Glu, and Lys619Glu all abolished Crb2-BRCT2 interaction with the peptide (Fig. 3A) PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 K617E Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K617E crb2-L617E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000703 K617E Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-K617E crb2-L617E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC342.05),assayed_protein(PomBase:SPBC342.05) PMID:18676809 4896 2023-02-15 Consistent with their observed structural roles, charge reversal mutations Arg616Glu, Lys617Glu, and Lys619Glu all abolished Crb2-BRCT2 interaction with the peptide (Fig. 3A) PomBase SPBC1683.06c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph urh1 urh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph urh1 urh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.06c FYPO:0000084 deletion 972 h- urh1 urh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPBC1683.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph urh1 urh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.06c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph urh1 urh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 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ura4-D18 leu1-32 ade6- mcp6 mcp6delta hrs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC582.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- mcp6 mcp6delta hrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC582.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp6 mcp6delta hrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcp6 mcp6delta hrs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptr8 ptr8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- ptr8 ptr8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17A5.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptr8 ptr8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.10 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph dal51 dal51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.10 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dal51 dal51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dal51 dal51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dal51 dal51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.10 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph dal51 dal51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dal51 dal51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC417.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- dal51 dal51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC417.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal51 dal51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal51 dal51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0003042 196-245 Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-delta196-245 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F3.01) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure 2) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 196-245 Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-delta196-245 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 196-245 Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-delta196-245 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002173 196-245 Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-delta196-245 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002085 196-245 Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-delta196-245 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:32012158 4896 2020-03-10 (Figure S3A) PomBase SPCC663.05c FYPO:0000674 F24S,G120S,D173G Overexpression 972 h- asf1 asf1-30 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:21324894 4896 2012-03-12 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0002061 231-501 Not assayed or wild type 972 h- mcb1 mcb1-D6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:21813639 4896 2011-08-10 PomBase SPAC16A10.06c FYPO:0000703 179-250 Not assayed or wild type 972 h- nse2 nse2(2-178) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.06c),assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.08c) PMID:36793083 4896 2023-03-06 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0001934 deletion 972 h- por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0006978 deletion 972 h- por1 por1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0000087 deletion 972 h- por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 por1 por1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- por1 por1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 por1 por1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1635.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 por1 por1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0008196 V82E Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-V82E amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:19362535 4896 2024-02-13 The Swi6 V82E mutant bound H3K9me2 with 5-fold higher affinity than wild-type Swi6 (Table 1; Figure S2A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0008196 V82E Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-V82E amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:19362535 4896 2024-02-13 Introduction of an E80V mutation, corresponding to V21 of Chp1, into Swi6V82E further increased Swi6’s affinity by 2-fold (Table 1; Figure S2A). PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0000453 T154A,T99A,T74A,T60A,S87A Knockdown 972 h- drc1 drc1-CD5A amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:11937031 4896 2012-02-23 PomBase SPAC6G9.11 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syb1 syb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syb1 syb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.11 FYPO:0002150 deletion 972 h- syb1 syb1delta deletion ECO:0005638 PMID:12565827 4896 2020-12-30 PomBase SPAC6G9.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- syb1 syb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G9.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syb1 syb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002133 K110A,R121A,R127A Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-74-M6 spTrm10_74_M6 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002764 K110A,R121A,R127A Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-74-M6 spTrm10_74_M6 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 erv46 erv46delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 erv46 erv46delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph erv46 erv46delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- erv46 erv46delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erv46 erv46delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24B11.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erv46 erv46delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000705 1-169,911-1076 Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-headless partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 5A) PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000705 1-169,911-1076 Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-headless partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.08c),assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 7A) PomBase SPAC14C4.02c FYPO:0000703 1-169,911-1076 Not assayed or wild type 972 h- smc5 smc5-headless partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC651.10) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 6A, lane 9) PomBase SPAC890.04c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ytm1 ytm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC890.04c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ytm1 ytm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC890.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- ytm1 ytm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC890.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ytm1 ytm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6- unknown ECO:0005638 PMID:6587363 4896 2014-05-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6- unknown ECO:0005638 PMID:24719968 4896 2014-06-18 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6- unknown ECO:0000059 high PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 1A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6- unknown ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6- unknown ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15537537 4896 2024-07-10 (Fig. 2G) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003353 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6- unknown ECO:0000337 PMID:6587363 4896 2014-05-07 PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0008439 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001690 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004752 D68H Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67H amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-27 (Fig. 1B) PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0003787 pkl1-3xGFP Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-3xGFP fusion_or_chimera ECO:0001232 13 PMID:32327557 4896 2022-05-30 (Fig. 3) PomBase SPAC3A11.14c FYPO:0007988 pkl1-3xGFP Not assayed or wild type 972 h- pkl1 pkl1-3xGFP fusion_or_chimera ECO:0001232 complete PMID:32327557 4896 2022-05-30 (Fig. 3) PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0000444 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0004201 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 Moreover, mutants that alleviated cen1:ade6+ silencing also displayed increased levels of noncoding centromeric otr transcripts and concomitant reductions in centromeric siRNA accumulation, with prp10-1 showing the most severe silencing defects (Fig. 1C PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0003412 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0003029 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0001117 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0003041 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0001490 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0003619 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 However, at the permissive temperature of 25°C (at which centromeric silencing was alleviated), splicing efficiency was similar to that in wild-type cells (Fig. 2A). PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0000785 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPBP22H7.07 FYPO:0002176 unknown Not assayed or wild type 972 h- prp5 prp5-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:9745017 4896 2017-08-17 PomBase SPBC216.07c FYPO:0005097 I2241T,S2293P Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-19 tor2ts19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17121544 4896 2021-05-24 (mimic nitrogen starvation response, When starved for nitrogen, on the other hand, the cells divide twice and then arrest at G1) At 4 h and 8 h after the shift to36 °C, the average cell length was reduced to 6.4 μm and6.2 μm, respectively, which were ∼50% decreases com-pared to wild-type cells (13.0 μm and 12.9 μm). Similar tsresults were obtained for tor2 -19. It is of note that, in contrast to the reduced length, the cell width remained constant in these mutant cells. PomBase SPBC216.07c FYPO:0002172 I2241T,S2293P Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-19 tor2ts19 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPAC4A8.04) PMID:17121544 4896 2021-05-24 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000951 I2241T,S2293P Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-19 tor2ts19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high high PMID:17121544 4896 2021-05-24 (mimic nitrogen starvation response, When starved for nitrogen, on the other hand, the cells divide twice and then arrest at G1) At 4 h and 8 h after the shift to36 °C, the average cell length was reduced to 6.4 μm and6.2 μm, respectively, which were ∼50% decreases com-pared to wild-type cells (13.0 μm and 12.9 μm). Similar tsresults were obtained for tor2 -19. It is of note that, in contrast to the reduced length, the cell width remained constant in these mutant cells. PomBase SPBC216.07c FYPO:0002061 I2241T,S2293P Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-19 tor2ts19 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17121544 4896 2021-05-24 (Figure 1B) PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC13E7.07 SPBC13E7.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000703 1-300 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-301-990 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.08c) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000703 1-300 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-301-990 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 T121A,T327A,T513A,S572A,S599A,S604A,S614A,T634A,S637A,T645A,T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-N4,Mid7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000659 R273A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R273A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000972 R273A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R273A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000969 R273A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R273A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001690 R273A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R273A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003183 R273A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R273A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000267 R273A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R273A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000173 1-176 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del6 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004921 1-176 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000703 1-176 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c),assayed_using(PomBase:SPCC550.13) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0001357 1-176 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del6 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-06 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000089 1-176 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del6 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPAC31G5.02 FYPO:0000741 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rot1 rot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.02 FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rot1 rot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- rot1 rot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31G5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rot1 rot1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.22c FYPO:0007319 1-375 Not assayed or wild type 972 h- puf3 puf3(376-732) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000210 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 5C) PomBase SPAC227.11c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph yos9 yos9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph yos9 yos9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.11c FYPO:0000245 deletion 972 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FYPO:0000703 V498A Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-V498A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 K371A,R372A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K371A,R372A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 Y182A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-Y182A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 Y182A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-Y182A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0002033 M285A,T348A Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-as4 Sid2.as4 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000170,FYECO:0000244 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),residue(T75,T78) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 4A) fin1 activation is dependent on sid1 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003306 M285A,T348A Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-as4 Sid2.as4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000244 PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 3a) PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0003481 M285A,T348A Not assayed or wild type 972 h- sid2 sid2-as4 Sid2.as4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000244 PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 3A; Table 1) indicating that inhibition of Sid2 or Fin1 delayed the timing of mitotic commitment until a new size threshold for division was me PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001355 T636A,T650A,S673A,T690A Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-4A698 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001357 T636A,T650A,S673A,T690A Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-4A698 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001357 T636A,T650A,S673A,T690A Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-4A698 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0000590 G2A Not assayed or wild type 972 h- ncs1 ncs1-G2A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14722091 4896 2011-09-21 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0002060 G2A Not assayed or wild type 972 h- ncs1 ncs1-G2A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:14722091 4896 2011-09-22 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002061 1-140 Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4delta bqt4 bqt4delta1-140 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-19 Upon shut-off of lem2, the cells expressing D1-140 and D259 to 383 fragments of Bqt4 did not grow, whereas the cells expressing D141 to 262 did (Fig. 1B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 1-140 Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4delta bqt4 bqt4delta1-140 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:38825008 4896 2025-04-19 All these fragments as well as wild-type Bqt4 (FL) were localized to the NE (Fig. 1C), suggesting that the lethality was not caused by the loss of NE localization. PomBase SPCC550.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0005776 deletion 972 h- atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-10 PomBase SPCC550.10 FYPO:0007331 deletion 972 h- atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32034465 4896 2020-04-20 PomBase SPCC550.10 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC550.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atd3 atd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC550.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- atd3 atd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC550.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atd3 atd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atd3 atd3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1782.05 FYPO:0000339 E142K Not assayed or wild type 972 h- ypa2 ypa2-E142K csr7-7|ypa2-7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 20.5 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Table 3) PomBase SPAC1782.05 FYPO:0000339 E142K Not assayed or wild type 972 h- ypa2 ypa2-E142K csr7-7|ypa2-7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 48.1 PMID:22267499 4896 2024-02-22 (Table 3) PomBase SPAC1565.04c FYPO:0000584 wild type Overexpression 972 h- ste4 ste4+ wild_type ECO:0005638 PMID:1766866 4896 2013-01-30 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0003730 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000148 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1A) PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0001621 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:32896087 4896 2020-09-29 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0000470 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta 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SPCC4B3.17 FYPO:0000035 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 medium PMID:32896087 4896 2020-09-29 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0001437 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1A) PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0004529 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:22349564 4896 2021-01-27 (Figure 1C) PomBase SPCC4B3.17 FYPO:0004529 deletion 972 h- cbp3 cbp3delta deletion 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The reduction of the Sfp1 protein upon nitrogen starvation was significantly delayed in the mts3-1 mutant (Fig. 2K), suggesting that the stability of Sfp1 during starvation is regulated by the proteasome. PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:23349636 4896 2014-02-25 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:23349636 4896 2014-02-25 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:23349636 4896 2014-02-25 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC25H2.13c) PMID:23349636 4896 2014-02-25 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:23349636 4896 2014-02-25 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:23349636 4896 2014-02-25 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000846 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.13c) PMID:11084332 4896 2015-12-14 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8621436 4896 2018-03-22 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003865 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC140.01) PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003865 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003865 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 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assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 3A, lanes 1 and 7) (control) PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0004503 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9653157 4896 2019-02-08 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003872 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002951 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003870 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003869 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0005619 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:22730331 4896 2016-08-18 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003867 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003867 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002774 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002774 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:28366744 4896 2017-04-24 (Figures 3A, 3B) PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000836 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9430640 4896 2021-03-02 (Fig. 2) PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000836 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.08) PMID:15933715 4896 2022-09-29 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003866 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.13c) PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0004157 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.13c) PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:22451489 4896 2013-11-10 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPCC736.09c) PMID:18062930 4896 2015-01-13 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:23209828 4896 2016-11-29 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:23209828 4896 2016-11-29 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:24006256 4896 2014-02-13 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9203581 4896 2015-05-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9203581 4896 2015-05-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-14 We confirmed it by microscopy as well. Fig 1C and D. PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PR:000046671),assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:27655872 4896 2016-12-02 (Fig. 3A, lane 4) both cleavage products PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PR:000046672),assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:27655872 4896 2016-12-05 (Fig. 3A, lane 4) PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000337 PMID:21091378 4896 2013-08-28 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:12511578 4896 2016-02-10 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9203581 4896 2015-05-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9203581 4896 2015-05-05 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002082 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-21 (Figure 5; Figure supplement 4) PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003873 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0005620 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:22730331 4896 2016-08-22 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0002303 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8621436 4896 2018-03-22 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003868 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003027 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:18023413 4896 2014-09-01 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC140.01) PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1687.05) PMID:26221037 4896 2016-08-26 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1687.05) PMID:26221037 4896 2016-08-26 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8621436 4896 2018-03-22 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0001420 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000227 PMID:8621436 4896 2018-03-22 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000067 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000073 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0004025 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0000767 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003840 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:8621436 4896 2018-03-22 PomBase SPBC16G5.01 FYPO:0003877 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpn12 mts3-1 unknown ECO:0005638 PMID:20133687 4896 2014-10-02 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000705 C143D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C143D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002019 C143D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C143D amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 C143D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C143D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 C143D Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-C143D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 R165A Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-S3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004250 270-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-269 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000705 270-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-269 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 3—Figure supplement 2) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004248 270-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-269 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0006784 270-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-269 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1B, 2B) PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0005968 deletion 972 h- SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:29856841 4896 2018-06-11 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC25B2.03 SPBC25B2.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.08c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl33 mrpl33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrpl33 mrpl33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1919.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl33 mrpl33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.04c FYPO:0006548 deletion 972 h- pob1 pob1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 The loss of Clr3 or Pob3 caused an increase in pho1 transcript levels, consistent with their involvement in repression by lncRNA8,38, but the extent of upregulation was less than in pir2-1 (Fig. 5c). PomBase SPBC1289.04c FYPO:0001991 deletion 972 h- pob1 pob1delta deletion ECO:0001232 PMID:10436025 4896 2014-07-01 PomBase SPBC1289.04c FYPO:0003333 deletion 972 h- pob1 pob1delta deletion ECO:0001232 PMID:10436025 4896 2014-07-01 PomBase SPBC1289.04c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pob1 pob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- pob1 pob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1289.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pob1 pob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002373 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-08-01 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002374 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-08-01 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0003000 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 1G-G) PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0001008 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-02-25 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002024 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-06-03 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002424 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-08-02 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002999 948-950,F1361S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-299 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 1B) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000703 T73A,T89A,S109A,S116A,S147A,T152A,S165A Not assayed or wild type 972 h- sfr1 sfr1-7A (CDK sites) amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC644.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.07) PMID:39174851 4896 2024-09-24 (Fig. 3A, Fig. EV1A) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000705 1-68,122-1017 Not assayed or wild type 972 h- pck2 pck2-69-121 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04),assayed_using(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC4D7.15 FYPO:0002059 deletion 972 h- gem6 gem6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33754639 4896 2021-03-24 PomBase SPBC17D1.01 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 spp41 spp41+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC23C11.04c FYPO:0000059 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PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 S18A,S24A,S46A,S52A,S117A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S18-S117A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19136623 4896 2024-07-02 Similarly, Clr3 and Mit1 localization was decreased in ckb1D and swi6-S18-117A mutants, although this decrease was less in swi6-S18-117A than in ckb1D cells. PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 S18A,S24A,S46A,S52A,S117A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S18-S117A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:19136623 4896 2024-07-02 Similarly, Clr3 and Mit1 localization was decreased in ckb1D and swi6-S18-117A mutants, although this decrease was less in swi6-S18-117A than in ckb1D cells. PomBase SPCC622.11 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0000089 deletion 972 h- lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC622.11 FYPO:0000089 deletion 972 h- lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC622.11 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC622.11 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph lmb1 lmb1delta deletion ECO:0005638 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PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC725.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arg6 arg6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC725.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arg6 arg6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30.03c FYPO:0001420 wild type Overexpression 972 h- tsn1 tsn1+ wild_type ECO:0005638 PMID:18062930 4896 2015-01-13 PomBase SPAC30.03c FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- tsn1 tsn1+ wild_type ECO:0001232 PMID:18062930 4896 2015-01-13 PomBase SPBC660.13c FYPO:0000095 Y57N,Q130H,N134D Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-17 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000277 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000268 Y57N,Q130H,N134D Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-17 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000315 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPCC1795.11 FYPO:0001245 N599* Not assayed or wild type 972 h- sum3 sum3-599->stop sum3-599* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPCC962.01 FYPO:0008455 1333-1404 Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1deltaC2D partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000703 4-72 Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-CD cdc4p(C) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.16c),assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:11087749 4896 2020-12-30 PomBase SPAC29E6.04 FYPO:0000284 D77N Not assayed or wild type 972 h- nnf1 nnf1-495 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17352737 4896 2015-02-11 PomBase SPBC211.07c FYPO:0002768 L120A Not assayed or wild type 972 h- ubc8 ubc8-L120A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC211.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0000450 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-S121A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0004212 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-S121A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0002679 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-S121A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Te recombinant proteins of fssion yeast H2A (SpHta1) were also purifed. An in vitro kinase assay using these recombinant proteins showed that the H2A-K119D and the H2A-K119E mutants, as well as the H2A-S121A mutant, were not signifcantly phosphorylated by Bub1, whereas H2A-K119R mutant proteins were phosphorylated by Bub1 (Fig. 4B). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0003182 S122A Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-S121A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29769606 4896 2024-04-24 Consistently, sister chromatid non-disjunction at meiosis II was signifcantly increased in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. S3D). PomBase SPBC1604.14c FYPO:0006120 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 pak1-48 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC146.13c) PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- shk1 pak1-48 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC146.13c) PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 100-442 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta100-442 mid1-1-100-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 60 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 4B) PomBase SPCC1450.11c FYPO:0000080 deletion 972 h- cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0006978 deletion 972 h- cek1 cek1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPCC1450.11c FYPO:0001128 deletion 972 h- cek1 cek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0003532 deletion 972 h- cek1 cek1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0003861 deletion 972 h- cek1 cek1delta deletion ECO:0000335 PMID:23874875 4896 2014-10-01 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0001000 deletion 972 h- cek1 cek1delta 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph cek1 cek1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.11c FYPO:0001188 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ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10837231 4896 2025-01-28 SPB was unaffected in sid1, sid2, spg1 and cdc14 mutants (Figure 4a and data not shown), but was severely affected in sid4, cdc7 and cdc11 mutants. PomBase SPCC737.08 FYPO:0001168 E1637Q Overexpression 972 h- mdn1 mdn1-B5 mdn1-E1637Q amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30318141 4896 2018-10-23 PomBase SPAC806.06c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC806.06c SPAC806.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC806.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- SPAC806.06c SPAC806.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC806.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC806.06c SPAC806.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC806.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC806.06c SPAC806.06cdelta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000705 1-10 Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-(11-436) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 1-10 Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-(11-436) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 1-10 Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-(11-436) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 1-10 Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-(11-436) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 2) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002672 1-10 Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-(11-436) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 5A) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003056 1-574 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2delta1-574 sme2D1-574 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0001509 1-574 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2delta1-574 sme2D1-574 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003121 1-574 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2delta1-574 sme2D1-574 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003059 1-574 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2delta1-574 sme2D1-574 partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007629 Y451* Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-Y451* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPBC776.02c FYPO:0004422 T316S Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316S dis2-SPPR amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:7957097 4896 2015-12-04 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000580 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000900 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000348 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000681 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 low PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003181 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0000337 PMID:10882124 4896 2020-09-15 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000484 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 PMID:1339382 4896 2013-08-12 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000484 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:8299939 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003606 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 In contrast to the point mutation, the rec8::ura4 strain showed no shortening of prophase in three independent time courses (data not shown). Shortening of the prophase in the point mutation strain may indicate a role of Rec8p in meiosis regulation. Alternative explanations, like shortening of prophase by an additional mutation, were not excluded. PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003606 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003539 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0000059 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0002485 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003179 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0002093 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000581 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0004665 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000925 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0000925 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8-110 unknown ECO:0001232 PMID:8536990 4896 2014-07-29 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000703 1-2481 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-5 tra1delta1-2519 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure 3C) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0002357 1-2481 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-5 tra1delta1-2519 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 (Figure 3E) PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003164 disruption Not assayed or wild type 972 h- exo1 exo1-1::ura4 exol-1::ura4 disruption ECO:0005801 PMID:7855597 4896 2014-04-22 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000256 disruption Not 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FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PR:000044799) PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPBC354.13 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPBC354.13 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC354.13 FYPO:0003532 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 high PMID:26960792 4896 2020-02-11 PomBase SPBC354.13 FYPO:0002482 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC354.13 FYPO:0007283 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPBC354.13 FYPO:0000647 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC354.13 FYPO:0007282 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPBC354.13 FYPO:0002903 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPBC354.13 FYPO:0002110 wild type Overexpression 972 h- rga6 rga6+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high variable severity PMID:26960792 4896 2020-02-11 growing tips were longer and thinner than those of wild-type cells. This morphology is similar to the one caused by overexpression of Rga4. PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004811 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0004811 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 high assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 high assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 high assayed_using(PomBase:SPCC1442.14c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0003049 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001134 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0007012 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0007013 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0007013 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0000291 PMID:31294478 4896 2019-07-28 (Fig. 2b) PomBase SPBC26H8.10 FYPO:0001234 wild type Knockdown 972 h- dis3 dis3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000106 high PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0006825 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000705 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000705 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0003566 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0000228 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 6) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0005779 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0003840 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0009114 I463N,P464N Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-I463N,P464N csi1-463IPNN amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 4) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 A146V Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-B9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38938413 4896 2024-07-10 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000024 C581T 972 h- nak1 orb3-167 nak1-167 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:19646873 4896 2012-02-21 PomBase SPAC16C9.04c FYPO:0001327 C57A Overexpression 972 h- mot2 mot2-C57A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001779 L199P,L209P Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-2LP amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001269 L199P,L209P Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-2LP amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:23166349 4896 2012-12-13 PomBase SPBC2G2.14 FYPO:0001861 L199P,L209P Not assayed or wild type 972 h- csi1 csi1-2LP amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:23166349 4896 2012-11-26 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0004418 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 cut5- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000082 196-652 Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-617 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:19371376 4896 2012-06-21 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001122 196-652 Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-617 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:19371376 4896 2012-06-21 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002391 K118R Overexpression 972 h- ark1 ark1-K118R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002902 K118R Overexpression 972 h- ark1 ark1-K118R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007725 Y139A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-Y139A stx8(Y139A)|fsv1-Y139A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 V242VGVPRV Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-F41 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0003315 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0002021 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001035 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rga1 rga1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001234 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 2A The resulting strain, rgf1+, showed a slow growth pattern at 28°C PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0007436 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0007436 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 PMID:16421249 4896 2022-01-08 (Figure 4c) Lack of Rga1p produces small colonies and the cells show a swollen, multiseptated or branched shape; a phenotype similar to that seen in cells in which Rho1p is excessively activated PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0002240 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rga1 rga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.11 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPAC25B8.11 SPAC25B8.11+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC25B8.11 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPAC25B8.11 SPAC25B8.11+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003672 T469A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-GKA amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:14713954 4896 2014-08-15 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003630 T469A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-GKA amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:14713954 4896 2014-08-14 PomBase SPCC790.03 FYPO:0001422 A186T Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-A186T amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-09-30 (Fig. 8C, 8D) Western blot analysis show Sre1 cleavage defect under low oxygen PomBase SPAC22H10.04 FYPO:0001875 D82N Not assayed or wild type 972 h- ppa3 ppa3-D82N amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:38865179 4896 2024-07-09 ppa3-D82N cells producing Sid4-RFP displayed symmetric Sid1-GFP and Cdc7-GFP localization on anaphase SPBs whereas the localization is asymmetric in wild-type cells (Figure 4B). This further demonstrates that ppa3-D82N is a loss of function allele. PomBase SPAC22H10.04 FYPO:0001875 D82N Not assayed or wild type 972 h- ppa3 ppa3-D82N amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:38865179 4896 2024-07-09 ppa3-D82N cells producing Sid4-RFP displayed symmetric Sid1-GFP and Cdc7-GFP localization on anaphase SPBs whereas the localization is asymmetric in wild-type cells (Figure 4B). This further demonstrates that ppa3-D82N is a loss of function allele. PomBase SPAC22H10.04 FYPO:0005709 D82N Not assayed or wild type 972 h- ppa3 ppa3-D82N amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:38865179 4896 2024-07-09 In both wild-type and ppa3-D82N cells, Csc1-GFP localized to mitotic SPBs (Figure 4C). PomBase SPAC22H10.04 FYPO:0002060 D82N Not assayed or wild type 972 h- ppa3 ppa3-D82N amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:38865179 4896 2024-07-10 Like ppa3∆, ppa3-D82N cells were viable and 9 rescued growth of cdc11-136, an indication that it is a loss-of-function ppa3 allele (Figure S3A) PomBase SPCC1840.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq11 coq11delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000835 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1687.12c) PMID:37156397 4896 2023-05-24 The amount of Coq4 was significantly reduced in ∆coq11 and ∆coq12 single mutants PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000037 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:37156397 4896 2023-05-24 (Figs. 2A, S1A) Like other mutants lacking CoQ, the ∆coq11 strain showed better growth on cysteine-containing medium. PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0001413 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:37156397 4896 2023-05-24 (Fig. 4) The results revealed higher sulfide levels in both Δcoq11 and Δcoq12 strains PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0007035 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPCC1840.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 coq11 coq11delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000102 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000103 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:37156397 4896 2023-05-24 (Figs. 3, S1C) Similar to the Δcoq2 (ppt1) strain, the Δcoq11 and Δcoq12 strains grew more slowly in the presence of 1 and 2 mM hydrogen peroxide or 0.5 mM CuSO4 than in its absence PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0003559 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000087 deletion 972 h- coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:37156397 4896 2023-05-25 (Figs. 3, S1C) Similar to the Δcoq2 (ppt1) strain, the Δcoq11 and Δcoq12 strains grew more slowly in the presence of 1 and 2 mM hydrogen peroxide or 0.5 mM CuSO4 than in its absence PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.09 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph coq11 coq11delta deletion 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fan1 fan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPBC146.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- fan1 fan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC146.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- fan1 fan1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC146.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fan1 fan1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fan1 fan1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 F301A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F301A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 F301A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F301A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC29A3.06 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp18 utp18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.06 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp18 utp18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- utp18 utp18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A3.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 utp18 utp18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.06 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 utp18 utp18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPCC1739.14 FYPO:0002563 26-64 Not assayed or wild type 972 h- npp106 npp106delta26-64 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1739.14) PMID:9372936 4896 2014-09-01 PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0001490 csc1 SPB constitutive (via sid4) Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-GFP-sid4-GBP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:38865179 4896 2024-07-10 died as single elongated cells, consistent with SIN inactivation (Figure S2, C and D) PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0002061 csc1 SPB constitutive (via sid4) Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-GFP-sid4-GBP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:38865179 4896 2024-07-10 Interestingly, we found that cells producing both Csc1-GFP and either Ppc89-GBP-mCherry (Figure S2A) or Sid4-GBP-mCherry (Figure 3A) were inviable. PomBase SPNCRNA.720 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.720 SPNCRNA.720delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000705 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Figure 7B) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001645 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Fig. 7e) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001645 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.10c),assayed_using(PomBase:SPBC36B7.08c) PMID:27666591 4896 2017-01-04 (Fig. 7F) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0001645 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC36B7.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC800.13) PMID:34810257 4896 2022-06-24 Yeast two hybrid The yeast two-hybrid assays showed that the Ccp1 homodimer mutant, Ccp1-4A, was unable to interact with CENP-TCnp20 (Fig. 3A and SI Appendix, Fig. S8) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0005887 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0000059 12 PMID:27666591 4896 2016-12-28 (Figure 7D) PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0002090 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:27666591 4896 2016-12-28 PomBase SPBC36B7.08c FYPO:0000091 L10A,F17A,I24A,F32A Not assayed or wild type 972 h- ccp1 ccp1-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27666591 4896 2016-12-28 (Figure 7C) PomBase SPCC757.09c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001324 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001885 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 3f) PomBase SPCC757.09c FYPO:0001117 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002700 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 1D). In addition, basal Sty1 activity was significantly higher in exponentially growing rnc1􏰂 cells expressing a genomic C-terminal hemagglutinin (HA)-tagged version of the MAP kinase, compared to wild-type cells or a pmk1􏰂 mutant PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 2B) PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000836 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002129 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:12931193 4896 2013-05-09 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001038 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002138 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-09 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC887.10) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 2) PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001890 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001309 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000238 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000238 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0006660 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001522 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000962 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0005947 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC757.09c FYPO:0004083 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0004083 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC887.10) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001317 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC543.07) PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0000073 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001103 deletion 972 h- rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rnc1 rnc1delta deletion ECO:0005638 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ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6828164 4896 2017-12-05 (Fig. 1A) The transition point for cdc2 is 0.65 using cdc2.33 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000229 high PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 2B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000168,FYECO:0000229 high PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 2B) cells do not undergo re replication at restrictive temperature PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000444 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:1655416 4896 2016-03-08 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004596 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000117,FYECO:0000227 high PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 2B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000502 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:1464318 4896 2013-01-29 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003379 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002044 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:7498766 4896 2014-05-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001384 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:11250892 4896 2017-07-24 (Figure 3) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002033 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c) PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000082 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003436 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000229,FYECO:0000260 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 Cdc2 kinase activity is low during G2 data not shown PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003950 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),residue(T10A) PMID:9353247 4896 2018-08-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),residue(T46A) PMID:9353247 4896 2018-08-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),residue(T60A) PMID:9353247 4896 2018-08-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),residue(T104A) PMID:9353247 4896 2018-08-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),residue(T134A) PMID:9353247 4896 2018-08-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),residue(T374A) PMID:9353247 4896 2018-08-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8319772 4896 2016-07-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC685.09) PMID:11486016 4896 2013-12-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),residue(T378) PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),residue(S422) PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),residue(S513) PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-18 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:2569363 4896 2013-02-18 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001645 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.14c) PMID:2569363 4896 2013-02-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001128 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:1563349 4896 2013-02-15 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001355 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16453733 4896 2024-06-27 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000836 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:2320127 4896 2016-12-13 (Fig. 4a) Cells blocked in G2 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001038 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000422,FYECO:0000451 high assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 4C and D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001890 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000110,FYECO:0000168,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 2A) cells do not undergo re replication at restrictive temperature but cdc18 transcript increases PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000839 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7254352 4896 2012-07-09 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:2674650 4896 2013-04-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000333 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:1655416 4896 2016-03-08 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000333 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003246 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000229,FYECO:0000260 PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 4D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004962 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:21518960 4896 2015-12-03 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000776 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8319772 4896 2016-07-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000776 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c) PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000703 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c),assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:9201720 4896 2018-06-09 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000840 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000170,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 4C) Cdc2 not required for active cdc10 dependent transcription during S phase PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006506 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000110,FYECO:0000117,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 2B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006158 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000110,FYECO:0000117,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-05-04 (Fig. 2B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004235 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229,FYECO:0000260 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 4C) Cdc18 transcript is low during G2 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003503 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:893551 4896 2015-07-07 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001357 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24656819 4896 2017-02-17 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001357 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22768388 4896 2017-03-29 (Figure 1C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000097 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10036242 4896 2014-11-21 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0003481 A177T Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-33 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:893551 4896 2015-07-07 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001355 213-342 Not assayed or wild type 972 h- pmt3-His6SUMO-L109K ufd1 ufd1deltaCt partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:26537787 4896 2020-11-06 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0005619 213-342 Not assayed or wild type 972 h- pmt3-His6SUMO-L109K ufd1 ufd1deltaCt partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:26537787 4896 2020-11-06 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pac1 pac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.11c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pac1 pac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- pac1 pac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pac1 pac1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC890.07c FYPO:0006123 deletion 972 h- rmt1 rmt1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16E9.12c) PMID:17213188 4896 2017-07-19 PomBase SPAC890.07c 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972 h- plo1 plo1-24c F295L unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9852154 4896 2012-10-11 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0003566 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-24c F295L unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:24963130 4896 2014-07-17 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0006023 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-24c F295L unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:40161431 4896 2025-04-08 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002970 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-24c F295L unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:24920823 4896 2014-07-11 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001369 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-24c F295L unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9852154 4896 2012-10-11 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000339 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-24c F295L unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:24920823 4896 2014-07-16 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000276 unknown 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PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC21C3.13 FYPO:0007556 deletion 972 h- rps1901 rps1901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC21C3.13 FYPO:0000087 deletion 972 h- rps1901 rps1901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC21C3.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- rps1901 rps1901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC21C3.13 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1901 rps1901delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps1901 rps1901delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21C3.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1901 rps1901delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007376 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Notably, replacement of clr4+ with clr4F449Y or clr4I418P abolished the epigenetic inheritance of ade6+ silencing (Fig. 4b, right). PomBase SPBC428.08c FYPO:0008368 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Furthermore, chromatin immu- noprecipitation followed by high throughput sequencing (ChIP–seq) or quantitative PCR (ChIP–qPCR) showed that while pericentromeric H3K9me2 levels were increased in clr4 mutants relative to clr4+ cells (Fig. 1c; Extended Data Fig. 2a, b)H3K9me3 was lost in clr4F449Y cells and reduced in clr4I418P cells (Fig. 1d; Extended Data Fig. 2c). PomBase SPBC428.08c FYPO:0006993 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:28682306 4896 2025-10-23 Similar to ∆ clr4 cells, clr4F449Y cells displayed increased growth on plateslacking uracil and grew poorly on FOA plates (Fig. 1e, left) indicatinga loss of otr1R::ura4+ silencing. (Fig. 1f, g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004604 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002355 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3a) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004137 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3b-g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005845 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3a) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004577 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3b-g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000882 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Immunoblotting and quantitative mass spectrometry of an enriched histone fraction showed that H3K9me3 levels were dramatically decreased in clr4F449Y cells, while H3K9me2 levels were increased (Extended Data Fig. 1d, e). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:28682306 4896 2025-10-23 In clr4F449Y cells, Swi6 association with pericentromeric dh repeats was nearly abolished, while its associ- ation with dg repeats was reduced by about threefold (Fig. 3a; Extended Data Fig. 9a). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:28682306 4896 2025-10-23 Chp2 recruitment was also impaired, but to a lesser extent (Fig. 3b; Extended Data Fig. 9c). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:28682306 4896 2025-10-23 Moreover, the reduced Swi6 and Chp2 recruit- ment to pericentromeric DNA repeats in clr4F449Y cells was accom- panied by a reduction in Clr3 recruitment (Fig. 3c; Extended Data Fig. 9d). PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:28682306 4896 2025-10-23 ChIP experiments also revealed that in contrast to greatly reduced association of Clr4(W31G) with ­ chromatin, Clr4(F449Y) associated with pericentromeric DNA repeats at levels close to that of wild-type Clr4, demonstrating that Clr4 can bind to H3K9me2 via its chromodomain (Fig. 3i; Extended Data Fig. 9g). PomBase SPBC428.08c FYPO:0000966 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 ChIP–seq and ChIP–qPCR showed increased levels of transcription-associated H3K4me3, H3K36me3, H3K14 ­ acetylation (H3K14ac), and H4K16ac in clr4F449Y relative to clr4+ cells (Fig. 2d, e; Extended Data Fig. 5e–h). PomBase SPBC428.08c FYPO:0010018 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 ChIP–seq and ChIP–qPCR showed increased levels of transcription-associated H3K4me3, H3K36me3, H3K14 ­ acetylation (H3K14ac), and H4K16ac in clr4F449Y relative to clr4+ cells (Fig. 2d, e; Extended Data Fig. 5e–h). PomBase SPBC428.08c FYPO:0010013 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 ChIP–seq and ChIP–qPCR showed increased levels of transcription-associated H3K4me3, H3K36me3, H3K14 ­ acetylation (H3K14ac), and H4K16ac in clr4F449Y relative to clr4+ cells (Fig. 2d, e; Extended Data Fig. 5e–h). PomBase SPBC428.08c FYPO:0000874 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Furthermore, chromatin immu- noprecipitation followed by high throughput sequencing (ChIP–seq) or quantitative PCR (ChIP–qPCR) showed that while pericentromeric H3K9me2 levels were increased in clr4 mutants relative to clr4+ cells (Fig. 1c; Extended Data Fig. 2a, b) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000873 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Immunoblotting and quantitative mass spectrometry of an enriched histone fraction showed that H3K9me3 levels were dramatically decreased in clr4F449Y cells, while H3K9me2 levels were increased (Extended Data Fig. 1d, e). PomBase SPBC428.08c FYPO:0007311 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 ChIP–seq and ChIP–qPCR showed increased levels of transcription-associated H3K4me3, H3K36me3, H3K14 ­ acetylation (H3K14ac), and H4K16ac in clr4F449Y relative to clr4+ cells (Fig. 2d, e; Extended Data Fig. 5e–h). PomBase SPBC428.08c FYPO:0004380 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:28682306 4896 2025-10-23 Furthermore, the pericentromeric recruitment of the RITS complex subunits Chp1 was increased in both clr4F449Y and clr4I418P cells, presumably owing to increased H3K9me2 (Fig. 2c; Extended Data Fig. 5a–c) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000703 F449Y Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-F449Y clr4F449Y amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:28682306 4896 2025-10-23 Clr4(F449Y) was incorporated into the CLRC methyltransferase complex and inter- acted with Swi6 with efficiency similar to wild-type Clr4 (Extended Data Fig. 1b, c). PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 P103L,K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001355 P103L,K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000095 P103L,K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 P103L,K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 P103L,K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 P103L,K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 V17G,Y36A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G,Y36A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006644 K333M Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0003268 K333M Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2C, D) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006917 K333M Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31089172 4896 2019-06-04 (Fig. 2E) PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 D81A,E82A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-D81A,E82A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPAC144.13c FYPO:0004233 AAAGTGCATTACCCTTCCCGGTTTCTC(-198)CCCGGTACCGCAAAGGAAATTGGGAGC Not assayed or wild type 972 h- srw1 srw1-MutPste9 nucleotide_mutation ECO:0005580 PMID:21118960 4896 2012-06-20 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000708 AAAGTGCATTACCCTTCCCGGTTTCTC(-198)CCCGGTACCGCAAAGGAAATTGGGAGC Not assayed or wild type 972 h- srw1 srw1-MutPste9 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:21118960 4896 2012-06-20 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001152 AAAGTGCATTACCCTTCCCGGTTTCTC(-198)CCCGGTACCGCAAAGGAAATTGGGAGC Not assayed or wild type 972 h- srw1 srw1-MutPste9 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c) PMID:21118960 4896 2014-04-30 PomBase SPAC144.13c FYPO:0004142 AAAGTGCATTACCCTTCCCGGTTTCTC(-198)CCCGGTACCGCAAAGGAAATTGGGAGC Not assayed or wild type 972 h- srw1 srw1-MutPste9 nucleotide_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC144.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1198.11c) PMID:21118960 4896 2014-12-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001001 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0005580 high PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002003 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC21E11.03c),assayed_using(SO:0001843) PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000711 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0005580 high PMID:9135083 4896 2015-11-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000080 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000303 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000708 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:9135083 4896 2015-11-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001152 disruption 972 h- atf1 atf1::ura4 gad7::ura4 disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:9135083 4896 2013-03-13 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4896 2021-09-21 (Figure 3A) during spindle checkpoint PomBase SPBPB2B2.02 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr say1 say1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBPB2B2.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr say1 say1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBPB2B2.02 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph say1 say1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.02 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph say1 say1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph say1 say1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph say1 say1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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SPNCRNA.188 SPNCRNA.188+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC645.03c FYPO:0001736 C116A Not assayed or wild type 972 h- isa1 isa1-C116A isa1-C72A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC645.03c),assayed_substrate(PomBase:SPAC22E12.10c) PMID:12741836 4896 2016-05-19 PomBase SPCC645.03c FYPO:0001711 C116A Not assayed or wild type 972 h- isa1 isa1-C116A isa1-C72A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 PMID:11941510 4896 2012-11-09 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005781 S19A,S31A,S33A,S38A,S40A,T44A,T64A,T93A,S94A,S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 2b,c) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001382 S19A,S31A,S33A,S38A,S40A,T44A,T64A,T93A,S94A,S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-18A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC106.01),assayed_substrate(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 1d) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001324 S19A,S31A,S33A,S38A,S40A,T44A,T64A,T93A,S94A,S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-18A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Fig. 2) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001687 S19A,S31A,S33A,S38A,S40A,T44A,T64A,T93A,S94A,S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-18A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure S3) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 S614A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S614A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cut2 cut2delta deletion ECO:0001232 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In contrast, no stacked GA structure was observed in cells of spac17a5.16 isolates and the onlycorrespondingstructurewasasingle,enlargedandelongated structure with associated vesicles. This single structure was not observed in BP90 or spap27g11.12 isolates. PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hid1 hid1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000127 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:40899782 4896 2025-09-10 Treatment with Golgicide A (GCA) resulted in increased GTs for all strains with spac17a5.16 being most profoundly affected (Fig. 4B). The median GT for spac17a5.16 increased by about 6 h compared to around 2 h for both BP90 and spap27g11.12.Again, the GT for spac17a5.16 under nontreated conditions was about 2 h longer than that for BP90. PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009008 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009008 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009008 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0001309 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000123,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0001309 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0001309 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0004163 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0004163 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0002444 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.08c) PMID:20838651 4896 2015-12-04 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000067 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:40899782 4896 2025-09-10 Treating with increasing concentrations of Brefeldin A (BFA) led to an increase in GT for BP90 from a median time of 3.8–4.3 h, but not for either spac17a5.16 or spap27g11.12 (Fig.4A). PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0001029 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0001029 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0002634 deletion 972 h- hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC17A5.16 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hid1 hid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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PomBase SPBC31F10.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mug37 mug37delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mug37 mug37delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug37 mug37delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31F10.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug37 mug37delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug37 mug37delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.12 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC977.12 SPAC977.12delta deletion ECO:0000336 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2018-11-09 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003203 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 PMID:41144523 4896 2025-12-10 Compared to ync13+, the septa in ync13Δ cells were distorted, curved, wavy, uneven, and/or thinner (Fig 7A and 7B), PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0004651 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 PMID:41144523 4896 2025-12-10 Compared to ync13+, the septa in ync13Δ cells were distorted, curved, wavy, uneven, and/or thinner (Fig 7A and 7B), PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. 2b) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003213 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:41144523 4896 2025-11-27 Because many more ync13Δ cells lyse when grown in YE5S rich medium than in the EMM5S minimal medium, we observed septum morphology after shifting cells from YE5S with sorbitol to YE5S by electron microscopy. PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0001327 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S4E) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0001327 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S4E) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0004655 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 The total Rga7 amount at the division site increased in ync13Δ cells under fluorescence microscopy, although Rga7 and Rng10 global protein levels were not obviously affected in ync13Δ cells (slightly increased in 3nmt1-ync13 cells) in Western blotting (Figs 3D, 3E, S6B and S6C). PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.01) PMID:41144523 4896 2025-12-10 As previously reported [58], compared to WT cells, in ync13Δ cells, Ags1 and Bgs4 were more concentrated at cell center during septum maturation (from the end of ring constriction until daughter-cell separation), but Bgs1 was less affected (Fig 4A–4C). PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 As previously reported [58], compared to WT cells, in ync13Δ cells, Ags1 and Bgs4 were more concentrated at cell center during septum maturation (from the end of ring constriction until daughter-cell separation), but Bgs1 was less affected (Fig 4A–4C). PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Trs120 was also more concentrated at the center of the division plane in ync13Δ cells (Fig 5A), confirmed the earlier report [58]. PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPCC645.06c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:30044717 4896 2019-05-03 (Fig. 5C) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 (Fig. 6A) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:30044717 4896 2019-05-03 (Fig. 5C) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPBC800.10c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPAC25G10.09c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 (Fig. 4) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 complete assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:30044717 4896 2019-05-03 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0002410 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0005638 PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. 2a) PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003212 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 PMID:41144523 4896 2025-12-10 Compared to ync13+, the septa in ync13Δ cells were distorted, curved, wavy, uneven, and/or thinner (Fig 7A and 7B), PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0001865 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0000049 PMID:16489217 4896 2017-09-28 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0008456 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Moreover, both Ync13 and Git1, the S. pombe homologs of Munc13 family which is one core......were dispensable for substantial hypotonic PM expansion (Additional file 1: Fig. S2E). PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0002442 deletion 972 h- ync13 ync13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S6B) PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 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prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph nep2 nep2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- nep2 nep2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nep2 nep2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nep2 nep2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000172 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 3B and Supplementary Figure S6) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001894 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 3) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001645 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30462301 4896 2019-10-03 (Figure 4A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure 3A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30503780 4896 2018-12-20 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004083 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:30462301 4896 2019-10-03 Supplementary Figure S7E PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005612 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30462301 4896 2019-10-02 Supplementary Figure S4A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006515 F61A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F61A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Supplementary Figure S5B) PomBase SPBC13G1.04c FYPO:0000957 abh1::URA4 Not assayed or wild type 972 h- abh1 abh1::URA4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000211,FYECO:0000260 PMID:22365419 4896 2015-10-13 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001422 G84A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GAKGG) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 G84A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GAKGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 reduced processing, complements partially sde2Δ PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000705 1-256 Not assayed or wild type 972 h- scm3 scm3(257-336) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPAC56E4.04c FYPO:0005995 G(-127)C,G(-125)C,G(-123)A,A(-122)G Not assayed or wild type 972 h- cut6 cut6-promoter-mutant Pcut6MUT nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:39652606 4896 2025-01-07 (Fig. 2E) PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 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sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph sah1 sah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.18c FYPO:0009060 deletion 972 h- sah1 sah1delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase 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Not assayed or wild type 972 h- puf3 puf3-Y449A/Y671A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30601114 4896 2019-01-11 ADD DOMAIN WHEN SO TERM AVAILABLE Figure 2A and Figure 2-Figure supplement 1B-E PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0008206 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:21481773 4896 2023-02-16 As previously reported, Sre1N accumulated in sre1N cells under anaerobic conditions (Fig. 4B, lanes 1-3)(Lee et al., 2009). PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0002779 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.13) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0002779 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000243 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000705 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPBP4H10.13) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000705 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.02c),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000658 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:22017871 4896 2017-11-30 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001274 deletion 972 h- nro1 nro1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 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PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 492-791 Not assayed or wild type 972 h- fus1 Fus1deltaIDR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0008002 492-791 Not assayed or wild type 972 h- fus1 Fus1deltaIDR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006386 492-791 Not assayed or wild type 972 h- fus1 Fus1deltaIDR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 3F and G) PomBase SPBC29A10.10c FYPO:0003902 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP dbl8 dbl8+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0003412 rpl1502::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpl1502 rpl1502::Tn-seq disruption ECO:0000049 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Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0001178 deletion 972 h- atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000110 PMID:11270572 4896 2014-05-02 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000760 deletion 972 h- atg11 atg11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 PMID:11270572 4896 2014-05-02 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006293 deletion 972 h- atg11 atg11delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0002687 deletion 972 h- atg11 atg11delta deletion ECO:0000059 PMID:11270572 4896 2014-05-02 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0002802 deletion 972 h- atg11 atg11delta deletion ECO:0001232 PMID:11270572 4896 2014-05-02 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg11 atg11delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0002835 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000325 PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 2C) PomBase SPAC140.03 FYPO:0001407 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPAC140.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.03 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.03 FYPO:0004201 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 3B) PomBase SPAC140.03 FYPO:0006993 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1C) PomBase SPAC140.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC140.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000049 low PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1C) PomBase SPAC140.03 FYPO:0007009 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 4) PomBase SPAC140.03 FYPO:0000888 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000226 low PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5E) PomBase SPAC140.03 FYPO:0000888 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000226 high PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1D) PomBase SPAC140.03 FYPO:0002386 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1D) PomBase SPAC140.03 FYPO:0004205 deletion 972 h- arb1 arb1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC140.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.03 FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta arb1 arb1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPAC140.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 arb1 arb1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC140.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC140.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC140.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph arb1 arb1delta 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PomBase SPCC1020.04c FYPO:0002061 M112T Not assayed or wild type 972 h- rpb6 rpb6-ts159 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10648612 4896 2022-04-13 PomBase SPCC1020.04c FYPO:0000084 M112T Not assayed or wild type 972 h- rpb6 rpb6-ts159 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 high PMID:10648612 4896 2022-04-13 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 P303A Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-A4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0002346 deletion 972 h- pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0002827 deletion 972 h- pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0006920 deletion 972 h- pcf3 pcf3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30667359 4896 2019-07-11 (Figure 6B) PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0007005 deletion 972 h- pcf3 pcf3delta deletion ECO:0000049 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SPAC25H1.06 FYPO:0007479 deletion 972 h- pcf3 pcf3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0001357 deletion 972 h- pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion 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prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25H1.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pcf3 pcf3delta deletion ECO:0005638 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972 h- vps45 vps45-v1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0003407 wild type Overexpression 972 h- hsp3102 hsp3102+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPAC5H10.02c FYPO:0003406 wild type Overexpression 972 h- hsp3102 hsp3102+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000113 disruption Null 972 h- pck2 pck2::LEU2 disruption ECO:0005638 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002903 disruption Null 972 h- pck2 pck2::LEU2 disruption ECO:0001232 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002380 disruption Null 972 h- pck2 pck2::LEU2 disruption ECO:0001232 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002060 disruption Null 972 h- pck2 pck2::LEU2 disruption ECO:0005638 PMID:8491190 4896 2014-05-21 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SA7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SA7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000141 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:12676088 4896 2014-10-10 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001407 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 est1 est1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003803 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 1e) Localization of Pof8 at telomeres is reduced but not eliminated in est1∆. PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 est1 est1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001490 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0001232 PMID:12676088 4896 2014-10-10 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 est1 est1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 PMID:12676088 4896 2014-10-10 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 est1 est1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007035 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0004083 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Pof8 expression was not affected by est1∆. PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0004083 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Lsm3 protein level was not affected by est1∆. PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002887 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4f) Lsm3 binding to telomeres was not affected by est1∆. PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002357 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 3a) Pof8-TER1 interaction is not affected by est1∆. PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002357 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:18157149 4896 2015-10-06 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002357 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000840 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-21 Supplementary Fig. 4 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003107 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000337 PMID:12676088 4896 2014-10-10 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000098 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 PMID:26891792 4896 2023-06-21 (Fig. 1) PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003384 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000102 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003559 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000091 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 est1 est1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph est1 est1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002239 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 est1 est1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- est1 est1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 est1 est1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 est1 est1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000705 D304N,D307N Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-2DN amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. 1) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002779 97-101 Overexpression 972 h- pol1 pol1-delta-NLS partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8590799 4896 2016-07-22 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005369 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000082 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 1A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002085 G863D Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G863D STF-3|STF11|STF14|STF3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3A) PomBase SPBC31F10.08 FYPO:0003177 deletion 972 h- mde2 mde2delta deletion ECO:0001232 PMID:16169489 4896 2014-03-04 PomBase SPBC31F10.08 FYPO:0003181 deletion 972 h- mde2 mde2delta deletion ECO:0000337 PMID:16169489 4896 2014-03-04 PomBase SPBC31F10.08 FYPO:0002485 deletion 972 h- mde2 mde2delta deletion ECO:0000059 PMID:16169489 4896 2014-03-04 PomBase SPBC31F10.08 FYPO:0003179 deletion 972 h- mde2 mde2delta deletion ECO:0000059 PMID:16169489 4896 2014-03-04 PomBase SPBC31F10.08 FYPO:0000581 deletion 972 h- mde2 mde2delta deletion ECO:0005638 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ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mde2 mde2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mde2 mde2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC631.02 FYPO:0001357 Y268F Not assayed or wild type 972 h- bdf2 bdf2-Y268F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0000161 1272-1489 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaGAP-C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23615450 4896 2019-10-17 (Figure 3). PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002061 1272-1489 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaGAP-C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:23615450 4896 2019-10-17 (Figure 3). PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002061 1272-1489 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaGAP-C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23615450 4896 2019-10-17 (Figure 3). PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0009009 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000331 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0000067 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0009038 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.90 FYPO:0000111 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.90 SPNCRNA.90+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC644.04 FYPO:0004300 1-40 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-Ndelta40 pct1-41-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:12788946 4896 2014-10-15 PomBase SPAC644.04 FYPO:0000703 1-40 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-Ndelta40 pct1-41-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC644.04 FYPO:0000703 1-40 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-Ndelta40 pct1-41-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC644.04),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC644.04 FYPO:0000703 1-40 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-Ndelta40 pct1-41-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC644.04),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:12788946 4896 2014-10-15 PomBase SPAC644.04 FYPO:0002060 1-40 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-Ndelta40 pct1-41-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12788946 4896 2014-10-15 PomBase SPAC644.04 FYPO:0002060 1-40 Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-Ndelta40 pct1-41-303 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12788946 4896 2014-10-15 PomBase SPBC725.02 FYPO:0001645 1-160 Not assayed or wild type 972 h- mpr1 mpr1deltaN160 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC725.02),assayed_using(PomBase:SPBC887.10) PMID:17559414 4896 2012-11-02 PomBase SPBC1D7.03 FYPO:0000705 198-461 Not assayed or wild type 972 h- clg1 clg1(1-197) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.03),assayed_using(PomBase:SPCC16C4.11) PMID:23874875 4896 2014-10-01 PomBase SPCC777.14 FYPO:0002061 S90G,S92L,S94A,S112I,S114L,S116A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-SX1-SX2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:9102632 4896 2013-09-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdk9 cdk9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdk9 cdk9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdk9 cdk9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdk9 cdk9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdk9 cdk9delta deletion ECO:0000059 PMID:16428435 4896 2024-03-22 Tetrad analysis revealed a 2:2 segregation of viability, and all viable progeny were G418 sensitive, indicating that cdk9 + is essential (data not shown). PomBase SPCC576.15c FYPO:0000082 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.18) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC144.04c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC543.07) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC609.04) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC4B4.08) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001324 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.11) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC119.09c),residue(S10) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC119.09c),residue(S12) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC17D11.08),residue(S10) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC17D11.08),residue(S12) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1709.01),residue(S100) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCP31B10.06),residue(S1005) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCP31B10.06),residue(S1009) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC417.07c),residue(S1017) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.09c),residue(S1017) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC56F2.08c),residue(S102) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC10F6.16),residue(S102) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC10F6.16),residue(S115) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.11c),residue(S1038) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC27F1.09c),residue(S105) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.15c),residue(S106) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.15c),residue(S334) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.15c),residue(T366) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.15c),residue(T369) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC4E9.02),residue(S108) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC12B10.03),residue(S108) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBP19A11.06),residue(S1081) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.06c),residue(S11) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC23G3.12c),residue(S11) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBP22H7.08),residue(S111) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBP22H7.08),residue(S112) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBP22H7.08),residue(S136) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC4D7.01c),residue(S1111) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC4D7.01c),residue(S1134) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC4D7.01c),residue(S1603) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC119.07),residue(S1117) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAPB17E12.14c),residue(S112) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC607.07c),residue(S112) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC343.14c),residue(S112) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC17D1.06),residue(S113) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1682.13),residue(S115) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.03c),residue(S116) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.08c),residue(S117) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC713.12),residue(S119) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC713.12),residue(S152) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC713.12),residue(S154) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.07c),residue(S12) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.10c),residue(S12) PMID:39476757 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Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC12C2.10c),residue(T498) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC146.03c),residue(T51) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c),residue(T527) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.09c),residue(T1758) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.09c),residue(T573) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC13A2.02),residue(T579) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC290.04),residue(T586) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC167.05),residue(T600) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.01),residue(T63) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC17A3.05c),residue(T64) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC1952.16),residue(T644) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1718.03),residue(T76) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19),residue(T836) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19),residue(T845) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19),residue(T863) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19),residue(T890) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC19B12.03),residue(T893) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC19B12.03),residue(Y901) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC962.01),residue(T919) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC23E6.09),residue(T955) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001838 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.14c),residue(Y45) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001355 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000338 medium PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Fig. 1D, E and F) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.13) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.20) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC576.15c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.14) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.17c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC513.07) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC3B9.01) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC13G7.05) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC887.15c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1289.14) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC550.06c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.05c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.01c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBP4G3.03) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC186.05c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCPB16A4.05c) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001327 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC8E4.03) PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Table S1) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.16c),residue(S201) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.16c),residue(S525) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.16c),residue(S714) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.22),residue(S47) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.19),residue(S132) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC3E7.04c),residue(S399) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPAC144.13c),residue(T98) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1795.11),residue(S61) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- 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972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC2A9.04c),residue(S656) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC725.04),residue(S132) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC9B6.03),residue(S23) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.02),residue(S346) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.02),residue(S357) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.02),residue(S392) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.02),residue(S503) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.02),residue(S504) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c 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PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC2H8.02),residue(S330) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC306.03c),residue(T599) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC2H8.05c),residue(S208) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC63.14),residue(S686) 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assayed_protein(PomBase:SPCC645.12c),residue(S72) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPCC645.13),residue(S408) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.14),residue(S420) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0001038 L177G Not assayed or wild type 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 ksg1::natMX4 ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation FYECO:0000137,FYECO:0000338 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.02c),residue(S407) PMID:39476757 4896 2024-11-28 PomBase SPCC576.15c FYPO:0002141 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC576.15c FYPO:0001357 L177G Not assayed or wild type 972 h- ksg1 ksg1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39476757 4896 2024-11-21 (Fig. 1B and E) PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004056 1200-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2+ top2 top2delta-Sph partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002060 1200-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta-Sph partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0001147 wild type Overexpression 972 h- byr1 byr1+ wild_type ECO:0001232 PMID:3042386 4896 2013-02-25 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0003181 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec7 rec7-102 unknown ECO:0000337 PMID:10882124 4896 2020-09-15 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0000484 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec7 rec7-102 unknown ECO:0005638 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S5) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 mrc1(536-673)-mrc1(536-673) Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1(536-673)-mrc(536-673)tandemfusion mrc1(536-673):mrc(536-673)tandemfusion fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22024164 4896 2016-06-07 PomBase SPBC31F10.13c FYPO:0001645 P489A Not assayed or wild type 972 h- hip1 hip1-P489A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.13c),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPBC1105.02c FYPO:0005762 R43K Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-R43K amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:19776021 4896 2016-10-31 PomBase SPAC3A11.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph sod22 sod22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.09 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 sod22 sod22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC3A11.09 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or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-99 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0001423 T418* Not assayed or wild type 972 h- vps3844 vps3844-T418* partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:39477503 4896 2024-11-08 1 showed that the signal peptide and the transmembrane including DUF3844 domain were 2 essential for this function (Fig. 4A). PomBase SPBPB2B2.11 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tgd1 tgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBPB2B2.11 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph tgd1 tgd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.11 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tgd1 tgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBPB2B2.11 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tgd1 tgd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBPB2B2.11 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tgd1 tgd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBPB2B2.11 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tgd1 tgd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 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precocious fusion resulting in cell lysis PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0006011 Q66L Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-Q66L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24147005 4896 2018-04-29 PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0000022 Q66L Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-Q66L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:2107403 4896 2013-02-14 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpz1 tpz1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003412 deletion 972 h- tpz1 tpz1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 low PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpz1 tpz1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- tpz1 tpz1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F6.16c 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SPNCRNA.627 FYPO:0007808 I:238509..238898 Overexpression 972 h- SPNCRNA.627 SPNCRNA.627(606-995) SPNCRNA.144OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC970.12 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mis18 mis18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- mis18 mis18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC970.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mis18 mis18delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- mis18 mis18delta deletion ECO:0005638 PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPCC970.12 FYPO:0000284 deletion 972 h- mis18 mis18delta deletion ECO:0001232 PMID:15369671 4896 2014-08-29 PomBase SPCC16C4.03 FYPO:0000087 S79E Overexpression 972 h- pin1 pin1-S79E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:33410907 4896 2021-01-12 (Figure 5) PomBase SPSNORNA.25 FYPO:0003622 deletion 972 h- snoZ30 snoZ30delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:37403782 4896 2023-07-10 Deletion of snoZ30 and sno530 resulted in a loss of 2′-O-methylation at A41 and A64, respectively, suggesting that sno530 is indeed the A64 U6-modifying snoRNA (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPSNORNA.25 FYPO:0003622 deletion 972 h- snoZ30 snoZ30delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:11842100 4896 2014-08-07 PomBase SPSNORNA.25 FYPO:0003041 deletion 972 h- snoZ30 snoZ30delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:11842100 4896 2014-08-07 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002430 deletion 972 h- adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 PMID:8496185 4896 2014-08-04 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0001991 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 adk1 adk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- adk1 adk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8496185 4896 2014-08-04 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- adk1 adk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:8496185 4896 2014-08-04 PomBase SPAC4G9.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- adk1 adk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8496185 4896 2014-08-04 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0006548 1723-1726 Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1-5'cryptic-splice1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Remarkably, strains carrying splice site mutations showed significant upregulation of the pho1 transcript (Fig. 3c), similar to the effect observed in pir2-1, cwf10- 1 and prtΔ (Figs. 1b, 2c and Supplementary Fig. 1b) PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002561 491-621 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1deltaEF partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-05-27 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001214 491-621 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1deltaEF partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPCC830.03 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-8 unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:21385875 4896 2012-06-08 PomBase SPCC830.03 FYPO:0001137 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-7 unknown ECO:0000106 PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPCC830.03 FYPO:0001138 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-7 unknown ECO:0000106 PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPCC830.03 FYPO:0001135 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-7 unknown ECO:0000106 PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPCC830.03 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-7 unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:21385875 4896 2012-06-08 PomBase SPCC830.03 FYPO:0001134 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-7 unknown ECO:0000106 PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0001309 deletion 972 h- fma1 fma1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- 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PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph fma1 fma1delta deletion 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unknown Not assayed or wild type 972 h- spo13 spo13-B82 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPCC1183.12 FYPO:0000478 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo13 spo13-B82 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 V42VGVPLL,42-46 Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K33deltaK22 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002678 1-246,381-665 Overexpression 972 h- sin1 sin1-(247-380) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0001690 nbs1delta::ctp1-linker-nbs1(221-613) Not assayed or wild type 972 h- nbs1 ctp1:nbs1-FHA/BRCT1-delta ctp1-nbs1-FHA/BRCT1-delta fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000957 nbs1delta::ctp1-linker-nbs1(221-613) Not assayed or wild type 972 h- nbs1 ctp1:nbs1-FHA/BRCT1-delta ctp1-nbs1-FHA/BRCT1-delta fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0003183 nbs1delta::ctp1-linker-nbs1(221-613) Not assayed or wild type 972 h- nbs1 ctp1:nbs1-FHA/BRCT1-delta ctp1-nbs1-FHA/BRCT1-delta fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0001357 nbs1delta::ctp1-linker-nbs1(221-613) Not assayed or wild type 972 h- nbs1 ctp1:nbs1-FHA/BRCT1-delta ctp1-nbs1-FHA/BRCT1-delta fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19804756 4896 2017-03-22 PomBase SPBC1348.03 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ftm6 ftm6delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0003700 degron Knockdown 972 h- dhp1 Dhp1-3xmAID-5xFLAG fusion_or_chimera ECO:0000337 FYECO:0000339 low assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S2E) PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001355 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000703 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000703 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000085 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000088 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000267 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000268 C454R,L455R,C479R,V480R Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-RRRR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0003165 G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002061 G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353 cdc48-605|cdc48-G338D cdc48-G332D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0003425 S1834E Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-S1834E tor1-SE amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c),assayed_using(PomBase:SPBC839.17c) PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 S1834E Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-S1834E tor1-SE amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002672 S1834E Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-S1834E tor1-SE amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000246 PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004213 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 67 PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 2) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005509 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 1b) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000204 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 low PMID:33159083 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005574 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. S2) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004762 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 53 assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 6) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004762 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 77 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 6) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004762 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 8, B and C) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003066 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002568 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.09) PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002568 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.09) PMID:38917328 4896 2024-07-15 (Fig. 3B) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000229 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005630 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:26221037 4896 2016-08-24 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005630 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:26221037 4896 2016-08-24 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0006800 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 low PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003411 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003411 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000137 medium PMID:37970674 4896 2023-11-17 , deletion of either nup132+ or pli1+ results in reduced growth in the presence of 5-FOA, indicating increased expression of ura4+ and hence loss of silencing (Fig. 1C). PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1687.05) PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPBC19G7.09) PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC1687.05) PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC1687.05) PMID:37970674 4896 2023-11-17 However, in nup132Δ cells, whereas wild-type Pli1 was destabilised, Pli1K3R levels remained high (Fig. 1B). PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001324 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.09) PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. 3A) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005631 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000257,FYECO:0000300 assayed_using(PomBase:SPAC1687.05) PMID:26221037 4896 2016-08-24 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0007255 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005801 PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003589 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000260 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004003 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005580 PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1B) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup132 nup132delta deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005512 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-07-11 (Fig. S1) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0008176 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000231 low PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000614 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000260 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000614 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000260 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0008171 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 medium PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 3A, B and C) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0008171 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 high PMID:35354597 4896 2024-03-25 NPC clusters in nup132Δ nuclei coalesced into larger clusters that preferentially localized to the SPBs in mitosis. Fig. 3F PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005384 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 1B) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0005510 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0006995 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000263 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004310 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-06-30 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000969 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003906 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001690 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000963 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002776 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002776 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004667 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 4, C and D) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004093 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-06-30 (Fig. 3A,B, S5) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004121 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004214 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.04c) PMID:26483559 4896 2016-07-11 (Fig. 7, B and C) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0004214 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.03) PMID:26483559 4896 2016-07-11 (Fig. 7C) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002967 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0007533 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001357 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26221037 4896 2016-08-22 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 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PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-08 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1A) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 medium PMID:33159083 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 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deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1A) PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 medium PMID:33159083 4896 2020-11-19 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 nup132 nup132delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-08 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 medium PMID:37970674 4896 2023-11-16 Similarly, both nup132Δ and pli1Δ cells showed sensitivity to the microtubule-stabilising drug thiabendazole (TBZ), consistent with defects in centromere function, and this TBZ sensitivity was also not rescued by the Pli1K3R mutation (Fig. 1C). T PomBase SPAC1805.04 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 nup132 nup132delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- nup132 nup132delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1805.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup132 nup132delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F7.04 FYPO:0003412 med1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 med1 med1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC776.02c FYPO:0006020 T316D Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316D amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),occurs_at(SO:0002213) PMID:29899453 4896 2018-07-17 Extended Data Fig 10 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001324 T316D Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 T316D Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-17 (Fig. 1d) PomBase SPBC776.02c FYPO:0002980 T316D Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-T316D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Fig. 6a, b) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000705 D358N Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-D358N amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0001355 1-226 Overexpression 972 h- pxd1 pxd1(227-351) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:25203555 4896 2014-12-22 PomBase SPBC4C3.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif306 tif306delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4C3.07 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif306 tif306delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4C3.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- tif306 tif306delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4C3.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif306 tif306delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.14 FYPO:0001357 T318A,Y320F Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-T318A,Y320F mut7 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9102632 4896 2013-09-25 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mug124 mug124delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug124 mug124delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug124 mug124delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug124 mug124delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr6 clr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002430 deletion 972 h- clr6 clr6delta deletion ECO:0005638 PMID:9755190 4896 2019-05-10 PomBase SPBC36.05c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr6 clr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- clr6 clr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr6 clr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- clr6 clr6delta deletion ECO:0005638 PMID:9755190 4896 2019-05-10 PomBase SPCC63.08c FYPO:0006295 D193A Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1(D193A) amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-16 (Fig. 1a) PomBase SPCC63.08c FYPO:0001384 D193A Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1(D193A) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 (Figure 1C) Such a band was not observed for D193A and T208A mutants, confirming that they are indeed kinase dead PomBase SPBC1778.02 FYPO:0003555 96-141,514-596 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-cDNA c-rap1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000833 96-141,514-596 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-cDNA c-rap1 partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) 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FYPO:0001495 S35A,S36A Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-SA Rlc1p-AA|Rlc1p-S35A-S36A|rlc1-AA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 50 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000705 1-114 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1delta-FHA dma1delta-FHA domain partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_using(PomBase:SPBC25D12.02c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPBC582.04c FYPO:0002568 276-295 Not assayed or wild type 972 h- dsh1 dsh1delta276-295 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPBC582.04c FYPO:0000888 276-295 Not assayed or wild type 972 h- dsh1 dsh1delta276-295 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPAC26A3.15c FYPO:0001991 deletion 972 h- nsp1 nsp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC26A3.15c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ 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The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uaf2 uaf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- uaf2 uaf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- uaf2 uaf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uaf2 uaf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uaf2 uaf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 L482R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L482R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 L482R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L482R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 L482R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-L482R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPCC338.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph mug112 mug112delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.02 FYPO:0003656 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PomBase SPCC1235.14 FYPO:0003227 deletion 972 h- ght5 ght5delta deletion ECO:0001232 PMID:35286199 4896 2022-05-25 (Fig. 4) PomBase SPCC1235.14 FYPO:0001164 deletion 972 h- ght5 ght5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25411338 4896 2015-08-17 PomBase SPCC1235.14 FYPO:0002559 deletion 972 h- ght5 ght5delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:35286199 4896 2022-05-25 (Fig. 4) PomBase SPCC1235.14 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph ght5 ght5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.14 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ght5 ght5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.14 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ght5 ght5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.14 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17A3.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pas4 pas4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0006676 (-147)-(-44) Not assayed or wild type 972 h- h90 ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig2 cig2delta-147--44 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:11781565 4896 2018-08-08 (Fig. 2B) PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0000781 (-147)-(-44) Not assayed or wild type 972 h- h90 ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig2 cig2delta-147--44 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:11781565 4896 2018-08-08 (Fig. 2B) PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0000780 (-147)-(-44) Not assayed or wild type 972 h- h90 ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig2 cig2delta-147--44 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11781565 4896 2018-08-08 (Fig. 2B) PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0000780 (-147)-(-44) Not assayed or wild type 972 h- h90 ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig2 cig2delta-147--44 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:11781565 4896 2018-08-08 (Fig. 2B) PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0006762 (-147)-(-44) Not assayed or wild type 972 h- h90 ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig2 cig2delta-147--44 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11781565 4896 2018-08-29 (Fig. 2B) PomBase SPAPB2B4.03 FYPO:0006762 (-147)-(-44) Not assayed or wild type 972 h- h90 ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cig2 cig2delta-147--44 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 PMID:11781565 4896 2018-08-29 (Fig. 2B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0000728 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16087707 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000743 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16087707 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0005666 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11260263 4896 2016-09-08 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002946 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11260263 4896 2016-09-08 PomBase SPBC146.13c FYPO:0007285 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:39012625 4896 2024-07-27 (Fig. 7G) PomBase SPBC146.13c FYPO:0007285 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC110.03) PMID:39012625 4896 2024-07-30 (Fig. 7A and B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0006497 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high high PMID:27852900 4896 2018-04-18 (Fig. 4) PomBase SPBC146.13c FYPO:0000135 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:18346214 4896 2015-10-15 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000196 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 PMID:21832151 4896 2012-09-13 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000191 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:39012625 4896 2024-07-27 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001894 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 PMID:21832151 4896 2012-09-13 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000428 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000112,FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-09 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000927 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:28292899 4896 2019-04-23 (Fig. 7) PomBase SPBC146.13c FYPO:0003209 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000225 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000705 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC105.02c),assayed_protein(PomBase:SPAC3A12.14) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure S1A) PomBase SPBC146.13c FYPO:0000705 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC105.02c),assayed_protein(PomBase:SPAC29A4.05) PMID:37531259 4896 2023-08-04 (Figure S1B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0000583 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11260263 4896 2016-09-08 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004972 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 PMID:26345368 4896 2015-10-16 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000082 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-09 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004446 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 PMID:21832151 4896 2015-02-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000422 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 PMID:21832151 4896 2015-02-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000422 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000422 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:18346214 4896 2015-10-15 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004971 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0000291 PMID:26345368 4896 2015-10-16 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000708 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16087707 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000708 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11260263 4896 2016-09-08 (Fig. 2B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0006120 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC13E7.09) PMID:16087707 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0006868 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:28292899 4896 2019-05-01 (Fig. 5B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0006868 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1093.06c) PMID:28292899 4896 2019-05-01 (Fig. 6) PomBase SPBC146.13c FYPO:0001586 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:39012625 4896 2024-07-27 (Fig. 7C and D) PomBase SPBC146.13c FYPO:0004444 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC825.03c) PMID:21832151 4896 2012-09-13 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004444 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC663.03) PMID:21832151 4896 2012-09-13 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001365 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0003014 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000584 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 PMID:21832151 4896 2015-02-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000200 PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16087707 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004653 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0006797 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000639 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002021 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11260263 4896 2016-09-08 (Fig. 2B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004967 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000112,FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-09 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:16087707 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-16 PomBase SPBC146.13c FYPO:0003210 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000381 10 PMID:31217286 4896 2024-03-22 (Fig. 6D) PomBase SPBC146.13c FYPO:0001368 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:16864655 4896 2019-01-11 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000961 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 PMID:11260263 4896 2016-09-08 PomBase SPBC146.13c FYPO:0003835 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:28292899 4896 2019-05-01 (Fig. 5B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0003835 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:28292899 4896 2019-05-01 (Fig. 5B) PomBase SPBC146.13c FYPO:0001587 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC947.01) PMID:25422470 4896 2017-02-07 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002674 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:28292899 4896 2019-05-01 (Fig. 5B,A) PomBase SPBC146.13c FYPO:0008003 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPBC146.13c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c 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PomBase SPBC146.13c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC146.13c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph myo1 myo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 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amino_acid_mutation ECO:0000325 FYECO:0000207 medium assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 9) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0000325 assayed_using(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 9B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0000325 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 9B) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0000325 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 9) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0001324 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 low assayed_protein(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5C) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0007525 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 8) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0002680 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 9A) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0002444 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 8) PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003295 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003076 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC36B7.09) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0000776 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:23671279 4896 2014-04-22 PomBase SPAC6B12.15 FYPO:0003481 R36D,K38E Not assayed or wild type 972 h- cpc2 cpc2-R36D,K38E Cpc2(DE)|cpc2(DE) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 4A) PomBase SPCC188.02 FYPO:0000031 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPCC188.02 FYPO:0003345 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000127 PMID:32361273 4896 2020-08-05 (Fig. 1D) The cells also presented a defect in the degradation of the cyclin Cdc13 and a delay in the dephosphorylation of Ste9 PomBase SPCC188.02 FYPO:0004763 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.02) PMID:16541025 4896 2021-03-15 (Fig. 5b). PomBase SPCC188.02 FYPO:0004763 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:16541025 4896 2021-03-15 We found that, like sgo1D cells, par1D cells mostly lost centromeric Rec8 localization at this stage (Fig. 5d) PomBase SPCC188.02 FYPO:0006825 deletion 972 h- cdc25-22 par1 par1delta deletion ECO:0001232 90 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 Less than 10% of these cells had cdc7p on the spindle pole body, consistent with previous studies [25]. PomBase SPCC188.02 FYPO:0001054 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000059 PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001876 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 10 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:11514436 4896 2021-12-18 (Figure 4a) PomBase SPCC188.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001407 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 par1 par1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000103,FYECO:0000127 medium PMID:32361273 4896 2020-08-05 (Fig. 1) PomBase SPCC188.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002798 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. 2) PomBase SPCC188.02 FYPO:0005034 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. S1A) PomBase SPCC188.02 FYPO:0005727 deletion 972 h- nda3-KM311 par1 par1delta deletion ECO:0000059 PMID:36006032 4896 2023-01-17 (Figure 1D) PomBase SPCC188.02 FYPO:0001152 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. S1A) PomBase SPCC188.02 FYPO:0002049 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000059 PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPCC188.02 FYPO:0006023 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:11514436 4896 2021-12-18 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001253 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 4 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001253 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 1.5 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001253 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 13 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0009011 deletion 972 h- par1 par1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000155 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002277 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. 2) PomBase SPCC188.02 FYPO:0007897 deletion 972 h- cdc25-22 par1 par1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002681 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. 2) This conserved inhibitory phosphorylation occurs as the Cdc2-Cdc13 complex is being formed to prevent its premature activation during G2 phase PomBase SPCC188.02 FYPO:0000650 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000650 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000650 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000650 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0003536 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 32 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 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SPCC188.02 FYPO:0001387 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001387 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC188.02 FYPO:0006660 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002071 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 15 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002071 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 7 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002071 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 11 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000339 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 21 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000339 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 11 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000339 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 14 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0004294 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0004297 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0004297 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000118 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 0.3 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001037 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000207 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000961 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001147 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001147 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0004084 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. 2) PomBase SPCC188.02 FYPO:0004214 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:16541025 4896 2021-03-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0005035 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. 1C) PomBase SPCC188.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:10757751 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001120 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:11514436 4896 2021-12-18 (Figure 4a) PomBase SPCC188.02 FYPO:0000441 deletion 972 h- par1 par1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000441 deletion 972 h- par1 par1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC188.02 FYPO:0000441 deletion 972 h- par1 par1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC188.02 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deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 PMID:16541025 4896 2021-03-15 (Supplementary Fig. 7)...both of these mutant cell types showed precocious centromeric dissociation after meiosis I, and random chromosome segregation following meiosis II PomBase SPCC188.02 FYPO:0001234 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:11380623 4896 2015-01-14 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 par1 par1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- par1 par1delta deletion ECO:0005638 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2023-02-23 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0000829 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp11 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SPBC19C2.04c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- ubp11 ubp11delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- ubp11 ubp11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp11 ubp11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubp11 ubp11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.06 FYPO:0000422 unknown Not assayed or wild type 972 h- arp2 arp2- unknown ECO:0001232 PMID:16141239 4896 2018-01-22 (Fig. 5A,B) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S566A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S566A B2d7-S566A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S566A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S566A B2d7-S566A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-11A1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:22665807 4896 2020-12-04 (Fig. 4b) PomBase SPCC736.14 FYPO:0002679 T279A,S293A,S300A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-T279A,S293A,S300A dis1-N3A|dis1N3A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0000964 T279A,S293A,S300A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-T279A,S293A,S300A dis1-N3A|dis1N3A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2B) The sensitivities of Dis1N3A and Dis1C3A were similar to that of the wild-type. PomBase SPCC736.14 FYPO:0001839 T279A,S293A,S300A Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-T279A,S293A,S300A dis1-N3A|dis1N3A amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2C) .... whereas Dis1N3A and Dis1C3A had loss rates that were comparable to those of the wild-type Dis1 integrant. PomBase SPBC146.07 FYPO:0000705 1-111,284-517 Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-deltaR/S,deltaRRM2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1289.02c),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:9371883 4896 2014-06-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0000705 1-111,284-517 Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-deltaR/S,deltaRRM2,3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.06),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:8657565 4896 2014-06-27 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 Y77YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J10 amino_acid_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 Y77YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J10 amino_acid_insertion ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 Y77YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-J10 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPBC19G7.04 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPBC19G7.04 SPBC19G7.04delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC19G7.04 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr SPBC19G7.04 SPBC19G7.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC19G7.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr SPBC19G7.04 SPBC19G7.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC19G7.04 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 SPBC19G7.04 SPBC19G7.04delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC19G7.04 FYPO:0001986 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC19G7.04 SPBC19G7.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium 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bzz1-deltaSH3deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.05c) PMID:21885283 4896 2017-10-31 (Figure 3B) PomBase SPBC12C2.05c FYPO:0006120 521-642 Not assayed or wild type 972 h- bzz1 bzz1-deltaSH3deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 70-80 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:21885283 4896 2017-10-31 (Figures 3B) PomBase SPBC12C2.05c FYPO:0001645 521-642 Not assayed or wild type 972 h- bzz1 bzz1-deltaSH3deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.15c),assayed_using(PomBase:SPBC12C2.05c) PMID:21885283 4896 2017-10-31 (Figure 3D) PomBase SPCC16C4.02c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo6-1,ceo6-3 asi1 asi1+ wild_type ECO:0005638 medium PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 4A,C; Figure 6B,D,E) PomBase SPCC16C4.02c FYPO:0000017 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo6-1,ceo6-3 asi1 asi1+ wild_type ECO:0001232 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 7) PomBase SPCC16C4.02c FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo6-1 asi1 asi1+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 4A,C) PomBase SPCC16C4.02c FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo6-3 asi1 asi1+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 4A,C) PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001522 short partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Bdelta other ECO:0005638 PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000963 short partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Bdelta other ECO:0005638 PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000964 short partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Bdelta other ECO:0005638 PMID:25428589 4896 2022-12-01 Truncations of nc-1343 (that is, AD and BD) that retain its 50 end did not result in the drug-sensitivity phenotype presented by 1343D cells (Fig. 3b) and, similarly, did not induce tgp1þ expression (Fig. 3c) PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001317 short partial deletion,not affecting nc-tgp1 promoter Not assayed or wild type 972 h- ncRNA-1343 nc-1343-Bdelta other ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2025-01-20 PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0000705 522-544,F526A Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-544)F526A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-17 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002967 R244E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R244E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000659 151-294 Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-1-150 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC576.14 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr dph5 dph5delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002966 T1020A,S1022A,T1024A Not assayed or wild type 972 h- nuc2-663 cut7 cut7-T1020A,S1022A,T1024A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:9490630 4896 2017-08-07 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000080 deletion 972 h- any1 any1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001407 deletion 972 h- any1 any1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001407 deletion 972 h- any1 any1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0001327 deletion 972 h- any1 any1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0002127 deletion 972 h- any1 any1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 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prototroph elp2 elp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph elp2 elp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph elp2 elp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.06 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elp2 elp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- elp2 elp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC895.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elp2 elp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000580 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 php5 php5delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000031 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 98 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 php5 php5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0001934 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:9372932 4896 2019-05-17 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0008153 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Consistent with the fact that Php2/3/5 forms a complex, loss of Php3 localization at cenH and dh elements was observed in the absence of php2 or php5 (Fig. 3a, b, and Supplementary Fig. 3a). PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0008153 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Interestingly, we also observed that Moc3 occupancy at both cenH and dh heterochromatic regions was contingent upon PhpC (Fig. 3a, c and Supplementary Fig. 3d). PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0003074 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Consistent with the fact that Php2/3/5 forms a complex, loss of Php3 localization at cenH and dh elements was observed in the absence of php2 or php5 (Fig. 3a, b, and Supplementary Fig. 3a). PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0003074 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Interestingly, we also observed that Moc3 occupancy at both cenH and dh heterochromatic regions was contingent upon PhpC (Fig. 3a, c and Supplementary Fig. 3d). PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:9372932 4896 2019-05-17 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0006755 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01),assayed_using(SO:0001859) PMID:28934464 4896 2018-11-11 (Fig. 3C) PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0006755 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02),assayed_using(SO:0001859) PMID:28934464 4896 2018-11-11 (Fig. 3D) PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 php5 php5delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0006754 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28934464 4896 2018-11-11 (Fig. 3B) PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0001117 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC191.07) PMID:9372932 4896 2019-05-17 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0001117 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 assayed_using(PomBase:SPCC191.07) PMID:9372932 4896 2019-05-24 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 php5 php5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- php5 php5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph php5 php5delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPCC1183.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pet127 pet127delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.04c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph pet127 pet127delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.04c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph pet127 pet127delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph pet127 pet127delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1183.04c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pet127 pet127delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1183.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- pet127 pet127delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000030 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:11870212 4896 2019-10-30 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0007128 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:11870212 4896 2019-10-30 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003779 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001894 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 >95 PMID:11739790 4896 2016-06-02 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003186 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001270 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 10 PMID:24239120 4896 2022-04-25 (Fig. 3) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003327 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006047 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 5) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0005682 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0005682 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 high PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0005681 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003189 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000243 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000937 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1687.10) PMID:24530531 4896 2014-06-06 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002825 deletion 972 h- leu1-32 ura4-D18 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 4) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000903 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 low PMID:18799626 4896 2014-03-06 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006041 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004705 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 Figure 7 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006049 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 6) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006039 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 40 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 1, 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0008008 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:22363481 4896 2022-07-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000274 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1A) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000274 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:11870212 4896 2019-10-30 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006180 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001840 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006043 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0007959 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. S1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004393 deletion 972 h- hht1-CFP mCherry-atb2 klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000135,FYECO:0000141 high PMID:34346498 4896 2021-09-13 (Figure 7) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004394 deletion 972 h- hht1-CFP mCherry-atb2 klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000135,FYECO:0000141 high PMID:34346498 4896 2021-09-13 (Figure 7) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000228 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000228 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 10-20 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1D) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004101 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 40 PMID:24239120 4896 2022-05-13 (Fig. 3) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004101 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 7, 1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004101 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 7) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004511 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11739790 4896 2016-06-01 (Figure 4B and D) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004863 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 20 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 1A) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006044 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 8) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000733 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-26 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004307 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0004021 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 Figure 2 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp6 klp6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000324 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000324 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. S1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000324 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:16824200 4896 2014-05-13 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 klp6 klp6delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001164 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003178 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 high PMID:18262494 4896 2016-04-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003627 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:11739790 4896 2016-06-02 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003185 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:18799626 4896 2014-03-04 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003185 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:24530531 4896 2014-06-06 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003349 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:16824200 4896 2014-05-13 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003225 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0005342 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 (Fig. 1e) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0005342 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 8) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0003187 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 klp6 klp6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2f) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006084 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:27146110 4896 2017-05-17 (Table 1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000087 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001234 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001234 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0006046 deletion 972 h- nda3-KM311 ade6-M216 ura4-D18 leu1-32 h− klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000285 PMID:27146110 4896 2017-05-18 (Figure 5) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000678 deletion 972 h- hht1-CFP mCherry-atb2 klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 16 PMID:34346498 4896 2021-09-13 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Figure S1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Figure S1) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11739790 4896 2016-06-01 (Figure 2, Table 2) PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp6 klp6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0002104 deletion 972 h- klp6 klp6delta deletion ECO:0005638 PMID:11739790 4896 2016-06-01 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-A9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-A9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC962.02c FYPO:0000705 S202D,S229D,S244D,S278D,S294D Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-N-5D phosphomimetic amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15),assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:20739936 4896 2020-02-11 Bir1-N-5A abolished the interaction with Sgo2, whereas Bir1-N-5D retained the interaction (Fig. 2h) PomBase SPCC962.02c FYPO:0007244 S202D,S229D,S244D,S278D,S294D Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-N-5D phosphomimetic amino_acid_mutation ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. 2a, 2b, S5) PomBase SPCC188.03 FYPO:0000214 L269P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L269P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 L269P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L269P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000085 L269P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L269P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000088 L269P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L269P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002546 L269P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L269P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000268 L269P Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-L269P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mug111 mug111delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0001309 deletion 972 h- mug111 mug111delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mug111 mug111delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mug111 mug111delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug111 mug111delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug111 mug111delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug111 mug111delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000026 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0004700 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0004702 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0001324 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0001324 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000650 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 31 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002462 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 5 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002462 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:10905343 4896 2015-04-29 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002113 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 26 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002061 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10905343 4896 2015-04-29 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002069 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000339 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 62 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000895 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000324 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10473641 4896 2015-03-25 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0003166 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000833 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c),assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:10905343 4896 2015-04-29 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000091 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000091 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10905343 4896 2015-04-29 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0004539 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0000013 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 low PMID:9658169 4896 2015-07-08 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002112 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10905343 4896 2015-04-29 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002060 W119* Not assayed or wild type 972 h- alp11 alp11-924 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:10905343 4896 2015-04-29 PomBase SPAC16C9.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC16C9.01c SPAC16C9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.01c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC16C9.01c SPAC16C9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC16C9.01c SPAC16C9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16C9.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC16C9.01c SPAC16C9.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16C9.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC16C9.01c SPAC16C9.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16C9.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC16C9.01c SPAC16C9.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0007446 131-150 Not assayed or wild type 972 h- yep1Δ hva22 yep1delta(131-150) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000341 PMID:37939137 4896 2025-03-04 (Fig. 3K) PomBase SPCC24B10.18 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.18 SPCC24B10.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.18 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph SPCC24B10.18 SPCC24B10.18delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.18 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC24B10.18 SPCC24B10.18delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC24B10.18 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC24B10.18 SPCC24B10.18delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC24B10.18 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PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0001214 827-2104 Overexpression 972 h- myp2 myo3-tail partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:26092938 4896 2015-08-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 D130A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 D130A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 D130A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 D130A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 D130A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000089 D130A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001485 S438A Overexpression 972 h- atf1 atf1-1M atf1.1M amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:28652406 4896 2020-04-06 the HA-Atf1.1M mutant was fully able to suppress the sensitivity to peroxides of strain Δatf1, expression of the HA-Atf1.10M and 11M mutants did not alleviate this phenotype (supplemental Fig. S1C). PomBase SPBC1685.09 FYPO:0004325 deletion 972 h- rps29 rps29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC1685.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- rps29 rps29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC1685.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps29 rps29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1685.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps29 rps29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1685.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps29 rps29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000088 R319I Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-R319I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPBC14C8.01c FYPO:0002061 1-80,208-296 Overexpression 972 h- cut2 cut2(81-207) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16483313 4896 2016-04-19 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000777 deletion 972 h- pxd1 pxd1delta deletion ECO:0005638 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0003659 deletion 972 h- pxd1 pxd1delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000705 deletion 972 h- pxd1 pxd1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC8F11.07c),assayed_using(PomBase:SPCC970.01) PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000705 deletion 972 h- pxd1 pxd1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC8F11.07c),assayed_using(PomBase:SPBC409.16c) PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0003352 deletion 972 h- pxd1 pxd1delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- pxd1 pxd1delta deletion ECO:0005638 PMID:25203555 4896 2014-12-22 PomBase 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2024-06-27 (Figure 3C) The immunoblot analysis detected an appreciable amount of Ecm33 fragments A, C, F, G, and I PomBase SPAC1705.03c FYPO:0006836 886-981 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtI partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPBP4H10.13 FYPO:0001645 A5D Not assayed or wild type 972 h- rps2302 rps2302-A5D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPBP4H10.13) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000655 G255A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-34 amino_acid_mutation ECO:0000325 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004498 G255A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-34 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001357 G255A Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-34 amino_acid_mutation ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.18c FYPO:0002060 deletion 972 h- pth3 pth3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1105.18c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pth3 pth3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.18c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pth3 pth3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 2-456 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-F partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002905 2-456 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-F partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 V373A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V373A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 V373A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V373A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 V373A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V373A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 V373A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V373A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 V373A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V373A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000703 1-304 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(305–360) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC16E8.08),assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-12-11 In accord with this model, a spa2 construct encoding residues 305–360 [spa2(305–360)] supported pos1 interaction in a yeast two-hybrid assay (Fig. 3C) PomBase SPBC359.02 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alr2 alr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC359.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- alr2 alr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC359.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alr2 alr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002061 (-37)-(-25) Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2(promoter-delta-TATA) pJK148-delta-TATA partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27902423 4896 2016-12-12 PomBase SPAC12B10.11 FYPO:0000182 E338A Overexpression 972 h- exg2 exg2-A1 amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:20852022 4896 2015-08-28 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 L35P,D90H Not assayed or wild type 972 h- byr2 byr2-FBS-1 byr2FBS-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1565.04c),assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:9315645 4896 2018-04-29 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0001041 unknown Not assayed or wild type 972 h- tnr3 tnr3-1 unknown ECO:0000325 PMID:7499352 4896 2012-07-10 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001357 1-19 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001492 1-19 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0003485 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M31 unknown ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2024-03-18 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-M31 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 252-260 Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-38 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 252-260 Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-38 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0002061 252-260 Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-38 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000655 252-260 Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-38 partial_amino_acid_deletion ECO:0000325 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10449724 4896 2016-02-04 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002555 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 90 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 4A) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 However, its localization to the SPB was lost in the sid4-SA1 mutant at restrictive temperature (Figure 3). PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 2) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11676915 4896 2020-12-29 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000941 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000272 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000272 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000082 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPBC244.01c FYPO:0001382 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC244.01c FYPO:0006317 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_protein(PomBase:SPCC417.06c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 3F) PomBase SPBC244.01c FYPO:0006317 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPCC417.06c) PMID:18562696 4896 2024-08-16 (Fig. 3F) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000940 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000940 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 90 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:12479804 4896 2019-01-30 (Figure 4A) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000940 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:16085489 4896 2015-03-03 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002822 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 The spindle pole body signal was greatly reduced in intensity in cdc7-24, spg1-B8, and sid4-SA1 mutants at 36°C. PomBase SPBC244.01c FYPO:0004357 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 3B). However, at 36+C, when cdc11p is no longer associated with the SPB [3, 4], most of the cdc11p was hypophosphorylated (form 1) PomBase SPBC244.01c FYPO:0001355 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC244.01c FYPO:0000133 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPBC244.01c FYPO:0004044 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002024 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:12479804 4896 2019-01-30 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002024 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002061 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0001294 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0003028 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0001368 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC244.01c FYPO:0008403 L629P Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:24838944 4896 2025-04-16 (Fig. 4D) PomBase SPBC244.01c FYPO:0004634 L629P Not assayed or wild type 972 h- pat1-114 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:24838944 4896 2025-04-15 (Fig. 3B) PomBase SPBC244.01c FYPO:0000833 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.12) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.12) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:24055157 4896 2022-09-28 Hhp1-GFP localization at SPBs is Sid4 independent (Figure S3E) PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.12) PMID:24055157 4896 2022-09-28 Hhp1-GFP localization at SPBs is Sid4 independent (Figure S3E) PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002967 L629P Not assayed or wild type 972 h- sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:16775007 4896 2018-03-07 PomBase SPBC244.01c FYPO:0002060 L629P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 sid4 sid4-SA1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001277 736-830 Not assayed or wild type 972 h- mcm2 cdc19-D6 mcm2-D6 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 736-830 Not assayed or wild type 972 h- mcm2 cdc19-D6 mcm2-D6 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 736-830 Not assayed or wild type 972 h- mcm2 cdc19-D6 mcm2-D6 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 736-830 Not assayed or wild type 972 h- mcm2 cdc19-D6 mcm2-D6 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0000708 Q202L Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-Q202L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 high PMID:1340462 4896 2013-02-14 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001664 Q202L Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-Q202L amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000126 low PMID:1340462 4896 2013-02-14 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0004303 1-78,C189S Overexpression 972 h- siw14 siw14-(79-287)-C189S amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 PMID:37772819 4896 2023-10-06 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000674 L2045S Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-L2045S tor1-D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPCC622.09 FYPO:0007386 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0000112 low PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002578 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000095 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 G53C Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52C amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC162.07 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent1 ent1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC162.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- ent1 ent1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC162.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ent1 ent1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0001407 deletion 972 h- spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 spc19 spc19delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 spc19 spc19delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0007035 deletion 972 h- spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0004325 deletion 972 h- spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc19 spc19delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.15c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph spc19 spc19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 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amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC16.01),assayed_using(PomBase:SPAC17G8.14c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0001045 A(-61)G,G(-59)A,T(-58)C,C(-57)T,A(-56)C,C(-55)A Not assayed or wild type 972 h- prt2 prt2-HomoID-like-sequence-mutant nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pof10 pof10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pof10 pof10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pof10 pof10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pof10 pof10delta deletion ECO:0005638 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ade6-M210 pof10 pof10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- pof10 pof10delta deletion ECO:0005638 PMID:11820777 4896 2015-05-20 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof10 pof10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0008218 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2024-05-17 These results showed that cells lacking functional Mis3 could not promote cell growth upon the release to complete medium and remained in the G1/S phase. PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0004481 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2024-05-17 they ceased to increase in number after two divisions (Fig. 1A, open triangles). The growth arrest phenotype of mis3-224 (Fig. 1C) was distinct from that of typical cdc mutants, as its cell length increase was insigni®cant (1.3-fold) after 8h at 36 8C. mis3-224 at 36 8C was unable to increase in cell length because the levels of protein and RNA ceased to increase (B, ®lled and open triangles, respectively). PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0003694 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:10947840 4896 2024-05-17 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0004194 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC660.14) PMID:10947840 4896 2024-05-17 At 36 8C in mis3-224, the level of Mik1 increased to a peak after 4h, but then strikingly decreased to a low level (E). PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0004194 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 high assayed_protein(PomBase:SPBC660.14) PMID:10947840 4896 2024-05-17 At 36 8C in mis3-224, the level of Mik1 increased to a peak after 4h, but then strikingly decreased to a low level (E). PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0000786 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-16 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0004629 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2024-05-17 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0000104 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:15126629 4896 2014-05-15 PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0000088 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2024-05-17 it was moderately sensitive at 308C (Fig. 5A, top): mutant failed to produce colonies in the presence of 8 mM HU at 30 8C, a semi-restrictive temperature. PomBase SPBC25B2.05 FYPO:0007136 G188E Not assayed or wild type 972 h- mis3 mis3-224 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10947840 4896 2024-05-17 they ceased to increase in number after two divisions (Fig. 1A, open triangles). The growth arrest phenotype of mis3-224 (Fig. 1C) was distinct from that of typical cdc mutants, as its cell length increase was insigni®cant (1.3-fold) after 8h at 36 8C. mis3-224 at 36 8C was unable to increase in cell length because the levels of protein and RNA ceased to increase (B, ®lled and open triangles, respectively). PomBase SPCC70.12c FYPO:0005097 T7D,S22D Overexpression 972 h- ecl1Δ,ecl2Δ,ecl3Δ ecl1 ecl1-DD amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:39910760 4896 2025-02-13 The number of cells in the G1 phase was considerably reduced in cells harboring pE- cl1-DD (Figure 2e).. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000708 T7D,S22D Overexpression 972 h- ecl1Δ,ecl2Δ,ecl3Δ ecl1 ecl1-DD amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:39910760 4896 2025-02-13 This suggested that the Ecl1-AA mutant protein activity was comparable to that of the wild-type Ecl1 protein. Meanwhile, when Ecl1-DD was expressed, the recovery was low, and the degree of recovery was significantly lower than that of Ecl1 and Ecl1-AA. This suggested that the activity or stability of the Ecl1-DD mutant protein, which mimics the phosphorylation of Thr7 and Ser22, was reduced compared with the wild-type Ecl1 protein. 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assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 4e) PomBase SPBC582.04c FYPO:0005917 deletion 972 h- dsh1 dsh1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 3) PomBase SPBC582.04c FYPO:0000228 deletion 972 h- dsh1 dsh1delta deletion ECO:0001232 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC582.04c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dsh1 dsh1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC582.04c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dsh1 dsh1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC582.04c FYPO:0000091 deletion 972 h- dsh1 dsh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22895252 4896 2015-05-19 PomBase SPBC582.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- dsh1 dsh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC582.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- dsh1 dsh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC582.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsh1 dsh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsh1 dsh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.02 FYPO:0002177 1-958,K1066R Overexpression 972 h- wis4 wis4deltaN1-958,K1066R wis4-deltaN terminus,K1066R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 PMID:9321395 4896 2019-10-26 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001355 E101G Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001355 E101G Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000085 E101G Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 high PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000088 E101G Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 medium PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000089 E101G Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 low PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16C6.06 FYPO:0005489 F1426A Not assayed or wild type 972 h- vps10 vps10-F1425,1426A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:22484924 4896 2016-07-05 (Fig. 2d) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001514 R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Fig. 4A) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007133 R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Fig. 4A) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 D266E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-D266E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 high PMID:15724441 4896 2015-11-30 PomBase SPAC1F7.08 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph fio1 fio1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.08 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph fio1 fio1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph fio1 fio1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.08 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph fio1 fio1delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F7.08 FYPO:0002015 deletion 972 h- fio1 fio1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000330 high PMID:35079912 4896 2022-03-31 (Figure 3A) 25 µM of iron chelator bathophenanthroline disulfonate (BPS) was added to YES media to create iron-depleted condition. 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2015-01-23 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004304 D172A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D172A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:11934898 4896 2015-01-15 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0008332 deletion 972 h- cid1 cid1delta deletion ECO:0000059 high PMID:39333464 4896 2024-11-12 (Fig. 3A and B and Fig. S4) PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002930 deletion 972 h- cid1 cid1delta deletion ECO:0000059 PMID:39333464 4896 2024-11-13 While the global tail profile did not change in the Δcid16 mutant, we noticed an increase in the fraction of short-tailed reads in Δcid1 and double deletion strains (Fig. 3e). PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0006995 deletion 972 h- cid1 cid1delta deletion ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 Finally, deletion of the other four members of the fission yeast Cid14/Trf4/5 poly(A) polymerase family did not affect silencing of an imr1R::ura4+ reporter gene (Figure 2H). PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0001522 deletion 972 h- cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:10757807 4896 2015-05-07 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0000963 deletion 972 h- cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:10757807 4896 2015-05-07 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39333464 4896 2024-11-12 (Fig. S5B) PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cid1 cid1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0009043 deletion 972 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2014-07-24 PomBase SPBC16C6.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- dbl6 dbl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16C6.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbl6 dbl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbl6 dbl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002834 S18A,S24A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S18-S24A amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:19136623 4896 2024-07-02 swi6-S192-274A mutations did not affect silencing at the centromere (imr::ura4), while swi6-S18-24A and S18- 117A mutants displayed decreases in silencing (Fig. 3C). PomBase SPAC664.01c FYPO:0002679 S18A,S24A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S18-S24A amino_acid_mutation ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19136623 4896 2024-07-02 whereas mutant Swi6 harboring S18A and S24A showed a slight mobility change PomBase SPAC664.01c FYPO:0002679 S18A,S24A Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-S18-S24A amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19136623 4896 2024-07-02 Mutations at the five CK2 sites located in the N-terminal half (S18-117A in Fig. 3A) resulted in an increase in mobility PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003352 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3- unknown ECO:0000337 PMID:6587363 4896 2014-05-07 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3- unknown ECO:0005638 PMID:6587363 4896 2014-05-07 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3- unknown ECO:0005638 PMID:24189946 4896 2014-12-05 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3- unknown ECO:0005638 PMID:24719968 4896 2014-06-18 PomBase SPAPB18E9.02c FYPO:0001974 wild type Overexpression 972 h- ppk18 ppk18+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000263 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAPB18E9.02c FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- ppk18 ppk18+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0000375 1-38 Overexpression 972 h- trz2 trz2deltaMTS trz2-deltaN38-EGFP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Figure 3D) PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0001673 1-38 Overexpression 972 h- trz2 trz2deltaMTS trz2-deltaN38-EGFP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:30393157 4896 2018-12-04 (Figure 3D) PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 fft3 fft3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0003586 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000059 PMID:31575705 4896 2020-02-20 decreased replciation restart fig1 indicating that only one-third of forks arrested at the RTS1-RFB are efficiently restarted in the absence of Fft3. PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0004481 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0007376 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. S1F) PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0001946 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0001232 5 PMID:21437270 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0001407 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 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fft3 fft3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0002827 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0004604 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0006686 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000059 PMID:31575705 4896 2020-02-20 (Fig. 1) PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0006318 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000337 PMID:31575705 4896 2020-02-20 (Fig. 2C) PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0005922 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000059 PMID:21437270 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0005433 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000049 PMID:30373637 4896 2020-02-06 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0005948 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0004345 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.05c) PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0004345 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC17G9.04c) PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0005918 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.05c) PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:18422602 4896 2021-09-23 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:18422602 4896 2021-09-23 PomBase SPAC25A8.01c FYPO:0005924 deletion 972 h- fft3 fft3delta deletion ECO:0000226 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We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPBC1773.10c FYPO:0006748 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000213) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC1773.10c FYPO:0006748 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000221) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC1773.10c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC1773.10c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC1773.10c FYPO:0006251 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000256) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC1773.10c FYPO:0003031 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPBC1773.10c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- nrs1 nrs1-hmt1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-301 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-301 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPBP35G2.07 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ilv1 ilv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.07 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ilv1 ilv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.07 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ilv1 ilv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.07 FYPO:0009091 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SPCC830.10 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph ham1 ham1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC830.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- ham1 ham1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC830.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ham1 ham1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC830.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ham1 ham1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001645 P134A,P137A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-AxxA5,6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:35108037 4896 2022-02-14 Mutant reduced binding to Cdc15C1(aa600-end) compared to wild type Pxl1 (Figure S1A) PomBase SPBC1604.05 FYPO:0003412 pgi1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 pgi1 pgi1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC227.18 FYPO:0002727 E329K Not assayed or wild type 972 h- lys3 lys3-37 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:3142867 4896 2013-11-02 PomBase SPAC227.18 FYPO:0000039 E329K Not assayed or wild type 972 h- lys3 lys3-37 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3142867 4896 2013-09-24 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0001355 R145A,E146A Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-R145A,E146A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000674 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000674 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000674 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000674 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000674 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000674 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000964 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000964 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000964 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000964 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000964 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0000964 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 Supplemental Figure S6B PomBase SPCC338.17c FYPO:0001513 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPCC338.17c FYPO:0003241 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPCC338.17c FYPO:0003241 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPCC338.17c FYPO:0003241 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 16 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPCC338.17c FYPO:0003241 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 11 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPCC338.17c FYPO:0003241 rad21-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS rad21 rad21-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 15 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC215.06c FYPO:0003411 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0000049 high PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPBC215.06c FYPO:0004604 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0000291 medium PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPBC215.06c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC215.06c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC215.06c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.06c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC215.06c FYPO:0006299 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPBC215.06c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.06c FYPO:0009008 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC215.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC215.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC215.06c FYPO:0002336 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPBC215.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC215.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- SPBC215.06c SPBC215.06cdelta deletion ECO:0005638 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h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0000855 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0001407 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0003412 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0002367 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0002368 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPAC1F7.01c 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2020-04-09 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0007311 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0007309 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2013-08-01 PomBase SPAC1F7.01c FYPO:0007309 708-789 Not assayed or wild type 972 h- spt6 spt6-K20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:23851719 4896 2020-04-09 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K200Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K200Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K200Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K200Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPCC285.07c FYPO:0006790 333-372,G332GLGNAFGGIGNAFGGIGNAIGRIGNAFRGANDNNDIPLGEMDVESEV Not assayed or wild type 972 h- wtf18 wtf18-2 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0000059 PMID:30475921 4896 2018-12-14 PomBase SPCC285.07c FYPO:0000590 333-372,G332GLGNAFGGIGNAFGGIGNAIGRIGNAFRGANDNNDIPLGEMDVESEV Not assayed or wild type 972 h- wtf18 wtf18-2 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0000059 PMID:30475921 4896 2018-12-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000659 1-260 Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-CSD partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:37400983 4896 2023-09-08 whereas no DNA binding activity was detected for Swi6-CD or Swi6-CSD (Fig. 2E, G and L). PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0002967 1-1086 Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1(PACT) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:38985524 4896 2024-07-30 Like GFP-Pcp1 expressed from the weak nmt81 promoter, the GFP-PACT domain alone colocalized with Ppc89-mCherry (Figure 4B). Thus, Pcp1’s PACT domain is sufficient for SPB targeting. PomBase SPAC23D3.07 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- pup1 mts6-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPAC23D3.07 FYPO:0000067 unknown Not assayed or wild type 972 h- pup1 mts6-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPAC23D3.07 FYPO:0000073 unknown Not assayed or wild type 972 h- pup1 mts6-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPAC23D3.07 FYPO:0004025 unknown Not assayed or wild type 972 h- pup1 mts6-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPAC23D3.07 FYPO:0000767 unknown Not assayed or wild type 972 h- pup1 mts6-1 unknown ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPAC56F8.06c FYPO:0008420 deletion 972 h- alg10 alg10delta deletion ECO:0000059 PMID:34851357 4896 2025-06-24 PomBase SPAC56F8.06c FYPO:0001910 deletion 972 h- alg10 alg10delta deletion ECO:0005638 PMID:30389790 4896 2019-08-05 (Figure 5c) PomBase SPAC56F8.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph alg10 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC17A5.05c SPAC17A5.05cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17A5.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC17A5.05c SPAC17A5.05cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC17A5.05c SPAC17A5.05cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.06c FYPO:0000082 K428A,K429A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K428A,K429A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002060 K428A,K429A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K428A,K429A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPBC83.18c FYPO:0003013 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 8 PMID:23093943 4896 2021-03-26 Fic1 most likely functions during late stages of cytokinesis. In line with this idea, the percentage of fic1D cells that had undergone ingression but were still joined at their division sites was more than four times that of wild-type cells (Figure 5A-5B). PomBase SPBC83.18c FYPO:0000202 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 1E and G) PomBase SPBC83.18c FYPO:0000202 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:37158439 4896 2024-02-13 (Figure 1E and G) PomBase SPBC83.18c FYPO:0001018 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 ~66 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Fig. 1b, 2) PomBase SPBC83.18c FYPO:0003535 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Fig. 1b) PomBase SPBC83.18c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC83.18c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC83.18c FYPO:0007709 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.02) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure S1B-S1C) PomBase SPBC83.18c FYPO:0007709 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure 1F-1G) PomBase SPBC83.18c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC83.18c FYPO:0007774 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 4C) PomBase SPBC83.18c FYPO:0003532 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 4A) PomBase SPBC83.18c FYPO:0003532 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:32878942 4896 2020-10-07 (Fig. 4D,E,F) PomBase SPBC83.18c FYPO:0003776 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:32878942 4896 2020-10-07 (Fig. S3F,G) PomBase SPBC83.18c FYPO:0003776 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102 PMID:23093943 4896 2021-03-26 Cells lacking Fic1 or its interacting partners Cyk3 or Imp2 were significantly more invasive than wild-type cells (Figure 9A-9B). PomBase SPBC83.18c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC83.18c FYPO:0000674 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPBC83.18c FYPO:0002141 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPBC83.18c FYPO:0008090 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 1) PomBase SPBC83.18c FYPO:0007451 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure S1B-S1C) PomBase SPBC83.18c FYPO:0007451 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure S1B-S1C) PomBase SPBC83.18c FYPO:0001357 deletion 972 h- fic1 fic1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 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ade6-M210 pfd2 pfd2delta gim4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.10 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfd2 pfd2delta gim4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.10 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfd2 pfd2delta gim4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004780 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Fig. 2D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006552 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 When mutations in the helix were combined with mutations in the NLS (Helix* NLS* Cter-GFP), Cter-GFP was found in the cytoplasm. Fig. 2C PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,F683A,F684A,L687A,F688A,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-helix*-NLS*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000705 I379R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-I379R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:21217703 4896 2023-02-16 An arginine substitution of Ile379 or Leu383 of Taz1 or Ile655 of SpRap1 at the center of the hydrophobic interface completely abolished the Taz1RBM-SpRap1RCT interaction (Fig. 6a). PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002907 I379R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-I379R amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:21217703 4896 2023-02-16 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0002019 I379R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-I379R amino_acid_mutation ECO:0001807 high PMID:21217703 4896 2023-02-16 Three point mutants (Taz1 I379R, Taz1 L383R, and Rap1 I655R) that completely abolished the Taz1-SpRap1 interaction in the ITC assay displayed a rap1Δ- and taz1Δ-like telomere length defect (Figs. 6b and 6c) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,R758S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,R758S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001972 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 36 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000676 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC24C9.08) PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 8 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001390 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 3 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000118 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 3 PMID:25356547 4896 2015-08-10 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000085 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T11 unknown ECO:0005638 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deletion 972 h- rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:7565608 4896 2012-07-25 PomBase SPAC343.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000129 PMID:7565608 4896 2012-07-25 PomBase SPAC343.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7565608 4896 2012-07-25 PomBase SPAC343.12 FYPO:0001310 deletion 972 h- rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 PMID:7565608 4896 2015-01-09 PomBase SPAC343.12 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.12 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.12 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC343.12 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rds1 rds1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC343.12 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rds1 rds1delta deletion ECO:0005638 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rds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 R510A,V511A,L512A,Q513A Not assayed or wild type 972 h- mad1 mad1-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26258632 4896 2015-11-27 (Fig. 3A,B) PomBase SPAC3F10.10c FYPO:0000708 F214C Not assayed or wild type 972 h- map3 map3-F214C amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:25831518 4896 2016-06-08 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000161 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-D3 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-D3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-D3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase 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2012-01-01 PomBase SPBC649.04 FYPO:0003034 (-1221)-(-1204) Not assayed or wild type 972 h- uvi15 uvi15-promoter--1204--1221 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:12074602 4896 2014-01-20 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003121 (-925)-(-144) Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2deltaD partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000620 wild type Overexpression 972 h- mad2 mad2+ wild_type ECO:0001232 PMID:22184248 4896 2019-07-11 When Mad2 was turned on, the index of the chromosome condensation gradually increased from 0 to more than 50%. Binucleate cells, which passed through anaphase, however, did not increase. These results indicated that when Mad2 was turned on, the cells, which were initially at the boundary of G2/M, were arrested before anaphase (Fig. 5B). PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000620 wild type Overexpression 972 h- mad2 mad2+ wild_type ECO:0001232 PMID:12186944 4896 2014-09-20 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000620 wild type Overexpression 972 h- mad2 mad2+ wild_type ECO:0001232 PMID:23394829 4896 2014-03-31 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0001009 wild type Overexpression 972 h- mad2 mad2+ wild_type ECO:0001232 PMID:12186944 4896 2014-09-20 PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0000940 wild type Overexpression 972 h- mad2 mad2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12186944 4896 2014-09-22 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000044 unknown Not assayed or wild type 972 h- pka1 git6-261 unknown ECO:0000291 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC106.10 FYPO:0001665 unknown Not assayed or wild type 972 h- pka1 git6-261 unknown ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000310 PMID:8227198 4896 2020-10-22 PomBase SPBC106.10 FYPO:0005288 unknown Not assayed or wild type 972 h- pka1 git6-261 unknown 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SPAC26A3.09c FYPO:0001587 675-1229 Not assayed or wild type 972 h- rga2 rga2deltaPH&GAP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC26A3.09c) PMID:18793338 4896 2013-01-09 PomBase SPAC26A3.09c FYPO:0000271 675-1229 Not assayed or wild type 972 h- rga2 rga2deltaPH&GAP partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000214 PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPAC26A3.09c FYPO:0000086 675-1229 Not assayed or wild type 972 h- rga2 rga2deltaPH&GAP partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPAC26A3.09c FYPO:0001878 675-1229 Not assayed or wild type 972 h- rga2 rga2deltaPH&GAP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:18793338 4896 2013-01-09 PomBase SPAC26A3.09c FYPO:0002060 675-1229 Not assayed or wild type 972 h- rga2 rga2deltaPH&GAP partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18793338 4896 2013-01-16 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000082 T189A Overexpression 972 h- ssp2 ssp2-T189A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001830 T189A Overexpression 972 h- ssp2 ssp2-T189A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000708 T189A Overexpression 972 h- ssp2 ssp2-T189A amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000280 T189A Overexpression 972 h- ssp2 ssp2-T189A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPNCRNA.737 FYPO:0009022 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.737 SPNCRNA.737+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000278 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.737 FYPO:0000799 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.737 SPNCRNA.737+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0000351 wild type Overexpression 972 h- rgf2 rgf2+ wild_type ECO:0001232 PMID:19189958 4896 2022-01-06 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001968 wild type Overexpression 972 h- rgf2 rgf2+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:19189958 4896 2022-01-06 GS activity was threefold higher than that observed in the wild-type strain (Figure 4C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001968 wild type Overexpression 972 h- rgf2 rgf2+ wild_type ECO:0001232 high PMID:19189958 4896 2022-01-06 GS activity was threefold higher than that observed in the wild-type strain (Figure 4C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0007911 wild type Overexpression 972 h- rgf2 rgf2+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:19189958 4896 2022-01-06 the amount of active Rho1p increased considerably in the strain overexpressing Rgf2p as compared with the wild-type strain (Figure 4B PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001038 wild type Overexpression 972 h- rgf2 rgf2+ wild_type ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7A) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0007436 wild type Overexpression 972 h- rgf2 rgf2+ wild_type ECO:0001232 PMID:19189958 4896 2022-01-06 cells were larger than wild-type cells and displayed multiple abnormal septa. PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0001686 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0000964 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0003702 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0007678 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 PMID:32320462 4896 2021-03-17 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0007678 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 PMID:32320462 4896 2021-03-17 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC2F12.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 osh2 osh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000703 28-160 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-delta28-160 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:15509783 4896 2019-05-11 (Fig. 7B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000091 28-160 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1-delta28-160 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:15509783 4896 2019-05-11 (Fig. 7B) PomBase SPAC664.13 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC664.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC664.13 SPAC664.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC664.13 SPAC664.13delta 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partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC4F8.14c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- hcs1 hcs1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC162.09c) PMID:8896278 4896 2014-09-05 PomBase SPAC4F8.14c FYPO:0000075 wild type Overexpression 972 h- hcs1 hcs1+ wild_type ECO:0005638 medium PMID:8896278 4896 2014-09-05 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0001045 472-864 Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1delta(472-864) partial_nucleotide_deletion ECO:0005801 PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. S5) PomBase SPCC24B10.19c FYPO:0003236 wild type Overexpression 972 h- nts1 nts1+ wild_type ECO:0000291 PMID:25002536 4896 2015-01-23 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0007459 deletion 972 h- les1 les1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 complete medium PMID:32848252 4896 2020-09-05 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0007458 deletion 972 h- les1 les1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 complete high assayed_using(PomBase:SPCC285.13c) PMID:32848252 4896 2020-09-04 (Fig. 4) Extended Data Fig. 7 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 les1 les1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0007974 deletion 972 h- les1 les1delta deletion ECO:0001232 PMID:35293864 4896 2022-04-12 (Fig. 4) Figure supplement 2 We found that in both les1Δ and nem1Δ cells microtubule growth speed inside the nuclear bridge was faster than in wild-type cells PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0000772 deletion 972 h- les1 les1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium medium PMID:32848252 4896 2020-09-05 (Fig. 4a, b) Daughter nuclei in the les1Δ strain also suffered transient leakages at the time of maximum spindle elongation, as measured by loss of nuclear NLS-GFP PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 les1 les1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 les1 les1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C4.05c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph les1 les1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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4896 2020-11-12 (Figure 6B) decreased stability in response to oxidative stress PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003345 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005580 PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004481 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004481 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001934 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004054 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12080074 4896 2014-12-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002033 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12589433 4896 2017-08-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002003 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000337 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PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002780 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:20655879 4896 2014-10-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000342 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000335 PMID:22139357 4896 2015-01-22 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003460 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000335 PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003459 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000166 PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002827 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000049 low low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 3) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000303 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 high PMID:10428959 4896 2021-05-25 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006037 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000207 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006037 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000059 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15840944 4896 2017-09-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000835 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC736.15) PMID:32023460 4896 2020-02-22 decreased Pil1 protein abundance Figure S1F PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001101 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12080074 4896 2014-12-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:15135546 4896 2014-11-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12589433 4896 2017-08-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC365.12c) PMID:11751918 4896 2014-10-22 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12080074 4896 2014-12-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001324 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC17D11.05) PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007704 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000210 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:26443240 4896 2021-03-24 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002679 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC736.15) PMID:32023460 4896 2020-02-28 decreased Pil1 protein abundance Figure S1F PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002679 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005479 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004173 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:15917811 4896 2016-06-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004173 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002446 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC17A2.09c) PMID:14633985 4896 2020-11-12 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002446 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC23A1.06c) PMID:11886858 4896 2017-08-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002446 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17A2.09c) PMID:17612531 4896 2014-08-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002376 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002376 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-10-31 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004228 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005749 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC757.09c) PMID:31911490 4896 2020-10-13 (Fig. 4h) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001885 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001838 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001838 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001838 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC17D11.05) PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002134 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC17A2.09c),assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:17612531 4896 2014-08-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000826 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000826 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000826 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000826 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.01c) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000826 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC663.03) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002287 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:15164362 4896 2019-10-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002287 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC824.07) PMID:16141205 4896 2015-01-27 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002287 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC713.11c) PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002287 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002287 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12080074 4896 2014-12-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002287 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.20) PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC824.07) PMID:16141205 4896 2015-01-27 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC713.11c) PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.20) PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:17612531 4896 2014-08-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001116 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003993 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002305 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPBC713.11c) PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002305 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:10428498 4896 2013-07-02 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002305 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12080074 4896 2014-12-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.07c) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.15c) PMID:11004189 4896 2013-09-09 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002304 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:10428498 4896 2013-07-02 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003034 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003034 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003034 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001152 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC285.09c) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001152 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001152 deletion 972 h- h90 sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001152 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001117 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001117 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.07c) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001117 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001117 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001117 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003039 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005496 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000049 high PMID:26108447 4896 2016-07-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005499 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000049 high PMID:26108447 4896 2016-07-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002349 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:21098141 4896 2013-07-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002352 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:21098141 4896 2013-07-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007263 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-28 resulting in the formation of fewer punctate eisosomes (Figure S1B). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006036 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000207 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006036 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000078 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006036 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000127 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006718 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c),residue(T189) PMID:28515144 4896 2018-10-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003532 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003532 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000255 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 6) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000847 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000327 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:18272791 4896 2017-10-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001327 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001327 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.05c) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001327 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC777.08c) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001327 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-15 (Figure 5B) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002852 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC297.03) PMID:10233158 4896 2014-10-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000825 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC191.09c) PMID:12063243 4896 2014-11-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000825 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC965.07c) PMID:12063243 4896 2014-11-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000825 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003991 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006634 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:27746023 4896 2020-11-17 unlike WT cell elongation continued after actin depolymerization, (Figures 2A and 2B; Movie S1) conclusions. 1. the SAPK pathway is required for CRIB dispersal after LatA treatment. 2 the actin cytoskeleton per se is not required for stability of the Cdc42 polarity module at cell tips. 3. cell elongation can occur in the complete absence of the actin cytoskeleton. PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007435 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 complete PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 4) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001490 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 PMID:9585506 4896 2014-11-21 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007151 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000078,FYECO:0000207,FYECO:0000248 PMID:32915139 4896 2020-10-15 (Figure 2A, C) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001387 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:38424265 4896 2024-05-24 (Fig. 6A) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:23832353 4896 2013-08-02 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:20075862 4896 2016-07-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:20075862 4896 2016-07-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:36174923 4896 2022-11-06 (Fig. 5) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:18422613 4896 2014-08-21 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:11751918 4896 2014-10-22 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:31601154 4896 2019-11-23 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001368 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:32915139 4896 2020-10-15 (Figure 2—Figure supplement 5). ngs formed and constricted correctly in >85% of sty1D cells (Figure 2D). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003265 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9202173 4896 2024-08-20 (Fig. 7) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001753 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001753 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001437 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001192 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003506 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003721 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:25793410 4896 2015-07-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23695164 4896 2013-06-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001175 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000236 PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002940 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005884 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001691 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005947 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:10428959 4896 2021-05-25 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001471 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003896 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:20655879 4896 2014-10-14 PomBase SPAC24B11.06c 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assayed_using(PomBase:SPCC1450.06c) PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000833 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003627 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000092 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003627 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000092 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007451 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27746023 4896 2020-11-17 (Figures 2A, S1A; Movie S1) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007451 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:27746023 4896 2020-11-17 (Figure S1B) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0008003 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002013 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:33225241 4896 2021-01-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004230 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:17369398 4896 2015-11-05 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005035 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005035 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:20144990 4896 2016-01-12 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000776 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. 2b) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000776 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. 2b) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000776 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.05c) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. 2b) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000776 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC777.08c) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. 2b) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001668 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.11c) PMID:25803873 4896 2018-01-12 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003828 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:20144990 4896 2016-01-12 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001487 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.09) PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001246 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.09) PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003992 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004350 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:16141205 4896 2015-01-27 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006830 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000173 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-08-27 (Fig. 1B) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006829 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000177 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 1B) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001317 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002350 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Figure 2C) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003036 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001357 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-03-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001420 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001984 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:18272791 4896 2017-08-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001227 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002766 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-06 (Figure 6) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007359 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004513 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 high PMID:32915139 4896 2020-10-14 cells lacking Sty1 grew in these low LatA concentrations (Figure 1B). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003860 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-01 (Figure 6) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003895 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20655879 4896 2014-10-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18003976 4896 2016-09-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004052 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004052 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:14633985 4896 2020-11-12 (Figure 4E) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004052 deletion 972 h- 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PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001408 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000081 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000166 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000081 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:18665268 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sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000112 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000112 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 high PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 6a) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000112 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10348908 4896 2014-07-02 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000112 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12684881 4896 2014-10-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000113 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-03-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- 972 sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC24B11.06c 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2018-11-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006738 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006736 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:29900664 4896 2018-11-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000280 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:23370392 4896 2013-05-15 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000280 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 high PMID:29079657 4896 2019-02-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007379 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000207 PMID:15936270 4896 2020-06-12 Cell polarity defects with bent and branched morphology were observed after shifting the Δspc1 mutant from 25oC to 36oC (Figure 6C). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15917811 4896 2016-06-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:15917811 4896 2016-06-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:17952063 4896 2016-01-14 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000220 PMID:17952063 4896 2016-01-15 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:10233158 4896 2014-10-28 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 high high PMID:10428959 4896 2021-05-25 (Figure 3) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 high PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Table 1) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 3A) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003612 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sty1 sty1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- sty1 sty1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPBC23G7.05 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sui1 sui1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23G7.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- sui1 sui1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC23G7.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sui1 sui1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC336.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- sfc3 sfc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC336.07 FYPO:0002061 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h- SPNCRNA.399 SPNCRNA.399+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002098 T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T653A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:16618806 4896 2018-04-11 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007479 T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T653A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. S1I) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T653A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T653A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. S1I) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000957 T653A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-T653A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 R395L Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-R395L amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0002271 deletion 972 h- gln1 gln1delta deletion ECO:0005638 PMID:28982178 4896 2018-02-28 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gln1 gln1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gln1 gln1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- gln1 gln1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23H4.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gln1 gln1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0007336 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000049 98.90 PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5C, 5F, 5H) PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0007376 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:39096900 4896 2025-06-12 Expression of Snf5-CDx2 fusion protein abolished epigenetic inheritance of ectopic heterochromatin. (Fig. 6C, 6D) PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0005844 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5D, 5G) PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0000883 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 medium PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S5A) PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0004577 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S5B) PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0008416 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5I) PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0004377 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- snf5 snf5-CDx2 Snf5-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1620.14c) PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 5B) PomBase SPNCRNA.401 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.401 SPNCRNA.401+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.401 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.401 SPNCRNA.401+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.401 FYPO:0002693 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.401 SPNCRNA.401+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.401 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.401 SPNCRNA.401+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.401 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.401 SPNCRNA.401+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.401 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.401 SPNCRNA.401+ wild_type ECO:0005638 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC290.02 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc34 rpc34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC290.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpc34 rpc34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC290.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc34 rpc34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- ccr1 ccr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:23737303 4896 2013-08-14 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002524 wild type Overexpression 972 h- ccr1 ccr1+ wild_type ECO:0005801 PMID:23737303 4896 2013-08-14 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002716 wild type Overexpression 972 h- ccr1 ccr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000368 PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Fig. 5) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0005253 wild type Overexpression 972 h- ccr1 ccr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Fig 4) PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 qcr6 qcr6delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0006141 deletion 972 h- qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0007618 deletion 972 h- qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0007612 deletion 972 h- qcr6 qcr6delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph qcr6 qcr6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qcr6 qcr6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005369 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6A, S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000082 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6A, S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 The STF7 (H686Y) pyrophosphatase domain mutation of asp1 elicits a severe growth defect at all temperatures (Fig. 1A). PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6A, S3A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001355 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 1A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 1B). The asp1-STF7 pyrophosphatase mutation resulted in derepression of Pho1 expression, by 23-fold compared to the wild-type control. PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 6B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H686Y Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H686Y STF-7|STF7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. S3A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005848 1-330 Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-delta4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c),assayed_substrate(PomBase:SPAC1834.04) PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005848 1-330 Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-delta4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c),assayed_substrate(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005848 1-330 Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-delta4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c),assayed_substrate(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007077 1-330 Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-delta4 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:31468675 4896 2019-10-03 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002779 60-217 Overexpression 972 h- pol1 pol1-delta-BlockII-III partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8590799 4896 2016-07-22 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0003066 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0004481 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-08 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0000080 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23658229 4896 2013-05-17 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0001407 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-08 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0001407 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2015-08-03 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0001407 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0002021 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup120 nup120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0000825 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0000825 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0000825 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0000825 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup120 nup120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0004118 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B9.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- nup120 nup120delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase 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2018-07-24 (Fig. 5B) PomBase SPCC1795.11 FYPO:0007317 unknown Not assayed or wild type 972 h- sum3 ded1-1D5 unknown ECO:0000337 FYECO:0000126,FYECO:0000228 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:10725227 4896 2018-08-06 (Fig. 6) PomBase SPCC1795.11 FYPO:0007317 unknown Not assayed or wild type 972 h- sum3 ded1-1D5 unknown ECO:0000337 FYECO:0000126,FYECO:0000228 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:10725227 4896 2018-08-06 (Fig. 6) PomBase SPCC1795.11 FYPO:0000835 unknown Not assayed or wild type 972 h- sum3 ded1-1D5 unknown ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000300 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:10725227 4896 2018-07-24 (Fig. 3A) PomBase SPCC1795.11 FYPO:0000835 unknown Not assayed or wild type 972 h- sum3 ded1-1D5 unknown ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000300 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:10725227 4896 2018-07-24 (Fig. 3A) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 S599A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S599A amino_acid_mutation ECO:0005638 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S248A,S326A,T412A,T429A,S499A,T502A,S533A Not assayed or wild type 972 h- byr4 byr4-7A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:24920823 4896 2014-07-10 PomBase SPAC222.10c FYPO:0002970 S248A,S326A,T412A,T429A,S499A,T502A,S533A Not assayed or wild type 972 h- byr4 byr4-7A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC222.10c) PMID:24920823 4896 2014-07-11 PomBase SPAC222.10c FYPO:0001164 S248A,S326A,T412A,T429A,S499A,T502A,S533A Not assayed or wild type 972 h- byr4 byr4-7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24920823 4896 2014-07-16 PomBase SPAC222.10c FYPO:0001904 S248A,S326A,T412A,T429A,S499A,T502A,S533A Not assayed or wild type 972 h- byr4 byr4-7A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:24920823 4896 2014-07-10 PomBase SPAC222.10c FYPO:0003245 S248A,S326A,T412A,T429A,S499A,T502A,S533A Not assayed or wild type 972 h- byr4 byr4-7A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24920823 4896 2014-07-11 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002134 TTT_822-824_CTC,TGT_838-840_CTC,ACA_888-890_GAG Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-m4 nucleotide_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003107 TTT_822-824_CTC,TGT_838-840_CTC,ACA_888-890_GAG Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-m4 nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC644.06c FYPO:0006822 355-593 Overexpression 972 h- cdr1 nim1(1-354) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9135149 4896 2014-12-30 PomBase SPAC24B11.11c FYPO:0004653 wild type Knockdown 972 h- sid2 sid2+ wild_type ECO:0001232 PMID:24790095 4896 2015-10-29 PomBase SPAC1002.04c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf11 taf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- taf11 taf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1002.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf11 taf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0004340 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:37540145 4896 2023-08-14 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0004340 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0001232 PMID:37192628 4896 2023-06-09 Similarly, loss of Atg44 in S. pombe affected mitochondrial morphology; some of the Sp-atg44D cells showed spherically enlarged mitochondria like Sp-dnm1D cells (Figure 3D) PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0007594 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0000112 PMID:37192628 4896 2023-06-09 In atg44D cells, mitophagy was completely blocked similarly to cells lacking Atg1, a core autophagy protein (Figures 1A and S1B). PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0008067 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0001232 ~30 PMID:37540145 4896 2023-08-15 (Figure 4G) PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0003807 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0001232 ~70 PMID:37540145 4896 2023-08-17 (Figure 4F) PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0003768 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC12C2.08) PMID:37540145 4896 2023-08-15 loss of Mdi1 did not impact Dnm1 recruitment to mitochondria and Dnm1 foci appeared associated with the hyperfused net structures (Fig. 4 F, arrows). PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0007448 deletion 972 h- atg44 atg44delta deletion ECO:0000112 PMID:37192628 4896 2023-06-09 Loss of Atg44 in either S. pombe or S. cerevisiae did not or only marginally affected non-selective macroautophagy, as measured by GFP/RFP processing (Figures S1C, S1D, and S1F) or the Pho8D60 assay (Figure 1E), or other types of selective autophagy including the Cvt pathway that delivers the precursor form of the hydrolase aminopeptidase I to the vacuole (Figure S1G), endoplasmic reticulum-phagy/reticulophagy (Figures S1E and S1H), and pexophagy (Figure S1I), suggesting that Atg44 is specifically required for mitophagy. PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.14c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph atg44 atg44delta deletion ECO:0005638 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4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0003392 W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-W104A amino_acid_mutation ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.07) PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0000246 W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-W104A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000118,FYECO:0000126 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0001413 W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-W104A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000164 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 PMID:8887550 4896 2014-01-07 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002946 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 low PMID:10651902 4896 2020-11-27 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:14506270 4896 2016-06-23 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:9491802 4896 2020-08-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002021 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0007949 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 PMID:15546915 4896 2022-03-30 As shown in Fig. 6C, there was an increase in the amount of β-glucan in cells that overexpressed rgf3+ compared with wild-type cells (16% and 10%, respectively) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001968 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001968 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001035 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8887550 4896 2013-02-01 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002700 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0000112 assayed_substrate(PomBase:SPBC119.08) PMID:24498240 4896 2024-07-03 Also, Pmk1 hyperactivation triggered by rho2+ overexpression is fully attenuated in mutants lacking Pck2 (Figure 1A). PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.14c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001406 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8887550 4896 2013-02-01 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0003413 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 low PMID:10651902 4896 2020-11-27 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0004104 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10651902 4896 2020-11-27 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10651902 4896 2020-11-27 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001078 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0000335 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001383 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005580 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001079 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0000335 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002161 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000776 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 6D) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0006832 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000105 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 6) The levels of Etd1 and Rho1 regulate the timing of septation start. (F) The start of septum deposition is dependent on the level of rho1+. Cells expressing endogenous rho1+ and 3Xrho1+ grown at 32ÊC for 16 h either without (ON, high rho1+ level; n = 2, 14 cells) or with thiamine (OFF, wild-type rho1+ level; n = 2, 16 cells) were analyzed. PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001190 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000105 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9491802 4896 2020-08-18 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000109 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000109 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8887550 4896 2013-02-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000646 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8887550 4896 2013-02-01 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000647 wild type Overexpression 972 h- rho1 rho1+ wild_type ECO:0001232 PMID:8887550 4896 2014-01-07 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or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:17452625 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002561 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18272786 4896 2018-01-26 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002561 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:17452625 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001880 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:11694585 4896 2017-05-11 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001880 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002555 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001008 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8978670 4896 2016-06-29 (Figure 1) PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0000082 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:10388810 4896 2014-09-19 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001382 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0000835 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-14 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001355 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001355 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002024 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8978670 4896 2016-06-29 (Figure 1) PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002024 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 medium PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0001006 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002061 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 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amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002558 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002558 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002967 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0003626 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:9490631 4896 2017-09-07 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0003626 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:9606213 4896 2021-02-24 In fact, more cells had staining at their tips than wild-type cells, probably indicating a prolonged attempt to conjugate, after which the protein delocalizes PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002060 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002060 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:10588653 4896 2020-09-01 (Fig 3) PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002060 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16085489 4896 2015-03-02 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002060 E43K Not assayed or wild type 972 h- cdc3 cdc3-124 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16866873 4896 2017-09-14 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0006799 1-25,50-643 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-26-49 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29180432 4896 2019-01-02 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001357 ned8-(GGKGG)-sde2(85-263) Not assayed or wild type 972 h- sde2 ned8-GGKGG-sde2-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 (Fig. EV2B) normal processing, complements sde2Δ PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0000082 A1C Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0000080 A1C Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003029 A1C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-210 DS2 snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003244 A1C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-210 DS2 snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003244 A1C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-210 DS2 snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0001355 A1C Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003469 A1C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-210 DS2 snu1 snu1-A1C nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPBC354.05c FYPO:0001422 K743R Overexpression 972 h- sre2 sre2-K743R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPBP35G2.05c FYPO:0004250 430-435 Not assayed or wild type 972 h- cki2 cki2-1-429 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.05c) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 N469A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-N469A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 N469A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-N469A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 N469A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-N469A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002825 1-517 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-Bam/C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 (Fig. 2C) PomBase SPCC736.14 FYPO:0006725 1-517 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-Bam/C partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 PomBase SPAC328.06 FYPO:0001424 ubp2-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp2 ubp2-NES fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC328.06) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPAC328.06 FYPO:0002774 ubp2-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp2 ubp2-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044777) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPAC328.06 FYPO:0002774 ubp2-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp2 ubp2-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044778) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPAC328.06 FYPO:0002774 ubp2-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp2 ubp2-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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dal81delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC105.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dal81 dal81delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC105.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph dal81 dal81delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- dal81 dal81delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC105.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal81 dal81delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC105.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dal81 dal81delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC663.05c FYPO:0001645 L60A,V62A Not assayed or wild type 972 h- asf1 cia1-L60A,V62A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.13c),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPCC663.05c FYPO:0001645 L60A,V62A Not assayed or wild type 972 h- asf1 cia1-L60A,V62A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPCC338.11c FYPO:0007628 wild type Overexpression 972 h- efm2 efm2+ wild_type ECO:0005638 PMID:12442907 4896 2021-01-28 (Figs. 3A and 3B). PomBase SPCC338.11c FYPO:0003306 wild type Overexpression 972 h- efm2 efm2+ wild_type ECO:0005638 PMID:12442907 4896 2021-01-28 (Table 1) PomBase SPCC338.11c FYPO:0001406 wild type Overexpression 972 h- efm2 efm2+ wild_type ECO:0005638 PMID:12442907 4896 2021-01-28 a considerable portion of the Rrg1-overproduced cells that undergo mitosis showed an abnormal accumulation of septum material (Figs. 3F, 3G, and 3H). PomBase SPCC338.11c FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- efm2 efm2+ wild_type ECO:0005638 PMID:12442907 4896 2021-01-28 As shown in Fig. 2A, the rate of cell proliferation was immediately reduced after the amount of Rrg1 was increased. PomBase SPCC338.11c FYPO:0003481 wild type Overexpression 972 h- efm2 efm2+ wild_type ECO:0005638 PMID:12442907 4896 2021-01-28 (Figs. 3A and 3B). there were cells that initiated and completed the mitosis in a small portion (Table 1), which eventually led to cell proliferation until the stationary phase (Fig. 2A). PomBase SPCC895.07 FYPO:0007108 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Figure 4c) PomBase SPCC895.07 FYPO:0004614 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:26124291 4896 2016-07-27 (Fig. 7 CD) PomBase SPCC895.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0004318 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000079 PMID:11432827 4896 2015-01-16 PomBase SPCC895.07 FYPO:0003186 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 3B) PomBase SPCC895.07 FYPO:0003165 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 20 PMID:11432827 4896 2015-01-16 (Figure 4B) PomBase SPCC895.07 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0003411 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPCC895.07 FYPO:0003411 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000049 low PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S2) PomBase SPCC895.07 FYPO:0002827 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005682 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 2D,2F) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005682 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0005681 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 2D,2F) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005681 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0005215 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:12426374 4896 2017-08-07 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000903 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0005703 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001355 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002638 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000059 PMID:11432827 4896 2015-01-16 PomBase SPCC895.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001861 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000340 PMID:11432827 4896 2015-01-16 PomBase SPCC895.07 FYPO:0006102 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11369198 4896 2017-08-17 (Figure 5b) PomBase SPCC895.07 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002818 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 2B) PomBase SPCC895.07 FYPO:0007110 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Fig. 4c) PomBase SPCC895.07 FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 1.4 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000324 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000340 PMID:11432827 4896 2017-08-16 (Figure 3F) PomBase SPCC895.07 FYPO:0003758 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11369198 4896 2017-08-17 (Figure 5b) PomBase SPCC895.07 FYPO:0004742 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPCC895.07 FYPO:0003555 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPCC895.07 FYPO:0004731 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:22696680 4896 2017-06-05 Supplemental Figure S1, C-E PomBase SPCC895.07 FYPO:0004731 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:22696680 4896 2017-06-05 Supplemental Figure S1, C-E PomBase SPCC895.07 FYPO:0004731 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:22696680 4896 2017-06-05 Supplemental Figure S1, C-E PomBase SPCC895.07 FYPO:0004214 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Fig. 4d) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005709 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 4A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005613 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:26124291 4896 2016-07-27 (Fig. S5E) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005613 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC902.06) PMID:26124291 4896 2016-07-27 (Fig. S5E) PomBase SPCC895.07 FYPO:0000416 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:11432827 4896 2015-01-16 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0003595 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 2.9 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0004325 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 alp14 alp14delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000091 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000091 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 high PMID:11432827 4896 2015-01-16 (Figure 4A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC895.07 FYPO:0005797 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 2C) PomBase SPCC895.07 FYPO:0005797 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPCC895.07 FYPO:0001234 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 2A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0004236 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11369198 4896 2017-08-17 (Figure 5b) PomBase SPCC895.07 FYPO:0000678 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 78 PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Figure 4) PomBase SPCC895.07 FYPO:0002215 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 38.2 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002112 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 2A) PomBase SPCC895.07 FYPO:0001491 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 PMID:11432827 4896 2015-01-16 (Figure 2C) PomBase SPCC895.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp14 alp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- alp14 alp14delta deletion ECO:0005638 PMID:11432827 4896 2015-01-16 (Figure 2C) PomBase SPBC1921.05 FYPO:0006274 2-6 Not assayed or wild type 972 h- ape2 ape2-N-terdelta2-6 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-11-16 PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0000468 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-1T unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:11780129 4896 2024-04-12 we found that cohesin mutants (psc3-1T, psc3-2T, psc3-4T and rad21-K1) produced switching-defective colonies at a rate nearly 100-fold that of the wild type (Fig. 3a,b). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0007209 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-1T unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:31483748 4896 2019-12-06 Figure 5A-E PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0001840 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-1T unknown ECO:0001232 0.6 PMID:11780129 4896 2024-04-12 psc3-1T also displays the lagging-chromosome phenotype and mis-segregated the mini-chromosome Ch16 (ref. 17) at a higher rate than the wild type, mimicking the swi6∆ phenotype (Fig. 2a, b). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0000228 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-1T unknown ECO:0001232 PMID:11780129 4896 2024-04-12 (Figure 2b) PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 D126E Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-D126E amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 K360R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K360R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 K360R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K360R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 K360R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K360R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 K360R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-K360R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPBC651.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC651.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC651.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC651.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC651.04 SPBC651.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0000703 E301A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-E301A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPAC821.03c FYPO:0003715 1-450 Not assayed or wild type 972 h- slf1 slf1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC821.03c) PMID:25009287 4896 2014-08-26 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002379 785-1599 Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-delta785-1599nt cdc13 disruption partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:2908246 4896 2014-06-30 PomBase SPAC343.16 FYPO:0002008 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys2 lys2-97 unknown ECO:0005801 PMID:3142867 4896 2013-09-24 PomBase SPAC343.16 FYPO:0000039 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys2 lys2-97 unknown ECO:0005638 PMID:3142867 4896 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2012-01-01 PomBase SPAC1805.05 FYPO:0001838 C433S,C434S Not assayed or wild type 972 h- cki3 cki3-SS amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:26525038 4896 2015-12-08 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002559 Q10A,T13A Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1-ABS1-2A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-05-27 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0001214 Q10A,T13A Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1-ABS1-2A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPBC428.01c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC428.01c FYPO:0004118 deletion 972 h- nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC428.01c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.01c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- nup107 nup107delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC428.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC428.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- nup107 nup107delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPBC428.01c FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup107 nup107delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.01c FYPO:0003612 deletion 972 h- nup107 nup107delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPCC1322.08 FYPO:0001384 K153A,T463A Not assayed or wild type 972 h- srk1 srk1-KA-T463A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_substrate(PomBase:SPCC1322.08) PMID:18272791 4896 2017-08-04 PomBase SPBC365.14c FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 uge1 uge1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0003728 deletion 972 h- uge1 uge1delta deletion ECO:0000059 PMID:19942659 4896 2020-03-19 Like the gms1D mutant, neither the uge1D strain nor the uge1Dgal10D strain reacted with PNA (Fig. 2b PomBase SPBC365.14c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC365.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph uge1 uge1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.14c FYPO:0007291 deletion 972 h- uge1 uge1delta deletion ECO:0000334 PMID:19942659 4896 2020-03-19 PomBase SPBC365.14c FYPO:0007291 deletion 972 h- uge1 uge1delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000137 PMID:19942659 4896 2020-03-19 PomBase SPBC365.14c FYPO:0007291 deletion 972 h- uge1 uge1delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000289 PMID:19942659 4896 2020-03-19 PomBase SPBC365.14c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uge1 uge1delta deletion 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FYPO:0000906 deletion 972 h- emr1 emr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000252 high PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 1d) Despite the multiple types of abnormalities observed in emr1Δ cells, mitochondria of emr1Δ cells were still able to undergo fission and fusion (Fig. 1d), but improperly segregated into daughter cells after mitosis (Fig. 1e). This phenotype of defective mitochondrial segregation is consistent with the previous finding that spherical/giant mitochondria in mutant cells compromise mitochondrial movements, inheritance, and segregation7,8,2 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 emr1 emr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph emr1 emr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph emr1 emr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph emr1 emr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph emr1 emr1delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.06c) PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 4) significantly decreased the number of Mdm12 (a constitutive component of the ERMES complex) foci PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0007713 deletion 972 h- emr1 emr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.01c) PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 5) PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 emr1 emr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0007712 deletion 972 h- emr1 emr1delta deletion ECO:0001232 19.2 PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 1b) PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0000895 deletion 972 h- emr1 emr1delta deletion ECO:0001232 PMID:33483504 4896 2021-04-05 (Fig. 1) PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0007724 deletion 972 h- emr1 emr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.06c) PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Fig. 4d) PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.13c FYPO:0002678 K147R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-K147R ark1-KD amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11950927 4896 2020-06-30 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001513 K147R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-K147R ark1-KD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11950927 4896 2020-06-30 (Fig. 3c) PomBase SPAC140.02 FYPO:0000361 Y306L,Y308L,F409L,Y411L Not assayed or wild type 972 h- gar2 gar2-RNP1* amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9693363 4896 2022-09-19 PomBase SPAC140.02 FYPO:0001234 Y306L,Y308L,F409L,Y411L Not assayed or wild type 972 h- gar2 gar2-RNP1* amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 medium PMID:9693363 4896 2022-09-19 PomBase SPBC1703.06 FYPO:0002060 unknown Overexpression 972 h- pof10 pof10deltaF-box unknown ECO:0005638 PMID:11820777 4896 2015-05-20 PomBase SPCC622.08c FYPO:0002679 K120Q Not assayed or wild type 972 h- hta1 hta1-K119Q amino_acid_mutation ECO:0005801 low assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 An acetyl-mimetic H2A-K119Q mutation slightly inhibited Bub1-mediated H2A phosphorylation (Fig. 4B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003762 T507A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 spc7 spc7-1TA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1B) PomBase SPCC830.03 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- grc3 grc3-3 unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:21385875 4896 2012-06-08 PomBase SPAC1F8.05 FYPO:0004862 wild type Overexpression 972 h- isp3 isp3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC337.13c FYPO:0002060 S20L Not assayed or wild type 972 h- gtr1 gtr1-S20L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 apn2 apn2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 apn2 apn2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0005776 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32034465 4896 2020-04-20 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0006679 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000957 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 PMID:23245849 4896 2020-02-14 (Fig. 1D) PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0007330 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:32034465 4896 2020-03-31 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22748672 4896 2013-05-13 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23245849 4896 2020-02-14 (Fig. 1D) PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.10 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph apn2 apn2delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0004248 318-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-317 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0006784 318-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-317 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1B, 2B) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004790 567-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0003411 567-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 low PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6d) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004604 567-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 medium PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 6e) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0004879 567-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 high PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 5c) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0005612 567-669 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:26744419 4896 2019-01-28 (Fig. 5b) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004058 wild type Knockdown 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0005638 medium PMID:19436749 4896 2014-11-21 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000141 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 9 PMID:11027263 4896 2019-11-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000141 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170,FYECO:0000300 13 PMID:11027263 4896 2019-11-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000670 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion 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972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003912 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000059 PMID:25165823 4896 2014-10-22 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000185 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002485 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Table S6) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003179 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 6, Table S6) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0006494 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14528010 4896 2019-11-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0005939 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:28139976 4896 2017-02-21 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000581 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Table S6) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9184215 4896 2014-11-26 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003004 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001741 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000337 PMID:25313826 4896 2014-11-21 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0007006 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30667359 4896 2019-07-11 (Figure 6C) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003584 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003584 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000059 PMID:10373582 4896 2014-08-07 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003588 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000337 PMID:23093942 4896 2014-07-21 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002604 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001840 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001840 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high PMID:9184215 4896 2014-11-26 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001840 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:9184215 4896 2014-11-26 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000473 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 PMID:31584934 4896 2019-11-15 (Fig. 7) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000473 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:9184215 4896 2014-11-26 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000473 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000059 PMID:10835372 4896 2015-04-09 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0004709 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 PMID:25965521 4896 2016-07-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002573 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 PMID:25965521 4896 2016-07-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 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SPAC2G11.12 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002239 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0000337 PMID:10373582 4896 2014-08-07 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001234 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003612 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 PMID:31712578 4896 2019-12-02 Table S3; spore viability lower than wild type (~50% of wild-type viability) PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003612 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 PMID:31712578 4896 2021-06-28 Table S3 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0001491 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- rqh1 rqh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002060 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ade6-704 srp7 srp7-C69A,U70C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0005503 wild type Overexpression 972 h- fus1 fus1+ wild_type ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1D) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0005503 wild type Overexpression 972 h- fus1 fus1+ wild_type ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Figure S1) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003482 wild type Overexpression 972 h- fus1 fus1+ wild_type ECO:0001232 high medium assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1F and G) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003527 wild type Overexpression 972 h- fus1 fus1+ wild_type ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1D) PomBase SPBC17G9.13c FYPO:0000073 L73G Not assayed or wild type 972 h- h- cup1 cup1-L73G amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32908306 4896 2021-04-06 PomBase SPBC17G9.13c FYPO:0002060 L73G Not assayed or wild type 972 h- h- cup1 cup1-L73G amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32908306 4896 2021-04-06 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0003768 176-768 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-1-175 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0000838 176-768 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-1-175 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAPB1E7.14 FYPO:0004083 W98A Not assayed or wild type 972 h- iec5 iec5-W98A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.14) PMID:33378674 4896 2021-07-19 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 527-676 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-1-526 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. 1F) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005300 527-676 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-1-526 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Fig. 1A, C-D) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001645 527-676 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-1-526 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Figure 1H) PomBase SPBC3D6.08c FYPO:0000784 wild type Overexpression 972 h- lsm1 lsm1+ wild_type ECO:0001232 PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 5G, left panel) PomBase SPAP7G5.04c FYPO:0002725 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys1 lys1-131 unknown ECO:0005801 PMID:3142867 4896 2013-11-02 PomBase SPAP7G5.04c FYPO:0000039 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys1 lys1-131 unknown ECO:0005638 PMID:8590485 4896 2014-09-25 PomBase SPAP7G5.04c FYPO:0000039 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys1 lys1-131 unknown ECO:0005638 PMID:8590464 4896 2013-05-23 PomBase SPAP7G5.04c FYPO:0000039 unknown Not assayed or wild type 972 h- lys1 lys1-131 unknown ECO:0005638 PMID:3142867 4896 2013-09-24 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0003310 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-11 unknown ECO:0005801 PMID:24186301 4896 2014-04-17 PomBase SPBC29A10.08 FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- gas2 gas2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 8D) PomBase SPCC663.05c FYPO:0001645 D58A Not assayed or wild type 972 h- asf1 cia1-D58A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 G332D,N365S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 G332D,N365S Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-9 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0004677 D172N Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-D172N amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11683277 4896 2015-05-20 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000256 D172N Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-D172N amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11683277 4896 2015-05-20 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0005547 386-408 Not assayed or wild type 972 h- vps3844 vps3844-delta386-408 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:39477503 4896 2024-11-08 1 showed that the signal peptide and the transmembrane including DUF3844 domain were 2 essential for this function (Fig. 4A). PomBase SPCC306.03c FYPO:0000611 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0000611 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0004588 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0001384 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0003165 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0001382 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0001382 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPBC660.14) PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0001128 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0001122 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000315 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0003547 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000315 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0003545 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0005304 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0000614 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000170 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0002573 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22645654 4896 2016-07-06 (Fig. 4) PomBase SPCC306.03c FYPO:0002061 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31072933 4896 2019-05-26 (Figure 1c) PomBase SPCC306.03c FYPO:0003438 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0000838 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0007566 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0000088 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0000089 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPCC306.03c FYPO:0000268 A114T Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:12000964 4896 2016-03-01 PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000141 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 50 high PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 4E) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0003786 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 3A) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000634 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 3D) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000450 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 high assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. S7C-D) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000450 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 medium assayed_protein(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 4B-C) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0000450 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000381 assayed_protein(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:38084929 4896 2025-09-16 (Fig. S7A) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001355 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106 high PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 3E) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001840 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000381 PMID:38084929 4896 2025-09-15 (Fig. 4D) PomBase SPAPB1A10.02 FYPO:0001357 H316A,C321A,C326A,C329A Ectopic 972 h- scm3 scm3-4A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000381 PMID:38084929 4896 2025-08-28 (Fig. 3C and 3E) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 PMID:21642955 4896 2012-07-09 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7C and H) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0000082 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23874237 4896 2014-03-17 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0006357 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004604 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000049 medium PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0000967 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 low PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 5) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0008323 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000015 assayed_region(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:19056896 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0008323 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000015 assayed_region(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:19056896 4896 2012-08-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001458 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000112 PMID:23874237 4896 2020-04-09 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0008322 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000015 assayed_region(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:19056896 4896 2012-08-24 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0008322 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000015 assayed_region(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:19056896 4896 2012-08-24 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0007217 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001442 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000112 PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 2A) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001442 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000112 PMID:23874237 4896 2014-03-17 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001324 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004161 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004161 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_region(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004161 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_region(PomBase:SPAC328.10c) PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004161 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_region(PomBase:SPCC364.07) PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004161 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_region(PomBase:SPCC417.08) PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0002386 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 we investigated the dis- tribution of Php3 and Moc3 in cells devoid of both Gcn5, a subunit of the SAGA complex, and Mst2, a MYST acetyltransferase. Interestingly, we found that in those cells, both TFs can still localize to cenH and dh heterochromatic repeat elements, albeit with a slight reduction (Sup- plementary Fig. 4d, e). PomBase SPAC1952.05 FYPO:0002386 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-23 we investigated the dis- tribution of Php3 and Moc3 in cells devoid of both Gcn5, a subunit of the SAGA complex, and Mst2, a MYST acetyltransferase. Interestingly, we found that in those cells, both TFs can still localize to cenH and dh heterochromatic repeat elements, albeit with a slight reduction (Sup- plementary Fig. 4d, e). PomBase SPAC1952.05 FYPO:0005685 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC27.08c) PMID:27558664 4896 2016-09-22 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0005685 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1782.11) PMID:27558664 4896 2016-09-22 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0005685 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC36.04) PMID:27558664 4896 2016-09-22 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001116 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001116 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001116 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC106.02c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001116 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001116 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:23874237 4896 2014-03-18 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001117 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC965.07c) PMID:27558664 4896 2016-09-27 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0003120 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0005318 deletion 972 h- cdc25-22 gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c),assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:31260531 4896 2020-01-01 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0000761 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0008413 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000049 50 high PMID:40063661 4896 2025-06-06 (Fig. 1E) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0002990 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000335 PMID:22992726 4896 2013-12-09 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0006155 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 PMID:19056896 4896 2017-07-28 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001043 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0001232 PMID:19056896 4896 2012-07-23 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001043 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000231 PMID:19056896 4896 2012-07-23 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001043 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000059 PMID:19056896 4896 2012-07-23 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001974 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25015293 4896 2018-02-20 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0000451 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0004032 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:36793083 4896 2023-03-08 (Fig. 4D) PomBase SPAC1952.05 FYPO:0001890 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0002020 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC1952.05 FYPO:0002020 deletion 972 h- gcn5 gcn5delta deletion ECO:0000291 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4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0006553 1-353 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-533 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.14c) PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0001098 1-353 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-533 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0000084 1-353 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-533 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0000089 1-353 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-533 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0002550 1-353 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-533 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0001234 1-353 Not assayed or wild type 972 h- ell1 ell1-354-533 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 K45KGVPQK Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K27 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000705 T110A Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-T110A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.11c),assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:23376070 4896 2013-05-03 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001838 T110A Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-T110A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:23376070 4896 2013-05-03 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0006502 451-969 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3-delta451-969 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC29A4.11) PMID:30279276 4896 2021-03-31 PomBase SPAC4A8.05c FYPO:0000703 1-705,975-2104 Not assayed or wild type 972 h- myp2 myo3-IQ myo3IQ partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.05c),assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001407 Y35A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-Y35A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 Y35A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-Y35A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0000703 1-407,583-891 Not assayed or wild type 972 h- mts4 mts4-PC-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC637.10c),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC16G5.02c 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SPBC16G5.02c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16G5.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rbk1 rbk1delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rbk1 rbk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0005220 431-1085 Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7delta431-1085 cut7m partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:26258632 4896 2016-01-19 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0005220 431-1085 Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7delta431-1085 cut7m partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:26258632 4896 2016-01-19 fig 4f PomBase SPCC825.02 FYPO:0007797 R437K Not assayed or wild type 972 h- gbs1 gbs1-R437K gbs1-R438K amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC825.02) PMID:19605557 4896 2021-05-26 (Figure 6) PomBase SPCC70.12c FYPO:0000708 S22D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-S22D amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:39910760 4896 2025-02-13 This suggested that the Ecl1-AA mutant protein activity was comparable to that of the wild-type Ecl1 protein. Meanwhile, when Ecl1-DD was expressed, the recovery was low, and the degree of recovery was significantly lower than that of Ecl1 and Ecl1-AA. This suggested that the activity or stability of the Ecl1-DD mutant protein, which mimics the phosphorylation of Thr7 and Ser22, was reduced compared with the wild-type Ecl1 protein. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000644 S22D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-S22D amino_acid_mutation ECO:0001232 complete assayed_protein(PomBase:SPCC70.12c) PMID:39910760 4896 2025-02-13 This suggested that phosphorylation of the N-terminus of Ecl1 was unlikely to significantly affect the intracellular localization of Ecl1. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000776 S22D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-S22D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39910760 4896 2025-02-13 Furthermore, the Ecl1-overexpression reduced TORC1 activity regardless of the presence or absence of sulfur (Figure 5e,f). In other words, even during the logarithmic growth phase, when Thr7 is phosphorylated and Ecl function is suppressed, Ecl1 overexpression sufficiently reduces TORC1 activity. These results indicated that phosphorylation of the N-terminus of Ecl1 had little effect on TORC1 repression and that the expression of Ecl1, rather than starvation conditions, was important for TORC1 repression. PomBase SPCC70.12c FYPO:0000703 S22D Overexpression 972 h- Δecl1Δecl2Δecl3 ecl1 ecl1-S22D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC70.12c) PMID:39910760 4896 2025-02-13 We investigated the effect of phosphorylation mutations of Ecl1 on the binding of TORC1 subunit Mip1 to Ecl1 (Figure 5i). Mip1-HA protein did not coprecipitate with GFP but did coprecipitate wild-type Ecl1 and with Ecl1 proteins with mutations at Thr7 or Ser22. PomBase SPCC584.13 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC584.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC584.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC584.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC584.13 SPCC584.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0005335 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 PMID:26804466 4896 2016-03-04 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0004562 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 10 PMID:38166399 4896 2024-01-11 Importantly, the onset of anaphase was postponed until all the satellite kinetochores merged with the main cluster in the mutant (Figure 2a,b). PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003535 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003535 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:24815688 4896 2014-08-19 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001407 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009007 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009007 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002638 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 PMID:38166399 4896 2024-01-11 As mitosis progressed, it was faintly found on the entire length of the spindle and SPB in the wild-type cells (Figure 3a). By contrast, Mad2 was found as one or two bright speckles in the vicinity of the spindle during mitosis in the wee1 mutant (Figure 3b,c). Judged by the length of the spindle, anaphase was initiated soon after Mad2 speckles disappeared (Figure 4a,b). In approximately 28% (28 cells out of 101 cells observed) of the wee1 mutants, the Mad2 speckle appeared at least once (Figure 4c). The observation thus suggested that the spindle checkpoint was activated in the wee1 mutants. PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003532 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003532 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0005411 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 29 PMID:38166399 4896 2024-01-11 Time-lapse imaging analysis revealed abnormal positioning of kinetochores in the wee1 (wee1Δ) mutant. ThBecause the kinetochores, which are captured and bioriented, are clustered and found on the spindle, the satellite kinetochores remained unattached, or detached from the spindle during the progression to anaphase in the wee1 mutant (electronic supplementary material, Figure S2).e cluster of kinetochores frequently fell apart into a main cluster and a small ‘satellite kinetochore’ during mitosis (Figure 1b). PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000730 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 PMID:38166399 4896 2024-01-11 Importantly, the onset of anaphase was postponed until all the satellite kinetochores merged with the main cluster in the mutant (Figure 2a,b). PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0004162 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 PMID:26804466 4896 2016-03-04 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000324 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 PMID:38166399 4896 2024-01-11 Importantly, the onset of anaphase was postponed until all the satellite kinetochores merged with the main cluster in the mutant (Figure 2a,b). PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006995 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0000049 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002336 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003555 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0005614 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000776 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:1703321 4896 2016-10-04 (Figure 4) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000725 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009042 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007808 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001098 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000326 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007921 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000407 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001501 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001188 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000113,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000085 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0003840 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000257 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000107 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000211 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000841 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000112 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000091 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000268 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 PMID:26131711 4896 2016-07-28 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000268 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 high PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1A) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000268 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000268 high PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1A) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000268 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000268 medium PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1A) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:1703321 4896 2016-10-04 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 PMID:3032459 4896 2015-03-05 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:22624651 4896 2012-06-11 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wee1 wee1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23G3.01 FYPO:0002061 E357A Not assayed or wild type 972 h- rpb2 rpb2-E357A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8569679 4896 2021-01-24 (Fig. 2) PomBase SPCC584.05 FYPO:0002869 unknown Not assayed or wild type 972 h- sec1 sec1-M2 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:41144523 4896 2025-12-10 Bgs4 levels at the division site decreased in sec1-M2 and trs120-ts1 mutants after ring constriction (S6D and S6E Fig). PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0004099 deletion 972 h- pat10 pat10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. S2D) PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pat10 pat10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- pat10 pat10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pat10 pat10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18B11.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pat10 pat10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001382 S19A,S31A,S33A,S38A,S40A,T44A,T64A,T93A,S94A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-N9A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium assayed_enzyme(PomBase:SPBC106.01),assayed_substrate(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 1d) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0003762 S19A,S31A,S33A,S38A,S40A,T44A,T64A,T93A,S94A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-N9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 2b) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0006810 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-13 In the wild-type background, srr1Δ but not skb1Δ slightly reduced GCR rates, showing that Srr1 is required for GCRs even in the presence of Rad51 PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0001355 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0005638 PMID:37237082 4896 2023-06-14 Like srr1Δ cells, srr1-W157R, srr1-D111A,P112A, and srr1-H184A cells produced small colonies (Supplementary Fig. 2b), consistent with the role of the SRR1-like domain even in the absence of exogenous DNA damage. PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0005371 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0000049 PMID:37237082 4896 2023-06-10 (Fig. 3e) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000972 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0001232 low PMID:37237082 4896 2023-06-10 PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0008094 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0001232 low PMID:37237082 4896 2023-06-10 PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0006437 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0000112 PMID:37237082 4896 2023-06-10 Normal Chk1 phosphorylation and cell cycle arrest PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-10 (Figure 3a) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-10 (Figure 3a) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-10 (Figure 3a) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- srr1 srr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srr1 srr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srr1 srr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.05 FYPO:0003412 cki3::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 cki3 cki3::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- uvi31 uvi31delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0005639 deletion 972 h- uvi31 uvi31delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:24897379 4896 2016-08-24 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph uvi31 uvi31delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 uvi31 uvi31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- uvi31 uvi31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uvi31 uvi31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16E9.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 uvi31 uvi31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.04c FYPO:0000161 wild type Overexpression 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000161 wild type Overexpression 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4C) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000418 wild type Overexpression 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000418 wild type Overexpression 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4C) PomBase SPCC613.04c FYPO:0001252 wild type Overexpression 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4B) PomBase SPCC613.04c FYPO:0001252 wild type Overexpression 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000381 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4C) PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002834 L142G Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-L142G amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003216 L142G Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-L142G amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002827 L142G Not assayed or wild type 972 h- clr2 clr2-L142G amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste20 ste20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0004839 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-13 The Ght5 protein, which is localized on the plasma membrane in the WT, fails to be localized on the plasma membrane, accumulating in the cytoplasm. PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0002033 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001160 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000124,FYECO:0000126 PMID:10467002 4896 2012-06-20 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001160 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000126 PMID:10467002 4896 2012-06-20 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000082 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000082 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000080 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:25411338 4896 2015-08-13 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001407 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001407 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072,FYECO:0000103 PMID:10467002 4896 2012-06-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072,FYECO:0000102 PMID:10467002 4896 2012-06-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0002827 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000021,FYECO:0000286 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0004604 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0002340 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000059 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000185 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000059 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0006549 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.13c) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0008378 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000112 high PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1B) PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste20 ste20delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0001232 high PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001156 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000123,FYECO:0000126 PMID:10467002 4896 2012-06-25 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001382 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001382 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:21035342 4896 2016-07-08 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001324 deletion 972 h- leu1-32 ste20 ste20delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.10) PMID:27191590 4896 2016-07-20 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001838 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001152 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:10467002 4896 2012-06-15 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001117 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.13c) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:10467002 4896 2012-06-13 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0002019 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000337 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001122 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 medium medium PMID:28281664 4896 2021-05-06 (Figure 3) PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001157 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 PMID:10467002 4896 2012-06-21 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001154 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000121,FYECO:0000123,FYECO:0000126 PMID:10467002 4896 2012-06-25 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001159 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000123 PMID:10467002 4896 2012-06-25 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000972 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0001232 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.04c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.06) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC750.01) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.18) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC977.02) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC1348.03) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0005917 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.05c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001309 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:28281664 4896 2021-05-06 (Figure 3) PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001153 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000121,FYECO:0000125,FYECO:0000126 PMID:10467002 4896 2012-06-25 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001153 deletion 972 h- ste20 ste20delta deletion ECO:0005801 PMID:10467002 4896 2012-06-21 PomBase SPBC12C2.02c FYPO:0001158 deletion 972 h- 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000268 D25N Overexpression 972 h- mre11 mre11-D25N rad32-D25N amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:9826747 4896 2016-04-13 PomBase SPBC119.02 FYPO:0002635 S108D Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-S108D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0001934 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tom70 tom70delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tom70 tom70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0007596 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-08 (Figure 1A) PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0001324 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC613.09) PMID:30228203 4896 2025-04-02 the levels of Sen2-mECitrine and Sen54-mECitrine are reduced in tom70Δ cells compared with wild type (Fig. 5B; Supplemental Fig. S9). We interpret these results to support the hypothesis that S. pombe Tom70 functions in the mitochondrial localization of SEN subunits; when mitochondrial localization is not achieved, the SEN subunits become unstable, although it is possible that SEN subunits are poorly expressed in tom70Δ cells. PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0007601 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC613.09) PMID:30228203 4896 2025-04-02 By confocal microscopy, Sen2-mECitrine and Sen54- mECitrine signals were very weak in tom70Δ cells, with the residual signals located in the cytoplasm and some located on mitochondria (Fig. 5A). PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0008394 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 PMID:30228203 4896 2025-04-02 If S. pombe Tom70 is important for function and/or stability of the SEN complex, then deletion of S. pombe TOM70 would be expected to cause defects in pre- tRNA splicing. We used Northern analysis with probes complementary to the 5′ exons or introns of S. pombe tRNALeuCAA and tRNAProCGG. tom70Δ cells accumulate more intron-containing tRNALeuCAA and tRNAProCGG than wild-type cells (Fig. 5C), documenting a role for S. pombe Tom70 in pre-tRNA splicing. PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0008128 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tom70 tom70delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0002723 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 is_bearer_of(PATO:0000324) PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0008113 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 PMID:30228203 4896 2025-04-02 If S. pombe Tom70 is important for function and/or stability of the SEN complex, then deletion of S. pombe TOM70 would be expected to cause defects in pre- tRNA splicing. We used Northern analysis with probes complementary to the 5′ exons or introns of S. pombe tRNALeuCAA and tRNAProCGG. tom70Δ cells accumulate more intron-containing tRNALeuCAA and tRNAProCGG than wild-type cells (Fig. 5C), documenting a role for S. pombe Tom70 in pre-tRNA splicing. PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0003768 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.12) PMID:33138913 4896 2021-01-11 Atg43 was observed on mitochondria in the absence of Tom70 (Figure 5E) and vice versa (Figure 5—Figure supplement 1I) PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0003768 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC713.08) PMID:33138913 4896 2021-01-11 Atg43 was observed on mitochondria in the absence of Tom70 (Figure 5E) and vice versa (Figure 5—Figure supplement 1I) PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0003768 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC409.23) PMID:33138913 4896 2021-01-11 Atg43 was observed on mitochondria in the absence of Tom70 (Figure 5E) and vice versa (Figure 5—Figure supplement 1I) PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0007448 deletion 972 h- tom70 tom70delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 1) PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph tom70 tom70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6B12.12 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tom70 tom70delta deletion 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2016-06-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000703 1-60 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-deltaC60 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:15964794 4896 2016-06-17 PomBase SPBC6B1.09c FYPO:0000267 1-60 Not assayed or wild type 972 h- nbs1 nbs1-deltaC60 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:15964794 4896 2016-06-17 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr prt2 prt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr prt2 prt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 prt2 prt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 prt2 prt2delta deletion 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SPNCRNA.9001 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prt2 prt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prt2 prt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007376 E763R,D767K Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-E763R,D767K amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4C) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007158 E763R,D767K Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-E763R,D767K amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4B) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007159 E763R,D767K Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-E763R,D767K amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4B) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 E763R,D767K Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-E763R,D767K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 4C) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004303 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004303 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:15128870 4896 2015-01-27 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004303 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:16950131 4896 2015-01-28 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001962 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0000705 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c),assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 1E) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0006800 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 9 PMID:21965289 4896 2024-12-05 Similar results were obtained when kinetochore position was assessed with other GFP-tagged kinetochore proteins and in clp1(C286S) mutant, in which relocalization of Nsk1 to the kinetochore-SPB junction is impaired (Figure S6A). PomBase SPAC1782.09c FYPO:0005957 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0000340 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:21965289 4896 2024-11-30 To test whether Nsk1 is dephosphorylated by the proline-directed Cdc14- like phosphatase Clp1, cell cycle-dependent modification of Nsk1 was examined in nda3-KM311 nsk1-gfp clp1(C286S) cells, which express a substrate-trapping allele of Clp1 that binds, but does not release, its phosphosubstrates (Jia et al., 1995; Chen et al., 2008). In these cells, the proportion of faster-migrating Nsk1 increases only very slowly after release into anaphase, suggesting that Clp1 dephosphorylates Nsk1 (Figure 5, A and B). Consistent with this, we found that Clp1(C286S) coimmunoprecipitates with Nsk1 from cell lysates (Figure 5C) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004833 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004833 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 1B and S1B,C) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0003268 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures S2B) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001117 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.02) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001840 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0000340 PMID:15525536 4896 2014-09-25 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004355 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0000825 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC212.06c) PMID:38415071 4896 2024-10-09 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0006475 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures S2B) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001922 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0003349 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 1D) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0003349 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure 1D) PomBase SPAC1782.09c FYPO:0003840 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15525536 4896 2014-09-25 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0002526 C286S Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-C286S clp1-C286 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPBC16E9.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC16E9.02c SPBC16E9.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16E9.02c FYPO:0001686 deletion 972 h- SPBC16E9.02c SPBC16E9.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 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PomBase SPBC19F5.03 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sac11 sac11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19F5.03 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sac11 sac11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19F5.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- sac11 sac11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19F5.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sac11 sac11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC162.08c FYPO:0002060 656-1837 Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211-1-655 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000263 PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Fig. 4A) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000161 wild type Knockdown 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4A) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000418 wild type Knockdown 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4A) PomBase SPCC613.04c FYPO:0001252 wild type Knockdown 972 h- rng3 rng3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 4A) PomBase SPAC10F6.12c FYPO:0005724 wild type Overexpression 972 h- mam4 mam4+ wild_type ECO:0000059 PMID:9032282 4896 2016-10-14 PomBase SPAC4D7.03 FYPO:0001327 242-703 Not assayed or wild type 972 h- pop2 pop2-N241 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:10209119 4896 2019-08-07 PomBase SPAC4D7.03 FYPO:0001327 242-703 Not assayed or wild type 972 h- pop2 pop2-N241 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:10209119 4896 2019-08-07 PomBase SPAC4D7.03 FYPO:0000703 242-703 Not assayed or wild type 972 h- pop2 pop2-N241 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prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBC725.09c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hob3 hob3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC725.09c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hob3 hob3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0000969 deletion 972 h- hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 PMID:12569356 4896 2024-06-11 UV irradiation resulted in the same phenotypes as those seen in the case of phleomycin: hob1D cells were more sensitive to the effects of UV irradiation than wild-type cells, while hob3D cells were as resistant to UV as were their wild-type cohorts (Figure 4b). PomBase SPBC725.09c FYPO:0003183 deletion 972 h- hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 PMID:12569356 4896 2024-06-11 (Figure 4a). In contrast, treatment of hob3D cells did not produce a hypersensitive phenotype. PomBase SPBC725.09c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC725.09c FYPO:0002559 deletion 972 h- hob3 hob3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPBC725.09c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph hob3 hob3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC725.09c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph hob3 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Dclr3 single mutant (Figure 5E). These results suggest that Epe1 has an important role in promoting access of transcriptional machinery to heterochromatic sequences, thereby facilitating transcription of repeat elements. Therefore, the balance of activities between Clr3 and Epe1, both of which are recruited by Swi6, seems critical in determining the transcriptional state of repeat elements. PomBase SPCC622.16c FYPO:0000890 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPCC622.16c FYPO:0005845 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003573 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004689 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000231 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000220 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000231 PMID:30573453 4896 2019-06-26 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000966 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0005310 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:12773576 4896 2022-03-28 (Figure 6C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004238 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:12773576 4896 2022-03-28 (Figure 6C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0006814 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 5) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000892 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:12773576 4896 2022-03-28 (Figure 6C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0001859 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:12773576 4896 2022-03-28 (Figure 6C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0003009 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1952.05) PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 4C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004237 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC736.11) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0004237 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:36617881 4896 2023-03-11 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000862 wild type Overexpression 972 h- epe1 epe1+ wild_type ECO:0000226 PMID:16762840 4896 2024-01-17 Indeed, we found that loss of H3K9me2 in cells overexpressing Epe1 is dependent upon Swi6 (Figure 6D). PomBase SPBC1773.07c FYPO:0000769 deletion 972 h- sbp1 sbp1delta deletion ECO:0001232 PMID:9504913 4896 2014-09-01 PomBase SPBC1773.07c FYPO:0003171 deletion 972 h- sbp1 sbp1delta deletion ECO:0001232 PMID:9504913 4896 2014-09-01 PomBase SPBC1773.07c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sbp1 sbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1773.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- sbp1 sbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1773.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sbp1 sbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.07 FYPO:0006427 TEVcleavable Not assayed or wild type 972 h- alp14 alp14-KTdelta fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Fig. 5b) PomBase SPCC736.14 FYPO:0001944 189-882 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-Hind partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 PomBase SPCC5E4.06 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- smc6 rad18- unknown ECO:0005638 PMID:8290359 4896 2013-05-01 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 1-534,S772A Overexpression 972 h- crb2 crb2(BRCT-778,S772A) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11D3.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.04c SPAC11D3.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0008434 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 PMID:40427588 4896 2025-06-10 Moreover, the deletion significantly reduced the association with assembled mitoribosomes and impaired mitoribosome assembly. Specifically, a distinct mitoribosome peak was observed in fraction 11 in the wild-type cells (Figure 4a) but was markedly diminished in the mti2∆insertion cells (Figure 4b), indicating a defect in mitoribosome assembly. This phenotype is similar Biomolecules 2025, 15, x FOR PEER REVIEW 11 of 16 to that observed in ∆mti2 cells (Figure 4c). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001934 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 2A) The Dmti2 mutant was not able to grow at all on medium containing glycerol at the restrictive temperature of 37 °C PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000684 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000252 PMID:40427588 4896 2025-06-10 Compared to wild-type cells, the growth of mti2∆insertion and ∆mti2 cells was only marginally reduced in glucose media but was significantly impaired in glycerol media (Figure 2b). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000684 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000138 medium PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1A) PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0003769 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000078 45 PMID:31350787 4896 2019-10-29 (Fig. 4B) PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mti2 mti2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007122 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 PMID:31350787 4896 2019-10-29 (Fig. 6) PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002056 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 PMID:31350787 4896 2019-10-29 (Fig. 5) PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001324 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:40427588 4896 2025-06-10 Furthermore, both mti2∆insertion and ∆mti2 cells showed nearly abolished expression of the corresponding OXPHOS-related proteins (Figure 2d). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007525 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:40427588 4896 2025-06-10 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.11) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.04) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.07) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.09) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.10) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.02) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001117 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.01) PMID:40427588 4896 2025-06-10 We found that mti2∆insertion cells, similar to ∆mti2 cells, showed significantly reduced RNA levels of core subunits of respiratory chain complexes, PomBase SPBC1271.15c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mti2 mti2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001317 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPMIT.08) PMID:40427588 4896 2025-06-10 However, the RNA level of var1, which encodes a mitochondrial ribosomal protein, remained stable in both mutants (Figure 2c). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001357 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:40427588 4896 2025-06-10 Compared to wild-type cells, the growth of mti2∆insertion and ∆mti2 cells was only marginally reduced in glucose media but was significantly impaired in glycerol media (Figure 2b). PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000087 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 low PMID:31350787 4896 2019-10-18 (Fig. 1) PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0005825 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000186 PMID:31350787 4896 2019-10-18 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- mti2 mti2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- mti2 mti2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mti2 mti2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1271.15c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mti2 mti2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000705 1-241,563-652 Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-242-562 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0003075 299-446 Not assayed or wild type 972 h- cki1 cki1delta298 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0001315 299-446 Not assayed or wild type 972 h- cki1 cki1delta298 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPBC1347.06c FYPO:0001357 299-446 Not assayed or wild type 972 h- cki1 cki1delta298 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8163505 4896 2014-08-29 PomBase SPCC1795.06 FYPO:0004075 wild type Overexpression 972 h- map2 map2+ wild_type ECO:0001232 PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPCC1795.06 FYPO:0000333 wild type Overexpression 972 h- map2 map2+ wild_type ECO:0005580 PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPCC1795.06 FYPO:0001046 wild type Overexpression 972 h- map2 map2+ wild_type ECO:0005580 PMID:9034336 4896 2016-10-03 PomBase SPAC869.02c FYPO:0001327 deletion 972 h- yhb1 yhb1delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC1198.01) PMID:26645666 4896 2018-02-23 PomBase SPAC869.02c FYPO:0007615 deletion 972 h- yhb1 yhb1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000378 medium assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 2n) PomBase SPAC869.02c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0009060 deletion 972 h- yhb1 yhb1delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPAC869.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph yhb1 yhb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC869.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- yhb1 yhb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC869.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yhb1 yhb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC869.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yhb1 yhb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 saf5 saf5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000189 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000231 PMID:22681890 4896 2013-01-09 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000082 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24298023 4896 2014-01-15 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001407 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24298023 4896 2014-01-15 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0004201 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003412 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003096 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0006030 PMID:25274039 4896 2014-12-15 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 saf5 saf5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC594.01) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1703.10) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003029 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003244 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000059 high PMID:38833506 4896 2024-12-29 Among the 41 tested strains, three showed a markedly low YFP/RFP ratio when compared to the wild type strain: Δcwf12, Δsaf5 and Δsaf1. (Figure 2A) PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.01) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.02) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.04) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.05) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:24298023 4896 2014-01-16 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003041 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:24298023 4896 2014-01-20 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0003030 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0000337 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prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0004325 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 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2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 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prototroph saf5 saf5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 saf5 saf5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- saf5 saf5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1610.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 saf5 saf5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007050 427-522 Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-427-522 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000172 medium assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:24831008 4896 2020-02-08 RNA transcript expression is increased during the stress response to zinc ions, but the increase is less than the transcript levels seen with full de-repression PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 427-522 Not assayed or wild type 972 h- loz1 loz1-427-522 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24831008 4896 2020-02-08 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0000357 687-790 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000039,FYECO:0000127 PMID:30279276 4896 2021-03-31 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0006502 687-790 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC29A4.11) PMID:30279276 4896 2021-03-31 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0001585 687-790 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:30279276 4896 2021-03-11 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0001867 687-790 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000127,FYECO:0000383 PMID:30279276 4896 2021-03-11 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0000021 687-790 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaC1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:30279276 4896 2021-03-31 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0005441 144-308 Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3(1-143) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:30973898 4896 2019-04-24 (Figure 2D) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000705 144-308 Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3(1-143) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15),assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:30973898 4896 2019-04-24 (Figure 2B) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002966 144-308 Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3(1-143) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:30973898 4896 2019-04-24 (Figure 2D) PomBase SPCC962.02c FYPO:0004412 1-841 Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-deltaN841 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004067 R299E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-R299E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004068 R299E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-R299E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC1565.02c FYPO:0001118 deletion 972 h- rga10 rga10delta deletion ECO:0001232 PMID:34006635 4896 2021-09-05 PomBase SPAC1565.02c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph rga10 rga10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1565.02c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph rga10 rga10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1565.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rga10 rga10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:20705466 4896 2017-06-30 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001253 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000228 60 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000133 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000228 5 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001006 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000779 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0007858 unknown Not assayed or wild type 972 h- h+ cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0005580 PMID:20967237 4896 2019-07-01 (Fig. 1D) PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0006082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228,FYECO:0000248 PMID:20705466 4896 2017-06-30 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0005020 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:20705466 4896 2017-06-30 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000744 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC146.13c) PMID:20705471 4896 2017-07-07 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0004895 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000227 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0004895 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000228 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0006213 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15743909 4896 2017-09-13 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0006091 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:20705471 4896 2017-07-07 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0004430 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000227 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002459 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000228 PMID:20705466 4896 2017-06-30 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002459 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000228 medium PMID:11952834 4896 2014-08-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001495 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 95 PMID:20705466 4896 2017-06-30 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002177 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-27 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004306 K163A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-K163A amino_acid_mutation ECO:0005801 low PMID:14701811 4896 2015-01-22 PomBase SPAC1399.05c FYPO:0000214 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe1 toe1+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1399.05c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe1 toe1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1399.05c FYPO:0004388 wild type Overexpression 972 h- toe1 toe1+ wild_type ECO:0000291 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1399.05c FYPO:0000333 wild type Overexpression 972 h- toe1 toe1+ wild_type ECO:0005580 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1399.05c FYPO:0001903 wild type Overexpression 972 h- toe1 toe1+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1399.05c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe1 toe1+ wild_type ECO:0001232 high PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC23G7.08c FYPO:0000032 392-695 Not assayed or wild type 972 h- rga7 rga7-FBD-AH1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25977474 4896 2018-03-16 Fig 3 PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0001934 deletion 972 h- trm61 trm61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph trm61 trm61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0000082 deletion 972 h- trm61 trm61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 high PMID:35901126 4896 2024-02-23 (Fig. S1) PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph trm61 trm61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph trm61 trm61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0001772 deletion 972 h- trm61 trm61delta deletion ECO:0005801 high assayed_enzyme(GO:0031515),assayed_substrate(PomBase:SPBTRNAMET.06) PMID:35901126 4896 2024-02-23 Examination by HPLC of the nucleoside composition of purified tRNATyr(GUA) from trm6Δ and trm61Δ mutants revealed that m1A levels were less than 0.03 moles/mole, compared to 0.60 moles/mole in WT cells, whereas levels of C, m5C, and m7G were very similar in the tRNATyr(GUA) from both mutant and WT cells (Fig 1B and 1C) PomBase SPAC9G1.12 FYPO:0001772 deletion 972 h- trm61 trm61delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(GO:0031515),assayed_substrate(PomBase:SPBTRNAMET.06) PMID:35901126 4896 2024-02-23 Similarly, poison primer extension showed that tRNAiMet(CAU) was nearly completely modified with m1A58 in WT cells (97%), but not visibly modified in trm6Δ and trm61Δ mutants (although quantification with the high background gave 2.0% for trm6Δ and 2.8% in trm61Δ). 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as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPBC11B10.03 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog8 cog8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.03 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog8 cog8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- cog8 cog8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11B10.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog8 cog8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion 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2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl3002 rpl3002delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3002 rpl3002delta 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SPAC24B11.06c FYPO:0001645 302-349 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-deltaC-term partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:33410907 4896 2021-01-22 PomBase SPBC119.13c FYPO:0003412 prp31::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 prp31 prp31::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 K460A,R461A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K460A,R461A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 K460A,R461A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K460A,R461A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 K460A,R461A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K460A,R461A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000010 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 1B) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000010 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-14 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0005504 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:23236291 4896 2016-07-06 (Figure 6A) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001117 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000123,FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1C) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-14 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000957 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000211 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4D) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001317 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000123,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1742.01) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1C) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001903 deletion 972 h- cbf12 cbf12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cbf12 cbf12delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pmt3 pmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC365.06 FYPO:0001234 deletion 972 h- pmt3 pmt3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10567589 4896 2019-02-22 PomBase SPBC365.06 FYPO:0003241 deletion 972 h- pmt3 pmt3delta deletion ECO:0005580 PMID:10567589 4896 2019-02-22 The profile of pmt3􏰗 cells showed a decrease of the number of cells with 2C DNA content and an increase in the number of cells with a DNA content greater or less than 2C DNA content (at times 􏰔2 and 0 h in Fig. 3C) PomBase SPBC365.06 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pmt3 pmt3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- pmt3 pmt3delta deletion ECO:0001232 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ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-47 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 low PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001128 R536A,R538A,K540A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-47 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001490 R536A,R538A,K540A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-47 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002061 R536A,R538A,K540A Not assayed or wild type 972 h- cdc18delta::ura4+ ade6-M210 ura4-D18 his3-D1 [pDAD112] cdc18 cdc18-47 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:11030343 4896 2013-12-04 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 slm9 slm9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0004481 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0005369 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0003412 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0007478 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0005368 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000470 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000059 high PMID:21211723 4896 2024-01-17 Defective mating-type switching in heterochromatin mutants results in poor iodine staining of colonies, in contrast to the dark staining of wild-type colonies (Jia et al., 2004). asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F). PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0001324 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.14c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0001514 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC31F10.13c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0003557 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000220 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000220 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000231 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006414 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1834.03c) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006414 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.03c) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006414 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1105.12) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006414 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006414 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006414 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:17452352 4896 2018-03-01 (Figure 7) PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0004342 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0004342 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000825 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.04c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000825 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0005917 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0003105 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0000291 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000228 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0001232 8 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 slm9 slm9delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 slm9 slm9delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0001164 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0001147 deletion 972 h- slm9 slm9delta deletion ECO:0001232 PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC15D4.03 FYPO:0000833 deletion 972 h- 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mid1-(1-100)-(401-680) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 101-400,681-920 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-680) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001424 101-400,681-920 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-680) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 101-400,681-920 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-680) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 23 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 101-400,681-920 Knockdown 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-680) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 37 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC895.05 FYPO:0000024 353-406 Not assayed or wild type 972 h- for3 for3-DID partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:19646873 4896 2012-02-21 PomBase SPAPYUG7.04c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- rpb9 rpb9+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:33775921 4896 2021-05-17 PomBase SPAC4F10.04 FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypa1 ypa1delta ypa1-delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.04 FYPO:0000164 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypa1 ypa1delta ypa1-delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.04 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ypa1 ypa1delta ypa1-delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC4F10.04 FYPO:0000044 deletion 972 h- ypa1 ypa1delta ypa1-delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:27481777 4896 2016-08-04 PomBase SPAC4F10.04 FYPO:0000044 deletion 972 h- ypa1 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SPAC4F10.04 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ypa1 ypa1delta ypa1-delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000704 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Mutations of the DEAD-box in Mrh5-Myc resulted in the dissociation of the Mrh5 mutants with the mtSSU (Figs. 7 and S6). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000704 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC2F7.15),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Mutations of the DEAD-box in Mrh5-Myc resulted in the dissociation of the Mrh5 mutants with the mtSSU (Figs. 7 and S6). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000705 D261A Not assayed or wild type 972 h- pnu1[Δi] mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000705 D261A Not assayed or wild type 972 h- pnu1[Δi] mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000705 D261A Not assayed or wild type 972 h- pnu1[Δi] mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000342 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000252 high PMID:38499152 4896 2024-10-26 It is likely that the abolishment of Cox1 synthesis results in the downregulation of OXPHOS complexes. Consistent with these results, cells harboring mrh5D261A-Myc or mrh5E262A-Myc could not grow on glycerol-containing medium, suggesting that they are respiratory-deficient (Fig. S5). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003423 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 A single Asp261 to Ala or Glu262 to Ala mutation gave rise to a substantially reduced level of cox1 mRNA but little or no reduction of the levels of other mt- mRNAs and mt-rRNAs (Fig. 5A). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002056 D261A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002134 D261A Not assayed or wild type 972 h- pnu1[Δi] mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c),assayed_transcript(PomBase:SPMIT.05) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002134 D261A Not assayed or wild type 972 h- pnu1[Δi] mrh5 mrh5-D261A amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c),assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC1306.01c FYPO:0003412 mef1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 gfm1 mef1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G149A,G152A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G149A,G152A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G149A,G152A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G149A,G152A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G149A,G152A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G149A,G152A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 low PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000468 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000337 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2A) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0002922 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000112 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Figure 2b) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000708 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2B) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0003151 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Figure 6) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0003151 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Figure 6) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0003151 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Figure 6) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001324 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4C) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001122 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0001232 high PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Fig. 1D) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0006299 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Figure 2d) Δrhp6 resulted in enhanced silencing of the otr1::ura4+, as shown by reduced growth on medium lacking uracil (Fig. 2D) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000969 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2D) PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0004325 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1919.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl1 brl1delta rfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001946 deletion 972 h- sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 low PMID:7744953 4896 2013-12-19 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0000320 deletion 972 h- sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:7744953 4896 2013-12-19 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- sad1 sad1delta deletion ECO:0005638 PMID:7744953 4896 2013-12-19 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0000733 deletion 972 h- sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 low PMID:7744953 4896 2013-12-19 PomBase SPBC12D12.01 FYPO:0002018 deletion 972 h- sad1 sad1delta deletion ECO:0001232 high PMID:7744953 4896 2013-12-19 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000705 E368K Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-E368K amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:24663817 4896 2020-03-09 E368K mutation abolished the binding to Rad9 as previously reported [47] (Fig. 5A and B) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002679 E368K Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-E368K amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000162 medium assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:24663817 4896 2020-03-09 (Fig. 3a, b) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000088 E368K Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-E368K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 medium PMID:24663817 4896 2020-03-09 (Fig. 1D) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000089 E368K Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-E368K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 low PMID:24663817 4896 2020-03-09 PomBase SPAC806.05 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lyr3 lyr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC806.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- lyr3 lyr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC806.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lyr3 lyr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC806.05 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 lyr3 lyr3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC806.05 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lyr3 lyr3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC806.05 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 lyr3 lyr3delta deletion 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 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PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21H7.04 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dbp7 dbp7delta deletion ECO:0005638 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membrane, accumulating in the cytoplasm. 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medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1F5.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mso1 mso1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0004811 S62SGESEGESEGLE Not assayed or wild type 972 h- rrp41 rrp41-co rrp41 channel-occluded amino_acid_insertion ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.35) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0004811 S62SGESEGESEGLE Not assayed or wild type 972 h- rrp41 rrp41-co rrp41 channel-occluded amino_acid_insertion ECO:0000226 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPAC1071.10c) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0003700 S62SGESEGESEGLE Not assayed or wild type 972 h- rrp41 rrp41-co rrp41 channel-occluded amino_acid_insertion ECO:0000291 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPSNORNA.32) PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC3G9.10c FYPO:0001234 S62SGESEGESEGLE Not assayed or wild type 972 h- rrp41 rrp41-co rrp41 channel-occluded amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000106 high PMID:25240800 4896 2018-03-27 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002827 558-1019 Not assayed or wild type 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ mrc1 mrc1-R558stop partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000233,FYECO:0000370 medium PMID:38285941 4896 2024-03-15 (Fig. S1) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0000783 1-261 Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1(262-1828) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9635190 4896 2016-04-05 (Fig. 5) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0005555 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 3A and B) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0005555 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0001232 54 assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 3C) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000415 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0001232 38 PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 3D) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0006599 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 5F) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0001645 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0006030 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1250.01),assayed_protein(PomBase:SPCC338.17c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 5A) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0001861 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0001232 high PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 2B) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0004380 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC31A2.05c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 5D and F) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0004380 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1687.18c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 5E and F) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0004827 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 12 PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 2E) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000228 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0001232 PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 2C and D) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0004742 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000049 PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 3E) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0008154 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1250.01) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 5F) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0008154 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 5F) PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000084 deletion 972 h- phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph phi1 phi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 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2023-06-28 PomBase SPBC21C3.09c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph oaa1 oaa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.09c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph oaa1 oaa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph oaa1 oaa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.09c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph oaa1 oaa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.09c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph oaa1 oaa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph oaa1 oaa1delta deletion ECO:0005638 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25B2.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC25B2.08 SPBC25B2.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25B2.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC25B2.08 SPBC25B2.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25B2.08 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC25B2.08 SPBC25B2.08delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC25B2.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC25B2.08 SPBC25B2.08delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0000705 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.05c),assayed_using(PomBase:SPCC736.15) PMID:32023460 4896 2020-02-28 (Figure 4, S4B). PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0006330 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Figure 4, S4B). PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0006330 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:39110593 4896 2024-11-05 Notably, mutations of three previously reported conserved lysine residues (K36/38/43A,20,21 hereafter referred to as 3KA) in the VAP consensus sequence (VCS) within the MSP domain of either Scs2 or Scs22 abolished their ER-PM tethering capacity (asterisked by large PM regions devoid of the cER in Figure 1C) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0008328 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:39110593 4896 2024-11-01 (Figure 3D) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0008077 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:39110593 4896 2024-11-01 (Figure 3D) PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001645 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPAC3H8.02),assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:39110593 4896 2024-11-01 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001645 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:39110593 4896 2024-11-01 PomBase SPBC16G5.05c FYPO:0001645 K36A,K38A,K43A Not assayed or wild type 972 h- scs2 scs2-3KA amino_acid_mutation ECO:0006030 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1071.10c),assayed_protein(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:39110593 4896 2024-11-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 V297A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-V297A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 V297A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-V297A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0003891 T268A Not assayed or wild type 972 h- rec7 rec7-cdk-site2 rec7-cdk2 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:30640914 4896 2019-02-04 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 R398A,R401A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R398A,R401A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPBC947.02 FYPO:0007327 unknown Not assayed or wild type 972 h- apl2 apl2-929 unknown ECO:0005580 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC947.02 FYPO:0006518 unknown Not assayed or wild type 972 h- apl2 apl2-929 unknown ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC947.02 FYPO:0000997 unknown Not assayed or wild type 972 h- apl2 apl2-929 unknown ECO:0001232 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0006099 441-900 Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:21481773 4896 2023-02-16 Ofd1 was enriched in the nucleus with little cytosolic staining consistent with previous findings (Fig. 3A)( PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0005545 441-900 Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:27343236 4896 2016-07-18 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0004342 441-900 Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0004342 441-900 Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001130 441-900 Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:21481773 4896 2023-02-16 Ofd1 was enriched in the nucleus with little cytosolic staining consistent with previous findings (Fig. 3A)( PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0000594 441-900 Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-06 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rqc1 rqc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph rqc1 rqc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- rqc1 rqc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqc1 rqc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1142.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqc1 rqc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000705 312-830 Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1(1-311) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.04),assayed_using(PomBase:SPCC63.08c) PMID:32909946 4896 2020-09-16 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0007146 K516A,N517A,K518A,K519A Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-AlaB(NLS) rec10-293 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17A5.18c) PMID:33526714 4896 2021-12-08 (Figure 2) PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0007146 K516A,N517A,K518A,K519A Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-AlaB(NLS) rec10-293 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:33526714 4896 2021-12-08 (Figure 2) PomBase SPBC215.12 FYPO:0003029 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24014766 4896 2024-07-09 GENERAL SPLICING DEFECT RT-PCR analysis of tbp1_a, an mRNA intron highly sensitive to splicing defects (53), indicated that cwf10-ΔNTE cells grown at 25°C accumulate unspliced transcript (Fig. 2C). retrotransposon silencing by mRNA destabilization PomBase SPBC215.12 FYPO:0000835 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 medium assayed_protein(PomBase:SPAC644.12) PMID:24014766 4896 2024-07-09 In the cwf10-ΔNTE background, levels of Brr2 and Prp3 were similar to levels seen in wild-type cells; however, both Cdc5 and Prp1 levels were reduced to 70% and 65%, respectively (Fig. 2I). PomBase SPBC215.12 FYPO:0000835 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 medium assayed_protein(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:24014766 4896 2024-07-09 In the cwf10-ΔNTE background, levels of Brr2 and Prp3 were similar to levels seen in wild-type cells; however, both Cdc5 and Prp1 levels were reduced to 70% and 65%, respectively (Fig. 2I). PomBase SPBC215.12 FYPO:0000836 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC215.12) PMID:24014766 4896 2024-07-09 Using quantitative Western blotting, we found that levels of Cwf10 were consistently higher in cwf10-ΔNTE cells than in wild-type cells when quantified against the loading control Cdc2 (Cdk1) (Fig. 2I) PomBase SPBC215.12 FYPO:0004083 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC9.03c) PMID:24014766 4896 2024-07-09 In the cwf10-ΔNTE background, levels of Brr2 and Prp3 were similar to levels seen in wild-type cells; however, both Cdc5 and Prp1 levels were reduced to 70% and 65%, respectively (Fig. 2I). PomBase SPBC215.12 FYPO:0004083 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC29E6.02) PMID:24014766 4896 2024-07-09 In the cwf10-ΔNTE background, levels of Brr2 and Prp3 were similar to levels seen in wild-type cells; however, both Cdc5 and Prp1 levels were reduced to 70% and 65%, respectively (Fig. 2I). PomBase SPBC215.12 FYPO:0001234 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:24014766 4896 2024-07-09 The cwf10-ΔNTE strain formed slightly smaller colonies on solid media at all temperatures tested (Fig. 2A) and exhibited slow growth in liquid culture at 25°C and 36°C compared with wild-type cells (Fig. 2B and data not shown) PomBase SPBC215.12 FYPO:0001234 2-127 Not assayed or wild type 972 h- cwf10 cwf10-NTE partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24014766 4896 2024-07-09 The cwf10-ΔNTE strain formed slightly smaller colonies on solid media at all temperatures tested (Fig. 2A) and exhibited slow growth in liquid culture at 25°C and 36°C compared with wild-type cells (Fig. 2B and data not shown) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000703 462-593 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1-461 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.10) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPBC725.15 FYPO:0001012 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura5 ura5-108 unknown ECO:0005638 PMID:22198627 4896 2012-07-26 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000164 unknown 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1828464 4896 2012-05-25 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000082 unknown 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:1828464 4896 2012-05-25 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001315 unknown 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:1828464 4896 2012-05-25 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001315 unknown 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1828464 4896 2012-05-25 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001357 unknown 972 h- bgs4 cwg1-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:1828464 4896 2012-05-25 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001357 unknown 972 h- bgs4 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assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:19357077 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003077 443-460 Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000037297) PMID:19357077 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 443-460 Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 443-460 Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC1002.08c FYPO:0000444 wild type Overexpression 972 h- mtf1 mtf1+ wild_type ECO:0005580 PMID:21138961 4896 2014-11-20 PomBase SPAC1002.08c FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- mtf1 mtf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:21138961 4896 2014-11-20 PomBase SPAC1002.08c FYPO:0000849 wild type Overexpression 972 h- mtf1 mtf1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:21138961 4896 2014-11-20 PomBase SPAC1002.08c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- mtf1 mtf1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:21138961 4896 2014-11-20 PomBase SPAC1002.08c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- mtf1 mtf1+ wild_type ECO:0000231 PMID:21357609 4896 2014-06-09 PomBase SPAC1002.08c FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- mtf1 mtf1+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:21138961 4896 2014-11-20 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0007426 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 (Figure 1 and 2) We conclude that it is the new SPB that fails to activate and insert into the nuclear envelope in cut12.1 mutants. PomBase SPAC1786.03 FYPO:0003165 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 ~80 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0001514 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1786.03) PMID:33109728 4896 2022-06-27 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0007428 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0002061 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-06-24 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0002061 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:33109728 4896 2022-06-27 (Fig. 4B) PomBase SPAC1786.03 FYPO:0006592 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:19487457 4896 2020-07-07 PomBase SPAC1786.03 FYPO:0000772 L521F Not assayed or wild type 972 h- cut11 cut11-1 cut11.1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 80 PMID:19487457 4896 2020-06-24 (Fig. 4 C and Video 3) PomBase SPCC1450.08c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph wtf16 wtf16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- wtf16 wtf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wtf16 wtf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1450.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wtf16 wtf16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.15 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpp101 rpa1- unknown ECO:0005638 PMID:2325655 4896 2013-09-24 PomBase SPAC644.15 FYPO:0001491 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpp101 rpa1- unknown ECO:0005638 PMID:2325655 4896 2013-09-24 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0004287 T180E,S192E Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1.EE(T180E,S192E) amino_acid_mutation ECO:0000340 PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0003929 T180E,S192E Not assayed or wild type 972 h- xlf1 xlf1.EE(T180E,S192E) amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC663.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- asf1 asf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC663.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asf1 asf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC663.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- asf1 asf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39878217 4896 2025-02-15 (Fig. 1B) PomBase SPCC663.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- asf1 asf1delta deletion ECO:0005638 PMID:11856374 4896 2024-06-12 PomBase SPCC663.05c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asf1 asf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0003263 plo1-sid4(302-660) Overexpression 972 h- plo1 plo1-sid4C plo1-sid4C fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 6A) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0003263 plo1-sid4(302-660) Overexpression 972 h- plo1 plo1-sid4C plo1-sid4C fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 6A) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0007256 plo1-sid4(302-660) Overexpression 972 h- plo1 plo1-sid4C plo1-sid4C fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:22438582 4896 2020-02-20 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0007256 plo1-sid4(302-660) Overexpression 972 h- plo1 plo1-sid4C plo1-sid4C fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:22438582 4896 2020-02-20 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004609 plo1-sid4(302-660) Overexpression 972 h- plo1 plo1-sid4C plo1-sid4C fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 6A) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004609 plo1-sid4(302-660) Overexpression 972 h- plo1 plo1-sid4C plo1-sid4C fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 6A) PomBase SPAC29A4.04c FYPO:0000059 deletion 972 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4896 2021-10-25 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001407 G17V Not assayed or wild type 972 h- rho2 rho2-G17V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0002297 G17V Not assayed or wild type 972 h- rho2 rho2-G17V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0000021 G17V Not assayed or wild type 972 h- rho2 rho2-G17V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 medium PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPBC29A10.07 FYPO:0003066 deletion 972 h- pom152 pom152delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPBC29A10.07 FYPO:0000581 deletion 972 h- pom152 pom152delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPBC29A10.07 FYPO:0001355 deletion 972 h- pom152 pom152delta deletion ECO:0005638 PMID:33109728 4896 2022-06-27 (Fig. 4B) PomBase SPBC29A10.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pom152 pom152delta deletion 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PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC645.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1709.14) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC725.10) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11E3.06) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC11C11.06c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC977.16c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC2H10.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC713.05) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1709.13c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC15E1.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC3A11.07) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1703.13c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1685.17) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1782.07) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC83.13) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.08c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC23E6.03c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1861.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPACUNK4.17) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC56F8.15) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.03c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC530.10c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29A3.18) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC622.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1399.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC18G6.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1565.04c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC2G2.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC513.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.14c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP23A10.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 10) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S4) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0000826 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S4) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001117 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. 2B) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001117 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. 2B) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002019 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. 1) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC750.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23H3.15c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC9E9.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11D3.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC25B8.12c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC18B5.01c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1020.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC947.04) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13G7.13c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC569.09) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.03) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13D6.01) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.11c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC13A11.06) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001890 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 11) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0003903 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:33711009 4896 2022-10-04 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0004423 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),residue(CTD_T1) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 2f . PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002085 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 10A) PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0001357 C13S Not assayed or wild type 972 h- ssu72 ssu72-C13S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 1) PomBase SPAC18G6.07c FYPO:0001407 R127L,H200R Overexpression 972 h- mra1 mra1-12 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9133664 4896 2014-09-18 PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0006153 C(-2372)G Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-Mb3 nucleotide_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0000838 495-809 Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-deltaN-EGFP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.10) PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000705 1-639 Not assayed or wild type 972 h- ase1 ase1-640-731 partial_amino_acid_deletion ECO:0000092 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09),assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:19686686 4896 2016-09-08 (Figure 3D) PomBase SPAC27E2.02 FYPO:0007803 wild type Overexpression 972 h- Pnmt1-FLAG yih1 yih1+ Pnmt1-FLAG-yih1 wild_type ECO:0000337 FYECO:0000126 PMID:33534698 4896 2021-06-28 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0003066 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0002485 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPBC1A4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC21H7.07c) PMID:30640914 4896 2019-01-31 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0003179 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:30640914 4896 2019-01-31 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0005650 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0005580 PMID:30640914 4896 2019-02-21 (Figure S4) PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0004993 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0005638 PMID:30640914 4896 2019-02-08 (Figure S1A) PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph crs1 crs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph crs1 crs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph crs1 crs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph crs1 crs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- crs1 crs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crs1 crs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crs1 crs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-144 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc7 cdc7-144 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003631 wild type Knockdown 972 h- prp11 prp11+ wild_type ECO:0001807 PMID:14713954 4896 2014-08-14 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003055 1425-1586 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2deltaF partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003049 1425-1586 Not assayed or wild type 972 h- sme2 sme2deltaF partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 trp1322 trp1322delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 trp1322 trp1322delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0005947 deletion 972 h- trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:34349749 4896 2024-12-15 As shown in Supplementary Figure 4, their deletion neither produced sensitivity to KCl nor enhanced the sensitivity of bch1delta PomBase SPCC1322.03 FYPO:0008456 deletion 972 h- trp1322 trp1322delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Moreover, none of other putative non-essen- tial stretch-activated ion channels [29] or organellar Ca2+-ATPase [30] appeared to be crucial for control- ling Ca2+ flux or for acute hypotonic protoplast expan- sion (Additional file 1: Fig. S1E). PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001473 deletion 972 h- trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000207 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001473 deletion 972 h- trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001473 deletion 972 h- trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000214 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph trp1322 trp1322delta deletion 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PomBase SPBC725.11c FYPO:0003074 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-22 Consistent with the fact that Php2/3/5 forms a complex, loss of Php3 localization at cenH and dh elements was observed in the absence of php2 or php5 (Fig. 3a, b, and Supplementary Fig. 3a). PomBase SPBC725.11c FYPO:0001407 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23832353 4896 2013-08-02 PomBase SPBC725.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:9372932 4896 2019-05-17 PomBase SPBC725.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0005638 PMID:23832353 4896 2013-08-01 PomBase SPBC725.11c FYPO:0000342 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0000335 PMID:23832353 4896 2013-08-02 PomBase SPBC725.11c FYPO:0002009 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0000335 PMID:23832353 4896 2013-08-02 PomBase SPBC725.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC191.07) PMID:9372932 4896 2019-05-17 PomBase SPBC725.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- php2 php2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 assayed_using(PomBase:SPCC191.07) PMID:9372932 4896 2019-05-24 PomBase SPBC725.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- php2 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4896 2012-01-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000726 C terminal fusion of sty1C13SC35SC153SC158SC242S with Tpx1 expressed from sty1 locus Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-5CS-tpx1 fusion_or_chimera ECO:0005638 low PMID:37572670 4896 2024-01-26 Crucially, both Sty1-Tpx1 fusions were expressed at similar levels to wild-type Sty1 and supported growth under stress conditions, confirming retention of Sty1 function (Figures 1B and 1D). By contrast, the oxidative stress sensitivity and lower Pyp1 levels in cells expressing a Sty15CS-Tpx1 fusion protein, provided further evidence that cysteines in Sty1 are required for Sty1 function independently from forming disulfide-bonded complexes with Tpx1 (Figures 1B and S1F).39 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 G159T,A162C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159U,A162C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPAC630.13c FYPO:0001592 N1191K Not assayed or wild type 972 h- tsc2 tsc2-N1191K amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:14718525 4896 2013-09-26 PomBase SPAC630.13c FYPO:0001029 N1191K Not assayed or wild type 972 h- tsc2 tsc2-N1191K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14718525 4896 2013-09-26 PomBase SPAC3C7.07c FYPO:0003300 deletion 972 h- ate1 ate1delta deletion ECO:0000112 high PMID:23348717 4896 2014-04-24 PomBase SPAC3C7.07c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph ate1 ate1delta 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2016-01-18 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005195 R17A Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A+4 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPBC428.18 FYPO:0000838 R17A Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A+4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-13 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005196 R17A Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A+4 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000608 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:24173154 4896 2014-04-29 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000608 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000608 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000608 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:8978687 4896 2016-10-06 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000608 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000608 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000620 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000294 100 PMID:21540296 4896 2016-05-24 Fig. 1c PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000620 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:3040264 4896 2016-10-06 (Fig. 2a) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000620 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 81 PMID:17036054 4896 2017-06-28 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003145 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:10418128 4896 2014-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001972 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000232 PMID:6094012 4896 2014-02-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001352 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003738 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000338 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:6094012 4896 2023-12-24 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001733 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 20 PMID:17036054 4896 2017-06-28 (Figure 1a) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000769 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:2211869 4896 2013-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002403 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:10418128 4896 2014-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000681 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9167972 4896 2013-01-30 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001683 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:3040264 4896 2016-10-06 (Fig. 2a) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001683 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001792 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:2211869 4896 2013-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001375 G93E Not assayed or wild type 972 h- tea3-GFP nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.02c) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 2D PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000930 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003209 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15936270 4896 2020-06-12 Wsh3-GFP was abrogated by a mutation in β- tubulin, nda3-KM311 [39] even at its permissive temperature, 30oC (Figure 3B, left). PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000634 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:19217403 4896 2014-06-06 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002555 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000941 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC13E7.06) PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002027 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:8834798 4896 2013-02-25 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003811 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 22 PMID:8876193 4896 2018-10-17 (Fig. 3) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003811 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001512 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000232 PMID:6094012 4896 2014-02-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000134 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000232 PMID:6094012 4896 2014-02-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000080 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005798 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 5C) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001355 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001122 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002638 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:11950879 4896 2015-03-18 ...majority of the Mad2-GFP was localized to the spindle PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005411 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 80 PMID:17036054 4896 2017-06-28 (Figure 1a) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002700 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:2665944 4896 2014-02-18 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002969 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 Hhp1 accumulates at SPB when spindle checkpoint activated PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0006102 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 high PMID:9200612 4896 2018-04-10 (Fig. 5C) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002462 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:6887244 4896 2012-03-09 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003128 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:6094012 4896 2014-02-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002005 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:2211869 4896 2013-03-08 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002004 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002004 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:2211869 4896 2013-03-08 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002004 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 81 PMID:17036054 4896 2017-06-28 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002071 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:3040264 4896 2016-10-06 (Fig. 2a) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000895 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:21856157 4896 2012-04-05 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002018 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:3040264 4896 2016-10-06 (Fig. 2a) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002018 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:8978687 4896 2016-10-06 (Figure 5) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001368 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:8978687 4896 2016-10-06 (Fig. 4b) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005720 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000232 20 PMID:17036054 4896 2017-06-28 (Fig. 1b) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001513 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227,FYECO:0000232 PMID:11861765 4896 2016-05-26 (Fig. 3C) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001513 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000293 PMID:21540296 4896 2016-05-24 Fig. 1c PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001513 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000295 100 PMID:21540296 4896 2016-05-24 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0004301 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000306 54 PMID:3040264 4896 2016-10-06 Table1 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005717 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_substrate(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8978687 4896 2016-10-06 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002559 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.06c) PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002559 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002559 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001402 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:12234926 4896 2017-08-16 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002442 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:11694585 4896 2017-05-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0007890 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0007890 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 2B). Immunofluorescence showed that byr4p was also present on the SPB in the arrested cells PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002901 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:15371542 4896 2014-12-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002967 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.12) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002967 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.13) PMID:22119525 4896 2012-11-28 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005709 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:14742702 4896 2017-08-16 On temperature shift down to 20°C, Alp7-YFP localized only to the SPB (Figure 2B). This also indicates that Alp7 does not require a microtubule cytoskeleton to localize to the SPB. PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003414 G93E Not assayed or wild type 972 h- tea3-GFP nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.02c) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 2D PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000703 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000006 PMID:11950879 4896 2015-03-18 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001357 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:15743909 4896 2017-09-13 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0007859 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:20967237 4896 2019-10-22 Video S3 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003302 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:2211869 4896 2013-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0006084 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27146110 4896 2017-05-17 (Table 1) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003146 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:10418128 4896 2014-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000091 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:15126629 4896 2014-05-15 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000091 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. S3) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003810 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005838 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 91 PMID:8876193 4896 2018-10-17 (Fig. 3) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000952 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:2211869 4896 2013-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000952 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:10418128 4896 2014-02-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001491 G93E Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-KM311 nda3-311|nda3-311cs amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000285 >95 PMID:11909965 4896 2019-05-11 (Fig. 2B) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000941 R272E,K273E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R272E,K273E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000705 R272E,K273E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R272E,K273E amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC4H3.11c),assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001382 R272E,K273E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R272E,K273E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002442 R272E,K273E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R272E,K273E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001357 R272E,K273E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R272E,K273E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001357 R272E,K273E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R272E,K273E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC365.15 FYPO:0000608 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0000141 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0000177 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0000131 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0000446 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0005029 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0004750 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 23 PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0001587 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.16) PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPBC365.15 FYPO:0001587 NLS-alp4(566-784) Overexpression 972 h- alp4 NLS-alp4-C(566-784) NLS-alp4C fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:16611237 4896 2015-10-23 PomBase SPAC644.10 FYPO:0002113 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 med11 med11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- med11 med11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC644.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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2012-01-01 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000963 S422A,S439A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-S422A,S439A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000957 S422A,S439A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-S422A,S439A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC328.01c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 msn5 msn5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 msn5 msn5delta 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FYPO:0007358 deletion 972 h- msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPAC328.01c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC328.01c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph msn5 msn5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- msn5 msn5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msn5 msn5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC328.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msn5 msn5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003217 E92K Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-87 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0004313 E92K Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-87 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 E92K Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-87 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 E92K Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-87 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0007295 E92K Not assayed or wild type 972 h- cnt1::ura4+ cnp1 cnp1-87 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:17677001 4896 2020-03-31 (Figure 2B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0000251 253-322 Not assayed or wild type 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0000684 253-322 Not assayed or wild type 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0004153 253-322 Not assayed or wild type 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:28334955 4896 2017-03-29 Supplementary Figure S3B PomBase SPBC106.19 FYPO:0003335 253-322 Not assayed or wild type 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:28334955 4896 2017-03-29 Supplementary Figure S3B ( PomBase SPBC106.19 FYPO:0000245 253-322 Not assayed or wild type 972 h- ppr10 ppr10deltaPPR partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1 E,F) PomBase SPAC2C4.14c FYPO:0000164 K35R Not assayed or wild type 972 h- ppk11 ppk11-kd amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC2C4.14c FYPO:0002869 K35R Not assayed or wild type 972 h- ppk11 ppk11-kd amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0008435 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000059 medium PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 3D) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002134 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPAC23G3.06),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 6H) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001135 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S3C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001327 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 4E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0005120 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- pat1-as snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 5F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0005120 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- pat1-as snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 5E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000703 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000703 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6D) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002357 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 6E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002357 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 6F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002357 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 6G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002357 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6B) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001317 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S3E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003058 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S3F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001357 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:40185772 4896 2025-05-02 (Fig. S3G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0008436 C83T,T84A,T85C,G86T,C87G,C88G,A89C,G90A,T91A,A92G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE2mut nucleotide_mutation ECO:0000337 medium assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.48) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. 3C) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 C26S,C76S,C140S,C176S,C213S,C221S,C256S,C291S,C340S,C374S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-Cysteine-less amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 C26S,C76S,C140S,C176S,C213S,C221S,C256S,C291S,C340S,C374S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-Cysteine-less amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 C26S,C76S,C140S,C176S,C213S,C221S,C256S,C291S,C340S,C374S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-Cysteine-less amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000166 PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 C26S,C76S,C140S,C176S,C213S,C221S,C256S,C291S,C340S,C374S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-Cysteine-less amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC227.03c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 yea6 yea6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph yea6 yea6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- yea6 yea6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC227.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph yea6 yea6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph yea6 yea6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph yea6 yea6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph yea6 yea6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph yea6 yea6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- yea6 yea6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC227.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yea6 yea6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yea6 yea6delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPAC1A6.10 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph tcd1 tcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph tcd1 tcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.10 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph tcd1 tcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.10 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph tcd1 tcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tcd1 tcd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.10 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph tcd1 tcd1delta deletion ECO:0005638 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gpm1 gpm1-R94Q amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11106417 4896 2023-07-03 PomBase SPAC26F1.06 FYPO:0008116 R94Q Not assayed or wild type 972 h- gpm1 gpm1-R94Q amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11106417 4896 2023-07-13 PomBase SPBC947.10 FYPO:0001913 H668A Not assayed or wild type 972 h- dsc1 dsc1-H668A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:25918164 4896 2015-08-04 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002627 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 PMID:23907979 4896 2022-07-01 Moreover, when we looked at the cell wall composition of mtl2D mutants we found a decrease in the total amount of glucose incorporated in the cell wall as compared with wild-type cells (30% in wild-type cells and 25% in mtl2D). The difference was mainly due to a decrease in the b-glucan content (17% in the wild type and 13% in the mtl2D) (Fig. 1E). PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002159 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 low PMID:23907979 4896 2022-07-01 We found that GS activity was slightly reduced in mtl2D null cells (Fig. 1D) PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0001324 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000114 assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:23907979 4896 2022-07-01 GTP bound modified form. Interestingly, mtl2D and wsc1D mutants contained much less Rho1p-GTP than wild-type cells when the cultures were grown in the presence of 0.1 lg/mL of Csp for 16 h prior to harvesting (Fig. 4C) PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000760 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 PMID:23907979 4896 2022-07-01 The mating rate was not affected in mtl2Δh+ × mtl2Δh− or wsc1Δh+ × wsc1Δh− homozygous crosses PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0008003 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0001315 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0001232 PMID:23907979 4896 2022-07-01 wsc1D and mtl2D cells did not exhibit any evident morphological changes (Fig. 1B) PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23907979 4896 2022-07-01 The wsc1D and mtl2D mutants grew well under standard growth conditions at both 28 and 37°C and entered the stationary phase at the same time as the wild-type cultures. PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23907979 4896 2022-07-01 Deletion of mtl2+ rendered cells hypersensitive to caffeine, vanadate, NaCl, H2O2, and SDS (see Fig. S1). PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000105 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 medium PMID:23907979 4896 2022-07-01 mtl2D cells were unable to grow on plates supplemented with 0.5 lg/mL Csp, whereas the wild-type cells were able to withstand concentrations of up to 5 lg/ mL PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000105 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23907979 4896 2022-07-01 mtl2D cells were unable to grow on plates supplemented with 0.5 lg/mL Csp, whereas the wild-type cells were able to withstand concentrations of up to 5 lg/ mL PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000087 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23907979 4896 2022-07-01 Deletion of mtl2+ rendered cells hypersensitive to caffeine, vanadate, NaCl, H2O2, and SDS (see Fig. S1). PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0005889 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23907979 4896 2022-07-01 Deletion of mtl2+ rendered cells hypersensitive to caffeine, vanadate, NaCl, H2O2, and SDS (see Fig. S1). PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23907979 4896 2022-07-01 Deletion of mtl2+ rendered cells hypersensitive to caffeine, vanadate, NaCl, H2O2, and SDS (see Fig. S1). PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0005638 high PMID:23907979 4896 2022-07-01 Deletion of mtl2+ rendered cells hypersensitive to caffeine, vanadate, NaCl, H2O2, and SDS (see Fig. S1). PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0000647 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0001232 15 PMID:23907979 4896 2022-07-01 ~8% of the cells in the wsc1D mutant and 15% of the cells in mtl2D were lysed (Fig. 1B) PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- mtl2 mtl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtl2 mtl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11G7.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtl2 mtl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002061 I753IQGVPL Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-43 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000214 K627E Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-K627E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 K627E Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-K627E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31072933 4896 2019-05-26 (Figure 1c) PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 K627E Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-K627E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000085 K627E Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-K627E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000088 K627E Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-K627E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000268 K627E Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-K627E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC825.01 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC825.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPCC825.01 SPCC825.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC825.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- 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assayed_using(PomBase:SPBC1347.10) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0005095 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0005095 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.11) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000705 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.10) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0003950 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000478 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002043 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.10) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.11) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.11) PMID:21945095 4896 2016-01-29 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000943 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000267 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0005638 PMID:1762905 4896 2013-01-24 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0005638 PMID:1762905 4896 2013-01-24 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0003612 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0003612 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-116 rad4.116 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0003760 D984N Knockdown 972 h- pol1 pol1-D984N amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:9693370 4896 2015-02-13 PomBase SPBPB8B6.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- fah1 fah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000502 T167A Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-T167A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000502 T167A Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-T167A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0008128 deletion 972 h- atp14 atp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0001309 deletion 972 h- atp14 atp14delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0009060 deletion 972 h- atp14 atp14delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 atp14 atp14delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- atp14 atp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atp14 atp14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0004250 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.11) PMID:33534698 4896 2021-07-09 Furthermore, consi tent with the essential role of Sea3 in the interaction between GATOR1 and the other GATOR2 subunits, the vacuolar localization of Sea2, Sea4, and Seh1 ( was abrogated in the sea3D background (Figure 3—Figure supplement 1C-E). PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0004250 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC12G12.01c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 3 Figure supplement 1C-E). PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0004250 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC15F9.02) PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 3 Figure supplement 1C-E). PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001645 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.04c),assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 On the other hand, immunoprecipitation of the GATOR1 subunit Iml1 found that the physical interaction between GATOR1 and the Gtr1 GTPase was reduced in the sea3D mutant (Figure 3M). PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 PMID:33534698 4896 2021-07-08 (Figure 2a) PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0006345 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 2f) PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sea3 sea3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sea3 sea3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.03c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 In the case of the sea3D mutant, Iml1, Npr2, and Npr3 were all detectable on vacuoles (Figure 3—Figure supplement 2E,F and G) PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC543.04) PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 3 Figure supplement 2E,F and G) PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0004248 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 (Figure 3 Figure supplement 2E,F and G) PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000242 PMID:33534698 4896 2021-07-08 (Figure 2a) PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 sea3 sea3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sea3 sea3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.05 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sea3 sea3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.06c FYPO:0002678 S131A,S133A Not assayed or wild type 972 h- bpb1 bpb1-2A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC962.06c),residue(S131,S133) PMID:26167880 4896 2024-07-04 PomBase SPCC962.06c FYPO:0003029 S131A,S133A Not assayed or wild type 972 h- bpb1 bpb1-2A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:26167880 4896 2024-07-04 However, mutation of the conserved S131 and S133 residues to alanine in Bpb1 (denoted Bpb1-2A) caused significant intron retention in 1,598 introns (~35%) (Fig. 3b) and thus produces a defect quantitatively and qualitatively similar to inhibition of either Dsk1 (ρ = 0.62 ± 0.02; P < 10−6, two sided) or Prp4 (ρ = 0.63 ± 0.02; P < 10−6, two sided). PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002827 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr1 clr1-3 unknown ECO:0000049 PMID:1644273 4896 2015-02-13 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003791 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr1 clr1-3 unknown ECO:0000059 PMID:1644273 4896 2015-02-13 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0004361 unknown Not assayed or wild type 972 h- clr1 clr1-3 unknown ECO:0001232 PMID:1644273 4896 2013-11-01 PomBase SPBC1709.01 FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- chs2 chs2+ wild_type ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC1709.01 FYPO:0002560 wild type Overexpression 972 h- chs2 chs2+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC1709.01 FYPO:0001253 wild type Overexpression 972 h- chs2 chs2+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC1709.01 FYPO:0000232 wild type Overexpression 972 h- chs2 chs2+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp16 prp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000741 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp16 prp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0002411 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp16 prp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp16 prp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp16 prp16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1711.17 FYPO:0000091 deletion 972 h- prp16 prp16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:28231281 4896 2017-04-10 PomBase SPCC737.09c FYPO:0001023 wild type Overexpression 972 h- hmt1 hmt1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9016341 4896 2012-05-01 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000763 wild type Overexpression 972 h- hmt1 hmt1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9016341 4896 2012-03-07 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mms1 mms1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mms1 mms1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19819763 4896 2015-03-30 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0000470 deletion 972 h- mms1 mms1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0000950 deletion 972 h- mms1 mms1delta deletion ECO:0001232 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mms1 mms1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0004466 deletion 972 h- mms1 mms1delta deletion ECO:0001232 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0000972 deletion 972 h- mms1 mms1delta deletion ECO:0001232 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mms1 mms1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H8.05c 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assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-07-29 yW formation was impaired in the Sp trm734△ mutant (44% of wild-type levels) and to a lesser extent in the Sp trm732△ mutant (73%) (Fig. 4F), consistent with the increased m1G levels (Table 3; Fig. 4A) PomBase SPBC1306.02 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph trm734 trm734delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1306.02 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph trm734 trm734delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1306.02 FYPO:0001890 deletion 972 h- trm734 trm734delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC1105.02c) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7C) PomBase SPBC1306.02 FYPO:0001890 deletion 972 h- trm734 trm734delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC56E4.03) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7C) PomBase SPBC1306.02 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assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 We constructed mutants of E3 ligases and their components that have been suggested to localize to or function in the ER and nucleus, namely ......... The mutants tested showed no detectable increase in fluorescence, except for the hul5Δ mutant (Fig. S2) PomBase SPBC2A9.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- san1 san1delta san1-delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPBC2A9.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph san1 san1delta san1-delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.04c FYPO:0000829 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 san1 san1delta san1-delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPBC2A9.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph san1 san1delta san1-delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2A9.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph san1 san1delta san1-delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 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(Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001130 101-400 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 101-400 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 5 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001368 101-400 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 2H) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002253 101-400 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-(401-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPBC725.16 FYPO:0001430 1-398 Overexpression 972 h- res1 res1delta398 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000126 PMID:7739540 4896 2019-01-30 (Figure 3b) PomBase SPBC725.16 FYPO:0001117 1-398 Overexpression 972 h- res1 res1delta398 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:7739540 4896 2014-08-08 PomBase SPBC725.16 FYPO:0001117 1-398 Overexpression 972 h- res1 res1delta398 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:7739540 4896 2014-08-08 PomBase SPBC725.16 FYPO:0001974 1-398 Overexpression 972 h- res1 res1delta398 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:7739540 4896 2014-08-08 PomBase SPBC725.16 FYPO:0004255 1-398 Overexpression 972 h- res1 res1delta398 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:7739540 4896 2014-08-08 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002061 1-398 Overexpression 972 h- res1 res1delta398 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:7739540 4896 2014-08-07 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000650 D125A Overexpression 972 h- spg1 spg1-D125A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC5H10.11 FYPO:0001357 gmh1::ura4 Not assayed 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PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0004171 unknown Not assayed or wild type 972 h- rst2 rst2- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1326) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the rst22 mutant, transcripts a, b, and c are expressed normally, whereas transcript d is absent (Fig. 4A). PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0004171 unknown Not assayed or wild type 972 h- rst2 rst2- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.4604) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the rst22 mutant, transcripts a, b, and c are expressed normally, whereas transcript d is absent (Fig. 4A). PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0008156 unknown Not assayed or wild type 972 h- rst2 rst2- unknown ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:18820678 4896 2024-01-29 In the rst22 mutant, transcripts a, b, and c are expressed normally, whereas transcript d is absent (Fig. 4A). PomBase SPAC1002.02 FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pom34 pom34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1002.02 FYPO:0000581 deletion 972 h- pom34 pom34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1002.02 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pom34 pom34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.02 FYPO:0001309 deletion 972 h- pom34 pom34delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1002.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pom34 pom34delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1002.02 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pom34 pom34delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1002.02 FYPO:0000764 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deletion 972 h- h- prototroph mir1 mir1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1703.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- mir1 mir1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1703.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mir1 mir1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1703.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mir1 mir1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0007609 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:32841241 4896 2021-01-21 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:38295128 4896 2024-02-23 (Fig. 1A) PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000455 high PMID:38295128 4896 2024-12-27 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32841241 4896 2020-12-21 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:32841241 4896 2021-01-21 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000252 PMID:32841241 4896 2021-01-21 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0002583 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(SO:0000268) PMID:32841241 4896 2021-01-26 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0002583 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high assayed_using(SO:0000272) PMID:32841241 4896 2021-01-26 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0008342 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 medium assayed_transcript(SO:0000272) PMID:38295128 4896 2024-12-27 As expected, in trm8Δ mutants at 38.5 ̊C, relative tRNATyr(GUA) levels were reduced, to 30% of WT levels (Fig 1B and 1C). PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0008342 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 medium assayed_transcript(SO:0000268) PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Fig 1B and 1C). PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0008343 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 high assayed_using(PomBase:SPBC1105.02c) PMID:38295128 4896 2024-12-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0002580 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000270) PMID:32841241 4896 2021-01-26 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009030 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000455 low PMID:38295128 4896 2024-12-27 (Fig. 1A) PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0004325 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0004325 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000455 medium PMID:38295128 4896 2024-12-27 (Fig. 1A) PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0004325 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000377 PMID:32841241 4896 2020-12-21 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0001097 deletion 972 h- trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000455 low PMID:38295128 4896 2024-12-27 (Fig. 1A) PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCPB16A4.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph trm8 trm8delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002027 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23349808 4896 2013-08-20 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001382 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 We concluded that the Plo1-dependent kinase activity of both plo1.ts2 and plo1.ts19 was greatly reduced. PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0006023 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:40161431 4896 2025-04-08 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001122 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 variable severity PMID:12815070 4896 2019-11-28 The extended and more random size of plo1.ts2 cells at division suggested that this may be the case. Despite the fact that these cells are able to enter mitosis,the appear to be doing so in a less efficient, or more random manner (Fig. 8B). PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:12815070 4896 2019-11-28 Both plo1.ts2 and plo1.ts19 conferred temperature sensitivity for growth on minimal medium PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 W316* Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:12815070 4896 2019-11-28 (Fig. 9A) cdc25.22 and cdc25.22 plo1.ts19 cells, on the other hand, could not form colonies on this medium at this temperature, but cdc25.22 cut12.s11 cells could PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000276 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:12815070 4896 2019-11-28 plo1.ts2 strains entered mitosis but did not form spindles PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000061 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:12815070 4896 2019-11-28 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001984 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 full-length protein appeared to be largely absent from plo1.ts19 on either minimal or rich medium at either 25°C or 36°C (Fig. 7B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001984 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 full-length protein appeared to be largely absent from plo1.ts19 on either minimal or rich medium at either 25°C or 36°C (Fig. 7B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002060 W316* Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts19 plo1.ts19 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:12815070 4896 2019-11-28 ability to form colonies o nrich medium at 36°C was indistinguishable from that of wild-typec ells PomBase SPAC1782.06c FYPO:0007035 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPAC1782.06c FYPO:0000980 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPAC1782.06c FYPO:0001883 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPAC1782.06c FYPO:0002643 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPAC1782.06c FYPO:0003849 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPAC1782.06c FYPO:0007036 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPAC1782.06c FYPO:0002343 wild type Overexpression 972 h- phb1 phb1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:30181366 4896 2019-08-13 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0002061 H201N,G276R Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-H201N-G276R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 4D) PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000082 T51I,P77S Not assayed or wild type 972 h- spg1 spg1-C6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38938413 4896 2024-07-10 PomBase SPBC23G7.15c FYPO:0001489 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpp202 rpa4- unknown ECO:0005638 PMID:2325655 4896 2013-09-24 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0000444 wild type Overexpression 972 h- cmk2 cmk2+ wild_type ECO:0001232 PMID:12135745 4896 2014-08-16 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001497 wild type Overexpression 972 h- cmk2 cmk2+ wild_type ECO:0001232 PMID:12135745 4896 2014-08-16 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- cmk2 cmk2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:12135745 4896 2014-08-16 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- cmk2 cmk2+ wild_type ECO:0005638 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000703 197-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-1-196 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC306.09c),assayed_using(PomBase:SPCC306.09c) PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004104 wild type Overexpression 972 h- tor1 tor1+ wild_type ECO:0001232 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- tor1 tor1+ wild_type ECO:0005638 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000141 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe3 toe3+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe3 toe3+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0004390 wild type Overexpression 972 h- toe3 toe3+ wild_type ECO:0000291 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- toe3 toe3+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001917 wild type Overexpression 972 h- toe3 toe3+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0003166 wild type Overexpression 972 h- toe3 toe3+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 toe3 toe3+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006657 R326A,R331A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R326A,R331A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000263,FYECO:0000337 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000082 R326A,R331A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R326A,R331A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-15 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000080 R326A,R331A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R326A,R331A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28811350 4896 2018-08-17 PomBase SPAC821.09 FYPO:0001971 deletion 972 h- eng1 eng1delta deletion ECO:0001232 low PMID:15194814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC821.09 FYPO:0000141 deletion 972 h- eng1 eng1delta deletion ECO:0001232 PMID:27548313 4896 2020-02-27 PomBase SPAC821.09 FYPO:0001018 deletion 972 h- eng1 eng1delta deletion ECO:0001232 30-40 PMID:23093943 4896 2021-03-26 Loss of Eng1 or its cooperating glucanase, Agn1 [34], resulted in high percentages of monopolar growth (Figure 6C-6D and Figure S5A) PomBase SPAC821.09 FYPO:0002159 deletion 972 h- eng1 eng1delta deletion ECO:0005801 PMID:19542306 4896 2020-11-30 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0004268 deletion 972 h- eng1 eng1delta deletion ECO:0001232 PMID:15194814 4896 2015-01-21 PomBase SPAC821.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph eng1 eng1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.09 FYPO:0000650 deletion 972 h- eng1 eng1delta deletion ECO:0001232 high PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3C) PomBase SPAC821.09 FYPO:0004557 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FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003094 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002834 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000231 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003217 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003411 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003216 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003216 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000231 PMID:24475199 4896 2014-03-16 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003352 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr2 clr2delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000470 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000584 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 PMID:24475199 4896 2014-03-17 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 clr2 clr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002836 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5E). Enhanced transcriptional-machinery occupancy at heterochromatic repeats in SHREC defective cells,..should result in elevated repeat transcripts ...corresponding increase in siRNA production. PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000226 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5B) we found increases in H3K14ac levels and greater Pol II occupancy at the reporter embedded within pericentromeric heterochromatin in....strains lacking SHREC components PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0006681 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0006300 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000825 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Northern blot (Supplementary Figure S1A). Compared to wild-type pho1 mRNA levels, a slight accumulation was detected for all strains. However, this is less pronounced than in clr3Δ, indicating that Clr3 is unlikely to entirely depend on Clr2 or other components of SHREC for recruitment to pho1. PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 clr2 clr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002567 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 clr2 clr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0007529 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0000226 PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph clr2 clr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- clr2 clr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr2 clr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr2 clr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eso1 eso1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0005324 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta eso1 eso1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0005330 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta eso1 eso1delta deletion ECO:0000049 high PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0005331 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta eso1 eso1delta deletion ECO:0000049 low PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eso1 eso1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- eso1 eso1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- eso1 eso1delta deletion ECO:0005638 PMID:21300781 4896 2013-07-02 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eso1 eso1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- eso1 eso1delta deletion ECO:0005638 PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. S4A) PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eso1 eso1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000256 deletion 972 h- eso1 eso1delta deletion ECO:0000059 low PMID:17515930 4896 2015-02-17 PomBase SPAC458.03 FYPO:0003827 tel2-AID Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S1G) PomBase SPAC458.03 FYPO:0003827 tel2-AID Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S1G) PomBase SPAC458.03 FYPO:0001355 tel2-AID Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000339 PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figures S1C and S1D). PomBase SPAC458.03 FYPO:0000780 tel2-AID Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figures S1E and S1F) PomBase SPAC458.03 FYPO:0000780 tel2-AID Not assayed or wild type 972 h- tel2 tel2-AID fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figures S1E and S1F) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004757 1-149 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(150-577) cdc18-150-577|cdc18-d5 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000105 >40 PMID:9739083 4896 2017-06-28 (Fig. 2B) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001425 1-149 Overexpression 972 h- cdc18 cdc18-C(150-577) cdc18-150-577|cdc18-d5 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 medium PMID:10766248 4896 2015-05-07 ( PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000705 1-149 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(150-577) cdc18-150-577|cdc18-d5 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 3) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0005773 1-149 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(150-577) cdc18-150-577|cdc18-d5 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105 high PMID:9739083 4896 2017-06-28 (Fig. 2A) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0003075 1-149 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(150-577) cdc18-150-577|cdc18-d5 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 3) PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0004083 1-149 Overexpression 972 h- leu1-32 cdc18 cdc18-C(150-577) cdc18-150-577|cdc18-d5 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000105 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9739083 4896 2017-07-03 (Fig. 3) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000705 1-361 Not assayed or wild type 972 h- pck2 pck2-362-1017 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04),assayed_using(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPBC119.04 FYPO:0002044 unknown Not assayed or wild type 972 h- mei3 mei3-B71 unknown ECO:0000059 PMID:4472733 4896 2014-10-09 PomBase SPCC1682.09c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ggc1 ggc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- ggc1 ggc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1682.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ggc1 ggc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0001022 wild type Overexpression 972 h- msy2 msy2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22910366 4896 2013-04-24 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000961 wild type 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PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 1e) Localization of Pof8 at telomeres is reduced but not eliminated in trt1∆. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0003803 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-20 (Fig. 1E) PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002134 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 3a) Pof8-TER1 interaction is reduced but not eliminated in trt1∆ cells. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0001355 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9252327 4896 2017-08-16 Cell growth rate is reduced in later generation due to telomere shortening. In early generation, cells growth rate is not distingushiable from trt1+ cells. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0001490 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9252327 4896 2017-08-16 Cells look normal in early generation, but show many elongated cells in later generation due to telomere shortening. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0004083 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Pof8 expression level is not affected by trt1∆. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0004083 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Lsm3 protein level was not affected by trt1∆. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002887 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4f) Lsm3 binding to telomeres was not affected by trt1∆. PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0000840 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0000226 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-22 (Supplementary Fig. 4) PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002239 disruption Null 972 h- trt1 trt1delta::his3+ disruption ECO:0000337 high PMID:9252327 4896 2017-08-16 Cells show progressive telomere shortening. PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0001357 1-96 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta96 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC1142.03c FYPO:0000703 T279A Not assayed or wild type 972 h- swi2 swi2-T279A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.03c),assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:36951094 4896 2024-04-24 (Fig. 2D) PomBase SPAC22F8.04 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pet1 pet1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F8.04 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pet1 pet1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F8.04 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph pet1 pet1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F8.04 FYPO:0004013 deletion 972 h- pet1 pet1delta deletion ECO:0000335 PMID:25195688 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2016-10-06 (Fig. 4) PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0003694 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000291 FYECO:0000229 PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0001324 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:2537310 4896 2014-08-14 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002391 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002391 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000226 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC216.07c) PMID:37913773 4896 2024-01-15 nuc1-632 mutant strain, wherein RNA polymerase I function was impaired.33,34 As a result, we found a considerable reduction in Tor2 accumulation in the rDNA region compared with wild-type cells, concomitant with a decrease in rRNA abundance (Figures 2A and 2B). PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0003119 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:15161942 4896 2016-04-28 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:2537310 4896 2014-08-14 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002053 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002625 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2D) PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002625 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2D) PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002625 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 2D) PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0002901 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC4C3.05c FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- nuc1 nuc1-632 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:2537310 4896 2014-08-14 PomBase SPCC1620.11 FYPO:0003752 wild type Knockdown 972 h- nup97 nup97+ wild_type ECO:0001232 PMID:17846589 4896 2014-12-01 PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001355 17-273 Not assayed or wild type 972 h- shk2 pak2-delta(17-273) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000381 high PMID:11453249 4896 2025-10-23 Expression of Pak2D17±273p under the control of the thiamine-repressible nmt1 pro- moter, but not full length Pak2p, conferred a growth defect in wild-type cells (Fig. 1A; Table 2) PomBase SPAC1F5.09c FYPO:0001122 17-273 Not assayed or wild type 972 h- shk2 pak2-delta(17-273) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000381 16 PMID:11453249 4896 2025-10-23 Expression of Pak2D17±273p in wild- type cells also led to an increase in elongated cells within the population that was suppressed in Dmkh1 cells Fig. 1B), with 16% of Pak2D17±273p-expressing wild- type cells n=200) displaying an$2-fold increase in cell length PomBase SPAC27D7.13c FYPO:0000681 1-240 Not assayed or wild type 972 h- ssm4 ssm4-deltaN partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:9167972 4896 2015-11-04 PomBase SPCC757.08 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp45 rrp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.08 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp45 rrp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.08 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp45 rrp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp45 rrp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC757.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- rrp45 rrp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC757.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp45 rrp45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC589.08c FYPO:0005366 S143A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0001164 S143A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0005720 S143A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0003627 S143A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC27.02c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000703 S143A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c),assayed_using(PomBase:SPBC27.02c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000069 S143A Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spb70 spb70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC553.09c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spb70 spb70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC553.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- spb70 spb70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC553.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spb70 spb70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4E9.02 FYPO:0001430 wild type Overexpression 972 h- cig1 cig1+ wild_type ECO:0005580 PMID:1829983 4896 2013-03-19 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000082 C197A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C197A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:18667531 4896 2022-11-07 The 􏰂RING, C197A, C199A, and C197A/C199A mutants were mildly temperature sensitive but grew normally at 25°C (Figure 2A and data not shown) PomBase SPCC550.05 FYPO:0001357 C197A Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-C197A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:18667531 4896 2022-11-07 The 􏰂RING, C197A, C199A, and C197A/C199A mutants were mildly temperature sensitive but grew normally at 25°C (Figure 2A and data not shown) PomBase SPAC222.10c FYPO:0003830 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:8682866 4896 2015-05-07 PomBase SPAC222.10c FYPO:0004481 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9742395 4896 2018-02-23 PomBase SPAC222.10c FYPO:0000272 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:8682866 4896 2015-05-07 PomBase SPAC222.10c FYPO:0000940 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 7 assayed_protein(PomBase:SPAC1565.06c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 A corresponding decrease in the fraction of cells with Spg1 localized to SPBs occurred and reached 7% at 16 h (Fig. 3) PomBase SPAC222.10c FYPO:0000940 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10799520 4896 2021-10-17 PomBase SPAC222.10c FYPO:0002024 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:11514436 4896 2021-12-18 PomBase SPAC222.10c FYPO:0002024 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:8682866 4896 2015-05-07 PomBase SPAC222.10c FYPO:0002024 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:9742395 4896 2018-02-23 PomBase SPAC222.10c FYPO:0003245 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:8682866 4896 2015-05-07 PomBase SPAC222.10c FYPO:0000647 wild type Overexpression 972 h- byr4 byr4+ wild_type ECO:0001232 PMID:8682866 4896 2015-05-07 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0000705 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c),assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:25688133 4896 2015-07-21 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0004747 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25688133 4896 2015-07-29 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0004737 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25688133 4896 2015-07-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002699 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:25688133 4896 2015-07-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0000729 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25688133 4896 2015-07-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002559 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:25688133 4896 2015-07-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002559 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:25688133 4896 2015-07-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002060 P31A Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-P31A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25688133 4896 2015-07-22 PomBase SPAC1071.09c FYPO:0003247 1-168 Not assayed or wild type 972 h- djc9 djc9-(169-255) djc9-(196-282) 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SPBC211.06 FYPO:0006015 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0000644 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC902.06) PMID:15800064 4896 2016-09-23 (Fig. 5A) PomBase SPBC211.06 FYPO:0002967 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.19) PMID:27053664 4896 2024-03-13 PomBase SPBC211.06 FYPO:0002967 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:27053664 4896 2024-03-13 PomBase SPBC211.06 FYPO:0002967 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.15c) PMID:27053664 4896 2024-03-13 PomBase SPBC211.06 FYPO:0004429 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 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prototroph gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0000091 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC211.06 FYPO:0002112 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0001232 PMID:15004232 4896 2015-04-28 PomBase SPBC211.06 FYPO:0003612 deletion 972 h- gfh1 gfh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27053664 4896 2024-03-13 PomBase SPBC211.06 FYPO:0001491 deletion 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This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0006686 K6R,K8R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KR K5R,K7R,K12R,K16R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0004516 K6R,K8R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KR K5R,K7R,K12R,K16R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000354 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007710 K6R,K8R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KR K5R,K7R,K12R,K16R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0007710 K6R,K8R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KR K5R,K7R,K12R,K16R amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000354 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC11B10.10c FYPO:0005318 K6R,K8R,K13R,K17R Not assayed or wild type 972 h- pht1 pht1-4KR K5R,K7R,K12R,K16R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:30134042 4896 2018-11-07 PomBase SPBC11B10.10c 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2016-03-02 (Figure 2A,B) PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0001861 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1315 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:17004072 4896 2016-03-02 (Figure 2a) PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1315 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:19330768 4896 2016-03-09 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0002071 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1315 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 80 PMID:9450991 4896 2016-03-02 (Figure 1A) PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003166 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1315 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9450991 4896 2016-03-02 (Figure 1A) PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0003166 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1315 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9450991 4896 2016-03-02 (Figure 1A) PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0002085 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1315 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 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assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 K75A Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003107 K75A Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-K75A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001117 A725C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-BPmut nucleotide_mutation ECO:0000337 medium assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S4B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003040 A725C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-BPmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 1B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003700 A725C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-BPmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 1B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0000833 A725C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-BPmut nucleotide_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4D) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 G64GRGTPG Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K18 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000669 W247* Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-563 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC1795.06) PMID:10792724 4896 2012-01-17 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000537 W247* Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-563 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC1296.03c) PMID:10792724 4896 2011-10-12 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000303 W247* Not assayed or wild type 972 h- h- sxa2 sxa2-563 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000090 PMID:1549128 4896 2013-08-13 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000022 W247* Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-563 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000090 PMID:1549128 4896 2013-08-13 PomBase SPAC1687.05 FYPO:0000443 C321S,H323A,C326S Not assayed or wild type 972 h- pli1 pli1-C321S-H323A-C326S amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.11c) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 2B and C) PomBase SPAC1687.05 FYPO:0002778 C321S,H323A,C326S Not assayed or wild type 972 h- pli1 pli1-C321S-H323A-C326S amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:39786922 4896 2025-01-31 (Fig. 2A) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001384 K69R Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:11250892 4896 2017-07-24 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001645 K69R Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.06) PMID:18057023 4896 2024-04-12 (Fig. 2B) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 K69R Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000535 K69R Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11250892 4896 2017-07-24 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002967 K69R Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K69R Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K69R Not 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FYPO:0000703 K69R Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K69R Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC26H5.05) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 K69R Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-K69R plo1-K65R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPCC74.09 FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP mug24 mug24+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC27E2.06c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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596-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta38C klp9(delta38C) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure S4C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006644 596-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta38C klp9(delta38C) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC725.12) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure S4C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006644 596-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta38C klp9(delta38C) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC336.15) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figure S4C) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006642 596-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta38C klp9(delta38C) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures 1G and 1I; Figure S1F) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0000324 596-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta38C klp9(delta38C) 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2019-02-07 PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0001492 C233Y Not assayed or wild type 972 h- wat1 wat1-17 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:36481249 4896 2023-04-12 wat1Δ and wat1-17 mutant cells were a little elongated with an average size of 18.5 μm (Fig. 3A and 3B). PomBase SPBC21B10.05c FYPO:0002177 C233Y Not assayed or wild type 972 h- wat1 wat1-17 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:24586893 4896 2014-06-11 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0000725 deletion 972 h- SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.15 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC14C8.15 SPBC14C8.15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0005547 319-385 Not assayed or wild type 972 h- vps3844 vps3844-delta319-385 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:39477503 4896 2024-11-08 1 showed that the signal peptide and the transmembrane including DUF3844 domain were 2 essential for this function (Fig. 4A). PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000169 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000151 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000121 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:11676924 4896 2015-05-27 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0003066 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 ~82 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. 1B) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0003066 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001894 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0006366 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:11676924 4896 2015-05-27 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0006366 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002702 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002907 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:23188080 4896 2020-10-15 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004604 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0005937 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:31289327 4896 2019-08-28 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000581 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 PMID:11676924 4896 2015-05-27 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000581 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 PMID:11676924 4896 2015-05-27 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 high PMID:29422503 4896 2018-02-14 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 high PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 high PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5A) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 PMID:31289327 4896 2019-08-28 (Fig. S2) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001807 high PMID:21217703 4896 2023-02-16 Consistent with the published results, deletion of taz1+ or rap1+ from yeast cells resulted in a dramatic increase in telomere length and length heterogeneity compared to wild-type cells (Fig. 6c). PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 high PMID:29774234 4896 2018-06-08 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 PMID:11676925 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 high PMID:17429064 4896 2016-06-24 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 deletion 972 h- ccq1+ rap1 rap1delta deletion ECO:0000337 high PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph rap1 rap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000657 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(GO:0016591),assayed_using(SO:0001923) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004575 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000226 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004656 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:31289327 4896 2019-08-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004656 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.17) PMID:31289327 4896 2019-08-28 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0005917 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11),assayed_transcript(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 5B) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0006267 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:25778919 4896 2017-10-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004791 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0001232 PMID:22959349 4896 2015-09-22 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004573 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000291 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002908 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002908 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000780 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001923) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000780 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001925) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000780 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001924) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000780 deletion 972 h- rap1 rap1delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001926) 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PMID:15546162 4896 2012-07-18 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0007094 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 2D) PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002681 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:20144990 4896 2016-01-12 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002672 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000246 PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002672 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000253 PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002988 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:22992726 4896 2013-12-09 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002988 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:22992726 4896 2013-12-09 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002988 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000208 PMID:36302945 4896 2023-04-11 (Figure 1) Cells with leucine auxotrophy (leu1-32 strain) show weak growth on the synthetic medium EMM supplemented with 0.2 mM leucine (Fig. 1B). EMM contains 0.5% NH4Cl PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0001987 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8625425 4896 2019-09-27 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0000111 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC1A4.02c FYPO:0002701 G46E Not assayed or wild type 972 h- leu1 leu1-32 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-20 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001037 T142A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-T142A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 T142A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-T142A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp10 prp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp10 prp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- prp10 prp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp10 prp10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002357 L47R Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-L47R uaf2-T47R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPAP8A3.06 FYPO:0002060 L47R Not assayed or wild type 972 h- uaf2 uaf2-L47R uaf2-T47R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15121844 4896 2014-08-05 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 T1972D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001037 T1972D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001020 T1972D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001164 T1972D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000961 T1972D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001103 T1972D Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-T1972D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000005 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000393 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Figure 4A,S2A) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000005 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000399 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Figure 4A,S2A) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000164 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000394 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Figure 4B and Figure S2B) Also in the Table 3. The pbr1-8 mutation partially suppresses the slowing cytokinesis caused by lethal concentrations of caspofungin, suggesting that besides Bgs4, this drug affects other Bgs subunits (Bgs1 and/or Bgs3) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000417 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000400 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Figure 3B,S1B) Also in the Table 3. Cytokinesis is blocked in both wild-type and pbr1-8 strains treated with lethal concentrations of the echinocandin drug anidulafungin, suggesting that this drug affects the function of Bgs4 and Bgs1 and/or Bgs3 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001970 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001969 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001406 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0000224 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0004893 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001367 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000396 PMID:34959732 4896 2022-01-10 Figure 5 and Figure S3. Also in the Table 3. PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001367 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000399 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Figure 3A and Figure S1A. Table 3) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001367 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000394 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Figure 4B, S2B, Table 3) The pbr1-8 mutation partially suppresses the slowing cytokinesis caused by lethal concentrations of caspofungin, suggesting that besides Bgs4, this drug affects other Bgs subunits (Bgs1 and/or Bgs3) PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001367 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000397 PMID:34959732 4896 2022-01-10 Figure 5 and Figure S3. Also in the Table 3. PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001192 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-01 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001357 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-01 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001964 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005152 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005150 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001963 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001963 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001965 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7592316 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0005151 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001190 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21115488 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002060 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000397 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Table 5 and Figure S3, and Figure S4C) Vegetative cell lysis caused by lethal and sublethal concentrations of micafungin is suppressed in the pbr1-8 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002060 E700V Not assayed or wild type 972 h- bgs4 pbr1-8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000396 PMID:34959732 4896 2022-01-10 (Table 5 and Figure S3, and Figure S4C) Vegetative cell lysis caused by lethal and sublethal concentrations of micafungin is suppressed in the pbr1-8 PomBase SPCC794.16 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.16 SPCC794.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.16 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.16 SPCC794.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.16 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.16 SPCC794.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC794.16 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPCC794.16 SPCC794.16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0005258 I:4531070..4531631 Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996((-74)-487) SPNCRNA.248OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0009028 I:4531070..4531631 Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996((-74)-487) SPNCRNA.248OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0009031 I:4531070..4531631 Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996((-74)-487) SPNCRNA.248OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.996 FYPO:0000111 I:4531070..4531631 Overexpression 972 h- SPNCRNA.996 SPNCRNA.996((-74)-487) SPNCRNA.248OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000242 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002887 V152R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-V152R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 V152R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-V152R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 V152R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-V152R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 V152R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-V152R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC800.03),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002687 V152R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-V152R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPBC1604.25 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph pet117 pet117delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.25 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pet117 pet117delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 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PomBase SPBC16E9.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pub3 pub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16E9.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pub3 pub3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000620 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22184248 4896 2019-07-11 (Fig. 1B) As shown in Fig. 1B, when Mph1-KD was expressed from pREP41, it caused a weak growth inhibition, which was partially relieved by deletion of mad2+ or mph1+, indicating that expression of Mph1-KD from pREP41 caused a weak delay in mitotic progression as well as a growth defect for a reason unrelated to the checkpoint activation. We speculate that partially degraded Mph1-KD proteins (Fig. S2B) might be toxic to some extent. PomBase SPBC106.01 FYPO:0000141 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001384 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC106.01),assayed_substrate(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 1b) PomBase SPBC106.01 FYPO:0001384 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC106.01),assayed_substrate(PomBase:SPBC106.01) PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001384 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC106.01) PMID:22521786 4896 2013-11-26 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001269 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22521786 4896 2013-11-25 PomBase SPBC106.01 FYPO:0002678 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:22521786 4896 2013-11-26 PomBase SPBC106.01 FYPO:0005781 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:26882497 4896 2016-11-08 (Figure 2bc,5) PomBase SPBC106.01 FYPO:0005781 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26882497 4896 2016-11-08 (Figure 2bc,5) PomBase SPBC106.01 FYPO:0005781 D459A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0005782 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004156 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004357 D459A Not assayed or wild type 972 h- mad2-OP mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 1a) PomBase SPBC106.01 FYPO:0001645 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001645 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0002638 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22184248 4896 2019-07-11 We also examined localization of Mad2. Mad2 remained on kinetochores in more than 80% of the cells, indicating that the spindle checkpoint was kept active (Fig. S1 B and C) PomBase SPBC106.01 FYPO:0001840 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0004310 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000703 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0000094 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPBC106.01 FYPO:0001234 D459A Not assayed or wild type 972 h- mph1 mph1-kd mph1-kinase dead amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22184248 4896 2019-07-11 (Fig. 1B) As shown in Fig. 1B, when Mph1-KD was expressed from pREP41, it caused a weak growth inhibition, which was partially relieved by deletion of mad2+ or mph1+, indicating that expression of Mph1-KD from pREP41 caused a weak delay in mitotic progression as well as a growth defect for a reason unrelated to the checkpoint activation. We speculate that partially degraded Mph1-KD proteins (Fig. S2B) might be toxic to some extent. PomBase SPAC23C11.05 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ipp1 ipp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.05 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ipp1 ipp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- ipp1 ipp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C11.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ipp1 ipp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0003127 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0000335 FYECO:0000271 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0002780 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0000335 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0000637 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0001521 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0000335 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0003112 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.06) PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0001109 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAPYUG7.06 FYPO:0003113 wild type Overexpression 972 h- sdu1 mug67+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:24313451 4896 2014-02-13 PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 L384A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L384A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 L384A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L384A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 L384A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L384A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 L384A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L384A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 L384A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L384A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC959.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19054127 4896 2013-09-04 PomBase SPAC959.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC959.04c FYPO:0001407 deletion 972 h- omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19054127 4896 2013-09-04 PomBase SPAC959.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC959.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0002107 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 omh6 omh6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC959.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC959.04c FYPO:0001120 deletion 972 h- omh6 omh6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:19054127 4896 2013-09-04 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC959.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph omh6 omh6delta deletion ECO:0005638 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or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. 1F) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005300 601-676 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Fig. 1A, C-E) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001645 601-676 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-06-04 (Figure 1H) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 G43E Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M35 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000293 PMID:6828164 4896 2017-12-05 (Fig. 1A) The transition point for cdc2 is 0.66 using cdc2.M35 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 G43E Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-M35 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 high 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PomBase SPBC29B5.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 isp4 isp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 swi6::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 swi6 swi6::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0003659 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC1851.03 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0002834 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000049 high PMID:19136623 4896 2024-07-02 disruption of ckb1 alleviated the silencing of marker genes inserted in centromeric heterochromatin (Fig. 1A,B). PomBase SPAC1851.03 FYPO:0003352 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC1851.03 FYPO:0008200 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000226 PMID:19136623 4896 2024-07-02 In contrast, levels of H3K9me and Swi6 at imr::ura4 were significantly decreased in clr3D and ckb1D cells (Fig. 1C). PomBase SPAC1851.03 FYPO:0003571 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000226 low PMID:19136623 4896 2024-07-02 H3K9me on the ura4 inserted at the mating locus heterochromatin (Kint2 ::ura4) was hardly affected by deletion of either atf1 or dcr1, an essential component of the RNAi-directed pathway (Fig. 1D). PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000470 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001382 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPAC23C11.11),assayed_substrate(PomBase:SPAC458.03) PMID:27935167 4896 2019-12-12 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0006599 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19136623 4896 2024-07-02 Similarly, Clr3 and Mit1 localization was decreased in ckb1D and swi6-S18-117A mutants, although this decrease was less in swi6-S18-117A than in ckb1D cells. PomBase SPAC1851.03 FYPO:0006599 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:19136623 4896 2024-07-02 Similarly, Clr3 and Mit1 localization was decreased in ckb1D and swi6-S18-117A mutants, although this decrease was less in swi6-S18-117A than in ckb1D cells. PomBase SPAC1851.03 FYPO:0002679 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19136623 4896 2024-07-02 The lesser mobility change in ckb1D cells than that of Swi6-S18-117A would reflect the partial phosphorylation of Swi6 by residual activity of CK2 in ckb1D cells (Fig. 2A,C). PomBase SPAC1851.03 FYPO:0002679 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19136623 4896 2024-07-02 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001838 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:31131414 4896 2020-03-19 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0004416 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:36779416 4896 2023-03-05 Phosphate starvation did not induce ecl3+ expression in Δckb1 cells, indicating that the induction was dependent on Ckb1 (Fig. 2B) PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000200 PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 high PMID:36779416 4896 2023-03-02 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0004380 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 6B) PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001460 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0003235 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000226 PMID:19136623 4896 2024-07-02 Both H3K9me and Swi6 were enriched on centromeric repeats (dg223) in ckb1D cells similar to wild-type or clr3D cells (Fig. 1C). PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000833 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. 6A) PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000946 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckb1 ckb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:36779416 4896 2023-03-02 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ckb1 ckb1delta deletion ECO:0005638 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lem2-shut-off bqt4delta bqt4 bqt4delta141-262 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:38825008 4896 2025-04-19 All these fragments as well as wild-type Bqt4 (FL) were localized to the NE (Fig. 1C), suggesting that the lethality was not caused by the loss of NE localization. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002060 141-262 Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4delta bqt4 bqt4delta141-262 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-19 Upon shut-off of lem2, the cells expressing D1-140 and D259 to 383 fragments of Bqt4 did not grow, whereas the cells expressing D141 to 262 did (Fig. 1B) PomBase SPCC1739.10 FYPO:0002849 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000235 PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0001128 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0002850 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-11 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0000674 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0000426 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0000059 PMID:21652630 4896 2013-11-11 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0002442 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0002442 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0002442 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13F5.06c) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0001587 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0001587 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0001587 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13F5.06c) PMID:21652630 4896 2013-11-07 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0001945 deletion 972 h- mug33 mug33delta deletion ECO:0005801 PMID:21652630 4896 2013-11-08 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug33 mug33delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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2014-01-09 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0000705 1-157 Not assayed or wild type 972 h- pdp1 pdp1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.13),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.12) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000444 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0005580 PMID:12058079 4896 2014-10-21 PomBase SPBC887.14c FYPO:0000470 deletion 972 h- h90 pfh1 pfh1delta deletion ECO:0000059 low PMID:18388861 4896 2024-07-12 None of the single helicase and essential topoisomerase 3 (in rqh1D background) mutant strains exhibit MT switching and/or viability defect, except for the pfh1 mutant where a mild MT switching defect was observed (Table I, data not shown). PomBase SPBC887.14c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002262 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 PMID:12058079 4896 2014-10-21 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002262 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfh1 pfh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0005638 PMID:12058079 4896 2014-10-21 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0005638 PMID:12409464 4896 2014-09-19 PomBase SPBC887.14c FYPO:0002239 deletion 972 h- pfh1 pfh1delta deletion ECO:0000337 PMID:12058079 4896 2014-10-21 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta pfh1 pfh1delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000303 808-817 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:9606213 4896 2021-02-24 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003626 808-817 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:9606213 4896 2021-02-24 (slightly increased- In fact, more cells had staining at their tips than wild-type cells, probably indicating a prolonged attempt to conjugate, after which the protein delocalizes) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0003626 808-817 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.15c) PMID:9606213 4896 2021-02-24 (Fig. 7) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007658 808-817 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1deltaFH1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9606213 4896 2021-02-24 PomBase SPCC191.07 FYPO:0000078 deletion 972 h- cyc1 cyc1delta deletion ECO:0000059 PMID:18808426 4896 2014-08-14 PomBase SPCC191.07 FYPO:0001934 deletion 972 h- cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 PMID:23832353 4896 2013-08-02 PomBase SPCC191.07 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC191.07 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cyc1 cyc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC191.07 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functions were not specific to S. cerevisiae, as these mutations also rescued SpHsp90-EA mediated temperature sensitivity in Sz. pombe (Fig. 5d). PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 1-232,608-778 Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2(233-607) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.05),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000007 wild type Overexpression 972 h- rqh1 rqh1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000260 PMID:9566891 4896 2019-11-07 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0003165 wild type Overexpression 972 h- rqh1 rqh1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000260 PMID:9566891 4896 2019-11-07 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0005704 wild type Overexpression 972 h- rqh1 rqh1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9566891 4896 2019-11-07 PomBase SPAC15A10.17 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph coa2 coa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15A10.17 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph coa2 coa2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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SPCC1840.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1840.07c SPCC1840.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1840.07c SPCC1840.07cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.14 FYPO:0001944 1-644 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 PomBase SPCC736.14 FYPO:0003186 1-644 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 (Fig. 2C) PomBase SPCC736.14 FYPO:0002967 1-644 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 (Fig. 2C) PomBase SPBC646.13 FYPO:0009111 wild type Overexpression 972 h- leu1-32 h- sds23 sds23+ sds23OE wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000226,FYECO:0000381 high PMID:35924983 4896 2023-07-06 (Figure 7) PomBase SPBC646.13 FYPO:0002020 wild type Overexpression 972 h- sds23 sds23+ sds23OE wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:19682301 4896 2014-11-24 PomBase SPBC646.13 FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- sds23 sds23+ sds23OE wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:20536828 4896 2014-06-23 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 F683A,F684A,L687A,F688A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-helix* Helix*-mid1 amino_acid_mutation ECO:0001232 20 PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 1B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 F683A,F684A,L687A,F688A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-helix* Helix*-mid1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S3A) PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0001355 P112S 972 h- drc1 drc1-P112S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2011-11-18 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007661 827-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1(1-826) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:16360688 4896 2024-04-24 , Sgo1 is seen as nuclear staining with punctate dots of fluorescence along the spindle (Figure 1D and [2, 9]). This localization is abolished in a bub1D background but preserved in the truncated mutants (Figure 1D), although the signal intensity was variable; in bub11-585, Sgo1 staining was as strong as in the wild-type, but it was weaker in bub11-179 and bub11-826 backgrounds. We conclude that the N terminus of Bub1 is sufficient to promote correct Sgo1 localization and function during MI. PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4F10.16c SPAC4F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0001168 S1363A,S1364A Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-2A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:30635402 4896 2019-01-25 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0000228 S1363A,S1364A Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-2A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000342 PMID:30635402 4896 2019-01-25 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002053 S1363A,S1364A Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-2A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:30635402 4896 2019-02-06 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0002243 ATTTTT342CTCGAG Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1-PAS-mut nucleotide_mutation ECO:0005801 medium PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. S6) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002060 S369E,S369E Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-2SE amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-22 As predicted, the 4KRA mutant did not restore lethality upon shut-off, whereas the other three mutants did (Fig. 4C) PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0006207 deletion 972 h- gmf1 gmf1delta deletion ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-08 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph gmf1 gmf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0001366 deletion 972 h- gmf1 gmf1delta deletion ECO:0001232 PMID:20517925 4896 2019-11-08 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gmf1 gmf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph gmf1 gmf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph gmf1 gmf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17H9.11 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph gmf1 gmf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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amino_acid_mutation ECO:0001232 50 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Figures 5C) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004083 F46A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F46A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:30462301 4896 2019-10-03 Supplementary Figure S7E PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005612 F46A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F46A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Figure S4A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006515 F46A Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-F46A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:30462301 4896 2019-10-02 (Supplementary Figure S5B) PomBase SPBP23A10.12 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph frg1 frg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.12 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph frg1 frg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.12 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assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:23066505 4896 2017-01-18 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0005419 deletion 972 h- mic60 mic60delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:38692277 4896 2024-06-26 the absence of MICOS subunits caused characteristic alterations in mitochondrial morphology (Figure 1A). PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0003393 deletion 972 h- mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:38692277 4896 2024-06-26 disruption of cristae architecture through loss of the core MICOS subunit Mic60 caused a growth defect specifically on media that requires respiration (Figure 1D). PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mic60 mic60delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- mic60 mic60delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic60 mic60delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mic60 mic60delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 R33A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-R33A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000038 PMID:16341225 4896 2014-10-30 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0001571 G23V Not assayed or wild type 972 h- rho4 rho4-G23V amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.04),assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0002033 S377A,S526A,S698A Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-3A fin1.3A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000346 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),residue(T75,T78) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 4F) T75 T78 no longer phosphorylated and dis2 remains bound to cut12 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0007385 S377A,S526A,S698A Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-3A fin1.3A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000346 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 4F) dis2 remains bound to cut12 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001422 N408E Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-N408E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001838 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 1C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001365 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 3A, 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004854 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 4A, 4B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006853 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 2A, 2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001677 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 1D-G) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001571 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 4C, 4D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0005905 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 3A, 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006008 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S2A, S2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006008 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S2C) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002873 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 3D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002874 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 3A, 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002874 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S2A, S2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002874 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S2A, S2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002874 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S2A, S2B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0007474 S110A,S127A,S218A,S227A,S329A,S432A,S452A,S464A,S531A Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 4E) PomBase SPAC4F10.15c FYPO:0000744 wild type Overexpression 972 h- wsp1 wsp1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.15c) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC4F10.15c FYPO:0000024 wild type Overexpression 972 h- wsp1 wsp1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC31G5.15 FYPO:0001164 deletion 972 h- psd3 psd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:19286980 4896 2013-09-16 PomBase SPAC31G5.15 FYPO:0001164 deletion 972 h- psd3 psd3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19286980 4896 2013-09-16 PomBase SPAC31G5.15 FYPO:0001164 deletion 972 h- psd3 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972 h- fus1 fus1N-for3C fusion_or_chimera ECO:0001232 medium PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002061 K45E Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-K45E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. S2) and text PomBase SPBC713.06 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph adl1 adl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.06 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph adl1 adl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.06 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 adl1 adl1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC713.06 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 adl1 adl1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC713.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph adl1 adl1delta deletion 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4896 2014-11-28 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0000941 deletion 972 h- dlc1 dlc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:21965289 4896 2012-11-13 To our surprise, although loss of Msd1 or Alp7 had little or no effect on Nsk1 localization, we were unable to observe Nsk1 at the spindle pole in the absence of Dlc1 in fixed-cell preparations (Figure 6A). PomBase SPAC1805.08 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph dlc1 dlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph dlc1 dlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph dlc1 dlc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0004089 deletion 972 h- dlc1 dlc1delta deletion ECO:0000059 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0001324 deletion 972 h- dlc1 dlc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0000513 deletion 972 h- dlc1 dlc1delta deletion ECO:0001232 PMID:11907273 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1805.08 FYPO:0002638 deletion 972 h- dlc1 dlc1delta deletion ECO:0000059 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC1805.08 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2024-05-31 (Fig. S1E and F) PomBase SPAC1834.06c FYPO:0003328 L79H Not assayed or wild type 972 h- 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0000012 L79H Not assayed or wild type 972 h- 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0003326 L79H Not assayed or wild type 972 h- 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0002442 L79H Not assayed or wild type 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0002967 L79H Not assayed or wild type 972 h- 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC21.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0000091 L79H Not assayed or wild type 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000227 high PMID:38442865 4896 2024-05-29 (Fig. S1) PomBase SPAC1834.06c FYPO:0000021 L79H Not assayed or wild type 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0001491 L79H Not assayed or wild type 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC1834.06c FYPO:0002060 L79H Not assayed or wild type 972 h- pmo25 pmo25-35 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC27E2.12 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.12 SPAC27E2.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.12 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.12 SPAC27E2.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 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PomBase SPBC12D12.06 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph srb11 srb11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.06 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph srb11 srb11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.06 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph srb11 srb11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.06 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph srb11 srb11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.06 FYPO:0002546 deletion 972 h- h- prototroph srb11 srb11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.06 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph srb11 srb11delta deletion ECO:0005638 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I PomBase SPCC132.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC132.03 SPCC132.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC132.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC132.03 SPCC132.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC132.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC132.03 SPCC132.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26A3.16 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph dsk2 dsk2delta dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26A3.16 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dsk2 dsk2delta dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC26A3.16 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dsk2 dsk2delta dph1delta deletion 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cdr1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Supplementary Fig. 4) PomBase SPAC644.06c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PomBase SPAC644.06c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0000091 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC644.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cdr1 cdr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1464319 4896 2013-02-19 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:28924043 4896 2018-10-31 PomBase SPAC644.06c FYPO:0001492 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1464318 4896 2013-01-30 PomBase SPAC644.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 3) PomBase SPAC644.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Table 1) PomBase SPAC644.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 PMID:3453113 4896 2015-03-05 PomBase SPAC644.06c FYPO:0003481 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure S4F, S4G) PomBase SPAC644.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC644.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdr1 cdr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17H9.02 FYPO:0008148 unknown Not assayed or wild type 972 h- mtl1 mtl1-17 unknown ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 In contrast, deletion or mutation alleles of the MTREC complex lead to significant accumulation of all types of CUTs and also meiotic mRNAs. This effect is comparable to the level of CUT accumulation in the nuclear exosome subunit rrp6 deletion (Fig. 2a,b) PomBase SPAC17H9.02 FYPO:0008113 unknown Not assayed or wild type 972 h- mtl1 mtl1-17 unknown ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 Similar to previous reports, we detected significantly increased intronic reads in the exosome mutant rrp6D strain (Fig. 4a,b). PomBase SPAC17H9.02 FYPO:0002960 unknown Not assayed or wild type 972 h- mtl1 mtl1-17 unknown ECO:0000291 PMID:25989903 4896 2023-11-19 In contrast, deletion or mutation alleles of the MTREC complex lead to significant accumulation of all types of CUTs and also meiotic mRNAs. This effect is comparable to the level of CUT accumulation in the nuclear exosome subunit rrp6 deletion (Fig. 2a,b) PomBase SPAC8F11.10c FYPO:0003347 H168A Not assayed or wild type 972 h- pvg1 pvg1-H168A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:27194449 4896 2016-07-01 PomBase SPCC777.17c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC777.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC777.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC777.17c SPCC777.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0008145 deletion 972 h- etp1 etp1delta deletion ECO:0005801 high PMID:11248251 4896 2023-12-30 This was not true of the cox15 mutant which had a very low but detectable amount of heme O (Fig. 1). PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0008143 deletion 972 h- etp1 etp1delta deletion ECO:0005801 PMID:11248251 4896 2023-11-29 The two exceptions were the cox10 and cox15 mutants, both of which lacked heme A. In agreement with earlier results the cox10 mutant also had no heme O [4]. This was not true of the cox15 mutant which had a very low but detectable amount of heme O (Fig. 1). PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0008144 deletion 972 h- etp1 etp1delta deletion ECO:0005801 PMID:11248251 4896 2023-12-30 In agreement with earlier results the cox10 mutant also had no heme O [4]. This was not true of the cox15 mutant which had a very low but detectable amount of heme O (Fig. 1). PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 etp1 etp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0002482 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 etp1 etp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 etp1 etp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- etp1 etp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22E12.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 etp1 etp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B9.02c FYPO:0000082 K331A Not assayed or wild type 972 h- sck1 sck1-K331A sck1KD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 low PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 2) PomBase SPAC1B9.02c FYPO:0005258 K331A Not assayed or wild type 972 h- sck1 sck1-K331A sck1KD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 2) PomBase SPAC1B9.02c FYPO:0001357 K331A Not assayed or wild type 972 h- sck1 sck1-K331A sck1KD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 2) PomBase SPAC1B9.02c FYPO:0001357 K331A Not assayed or wild type 972 h- sck1 sck1-K331A sck1KD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 2) PomBase SPCC162.03 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC162.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC162.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC162.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC162.03 SPCC162.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC737.08 FYPO:0006781 D1123E Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-D1123E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-12-03 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000705 S438A,T527A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-SATA amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:11818066 4896 2021-01-11 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000705 S438A,T527A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-SATA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:11818066 4896 2021-01-11 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0005041 S438A,T527A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-SATA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:22144909 4896 2015-11-04 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002680 S438A,T527A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-SATA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:22144909 4896 2015-11-04 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000705 S438A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-S438A mei2-SA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:10788621 4896 2015-12-02 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0001645 S438A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-S438A mei2-SA amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:11818066 4896 2021-01-11 PomBase SPAC4D7.10c FYPO:0001216 424-473 Not assayed or wild type 972 h- spt20 spt20-423 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 PMID:31748520 4896 2023-09-05 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002061 T316A Overexpression 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7957097 4896 2015-12-04 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002061 T316A Overexpression 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8978689 4896 2024-12-05 (Figure ID, -Thi, Dis2),which allows for colony formation. Cells producing the mutant T316A protein under the strong promoter, on the other hand, severely blocked colony formation (Figure ID,-Thi,Dis2T316A) PomBase SPBC776.02c FYPO:0002104 T316A Overexpression 972 h- dis2 dis2-T316A dis2-APPR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7957097 4896 2015-12-04 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-312 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27(313-372) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0000082 E42P Not assayed or wild type 972 h- mzt1 mzt1-E42P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23885124 4896 2013-11-01 PomBase SPAC9G1.15c FYPO:0000091 E42P Not assayed or wild type 972 h- mzt1 mzt1-E42P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23885124 4896 2013-11-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 S604E Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-S604E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0000161 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11870208 4896 2022-09-18 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002872 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18184749 4896 2023-11-01 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002560 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0000731 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002023 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 94 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0003000 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 1D-G) PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002998 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:24127216 4896 2013-12-11 (Fig. 1A) PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0004481 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002561 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18256290 4896 2014-06-06 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002561 F1355S Not assayed or wild type 972 h- cdc12 cdc12-112 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18272786 4896 2018-01-26 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0001880 F1355S Not assayed or wild type 972 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(Supplementary Fig. S3B). PomBase SPCC737.08 FYPO:0006780 L1113F Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-L1113F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-12-03 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85S Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGSGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, protein stable, complements partially sde2Δ PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0007043 D352A,H353A Null 972 h- pho2Δ pho8Δ pho8 pho8-m2 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:31239353 4896 2019-08-01 (Figure 5B) PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0007054 D352A,H353A Null 972 h- pho2Δ pho8Δ pho8 pho8-m2 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000177 assayed_using(PomBase:SPBC14F5.13c) PMID:31239353 4896 2019-08-09 (Figure 5D) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000703 1-269 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-270-426 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 2) PomBase SPBC2G5.07c FYPO:0001971 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc25 rpc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G5.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpc25 rpc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2G5.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpc25 rpc25delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 K62R Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-K62R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPBC119.02 FYPO:0002768 D28R Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-D28R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPAC13G6.01c FYPO:0006810 L231A,E232A,R233A Not assayed or wild type 972 h- rad8 rad8-HIRAN amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:34292936 4896 2021-07-30 PomBase SPBC354.05c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 sre2 sre2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC354.05c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP sre2 sre2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC4C3.10c FYPO:0001387 disruption Not assayed or wild type 972 h- pre3 mts8-1 disruption ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4C3.10c FYPO:0000067 disruption Not assayed or wild type 972 h- pre3 mts8-1 disruption ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4C3.10c FYPO:0000073 disruption Not assayed or wild type 972 h- pre3 mts8-1 disruption ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4C3.10c FYPO:0004025 disruption Not assayed or wild type 972 h- pre3 mts8-1 disruption ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPBC4C3.10c FYPO:0000767 disruption Not assayed or wild type 972 h- pre3 mts8-1 disruption ECO:0005638 PMID:23209828 4896 2016-11-28 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006892 386-920,K260A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)K260A asp1-(1-385)K260A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPAC16.01 FYPO:0001571 G17V,C197S Not assayed or wild type 972 h- rho2 rho2-G17V,C197S rho2-G17V,C198S amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC16.01),assayed_using(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001571 G17V,C197S Not assayed or wild type 972 h- rho2 rho2-G17V,C197S rho2-G17V,C198S amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC16.01),assayed_using(PomBase:SPAC17G8.14c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S423A,S425A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S423A,S425A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 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2021-08-11 PomBase SPBC1347.07 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rex2 rex2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1347.07 FYPO:0000245 deletion 972 h- rex2 rex2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC1347.07 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rex2 rex2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1347.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rex2 rex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rex2 rex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rex2 rex2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 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(Fig. 3C) PomBase SPBC1604.18c FYPO:0000941 deletion 972 h- cmp7 cmp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.07c) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3C) PomBase SPBC1604.18c FYPO:0000941 deletion 972 h- cmp7 cmp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC9E9.14) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3C) PomBase SPBC1604.18c FYPO:0000941 deletion 972 h- cmp7 cmp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.01) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3C) PomBase SPBC1604.18c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion 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(Fig. 1C) PomBase SPBC1604.18c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.18c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cmp7 cmp7delta deletion 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G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002720 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000227 medium PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001190 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:12206652 4896 2014-08-19 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000021 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000228 high PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000647 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000025,FYECO:0000229 medium PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000647 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002060 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0002104 G2086A Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000227 high PMID:9689051 4896 2014-09-05 PomBase SPNCRNA.1562 FYPO:0000684 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1562 SPNCRNA.1562+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000072 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1562 FYPO:0007931 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1562 SPNCRNA.1562+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 wild type Overexpression 972 h- rap1 rap1+ wild_type ECO:0000337 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000733 E575P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-E575P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure S2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000069 E575P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-E575P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2f) PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000082 476-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta476-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0002287 476-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta476-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1B3.03c) PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0002806 476-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta476-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 476-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta476-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 476-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta476-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000844 476-609 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta476-609 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0003955 wild type Overexpression 972 h- dga1 dga1+ nmt81::dga1 wild_type ECO:0000335 PMID:12963726 4896 2014-10-28 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000941 360-471 Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-N sid1N partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:11384993 4896 2020-12-30 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0000705 360-471 Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-N sid1N partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09),assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:11384993 4896 2020-12-30 PomBase SPAC9G1.09 FYPO:0001382 360-471 Not assayed or wild type 972 h- sid1 sid1-N sid1N partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:11384993 4896 2020-12-30 PomBase SPCC757.11c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC757.11c SPCC757.11cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC757.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.11c SPCC757.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.11c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.11c SPCC757.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.11c SPCC757.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC757.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC757.11c SPCC757.11cdelta deletion ECO:0005638 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that over-production of Duc1 indeed reduced Opy1-mNG at the PM by ~35% (Fig. 5C,D). PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0002127 wild type Overexpression 972 h- opy1 opy1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Figure S3) PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0000339 wild type Overexpression 972 h- opy1 opy1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Figure 4E-F) PomBase SPCPB16A4.02c FYPO:0002674 wild type Overexpression 972 h- opy1 opy1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:33172987 4896 2020-11-18 (Fig. S2B) PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001118 528-649 Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 73 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001382 528-649 Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005 high assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000581 528-649 Not assayed or wild 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FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 asl1 asl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G6.10c FYPO:0006616 deletion 972 h- asl1 asl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1B) PomBase SPAC13G6.10c FYPO:0002104 deletion 972 h- asl1 asl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-04-10 Table 1 PomBase SPAC821.08c FYPO:0000703 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-deltaC-box,deltaIR unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c),assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:18331722 4896 2019-07-11 PomBase SPAC4A8.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4A8.02c SPAC4A8.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4A8.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC4A8.02c SPAC4A8.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 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h- SPAC4A8.02c SPAC4A8.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4A8.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4A8.02c SPAC4A8.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC4A8.02c SPAC4A8.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPSNORNA.43 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR91 snR91delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201 PMID:15716270 4896 2014-08-15 PomBase SPSNORNA.43 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR91 snR91delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:15716270 4896 2014-08-15 PomBase SPSNORNA.43 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR91 snR91delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000201 PMID:15716270 4896 2014-08-15 PomBase SPSNORNA.43 FYPO:0003699 deletion 972 h- snR91 snR91delta deletion ECO:0000337 PMID:15716270 4896 2014-08-19 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002399 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC227.01c FYPO:0007800 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:33536395 4896 2021-06-10 In contrast, gmn2∆ cells missorted and secreted a significant amount of BiP to the cell surface. These results indicate that Gmn2p is required for normal retention of a luminal ER protein in S. pombe cells. PomBase SPAC227.01c FYPO:0007800 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:33536395 4896 2021-06-10 In contrast, gmn2∆ cells missorted and secreted a significant amount of BiP to the cell surface. These results indicate that Gmn2p is required for normal retention of a luminal ER protein in S. pombe cells. PomBase SPAC227.01c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0001911 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC191.11) PMID:33536395 4896 2021-06-10 (Fig. 3B) PomBase SPAC227.01c FYPO:0004786 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.05c) PMID:33536395 4896 2021-06-10 As expected, Och1-EGFP expressed in the wild type strain showed strong fluorescence as a typical Golgi-like dots, but faint fluorescent dots were confirmed in gmn2∆ cells (Fig. 4A). PomBase SPAC227.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000650 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000233 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002401 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC227.01c FYPO:0007288 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000337 PMID:33536395 4896 2021-06-10 (Fig. 3C) PomBase SPAC227.01c FYPO:0004325 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000106 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 high PMID:33536395 4896 2021-06-10 The gmn2∆ cells were highly sensitive to hygromycin B, being unable to grow on YES plates containing 25 μg/ml of the drug (Fig. 3A) PomBase SPAC227.01c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC227.01c FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC227.01c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC227.01c FYPO:0001234 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:33536395 4896 2021-06-10 The gmn2∆ cells were found to be viable despite growing slightly slower than the wild type (Fig. 3A MM (leu-)) and exhibited the same phenotypes as those of the original gmn2 mutant. PomBase SPAC227.01c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPAC227.01c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC227.01c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 erd1 erd1delta sgm2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC569.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC569.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC569.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC569.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC569.02c SPCC569.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 oxa102 oxa102delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0003730 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:16911509 4896 2014-08-21 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0003730 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:10712694 4896 2014-10-21 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0003690 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000139 PMID:10712694 4896 2012-06-20 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr oxa102 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FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0000440 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16911509 4896 2014-08-21 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0000440 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10712694 4896 2012-06-20 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxa102 oxa102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- oxa102 oxa102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10712694 4896 2012-06-20 PomBase SPBP4H10.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 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2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-ts3 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002960 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-ts3 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:20512112 4896 2015-05-26 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002173 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-ts3 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC11E10.03) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002173 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-ts3 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC428.07) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002173 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-ts3 unknown ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.13c) PMID:16823445 4896 2014-01-09 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002173 unknown Not assayed or wild type 972 h- mmi1 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ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002048 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 PMID:2038319 4896 2013-01-31 PomBase SPBC21.05c FYPO:0000551 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ral2 ral2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPBC21.05c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ral2 ral2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC21.05c FYPO:0000280 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0005638 PMID:2586528 4896 2014-07-31 PomBase SPBC21.05c FYPO:0000280 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0005638 PMID:9133664 4896 2014-09-18 PomBase SPBC21.05c FYPO:0006617 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1A) PomBase SPBC21.05c FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002380 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 PMID:2586528 4896 2014-07-31 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ral2 ral2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002106 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 PMID:2586528 4896 2014-07-31 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21.05c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ral2 ral2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC21.05c FYPO:0006616 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1B) PomBase SPBC21.05c FYPO:0006616 deletion 972 h- ral2 ral2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-04-10 Table 1 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002019 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0000337 PMID:17671430 4896 2014-03-04 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hob1 hob1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000426 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 low PMID:12569356 4896 2024-06-11 Thus, unlike RVS167 in budding yeast, hob1+ was dispensable for endocytosis in fission yeast. PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 hob1 hob1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000744 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.15c) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000090 low PMID:12569356 4896 2024-06-11 On nitrogen-poor medium or on medium of high osmolarity (i.e. YE/250 mm NaCl), we observed no differences in the growth of hob1+ and hob1D cells (Figure 2c). PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001357 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002344 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 PMID:17671430 4896 2014-03-04 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002344 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 low PMID:12569356 4896 2024-06-11 Treatment of hob1D cells with the DNA strand-breaking drug phleomycin, a bleomycin analog that is cytotoxic to yeasts (Pramanik et al., 1995), resulted in a marked hypersensitivity in hob1D cells (Figure 4a). In PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph hob1 hob1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0000268 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 low PMID:12569356 4896 2024-06-11 UV irradiation resulted in the same phenotypes as those seen in the case of phleomycin: hob1D cells were more sensitive to the effects of UV irradiation than wild-type cells, while hob3D cells were as resistant to UV as were their wild-type cohorts (Figure 4b). PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0001492 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 low PMID:12569356 4896 2024-06-11 Microscopic examination of hob1D cells revealed them to be slightly but not significantly elongated, relative to an isogenic hob1+ strain (Figure 2b). PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21D10.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- hob1 hob1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0003138 deletion 972 h- omt2 omt2delta deletion ECO:0001232 PMID:12786945 4896 2014-07-17 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0003066 deletion 972 h- omt2 omt2delta deletion ECO:0001232 PMID:12786945 4896 2014-07-17 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0000478 deletion 972 h- omt2 omt2delta deletion ECO:0001232 PMID:12786945 4896 2014-07-17 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0000579 deletion 972 h- omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 PMID:12786945 4896 2014-07-17 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph omt2 omt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- omt2 omt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 omt2 omt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 omt2 omt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000705 R188E Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-R188E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.04c),assayed_protein(PomBase:SPCC550.05) PMID:35011726 4896 2022-10-17 Among the Nse1-bound factors, we repeatedly observed the Ubc13, Mms2, and Uba1 (Data File S1A,B, Data File S2A-C—ProteomeXchange: PXD029573, and Table S3). PomBase SPCC550.05 FYPO:0001913 R188E Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-R188E amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:35011726 4896 2022-10-17 (Figure 2D PomBase SPCC550.05 FYPO:0000088 R188E Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-R188E amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:35011726 4896 2022-10-14 (Figure 3A) ubiquitin ligase mutant PomBase SPCC550.05 FYPO:0000089 R188E Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-R188E amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:35011726 4896 2022-10-14 (Figure 3A) ubiquitin ligase mutant PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001245 W835* Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-W835* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPBC530.16 FYPO:0002061 deletion 972 h- ksh1 ksh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21270388 4896 2021-10-07 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0000267 wild type Overexpression 972 h- swi10 swi10+ wild_type ECO:0005638 PMID:8621070 4896 2014-09-24 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBCPT2R1.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBCPT2R1.03 SPBCPT2R1.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.627 FYPO:0000725 606-995 972 h- SPNCRNA.627 SPNCRNA.144delta606-995 SPNCRNA.144delta partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.627 FYPO:0007928 606-995 972 h- SPNCRNA.627 SPNCRNA.144delta606-995 SPNCRNA.144delta partial_nucleotide_deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.627 FYPO:0002546 606-995 972 h- SPNCRNA.627 SPNCRNA.144delta606-995 SPNCRNA.144delta partial_nucleotide_deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0000338 wild type Overexpression 972 h- prp17 prp17+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0004702 wild type Overexpression 972 h- prp17 prp17+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBPB2B2.16c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBPB2B2.16c SPBPB2B2.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPB2B2.16c FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBPB2B2.16c SPBPB2B2.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPB2B2.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBPB2B2.16c SPBPB2B2.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBPB2B2.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBPB2B2.16c SPBPB2B2.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBPB2B2.16c FYPO:0002104 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBPB2B2.16c SPBPB2B2.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000927 G281D Knockdown 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:28292899 4896 2019-04-23 (Fig. 7) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006868 G281D Knockdown 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:28292899 4896 2019-05-01 (Fig. 4 D-F) PomBase SPBC887.09c FYPO:0000703 1-499,801-886 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-500-800 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC887.09c) PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008406 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:40124504 4896 2025-04-12 As shown in Figure 1C, depletion of Oca3 leads to loss of Emc3, aggregation of Emc5, and normal ER localization, but reduced fluorescence levels of EMC6, revealing the requirement of Oca3 for the assembly of a functional EMC complex. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0007677 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0000059 high PMID:40124504 4896 2025-04-13 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008405 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1711.03) PMID:40124504 4896 2025-04-12 As shown in Figure 1C, depletion of Oca3 leads to loss of Emc3, aggregation of Emc5, and normal ER localization, but reduced fluorescence levels of EMC6, revealing the requirement of Oca3 for the assembly of a functional EMC complex. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0003766 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 however, clumps of mitochondrial DNA (mtDNA) were present in the cytoplasm of these mutant cells (Figure 2A). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0000080 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000237 high PMID:40124504 4896 2025-04-11 The oca3D strain produces compromised cells that can grow at 30°C but fail to grow at lower temperatures (routinely assessed at 20°C) (Figure 1D), a cold-sensitive phenotype that may reflect the loss of membrane lipid homeostasis,16,17 energy homeostasis,18,19 or other adaptive mechanisms required for growth at these environmental conditions. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0002321 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 As shown in Figure 4A, loss of EMC results in a marked increase in the ergosterol content in the oca3D mutant strain at both temperatures when compared to levels in wild-type cells. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0003769 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 Quantitative PCR analysis of target mtDNA sequences determined a 28% reduction in mtDNA molecules per cell in the mutant strain at 30C, exacerexacerbated at low temperature (37% reduction at 20C) (Figure 2B). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0001324 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1020.11c) PMID:40124504 4896 2025-04-12 As shown in Figure 1C, depletion of Oca3 leads to loss of Emc3, aggregation of Emc5, and normal ER localization, but reduced fluorescence levels of EMC6, revealing the requirement of Oca3 for the assembly of a functional EMC complex. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008407 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAP4C9.02) PMID:40124504 4896 2025-04-12 In oca3D cells, most of the Mdm34-GFP is delocalized into the abnormal mitochondria, indicating that EMC disfunction may interfere the assembly of ERMES components. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008407 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.07) PMID:40124504 4896 2025-04-12 In contrast to Mdm34-GFP, Ltc1-GFP lacks its normal ER-PM and ER-mitochondria localization (see Figure 3). This result indicates that Ltc1 localization is fully dependent on EMC activity. PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0003004 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 The accumulation of reactive oxygen species (ROS) is associated to mitochondrial dysfunctions.18 Remarkably, proliferating Oca3-depleted cells (at 30C) reach ROS levels similar to those found in wild-type cells subjected to oxidative stress (H2O2 treatment), indicating that EMC-deficient cells suffer mitochondrial stress (Figures S1A and S1B). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008410 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0000059 PMID:40124504 4896 2025-04-13 In contrast, BiP1-driven expression of mCherry-ADEL is greatly induced in Oca3/Emc2-depleted cells. The UPR senses the protein folding capacity of the ER,45 suggesting that EMC dysfunction may provoke the accumulation of ER-unfolded proteins in S. pombe cells (ER stressed cells). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 oca3 oca3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 oca3 oca3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0006378 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.04) PMID:40124504 4896 2025-04-12 Localization of the Tts1-mCherry construct, enriched in the tubular structure of the ER14 indicates that the ER, ER-associated plasma membrane (PM) and nuclear membrane remain unaltered in oca3-null cells (the oca3D deletion strain) (Figure 1B). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008409 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 As expected for the observed ergosterol overaccumulation (Figures 4A and 4B), the growth of Oca3/Emc2-depleted cells is sensitive to nystatin and resistant to ketoconazole (Figure 4C). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0008408 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 As expected for the observed ergosterol overaccumulation (Figures 4A and 4B), the growth of Oca3/Emc2-depleted cells is sensitive to nystatin and resistant to ketoconazole (Figure 4C). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0001457 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0005838 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 PMID:40124504 4896 2025-04-12 In comparison to wild-type cells, Oca3/Emc2 depletion results in a condensed mitochondrial structure that co-localize with abnormal mtDNA aggregations (Figure 2C). PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15C4.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca3 oca3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0004488 deletion 972 h- set5 set5delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC794.09c) PMID:18292091 4896 2015-03-02 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 set5 set5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 set5 set5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set5 set5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- set5 set5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set5 set5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 set5 set5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 S522A,E523A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-SE522.523AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000703 S522A,E523A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-SE522.523AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 S522A,E523A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-SE522.523AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPCC1672.10 FYPO:0001645 Y41H Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16-Y41H amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC27B12.02),assayed_protein(PomBase:SPCC1672.10) PMID:29804820 4896 2023-04-01 (Figures 6A, 6B). PomBase SPCC1223.02 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph nmt1 nmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- nmt1 nmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nmt1 nmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nmt1 nmt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003338 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26092938 4896 2015-08-20 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0007577 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001880 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:11694585 4896 2017-05-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001880 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002555 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.06c) PMID:16467379 4896 2017-06-29 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0006220 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1006.08) PMID:15933715 4896 2022-09-29 We therefore analysed the localisation of Etd1p-GFP in cdc8-110 mutant cells and found that, at the restrictive temperature of 361C, Etd1p never formed a ring (Figure 3B upper panels). PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000835 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-14 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001493 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17452625 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001006 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:958201 4896 2012-07-18 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003876 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11448769 4896 2014-09-22 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003441 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003441 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:11359928 4896 2021-01-02 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002558 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0002558 A18T,E31K Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-110 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-175 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 5-30 PMID:16453724 4896 2016-04-05 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0001317 C-term tag with 3XFLAG bridging to auxin-inducible degron Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-3XFLAG-AID mst2-deg fusion_or_chimera ECO:0000231 FYECO:0000106,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPBC428.08c) PMID:39094565 4896 2024-10-29 (Fig. S1G) PomBase 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ppc89-L756P,I770V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:39471327 4896 2024-11-01 Interestingly we found that the additional foci of Ppc89-4, 11 observed in 169/280 cells that progressed through mitosis during the movies, always 12 formed during anaphase by splitting off from one of the two SPBs (Figure 7A). By 13 determining the intensity of the two SPBs before and after foci appeared, we confirmed 14 that the fragments originated from one SPB because the fluorescence intensity of that 15 SPB always diminished relative to the second SPB (Figure 7B). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0007652 L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-L756P,I770V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 ppc89-L756P,I770V was 3 temperature-sensitive and accumulated cells with one nucleus and a septum (Figure 4 6B-D), reminiscent of what we observed in ppc89-4 cells| Moreover, we found that 5 ppc89(1-707)-mNG cells accumulated mononucleated, septated cells and anucleate cell 6 compartments (Figure 6C,D) as well as multiple Ppc89 foci (Figure 6E and S4B). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0007742 L756P,I770V Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89-L756P,I770V amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:39471327 4896 2024-11-01 We also determined 16 that the rarer off-center septum phenotype (9 of 280 cells) arose because a second 17 cytokinetic ring formed at the new cell end of one daughter cell after its birth (Figure 18 7C). In these cells, the cytokinetic ring appeared not to fully disassemble and one 19 daughter inherited this cortical material. Then, a second cytokinetic ring formed at 20 variable times relative to completion of the previous division where the first cytokinetic 21 ring remnants were located (Figure 7C). PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 sac12 sac12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0002253 deletion 972 h- sac12 sac12delta deletion ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 1B) PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sac12 sac12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- sac12 sac12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sac12 sac12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3C7.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sac12 sac12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- elo2 elo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000263 PMID:30975915 4896 2019-05-04 (Fig. 2B) PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- elo2 elo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elo2 elo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B2.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elo2 elo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0009111 deletion 972 h- scr1 scr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000225,FYECO:0000226,FYECO:0000381 PMID:35924983 4896 2023-07-06 (Figure 7) PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0000796 deletion 972 h- scr1 scr1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000126 PMID:20396879 4896 2012-03-16 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0000825 deletion 972 h- scr1 scr1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-13 The ght5 gene, the transcription of which is repressed in the WT cells, is transcribed at a high level in the presence of 111 mM glucose in the scr1 delta cells. PomBase SPBC409.07c FYPO:0001384 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC409.07c),assayed_substrate(PomBase:SPBC409.07c) PMID:9693384 4896 2014-01-09 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001384 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC409.07c),assayed_substrate(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9693384 4896 2017-06-29 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001384 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002033 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9693384 4896 2014-01-09 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 K349R Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-K349R amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC211.07c FYPO:0003914 deletion 972 h- ubc8 ubc8delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.03) PMID:35075549 4896 2022-04-02 (Fig. S1) The results showed that Fzo1 protein was not degraded at late time points only in the Δubc8 mutant (Fig. 4). Fzo1 protein was not degraded in ∆rsv2 and Δubc8 mutants after longer incubation times (60 and 72 h) PomBase SPBC211.07c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.07c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.07c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC211.07c FYPO:0001491 deletion 972 h- ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC211.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- ubc8 ubc8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC211.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- ubc8 ubc8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC211.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubc8 ubc8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC211.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ubc8 ubc8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 F276A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F276A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 F276A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-F276A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mug73 mug73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mug73 mug73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- mug73 mug73delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mug73 mug73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug73 mug73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug73 mug73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug73 mug73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0003085 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:19416828 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0003085 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000049 PMID:19416828 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0003085 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000049 PMID:12840005 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0003085 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:12840005 4896 2016-04-08 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0006603 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000059 PMID:37615341 4896 2024-04-08 (Fig. 1) PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0005357 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0005357 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 high PMID:12840005 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rtf2 rtf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0008113 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC22F8.07c) PMID:37615341 4896 2024-04-08 (Fig. 3C and D) PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0005361 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 high PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0000969 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0001690 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0000963 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37615341 4896 2024-04-08 (Fig. 2-S1A) PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0000963 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:19416828 4896 2016-04-12 PomBase SPAC1D4.09c FYPO:0005359 deletion 972 h- rtf2 rtf2delta deletion ECO:0000337 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assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8041618 4896 2014-06-11 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 G4C Not assayed or wild type 972 h- srp7 srp7-G4C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000252 PMID:8041618 4896 2014-06-11 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G4C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G4C Not assayed or wild type 972 h- srp7 srp7-G4C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8041618 4896 2014-06-11 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002966 T1020A Not assayed or wild type 972 h- nuc2-663 cut7 cut7-T1020A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC25G10.07c) PMID:9490630 4896 2017-08-07 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 S213D,T378D,S422D,S456D,S513D Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-5D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004791 S213D,T378D,S422D,S456D,S513D Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-5D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000590 S213D,T378D,S422D,S456D,S513D Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-5D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 S213D,T378D,S422D,S456D,S513D Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-5D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22959349 4896 2015-08-06 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001357 ubi4-(GGKGG)-sde2(85-263) Not assayed or wild type 972 h- sde2 ubi4-GGKGG-sde2-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 (Fig. EV2B) normal processing, complements sde2Δ PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002667 E61A Not assayed or wild type 972 h- naa10 naa10-E61A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 V94A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-V94A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 V94A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-V94A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAP27G11.15 FYPO:0006494 deletion 972 h- slx1 slx1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14528010 4896 2019-11-06 PomBase SPAP27G11.15 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 slx1 slx1delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAP27G11.15 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP27G11.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 slx1 slx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 slx1 slx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.08 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrn10 rrn10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.08 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrn10 rrn10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- rrn10 rrn10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22E12.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrn10 rrn10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002577 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000226 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPBC25H2.11c) PMID:31748520 4896 2023-08-31 (Fig. 2e, 1f) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002577 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000226 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:31748520 4896 2023-08-31 (Fig. 2e, 1f) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002577 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000226 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.11c) PMID:31748520 4896 2023-08-31 (Fig. 2e, 1f) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0008121 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.11c) PMID:31748520 4896 2023-09-06 Decreased levels of Tra1 and Tra2 in SAGA and NuA4 complexes, respectively (Figure 2) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0008120 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:31748520 4896 2023-08-31 Decreased levels of Tra1 and Tra2 in SAGA and NuA4 complexes, respectively (Figure 2) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001645 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC622.13c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001645 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002134 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPCC622.13c),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002134 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03),assayed_transcript(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002876 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_transcript(PomBase:SPCC569.05c) PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002876 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_transcript(PomBase:SPCC965.07c) PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002876 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_transcript(PomBase:SPCC1884.01) PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002876 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_transcript(PomBase:SPAC977.12) PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0002876 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 medium PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000847 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218,FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 Western blotting followed by quantification of signal intensities showed that both the steady-state levels and the stability of Tra1, Tra2, and Tor1 decrease following Tti2 depletion (Figures 1C-1F). PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000847 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218,FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.11c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 Western blotting followed by quantification of signal intensities showed that both the steady-state levels and the stability of Tra1, Tra2, and Tor1 decrease following Tti2 depletion (Figures 1C-1F). PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000847 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218,FYECO:0000257 assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 Western blotting followed by quantification of signal intensities showed that both the steady-state levels and the stability of Tra1, Tra2, and Tor1 decrease following Tti2 depletion (Figures 1C-1F). PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPCC622.13c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000218 assayed_protein(PomBase:SPAC458.03) PMID:34686329 4896 2023-09-01 Surprisingly, despite a strong decrease of Tor2 steady-state levels, its stability appears unaffected, even increasing 6 h after CHX treatment. It is possible that Tor2 is subjected to rapid turnover and compensatory mechanisms boosting its synthesis. PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001317 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-06 Finally, our published transcriptomic analysis of tti2-CKO mutants showed that PIKK mRNA levels remain unaffected following Tti2 depletion (FigureS1H) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001317 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.11c) PMID:34686329 4896 2023-09-06 Finally, our published transcriptomic analysis of tti2-CKO mutants showed that PIKK mRNA levels remain unaffected following Tti2 depletion (FigureS1H) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001317 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:34686329 4896 2023-09-06 Finally, our published transcriptomic analysis of tti2-CKO mutants showed that PIKK mRNA levels remain unaffected following Tti2 depletion (FigureS1H) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001317 wild type Knockdown 972 h- tti2 tti2+ tti2-CKO wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC216.07c) PMID:34686329 4896 2023-09-06 Finally, our published transcriptomic analysis of tti2-CKO mutants showed that PIKK mRNA levels remain unaffected following Tti2 depletion (FigureS1H) PomBase SPAC23C4.14 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alg1 alg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- alg1 alg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C4.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alg1 alg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm141 trm141delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm141 trm141delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- trm141 trm141delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm141 trm141delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3H7.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm141 trm141delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0001309 deletion 972 h- pls1 pls1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pls1 pls1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- pls1 pls1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pls1 pls1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pls1 pls1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 npr2 npr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0002128 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0000705 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC11E3.05),assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.04c) PMID:33534698 4896 2021-07-09 The binding of Sea3 to GATOR1 is dependent on the integrity of the GATOR1 complex, and the absence of any one of the GATOR1 subunits disrupted the Sea3-GATOR1 association (Figure 3F,G and H). PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001575 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001575 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0000046 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 high PMID:38051102 4896 2023-12-15 Notably, the absence of Sfp1 modestly alleviates the growth defect of the mutants lacking functional GATOR1 (Fig. 1I); the absence of GATOR1 causes a severe growth defect due to deregulated TORC1 activation,28 and therefore, the observed genetic interaction corroborates a functional link between Sfp1 and TORC1. PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph npr2 npr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.03c FYPO:0009091 deletion 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prototroph pan1 pan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph pan1 pan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pan1 pan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pan1 pan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph pan1 pan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pan1 pan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- pan1 pan1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pan1 pan1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25G10.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pan1 pan1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1601 rps1601delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ rps1601 rps1601delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000825 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC713.12) PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1601 rps1601delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps1601 rps1601delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0007559 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0007558 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000979 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0002343 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0007557 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000087 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000089 deletion 972 h- rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:33223513 4896 2020-12-16 PomBase SPBC18H10.14 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph rps1601 rps1601delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc23 cdc23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002724 deletion 972 h- cdc23 cdc23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:9745018 4896 2015-09-04 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002263 deletion 972 h- cdc23 cdc23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:9745018 4896 2015-09-04 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc23 cdc23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc23 cdc23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc23 cdc23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc23 cdc23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9745018 4896 2015-09-04 PomBase SPCC645.07 FYPO:0005338 R408A,R409A,R410A,R411A Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC645.07 FYPO:0000255 R408A,R409A,R410A,R411A Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1-NLS* amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPAC9E9.03 FYPO:0000635 unknown Not assayed or wild type 972 h- leu2 leu2- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000026 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:10545452 4896 2022-11-09 capable of germination and establishing polarized growth, but were incapable of performing cytokinesis and did not maintain polarity (Figure 6B). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001585 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBP22H7.03) PMID:27898700 4896 2016-12-12 (Fig. 4) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0001585 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.03) PMID:27898700 4896 2016-12-12 (Fig. 4) PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000272 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:10545452 4896 2022-11-09 capable of germination and establishing polarized growth, but were incapable of performing cytokinesis and did not maintain polarity (Figure 6B). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002515 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003005 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0004691 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:10545452 4896 2022-11-09 Germinated drc1::ura4 spores were capable of polarity establishment (shown with arrows in Figure 6C), but appeared to be incapable of polarity maintenance, causing them to become spherical and highly enlarged (Figure 6C). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0000579 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 PMID:10545452 4896 2022-11-09 capable of germination and establishing polarized growth, but were incapable of performing cytokinesis and did not maintain polarity (Figure 6B). PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0008044 deletion 972 h- bgs1 bgs1delta drc1::ura4 deletion ECO:0001232 high PMID:10545452 4896 2022-11-09 Interestingly, unlike the drc1-191 mutant, drc1::ura4 underwent multiple nuclear division cycles causing arrested cells to accumulate up to 32 nuclei. PomBase SPAC1071.09c FYPO:0003247 1-94,160-255 Not assayed or wild type 972 h- djc9 djc9-(95-159) djc9-(122-186) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. 2E) PomBase SPAC926.03 FYPO:0001357 3-36,T43A,S44A,S45A Not assayed or wild type 972 h- rlc1 rlc1-N2delta amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000207,FYECO:0000233 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 6B) PomBase SPAC2F3.12c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph plp1 plp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.12c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph plp1 plp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.12c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph plp1 plp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.12c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph plp1 plp1delta deletion 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptc4 ptc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 C176S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-C176S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0003957 D201A Not assayed or wild type 972 h- trm1 trm1-D201A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:37805140 4896 2023-10-23 the D201A mutant showed the same lack of modification of nuclear- and mitochondrial-encoded tRNAs as trm1∆ cells transformed with an empty vector, despite similar levels of protein accumulation as the wild type overexpressed isoform (Figure 1D). PomBase SPBC25D12.05 FYPO:0006253 D201A Not assayed or wild type 972 h- trm1 trm1-D201A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:37805140 4896 2023-10-23 Wild type and D201A exhibited comparable binding affinity, suggesting that disruption of the putative catalytic site does not impair tRNA binding affinity or binding cooperativity (Figure 2A, B, Figure S2, Table S5). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0001352 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 28 PMID:18957202 4896 2020-04-07 28% of the cells contained fragmented nuclear DNA (Figure 2D), indicating that the mutant nucleus is disorganized. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007335 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 We found that deletion of the Lid2 JmjC domain resulted in the complete loss of ura4+ silencing at both the otr and imr loci (Figure 3A and Figure 7A). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007334 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 We found that deletion of the Lid2 JmjC domain resulted in the complete loss of ura4+ silencing at both the otr and imr loci (Figure 3A and Figure 7A). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007336 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 mating-type region was likewise reduced (Figure 3A) PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0004170 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 As shown in Figure 3B, H3K9 methylation at the centromere was completely abolished. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 drastic reduction of Swi6 binding (Figure 3D). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 We then determined whether Lid2 is required for the recruitment of Clr4 to heterochromatin. We carried out a ChIP experiment using lid2-j or clr8Δ containing a N-terminal FLAG-tagged Clr4. The localization of Clr4 at centromeres is abrogated in both mutants (Figure 3E). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:18957202 4896 2020-04-07 As shown in Figure 5D, the association of Ago1 with the centromere is significantly reduced in lid2-j, indicating that Lid2 is required for RITS to load onto centromeres. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002386 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC613.12c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 In WT cells, Myc- Clr8 associates with centromere otr regions, but not in lid2-j suggesting that Lid2 is required for Clr8 association with heterochromatin (Figure 5E). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0004205 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 high PMID:18957202 4896 2020-04-07 As shown in Figure 5C, siRNA is barely detectable. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007339 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 forward and reverse centromeric strands were detected in lid2-j and accumulated at the same level as in clr8Δ, suggesting that Lid2 is involved in the RNAi pathway. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000220 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 forward and reverse centromeric strands were detected in lid2-j and accumulated at the same level as in clr8Δ, suggesting that Lid2 is involved in the RNAi pathway. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007338 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 In contrast, H3K4me3 methylation was increased significantly (Figure 3C) PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0003087 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC146.09c) PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000091 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 high PMID:18957202 4896 2020-04-07 As shown in Figure 2E, lid2-j, like clr8Δ, is hypersensitive to TBZ PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0003481 unknown Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-j unknown ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 WT and frequently exhibited an aberrant elongated cell shape (Figure 2C) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0001355 D111A,P112A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-D111A,P112A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37237082 4896 2023-06-14 Like srr1Δ cells, srr1-W157R, srr1-D111A,P112A, and srr1-H184A cells produced small colonies (Supplementary Fig. 2b), consistent with the role of the SRR1-like domain even in the absence of exogenous DNA damage. PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000085 D111A,P112A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-D111A,P112A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 5e) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000088 D111A,P112A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-D111A,P112A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 5e) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000089 D111A,P112A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-D111A,P112A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 5e) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0007950 S87A,T94A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 high PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 6G) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 S87A,T94A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 S87A,T94A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001045 CTD-T4A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006658 CTD-T4A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 1) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0008028 CTD-T4A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S3) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-T4A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-T4A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-T4A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-T4A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S2) PomBase SPAC110.06 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC110.06 SPAC110.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC110.06 SPAC110.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC110.06 SPAC110.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC110.06 SPAC110.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.06 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC110.06 SPAC110.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC110.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC110.06 SPAC110.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0001038 S32A,S34A Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-S32,34A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1921.02) PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000088 S32A,S34A Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-S32,34A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPAC6G10.04c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre5 pre5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.04c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre5 pre5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G10.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- pre5 pre5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G10.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pre5 pre5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 low assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4A) PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0002151 1075-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 complete PMID:32295063 4896 2020-09-28 PomBase SPAC23E2.02 FYPO:0002061 1075-1235 Not assayed or wild type 972 h- lsd2 lsd2-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38181050 4896 2024-05-07 Notably, deletion of the Lsd2 HMG-domain results in lethality akin to that in the complete loss of Lsd2, which further implies the unknown and important functions of the C-terminus of these two proteins PomBase SPAC821.08c FYPO:0003379 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-NF410 unknown ECO:0000112 PMID:21389117 4896 2016-04-22 (Fig. 1c) no tetranucleates PomBase SPAC821.08c FYPO:0004994 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-NF410 unknown ECO:0001232 PMID:21389117 4896 2016-04-22 PomBase SPAC821.08c FYPO:0003611 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-NF410 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPAC821.08c FYPO:0003611 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-NF410 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPAC821.08c FYPO:0005415 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-NF410 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPAC821.08c FYPO:0005384 unknown Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-NF410 unknown ECO:0000112 PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0004781 T180A,S192A Overexpression 972 h- xlf1 xlf1.AA S192A|xlf1-T180A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC24B10.14c FYPO:0002061 T180A,S192A Overexpression 972 h- xlf1 xlf1.AA S192A|xlf1-T180A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25533340 4896 2015-07-28 PomBase SPCC736.12c FYPO:0002134 Y352F Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-Y352F amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 6C) PomBase SPCC736.12c FYPO:0002134 Y352F Not assayed or wild type 972 h- mmi1 mmi1-Y352F amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-05-02 (Fig. S6E) PomBase SPSNRNA.04 FYPO:0002061 T105A,T106C,T107G,G109C Not assayed or wild type 972 h- snu4 snu4-4 snu4.4 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:1441744 4896 2014-06-19 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 wos2 wos2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 wos2 wos2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0009060 deletion 972 h- wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ 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mag2-NATMX-rpt6 wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wos2 wos2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9E9.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- wos2 wos2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10581266 4896 2019-06-07 PomBase SPBC887.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph adi1 adi1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph adi1 adi1delta deletion 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SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.02 FYPO:0000102 deletion 972 h- SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC18.02 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPCC18.02 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.02 FYPO:0000091 deletion 972 h- SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC18.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC18.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC18.02 SPCC18.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005369 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 2A) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005857 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 PMID:26942678 4896 2016-12-09 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005858 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 PMID:26942678 4896 2016-12-09 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000016 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000123,FYECO:0000126 PMID:23145069 4896 2013-03-22 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000082 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31974447 4896 2021-01-21 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 high PMID:31974447 4896 2021-01-21 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 3A) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26942678 4896 2016-12-09 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003216 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000049 PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000876 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1006.04c) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003230 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC13A11.03) PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003230 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003230 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003230 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.10) PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000872 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000708 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000059 PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001645 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 6) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000584 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0001232 PMID:31974447 4896 2021-01-21 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001355 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:31974447 4896 2021-01-21 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002243 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 Moreover, snf22-(D996A-E997A) reversed the derepression of Pho1 accompanying deletion of erh1 (Fig. 3B), which results from precocious 3′-processing/termination of prt lncRNA synthesis (38). PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002243 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 2B) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0004582 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000127 PMID:23145069 4896 2013-03-22 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002960 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002960 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002960 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002960 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23980030 4896 2013-11-29 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002960 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 PMID:26942678 4896 2016-12-09 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005868 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000049 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001327 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001327 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001890 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-20 Northern blotting, Figure 6 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000825 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000825 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005863 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003056 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0001232 PMID:31974447 4896 2021-01-21 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003056 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000092 PMID:26942678 4896 2016-11-15 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003056 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000674 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001164 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23980030 4896 2013-11-28 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003235 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005865 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0005864 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000226 PMID:26942678 4896 2016-12-12 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000703 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 6) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0006862 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 5) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0006862 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:29424342 4896 2019-04-26 (Fig. 5) PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0003840 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000088 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0001232 PMID:23145069 4896 2015-09-21 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0001214 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0000112 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 PMID:23145069 4896 2013-03-22 PomBase SPAC19G12.17 FYPO:0002067 deletion 972 h- erh1 erh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:23145069 4896 2013-04-18 PomBase SPAC222.09 FYPO:0002335 G76S Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-G76S amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:24013500 4896 2024-06-10 We found that all three mutations are required to produce a silencing defect on 5- FOA medium (Fig. 1B). PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0003352 W405G Not assayed or wild type 972 h- RTS1-mat1-SspI::inv-RTS1 (RTS1 moved to cenII-distal side of mat1 and inverted) rtf1 rtf1-W405G amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:18723894 4896 2016-04-08 RTS1 inversion background abolishes DSB formation; "decreased" level in rtf1-W405G is relative to wild type and above the inverted-RTS1 background level PomBase SPBC36B7.09 FYPO:0003902 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP gcn2 gcn2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002061 G82D Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-A1 cdc4-G82D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000703 G82D Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-A1 cdc4-G82D amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.16c),assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:11087749 4896 2020-12-30 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002060 G82D Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-A1 cdc4-G82D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0003286 G10D Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-r8 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23263988 4896 2014-04-04 PomBase SPCC330.14c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph rpl2402 rpl2402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl2402 rpl2402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl2402 rpl2402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC330.14c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rpl2402 rpl2402delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 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4896 2010-04-06 PomBase SPAC5H10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC5H10.03 SPAC5H10.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5H10.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC5H10.03 SPAC5H10.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.04c FYPO:0001355 F275FSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-3L amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000381 high PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5D) PomBase SPCC330.04c FYPO:0001571 F275FSGGGSSG Not assayed or wild type 972 h- tdk1 tdk1-3L amino_acid_insertion ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPCC1450.02),assayed_protein(PomBase:SPCC330.04c) PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. 5C) PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000080 801-990,S800SGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGS Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-CTD-T1A(7) spt5-(T1A)7|spt5-T1A(7) amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:29899453 4896 2018-07-03 (Fig. 3e) PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0007386 801-990,S800SGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGS Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-CTD-T1A(7) spt5-(T1A)7|spt5-T1A(7) amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0000112 medium PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000835 801-990,S800SGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGSGSKAPAWNSGS Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-CTD-T1A(7) spt5-(T1A)7|spt5-T1A(7) amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPBC651.09c) PMID:32366382 4896 2020-06-04 PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000833 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003579 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- pat1-as snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 5E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003579 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- pat1-as snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 5E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001317 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003058 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001357 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:40185772 4896 2025-05-02 (Fig. S3G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003720 G19C,T20G,C21G,T22G,C24A,T25A,T26A,T27G,C29A,C30G,C31A,G32C Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-ASE1mut nucleotide_mutation ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.48) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 3A, 3C) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 I252A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-I252A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 I252A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-I252A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPAC5D6.01 FYPO:0002909 (-156)-(-10) Not assayed or wild type 972 h- rps2202 rps2202-idelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000226 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:26670050 4896 2016-09-12 PomBase SPAC5D6.01 FYPO:0000825 (-156)-(-10) Not assayed or wild type 972 h- rps2202 rps2202-idelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.01) PMID:26670050 4896 2016-09-12 PomBase SPAC4D7.08c FYPO:0002311 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade4 aza1-1 aza-1 unknown ECO:0005801 PMID:4314233 4896 2013-07-02 PomBase SPAC4D7.08c FYPO:0002309 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade4 aza1-1 aza-1 unknown ECO:0005801 PMID:4314233 4896 2013-07-02 PomBase SPAC4D7.08c FYPO:0002307 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade4 aza1-1 aza-1 unknown ECO:0005801 PMID:4314233 4896 2013-07-02 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002085 G43D Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-G43D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPBC17G9.05 FYPO:0002106 wild type Knockdown 972 h- rct1 rct1+ wild_type ECO:0001232 PMID:17339332 4896 2016-01-08 PomBase SPCC584.12 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug42 mug42delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPCC584.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- mug42 mug42delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC584.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug42 mug42delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug42 mug42delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 T197V Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-T197V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002967 T197V Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-T197V amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000082 A398V Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-A398V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000080 A398V Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-A398V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 A398V Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-A398V amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007074 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000964 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002578 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 E35D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E34D amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007721 1-151 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSNTM stx8(SNTM)|fsv1deltaSNTM partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-08 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0005489 1-151 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8deltaSNTM stx8(SNTM)|fsv1deltaSNTM partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002368 wild type Overexpression 972 h- lid2 lid2+ wild_type ECO:0000226 high PMID:18957202 4896 2020-04-07 H3K4me3 staining was reduced to nearly undetectable levels in 82% of the cells overexpressing Lid2, suggesting that Lid2 can specifically demethylate H3K4 me3 (Figure 4B) PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000874 wild type Overexpression 972 h- lid2 lid2+ wild_type ECO:0000226 PMID:18957202 4896 2020-04-07 overexpressing Lid2 enhances H3K9 methylation (Figures 5G and H) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002133 1-264 Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-shadow partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 PMID:22683269 4896 2013-07-18 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004917 1-249,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1(250-335) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004917 1-249,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1(250-335) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC776.12c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0002061 1-249,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1(250-335) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-06 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000703 1-249,336-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 dfp1(250-335) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c),assayed_using(PomBase:SPCC550.13) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0000998 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-96 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:3448096 4896 2013-07-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001219 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-96 unknown ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:3448096 4896 2013-07-18 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001929 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-96 unknown ECO:0001232 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0001927 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-96 unknown ECO:0001232 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-96 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:3448096 4896 2013-07-18 PomBase SPCC970.08 FYPO:0001045 L338R Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-L338R amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 7B) PomBase SPCC970.08 FYPO:0001117 L338R Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-L338R amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 8B) PomBase SPCC970.08 FYPO:0001117 L338R Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-L338R amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) 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2019-08-07 PomBase SPBC725.16 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 res1 res1+ wild_type ECO:0001232 high PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0002151 591-603 Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1-dFFAT partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 100 PMID:39110593 4896 2024-11-01 Either the removal or genetic alterations of this presumed Scs2-interacting motif engendered inviable spores in S. pombe (Figure 6A), indicative of its necessity for Pma1 function. PomBase SPBC660.14 FYPO:0001384 K320R Not assayed or wild type 972 h- mik1 mik1-K320R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC660.14) PMID:7982971 4896 2013-10-24 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 C291S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-C291S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 C291S Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-C291S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 low PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPBC83.12 FYPO:0000785 deletion 972 h- SPBC83.12 SPBC83.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPBC83.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC83.12 SPBC83.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC83.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC83.12 SPBC83.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC83.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC83.12 SPBC83.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000164 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000026 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Figure 4A-4C, S3A-S3B) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001018 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 50 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Fig. 4c) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:26132084 4896 2015-09-16 (Fig. 5) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001586 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001365 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005543 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:26132084 4896 2017-09-19 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003532 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:31591131 4896 2019-10-16 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001369 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001368 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:19139265 4896 2018-02-28 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0006635 753-927 Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15deltaSH3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31591131 4896 2019-10-18 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000705 PTIP272ATIA,PDVP457ADVA,PPP514AAA,PSVP538ASVA,PNLP1029AALA Not assayed or wild type 972 h- pom1 pom1-5PxxP* amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c),assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) 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deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000236 PMID:24224056 4896 2013-11-20 The decrease in cell growth on maltose medium is suppressed by neighboring wild-type cells but not by agl1 delta cells, which are defective in maltase secretion. PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002827 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 medium medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 1) An atf1 deletion strain carrying the ade6+ reporter gene inserted at the mat3-M locus displayed a loss of silencing of the reporter gene (Fig. 1A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000303 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000059 PMID:11129048 4896 2015-12-14 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006037 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000207 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003964 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005801 PMID:14503856 4896 2014-12-02 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003571 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 low PMID:19136623 4896 2024-07-02 H3K9me on the ura4 inserted at the mating locus heterochromatin (Kint2 ::ura4) was hardly affected by deletion of either atf1 or dcr1, an essential component of the RNAi-directed pathway (Fig. 1D). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0001232 high PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0001232 PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004058 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:19436749 4896 2014-11-21 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005039 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:22144909 4896 2015-11-04 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002522 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15840944 4896 2017-09-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001101 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001283 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003930 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC365.12c) PMID:11751918 4896 2014-10-22 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001324 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005580 PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001324 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.20) PMID:14503856 4896 2014-12-02 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002925 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000236 assayed_using(PomBase:SPBC14F5.08) PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002446 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:16278445 4896 2017-09-22 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002376 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001838 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002287 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:15164362 4896 2019-10-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002287 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC713.11c) PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002287 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC713.11c) PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC688.04c) PMID:12063243 4896 2014-11-20 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC70.12c) PMID:24696293 4896 2015-04-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003993 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002305 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPBC713.11c) PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002305 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:10428498 4896 2013-07-02 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002305 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002305 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.07c) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000261 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000261 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000261 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000261 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPAC328.03) PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 high assayed_using(PomBase:SPAC1006.05c) PMID:12784644 4896 2019-11-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 high assayed_using(PomBase:SPAC1006.05c) PMID:12784644 4896 2019-11-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:10428498 4896 2013-07-02 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002304 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003034 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003034 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005302 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001152 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC285.09c) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001152 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:15448137 4896 2017-07-20 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001152 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001152 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:11129048 4896 2015-12-15 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC4F11.02) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.07c) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.08c) PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:26108447 4896 2016-07-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPAC1006.05c) PMID:12784644 4896 2019-11-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001117 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000781 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000236 assayed_using(PomBase:SPAPB24D3.10c) PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000781 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000236 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:24224056 4896 2013-11-25 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006994 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 1A) In contrast, the atf1 deletion resulted in increased transcriptional repression at both centromeres and telomeres (Fig. 1A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004542 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 1A) In contrast, the atf1 deletion resulted in increased transcriptional repression at both centromeres and telomeres (Fig. 1A). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006036 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000207 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006718 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c),residue(T189) PMID:28515144 4896 2018-10-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004062 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004062 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007633 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005063 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) Furthermore, ChIP analysis showed that the absence of atf1 and pcr1 resulted in a considerable increase in histone H3/H4 acetylation and euchromatic-specific H3 Lys-4 methylation of the selected region PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004690 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0008174 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0008172 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0008173 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 high PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003909 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000231 PMID:25122751 4896 2014-09-15 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001038 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:15917811 4896 2016-06-14 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000825 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000106 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.01c) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003991 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003908 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 PMID:25122751 4896 2014-09-11 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000780 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000230 low assayed_transcript(PomBase:SPBC1711.02) PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 2C) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009019 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000324 PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 4D) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 atf1 atf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000056,FYECO:0000069,FYECO:0000126 PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:20075862 4896 2016-07-05 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:20075862 4896 2016-07-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006660 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000324 PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 4E) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001252 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000324 high PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 4F) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001483 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005801 PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001682 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000166 PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000674 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000988 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003462 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000335 PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003461 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000166 PMID:12855726 4896 2014-06-19 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002336 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002336 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000268,FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 atf1 atf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001241 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001237 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001023 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001236 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001240 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16603158 4896 2014-08-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004348 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16141205 4896 2015-01-27 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004348 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16141205 4896 2015-01-27 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001238 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001239 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-07-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005865 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005865 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007384 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:28652406 4896 2020-04-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000833 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000833 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000833 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1450.06c) PMID:16258244 4896 2014-11-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007451 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27746023 4896 2020-11-17 (Figure 2D) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002625 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC216.07c) PMID:37913773 4896 2024-01-18 Nevertheless, our analysis revealed that deletion of atf1+ gene (atf1D) did not significantly affect Tor2 accumulation in rDNA (Figures S2A and S2B). PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004378 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004378 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002013 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:33225241 4896 2021-01-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002290 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9585506 4896 2014-11-21 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001487 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001246 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC576.03c) PMID:24696293 4896 2015-04-17 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001246 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003992 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006830 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000173 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-08-27 (Fig. 1B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001486 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003035 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006829 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000177 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 1B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001096 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC70.12c) PMID:21307597 4896 2015-03-31 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001317 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001317 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC688.04c) PMID:12063243 4896 2014-11-20 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9585505 4896 2012-03-01 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:11460168 4896 2024-04-16 (Fig. 4A) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004663 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004662 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001310 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004263 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001984 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC365.12c) PMID:11751918 4896 2014-10-22 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002766 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-06 (Figure 6) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002766 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-06 (Figure 6) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004513 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 PMID:32915139 4896 2020-10-14 (Fig. 1F) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003860 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-01 (Figure 6) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001473 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000214 medium PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18003976 4896 2016-09-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009065 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009062 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004052 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:10455235 4896 2015-01-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003162 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:12784644 4896 2019-11-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003162 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:12784644 4896 2019-11-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003162 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003162 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003161 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:10455235 4896 2015-01-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003161 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:12784644 4896 2019-11-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003161 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:10348908 4896 2014-07-02 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000098 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 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4A) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 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prototroph atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000271 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000271 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:12221110 4896 2015-12-16 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000271 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 high PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 6a) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000271 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000271 deletion 972 h- atf1 atf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166,FYECO:0000201 PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph atf1 atf1delta 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PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001164 C532T Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C532T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23525001 4896 2016-07-19 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000087 C532T Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1-C532T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23525001 4896 2016-07-05 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0007440 432-598 Not assayed or wild type 972 h- ltc1 ltc1-StARTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 PMID:32320462 4896 2020-08-05 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0000135 432-598 Not assayed or wild type 972 h- ltc1 ltc1-StARTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:32320462 4896 2020-08-03 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0007442 432-598 Not assayed or wild type 972 h- ltc1 ltc1-StARTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.07) PMID:32320462 4896 2020-08-05 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0007441 432-598 Not assayed or wild type 972 h- ltc1 ltc1-StARTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.07) PMID:32320462 4896 2020-08-05 PomBase SPBC20F10.07 FYPO:0002642 432-598 Not assayed or wild type 972 h- ltc1 ltc1-StARTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:32320462 4896 2020-08-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003659 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:1620099 4896 2014-09-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003346 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:1783290 4896 2014-05-06 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000469 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:10716938 4896 2018-06-07 PomBase SPAC664.01c FYPO:0008153 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:16246721 4896 2024-01-25 Remarkably, loss of Swi6 and Chp2 but not Chp1 completely abolished the localization of Clr3 at Kint2::ura4+ (Figure 1) PomBase SPAC664.01c FYPO:0008153 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:16246721 4896 2024-01-25 Remarkably, loss of Swi6 and Chp2 but not Chp1 completely abolished the localization of Clr3 at Kint2::ura4+ (Figure 1) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003412 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28231281 4896 2017-04-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000291 medium PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 5D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:1620099 4896 2014-09-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 1D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0002827 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:9710635 4896 2016-02-23 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005845 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:16246721 4896 2024-01-25 .....Interestingly, identical modification patterns were also observed in a swi6 mutant, consistent with Swi6 involvement in Clr3 spreading (Figure 5A). PomBase SPAC664.01c FYPO:0000470 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:22042869 4896 2024-07-11 (Fig. 2A) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.12c) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0006599 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.18) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 3) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 3) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.18) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0003573 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.12c) PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 3C and D) PomBase SPAC664.01c FYPO:0007891 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:16246721 4896 2024-01-25 In the absence of Swi6, Clr3 localization was confined to a small region near the mat3 locus (Figure 2A), which is distinct from the cenH element responsible for RNAi-mediated targeting of heterochromatin to this region. PomBase SPAC664.01c FYPO:0000471 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:1620099 4896 2014-09-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003792 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:1620099 4896 2014-09-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003791 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:1620099 4896 2014-09-10 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000228 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0001232 24.5 PMID:7660126 4896 2015-03-12 PomBase SPAC664.01c FYPO:0001886 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:1620099 4896 2014-09-05 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002336 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21253571 4896 2015-05-18 PomBase SPAC664.01c FYPO:0003235 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005865 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0005865 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0002390 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 2.4 PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Figure 1e) PomBase SPAC664.01c FYPO:0004378 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 4B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0004378 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC21E11.03c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 4B) PomBase SPAC664.01c FYPO:0001984 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPAC664.01c FYPO:0000091 W269R Not assayed or wild type 972 h- swi6 swi6-115 swi6- amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 1) PomBase SPBC691.01 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000760 deletion 972 h- pfa5 pfa5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPBC691.01 FYPO:0002501 deletion 972 h- pfa5 pfa5delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.09c) PMID:23843742 4896 2013-08-12 PomBase SPBC691.01 FYPO:0002502 deletion 972 h- pfa5 pfa5delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.09c) PMID:23843742 4896 2013-08-12 PomBase SPBC691.01 FYPO:0004795 deletion 972 h- pfa5 pfa5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPBC691.01 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC691.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.01 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph pfa5 pfa5delta 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amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000733 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000324 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 2) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000674 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000674 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002141 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000703 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1f) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0001357 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0000069 Q582P Not assayed or wild type 972 h- klp5 klp5-Q582P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1e) PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 agm2 agm2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph agm2 agm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- agm2 agm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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Either the removal or genetic alterations of this presumed Scs2-interacting motif engendered inviable spores in S. pombe (Figure 6A), indicative of its necessity for Pma1 function. PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0003484 S392A Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-S392A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-27 PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0000705 S392A Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-S392A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PR:000027566),assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-25 PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0002825 S392A Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-S392A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-27 PomBase SPACUNK4.14 FYPO:0003129 S392A Not assayed or wild type 972 h- mdb1 mdb1-S392A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-25 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000088 Y127A,K128A Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-Y127A,K128A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPCC126.12 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC126.12 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2023-02-23 PomBase SPCC126.12 FYPO:0000089 deletion 972 h- SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC126.12 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC126.12 SPCC126.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC126.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC126.12 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4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph emp43 emp43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- emp43 emp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emp43 emp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4F6.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emp43 emp43delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000658 151-254 Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1delta151-254 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0008121 wild type Knockdown 972 h- tra2 tra2-CKO wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 PMID:31748520 4896 2023-09-01 See Figure 4 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0002876 wild type Knockdown 972 h- tra2 tra2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 medium PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0000781 wild type Knockdown 972 h- tra2 tra2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_transcript(PomBase:SPCC1884.01) PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0000781 wild type Knockdown 972 h- tra2 tra2-CKO wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_transcript(PomBase:SPAC977.12) PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPAC1F5.11c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- tra2 tra2-CKO wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:31748520 4896 2023-08-31 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000658 R82H Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-R82H amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPBC6B1.07 FYPO:0003041 G705D Not assayed or wild type 972 h- prp1 prp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC6B1.07 FYPO:0000911 G705D Not assayed or wild type 972 h- prp1 prp1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000061 PMID:9286671 4896 2014-06-04 PomBase SPBC6B1.07 FYPO:0004742 G705D Not assayed or wild type 972 h- prp1 prp1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 we surveyed several additional ts lethal splicing mutants for silencing defects at the permissive temperature (11-14). Only particular splicing mutants affected silencing. Silencing of a centromeric cen1:ade6+ marker gene (Fig. 1A) remained intact in the presence of prp1 (Prp6Sc/Hs), prp2 (U2AFHs), prp3 (Prp3Sc/PRPF3Hs), or prp4 (PRPF4BHs) mutations PomBase SPBC6B1.07 FYPO:0000964 G705D Not assayed or wild type 972 h- prp1 prp1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37637271 4896 2023-08-30 (Figure 1H) PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0004719 deletion 972 h- sar1 sar1delta deletion ECO:0001232 27 PMID:11839792 4896 2023-12-11 sar1, sec31 and pmm1 are essential genes PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0004719 deletion 972 h- sar1 sar1delta deletion ECO:0001232 19 PMID:11839792 4896 2023-12-11 19% were septated, binucleated cells with condensed chromosomes. PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sar1 sar1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- sar1 sar1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sar1 sar1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- sar1 sar1delta deletion ECO:0005638 PMID:11839792 4896 2023-12-11 These data confirmed that sar1 is an essential gene in S. pombe, as previously reported (d’Enfert et al., 1992). PomBase SPCC663.05c FYPO:0001645 E39A Not assayed or wild type 972 h- asf1 cia1-E39A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hhp1 hhp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000082 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000082 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. S1C) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0000080 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph hhp1 hhp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph hhp1 hhp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph hhp1 hhp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0006978 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0004287 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. S2C) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0003179 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0000059 high PMID:25993311 4896 2017-04-11 (Table 1) PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001128 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001128 deletion 972 h- hhp1 hhp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase 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transcription termination sites. PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0007736 D274A,E275A Overexpression 972 h- tfs1 tfs1-dn tfs1-dominant-negative|tfs1DN amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_region(PomBase:SPAC1705.03c),assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 3) At exg1, ecm33, eng1 et gas1, condensin is redistributed throughout the gene body instead of accumulating around transcription termination sites. PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0007736 D274A,E275A Overexpression 972 h- tfs1 tfs1-dn tfs1-dominant-negative|tfs1DN amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_region(PomBase:SPAC19B12.02c),assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 3) At exg1, ecm33, eng1 et gas1, condensin is redistributed throughout the gene body instead of accumulating around transcription termination sites. PomBase SPAC20H4.03c FYPO:0007736 D274A,E275A Overexpression 972 h- tfs1 tfs1-dn tfs1-dominant-negative|tfs1DN amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_region(PomBase:SPAC821.09),assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:33771877 4896 2021-04-07 (Fig. 3) At exg1, ecm33, eng1 et gas1, condensin is redistributed throughout the gene body instead of accumulating around transcription termination sites. PomBase SPAC637.11 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- rpm2 rpm2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18304578 4896 2015-10-15 PomBase SPAC637.11 FYPO:0004960 wild type Overexpression 972 h- rpm2 rpm2+ wild_type ECO:0000291 PMID:18304578 4896 2015-10-15 PomBase SPBC146.14c FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec26 sec26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.14c FYPO:0001991 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec26 sec26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec26 sec26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC146.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec26 sec26delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0003724 E93Q Overexpression 972 h- 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4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPAC1705.03c FYPO:0004083 682-783 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtG partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) The immunoblot analysis detected an appreciable amount of Ecm33 fragments A, C, F, G, and I PomBase SPBC1703.10 FYPO:0007327 F96S Not assayed or wild type 972 h- ypt1 ypt1-371 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC1703.10 FYPO:0006518 F96S Not assayed or wild type 972 h- ypt1 ypt1-371 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC1703.10 FYPO:0000997 F96S Not assayed or wild type 972 h- ypt1 ypt1-371 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000703 121-294 Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1(1-120) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC6B1.09c),assayed_protein(PomBase:SPCC338.08) PMID:33836577 4896 2021-06-18 (Figure 1) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007594 1-40 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN40 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3B,4B) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000705 1-40 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN40 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3D) PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0001645 R504A Not assayed or wild type 972 h- pcf2 pcf2-R504A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPCC663.05c) PMID:18334479 4896 2015-10-06 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 F493L Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-F493L amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001645 F493L Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-F493L amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 F493L Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-F493L amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000703 F493L Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-F493L amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC9E9.11 FYPO:0004147 wild type Overexpression 972 h- plr1 plr1+ wild_type ECO:0005801 PMID:15047724 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0000141 wild type Overexpression 972 h- cnp3 cnp3+ wild_type ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 6) PomBase SPBC1861.01c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- cnp3 cnp3+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:28974540 4896 2018-06-18 (Fig. 6) PomBase SPBC215.09c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg10 erg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC215.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- erg10 erg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC215.09c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg10 erg10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC821.03c FYPO:0003714 deletion 972 h- slf1 slf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16H5.11c) PMID:25009287 4896 2014-08-26 PomBase SPAC821.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 slf1 slf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 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FYPO:0000836 S630A,S632A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ppk32 ppk32-AA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.10) PMID:27191590 4896 2016-07-04 (Fig. 6B) PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0005193 S630A,S632A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ppk32 ppk32-AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-04 (Fig. 6C) PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0001501 S630A,S632A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ppk32 ppk32-AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-04 (Fig. 6C) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0003345 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005580 PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004839 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 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deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 low assayed_using(PomBase:SPMTR.01) PMID:29632066 4896 2018-11-11 (Fig. S1B) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004604 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002340 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000059 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000185 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000059 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0008378 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 high PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1A and B) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0008438 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 high PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1B) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0008379 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 2A) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005187 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000291 PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000708 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 PMID:23370392 4896 2013-05-15 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000708 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 high PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004194 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0004194 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001324 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001324 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002976 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005314 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005314 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC22F3.09c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005314 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005034 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005034 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC1718.07c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 4D, S3) the hyperphosphoryated zfs1 (3rd band higest). Gad8 is required to hyperphosphorylate zfs1. In Fig4C they also show that TOR inhibition by Torin stimulates hyerphosphorylation of Zfs1 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002975 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002975 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002975 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002975 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC660.14) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002975 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001152 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001152 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001152 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001355 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1E) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000017 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000220 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002019 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000337 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0003533 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0003533 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000972 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001327 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002852 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:21035342 4896 2016-07-08 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0006740 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1952.05) PMID:35157728 4896 2022-03-02 Unexpectedly, although there is no increase in MBF-dependent transcription, we detected an increase in Gcn5 binding at the promoters of cdc22+ or cdc18+ in Δtor1 or Δgad8 cells under normal or replication stress conditions (Fig 5A) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0006552 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002082 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.14) PMID:34028542 4896 2021-06-28 (Fig. 6) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000650 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.04c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.06) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC750.01) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.18) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC977.02) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC1348.03) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005917 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.05c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 gad8 gad8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001925 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002567 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 gad8 gad8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0006554 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002099 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005602 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0005602 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0001098 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000326 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000095 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000098 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000085 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000085 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0000085 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1E) PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0003840 deletion 972 h- gad8 gad8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC24B10.07 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gad8 gad8delta deletion 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Fig. 3C and D PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph swi10 swi10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0005777 deletion 972 h- swi10 swi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-10 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0000972 deletion 972 h- swi10 swi10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27687866 4896 2016-11-10 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi10 swi10delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi10 swi10delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0001690 deletion 972 h- swi10 swi10delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPBC4F6.15c FYPO:0001164 deletion 972 h- swi10 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SPBC691.03c FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000674 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000833 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2G2.06c) PMID:26749213 4896 2016-07-01 (Figure 1a) PomBase SPBC691.03c FYPO:0000833 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.09c) PMID:26749213 4896 2016-07-01 (Figure 1a) PomBase SPBC691.03c FYPO:0001945 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26749213 4896 2016-07-06 (Fig. S2C) PomBase SPBC691.03c FYPO:0004247 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0001232 PMID:26749213 4896 2016-07-06 (Fig. S2A, B) PomBase SPBC691.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC691.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002766 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC691.03c 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2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC691.03c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000079 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:26749213 4896 2016-06-29 PomBase SPBC691.03c FYPO:0001190 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000298 low PMID:26749213 4896 2016-06-29 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0003358 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:26749213 4896 2016-06-29 PomBase SPBC691.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC691.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC691.03c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC691.03c FYPO:0000647 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000298 PMID:26749213 4896 2016-07-06 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- apl3 apl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl3 apl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC691.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apl3 apl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000655 165-380 Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-N(1-164) chp2-N partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 The hinge and the N-terminal disordered regions of Chp2 (Chp2-H and Chp2-N) also bound DNA (Fig. 2H, J and M) PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001355 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000703 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000703 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000085 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000088 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21441914 4896 2017-03-27 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000267 CV479RR Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-CV497RR amino_acid_mutation ECO:0005638 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2016-09-27 (Fig. 3b) PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000705 1-123,476-628 Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-M T2M partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15),assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15665379 4896 2016-09-27 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003267 CTD-∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(CTD-18repeats) partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S1) PomBase SPCC1739.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cox13 cox13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.09c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cox13 cox13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cox13 cox13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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972 h- med18 sep11-556 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPAC5D6.05 FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- med18 sep11-556 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10392445 4896 2020-06-25 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0000082 1-707 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89(1-707) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:39471327 4896 2024-11-01 ppc89(1-707)-mNG cells were 7 viable but temperature-sensitive (Figure 3C). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0001475 1-707 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89(1-707) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:39471327 4896 2024-11-01 PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0007652 1-707 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89(1-707) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:39471327 4896 2024-11-01 Moreover, we found that 5 ppc89(1-707)-mNG cells accumulated mononucleated, septated cells and anucleate cell 6 compartments (Figure 6C,D) as well as multiple Ppc89 foci (Figure 6E and S4B). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 1-707 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89(1-707) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 Both Ppc89(1-707)-mNG and Sid4-RFP 8 localized to the SPB with comparable intensity to wild-type at both 25 ̊C and 36°C 9 (Figure 3D,E). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 1-707 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89(1-707) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 Both Ppc89(1-707)-mNG and Sid4-RFP 8 localized to the SPB with comparable intensity to wild-type at both 25 ̊C and 36°C 9 (Figure 3D,E). PomBase SPAC4H3.11c FYPO:0002967 1-707 Not assayed or wild type 972 h- ppc89 ppc89(1-707) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC417.07c) PMID:39471327 4896 2024-11-01 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0004700 T1566C Not assayed or wild type 972 h- nda3 alp12-1828 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0004702 T1566C Not assayed or wild type 972 h- nda3 alp12-1828 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-03-26 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0002071 T1566C Not assayed or wild type 972 h- nda3 alp12-1828 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 24 PMID:9658169 4896 2015-03-26 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000339 T1566C Not assayed or wild type 972 h- nda3 alp12-1828 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-03-26 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003166 T1566C Not assayed or wild type 972 h- nda3 alp12-1828 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 2 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sec9-10 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16272747 4896 2023-12-11 In marked contrast, sec9-10 cells exhibited a rather uniform arrest morphology at the restrictive temperature (Fig. 3C). At 12 hr after the shift to 34°C, approximately 43% of the sec9-10 cells had a single septum, and 4% exhibited multiple septa (Table II). PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0001914 L228P Not assayed or wild type 972 h- sec9 sec9-L228P sec9-10 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16272747 4896 2023-12-11 In wild type cells, most haploid nuclei produced by meiotic second divisions were encapsulated by the FSM (Fig. 4A). In sec9-10 mutant cells, FSMs initiated normally at both poles of the meiosis II spindles (Fig. 4A), but extension of the FSMs was soon blocked, resulting in anucleated small prespores (Fig. 4B). These results indicated that the FSM initiated normally, but its subsequent development was abnormal. PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0001253 L228P Not assayed or wild type 972 h- sec9 sec9-L228P sec9-10 amino_acid_mutation ECO:0001232 4 PMID:16272747 4896 2023-12-11 In marked contrast, sec9-10 cells exhibited a rather uniform arrest morphology at the restrictive temperature (Fig. 3C). At 12 hr after the shift to 34°C, approximately 43% of the sec9-10 cells had a single septum, and 4% exhibited multiple septa (Table II). PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0002061 L228P Not assayed or wild type 972 h- sec9 sec9-L228P sec9-10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:16272747 4896 2023-12-11 In addition to causing a defect in ascospore formation, the sec9-10 mutation compromised vegetative growth. As shown in Fig. 3B, the sec9-10 mutant grew well at 25°C but was unable to form colonies at 37°C. PomBase SPBC119.02 FYPO:0000912 L10D Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-L10D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0000741 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-3H unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000178,FYECO:0000192 is_bearer_of(PATO:0001262) PMID:499806 4896 2016-06-30 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0001852 (-138)-(-67) Not assayed or wild type 972 h- frp1 frp1(-67--138) partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 PMID:8321236 4896 2012-12-13 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0001854 (-138)-(-67) Not assayed or wild type 972 h- frp1 frp1(-67--138) partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 PMID:8321236 4896 2013-01-09 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005485 H807A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H807A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:26422458 4896 2016-07-04 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005481 H807A Not assayed or wild type 972 h- asp1 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Similar tsresults were obtained for tor2 -19. It is of note that, in contrast to the reduced length, the cell width remained constant in these mutant cells. PomBase SPBC216.07c FYPO:0004481 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000082 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38051102 4896 2023-12-15 The screen isolated a plasmid, pALSK53, which suppressed the ts growth phenotype and rapamycin sensitivity of the tor2-13 mutant (Fig. 1A). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001407 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001407 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000208 medium PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000835 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC16.05c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 In the tor2-287 and tor2-13 mutants, the Sfp1 protein dramatically decreased within 2h after shifting to the restrictive temperature (Fig. 2A) PomBase SPBC216.07c FYPO:0002679 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.11c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 When TORC1 was inactivated in the tor2-13 or tor2-287 mutants at the restrictive temperature, the electrophoretic mobility of Ifh1 was notably decreased (Fig. 6A). The slow migrating form of Ifh1 was also observed when TORC1 was inactivated in wild-type cells starved of nitrogen (Fig. 6B). Phosphatase treatment experiments confirmed that slow-migrating Ifh1 was its phosphorylated form (Fig. 6B). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000228 medium PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000228 low PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0002172 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPAC4A8.04) PMID:17121544 4896 2021-05-24 PomBase SPBC216.07c FYPO:0007788 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17121544 4896 2021-05-24 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000501 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 2) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001327 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000951 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high high PMID:17121544 4896 2021-05-24 (mimic nitrogen starvation response, When starved for nitrogen, on the other hand, the cells divide twice and then arrest at G1) At 4 h and 8 h after the shift to36 °C, the average cell length was reduced to 6.4 μm and6.2 μm, respectively, which were ∼50% decreases com-pared to wild-type cells (13.0 μm and 12.9 μm). Similar tsresults were obtained for tor2 -19. It is of note that, in contrast to the reduced length, the cell width remained constant in these mutant cells. PomBase SPBC216.07c FYPO:0002061 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17121544 4896 2021-05-24 (Figure 1B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0003031 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 70 PMID:17121544 4896 2021-05-24 70% of ts the tor2 -13 cells committed sexual development to ts form zygotes and spores (Fig. 3B,C) PomBase SPBC216.07c FYPO:0000776 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000228 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2C) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000227 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001877 C2163R,I2280V,Q2305L Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-13 tor2ts13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0006978 deletion 972 h- ppm1 ppm1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0002019 deletion 972 h- ppm1 ppm1delta deletion ECO:0000337 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0004573 deletion 972 h- ppm1 ppm1delta deletion ECO:0000291 PMID:25398909 4896 2015-04-20 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ppm1 ppm1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ppm1 ppm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- ppm1 ppm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppm1 ppm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppm1 ppm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0000229 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-03 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0000158 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0005580 PMID:10341216 4896 2014-07-03 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0001272 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-07 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002262 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-03 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0004522 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10473641 4896 2015-04-28 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002303 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-03 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0005638 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002818 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-03 PomBase SPAC22H10.10 FYPO:0002018 deletion 972 h- alp21 alp21delta deletion ECO:0001232 PMID:10341216 4896 2014-07-03 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0001724 K270E Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-K270E amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:20139237 4896 2012-11-23 PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0006296 K270E Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-K270E amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPBP35G2.14 FYPO:0007317 593-1065 Overexpression 972 h- puf2 puf2(1-592) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:32071154 4896 2020-03-31 PomBase SPBP35G2.14 FYPO:0002061 593-1065 Overexpression 972 h- puf2 puf2(1-592) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:32071154 4896 2020-04-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 V42VGVPQV Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K33 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 241-254 Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1delta241-254 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPBC651.09c FYPO:0000835 R262E Not assayed or wild type 972 h- prf1 prf1-R262E amino_acid_mutation ECO:0000112 low assayed_using(PomBase:SPBC651.09c) PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPBC651.09c FYPO:0006631 R262E Not assayed or wild type 972 h- prf1 prf1-R262E amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC651.09c) PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPBC651.09c FYPO:0004385 R262E Not assayed or wild type 972 h- prf1 prf1-R262E amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:32366382 4896 2020-05-21 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000658 K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-CSD2A chp2-mut2 amino_acid_mutation ECO:0001807 high assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 exhibited only a very weak DNA binding activity compared to wild-type Chp2-CD (Chp2-CSDWT ) (Fig. 3D and E, and Supplementary Fig. S2B and S2E) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002336 K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-CSD2A chp2-mut2 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:37400983 4896 2023-09-04 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000775 T356D Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000081 assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000705 T356D Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356D amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000081 assayed_using(PomBase:SPBC106.10),assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000584 T356D Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:21879336 4896 2011-09-30 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000849 T356D Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000081 assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2012-03-16 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000255 T356D Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC106.10) PMID:21879336 4896 2012-03-14 PomBase SPBC106.10 FYPO:0000852 T356D Not assayed or wild type 972 h- pka1 pka1-T356D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000031,FYECO:0000137 PMID:21879336 4896 2012-04-20 PomBase SPBC649.03 FYPO:0002169 unknown Not assayed or wild type 972 h- rhp14 rad14-G unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPBC649.03 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rhp14 rad14-G unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001880 1-305 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-305) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Truncating the C terminus further to the predicted CC1 region (amino acid 305) abolished plasma membrane (PM) localization (Fig. 1D). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0003209 1-305 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-305) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000835 1-305 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-305) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-12-23 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0003098 K10M Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K9M amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:27648579 4896 2016-10-05 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0003412 K10M Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K9M amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:27648579 4896 2016-12-14 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0000583 deletion 972 h- gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000059 PMID:9315645 4896 2018-04-29 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0001152 deletion 972 h- gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:8264618 4896 2020-01-21 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0001152 deletion 972 h- gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAPB8E5.05) PMID:8196631 4896 2017-09-19 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0001152 deletion 972 h- gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC513.03) PMID:8196631 4896 2017-09-19 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0001152 deletion 972 h- gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPJ4664.03) PMID:8196631 4896 2017-09-19 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 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FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC24C6.06 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph gpa1 gpa1delta sar1delta 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SPBC1718.07c FYPO:0002137 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPCC1494.03) PMID:18042546 4896 2014-01-10 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001152 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001152 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMTR.02) PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000155 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000261 PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0005505 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-09 (Fig. 2D, 2E, S2) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001890 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0006030 PMID:29084823 4896 2021-02-09 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC188.09c) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.06) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.15c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1289.13c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.07) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.12) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC17D11.01) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC343.06c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.03) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.10c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC365.09c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.12c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1494.03) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.16c) PMID:18042546 4896 2014-01-10 all microarray (Table 1); arz1 also northern (Fig 1) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:36779416 4896 2023-03-05 Zfs1 is involved in the repression of the ecl3+ transcript level in a nutrient-rich environment but is not required for the induction by phosphate starvation. PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000825 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-09 (Fig. 2B, 2C, 6A) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 zfs1 zfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000333 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:10462526 4896 2014-09-19 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001020 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16273369 4896 2014-10-29 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1494.03) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.02c) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.10c) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC589.03c) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1223.13) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.03) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002928 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC359.04c) PMID:22907753 4896 2016-07-12 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0004084 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 6A, 6B) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002442 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:12186944 4896 2014-09-22 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001096 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001096 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMTR.01) PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001096 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC19F5.01c) PMID:29084823 4896 2021-02-10 (Fig. 6A) PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000579 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0005638 PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zfs1 zfs1delta deletion ECO:0005638 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deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:22624651 4896 2012-06-11 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0006822 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:10462526 4896 2014-09-19 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zfs1 zfs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- zfs1 zfs1delta deletion ECO:0005638 PMID:10462526 4896 2014-09-19 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 zfs1 zfs1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0000705 P4D Not assayed or wild type 972 h- rps23 rps23-P4D amino_acid_mutation ECO:0006030 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972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0003352 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC970.10c FYPO:0007478 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPCC970.10c FYPO:0000708 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2B) PomBase SPCC970.10c FYPO:0000470 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPCC970.10c FYPO:0003151 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Figure 6) PomBase SPCC970.10c FYPO:0003151 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Figure 6) PomBase SPCC970.10c FYPO:0003151 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 (Figure 6) PomBase SPCC970.10c FYPO:0001324 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4C) PomBase SPCC970.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0001122 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0001232 high PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Fig. 1D) PomBase SPCC970.10c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0006299 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Figure 2d) Δrhp6 resulted in enhanced silencing of the otr1::ura4+, as shown by reduced growth on medium lacking uracil (Fig. 2D) PomBase SPCC970.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0000969 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2D) PomBase SPCC970.10c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 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2014-08-25 PomBase SPCC970.10c FYPO:0004325 deletion 972 h- brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC970.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.10c FYPO:0001190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC970.10c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC970.10c FYPO:0001245 deletion 972 h- h- prototroph brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0005638 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SPCC970.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.10c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 brl2 brl2delta rfp2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000705 1-199 Not assayed or wild type 972 h- mcm2 mcm2-200-830 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0007679 wild type Overexpression 972 h- rtf1 rtf1+ wild_type ECO:0000059 PMID:33568651 4896 2021-03-15 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0005358 wild type Overexpression 972 h- rtf1 rtf1+ wild_type ECO:0000049 PMID:12840005 4896 2016-04-12 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000705 757-818 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaIQ myo2dIQs partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000833 757-818 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaIQ myo2dIQs partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:11069761 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 757-818 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaIQ myo2dIQs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:11069761 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 757-818 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaIQ myo2dIQs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001234 757-818 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaIQ myo2dIQs partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001495 757-818 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-deltaIQ myo2dIQs partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPAC144.19 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0009024 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000416 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0002634 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000311 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0000725 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000211 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC144.19 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- prl46 prl46+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005494 G364A Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G364A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0005463 G364A Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G364A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000013 G364A Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2-G364A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r9-r18),∆(r19-r29)-mammalian-MCE Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S5A-MCE fusion_or_chimera ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPBC19G7.09 FYPO:0007537 wild type Overexpression 972 h- ulp1 ulp1+ wild_type ECO:0000049 PMID:33159083 4896 2020-12-01 PomBase SPBC19G7.09 FYPO:0001870 wild type Overexpression 972 h- ulp1 ulp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPBC19G7.09 FYPO:0000964 wild type Overexpression 972 h- ulp1 ulp1+ wild_type ECO:0005638 PMID:37970674 4896 2023-11-17 PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0007049 loz1(462-522)-Anid\mtfA(1-230) Overexpression 972 h- loz1 loz1(462-522)-mtfA(1-230) loz1-426-522:mtfA-1-230 fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24831008 4896 2020-02-08 (Figure 7) the goal of the experiments in this figure is to map the minimal region of loz1 that is required for zinc-responsiveness by generating gene fusion with MtfA, a transcription factor from Aspergillus nidulans that contains a double zinc finger domain with high similarity to Loz1 from S. pombe, but contains no other similarity. When expressed in S. pombe this gene fusion was regulated by zinc, suggesting that the region necessary for zinc responsiveness in S. pombe, maps to the zinc finger domains PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 loz1(462-522)-Anid\mtfA(1-230) Overexpression 972 h- loz1 loz1(462-522)-mtfA(1-230) loz1-426-522:mtfA-1-230 fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPAC5H10.06c) PMID:24831008 4896 2020-02-08 (Figure 7) the goal of the experiments in this figure is to map the minimal region of loz1 that is required for zinc-responsiveness by generating gene fusion with MtfA, a transcription factor from Aspergillus nidulans that contains a double zinc finger domain with high similarity to Loz1 from S. pombe, but contains no other similarity. When expressed in S. pombe this gene fusion was regulated by zinc, suggesting that the region necessary for zinc responsiveness in S. pombe, maps to the zinc finger domains and an upstream accessory domain PomBase SPAC25B8.19c FYPO:0006830 loz1(462-522)-Anid\mtfA(1-230) Overexpression 972 h- loz1 loz1(462-522)-mtfA(1-230) loz1-426-522:mtfA-1-230 fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000172 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:24831008 4896 2020-02-08 (Figure 7) the goal of the experiments in this figure is to map the minimal region of loz1 that is required for zinc-responsiveness by generating gene fusion with MtfA, a transcription factor from Aspergillus nidulans that contains a double zinc finger domain with high similarity to Loz1 from S. pombe, but contains no other similarity. When expressed in S. pombe this gene fusion was regulated by zinc, suggesting that the region necessary for zinc responsiveness in S. pombe, maps to the zinc finger domains and an upstream accessory domain PomBase SPCC1494.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPCC1494.08c SPCC1494.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1494.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- SPCC1494.08c SPCC1494.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1494.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC1494.08c SPCC1494.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1494.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC1494.08c SPCC1494.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1494.08c FYPO:0009007 deletion 972 h- SPCC1494.08c SPCC1494.08cdelta deletion 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2014-10-31 PomBase SPAC8F11.07c FYPO:0002060 R370* Not assayed or wild type 972 h- cdc24 cdc24-M38 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000118 484-683 Overexpression 972 h- ura4-D18 plo1 plo1-1-483 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0001838 A634E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A634E amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 (Figure 6c) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0002061 A634E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A634E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0000268 A634E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A634E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:31072933 4896 2019-05-17 PomBase SPBC11C11.04c FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp1 alp1-1356 unknown ECO:0001232 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.18c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC2F3.18c SPAC2F3.18cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000172 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004885 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC594.07c) PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001894 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:23133674 4896 2013-11-21 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004790 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004889 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC12D12.01) PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002834 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000137 PMID:30975915 4896 2019-05-08 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002827 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000049 low PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S1E) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002485 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005915 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000059 PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005932 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000059 PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005916 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000059 PMID:25798942 4896 2017-02-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002339 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 5) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000581 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 high PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007419 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000337 PMID:31980821 4896 2020-06-22 (Fig. 3D) We confirmed that telomere foci moved from nuclear periphery to a more central area (zone 1 to zone 2 or 3) in bqt4Δ Vg cells PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0005371 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000137,FYECO:0000263 PMID:30975915 4896 2019-05-08 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002969 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:29292846 4896 2019-08-16 (Fig. 5) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004890 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:30503780 4896 2018-12-20 (Figures 5A and 5B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 60 PMID:30503780 4896 2019-01-02 (Figures 5C) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004791 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:22959349 4896 2015-09-22 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007421 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000231 PMID:31980821 4896 2020-06-22 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007421 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000231 high assayed_using(SO:0001923) PMID:31980821 4896 2020-06-22 TERRA level was higher in bqt4Δ than WT in vegetative cells and this difference was substantially intensified after 48H in quiescence (Figure 6A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002908 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000231 assayed_using(SO:0001923) PMID:31980821 4896 2020-06-12 TERRA level was higher in bqt4Δ than WT in vegetative cells and this difference was substantially intensified after 48H in quiescence (Figure 6A) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001870 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 PMID:37970674 4896 2024-03-11 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002336 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000049 PMID:32817556 4896 2021-02-10 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000833 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC594.07c) PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0003627 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC589.12) PMID:36799444 4896 2023-06-09 (Fig. 2D) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002563 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.05c) PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 5) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000703 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_protein(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:36799444 4896 2023-06-08 We performed an IP-WB experiment on the bqt4Δ background (‘bqt4Δ’ in Fig. 2A). Deletion of bqt4+ did not affect these interactions, indicating that Cho2, Ole1 and Erg11 interact with Lem2 independent of Bqt4. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000703 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.03) PMID:36799444 4896 2023-06-08 We performed an IP-WB experiment on the bqt4Δ background (‘bqt4Δ’ in Fig. 2A). Deletion of bqt4+ did not affect these interactions, indicating that Cho2, Ole1 and Erg11 interact with Lem2 independent of Bqt4. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000703 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13A11.02c),assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:36799444 4896 2023-06-08 We performed an IP-WB experiment on the bqt4Δ background (‘bqt4Δ’ in Fig. 2A). Deletion of bqt4+ did not affect these interactions, indicating that Cho2, Ole1 and Erg11 interact with Lem2 independent of Bqt4. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001317 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC594.07c) PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006516 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0000337 PMID:31980821 4896 2020-06-12 (Fig. 5A) bqt4delta/ telomerase + cells exhibited wild-type telomeres that were stable in post-mitotic cells PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001420 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001420 deletion 972 h- bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19948484 4896 2015-09-25 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph bqt4 bqt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- 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disruption ECO:0001232 PMID:1989884 4896 2012-11-22 PomBase SPBC119.11c FYPO:0002061 disruption Null 972 h- pac1 pac1delta::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:1989884 4896 2012-11-22 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005485 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:25254656 4896 2019-05-29 (Figure 3C) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008024 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 13) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005682 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25254656 4896 2019-05-29 (Figure 4A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 5B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31276588 4896 2022-10-21 (Figure 1C) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 The derepression of Pho1 seen in asp1-H397A cells was erased by snf22∆, to the extent that acid phosphatase activity in snf22∆ asp1-H397A cells was the same as that of the wild-type control (Fig. 2B). PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 7B, 8B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 2C) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008277 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000335 low PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008279 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000335 high PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0003417 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC25B2.08) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC354.12) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB7E8.01) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPB24D3.07c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1815.01) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.06) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC317.01) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC32F12.11) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP8B7.26) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.01) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC16A3.08c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.09c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23A1.10) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPB18E9.05c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC11B10.08) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC3H7.05c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC409.08) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1604.03c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC343.12) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1786.02),assayed_transcript(PomBase:SPBC36.03c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPB15E9.01c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.01) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC19C7.05) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001890 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1002.12c) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006614 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:31276588 4896 2022-10-21 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000047 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31276588 4896 2022-10-21 (Figure 1B) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0008285 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001513 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005342 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. 4E) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002085 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 5A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 10) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 10) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 2A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 11A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37772819 4896 2023-10-06 (Fig. 7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001357 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 7A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006476 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:27697865 4896 2018-04-03 (Fig. S4) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0004025 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0000069 H397A Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25254656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001001 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005580 PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPAC144.13c FYPO:0004233 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005580 PMID:21118960 4896 2012-02-24 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002798 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:32361273 4896 2020-10-05 deletion mutants of either ste9 or rum1 fail to degrade Cdc13 (Figures S4A and S4B). PomBase SPAC144.13c FYPO:0000581 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 PMID:9571240 4896 2019-03-04 PomBase SPAC144.13c FYPO:0004108 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.02) PMID:10921876 4896 2014-12-01 (Fig. 3) PomBase SPAC144.13c FYPO:0004108 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:10921876 4896 2014-12-01 (Fig. 3) PomBase SPAC144.13c FYPO:0001178 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 low PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002048 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001164 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9571240 4896 2019-03-04 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001164 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:9571240 4896 2019-03-04 PomBase SPAC144.13c FYPO:0005410 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. S3G, S3H) PomBase SPAC144.13c FYPO:0005410 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. S3I, S3J) PomBase SPAC144.13c FYPO:0004110 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:10921878 4896 2014-12-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0004107 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.02) PMID:10921876 4896 2014-12-01 (Fig. 3) PomBase SPAC144.13c FYPO:0004107 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:10921876 4896 2014-12-01 (Fig. 3) PomBase SPAC144.13c FYPO:0001903 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 PMID:9571240 4896 2019-03-05 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001420 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 PMID:9571240 4896 2019-03-04 PomBase SPAC144.13c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000280 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 PMID:9571240 4896 2019-03-04 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001491 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srw1 srw1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.06c FYPO:0001914 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo9 spo9-B261 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:17596513 4896 2015-07-30 PomBase SPBC36.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo9 spo9-B261 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:17596513 4896 2015-07-30 PomBase SPBC36.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo9 spo9-B261 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17596513 4896 2015-07-30 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0005089 K40R,K41R Not assayed or wild type 972 h- mcs6 mcs6-K40R,K41R amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC19F8.07) PMID:15829570 4896 2015-11-21 PomBase SPBC211.04c FYPO:0002060 K482A Not assayed or wild type 972 h- N-terminal 3 x HA mcm6 mcm6-KA mcm6-K>A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11973289 4896 2012-11-15 PomBase SPBC211.04c FYPO:0002060 K482A Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-KA mcm6-K>A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11973289 4896 2012-11-15 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0005330 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta rev1 rev1delta deletion ECO:0000049 high PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0005331 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta rev1 rev1delta deletion ECO:0000049 low PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rev1 rev1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0005328 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta rev1 rev1delta deletion ECO:0000049 PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rev1 rev1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0002102 deletion 972 h- rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 PMID:20404181 4896 2014-06-11 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0005626 deletion 972 h- rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 complete PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 3I, Fig. 4A, Fig. S6 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0001420 deletion 972 h- rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 PMID:20404181 4896 2014-06-13 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0005625 deletion 972 h- rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 3I, Fig. 4A, Fig. S6 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0000102 deletion 972 h- rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 PMID:22064477 4896 2012-04-16 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0005623 deletion 972 h- rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 low PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 3I, Fig. 4A, Fig. S6 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rev1 rev1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rev1 rev1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high 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unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:672898 4896 2013-07-16 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:7217015 4896 2020-06-25 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:3442828 4896 2015-06-16 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:3442828 4896 2015-06-16 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0004318 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:28366743 4896 2020-06-01 (Fig. 1B) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-01 fig 1c PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-01 (Fig. 1C) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-01 (Figure 4C) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0000705 K20A,E21A,N22A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 mad3 mad3-KEN1-AAA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure 4D) PomBase SPCC962.02c FYPO:0003241 C95A Overexpression 972 h- bir1 bir1-C95A bir1-C105A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000940 R346I,K347R,Y348L Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-13 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:29021344 4896 2018-02-01 (Figure S5D) PomBase SPBC800.03 FYPO:0008413 wild type Overexpression 972 h- clr3 clr3+ wild_type ECO:0000049 10 low PMID:40063661 4896 2025-06-06 (Fig. 1E) PomBase SPBC800.03 FYPO:0002360 wild type Overexpression 972 h- clr3 clr3+ wild_type ECO:0000049 PMID:18809570 4896 2024-04-18 (Fig. 5A) PomBase SPBC30B4.07c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ tfb4 tfb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC30B4.07c FYPO:0002170 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tfb4 tfb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30B4.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- tfb4 tfb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC30B4.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tfb4 tfb4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0002060 K94A Overexpression 972 h- cmk2 cmk2-K94A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12135745 4896 2014-08-16 PomBase SPBC530.12c FYPO:0001422 R363A Not assayed or wild type 972 h- pdf1 pdf1-R363A pdf1-R344A amino_acid_mutation ECO:0000333 PMID:15075260 4896 2012-02-24 PomBase SPAC16.04 FYPO:0003412 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000233 PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC16.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dus3 dus3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:34798057 4896 2021-12-02 (Figure S1D) PomBase SPAC16.04 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dus3 dus3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001327 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:34798057 4896 2021-12-02 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001327 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:34798057 4896 2021-12-02 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001327 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.03) PMID:34798057 4896 2021-12-08 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC16.04 FYPO:0002091 deletion 972 h- dus3 dus3delta deletion ECO:0001232 PMID:34798057 4896 2021-12-02 (Figures 6I, 6J) PomBase SPAC16.04 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dus3 dus3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.04 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph dus3 dus3delta 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We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. 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ade6-M210 trm11 trm11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0001983 478-579 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) but failed to detect fragment B, D, E, H, J or K. PomBase SPAC1705.03c FYPO:0006836 478-579 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6F6.04c SPAC6F6.04cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0008170 T212E Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212E amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000140 medium assayed_protein(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:16428435 4896 2024-03-22 (Fig. 2D) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002243 T212E Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212E amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 6) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001164 T212E Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18231579 4896 2015-11-12 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0000268 T212E Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T212E amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:18231579 4896 2015-11-12 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000703 S2A,T3A,S6A Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-S2A,T3A,S6A cdc4-S2AT3AS6A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10364209 4896 2020-12-30 The same level of Myo2p co-immunoprecipitated with mutant Cdc4p as with wild-type Cdc4p (Fig. 5A). PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0001357 S2A,T3A,S6A Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-S2A,T3A,S6A cdc4-S2AT3AS6A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10364209 4896 2020-12-30 DNS PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0006518 374-413 Not assayed or wild type 972 h- pqr1 pqr1-deltaRING partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0003762 S633G,P661A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-S633G,P661A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S4a) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005212 S633G,P661A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-S633G,P661A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S4a) PomBase SPAC1565.04c FYPO:0000302 unknown Not assayed or wild type 972 h- ste4 ste4-JMl04 unknown ECO:0001232 PMID:1934121 4896 2013-02-01 PomBase SPAC1565.04c FYPO:0000822 unknown Not assayed or wild type 972 h- ste4 ste4-JMl04 unknown ECO:0001232 PMID:1934121 4896 2013-02-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 L170LRGTPL Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-F39 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-h11 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-h11 unknown ECO:0005638 high PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-h11 unknown ECO:0005638 high PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph abp1 abp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph abp1 abp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph abp1 abp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph abp1 abp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- abp1 abp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 abp1 abp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPJ760.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 abp1 abp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 hub1-(AAKGG)-sde2(85-263) Not assayed or wild type 972 h- sde2 hub1-AAKGG-sde2-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 (Fig. EV2B) processing defective, does not complement sde2Δ PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 E361A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E361A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 E361A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E361A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 E361A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E361A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 E361A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E361A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002679 L357A,F361A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L357A,F361A sin1-AA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001645 L357A,F361A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L357A,F361A sin1-AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000703 L357A,F361A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-L357A,F361A sin1-AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0001192 deletion 972 h- sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:8886983 4896 2014-01-14 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.09 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sts5 sts5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 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PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000082 E69V,E106V Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-E14 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9264467 4896 2013-06-03 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000283 E69V,E106V Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-E14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9264467 4896 2013-06-04 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0000324 E69V,E106V Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-E14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9264467 4896 2013-06-04 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001400 E69V,E106V Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-E14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9264467 4896 2013-06-04 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0003241 E69V,E106V Not assayed or wild type 972 h- cam1 cam1-E14 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9264467 4896 2016-03-07 PomBase SPBC21.05c FYPO:0000280 unknown Not assayed or wild type 972 h- ral2 ral2-23A unknown ECO:0005638 PMID:8575018 4896 2014-10-24 PomBase SPAC144.09c FYPO:0000659 268-285 Not assayed 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This is expected for an essential mitoribosomal protein because S. pombe is a petite- negative yeast, i.e. that cannot tolerate the complete loss of the mtDNA, or similarly a complete block in mitochondrial translation PomBase SPNCRNA.720 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.720 SPNCRNA.720+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.720 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.720 SPNCRNA.720+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.720 FYPO:0000095 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.720 SPNCRNA.720+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.720 FYPO:0000841 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.720 SPNCRNA.720+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.720 FYPO:0000112 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.720 SPNCRNA.720+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000082 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002869 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC22F8.08) PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001253 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:40114852 4896 2025-04-08 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:40114852 4896 2025-04-09 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 W218C,G284E,E430V,R708* Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22 amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:40114852 4896 2025-04-09 PomBase SPCC297.03 FYPO:0004840 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000082 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:19371376 4896 2012-06-21 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003743 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 high PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003650 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003032 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-13 the level of ght5 transcription, which increases in the WT during glucose limitation, fails to increase in this mutant cells in low-glucose medium. PomBase SPCC297.03 FYPO:0008128 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:25411338 4896 2015-08-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001122 W337* Not assayed or wild type 972 h- ssp1 ssp1-837 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:19371376 4896 2012-06-21 PomBase SPAC3F10.10c FYPO:0000280 F214K Not assayed or wild type 972 h- map3 map3-F214K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25831518 4896 2016-06-08 PomBase SPBC646.12c FYPO:0001531 R195A,R340A Not assayed or wild type 972 h- gap1 gap1-R195A,R340A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC17H9.09c) PMID:29453312 4896 2018-03-22 PomBase SPBC646.12c FYPO:0006500 R195A,R340A Not assayed or wild type 972 h- gap1 gap1-R195A,R340A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 29 PMID:29453312 4896 2018-03-22 PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0003404 C111A Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-C111A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002151 1548-1752 Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-deltaCTD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002150 1548-1752 Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-deltaCTD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPAC767.01c FYPO:0002788 428-678 Not assayed or wild type 972 h- vps1 vps1-delta251 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:19643199 4896 2020-12-30 PomBase SPBC649.05 FYPO:0000705 G71V,I72A,L73A,K83A,V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-PDSA cut12.PDSA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1E) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 G71V,I72A,L73A,K83A,V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-PDSA cut12.PDSA amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 G71V,I72A,L73A,K83A,V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-PDSA cut12.PDSA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 G71V,I72A,L73A,K83A,V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-PDSA cut12.PDSA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000444 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000260 50 PMID:11027257 4896 2015-02-09 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0004371 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000170 PMID:11027257 4896 2015-02-13 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002097 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0001645 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.10c) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0001645 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC17D11.06) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002019 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000337 medium PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. S3) PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002019 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000228 medium PMID:12697806 4896 2015-02-16 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000614 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000260 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0004255 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11027257 4896 2015-02-09 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005638 low PMID:11027257 4896 2015-02-09 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000333 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000110 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0003555 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000049 PMID:12697806 4896 2015-02-16 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000969 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000963 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.10c) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC17D11.06) PMID:11027257 4896 2015-02-10 PomBase SPBC17D11.06 FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- spp2 spp2-9 unknown 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PomBase SPAC25G10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- rps2801 rps2801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC25G10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps2801 rps2801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25G10.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps2801 rps2801delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002678 S720A,S732A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-S720A,S732A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000140 PMID:24006488 4896 2013-12-06 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002898 S720A,S732A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-S720A,S732A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:24006488 4896 2013-12-06 PomBase SPBC336.12c FYPO:0002986 S720A,S732A Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-S720A,S732A 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SPCC1840.03 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000091 deletion 972 h- sal3 sal3delta deletion ECO:0000291 PMID:22268381 4896 2019-10-30 (Fig. 4) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- sal3 sal3delta deletion ECO:0001232 high PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 2a) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sal3 sal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 sal3 sal3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0003481 deletion 972 h- sal3 sal3delta deletion ECO:0001232 complete PMID:12399381 4896 2016-09-09 (Figure 2a) PomBase SPCC1840.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- sal3 sal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sal3 sal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- sal3 sal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPCC1840.03 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 sal3 sal3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002148 720-934 Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1deltaC720-934 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002061 720-934 Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1deltaC720-934 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPCC645.07 FYPO:0001529 772-1003 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. S4C) PomBase SPCC645.07 FYPO:0000929 772-1003 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. S4D) PomBase SPCC645.07 FYPO:0005798 772-1003 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1706.01) PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. S4E) PomBase SPCC645.07 FYPO:0002848 772-1003 Not assayed or wild type 972 h- rgf1 rgf1deltaPH partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 50 PMID:39509469 4896 2025-01-23 (Fig. S4G) PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000705 1-328 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-(329-665) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 (Fig. S2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S2A,S7A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S2A-S7A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph cbc3 cbc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC16C4.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- cbc3 cbc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0003738 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 10 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0004506 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 40 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0003829 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0002391 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0001514 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0000228 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 5 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0002901 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPBC17D1.04 FYPO:0000732 unknown Not assayed or wild type 972 h- acr1 acr1-936 unknown ECO:0001232 PMID:18362178 4896 2015-03-11 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-PD2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-PD2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000658 S87P Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-S87P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPCC162.08c FYPO:0002563 864-1837 Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211-1-863 partial_amino_acid_deletion ECO:0006031 assayed_protein(PomBase:SPCC162.08c) PMID:39666777 4896 2025-03-03 (Figure 5C) PomBase SPCC162.08c FYPO:0002060 864-1837 Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ura4-D18 ade6-M210 nup211 nup211-1-863 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000103,FYECO:0000137,FYECO:0000263 PMID:39666777 4896 2025-03-03 Exogenous expression of Nup211, Nup2111-863, or Nup2111-655 restored cell viability; however, expression of Nup2111-1033 only led to a partial recovery (Fig 4A) PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0000470 deletion 972 h- cyp8 cyp8delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cyp8 cyp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cyp8 cyp8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cyp8 cyp8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- cyp8 cyp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cyp8 cyp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cyp8 cyp8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:12553909 4896 2013-04-25 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004198 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. 4D, 4E) PomBase SPBC582.03 FYPO:0003950 wild type Overexpression 972 h- cdc10-V50 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004705 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 PMID:26527280 4896 2020-06-16 (Figures 3B, 3D). sister chromatid separation (which depends on securin degradation, not on cyclin B degradation) was delayed as well PomBase SPBC582.03 FYPO:0000274 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 high PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. 3A, 3B) PomBase SPBC582.03 FYPO:0001130 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. S6L, S6M) PomBase SPBC582.03 FYPO:0000333 wild type Overexpression 972 h- cdc10-V50 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 PMID:26527280 4896 2020-06-16 (Fig. 1J) PomBase SPBC582.03 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005638 PMID:17178839 4896 2016-06-13 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004067 R405A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-R405A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004068 R405A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-R405A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPBC342.05 FYPO:0005199 1-534,S666A Overexpression 972 h- crb2 crb2(BRCT-778,S666A) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.05) PMID:14739927 4896 2016-01-18 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000969 1-534,S666A Overexpression 972 h- crb2 crb2(BRCT-778,S666A) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003075 1-534,S666A Overexpression 972 h- crb2 crb2(BRCT-778,S666A) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPBC211.04c FYPO:0004922 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mis5-226 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K53R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K53R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K53R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K53R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC1348.12 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC1348.12 SPBC1348.12delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1039.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1039.01 SPAC1039.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- cwg2 orb7- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000703 1960-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S4C) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002357 1960-2335 Not assayed or wild type 972 h- tor1 tor1-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPAC1250.05 FYPO:0001908 rpl3002-Rbz(ribozyme) Not assayed or wild type 972 h- rpl3002 rpl3002-Rbz fusion_or_chimera ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 In contrast, the expression of nonpolyadenylated rpl30-2 from the ribozyme construct was largely insensitive to Pab2- and Rrp6-dependent degradation (Figure 3C, lanes 4-6). PomBase SPAC17C9.13c FYPO:0001786 218-263,Y94A,R99A,Y102A,R106A Not assayed or wild type 972 h- cut8 cut8(1-217)-4A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.13c) PMID:21976488 4896 2012-11-15 PomBase SPAC4C5.02c FYPO:0001838 G53A Not assayed or wild type 972 h- ryh1 sat7-110 nucleotide_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPAC13G7.04c FYPO:0002128 1-180 Not assayed or wild type 972 h- mac1 mac1(181-756) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.04c) PMID:12206652 4896 2014-08-19 PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0006518 H229R Not assayed or wild type 972 h- dhp1 dhp1-154 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005268 D25A Knockdown 972 h- cdc10-M17 mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000211,FYECO:0000291 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001118 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 74 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000705 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001382 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 high assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000581 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0002150 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000088 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000267 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000089 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000268 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001234 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0000646 D25A Knockdown 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0005371 wild type Overexpression 972 h- act1 act1+ wild_type ECO:0000059 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- act1 act1+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:12237855 4896 2014-02-20 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- act1 act1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPBC32H8.12c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- act1 act1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:10526238 4896 2014-07-30 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003412 tea4::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 tea4 tea4::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0007139 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0007116 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002699 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 Figure 6A PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002699 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 Figure 6A PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002699 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC428.13c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 Figure 6A PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0006326 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 Figure 6A PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0004653 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 (Fig. 5) PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0000639 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 Figure 6A PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0001368 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002999 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0007133 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0007134 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC428.13c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002060 310-712 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-pdeltaIQ partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPBC839.17c FYPO:0001147 wild type Overexpression 972 h- fkh1 fkh1+ wild_type ECO:0001232 PMID:11335722 4896 2015-03-30 PomBase SPBC839.17c FYPO:0001357 wild type Overexpression 972 h- fkh1 fkh1+ wild_type ECO:0005638 PMID:11335722 4896 2015-03-30 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 26-GVPK,Q27* Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-E2 other ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 26-GVPK,Q27* Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-E2 other ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 26-GVPK,Q27* Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-E2 other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC1705.03c FYPO:0001983 376-477 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtD partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) but failed to detect fragment B, D, E, H, J or K. PomBase SPAC1705.03c FYPO:0006836 376-477 Not assayed or wild type 972 h- ecm33 ecm33-fgtD partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3B) PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000583 S34A,S35A,S39A,S43A,T44A,T231A,T339A,S343A,S694A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0000846 S34A,S35A,S39A,S43A,T44A,T231A,T339A,S343A,S694A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-9A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002679 S34A,S35A,S39A,S43A,T44A,T231A,T339A,S343A,S694A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-9A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c),assayed_substrate(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002768 S34A,S35A,S39A,S43A,T44A,T231A,T339A,S343A,S694A Not assayed or wild type 972 h- mei2 mei2-9A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mtq1 mtq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mtq1 mtq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mtq1 mtq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mtq1 mtq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtq1 mtq1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- mtq1 mtq1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtq1 mtq1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29B12.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtq1 mtq1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001383 198-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-197) partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0007114 198-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-197) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0004367 198-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-197) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-12 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002085 198-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-197) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001042 disruption 972 h- srp54 srp54::LEU2 disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 disruption 972 h- srp54 srp54::LEU2 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0000251 49-203 972 h- H1::hygr atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0002060 49-203 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0002177 49-203 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg43 atg43-1 atg43::kanMX4(nt49-203) partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.05 FYPO:0007325 D90G Not assayed or wild type 972 h- rpc11 rpc11-D90G amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.10c) PMID:15632064 4896 2020-04-02 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0003029 deletion 972 h- cyp1 cyp1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-28 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cyp1 cyp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph cyp1 cyp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cyp1 cyp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- cyp1 cyp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cyp1 cyp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cyp1 cyp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 S420A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-S420A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 S420A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-S420A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 S420A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-S420A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000151 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:23370392 4896 2013-05-15 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000141 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 high PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5C) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008164 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:15509783 4896 2019-05-11 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008164 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:11909965 4896 2019-05-11 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004318 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:12606573 4896 2021-09-21 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004318 deletion 972 h- nda3-KM311 bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 1A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004318 deletion 972 h- cut7-446 bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S2A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004318 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004318 deletion 972 h- nda3-KM311 bub1 bub1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000006 PMID:36537249 4896 2023-04-08 As shown in Fig. 1A,B, the percentage of mitotic WT cells displaying Plo1-GFP signals increased over time upon incubation at 16°C and, 8 h after cold treatment, ∼90% of WT cells were arrested at preanaphase presumably due to the activation of the SAC. As Bub1 is a core component of the SAC (Fischer et al., 2021), the absence of Bub1 was expected to abolish the SAC. Consistently, the percentage of mitotic bub1Δ cells remained low (<10%) throughout the period of cold treatment (Fig. 1A,B). PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007688 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:16360688 4896 2024-04-24 , Sgo1 is seen as nuclear staining with punctate dots of fluorescence along the spindle (Figure 1D and [2, 9]). This localization is abolished in a bub1D background but preserved in the truncated mutants (Figure 1D), although the signal intensity was variable; in bub11-585, Sgo1 staining was as strong as in the wild-type, but it was weaker in bub11-179 and bub11-826 backgrounds. We conclude that the N terminus of Bub1 is sufficient to promote correct Sgo1 localization and function during MI. PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007400 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. 3E) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008166 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 5B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:19680287 4896 2020-06-12 (Fig. S6C,D) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4A and S7) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007383 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 4A and S8) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007650 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:14730319 4896 2021-02-16 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007651 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 4d) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005396 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 3B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000705 deletion 972 h- cdc25-22 bub1 bub1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S1e) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000705 deletion 972 h- cdc25-22 bub1 bub1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S3B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006260 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 4c) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000229 deletion 972 h- nda3-KM311 bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:9864354 4896 2019-10-30 (Fig. 2D) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005918 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. S6) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001645 deletion 972 h- cdc25-22 bub1 bub1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S3B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005780 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 90 PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000581 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 61 PMID:26483559 4896 2016-07-11 (Fig. 9A) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 low PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 5E) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008202 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 40 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1a) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006263 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(SO:0001997) PMID:26804021 4896 2017-11-19 (Fig. 5) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005225 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(SO:0001997) PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 5) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001840 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000059 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001840 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 PMID:22521786 4896 2013-11-27 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000786 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000049 3.5 PMID:15509783 4896 2019-05-11 Table2 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000650 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 high PMID:12606573 4896 2021-09-21 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005917 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000231 PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 5C) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0004827 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 21 PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 2E) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000228 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000228 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000049 17.5 PMID:15509783 4896 2019-05-11 Table2 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000228 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000228 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:36537249 4896 2023-04-06 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bub1 bub1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007125 deletion 972 h- nda3-KM311 bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:9864354 4896 2019-10-30 (Fig. 2E) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007125 deletion 972 h- nda3-KM311 bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 PMID:9864354 4896 2019-10-30 (Fig. 2E) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000674 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0002141 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 bub1 bub1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001164 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:28567704 4896 2017-10-20 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001164 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26581324 4896 2015-12-07 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001164 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19965387 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0005212 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC106.01) PMID:22660415 4896 2024-03-19 (Fig. 1D) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000703 deletion 972 h- cdc25-22 bub1 bub1delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000235,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:28366743 4896 2020-06-15 (Figure S3B) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0006272 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0000059 PMID:26804021 4896 2017-10-21 (Fig. 7b) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0001098 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000326 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000094 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22281223 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0003840 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000088 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000089 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000211 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000091 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000091 deletion 972 h- bub1 bub1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18062930 4896 2015-01-13 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0000091 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thi4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H4.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thi4 thi4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002061 259-383 Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4delta bqt4 bqt4delta259-383 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:38825008 4896 2025-04-19 Upon shut-off of lem2, the cells expressing D1-140 and D259 to 383 fragments of Bqt4 did not grow, whereas the cells expressing D141 to 262 did (Fig. 1B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0004887 259-383 Not assayed or wild type 972 h- lem2-shut-off bqt4delta bqt4 bqt4delta259-383 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:38825008 4896 2025-04-19 All these fragments as well as wild-type Bqt4 (FL) were localized to the NE (Fig. 1C), suggesting that the lethality was not caused by the loss of NE localization. PomBase SPBC409.10 FYPO:0000741 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade7 ade7-50 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000178,FYECO:0000192 is_bearer_of(PATO:0001261) PMID:499806 4896 2016-06-30 PomBase SPAC6F12.02 FYPO:0002052 T253A Not assayed or wild type 972 h- rst2 rst2-M2 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:11739717 4896 2017-07-14 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15E1.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC15E1.02c SPAC15E1.02cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 K195A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-K195A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004303 R223Q Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-R223Q amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:12556522 4896 2015-01-14 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 H98R Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-H98R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:9622480 4896 2015-12-01 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000080 P286T,G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-26 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 P286T,G332D Not assayed or wild type 972 h- cdc48 cdc48-353sup-26 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25658828 4896 2015-07-20 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 353-372 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 353-372 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-D3 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- pdc202 pdc202+ wild_type ECO:0005638 PMID:25102102 4896 2015-09-29 PomBase SPAC26A3.05 FYPO:0007589 1615-1666 Not assayed or wild type 972 h- chc1 chc1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 Thus, GFP-Ecm33 localized at Golgi/endosome structures in addition to the cell surface and the division site in these mutants, suggesting that GPI-anchored proteins were not correctly transported and were retained at the Golgi/endosome structures in these membrane trafficking mutants PomBase SPAC26A3.05 FYPO:0007589 1615-1666 Not assayed or wild type 972 h- chc1 chc1-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1E8.05) PMID:22848669 4896 2024-06-27 Similarly, in the wild-type cells, GFP-Gaz2 also clearly localized at the cell surface and medial regions (Figure 6C), while in Dapm1 cells, GFP-Gaz2 localized as intracellular dot-like structures (Figure 6C). PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 S2164* Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9356477 4896 2015-03-17 PomBase SPAC6F12.13c FYPO:0006518 unknown Not assayed or wild type 972 h- fps1 fps1-439 unknown ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC694.04c FYPO:0003412 SPAC694.04c::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 SPAC694.04c SPAC694.04c::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001327 511-737 Not assayed or wild type 972 h- mamRNA mamRNA-introndelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4B) PomBase SPAC664.10 FYPO:0007108 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-08 (Fig. 3d) PomBase SPAC664.10 FYPO:0005363 deletion 972 h- cdc25-22 klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:18256284 4896 2016-04-06 PomBase SPAC664.10 FYPO:0007150 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:21151990 4896 2019-11-08 PomBase SPAC664.10 FYPO:0000513 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 medium PMID:25869666 4896 2022-05-16 (Fig. 1) PomBase SPAC664.10 FYPO:0000733 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:11694582 4896 2014-11-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0004307 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:22264609 4896 2015-02-13 PomBase SPAC664.10 FYPO:0001513 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:32723864 4896 2021-04-27 (Figure 7) PomBase SPAC664.10 FYPO:0006259 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPAC664.10 FYPO:0004692 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:17254972 4896 2019-10-29 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002967 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC13E7.06) PMID:25987607 4896 2015-07-24 PomBase SPAC664.10 FYPO:0005342 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 (Fig. 1e) PomBase SPAC664.10 FYPO:0005342 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:30806623 4896 2023-07-21 (Fig. 6) PomBase SPAC664.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0003305 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 PMID:11694582 4896 2014-11-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0001491 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 PMID:11694582 4896 2014-11-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6- klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:11018050 4896 2016-10-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6- klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:11018050 4896 2023-01-25 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- his3-D1 leu1-32 ura4-D18 ade6- klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:11018050 4896 2023-01-25 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- klp2 klp2delta deletion ECO:0005638 PMID:11694582 4896 2014-11-28 PomBase SPAC664.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp2 klp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.09 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trp3 trp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.09 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trp3 trp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- trp3 trp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trp3 trp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0003066 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0008168 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC409.03) PMID:17304215 4896 2022-01-12 On the other hand, the nuclei of sfr1D cells contained Swi5-EGFP foci PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0003814 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0005660 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 4C, Table S5) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000185 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000049 PMID:17304215 4896 2009-02-10 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002485 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 4B, Table S5) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002485 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000059 PMID:22723423 4896 2013-08-12 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0003179 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000049 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 4A, Table S5) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000581 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 PMID:25414342 4896 2016-06-29 (Fig. 4D, Table S5) PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000199 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0000049 PMID:17304215 4896 2009-02-10 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0001164 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0004245 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005801 FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0004083 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC409.03) PMID:17304215 4896 2022-01-12 (Figure 1B) The absence of Swi2 or Sfr1 did not affect the cellular expression level of the Swi5-EGFP protein . PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0001124 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000085 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19185548 4896 2012-10-23 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000267 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:18769921 4896 2016-09-27 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000267 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:18769921 4896 2016-09-27 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000267 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:18769921 4896 2016-09-29 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:18769921 4896 2016-09-27 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 low PMID:18769921 4896 2016-09-27 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:29898918 4896 2018-07-03 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000089 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:34208949 4896 2021-07-15 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000268 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:18769921 4896 2016-09-27 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000268 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 medium PMID:18769921 4896 2016-09-27 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000268 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 medium PMID:18231579 4896 2015-11-12 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0000925 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 PMID:22723423 4896 2013-08-07 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfr1 sfr1delta sfr1-2 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000361 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0004321 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0005580 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0003165 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0003286 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0001232 93 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001840 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0000059 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0000284 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10756203 4896 2015-12-02 PomBase SPAC1783.05 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- hrp1 hrp1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9520266 4896 2014-04-29 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0002623 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1- unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:11453251 4896 2013-09-03 PomBase SPAC8C9.03 FYPO:0001259 unknown Not assayed or wild type 972 h- cgs1 cgs1- unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:11453251 4896 2013-09-03 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005300 T257A,T422A,T552A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-3TA amino_acid_mutation ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003762 T257A,T422A,T552A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 spc7 spc7-3TA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0007962 74-659 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d9 B2d9 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 medium PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Table 2) PomBase SPAC1142.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc201 noc201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1142.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- noc201 noc201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1142.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 noc201 noc201delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.04 FYPO:0001645 Y577A Not assayed or wild type 972 h- sup35 sup35-Y577A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:19417105 4896 2016-10-30 Supplemental Table S1; Supplemental Fig. S3 PomBase SPAC30D11.08c FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 phf2 phf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.08c FYPO:0002150 deletion 972 h- phf2 phf2delta deletion ECO:0005638 PMID:17371846 4896 2024-06-21 We found that saf140, saf60, and saf50 are essential genes, as viability segregated 2:2 in four-spore tetrads PomBase SPAC30D11.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- phf2 phf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC30D11.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 phf2 phf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- phf2 phf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17434129 4896 2020-11-05 data not shown PomBase SPBC56F2.05c FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPBC56F2.05c SPBC56F2.05c+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC56F2.05c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPBC56F2.05c SPBC56F2.05c+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC17A3.03c FYPO:0001357 C189S Not assayed or wild type 972 h- siw14 siw14-C189S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:37772819 4896 2023-10-06 (Fig. 7) PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0002061 R2169* Not assayed or wild type 972 h- cdc20 cdc20-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9356477 4896 2015-03-17 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004596 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-9 unknown ECO:0005580 FYECO:0000309 high PMID:8087848 4896 2015-08-28 PomBase SPBC582.03 FYPO:0005711 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-9 unknown ECO:0000112 FYECO:0000227 PMID:8087848 4896 2016-09-29 p34cdc2 cdc13-9 complex was pulled down using p13suc1 beads and then western blotted using anti cdc13 antibody SP4 to show reduced levels of Cdc13 complexed with cdc2 compared to the wild type control PomBase SPBC582.03 FYPO:0000252 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000272 85 PMID:8087848 4896 2015-08-28 (Table 1) PomBase SPBC582.03 FYPO:0000252 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000309 99 PMID:8087848 4896 2016-09-29 (Table 1) PomBase SPBC582.03 FYPO:0002066 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-9 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:8087848 4896 2015-08-28 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004235 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-9 unknown ECO:0000291 FYECO:0000229,FYECO:0000260 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9303312 4896 2018-04-30 (Fig. 4C) Cdc18 transcript is low during G2 PomBase SPNCRNA.1249 FYPO:0007931 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1249 SPNCRNA.1249+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1249 FYPO:0002546 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1249 SPNCRNA.1249+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000268 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0000705 601-699 Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3deltaC sld3-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0002724 601-699 Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3deltaC sld3-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0002061 601-699 Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3deltaC sld3-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0000703 601-699 Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3deltaC sld3-1-600 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.06),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T119C,T126C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U119C,U126C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 T119C,T126C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-U119C,U126C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001245 G196A Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-A66T nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002558 1-780 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-tail myo2t-781-1526 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-13 (Fig. 1C) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002874 1-780 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-tail myo2t-781-1526 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-13 (Fig. 1C,3) PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0004227 927-935 Not assayed or wild type 972 h- hrp3 hrp3-deltacoupling_region Delta COUPLING region partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:33670267 4896 2021-04-08 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0007722 927-935 Not assayed or wild type 972 h- hrp3 hrp3-deltacoupling_region Delta COUPLING region partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:33670267 4896 2021-04-08 PomBase SPBC1105.03c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl16 mrpl16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrpl16 mrpl16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1105.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl16 mrpl16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.03c FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrpl16 mrpl16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 W605* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-W605->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30072439 4896 2019-06-26 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 W605* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-W605->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30072439 4896 2023-01-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000082 W605* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-W605->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 low PMID:30072439 4896 2019-06-26 PomBase SPAC589.12 FYPO:0000082 W605* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-W605->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 high PMID:30072439 4896 2019-07-09 PomBase SPAC589.12 FYPO:0003743 W605* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-W605->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001178 W605* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-W605->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0000450 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119E amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0004212 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119E amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Intriguingly, we found that both Sgo2 centromeric localization during mitosis and Sgo1 centromeric localization during meiosis I were dramatically delocalized in the K119D and K119E mutants as well as the H2A-S121A mutant (Fig. 3C-E). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0002679 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119E amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.08c),residue(S121) PMID:29769606 4896 2024-04-24 Te recombinant proteins of fssion yeast H2A (SpHta1) were also purifed. An in vitro kinase assay using these recombinant proteins showed that the H2A-K119D and the H2A-K119E mutants, as well as the H2A-S121A mutant, were not signifcantly phosphorylated by Bub1, whereas H2A-K119R mutant proteins were phosphorylated by Bub1 (Fig. 4B). PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0000091 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29769606 4896 2024-04-24 We found that malonyl-mimetic K119D and K119E mutants showed sensitivity to a microtubule depolymerizing agent (TBZ) in the same way the H2A-S121A mutant had (Fig. S3B) PomBase SPAC19G12.06c FYPO:0003182 K120E Not assayed or wild type 972 h- hta2 hta2-K119E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29769606 4896 2024-04-24 Consistently, sister chromatid non-disjunction at meiosis II was signifcantly increased in the K119D and K119E mutants PomBase SPBC660.17c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC660.17c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC660.17c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC660.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC660.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC660.17c SPBC660.17cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0004229 S77A,T78A,T79A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-3A ctp1-S77A,T78A,T79A|ctp1-STT77AAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001690 S77A,T78A,T79A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-3A ctp1-S77A,T78A,T79A|ctp1-STT77AAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000963 S77A,T78A,T79A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-3A ctp1-S77A,T78A,T79A|ctp1-STT77AAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPBC8D2.23 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph new15 new15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.23 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph new15 new15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.23 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- 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assayed_using(PomBase:SPAC15E1.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:31366733 4896 2019-09-23 (Fig. 7) PomBase SPAC3H1.03 FYPO:0009007 deletion 972 h- mug151 mug151delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H1.03 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph mug151 mug151delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.03 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mug151 mug151delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.03 FYPO:0009045 deletion 972 h- mug151 mug151delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H1.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug151 mug151delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.03 FYPO:0002693 deletion 972 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6G) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0008272 9-38 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaαlpha1 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 6H) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0008273 9-38 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaαlpha1 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 6H) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0000703 9-38 Not assayed or wild type 972 h- pol1 pol1-deltaαlpha1 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.02c) PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 6I) PomBase SPBC1778.02 FYPO:0004604 S497A Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-S497A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:31131414 4896 2020-03-27 PomBase SPCC965.05c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 thp1 thp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC965.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC965.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 thp1 thp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC965.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph thp1 thp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- thp1 thp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC965.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thp1 thp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC965.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thp1 thp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 I127IGVPRI Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-J4 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPBC1105.02c FYPO:0008054 R288K Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-R288K HCS-R288K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20089861 4896 2023-02-16 Indeed, the R288K and Q364R mutations in SpHCS confer diminished sensitivity to feedback inhibition by L-lysine in vitro and in vivo (Table 2 and Fig. 4) PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0001352 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0002346 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0002827 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0006920 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30667359 4896 2019-07-11 (Figure 6B) PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0007005 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30667359 4896 2019-07-11 (Figure 6C) PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0001232 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0004026 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0000337 PMID:25313826 4896 2014-11-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0001000 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005580 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0007479 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. S1F) PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0007479 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:29899117 4896 2020-10-08 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0000478 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0001232 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0001357 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 PMID:18761674 4896 2014-07-17 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 pcf2 pcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- pcf2 pcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcf2 pcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26H5.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcf2 pcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000705 D360N Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-D360N amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0001645 D360N Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-D360N amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-26 PomBase SPAC227.07c FYPO:0000705 R52A,V54A,F56A Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-R52A,V54A,F56A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC227.07c),assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPAC227.07c FYPO:0003165 R52A,V54A,F56A Not assayed or wild type 972 h- pab1 pab1-R52A,V54A,F56A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 I524A,S525A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-IS524.525AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000703 I524A,S525A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-IS524.525AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 I524A,S525A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-IS524.525AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001355 1-265,912-1150 Overexpression 972 h- rga1 rga1-N2(266-911) rga1N2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPBC3F6.05 FYPO:0001315 1-265,912-1150 Overexpression 972 h- rga1 rga1-N2(266-911) rga1N2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11737264 4896 2020-07-09 PomBase SPAPB24D3.10c FYPO:0001181 E484D Not assayed or wild type 972 h- agl1 agl1-E484D amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11298744 4896 2012-07-09 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000082 D354G Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-P2 cdc10-P10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000833 D354G Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-P2 cdc10-P10 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:1406591 4896 2013-02-19 PomBase SPAC750.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC750.08c SPAC750.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC750.08c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph SPAC750.08c SPAC750.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC750.08c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPAC750.08c SPAC750.08cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC750.08c FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC750.08c SPAC750.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 low PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC750.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC750.08c SPAC750.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC750.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC750.08c SPAC750.08cdelta deletion 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Overexpression 972 h- dsk1 dsk1+ wild_type ECO:0005638 high PMID:39789818 4896 2025-05-15 We then overexpressed dsk1+ from the constitutive adh21 promoter with medium strength at the lys1 locus of S. pombe genome (Chen et al. 2017). This made the cells highly sensitive to CPT and marginally sensitive to MMS (Figure 1g). PomBase SPBC530.14c FYPO:0000089 wild type Overexpression 972 h- dsk1 dsk1+ wild_type ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 We then overexpressed dsk1+ from the constitutive adh21 promoter with medium strength at the lys1 locus of S. pombe genome (Chen et al. 2017). This made the cells highly sensitive to CPT and marginally sensitive to MMS (Figure 1g). PomBase SPBC800.13 FYPO:0004213 unknown Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-ts1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC800.13 FYPO:0001946 unknown Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-ts1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC800.13 FYPO:0002902 unknown Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-ts1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.12) PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC800.13 FYPO:0002901 unknown Not assayed or wild type 972 h- cnp20 cnp20-ts1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:19758558 4896 2014-12-18 PomBase SPBC146.13c FYPO:0006030 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 52 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000708 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0005638 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001355 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001355 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002021 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 16 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000650 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0000650 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11076964 4896 2018-12-19 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001406 myo1::his3 Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 37 low PMID:11076964 4896 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S369A,T395A Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-S369A,T395A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8039497 4896 2013-10-24 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004550 N107A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-N107A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004194 N107A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-N107A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 N107A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-N107A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC1235.05c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 fft2 fft2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1235.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- 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temperature-sensitive ark1-T7 mutant, indicating that Nsk1 does not counteract Ark1 function (Figure S2B) PomBase SPCC320.13c FYPO:0000228 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T7 unknown ECO:0005638 45 PMID:20739936 4896 2020-02-11 (Fig. S1) Nuclear staining of anaphase cells showed that the cdc13-M7 mutant, but not the conventional cdc13-117 mutant, often exhibited lagging chromosomes at anaphase (Fig. 1c). PomBase SPCC320.13c FYPO:0000085 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-T7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPBC336.03 FYPO:0000280 wild type Overexpression 972 h- efc25 efc25+ wild_type ECO:0001232 PMID:12052869 4896 2018-04-29 PomBase SPBC336.03 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- efc25 efc25+ wild_type ECO:0001232 PMID:12052869 4896 2018-04-29 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 snt1 snt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 snt1 snt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 snt1 snt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0004742 deletion 972 h- snt1 snt1delta deletion ECO:0000291 PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 2) PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0000969 deletion 972 h- snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0001690 deletion 972 h- snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0000963 deletion 972 h- snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0000957 deletion 972 h- snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22E12.19 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph snt1 snt1delta deletion 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2012-01-01 PomBase SPBC713.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- pwp2 pwp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC713.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pwp2 pwp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP23A10.03c FYPO:0001491 deletion 972 h- sdh7 sdh7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBP23A10.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- sdh7 sdh7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBP23A10.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- sdh7 sdh7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP23A10.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh7 sdh7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP23A10.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh7 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amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000705 1-2,1192-2386 Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-N(3-1191) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000251 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c),assayed_using(PomBase:SPBC216.05) PMID:17531813 4896 2017-10-30 (Fig. 4A) PomBase SPBC83.03c FYPO:0003098 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:17531816 4896 2023-03-05 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000705 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c),assayed_protein(PomBase:SPCC736.11) PMID:17531816 4896 2023-03-05 PomBase SPBC83.03c FYPO:0003412 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 low PMID:17531816 4896 2023-03-05 (dg repeat) Centromeric transcripts were only marginally elevated in tas3WG cells, in marked contrast to the 10- to 20-fold accumulation of transcripts in tas3-, dcr1-, or ago1-null cells (Figure 2B). PomBase SPBC83.03c FYPO:0002837 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:17531816 4896 2023-03-05 Further, centromeric siRNAs were similarly abundant in tas3WG and tas3+ cells (Figure 2D). PomBase SPBC83.03c FYPO:0005930 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPCC736.11) PMID:17531816 4896 2023-03-05 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) analyses showed that Ago1 was indeed localized at centromeres in the tas3WG mutant, a PomBase SPBC83.03c FYPO:0005930 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:17531816 4896 2023-03-05 ......as were Chp1 and the mutant Tas3WG protein (Figure 2C). PomBase SPBC83.03c FYPO:0005930 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:17531816 4896 2023-03-05 ......as were Chp1 and the mutant Tas3WG protein (Figure 2C). PomBase SPBC83.03c FYPO:0004742 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19362535 4896 2024-02-14 loss of maintenance of heterochromatin was seen in cells expressing both Tas3WG and E23Vchp1, unlike cells expressing either single mutant PomBase SPBC83.03c FYPO:0004744 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:17531816 4896 2023-03-05 PomBase SPBC83.03c FYPO:0001513 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:17531816 4896 2023-03-05 Consistent with these findings, tas3WG mutant cells showed no defects in chromosome segregation (Table S2). PomBase SPBC83.03c FYPO:0004083 W265A,G266A Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265A,G266A tas3-WG|tas3WG amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:17531816 4896 2023-03-05 PomBase SPAC20H4.06c FYPO:0000705 1-258 Not assayed or wild type 972 h- gpl1 gpl1(C)259-534 gpl1(C): 259–534 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.06c),assayed_protein(PomBase:SPAC20H4.09) PMID:36361590 4896 2022-11-28 (Figure 3) PomBase SPAC12G12.04 FYPO:0002430 disruption Knockdown 972 h- mcp60 mcp60- disruption ECO:0005638 PMID:8566770 4896 2015-02-16 PomBase SPAC12G12.04 FYPO:0002061 disruption Knockdown 972 h- mcp60 mcp60- disruption ECO:0005638 PMID:8566770 4896 2015-02-16 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0007327 I35N Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-974 amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000998 I35N Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-974 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:22084378 4896 2015-02-13 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006518 I35N Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-974 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC1215.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP shy1 shy1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008009 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 3C and D) In contrast, a noticeably larger fraction of rdp1D903A cells exhibited an increased number of Swi6 foci, and most of these Swi6 foci still colocalized with Taz1, suggesting a declustering of telomeres even though the localization of telomeres to the nuclear periphery was unaffected PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0007334 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 2C). (otr1R::ura4+) (Fig. 2B) Immunoblotting assay showed that the protein level of the Rdp1 mutant (Rdp1D903A) is comparable to that of wild-type Rdp1, suggesting that the D903A mutation does not affect the stability of the mutant protein PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008011 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 4B). We found that, whereas siRNAs could be readily detected in the affinity-purified fraction of RITS from wild-type cells, there were no detectable RITS- associated siRNAs present in rdp1D903A, rdp1Δ, or dcr1Δ cells PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003096 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 2D). cells localization of both methylated H3-K9 and Swi6 at centromeric otr1R::ura4+ was severely affected in rdp1D903A cells (Fig. 2D). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003573 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. S5) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002386 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 2D). cells localization of both methylated H3-K9 and Swi6 at centromeric otr1R::ura4+ was severely affected in rdp1D903A cells (Fig. 2D). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002386 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC736.11) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 5A) Although all three components of RITS (Ago1, Chp1, and Tas3) are found to be dramatically enriched at otr1R::ura4+ and centromeric repeats in wild-type cells, these proteins completely fail to localize to these centromeric loci in rdp1D903A cells PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002386 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 5A) Although all three components of RITS (Ago1, Chp1, and Tas3) are found to be dramatically enriched at otr1R::ura4+ and centromeric repeats in wild-type cells, these proteins completely fail to localize to these centromeric loci in rdp1D903A cells PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002386 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 5A) Although all three components of RITS (Ago1, Chp1, and Tas3) are found to be dramatically enriched at otr1R::ura4+ and centromeric repeats in wild-type cells, these proteins completely fail to localize to these centromeric loci in rdp1D903A cells PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002386 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. S5) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008010 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15615848 4896 2022-07-21 In contrast, a noticeably larger fraction of rdp1D903A cells exhibited an increased number of Swi6 foci, and most of these Swi6 foci still colocalized with Taz1, suggesting a declustering of telomeres even though the localization of telomeres to the nuclear periphery was unaffected (Fig. 3 C and D) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000228 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0001232 20 PMID:15615848 4896 2022-07-21 . We found that rdp1 mutants have a significantly higher percentage (∼20%) of cells with lagging chromosomes during late anaphase than in the wild-type strain (􏰆1%) (Fig. 3B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004083 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 2B) Immunoblotting assay showed that the protein level of the Rdp1 mutant (Rdp1D903A) is comparable to that of wild-type Rdp1, suggesting that the D903A mutation does not affect the stability of the mutant protein PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004974 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15615848 4896 2022-07-21 In contrast, a noticeably larger fraction of rdp1D903A cells exhibited an increased number of Swi6 foci, and most of these Swi6 foci still colocalized with Taz1, suggesting a declustering of telomeres even though the localization of telomeres to the nuclear periphery was unaffected (Fig. 3 C and D) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000091 D903A Not assayed or wild type 972 h- rdp1 rdp1-D903A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:15615848 4896 2022-07-21 hypersensitive to TBZ, indicating that chromosome segregation is not robust in these mutant cells (Fig. 3A). PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 1-390 Overexpression 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta390 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPCC1223.13 FYPO:0000657 1-394 Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12delta1-394 cbf12(D1-394)|cbf12deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(SO:0001839) PMID:21858190 4896 2012-09-11 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000769 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 low PMID:21880100 4896 2012-09-14 PomBase SPCC737.03c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000274 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 PMID:21880100 4896 2012-09-14 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC737.03c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0001870 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 PMID:21880100 4896 2013-01-24 PomBase SPCC737.03c FYPO:0001870 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 PMID:23669133 4896 2013-06-21 PomBase SPCC737.03c FYPO:0002360 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0000049 PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 1d) PomBase SPCC737.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPCC737.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPCC737.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21880100 4896 2012-10-19 PomBase SPCC737.03c FYPO:0001839 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0000340 FYECO:0000021,FYECO:0000137 PMID:27334362 4896 2016-06-30 PomBase SPCC737.03c FYPO:0001221 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31015410 4896 2019-05-28 (Fig. 1 supp data) PomBase SPCC737.03c FYPO:0002967 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC26A3.15c) PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 6B) PomBase SPCC737.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ima1 ima1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC737.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC737.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ima1 ima1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC965.07c FYPO:0003981 wild type Overexpression 972 h- gst2 gst2+ wild_type ECO:0005801 PMID:11997110 4896 2014-11-03 PomBase SPCC965.07c FYPO:0003981 wild type Overexpression 972 h- gst2 gst2+ wild_type ECO:0005801 PMID:12063243 4896 2014-11-20 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- hhp2 hhp2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:26982200 4896 2018-03-13 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001274 wild type Overexpression 972 h- hhp2 hhp2+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:24327658 4896 2014-03-27 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- hhp2 hhp2+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:24327658 4896 2014-03-27 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0003251 wild type Overexpression 972 h- hhp2 hhp2+ wild_type ECO:0000049 PMID:24327658 4896 2014-03-27 PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0002004 wild type Overexpression 972 h- hhp2 hhp2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0007056 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 medium assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:31341193 4896 2019-08-01 (Fig. 1) Increased colocalization with Cfr1 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000179 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 medium assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:31341193 4896 2019-08-01 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000674 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002141 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001020 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) gga22delta, which was the only mutant that grew on CaCl2 plates as efficiently as the WT. PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000644 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPAC16E8.07c) PMID:31341193 4896 2019-08-01 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001357 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002578 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001188 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000106 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) All mutants exhibited a degree of sensitivity to hygromycin B that was alleviated by KCl, an indication of membrane hyperpolarization. PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0001214 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 low PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) We found that apm1delta, gga22delta, and gga21delta gga22delta (denoted by ggadeltadelta in the Figure 8) were sensitive to both high concentrations of K+ salts and sorbitol (Figure 8), which showed that they were defective in growth under osmotic stress. PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000200 medium PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gga22 gga22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0000281 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gga22 gga22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000655 E234A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-E234A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPAC823.06 FYPO:0001110 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf3 taf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.06 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf3 taf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- taf3 taf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC823.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf3 taf3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0000846 229-298 Overexpression 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:14745200 4896 2013-01-17 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0000255 229-298 Overexpression 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:14745200 4896 2013-01-17 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0000825 229-298 Overexpression 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:14745200 4896 2013-01-17 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0000825 229-298 Overexpression 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:14745200 4896 2013-01-17 PomBase SPAC57A10.10c FYPO:0001886 229-298 Overexpression 972 h- sla1 sla1deltaC229-298 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:14665462 4896 2015-01-12 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000446 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126 high PMID:32084401 4896 2020-10-26 (Fig. 2A) cells are unable to enter mitosis in absence of cdc13+ expression-no septated cells PomBase SPBC582.03 FYPO:0007475 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000105,FYECO:0000126 high high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:32084401 4896 2020-10-26 (Fig. 2B-D) Endogenous untagged nmt 41cdc13+ is expressed to allow cells to proceed into mitosis tagged exogenous cdc13HPM or cdc13+ control can be seen at SPB PomBase SPBC582.03 FYPO:0002061 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cig1Δ, cig2Δ cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000106 PMID:32084401 4896 2020-10-26 (Fig. 2A) cells expressing only cdc13HPM are unable to form colonies PomBase SPBC582.03 FYPO:0003246 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cig1Δ, cig2Δ cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000272 high PMID:32084401 4896 2020-10-23 (Fig. 1B) cells blocked in G1 by nitrogen starvation and released in presence of nitrogen into S phase with cdc13+ switched off PomBase SPBC582.03 FYPO:0000776 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cig1Δ, cig2Δ cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000272 residue(Y15) PMID:32084401 4896 2021-02-24 (Figure S1E) Wee1-dependent CDK-Y15 phosphorylation was similar between Cdc13HPM-CDK and Cdc13WT-CDK PomBase SPBC582.03 FYPO:0001357 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cdc13-9 cig1Δ, cig2Δ cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000227,FYECO:0000229,FYECO:0000272 PMID:32084401 4896 2020-10-23 (Fig. S1A, S1C) cells arrested G1 in low nitrogen then released into S phase at restrictive temperature cells the tested for viability at 25°C after S phase with only ccdc13hpm PomBase SPBC582.03 FYPO:0002516 M235A,L239A,W242A Not assayed or wild type 972 h- cdc13+ cig1Δ cig2Δ puc1Δ cdc13 cdc13-HPM amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high medium PMID:32084401 4896 2020-11-13 (Fig. 3A) when an integrated copy of cdc13HPM (at leu1 locus) is expressed from the cdc13 promoter the endogenous cdc13+ cells are advanced into mitosis. This suggests cdc13HPM can do some of events required for mitotic entry. This is independent of the G1/S cyclins PomBase SPBC21.01 FYPO:0002902 unknown Not assayed or wild type 972 h- mis17 mis17-262 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.03) PMID:16855021 4896 2014-12-17 PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000833 58-78 Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-21ntdelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001317 58-78 Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-21ntdelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001357 58-78 Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-21ntdelta partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:40185772 4896 2025-05-02 (Fig. S3G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0008436 58-78 Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-21ntdelta partial_nucleotide_deletion ECO:0000337 low assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.48) PMID:40185772 4896 2025-05-01 (Fig. 3C) PomBase SPCC645.06c FYPO:0002869 wild type Knockdown 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.08c) PMID:25473118 4896 2015-05-18 PomBase SPCC645.06c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0005638 FYECO:0000106,FYECO:0000126 high PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 5A) PomBase SPCC645.06c FYPO:0000951 wild type Knockdown 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0001232 PMID:15546915 4896 2022-03-30 (Figure 3C) PomBase SPCC645.06c FYPO:0006008 wild type Knockdown 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106,FYECO:0000126 assayed_protein(PR:000050473) PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 5D) PomBase SPCC645.06c FYPO:0001357 wild type Knockdown 972 h- rgf3 rgf3+ P81nmt-rgf3|rgf3-SwitchOff wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000381 PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 5A) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 E193V Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-E193V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0001198 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000261 PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 3B) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0001130 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 3D) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0001758 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000261 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 3A) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0004325 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0004325 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000098 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 3C) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002640 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 1) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0006581 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0003853 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002641 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0003358 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000086 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0005252 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002328 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002792 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2c) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0000647 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000369 medium PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 2b) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- ccr1 ccr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:32571823 4896 2020-09-02 (Figure 1) PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC29A10.01 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ccr1 ccr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 swc3 swc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swc3 swc3delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 swc3 swc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0004325 deletion 972 h- swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swc3 swc3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.02c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph swc3 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swc3 swc3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001690 N17I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-N17I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 N17I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-N17I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 N17I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-N17I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 N17I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-N17I amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 N17I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-N17I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC146.09c FYPO:0003081 W891A Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-W891A amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPBC146.09c FYPO:0001324 W891A Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-W891A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC146.09c) PMID:23260662 4896 2014-02-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003085 W891A Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-W891A amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003090 W891A Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-W891A amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007721 152-224 substituted by a hinge of A+G Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8(A+G) fsv1(A+G) amino_acid_mutation ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-08 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC6F12.03c 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PomBase SPAC23C11.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpn1 mpn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.10 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mpn1 mpn1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPNCRNA.534 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.534 SPNCRNA.534delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000444 wild type Overexpression 972 h- spg1 spg1+ Prad21-spg1 wild_type ECO:0005580 PMID:9203579 4896 2013-02-13 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0001876 wild type Overexpression 972 h- spg1 spg1+ Prad21-spg1 wild_type ECO:0006031 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:9420333 4896 2021-04-12 (Fig. 6C) in late anaphase cdc7 is normally localized only one SPB PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000650 wild type Overexpression 972 h- spg1 spg1+ 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PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0000080 deletion 972 h- spk1 spk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spk1 spk1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0001152 deletion 972 h- spk1 spk1delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:8264618 4896 2020-01-21 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0001152 deletion 972 h- spk1 spk1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAPB8E5.05) PMID:8196631 4896 2017-09-19 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0001152 deletion 972 h- spk1 spk1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC513.03) PMID:8196631 4896 2017-09-19 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0001152 deletion 972 h- spk1 spk1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBPJ4664.03) PMID:8196631 4896 2017-09-19 PomBase SPAC31G5.09c FYPO:0001355 deletion 972 h- spk1 spk1delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC8C9.19 FYPO:0003768 1-20 Not assayed or wild type 972 h- emr1 emr1deltaN erm1(C) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC8C9.19) PMID:33483504 4896 2021-04-06 (Figure 3a) PomBase SPBC428.13c FYPO:0002024 I55P,A56I Overexpression 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:10837231 4896 2025-01-28 After shifting to the restrictive temperature, mob1-1 cells failed to perform cytokinesis, became multinucleate, and did not form septa(Figure 2a-b). PomBase SPBC428.13c FYPO:0001294 I55P,A56I Overexpression 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:10837231 4896 2025-01-28 Staining for the myosin light chain Cdc4p and actin revealed mob1-1 cells formed normal actomyosin rings and medially placed patches (Figure 2c-e). PomBase SPBC428.13c FYPO:0001368 I55P,A56I Overexpression 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:10837231 4896 2025-01-28 Staining for the myosin light chain Cdc4p and actin revealed mob1-1 cells formed normal actomyosin rings and medially placed patches (Figure 2c-e). PomBase SPBC428.13c FYPO:0003702 I55P,A56I Overexpression 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:10837231 4896 2025-01-28 Examination of microtubules showed that mob1-1 cells form normal mitotic spindles (Figure 2f,g), and interphase arrays of microtubules. Thus, unlike S. cerevisiae mob1 mutants, S. pombe mob1 mutants do not have defects in mitotic exit, but are specifically defective in cytokinesis PomBase SPBC428.13c FYPO:0002967 I55P,A56I Overexpression 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:10837231 4896 2025-01-28 These results support the model that Mob1p, like Sid2p, functions downstream in the sid pathway. Consistent with this hypothesis, we found that Cdc7p localizes normally to the SPB in a mob1-1 temperature-sensitive mutant (Figure 4f). I PomBase SPAC664.07c FYPO:0002471 T82A,T159A,T225A,T412A,S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T82A,T159A,T225A,T412A,S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 1) PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 T82A,T159A,T225A,T412A,S423A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T82A,T159A,T225A,T412A,S423A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 1) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001117 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-12xS2ACTD unknown ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.05) PMID:21931816 4896 2014-11-21 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-12xS2ACTD unknown ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC2F3.15) PMID:21931816 4896 2014-11-21 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-12xS2ACTD unknown ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:21931816 4896 2014-11-21 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-12xS2ACTD unknown ECO:0000291 FYECO:0000248 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:21931816 4896 2014-11-21 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002779 1-75,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2+ top2 top2delta(1-74)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002779 1-75,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(1-74)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002061 1-75,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(1-74)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002053 1-75,1221-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(1-74)-delta-Xba partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_enzyme(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC215.02 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pfd5 pfd5delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC215.02 FYPO:0000141 deletion 972 h- pfd5 pfd5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:33137104 4896 2021-01-11 PomBase SPBC215.02 FYPO:0000141 deletion 972 h- pfd5 pfd5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 medium PMID:33137104 4896 2021-01-15 PomBase SPBC215.02 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pfd5 pfd5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC215.02 FYPO:0005369 deletion 972 h- pfd5 pfd5delta deletion ECO:0005638 PMID:33137104 4896 2021-01-11 PomBase SPBC215.02 FYPO:0004700 deletion 972 h- pfd5 pfd5delta deletion 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or wild type 972 h- cdc25 cdc25-d1 cdc25-stabilized fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:10462529 4896 2017-05-18 (Fig. 7) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001317 (-822)-(-7) Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-d1 cdc25-stabilized fusion_or_chimera ECO:0000112 PMID:28479325 4896 2022-02-15 We find that the size dependent expression of Cdc25 does not require the 5′ UTR of its transcript, showing that this mechanism of translational regulation is not necessary for size dependent expression (Figure S3A). PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0001124 (-822)-(-7) Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-d1 cdc25-stabilized fusion_or_chimera ECO:0000112 PMID:28479325 4896 2022-02-15 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000705 cdc18delta(1-183)-SV40\NLS Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-NLSdelta183 fusion_or_chimera ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0002061 cdc18delta(1-183)-SV40\NLS Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-NLSdelta183 fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:9177184 4896 2014-08-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000272 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0009032 deletion 972 h- tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- tif213 tif213delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- tif213 tif213delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0007808 deletion 972 h- tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tif213 tif213delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tif213 tif213delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- tif213 tif213delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif213 tif213delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif213 tif213delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005182 Q6A,L9E,FSV11EEE Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A5 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005195 Q6A,L9E,FSV11EEE Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A5 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPBC428.18 FYPO:0000838 Q6A,L9E,FSV11EEE Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A5 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-13 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005196 Q6A,L9E,FSV11EEE Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP28A5 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPAC4C5.04 FYPO:0002775 G56R Not assayed or wild type 972 h- rad31 rad31-G56R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:28552615 4896 2017-07-16 (Fig. S1C) PomBase SPCC622.16c FYPO:0002346 K314A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003743 K314A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC622.16c FYPO:0005749 K314A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2a) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004544 K314A Not assayed or wild type 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 Catalytically inactivating mutations in the Fe(II) or 2-oxyglutarate binding sites of the Epe1 putative demethylase (epe1-H297A and epe1-K314A) had a similar phenotype (Fig. 4A, fig. S6, and table S3) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004544 K314A Not assayed or wild type 972 h- tetR-clr4-I ura4delta::10xtetO-ade6+ clr4+ epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 3D) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004948 K314A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000833 K314A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 3d) PomBase SPAC1610.02c FYPO:0000031 deletion 972 h- mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 98 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph mrpl1 mrpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1610.02c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph mrpl1 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2023-06-28 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0000099 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0007922 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000179 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0004674 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000371 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh1 sdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- sdh1 sdh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh1 sdh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1556.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sdh1 sdh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPATRNAPRO.02 FYPO:0002059 deletion 972 h- spl1 spl1delta deletion ECO:0005638 PMID:19636559 4896 2019-01-30 PomBase SPBC216.02 FYPO:0007275 deleted CC domain Not assayed or wild type 972 h- num1 mcp5-CCdelta fusion_or_chimera ECO:0001232 high high PMID:31582398 4896 2020-03-14 (Figure. 3C, D, E, F and Video 5) PomBase SPBC216.02 FYPO:0007275 deleted CC domain Not assayed or wild type 972 h- num1 mcp5-CCdelta fusion_or_chimera ECO:0000059 ~31 PMID:31582398 4896 2020-03-24 "in the absence of Mcp5 in rho+ parental strain (strain PHP4xVA074; see Table S1), only 31.3% of the tetrads dissected (n = 16 tetrads) exhibited mtDNA segregation similar to that observed in Fig. 6 D." PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000421 P348A,F350A,P358A,Y360A Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-PFPY/4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 4896 2014-08-01 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000912 P348A,F350A,P358A,Y360A Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-PFPY/4A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.20c) PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000705 P348A,F350A,P358A,Y360A Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-PFPY/4A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC11G7.02),assayed_using(PomBase:SPBC18H10.20c) PMID:24876389 4896 2015-11-03 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0002127 P348A,F350A,P358A,Y360A Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-PFPY/4A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000257 assayed_using(PomBase:SPAC869.11) PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPBC18H10.20c FYPO:0000099 P348A,F350A,P358A,Y360A Not assayed or wild type 972 h- any1 any1-PFPY/4A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:24876389 4896 2014-06-25 PomBase SPAC31G5.16c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dpm1 dpm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.16c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dpm1 dpm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.16c FYPO:0002151 deletion 972 h- dpm1 dpm1delta deletion ECO:0005638 PMID:11030744 4896 2013-09-05 PomBase SPAC31G5.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- dpm1 dpm1delta deletion ECO:0005638 PMID:9223280 4896 2014-05-05 PomBase SPAC31G5.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- dpm1 dpm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31G5.16c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dpm1 dpm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005306 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:18079700 4896 2013-09-10 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0007498 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000004,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31895039 4896 2020-07-02 (Figure 2, S1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002394 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.09c) PMID:31895039 4896 2020-10-26 (Fig. 2 supp1) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002391 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:21300781 4896 2013-08-08 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005896 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:18079700 4896 2013-09-10 (Figure 3A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002386 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21300781 4896 2013-08-08 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002387 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:21300781 4896 2013-08-08 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002061 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31895039 4896 2020-10-26 (Fig. 2b) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000228 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 60 PMID:31895039 4896 2020-10-16 (Fig. 2) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0002390 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21300781 4896 2013-08-08 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0005894 G1487D Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-367 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:18079700 4896 2013-09-10 (Figure 3A) PomBase SPAC57A10.09c FYPO:0003412 nhp6::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 nhp6 nhp6::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPNCRNA.778 FYPO:0009046 deletion 972 h- SPNCRNA.778 SPNCRNA.778delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.778 FYPO:0001501 deletion 972 h- SPNCRNA.778 SPNCRNA.778delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001368 S3SAD,S24D,S31D,T55D,T64D,S67D,S97D,S136D,T214D Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-9D-(Cdk1-phosphomimetic) amino_acid_insertion_and_mutation ECO:0001232 PMID:34133210 4896 2021-07-11 Although there was a small difference in CR formation between pxl1(9A) (13.6 +/- 2.5; 33 cells) and pxl1(9D) (12.2 +/- 2.3 min; 41 cells), formation was similar in pxl1(9D) and pxl1+ (12.4 +/- 3.0; 32 cells), and there were no significant differences in the durations of CR maturation. PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0007828 S3SAD,S24D,S31D,T55D,T64D,S67D,S97D,S136D,T214D Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-9D-(Cdk1-phosphomimetic) amino_acid_insertion_and_mutation ECO:0001232 PMID:34133210 4896 2021-07-11 Although there was a small difference in CR formation between pxl1(9A) (13.6 +/- 2.5; 33 cells) and pxl1(9D) (12.2 +/- 2.3 min; 41 cells), formation was similar in pxl1(9D) and pxl1+ (12.4 +/- 3.0; 32 cells), and there were no significant differences in the durations of CR maturation. PomBase SPNCRNA.781 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.781 SPNCRNA.781+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.781 FYPO:0005261 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.781 SPNCRNA.781+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000289 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.781 FYPO:0009025 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.781 SPNCRNA.781+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000278 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.781 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.781 SPNCRNA.781+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.781 FYPO:0000725 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.781 SPNCRNA.781+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000211 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.781 FYPO:0009042 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.781 SPNCRNA.781+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 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PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0005231 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000123,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0006660 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0004162 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009033 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000410 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000725 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0002546 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cqd1 cqd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- cqd1 cqd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cqd1 cqd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cqd1 cqd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002019 440-490 Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1deltaPI partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:26063574 4896 2017-10-20 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nse1 nse1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.05 FYPO:0002262 deletion 972 h- nse1 nse1delta deletion ECO:0001232 PMID:12966087 4896 2014-11-25 PomBase SPCC550.05 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nse1 nse1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- nse1 nse1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC550.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nse1 nse1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC550.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- nse1 nse1delta deletion ECO:0005638 PMID:12966087 4896 2014-11-25 PomBase SPCC550.05 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nse1 nse1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 R536A,R537A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-RR536.537AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000703 R536A,R537A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-RR536.537AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 R536A,R537A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-RR536.537AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0001778 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 5B) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007975 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 complete high PMID:35293864 4896 2022-04-14 (Fig. 5E) Ase1 is required for normal rescue distribution PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000197 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007981 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 6) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0005558 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 2) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007126 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007548 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:32502403 4896 2020-12-07 ase1D cells that elongated the spindle, the MMD was not properly formed, and the number of NPCs was variable (Figure S2B PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000141 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 ~20 PMID:32723864 4896 2021-04-27 (Figure 7) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007547 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:32502403 4896 2020-12-07 ase1D cells that elongated the spindle, the MMD was not properly formed, and the number of NPCs was variable (Figure S2B PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0004316 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:36980258 4896 2023-06-27 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003484 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-27 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0004412 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12) PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 4) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003350 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:19686686 4896 2016-04-01 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0004700 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 low PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 1) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000229 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2021-02-15 (Fig. 4) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003165 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007150 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:21151990 4896 2019-11-08 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003841 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007960 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. S1) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000584 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0001840 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0000340 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007971 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:35293864 4896 2022-05-17 (Fig. 5F,G) The decrease in growth speed associated with internalisation of microtubules in the nuclear membrane bridge is reduced upon Ase1 deletion PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007974 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:35293864 4896 2022-04-14 (Fig. 5F, G) The decrease in growth speed associated with internalisation of microtubules in the nuclear membrane bridge is reduced upon Ase1 deletion PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000252 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0005580 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000252 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2021-02-15 (Fig. 4) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002303 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 (Fig. 4) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0006716 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:32502403 4896 2020-12-07 Consistently, these cells showed a higher frequency of asymmetric NE divisions (Figure S2C) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ase1 ase1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002818 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002401 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 2) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002401 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:38442865 4896 2024-05-31 (Fig. 2D, E and F) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000339 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 low PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 1) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000324 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. S1) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000324 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0006475 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:32502403 4896 2020-06-15 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0005722 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 6) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0005722 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0005722 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 45 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0006643 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 35 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 5B) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0006643 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 45 PMID:18562692 4896 2022-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002688 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ase1 ase1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003326 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0002966 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC736.14) PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 5 Supp 3) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003349 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 5 Supp 3) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007124 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.12) PMID:31615768 4896 2019-10-29 (Fig. 4) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003302 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 5) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0004325 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-16 (Fig. 1) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000085 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003840 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0001232 PMID:15647375 4896 2014-09-26 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003840 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 PMID:15689489 4896 2022-06-21 (Fig. 1) PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000102 deletion 972 h- ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ase1 ase1delta 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The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC19C2.08 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp38 prp38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp38 prp38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19C2.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp38 prp38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 139-144 Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7delta139-144 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.253 FYPO:0009012 deletion 972 h- SPNCRNA.253 SPNCRNA.253delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.253 FYPO:0007808 deletion 972 h- SPNCRNA.253 SPNCRNA.253delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPBC18H10.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph wbp4 wbp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- wbp4 wbp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18H10.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wbp4 wbp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.07 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 wbp4 wbp4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC18H10.07 FYPO:0002104 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wbp4 wbp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1322.01 FYPO:0003412 rpm1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpm1 rpm1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAPB8E5.07c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp12 rrp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB8E5.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- rrp12 rrp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB8E5.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp12 rrp12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000190 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 37 PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 3) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002029 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 high PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. S1D and S1E) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pom1 pom1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0006547 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 PMID:27852900 4896 2018-05-03 (Figure 3, A and E) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001584 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC31A2.16) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 4D) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001129 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:9852154 4896 2012-10-12 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001018 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001394 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 1) about 30% from new end. In contrast, 14% of tea1 cells and 30% of pom1 cells failed to resume growth from a previously growing end (Figure 1). PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003535 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003535 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:9852154 4896 2012-10-12 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003150 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high PMID:14663827 4896 2023-07-15 (Figure 3) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000929 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:24554432 4896 2015-11-20 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0006637 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 4F) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 3a) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC1A4.05) PMID:19474789 4896 2017-04-26 Supplementary Figure S8 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19474789 4896 2017-04-26 Supplementary Figure S8 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC144.14) PMID:19474789 4896 2017-04-26 Supplementary Figure S8 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:19474789 4896 2017-04-26 Supplementary Figure S8 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Fig. 2a) and data not shown PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002556 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002679 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:32101481 4896 2020-05-27 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0006772 deletion 972 h- cyr1Δ LEU2+ sxa2Δ ura4+ ura4-D18 leu1-32 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 PMID:11950884 4896 2021-06-02 (Fig. 8D,E) pom1 has a role in the relocalisation of actin to the shmooing cell tip PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001740 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000049 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Fig. 6A) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003532 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003532 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0006610 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-05 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0007156 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-06-27 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002680 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),residue(T166) PMID:24508166 4896 2015-02-23 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001038 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0006608 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-05 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001369 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 PMID:9852154 4896 2012-10-12 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001369 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000339 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 50 PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 4C) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000339 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 PMID:28784611 4896 2017-08-22 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001391 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 23.2 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001390 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003717 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001368 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 PMID:9852154 4896 2012-10-11 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000674 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001400 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000760 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000478 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0005207 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000126,FYECO:0000220,FYECO:0000300 PMID:24047646 4896 2018-05-29 (Fig. 6) shows pom1delta cells still have G2-M size control PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001399 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001389 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000644 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.11c) PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000644 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000644 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002559 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23349808 4896 2013-08-29 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0007451 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:12789340 4896 2020-08-19 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001587 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:15936270 4896 2020-06-12 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001587 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:21703453 4896 2016-11-11 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001587 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.02c) PMID:12007420 4896 2020-04-10 Fig. 3C PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002674 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.04c) PMID:12206652 4896 2014-08-19 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003414 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.04c) PMID:12206652 4896 2014-08-19 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0008003 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0004422 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 1D) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001266 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000590 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 PMID:9573052 4896 2012-08-17 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0002516 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 5G) PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0005466 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 (Fig. 1SE) to cell cortex of (new non growing) cell tip from medial cortex PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0003595 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pom1 pom1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 3.0 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000095 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pom1 pom1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0000096 deletion 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assayed_using(PomBase:SPAC4H3.11c),assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001382 R261E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R261E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002442 R261E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R261E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001357 R261E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R261E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0001357 R261E Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R261E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPAP8A3.09c FYPO:0001758 wild type Overexpression 972 h- paa1 paa1+ wild_type ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAP8A3.09c) PMID:36006032 4896 2023-01-05 Our in vitro dephosphorylation assay results demonstrated that individually overexpressing PP2A subunits indeed boosted the overall phosphatase activity compared to expressing endogenous subunits alone (Figure 3B). PomBase SPCC5E4.06 FYPO:0000703 295-895 Not assayed or wild type 972 h- smc6 smc6-heads partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC5E4.06) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 1f) PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0000963 S219D Not assayed or wild type 972 h- dna2 dna2-S219D dna2-S220D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22682245 4896 2014-02-12 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000969 S494A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S494A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003906 S494A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S494A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002102 S494A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S494A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000277 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPAC30.02c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 kti12 kti12delta deletion ECO:0000059 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PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0006187 deletion 972 h- aip1 aip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:25451933 4896 2020-12-05 (Figs. 6B and C, Table 3) PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 PMID:25451933 4896 2020-12-05 PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0007573 deletion 972 h- aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 PMID:25451933 4896 2020-12-05 Surprisingly, contractile rings began to constrict earlier in Δaip1 cells than wild type cells (Fig. 7, A and B, and Table 3), foreshortening the maturation period before constriction PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0007573 deletion 972 h- aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 PMID:25451933 4896 2020-12-05 As a result, ring constriction in Δaip1 cells takes ∼ 5 min less than in wild type cells (Table 3). Overall, cytokinesis was ∼16 min (24%) faster in Δaip1 cells than wild type cells, because the maturation period was shorter and the rings constricted faster. PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9G1.05 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph aip1 aip1delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0006326 S15A,S24A,T34A,S46A,S62A,S95A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mid1 mid1-6Ala amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 60 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. S2E) PomBase SPAC1687.20c FYPO:0000284 wild type Knockdown 972 h- mis6 mis6+ wild_type ECO:0001232 20 PMID:39378339 4896 2025-08-12 Similarly, 48 h after induction of CRISPRi, the mis6-KD strain produced unequally divided nuclei and lagging chromosomes, which were observed in the mis6 temperature-sensitive mutant cells (Saitoh et al., 1997) (Fig. 4 B). . PomBase SPBC1198.11c FYPO:0007202 1-145,419-504 Not assayed or wild type 972 h- reb1 reb1-146-418 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:18794373 4896 2019-12-18 PomBase SPBC1198.11c FYPO:0007205 1-145,419-504 Not assayed or wild type 972 h- reb1 reb1-146-418 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:18794373 4896 2019-12-18 PomBase SPAC694.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.02 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.02 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0005638 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SPAC694.02 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC694.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC694.02 SPAC694.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.14 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp4 prp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.14 FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ prp4 prp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPCC777.14 FYPO:0002411 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp4 prp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- prp4 prp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC777.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp4 prp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000963 S439A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-S439A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000957 S439A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-S439A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000969 S367A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S367A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003906 S367A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S367A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0005299 S367A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-S367A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000277 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPAC22F3.02 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 atf31 atf31+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC22F3.02 FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- atf31 atf31+ wild_type ECO:0001232 PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPAC22F3.02 FYPO:0005129 wild type Overexpression 972 h- atf31 atf31+ wild_type ECO:0000291 PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPAC22F3.02 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 atf31 atf31+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0007160 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 low PMID:38376141 4896 2024-07-10 When we used the SpCAF-1-PIP* mutant, we did not detect supercoiling on labeled DNA at 45 min, yet at 2 hr supercoiling ultimately reached levels achieved using the WT SpCAF-1 (Figure 5, bottom, synthesized DNA). PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0000705 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 6A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0003412 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 7A) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0001645 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:25313826 4896 2014-11-17 PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0001645 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:25313826 4896 2014-11-17 PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0002624 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.03) PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 6C and D) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0004709 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:38376141 4896 2024-07-10 (Fig. 7B and C) PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0004026 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25313826 4896 2014-11-17 PomBase SPBC29A10.03c FYPO:0000703 Q172A,L175A,F178A,F179A Not assayed or wild type 972 h- pcf1 pcf1-PIPmut pcf1-PIP* amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.03),assayed_using(PomBase:SPBC29A10.03c) PMID:25313826 4896 2014-11-17 PomBase SPAC3A12.09c FYPO:0006792 unknown Not assayed or wild type 972 h- ure4 ure4- unknown ECO:0005638 PMID:12471450 4896 2018-12-15 PomBase 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SPBC660.07 FYPO:0001449 I104A Not assayed or wild type 972 h- ntp1 ntp1-I104A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:15965643 4896 2014-06-19 PomBase SPBC660.07 FYPO:0003466 I104A Not assayed or wild type 972 h- ntp1 ntp1-I104A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:15965643 4896 2014-06-19 PomBase SPBC660.07 FYPO:0003461 I104A Not assayed or wild type 972 h- ntp1 ntp1-I104A amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000166 PMID:15965643 4896 2014-06-19 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo3 spo3-B3 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPAC607.10 FYPO:0000478 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo3 spo3-B3 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0001425 T104A Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-T104A amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 low PMID:9436991 4896 2015-12-14 PomBase SPBC14C8.07c FYPO:0000703 T104A Not assayed or wild type 972 h- cdc18 cdc18-T104A amino_acid_mutation 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deletion 972 h- oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 high PMID:35172472 4896 2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0007938 deletion 972 h- oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0007938 deletion 972 h- oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph oga1 oga1delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006893 386-920,K43A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)K43A asp1-(1-385)K43A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 high assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPBC725.16 FYPO:0000655 E56K Not assayed or wild type 972 h- res1 res1-E56K sct1-b1 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:7739540 4896 2014-08-07 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002060 E56K Not assayed or wild type 972 h- res1 res1-E56K sct1-b1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC725.16 FYPO:0002177 E56K Not assayed or wild type 972 h- res1 res1-E56K sct1-b1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7916653 4896 2014-07-09 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0006802 wild type Overexpression 972 h- imp2 imp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:9786952 4896 2019-01-03 (Fig. 2E) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0005870 wild type Overexpression 972 h- imp2 imp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:9786952 4896 2019-01-03 (Fig. 2B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001406 wild type Overexpression 972 h- imp2 imp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:9786952 4896 2019-01-03 (Fig. 2B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0006556 wild type Overexpression 972 h- imp2 imp2+ wild_type ECO:0001232 10 PMID:9786952 4896 2019-01-03 (Fig. 2A) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001904 wild type Overexpression 972 h- imp2 imp2+ wild_type ECO:0001232 PMID:9786952 4896 2019-01-03 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0004481 F18A,F21A,W26A,L40A,W41A,W45A Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-UBS-I&II amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0000705 F18A,F21A,W26A,L40A,W41A,W45A Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-UBS-I&II amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBC337.08c) PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0000705 F18A,F21A,W26A,L40A,W41A,W45A Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-UBS-I&II amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0002774 F18A,F21A,W26A,L40A,W41A,W45A Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-UBS-I&II amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPAC3G6.02 FYPO:0000099 F18A,F21A,W26A,L40A,W41A,W45A Not assayed or wild type 972 h- dss1 rpn15-UBS-I&II amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005743 S408A,S410A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S408A,S410A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005748 S408A,S410A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S408A,S410A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0008435 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000059 medium PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 3D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001117 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. S4B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003040 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 1B, 1C) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001135 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. S3C) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001327 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 4D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0005120 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- pat1-as mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 5D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0005120 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- pat1-as mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 5D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003700 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000291 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 1, Fig. 2D) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0000590 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. S5F) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0008437 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0001232 high high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:40185772 4896 2025-04-30 5’&3’SSmut cells also exhibited a strong increase in signal intensity and a redistribution of the lncRNA to the nucleolus, as determined by fluorescence overlap with the nucleolar marker Nop56 (Fig. 1d, e) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003720 G511C,T512A,A736C,G737C Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'+3'SSmut mamRNA-5'&3'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.48) PMID:40185772 4896 2025-04-30 (Fig. 3A, 3C) PomBase SPAC22F8.03c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22F8.03c SPAC22F8.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F8.03c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPAC22F8.03c SPAC22F8.03cdelta deletion ECO:0005638 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PomBase SPCC63.02c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC63.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC63.02c FYPO:0003795 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0000335 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0004533 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0000335 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0001120 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:40668835 4896 2025-08-26 aah3∆ cells were abnormally pear-shaped and had a lower length-to-width ratio (Fig. 2 A and B) consistent with published work (29, 39) PomBase SPCC63.02c FYPO:0004534 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 aah3 aah3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 aah3 aah3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000098 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 2) PomBase SPCC63.02c FYPO:0001190 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000087 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002903 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002903 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 aah3 aah3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002106 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 aah3 aah3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16751704 4896 2015-03-31 PomBase SPCC63.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- aah3 aah3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22848669 4896 2024-06-27 We constructed a null mutation in the ecm33+ and gaz2+ genes, respectively (see Materials and Methods) and found that the gaz2 deletion mutant was also viable (Figure 2A, upper panel), indicating that Gaz2 is not essential for cell viability. PomBase SPCC63.02c FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 aah3 aah3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC215.05 FYPO:0000853 TTACGTCA(-324)CGGAAGACTCTCCTCCG Not assayed or wild type 972 h- gpd1 gpd1-G4BS nucleotide_mutation ECO:0000231 PMID:25122751 4896 2014-09-15 PomBase SPBC713.12 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC713.12 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC713.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- erg1 erg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC713.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg1 erg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004303 1-368 Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-Cter fcp1c-H partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:11839823 4896 2015-01-14 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002861 H336A Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-H336A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:22608966 4896 2013-11-08 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000082 513-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-513-551 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:1550959 4896 2012-12-26 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000760 513-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-513-551 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:1550959 4896 2012-12-26 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000590 513-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-513-551 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:1550959 4896 2012-12-26 PomBase SPCC306.09c FYPO:0001357 513-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-513-551 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1550959 4896 2012-12-26 PomBase SPCC306.09c FYPO:0001234 513-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-513-551 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:1550959 4896 2012-12-26 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 suc22 suc22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 suc22 suc22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- suc22 suc22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 suc22 suc22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SB7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SB7 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC4.01 FYPO:0000708 A158L,A162L Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-TMD3sL amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPCC16C4.22 FYPO:0003412 dpb3::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 dpb3 dpb3::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC16G5.11c FYPO:0000705 1-77,191-195 Not assayed or wild type 972 h- bag101 bag101-BAG partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 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assayed_protein(PomBase:SPCC1223.13),assayed_region(PomBase:SPCC1223.13) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1D and E) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0008249 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000123,FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1223.13),assayed_region(PomBase:SPCC1742.01) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 1D and E) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0008249 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000123,FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPCC1223.13),assayed_region(PomBase:SPBC359.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 1D and E) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001117 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000123,FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1C) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001690 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000314 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4B) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001317 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000123,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1742.01) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1C) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001317 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000123,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.13) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1C) PomBase SPCC1223.13 FYPO:0001357 R644H Not assayed or wild type 972 h- cbf12 cbf12(DBM) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. S1) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000470 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000005 high PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6D) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6D) PomBase SPBC83.03c FYPO:0004083 W265F Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-W265F amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:17531816 4896 2023-03-05 PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0001269 R201A,K221A Not assayed or wild type 972 h- bub3 bub3-RA,KA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Figure 2A) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0005781 R201A,K221A Not assayed or wild type 972 h- bub3 bub3-RA,KA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 low PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 2D) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0001324 R201A,K221A Not assayed or wild type 972 h- bub3 bub3-RA,KA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 2E) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0004828 R201A,K221A Not assayed or wild type 972 h- bub3 bub3-RA,KA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Figure 2A) PomBase SPAC23H3.08c FYPO:0000703 R201A,K221A Not assayed or wild type 972 h- bub3 bub3-RA,KA amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC23H3.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Figure 2B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002338 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC365.12c) PMID:38825008 4896 2025-04-22 The Ish1 signal, which was localized in the NE under normal conditions, was distributed on cytoplasmic membranes besides the NE under overexpression conditions (Fig. 2E) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006692 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-22 Consequently, the chromosome was missegregated during the next mitosis (Fig. 3C). Alternatively, the entire chromosome moved to one side or the cells showed a cut phenotype (untimely torn cell phenotype); these cells displayed nuclear membrane extrusion along the spindle microtubule (Movie S2). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0006800 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-22 Overexpression of the GFP-IDR and GFP-IDR-TM fragments, but not GFP and GFP-KSE, caused dissociation of the centromeres from the NE and their declustering (Fig. 3, A and B). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001355 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0005638 high PMID:38825008 4896 2025-04-19 When GFP-IDR was overexpressed in S. pombe cells under the control of the nmt1 promoter, its overexpression resulted in severe growth defects in the spot assay (Fig. 2D). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001556 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-22 Under overexpression conditions, GFP-IDR was localized in the nucleoplasm, accompanied by a herniated structure adjacent to the nucleus (Fig. 2E, arrows). The Ish1 signal, which was localized in the NE under normal conditions, was distributed on cytoplasmic membranes besides the NE under overexpression conditions (Fig. 2E), suggesting that overexpression of GFP-IDR may cause abnormal membrane proliferation. PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007457 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0001232 high PMID:38825008 4896 2025-02-01 Figure 2 Under overexpression conditions, GFP-IDR was localized in the nucleoplasm, accompanied by a herniated structure adja- cent to the nucleus (Fig. 2E, arrows). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0002360 GFP-364-413 Overexpression 972 h- lem2-shut-off bqt4Δ bqt4 bqt4-IDR(364-413) other ECO:0001232 PMID:38825008 4896 2025-04-22 This dissociation did not affect transcriptional silencing in the centromeric region (Fig. S6A). PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 V86VMGYPV Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-E5 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000825 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001690 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 D68Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-D67Q amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-28 (Fig. 1B) PomBase SPAC144.13c FYPO:0000252 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-10A unknown ECO:0001232 18 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000760 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-10A unknown ECO:0005638 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- srw1 ste9-10A unknown ECO:0001232 PMID:10921876 4896 2014-12-01 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0007394 A1060G Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-A1060G nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:24793650 4896 2020-06-16 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0005540 A1060G Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-A1060G nucleotide_mutation ECO:0005801 PMID:24793650 4896 2020-06-16 PomBase SPCC1672.10 FYPO:0000703 1-51,100-430 Not assayed or wild type 972 h- mis16 mis16-C3 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02),assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:31371524 4896 2019-10-29 (Figure 2) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000969 T186A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-T186A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003906 T186A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-T186A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11553781 4896 2016-02-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002102 T186A Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-T186A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000277 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPAC823.04 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp36 rrp36delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.04 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp36 rrp36delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp36 rrp36delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- rrp36 rrp36delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC823.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rrp36 rrp36delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC823.04 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rrp36 rrp36delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC823.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rrp36 rrp36delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pyk1 pyk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- pyk1 pyk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pyk1 pyk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000658 16-171 Not assayed or wild type 972 h- pcr1 pcr1delta16-171 pcr1T partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(SO:0001843) PMID:8552099 4896 2014-08-04 PomBase SPAC21E11.03c FYPO:0000708 16-171 Not assayed or wild type 972 h- pcr1 pcr1delta16-171 pcr1T partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:8552099 4896 2014-08-04 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000073 N424* Not assayed or wild type 972 h- h- pap1 pap1-N424STOP partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32908306 4896 2021-04-06 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0002060 N424* Not assayed or wild type 972 h- h- pap1 pap1-N424STOP partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32908306 4896 2021-04-06 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0006978 deletion 972 h- pit1 pit1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pit1 pit1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC3C7.06c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph pit1 pit1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3C7.06c 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T75D reduces dis2 binding PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 T75D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75D amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0000703 T75D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75D amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 T75D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPAC6G9.09c FYPO:0003412 rpl2401::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpl2401 rpl2401::Tn-seq disruption ECO:0000049 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FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc1 cdc30-2H4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002555 S1444D Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-S1444D Myo2p-S1444D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-13 (Fig. 4D) PomBase SPCC645.05c FYPO:0005905 S1444D Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-S1444D Myo2p-S1444D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000703 S1444D Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-S1444D Myo2p-S1444D amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-14 (Fig. 6F) PomBase SPCC645.05c FYPO:0005899 S1444D Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-S1444D Myo2p-S1444D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19570908 4896 2017-01-18 PomBase SPCC645.05c FYPO:0004895 S1444D Not 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sde2delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:28947618 4896 2017-12-29 (Fig. 5B,S5A,S5B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000835 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000835 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.04c) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000835 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.09) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000835 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC428.06c) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Figure S12B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0006328 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.12c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 (Fig. 8B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0003803 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC800.03) PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0003803 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008118 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-18 (Figure 1) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008118 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPAC11E3.09) PMID:36095128 4896 2023-09-11 (Figure 1) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0002019 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000335 PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0003802 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000226 PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008113 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPBC582.04c) PMID:36095128 4896 2023-08-28 ; Intron retention observed in absence of sde2, cay1 and tls1 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008113 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.09) PMID:36095128 4896 2023-08-28 ; Intron retention observed in absence of sde2, cay1 and tls1 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008113 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_transcript(PomBase:SPCC16A11.08) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Supplementary Figures S6 and S7A). ...the disruption of secondary structures by exposure to elevated temperatures could open the fold and increase the distance between the BP and 3′ss.... Indeed, excision of introns with secondary structures such as rap1 intron 2, whi5 intron 1, atg20 intron 2 and mug65 intron 2 was sensitive to 15 min treatment at 42◦C. After lowering the temperature to 25◦C, splicing defects of these introns recovered in wt cells, but the recovery with whi5 and atg20 introns was slower in Δsde2. PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008113 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_transcript(PomBase:SPBC1778.02) PMID:36095128 4896 2023-08-29 (Supplementary Figures S6 and S7A). PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001908 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:25274039 4896 2014-12-15 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001908 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:25274039 4896 2014-12-15 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001890 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:28947618 4896 2018-01-08 (Fig 7A) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001890 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 (Fig 7A) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001890 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.06c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 (Fig 7A) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sde2 sde2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0002336 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000049 PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0002336 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0000291 PMID:25274039 4896 2014-12-15 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sde2 sde2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000969 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001690 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000963 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000957 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 PMID:25795664 4896 2016-08-05 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0004325 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000095 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 PMID:21333630 4896 2014-09-10 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000785 deletion 972 h- sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sde2 sde2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph 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PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0006926 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 2A, 2B) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000836 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPAC57A7.04c) PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000836 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 3A, 3B) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000836 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0000059 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 3B, Table S4) mass spec used to show that there is bulk accumulation of nuclear localised protein rather than a few specific proteins PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0004456 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.04c) PMID:33946513 4896 2021-05-15 (Fig. S4a) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000825 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0003752 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0006031 FYECO:0000004 PMID:18023413 4896 2014-11-20 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18758733 4896 2014-12-02 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0002336 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0000049 PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S2D) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0003751 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9372936 4896 2014-09-04 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0003751 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:9372936 4896 2014-09-04 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0000771 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9372936 4896 2014-09-01 PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0001221 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31015410 4896 2019-06-11 (Fig. 1) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0001221 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000227 high PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 2A, 2B) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0001221 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229,FYECO:0000257 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 2A, 2B) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0001221 unknown Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6 rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 2A) PomBase SPBC16A3.05c FYPO:0003027 unknown Not assayed or wild type 972 h- rae1 rae1-167 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:9372936 4896 2014-09-01 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000659 1287-1302 Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-delta-loop2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21847092 4896 2013-08-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002133 1287-1302 Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-delta-loop2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21847092 4896 2013-08-20 PomBase SPCC188.13c FYPO:0002563 1287-1302 Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-delta-loop2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21847092 4896 2013-08-29 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0001571 G192L,S196L Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-TMD4sL amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07),assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-20 PomBase SPAC6B12.09 FYPO:0002765 237-240 Not assayed or wild type 972 h- trm10 trm10-M1 sp_Trm10_M1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high assayed_using(SO:0000261) PMID:24081582 4896 2013-10-07 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009007 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009031 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009032 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009032 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0002693 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0003383 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0000089 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0000089 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- hdd1 hdd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hdd1 hdd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4G3.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hdd1 hdd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.17 FYPO:0001355 deletion 972 h- ppt2 ppt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21270388 4896 2021-10-07 PomBase SPAC3G9.17 FYPO:0001355 deletion 972 h- ppt2 ppt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:21270388 4896 2021-10-07 PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- cdc48 cdc48+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_protein(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- cdc48 cdc48+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 4) PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0003667 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.05c) PMID:11719193 4896 2015-03-30 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001407 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0002150 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0001098 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000085 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000088 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000089 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23982516 4896 2013-11-21 PomBase SPCC4G3.05c FYPO:0000268 D395A,D396A Not assayed or wild type 972 h- mus81 mus81-DD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPBC3B9.07c FYPO:0003601 Y14H,I17T,D24E,L41H,F81S,L144Q Not assayed or wild type 972 h- rpa43 rpa43-ts2817 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12207036 4896 2018-05-29 PomBase SPBC3B9.07c FYPO:0002061 Y14H,I17T,D24E,L41H,F81S,L144Q Not assayed or wild type 972 h- rpa43 rpa43-ts2817 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12207036 4896 2018-05-29 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-40 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229,FYECO:0000334 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002085 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-40 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227,FYECO:0000334 PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPAC688.11 FYPO:0004842 1-852 Not assayed or wild type 972 h- end4 end4-delta-(1-852) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 complete assayed_protein(PomBase:SPAC688.11) PMID:35024575 4896 2022-06-24 Conclusion is dawn by comparing Fig. 1H and Fig. 1I in https://www.micropublication.org/journals/biology/micropub-biology-000508. PomBase SPAC1F8.02c FYPO:0001852 -127AGATA-122,-136AGATAA-131,-136TGATAA-141GCCGTC Overexpression 972 h- shu1 shu1-M1-GATA-box-mutant shu1-M1 GATA box mutant other ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.02c) PMID:25733668 4896 2015-06-11 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0003165 E1003K Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1-686 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8395535 4896 2015-09-02 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000659 Q320A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-CSD3A chp2-mut4 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 Chp2-CSD (Chp2-CSD3A) no longer bound DNA (Fig. 3F and Supplementary Fig. S2B), Chp2 with H5A mutation in the hinge (Chp2-mut1) or with either CSD2A or CSD3A mutation in the CSD (Chp2-mut2 and Chp2- mut4) exhibited weaker DNA-binding activity compared to wild-type Chp2 (Chp2-WT) (Fig. 3H, I, J and L and Supplementary Fig. S2C and S2F) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002336 Q320A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-CSD3A chp2-mut4 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:37400983 4896 2023-09-04 PomBase SPBC1718.05 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs31 trs31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- trs31 trs31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1718.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs31 trs31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1718.05 FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs31 trs31delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000790 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10950958 4896 2022-11-10 In wild-type cells, a shift from 27 to 33 °C caused a transient heat-induced disorganization of actin patches PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0008042 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10950958 4896 2022-11-10 On the other hand, in the its3-1 mutant cells, actin patches were partially polarized at 27 °C, and the polarization was completely lost upon temperature upshift or FK506 treatment (Fig. 7A). PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001880 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S1G) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001585 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001585 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002128 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:10950958 4896 2022-11-10 As shown in Fig. 9B, the GFP-Its3-1 mutant protein (GFP-mIts3) was no longer localized to the plasma membrane and instead... PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0005289 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 3) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0008039 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_enzyme(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:10950958 4896 2022-11-10 PI(4)5K activity kinase: As shown in Fig. 1A, its3-1 mutant cells could not grow at 33 °C, 36 °C, or in the YPD plate containing FK506, whereas wild-type cells grew normally. PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000082 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 We found that cfr11 enhanced its3-1 thermosensitivity, and that its3-1 enhanced cfr11 sensitivity to 0.6 M KCl, which showed genetic interaction (Figure 7D). PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006625 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 5C) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006625 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10950958 4896 2022-11-10 As shown in Fig. 5B, its3-1 mutant cells contained about 10% of the amount of PI(4,5)P2 found in wild-type cells, indicating that the mutation caused a significant decrease in PI(4)P5K activity of Its3. PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006628 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29975157 4896 2018-07-10 (Fig. 5A) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000929 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCPB16A4.02c) PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 4D) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002869 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 4B) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002869 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 4C) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006221 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001586 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:22768263 4896 2012-09-24 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0003208 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0003771 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0004780 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC594.01) PMID:39239853 4896 2024-09-08 Duc1-mNG levels were also reduced at the lateral PM in its3-1 cells at a semi-restrictive temperature compared to wild-type (Fig. 5A,B). These results are consistent with Duc1 requiring PM PI(4,5)P2 for its PM localization. PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001355 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:29975157 4896 2018-07-17 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000994 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10950958 4896 2022-11-10 Interestingly, the level of PI(4)P was significantly higher than that of the wild-type cells. PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0006626 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10950958 4896 2022-11-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000650 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10950958 4896 2022-11-10 In addition, its3-1 mutant had a septation index approximately twice that seen in wild-type cells at the permissive temperature. PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001406 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10950958 4896 2022-11-10 Microscopic observation revealed that some mutant cells have a thick septum that was brightly stained with Calcofluor and was hardly seen in wild-type cells (Fig. 8A). PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002061 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:29975157 4896 2018-07-17 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002061 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10950958 4896 2022-11-10 As shown in Fig. 1A, its3-1 mutant cells could not grow at 33 °C, 36 °C, or in the YPD plate containing FK506, whereas wild-type cells grew normally. PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000339 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 1B) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002559 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002559 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002442 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:29975157 4896 2018-07-09 (Fig. 4A) PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001587 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0001587 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:21148300 4896 2021-03-10 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0000086 G281D Not assayed or wild type 972 h- its3 its3-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:10950958 4896 2022-11-10 As shown in Fig. 1A, its3-1 mutant cells could not grow at 33 °C, 36 °C, or in the YPD plate containing FK506, whereas wild-type cells grew normally. PomBase SPCC1672.04c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cox19 cox19delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0006141 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPCC1672.04c FYPO:0001934 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox19 cox19delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0008128 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0007618 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0007612 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0004325 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0004325 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPCC1672.04c FYPO:0000102 deletion 972 h- cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPCC1672.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cox19 cox19delta deletion ECO:0005638 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partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:12796476 4896 2020-03-17 (Figure 1D) impressive enrichment of actin filaments in aberrant thick cables and aster-like accumulations PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002021 1-881,1375-1841 Overexpression 972 h- cdc12 cdc12(FH1FH2-2) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:12796476 4896 2020-03-17 (Figure 1D) but lacked both actin contractile rings and polarized actin patches (Fig. 1 D) PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0001493 1-881,1375-1841 Overexpression 972 h- cdc12 cdc12(FH1FH2-2) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:12796476 4896 2020-03-17 (Figure 1D) arrested after 􏰖24 h (Fig. 1 E) PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002061 1-881,1375-1841 Overexpression 972 h- cdc12 cdc12(FH1FH2-2) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:12796476 4896 2020-03-17 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0003210 1-881,1375-1841 Overexpression 972 h- cdc12 cdc12(FH1FH2-2) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:12796476 4896 2020-03-17 (Fig. 1 G) PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0002437 1-881,1375-1841 Overexpression 972 h- cdc12 cdc12(FH1FH2-2) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000227 PMID:12796476 4896 2020-03-17 (Figure 1D) impressive enrichment of actin filaments in aberrant thick cables and aster-like accumulations PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0000670 A561E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A561E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0002061 A561E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A561E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0000085 A561E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A561E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29735656 4896 2019-05-20 (Supp. Figure. S4) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0000088 A561E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A561E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29735656 4896 2019-05-20 (Supp. Figure S4) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0000268 A561E Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-A561E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC19D5.06c FYPO:0003664 E199A,D201A Not assayed or wild type 972 h- din1 din1-E199A,D201A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.06c) PMID:19194460 4896 2014-08-07 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005682 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium medium PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0005681 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium medium PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0007767 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0007131 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003326 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 medium PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001400 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0007452 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC890.02c) PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001357 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0001357 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0004025 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000290 high PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003022 Y50S Not assayed or wild type 972 h- MDR-sup nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000222 high PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000069 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:33925026 4896 2021-05-12 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000069 Y50S Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000069 Y50S Not assayed or wild type 972 h- MDR-sup nda3 nda3-TB101 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000079,FYECO:0000137 high PMID:33925026 4896 2021-05-19 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001838 F616S Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-F616S amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000268 F616S Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-F616S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29735656 4896 2019-05-20 (Figure 4d) PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0001068 unknown 972 h- pho1 pho1-150 unknown ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:3447747 4896 2012-05-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002133 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6b) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000835 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-16 Trt1 binding is reduced to ~70% of pof8+ cells, but not as severely reduced as pof8∆ cells (~35%). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000826 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002908 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003555 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003106 R343A Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-R343A amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6) pof8-R343A cells show as short telomere as pof8∆ cells. PomBase SPAC3H8.06 FYPO:0000071 G240C Not assayed or wild type 972 h- aur1 aur1-G240C amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9472078 4896 2014-08-26 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000705 I222A,L226A Not assayed or wild type 972 h- rad24 rad24-I222A,L226A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:10523629 4896 2016-09-14 PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0003482 G5126A Not assayed or wild type 972 h- mor2 mor2-282 cps12-282 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:12234926 4896 2017-08-15 PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0001402 G5126A Not assayed or wild type 972 h- mor2 mor2-282 cps12-282 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:12234926 4896 2017-08-15 PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0001823 G5126A Not assayed or wild type 972 h- mor2 mor2-282 cps12-282 nucleotide_mutation ECO:0005638 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SPBC2D10.14c FYPO:0000703 1293-1471 Not assayed or wild type 972 h- myo51 myo51-(1-1294) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.14c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.02) PMID:24798735 4896 2014-06-12 PomBase SPAC1002.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sat1 sat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.07c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph sat1 sat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.07c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph sat1 sat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.07c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph sat1 sat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- 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Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta1-442 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 95 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 4B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000703 1-442 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-delta1-442 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 1B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0005300 T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-7TA amino_acid_mutation ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1A) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003762 T338A,T366A,T395A,T422A,T453A,T507A,T529A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 spc7 spc7-7TA amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 1B) PomBase SPBP19A11.03c FYPO:0000703 583-891 Not assayed or wild type 972 h- mts4 mts4-Cdelta2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.12),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.03c) PMID:12615927 4896 2015-12-03 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0003016 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000025,FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Similar to WT protoplasts treated with Ca2+-free hypotonic buffer, both msy1Δmsy2Δ and msy2Δ cells exhibited limited PM expansion (~10%) before quick rupturing, independently of external Ca2+ (Fig. 1D and Additional file 1: Fig. S1B). PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0008455 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000025,FYECO:0000150,FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Similar to WT protoplasts treated with Ca2+-free hypotonic buffer, both msy1Δmsy2Δ and msy2Δ cells exhibited limited PM expansion (~10%) before quick rupturing, independently of external Ca2+ (Fig. 1D and Additional file 1: Fig. S1B). PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000081 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:22910366 4896 2013-04-24 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000081 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:22910366 4896 2013-04-24 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0002077 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:22910366 4896 2013-04-29 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0002077 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 PMID:22910366 4896 2013-04-29 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000270 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-08-31 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000112 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:22910366 4896 2013-04-24 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0000112 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:22910366 4896 2013-04-24 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2C4.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msy2 msy2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.08c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dfr1 dfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.08c FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ dfr1 dfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPCC1223.08c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dfr1 dfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- dfr1 dfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1223.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dfr1 dfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.08c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dfr1 dfr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0003541 deletion 972 h- spo2 spo2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.04) PMID:21775631 4896 2016-09-06 (Figure S2A) PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph spo2 spo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec9 sec9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec9 sec9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec9 sec9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec9 sec9delta deletion ECO:0005638 PMID:16272747 4896 2023-12-11 Therefore, sec9+ is essential for vegetative cell growth and spore germination. PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000777 108-226 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1delta108-226 pxd1-delta108-226|pxd1-deltaM|pxd1deltaM pxd1-deltaM partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000705 108-226 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1delta108-226 pxd1-delta108-226|pxd1-deltaM|pxd1deltaM pxd1-deltaM partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPCC1322.02),assayed_using(PomBase:SPCC970.01) PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000470 108-226 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1delta108-226 pxd1-delta108-226|pxd1-deltaM|pxd1deltaM pxd1-deltaM partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:25203555 4896 2014-12-22 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000085 108-226 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1delta108-226 pxd1-delta108-226|pxd1-deltaM|pxd1deltaM pxd1-deltaM partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000314 low PMID:32692737 4896 2020-08-19 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K112Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K112Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K112Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K112Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBP4H10.13 FYPO:0000838 P62A Not assayed or wild type 972 h- rps2302 rps2302-P62A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.13) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC622.09 FYPO:0006321 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000170 low assayed_protein(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0006321 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000211 low assayed_protein(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0006321 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000170 low assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0006321 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000211 low assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0006321 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000170 medium assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0006321 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000211 medium assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:31262821 4896 2025-11-18 (Fig. 7C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0010011 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 6D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007814 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 3C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0010016 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000260 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 3E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001903 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000260 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 3A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 3A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 K34Q Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33Q amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 3A) PomBase SPCC576.03c FYPO:0004835 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:24268782 4896 2015-08-13 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003228 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003228 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:24268782 4896 2015-08-13 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003228 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC577.08c) PMID:24268782 4896 2015-08-13 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003238 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 low PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0000835 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000028949) PMID:22245228 4896 2012-06-21 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001101 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000028949) PMID:22245228 4896 2012-06-21 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003004 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000335 PMID:24521463 4896 2014-03-20 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001942 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001942 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0000836 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000028947) PMID:22245228 4896 2012-06-21 PomBase SPCC576.03c FYPO:0001102 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PR:000028947) PMID:22245228 4896 2012-06-21 PomBase SPCC576.03c FYPO:0000219 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000337 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003692 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC409.07c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Indeed, our analysis of Dtpx1 mutant cells indicated that Tpx1 was important for maximal Wis1 phosphorylation (pppWis1) in response to 6 mM H2O2 (Figures 3C, S4E, and S4F). PomBase SPCC576.03c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpx1 tpx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC576.03c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpx1 tpx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC576.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC576.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpx1 tpx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC576.03c FYPO:0000087 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC576.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- tpx1 tpx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000705 1-166 Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1deltaFHA(1-166) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c),assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:36138017 4896 2022-11-08 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000705 R10D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-R10D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0004213 deletion 972 h- cdc25-22 pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 low PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 3) mad2 signal. PomBase SPBC1778.10c FYPO:0002560 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 34 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 7) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0002560 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 7) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000417 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 15 PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 5) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001324 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:35082773 4896 2022-04-11 (Figure 5A) In addition, the Cdc25 protein level decreased in Δppk21 and Δcdr2 cells as well, indicating the role of Ppk21 and Cdr2 on regulating Cdc25 protein level . PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000729 deletion 972 h- cdc25-22 pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 3) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0004087 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 2) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0002680 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.15) PMID:32023460 4896 2020-02-28 (Figure S1F). increased Pil1 phosphorylation was detected in these cells PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000252 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 low PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 2) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0007265 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Figure S1F). Pil1 mis-assembled into fewer and longer filaments PomBase SPBC1778.10c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000324 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 2,3) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000061 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0001232 5 PMID:15857958 4896 2022-08-01 (Fig. 2) PomBase SPBC1778.10c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pdk1 pdk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000095 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001501 deletion 972 h- pdk1 pdk1delta deletion 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pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pdk1 pdk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.10c 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or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-E179K amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000659 1-64,245-380 Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-CD partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:37400983 4896 2023-09-08 no detectable DNA-binding activity was observed for Chp2-CD (Fig. 2I and M). 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC12G12.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC12G12.16c SPAC12G12.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 E807A Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-36 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC947.11c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- elg1 elg1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC19C7.09c FYPO:0004031 disruption 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 h- uve1 uvde::LEU2+ disruption ECO:0000335 FYECO:0000005 medium PMID:9092661 4896 2023-11-26 (Figure 4) PomBase SPBC19C7.09c FYPO:0002550 disruption 972 h- ade6-704 ura4-D18 leu1-32 h- uve1 uvde::LEU2+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000315 low PMID:9092661 4896 2023-11-24 (Figure 2) ...The uvde gene disruption made cells only mildly sensitive to UV, even after high doses. PomBase SPCC622.13c FYPO:0003827 tti1-AID Not assayed or wild type 972 h- tti1 tti1-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S1G) PomBase SPCC622.13c FYPO:0003827 tti1-AID Not assayed or wild type 972 h- tti1 tti1-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure S1G) PomBase SPCC622.13c FYPO:0001355 tti1-AID Not assayed or wild type 972 h- tti1 tti1-AID fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000339 PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figures S1C and S1D). PomBase SPCC622.13c FYPO:0000780 tti1-AID Not assayed or wild type 972 h- tti1 tti1-AID fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figures S1E and S1F) PomBase SPCC622.13c FYPO:0000780 tti1-AID Not assayed or wild type 972 h- tti1 tti1-AID fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figures S1E and S1F) PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0004325 deletion 972 h- SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3F10.16c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3F10.16c SPAC3F10.16cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0007806 1-279 Overexpression 972 h- ctp1 ctp1-CT15 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:33836577 4896 2021-06-09 We therefore introduced a synthetic CT15 peptide into an endonuclease assay containing the MR complex, but lacking Nbs1 (Fig. 4A). Strikingly, the CT15 peptide stimulated the endonuclease activity of MR similarly to the unphosphorylated, full-length Ctp1 (Fig. 4B). Moreover, stimulation of MR at higher concentrations of the CT15 peptide (100 μM) was comparable to the maximal levels achieved with the MRN complex and phosphorylated full-length Ctp1 (Ctp1p in Fig. 4C). PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0001908 rrp6::ura4 Null 972 h- rrp6 rrp6::ura4+ disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:24081329 4896 2013-11-29 PomBase SPAC1F3.01 FYPO:0000825 rrp6::ura4 Null 972 h- rrp6 rrp6::ura4+ disruption ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1250.05) PMID:24081329 4896 2013-12-05 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0002873 S476A,S632A Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-2A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:30853434 4896 2019-04-01 (Figure 3C,D) PomBase SPAC16A10.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC16A10.01 SPAC16A10.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16A10.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC16A10.01 SPAC16A10.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16A10.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC16A10.01 SPAC16A10.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.14 FYPO:0004159 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 80 PMID:23770679 4896 2019-10-08 (Fig. 2g) PomBase SPCC736.14 FYPO:0007108 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-08 (Figure 2a) PomBase SPCC736.14 FYPO:0004090 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.09) PMID:21151990 4896 2019-11-08 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002678 deletion 972 h- rep1-mad2 dis1 dis1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC736.14),residue(S551) PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 1B) PomBase SPCC736.14 FYPO:0001270 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0000080 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPCC736.14 FYPO:0000080 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000227 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPCC736.14 FYPO:0000080 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPCC736.14 FYPO:0007072 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 low PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 7) PomBase SPCC736.14 FYPO:0009056 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000137 high PMID:36435910 4896 2023-04-13 PomBase SPCC736.14 FYPO:0004212 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:23770679 4896 2019-10-08 (Fig. 3b) PomBase SPCC736.14 FYPO:0004833 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.14 FYPO:0009057 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:36435910 4896 2023-04-13 (Figure 2a) PomBase SPCC736.14 FYPO:0007112 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-08 (Fig. 2b-d) PomBase SPCC736.14 FYPO:0005343 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.14 FYPO:0001846 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 6) PomBase SPCC736.14 FYPO:0005706 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.14 FYPO:0007071 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 6) PomBase SPCC736.14 FYPO:0000316 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:10398680 4896 2021-12-20 (Figure 8a) PomBase SPCC736.14 FYPO:0000228 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 low PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 6) PomBase SPCC736.14 FYPO:0003614 deletion 972 h- hht1-CFP mCherry-atb2 dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 23 PMID:34346498 4896 2021-09-12 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002688 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:21256022 4896 2014-05-06 PomBase SPCC736.14 FYPO:0001164 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102 PMID:12376568 4896 2012-11-15 PomBase SPCC736.14 FYPO:0005699 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:31618856 4896 2019-10-24 appears to retain normal microtubule nucleation activity PomBase SPCC736.14 FYPO:0007107 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-08 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002901 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1805.07c) PMID:17352737 4896 2015-02-11 PomBase SPCC736.14 FYPO:0005342 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 7) PomBase SPCC736.14 FYPO:0001357 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31427431 4896 2019-08-29 (Figure 1b) PomBase SPCC736.14 FYPO:0000091 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 high PMID:27872152 4896 2017-04-03 (Fig. 7D) PomBase SPCC736.14 FYPO:0000091 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 high PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2B) PomBase SPCC736.14 FYPO:0002546 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 PMID:17004072 4896 2016-03-02 PomBase SPCC736.14 FYPO:0003305 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0007304 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.14 FYPO:0001491 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- dis1 dis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7628693 4896 2014-12-30 PomBase SPCC736.14 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dis1 dis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 G124A Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-G124A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002059 cdc15(1-312)-imp2(321-591) Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-imp2(IDR) fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:31509478 4896 2020-01-07 (Fig. 2) PomBase SPBC3B8.01c FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arh1 arh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- arh1 arh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B8.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arh1 arh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006586 C85S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C85S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPBC4.01 FYPO:0000708 C85S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C85S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006541 C85S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C85S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006587 C85S Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-C85S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPAC17H9.18c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC17H9.18c SPAC17H9.18cdelta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000173 154-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta154-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000229 154-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta154-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004921 154-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta154-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0001357 154-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta154-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-06 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000088 154-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta154-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002346 K314A Overexpression 972 h- epe1 epe1-K314A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPAC328.08c FYPO:0000016 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0000082 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0001324 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC800.05c) PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0001324 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC16A3.15c) PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0002462 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0002004 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0000091 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC328.08c FYPO:0002760 F174S Not assayed or wild type 972 h- tbc1 tbc1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:23576550 4896 2013-11-19 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 A195AGVPLA Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K1 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0001645 1-200,308-688 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2delta200-307 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:29292846 4896 2019-09-25 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0002969 1-200,308-688 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2delta200-307 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10) PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 5) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000078 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 high PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Fig. 1B) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0008316 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000059 PMID:34119521 4896 2024-10-22 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU (Fig. 2, B-D). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000046 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Fig. 7A) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Fig. 7A) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0006978 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003769 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000231 low PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8A) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.07) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8D) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8D) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8D) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8D) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8D) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.08) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8D) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC106.19) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 9A) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003423 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8B,8C) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003423 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8B,8C) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0003423 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPMIT.09) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 8B,8C) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0007525 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.15c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU and reduced the association of Mti2 and Mti3 with mitoribosomes (Fig. 2, B-D). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0007525 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:34119521 4896 2024-10-21 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU and reduced the association of Mti2 and Mti3 with mitoribosomes (Fig. 2, B-D). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009007 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000035 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:32896087 4896 2020-09-26 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0004153 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000059 PMID:28334955 4896 2017-03-30 Supplementary Figure S7 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Fig. 7c) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0004960 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC106.19) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure Supp S8) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC2F7.15) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.03c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.15c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009032 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0001034 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000412 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000440 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Fig. 7B) PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mpa1 mpa1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 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FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph mpa1 mpa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- mpa1 mpa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpa1 mpa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mpa1 mpa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004212 plo1(1-341)-(ENLYFQGAS)-plo1(342-405)-(ENLYFQGAS)-plo1(406-683) Not assayed or wild type 972 h- Cnp3C-TEV (kinetochore localized protease) plo1 plo1-TEVAA341 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:25533956 4896 2015-07-28 (Fig. 5e) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004212 plo1(1-341)-(ENLYFQGAS)-plo1(342-405)-(ENLYFQGAS)-plo1(406-683) Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-TEVAA341 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. S2A) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004764 plo1(1-341)-(ENLYFQGAS)-plo1(342-405)-(ENLYFQGAS)-plo1(406-683) Not assayed or wild type 972 h- Cnp3C-TEV (kinetochore localized protease) plo1 plo1-TEVAA341 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:25533956 4896 2015-07-28 (Fig. 5e) PomBase SPBC16C6.12c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 las1 las1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.12c FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 las1 las1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- las1 las1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16C6.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 las1 las1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.12c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 las1 las1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs4 mcs4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000705 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000705 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02),assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002663 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005801 PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0001232 medium PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0001232 PMID:9383051 4896 2018-06-07 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001382 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000248 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:32915139 4896 2020-10-19 upstream elements of this signaling cascade shared this phenotype... Mcs4, the redundant MAPKKK´s Wak1 and Win1, and MAPKK Wis1 (Figure 1A, Figure 1—Figure supplement 1 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001324 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-16 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002446 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001885 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 high assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001645 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001645 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:24255738 4896 2014-03-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0003207 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:24255738 4896 2014-03-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0003206 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC1006.09),assayed_using(PomBase:SPAC9G1.02) PMID:24255738 4896 2014-03-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001116 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10940030 4896 2015-04-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001116 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:10940030 4896 2015-04-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001116 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002304 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10940030 4896 2015-04-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002304 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:10940030 4896 2015-04-13 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001000 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005580 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002807 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001164 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPBC887.10 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002766 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-06 (Figure 6) PomBase SPBC887.10 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPBC887.10 FYPO:0004513 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000248 PMID:32915139 4896 2020-10-14 upstream elements of this signaling cascade shared this phenotype... Mcs4, the redundant MAPKKK´s Wak1 and Win1, and MAPKK Wis1 (Figure 1A, Figure 1—Figure supplement 1 PomBase SPBC887.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0003860 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:26108447 4896 2016-07-01 (Figure 6) PomBase SPBC887.10 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC887.10 FYPO:0004325 deletion 972 h- mcs4 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wild-type cells before dividing (Figure 5A).45,47,48 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs4 mcs4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- mcs4 mcs4delta deletion ECO:0005638 PMID:9383051 4896 2018-06-07 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 R218A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R218A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC550.15c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rei1 rei1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.15c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rei1 rei1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC550.15c FYPO:0001355 deletion 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alleviated cen1:ade6+ silencing also displayed increased levels of noncoding centromeric otr transcripts and concomitant reductions in centromeric siRNA accumulation, with prp10-1 showing the most severe silencing defects (Fig. 1C PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003412 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003029 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003029 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003041 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 medium assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0000220 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:18948543 4896 2024-01-30 In contrast, mutations in prp5 (Prp46Sc/PLRG1Hs), prp8 (Prp2Sc/DHX16Hs), prp10 (Hsh155Sc/ SF3B1Hs), and prp12 (Rse1Sc/SF3B2Hs), like cwf10 and prp39, alleviated cen1:ade6+ silencing (Fig. 1B) and increased cen1:ade6+ transcript accumulation (Fig. 1C, ade6) PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0000220 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0001908 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0000839 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0001490 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003619 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000049 PMID:18948543 4896 2024-01-30 However, at the permissive temperature of 25°C (at which centromeric silencing was alleviated), splicing efficiency was similar to that in wild-type cells (Fig. 2A). PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003619 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003619 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003619 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003619 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003619 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003620 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003620 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003620 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003620 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0003620 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-08-07 PomBase SPAPJ698.03c FYPO:0000785 G3340A Not assayed or wild type 972 h- prp12 prp12-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPCC1682.04 FYPO:0002061 P108S Not assayed or wild type 972 h- cdc31 cdc31-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 data not shown PomBase SPCC970.08 FYPO:0001045 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 7B) PomBase SPCC970.08 FYPO:0008281 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000335 medium PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC970.08 FYPO:0008283 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000335 medium PMID:38940614 4896 2024-07-25 (Fig. 11) PomBase SPCC970.08 FYPO:0008282 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000335 medium PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 11) PomBase SPCC970.08 FYPO:0001117 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 8B) PomBase SPCC970.08 FYPO:0001117 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 8B) PomBase SPCC970.08 FYPO:0001117 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 8B) PomBase SPCC970.08 FYPO:0001117 R332T Not assayed or wild type 972 h- kcs1 kcs1-R332T amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 8B) PomBase 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SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-70,181-659 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d2 B2d2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 2) PomBase SPAC1B9.02c FYPO:0005034 wild type Overexpression 972 h- sck1 sck1+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000296 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.16) PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC1B9.02c FYPO:0000584 wild type Overexpression 972 h- sck1 sck1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:9560431 4896 2013-09-17 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001164 CTD-delta(r11-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-delta(r11-r29) rpb1-12xCTD|rpb1-CTDdelta(11-29) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17502918 4896 2015-11-09 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0000031 deletion 972 h- pfl10 pfl10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 99 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pfl10 pfl10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- pfl10 pfl10delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pfl10 pfl10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- pfl10 pfl10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl10 pfl10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB2C8.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl10 pfl10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007376 730-797 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-delta(730-797) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4C) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 730-797 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-delta(730-797) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4C) PomBase SPAPB17E12.09 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB17E12.09 SPAPB17E12.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB17E12.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- SPAPB17E12.09 SPAPB17E12.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB17E12.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAPB17E12.09 SPAPB17E12.09delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0007645 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-02-11 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000427 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008235 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000059 PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Table 1) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003744 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c),assayed_region(SO:0001898) PMID:14704433 4896 2024-01-18 Furthermore, deletion of ago1+, dcr1+, or rdp1+ abolished the association of Chp1-Flag and Tas3-TAP with otr1::ura4+, as well as with centromeric repeat sequences (Fig. 4, A and B). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003074 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008011 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000059 PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 3D) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008011 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000337 PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 4B). We found that, whereas siRNAs could be readily detected in the affinity-purified fraction of RITS from wild-type cells, there were no detectable RITS- associated siRNAs present in rdp1D903A, rdp1Δ, or dcr1Δ cells PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002835 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 2A and B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004201 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002834 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000231 high PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 2B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003411 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 high PMID:15607976 4896 2024-05-28 (Fig. 6F) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003412 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003412 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 PMID:12193640 4896 2024-01-19 Two transgenes located centromere distal to the tRNA genes were de-repressed in ago1- , dcr1- , and rdp1- , but a transgene located within the central region remained silent. Similar results were obtained in all three mutant strains, as assayed by growth on medium lacking uracil and by Northern blots (Fig. 1, B) (21). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003412 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003412 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003412 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003412 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002827 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 low PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 5B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002827 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000268,FYECO:0000370 high PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0007009 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 4) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000888 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5C and E) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006269 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003096 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193640 4896 2024-01-19 In contrast, levels of K9 were greatly reduced. PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003571 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 high PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006599 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12193640 4896 2024-01-19 As expected, Swi6, which depends on histone modification for chromatin binding, was delocalized from the ura4+ transgenes (Fig. 3C). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003573 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. S5) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003573 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003573 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002386 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. S5) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000220 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000220 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 high PMID:12193640 4896 2024-01-19 However, three major transcripts that hybridized to the repeats were found to accumulate at high levels in each of the RNAi mutants (Fig. 1C). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0008148 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0003351 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16738311 4896 2014-12-23 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0007337 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193640 4896 2024-01-19 dcr1- , rdp1- , and ago1- cells had increased levels of K4 in the centromeric region in comparison to actin controls (Fig. 3B). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0007468 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000127 assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 2E, 2F) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002664 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 PMID:22431512 4896 2013-09-19 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0005995 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000825 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0000286) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1A) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006518 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006660 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000674 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002141 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004331 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 PMID:12193640 4896 2024-01-19 Two transgenes located centromere distal to the tRNA genes were de-repressed in ago1- , dcr1- , and rdp1- , but a transgene located within the central region remained silent. Similar results were obtained in all three mutant strains, as assayed by growth on medium lacking uracil and by Northern blots (Fig. 1, B) (21). PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002336 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0001164 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0005866 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. S2B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0005865 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000226 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004325 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0004325 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. S2) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion 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prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 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SPAC6F12.09 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph rdp1 rdp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0006076 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0000337 PMID:20178743 4896 2024-11-18 (Fig. 1B and C) PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rdp1 rdp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002470 T110V Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T110V amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 T110V Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T110V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 T110V Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T110V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0001164 T110V Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-T110V amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000085 T110V Not assayed or wild type 972 h- rad4 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2013-09-20 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 trx2 trx2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- trx2 trx2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trx2 trx2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trx2 trx2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001971 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000244 PMID:19328067 4896 2014-11-24 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006020 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.15) PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Figure 5) rbp1 also Figure 7 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006020 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Figure 5) rbp1 also Figure 7 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002577 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Extended Data Fig 3a, Fig. 2c, Extended Data Fig. 3b-d) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004067 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000244 PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004161 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004161 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004161 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.02c) PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Supplementary Fig S7) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002679 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c),residue(T316) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Fig. 1c, Extended Data Fig 2a) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001117 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001117 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC16C9.06c) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0006613 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 PMID:29899453 4896 2018-07-06 Extended Data Fig 3a, Fig. 2c, Extended Data Fig. 3b-d) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002913 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000244 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 1, 2 and 4) Supplementary Fig S1, S3 and S5 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002913 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000244 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 2) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002980 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 4a Cdk9 inhibition increased chromatin recruitment of Dis2 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0002061 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000244 PMID:19328067 4896 2014-11-24 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003086 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 6e Cdk9 does not restrict chromatin recruitment of Sds21. PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003086 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC1709.08) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 5a PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003086 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC646.04) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 5a PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0003086 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC12G12.14c) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 5a PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0007347 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000244 PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Supplementary Fig S7) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001509 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC330.10) PMID:19328067 4896 2014-11-25 PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0004422 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),residue(CTD_T1) PMID:29899453 4896 2018-07-06 (Extended Data Fig 2f) PomBase SPBC32H8.10 FYPO:0001234 T120G Not assayed or wild type 972 h- cdk9 cdk9-T120G cdk9-as|cdk9as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000244 PMID:20605454 4896 2015-11-06 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph met3 met3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0001309 deletion 972 h- met3 met3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC15D4.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 met3 met3delta deletion ECO:0005638 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2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005228 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005947 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:34349749 4896 2024-12-14 Nonetheless, we compared the growth of trk1delta and trk2delta with that of cfr1delta in the presence of high K+ concentrations. Additionally, we constructed double and triple mutants to determine whether cfr1+ acts in the same functional pathways as trk1+ and/or trk2+. The results showed that while cfr1delta was sensitive to potassium salts, neither trk1delta, trk2delta nor trk1delta trk2delta exhibited sensitivity (Figure 2A). PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 trk1 trk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000095 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000098 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000261 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000098 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 medium PMID:34349749 4896 2024-12-14 The results showed that trk1delta was partially sensitive to 40 mM NaCl and sensitive to 100 mM CaCl2 (Figure 3D) PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000098 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 low PMID:34349749 4896 2024-12-14 cfr1delta was only sensitive to very high Na+ and Ca2+ concentrations (lower panels in Figure 3D) PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000106 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 low PMID:10629185 4896 2017-09-15 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000106 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000106 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-14 cfr1delta was partially sensitive to hygromycin B and deleting cfr1+ enhanced the sensitivity of trk1delta, trk2delta, and trk1delta trk2delta strains (Figure 3C). PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 medium PMID:10629185 4896 2017-09-15 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:10091581 4896 2017-03-27 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000093 PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 PMID:10091581 4896 2017-03-27 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 medium PMID:34349749 4896 2024-12-14 The results showed that trk1delta was partially sensitive to 40 mM NaCl and sensitive to 100 mM CaCl2 (Figure 3D) PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 low PMID:34349749 4896 2024-12-14 cfr1delta was only sensitive to very high Na+ and Ca2+ concentrations (lower panels in Figure 3D) PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0006225 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:16164595 4896 2017-09-18 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- trk1 trk1delta deletion ECO:0005638 PMID:10091581 4896 2017-03-27 PomBase SPAC3F10.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trk1 trk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 php5 php5+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC3B8.02 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 php5 php5+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC227.07c FYPO:0000158 R58* Not assayed or wild type 972 h- pab1 ret1-4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:7845361 4896 2014-02-19 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0007212 1-86 Not assayed or wild type 972 h- epe1delta ssu72 ssu72-1-86 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0007213 1-86 Not assayed or wild type 972 h- epe1delta ssu72 ssu72-1-86 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002836 1-86 Not assayed or wild type 972 h- epe1delta ssu72 ssu72-1-86 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC3G9.04 FYPO:0002336 1-86 Not assayed or wild type 972 h- epe1delta ssu72 ssu72-1-86 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001820 D389A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-D389A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0006717 D389A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-D389A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 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4896 2024-08-05 (Fig. 1G) PomBase SPAC13A11.02c FYPO:0000088 G189D Not assayed or wild type 972 h- erg11 erg11-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:28893786 4896 2017-09-29 PomBase SPBC365.15 FYPO:0004700 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp4 alp4-225 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-20 PomBase SPBC365.15 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- alp4 alp4-225 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:9658169 4896 2015-07-08 PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0002276 L108R Not assayed or wild type 972 h- tbf1 tbf1-L108R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.13) PMID:38677290 4896 2024-12-13 Surprisingly, arginine substitutions of the hydrophobic residues (L101R, L108R, V141R, and V148R) led to degradation and insolubility of mutant proteins of spTbf1TRFH (Figures S3) | Consistently, all L101R, L108R, V141R, and V148R mutations resulted in great degradation of spTbf1 in cells (Figure 2E). PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0001179 706-1828 Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1(N705) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9635190 4896 2016-04-05 (Figure 4a, I) PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0001179 706-1828 Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1(N705) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:9635190 4896 2016-04-05 PomBase SPCC5E4.04 FYPO:0004412 706-1828 Not assayed or wild type 972 h- cut1 cut1(N705) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:9635190 4896 2016-04-05 (Figure 4b) PomBase SPAC23G3.01 FYPO:0002061 D383A Not assayed or wild type 972 h- rpb2 rpb2-D383A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8569679 4896 2021-01-24 (Fig. 2) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 S49SKGYP,49-57 Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K23deltaK14 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0001340 deletion 972 h- hsr1 hsr1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000078 PMID:18003976 4896 2016-09-07 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph hsr1 hsr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph hsr1 hsr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph hsr1 hsr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph hsr1 hsr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0000470 deletion 972 h- hsr1 hsr1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0009007 deletion 972 h- hsr1 hsr1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph hsr1 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FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hsr1 hsr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- hsr1 hsr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3H1.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hsr1 hsr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1734.12c FYPO:0003860 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP alg12 alg12+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0006821 wild type Overexpression 972 h- mid2 mid2+ wild_type ECO:0001232 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 8) PomBase SPAPYUG7.03c FYPO:0000021 wild type Overexpression 972 h- mid2 mid2+ wild_type ECO:0001232 PMID:12668659 4896 2019-07-30 (Fig. 8) PomBase SPCC794.12c FYPO:0003418 unknown Not assayed or wild type 972 h- mae2 mae2-mutant unknown ECO:0005801 PMID:10187772 4896 2014-06-06 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004194 disruption Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPBC660.14) PMID:9572736 4896 2024-04-11 (Fig. 3C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 disruption Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0005801 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:9572736 4896 2024-04-11 (Fig. 2A) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 disruption Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000170 medium PMID:9572736 4896 2024-04-11 (Fig. 5B) PomBase SPNCRNA.1710 FYPO:0001551 III:1593402-1593818 Not assayed or wild type 972 h- adh1AS adh1AS-deltapromoter partial_nucleotide_deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC13B11.01) PMID:23223230 4896 2023-03-16 However, the larger band preferentially accumulated under zinc-replete conditions in wild-type cells and constitutively accumulated in SPCC13B11.02c cells. Thus, changes in adh1AS levels influence the levels of Adh1 protein, suggesting that this mechanism may exist to conserve zinc. PomBase SPNCRNA.1710 FYPO:0001547 III:1593402-1593818 Not assayed or wild type 972 h- adh1AS adh1AS-deltapromoter partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC13B11.01) PMID:23223230 4896 2023-03-16 When adh1AS and adh1 transcript levels were examined in SPCC13B11.02c cells, the adh1AS transcript was not detected, and adh1 mRNAs were detected in both zinc-limited and zinc-replete cells (Fig. 1C). PomBase SPNCRNA.1710 FYPO:0001889 III:1593402-1593818 Not assayed or wild type 972 h- adh1AS adh1AS-deltapromoter partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1710) PMID:23223230 4896 2023-03-16 When adh1AS and adh1 transcript levels were examined in SPCC13B11.02c cells, the adh1AS transcript was not detected, and adh1 mRNAs were detected in both zinc-limited and zinc-replete cells (Fig. 1C). PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pud1 pud1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- pud1 pud1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pud1 pud1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4C5.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pud1 pud1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002243 E89A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. S7B) PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0002085 E89A Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-E89A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. S7A) PomBase SPBC119.11c FYPO:0000082 K329* Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-T329 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001147 K329* Not assayed or wild type 972 h- pac1 pac1-T329 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:7616961 4896 2014-01-17 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000580 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000031 deletion 972 h- mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000357 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 high PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0003797 deletion 972 h- h90 his5::ura3GFP::psy1+::LEU2 sid4+::tdTomato::hphMX6 ura4-D18 leu1-32 cyhR EAP20 mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 PMID:24727291 4896 2014-09-30 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- mam3 mam3delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP11E10.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mam3 mam3delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPAC144.13c FYPO:0005414 wild type Knockdown 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:21389117 4896 2016-04-22 PomBase SPAC144.13c FYPO:0005416 wild type Knockdown 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001000 wild type Knockdown 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0001232 PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPAC144.13c FYPO:0001000 wild type Knockdown 972 h- srw1 srw1+ Puhp1-HA-ste9 wild_type ECO:0001232 PMID:21389117 4896 2016-04-22 (Fig. 1B) 4 nuclei appear later than normal. PomBase SPCC1682.04 FYPO:0002061 A62T Not assayed or wild type 972 h- cdc31 cdc31-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229 PMID:12857865 4896 2018-03-06 data not shown PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0002134 K235A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-K235A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:18280239 4896 2015-10-12 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004914 T228G Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-1 nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002239 T228G Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-1 nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001357 H423A,F476A Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-H423A,F476A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:14730023 4896 2014-08-05 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000705 E262Q Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-E262Q amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000140 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- rbm10 rbm10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A7.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rbm10 rbm10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rbm10 rbm10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001045 C394A,C397A Not assayed or wild type 972 h- pqr1 spx1-C394A,C397A spx1-C394A-C397A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 10B) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001357 C394A,C397A Not assayed or wild type 972 h- pqr1 spx1-C394A,C397A spx1-C394A-C397A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 10A) PomBase SPBP35G2.14 FYPO:0001357 1-711 Overexpression 972 h- puf2 puf2(712-1065) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 7B) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002835 V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24M amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008195 V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24M amino_acid_mutation ECO:0000059 medium PMID:19362535 4896 2024-02-13 A second class of mutants showed a 5- to 17-fold reduction in binding affinity for H3K9me2 compared with the wild-type Chp1 chromodomain (V21A, E23V, N59A, and V24M). A PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0006599 V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24M amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19362535 4896 2024-02-13 Surprisingly, in contrast to robust association of wild-type Chp1 at the centromeric outer repeat sites, we found only very low levels of many of the mutant Chp1 proteins at centromeres under our standard ChIP conditions (Figure 4A and Figure S5A) PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002837 V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24M amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004742 V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24M amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19362535 4896 2024-02-13 Interestingly, cells expressing most of the mutant alleles of chp1 showed no defect in heterochromatin assembly as measured in this assay (Figure 3A), with the exception of the double mutant E23V V24M and the V24R chp1 mutant, which did show silencing defects. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0008070 V24M Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24M amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:19362535 4896 2024-02-13 unlike chp1 null cells, there was no significant decrease in centromeric H3K9me2 or Swi6 association in any of the chp1 mutants tested (Figures 4B and 4C; Figure S5B). PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0003041 wild type Knockdown 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-210 DS2 snu1 snu1+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0002679 S771A,S788A,S794A,S798A Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-4A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:31644361 4896 2020-02-19 (Figure 3A) Consistent with this model, wee1(4A) phosphorylation was reduced when compared with wild type, and its phosphorylation was not altered by cdr1∆ or cdr2∆ ( PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001122 S771A,S788A,S794A,S798A Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-4A amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:31644361 4896 2020-02-07 (Figure 3B) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0004083 S771A,S788A,S794A,S798A Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-4A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:31644361 4896 2020-02-19 (Figure 3, A and D) We confirmed that wee1(4A) protein level does not increase and still localizes to cortical nodes PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 Y251YRGTPY Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K35 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hip4 hip4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hip4 hip4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0004481 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC947.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0003412 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC947.08c FYPO:0002827 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hip4 hip4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000470 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0000059 high PMID:21211723 4896 2024-01-17 Defective mating-type switching in heterochromatin mutants results in poor iodine staining of colonies, in contrast to the dark staining of wild-type colonies (Jia et al., 2004). asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F). PomBase SPBC947.08c FYPO:0000470 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000220 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0000231 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC947.08c FYPO:0003105 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0000291 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC947.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC947.08c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hip4 hip4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001164 deletion 972 h- hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:20976105 4896 2016-04-07 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0009065 deletion 972 h- h- prototroph hip4 hip4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.08c FYPO:0007921 deletion 972 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PMID:32546830 4896 2020-06-30 (Figure 2E) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0004213 L405P Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-L405P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21256022 4896 2015-02-09 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 G53R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52R amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-24 (Fig. 1A) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005485 H397A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:35536002 4896 2022-10-12 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001327 H397A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1-H397A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35536002 4896 2022-10-19 (Fig. 12) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002680 Sty1-Tpx1@sty1 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-tpx1 fusion_or_chimera ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37572670 4896 2024-01-22 (Figure 1) Strikingly, Sty1 phosphorylation was increased in cells expressing either Sty1-Tpx1 or Sty1-Tpx1C48S (Figure 1D) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002680 Sty1-Tpx1@sty1 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-tpx1 fusion_or_chimera ECO:0001807 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPBC409.07c) PMID:37572670 4896 2024-01-22 (Figure 3) Sty1-Tpx1 fusion proteins, Wis1 was hyperphosphorylated to less electrophoretically mobile forms even in the absence of stress (Figures 3A and 3D). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006822 Sty1-Tpx1@sty1 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-tpx1 fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:37572670 4896 2024-01-22 This revealed that Sty1- Tpx1- and Sty1-Tpx1C48S-expressing cells both divided at a significantly smaller size than wild-type cells (Figure 1F). PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 L149A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L149A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 L149A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L149A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004232 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC1834.03c) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004224 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004227 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004223 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004229 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0000969 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004221 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0002102 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0004230 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPBC29A3.13 FYPO:0000703 F94A Endogenous 972 h- pdp1 pdp1-F94A amino_acid_mutation ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.13),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.12) PMID:19250904 4896 2014-12-23 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0001971 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:15194814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0001018 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 30-40 PMID:23093943 4896 2021-03-26 Loss of Eng1 or its cooperating glucanase, Agn1 [34], resulted in high percentages of monopolar growth (Figure 6C-6D and Figure S5A) PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004270 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 PMID:15194814 4896 2015-01-21 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000650 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3C) PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000239 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000118 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 10 PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3C) PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0003334 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC16A3.01) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 3A) PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000673 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 PMID:15194814 4896 2015-01-09 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0004267 deletion 972 h- agn1 agn1delta deletion ECO:0001232 PMID:15194814 4896 2015-01-21 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0002634 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph agn1 agn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC14C4.09 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph agn1 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I PomBase SPAC31A2.09c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph apm4 apm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph apm4 apm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.09c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph apm4 apm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.09c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph apm4 apm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph apm4 apm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph apm4 apm4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31A2.09c 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assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 7) PomBase SPBC409.07c FYPO:0000255 L9A,L13A Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-LA wis1LA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 5) PomBase SPBC409.07c FYPO:0003627 L9A,L13A Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-LA wis1LA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 7) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 L132A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L132A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 L132A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L132A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 K273* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-K273->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:30072439 4896 2019-06-26 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001118 K273* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-K273->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:30072439 4896 2023-01-25 PomBase SPAC589.12 FYPO:0003743 K273* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-K273->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC589.12 FYPO:0001178 K273* Not assayed or wild type 972 h- cwh43 cwh43-K273->stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:30072439 4896 2019-07-10 PomBase SPAC22G7.09c FYPO:0004862 wild type Overexpression 972 h- nup45 nup45+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0006918 541-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta92C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0004833 541-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta92C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 541-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta92C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0002061 541-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta92C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A) PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0000704 L169P Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-L169P amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c),assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c) PMID:26152728 4896 2015-07-21 As expected, we found that GST-tagged Sdj1 was able to co-precipitate wild type His6- tagged Sdj1, but not His6-tagged Sdj1-L169P (Fig. 1B). In agreement with this, we observe that the Leu-169 residue is located in the proximity of the subunit-subunit interface in the published crystal structure of Sdj1 (33) (Fig. 1C). PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0000705 L169P Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-L169P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c),assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c) PMID:22173095 4896 2016-10-27 Fig. 6 PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0000847 L169P Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-L169P amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c) PMID:26152728 4896 2015-07-21 First, we observed that the steady-state level of Sdj1-L169P was reduced compared with wild type Sdj1 (Fig. 3A). In cultures where protein synthesis was blocked by addition of cycloheximide, we found that wild type Sdj1 appeared stable, whereas the Sdj1-L169P protein was rapidly degraded (Fig. 3B). However, when the proteasome inhibitor bortezomib was added to the culture, the degradation was blocked (Fig. 3B), suggesting that the reduced Sdj1-L169P steady-state level was primarily caused by proteasomal degradation of the protein PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0001571 L169P Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-L169P amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.02c),assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c) PMID:26152728 4896 2015-07-21 Interestingly, a few proteins were found to specifically interact with Sdj1-L169P (supplemental File S2). Among these were Ssa1 and Ssa2, two highly similar cytosolic Hsp70-type chaperones. To independently validate the data from mass spectrometry, we subsequently performed immunoprecipitation experiments with wild type Sdj1 and Sdj1-L169P. Indeed, we found that Hsp70 (Ssa1 and Ssa2) was specifically associated with Sdj1-L169P and not wild type Sdj1 (Fig. 4A). PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0001571 L169P Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-L169P amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.03c),assayed_using(PomBase:SPCC1739.13) PMID:26152728 4896 2015-07-21 Interestingly, a few proteins were found to specifically interact with Sdj1-L169P (supplemental File S2). Among these were Ssa1 and Ssa2, two highly similar cytosolic Hsp70-type chaperones. To independently validate the data from mass spectrometry, we subsequently performed immunoprecipitation experiments with wild type Sdj1 and Sdj1-L169P. Indeed, we found that Hsp70 (Ssa1 and Ssa2) was specifically associated with Sdj1-L169P and not wild type Sdj1 (Fig. 4A). PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0002219 S10D,S22D,S34D,S43D,S150D,S439D,S496D,S880D,T60D,T70D Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-10D amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25993311 4896 2017-04-11 PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0000488 S10D,S22D,S34D,S43D,S150D,S439D,S496D,S880D,T60D,T70D Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-10D amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25993311 4896 2017-04-11 (Table 3) PomBase SPCC4E9.01c FYPO:0003178 S10D,S22D,S34D,S43D,S150D,S439D,S496D,S880D,T60D,T70D Not assayed or wild type 972 h- rec11 rec11-10D amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:25993311 4896 2017-04-11 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0001407 deletion 972 h- pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC323.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pex8 pex8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC323.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pex8 pex8delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0003824 deletion 972 h- pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:24463365 4896 2014-09-19 PomBase SPAC323.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pex8 pex8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC323.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- pex8 pex8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC323.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pex8 pex8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC323.03c 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prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000091 deletion 972 h- ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0002546 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph ckk2 ckk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- ckk2 ckk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckk2 ckk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckk2 ckk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0005710 wild type Overexpression 972 h- ade6-704 leu1-32 h+ rum1 rum1+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000105,FYECO:0000126 high high PMID:7883794 4896 2019-02-27 (Fig. 1B) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001425 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0005580 PMID:8598285 4896 2014-08-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001425 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0005580 PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0005638 PMID:9203581 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003436 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 5B) over expression reduces cdc2 kinase activity even in absence of added rum1 protein PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003436 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC582.03) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 5B) over expression abolishes cdc13 associated kinase activity even in absence of added rum1 protein PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003436 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:9552380 4896 2014-06-12 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0006031 wild type Overexpression 972 h- ade6-704 leu1-32 h+ rum1 rum1+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000105,FYECO:0000126 high PMID:7883794 4896 2019-02-27 Table 1, Figure 1B appearance of IC peak at early timepoint PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001974 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0005580 PMID:9552380 4896 2014-06-12 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:8598285 4896 2014-08-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001571 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 5A) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001571 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:8521500 4896 2018-04-17 (Fig. 5A) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000833 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000833 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000833 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000833 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000838 wild type Overexpression 972 h- rum1 rum1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c) PMID:10388806 4896 2012-08-24 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP rum1 rum1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0005440 wild type Overexpression 972 h- ade6-704 leu1-32 h+ rum1 rum1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000105,FYECO:0000126 high PMID:7883794 4896 2019-02-27 (Figure 1A) PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0002779 deletion 972 h- rps23 rps23delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rps23 rps23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rps23 rps23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rps23 rps23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rps23 rps23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0007317 deletion 972 h- rps23 rps23delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 The rps23Δ mutant also has reduced polysome density, indicative of reduced translation, accompanied by an undetectable 40S peak and a greatly pronounced 60S peak that substantially overshadows the 80 monosome peak PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0000470 deletion 972 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30 ̊C (Fig 7A and 7B and S1 Table). PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- rps23 rps23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps23 rps23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps23 rps23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11B10.07c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ivn1 ivn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC11B10.07c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ivn1 ivn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11B10.07c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ivn1 ivn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PMID:35354597 4896 2024-03-25 (Fig. 6D) PomBase SPAC31A2.10 FYPO:0001491 deletion 972 h- SPAC31A2.10 SPAC31A2.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC31A2.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC31A2.10 SPAC31A2.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC31A2.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC31A2.10 SPAC31A2.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31A2.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC31A2.10 SPAC31A2.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC31A2.10 SPAC31A2.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001690 T79A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-T79A amino_acid_mutation ECO:0005638 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nitrogen sources, some of the nc1669Δ cells underwent mating (followed by meiosis), whereas WT cells never initiated mating (Figure 3B, C) PomBase SPNCRNA.1669 FYPO:0007951 deletion 972 h- SPNCRNA.1669 SPNCRNA.1669delta deletion ECO:0001232 PMID:36259651 4896 2022-12-02 PomBase SPNCRNA.1669 FYPO:0003031 deletion 972 h- SPNCRNA.1669 SPNCRNA.1669delta deletion ECO:0001232 PMID:36259651 4896 2022-12-02 When cells were grown in media containing nitrogen sources, some of the nc1669Δ cells underwent mating (followed by meiosis), whereas WT cells never initiated mating (Figure 3B, C) PomBase SPCC188.03 FYPO:0001122 S546R Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-S546R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000085 S546R Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3-S546R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000705 F256A Not assayed or wild type 972 h- dis2 dis2-F256A amino_acid_mutation ECO:0000049 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PomBase SPCC306.03c FYPO:0000228 S5A,S41A,S52A Not assayed or wild type 972 h- cnd2 cnd2-3A amino_acid_mutation ECO:0001232 5 PMID:21633354 4896 2015-10-29 PomBase SPCC970.04c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- mob2 mob2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPNCRNA.175 FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.175 SPNCRNA.175+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000181 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.175 FYPO:0009051 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.175 SPNCRNA.175+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000254 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.175 FYPO:0005261 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.175 SPNCRNA.175+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000289 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.175 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.175 SPNCRNA.175+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 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trz1 trz1-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000273) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0002581 unknown Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000265) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0002581 unknown Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000264) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0002586 unknown Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000265) PMID:23928301 4896 2013-09-06 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0002586 unknown Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0001036) PMID:23928301 4896 2013-09-06 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0002586 unknown Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-1 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000262) PMID:23928301 4896 2013-09-06 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000705 F4A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F4A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 1) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 F4A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F4A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 F4A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F4A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 F4A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F4A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPBC1105.02c FYPO:0001752 S165A Not assayed or wild type 972 h- lys4 lys4-S165A amino_acid_mutation ECO:0005801 medium PMID:19776021 4896 2016-10-31 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002019 501-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-500) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 low PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 G1087R,N1088P Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1-G1087R,N1088P amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 2) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000349 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 (Figure 3B, a-c) accumulation of presumptive post-Golgi secretory vesicles and abnormal Golgi-like structures were also characteristic of the ypt3-i5 mutants that we reported previously (Cheng et al., 2002). PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000349 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007588 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPBC947.02) PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 5) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002126 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:15047861 4896 2021-02-16 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002128 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002159 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005801 PMID:27974503 4896 2017-01-04 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000082 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 high PMID:19624755 4896 2021-01-04 Dapl2 and Dapm1 cells were more sensitive when exposed to 34 °C or to 5 mM VPA compared with those of Dapl4 and Daps1 cells PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002321 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2014-07-24 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0004572 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0006637 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. S10A) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0008258 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 In Dapm1 cells, in contrast, GFP-Ecm33 primarily localized as dot-like structures that were observed in the cytoplasm (Figure 6A, arrows) as well as at the cell surface and the division site (Figure 6A, arrowheads). PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007059 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 low assayed_using(PomBase:SPAP27G11.06c) PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 5) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003771 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003771 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003771 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.03) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003771 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003771 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001885 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 medium assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. 7A) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001355 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:27974503 4896 2017-01-04 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003279 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 (Figure 3B, a-c) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001130 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4G8.13c) PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000650 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000160,FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 (Fig. 6) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001494 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000160,FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:15047861 4896 2021-02-16 (Fig. 1) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 apm1 apm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000426 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000160,FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 When the cells were labeled with FM4-64 for 60 min, the Δapm1 cells were highly fragmented compared with wild-type cells, consistent with the findings obtained by (Figure 7B) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 apm1 apm1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007676 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000356 PMID:32320462 4896 2021-03-17 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0008374 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 7G) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0008374 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 7G) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000833 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1281.01) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000833 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000833 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.03) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000833 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0008373 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 7E) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0005114 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:31341193 4896 2019-08-01 (Fig. 1a-c) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0003658 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000216 high assayed_using(PomBase:SPBC16C6.06) PMID:31341193 4896 2019-08-01 (Fig. 1a-c) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000703 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAP27G11.06c),assayed_using(PomBase:SPCP1E11.06) PMID:19624755 4896 2021-01-04 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007678 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 PMID:32320462 4896 2021-03-17 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007589 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 Thus, GFP-Ecm33 localized at Golgi/endosome structures in addition to the cell surface and the division site in these mutants, suggesting that GPI-anchored proteins were not correctly transported and were retained at the Golgi/endosome structures in these membrane trafficking mutants PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0007589 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1E8.05) PMID:22848669 4896 2024-06-27 Similarly, in the wild-type cells, GFP-Gaz2 also clearly localized at the cell surface and medial regions (Figure 6C), while in Dapm1 cells, GFP-Gaz2 localized as intracellular dot-like structures (Figure 6C). PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0004325 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0004325 deletion 972 h- leu1-32 ura4-D18 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002720 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:15047861 4896 2021-02-16 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000079 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:27974503 4896 2017-01-04 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001190 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000106 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 high PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) All mutants exhibited a degree of sensitivity to hygromycin B that was alleviated by KCl, an indication of membrane hyperpolarization. PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002641 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001214 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 low PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) We found that apm1delta, gga22delta, and gga21delta gga22delta (denoted by ggadeltadelta in the Figure 8) were sensitive to both high concentrations of K+ salts and sorbitol (Figure 8), which showed that they were defective in growth under osmotic stress. PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001214 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high PMID:15047861 4896 2021-02-16 (Fig. 1) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000200 high PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000086 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000086 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 high PMID:19624755 4896 2021-01-04 (Fig. 2b) D-apl2 and D-apm1 cells was completely inhibited in the presence of FK506 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000086 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high PMID:15047861 4896 2021-02-16 (Fig. 1) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002546 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000115 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 high PMID:19624755 4896 2021-01-04 Dapl2 and Dapm1 cells were more sensitive when exposed to 34 °C or to 5 mM VPA compared with those of Dapl4 and Daps1 cells PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002788 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002258 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000160,FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 When the cells were labeled with FM4-64 for 60 min, the Δapm1 cells were highly fragmented compared with wild-type cells, consistent with the findings obtained by (Figure 7B) PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm1 apm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- apm1 apm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:15047861 4896 2021-02-16 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0003267 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. S5B) PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0001686 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0000964 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0003702 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. S5A) PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 plt1 plt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- plt1 plt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC3B8.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 plt1 plt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo2 spo2-B1 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC16C6.14 FYPO:0000478 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo2 spo2-B1 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002561 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0004355 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC926.03) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002559 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0005212 431-481 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1delta431-481 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18378776 4896 2016-07-27 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPBP23A10.17 SPBP23A10.17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP23A10.17 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- 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assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003165 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003585 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0001324 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0001324 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0002768 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003592 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:23442800 4896 2014-07-24 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003592 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:23442800 4896 2014-07-24 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0001327 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0002061 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0000324 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003594 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:23442800 4896 2014-07-24 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003594 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:23442800 4896 2014-07-24 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0003570 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23442800 4896 2014-07-24 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0000833 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPCC1259.15c FYPO:0002060 P93L Not assayed or wild type 972 h- ubc11 ubc11-P93L ubc11-P39L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23442800 4896 2014-07-23 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 E94EGVPHE Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K11 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0006606 119-282 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaSTR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-07-15 increased lateral diffusion in membrane. Finally, Wsc1DWSC-GFP and Wsc1DSTR-GFP, which are incapable of clustering, exhibited much smaller half-times—closer to that of mCherry-Psy1 (Figures 6A, 6B, and S6A). PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008004 119-282 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaSTR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 In sharp contrast, Wsc1DSTR-GFP, Wsc1DWSC-GFP and Wsc1DSTRDWSC-GFP cells were completely devoid of any clustering phenotype, with an enrichment at contacts close to $2 (Figures 5D, 5E, and S2F-S2H). PomBase SPBC30B4.01c FYPO:0008012 119-282 Not assayed or wild type 972 h- wsc1 wsc1deltaSTR partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:34666001 4896 2022-06-30 PomBase SPCC330.05c FYPO:0001012 D227N Not assayed or wild type 972 h- ura4 ura4-294 ura4-ntG679A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000233 complete high PMID:38440330 4896 2024-03-13 PomBase SPCC330.05c FYPO:0002864 D227N Not assayed or wild type 972 h- ura4 ura4-294 ura4-ntG679A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000370 high PMID:38440330 4896 2024-03-20 PomBase SPBC776.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec2302 sec2302delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC776.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 sec2302 sec2302delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC776.04 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph sec2302 sec2302delta deletion ECO:0005638 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L289S Not assayed or wild type 972 h- mam2 mam2-L289S amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:15580593 4896 2015-04-16 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000705 F17R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17R amino_acid_mutation ECO:0000325 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 2C) PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 F17R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 3E) PomBase SPBC1348.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1348.08c SPBC1348.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1348.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1348.08c SPBC1348.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1348.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1348.08c SPBC1348.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001972 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000113,FYECO:0000207 high PMID:27974503 4896 2016-12-21 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000443 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPAC6G9.12) PMID:27974503 4896 2016-12-22 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0008376 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000459 50 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 4C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0008376 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000025 30 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 4C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0008376 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000460 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 4C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001082 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000059 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0004468 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 60 high assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 3A) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0004468 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 70 high assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 3B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0004468 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 40 assayed_protein(PomBase:SPAC1F3.02c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 3C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001586 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC839.06) PMID:34349749 4896 2024-12-14 in the WT about 10% of the cells exhibited asymmetrical and subapical Cta3 distribution, while this percentage was over 50% in the mutant (lower right panel in Figure 4F). PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0003771 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001885 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 low assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-01-28 (Fig. 1B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001084 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000059 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0008375 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 medium PMID:39540318 4896 2025-02-10 (Fig. S8B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000539 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.10c) PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005168 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPCC645.07) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 3A) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005168 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 3B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005168 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC1F3.02c) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. 3C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005168 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S5C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005168 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC16.01) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S4D) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005168 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC1685.01) PMID:39540318 4896 2025-02-06 (Fig. S1C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0003627 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC16.01) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S4B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0003627 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-01-29 (Fig. S5) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0003627 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPAC16.01) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S4B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0003627 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000207 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S5) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001357 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 bch1 bch1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000106 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 erg51 exhibited a sensitivity to K+ salts and hygromycin B, that was milder than that of exomer mutants, was slightly more sensitive to CaCl2, and grew well on sorbitol (Figure 7A) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0001214 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 medium PMID:34349749 4896 2024-12-14 we analyzed the growth of prototrophic WT and bch1delta strains on YES plates with 0.6 M KCl. We found that the mutant was sensitive under these conditions (Figure 1C). | Figure 5C PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0007717 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 5C) PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000271 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000207 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph bch1 bch1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC31F10.16 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bch1 bch1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC57A7.05 SPAC57A7.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0001168 E1126Q Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-3B amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(GO:0030892) PMID:26687354 4896 2016-07-08 (Figure 3B) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0005557 E1126Q Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-3B amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:26687354 4896 2016-07-08 (Figure 3B) PomBase SPAC589.08c FYPO:0001164 S143D Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0005720 S143D Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPAC589.08c FYPO:0000069 S143D Not assayed or wild type 972 h- dam1 dam1-S143D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPCC18.09c FYPO:0002493 H138A Not assayed or wild type 972 h- hnt3 hnt3-H138A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:21984210 4896 2013-08-12 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fas2 fas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0002251 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fas2 fas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- fas2 fas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fas2 fas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- fas2 fas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:8769419 4896 2014-12-15 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- fas2 fas2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8769419 4896 2014-12-15 PomBase SPAC4A8.11c FYPO:0000284 deletion 972 h- fas2 fas2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:8769419 4896 2014-12-15 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0000753 E375A Not assayed or wild type 972 h- pcs2 pcs2-E375A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:12905027 4896 2012-02-23 PomBase SPAC3H1.10 FYPO:0000096 E375A Not assayed or wild type 972 h- pcs2 pcs2-E375A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:12905027 4896 2012-01-09 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002737 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 2A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001118 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 2A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000229 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 8.4 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 2A and B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC18H10.02) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPBP4H10.11c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC22A12.06c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC4A8.11c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1450.16c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC18H10.02) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4H10.11c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC22A12.06c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.02) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004880 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC4A8.11c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3C and D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005187 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC869.10c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005187 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007505 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPCC736.08),assayed_region(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3F and G) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007505 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPCC736.08),assayed_region(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 3F and G) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007505 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPCC736.08),assayed_region(PomBase:SPBC18H10.02) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 3F and G) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007505 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC736.08),assayed_region(PomBase:SPBP4H10.11c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007505 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC736.08),assayed_region(PomBase:SPAC22A12.06c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007505 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC736.08),assayed_region(PomBase:SPCC1450.16c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001117 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001117 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAPB15E9.01c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001355 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. S1) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001403 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 1A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 high assayed_transcript(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low assayed_transcript(PomBase:SPAC869.10c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 high assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005995 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 5) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC1786.01c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC926.09c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low assayed_transcript(PomBase:SPAC4A8.11c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.13) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPCC1742.01) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002552 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 3A and B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000085 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000314 high PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000091 R318H Not assayed or wild type 972 h- cbf11 cbf11(DBM) amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. S3) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004069 M244E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-M244E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0008061 M244E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-M244E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0006822 unknown Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-8 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:672898 4896 2013-07-16 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0003013 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000164 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:26776521 4896 2016-03-01 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001971 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-27 (Figure S2A-B) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001018 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 50 PMID:23093943 4896 2021-03-26 (Fig. 4c,6a) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0005289 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:36287824 4896 2024-11-04 This result suggests that rings either slid off the center of the cell after assembly or assembled off center in ∆imp2 cells (Figure 1B). PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000134 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000082 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:26776521 4896 2016-03-01 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002699 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36287824 4896 2024-11-08 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001365 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:36287824 4896 2024-11-04 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0003776 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102 PMID:23093943 4896 2021-03-26 Cells lacking Fic1 or its interacting partners Cyk3 or Imp2 were significantly more invasive than wild-type cells (Figure 9A-9B). PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001252 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure S2A-C) PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002028 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007579 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:15517003 4896 2020-12-30 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001315 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 PMID:19139265 4896 2012-11-13 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 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SPBC11C11.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- imp2 imp2delta deletion ECO:0005638 PMID:21885283 4896 2017-10-31 Table I PomBase SPBC11C11.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 imp2 imp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.04c FYPO:0003213 Nak1-Mor2 fusion protein Ectopic 972 h- mor2 nak1-mor2 fusion_or_chimera ECO:0005638 25 PMID:34523683 4896 2025-03-07 (Fig. 7) PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0001253 mcs6::ura4 Null 972 h- mcs6 mcs6::ura4+ disruption ECO:0001232 medium PMID:8557036 4896 2014-12-03 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002904 mcs6::ura4 Null 972 h- mcs6 mcs6::ura4+ disruption ECO:0001232 medium PMID:8557036 4896 2014-12-03 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002061 mcs6::ura4 Null 972 h- mcs6 mcs6::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:8557036 4896 2014-12-03 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0000082 L780LPVGVP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-54 amino_acid_insertion ECO:0005638 high PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC23E6.07c FYPO:0002060 L780LPVGVP Not assayed or wild type 972 h- rfc1 rfc1-54 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC3H7.15 FYPO:0002967 R71Y,W72Y Not assayed or wild type 972 h- hhp1 hhp1-R71Y,W72Y amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC3H7.15) PMID:29742018 4896 2018-07-12 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 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SPBC19G7.17 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.17 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ssh1 ssh1delta deletion ECO:0005638 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002485 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC227.18),assayed_using(PomBase:SPAC22G7.06c) PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0002485 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.06c),assayed_using(PomBase:SPAC56F8.10) PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0003179 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0000485 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0005638 PMID:7586030 4896 2013-10-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0004058 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0000049 PMID:28469148 4896 2019-02-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0000969 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0005638 PMID:7586030 4896 2013-10-21 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0000957 deletes aa 691-791 and adds IVVIMGGMLE at C-terminus Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10-155::LEU2 rec10-155 disruption ECO:0005638 PMID:7586030 4896 2013-10-21 PomBase SPCC569.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.09 SPCC569.09delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.09 SPCC569.09delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC29B12.01 FYPO:0002386 K873A Not assayed or wild type 972 h- ino80 ino80-K873A amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-23 Specifically, we assessed TF localization in cells lacking the RSC subunit Rsc1, the SWI/SNF ATP-dependent chromatin remodeler Snf22 and/or bearing a mutation in the ATPase domain of Ino80 (i.e., ino80K873A). In all cases, we observed that Php3 and Moc3 binding to cenH and dh regions were only marginally reduced but nevertheless not abolished (Supplementary Fig. 4f–i). PomBase SPAC29B12.01 FYPO:0002386 K873A Not assayed or wild type 972 h- ino80 ino80-K873A amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 Specifically, we assessed TF localization in cells lacking the RSC subunit Rsc1, the SWI/SNF ATP-dependent chromatin remodeler Snf22 and/or bearing a mutation in the ATPase domain of Ino80 (i.e., ino80K873A). In all cases, we observed that Php3 and Moc3 binding to cenH and dh regions were only marginally reduced but nevertheless not abolished (Supplementary Fig. 4f–i). PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0003858 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP cul4 cul4+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:18769921 4896 2016-09-29 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000267 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:18769921 4896 2016-09-29 PomBase SPBC1921.02 FYPO:0000089 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad60 rad60-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:18769921 4896 2016-09-29 PomBase SPBC776.09 FYPO:0003345 Q130* Not assayed or wild type 972 h- ste13 ste13-N50 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:8078473 4896 2014-05-02 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006658 CTD-Y1F,S2A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-Y1F-S2A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 1) PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0000705 877-900 Knockdown 972 h- sre1 sre1(1-876) partial_amino_acid_deletion ECO:0000325 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.15c) PMID:27811944 4896 2018-01-19 deletion of Sre1 aa 877-900 also destabilized Sre1 and prevented proteolytic activation PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001245 877-900 Knockdown 972 h- sre1 sre1(1-876) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:27811944 4896 2018-02-02 PomBase SPCC320.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mde7 mde7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mde7 mde7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC320.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mde7 mde7delta deletion ECO:0005638 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Further observation of the germinating spores showed that the mutated h90 cells elongated and eventually divided, but never formed visible colonies (data not shown). 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2017-08-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001885 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001885 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Figure 4A) PomBase SPBC409.07c FYPO:0001885 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:12080074 4896 2014-12-05 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002304 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:10749922 4896 2017-08-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002700 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0005801 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SPBC409.07c FYPO:0001310 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:20075862 4896 2016-07-07 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002516 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:20974849 4896 2024-04-17 (Fig. 3A) PomBase SPBC409.07c FYPO:0000073 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001103 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000852 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:15870269 4896 2017-09-18 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000852 S469D,T473D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD 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or wild type 972 h- dcr1 dcr1-Y1348A,N1344A,S1349A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.13c) PMID:21847092 4896 2013-08-29 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002553 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000059 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003088 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000226 PMID:24806966 4896 2014-06-11 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0006087 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000226 PMID:28475874 4896 2017-06-30 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0006686 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0006687 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000231 high PMID:21931565 4896 2018-09-18 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0006920 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28586299 4896 2019-06-04 (Figure 4A) decreased frequency of deletions and gene conversions at direct repeat recombination reporter PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0006318 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29215009 4896 2018-01-10 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000185 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003913 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003913 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003913 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-21 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0005388 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:12861005 4896 2016-05-04 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003589 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000049 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ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000969 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003906 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001690 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001690 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001690 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001690 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001164 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 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Fig. 2B. Table 1 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0007533 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-08 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3H) PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000725 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3H) PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 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FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:17277362 4896 2016-03-31 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 low PMID:15485922 4896 2016-05-17 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0005455 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0000337 PMID:17724078 4896 2016-06-24 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003612 deletion 972 h- h90 exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 The h90 exo1D mutant is viable. Fig. 2B. Table 1 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Pdelta17 exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Msmt0 exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo1 exo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- exo1 exo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-11-03 PomBase SPBC29A10.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo1 exo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4D7.08c FYPO:0000741 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade4 min13-32 unknown ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000178,FYECO:0000192 is_bearer_of(PATO:0000323) PMID:499806 4896 2016-06-30 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 N328A Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A5 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 N328A Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A5 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 N328A Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0000705 1,123-628 Not assayed or wild type 972 h- tea2 tea2(2-122) T2Nte|tea2-Nte partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15),assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15665379 4896 2016-09-27 (Fig. 2) PomBase SPBC776.13 FYPO:0001122 N914Y Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-N914Y amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000085 N914Y Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-N914Y amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000088 N914Y Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1-N914Y amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25764183 4896 2019-05-17 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0000174 unknown Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1- unknown ECO:0001232 PMID:12673626 4896 2022-09-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001035 unknown Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1- unknown ECO:0001232 PMID:12673626 4896 2022-09-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0001120 unknown Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1- unknown ECO:0001232 PMID:12673626 4896 2022-09-18 PomBase SPCC1281.01 FYPO:0007230 unknown Not assayed or wild type 972 h- ags1 mok1- unknown ECO:0001232 PMID:12673626 4896 2022-09-18 PomBase SPBC336.04 FYPO:0000705 C1058S Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-C1058S C1056S amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:15173383 4896 2015-06-08 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002061 C1058S Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-C1058S C1056S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:15173383 4896 2015-06-08 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002061 C1058S Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-C1058S C1056S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:15173383 4896 2015-06-08 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002061 C1058S Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-C1058S C1056S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:15173383 4896 2015-06-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0005301 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000291 PMID:26697368 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004490 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000291 PMID:26697368 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001130 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004571 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPBC106.02c) PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0005638 PMID:8557039 4896 2015-01-08 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001485 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:28652406 4896 2020-04-06 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- atf1 atf1+ wild_type ECO:0001232 PMID:24728197 4896 2016-02-29 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001401 S3A,S24A,S31A,T55A,T64A,S67A,S97A,S136A,T214A Overexpression 972 h- pxl1 pxl1-9A-(Cdk1-non-phosphorylatable) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:34133210 4896 2021-07-07 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0005543 S3A,S24A,S31A,T55A,T64A,S67A,S97A,S136A,T214A Overexpression 972 h- pxl1 pxl1-9A-(Cdk1-non-phosphorylatable) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34133210 4896 2021-07-11 Constriction took longer in pxl1(9A) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000836 S3A,S24A,S31A,T55A,T64A,S67A,S97A,S136A,T214A Overexpression 972 h- pxl1 pxl1-9A-(Cdk1-non-phosphorylatable) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:34133210 4896 2021-07-07 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0007829 S3A,S24A,S31A,T55A,T64A,S67A,S97A,S136A,T214A Overexpression 972 h- pxl1 pxl1-9A-(Cdk1-non-phosphorylatable) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34133210 4896 2021-07-07 (Figure 4, A and B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003486 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC644.14c) PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 5) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002340 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4F) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170 10 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2A and B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170,FYECO:0000211 30 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2C and D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000170,FYECO:0000464 30 medium PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2C and D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 P103L Not assayed or wild type 972 h- cdc10-ts htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 10 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2I) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 P103L Not assayed or wild type 972 h- cdc10-ts htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000211,FYECO:0000291 15 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2J) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005159 P103L Not assayed or wild type 972 h- cdc10-ts htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291,FYECO:0000464 25 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 2J) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003912 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000049 65 PMID:38718864 4896 2025-07-08 HR frequency goes from 20% in WT to 7% in mutant (Fig. 7I) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005608 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000226 medium PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8I-N) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007386 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007386 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8A-H) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005677 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000211 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4F) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4G) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4H) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001355 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007881 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000464 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000972 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000464 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002475 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.09) PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 6A-D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000964 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000084 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003670 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 P103L Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102L amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC737.08 FYPO:0004300 F1093L Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-F1093L amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:27667686 4896 2018-11-29 PomBase SPCC737.08 FYPO:0006781 F1093L Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-F1093L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-12-03 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K87Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K87Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K87Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K87Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0001042 deletion 972 h- tnr3 tnr3delta deletion ECO:0001232 PMID:7499352 4896 2012-05-16 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tnr3 tnr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- tnr3 tnr3delta deletion ECO:0005638 PMID:7499352 4896 2015-02-09 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- tnr3 tnr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tnr3 tnr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.09c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC354.09c FYPO:0001986 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tre1 tre1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPBC354.09c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0005253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC354.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- tre1 tre1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC354.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- tre1 tre1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC354.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tre1 tre1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tre1 tre1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000146 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000156 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000169 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0007334 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 Overexpression of Rhp6 abrogates silencing of the otr1::ura4+ reporter, resulting in the loss of cell viability on medium supplemented with FOA (Fig. 3A) PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0003096 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0006030 medium PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0003571 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0006030 high PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0003572 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0006030 medium PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000883 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0006599 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:17363370 4896 2021-09-13 Interestingly, levels of trimethylated H3K9 (H3K9me3) were significantly reduced, although the levels of monomethylated H3K9 (H3K9me1) were increased at the dg repeat element and otr1::ura4+ (Fig. 3B). PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0005063 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0006030 PMID:12417737 4896 2015-11-26 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0005062 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0006030 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0007844 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 Interestingly, levels of trimethylated H3K9 (H3K9me3) were significantly reduced, although the levels of monomethylated H3K9 (H3K9me1) were increased at the dg repeat element and otr1::ura4+ (Fig. 3B). PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0001840 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0004237 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Fig. 5D) PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0007843 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (supplemental Fig. 2) PomBase SPAC18B11.07c FYPO:0000091 wild type Overexpression 972 h- rhp6 rhp6+ wild_type ECO:0000049 PMID:12417737 4896 2015-11-12 PomBase SPCC553.06 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swp1 swp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC553.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swp1 swp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC553.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- swp1 swp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC553.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 swp1 swp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000141 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:26446992 4896 2015-10-29 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000229 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 2 PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 6B) PomBase SPCC645.04 FYPO:0003165 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 4 PMID:38780300 4896 2024-09-06 (Fig. 6B) PomBase SPCC645.04 FYPO:0003165 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26446992 4896 2015-11-17 PomBase SPCC645.04 FYPO:0005018 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0001807 high assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPCC645.04 FYPO:0002385 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPCC645.04 FYPO:0001919 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0001232 2.6 PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000085 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000102 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000088 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 3) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000088 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000089 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000211 high PMID:36793083 4896 2023-03-06 (Fig. 3) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000089 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26446992 4896 2015-10-29 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000268 R254E Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-R254E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26446992 4896 2015-10-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0001309 deletion 972 h- gcv1 gcv1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC31G5.14 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph gcv1 gcv1delta deletion 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PomBase SPBC776.01 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rpl29 rpl29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.01 FYPO:0007808 deletion 972 h- rpl29 rpl29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC776.01 FYPO:0007808 deletion 972 h- rpl29 rpl29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC776.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rpl29 rpl29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl29 rpl29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl29 rpl29delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl29 rpl29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC776.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl29 rpl29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl29 rpl29delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 Fus1 chimera with the IDR replaced by an oligomerization-promoting mutant of the light-sensitive domain of A. thaliana CRYPTOCHROME 2 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-CRY2(olig)-fus1(792-1372) fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000462 high PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4C) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 Fus1 chimera with the IDR replaced by an oligomerization-promoting mutant of the light-sensitive domain of A. thaliana CRYPTOCHROME 2 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-CRY2(olig)-fus1(792-1372) fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000463 medium PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4C) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007096 Fus1 chimera with the IDR replaced by an oligomerization-promoting mutant of the light-sensitive domain of A. thaliana CRYPTOCHROME 2 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-CRY2(olig)-fus1(792-1372) fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000463 high high assayed_protein(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4H) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007096 Fus1 chimera with the IDR replaced by an oligomerization-promoting mutant of the light-sensitive domain of A. thaliana CRYPTOCHROME 2 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-CRY2(olig)-fus1(792-1372) fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000463 high high assayed_protein(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4I) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0007095 Fus1 chimera with the IDR replaced by an oligomerization-promoting mutant of the light-sensitive domain of A. thaliana CRYPTOCHROME 2 Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(1-491)-CRY2(olig)-fus1(792-1372) fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000463 high high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 4D) PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 F292A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-F292A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0002151 F292A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-F292A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:33836577 4896 2021-06-09 (Figure 3D) PomBase SPCC338.08 FYPO:0000085 F292A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-F292A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000314 high PMID:33836577 4896 2021-06-09 (Figure 3C) PomBase SPAC57A7.04c FYPO:0001490 wild type Overexpression 972 h- pabp pabp+ wild_type ECO:0001232 complete PMID:12237855 4896 2014-02-20 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001880 R58A,R59A Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2-R58A,R59A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0003209 R58A,R59A Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2-R58A,R59A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Spa2(R58A, R59A)–GFP formed puncta and did not localize to the PM (Fig. 2D). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000835 R58A,R59A Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2-R58A,R59A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-12-23 PomBase SPAC30.03c FYPO:0004291 R86G Not assayed or wild type 972 h- tsn1 tsn1-R86G tsn1-R102G amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC30.03c) PMID:20081200 4896 2015-01-13 PomBase SPAC30.03c FYPO:0004289 R86G Not assayed or wild type 972 h- tsn1 tsn1-R86G tsn1-R102G amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC30.03c) PMID:20081200 4896 2015-01-13 PomBase SPAC23C4.13 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bet1 bet1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.13 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bet1 bet1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- bet1 bet1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C4.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bet1 bet1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1459 FYPO:0006548 deletion 972 h- nam1 nam1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:32415063 4896 2024-01-22 (Fig. 1b), similar to the effect observed upon deletion of the lncRNA (Supplementary Fig. 1b)6,7,11. PomBase SPNCRNA.1459 FYPO:0006548 deletion 972 h- nam1 nam1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 (Fig. 1b), similar to the effect observed upon deletion of the lncRNA (Supplementary Fig. 1b)6,7,11. PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006893 386-920,N335A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)N335A asp1-(1-385)N335A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001327 386-920,N335A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)N335A asp1-(1-385)N335A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 low assayed_protein(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35536002 4896 2022-10-19 (Fig. 8) PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0003779 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 medium medium PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0007546 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0007546 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 high high PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0005721 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 31 PMID:36695178 4896 2023-03-05 Severe buckling of the mitotic spindle was observed in 31% of cells, resulting in bowshaped nuclear intermediates during anaphase (Fig. 4D). It took longer for these nuclei to divide, and they often formed daughter nuclei of unequal sizes (Fig. S4E) PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000229 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000252 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000137 low PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000252 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000126 high high PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0001489 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 medium PMID:36695178 4896 2023-03-02 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0006716 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 PMID:36695178 4896 2023-03-05 Severe buckling of the mitotic spindle was observed in 31% of cells, resulting in bowshaped nuclear intermediates during anaphase (Fig. 4D). It took longer for these nuclei to divide, and they often formed daughter nuclei of unequal sizes (Fig. S4E) PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ptp4 ptp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ptp4 ptp4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snf21 snf21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0003738 deletion 972 h- snf21 snf21delta deletion ECO:0001232 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0002262 deletion 972 h- snf21 snf21delta deletion ECO:0001232 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0002411 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snf21 snf21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- snf21 snf21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snf21 snf21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- snf21 snf21delta deletion ECO:0005638 PMID:19168987 4896 2016-03-02 PomBase SPAC1250.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- snf21 snf21delta deletion ECO:0005638 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPAC1556.05c FYPO:0008435 deletion 972 h- cgr1 cgr1delta deletion ECO:0000059 high PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S4E) PomBase SPAC1556.05c FYPO:0000031 deletion 972 h- cgr1 cgr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAC1556.05c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cgr1 cgr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 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ecm33 ecm33-fgtC partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 (Figure 3C) The immunoblot analysis detected an appreciable amount of Ecm33 fragments A, C, F, G, and I PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000705 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002702 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000102 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0004604 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003803 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0001038 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003107 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:25330395 4896 2014-11-09 Tpz1-L439R,L445R disrupts interaction with Ccq1 but retain interactions with Pot1 and Poz1 based on co-IP experiments. PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003106 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000102 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0001492 Y439R,L445R Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-Y439R,L445R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25330395 4896 2015-05-21 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0000705 DPLD303AAAA Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-AAAA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003244 DPLD303AAAA Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-AAAA amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:22064476 4896 2014-08-19 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0002061 DPLD303AAAA Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-AAAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0000703 DPLD303AAAA Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-AAAA 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Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPBC11G11.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph end3 end3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.02c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph end3 end3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.02c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph end3 end3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph end3 end3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph end3 end3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC11G11.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph end3 end3delta deletion ECO:0005638 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Only particular splicing mutants affected silencing. Silencing of a centromeric cen1:ade6+ marker gene (Fig. 1A) remained intact in the presence of prp1 (Prp6Sc/Hs), prp2 (U2AFHs), prp3 (Prp3Sc/PRPF3Hs), or prp4 (PRPF4BHs) mutations PomBase SPBC4.04c FYPO:0001388 disruption Null 972 h- mcm2 mcm2delta::his3+ cdc19delta::his3+ disruption ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000614 disruption Null 972 h- mcm2 mcm2delta::his3+ cdc19delta::his3+ disruption ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001385 disruption Null 972 h- mcm2 mcm2delta::his3+ cdc19delta::his3+ disruption ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0004142 C70A,C76A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-C70A,C76A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(SO:0001851) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000825 C70A,C76A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-C70A,C76A amino_acid_mutation 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mim1delta tom13delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC713.08 FYPO:0000470 deletion 972 h- mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC713.08 FYPO:0007596 deletion 972 h- mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-08 Consistent with this, mitophagy was impaired in the mim1D and mim2D mutants (Figure 5D) PomBase SPBC713.08 FYPO:0007038 deletion 972 h- mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-08 In the absence of Mim1 or Mim2, the GFP-Atg43 signal at the mitochondria was severely decreased (Figure 5C) PomBase SPBC713.08 FYPO:0007038 deletion 972 h- mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.12) PMID:33138913 4896 2021-01-11 We confirmed that Mim1 and Mim2 are required for stable localization of Tom70 on mitochondria in fission yeast (Figure 5—Figure supplement 1H PomBase SPBC713.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0005638 PMID:33138913 4896 2021-01-08 (Figure 5, Figure supplement 1F) PomBase SPBC713.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.08 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.08 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.08 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph mim1 mim1delta tom13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 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depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. 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2012-01-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0004422 1206-1324 Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC146.03c) PMID:25520186 4896 2015-07-29 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0006822 1-276 Overexpression 972 h- shk1 shk1-deltaN276 pak1-deltaN|shk1-FN-Pak1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPBC1604.14c FYPO:0002060 1-276 Overexpression 972 h- shk1 shk1-deltaN276 pak1-deltaN|shk1-FN-Pak1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPBC660.15 FYPO:0003412 msi2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 msi2 msi2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC557.03c FYPO:0000255 unknown Not assayed or wild type 972 h- pim1 dcd1-ts dcd1ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPBC557.03c FYPO:0000255 unknown Not assayed or wild type 972 h- pim1 dcd1-ts dcd1ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:9585505 4896 2012-03-16 PomBase SPCC297.04c FYPO:0006858 N79A Not assayed or wild type 972 h- set7 set7-N79A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30773398 4896 2019-04-13 (Figure S2) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001645 P120A,P123A,P181A,P184A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-AxxA4,6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:35108037 4896 2022-02-14 Mutant reduced binding to Cdc15C1(aa600-end) compared to wild type Pxl1 (Figure S1A) PomBase SPBP4H10.13 FYPO:0001645 A9D Not assayed or wild type 972 h- rps2302 rps2302-A9D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPBP4H10.13) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPAC890.02c FYPO:0006396 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:16481403 4896 2018-02-12 PomBase SPAC890.02c FYPO:0005558 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:16481403 4896 2018-02-12 PomBase SPAC890.02c FYPO:0004317 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:16481403 4896 2018-02-12 PomBase SPAC890.02c FYPO:0005441 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 3B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0003186 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 3B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000941 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 3B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0006346 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:12951601 4896 2018-01-26 (Fig. 1a) PomBase SPAC890.02c FYPO:0006397 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:16481403 4896 2018-02-12 PomBase SPAC890.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0006195 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:16481403 4896 2018-02-12 (Fig. 1D) PomBase SPAC890.02c FYPO:0001514 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:17476213 4896 2012-09-14 PomBase SPAC890.02c FYPO:0003566 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 2) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002638 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 18 PMID:12951601 4896 2018-01-26 (Fig. 1c) cells 1 and 3 Furthermore, multiple Mad2 dots, which have never been seen in wild type cells PomBase SPAC890.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 alp7 alp7delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC890.02c FYPO:0007110 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 PMID:23770679 4896 2019-10-15 (Fig. 4c) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000324 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:24937146 4896 2014-07-11 PomBase SPAC890.02c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 alp7 alp7delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC890.02c FYPO:0004328 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:17032733 4896 2015-01-21 PomBase SPAC890.02c FYPO:0005709 deletion 972 h- alp7 alp7delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC2G2.14) PMID:25057016 4896 2023-07-21 (Fig. 3) PomBase SPAC890.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph alp7 alp7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC890.02c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- 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prototroph pof4 pof4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pof4 pof4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A3.08 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 pof4 pof4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC29A3.08 FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof4 pof4delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC825.05c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC29A3.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pof4 pof4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC29A3.08 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pof4 pof4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 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clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005847 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 6B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003573 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0002386 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:11283354 4896 2019-03-03 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000581 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000487 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8001791 4896 2013-11-18 PomBase SPBC428.08c FYPO:0008236 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 7A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000943 G486D Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-G486D clr4-681 amino_acid_mutation ECO:0001232 35 PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPBC83.03c FYPO:0005929 422-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3deltaTAM partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:19394293 4896 2023-03-01 PomBase SPBC83.03c FYPO:0003411 422-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3deltaTAM partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3) tas3-TAM Mutations Cause a Dramatic Loss of ura4+ Silencing at imr1 but Only a Modest Loss at otr1 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004205 422-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3deltaTAM partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:19394293 4896 2023-03-01 To determine the effect of tas3-TAM mutations on cen siRNAs levels, we performed northern blot analysis on RNAs isolated from wild-type, tas3D, and tas3-TAM mutant cells. We found a dramatic reduction in the levels of both total (Figure 4C) and Ago1-purified (Figure 4D) cen siRNAs in all tas3-TAM mutants compared to wild-type. PomBase SPBC83.03c FYPO:0004083 422-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3deltaTAM partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3C) PomBase SPBC83.03c FYPO:0008073 422-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3deltaTAM partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:19394293 4896 2023-03-01 We found that mutant proteins coimmunoprecipitated with Chp1 and FLAG-Ago1 with similar efficiency as the wild-type protein (Figures 4A and 4B, compare lane 1 with lanes 2-5). This result demonstrates that RITS complex formation is not affected in tas3-TAM mutants and that theCterminus of Tas3 is not involved in Chp1 or Ago1 binding (also shown in Partridge et al. [2007]). PomBase SPBC83.03c FYPO:0008072 422-549 Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3deltaTAM partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:19394293 4896 2023-03-01 Surprisingly, we found no defect in H3K9me in tas3DTAM compared to wild-type cells at native centromeric repeats (dg1, imr1, imr2-1, or imr2-2) or the ura4+ inserts (for imr1R::ura4+ PomBase SPAC4A8.12c FYPO:0002060 E142P Not assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-E142P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPCC338.07c FYPO:0000705 F449A Not assayed or wild type 972 h- naa15 naa15-F449A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC15E1.08),assayed_using(PomBase:SPCC338.07c) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPBC1921.07c FYPO:0006450 T202A,Y205V Not assayed or wild type 972 h- sgf29 sgf29-T202A,Y205V amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPAC1952.05) PMID:26401015 4896 2018-03-26 PomBase SPBC1921.07c FYPO:0006451 T202A,Y205V Not assayed or wild type 972 h- sgf29 sgf29-T202A,Y205V amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26401015 4896 2018-03-26 PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003055 (-925)-(-54) Null 972 h- sme2 sme2deltaC partial_nucleotide_deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPAC3A11.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- dpe1 dpe1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A11.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- dpe1 dpe1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A11.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- dpe1 dpe1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A11.10c FYPO:0009014 deletion 972 h- dpe1 dpe1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000414 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3A11.10c FYPO:0000441 deletion 972 h- dpe1 dpe1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase 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321-695,K60E,K67E,K78E,K82E,R144D,K148E,K167E,R181D,K194E Knockdown 972 h- rga7 rga7(1-320)-PIP2+core+tips amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:30840879 4896 2019-06-24 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000969 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000957 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001032 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 P103I Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102I amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPBC839.10 FYPO:0001355 CDS.usp107:natMX6:3UTR.usp107 Overexpression 972 h- usp107 usp107-DAmP fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPBC839.10 FYPO:0001355 CDS.usp107:natMX6:3UTR.usp107 Overexpression 972 h- usp107 usp107-DAmP fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPBC839.10 FYPO:0001357 CDS.usp107:natMX6:3UTR.usp107 Overexpression 972 h- usp107 usp107-DAmP fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:28446597 4896 2019-12-13 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000843 97-166 Not assayed or wild type 972 h- hva22 rop1delta97-166 rop1(1-97) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 5A) PomBase SPCC895.03c FYPO:0002113 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sua5 sua5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- sua5 sua5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC895.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sua5 sua5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC895.03c FYPO:0002273 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sua5 sua5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0002827 K15A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K14A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:31468675 4896 2019-09-25 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0002827 K15A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K14A amino_acid_mutation ECO:0000231 PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0007075 K15A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K14A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:31468675 4896 2019-10-03 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0002355 K15A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K14A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0004237 K15A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K14A amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_using(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:31468675 4896 2025-07-02 PomBase SPAC1834.04 FYPO:0004377 K15A Not assayed or wild type 972 h- hht1 hht1-K14A amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_using(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:31468675 4896 2019-10-02 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000080 CTD-S5A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2) rpb1-CTD-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-S5A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2) rpb1-CTD-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.02c),assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.03),assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2) rpb1-CTD-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 5B) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S5A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S5A(r2-r29-2) rpb1-CTD-S5.S5A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c),assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09),assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09),assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c),assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000848 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 PMID:7769002 4896 2013-01-28 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002262 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0005638 PMID:7769002 4896 2013-05-24 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9374539 4896 2014-03-20 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0005638 PMID:7642144 4896 2012-03-08 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0005638 PMID:7769002 4896 2013-04-23 PomBase SPAC31G5.13 FYPO:0002071 deletion 972 h- rpn11 rpn11delta sks1-delta|sks1delta deletion ECO:0001232 PMID:7769002 4896 2013-01-28 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste6 ste6delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0001152 deletion 972 h- ste6 ste6delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:8264618 4896 2020-01-21 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0002048 deletion 972 h- ste6 ste6delta deletion ECO:0001232 PMID:2038319 4896 2013-01-31 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0000280 deletion 972 h- ste6 ste6delta deletion ECO:0005638 PMID:2107403 4896 2013-02-14 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0000280 deletion 972 h- ste6 ste6delta deletion ECO:0005638 PMID:9133664 4896 2014-09-18 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- ste6 ste6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste6 ste6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ste6 ste6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0001645 V651R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-V651R amino_acid_mutation ECO:0000049 high assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPBC1778.02) PMID:21217703 4896 2023-02-16 An arginine substitution of Ile379 or Leu383 of Taz1 or Ile655 of SpRap1 at the center of the hydrophobic interface completely abolished the Taz1RBM-SpRap1RCT interaction (Fig. 6a). PomBase SPBC405.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ade1 ade1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC405.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ade1 ade1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A,F87A cut12.V85AF87A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1E) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A,F87A cut12.V85AF87A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-10-06 (Fig. 1C) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A,F87A cut12.V85AF87A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-06 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A,F87A cut12.V85AF87A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-06 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 V85A,F87A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A,F87A cut12.V85AF87A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-06 (Fig. 5B) PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001045 R323A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R323A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0006658 R323A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R323A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0000082 R323A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R323A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0004142 R323A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R323A-TAP amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(SO:0002216) PMID:30212894 4896 2018-10-29 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0002141 R323A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R323A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPBC27B12.11c FYPO:0001357 R323A Not assayed or wild type 972 h- pho7 pho7-R323A-TAP amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30212894 4896 2018-10-08 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0000175 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0000583 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0004894 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005801 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0002150 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0004893 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005801 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0003797 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0002161 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0004892 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0001075 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0003563 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0003798 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0001420 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0001420 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0001310 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0002177 disruption Null 972 h- bgs2 bgs2::his3 disruption ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001045 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 snf22∆ elicited a sevenfold hyper-repression of Pho1 expression in phosphate-replete cells compared to the wild-type control (Fig. 2B, P value <0.0001). PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001045 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 4C) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0006658 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000337,FYECO:0000438 PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 12) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000080 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0006357 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0005948 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 5) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 5) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000438 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 5) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.01) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.06c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC17D4.01) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.05) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC23G7.13c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAPB24D3.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1289.14) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC2E1P3.05c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.12c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC29B5.02c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.03c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC757.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1861.02) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.12c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1685.17) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.08c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB21E7.07) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB8B6.04c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC26H8.11c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC513.07) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB10D8.01) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCPB1C11.03) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC70.08c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC36.03c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC5H10.03) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000826 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC584.16c) PMID:38899862 4896 2024-07-15 (Fig. 7) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.01) PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001117 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0006355 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:28674280 4896 2018-02-08 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0008417 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000226 low PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S6) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0005005 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0002742 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC548.07c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.06) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.18) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC359.02) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.14) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.08) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1235.17) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB21E7.04c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.01) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC1739.08c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4H10.09) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC794.01c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.12c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBP4H10.10) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1A6.04c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC11D3.19) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC56F2.06) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC4H3.03c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.11c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC17A2.11) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001890 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.10c) PMID:38899862 4896 2024-07-22 (Fig. S3) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0002390 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0001232 PMID:32277274 4896 2020-04-27 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0001357 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38899862 4896 2024-07-15 snf22∆ cells grew similarly to wild-type cells on YES agar at all temperatures tested (Fig. 2A). PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000064 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000094 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000087 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 high PMID:37956308 4896 2024-02-21 Regarding tolerance to oxidative stress, cells lacking Hrp3 or Snf22 are severely sensitive to oxidative stress (Figure 6A) PomBase SPCC1620.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0006822 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:22624651 4896 2012-06-18 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snf22 snf22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- snf22 snf22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPCC1620.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snf22 snf22delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1795.07 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sws2 sws2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1795.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- sws2 sws2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1795.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sws2 sws2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oar2 oar2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.02 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oar2 oar2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- oar2 oar2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3G9.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oar2 oar2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001645 381-580 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(1-380) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. 6A) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 381-580 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(1-380) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 381-580 Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1(1-380) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPAC222.09 FYPO:0000082 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:34389684 4896 2022-01-13 PomBase SPAC222.09 FYPO:0003411 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000049 high PMID:24013500 4896 2024-06-10 A strain harboring a ura4+ reporter gene inserted into the innermost repeat (imr) region of centromere 1 displays reduced growth on 5-FOA when harboring the seb1-1 allele (Fig. 1C). I PomBase SPAC222.09 FYPO:0000877 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000226 medium PMID:24013500 4896 2024-06-20 To further test whether Seb1 functions in the same pathway as SHREC in promoting H3K9me, we compared H3K9me2 levels at dg and dh repeats of the seb1-1 clr3D double mutant with those of the corresponding single mutants. Significantly, the double and single mutants display very similar levels of H3K9me2, ;20%-30% of wild-type levels (Fig. 3B). PomBase SPAC222.09 FYPO:0000876 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000049 PMID:24013500 4896 2024-06-10 In the ectopic heterochromatic silencing reporter strain, the seb1-1 mutation causes an accumulation of the ura4+ transcript (Fig. 1D) and a strong defect in H3K9me2 at the ura4+ gene (Fig. 1E), supporting the growth defect observed using the 5-FOA assay. PomBase SPAC222.09 FYPO:0000835 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC222.09) PMID:24013500 4896 2024-06-20 Indeed, the level of Seb1 protein is lower in the seb1-1 mutant when compared with its level in the wild-type seb1+ strain (Supplemental Fig. S4) PomBase SPAC222.09 FYPO:0006599 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC800.03) PMID:24013500 4896 2024-06-20 We found that every subunit of SHREC tested (Clr3, Clr1, Mit1, and Chp2) is enriched at both dg and dh repeats. However, in the seb1-1 mutant, this enrichment is abolished or strongly reduced (Figs. 5A-D). PomBase SPAC222.09 FYPO:0006599 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.17) PMID:24013500 4896 2024-06-20 We found that every subunit of SHREC tested (Clr3, Clr1, Mit1, and Chp2) is enriched at both dg and dh repeats. However, in the seb1-1 mutant, this enrichment is abolished or strongly reduced (Figs. 5A-D). PomBase SPAC222.09 FYPO:0006599 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:24013500 4896 2024-06-20 We found that every subunit of SHREC tested (Clr3, Clr1, Mit1, and Chp2) is enriched at both dg and dh repeats. However, in the seb1-1 mutant, this enrichment is abolished or strongly reduced (Figs. 5A-D). PomBase SPAC222.09 FYPO:0006599 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:24013500 4896 2024-06-20 We found that every subunit of SHREC tested (Clr3, Clr1, Mit1, and Chp2) is enriched at both dg and dh repeats. However, in the seb1-1 mutant, this enrichment is abolished or strongly reduced (Figs. 5A-D). PomBase SPAC222.09 FYPO:0007307 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC222.09) PMID:24013500 4896 2024-06-20 Moreover, we found that the seb1-1 mutation increases Pol II occupancy and H3K14 acetylation levels at dg and dh repeats (Figs. 3D,E) PomBase SPAC222.09 FYPO:0000825 A45G,T132A,G226A,T1384C,T1450A,A1514G,A1760G Not assayed or wild type 972 h- seb1 seb1-1 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:29618061 4896 2024-01-24 We found accumulation of tgp1 in the seb1-1 mutant compared to wild-type (Supplementary Figure S3A, compare lanes 1 and 2). PomBase SPBC28F2.09 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 toa1 toa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- toa1 toa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC28F2.09 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 toa1 toa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002455 300-350,507-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-Nter-delta300-350 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 85 PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 2B) PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000117 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0002555 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 10 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:25411334 4896 2015-07-23 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rho4 rho4delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000674 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0001164 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000644 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC106.20) PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000783 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1235.10c) PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph rho4 rho4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16A10.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rho4 rho4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005781 R593A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-R593A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S4a) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005300 R593A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-R593A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S4A) PomBase SPBC146.11c FYPO:0002004 wild type Overexpression 972 h- mug97 mug97+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 1-630 Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-631-1045 GFP-Cdc11p(631–1045) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 GFP- Cdc11p(1- 630) was distributed throughout the cytoplasm (our unpublished results), but GFP-Cdc11p(631-1045) localized to SPBs (Figure 5A). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004742 311-407 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-deltaRRM deltaRRMchp1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:15743828 4896 2024-02-29 In contrast, cells lacking the RRM domain of Chp1 (ΔRRMchp1-6xmyc) exhibited no loss of Chp1 function. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0001509 311-407 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-deltaRRM deltaRRMchp1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:15743828 4896 2024-02-29 In contrast, cells lacking the RRM domain of Chp1 (ΔRRMchp1-6xmyc) exhibited no loss of Chp1 function. PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S265A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S265A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 S265A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S265A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002678 291-390 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-delta291-390 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000703 291-390 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-delta291-390 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC30D10.10c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000703 291-390 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-delta291-390 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c),assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000081 291-390 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-delta291-390 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:28264193 4896 2018-07-24 PomBase SPCC63.08c FYPO:0004159 L411* Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1-m14 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:26696398 4896 2016-05-20 PomBase SPCC63.08c FYPO:0002890 L411* Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1-m14 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:26696398 4896 2016-08-09 PomBase SPCC63.08c FYPO:0004670 L411* Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1-m14 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 PMID:26696398 4896 2016-08-08 PomBase SPCC63.08c FYPO:0002224 L411* Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1-m14 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:26696398 4896 2016-08-09 PomBase SPCC63.08c FYPO:0004993 L411* Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1-m14 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:26696398 4896 2016-08-08 PomBase SPBC26H8.03 FYPO:0004555 unknown Not assayed or wild type 972 h- cho2 cho2-339 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9755189 4896 2015-04-14 PomBase SPAC11E3.09 FYPO:0006822 wild type Overexpression 972 h- pyp3 pyp3+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:1464318 4896 2013-01-29 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0003354 deletion 972 h- gmh2 gmh2delta deletion ECO:0000059 PMID:21098516 4896 2014-05-12 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph gmh2 gmh2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- gmh2 gmh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gmh2 gmh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC5H10.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gmh2 gmh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC637.08 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nbp35 nbp35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC637.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- nbp35 nbp35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC637.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nbp35 nbp35delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003481 S758D,S760D,S761D,S762D Not assayed or wild type 972 h- cdr2 cdr2-4D amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPCPB16A4.03c FYPO:0003310 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade10 ade10-17 unknown ECO:0005801 PMID:24186301 4896 2014-04-17 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0001972 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 PMID:16291723 4896 2021-12-29 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0001972 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Fig. 5) PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0001972 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 low PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Fig. 5) PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0002557 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 PMID:25411334 4896 2015-07-23 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0006772 deletion 972 h- h90 spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0006062 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0000650 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 PMID:25724972 4896 2015-10-19 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0004807 deletion 972 h- h90 spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0003334 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.11) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0003334 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC821.06) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0003334 deletion 972 h- spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.11c) PMID:15385632 4896 2017-05-28 (Figure 6A, D, and E) PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0000590 deletion 972 h- h90 spn3 spn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:20123972 4896 2018-11-29 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph spn3 spn3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.01 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PomBase SPCC1672.06c FYPO:0002243 G762S Not assayed or wild type 972 h- asp1 asp1-G762S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33010152 4896 2022-11-29 (Fig. 4) PomBase SPCC550.13 FYPO:0000173 177-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta177-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000229 177-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta177-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0004921 177-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta177-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0001357 177-222 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-delta177-222 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 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or wild type 972 h- htb1 htb1-G52S amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 G53S Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-G52S amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-22 (Fig. 1A) PomBase SPSNRNA.04 FYPO:0002060 GAATA111ACGCG Not assayed or wild type 972 h- snu4 snu4-5 snu4.5 nucleotide_mutation ECO:0005638 PMID:1441744 4896 2014-06-19 PomBase SPCC794.12c FYPO:0001117 T(-88)G,A(-86)C,T(-85)A,T(-84)C,T(-83)C Not assayed or wild type 972 h- mae2 mae2-promoter(TATA) nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:10187772 4896 2014-06-06 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0007885 L7R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-L7R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_protein(PomBase:SPCC1840.10) PMID:33378677 4896 2021-11-17 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 L7R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-L7R amino_acid_mutation ECO:0006030 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We currently do not have a mechanistic explanation for this observation. PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0004203 deletion 972 h- ncs1 ncs1delta deletion ECO:0000335 PMID:20018864 4896 2014-12-15 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0000994 deletion 972 h- ncs1 ncs1delta deletion ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0001386 deletion 972 h- ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 PMID:14722091 4896 2011-09-21 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0001043 deletion 972 h- ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 PMID:14722091 4896 2017-11-23 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- ncs1 ncs1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 ncs1 ncs1delta 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1B) PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0001420 deletion 972 h- ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 PMID:14722091 4896 2011-09-22 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ncs1 ncs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18B11.04 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PMID:39601909 4896 2025-01-08 (Fig. 3) Tunicamycin exposure leads to apoptotic cell death and aberrant nuclear morphology. PomBase SPAC328.07c FYPO:0000368 deletion 972 h- bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:39601909 4896 2025-01-08 Interestingly, unlike wild type cells, the bsd1Δ cells showed punctate FM4-64 staining after tunicamycin exposure (Fig. 4), reminiscent of endosome like intermediate compartment previously has been reported in vps28 mutant cells that exhibit a defect in protein sorting process in budding yeast [34]. PomBase SPAC328.07c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0008365 deletion 972 h- bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39601909 4896 2025-01-08 Furthermore, we checked the growth of S. pombe cells in the presence of 2-deoxy-glucose and observed the concentration-dependent sensitivity of bsd1delta PomBase SPAC328.07c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC328.07c FYPO:0001491 deletion 972 h- bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC328.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- bsd1 bsd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC328.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- bsd1 bsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC328.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bsd1 bsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC328.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bsd1 bsd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.05c FYPO:0000183 G126D 972 h- dim1 dim1-35 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:21745468 4896 2012-02-08 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0006464 L445R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L445R amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:26088418 4896 2023-02-19 Indeed, yeast cells expressing the L431R and L445R mutants exhibited significant loss of function in telomere length regulation and showed long and highly heterogenous telomeres that were as severe as that in taz1Δ cells (Figure 1K) PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000705 L445R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L445R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26088418 4896 2023-02-19 PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0000658 L445R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L445R amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:26088418 4896 2023-02-19 The L445R mutation caused a 10-fold decrease in DNA binding with a Kd of ~7 μM (Figure 1I), suggesting that Taz1 homodimerization is PomBase SPAC16A10.07c FYPO:0004083 L445R Not assayed or wild type 972 h- taz1 taz1-L445R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC16A10.07c) PMID:26088418 4896 2023-02-19 Mutant proteins were expressed at a comparable level as wild-type Taz1 (data not shown). PomBase SPAC806.04c FYPO:0009007 deletion 972 h- duf8901 duf8901delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC806.04c FYPO:0003267 deletion 972 h- duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35314193 4896 2022-10-20 (Figure 12) PomBase SPAC806.04c FYPO:0002085 deletion 972 h- duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:35314193 4896 2022-10-20 (Figure 12) PomBase SPAC806.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0000725 deletion 972 h- duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC806.04c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0001034 deletion 972 h- duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000412 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC806.04c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 duf8901 duf8901delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC806.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- duf8901 duf8901delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC806.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 duf8901 duf8901delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC806.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 duf8901 duf8901delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0005965 deletion 972 h- pzh1 pzh1delta deletion ECO:0000335 PMID:10091581 4896 2017-03-27 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0005983 deletion 972 h- pzh1 pzh1delta deletion ECO:0000335 PMID:10091581 4896 2017-03-27 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0005963 deletion 972 h- pzh1 pzh1delta deletion ECO:0000335 PMID:10091581 4896 2017-03-27 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pzh1 pzh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- pzh1 pzh1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:9428701 4896 2017-03-28 PomBase SPAC57A7.08 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pzh1 pzh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 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2024-12-26 (Fig. S6A) PomBase SPCC338.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC338.11c FYPO:0000636 deletion 972 h- efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12442907 4896 2021-01-28 (Fig. 1b) The estimated doubling time of the mutant was 110 min in a rich (YE) medium, while that of the wild-type cells was 150 min. PomBase SPCC338.11c FYPO:0001046 deletion 972 h- efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12442907 4896 2021-01-28 (Fig. 1c) The mutant produced daughter cells with an average length of 6 μm; whereas, the wild-type cells averaged 7.5 μm PomBase SPCC338.11c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0009087 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Fig 1c The mutant produced daughter cells with an average length of 6 μm; whereas, the wild-type cells averaged 7.5 μm PomBase SPCC338.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- efm2 efm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC338.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efm2 efm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- efm2 efm2delta deletion ECO:0005638 PMID:12442907 4896 2021-01-28 PomBase SPCC338.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 efm2 efm2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000703 1-499,851-886 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-500-850 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC887.09c) PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPCC970.09 FYPO:0007676 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PomBase SPAC144.09c FYPO:0000655 292-343,C351A,C356A Not assayed or wild type 972 h- sfc2 sfc2-deltaS/F10C2A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC144.09c) PMID:12888341 4896 2021-01-02 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph vtc1 vtc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 vtc1 vtc1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph vtc1 vtc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph vtc1 vtc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- vtc1 vtc1delta deletion 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cdc13+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 low PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 wild type Knockdown 972 h- cdc2-33 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 low PMID:12419251 4896 2016-04-05 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 wild type Knockdown 972 h- ade6-704 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005580 PMID:19487461 4896 2018-05-15 (Fig. 5A) PomBase SPBC582.03 FYPO:0001425 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 PMID:8631306 4896 2014-06-11 PomBase SPBC582.03 FYPO:0006575 wild type Knockdown 972 h- ade6-704 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000059 PMID:19487461 4896 2018-05-15 section titled MBF-dependent gene expression...these cells undergo G1 transcription, a seemingly normal Sphase (no region specific amplifications) and can only reinitiate replication once size per genome is minimal size. PomBase SPBC582.03 FYPO:0004759 wild type Knockdown 972 h- pat1-as2 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000223 40 PMID:25891897 4896 2015-07-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001093 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:12972571 4896 2014-09-10 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003378 wild type Knockdown 972 h- pat1-as2 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000223 PMID:25891897 4896 2015-07-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003379 wild type Knockdown 972 h- pat1-as2 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000223 PMID:25891897 4896 2015-07-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000835 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 1C) PomBase SPBC582.03 FYPO:0003950 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:12419251 4896 2015-10-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001838 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 1C) PomBase SPBC582.03 FYPO:0001838 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c),residue(T314) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001838 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c),residue(S462) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC582.03 FYPO:0004189 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000170,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:12093738 4896 2017-11-13 (Fig. 1D) PomBase SPBC582.03 FYPO:0006291 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:17531813 4896 2017-11-19 The same experiment was repeated, but HU was added at the time of release, allowing cells to progress through mitosis and stall after initiation of DNA replication. In that case, Cdc2 tyrosine 15 phosphorylation reappeared after 100 min and increased further with time. Cig2 remained present at a high level, indicating that the Cdc2-Cig2 complex was inhibited (Figure 5B) PomBase SPBC582.03 FYPO:0004961 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 60 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:12419251 4896 2015-10-22 PomBase SPBC582.03 FYPO:0002096 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000170,FYECO:0000291 medium assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:12093738 4896 2017-11-13 (Fig. 1D) The protein cdc2 protein assayed is in complex with cig2 as there is no cdc2-cdc13 complex present PomBase SPBC582.03 FYPO:0002083 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 PMID:8631306 4896 2014-06-11 PomBase SPBC582.03 FYPO:0001221 wild type Knockdown 972 h- cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000106 PMID:17998401 4896 2012-07-16 PomBase SPBC582.03 FYPO:0000833 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:12093738 4896 2017-11-10 (Fig. 1C) PomBase SPBC582.03 FYPO:0004962 wild type Knockdown 972 h- cdc2-33 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000288 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:12419251 4896 2016-04-05 PomBase SPBC582.03 FYPO:0006290 wild type Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc13 cdc13+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000106,FYECO:0000170,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:17531813 4896 2017-11-10 (Fig. 5B) PomBase SPBC660.13c FYPO:0001355 R46E Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R46E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. S2) and text PomBase SPBC660.13c FYPO:0002060 R46E Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R46E amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. S2) and text PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0002725 H99R Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-H99R amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC23D3.08 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 usp108 usp108delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.08 FYPO:0002251 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 usp108 usp108delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- usp108 usp108delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23D3.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 usp108 usp108delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- usp108 usp108delta deletion ECO:0005638 PMID:17264129 4896 2014-08-13 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0006893 386-920,R293A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)R293A asp1-(1-385)R293A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC1672.06c) PMID:35536002 4896 2022-10-12 (Fig. 7) PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001327 386-920,R293A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1(1-385)R293A asp1-(1-385)R293A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 low assayed_protein(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35536002 4896 2022-10-19 (Fig. 8) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0007496 CU329671.1:g.33962T>C,CU329671.1:g.33960T>C,CU329671.1:g.33955T>C,CU329671.1:g.33950A>G Null 972 h- sme2 sme2-m nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.12c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure 3) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0007496 CU329671.1:g.33962T>C,CU329671.1:g.33960T>C,CU329671.1:g.33955T>C,CU329671.1:g.33950A>G Null 972 h- sme2 sme2-m nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:24920274 4896 2019-11-08 (Figure 3) PomBase SPNCRNA.103 FYPO:0003055 CU329671.1:g.33962T>C,CU329671.1:g.33960T>C,CU329671.1:g.33955T>C,CU329671.1:g.33950A>G Null 972 h- sme2 sme2-m nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPAC27D7.09c FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAC27D7.09c SPAC27D7.09cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC27D7.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC27D7.09c SPAC27D7.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC27D7.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC27D7.09c SPAC27D7.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC27D7.09c SPAC27D7.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0000941 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-311 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 GFP±Sid1p signal was not observed at SPBs in these cells although faint nuclear signal was observed (Figure 7A). This suggests that some aspect of completion of mitosis is required in order for Sid1p to localize. PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0001934 Q200* Not assayed or wild type 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:6214396 4896 2013-01-30 PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0001938 Q200* Not assayed or wild type 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:6214396 4896 2013-03-21 PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0002056 Q200* Not assayed or wild type 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:6214396 4896 2013-03-21 PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0001936 Q200* Not assayed or wild type 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:6214396 4896 2013-03-21 PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0001940 Q200* Not assayed or wild type 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:6214396 4896 2013-03-21 PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0001491 Q200* Not assayed or wild type 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:1824697 4896 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4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 E173Q Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E173Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 PMID:15724441 4896 2015-11-30 PomBase SPBC354.05c FYPO:0001422 E788A Overexpression 972 h- sre2 sre2-E788A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC354.05c) PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPCC290.02 FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpc34 rpc34-hmt4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPCC290.02 FYPO:0002583 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpc34 rpc34-hmt4 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPCC290.02 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpc34 rpc34-hmt4 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPCC290.02 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpc34 rpc34-hmt4 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPCC290.02 FYPO:0003031 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpc34 rpc34-hmt4 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPCC290.02 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpc34 rpc34-hmt4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPAC3G9.15c FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fcf2 fcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.15c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fcf2 fcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- fcf2 fcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3G9.15c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fcf2 fcf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3G9.15c FYPO:0000084 deletion 972 h- fcf2 fcf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPAC1420.01c FYPO:0005258 R530A,D531A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-RD530.531AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0000703 R530A,D531A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-RD530.531AA amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1420.01c),assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 R530A,D531A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-RD530.531AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000141 P13A,P15A Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-P13A,P15A amino_acid_mutation ECO:0001232 43.8 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Fig. 1b, C) PomBase SPAC824.04 FYPO:0007212 W210* Not assayed or wild type 972 h- epe1delta swd22 swd22-1-209 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC824.04 FYPO:0007213 W210* Not assayed or wild type 972 h- epe1delta swd22 swd22-1-209 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC824.04 FYPO:0002836 W210* Not assayed or wild type 972 h- epe1delta swd22 swd22-1-209 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC824.04 FYPO:0002336 W210* Not assayed or wild type 972 h- epe1delta swd22 swd22-1-209 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:31269446 4896 2020-01-08 PomBase SPAC110.01 FYPO:0006978 deletion 972 h- ppk1 ppk1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPAC110.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- ppk1 ppk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC110.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk1 ppk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC110.01 FYPO:0000841 deletion 972 h- ppk1 ppk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000167 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC110.01 FYPO:0000091 deletion 972 h- ppk1 ppk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC110.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppk1 ppk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC110.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk1 ppk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC110.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk1 ppk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0000082 F48S Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-SE2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 A spot assay showed that the cdc14-E2 allele was comparable in its temperature sensitivity to cdc14-118 (Figure 1C). PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0003213 F48S Not assayed or wild type 972 h- cdc14 cdc14-SE2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 While cdc14-118 cells showed the classic sin phenotype of multinucleation and cell elongation at the non-permissive temperature, cdc14-E2 cells arrested uniformly at a very late stage of septation and frequently lysed (Figure 1B). PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002061 F48S Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc14 cdc14-SE2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC24C6.07 FYPO:0002060 F48S Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc14 cdc14-SE2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC13C5.03 FYPO:0003967 C65A,C78A Overexpression 972 h- tht1 tht1-C65A,C78A amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC13C5.03) PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPAC29B12.10c FYPO:0001582 wild type Overexpression 972 h- pgt1 pgt1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:18662319 4896 2012-09-24 PomBase SPBC30D10.11 FYPO:0003971 gpi1::his7 Not assayed or wild type 972 h- gpi1 gpi1::his7+ disruption ECO:0005638 PMID:9046095 4896 2014-09-05 PomBase SPBC1539.08 FYPO:0007133 Q75L Not assayed or wild type 972 h- arf6 arf6-Q75L-mNG amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:34958661 4896 2022-06-30 but the GTP-locked allele arf6(Q75L)-mNG remained at nodes (Fig. 2 F) PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0007327 W212* Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC30D10.17c FYPO:0006518 W212* Not assayed or wild type 972 h- smi1 smi1-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC336.04 FYPO:0001490 A2955AAAAAGCTAGCTCTTTACTTCATGGTGA Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-R37 cst4-R37 nucleotide_insertion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002061 A2955AAAAAGCTAGCTCTTTACTTCATGGTGA Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-R37 cst4-R37 nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPBC336.04 FYPO:0002060 A2955AAAAAGCTAGCTCTTTACTTCATGGTGA Not assayed or wild type 972 h- cdc6 cdc6-R37 cst4-R37 nucleotide_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15576681 4896 2014-10-31 PomBase SPCC1795.03 FYPO:0003292 A258E Not assayed or wild type 972 h- gms1 gms1-A258E gmn3 amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:11378902 4896 2014-08-07 PomBase SPCC1795.03 FYPO:0003727 A258E Not assayed or wild type 972 h- gms1 gms1-A258E gmn3 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:11378902 4896 2014-08-07 PomBase SPCC1795.03 FYPO:0003658 A258E Not assayed or wild type 972 h- gms1 gms1-A258E gmn3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11378902 4896 2014-08-07 PomBase SPCC1795.03 FYPO:0000106 A258E Not assayed or wild type 972 h- gms1 gms1-A258E gmn3 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11378902 4896 2014-08-07 PomBase SPCC1795.03 FYPO:0003656 A258E Not assayed or wild type 972 h- gms1 gms1-A258E gmn3 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11378902 4896 2014-08-19 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0003343 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0000650 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0001406 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0001404 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0002721 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0003492 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPCC16C4.07 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- scw1 scw1-1 unknown ECO:0001232 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPAPB18E9.02c FYPO:0001038 S1010A,S1012A Not assayed or wild type 972 h- ppk18 ppk18-2A-S6K amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000263 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.16) PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAPB18E9.02c FYPO:0006822 S1010A,S1012A Not assayed or wild type 972 h- ppk18 ppk18-2A-S6K amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000263 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005781 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 2bc,5) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005785 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-08 (Figure 5a) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005785 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000290 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.01c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:26882497 4896 2016-11-08 (Figure 5a) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001382 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0005801 low assayed_enzyme(PomBase:SPBC106.01),assayed_substrate(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 1d) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001324 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0000059 low assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Fig. 2) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0004310 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001687 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure S3) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005783 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:26882497 4896 2016-11-08 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005779 S246A,S251A,T259A,T262A,T265A,S276A,T278A,S279A,S289A Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3-C9A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:26882497 4896 2016-11-04 (Figure 2a) PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0006503 E104A Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-E104A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:28410370 4896 2021-03-09 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000413 E104A Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-E104A amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:28410370 4896 2021-03-09 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0007096 E104A Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-E104A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.14c) PMID:28410370 4896 2021-03-09 PomBase SPAC27F1.02c 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ECO:0001232 FYECO:0000069 high PMID:41227381 4896 2026-01-23 and multiseptated morphology on caffeine-containing medium (YEA + 10 mM caffeine, 37◦C) (2-1480) (b), PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0001355 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0001232 PMID:41227381 4896 2026-01-23 The growth of cells (cwf14−: 2-1542; WT: 0-3) was tested at 30◦C (d) and 25◦C (SMA) (e), showing slower growth of mutant cells. PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0009007 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0005638 PMID:41227381 4896 2026-01-23 In a long-term survival assay, four-week-old cwf14 mutant cells showed reduced colony-forming ability (57%) compared to the wild-type strain (99%), indicating a decrease in viability of mutant cells. PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0001122 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0000334 PMID:41227381 4896 2026-01-23 The size of the cells was also measured at 30◦C (SMA) and was found to be significantly longer in the mutant than in the wild-type strain (f). PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0002989 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0005638 PMID:41227381 4896 2026-01-23 3.2. The Protein-Coding Genes Affected by cwf14 Mutation Are Often Involved in Transport Processes, Encode Enzymes, and Rarely Contain Introns To find out what molecular processes lie behind the observed phenotypic changes, we selected the protein-coding genes (log2 value +/−1.5) affected by cwf14 mutation from the genes identified by Kallgren [17] and determined the GO categories to which they belong (Table S4) (PomBase database) [30]. Unexpectedly, most genes were upregulated (106 out of 117 genes; 90%), and many of them encoded proteins with oxidoreductase, transferase, hydrolase, and transporter activity (Tables S4 and 1). The genes involved in transport processes were also supported by GO enrich- ment analysis, which primarily highlighted genes related to urea (GO:0015840) (Num- Cells 2025, 14, 1736 10 of 23 ber of genes/pathway genes: 3/3) and putrescine transport (GO:0015847) (Number of genes/pathway genes: 3/3). PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0003031 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0005638 PMID:41227381 4896 2026-01-23 Similarly, the sporulation of the cwf14 deleted h90 strain (2-1532) was also altered, and cells showed an increased tendency to sporulate. That is, the mutant cells conjugated and produced asci both on nutrient-rich (YEA) and minimal (EMMA-nitrogen) media after only 1 day, in contrast to the wild-type h90 strain, which at that time contained only vegetative cells (Figure S2). PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0000097 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0005638 PMID:41227381 4896 2026-01-23 Stress response assays also demonstrated that the cwf14− mutant strains (2-1532, 2-1480) are sensitive to rapamycin, ethanol, and caffeine (Figure 1h–j), confirming previous results [60,61] PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0000842 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0005638 FYECO:0000212 PMID:41227381 4896 2026-01-23 Stress response assays also demonstrated that the cwf14− mutant strains (2-1532, 2-1480) are sensitive to rapamycin, ethanol, and caffeine (Figure 1h–j), confirming previous results [60,61] PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0000111 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0005638 FYECO:0000242 PMID:41227381 4896 2026-01-23 Stress response assays also demonstrated that the cwf14− mutant strains (2-1532, 2-1480) are sensitive to rapamycin, ethanol, and caffeine (Figure 1h–j), confirming previous results [60,61] PomBase SPBC24C6.11 FYPO:0001492 disruption Not assayed or wild type 972 h- cwf14 cwf14-1 disruption ECO:0001232 high PMID:41227381 4896 2026-01-23 Figure 1. Phenotype of the mutant strain (cwf14−). Morphology: The mutant strain produced elongated cells at 37◦C (YEA) (2-1480) (a) PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001360 unknown Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1- unknown ECO:0000335 PMID:2878925 4896 2014-08-05 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001168 unknown Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1- unknown ECO:0005801 PMID:2878925 4896 2014-08-05 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0003647 unknown Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1- unknown ECO:0000335 PMID:2878925 4896 2014-08-05 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1- unknown ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:2878925 4896 2014-08-05 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0001431 unknown Not assayed or wild type 972 h- pma1 pma1- unknown ECO:0005638 PMID:2878925 4896 2014-08-05 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000776 Y19F Not assayed or wild type 972 h- leu1-32, ura4-D18 ade6-704 cdc2 cdc2-Y19F cdc2-F19 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:2682257 4896 2016-12-12 (Fig. 6C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002085 Y19F Not assayed or wild type 972 h- leu1-32, ura4-D18 ade6-704 cdc2 cdc2-Y19F cdc2-F19 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2682257 4896 2016-12-12 (Fig. 6B) PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph rps3001 rps3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.04 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- 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In agreement with earlier results the cox10 mutant also had no heme O [4]. PomBase SPBC365.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- cox10 cox10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC365.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox10 cox10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cox10 cox10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000705 563-652 Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-1-562 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC21D10.12) PMID:15615784 4896 2017-07-20 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001382 563-652 Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-1-562 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:12427731 4896 2017-07-18 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0000583 deletion 972 h- h+ map1 map1delta deletion 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PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0004174 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0005638 PMID:9003326 4896 2014-12-09 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0005091 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0000337 PMID:15509866 4896 2015-11-22 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0001164 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0005638 PMID:8668157 4896 2014-06-10 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0001996 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1795.06) PMID:8668157 4896 2014-12-09 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0001996 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.10c) PMID:8668157 4896 2014-12-09 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0001996 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC21D10.06c) PMID:8668157 4896 2014-12-09 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- map1 map1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11E3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 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972 h- cdc23 cdc23-tstd cdc23ts-td fusion_or_chimera ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000106,FYECO:0000229,FYECO:0000260 PMID:12972571 4896 2014-09-10 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001093 Ub-DHFRts-cdc23-C239Y Knockdown 972 h- cdc23 cdc23-tstd cdc23ts-td fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:12972571 4896 2014-09-10 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003548 Ub-DHFRts-cdc23-C239Y Knockdown 972 h- cdc23 cdc23-tstd cdc23ts-td fusion_or_chimera ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12972571 4896 2014-09-10 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000608 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:9348288 4896 2014-04-17 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000240 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mal3 mal3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000197 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:24196444 4896 2014-04-01 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003065 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mal3 mal3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002736 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mal3 mal3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001894 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 medium PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003263 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 medium PMID:24196444 4896 2014-04-01 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0007989 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000511 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 40 PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0006502 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000938 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:12894167 4896 2016-06-27 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003277 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.10) PMID:23087209 4896 2014-04-01 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0005814 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC664.10) PMID:25869666 4896 2022-05-16 (Fig. S3A) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0005814 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-02 (Fig. 6E) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009001 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:24928430 4896 2023-07-21 (Fig. 3) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0006885 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.10) PMID:30463883 4896 2019-05-19 (Figure 2A,B) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0007972 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:35293864 4896 2022-04-12 mal3Δ cells exhibited lower microtubule growth speed throughout anaphase B (Fig. 2G) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000581 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000584 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:24196444 4896 2014-04-01 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001846 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:17561805 4896 2014-11-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000274 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:16179942 4896 2014-09-08 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001861 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0000340 PMID:9348288 4896 2014-04-17 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003003 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16179942 4896 2014-09-08 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002151 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 high PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0004611 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:11102508 4896 2016-04-20 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mal3 mal3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 mal3 mal3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003061 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:24196444 4896 2015-04-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003061 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002818 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:38442865 4896 2024-05-31 (Fig. 2D, E and F) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003303 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:9348288 4896 2014-04-24 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000339 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 low PMID:9348288 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mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:23755176 4896 2014-01-28 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0004731 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 PMID:22696680 4896 2017-06-05 (Figure 1) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002901 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:16179942 4896 2014-09-08 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0008003 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0005827 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1604.20c) PMID:15177031 4896 2016-11-02 (Fig. 6E) PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003302 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 low PMID:9348288 4896 2014-04-17 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0003302 deletion 972 h- mal3 mal3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:9348288 4896 2014-04-17 PomBase 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prototroph SPCC569.06 SPCC569.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.06 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.06 SPCC569.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.06 SPCC569.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.06 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.06 SPCC569.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.06 SPCC569.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC569.06 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC569.06 SPCC569.06delta deletion ECO:0005638 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produced small colonies (Supplementary Fig. 2b), consistent with the role of the SRR1-like domain even in the absence of exogenous DNA damage. PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0005371 W157R Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-W157R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Fig. 3e) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000085 W157R Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-W157R amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 3a) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000088 W157R Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-W157R amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 3a) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000089 W157R Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-W157R amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 3a) PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0002335 unknown Not assayed or wild type 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 lid2 lid2-jmjdelta unknown ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 (Fig. S5) PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0002485 135-561 Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8(1-134) rec8::ura4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0003179 135-561 Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8(1-134) rec8::ura4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0002151 135-561 Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8(1-134) rec8::ura4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 12 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0002151 135-561 Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8(1-134) rec8::ura4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 20 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0004665 135-561 Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8(1-134) rec8::ura4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC29A10.14 FYPO:0006371 135-561 Not assayed or wild type 972 h- rec8 rec8(1-134) rec8::ura4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:10207075 4896 2022-09-18 PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0001490 csc1 SPB constitutive (via ppc89) Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-GFP-ppc89-GBP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:38865179 4896 2024-07-10 died as single elongated cells, consistent with SIN inactivation (Figure S2, C and D) PomBase SPBC3H7.13 FYPO:0002061 csc1 SPB constitutive (via ppc89) Not assayed or wild type 972 h- csc1 csc1-GFP-ppc89-GBP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:38865179 4896 2024-07-10 We found that cells producing both Csc1-R31A-GFP and Ppc89-GBP-mCherry (Figure S2B) or Sid4-GBP-mCherry (Figure 3B) were also inviable. PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 E305A,H306A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E305A,H306A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPAC3F10.10c FYPO:0000708 F204P Not assayed or wild type 972 h- map3 map3-F204P amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:25831518 4896 2016-06-08 PomBase SPAC27E2.09 FYPO:0002446 1450-1740 Not assayed or wild type 972 h- mak2 mak2-deltagafpas partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:20919928 4896 2016-06-23 PomBase SPAC27E2.09 FYPO:0001266 1450-1740 Not assayed or wild type 972 h- mak2 mak2-deltagafpas partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:20919928 4896 2016-06-23 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0007963 1-70,393-659 Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d3 B2d3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Table 2) PomBase SPBC19G7.09 FYPO:0006152 C527S Not assayed 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17614284 4896 2024-06-20 (Fig. S3) PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0002061 deletion 972 h- spt16 spt16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt16 spt16delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB8E5.05 FYPO:0005118 G(-173)A Not assayed or wild type 972 h- mfm1 mfm1-promoter(M-box-mut2) nucleotide_mutation ECO:0000049 high assayed_using(PomBase:SPAPB8E5.05) PMID:9233811 4896 2017-12-09 PomBase SPCC962.03c FYPO:0000839 wild type Overexpression 972 h- cut15 cut15+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:15937127 4896 2018-01-22 (Figure 5B) PomBase SPBC8D2.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfi1 sfi1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC8D2.05c FYPO:0001490 deletion 972 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Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1-PAS-2-mut nucleotide_mutation ECO:0005801 medium PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. S6) PomBase SPCC970.07c FYPO:0000468 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC970.07c FYPO:0007336 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000049 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 2C) PomBase SPCC970.07c FYPO:0005850 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001978 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 13 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002834 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000049 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 2A) PomBase SPCC970.07c FYPO:0002834 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000291 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 7) PomBase SPCC970.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002827 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002827 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPCC970.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 2B) PomBase SPCC970.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000291 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 7) PomBase SPCC970.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002355 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 8B) PomBase SPCC970.07c FYPO:0004904 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0004904 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1861.01c) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0004904 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC970.07c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002836 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0005063 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000226 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 8C) PomBase SPCC970.07c FYPO:0001840 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 high PMID:16157682 4896 2024-04-29 Table 2 and Fig. 4 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 The western blot results suggest that the loss of any member of CLRC complex enhances the protein amount of Lsd1 (Fig 3C) or Lsd2 (Fig 3D). PomBase SPCC970.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 The western blot results suggest that the loss of any member of CLRC complex enhances the protein amount of Lsd1 (Fig 3C) or Lsd2 (Fig 3D). PomBase SPCC970.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 We found that the loss of any members in CLRC promotes the protein levels of Set1, both at 30 ̊C or 37 ̊C (Fig 5A), indicating that the intact CLRC restricts the amount of Set1. PomBase SPCC970.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC970.07c FYPO:0004909 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 complete assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 5) PomBase SPCC970.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 raf2 raf2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC970.07c FYPO:0000674 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002141 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002837 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002336 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000291 PMID:16157682 4896 2024-04-29 (Fig. 7) PomBase SPCC970.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 raf2 raf2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001164 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23050226 4896 2016-02-26 PomBase SPCC970.07c FYPO:0000833 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002574 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001357 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC970.07c FYPO:0004325 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. S2) PomBase SPCC970.07c FYPO:0000084 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26173815 4896 2015-07-27 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002642 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPCC970.07c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC970.07c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 raf2 raf2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC970.07c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPCC970.07c FYPO:0003241 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 14 PMID:23267073 4896 2018-02-09 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC970.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 raf2 raf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC15A10.02 FYPO:0000708 S217D,T218E,S220D,T221E,T283E Not assayed or wild type 972 h- taf12 taf12-5DE amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005307 E30K,K42A,R63A,R115A,R119A,E152K Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-core4A,E30K,E152K amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 swi3 swi3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006521 deletion 972 h- swi3 swi3delta deletion ECO:0001232 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7A-B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0007376 deletion 972 h- swi3 swi3delta deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-08-27 (Fig. 1C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0002603 deletion 972 h- swi3 swi3delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006677 deletion 972 h- swi3 swi3delta deletion 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(Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001122 deletion 972 h- swi3 swi3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 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PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph swi3 swi3delta deletion ECO:0005638 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hcn1 hcn1-S48A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.12c) PMID:16950791 4896 2015-11-18 PomBase SPAC23C11.12 FYPO:0000618 S48A Not assayed or wild type 972 h- hcn1 hcn1-S48A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16950791 4896 2015-11-18 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0000152 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000296 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0003345 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000272 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0000708 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0005456 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000296 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0005034 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0001152 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0001152 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0000998 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000296 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0000280 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 high PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPAC10F6.16 FYPO:0000280 S64A Not assayed or wild type 972 h- igo1 igo1-S64A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127,FYECO:0000272 high PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPAC30.03c FYPO:0004289 R20G Not assayed or wild type 972 h- tsn1 tsn1-R20G amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC30.03c) PMID:20081200 4896 2015-01-13 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001722 V147A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V147A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 V147A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V147A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC977.10) PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 V147A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V147A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 V147A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V147A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0005638 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 On the effect of temperature, in the its8-1Dcis4 double mutants, these cells exhibited more marked temperature sensitivity than that of the its8-1 single mutants (Figure 5B), suggesting that there is a genetic interaction between Its8 and Cis4. PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0001586 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.12) PMID:22891673 4896 2013-04-30 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002086 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:27082518 4896 2016-07-16 (Fig. 7D) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0001677 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC6G10.05c) PMID:27082518 4896 2016-07-22 (Fig. S6 B) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0001677 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:27082518 4896 2016-07-22 (Fig. S6 C) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0007589 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 Thus, GFP-Ecm33 localized at Golgi/endosome structures in addition to the cell surface and the division site in these mutants, suggesting that GPI-anchored proteins were not correctly transported and were retained at the Golgi/endosome structures in these membrane trafficking mutants PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0004325 unknown Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 ura4-D18 ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0002641 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0000110 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0005638 PMID:19486165 4896 2016-10-31 (Figure 7A) PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0000086 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPAC18G6.03 FYPO:0000115 unknown Not assayed or wild type 972 h- ypt3 ypt3-i5 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17287531 4896 2014-06-05 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000669 K309A,R310A Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-K309A,R310A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPCC1795.06) PMID:10792724 4896 2012-01-17 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0001669 K309A,R310A Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-K309A,R310A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC1296.03c) PMID:10792724 4896 2011-10-12 PomBase SPAC1296.03c FYPO:0000537 K309A,R310A Not assayed or wild type 972 h- sxa2 sxa2-K309A,R310A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC1296.03c) PMID:10792724 4896 2011-10-11 PomBase SPAC1B2.05 FYPO:0001388 disruption Null 972 h- mcm5 mcm5delta::his3+ nda4delta::his3+ disruption ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05) PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPAC1B2.05 FYPO:0000950 disruption Null 972 h- mcm5 mcm5delta::his3+ nda4delta::his3+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPAC1B2.05 FYPO:0000614 disruption Null 972 h- mcm5 mcm5delta::his3+ nda4delta::his3+ disruption ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPAC1B2.05 FYPO:0001385 disruption Null 972 h- mcm5 mcm5delta::his3+ nda4delta::his3+ disruption ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:9914167 4896 2012-08-17 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007369 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007366 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007365 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0002009 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 medium PMID:32319721 4896 2020-04-28 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007370 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0000637 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:32319721 4896 2020-04-28 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007371 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007367 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007368 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007368 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000126 PMID:37164017 4896 2023-05-18 Consistent with previous work,63 the higher Pyk1 activity in S. pombe increased the cellular ATP/ADP ratio, whereas the lower Pyk1 activity in S. japonicus reduced it (Figure 3B). PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0000433 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:32319721 4896 2020-04-28 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007364 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:32319721 4896 2020-05-07 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0001309 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:32319721 4896 2020-04-28 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0000441 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000143 medium PMID:32319721 4896 2020-04-28 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0000073 T343A Not assayed or wild type 972 h- pyk1 pyk1-T343A pyk1-high activity allele amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:32319721 4896 2020-04-28 PomBase SPAC4H3.10c FYPO:0007372 T343A 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cdc15 cdc15-core4A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 K42A,R63A,R115A,R119A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-core4A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC23C11.10 FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- mpn1 mpn1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23022480 4896 2015-08-25 PomBase SPBC1861.01c FYPO:0006798 88-643 Not assayed or wild type 972 h- cnp3 cnp3-1-87 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29180432 4896 2019-01-02 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0000303 H351I,H389I Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-H351I,H389I amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8534915 4896 2014-07-31 PomBase SPCC63.08c FYPO:0000705 593-830 Not assayed or wild type 972 h- atg1 atg1(1-592) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 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trs1 trs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25H2.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs1 trs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.06c FYPO:0000080 R194L Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R194L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001531 R194L Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R194L amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 high PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0000021 R194L Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R194L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0003448 R194L Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-R194L amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000126 medium PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0001645 160-972 Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1(N-term)1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC29A4.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.05) PMID:34209806 4896 2021-07-30 PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0000703 160-972 Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1(N-term)1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.02),assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.05) PMID:34209806 4896 2021-07-30 We observed similar intensities of interaction of the Nrl1(N-term) and the Nrl1(N-term + NRDE-2) constructs with Mtl1 (1511.2 ± 89.4 or 1558.2 ± 159.3 Miller units for the N-terminal region and the N-terminus with NRDE2 domain and Mtl1, respectively) PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000705 F6A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F6A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 F6A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F6A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 F6A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F6A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 F6A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-F6A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002024 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-PD9 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC27F1.09c FYPO:0002060 H524Q Not assayed or wild type 972 h- prp10 prp10-H524Q prp10-H662Q amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32168916 4896 2021-06-25 (Figure S4) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008202 180-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1(1-179) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 ~22 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1b) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008202 180-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1(1-179) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 10 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1c) Interestingly, no additive effect was seen in the bub11-179 sgo2D double mutant, indicating that Sgo2 and the kinase domain of Bub1 act in the same pathway (Figure 3A). PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007661 180-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1(1-179) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:16360688 4896 2024-04-24 , Sgo1 is seen as nuclear staining with punctate dots of fluorescence along the spindle (Figure 1D and [2, 9]). This localization is abolished in a bub1D background but preserved in the truncated mutants (Figure 1D), although the signal intensity was variable; in bub11-585, Sgo1 staining was as strong as in the wild-type, but it was weaker in bub11-179 and bub11-826 backgrounds. We conclude that the N terminus of Bub1 is sufficient to promote correct Sgo1 localization and function during MI. PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000151 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2017-12-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0005179 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005580 PMID:15498101 4896 2016-01-18 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002900 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004259 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000277 PMID:11553781 4896 2016-02-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000229 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000170 27 PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000229 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000229 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000375 PMID:28775153 4896 2019-04-24 (Fig. 4D) DAPI staining. PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003165 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001053 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 4 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. S12) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000080 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24586893 4896 2014-06-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004190 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003143 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPCC553.07c) PMID:12514100 4896 2014-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004464 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:21095590 4896 2015-02-24 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002098 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004192 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003142 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPCC553.07c) PMID:12514100 4896 2014-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0006372 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 (Figure S10 E and F) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001840 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000059 low PMID:8834792 4896 2014-05-13 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002978 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 (Fig. 4) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002978 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 (Fig. 4) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000650 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 2A III) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 chk1 chk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001929 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001929 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001929 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000674 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24586893 4896 2014-06-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003118 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003118 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001383 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000110,FYECO:0000229 high PMID:7796804 4896 2017-10-27 (Fig. 7A panel 3) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004286 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000049 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 chk1 chk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25269894 4896 2014-10-13 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001164 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24006488 4896 2013-12-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000963 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18753627 4896 2014-11-20 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000963 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0010017 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5C) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0010017 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5C) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000478 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004014 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12960401 4896 2015-10-19 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002043 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001509 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.13) PMID:10683155 4896 2015-04-30 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002554 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:12930957 4896 2016-02-29 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0005614 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0005614 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002099 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002099 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002099 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(S604) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002099 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002099 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:11027263 4896 2019-11-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002099 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003131 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0005395 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12196391 4896 2016-05-04 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000703 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1952.07),assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 (Fig. 3a) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004252 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000226 PMID:24806966 4896 2014-06-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001903 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000268 PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 2A III) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0005166 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:17304223 4896 2015-12-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002052 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000059 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002687 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002687 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002687 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000337 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003503 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003503 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001357 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001357 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0009110 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000434 low PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0004720 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 PMID:11711540 4896 2015-07-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003538 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2017-12-11 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000095 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000095 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0001501 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000319 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000314 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 Interestingly, we found that dsk1Δ was highly sensitive to replication-associated DNA break agents like camptothecin (CPT), which is a topoisomerase I inhibitor, and was slightly sensitive to methyl methanesulfonate (MMS), which alkylates and breaks DNA during replication (Figure 1a and Figure S1c). PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000085 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003840 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0003384 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002167 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000419 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 1A) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:16849602 4896 2015-12-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15367656 4896 2020-02-18 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000088 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000267 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000211 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000211 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 2A) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25269894 4896 2014-10-13 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23211746 4896 2013-11-18 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3A) PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24006488 4896 2013-12-06 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 deletion 972 h- chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph chk1 chk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1259.13 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0001987 deletion 972 h- frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 high PMID:28882432 4896 2018-01-17 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0005825 deletion 972 h- frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000186 medium PMID:35079912 4896 2022-03-31 (Figure 3A) Fe2(SO4)3 was added to YES media for a final concentration of 2.75 mM. PomBase SPBC1683.09c FYPO:0002015 deletion 972 h- frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000330 medium PMID:35079912 4896 2022-03-31 (Figure 3A) 25 µM of iron chelator bathophenanthroline disulfonate (BPS) was added to YES media to create iron-depleted condition. PomBase SPBC1683.09c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0006579 deletion 972 h- frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000344 medium PMID:35079912 4896 2022-03-31 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0000116 deletion 972 h- frp1 frp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000404 low PMID:35079912 4896 2022-03-31 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- frp1 frp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 frp1 frp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1683.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 frp1 frp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4B4.05 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smg1 smg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4B4.05 FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ smg1 smg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC4B4.05 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smg1 smg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4B4.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- smg1 smg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC4B4.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smg1 smg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4B4.05 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 smg1 smg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0006141 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPCC1682.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0006978 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:37156397 4896 2023-05-24 As a result, we obtained 42 strains in which the CoQ10 content was lower than half that of the wild-type (WT) strain. The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qcr9 qcr9delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0008128 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0007618 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-20 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001122 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-21 (Fig. 4) PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0007612 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.02) PMID:33400299 4896 2021-01-21 transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- qcr9 qcr9delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1682.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph qcr9 qcr9delta deletion 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PomBase SPCC962.02c FYPO:0001269 A990T Not assayed or wild type 972 h- bir1 cut17-275 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPCC962.02c FYPO:0001269 A990T Not assayed or wild type 972 h- bir1 cut17-275 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPCC962.02c FYPO:0004412 A990T Not assayed or wild type 972 h- bir1 cut17-275 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPCC962.02c FYPO:0003192 A990T Not assayed or wild type 972 h- bir1 cut17-275 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPCC962.02c FYPO:0004830 A990T Not assayed or wild type 972 h- bir1 cut17-275 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11554922 4896 2015-08-18 PomBase SPCC962.02c FYPO:0003286 A990T Not assayed 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SPCC16A11.17 FYPO:0001492 K551A Overexpression 972 h- C-terminal 3xHA mcm4 mcm4-KA mcm4-K->A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:11973289 4896 2012-11-15 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000705 T20N,C199R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-T20N,C199R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.14c),assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000705 T20N,C199R Not assayed or wild type 972 h- rho1 rho1-T20N,C199R amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.04),assayed_using(PomBase:SPBC12D12.04c) PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002561 cdc4::ura4 Null 972 h- cdc4 cdc4::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10022828 4896 2017-01-25 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001669 1055-1085 Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M6 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000134,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) 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rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0005167 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006818 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006818 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC1442.10c) PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002391 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4F) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002391 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4F) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002391 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4F) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000220 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000291 medium PMID:30652128 4896 2019-01-26 rpd1-S7A reduced centromere noncoding RNA in the clr4∆ strain. PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001740 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001740 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-26 rpd1-S7A increased the rate of gross chromosomal rearrangement in the otherwise wild-type background. PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001840 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000674 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22771993 4896 2015-11-21 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001164 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22771993 4896 2015-11-21 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000964 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0005866 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. 4E) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000107 CTD-S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-S7A(r5-r29) rpb1-CTD-S7A|rpb1-CTD-S7A(5-29)|rpb1-S7A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:22771993 4896 2015-11-21 PomBase SPCC320.11c FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nip7 nip7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.11c FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nip7 nip7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.11c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nip7 nip7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- nip7 nip7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC320.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nip7 nip7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0000468 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-2T unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:11780129 4896 2024-04-12 we found that cohesin mutants (psc3-1T, psc3-2T, psc3-4T and rad21-K1) produced switching-defective colonies at a rate nearly 100-fold that of the wild type (Fig. 3a,b). PomBase SPAC17H9.20 FYPO:0006521 unknown Not assayed or wild type 972 h- psc3 psc3-2T unknown ECO:0001232 PMID:12750522 4896 2024-11-19 Mitotic cells carrying a temperature-sensitive allele of psc3 (psc3-2T) (18) displayed extensive separation of cut3-GFP dots (Fig. S2B) PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.13 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ucp6 ucp6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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972 h- rbd2 rbd2(200-240) rbd2C(200-240) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1565.08),assayed_using(PomBase:SPCC790.03) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 6B) PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 F385R Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-F385R amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPCC777.14 FYPO:0003029 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:26730850 4896 2016-10-03 (Figure 1D) PomBase SPCC777.14 FYPO:0003029 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:26730850 4896 2016-10-03 (Figure 1D) PomBase SPCC777.14 FYPO:0003029 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:26730850 4896 2016-12-02 (Figure 3, 5) PomBase SPCC777.14 FYPO:0003029 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC22G7.08) PMID:26730850 4896 2016-12-02 (Figure 4) PomBase SPCC777.14 FYPO:0003244 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 30 PMID:26730850 4896 2016-10-03 (Figure 1D, 2D) (Figure 2A) PomBase SPCC777.14 FYPO:0000333 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 PMID:26730850 4896 2016-10-03 (Figure 1C) PomBase SPCC777.14 FYPO:0000012 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 PMID:26730850 4896 2016-12-02 (Figure 1A-C) PomBase SPCC777.14 FYPO:0003619 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC22F3.09c) PMID:26730850 4896 2016-12-07 (Figure 1D) PomBase SPCC777.14 FYPO:0003619 F238A Not assayed or wild type 972 h- prp4 prp4-as2 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC776.01) PMID:26730850 4896 2016-12-07 (Figure 1D) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0001645 A166C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A166C nucleotide_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 A166C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A166C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 medium PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 A166C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-A166C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001001 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001283 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001283 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000998 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:22084378 4896 2015-02-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000998 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000999 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:22084378 4896 2015-02-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000999 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001178 G461D Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-558 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000705 L9D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-L9D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001645 K16D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-K16D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPBC146.03c FYPO:0003286 S1116P Not assayed or wild type 972 h- cut3 cut3-l23 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23263988 4896 2014-04-04 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0004373 rad1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1::ura4 disruption ECO:0001232 PMID:9716408 4896 2018-03-17 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000088 rad1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1::ura4 disruption ECO:0005638 PMID:9716408 4896 2018-03-17 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000267 rad1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1::ura4 disruption ECO:0005638 PMID:9716408 4896 2018-03-17 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000268 rad1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1::ura4 disruption ECO:0005638 PMID:9716408 4896 2018-03-17 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000082 S1314P Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-381 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:39916665 4896 2025-03-05 (Fig. S1A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001357 S1314P Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-381 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. S1A) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004250 Y398A Overexpression 972 h- hfl1 hfl1-Y398A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0001645 Y398A Overexpression 972 h- hfl1 hfl1-Y398A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-11 (Figure 4A) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0001245 Y398A Overexpression 972 h- hfl1 hfl1-Y398A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figure 4E) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000116 Y398A Overexpression 972 h- hfl1 hfl1-Y398A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000173 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figure 4E) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0006784 Y398A Overexpression 972 h- hfl1 hfl1-Y398A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-11-26 (Figures 4C and 4D) PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 NP328AA Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A10 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 NP328AA Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A10 amino_acid_mutation ECO:0000049 low assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002061 NP328AA Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A10 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000941 1-1086,I115A Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1(PACT-I115A) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4H3.11c) PMID:38985524 4896 2024-07-30 Additionally, while GFP-Pcp1(PACT) localized at the SPB, GFP-Pcp1(PACT-I1151A) was diffuse throughout the cytosol and nucleus (Figure 6D) PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 toe3 toe3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 toe3 toe3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001236 deletion 972 h- toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-10-17 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001164 deletion 972 h- toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-10-17 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001795 deletion 972 h- toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-11-26 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph toe3 toe3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- toe3 toe3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB24D3.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ 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assayed or wild type 972 h- spa2 spa2deltaCC2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Spa2 lacking CC2 was more significantly reduced in abundance at both the cell division site (∼60%) and cell tips (∼67%) (Fig. 2E,F; Fig. S2F). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001586 310-365 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2deltaCC2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Spa2 lacking CC2 was more significantly reduced in abundance at both the cell division site (∼60%) and cell tips (∼67%) (Fig. 2E,F; Fig. S2F). PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005521 K406A Not assayed or wild type 972 h- hrp3 hrp3-K406A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0005520 K406A Not assayed or wild type 972 h- hrp3 hrp3-K406A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC3G6.01) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC3G6.01 FYPO:0003557 K406A Not assayed or wild type 972 h- hrp3 hrp3-K406A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:22990236 4896 2016-07-12 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph btb3 btb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph btb3 btb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph btb3 btb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph btb3 btb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph btb3 btb3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- btb3 btb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btb3 btb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13D6.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 btb3 btb3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25H1.04 FYPO:0005106 D185S Not assayed or wild type 972 h- mug105 mug105-D185S amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC25H1.04) PMID:35058438 4896 2024-04-21 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007449 339-380 Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-N339 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:32735772 4896 2020-08-07 (Figures S3B and S3D) Epr1-C showed ER localization in vegetatively growing cells, whereas Epr1-N was diffusely distributed in the cytoplasm and the nucleus PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000705 339-380 Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-N339 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 1C) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0006378 339-380 Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-N339 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:32735772 4896 2020-08-07 (Figures S3B and S3D) Epr1-C showed ER localization in vegetatively growing cells, whereas Epr1-N was diffusely distributed in the cytoplasm and the nucleus PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002024 1-803 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-C(803-1489) rng2C partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19713940 4896 2017-12-19 PomBase SPAC513.02 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC513.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC513.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC513.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC513.02 SPAC513.02delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0003768 1-185 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN184(C60) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3K) PomBase SPAC343.11c FYPO:0002488 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000227 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 PMID:19915592 4896 2023-11-15 Knockout or depletion of H2A.Z in Sc 15 or mammalian cells 5 leads to increased rates of chromosome loss. This phenotype was also observed if any component of the Sp Pht1Ac pathway is disrupted, including mutants in swr1 (and msc1), pht1 (pht1Δ, −4KR or −4KQ), or mst1 (Supplementary Table 2 and 16,25,26). PomBase SPAC343.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 low PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 4) PomBase SPAC343.11c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002827 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000049 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 4D) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000884 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 high PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1D) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000470 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 1.5 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 3) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000450 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 42 assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:28827290 4896 2017-09-28 (Fig. 2C) PomBase SPAC343.11c FYPO:0002909 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC11B10.10c) PMID:19693008 4896 2024-01-15 affected chromatin association of Swr1, distribution of H2A.Z across the genome (Supplementary Fig. 2c). PomBase SPAC343.11c FYPO:0003573 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 4B) PomBase SPAC343.11c FYPO:0005749 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 4) PomBase SPAC343.11c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0005071 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 PMID:19693008 4896 2024-01-15 Dpht1 causes a slight increase in silencing at the pericentromeric region, but H3K9me distribution at heterochromatic loci is not severely altered (Supplementary Fig. 4a). PomBase SPAC343.11c FYPO:0006299 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000049 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 2A) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000875 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 high PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1C) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000887 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000049 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 2B) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000451 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP22H7.09c) PMID:28827290 4896 2017-10-06 (Fig. 7) PomBase SPAC343.11c FYPO:0004237 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 2C) PomBase SPAC343.11c FYPO:0004380 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_region(SO:0001898),assayed_region(SO:0001899) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1B) PomBase SPAC343.11c FYPO:0004380 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_region(SO:0001898),assayed_region(SO:0001899) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1E) PomBase SPAC343.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000674 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002141 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002335 deletion 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 msc1 msc1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 (Fig. S5) PomBase SPAC343.11c FYPO:0002620 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000863 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1F) PomBase SPAC343.11c FYPO:0008203 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1G) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. 1H) PomBase SPAC343.11c FYPO:0000833 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1672.10) PMID:28827290 4896 2017-09-28 (Fig. 2D) PomBase SPAC343.11c FYPO:0008154 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC11B10.10c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 (Fig. S2) PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC736.11) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC23H4.12) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC428.08c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC664.01c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC188.13c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC1739.03) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC663.12) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC83.03c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC800.03) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC36.05c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP35G2.10) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC2D10.17) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1B3.17) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC16D10.07c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001317 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC622.16c) PMID:19164572 4896 2024-04-19 Table S1 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001357 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000069 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPAC343.11c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0000096 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2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph msc1 msc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 msc1 msc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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PomBase SPCC736.14 FYPO:0002639 unknown Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1- unknown ECO:0001232 PMID:9802907 4896 2016-04-28 A striking feature in dis1 mutant cells was that the back-and-forth cen1 DNA movements seen in phase 2 of wild-type cells were entirely absent. After spindle elongation (the SPB distance, ô°†8 ô°ˆm), the cen1 signals were fused again and moved to one of the SPBs. Such prolonged centromere splitting while the spindle was elongating was never seen in wild-type or any of the other mutant cells examined so far. PomBase SPCC736.14 FYPO:0002966 unknown Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1- unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:14742702 4896 2017-08-16 (Figure 4E) PomBase SPCC736.14 FYPO:0005417 unknown Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1- unknown ECO:0001232 PMID:9802907 4896 2016-04-28 PomBase SPBC8D2.17 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph gmh4 gmh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.17 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph gmh4 gmh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.17 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph gmh4 gmh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.17 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph gmh4 gmh4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC8D2.17 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- 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SPBC685.02 FYPO:0000102 deletion 972 h- exo5 exo5delta deletion ECO:0005638 PMID:31563844 4896 2023-11-09 Furthermore, the deletion is particularly hypersensitive to interstrand crosslinking (ICL) agents such as 8-methoxypsoralen (Fig. 5B) and cis-platin (Fig. 5C). 8- methoxypsoralen intercalates into the DNA and forms interstrand crosslinks upon irradiation with visible light [23]. PomBase SPBC685.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- exo5 exo5delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31563844 4896 2023-11-09 PomBase SPBC685.02 FYPO:0000268 deletion 972 h- exo5 exo5delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31563844 4896 2023-11-09 However, the exo5Δ mutant is more sensitive than isogenic wild-type to UV-irradiation and alkylating agents (Fig. 5A). PomBase SPBC685.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- exo5 exo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC685.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo5 exo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC685.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- exo5 exo5delta deletion ECO:0005638 PMID:31563844 4896 2023-11-09 S. pombe exo5Δ strains are viable, indicating that spExo5 is not essential for mitochondrial genome stability (Fig. 2B). PomBase SPBC685.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo5 exo5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC685.03 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC685.03 SPBC685.03delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC685.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr SPBC685.03 SPBC685.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC685.03 FYPO:0006012 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPBC685.03 SPBC685.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC685.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC685.03 SPBC685.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC685.03 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPBC685.03 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previous report (Figure 5B and Sergeant et al., 2005). PomBase SPCC550.05 FYPO:0001357 184-219 Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-deltaRING partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18667531 4896 2022-11-07 The 􏰂RING, C197A, C199A, and C197A/C199A mutants were mildly temperature sensitive but grew normally at 25°C (Figure 2A and data not shown) PomBase SPCC550.05 FYPO:0000088 184-219 Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-deltaRING partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000089 184-219 Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-deltaRING partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPCC550.05 FYPO:0000268 184-219 Not assayed or wild type 972 h- nse1 nse1-deltaRING partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:18667531 4896 2022-11-07 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 V42VGVPQK,42-46 Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K33deltaK27 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC343.16 FYPO:0000039 unknown 972 h- lys2 lys2-97 unknown ECO:0005638 PMID:16491385 4896 2012-04-24 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 F17A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 F17A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 F17A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17A amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 F17A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 F17A Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F17A 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SPBC16H5.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009035 deletion 972 h- SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16H5.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- SPBC16H5.14c SPBC16H5.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000854 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0006020 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.15) PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Figure 5) rbp1 also Figure 7 PomBase SPCC622.09 FYPO:0006020 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Figure 5) rbp1 also Figure 7 PomBase SPCC622.09 FYPO:0002922 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Figure 2b) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002922 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:40402811 4896 2025-11-06 (Fig. 2) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002922 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000082 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005226 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC622.09) PMID:26518661 4896 2019-07-23 PomBase SPCC622.09 FYPO:0003151 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 At 37 ̊C, only marginal changes in Lsd1 protein levels were observed in H3K4R and H2B-K119R mutants (Fig 6D). However, a significant reduction of Lsd2 was seen in both H3K4R and H2B K119R mutants (Fig 6E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4G) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001324 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4H) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0004161 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12),assayed_region(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPAC821.09) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001117 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPBC887.17) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001355 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001122 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Fig. 1D) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002913 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000291 high PMID:31837996 4896 2021-07-16 PomBase SPCC622.09 FYPO:0002913 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 1, 2 and 4) Supplementary Fig S1, S3 and S5 PomBase SPCC622.09 FYPO:0005071 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:17363370 4896 2021-09-13 Interestingly, the H2B-K119R mutation significantly enhanced silencing of the otr1::ura4+ (Fig. 5A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007835 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC609.05) PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0007835 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.19) PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0007836 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0007347 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Supplementary Fig S7) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001509 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.02c) PMID:32496538 4896 2020-07-21 (Supplementary Fig S7) PomBase SPCC622.09 FYPO:0006986 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-23 (Figure 2) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001984 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4F) PomBase SPCC622.09 FYPO:0007834 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC609.05) PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0007834 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.19) PMID:31837996 4896 2021-07-22 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000095 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:27098497 4896 2016-08-11 PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 K120R Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K119R H2B-K119R amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 7K) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000161 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC613.04c FYPO:0007127 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 9) PomBase SPCC613.04c FYPO:0006025 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPCC613.04c FYPO:0002998 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 8) PomBase SPCC613.04c FYPO:0001008 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC613.04c FYPO:0007603 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 low PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPCC613.04c FYPO:0004044 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC613.04c FYPO:0002061 G688E Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC613.04c FYPO:0001368 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 8) PomBase SPCC613.04c FYPO:0002559 G688E Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 8) PomBase SPCC613.04c FYPO:0002060 G688E Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 rng3 rng3-65 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000655 1-159,161-1019 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-160-317 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:15471884 4896 2018-04-05 PomBase SPAC22E12.17c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glo3 glo3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22E12.17c FYPO:0002061 deletion 972 h- glo3 glo3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22E12.17c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 glo3 glo3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000400 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0003485 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2024-03-18 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000839 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001387 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:16738311 4896 2014-12-23 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000969 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000957 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001839 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000088 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:8887553 4896 2013-02-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000088 G57E Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-P11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:10757807 4896 2015-05-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0008380 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 4A) PomBase SPBC216.07c FYPO:0004422 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000390 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S235) PMID:34296454 4896 2021-10-28 For the Torin1-resistant mutant, the phosphorylation levels remained constant throughout the time course PomBase SPBC216.07c FYPO:0004422 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000390 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S235) PMID:34296454 4896 2021-10-28 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004422 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000390 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S236) PMID:34296454 4896 2021-10-28 For the Torin1-resistant mutant, the phosphorylation levels remained constant throughout the time course PomBase SPBC216.07c FYPO:0004422 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000390 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S236) PMID:34296454 4896 2021-10-28 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002085 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000390 PMID:34296454 4896 2021-10-28 PomBase SPBC216.07c FYPO:0005193 G2040D Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-G2040D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000390 PMID:34296454 4896 2021-10-28 PomBase SPAC806.08c FYPO:0001350 deletion 972 h- mod21 mod21delta deletion ECO:0001232 low PMID:17021256 4896 2015-04-23 PomBase SPAC806.08c FYPO:0006336 deletion 972 h- mod21 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assayed_protein(PomBase:SPBC365.15) PMID:27053664 4896 2024-03-13 PomBase SPAC806.08c FYPO:0002967 deletion 972 h- mod21 mod21delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.15c) PMID:27053664 4896 2024-03-13 PomBase SPAC806.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mod21 mod21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.08c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mod21 mod21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.08c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph mod21 mod21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mod21 mod21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC806.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mod21 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h- mod21 mod21delta deletion ECO:0005638 PMID:17021256 4896 2015-04-23 PomBase SPAC806.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- mod21 mod21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC806.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mod21 mod21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC806.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- mod21 mod21delta deletion ECO:0005638 PMID:17021256 4896 2015-04-23 PomBase SPAC806.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mod21 mod21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pma1 pma1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pma1 pma1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- pma1 pma1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1071.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pma1 pma1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1347.02 FYPO:0003412 ani1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ani1 ani1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0001407 L169P Overexpression 972 h- sdj1 sdj1-L169P amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26152728 4896 2015-07-21 PomBase SPCC736.14 FYPO:0004532 S265* Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-203 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 high PMID:11683390 4896 2016-10-25 (Fig. 7) PomBase SPCC736.14 FYPO:0003627 S265* Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-203 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11683390 4896 2016-10-25 (Fig. 7) PomBase SPCC736.14 FYPO:0003627 S265* Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-203 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11683390 4896 2016-10-25 (Fig. 7) PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0006296 F62S Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-F62S amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 H97A Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-H97A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0004161 T818E,T827E,T836E,T845E,T854E,T863E,T872E,T881E,T890E,T899E,T908E,T917E,T925E,T939E,T952E,T963E,T971E Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-CTD-T1E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC222.09) PMID:30282034 4896 2020-11-22 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0003138 deletion 972 h- mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:11405625 4896 2014-05-12 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0001914 deletion 972 h- mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0001232 PMID:11405625 4896 2014-05-14 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0003066 deletion 972 h- mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0001232 PMID:11493649 4896 2015-07-16 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0003066 deletion 972 h- mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:11405625 4896 2014-05-12 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0000584 deletion 972 h- mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:11405625 4896 2014-05-13 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0005412 deletion 972 h- mfr1 mfr1delta mfr1-D deletion ECO:0000112 PMID:21389117 4896 2016-04-21 PomBase SPBC1198.12 FYPO:0000587 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PomBase SPCC1020.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dcr2 dcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dcr2 dcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- dcr2 dcr2delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPCC1020.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- dcr2 dcr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1020.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dcr2 dcr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dcr2 dcr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003431 V24R Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:19362535 4896 2024-02-13 and the V24R mutant abolished the specificity of the chromodomain interaction for K9 methylated peptides (Kd > 500 mM). PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002835 V24R Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24R amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:19362535 4896 2024-02-13 While chp1D and chp1CDD cells lack centromeric siRNAs, they were present in all other mutants with the exception of V24R. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0003412 V24R Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19362535 4896 2024-02-13 Interestingly, cells expressing most of the mutant alleles of chp1 showed no defect in heterochromatin assembly as measured in this assay (Figure 3A), with the exception of the double mutant E23V V24M and the V24R chp1 mutant, which did show silencing defects. PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0004982 V24R Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-V24R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19362535 4896 2024-02-13 Interestingly, cells expressing most of the mutant alleles of chp1 showed no defect in heterochromatin assembly as measured in this assay (Figure 3A), with the exception of the double mutant E23V V24M and the V24R chp1 mutant, which did show silencing defects. PomBase SPAC7D4.04 FYPO:0006295 522-583,F526A Not assayed or wild type 972 h- atg11 atg11(522-583)F526A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:32909946 4896 2020-09-17 PomBase SPCC330.05c FYPO:0006118 wild type Overexpression 972 h- ura4 ura4+ wild_type ECO:0005638 PMID:12172965 4896 2017-07-12 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002861 N165A Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-N165A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24322298 4896 2015-11-28 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 S87A,T94A,S136A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S136A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 S87A,T94A,S136A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S136A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPAC1002.10c FYPO:0001355 wild type Knockdown 972 h- sgt1 sgt1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:16408318 4896 2021-10-04 PomBase SPAC1002.10c FYPO:0001357 wild type Knockdown 972 h- sgt1 sgt1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000256 PMID:16408318 4896 2021-10-04 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002239 T78D Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-T78D amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- gsf2 gsf2+ wild_type ECO:0005638 PMID:23236291 4896 2016-07-08 (Figure 8D) PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000155 wild type Overexpression 972 h- gsf2 gsf2+ wild_type ECO:0005638 PMID:22180499 4896 2017-10-20 PomBase SPAC17C9.05c FYPO:0001117 S235A Not assayed or wild type 972 h- pmc3 med27-S235A med27* amino_acid_mutation ECO:0000291 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h- dhp1 dhp1deltaN1-91 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:11238999 4896 2014-07-01 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0002101 K547A Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1-K547A rqh1-hd amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:12724426 4896 2013-05-09 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000091 K547A Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1-K547A rqh1-hd amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22313747 4896 2015-11-05 PomBase SPAC2G11.12 FYPO:0000268 K547A Not assayed or wild type 972 h- rqh1 rqh1-K547A rqh1-hd amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 L135A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L135A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 L135A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-L135A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 low PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0003363 S125P Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8-S125P 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PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- prp17 prp17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- prp17 prp17delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- prp17 prp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp17 prp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prp17 prp17delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 S402A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S402A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 S402A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S402A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 S403A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S403A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 S403A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-S403A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 A193T Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-A193T amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001933 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000260 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FYPO:0006241 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000326 PMID:28806726 4896 2017-10-17 inhibition of origin firing requires intra-S checkpoint (Fig. 5) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003067 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006436 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:23071723 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005165 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:17304223 4896 2015-12-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005165 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:17304223 4896 2015-12-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004188 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004550 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) 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deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001324 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002976 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003068 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.04c) PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006321 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 medium assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005338 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAP14E8.02) PMID:31719112 4896 2020-03-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002098 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001982 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000170 PMID:18093330 4896 2019-08-15 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003923 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003923 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 PMID:28806726 4896 2017-10-12 (Table S1) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006240 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000211 PMID:28806726 4896 2017-10-12 replication forks slow independently of intra-S checkpoint (Fig. 6) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007255 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006242 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000211 PMID:28806726 4896 2017-10-12 replication forks stall with partial dependence on intra-S checkpoint (Fig. 6) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006242 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000277 PMID:28806726 4896 2017-10-12 replication forks stall with partial dependence on intra-S checkpoint (Fig. 6) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006242 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000326 PMID:28806726 4896 2017-10-17 replication forks stall with partial dependence on intra-S checkpoint (Fig. 6) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003815 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 high PMID:28806726 4896 2017-10-12 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002975 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002975 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002975 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002975 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002975 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003142 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003142 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPCC553.07c) PMID:12514100 4896 2014-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0009109 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000434 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006372 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005292 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.13) PMID:11313455 4896 2016-02-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000274 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000274 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000268 high PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000614 deletion 972 h- cdc10-M17 cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000170,FYECO:0000288 PMID:12062100 4896 2021-09-23 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002608 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000455 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high PMID:18180284 4896 2015-11-27 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006678 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000092 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007550 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000260 high PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007550 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19158664 4896 2020-12-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005296 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000092 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000972 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 low PMID:12930957 4896 2016-02-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000972 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000092 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:30148840 4896 2018-09-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002573 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 PMID:28806726 4896 2017-10-12 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001249 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:22024164 4896 2016-06-07 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007068 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 PMID:18093330 4896 2019-08-16 (Fig. 8) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007068 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 PMID:17304213 4896 2019-08-16 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004189 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007551 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.10) PMID:19158664 4896 2020-12-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002096 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002096 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26746798 4896 2017-10-21 (Fig. 2C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002096 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002096 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 4) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001038 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001038 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007814 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 high PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005704 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10567589 4896 2019-02-22 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005704 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000378 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001929 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 PMID:10567589 4896 2019-02-22 (Fig. 3c) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001929 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000337 PMID:11988741 4896 2014-01-06 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001929 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001929 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003118 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003118 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004286 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000049 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006371 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-07 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007479 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000049 PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. S1I) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000969 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18769921 4896 2016-09-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000969 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000969 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15367656 4896 2020-02-17 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001690 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001690 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3B) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24478943 4896 2016-03-31 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000957 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000957 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0010017 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0010017 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0007249 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:15367656 4896 2020-02-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000478 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004667 deletion 972 h- mat gene-induced haploid meiosis, nda3-K311 cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:34851403 4896 2023-06-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003613 deletion 972 h- mat gene-induced haploid meiosis, nda3-K311 cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:34851403 4896 2023-06-10 Additionally, the DNA replication checkpoint function of Mrc1 is not required for sister kinetochore association, because deletion of cds1, which encodes an effector kinase functioning downstream of Mrc1 in the DNA replication checkpoint pathway (Alcasabas et al., 2001; Murakami and Okayama, 1995; Tanaka and Russell, 2001), did not affect the kinetochore association state or sister chromatid segregation (Fig. 3C,E; Fig. S2C). PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0008078 deletion 972 h- mat gene-induced haploid meiosis, nda3-K311 cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 PMID:34851403 4896 2023-08-17 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005180 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 PMID:15498101 4896 2016-01-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006437 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:23071723 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006865 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:28775153 4896 2019-04-24 (Fig. 4C) DAPI staining. PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001513 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:32341083 4896 2020-05-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002043 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005181 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:17039252 4896 2016-01-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003144 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC553.07c) PMID:12514100 4896 2014-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003069 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003069 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17D4.02) PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003069 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.21c) PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003069 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC685.09) PMID:22682245 4896 2014-02-05 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005236 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPCC553.09c) PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002979 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 (Fig. 4) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002979 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 (Fig. 4) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001509 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.13) PMID:10683155 4896 2015-04-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002554 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:12930957 4896 2016-02-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005644 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005614 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005614 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002899 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 2B) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002099 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002099 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(S604) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002099 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002099 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002099 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:17189249 4896 2013-05-09 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003131 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005395 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12196391 4896 2016-05-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000703 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1952.07),assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 (Fig. 3a) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004252 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000226 PMID:24806966 4896 2014-06-11 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0005107 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:21518960 4896 2015-12-08 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003035 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002052 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002687 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002687 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003503 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003503 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001357 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001357 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3B) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0006272 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000059 PMID:17304213 4896 2019-08-16 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001103 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12181326 4896 2014-08-20 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001098 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000326 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000085 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 Interestingly, we found that dsk1Δ was highly sensitive to replication-associated DNA break agents like camptothecin (CPT), which is a topoisomerase I inhibitor, and was slightly sensitive to methyl methanesulfonate (MMS), which alkylates and breaks DNA during replication (Figure 1a and Figure S1c). PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000085 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0003384 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000257 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cds1 cds1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 high PMID:39094570 4896 2025-09-03 (Fig. S1I) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 1A) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:12181326 4896 2014-08-20 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22927644 4896 2013-08-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:14508607 4896 2015-01-15 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18753627 4896 2014-11-20 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19819763 4896 2015-03-27 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:12062100 4896 2021-09-23 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-03 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3B) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:16849602 4896 2015-12-16 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:10757807 4896 2015-05-07 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000106,FYECO:0000126 PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-10-21 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15367656 4896 2020-02-18 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5F) PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000107 deletion 972 h- cds1 cds1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase 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Knockdown 972 h- pho8 pho8-G475S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000173 PMID:31239353 4896 2019-08-05 reduced alkaline phosphatase activity and Pho8 dimerization (Figures 6C and 6D) PomBase SPBC1683.09c FYPO:0001857 (-138)-(-115) Not assayed or wild type 972 h- frp1 frp1(-115--138) partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 PMID:8321236 4896 2013-01-09 PomBase SPCC794.12c FYPO:0001117 T(-359)G,C(-358)T,C(-357)T,C(-356)A,T(-354)C Not assayed or wild type 972 h- mae2 mae2-UAS1 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC794.12c) PMID:10187772 4896 2014-06-06 PomBase SPBC1289.12 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 usp109 usp109delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.12 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 usp109 usp109delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1289.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- usp109 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assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T324A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19357077 4896 2014-02-04 PomBase SPAC1952.16 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rga9 rga9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.16 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rga9 rga9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.16 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rga9 rga9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.16 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rga9 rga9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1952.16 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rga9 rga9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 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PomBase SPBC16A3.08c FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- oga1 oga1+ wild_type ECO:0005638 PMID:23640107 4896 2013-05-07 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000089 K608E Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-K608E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 low PMID:24663817 4896 2020-02-22 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002262 1-96 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta96 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 1-96 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta96 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPBC13E7.05 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi14 gpi14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.05 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi14 gpi14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13E7.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- gpi14 gpi14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC13E7.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi14 gpi14delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0000895 E192Q Overexpression 972 h- yta4 yta4(EQ) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37590302 4896 2023-08-30 Yta4(EQ) impaired the formation of Dnm1 foci on mitochondria but unexpectedly caused mitochondria to aggregate (Figs 4D and S1C) PomBase SPCC24B10.10c FYPO:0003768 E192Q Overexpression 972 h- yta4 yta4(EQ) amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11G11.01) PMID:37590302 4896 2023-08-30 showed that the delocalized GFP-Fis1 appeared to be present in the cytoplasm of Yta4-overexpressing cells, while GFP-Fis1 in Yta4(AA)-overexpressing or Yta4 (EQ)-overexpressing cells was still present on mitochondria, which were clearly separated from the ER (S1D and S2 Figs). PomBase SPCC613.04c FYPO:0004736 L483P Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-A3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 9) PomBase SPCC613.04c FYPO:0000161 L483P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 rng3 rng3-A3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC613.04c FYPO:0002998 L483P Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-A3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 8) PomBase SPCC613.04c FYPO:0002061 L483P Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 rng3 rng3-A3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC613.04c FYPO:0001368 L483P Not assayed or wild type 972 h- rng3 rng3-A3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 8) PomBase SPCC613.04c 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between wis2+-deleted cels (wis2A) and wild-type cels,over a range oftemperatures from 20 to 36°C. PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wis2 wis2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- wis2 wis2delta deletion ECO:0005638 PMID:8599928 4896 2025-04-05 Tetrad analysis showed that all four haploid spores of the heterozygous diploid produced colonies at 28°C, indicating that the wis2+ gene is non-essential for viability under normal growth conditions. PomBase SPAC1B3.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wis2 wis2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001571 160-372 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002061 160-372 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27-D1 cdc27(1-159)|cdc27-1-159 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPBC106.07c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 nat2 nat2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC106.07c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nat2 nat2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 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2020-04-13 fig2 PomBase SPCC1919.05 FYPO:0006822 deletion 972 h- ski3 ski3delta SPCC1919.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:22624651 4896 2012-06-11 PomBase SPCC1919.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- ski3 ski3delta SPCC1919.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1919.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ski3 ski3delta SPCC1919.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1919.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ski3 ski3delta SPCC1919.05delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0001839 139-380 Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2delta(139-380) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:11129054 4896 2023-07-02 PomBase SPCC1259.03 FYPO:0002061 ura4+@AA39 Not assayed or wild type 972 h- rpa12 rpa12delta::ura4+ sprpa12delta::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:11254133 4896 2023-07-02 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002033 T392A,T415A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-TTAA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0001838 T392A,T415A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-TTAA amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0000776 T392A,T415A Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-TTAA amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC576.15c),assayed_substrate(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000705 L151R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L151R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002887 L151R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L151R amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPCC188.07 FYPO:0000703 L151R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L151R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC800.03),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:26365187 4896 2016-07-25 PomBase SPCC188.07 FYPO:0003106 L151R Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-L151R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000703 158-251 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(1-157) EAF(1-157aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.14c),assayed_using(PomBase:SPCC1223.10c) PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Table 3) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001234 158-251 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(1-157) EAF(1-157aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 3b) PomBase SPMIT.05 FYPO:0007122 deletion 972 h- cob1 cob1delta deletion ECO:0000059 high PMID:22349564 4896 2021-01-27 absent respiratory complex III. Figure 2D As expected, the higher molecular weight bands of complex III were absent in the Δppr4 mutant, which lacks complex IV PomBase SPMIT.05 FYPO:0007623 deletion 972 h- cob1 cob1delta deletion ECO:0000059 high PMID:22349564 4896 2021-01-27 absent respiratory complex III Figure 2D In both Δcbp6 and control Δcytb mitochondria, complex III was completely lacking (lanes 3 and 4) PomBase SPMIT.05 FYPO:0007624 deletion 972 h- cob1 cob1delta deletion ECO:0000059 PMID:22349564 4896 2021-01-27 Δmss51 cells showed normal cytochrome b and c1 peaks, but cytochromes aa3 were not detectable. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000400 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071,FYECO:0000137 high PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 1) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006175 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02) PMID:25375240 4896 2017-08-04 (Figure 5E) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001269 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002033 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.04) PMID:20935472 4896 2015-02-12 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008047 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:36408846 4896 2023-02-03 clr4F449Y/clr4F449Y cells displayed strongly elevated H3K9me2 levels when in mitosis, while H3K9me3 was absent (Figs 2A and EV3A). PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001382 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000071 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 2C) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000940 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 high assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Table 2) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000940 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 high assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Table 2) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005672 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:19696784 4896 2017-08-07 (Figure 5) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006185 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:19696784 4896 2017-08-07 supplementary Fig S6 online PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002679 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.02) PMID:34402513 4896 2021-07-26 (Figure 2D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005577 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:36408846 4896 2022-11-28 Upon inhibition of Cdk1-as, Clr4S458 phosphorylation rapidly decreased and was undetectable 3 h postinhibition, whereas Clr4 phosphorylation levels remained unaffected in cdk1+ cells (Figs 6D and EV5D). PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000170,FYECO:0000244 medium assayed_using(PomBase:SPBC649.05),residue(T75) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 4A) . PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000223 PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001355 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000223 high PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 2E) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002536 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000223 PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008106 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000244,FYECO:0000422 medium PMID:37128864 4896 2023-06-10 The N/C ratio was also reduced but not significantly different from that of stationary phase cells (Fig. 1E; Fig. S1G), suggesting that the observed nuclear size differences from stationary phase originate from the cell size differences. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008048 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:36408846 4896 2022-11-28 This revealed reduced H3K9me2, but increased H3K9me3 levels upon 1-NM-PP1 addition in cdk1-as cells specifically (Fig 6F) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004635 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 6B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000252 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Table 1) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004162 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000244,FYECO:0000422 medium PMID:37128864 4896 2023-06-08 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0007664 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000371 11 PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 3B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0007664 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000071 complete PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 3B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006832 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 4E and F) Inactivation of Cdc2 kinase in early mitosis induces a very premature septation onset. ATP-analogue sensitive cdc2-asM17 mutant cells carrying Cdc13-GFP were G2-arrested by growth in the presence of 1 μM1-NP-PP1 for 3.5 h at 32C. Then, the cells were G2-released by transfer to a fresh medium and imaged to detect the entry into mitosis. Cdc2 was inactivated during early mitosis transferring the cells to a fresh medium containing either DMSO or 10 μM1-NP-PP1. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002874 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Table 2) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002874 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Table 2) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004383 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.04) PMID:20935472 4896 2015-02-12 Thus, we conclude that Cdc2 activity prevents precocious localization of Mde4 to the metaphase spindle. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006824 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 5) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0007743 F84G Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-as cdc2.as|cdc2as|cdk1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071 PMID:18303049 4896 2024-08-12 (Fig. 6C) PomBase SPBC19C7.06 FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- prs1 prs1-hmt2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPBC19C7.06 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- prs1 prs1-hmt2 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC19C7.06 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- prs1 prs1-hmt2 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC19C7.06 FYPO:0006251 unknown Not assayed or wild type 972 h- prs1 prs1-hmt2 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000268) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC19C7.06 FYPO:0003031 unknown Not assayed or wild type 972 h- prs1 prs1-hmt2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPBC19C7.06 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- prs1 prs1-hmt2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPCC970.12 FYPO:0002061 T49A Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-818 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:24774534 4896 2019-01-29 (Fig. 6) PomBase SPCC970.12 FYPO:0001387 T49A Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-818 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:26921242 4896 2019-06-02 PomBase SPCC970.12 FYPO:0001357 T49A Not assayed or wild type 972 h- mis18 mis18-818 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26921242 4896 2019-06-02 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0002003 R184A,R185A,D186A,E187A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-R184A,R185A,D186A,E187A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(SO:0001851) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0000825 R184A,R185A,D186A,E187A Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-R184A,R185A,D186A,E187A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:15866870 4896 2015-06-12 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1071.09c FYPO:0001645 P33A Not assayed or wild type 972 h- djc9 djc9-P33A djc9-P60A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1071.09c),assayed_protein(PomBase:SPAC13G7.02c) PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S1G) PomBase SPAC1071.09c FYPO:0000088 P33A Not assayed or wild type 972 h- djc9delta djc9 djc9-P33A djc9-P60A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39878217 4896 2025-02-15 (Fig. S6A) PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 V17A,D101G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-RD3R-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G226C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G226C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G226C Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G226C nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0002854 unknown Not assayed or wild type 972 h- gcs1 gcs1-MN70 unknown ECO:0005801 PMID:2894829 4896 2013-11-10 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0002855 unknown Not assayed or wild type 972 h- gcs1 gcs1-MN70 unknown ECO:0005801 PMID:2894829 4896 2013-11-10 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0002722 unknown Not assayed or wild type 972 h- gcs1 gcs1-MN70 unknown ECO:0005801 PMID:2894829 4896 2013-11-14 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hif2 hif2delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hif2 hif2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0004045 deletion 972 h- hif2 hif2delta deletion ECO:0005638 PMID:22347452 4896 2024-06-12 (Figure 2c) PomBase SPCC1235.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- hif2 hif2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hif2 hif2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0004742 deletion 972 h- hif2 hif2delta deletion ECO:0000291 PMID:27538348 4896 2024-07-01 (Fig. 2) PomBase SPCC1235.09 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hif2 hif2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0004513 deletion 972 h- hif2 hif2delta deletion ECO:0005638 PMID:22347452 4896 2024-06-12 This reverse genetic approach identified a strain bearing a deletion in the annotated open reading frame, SPCC1235.09, which encodes a WD repeat domain protein (Figure 1). PomBase SPCC1235.09 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 hif2 hif2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 hif2 hif2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- hif2 hif2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hif2 hif2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1235.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hif2 hif2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1071.13 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1071.13 SPAC1071.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.13 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1071.13 SPAC1071.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.13 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1071.13 SPAC1071.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1071.13 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1071.13 SPAC1071.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000010 deletion 972 h- gsf2 gsf2delta deletion ECO:0000059 PMID:22098069 4896 2012-09-17 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0005504 deletion 972 h- gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000139 PMID:23236291 4896 2016-07-08 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000552 deletion 972 h- gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 PMID:22180499 4896 2017-10-20 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0001317 deletion 972 h- gsf2 gsf2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.06) PMID:23311928 4896 2014-04-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph gsf2 gsf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- gsf2 gsf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gsf2 gsf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1742.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gsf2 gsf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.13 FYPO:0002785 W27H Not assayed or wild type 972 h- rib4 rib4-W27H amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11856310 4896 2013-10-11 PomBase SPBC409.13 FYPO:0002809 W27H Not assayed or wild type 972 h- rib4 rib4-W27H amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11856310 4896 2013-10-11 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002687 701-735 Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1(1-700) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC777.05 FYPO:0001164 Q60L Not assayed or wild type 972 h- gtr2 gtr2-Q60L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPCC777.05 FYPO:0002060 Q60L Not assayed or wild type 972 h- gtr2 gtr2-Q60L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPAPB2B4.02 FYPO:0001164 1-27 Overexpression 972 h- grx5 grx5delta1-27 grx5D27 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15796926 4896 2014-08-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0003489 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 3) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000705 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:24663817 4896 2020-03-09 Consistent with the previous report [58], the interaction between Rad9 and Rad4 was dependent on Rad9 phosphorylation because the phosphorylation site mutant Rad9-T412A could not pull-down Rad4 (Fig. 5A, first lane on the left) and the interaction between Rad9 and Rad4 was sensitive to l-phosphatase treatment (Fig. S5A). PomBase SPAC664.07c FYPO:0000705 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 5) PomBase SPAC664.07c FYPO:0004464 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 4) PomBase SPAC664.07c FYPO:0002098 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T328) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(S423) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0002099 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(S604) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0003131 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 1) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000776 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(S423) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 3) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15155581 4896 2019-08-12 (Fig. 3) PomBase SPAC664.07c FYPO:0000089 T412A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-T412A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001001 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000620 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:3283148 4896 2013-03-19 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000620 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0003345 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:7622618 4896 2021-03-03 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000569 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000229 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:3283148 4896 2013-03-19 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0003165 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 30-40 PMID:33506191 4896 2021-02-09 (Fig. 1) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0003165 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2026-01-29 Often the chromosomes remained unseparated, despite the presence of a septum (Figure 4C, open triangles; Figure 4D, panel d), a phenotype also seen in nuc2-663ts PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0003165 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000082 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2297790 4896 2014-05-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000532 G504D Not assayed or wild type 972 h- cyr1delta, sxa2delta, h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 5A) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0005004 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.15c) PMID:9264466 4896 2015-11-18 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0005004 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.01c) PMID:9264466 4896 2015-11-18 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001355 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 high PMID:8978689 4896 2024-12-05 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0006571 G504D Not assayed or wild type 972 h- cyr1delta, sxa2delta, h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 5B) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001220 G504D Not assayed or wild type 972 h- cyr1delta, sxa2delta, h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 5C) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001220 G504D Not assayed or wild type 972 h- cyr1delta, sxa2delta, h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 5C) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001327 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001494 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0002252 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:3283148 4896 2013-06-08 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000895 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:3283148 4896 2013-03-19 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0007664 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8978689 4896 2024-12-05 (Figure 3A) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0006339 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 60-70 PMID:33506191 4896 2021-02-03 (Fig. 1) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0002048 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:7622618 4896 2013-07-18 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001096 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001315 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:7622618 4896 2013-07-18 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001310 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001984 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBPB8B6.04c) PMID:11058086 4896 2015-12-14 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000097 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:2297790 4896 2014-05-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0002080 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:9649518 4896 2016-04-19 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000732 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:3283148 4896 2013-01-25 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000280 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2297790 4896 2014-05-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0000280 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0003241 G504D Not assayed or wild type 972 h- nuc2 nuc2-663 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000229 PMID:9649518 4896 2016-04-19 Often the chromosomes remained unseparated, despite the presence of a septum (Figure 4C, open triangles; Figure 4D, panel d), a phenotype also seen in nuc2-663ts PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0007592 1-20 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaN20 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 3B) PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0003392 F39A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-F39A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.07) PMID:24870957 4896 2014-10-07 PomBase SPBC776.07 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mam33 mam33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- mam33 mam33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC776.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mam33 mam33delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0004998 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0001232 PMID:25492408 4896 2015-10-16 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0005128 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0001232 PMID:17927811 4896 2015-12-09 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002020 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1778.04) PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1778.04) PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC5D6.08c) PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1778.04) PMID:11405625 4896 2014-05-14 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0000411 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0005638 PMID:9528784 4896 2015-05-05 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0001317 wild type Overexpression 972 h- mei4 mei4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.12) PMID:11405625 4896 2014-05-14 PomBase SPBC32H8.11 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4896 2017-04-28 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0002505 deletion 972 h- akr1 akr1delta deletion ECO:0000059 high assayed_protein(PomBase:SPAC13C5.03) PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph akr1 akr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph akr1 akr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0002151 deletion 972 h- akr1 akr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 77 PMID:36650056 4896 2023-02-06 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 akr1 akr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0004796 deletion 972 h- akr1 akr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:36650056 4896 2023-01-29 PomBase SPAC2F7.10 FYPO:0002501 deletion 972 h- 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S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:28103117 4896 2017-03-23 (Fig. 3a) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0004449 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001807 high assayed_enzyme(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 1c) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0004474 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 3b) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000833 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 3a) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0000644 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22665807 4896 2017-12-04 PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001232 high medium PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 1d) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001232 high high PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 1d) PomBase SPAC24H6.05 FYPO:0003481 S3A,S66A,S84A,T89A,T104A,S113A,S118A,S143A,S308A,S332A,S334A,T351A,T379A Not assayed or wild type 972 h- cdc25 cdc25-13A amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:22665807 4896 2017-12-04 (Fig. 4b) PomBase SPAC1093.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- cca1 cca1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1093.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cca1 cca1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1093.04c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cca1 cca1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0001355 R105I Not assayed or wild type 972 h- mis19 eic1-R105I amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29804820 4896 2023-04-01 PomBase SPCC1393.13 FYPO:0003267 D252A Not assayed or wild type 972 h- duf89 duf89-D252A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 12B) PomBase SPCC1393.13 FYPO:0002085 D252A Not assayed or wild type 972 h- duf89 duf89-D252A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:36882296 4896 2023-04-11 (Fig. 12A) PomBase SPBC409.07c FYPO:0005947 C537S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C537S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-13 (Fig. 4B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0000087 C537S Not assayed or wild type 972 h- wis1 wis1-C537S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:31932483 4896 2020-04-12 (Fig. 4B) PomBase SPCC737.09c FYPO:0004370 deletion 972 h- hmt1 hmt1delta deletion ECO:0000335 PMID:19001374 4896 2015-02-09 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr hmt1 hmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC737.09c FYPO:0002829 deletion 972 h- hmt1 hmt1delta deletion ECO:0000335 PMID:20937798 4896 2015-10-05 PomBase SPCC737.09c FYPO:0004369 deletion 972 h- hmt1 hmt1delta deletion ECO:0000335 PMID:20937798 4896 2015-10-05 PomBase SPCC737.09c FYPO:0004369 deletion 972 h- hmt1 hmt1delta deletion ECO:0000335 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2023-06-28 PomBase SPCC737.09c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hmt1 hmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph hmt1 hmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000327 deletion 972 h- hmt1 hmt1delta deletion ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hmt1 hmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 hmt1 hmt1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000096 deletion 972 h- hmt1 hmt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16849797 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PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003440 1-804 Knockdown 972 h- ync13 ync13-805-1237 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 medium PMID:30044717 4896 2019-05-10 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0003440 1-804 Knockdown 972 h- ync13 ync13-805-1237 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 complete PMID:30044717 4896 2019-05-10 PomBase SPAC11E3.02c FYPO:0006880 1-804 Knockdown 972 h- ync13 ync13-805-1237 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.02c) PMID:30044717 4896 2019-05-10 (Fig. S2C,E) PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0001491 E33V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-03 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 E33V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 E33V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPAC3A12.14 FYPO:0002060 E33V,E106V,E142V Overexpression 972 h- cam1 cam1-E2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:7657644 4896 2013-06-02 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0000705 234-351 Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC8F11.07c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.02) PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 299-778 Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2(1-298) partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.05),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPSNRNA.04 FYPO:0002061 66-81 Not assayed or wild type 972 h- snu4 snu4-3 snu4.3 partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 PMID:1441744 4896 2014-06-19 PomBase SPBC146.09c FYPO:0008210 841-1000 Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_region(SO:0000167) PMID:38181050 4896 2024-04-19 Notably, the localizations of Lsd1 and Lsd2 are diminished at the promoter regions in the absence of a functional C-terminus (Fig 1C). This result demonstrates that the C-terminal domains of Lsd1 and Lsd2 are involved in their chromatin binding at these regions. PomBase SPBC146.09c FYPO:0008211 841-1000 Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 Intriguingly, about 72% of downregulated genes in lsd1-ΔHMG, lsd2-ΔC, and set1Δ are antisense non-coding RNAs (S1 Table) PomBase SPBC146.09c FYPO:0000703 841-1000 Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.08c),assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-04-19 We also observed that the loss of the C-terminus of Lsd2 does not disrupt the interactions between Lsd2 and Phf1 (Fig 1F) or Phf2 (Fig 1G). PomBase SPBC146.09c FYPO:0000703 841-1000 Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-deltaHMG partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.07c) PMID:38181050 4896 2024-05-07 We also observed that the loss of the C-terminus of Lsd2 does not disrupt the interactions between Lsd2 and Phf1 (Fig 1F) or Phf2 (Fig 1G). PomBase SPBC337.12 FYPO:0000183 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001407 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000303 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002174 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:23658229 4896 2013-05-17 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000708 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC359.02) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.03) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.06c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC330.03c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.08c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC750.07c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1289.14) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0001117 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F8.05) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000584 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002960 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:27365210 4896 2024-01-16 We chose to study mei4 + and ssm4 + transcripts because they both contain a DSR region (.........we observed an increase in mei4 + and ssm4 + transcripts during vegetative growth in cells containing red5-2 (Fig. 1D). PomBase SPBC337.12 FYPO:0002173 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:23658229 4896 2013-05-17 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002172 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:23658229 4896 2013-05-17 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.02) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC32A11.01) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC70.09c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.04) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.04) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1271.06c) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0000825 I234Y Not assayed or wild type 972 h- red5 red5-2 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PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0004161 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000245 PMID:25428589 4896 2022-12-02 In agreement with this, significantly less RNAPII associates with the nc-tgp1 transcription unit in both phosphate-starved wild-type cells and phosphate-replete 1343D cells, which do not transcribe nc-tgp1 (Fig. 4c). PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001355 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009007 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009007 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009007 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0007407 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-01 (repressed condition; Fig. 1c) PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009008 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009008 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009054 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000123,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001309 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001309 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0004163 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0004163 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001522 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000963 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000964 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 To determine whether the drug sensitivity of 1343D cells is a direct result of increased tgp1þ expression, the tgp1þ gene was deleted from 1343D cells (tgp1D1343D). This manipulation restored TBZ, HU and caffeine tolerance to levels comparable with wild-type cells (Fig. 1d). We conclude that increased tgp1þ expression is directly responsible for the drug-sensitivity phenotype of cells lacking ncRNA.1343. PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000441 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000441 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000441 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009031 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001029 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001029 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009047 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000371 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001453 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009035 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009035 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001103 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001103 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009050 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000725 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000725 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000725 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000725 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009046 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009039 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009043 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009043 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000077 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000077 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009044 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0001034 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000412 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0009010 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0007808 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000097 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0007927 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000410 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000785 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000087 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000087 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000087 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000088 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000089 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000138,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000089 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000089 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000111 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000091 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 high PMID:25428589 4896 2022-12-01 Cells lacking SPNCRNA.1343 (ncRNA.1343 for short) displayed a phenotype: hypersensitivity to TBZ, HU and caffeine but not to temperature extremities, ultraviolet-irradiation or oxidative stress (Supplementary Fig. 1c and Supplementary Fig. 2). PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0002701 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000390 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000268 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000115 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0000115 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1343 FYPO:0003656 deletion 972 h- ncRNA-1343 ncRNA-1343delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1751.01c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP gti1 gti1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0000705 1-401 Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-deltaRRM3a partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:14730023 4896 2014-08-05 PomBase SPBC146.07 FYPO:0000705 1-401 Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-deltaRRM3a partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC146.07),assayed_using(PomBase:SPCC962.06c) PMID:14730023 4896 2014-08-05 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002061 1-401 Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-deltaRRM3a partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:14730023 4896 2014-08-05 PomBase SPBC336.12c FYPO:0000703 S196D Not assayed or wild type 972 h- cdc10 cdc10-S196D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c),assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:9201720 4896 2018-06-09 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000705 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:26702831 4896 2016-02-02 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0005307 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.06c) PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC83.18c) PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002699 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0003339 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001365 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26702831 4896 2016-01-20 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002559 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001904 K163E Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-K163E amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:26702831 4896 2018-03-08 PomBase SPAC637.03 FYPO:0001309 deletion 972 h- SPAC637.03 SPAC637.03delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC637.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC637.03 SPAC637.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC637.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPAC637.03 SPAC637.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC637.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC637.03 SPAC637.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC637.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC637.03 SPAC637.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC637.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC637.03 SPAC637.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16.01 FYPO:0002297 wild type Overexpression 972 h- rho2 rho2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0001406 wild type Overexpression 972 h- rho2 rho2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0004104 wild type Overexpression 972 h- rho2 rho2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 high PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAC16.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- rho2 rho2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002290 552-665 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0000776 552-665 Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-10-11 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 1-70,181-659,S136A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d2-S136A B2d2-S136A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000226 FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 3) PomBase SPBC800.02 FYPO:0000470 deletion 972 h- whi5 whi5delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC800.02 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 whi5 whi5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC800.02 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 whi5 whi5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC800.02 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 whi5 whi5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 whi5 whi5delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC800.02 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph whi5 whi5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC800.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- whi5 whi5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC800.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 whi5 whi5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 whi5 whi5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85V Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGVGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, complements partially sde2Δ PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004249 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004249 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002128 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004250 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC222.19) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006148 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000049 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, in Δlam2 cells and Δgtr2 cells, basal isp5+ transcriptional activity and its activation induced by nitrogen depletion were abolished (Fig 4B). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001575 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001575 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000046 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000246 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000331 high PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In immunoblotting, the protein levels of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP, but not of GFP control vector, were reduced in Δlam2 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells, compared with wild-type cells (Fig 8C) PomBase SPBC1778.05c FYPO:0010009 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Whereas Cat1-GFP was present at the cell surface in wild-type cells, it was localized to intracellular punctate structures in Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 3B, EMM). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004457 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr2 cells and Δgtr1 cells, the nuclear localization of Gaf1-YFP was not observed within 30 min after nitrogen depletion. Although a subset of these mutant cells showed the nuclear locali- zation of Gaf1-YFP at 60 and 120 min, its nuclear localization appeared to be partial, compared with wild-type cells (Fig 4C). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004457 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006233 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC337.13c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δnpr2 cells and Δnpr3 cells, vacuoles were smaller, and the intensities of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP at vacuolar membranes were decreased, compared with wild-type cells (Fig 8A and 8B). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006233 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC777.05) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δnpr2 cells and Δnpr3 cells, vacuoles were smaller, and the intensities of Gtr1-GFP and Gtr2-GFP at vacuolar membranes were decreased, compared with wild-type cells (Fig 8A and 8B). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006233 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006233 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006233 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0006233 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001117 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr2 cells and Δgtr1 cells, the mRNA level of isp5+ was decreased, compared with wild- type cells (Fig 4A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001117 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0005118 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000781 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:26689777 4896 2025-11-16 The resultant Δlam2 cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates (Fig 1A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 The resultant Δlam2 cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates (Fig 1A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:26689777 4896 2025-11-16 The resultant Δlam2 cells grew slowly on EMM plates, and failed to grow on both YES and YPD plates (Fig 1A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000082,FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Exogenous addition of arginine to the EMM plates enhanced the cell growth of Δlam2 cells, Δgtr2 cells, Δgtr1 cells, Δnpr3 cells and Δnpr2 cells as well as wild-type cells, but did not rescue the defective cell growth of these mutant cells to the level of wild-type cells (S5 Fig). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002681 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells showed increased Rps6 phosphorylation under nitrogen depletion, compared with wild-type cells, especially at 15 min (Fig 5). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002681 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:26689777 4896 2025-11-16 By contrast, Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells showed increased Rps6 phosphorylation under nitrogen depletion, compared with wild-type cells, especially at 15 min (Fig 5). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002681 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002681 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000825 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC869.11) PMID:26689777 4896 2025-11-16 In Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells, the mRNA level of cat1+ was increased compared with wild-type cells (Fig 3A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000825 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001522 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001545 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 The canavanine resistance of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells was partially canceled by rapamycin treatment (Fig 3E, canavanine + Rapamy- cin). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001545 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 The canava- nine resistance of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells was completely canceled by Torin1 treatment (Fig 3E, canavanine + Torin). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002672 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0008372 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000069,FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 These intracellular punctate structures were abolished upon TORC1 inhibition by the com- bined treatment of rapamycin and caffeine (Fig 3B, Rapamycin + caffeine) PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004248 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.17) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0004248 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23D3.16) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000242 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001357 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201,FYECO:0000390 PMID:26689777 4896 2025-11-16 Both rapamycin (0.2 μg/ml) and Torin1 (2 μM) rescued the growth defects of Δlam2 cells, Δgtr1 cells and Δgtr2 cells (Fig 2A). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001029 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:26689777 4896 2025-11-16 Δlam2 cells, tetO7-lam2 cells, Δgtr2 cells, tetO7-gtr2 cells and Δgtr1 cells showed canavanine resistance (Fig 3D). PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001029 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27227887 4896 2017-09-27 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001029 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001453 deletion 972 h- lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1778.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph lam2 lam2delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC1556.08c FYPO:0007434 deletion 972 h- cbs2 cbs2delta deletion ECO:0001232 PMID:25639242 4896 2020-07-03 (Figure 4E) PomBase SPAC1556.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbs2 cbs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cbs2 cbs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.08c FYPO:0003743 deletion 972 h- cbs2 cbs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPAC1556.08c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph cbs2 cbs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.08c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph cbs2 cbs2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1556.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cbs2 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PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0004126 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000112 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001018 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0004127 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0002367 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000112 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0008248 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000708 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001324 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001324 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001324 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 loss of most members of the COMPASS complex, including Set1, Spp1, Swd1, Swd3, Swd2, and Ash2 leads to a significantly decreased amount of Lsd1 protein (Fig 3A) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001324 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 A similar pattern was observed in the Lsd2 samples, although the Lsd2 protein levels also decreased with shg1Δ (Fig 3B). PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001152 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001152 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.09c) PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001152 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001152 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.10c) PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000584 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000015 PMID:25252312 4896 2014-12-02 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ash2 ash2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0004689 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0005071 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC4D7.12c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC825.05c) PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0005917 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000238 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0006660 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ash2 ash2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001317 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009060 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 Table PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0004325 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ash2 ash2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ash2 ash2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0007358 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:32142608 4896 2020-05-01 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000087 deletion 972 h- ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC13G1.08c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ash2 ash2delta deletion ECO:0005638 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2023-02-23 PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0000268 deletion 972 h- pfl8 pfl8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0000115 deletion 972 h- pfl8 pfl8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pfl8 pfl8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- pfl8 pfl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl8 pfl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1F8.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pfl8 pfl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 C164G Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164G srp7-G-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 medium PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C164G Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164G srp7-G-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C164G Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164G srp7-G-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C164G Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164G srp7-G-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007449 F362A Overexpression 972 h- epr1 epr1-FFAT amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 3D) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000705 F362A Overexpression 972 h- epr1 epr1-FFAT amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08),assayed_using(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 3C) The 42-amino-acid Epr1-C region (residues 339-380), which is capable of Atg8 binding and contains the predicted FFAT motif, is sufficient for interacting with VAPs PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000705 F362A Overexpression 972 h- epr1 epr1-FFAT amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17C9.12),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 3C) The 42-amino-acid Epr1-C region (residues 339-380), which is capable of Atg8 binding and contains the predicted FFAT motif, is sufficient for interacting with VAPs PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0007446 F362A Overexpression 972 h- epr1 epr1-FFAT amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Fig. 3) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000843 F362A Overexpression 972 h- epr1 epr1-FFAT amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 6A) PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001081 pck1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pck1 pck1::ura4+ disruption ECO:0000335 PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001082 pck1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pck1 pck1::ura4+ disruption ECO:0000335 PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0002164 pck1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pck1 pck1::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000126 low PMID:10504305 4896 2013-05-17 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0002157 pck1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pck1 pck1::ura4+ disruption ECO:0005801 PMID:10504305 4896 2013-05-17 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0001164 pck1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- pck1 pck1::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:10504305 4896 2013-05-09 PomBase SPAC17G8.14c FYPO:0007078 pck1::ura4 Not assayed or 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PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph mvp1 mvp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3A11.06 FYPO:0003612 deletion 972 h- mvp1 mvp1delta deletion ECO:0005638 PMID:15189449 4896 2015-02-27 PomBase SPAC3A11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- mvp1 mvp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mvp1 mvp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mvp1 mvp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1183.06 FYPO:0007135 wild type Overexpression 972 h- ung1 ung1+ wild_type ECO:0000059 PMID:12810074 4896 2019-10-31 PomBase SPCC1183.06 FYPO:0000256 wild type Overexpression 972 h- ung1 ung1+ wild_type ECO:0000059 PMID:12810074 4896 2019-10-31 PomBase SPCC1183.06 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- ung1 ung1+ wild_type ECO:0001232 PMID:12810074 4896 2019-10-31 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000705 1-916 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-917-990 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.08c) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC23C4.19 FYPO:0000705 1-916 Not assayed or wild type 972 h- spt5 spt5-917-990 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19),assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11893740 4896 2017-05-05 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0007946 S4D,T18E,S20D,S166D,S251D,S266D Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-6D/E amino_acid_mutation ECO:0005801 low assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-01-12 (Fig. 2B). Dma1-6D/E auto-ubiquitination was modestly but reproducibly reduced relative to wild-type. Specifically, while 82% of wild-type Dma1 became ubiquitinated on at least one site, 71% of Dma1-6D/E did. PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0005227 S4D,T18E,S20D,S166D,S251D,S266D Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1-6D/E amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC244.01c) PMID:34674264 4896 2022-01-12 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0003762 S4D,T18E,S20D,S166D,S251D,S266D Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1-6D/E amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:34674264 4896 2022-04-08 (Fig. 4a) PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002967 S4D,T18E,S20D,S166D,S251D,S266D Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-6D/E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-04-08 Normal localization to medial cortical nodes, mitotic contractile ring, SPB, and septum as wild-type PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0002967 S4D,T18E,S20D,S166D,S251D,S266D Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 dma1 dma1-6D/E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:34674264 4896 2022-04-08 Localization to SPBs at the same level as wild-type during spindle stress PomBase SPCC338.17c FYPO:0001838 I67F Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-I67F rad21-K1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:29735656 4896 2019-05-20 (Figure 3c) PomBase SPAC1783.03 FYPO:0006926 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ fta2 fta2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPAC1783.03 FYPO:0002107 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fta2 fta2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.03 FYPO:0001489 deletion 972 h- fta2 fta2delta deletion ECO:0005638 PMID:16855021 4896 2014-12-16 PomBase SPAC1783.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- fta2 fta2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1783.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fta2 fta2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- fta2 fta2delta deletion ECO:0005638 PMID:16855021 4896 2014-12-16 PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0004753 500-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta133C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC15D4.01c FYPO:0005343 500-633 Not assayed or wild type 972 h- klp9 klp9-delta133C partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:31089172 4896 2019-06-05 (Figure 4A, B) PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001669 K635E,R640E,K643E Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M2 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000134,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:25771684 4896 2015-07-20 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001645 K635E,R640E,K643E Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M2 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.15c) PMID:25771684 4896 2015-07-20 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001245 K635E,R640E,K643E Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-M2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25771684 4896 2015-07-20 PomBase SPAC22E12.03c FYPO:0003404 E16A Not assayed or wild type 972 h- sdj1 sdj1-E16A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPAC9E9.05 FYPO:0001645 D303A Not assayed or wild type 972 h- sor1 sor1-D303A-Pk amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC10F6.09c),assayed_protein(PomBase:SPAC9E9.05) PMID:38830897 4896 2024-11-12 Sor1-D303A-Pk co-immunoprecipitated less efficiently with the Psm3-GFP protein, compared to wild-type Sor1- Pk, suggesting that the conserved residue D303 in the Sororin domain of Sor1 is important for the association of Sor1 with cohesin (Fig. 2d). PomBase SPBC354.13 FYPO:0002176 R354G Overexpression 972 h- rga6 rga6-R354G amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26960792 4896 2020-03-24 PomBase SPCC1223.07c FYPO:0001029 P308S Not assayed or wild type 972 h- drs1 drs1-P308S DY50491 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 medium PMID:38404922 4896 2024-10-14 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 deg1 deg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25651869 4896 2015-02-11 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC25B8.05 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 deg1 deg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC25B8.05 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wild type 972 h- htb1 htb1-E92D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003183 E93D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E92D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002923 E93D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E92D amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 E93D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E92D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 E93D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E92D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 E93D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E92D amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000091 E93D Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E92D 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FYPO:0000502 T167V Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-T167V amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000502 T167V Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-T167V amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:3796591 4896 2013-05-30 PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000705 151-300 Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-Nt nse4-1-150|nse4-N-terminal partial_amino_acid_deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC20F10.04c FYPO:0000705 151-300 Not assayed or wild type 972 h- nse4 nse4-Nt nse4-1-150|nse4-N-terminal partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.02c),assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c) PMID:17005570 4896 2016-08-22 (Fig. 1b) PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0005022 1-190 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHDdelta rng2-pdeltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:38041816 4896 2024-07-01 GFP-Rng2-CHDΔ behaved like the WT in all aspects (Figures 5E-5H), except for the loss of accumulation during the slow phase (Figure 5F, from −15 to 0 min). PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0001368 1-190 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHDdelta rng2-pdeltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0004097 1-190 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHDdelta rng2-pdeltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0004652 1-190 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHDdelta rng2-pdeltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:38041816 4896 2024-07-01 s. Surprisingly, the rng2- CHDΔ cells formed WT-like actin rings, as revealed by phalloidin staining (Figure 6A), despite the ability of CHD to bind F-actin.3 PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0006213 1-190 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHDdelta rng2-pdeltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:38041816 4896 2024-07-01 We found that the rng2-CHDΔ cells displayed similar cell and septum morphologies compared with the WT (rng2 +) cells at both temperatures (Figures 5B-5D and S4C). PomBase SPAC4F8.13c FYPO:0002060 1-190 Not assayed or wild type 972 h- rng2 rng2-CHDdelta rng2-pdeltaCHD partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23615450 4896 2019-10-17 PomBase SPBC947.11c FYPO:0006922 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-06-13 PCNA foci persist longer than normal, and form large bright patches before disappearing (Fig 2). PomBase SPBC947.11c FYPO:0006920 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-06-04 elg1∆ exhibits reduced direct repeat recombination associated with replication fork collapse at the RTS1 replication fork barrier PomBase SPBC947.11c FYPO:0007005 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-07-31 PomBase SPBC947.11c FYPO:0006925 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-06-13 (Fig. 5) PomBase SPBC947.11c FYPO:0006924 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-06-13 (Fig. 5) PomBase SPBC947.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0001740 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0000059 low PMID:34292936 4896 2021-08-11 PomBase SPBC947.11c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 elg1 elg1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC947.11c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 elg1 elg1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000969 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC947.11c FYPO:0001690 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-06-13 PomBase SPBC947.11c FYPO:0001690 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000963 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000089 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:31149897 4896 2019-06-13 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000089 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 low PMID:16040599 4896 2015-11-23 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC947.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC947.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elg1 elg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC947.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- elg1 elg1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-11-03 PomBase SPBC947.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 elg1 elg1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002134 AATTTGG_813-820_TTAAACC Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-m1 nucleotide_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003107 AATTTGG_813-820_TTAAACC Not assayed or wild type 972 h- ter1 ter1-m1 nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC22G7.11c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph cum1 cum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph cum1 cum1delta deletion ECO:0005638 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2024-05-15 (Fig. 3B and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0004562 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000160,FYECO:0000201 79 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000082 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000940 W900* Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002049 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000201 18 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3B and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0002049 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000160,FYECO:0000201 11 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0002967 W900* Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002967 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001357 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000105 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000114,FYECO:0000126 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0006836 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000214 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000086 W900* Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-i10 its10-1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000190 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 PMID:10233158 4896 2014-10-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000152 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 PMID:10233158 4896 2014-10-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC297.03 FYPO:0005206 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000220 PMID:25639242 4896 2016-01-12 (Figure 3F) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0004481 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001018 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 93 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0004463 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:22375066 4896 2015-02-23 PomBase SPCC297.03 FYPO:0004462 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:22375066 4896 2015-02-23 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001424 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0002678 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.06) PMID:29249658 4896 2018-03-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC297.03 FYPO:0002678 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),residue(T166) PMID:24508166 4896 2015-02-23 PomBase SPCC297.03 FYPO:0006711 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2e) PomBase SPCC297.03 FYPO:0006232 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2c) PomBase SPCC297.03 FYPO:0002289 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c),residue(T189) PMID:28515144 4896 2018-10-29 PomBase SPCC297.03 FYPO:0006709 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000166 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2d) PomBase SPCC297.03 FYPO:0006708 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2a) PomBase SPCC297.03 FYPO:0005036 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:25639242 4896 2016-01-12 (Figure 5a) PomBase SPCC297.03 FYPO:0007434 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 PMID:25639242 4896 2016-01-12 (Figure 3F) PomBase SPCC297.03 FYPO:0003535 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 PMID:10233158 4896 2014-10-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24451546 4896 2015-02-24 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC297.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000103 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC297.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000103 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPCC297.03 FYPO:0006712 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000303 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000303 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000708 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000059 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000470 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-05-09 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-05-09 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:25639242 4896 2016-01-12 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:22375066 4896 2015-02-23 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001128 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000584 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000584 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001122 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 high medium PMID:28281664 4896 2021-05-06 (Figure 2) PomBase SPCC297.03 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0006714 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0006713 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0003532 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003532 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001490 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001490 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:24451546 4896 2015-02-24 PomBase SPCC297.03 FYPO:0002061 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001019 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:26575035 4896 2017-09-13 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001397 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7628434 4896 2013-08-14 PomBase SPCC297.03 FYPO:0001294 deletion 972 h- leu1-32 ura4-D18 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113 70 PMID:10574765 4896 2017-04-24 (Figure 3) PomBase SPCC297.03 FYPO:0001395 deletion 972 h- leu1-32 ura4-D18 ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000113,FYECO:0000229 98 PMID:10574765 4896 2017-04-12 (Figure 2b) PomBase SPCC297.03 FYPO:0001164 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:28600551 4896 2018-10-25 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000833 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC297.03 FYPO:0002999 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:24508166 4896 2015-02-23 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000838 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:24451546 4896 2015-02-24 PomBase SPCC297.03 FYPO:0004450 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPACUNK12.02c) PMID:25081204 4896 2015-02-18 PomBase SPCC297.03 FYPO:0003824 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:28281664 4896 2021-05-06 (Figure 2) PomBase SPCC297.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000852 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC297.03 FYPO:0005968 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC297.03 FYPO:0005193 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 PMID:25639242 4896 2016-01-12 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000722 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10233158 4896 2014-10-28 PomBase SPCC297.03 FYPO:0000098 deletion 972 h- ssp1 ssp1delta deletion ECO:0005638 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SPNCRNA.1460 FYPO:0001501 deletion 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1460 FYPO:0000115 deletion 972 h- SPNCRNA.1460 SPNCRNA.1460delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC947.01 FYPO:0004700 D478A,E479A Not assayed or wild type 972 h- knk1 knk1-D478A,E479A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25422470 4896 2017-02-07 PomBase SPBC947.01 FYPO:0001587 D478A,E479A Not assayed or wild type 972 h- knk1 knk1-D478A,E479A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC947.01) PMID:25422470 4896 2017-02-07 PomBase SPCC970.08 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP kcs1 kcs1+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001357 T636A,T650A,S673A,S698A Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-4A690 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001357 T636A,T650A,S673A,S698A Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-4A690 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC24H6.06 FYPO:0001357 T636A,T650A,S673A,S698A Not assayed or wild type 972 h- sld3 sld3-4A690 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPCC736.11 FYPO:0006642 427-834 Overexpression 972 h- ago1 ago1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC24H6.05) PMID:17043360 4896 2024-06-05 (Fig. 4A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0001038 427-834 Overexpression 972 h- ago1 ago1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:17043360 4896 2024-06-05 (Fig. 4C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000650 427-834 Overexpression 972 h- ago1 ago1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:17043360 4896 2024-06-05 (Fig. 2) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000012 427-834 Overexpression 972 h- ago1 ago1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:17043360 4896 2024-06-05 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000088 427-834 Overexpression 972 h- ago1 ago1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000170 medium PMID:17043360 4896 2024-06-05 (Fig. 1B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000492 804-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta100 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 (Fig. 4B) PomBase SPBC1718.06 FYPO:0000636 804-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta100 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 Time-course measurements of the doubling times of these cultures showed that at day 5 the growth rate of strains expressing Msp1pK276A, Msp1pD50 and Msp1pD25 was greatly increased... (Fig. 4A). PomBase SPBC1718.06 FYPO:0002061 804-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta100 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:15710398 4896 2023-08-17 PomBase SPBC1718.06 FYPO:0003810 804-903 Overexpression 972 h- msp1 msp1delta100 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 On the contrary, even slight overexpression of Msp1pK276A, Msp1pD50 or Msp1pD25 induced mitochondrial fragmentation; in about 60% of the cells the mitochondria appeared as small more or less clustered individual dots. PomBase SPCC338.08 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ctp1 ctp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000006 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000112 PMID:21098122 4896 2014-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001118 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 59 PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0006087 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29215009 4896 2018-01-05 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005057 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000337 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.08 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.08 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000314 assayed_using(PomBase:SPBC1703.14c) PMID:19150433 4896 2017-02-03 PomBase SPCC338.08 FYPO:0006687 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000231 high PMID:21931565 4896 2018-09-18 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003660 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003912 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003912 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 high PMID:25533340 4896 2015-07-30 PomBase SPCC338.08 FYPO:0004287 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000126 PMID:28292918 4896 2017-04-11 PomBase SPCC338.08 FYPO:0002485 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000059 PMID:26130711 4896 2015-07-29 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005059 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000337 PMID:26130711 4896 2015-11-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001382 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPCC338.08 FYPO:0002474 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0002474 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:17936710 4896 2016-06-24 PomBase SPCC338.08 FYPO:0002474 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:21931565 4896 2018-09-18 PomBase SPCC338.08 FYPO:0004261 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:21098122 4896 2015-01-07 PomBase SPCC338.08 FYPO:0007532 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPCC338.08 FYPO:0003589 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29215009 4896 2018-01-05 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ctp1 ctp1delta deletion ECO:0005638 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high PMID:33683349 4896 2021-03-22 (Figure 4) PomBase SPBC582.03 FYPO:0001387 G282D Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-563 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:33683349 4896 2021-03-15 (Figure 4) PomBase SPBC582.03 FYPO:0006518 G282D Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-563 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002060 tea2(1-557)-GFP-myo52(926-1516) Not assayed or wild type 972 h- for3+ myo51+ myo52+ tea2 tea2N-GFP-myo52C tea2-N(1-557)-GFP-myo52-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002060 tea2(1-557)-GFP-myo52(926-1516) Not assayed or wild type 972 h- for3+ myo51+ myo52+ tea2 tea2N-GFP-myo52C tea2-N(1-557)-GFP-myo52-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPBC1604.20c FYPO:0002104 tea2(1-557)-GFP-myo52(926-1516) Not assayed or wild type 972 h- for3+ myo51+ myo52+ tea2 tea2N-GFP-myo52C tea2-N(1-557)-GFP-myo52-C fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22137473 4896 2020-01-20 PomBase SPCC645.06c FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-s44 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC645.06c FYPO:0000674 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-s44 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC645.06c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- rgf3 rgf3-s44 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:26702831 4896 2018-03-07 PomBase SPCC1393.12 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1393.12 SPCC1393.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1393.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC1393.12 SPCC1393.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1393.12 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1393.12 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SPBC21.06c FYPO:0003838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPBC21.06c FYPO:0006341 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 PMID:16141239 4896 2018-01-22 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001880 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:12456722 4896 2017-08-16 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001880 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2C4.14c) PMID:20826805 4896 2016-10-18 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002555 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000941 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000941 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC9G1.09) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000941 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC24C6.07) PMID:10775265 4896 2020-12-30 (Figure 4; Table I) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000941 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16325501 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0006825 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2024-07-10 In sharp contrast, on a cdc7-24 or sid1-239 mutant background, no Pmo25 was detected at the mitotic SPB(s) (Figure 8B and C). PomBase SPBC21.06c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPBC21.06c FYPO:0004562 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000201 10 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3A and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0004562 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000201 44 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3B and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0004562 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000160,FYECO:0000201 77 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0003440 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000082 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:20876564 4896 2024-05-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_enzyme(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004 PMID:8039497 4896 2013-10-24 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001382 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0000112 FYECO:0000005 PMID:8039497 4896 2013-10-24 PomBase SPBC21.06c FYPO:0003331 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0003331 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC821.12) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0003331 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 low assayed_enzyme(PomBase:SPAC821.12) PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000940 unknown Not assayed or wild type 972 h- 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1834.06c) PMID:16096637 4896 2014-04-25 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000940 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002822 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPBC428.13c) PMID:10769201 4896 2025-10-20 The spindle pole body signal was greatly reduced in intensity in cdc7-24, spg1-B8, and sid4-SA1 mutants at 36°C. PomBase SPBC21.06c FYPO:0004357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1E) In contrast, in cdc7-24, the hyperphosphorylated form of cdc11p (3) was greatly reduced, and the intensity of the hypophosphorylated forms (1 and 2) increased PomBase SPBC21.06c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001355 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000228 medium PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002049 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000201 15 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3B and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0002049 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000160,FYECO:0000201 12 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 3C and D) PomBase SPBC21.06c FYPO:0003776 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000102 PMID:23093943 4896 2021-03-26 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:22267499 4896 2023-02-04 (Figure 1A) PomBase SPBC21.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000012 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0003028 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001368 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 PMID:11870208 4896 2022-09-18 PomBase SPBC21.06c FYPO:0001368 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPBC21.06c FYPO:0005970 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000214 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0006004 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-21 data not shown PomBase SPBC21.06c FYPO:0003075 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17317928 4896 2017-08-16 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000833 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.11c) PMID:10459013 4896 2015-04-20 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002559 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.05c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002442 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC1778.06c) PMID:11694585 4896 2017-05-11 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002558 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:14602073 4896 2017-07-03 PomBase SPBC21.06c FYPO:0002967 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:11950932 4896 2023-11-06 The CAA20785 GFP fusion protein localized normally in cdc16-116, spg1-106, cdc7-24, and sid2-250 temperature-sensitive mutants...(Figure 3) PomBase SPBC21.06c FYPO:0002967 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:10805785 4896 2020-12-29 (Fig. 1c) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0003126 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12791993 4896 2017-04-21 data not shown PomBase SPBC21.06c FYPO:0002720 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPBC21.06c FYPO:0000105 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000114,FYECO:0000126 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000086 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 1) PomBase SPBC21.06c FYPO:0001234 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:22267499 4896 2023-02-04 (Figure 1A) PomBase SPBC21.06c FYPO:0000647 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc7 cdc7-24 unknown ECO:0005638 20 PMID:12242222 4896 2017-07-18 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000705 F444A Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-F444A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC26A3.02),assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:11805113 4896 2016-02-25 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0000256 F444A Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-F444A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:11805113 4896 2016-02-25 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0005297 F444A Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-F444A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:11805113 4896 2016-02-29 PomBase SPAC26A3.02 FYPO:0005298 F444A Not assayed or wild type 972 h- myh1 myh1-F444A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:11805113 4896 2016-02-29 PomBase SPCC645.05c FYPO:0007603 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000006 high PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPCC645.05c FYPO:0001645 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0004652 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0008207 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000006 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001357 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002177 764-774 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2deltaIQ1 myo2-deltaIQ1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 Y124YGVPHY Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-J6 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC1486.10 FYPO:0000780 wild type Overexpression 972 h- thi1 thi1+ wild_type ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1223.02) PMID:8163491 4896 2013-06-04 PomBase SPAC1486.10 FYPO:0000780 wild type Overexpression 972 h- thi1 thi1+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000106 assayed_using(PomBase:SPCC1223.02) PMID:8163491 4896 2013-06-04 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 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PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1604.12 SPBC1604.12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1834.02 FYPO:0003412 aro1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 aro1 aro1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0004670 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0000112 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000151 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:26696398 4896 2016-05-20 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000380 deletion 972 h- h- leu1-32 CFP-atg8::leu1+ atg7 atg7delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000127 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0004671 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0007602 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000127 PMID:33138913 4896 2021-01-11 By contrast, the atg7D and atg43DAIM mutants did not exhibit such an increased in superoxide (Figure 7D) PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0002615 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000230 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:23950735 4896 2013-09-15 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000584 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0006662 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 ~7 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4E) PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0008427 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC582.03) PMID:40395999 4896 2025-06-09 We investigated the levels of Cdc13 in these mutants under sulfur depletion, as with ecls∆ cells, 11 single- gene deletion mutants that did not display proper degradation were identi- fied (Fig. 1G). Interestingly, nine of these genes were Atg genes, suggesting that autophagy is required for Cdc13 degradation. PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0005598 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:26696398 4896 2016-08-09 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0005596 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:26696398 4896 2016-08-09 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000238 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0006660 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0001023 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:21247416 4896 2013-12-19 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0006785 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0006786 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000279 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 2D and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0003507 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000173 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 2D and Figure 2—Figure supplement 2) PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0008429 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:40395999 4896 2025-06-11 Cdc13 is degraded during sulfur depletion, but the levels of its binding partner Cdc2 did not change (Fig. 1F and 1G), suggesting autophagy selectively degrades Cdc13 but not Cdc2 in this condition. PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0007629 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000127 PMID:34147496 4896 2021-07-07 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph atg7 atg7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC6B1.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg7 atg7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph yip11 yip11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- yip11 yip11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yip11 yip11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19B12.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yip11 yip11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005781 1-457 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-458-676 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S2F) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005300 1-457 Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1-458-676 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24477934 4896 2020-05-31 (Fig. S2C,D,E) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007336 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-CDx2 mst2-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 4F) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0005845 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-CDx2 mst2-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 4E, 4G) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004577 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-CDx2 mst2-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S4B) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007633 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-CDx2 mst2-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 4C, 4H) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004377 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-CDx2 mst2-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC17G8.13c) PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. 4B) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004377 Chromodomain fusion Not assayed or wild type 972 h- mst2 mst2-CDx2 mst2-3xHA-CD-V5-CD fusion_or_chimera ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC1620.14c) PMID:39096900 4896 2025-06-24 (Fig. 4D) PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000082 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000082 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000655 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2E12.02),assayed_using(SO:0001850) PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0001037 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0001037 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0002806 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC2E12.02 FYPO:0000096 411-504 Not assayed or wild type 972 h- hsf1 hsf1delta411-504 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:10071222 4896 2014-02-19 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K68R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K68R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K68R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K68R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001671 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001529 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001531 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001571 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.07c),assayed_using(PomBase:SPBC428.16c) PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001164 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001524 V17G Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-V17G rhb1-RD3R-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPAPB8E5.05 FYPO:0002003 C(-177)A Not assayed or wild type 972 h- mfm1 mfm1-promoter(M-box-mut1) nucleotide_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.09) PMID:9233811 4896 2017-12-09 PomBase SPAPB8E5.05 FYPO:0005118 C(-177)A Not assayed or wild type 972 h- mfm1 mfm1-promoter(M-box-mut1) nucleotide_mutation ECO:0000049 high assayed_using(PomBase:SPAPB8E5.05) PMID:9233811 4896 2017-12-09 PomBase SPAC22F8.07c FYPO:0006603 K202KVWSLACCFIINIKKQ Not assayed or wild type 972 h- rtf1 rtf1-intron2NE amino_acid_insertion ECO:0000059 PMID:37615341 4896 2024-04-08 expression of an intron-less rtf1 gene that encodes the same additional 15 amino acids between residues 202-203 (Rtf1 intron2NE) does not provoke increased replication slippage downstream of RTS1 (Figure 4—Figure supplement 3), indicating that this protein is indeed dysfunctional. PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0001978 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-ts cut7ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:1538784 4896 2013-01-25 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002638 unknown Not assayed or wild type 972 h- cut7 cut7-ts cut7ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:11950879 4896 2015-03-18 PomBase SPBC1709.03 FYPO:0001423 25-318 Not assayed or wild type 972 h- vps3844 vps3844-delta25-318 partial_amino_acid_deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:39477503 4896 2024-11-08 1 showed that the signal peptide and the transmembrane including DUF3844 domain were 2 essential for this function (Fig. 4A). PomBase SPBC4.04c FYPO:0000444 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:7876346 4896 2014-04-17 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001343 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0000337 FYECO:0000006 PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001343 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:8298187 4896 2012-03-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:8298187 4896 2012-03-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000614 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:7876346 4896 2014-04-17 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001130 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:8838655 4896 2012-06-11 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:8298187 4896 2012-03-16 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000012 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005580 FYECO:0000006 PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000963 unknown Not assayed or wild type 972 h- mcm2 nda1-KM376 nda1-376 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:16849602 4896 2015-12-16 PomBase SPNCRNA.189 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.189 SPNCRNA.189+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC16G5.18 FYPO:0002061 deletion 972 h- erg24 erg24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16G5.18 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg24 erg24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16G5.18 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 erg24 erg24delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC14C4.11 FYPO:0003412 vtc2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 vtc2 vtc2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002678 Q89R,S147A,T149A,S151A Not assayed or wild type 972 h- mal3 mal3-Q89R,S147A,T149A,S151A mal3-89R,3A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.15) PMID:22134091 4896 2019-10-30 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0003411 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0000049 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0007532 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0006299 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0002336 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0003555 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0006319 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0000337 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0006986 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-23 (Figure 2) PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0001357 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27398807 4896 2016-08-26 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rfp1 rfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- rfp1 rfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19A8.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rfp1 rfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase 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2016-09-21 (Figure 1a) PomBase SPCC613.10 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 qcr2 qcr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0006141 deletion 972 h- qcr2 qcr2delta deletion ECO:0001232 PMID:33400299 4896 2021-01-20 (Figure 4b) PomBase SPCC613.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph 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transcriptional activity was dramatically increased in these 11 mitochondrial mutant strains (Figure 1i,j). PomBase SPCC613.10 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC613.10 FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph qcr2 qcr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 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apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 apm3 apm3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000674 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC651.11c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 apm3 apm3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001357 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27974503 4896 2017-01-09 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 apm3 apm3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000097 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000098 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 high PMID:34349749 4896 2024-12-15 ent3delta and apm3delta were slightly sensitive to high concentrations of KCl and KNO3 and were very sensitive to CaCl2. (Figure 8) PomBase SPBC651.11c FYPO:0003384 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPBC651.11c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0001214 deletion 972 h- apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 low PMID:34349749 4896 2024-12-15 (Figure 8) We found that apm1delta, gga22delta, and gga21delta gga22delta (denoted by ggadeltadelta in the Figure 8) were sensitive to both high concentrations of K+ salts and sorbitol (Figure 8), which showed that they were defective in growth under osmotic stress. PomBase SPBC651.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC651.11c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.11c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph apm3 apm3delta deletion ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPCC188.06c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:8382769 4896 2014-06-12 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000825 G159A,G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159A,G160A srp7-A-159,A-160 nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.98) PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 G159A,G160A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G159A,G160A srp7-A-159,A-160 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPAPYUK71.03c FYPO:0008455 704-823 Not assayed or wild type 972 h- tcb3 tcb3deltaC2C partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 low PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0009009 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000331 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0005258 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0009030 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000251 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0000073 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0007808 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.377 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.377 SPNCRNA.377+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001424 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000242 assayed_protein(PomBase:SPBC119.11c) PMID:34352089 4896 2023-01-04 Pac1 strain (Pac1-AA) that allowed rapid rapamycin-dependent nuclear exclusion of Pac1 (Figure 1B). PomBase SPBC119.11c FYPO:0007883 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 PMID:34352089 4896 2021-10-29 we observed a sharp decline in RNAPII occupancy inside the gene body, directly downstream of the Pac1- bound region located in the first half of the genes (Figure 2B, blue profile). In contrast, Pac1 nuclear exclusion resulted in extended RNAPII occupancy throughout the entire ORFs (Figure 2B, red profile). Such differences in RNAPII profiles are suggestive of Pac1-dependent premature termination. PomBase SPBC119.11c FYPO:0007883 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 PMID:34352089 4896 2021-10-29 PomBase SPBC119.11c FYPO:0001890 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000242 assayed_transcript(PomBase:SPBC530.02) PMID:34352089 4896 2021-10-28 PomBase SPBC119.11c FYPO:0003700 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000242 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.33) PMID:34352089 4896 2021-10-29 Pac1 nuclear exclusion specifically led to the accumulation of 5′-extended precursors of Pac1-bound C/D box snoRNAs (Supplementary Figure S3A). This accumulation was confirmed by Northern blot assays on three C/D box snoRNAs (sno16, snoU14 and snr79), whereas a control H/ACA box snoRNA (sno12) was unaffected PomBase SPBC119.11c FYPO:0003700 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000242 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:34352089 4896 2021-10-29 PomBase SPBC119.11c FYPO:0003700 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000242 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.54) PMID:34352089 4896 2021-10-29 PomBase SPBC119.11c FYPO:0000111 pac1-FRB-GFP Not assayed or wild type 972 h- rpl13-2xFKBP12 pac1 pac1-AA pac1-FRB fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000242 PMID:34352089 4896 2021-10-28 PomBase SPBC15D4.06 FYPO:0007841 N114A Not assayed or wild type 972 h- naa30 naa30-N114A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:34019809 4896 2021-09-05 PomBase SPBC428.18 FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- cdt1 cdt1+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:11532929 4896 2015-05-07 PomBase SPBC428.18 FYPO:0004598 wild type Overexpression 972 h- cdt1 cdt1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:11606752 4896 2019-08-07 PomBase SPBC428.18 FYPO:0001383 wild type Overexpression 972 h- cdt1 cdt1+ wild_type ECO:0005580 PMID:11606752 4896 2019-08-07 PomBase SPBC428.18 FYPO:0001428 wild type Overexpression 972 h- cdt1 cdt1+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:11532929 4896 2015-05-07 PomBase SPBP4G3.02 FYPO:0001068 S168F 972 h- pho1 pho1-304 pho1-281|pho1-310 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:3447747 4896 2012-05-16 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0003171 deletion 972 h- mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 PMID:8467814 4896 2014-08-08 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0000650 deletion 972 h- mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 60 PMID:8467814 4896 2014-08-08 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0002262 deletion 972 h- mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 PMID:8467814 4896 2014-08-08 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0002463 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0002411 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs2 mcs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcs2 mcs2delta deletion ECO:0005638 PMID:8467814 4896 2014-08-08 PomBase SPBP16F5.02 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mcs2 mcs2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 V227A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-V227A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 V227A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-V227A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC409.03 FYPO:0000089 S72D,S84D Not assayed or wild type 972 h- swi5 swi5-2D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:34208949 4896 2021-07-15 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001355 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001690 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 M91I Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E42 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 D133H Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-H133 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9862966 4896 2015-04-09 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001369 450-506,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 20 PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 3C,D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 450-506,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 20 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 3D) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001368 450-506,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 PMID:21376600 4896 2024-04-09 (Fig. 3) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002558 450-506,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-nsm amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:19427212 4896 2024-04-08 (Fig. 3A) PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002561 R135A,123-621 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1deltaCH1-ABS3-2A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 V85A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-13 (Fig. 1E) PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 V85A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-V85A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-10-06 (Fig. 1C) PomBase SPCC790.03 FYPO:0001422 A127D Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2-A127D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000135 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:27655872 4896 2016-09-30 (Fig. 8C, 8D) Western blot analysis show Sre1 cleavage defect under low oxygen PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000081 C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164T srp7-T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000252 medium PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164T srp7-T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164T srp7-T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C164T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C164T srp7-T-164 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:2657742 4896 2014-06-09 PomBase SPAC1952.13 FYPO:0003412 ned1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 ned1 ned1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000705 E262A Not assayed or wild type 972 h- Δpnu1[Δi] mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC5D6.12),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000705 E262A Not assayed or wild type 972 h- Δpnu1[Δi] mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAP8A3.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000705 E262A Not assayed or wild type 972 h- Δpnu1[Δi] mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC8C9.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.06) PMID:38499152 4896 2024-10-26 Immunoblot analysis of factions revealed that mutation of the DEAD-box of Mrh5 abolished the association of the cox1 mRNA with the mtSSU (Fig. 8). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0000342 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000252 high PMID:38499152 4896 2024-10-26 It is likely that the abolishment of Cox1 synthesis results in the downregulation of OXPHOS complexes. Consistent with these results, cells harboring mrh5D261A-Myc or mrh5E262A-Myc could not grow on glycerol-containing medium, suggesting that they are respiratory-deficient (Fig. S5). PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003915 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:38499152 4896 2024-10-26 These mutations also completely abolished Cox1 synthesis and decreased the synthesis of other mtDNA-encoded proteins (Fig. 5, B and C) PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0003423 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPMIT.01) PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPBC25D12.06 FYPO:0002056 E262A Not assayed or wild type 972 h- mrh5 mrh5-E262A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:38499152 4896 2024-10-26 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 K449A,K450A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K449A,K450A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 K449A,K450A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K449A,K450A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 K449A,K450A Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K449A,K450A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:10079327 4896 2014-06-13 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0004114 deletion 972 h- kap95 kap95delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap95 kap95delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- kap95 kap95delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- kap95 kap95delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kap95 kap95delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0002061 deletion 972 h- kap95 kap95delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 kap95 kap95delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPAC1B1.03c FYPO:0003612 deletion 972 h- kap95 kap95delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0003412 1-9 Knockdown 972 h- rss1 rss1-deltaN rex1BD-ND|rss1-ND partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 medium PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 2E) PomBase SPAC23C11.02c FYPO:0001645 R11D Not assayed or wild type 972 h- rps23 rps23-R11D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.02c),assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005743 S332A,S333A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S332A,S333A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPBC1D7.02c FYPO:0005748 S332A,S333A Not assayed or wild type 972 h- scr1 scr1-S332A,S333A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0006063 S873F Overexpression 972 h- mid1 mid1-18 mid1-S873F amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15385632 4896 2017-05-28 erexpression was the relative persistence of septin rings and the inhibition of mitotic progression, as determined by monitoring the formation of binucleates (Figure 8A). This result is consistent with our previous results, indicating that prolonged expression of Mid2p stabilizes septin ring structures and influences cell cycle progression (Tasto et al., 2003). erexpression was the relative persistence of septin rings and the inhibition of mitotic progression, as determined by monitoring the formation of binucleates (Figure 8A). This result is consistent with our previous results, indicating that prolonged expression of Mid2p stabilizes septin ring structures and influences cell cycle progression (Tasto et al., 2003). PomBase SPBC646.12c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- gap1 gap1+ wild_type ECO:0000059 high PMID:24147005 4896 2018-04-29 PomBase SPBC646.12c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- gap1 gap1+ wild_type ECO:0005638 high PMID:9133664 4896 2014-09-18 PomBase SPAC22E12.06c FYPO:0003447 gmh3::LEU2 Not assayed or wild type 972 h- gmh3 gmh3::LEU2+ disruption ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:9839953 4896 2019-01-09 PomBase SPBC428.13c FYPO:0006291 unknown Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-E9 unknown ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC19E9.02) PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 1g) PomBase SPBC215.11c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC215.11c SPBC215.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC215.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPBC215.11c SPBC215.11cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 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SPBC21C3.12c SPBC21C3.12cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC21C3.12c SPBC21C3.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21C3.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC21C3.12c SPBC21C3.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC21C3.12c SPBC21C3.12cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001584 1-507 Overexpression 972 h- mid1 mid1-delta1-507 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 Finally, Cter-GFP remained more concentrated at the new tip compared to the old tip in short cells after sister cell separation. [...] An association with the cell tips and septum region was never observed for wild-type mid1p and may either result from the truncation of mid1p or from the higher concentration of this construct. PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002718 1-507 Overexpression 972 h- mid1 mid1-delta1-507 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:15572668 4896 2024-04-10 Cter-GFP was then observed in the region of septum formation (Fig. 1B, 16 to 52 min), where it was probably associated with the ingressing plasma membrane of the cleavage furrow. [...] An association with the cell tips and septum region was never observed for wild-type mid1p and may either result from the truncation of mid1p or from the higher concentration of this construct. PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-507 Overexpression 972 h- mid1 mid1-delta1-507 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000006 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-507 Overexpression 972 h- mid1 mid1-delta1-507 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-507 Overexpression 972 h- mid1 mid1-delta1-507 mid1-Cter partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPBC146.09c FYPO:0000469 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003092 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC146.09c) PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003091 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC216.06c) PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003081 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 high PMID:23260662 4896 2014-02-13 PomBase SPBC146.09c FYPO:0001324 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:23260662 4896 2014-02-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0003085 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 medium PMID:23260662 4896 2014-02-12 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000963 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:23260662 4896 2014-02-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000085 E918* Not assayed or wild type 972 h- lsd1 lsd1-E918 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:23260662 4896 2014-02-05 PomBase SPBC146.09c FYPO:0000089 E918* Not 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assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-K164R amino_acid_mutation ECO:0000059 low PMID:28481910 4896 2017-05-15 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0005327 K164R Not assayed or wild type 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta pcn1 pcn1-K164R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0005332 K164R Not assayed or wild type 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta pcn1 pcn1-K164R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000912 K164R Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-K164R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09) PMID:16641370 4896 2016-03-09 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0005324 K164R Not assayed or wild type 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta pcn1 pcn1-K164R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:20452294 4896 2016-04-05 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0005330 K164R Not assayed or wild type 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta pcn1 pcn1-K164R amino_acid_mutation 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Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K25R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPCC306.04c FYPO:0002366 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000112 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1B) PomBase SPCC306.04c FYPO:0008248 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0008249 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c),assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 2A) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004689 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000231 high PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1E) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005071 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000231 low assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1D) PomBase SPCC306.04c FYPO:0004380 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 2C) PomBase SPCC306.04c FYPO:0005917 RRM1 domain deletion Knockdown 972 h- set1 set1-RRM1delta fusion_or_chimera ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 1F) PomBase SPBC32F12.11 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tdh1 tdh1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC32F12.11 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tdh1 tdh1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.11 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph tdh1 tdh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 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2023-06-28 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ade3 ade3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ade3 ade3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph ade3 ade3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ade3 ade3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ade3 ade3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6F12.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ade3 ade3delta deletion ECO:0005638 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SPBC32F12.09 FYPO:0001001 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000272 high PMID:7883794 4896 2019-02-27 (Figure 2B) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0005179 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005580 PMID:15498101 4896 2016-01-18 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003345 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000127 high PMID:8121488 4896 2021-02-17 (Fig. 2B) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003345 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000058 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000531 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high PMID:9614176 4896 2018-05-30 (Fig. 1A) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0006572 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 4) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000569 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000058 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001141 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000049 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000603 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000278 PMID:10036243 4896 2015-03-31 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002798 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:32361273 4896 2020-10-05 deletion mutants of either ste9 or rum1 fail to degrade Cdc13 (Figures S4A and S4B). PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003426 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.17c) PMID:9614176 4896 2018-06-06 (Fig. 6A) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0005773 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000126,FYECO:0000170 PMID:7883794 4896 2019-02-27 Data not shown PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0006571 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 3A) In absence of rum1 cdc2-cdc13 kinase activity remains high in presence of P factor PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001220 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 5C) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000674 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 PMID:8598285 4896 2014-08-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0006573 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:9614176 4896 2018-05-31 (Fig. 5C) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0004107 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4E9.02) PMID:10921876 4896 2014-12-01 (Fig. 3) ( PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0004107 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:10921876 4896 2014-12-01 (Fig. 3) ( PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0006574 deletion 972 h- cyr1delta, sxa2delta h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000039,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:9614176 4896 2018-06-08 (Fig. 4) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001420 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000398 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000127 high low PMID:8121488 4896 2021-02-17 (Table 1) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000280 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0000334 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000127 high low PMID:8121488 4896 2021-02-26 (Fig. 3a) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001491 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rum1 rum1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rum1 rum1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002177 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0005638 PMID:8598285 4896 2017-03-27 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002104 deletion 972 h- rum1 rum1delta deletion ECO:0001232 PMID:23843946 4896 2015-04-21 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0000082 deletion 972 h- spt4 spt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 high PMID:19460865 4896 2015-11-26 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0001407 deletion 972 h- spt4 spt4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:19460865 4896 2015-11-26 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0000470 deletion 972 h- spt4 spt4delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta spt4 spt4delta deletion ECO:0000049 medium PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- spt4 spt4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt4 spt4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.16c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spt4 spt4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.16c FYPO:0007336 unknown Not assayed or wild type 972 h- mtr4 mtr4-1 unknown ECO:0000049 PMID:17512405 4896 2024-01-18 However, we observed loss of silencing of mat3M:::ura4+ in cells carrying a hypomorphic allele of mtr4+ (mtr4-1, Figures 4F and 4H), suggesting the involvement of a TRAMP-like complex. PomBase SPAC6F12.16c FYPO:0004573 unknown Not assayed or wild type 972 h- mtr4 mtr4-1 unknown ECO:0000049 low assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:17512405 4896 2024-01-18 we observed a 3-fold increase in tlh1+ RNA levels in dcr1D cells and a 10-fold increase in mtr4-1 cells (Figures 4F and 4H), indicating that both RNAi and TRAMP contribute to the full silencing of this subtelomeric gene. PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC11E10.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC11E10.09c SPCC11E10.09cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19C2.02 FYPO:0001773 C81A Not assayed or wild type 972 h- pmt1 pmt1-C81A amino_acid_mutation ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.02) PMID:23074192 4896 2012-11-16 PomBase SPBC19C2.02 FYPO:0001768 C81A Not assayed or wild type 972 h- pmt1 pmt1-C81A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:23074192 4896 2012-11-16 PomBase SPBC19C2.02 FYPO:0001764 C81A Not assayed or wild type 972 h- pmt1 pmt1-C81A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:23074192 4896 2012-11-16 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0001457 deletion 972 h- SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16E9.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC16E9.15 SPBC16E9.15delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC664.02c FYPO:0000082 disruption Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:39387272 4896 2024-12-12 (Fig. 5E) PomBase SPAC664.02c FYPO:0004287 disruption Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8::ura4+ disruption ECO:0000049 medium PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5H) PomBase SPAC664.02c FYPO:0001355 disruption Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5E) PomBase SPAC664.02c FYPO:0004709 disruption Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8::ura4+ disruption ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 15 PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5G) PomBase SPAC664.02c FYPO:0000088 disruption Not assayed or wild type 972 h- arp8 arp8::ura4+ disruption ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 low PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. 5D) PomBase SPBC17D1.07c FYPO:0003066 858-949 Not assayed or wild type 972 h- npg1 npg1(1-857) npg1-857 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:25146394 4896 2014-09-05 PomBase SPBC17D1.07c FYPO:0003790 858-949 Not assayed or wild type 972 h- npg1 npg1(1-857) npg1-857 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC17D1.07c) PMID:25146394 4896 2014-09-05 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002085 D192K Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-D192K amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SC1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SC1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.06c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 spg1 sid3-SC1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC1565.02c FYPO:0001118 unknown Not assayed or wild type 972 h- rga10 rga10-GAPinactive unknown ECO:0001232 PMID:34006635 4896 2021-09-05 PomBase SPAC1565.02c FYPO:0001122 unknown Not assayed or wild type 972 h- rga10 rga10-GAPinactive unknown ECO:0001232 high PMID:34006635 4896 2021-09-05 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0000046 G15V,C199R Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V,C199R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:9781874 4896 2014-04-14 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001968 G15V,C199R Overexpression 972 h- rho1 rho1-G15V,C199R amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:9781874 4896 2014-04-14 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 oxs1 oxs1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0006349 deletion 972 h- oxs1 oxs1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:27664222 4896 2018-01-29 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000245 deletion 972 h- oxs1 oxs1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000096 deletion 972 h- oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 PMID:27664222 4896 2018-01-29 Supplementary Figure S1B PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000799 deletion 972 h- oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 PMID:27664222 4896 2018-01-29 Supplementary Figure S1B PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0000726 deletion 972 h- oxs1 oxs1delta deletion ECO:0005638 PMID:27664222 4896 2018-01-29 subcategory of oxidative stress known as GSH or disulfide stress (4). Indeed, a lower GSH/GSSG ratio was found after treatment with diamide or Cd (Supplementary Figure S4) in WT and in the SPBC29A10.12Δ strain PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- oxs1 oxs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxs1 oxs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A10.12 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oxs1 oxs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006586 A189L,G193L,S197L Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-TMD4sL amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC31G5.07) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPBC4.01 FYPO:0006585 A189L,G193L,S197L Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-TMD4sL amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPBC4.01 FYPO:0000708 A189L,G193L,S197L Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-TMD4sL amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPBC4.01 FYPO:0001645 A189L,G193L,S197L Not assayed or wild type 972 h- dni2 dni2-TMD4sL amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC4.01),assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-20 PomBase SPCC1450.12 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1450.12 SPCC1450.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.12 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1450.12 SPCC1450.12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.12 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1450.12 SPCC1450.12delta deletion 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4896 2023-03-03 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003743 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC74.03c FYPO:0003743 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000103 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC74.03c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001830 deletion 972 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972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001176 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000143,FYECO:0000144 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0006712 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC74.03c FYPO:0000303 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC74.03c FYPO:0000303 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000272 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0005742 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0004460 deletion 972 h- ssp2 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assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:32053662 4896 2020-03-23 (Fig. 6b, c) PomBase SPCC74.03c FYPO:0004457 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0005749 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.02c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-05-09 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000112 medium assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-05-09 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001838 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:25639242 4896 2015-12-18 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003032 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPAC13F5.03c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003032 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000054 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003032 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000054 high assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001152 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001152 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001152 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000584 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC74.03c FYPO:0000584 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000272 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003251 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000359 medium PMID:32053662 4896 2020-03-23 (Figure 5a-c) PomBase SPCC74.03c FYPO:0003251 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000360 medium PMID:32053662 4896 2020-03-23 (Figure 5a-c) PomBase SPCC74.03c FYPO:0000712 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005580 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000998 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 PMID:22375066 4896 2015-02-23 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0006979 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPCC74.03c FYPO:0006714 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC74.03c FYPO:0006713 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000335 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 5) PomBase SPCC74.03c FYPO:0004458 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0004459 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 PMID:22375066 4896 2015-02-19 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003532 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001038 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.12c) PMID:25639242 4896 2015-12-18 (Figure 2D,4B) PomBase SPCC74.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:28600551 4896 2018-10-25 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22140232 4896 2016-10-27 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003896 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000273 PMID:31562247 4896 2021-01-19 As shown in Fig. 5A, the changes in mitochondrial morphology were similar within 40 min of glucose starvation in the three mutant and WT cells PomBase SPCC74.03c FYPO:0003896 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:31562247 4896 2021-01-19 Indeed, no noticeable change in mitochondrial morphology or altered mitochondrion numbers were found in the three mutant cells cultured in glucose-rich EMM (Fig. 5, C and D). PomBase SPCC74.03c FYPO:0005035 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001420 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:22140232 4896 2016-11-01 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003824 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:28281664 4896 2021-05-06 (Figure 2) PomBase SPCC74.03c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000852 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC74.03c FYPO:0005968 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC74.03c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0005193 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 PMID:25639242 4896 2016-01-12 PomBase SPCC74.03c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009065 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001987 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1d) PomBase SPCC74.03c FYPO:0000107 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000324 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 PMID:28515144 4896 2018-10-29 PomBase SPCC74.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000091 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000280 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0005638 PMID:23370392 4896 2013-05-15 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000280 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 medium PMID:29079657 4896 2019-02-06 PomBase SPCC74.03c FYPO:0000280 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0000059 PMID:27604537 4896 2017-01-10 PomBase SPCC74.03c FYPO:0001492 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 low PMID:25639242 4896 2020-07-02 (Figure 2b) PomBase SPCC74.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC74.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC74.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssp2 ssp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002239 TS78AA Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-TS78AA amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 1-392,S566A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S566A,S650A B2d7-S566A-S650A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 1-392,S566A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S566A,S650A B2d7-S566A-S650A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPAC4G9.17c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrp5 mrp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.17c FYPO:0002061 deletion 972 h- mrp5 mrp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4G9.17c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrp5 mrp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.17c FYPO:0002199 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrp5 mrp5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.13c FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syf2 syf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.13c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 syf2 syf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3E7.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- syf2 syf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3E7.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ 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SPAC3A11.14c FYPO:0005709 G580E Overexpression 972 h- pkl1 pkl1-rigor(G580E) amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26031557 4896 2022-05-03 (Fig. S2) Pkl1md-GFP localized primarily to the spindle poles PomBase SPAC17C9.08 FYPO:0000160 wild type Overexpression 972 h- pnu1 pnu1+ wild_type ECO:0000059 PMID:18047809 4896 2012-04-27 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 1-1675 Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD.18 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.02c),assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.03),assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 1-1675 Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD.18 partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09),assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001179 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8- unknown ECO:0001232 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clr4-delta2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC428.08c),assayed_substrate(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:31468675 4896 2019-10-03 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0000705 1-150 Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-151-end(deltaN) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:29514920 4896 2018-07-02 (Fig. 2B) PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001492 1-150 Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-151-end(deltaN) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:29514920 4896 2018-06-27 (Figure 2D) (commment: Epistatic to cdr2delta) PomBase SPAC17A2.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph bsu1 bsu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph bsu1 bsu1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A2.01 FYPO:0000250 deletion 972 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ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05),assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.11c) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- zip1 zip1-sup9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPAC25G10.03 FYPO:0005488 unknown Not assayed or wild type 972 h- zip1 zip1-sup9 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000297 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcs6 mcs6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0005185 deletion 972 h- mcs6 mcs6delta deletion ECO:0001232 PMID:8557037 4896 2016-01-11 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcs6 mcs6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC19F8.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 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Consistently, clr6-1 mutant cells displayed a growth defect with proline as the nitrogen source, whereas hat1 cells grew normally (Fig. 1B). PomBase SPAC139.06 FYPO:0006752 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0000226 PMID:22771823 4896 2016-03-02 PomBase SPAC139.06 FYPO:0007315 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0000226 PMID:22771823 4896 2020-04-09 PomBase SPAC139.06 FYPO:0004742 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 PMID:22771823 4896 2016-03-02 PomBase SPAC139.06 FYPO:0002336 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 PomBase SPAC139.06 FYPO:0002336 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 PMID:22771823 4896 2016-03-02 PomBase SPAC139.06 FYPO:0000242 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000246 PMID:20404084 4896 2025-09-23 Finally, hat1 cells grew normally in both ammonia and proline. PomBase SPAC139.06 FYPO:0001164 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 PMID:17052979 4896 2015-05-05 PomBase SPAC139.06 FYPO:0000243 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000246 PMID:20404084 4896 2025-09-23 Finally, hat1 cells grew normally in both ammonia and proline. PomBase SPAC139.06 FYPO:0001839 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0000059 PMID:22771823 4896 2016-03-02 PomBase SPAC139.06 FYPO:0003362 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC139.06 FYPO:0000089 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0005638 PMID:17052979 4896 2015-05-05 PomBase SPAC139.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- hat1 hat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC139.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hat1 hat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC139.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hat1 hat1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000703 118-348 Not assayed or wild type 972 h- tea4 tea4-delta118-348 partial_amino_acid_deletion 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PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC24H6.13 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPAC24H6.13 SPAC24H6.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.13 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPAC24H6.13 SPAC24H6.13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC24H6.13 SPAC24H6.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24H6.13 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC24H6.13 SPAC24H6.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.13 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC24H6.13 SPAC24H6.13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 S22P Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-S22P amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000705 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002133 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000835 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 69 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Trt1 binding is reduced to ~69% of pof8+ cells, but not as severely reduced as pof8∆ cells (~35%). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Trt1-TER1 interaction is reduced but not eliminated in pof8-∆[289-4020]. Extent of reduction in Trt1-TER1 is similar to pof8∆ cells. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000826 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004656 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003555 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003555 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003106 289-402 Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-[delta289-402] partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 6) pof8-∆[289-402] cells show as short telomere as pof8∆ cells. PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000082 F508S Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-236 mis4-F508S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000201 high PMID:39916665 4896 2025-03-05 (Fig. S1A) PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0001357 F508S Not assayed or wild type 972 h- mis4 mis4-236 mis4-F508S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:39916665 4896 2025-03-14 (Fig. S1A) PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0001152 G149T Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-TR1-box nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPBC32C12.02 FYPO:0001117 G149T Not assayed or wild type 972 h- ste11 ste11-TR1-box nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:10982411 4896 2017-07-28 PomBase SPCC830.05c FYPO:0005011 323-343 Not assayed or wild type 972 h- epl1 epl1-FLEx-SL1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000126 low PMID:37550452 4896 2023-08-31 (Figure 6) PomBase SPCC830.05c FYPO:0001355 323-343 Not assayed or wild type 972 h- epl1 epl1-FLEx-SL1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:37550452 4896 2023-08-31 (Figure 5) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0008435 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000059 high PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 3D) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001135 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000337 PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001327 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4B, D and E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0005120 deletion 972 h- pat1-as snR107 snR107delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 5C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0005120 deletion 972 h- pat1-as snR107 snR107delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 5C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003747 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003747 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003747 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003747 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000590 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0001232 PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S5F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001357 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:40185772 4896 2025-05-02 (Fig. S3G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003720 deletion 972 h- snR107 snR107delta deletion ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.48) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 3A and C) PomBase SPCC338.08 FYPO:0004229 S87A,T89A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-2A ctp1-S87A,T89A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPCC338.08 FYPO:0001690 S87A,T89A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-2A ctp1-S87A,T89A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000963 S87A,T89A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-2A ctp1-S87A,T89A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19804755 4896 2017-03-14 PomBase SPCC584.04 FYPO:0001645 D647A Not assayed or wild type 972 h- sup35 sup35-D647A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:19417105 4896 2016-10-30 Supplemental Table S1; Supplemental Fig. S3 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0000444 deletion 972 h- drc1 drc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:21593208 4896 2020-01-15 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 drc1 drc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 drc1 drc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- drc1 drc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 drc1 drc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- drc1 drc1delta deletion ECO:0005638 PMID:11937031 4896 2014-12-15 PomBase SPBC336.03 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 efc25 efc25delta deletion ECO:0000059 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prototroph oxp2 oxp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph oxp2 oxp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.14c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph oxp2 oxp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.14c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph oxp2 oxp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph oxp2 oxp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.14c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph oxp2 oxp2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(882-972)-cdc12(882-972)-fus1(869-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(2FH1)-fus1(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC27F1.02c) PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 4E) PomBase SPAC4G9.04c FYPO:0007350 disruption Knockdown 972 h- pcf11 pcf11-degron disruption ECO:0001232 high assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:31811152 4896 2020-04-09 (Figure 1b) PomBase SPBC3F6.03 FYPO:0004036 wild type Overexpression 972 h- trr1 trr1+ wild_type ECO:0005801 PMID:15135546 4896 2014-11-20 PomBase SPBC3F6.03 FYPO:0001517 wild type Overexpression 972 h- trr1 trr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15135546 4896 2014-11-20 PomBase SPBC3F6.03 FYPO:0001516 wild type Overexpression 972 h- trr1 trr1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15135546 4896 2014-11-20 PomBase SPAPB17E12.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pex12 pex12delta deletion ECO:0005638 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2012-01-01 PomBase SPAPB17E12.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pex12 pex12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000272 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts4 R132Q unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:11250892 4896 2017-07-24 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0006023 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts4 R132Q unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:40161431 4896 2025-04-08 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004367 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts4 R132Q unknown ECO:0001232 PMID:11250892 4896 2021-11-24 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0005709 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts4 R132Q unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC21.06c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1C, and data not shown) Immunofluorescence indicated that both byr4p and cdc7p showed a normal, asymmetric distribution during mitosis PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0005709 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts4 R132Q unknown ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC222.10c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1C, and data not shown) Immunofluorescence indicated that both byr4p and cdc7p showed a normal, asymmetric distribution during mitosis PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004082 unknown Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts4 R132Q unknown ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:12546793 4896 2021-11-24 (Figure 1C) In the mutant plo1-ts4, which is defective in SIN signaling but not spindle formation [10], hyperphosphorylated cdc11p was observed during mitosis, even though the cells were not septating . PomBase SPAC1D4.12 FYPO:0002061 unknown 972 h- rad15 rad15.P rad15-P unknown ECO:0005638 PMID:1319571 4896 2012-04-24 PomBase SPAC1D4.12 FYPO:0000267 unknown 972 h- rad15 rad15.P rad15-P unknown ECO:0005638 PMID:1319571 4896 2012-04-24 PomBase SPAC1D4.12 FYPO:0000268 unknown 972 h- rad15 rad15.P rad15-P unknown ECO:0005638 PMID:1319571 4896 2012-04-24 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 F95W Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-F95W amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC17C9.02c FYPO:0004908 F95W Not assayed or wild type 972 h- lys7 lys7-F95W amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 Y150* Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K13 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC27B12.08 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr sip1 sip1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase 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SPAC3G9.14 FYPO:0000223 unknown Not assayed or wild type 972 h- sak1 sak1-891 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 R76E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-R76E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 R76E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-R76E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0002887 R76E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-R76E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0000703 R76E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-R76E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c),assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAC6F6.16c FYPO:0003106 R76E Not assayed or wild type 972 h- tpz1 tpz1-R76E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002346 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0007477 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000049 3.8 PMID:31206516 4896 2024-01-01 Unlike loss of Epe1, the H297A mutation generated few pink/white colonies in the ade6-m210 background (Fig 4A); indeed, 96.2% of Epe1H297A cells formed WT-like red colonies, while 61.7% of epe1Δ cells did. PomBase SPCC622.16c FYPO:0003743 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 1) PomBase SPCC622.16c FYPO:0000450 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:31206516 4896 2020-01-15 PomBase SPCC622.16c FYPO:0003573 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC622.16c FYPO:0002386 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:31206516 4896 2020-01-15 FLAG ChIP analysis revealed that H297A reduced appreciably Epe1 enrichment on centromeric dg repeats and IRC3 (Fig 4G), a centromeric boundary sequence where Epe1 accumulates to a high level [12, 14 PomBase SPCC622.16c FYPO:0005749 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2a) PomBase SPCC622.16c FYPO:0001645 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0006030 low assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c),assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:31206516 4896 2020-01-15 The H297A substitution slightly impaired the interaction (S4G Fig), which was confirmed by the results of a bait-prey exchange experiment. We performed co-immunoprecipitation analysis of Swi6 with Epe1H297A. Consistent with the results of yeast two-hybrid assay, the Epe1H297A mutant interacted with Swi6 with a slightly lower efficiency than wild-type Epe1 (Fig 4H). PomBase SPCC622.16c FYPO:0004544 H297A Not assayed or wild type 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 Catalytically inactivating mutations in the Fe(II) or 2-oxyglutarate binding sites of the Epe1 putative demethylase (epe1-H297A and epe1-K314A) had a similar phenotype (Fig. 4A, fig. S6, and table S3) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004544 H297A Not assayed or wild type 972 h- tetR-clr4-I ura4delta::10xtetO-ade6+ clr4+ epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 3D) PomBase SPCC622.16c FYPO:0004948 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:17948055 4896 2015-10-13 PomBase SPCC622.16c FYPO:0000833 H297A Not assayed or wild type 972 h- epe1 epe1-H297A Epe1H297A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC622.16c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 3d) PomBase SPBC342.05 FYPO:0003489 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22792081 4896 2014-07-02 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003486 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:22792081 4896 2014-07-02 PomBase SPBC342.05 FYPO:0001270 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:22792081 4896 2014-06-30 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003165 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000305 medium PMID:22792081 4896 2014-07-02 PomBase SPBC342.05 FYPO:0002897 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003129 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0002554 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:22792081 4896 2014-06-30 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003132 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003130 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000085 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000088 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000267 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 T73A,S80A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-2AQ amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22792081 4896 2014-06-21 PomBase SPAC4G8.02c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sss1 sss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G8.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- sss1 sss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC4G8.02c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sss1 sss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC146.03c FYPO:0002061 T19A,T86A Not assayed or wild type 972 h- h- leu1- cut3 cut3-T19A,T86A cut3-ATA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002085 L55M Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-L55M amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000082 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000229 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0001838 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC970.04c) PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000650 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000224 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0001903 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0001315 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000024 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0001491 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0002060 95-484 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-delta1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201,FYECO:0000227 PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC222.19 FYPO:0004249 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC337.13c) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPAC222.19 FYPO:0004249 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC777.05) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPAC222.19 FYPO:0004250 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPAC222.19 FYPO:0001522 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPAC222.19 FYPO:0002672 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPAC222.19 FYPO:0004248 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.17) PMID:29199950 4896 2018-01-19 PomBase SPAC222.19 FYPO:0004248 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23D3.16) PMID:29199950 4896 2018-01-24 PomBase SPAC222.19 FYPO:0001029 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPAC222.19 FYPO:0001453 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29199950 4896 2018-01-25 PomBase SPAC222.19 FYPO:0001188 deletion 972 h- lam3 lam3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-18 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SPAC3C7.11c FYPO:0000843 23-437,490-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-smini partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0000841 23-437,490-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-smini partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0000021 23-437,490-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-smini partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0002060 23-437,490-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-smini partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0002177 23-437,490-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1-smini partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:17230581 4896 2015-01-06 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007725 1-121 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8delta1-121 fsv1delta1-121 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-P3A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P3A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P3.P3A|rpb1-P3-P3A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.02c),assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.03) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-P3A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P3A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P3.P3A|rpb1-P3-P3A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c),assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09),assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003267 CTD-P3A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P3A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P3.P3A|rpb1-P3-P3A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 9C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002141 CTD-P3A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P3A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P3.P3A|rpb1-P3-P3A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:33579781 4896 2022-11-18 (Fig. 2) However, S. pombe is viable when Pro3 or Pro6 is changed to alanine in every other heptad, including the rump, in the context of the full-length CTD (Fig. 2), signifying that reduced proline content is tolerated and that Pro3 and Pro6 need not be present in consecutive heptads PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001357 CTD-P3A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P3A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P3.P3A|rpb1-P3-P3A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 9B) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 K1112A Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1-K1112A amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 2) PomBase SPBP8B7.03c FYPO:0003412 rpl402::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpl402 rpl402::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC119.17 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cym1 cym1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- cym1 cym1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC119.17 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cym1 cym1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.17 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cym1 cym1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPBC119.17 FYPO:0001234 deletion 972 h- cym1 cym1delta deletion ECO:0005638 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FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph dbl3 dbl3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- dbl3 dbl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbl3 dbl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14C8.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dbl3 dbl3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002638 wild type Overexpression 972 h- klp5 klp5+ wild_type ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Figure 5D) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP klp5 klp5+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- klp5 klp5+ wild_type ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Fig. 5A) PomBase SPBC2F12.13 FYPO:0003969 wild type Overexpression 972 h- klp5 klp5+ wild_type ECO:0005638 PMID:11967147 4896 2018-01-22 (Figure 5B) PomBase SPCC126.08c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC126.08c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC126.08c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0001034 deletion 972 h- SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC126.08c FYPO:0004325 deletion 972 h- SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0005252 deletion 972 h- SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 low PMID:35172472 4896 2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/ Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPCC126.08c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC126.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC126.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC126.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC126.08c SPCC126.08cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.13 FYPO:0000214 cnd1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPBC776.13 FYPO:0001991 cnd1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPBC776.13 FYPO:0002061 cnd1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPBC776.13 FYPO:0004396 cnd1::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd1 cnd1::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 P15A Overexpression 972 h- cnp1 cnp1-P15A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Figure S1A and B) PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0002276 V141R Not assayed or wild type 972 h- tbf1 tbf1-V141R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.13) PMID:38677290 4896 2024-12-13 Surprisingly, arginine substitutions of the hydrophobic residues (L101R, L108R, V141R, and V148R) led to degradation and insolubility of mutant proteins of spTbf1TRFH (Figures S3). | Consistently, all L101R, L108R, V141R, and V148R mutations resulted in great degradation of spTbf1 in cells (Figure 2E). PomBase SPAC1834.04 FYPO:0001840 wild type Overexpression 972 h- hht1 hht1+ PH3.c1->PH3.c2 wild_type ECO:0000340 PMID:24710126 4896 2014-06-03 PomBase SPBC1198.04c FYPO:0002151 V276K,F280K in short cDNA Not assayed or wild type 972 h- zas1 zas1-cV276K,F280K other ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 7B) PomBase SPCC1223.01 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0001309 deletion 972 h- rqt1 rqt1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rqt1 rqt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- rqt1 rqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1223.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rqt1 rqt1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29B12.02c FYPO:0000614 R255G Not assayed or wild type 972 h- set2 set2-R255G amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000110 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0002061 H201N,R364A,Y368F Not assayed or wild type 972 h- ceg1 pce1-H201N-R364A-Y368F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 1D) PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001740 D150E Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-D150E amino_acid_mutation ECO:0000059 low PMID:34292936 4896 2021-07-30 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000473 D150E Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-D150E amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31149897 4896 2019-06-04 (Figure 3A) PomBase SPBC1711.13 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FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0000470 deletion 972 h- puc1 puc1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph puc1 puc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0001043 deletion 972 h- puc1 puc1delta deletion ECO:0001232 PMID:8006074 4896 2018-06-09 (Fig. 8) PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0001043 deletion 972 h- puc1 puc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000090,FYECO:0000126 medium PMID:29084823 4896 2021-02-11 (Fig. 7A) shows that puc1delta shows increased mating efficiency at nitrogen levels which suppress mating in wild type cells PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0004099 deletion 972 h- puc1 puc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. S2D) PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0001112 deletion 972 h- puc1 puc1delta deletion ECO:0005580 PMID:8006074 4896 2018-06-09 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0000479 deletion 972 h- puc1 puc1delta deletion ECO:0001232 PMID:8006074 4896 2018-06-09 (Fig. 8) PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph puc1 puc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph puc1 puc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph puc1 puc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph puc1 puc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19F5.01c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph puc1 puc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 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Rga7-mEGFP and Rng10-mEGFP recruited tdTomato-tagged Trs120, which is a TRAPP-II-specific subunit [94,95], but not the exocyst subunit Sec3 [6,42,96], to mitochondria (Figs 1C and S3A). These data suggest that Rga7 and Rng10 selectively interact with the TRAPP-II complex to promote vesicle tethering during exocytosis along the cleavage furrow, rather than the exocyst complex, which is more concentrated at the rim of the division plane [6,42,96]. 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FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:10591634 4896 2015-12-14 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:9199286 4896 2014-05-02 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000271 deletion 972 h- mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000207 PMID:9199286 4896 2014-05-02 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph mkh1 mkh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1F3.02c FYPO:0000115 deletion 972 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SPNCRNA.1443 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1443 SPNCRNA.1443+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1443 FYPO:0002693 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1443 SPNCRNA.1443+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1443 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1443 SPNCRNA.1443+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1443 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1443 SPNCRNA.1443+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1443 FYPO:0005266 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1443 SPNCRNA.1443+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000167 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1443 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1443 SPNCRNA.1443+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0001679 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 dhp1 dhp1+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000339 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:31615333 4896 2020-09-24 PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0007883 wild type Knockdown 972 h- dhp1 dhp1+ wild_type ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC530.02) PMID:34352089 4896 2021-10-29 PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0007883 wild type Knockdown 972 h- dhp1 dhp1+ wild_type ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC11D3.05) PMID:34352089 4896 2021-10-29 we observed a sharp decline in RNAPII occupancy inside the gene body, directly downstream of the Pac1- bound region located in the first half of the genes (Figure 2B, blue profile). In contrast, Pac1 nuclear exclusion resulted in extended RNAPII occupancy throughout the entire ORFs (Figure 2B, red profile). Such differences in RNAPII profiles are suggestive of Pac1-dependent premature termination. PomBase SPAC26A3.12c FYPO:0006613 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 dhp1 dhp1+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000339 assayed_using(PomBase:SPAC1705.03c),assayed_using(PomBase:SPAC19B12.02c) PMID:31615333 4896 2020-09-18 (Figure 2 and 3) PomBase SPBP4H10.13 FYPO:0000705 K3D Not assayed or wild type 972 h- rps2302 rps2302-K3D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPBP4H10.13) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001424 R673A,R675A Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp6-NLSmut amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000243 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0001164 R673A,R675A Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp6-NLSmut amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000838 R673A,R675A Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp6-NLSmut amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000243 assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPBC1685.15c FYPO:0000069 R673A,R675A Not assayed or wild type 972 h- klp6 klp6-NLSmut amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18799626 4896 2014-03-05 PomBase SPAC6F12.13c FYPO:0001042 deletion 972 h- fps1 fps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:17596513 4896 2015-07-30 PomBase SPAC6F12.13c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fps1 fps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- fps1 fps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6F12.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fps1 fps1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.13c FYPO:0002061 deletion 972 h- fps1 fps1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:17596513 4896 2015-07-30 PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0001513 K536A,K1200A Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-K536A,K1200A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29898918 4896 2018-06-26 PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0000085 K536A,K1200A Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-K536A,K1200A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29898918 4896 2018-06-26 PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0000089 K536A,K1200A Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-K536A,K1200A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:29898918 4896 2018-06-26 PomBase SPBC29A10.04 FYPO:0002176 K536A,K1200A Not assayed or wild type 972 h- psm1 psm1-K536A,K1200A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29898918 4896 2018-06-26 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005781 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0001232 88 PMID:24161933 4896 2020-05-31 Even reduction to about 10% of the original Mad1 level, which is hardly visible by fluorescence microscopy (Fig. 2e), did not fully abolish the SAC PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005781 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 51 PMID:24161933 4896 2020-05-31 (Fig. 5a) PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001324 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24161933 4896 2024-03-29 , Fig. S4 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001324 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24161933 4896 2024-03-29 , Fig. S4 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0003762 wild type Knockdown 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000104 PMID:24161933 4896 2020-06-03 In cells with 30% Mad1, the checkpoint was markedly impaired in minimal medium, although largely functional in rich medium PomBase SPAC23C4.12 FYPO:0006530 hhp2-swi6(69-215) Not assayed or wild type 972 h- hhp2 hhp2-CD fusion_or_chimera ECO:0001232 ~90 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:20383139 4896 2018-04-26 (Fig. 5b) PomBase SPAC2E1P3.04 FYPO:0004039 H627A Not assayed or wild type 972 h- cao1 cao1-H627A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:18723604 4896 2014-11-20 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1-h24 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1-h24 unknown ECO:0005638 high PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1-h24 unknown ECO:0005638 medium PMID:1427071 4896 2014-08-22 PomBase SPBC16E9.18 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph psd1 psd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.18 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph psd1 psd1delta deletion 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PMID:21211723 4896 2024-01-17 Defective mating-type switching in heterochromatin mutants results in poor iodine staining of colonies, in contrast to the dark staining of wild-type colonies (Jia et al., 2004). asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F). PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0000470 deletion 972 h- hip3 hip3delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0001324 deletion 972 h- hip3 hip3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC15D4.03) PMID:16428807 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0000593 deletion 972 h- hip3 hip3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27343236 4896 2016-07-18 PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0003557 deletion 972 h- hip3 hip3delta deletion ECO:0000291 PMID:19620282 4896 2016-04-08 PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph hip3 hip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph hip3 hip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC31F10.14c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph hip3 hip3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 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partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 51 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 1-100 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(101-920) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 52 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0004056 43-75,1200-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(42-74)-delta-Sph partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002061 43-75,1200-1485 Not assayed or wild type 972 h- top2 top2delta(42-74)-delta-Sph partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPAC1952.07 FYPO:0002687 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad1 rad1-S6 unknown ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPBC3D6.13c FYPO:0000662 wild type Overexpression 972 h- pdi3 pdi3+ wild_type ECO:0005801 FYECO:0000141 PMID:20204527 4896 2014-05-20 PomBase 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Table 1 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0005371 wild type Overexpression 972 h- cut7 cut7+ wild_type ECO:0000059 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- cut7 cut7+ wild_type ECO:0005638 PMID:34864879 4896 2024-11-28 As shown in Figure 2a, cells overproducing Cut7 under the induced condition is lethal PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP cut7 cut7+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- cut7 cut7+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8972853 4896 2018-06-07 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0003787 wild type Overexpression 972 h- cut7 cut7+ wild_type ECO:0005638 PMID:34864879 4896 2024-11-28 Observation of spindle morphology showed that cells in which either Cut7 or Eg5-NLS is overproduced displayed the emergence of protruding spindles, which was never observed in the vector control strain. In these cells, the spindle MTs extended away from one side or both sides of the spindle poles, in which the spindle pole bodies (SPBs, fungi equivalents of animal centrosomes) localized to the MT tips (Figure 2b). PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000276 wild type Overexpression 972 h- cut7 cut7+ wild_type ECO:0005638 PMID:34864879 4896 2024-11-28 We notified that a small percentage of either Eg5-NLS or Cut7 overproducing cells showed the monopolar spindle phenotype (Figure 2c; after 18 h, 10% for Cut7 vs 11% for Eg5-NLS). PomBase SPAC23A1.19c FYPO:0001122 D444A,E445A Not assayed or wild type 972 h- hrq1 hrq1-HD amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22064477 4896 2012-04-10 PomBase SPAC23A1.19c FYPO:0000102 D444A,E445A Not assayed or wild type 972 h- hrq1 hrq1-HD amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22064477 4896 2012-04-16 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 G120C Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-G120C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 G120C Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-G120C amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000166 PMID:24104454 4896 2015-11-30 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11E3.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11E3.10 SPAC11E3.10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.11 FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gta3 gta3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC777.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- gta3 gta3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC777.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gta3 gta3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000245 deletion 972 h- ist1 ist1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002967 deletion 972 h- ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.18c) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3D) PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002967 deletion 972 h- ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.07c) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3D) PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002967 deletion 972 h- ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC9E9.14) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3D) PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002967 deletion 972 h- ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.01) PMID:37783794 4896 2023-10-05 (Fig. 3D) PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ist1 ist1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1442.17c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ist1 ist1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G6.14 FYPO:0008275 1-25 Not assayed or wild type 972 h- aps1 aps1-(26-210) aps1-Ndelta25 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 FYECO:0000140 assayed_enzyme(PomBase:SPAC13G6.14) PMID:38940614 4896 2024-07-24 (Fig. 3A) PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0000684 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000072 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0007726 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000296 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0000095 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000277 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0001501 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000319 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1559 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1559 SPNCRNA.1559+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0006274 deletion 972 h- ape2 ape2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-11-16 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0001645 deletion 972 h- ape2 ape2delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBP35G2.11c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.05c) PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0006294 deletion 972 h- ape2 ape2delta deletion ECO:0001232 PMID:26365378 4896 2017-12-01 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0002896 deletion 972 h- ape2 ape2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(SO:0001865) PMID:22496451 4896 2013-11-21 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ape2 ape2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1921.05 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ape2 ape2delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph ggt2 ggt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ggt2 ggt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ggt2 ggt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ggt2 ggt2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- ggt2 ggt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ggt2 ggt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56E4.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ggt2 ggt2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SB1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-SB1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006649 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006651 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0003674 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006655 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0005439 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBC887.14c) PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006653 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPBC887.14c FYPO:0006654 428-448 Not assayed or wild type 972 h- pfh1 pfh1-delta21 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:30053106 4896 2018-08-14 PomBase SPAC688.07c FYPO:0001880 751-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:30840879 4896 2019-06-24 (Fig. 1B) PomBase SPAC688.07c FYPO:0002488 751-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 61 PMID:30840879 4896 2019-06-24 PomBase SPAC688.07c FYPO:0002488 751-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(1-750) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 >22 PMID:27385337 4896 2016-09-19 (Figure 3F) PomBase SPBC776.12c FYPO:0007878 K129D Not assayed or wild type 972 h- hsk1-89 hsk1 hsk1-kd amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1783.04c) PMID:34608864 4896 2021-11-05 PomBase SPAC2F3.06c FYPO:0003412 kap104::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 kap104 kap104::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 K879A Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1-K879A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:31495586 4896 2019-10-14 (Figure 2) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0007394 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000059 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0008112 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 PMID:37403782 4896 2023-07-10 Importantly, co-migration of Pof8 with U6 was lost upon deletion of Bmc1 (Figure 1B), as well as co-migration of Bmc1 with U6 upon deletion of Pof8 (Supplementary Figure S1C). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000705 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4e) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002133 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2A9.10),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.25) PMID:37403782 4896 2023-07-10 Further supporting the idea that U6 complex formation is contingent on the presence of all three proteins, we observed a loss of snoZ30 binding to Bmc1 upon knockout of any member of the complex (Supplementary Figure S2A). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002133 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4c) Lsm3-TER1 interaction is abolished in pof8∆ cells. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0006466 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 high high assayed_using(SO:0000390) PMID:29422501 4896 2018-03-27 (Fig. 3a) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000835 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 moderately reduced less severe thanin ter1∆ cells. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 medium assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 1C,D) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Telomere binding of Est1 is reduced in pof8∆ cells. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003803 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000226 medium assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29422503 4896 2018-02-20 (Fig. 1C,D) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001645 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC1861.04c),assayed_transcript(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:37403782 4896 2023-07-06 Deletion of snoZ30 and sno530 resulted in a loss of 2′-O-methylation at A41 and A64, respectively, suggesting that sno530 is indeed the A64 U6-modifying snoRNA (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 3b) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000826 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4a) Expression level of telomerase RNA TER1 is reduced but not eliminated in pof8∆ cells. Expression level for telomerase RNA pre-cursor was not affected by pof8∆. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0005540 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0005801 PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0005540 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0005801 PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0006848 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:35277511 4896 2022-05-23 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0008110 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 PMID:37403782 4896 2023-07-06 reproducible decrease in modification at several other sites, most notably A64 (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0007845 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002908 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-15 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002908 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Est1 showed similar expression level in pof8∆ cells as wild-type cells. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 Lsm3 protein level was not affected by pof8∆. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0004083 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29422503 4896 2018-02-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002887 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC9B6.05c) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 4f) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002357 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000125 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13),assayed_using(SO:0000390) PMID:29422503 4896 2018-02-15 (Fig. 3c) Interaction between Est1 and TER1 was not affected by pof8∆. PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0005538 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000226 high PMID:29422501 4896 2018-03-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003107 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 high high PMID:29422501 4896 2018-03-19 (Fig. 1a) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pof8 pof8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002239 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003106 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000125 PMID:29422503 4896 2018-02-13 (Figure 1a) PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- pof8 pof8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof8 pof8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pof8 pof8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0004419 430-474 Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-deltaC45 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:19696784 4896 2017-08-07 (Fig. 2A,B) PomBase SPBC25D12.03c FYPO:0002061 D467A Not assayed or wild type 972 h- mcm7 mcm7-DA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11973289 4896 2012-11-15 PomBase SPAPB1A10.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- dhx37 dhx37delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAPB1A10.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dhx37 dhx37delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1A10.06c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dhx37 dhx37delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.02 FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urh2 urh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- urh2 urh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G8.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 urh2 urh2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3F10.15c FYPO:0004328 wild type Overexpression 972 h- spo12 spo12+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:17032733 4896 2015-01-21 PomBase SPAC212.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC212.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC212.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC212.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC212.03 SPAC212.03delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB8E5.05 FYPO:0005118 C(-165)A,C(-164)A,G(-154)A Not assayed or wild type 972 h- mfm1 mfm1-promoter(TR-mut3) nucleotide_mutation ECO:0000049 low assayed_using(PomBase:SPAPB8E5.05) PMID:9233811 4896 2017-12-09 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0000640 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:23314747 4896 2013-09-10 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004481 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23314747 4896 2013-09-10 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001407 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004907 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13G7.10) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004907 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004906 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004905 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004711 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004904 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0006031 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23314747 4896 2013-09-10 Cnp1 localisation to centromere reduced in teb1-1 cells grown at 36C (based on immunofluorescence) PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001117 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.04) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0004742 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0003555 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001317 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.10c) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001317 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC800.13) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001317 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001317 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC290.04) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001317 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0001317 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAPB1A10.02) PMID:23314747 4896 2015-10-01 PomBase SPAC13G7.10 FYPO:0002687 R184C Not assayed or wild type 972 h- teb1 teb1-1 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:23314747 4896 2013-09-10 Southern Blot of teb1-1 cells grown at permissive and restrictive temperatures shows no change in telomere length, compared to wild type cells PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 L264P Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-L264P amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPAC4D7.08c FYPO:0000747 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade4 ade4-24 unknown ECO:0005638 PMID:8082193 4896 2013-05-20 PomBase SPAC144.14 FYPO:0004622 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Figure 7b) PomBase SPAC144.14 FYPO:0007182 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Table 3) PomBase SPAC144.14 FYPO:0003190 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Table 3) PomBase SPAC144.14 FYPO:0005880 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Fig. 6) PomBase SPAC144.14 FYPO:0000733 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 Furthermore, abnormally elongated cytoplasmic and spindle MTs were frequently observed in these cells (Figure 6). PomBase SPAC144.14 FYPO:0004429 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 Furthermore, abnormally elongated cytoplasmic and spindle MTs were frequently observed in these cells (Figure 6). PomBase SPAC144.14 FYPO:0002215 wild type Overexpression 972 h- klp8 klp8+ wild_type ECO:0001232 PMID:31276301 4896 2019-11-25 (Fig. 6) PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0005011 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-22 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 bdf1 bdf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001355 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:39485795 4896 2025-01-08 (Fig. S10A) PomBase SPCC1450.02 FYPO:0004003 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000972 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22095079 4896 2018-06-22 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000969 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0003906 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000963 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0008380 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 5B) PomBase SPCC1450.02 FYPO:0004548 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:22095079 4896 2018-06-22 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:22095079 4896 2018-06-22 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001357 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:35194019 4896 2022-03-09 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0004325 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000085 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0000089 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph bdf1 bdf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- bdf1 bdf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bdf1 bdf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1450.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bdf1 bdf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.10c FYPO:0007488 V3A Not assayed or wild type 972 h- mnn9 mnn9-V3A amino_acid_mutation ECO:0000092 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.10c) PMID:32918581 4896 2020-10-21 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001422 deletion 972 h- ubp15 ubp15delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 Appendix Fig S2A PomBase SPBC713.02c FYPO:0002774 deletion 972 h- ubp15 ubp15delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044777) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000094 deletion 972 h- ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001188 deletion 972 h- ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:26412298 4896 2016-01-04 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001188 deletion 972 h- ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:26412298 4896 2016-01-04 PomBase SPBC713.02c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ubp15 ubp15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.02c 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assayed_using(PomBase:SPBC1706.01) PMID:19646873 4896 2019-01-30 (Fig. 2f) PomBase SPAC821.12 FYPO:0000789 M170A 972 h- orb6 orb6-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19646873 4896 2012-03-16 PomBase SPAC821.12 FYPO:0000024 M170A 972 h- orb6 orb6-as2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000071,FYECO:0000126 PMID:19646873 4896 2012-02-19 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004304 D172N Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D172N amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:11934898 4896 2015-01-15 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0001914 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo5 spo5-P2 unknown ECO:0001232 PMID:8203159 4896 2015-05-05 PomBase SPAC57A10.02 FYPO:0003412 cdr2::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 cdr2 cdr2::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000544 C13S,C35S,C153S,C158S,C242S Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-5CS Sty15CS-Tpx1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_protein(PomBase:SPCC576.03c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Sty1-Tpx1 disulfide formation abrogated (Figure S1C). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001327 C13S,C35S,C153S,C158S,C242S Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-5CS Sty15CS-Tpx1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC26F1.10c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 Consistent with lower Sty1 activity, Sty15CS-expressing cells contained less Pyp1 than wild-type cells (Figure S1F). This likely explains the slightly elevated phosphorylation of Sty15CS (Figure S1G) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0005947 C13S,C35S,C153S,C158S,C242S Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-5CS Sty15CS-Tpx1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37572670 4896 2024-01-26 Sty15CS-expressing cells were able to adapt to osmotic stress but were less tolerant than wild-type cells to higher levels of H2O2 (Figure 1B). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000087 C13S,C35S,C153S,C158S,C242S Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-5CS Sty15CS-Tpx1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:37572670 4896 2024-01-26 Sty15CS-expressing cells were able to adapt to osmotic stress but were less tolerant than wild-type cells to higher levels of H2O2 (Figure 1B). PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0003481 C13S,C35S,C153S,C158S,C242S Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-5CS Sty15CS-Tpx1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:37572670 4896 2024-01-22 Our analysis revealed that Sty15CS-mutant-expressing cells were longer at the point of division than wild-type cells, strongly suggesting that Sty15CS’s promitotic function was compromised (Figures S1D and S1E). PomBase SPBC577.05c FYPO:0003179 M1L,N50I Not assayed or wild type 972 h- rec27 rec27-246 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2017-09-25 PomBase SPBC577.05c FYPO:0004058 M1L,N50I Not assayed or wild type 972 h- rec27 rec27-246 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:28469148 4896 2017-09-25 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 T158TGC,G160C,C164CGC Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-D4E-2 nucleotide_insertion_and_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0000636 deletion 972 h- arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:16491466 4896 2016-02-15 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph arx1 arx1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- arx1 arx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arx1 arx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC23E6.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 arx1 arx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000704 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05),assayed_using(PomBase:SPBC25D12.04) PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0001327 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.03) PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000825 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC29B12.03) PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0005753 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0000335 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0001164 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000963 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000957 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0005751 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000838 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC25D12.04) PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0001420 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0001232 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph spd2 spd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.19 FYPO:0002177 deletion 972 h- spd2 spd2delta deletion ECO:0001232 PMID:24652833 4896 2016-10-27 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002097 T8A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T8A cds1.T8A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c),assayed_substrate(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:11313465 4896 2016-02-25 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000963 T8A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T8A cds1.T8A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 T8A Not assayed or wild type 972 h- cds1 cds1-T8A cds1.T8A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:11313465 4896 2016-02-17 PomBase SPBC16E9.01c FYPO:0000705 1-219 Not assayed or wild type 972 h- php4 php4-delta1-219 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC26H8.06) PMID:19502236 4896 2024-08-09 (Fig. 9A) PomBase SPAC144.13c FYPO:0000846 S62A,S214A,T98A,T177A Not assayed or wild type 972 h- srw1 srw1-S62A,S214A,T98A,T177A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC11E3.01c) PMID:10921878 4896 2014-12-01 PomBase SPAC144.13c FYPO:0000252 S62A,S214A,T98A,T177A Not assayed or wild type 972 h- srw1 srw1-S62A,S214A,T98A,T177A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10921878 4896 2014-12-01 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0003066 deletion 972 h- nup61 nup61delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0000229 deletion 972 h- nup61 nup61delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:15116432 4896 2014-12-02 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0002827 deletion 972 h- nup61 nup61delta deletion ECO:0000049 low PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. S1E) PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0001324 deletion 972 h- nup61 nup61delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.09) PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. 3A) PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0000581 deletion 972 h- nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2014-05-12 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0004003 deletion 972 h- nup61 nup61delta deletion ECO:0005580 PMID:38917328 4896 2024-07-16 (Fig. S1B) PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nup61 nup61delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph nup61 nup61delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.07c FYPO:0009098 deletion 972 h- 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FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000080 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001407 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0002930 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000059 medium PMID:39333464 4896 2024-11-13 (Fig. 4F) PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000584 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0004750 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29914874 4896 2018-11-26 Supplementary Figure S3 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001896 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 PMID:23319050 4896 2013-03-07 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0008148 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0005128 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0008335 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000059 medium PMID:39333464 4896 2024-11-13 (Fig. 4F) PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0003482 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12G12.09) PMID:24755092 4896 2014-11-20 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000825 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.16c),assayed_using(PomBase:SPCC338.11c) PMID:23503588 4896 2013-04-02 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0006109 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000231 PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000239 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000238 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0006660 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0006996 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0000231 PMID:32496538 4896 2020-07-17 (Figure 4 and Supplementary Fig S5) PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000969 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001895 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 PMID:23319050 4896 2013-03-07 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001034 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0004325 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000097 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0003840 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000091 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001234 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29914874 4896 2018-11-26 Supplementary Fig. S3 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2014-07-24 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0001492 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 PMID:8781170 4896 2015-04-23 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17A5.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 exo2 exo2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 N8NKGYPN Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K12 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000452 1093-1145 Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-phd2delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 We also examined the GFP-Swi6 distribution in the mutants (Figure 7B). While the lid2-phd1 mutant is similar to the WT, the nuclei in the lid2-phd2 and lid2-phd3 mutants often contained excessive GFP- Swi6 dots, suggesting that euchromatin assembly is disrupted in the mutants (Figure 7B). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0003411 1093-1145 Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-phd2delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:18957202 4896 2020-04-07 silencing at the imr region in lid2-phd2 and lid2-phd3 mutants was significantly impaired while lid2-phd1 showed only a slight defect (Figure 7A). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000877 1093-1145 Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-phd2delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 Obvious reduction of H3K9 methylation was also observed in lid2-phd2 and lid2-phd3 mutants (Figure S9) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 I146T Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-I146T amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 lon1 lon1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000499 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000499 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000082 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000138 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000054,FYECO:0000102 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000342 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 (0.08% Glu) that promote respiratory metabolism (Fig. 4A). We observed that the short-lived mutants lon1Δ and yta12Δ showed a severe growth defect in respiratory-prone media, comparable to that detected in cox6Δ lacking a subunit of the ETC complex IV PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000342 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 cells lacking Lon1 or Yta12 displayed decreased respiratory capacity in high and low glucose (Fig. 4B) PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003915 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 9F) PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003915 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 9F) PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003915 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 9F) PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003915 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Figure 9F) PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000835 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.11) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000835 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000835 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.07) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000835 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.04) PMID:35820914 4896 2024-12-30 (Fig. 4E) show that the levels of Cox1, Cox2, Cox3, and Atp6 proteins are similar in wild-type and the long-lived mutants mgr3Δ and yme1Δ. However, the blots demonstrate highly reduced levels of these proteins in lon1Δ and yta12Δ mutants which might explain the respi PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0004130 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005801 low PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000921 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005801 low PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003004 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 In contrast, the yta12Δ strain displayed enhanced levels of basal probe oxidation (OxD0 of 0.46) at the mitochondrial matrix compared to the wild-type strain (OxD0 of 0.4), indicative of higher steady-state levels of H2O2 (Additional file 5: Fig. S2). Cells lacking Lon1 displayed a slight increase in basal oxidation of MTS-Hyper7, suggesting that both short-lived mutants show enhanced production of mitochondrial ROS (Additional file 5: Fig. S2). PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003424 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 lon1 lon1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2023-11-08 Lack of the mitochondrial protease Lon1 reduced longevity whereas the absence of Mgr3, adaptor protein of the protease Yme1 [13], led to increased lifespan. PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003820 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0001232 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001537 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000335 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0004016 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0000291 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003118 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005580 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 lon1 lon1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001164 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:21354177 4896 2016-05-12 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph lon1 lon1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- lon1 lon1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lon1 lon1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lon1 lon1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4F10.20 FYPO:0003965 wild type Overexpression 972 h- grx1 grx1+ wild_type ECO:0005801 PMID:11118633 4896 2014-11-03 PomBase SPAC4F10.20 FYPO:0003965 wild type Overexpression 972 h- grx1 grx1+ wild_type ECO:0005801 PMID:15358115 4896 2014-11-03 PomBase SPAC4F10.20 FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- grx1 grx1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15796926 4896 2014-08-06 PomBase SPAC4F10.20 FYPO:0001420 wild type Overexpression 972 h- grx1 grx1+ wild_type ECO:0005638 PMID:15865206 4896 2014-11-06 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000705 S479E,S491E,S501E,S533E,S561E Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-5E amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.04c) PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002380 S479E,S491E,S501E,S533E,S561E Not assayed or wild type 972 h- nak1 nak1-5E amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23394829 4896 2014-03-27 PomBase SPBC1773.16c FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPBC1773.16c SPBC1773.16c+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC1773.16c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 SPBC1773.16c SPBC1773.16c+ wild_type ECO:0001232 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC2C4.04c FYPO:0001420 wild type Knockdown 972 h- dSpG-CRISPRi-ceo4-10,ceo4-9 aim29 aim29+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 5AB; Figure S3) PomBase SPAC2C4.04c FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- CRISPRi-ceo4-6 aim29 aim29+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 5A,B) PomBase SPAC2C4.04c FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- dSpG-CRISPRi aim29 aim29+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 5A,B) PomBase SPAC2C4.04c FYPO:0002058 wild type Knockdown 972 h- dSpG-CRISPRi-ceo4-10 aim29 aim29+ wild_type ECO:0005638 PMID:37162093 4896 2023-05-24 PomBase SPAC2C4.04c FYPO:0002104 wild type Knockdown 972 h- dSpG-CRISPRi-ceo4-10,ceo4-9 aim29 aim29+ wild_type ECO:0001232 PMID:37162093 4896 2023-05-24 (Figure 7) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002133 KRRKR58NEHG Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-alpha-mut amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPBC428.08c) PMID:22727667 4896 2014-06-11 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 KRRKR58NEHG Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-alpha-mut amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:22727667 4896 2014-06-10 PomBase SPAC630.14c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tup12 tup12delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC630.14c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tup12 tup12delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC630.14c FYPO:0001407 deletion 972 h- tup12 tup12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPAC630.14c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph tup12 tup12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.14c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph tup12 tup12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC630.14c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph tup12 tup12delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC725.08 FYPO:0006631 F165L,S316P Not assayed or wild type 972 h- pir2 pir2-1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC1289.04c),assayed_region(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Moreover, quantitative ChIP analyses showed enrichment of Clr3 and Pob3 at prt-pho1 in WT cells and a reduced localization in pir2-1 cells (Fig. 5e). PomBase SPBC725.08 FYPO:0006548 F165L,S316P Not assayed or wild type 972 h- pir2 pir2-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Surprisingly, pir2-1 showed a drastic upregulation of pho1 and byr2 genes as compared to wild-type (WT) (Fig. 1b) PomBase SPBC725.08 FYPO:0006548 F165L,S316P Not assayed or wild type 972 h- pir2 pir2-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Surprisingly, pir2-1 showed a drastic upregulation of pho1 and byr2 genes as compared to wild-type (WT) (Fig. 1b) PomBase SPBC216.05 FYPO:0001931 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005580 PMID:1594599 4896 2013-02-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001931 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0001232 PMID:1594599 4896 2013-02-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001933 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0001232 PMID:1594599 4896 2013-02-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001933 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0001232 PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002519 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 PMID:1398093 4896 2013-08-13 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000229 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001407 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004194 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001645 unknown Not 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2015-02-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000089 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 PMID:15347659 4896 2015-01-06 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000970 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102 PMID:18062930 4896 2015-01-13 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002345 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004407 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 medium PMID:166019 4896 2014-11-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-136 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9658208 4896 2015-02-16 PomBase SPBC216.05 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Zhf is required for growth on high and low zinc PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001533 Q298* Not assayed or wild type 972 h- zhf1 zhf1-537 zhf-537 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000404 high PMID:12050156 4896 2023-12-13 Fig. 1. 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2017-12-25 normal processing, protein stable, complements partially sde2Δ PomBase SPBC354.04 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPBC354.04 SPBC354.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.04 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph SPBC354.04 SPBC354.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.04 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC354.04 SPBC354.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.04 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPBC354.04 SPBC354.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.04 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph SPBC354.04 SPBC354.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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FYPO:0003411 I471E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-I471E amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3) PomBase SPBC83.03c FYPO:0004205 I471E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-I471E amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:19394293 4896 2023-03-01 To determine the effect of tas3-TAM mutations on cen siRNAs levels, we performed northern blot analysis on RNAs isolated from wild-type, tas3D, and tas3-TAM mutant cells. We found a dramatic reduction in the levels of both total (Figure 4C) and Ago1-purified (Figure 4D) cen siRNAs in all tas3-TAM mutants compared to wild-type. PomBase SPBC83.03c FYPO:0004083 I471E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-I471E amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3C) PomBase SPBC25H2.07 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif11 tif11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.07 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif11 tif11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC25H2.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- tif11 tif11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC25H2.07 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif11 tif11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 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2023-06-28 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4G9.05 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph mpf1 mpf1delta deletion ECO:0005638 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amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 4f) PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000460 K587A,T588A,Y589A,G590A Not assayed or wild type 972 h- cut9-665 eso1 eso1-pim amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:28343969 4896 2018-06-24 (Fig. 4F, 4H) PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0002394 K587A,T588A,Y589A,G590A Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-pim amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC10F6.09c),residue(K106) PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 4G) PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0001645 K587A,T588A,Y589A,G590A Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-pim amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.02),assayed_using(PomBase:SPBC16A3.11) PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 4E) PomBase SPBC16A3.11 FYPO:0000091 K587A,T588A,Y589A,G590A Not assayed or wild type 972 h- eso1 eso1-pim amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 high PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 4f) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 V147L Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V147L amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000271 V147L Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-V147L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:23836910 4896 2015-11-30 PomBase SPBC337.13c FYPO:0003031 Q61L Overexpression 972 h- gtr1 gtr1-Q61L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPNCRNA.737 FYPO:0009020 deletion 972 h- SPNCRNA.737 SPNCRNA.737delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc7 spc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc7 spc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc7 spc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001489 deletion 972 h- spc7 spc7delta deletion ECO:0005638 PMID:15371542 4896 2014-12-19 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- spc7 spc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spc7 spc7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- spc7 spc7delta deletion ECO:0005638 PMID:15371542 4896 2014-12-19 PomBase SPBC1604.17c FYPO:0003827 tti2-AID Not assayed or wild type 972 h- tti2 tti2-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_protein(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 Western blotting showed decreased phosphorylation of the ribosomal protein S6, a canonical TORC1 substrate, following Tel2, Tti1, and Tti2 depletion (Figure S1G) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0003827 tti2-AID Not assayed or wild type 972 h- tti2 tti2-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_protein(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:34686329 4896 2023-09-01 Western blotting showed decreased phosphorylation of the ribosomal protein S6, a canonical TORC1 substrate, following Tel2, Tti1, and Tti2 depletion (Figure S1G) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0001355 tti2-AID Not assayed or wild type 972 h- tti2 tti2-AID fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000339 PMID:34686329 4896 2023-09-01 Depletion of each protein reduces S. pombe viability and proliferation compared with control strains and culture conditions (Figures S1C and S1D). PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000780 tti2-AID Not assayed or wild type 972 h- tti2 tti2-AID fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:34686329 4896 2023-09-01 We used qRT-PCR to determine the effect of TTT depletion on the expression of two sexual differentiation genes, ste11+ and mei2+. We observed that the mRNA levels of both genes increase upon depletion of Tel2, Tti1, and Tti2 compared with control strains and conditions (Figures S1E and S1F) PomBase SPBC1604.17c FYPO:0000780 tti2-AID Not assayed or wild type 972 h- tti2 tti2-AID fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000339 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 We used qRT-PCR to determine the effect of TTT depletion on the expression of two sexual differentiation genes, ste11+ and mei2+. We observed that the mRNA levels of both genes increase upon depletion of Tel2, Tti1, and Tti2 compared with control strains and conditions (Figures S1E and S1F) PomBase SPCC188.02 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- par1 par1-35 unknown ECO:0005638 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPCC188.02 FYPO:0003903 unknown Not assayed or wild type 972 h- par1 par1-35 unknown ECO:0005638 PMID:11707284 4896 2015-01-15 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0001903 R100A,S128A,N151A Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25908789 4896 2015-08-28 PomBase SPBC530.12c FYPO:0001355 K321* Not assayed or wild type 972 h- pdf1 pdf1-K321* pdf1-K302Stop partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:15075260 4896 2011-12-05 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11H11.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11H11.03c SPAC11H11.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1122 FYPO:0009045 deletion 972 h- SPNCRNA.1122 SPNCRNA.1122delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1122 FYPO:0009039 deletion 972 h- SPNCRNA.1122 SPNCRNA.1122delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1122 FYPO:0009043 deletion 972 h- SPNCRNA.1122 SPNCRNA.1122delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1122 FYPO:0001214 deletion 972 h- SPNCRNA.1122 SPNCRNA.1122delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0000835 1-500 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-500) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-12-23 PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0006221 1-500 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-500) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Although the C-terminal truncation mutants Spa2(1–500) and Spa2(1–360) localized to cell tips and septa like full-length Spa2, they were both reduced in intensity by 3-fold and 1.5-fold relative to full-length Spa2 at tips and the division site, respectively (Fig. 1D–F; Fig. S2A,B). PomBase SPAC3G9.05 FYPO:0001586 1-500 Not assayed or wild type 972 h- spa2 spa2(1-500) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC3G9.05) PMID:40931936 4896 2025-11-21 Although the C-terminal truncation mutants Spa2(1–500) and Spa2(1–360) localized to cell tips and septa like full-length Spa2, they were both reduced in intensity by 3-fold and 1.5-fold relative to full-length Spa2 at tips and the division site, respectively (Fig. 1D–F; Fig. S2A,B). PomBase SPCC162.07 FYPO:0002177 572-702 Not assayed or wild type 972 h- ent1 ent1-delta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:37831774 4896 2024-07-11 In ent1-Δ(572-702) cells, force on End4 is increased to above 20 piconewton at G857, but remains the same as in wild type at P337 or D155. PomBase SPAC27E2.10c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- rfc3 rfc3-36 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:10588638 4896 2016-02-18 PomBase SPAC27E2.10c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- rfc3 rfc3-36 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:10588638 4896 2016-02-18 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002960 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:28841135 4896 2018-02-17 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0001043 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0005638 PMID:9062192 4896 2015-01-12 PomBase SPAC27D7.03c FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- mei2 mei2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11818066 4896 2021-01-11 PomBase SPAC3C7.04 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3C7.04 SPAC3C7.04delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC3C7.04 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC3C7.04 SPAC3C7.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC3C7.04 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPAC3C7.04 SPAC3C7.04delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 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PomBase SPAC3C7.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC3C7.04 SPAC3C7.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3C7.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3C7.04 SPAC3C7.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3C7.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC3C7.04 SPAC3C7.04delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002898 K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-K56R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000162,FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:24663817 4896 2020-03-09 C13Y and K56R mutations completely eliminated the phosphorylation of Chk1 in MMS-treated cells (Fig. 3A) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0002897 K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-K56R amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000162,FYECO:0000170 low assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:24663817 4896 2020-03-09 C13Y and K56R mutations completely eliminated the phosphorylation of Chk1 in MMS-treated cells (Fig. 3A)The slight decrease in Cds1 phosphorylation may be caused indirectly by a minor defect in DNA replication PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000088 K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-K56R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 medium PMID:24663817 4896 2020-03-09 (Fig. 1D,2B) PomBase SPAC23C4.18c FYPO:0000089 K56R Not assayed or wild type 972 h- rad4 rad4-K56R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000162 medium PMID:24663817 4896 2020-02-22 (Fig. 1D,2B) PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0004303 D297E Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-D297E amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC19B12.05c) PMID:12556522 4896 2015-01-14 PomBase SPBC342.05 FYPO:0002554 crb2(1-358)-LZ Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2(1-358)-LZ fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 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deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPAC869.10c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005187 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 high assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0006470 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 7D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPCC1281.06c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPBP4H10.11c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. S6A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPCC1450.16c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. S6A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPAC22A12.06c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. S6A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. S6A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPBC18H10.02) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. S6B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008249 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC26H5.05),assayed_region(PomBase:SPAC1786.01c) PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. S6B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0003268 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 variable severity PMID:37288768 4896 2023-10-03 (Fig. 2E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0006494 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000337 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 7C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000826 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC1235.02) PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000826 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000826 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC56E4.04c) PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000826 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1B3.16c) PMID:27687771 4896 2016-11-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001117 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC359.04c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001117 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAPB15E9.01c) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001355 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000223 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001122 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001405 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-16 PomBase SPCC736.08 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001403 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 1A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001403 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-16 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002317 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 4D and E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002317 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 4D and E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002235 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 4D and E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002235 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 4D and E) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000618 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 5) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000274 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 variable severity PMID:37288768 4896 2023-10-03 (Fig. 2G) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005683 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 5) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005583 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 4B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005583 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000325 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 4B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000155 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:19101542 4896 2012-08-17 PomBase SPCC736.08 FYPO:0004153 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23236291 4896 2016-07-08 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low assayed_transcript(PomBase:SPAC869.10c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 medium assayed_transcript(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002989 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 high assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0005995 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 5) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001861 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium medium PMID:37288768 4896 2023-06-08 (Fig. 4C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000972 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 7A and B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004032 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000125,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1198.11c) PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 7F) PomBase SPCC736.08 FYPO:0004380 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC29A10.04) PMID:37288768 4896 2023-10-03 (Fig. 4D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 low assayed_transcript(PomBase:SPCC1223.13) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000825 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPCC1742.01) PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S2C) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001406 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-16 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000252 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000252 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 PMID:38359013 4896 2024-02-16 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001404 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-16 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002552 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002552 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. 3A and B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002552 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 low PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002552 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 variable severity PMID:29931271 4896 2018-06-25 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002552 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000208 variable severity PMID:29931271 4896 2018-06-25 PomBase SPCC736.08 FYPO:0006791 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000126 PMID:39652606 4896 2025-01-07 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001273 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:37288768 4896 2023-06-08 (Fig. 1B) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007664 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 PMID:37288768 4896 2023-10-05 Notably, the nuclear displacement phenotypewas associated with mid-anaphase spindle bending and/or detachment of one of the daughter chromosome masses from the spindle, and subsequent spindle disassembly and merger of the two daughter chromosome masses into one diploid nucleus (Figs 1B and 2B). PomBase SPCC736.08 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000118 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:19101542 4896 2012-08-14 PomBase SPCC736.08 FYPO:0004646 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 5) PomBase SPCC736.08 FYPO:0006257 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 5) PomBase SPCC736.08 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000957 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000211 PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0001903 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001357 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. 4) PomBase SPCC736.08 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002578 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000170 medium PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4D) PomBase SPCC736.08 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000085 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000314 medium PMID:38482739 4896 2024-07-30 (Fig. 4) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000085 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000314 medium PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. 4) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38482739 4896 2024-07-31 (Fig. S3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 medium PMID:39652606 4896 2025-01-09 (Fig. 4) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:37288768 4896 2023-06-08 (Fig. S2A) We first validated the previous report of cbf11Δ cells being sensitive to TBZ. When plated on YES medium containing TBZ, the cbf11Δ mutant indeed showed strong sensitivity to the drug (Fig. S2A) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 medium PMID:37052630 4896 2023-05-11 Main text Table S1 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001234 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 PMID:27687771 4896 2016-12-09 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001234 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:26366556 4896 2015-09-23 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001234 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:26366556 4896 2015-09-23 PomBase SPCC736.08 FYPO:0000365 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 2) PomBase SPCC736.08 FYPO:0000365 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 PMID:38780300 4896 2024-09-07 (Fig. 2) PomBase SPCC736.08 FYPO:0008362 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:39652606 4896 2025-01-07 (Fig. 3) PomBase SPCC736.08 FYPO:0006822 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:26366556 4896 2015-09-22 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC736.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.08 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cbf11 cbf11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 K68E,I94K,D177N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E59 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002699 R57A,R60A,R63A,R65A,R68A Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1-L2-R5A ain1 L2-R5A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:32892625 4896 2020-12-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G104A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G104A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 G104A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G104A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC4B4.04 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph eif21 eif21delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 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assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 D468R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-D468R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPCC622.09 FYPO:0008439 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0000112 medium PMID:40402811 4896 2025-11-03 (Fig. 2C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000825 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBC359.03c) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000674 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0005517 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003906 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000963 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001317 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPAC110.01) PMID:40402811 4896 2025-11-15 (Fig. 4E) PomBase SPCC622.09 FYPO:0001357 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 P103A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-P102A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:40402811 4896 2025-10-29 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.14 FYPO:0009056 alp14(1-500)-dis1(518-882) Not assayed or wild type 972 h- dis1 alp14TOG-dis1C fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000126,FYECO:0000137 high PMID:36435910 4896 2023-04-13 PomBase SPCC736.14 FYPO:0009057 alp14(1-500)-dis1(518-882) Not assayed or wild type 972 h- dis1 alp14TOG-dis1C fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:36435910 4896 2023-04-13 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0002023 deletion 972 h- cwg2 cwg2delta deletion ECO:0001232 PMID:9781874 4896 2014-04-14 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0002430 deletion 972 h- cwg2 cwg2delta deletion ECO:0001232 PMID:9781874 4896 2014-04-14 PomBase SPAC2E1P5.04c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cwg2 cwg2delta deletion ECO:0001232 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1F) PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0002386 deletion 972 h- rss1 rss1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPBC36.05c) PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 4C) PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0002387 deletion 972 h- rss1 rss1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPBC36.05c) PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 4D) PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph rss1 rss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0006814 deletion 972 h- rss1 rss1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1E) PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0002336 deletion 972 h- rss1 rss1delta deletion ECO:0000049 PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 1G) PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rss1 rss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC4H3.06 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph rss1 rss1delta 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sensitive to MMS, but relatively mild compared with apn2Δ (SI Appendix, Fig. S4). 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PomBase SPAC1486.05 FYPO:0006374 S964A Not assayed or wild type 972 h- nup189 nup189(uncleavable) nup98-nup96 (uncleavable) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1486.05) PMID:26137436 4896 2019-11-27 PomBase SPAC1486.05 FYPO:0002060 S964A Not assayed or wild type 972 h- nup189 nup189(uncleavable) nup98-nup96 (uncleavable) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:26137436 4896 2017-10-20 (Table 1) PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0007130 H432A Not assayed or wild type 972 h- met6 met6-H432A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16216079 4896 2019-10-30 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 1-394 Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-bZIP partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:25122751 4896 2014-09-11 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0001116 1-394 Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-bZIP partial_amino_acid_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:25122751 4896 2014-09-11 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0003813 1-394 Not assayed or wild type 972 h- atf1 atf1-bZIP partial_amino_acid_deletion ECO:0000231 PMID:25122751 4896 2014-09-15 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0001355 R173K Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K173 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9862966 4896 2015-04-09 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpr1 tpr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0005286 deletion 972 h- tpr1 tpr1delta deletion ECO:0000049 PMID:25972440 4896 2016-07-14 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0006518 deletion 972 h- tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005580 PMID:31315658 4896 2020-09-21 Additional file 1: Fig. S1b, c PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0006986 deletion 972 h- tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-21 (Figure 2) PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tpr1 tpr1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0000785 deletion 972 h- tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29162938 4896 2017-12-05 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph tpr1 tpr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0002480 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpr1 tpr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27D7.14c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tpr1 tpr1delta deletion 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SPBP35G2.11c FYPO:0006274 130-258,A61R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-A61R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4F10.02) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPBP35G2.11c FYPO:0006293 130-258,A61R Not assayed or wild type 972 h- nbr1 nbr1-delta(ZZ2-ZZ3)-A61R amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC513.05) PMID:34169534 4896 2021-07-27 PomBase SPCC613.04c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rng3 rng3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.04c FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rng3 rng3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.04c FYPO:0002294 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rng3 rng3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC613.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- rng3 rng3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC613.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rng3 rng3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.14c FYPO:0006567 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:39789818 4896 2025-05-15 After CPT release, the percentage of Rad52 foci in dsk1Δ decreased more slowly than that in dsk1+ (Figures 2a and S3a,b), indicating a compromised HR repair in dsk1Δ. Second, we exploited a transformation-based genetic system (Figure 2b) PomBase SPBC530.14c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000141 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:32062975 4896 2021-01-09 (Figure 6A) PomBase SPBC530.14c FYPO:0004419 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.08) PMID:17362205 4896 2015-02-16 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002779 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:17362205 4896 2015-02-16 PomBase SPBC530.14c FYPO:0003912 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:39789818 4896 2025-05-15 As expected, the HR frequency of leu1 integration in rad51Δ cells was too low to be displayed. We also found that the HR frequency of leu1 integration in dsk1Δ cells was significantly reduced (Figure 2c), suggesting that Dsk1 may regulate the Rad52- and Rad51-dependent gene conversion sub-pathway of HR. PomBase SPBC530.14c FYPO:0000482 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:39789818 4896 2025-05-15 On the contrary, dsk1Δ cells displayed about a fivefold reduction in spontaneous recombination rate, mainly in the aspect of gene conversion rather than gene deletion (Figure 2g). 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assayed_using(PomBase:SPCC63.14),residue(T586) PMID:32062975 4896 2021-01-08 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002679 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0007464 assayed_using(PomBase:SPCC645.07),residue(S225) PMID:32062975 4896 2021-01-08 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002679 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.10),residue(S365) PMID:39789818 4896 2025-05-15 We found that the levels of the indicated phosphorylated peptide of Rad52-YFP were substantially reduced in dsk1Δ, whereas no differences in the levels of unmodified peptides (Figure 4h). The remaining Rad52 phosphorylation in dsk1Δ suggests that there are redundant kinases of Rad52 in vivo. Moreover, Ser319 was predicted as the major phosphorylated residue in this indicated Rad52 peptide (Figure 4h). PomBase SPBC530.14c FYPO:0001838 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11C11.08) PMID:17362205 4896 2015-02-16 PomBase SPBC530.14c FYPO:0001838 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC16.02c) PMID:17362205 4896 2015-02-16 PomBase SPBC530.14c FYPO:0001645 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0006030 low assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.10),assayed_protein(PomBase:SPAC644.14c) PMID:39789818 4896 2025-05-15 We found that the association affinity between Rad52-YFP and Rad51 was marginally affected by dsk1Δ (Figure S7b). PomBase SPBC530.14c FYPO:0001128 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC530.14c FYPO:0001355 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0004466 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 PMID:39789818 4896 2025-05-15 We exploited the YFP-tagged Rad52 strain and found that the percentage (45%) of Rad52-YFP fluorescent foci in dsk1Δ cells was elevated almost 100-fold relative to the percentage (0.5%) of that in WT cells under physiological conditions, suggesting more spontaneous DNA damage induced by dsk1Δ. PomBase SPBC530.14c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000969 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 However, dsk1Δ was not sensitive to Bleomycin (Bleo), Phleomycin (Phleo), and UV irradiation, which directly break DNA, as well as 6-Azauracil (6-AU) and Mycophenolic acid (MPA), which impair transcription (Figure S1d). PomBase SPBC530.14c FYPO:0005517 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 However, dsk1Δ was not sensitive to Bleomycin (Bleo), Phleomycin (Phleo), and UV irradiation, which directly break DNA, as well as 6-Azauracil (6-AU) and Mycophenolic acid (MPA), which impair transcription (Figure S1d). PomBase SPBC530.14c FYPO:0003906 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 However, dsk1Δ was not sensitive to Bleomycin (Bleo), Phleomycin (Phleo), and UV irradiation, which directly break DNA, as well as 6-Azauracil (6-AU) and Mycophenolic acid (MPA), which impair transcription (Figure S1d). PomBase SPBC530.14c FYPO:0007074 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 However, dsk1Δ was not sensitive to Bleomycin (Bleo), Phleomycin (Phleo), and UV irradiation, which directly break DNA, as well as 6-Azauracil (6-AU) and Mycophenolic acid (MPA), which impair transcription (Figure S1d). PomBase SPBC530.14c FYPO:0003183 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 However, dsk1Δ was not sensitive to Bleomycin (Bleo), Phleomycin (Phleo), and UV irradiation, which directly break DNA, as well as 6-Azauracil (6-AU) and Mycophenolic acid (MPA), which impair transcription (Figure S1d). PomBase SPBC530.14c FYPO:0006437 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000211 PMID:39789818 4896 2025-05-15 Additionally, there were few septa when both dsk1+ and dsk1Δ were treated with MMS, and their number of septa was similarly increased after MMS release (Figure S2d). This result indicates that the cell cycle progression of dsk1Δ under MMS is arrested by functional checkpoints. To further support it biochemically, we tagged Chk1 with 3HA as we had no antibody against S. pombe Chk1. We found that the 3HA tag did not influence the genotoxic phenotype of chk1+ (Figure S2e). Immunoblots showed that Chk1-3HA in dsk1Δ was normally phosphorylated after MMS treatment (Figure S2f). Therefore, we conclude that dsk1Δ does not influence checkpoints activation. PomBase SPBC530.14c FYPO:0003736 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:32062975 4896 2021-01-09 (Figure 6A) PomBase SPBC530.14c FYPO:0001903 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:32062975 4896 2021-01-09 (Figure 6A) PomBase SPBC530.14c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000829 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:39789818 4896 2025-05-15 Consistent with the phenotypes of deficiency of SKY1 and SRPKs, dsk1Δ also exhibited cisPt resistance.........(Figure 1a and Figure S1c). PomBase SPBC530.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0004325 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000095 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000277 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000085 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 high PMID:39789818 4896 2025-05-15 Interestingly, we found that dsk1Δ was highly sensitive to replication-associated DNA break agents like camptothecin (CPT), which is a topoisomerase I inhibitor, and was slightly sensitive to methyl methanesulfonate (MMS), which alkylates and breaks DNA during replication (Figure 1a and Figure S1c). PomBase SPBC530.14c FYPO:0003840 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000257 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0007931 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000411 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002167 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000419 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:32062975 4896 2021-01-09 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000170 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000088 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 In addition, dsk1Δ was consistently but marginally sensitive to HU. .........(Figure 1a and Figure S1c). PomBase SPBC530.14c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 low PMID:39789818 4896 2025-05-15 Interestingly, we found that dsk1Δ was highly sensitive to replication-associated DNA break agents like camptothecin (CPT), which is a topoisomerase I inhibitor, and was slightly sensitive to methyl methanesulfonate (MMS), which alkylates and breaks DNA during replication (Figure 1a and Figure S1c). PomBase SPBC530.14c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0000091 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:32062975 4896 2021-01-09 (Figure 6B) PomBase SPBC530.14c FYPO:0000091 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC530.14c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0005638 PMID:32062975 4896 2021-01-09 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dsk1 dsk1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0004318 wild type Overexpression 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0001232 PMID:24161933 4896 2020-05-31 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0005781 wild type Overexpression 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0001232 25 PMID:24161933 4896 2020-05-31 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24161933 4896 2024-03-29 , Fig. S4 PomBase SPBC3D6.04c FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- nda3-KM311 mad1 mad1+ wild_type ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:24161933 4896 2024-03-29 , Fig. S4 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002901 unknown Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:10864871 4896 2015-01-15 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0002901 unknown Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1687.20c) PMID:10864871 4896 2015-01-15 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 S87A,T94A,S402A,S566A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S402A,S566A,S650A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000703 S87A,T94A,S402A,S566A,S650A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S402A,S566A,S650A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0005501 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0001880 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC16E8.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph scd2 scd2delta 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FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1A,2A) PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002380 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002106 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 PMID:7923372 4896 2015-02-02 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0006616 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 1B) PomBase SPAC22H10.07 FYPO:0006616 deletion 972 h- scd2 scd2delta ral3- deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:21849474 4896 2018-04-10 Table 1 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 F60R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F60R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 F60R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F60R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 F60R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F60R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 F60R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-F60R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003129 T187A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T187A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0001357 T187A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T187A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003130 T187A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T187A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000267 T187A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T187A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 T187A Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-T187A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 its3 its3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- its3 its3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 its3 its3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- its3 its3delta deletion ECO:0005638 PMID:23028742 4896 2014-02-14 PomBase SPAC19G12.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- its3 its3delta deletion ECO:0005638 PMID:10950958 4896 2022-11-10 Tetrad analysis of the heterozygous diploid showed two viable (UraΔ) and two inviable spores (Fig. 3D), indicating that the its3Δ gene is essential for cell growth. PomBase SPBC354.08c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000470 deletion 972 h- rsn1 rsn1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC354.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0007938 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPBC354.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC354.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- rsn1 rsn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:12618370 4896 2021-10-04 PomBase SPBC354.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- rsn1 rsn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC354.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsn1 rsn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC354.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsn1 rsn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 H788A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-H788A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(SO:0001898) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 H788A Not assayed or wild type 972 h- ago1 ago1-H788A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_transcript(SO:0001899) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC576.08c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rps2 rps2delta 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assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-L240A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000769 wild type Overexpression 972 h- bqt4 bqt4+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000322 PMID:37694715 4896 2023-11-15 To ascertain whether this abnormal phenotype was caused by an accumulation of Bqt4, we overexpressed GFP-Bqt4 under the nmt1 promoter using the chemical compound YAM2 to control the expression level. YAM2 suppresses nmt1 promoter activity depending on its concentration (Nakamura et al., 2011). Overexpression of GFP-Bqt4 reproduced the nuclear-deformed morphology (Fig. 7B) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000117 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 bqt4 bqt4+ wild_type ECO:0001232 PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 bqt4 bqt4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 medium PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0008433 wild type Overexpression 972 h- bqt4 bqt4+ wild_type ECO:0000059 55 PMID:38825008 4896 2025-04-22 PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0008431 wild type Overexpression 972 h- bqt4 bqt4+ wild_type ECO:0001232 66 PMID:38825008 4896 2025-04-22 As expected, the number of cells with nuclear LDs increased in the cells overexpressing Bqt4-FL (Fig. 6, C and D; 65.9%; see arrowhead in FL) compared to the control cells under the suppressive conditions (0-0.3%). PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 bqt4 bqt4+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC1071.09c FYPO:0007158 1-94,169-255 Not assayed or wild type 972 h- djc9 djc9-(95-168) djc9-(122-195) partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. 2E) PomBase SPBC146.07 FYPO:0000444 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0000062 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000260 low PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003602 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003602 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003602 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003602 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003602 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003602 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003630 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004 PMID:12374752 4896 2014-08-07 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003629 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004 PMID:12374752 4896 2014-08-07 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003165 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000260 low PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0000082 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003029 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003029 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC29E6.08) PMID:8862522 4896 2014-01-17 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001645 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC146.07),assayed_using(PomBase:SPCC962.06c) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001645 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.06),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001645 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001645 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC146.07),assayed_using(PomBase:SPCC962.06c) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001645 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001645 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.06),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003041 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000201,FYECO:0000227 medium assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003041 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004,FYECO:0000201,FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001355 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000260 PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0008113 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_transcript(PomBase:SPBC428.16c) PMID:34706246 4896 2025-03-24 (Fig. 2C) PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC2G11.14) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC18H10.12c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.07) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC26H8.07c) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0001908 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC144.03) PMID:11350031 4896 2014-07-30 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002303 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000260 low PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0002107 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:9003295 4896 2014-06-27 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003166 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000260 low PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC146.07 FYPO:0000091 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPBC146.07 FYPO:0003095 T259I Not assayed or wild type 972 h- prp2 prp2-2 prp2-T259I amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000260 PMID:10923022 4896 2014-08-21 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000705 V184K Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-V184K amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000140 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.18c),assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPBC342.05 FYPO:0003129 V184K Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-V184K amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:24074952 4896 2014-02-17 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 V184K Not assayed or wild type 972 h- crb2 crb2-V184K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPAC22G7.07c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ime4 ime4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.07c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ime4 ime4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.07c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ime4 ime4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC22G7.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ime4 ime4delta 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2018-05-18 (Fig. S2D) PomBase SPBC713.14c FYPO:0001420 deletion 972 h- SPBC713.14c SPBC713.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. 5G) PomBase SPBC713.14c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPBC713.14c SPBC713.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.14c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC713.14c SPBC713.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.14c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPBC713.14c SPBC713.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.14c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph SPBC713.14c SPBC713.14cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC713.14c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph 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The induction of sdr1+ expression, yeast cell growth was significantly suppressed (Figure 2d), indicating that excessive expression of sdr1+ plays an active role in suppressing yeast cell growth. 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wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 3 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:23615450 4896 2019-10-17 (Figure 4C) PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0001355 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0001355 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0001253 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000133 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7622565 4896 2012-04-24 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000650 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0001232 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SPAP8A3.08 FYPO:0008207 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0008207 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004 PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000833 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000833 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000833 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000833 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC4F8.13c) PMID:21422229 4896 2018-02-21 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000703 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10022828 4896 2017-01-25 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0001357 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11942609 4896 2018-01-05 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002060 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10022828 4896 2017-01-25 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002060 G107S Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-8 cdc4-G107S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16085489 4896 2015-03-02 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0005288 2478-2517 Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-deltaC2 partial_nucleotide_deletion ECO:0000049 PMID:16489217 4896 2017-09-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tcb2 tcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0008456 deletion 972 h- tcb2 tcb2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 PMID:40629316 4896 2025-09-01 Among them, Tcb2 is functionally unrelated, as tcb2Δ protoplasts exhibited normal Ca2+-dependent hypotonic PM expansion (Fig. 3B). PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tcb2 tcb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tcb2 tcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- tcb2 tcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tcb2 tcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCP31B10.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tcb2 tcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 S144A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-S144A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 S144A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-S144A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC962.02c FYPO:0004412 1-112,842-997 Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-113-841 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- gpi13 gpi13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0000267 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC27B12.06 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 gpi13 gpi13delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPCC16C4.19 FYPO:0003412 rpp21::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpp21 rpp21::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K112R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K112R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K112R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K112R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000761 Q70* Not assayed or wild type 972 h- rad24 sam4-Q70* sam4 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:19584544 4896 2012-03-08 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000098 Q70* Not assayed or wild type 972 h- rad24 sam4-Q70* sam4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19584544 4896 2012-03-08 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000081 Q70* Not assayed or wild type 972 h- rad24 sam4-Q70* sam4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19584544 4896 2012-05-01 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000271 Q70* Not assayed or wild type 972 h- rad24 sam4-Q70* sam4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19584544 4896 2012-03-08 PomBase SPAC8E11.02c FYPO:0000268 Q70* Not assayed or wild type 972 h- rad24 sam4-Q70* sam4 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:19584544 4896 2012-03-08 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000703 1-549 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-550-886 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC887.09c) PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPAC2F7.03c FYPO:0001384 K728R Not assayed or wild type 972 h- pom1 pom1-KD amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPAC2F7.03c),assayed_substrate(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:21703453 4896 2016-11-11 PomBase SPAC2F7.03c 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PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-19 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:8187760 4896 2014-12-04 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-19 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:8187760 4896 2014-12-04 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 K139E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-K139E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002019 K139E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-K139E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 K139E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-K139E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-25 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 K139E Not assayed or wild type 972 h- 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h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3001 rpl3001delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3001 rpl3001delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0002400 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3001 rpl3001delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl3001 rpl3001delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3001 rpl3001delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC9G1.03c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl3001 rpl3001delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph met6 met6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph met6 met6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr met6 met6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr met6 met6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph met6 met6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph met6 met6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC56F2.11 FYPO:0002924 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SPAC16E8.09 FYPO:0001370 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 high assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:21849474 4896 2018-07-17 (Fig. 4D) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000443 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:21849474 4896 2018-06-13 (Fig. 4D) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0004105 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 PMID:31719163 4896 2020-01-31 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000930 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PR:000044799),assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:18328707 4896 2019-02-01 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0003329 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PR:000044799),assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0003329 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001585 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:21849474 4896 2018-06-13 (Fig. 5) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001800 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31719163 4896 2020-01-31 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0002528 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000044799) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000929 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.14c) PMID:39012625 4896 2024-07-30 (Fig. 4A) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0006637 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000235,FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:29930085 4896 2018-07-23 fig 2 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001586 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-11-10 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0006638 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:29930085 4896 2018-07-23 Figure 6C PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005803 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005543 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0002527 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scd1 scd1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005802 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005873 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000650 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0003212 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001294 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 2C) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0003135 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0000059 PMID:7923372 4896 2018-04-29 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005465 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 2, Movei 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005465 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005465 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 2) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001293 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000170 PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Fig. 2B) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005905 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0005906 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0006008 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PR:000044799) PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0003627 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Figure 4A) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000644 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:21849474 4896 2018-04-10 (Figure 4A) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001402 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0002442 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:31719163 4896 2020-02-11 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001587 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC1840.02c) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001587 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC970.09) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001587 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001587 deletion 972 h- cdc2-asM17 scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000244 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure 1) PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0004895 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:26941334 4896 2017-04-27 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001096 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC11H11.04) PMID:7923372 4896 2018-04-29 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000590 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0000059 PMID:7923372 4896 2018-04-29 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0001357 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0005638 PMID:7923372 4896 2012-02-21 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph scd1 scd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 scd1 scd1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scd1 scd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scd1 scd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:25552606 4896 2015-03-23 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 scd1 scd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC16E8.09 FYPO:0000107 deletion 972 h- scd1 scd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000248 high PMID:32915139 4896 2020-10-14 (Fig. 1) 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PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001325 deletion 972 h- pap1 pap1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC688.04c) PMID:12521310 4896 2014-12-02 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0004144 deletion 972 h- pap1 pap1delta deletion ECO:0005801 PMID:18248428 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pap1 pap1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0004141 deletion 972 h- pap1 pap1delta deletion ECO:0000335 PMID:18337696 4896 2014-12-04 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001107 deletion 972 h- pap1 pap1delta deletion ECO:0005801 PMID:16458193 4896 2014-11-05 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001107 deletion 972 h- pap1 pap1delta deletion ECO:0005801 PMID:9287302 4896 2012-06-12 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 pap1 pap1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0003650 deletion 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2018-10-25 (Fig. 8) PomBase SPACUNK4.07c FYPO:0002714 deletion 972 h- cta4 cta4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:22132152 4896 2018-10-25 (Fig. 6) PomBase SPACUNK4.07c FYPO:0005514 deletion 972 h- cta4 cta4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC22A12.15c) PMID:22132152 4896 2018-10-25 (Fig. 6) PomBase SPACUNK4.07c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph cta4 cta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.07c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph cta4 cta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.07c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph cta4 cta4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.07c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph cta4 cta4delta deletion ECO:0005638 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2016-11-17 PomBase SPAC8F11.07c FYPO:0001645 C114R Not assayed or wild type 972 h- cdc24 cdc24-ts cdc24ts amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC8F11.07c),assayed_using(PomBase:SPBC16D10.04c) PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPAC8F11.07c FYPO:0005786 C114R Not assayed or wild type 972 h- cdc24 cdc24-ts cdc24ts amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPAC8F11.07c FYPO:0005452 C114R Not assayed or wild type 972 h- cdc24 cdc24-ts cdc24ts amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPAC8F11.07c FYPO:0003584 C114R Not assayed or wild type 972 h- cdc24 cdc24-ts cdc24ts amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPAC8F11.07c FYPO:0002061 C114R Not assayed or wild type 972 h- cdc24 cdc24-ts cdc24ts amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 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cdc24 cdc24-ts cdc24ts amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27729451 4896 2016-11-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000703 1-665,999-1526 Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-IQ myo2IQ partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10769212 4896 2017-08-11 PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 G655E Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-G655E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:31072933 4896 2019-05-26 (Figure S8) PomBase SPBP4H10.06c FYPO:0002061 G655E Not assayed or wild type 972 h- cut14 cut14-G655E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:30914423 4896 2019-05-17 PomBase SPCC18.06c FYPO:0000031 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007336 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000291 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 Strikingly, however, silencing at the mating type locus was completely abolished in the 22 absence of Caf1 and Mot2, similar to clr4∆ cells, as revealed by the lack of cell growth on 23 5FOA-containing medium and the marked accumulation of ura4+ transcripts (Fig. 1g-h). PomBase SPCC18.06c FYPO:0007336 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000049 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007336 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007336 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0005580 high high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007336 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000112 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007336 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000231 high PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0006993 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000049 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0006993 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000231 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0003412 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000049 PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPCC18.06c FYPO:0004604 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPCC18.06c FYPO:0004604 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000049 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0004604 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000231 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0002355 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 (Figure 2) PomBase SPCC18.06c FYPO:0004137 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPCC18.06c FYPO:0005845 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 caf1 caf1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPCC18.06c FYPO:0003573 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007891 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007480 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC18.06c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18.06c FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 caf1 caf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPCC18.06c FYPO:0006926 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 caf1 caf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC18.06c FYPO:0001551 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000177 high assayed_protein(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-08 (Fig. 4B) PomBase SPCC18.06c FYPO:0004377 deletion 972 h- caf1 caf1delta 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2020-12-10 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 caf1 caf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC18.06c FYPO:0007035 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPCC18.06c FYPO:0003507 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:39761853 4896 2025-07-11 (Fig. 8C) PomBase SPCC18.06c FYPO:0004083 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0008441 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000173 assayed_protein(PomBase:SPAC821.10c) PMID:39761853 4896 2025-07-11 (Fig. 4B) PomBase SPCC18.06c FYPO:0004378 deletion 972 h- caf1 caf1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC622.16c) PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c 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tbf1-L101R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.13) PMID:38677290 4896 2024-12-13 Surprisingly, arginine substitutions of the hydrophobic residues (L101R, L108R, V141R, and V148R) led to degradation and insolubility of mutant proteins of spTbf1TRFH (Figures S3). | Consistently, all L101R, L108R, V141R, and V148R mutations resulted in great degradation of spTbf1 in cells (Figure 2E). PomBase SPAC24H6.01c FYPO:0002429 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gup1 gup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.01c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gup1 gup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24H6.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- gup1 gup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC24H6.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gup1 gup1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85T Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGTGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, protein very stable, complements partially sde2Δ PomBase SPCC1682.16 FYPO:0004137 D249A Not assayed or wild type 972 h- rpt4 rpt4-1 amino_acid_mutation 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assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Fig. 1b) PomBase SPBC216.07c FYPO:0007213 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Fig. 1b) PomBase SPBC216.07c FYPO:0003230 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Fig. 1a) PomBase SPBC216.07c FYPO:0003230 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Fig. 1a) PomBase SPBC216.07c FYPO:0006748 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229 assayed_using(SO:0000213) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC216.07c FYPO:0006748 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000229 low assayed_using(SO:0000221) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001382 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c),assayed_substrate(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001324 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC7D4.14c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Figure 1e) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.14c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:28671615 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:28671615 4896 2017-07-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137,FYECO:0000228 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2C) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000208 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001838 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001645 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_using(PomBase:SPBC216.07c) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0003827 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000110 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12) PMID:20144990 4896 2016-01-12 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:33574613 4896 2021-03-15 Similar to pir1∆, tor2-ts6 cells showed a severe growth defect at a semi-permissive temperature (29°C) on minimal medium but not on rich medium (Fig. 4d). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000228 medium PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001355 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000228 low PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0002173 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:33574613 4896 2021-03-15 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002173 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002172 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002172 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC4A8.04) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002172 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.13c) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001043 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001043 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001043 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:24741065 4896 2017-02-13 PomBase SPBC216.07c FYPO:0006542 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC337.08c) PMID:33574613 4896 2021-03-15 ubi4 gene, which encodes polyubiquitin implicated in sexual development34, was upregulate in tor2-ts6 cells (Fig. 3a). PomBase SPBC216.07c FYPO:0003031 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPBC216.07c FYPO:0001164 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19620394 4896 2014-06-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0003235 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Extended data Fig 1b, c PomBase SPBC216.07c FYPO:0005280 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000833 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.02) PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Figure 1c) PomBase SPBC216.07c FYPO:0006249 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000256) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC216.07c FYPO:0006249 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000268) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:33574613 4896 2021-03-15 Similar to pir1∆, tor2-ts6 cells showed a severe growth defect at a semi-permissive temperature (29°C) on minimal medium but not on rich medium (Fig. 4d). PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001357 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000227 PMID:39010328 4896 2024-08-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.07c FYPO:0001029 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19620394 4896 2014-06-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000111 S550P,K710M Not assayed or wild type 972 h- tor2 tor2-ts6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27165118 4896 2017-04-11 PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0000705 1-43 Not assayed or wild type 972 h- mis19 mis19-44-C partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02),assayed_using(PomBase:SPCC970.12) PMID:31371524 4896 2019-10-29 (Figure 6) PomBase SPBC27B12.02 FYPO:0001645 1-43 Not assayed or wild type 972 h- mis19 mis19-44-C partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 low assayed_using(PomBase:SPBC27B12.02),assayed_using(PomBase:SPCC970.12) PMID:31371524 4896 2019-10-29 (Figure 6) PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0000668 deletion 972 h- fra1 fra1delta deletion ECO:0000337 PMID:16491466 4896 2016-02-15 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0000636 deletion 972 h- fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:16491466 4896 2016-02-15 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0005639 deletion 972 h- fra1 fra1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:24897379 4896 2016-08-24 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph fra1 fra1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- fra1 fra1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fra1 fra1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22G7.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 fra1 fra1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.07c FYPO:0004461 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000291 PMID:20634885 4896 2016-01-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0005638 PMID:20634885 4896 2016-01-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000059 PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0000708 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0001232 PMID:26776736 4896 2016-06-21 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001283 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:20634885 4896 2016-01-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001324 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c) PMID:17261596 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001152 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:20634885 4896 2016-01-14 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001152 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001152 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC119.04) PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP tor2 tor2+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001000 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0005580 PMID:17046992 4896 2017-02-07 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001029 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:17179073 4896 2015-11-20 PomBase SPBC216.07c FYPO:0001029 wild type Overexpression 972 h- tor2 tor2+ wild_type 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amino_acid_mutation ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPBPB2B2.01) PMID:34209806 4896 2021-07-30 PomBase SPBC27B12.13 FYPO:0003412 tom40::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 tom40 tom40::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002262 1-31 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta31 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0002061 1-31 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-Ndelta31 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPAC1556.01c FYPO:0002475 I1192W Not assayed or wild type 972 h- rad50 rad50-I1192W amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:29851556 4896 2019-05-08 PomBase SPCC1322.02 FYPO:0002797 K69A Not assayed or wild type 972 h- pxd1 pxd1-K69A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:32692737 4896 2020-08-17 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000303 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:18059475 4896 2012-02-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0001152 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0004142 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c),assayed_using(SO:0001846) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0004235 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0004235 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC3F10.15c) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0004235 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c) PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0000673 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16G5.15c FYPO:0002177 T314E Not assayed or wild type 972 h- fkh2 fkh2-T314E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18059475 4896 2014-12-19 PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0002926 F75R Not assayed or wild type 972 h- pab2 pab2-F75R amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21981922 4896 2023-11-21 the ability of Pab2 to bind a poly(A) substrate was completely lost after the substitution of a conserved phenylalanine (F75R) residue within the RNA recognition motif of Pab2 (Figures S3C and S3D). PomBase SPBC16E9.12c FYPO:0001908 F75R Not assayed or wild type 972 h- pab2 pab2-F75R amino_acid_mutation ECO:0000291 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC1250.05) PMID:21981922 4896 2023-11-21 Importantly, Pab2 variants F75R and R-to-A did not rescue the increased levels of rpl30-2 transcripts observed in the pab2D strain (Figure 3E, lanes 2-4), although the two Pab2 variants defective in poly(A) binding were expressed at levels similar to wild-type Pab2 (Figure 3F). PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0006001 244-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta244-741 dcp2-N(1-243)|dcp2-delta244-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3B9.21) PMID:22085934 4896 2023-02-16 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0006001 244-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta244-741 dcp2-N(1-243)|dcp2-delta244-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:22085934 4896 2023-02-16 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0004083 244-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta244-741 dcp2-N(1-243)|dcp2-delta244-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC19A8.12) PMID:22085934 4896 2023-02-16 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0000703 244-741 Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2delta244-741 dcp2-N(1-243)|dcp2-delta244-741 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12),assayed_using(PomBase:SPAC20G4.08) PMID:23319050 4896 2013-01-22 PomBase SPAC1783.07c FYPO:0001130 488-544 Not assayed or wild type 972 h- pap1 pap1deltaCRD partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:10329722 4896 2014-11-24 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0000708 C58S Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-C58S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:29134248 4896 2018-06-19 PomBase SPAC31G5.07 FYPO:0006588 C58S Not assayed or wild type 972 h- dni1 dni1-C58S amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC4.01) PMID:29134248 4896 2018-06-21 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16E9.20 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC16E9.20 SPBC16E9.20delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 T115N Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-T115N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0000245 S82E,S83E,S84E Not assayed or wild type 972 h- maf1 maf1-3E2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPAP27G11.04c FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tad3 tad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP27G11.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- tad3 tad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP27G11.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tad3 tad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C69A,G127A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C69A,G127A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002060 C69A,G127A Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-C69A,G127A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPNCRNA.530 FYPO:0008109 deletion 972 h- sno530 sno530delta deletion ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNRNA.06) PMID:37403782 4896 2023-07-06 Deletion of snoZ30 and sno530 resulted in a loss of 2′-O-methylation at A41 and A64, respectively, suggesting that sno530 is indeed the A64 U6-modifying snoRNA (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPBC1778.06c FYPO:0006026 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0006027 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0004964 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0004562 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 55 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0006028 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.06c) PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0002061 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0006024 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0002437 1-368 Overexpression 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11694585 4896 2017-06-30 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000088 P21L Not assayed or wild type 972 h- hus5 ubc9-P21L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 In addition, we identified two mutations, P21L and F24S, at the noncovalent Ubc9:SLD2 interface that also result in HU sensitivity (Fig. 2C). PomBase SPAC1002.05c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 jmj2 jmj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0004765 deletion 972 h- jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 4) PomBase SPAC1002.05c FYPO:0002335 deletion 972 h- tetR-clr4-cdd clr4+ 4xtetO-ade6 jmj2 jmj2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000454 PMID:25838386 4896 2024-06-27 (Fig. S5) PomBase SPAC1002.05c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- jmj2 jmj2delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- jmj2 jmj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 jmj2 jmj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1002.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 jmj2 jmj2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- 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h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 dph1 dph1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC3B8.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph dph1 dph1delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPAC1834.01 FYPO:0000703 1-207 Not assayed or wild type 972 h- erf1 erf1-deltaN5 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:9701287 4896 2019-01-09 PomBase SPCC417.07c FYPO:0000703 801-1115 Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1(1-800) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC365.15),assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 3) PomBase SPCC188.07 FYPO:0004056 KR54AA Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-KR54AA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002887 KR54AA Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-KR54AA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC188.07 FYPO:0002687 KR54AA Not assayed or wild type 972 h- ccq1 ccq1-KR54AA amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29216371 4896 2017-12-18 PomBase SPCC830.05c FYPO:0005011 405-557(conditional) Not assayed or wild type 972 h- epl1 epl1-FLEx-DCt other ECO:0000337 FYECO:0000126 high PMID:37550452 4896 2023-08-31 (Figure 6) PomBase SPCC830.05c FYPO:0002061 405-557(conditional) Not assayed or wild type 972 h- epl1 epl1-FLEx-DCt other ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:37550452 4896 2023-08-31 (Figure 5) PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0006548 1772-1774 Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 nc-pho1-5'cryptic-splice2 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Remarkably, strains carrying splice site mutations showed significant upregulation of the pho1 transcript (Fig. 3c), similar to the effect observed in pir2-1, cwf10- 1 and prtΔ (Figs. 1b, 2c and Supplementary Fig. 1b) PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0002697 met9::ura4 Null 972 h- met9 met9::ura4+ disruption ECO:0005801 PMID:12112238 4896 2013-09-20 PomBase SPAC56F8.10 FYPO:0000040 met9::ura4 Null 972 h- met9 met9::ura4+ 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type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:38985524 4896 2024-07-29 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0006593 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000940 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:19942852 4896 2018-06-21 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000274 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0001489 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0002061 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31042107 4896 2019-05-18 PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0006592 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 80 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. S2, 3) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0006594 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 80 high assayed_using(PomBase:SPBC428.20c) PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 3) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0005380 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0003541 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 5A) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0005612 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1786.03) PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 6a) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0005612 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 6a) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0003241 L254S,L717P Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-18 amino_acid_mutation ECO:0005638 complete PMID:19942852 4896 2018-06-21 PomBase SPCC757.07c FYPO:0001310 wild type Overexpression 972 h- ctt1 ctt1+ wild_type ECO:0005638 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC757.07c FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- ctt1 ctt1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:24521463 4896 2014-03-19 PomBase SPCC757.07c FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- ctt1 ctt1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:10380645 4896 2012-06-12 PomBase SPCC757.07c FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 h- ctt1 ctt1+ wild_type ECO:0005638 PMID:22212525 4896 2014-09-25 PomBase SPCC757.07c FYPO:0001103 wild type Overexpression 972 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Subsequent cytokinesis appeared to cut through the chromosome mass, resulting in aneuploidy in 12% of mitotic cells. 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FYPO:0007930 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001214 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph mrc1 mrc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007925 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph mrc1 mrc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000268 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000268 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000315 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0003656 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC694.06c FYPO:0009063 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 4D) PomBase SPAC694.06c FYPO:0005648 deletion 972 h- mat gene-induced haploid meiosis, nda3-K311 mrc1 mrc1delta deletion ECO:0001232 PMID:34851403 4896 2023-06-10 In mrc1Δ cells, sister kinetochores and centromere cores separated at a low, but significant, level (Fig. 3A-D; Figs S2C and S3A,B), and non-separated signals were significantly wider in shape (Fig. 3E,F; Fig. S3C,D). PomBase SPAC694.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrc1 mrc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mrc1 mrc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0002176 deletion 972 h- mrc1 mrc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPCC1393.06c FYPO:0001136 unknown Not assayed or wild type 972 h- ipi1 ipi1-1 unknown ECO:0000106 PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPCC1393.06c FYPO:0001135 unknown Not assayed or wild type 972 h- ipi1 ipi1-1 unknown ECO:0000106 PMID:21385875 4896 2012-07-26 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001045 C374A,C377A Not assayed or wild type 972 h- pqr1 spx1-C374A,C377A spx1-C374A-C377A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 10B) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001357 C374A,C377A Not assayed or wild type 972 h- pqr1 spx1-C374A,C377A spx1-C374A-C377A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 10A) PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0002061 GAAAC160TTTCA Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-PTL2U nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:8390662 4896 2014-06-10 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC57A7.15c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pex22 pex22delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000703 297-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC306.09c),assayed_using(PomBase:SPCC306.09c) PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPCC306.09c FYPO:0000703 297-551 Not assayed or wild type 972 h- cap1 cap1-NT partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.05c),assayed_using(PomBase:SPCC306.09c) PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0006628 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0008133 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0008040 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0002127 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.14) PMID:37815455 4896 2023-10-11 In contrast, PM Its3-mNG was mildly reduced at 25°C and increased 1.8-fold at 36°C in pik1-11 compared to wild-type cells (Fig. 2E-F and S1E) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0002061 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0002061 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:37815455 4896 2023-10-14 pik1-11 cells grow similarly to wild-type at 25 ̊C and 29 ̊C but pik1-11 cells do not grow at 32 ̊C or 36 ̊C (Fig. 1C) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0001367 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-14 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0003736 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 (Figure 1F) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0000644 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC2G2.02) PMID:37815455 4896 2023-10-11 (Fig. S1D) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0000644 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC9G1.10c) PMID:37815455 4896 2023-10-11 (Fig. S1D) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0002674 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC577.06c) PMID:37815455 4896 2023-10-11 (Fig. S1D) PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0001903 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 (Fig. 1D-E). PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0002253 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0000024 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 low PMID:37815455 4896 2023-10-11 PomBase SPAC22E12.16c FYPO:0002060 D718G,C796R,T803A Not assayed or wild type 972 h- pik1 pik1-11 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:37815455 4896 2023-10-14 pik1-11 cells grow similarly to wild-type at 25 ̊C and 29 ̊C but pik1-11 cells do not grow at 32 ̊C or 36 ̊C (Fig. 1C) PomBase SPBC1706.03 FYPO:0002061 wild type Knockdown 972 h- fzo1 fzo1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000148 PMID:30658998 4896 2019-05-17 PomBase SPBC428.17c FYPO:0002678 deletion 972 h- wpl1 wpl1delta deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:28438891 4896 2017-11-01 (Fig. 3C) PomBase SPBC428.17c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph wpl1 wpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC428.17c FYPO:0005898 deletion 972 h- wpl1 wpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 low assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:18079700 4896 2017-01-13 (Figure 3C, 3E) PomBase SPBC428.17c FYPO:0005898 deletion 972 h- wpl1 wpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:18079700 4896 2017-01-13 (Figure 3C, 3E) PomBase SPBC428.17c FYPO:0005897 deletion 972 h- wpl1 wpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:18079700 4896 2017-01-13 (Figure 3A, 3B) PomBase SPBC428.17c FYPO:0002680 deletion 972 h- wpl1 wpl1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 PomBase SPBC428.17c FYPO:0000674 deletion 972 h- wpl1 wpl1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21300781 4896 2013-07-04 PomBase SPBC428.17c 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4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-T4A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-T4A rpb1-CTD-T4A29|rpb1-T4A|rpb1-T4A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c),assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08),assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c),assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0003903 CTD-T4A Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-T4A rpb1-CTD-T4A29|rpb1-T4A|rpb1-T4A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:33711009 4896 2022-10-04 PomBase SPAC15A10.08 FYPO:0002561 1-490 Not assayed or wild type 972 h- ain1 ain1-EF partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC15A10.08) PMID:28338873 4896 2021-06-10 PomBase SPBC1198.06c FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dfg501 dfg501delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase 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ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005571 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC12C2.02c) PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005571 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC777.08c) PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004839 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC1235.14) PMID:25411338 4896 2015-08-13 The Ght5 protein, which is localized on the plasma membrane in the WT, fails to be localized on the plasma membrane, accumulating in the cytoplasm. PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004839 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.14) PMID:34028542 4896 2021-06-18 Cytoplasmic Ght5-GFP was observed within the vacuolar membrane stained with FM4-64. PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002678 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:33137119 4896 2021-04-13 (Fig. 3C) The wild type Gad8 is not phosphorylated at T387 in the absence of Tor1 and is only weakly phosphorylated under low-glucose conditions (Fig 3C). PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002033 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002033 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-05-01 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002033 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002033 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:29699848 4896 2019-04-03 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001187 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:11096119 4896 2014-10-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 low PMID:22645648 4896 2017-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 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2015-07-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001407 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001407 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001407 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001407 deletion 972 h- leu1-32 tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27191590 4896 2016-07-21 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000021,FYECO:0000286 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002827 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 low assayed_using(PomBase:SPMTR.01) PMID:29632066 4896 2018-11-11 (Fig. S1B) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004604 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002340 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000059 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000185 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000059 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006549 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.13c) PMID:26152587 4896 2018-05-03 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0008378 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 high PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1A, B and C and Fig. 5) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0008438 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 high PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0008379 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 2A,B) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004137 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006753 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001140 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000335 PMID:17179073 4896 2015-11-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001140 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000254 PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005187 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005187 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 medium PMID:33137119 4896 2021-04-13 fig 2B PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 high PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000708 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000102 high PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000470 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001382 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001382 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07),assayed_substrate(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:21035342 4896 2016-07-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004194 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004194 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001324 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001324 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002976 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005314 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC725.16) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005314 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC22F3.09c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005314 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002387 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005034 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005034 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 3A) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001838 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001838 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1A,3A) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001838 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:12805221 4896 2015-11-18 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001838 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:21035342 4896 2016-07-08 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002975 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002975 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002975 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002975 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC660.14) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002975 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:26912660 4896 2016-03-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001152 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001152 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001152 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:18235227 4896 2015-12-17 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001152 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC70.12c) PMID:21307597 4896 2015-03-31 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001117 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000246 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:17179073 4896 2015-11-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001117 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000246 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:17179073 4896 2015-11-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001117 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000254 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:15466417 4896 2014-06-09 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001117 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC25B8.13c) PMID:24344203 4896 2014-04-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001355 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 1E) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0008128 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:25411338 4896 2015-08-18 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009007 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005188 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19546237 4896 2016-01-12 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002830 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000314 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:33137119 4896 2021-04-13 (Fig. 7B) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000017 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000220 PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005077 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 PMID:17179073 4896 2015-11-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000998 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 PMID:17179073 4896 2015-11-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0003160 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 PMID:11096119 4896 2014-10-20 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002019 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000337 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tor1 tor1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009011 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009016 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000414 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002341 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006751 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0004575 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 PMID:35157728 4896 2022-03-01 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0003746 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 low PMID:33574613 4896 2021-03-15 (Fig. 1b) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005316 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 high PMID:35157728 4896 2022-03-01 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006752 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:29632066 4896 2018-11-06 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000972 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0001327 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:19417002 4896 2016-01-14 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006740 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1952.05) PMID:35157728 4896 2022-03-02 Unexpectedly, although there is no increase in MBF-dependent transcription, we detected an increase in Gcn5 binding at the promoters of cdc22+ or cdc18+ in Δtor1 or Δgad8 cells under normal or replication stress conditions (Fig 5A) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006740 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 PMID:35157728 4896 2022-03-02 Unexpectedly, although there is no increase in MBF-dependent transcription, we detected an increase in Gcn5 binding at the promoters of cdc22+ or cdc18+ in Δtor1 or Δgad8 cells under normal or replication stress conditions (Fig 5A) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0006552 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0003010 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC1952.05) PMID:35157728 4896 2022-03-02 We detected a markedly higher level of Gcn5 binding at subtelomeric genes in Δtor1 cells, compared with wild type cells (Fig 4A). PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0007526 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 high assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. S1D) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002681 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000221 assayed_using(PomBase:SPCC1902.01) PMID:26152587 4896 2018-05-02 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0002082 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.14) PMID:34028542 4896 2021-06-28 (Fig. 6) PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0000650 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0001232 PMID:23703609 4896 2013-06-27 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC186.04c) PMID:35157728 4896 2022-03-02 30 fold. Fig 2 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC186.05c) PMID:35157728 4896 2022-03-02 280 fold. Fig 2 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC186.06) PMID:35157728 4896 2022-03-02 120 fold. Fig 2 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000291 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.04c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.06) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC750.01) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBPB2B2.18) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC977.02) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC1348.03) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0005917 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC186.05c) PMID:29632066 4896 2018-11-10 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC30D10.10c FYPO:0009008 deletion 972 h- tor1 tor1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 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sep1 sep1+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000381 high assayed_protein(PomBase:SPAPYUG7.03c) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 1D) PomBase SPBC4C3.12 FYPO:0001327 wild type Overexpression 972 h- sep1 sep1+ wild_type ECO:0000112 FYECO:0000381 high assayed_protein(PomBase:SPAC6G10.12c) PMID:16317047 4896 2024-07-22 (Fig. 4C) PomBase SPBC4C3.12 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- sep1 sep1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:15509866 4896 2015-11-22 PomBase SPBC4C3.12 FYPO:0002060 wild type Overexpression 972 h- sep1 sep1+ wild_type ECO:0005638 PMID:10491317 4896 2014-07-01 PomBase SPBC4C3.12 FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- sep1 sep1+ wild_type ECO:0001232 PMID:10491317 4896 2014-07-01 PomBase SPAC2F3.07c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.07c SPAC2F3.07cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F3.07c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2F3.07c 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PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC3D6.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- prs5 prs5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC3D6.06c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prs5 prs5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.06c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 prs5 prs5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC83.03c FYPO:0005929 L479E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L479E amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:19394293 4896 2023-03-01 PomBase SPBC83.03c FYPO:0003411 L479E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L479E amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3) tas3-TAM Mutations Cause a Dramatic Loss of ura4+ Silencing at imr1 but Only a Modest Loss at otr1 PomBase SPBC83.03c FYPO:0000888 L479E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L479E amino_acid_mutation ECO:0000226 low PMID:26438724 4896 2018-02-02 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004205 L479E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L479E amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:19394293 4896 2023-03-01 To determine the effect of tas3-TAM mutations on cen siRNAs levels, we performed northern blot analysis on RNAs isolated from wild-type, tas3D, and tas3-TAM mutant cells. We found a dramatic reduction in the levels of both total (Figure 4C) and Ago1-purified (Figure 4D) cen siRNAs in all tas3-TAM mutants compared to wild-type. PomBase SPBC83.03c FYPO:0004083 L479E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L479E amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3C) PomBase SPCC1183.10 FYPO:0001357 Wtf10 with aa (73-160) replaced by Wtf5 aa (73-171) tethered to a deubiquitinase using the GFP-GBP interaction Ectopic 972 h- wtf10 wtf10(73-160)-swap-wtf5(73-171)-GFP::GBP-DUB other ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000263 PMID:38097609 4896 2025-01-07 (Fig. S6C) PomBase SPCC285.09c FYPO:0001660 wild type Overexpression 972 h- cgs2 cgs2+ wild_type ECO:0000335 PMID:1318497 4896 2014-08-05 PomBase SPCC285.09c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- cgs2 cgs2+ wild_type ECO:0005638 PMID:1318497 4896 2014-08-05 PomBase SPCC285.09c FYPO:0001043 wild type Overexpression 972 h- cgs2 cgs2+ wild_type ECO:0005638 PMID:1318497 4896 2014-08-05 PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0007146 516-519 Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10deltaB(NLS) rec10-290 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC17A5.18c) PMID:33526714 4896 2021-12-08 (Figure 2) PomBase SPAC25G10.04c FYPO:0007146 516-519 Not assayed or wild type 972 h- rec10 rec10deltaB(NLS) rec10-290 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC25G10.04c) PMID:33526714 4896 2021-12-08 (Figure 2) PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0009007 deletion 972 h- mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0009007 deletion 972 h- mrx15 mrx15delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mrx15 mrx15delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph mrx15 mrx15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP22H7.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- mrx15 mrx15delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0001838 deletion 972 h- vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c) PMID:22344254 4896 2021-02-07 vam6D mutant cells showed similar Rps6 phosphorylation levels to that of wild-type cells in the absence of amino acids. However, in contrast to wild-type cells, vam6D cells did not show an increase in Rps6 phosphorylation in the presence of amino acids. PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H4.14 FYPO:0001234 deletion 972 h- vam6 vam6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000226 PMID:22344254 4896 2021-02-07 The doubling time of vam6D was shorter in the presence of amino acids, indicating that these cells were still able to respond, at least partially, to the presence of amino acids (Fig. 5A) and that Vam6 has an important role in regulating cell growth in S. pombe but is not essential for responding to the availability of amino acids. 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PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001779 E430K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-809 crm1-809|crm1-AC1|crm1-E430K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8388878 4896 2013-01-28 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000848 E430K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-809 crm1-809|crm1-AC1|crm1-E430K amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000810 E430K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-809 crm1-809|crm1-AC1|crm1-E430K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:9368044 4896 2013-01-28 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001921 E430K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-809 crm1-809|crm1-AC1|crm1-E430K amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:9368044 4896 2013-04-23 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000080 E430K Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-809 crm1-809|crm1-AC1|crm1-E430K amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:8569688 4896 2012-03-13 PomBase SPAC1805.17 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fxn1 fxn1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24997422 4896 2016-01-07 PomBase SPCC1183.03c FYPO:0001119 wild type Overexpression 972 h- fxn1 fxn1+ wild_type ECO:0001232 PMID:24997422 4896 2016-01-06 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pex6 pex6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pex6 pex6delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pex6 pex6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- pex6 pex6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pex6 pex6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pex6 pex6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003210 798-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaPH M1-delta6|deltaPH-mid1|mid1delta798-920 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 medium PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Fig. 3B) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 798-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaPH M1-delta6|deltaPH-mid1|mid1delta798-920 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22918954 4896 2020-03-31 (Figure 4) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 798-920 Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-deltaPH M1-delta6|deltaPH-mid1|mid1delta798-920 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:10930468 4896 2023-03-02 localized in an identical manner to wild-type mid1p (Figure 9A) and was fully functional (Figure 7 and Table 2). PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000705 R196E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R196E amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002019 R196E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R196E amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002887 R196E Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-R196E amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:26365187 4896 2016-07-09 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000230 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:34613787 4896 2021-11-30 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000161 G345R Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0000161 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 80 high PMID:35609605 4896 2022-06-11 (Figure 3) PomBase SPCC645.05c FYPO:0003338 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:10769212 4896 2017-08-10 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002560 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium assayed_using(PomBase:SPBC1709.01) PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002023 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 29 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002023 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30928696 4896 2019-04-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002023 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:30928696 4896 2019-05-01 PomBase SPCC645.05c FYPO:0006025 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000006 assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Table 1) PomBase SPCC645.05c FYPO:0004481 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 1B) PomBase SPCC645.05c FYPO:0004481 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 3B) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002561 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18272786 4896 2018-01-26 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001880 G345R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC613.04c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 7A) PomBase SPCC645.05c FYPO:0000949 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 100 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 2) PomBase SPCC645.05c FYPO:0003526 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24244528 4896 2021-01-09 However, most filaments (99%) bound by -E1 were non-motile while most filaments bound by wild-type Myo2p were motile (Movie S2). PomBase SPCC645.05c FYPO:0000082 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000334 medium PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPCC645.05c FYPO:0007603 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24244528 4896 2021-01-09 However, -E1 motors exhibited relatively low activity under either condition (Figure S1). These experiments performed in the absence of actin suggest that defects in -E1 motors are not specific to actin displacement and motility, and probably reflect a general defect in conformation and function. PomBase SPCC645.05c FYPO:0002699 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:34613787 4896 2021-12-01 Mutations of either type II myosin gene in the myo2-E1 or myp2Δ strains reduced the numbers of actin molecules in contractile rings by more than half compared with wild-type cells at the end of 10 the maturation period and the onset of constriction (Fig. 6A-B and Table 1). PomBase SPCC645.05c FYPO:0003339 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26092938 4896 2015-08-20 PomBase SPCC645.05c FYPO:0003339 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 PMID:35609605 4896 2022-06-11 and is already defective in actomyosin  17 compaction at the permissive temperature of 24 C (Figure S1C, video S2) and (Figures 3A, 3B, and S3A)) PomBase SPCC645.05c FYPO:0003339 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001365 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:26092938 4896 2015-08-24 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001365 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001365 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001355 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001355 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001355 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:10769212 4896 2017-08-10 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001355 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:11294907 4896 2017-05-12 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001355 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001253 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:15265986 4896 2014-09-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0001253 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 17 PMID:15743909 4896 2017-09-14 PomBase SPCC645.05c FYPO:0004044 G345R Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002527 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:30928696 4896 2019-05-01 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002527 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:30928696 4896 2019-05-01 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002276 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:24244528 4896 2021-01-09 However, the lower molecular weight form of -E1 failed to accumulate over time following protease addition (Figure 4C), suggesting an altered conformation more sensitive to proteolysis. PomBase SPCC645.05c FYPO:0000650 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:16772338 4896 2014-05-01 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002061 G345R Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002061 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000201 PMID:10769212 4896 2017-08-10 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002061 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:31116668 4896 2019-05-31 PomBase SPCC645.05c FYPO:0008090 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure 2) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:18272786 4896 2018-01-26 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC613.04c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 6) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002559 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC613.04c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 6) PomBase SPCC645.05c FYPO:0002442 G345R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC613.04c) PMID:10852821 4896 2019-10-30 (Fig. 7A) PomBase SPCC645.05c FYPO:0000703 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPCC613.04c),assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15504913 4896 2024-04-19 (Fig. 3B, 3C) PomBase SPCC645.05c FYPO:0000703 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08),assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:10022828 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002085 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 low PMID:25977474 4896 2018-03-16 PomBase SPCC645.05c FYPO:0004430 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20110347 4896 2017-08-11 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002060 G345R Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002060 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10022828 4896 2017-01-25 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002104 G345R Not assayed or wild type 972 h- myo2 myo2-E1 rng5-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000201 PMID:10769212 4896 2017-08-10 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000082 C239Y Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1E2 cdc23-IE2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12185500 4896 2012-11-15 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003352 C239Y Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1E2 cdc23-IE2 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000005 high PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4D) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003352 C239Y Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1E2 cdc23-IE2 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000004 high PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4D) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000470 C239Y Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1E2 cdc23-IE2 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 complete PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4B) PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000470 C239Y Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-1E2 cdc23-IE2 amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 complete PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. 4B) PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0006664 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion ECO:0001232 ~60 PMID:30116786 4896 2018-08-28 (Fig. 4E) PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0000238 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0006660 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0000441 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0009032 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph aut12 aut12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001103 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001103 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001103 deletion 972 h- aut12 aut12delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC1D4.03c FYPO:0001103 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sec21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- sec21 sec21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A7.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec21 sec21delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000082 Y154H Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-D1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 All temperature-sensitive alleles grew less than wild-type at 36°C with the cdc16-C1 allele showing the greatest temperature-sensitivity (Figure 1I). PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0000118 Y154H Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-D1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 (Figure 1H) PomBase SPAC644.16 FYPO:0007350 disruption Knockdown 972 h- rna15 rna15-degron disruption ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPNCRNA.103) PMID:31811152 4896 2020-04-09 (Figure 1b) PomBase SPBC20F10.05 FYPO:0000703 493-972 Not assayed or wild type 972 h- nrl1 nrl1(N-term)+NRDE-2 partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPAC17H9.02),assayed_protein(PomBase:SPBC20F10.05) PMID:34209806 4896 2021-07-30 We observed similar intensities of interaction of the Nrl1(N-term) and the Nrl1(N-term + NRDE-2) constructs with Mtl1 (1511.2 ± 89.4 or 1558.2 ± 159.3 Miller units for the N-terminal region and the N-terminus with NRDE2 domain and Mtl1, respectively) PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0003066 L301S Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-85 amino_acid_mutation ECO:0001232 80 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0001489 L301S Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-85 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPBC32F12.04 FYPO:0000091 L301S Not assayed or wild type 972 h- gtb1 gtb1-85 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15280226 4896 2015-04-23 PomBase SPAC11E3.01c FYPO:0002177 737-1288 Not assayed or wild type 972 h- swr1 swr1deltaC partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:19160458 4896 2014-03-19 PomBase SPAC323.08 FYPO:0001554 Q12R,P57L,Y60H,V86A,L132S,I142T,Y149C,L161P,S167P,V192A,F210L Not assayed or wild type 972 h- rmp1 rmp1-KA18 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:25401760 4896 2016-06-14 PomBase SPAC323.08 FYPO:0000082 Q12R,P57L,Y60H,V86A,L132S,I142T,Y149C,L161P,S167P,V192A,F210L Not assayed or wild type 972 h- rmp1 rmp1-KA18 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25401760 4896 2016-06-14 PomBase SPAC323.08 FYPO:0003675 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fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 5A) PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc3 cdc3-181 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC4A8.15c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc3 cdc3-181 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0003715 skb1-slf1(451-485) Not assayed or wild type 972 h- skb1 skb1-slf1C skb1-slf1-C-chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16H5.11c) PMID:25009287 4896 2014-08-26 PomBase SPBC16H5.11c FYPO:0003711 skb1-slf1(451-485) Not assayed or wild type 972 h- skb1 skb1-slf1C skb1-slf1-C-chimera fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:25009287 4896 2014-08-26 PomBase SPBC337.13c FYPO:0001164 S16N Not assayed or wild type 972 h- gtr1 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from the fus1 promotor at the ura4 locus Not assayed or wild type 972 h- fus1 pfus1:fus1N-cdc12deltaolig other ECO:0001232 high PMID:35673994 4896 2022-06-15 PomBase SPAC17G6.11c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ghs2 ghs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G6.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- ghs2 ghs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G6.11c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ghs2 ghs2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP7G5.04c FYPO:0004908 G913A Not assayed or wild type 972 h- lys1 lys1-G913A lys1-G910A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:15546125 4896 2015-10-01 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0000164 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assayed_transcript(PomBase:SPAC1039.09) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0005995 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:39652606 4896 2025-01-07 (Fig. 2E) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0000847 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 low assayed_using(PomBase:SPBC1734.04) PMID:28202541 4896 2017-02-28 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0006068 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low assayed_using(PomBase:SPAC27F1.07) PMID:28202541 4896 2017-02-28 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0000825 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000125,FYECO:0000137,FYECO:0000208 low assayed_transcript(PomBase:SPAC926.09c) PMID:38780300 4896 2024-09-18 (Fig. 3) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0000650 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mga2 mga2delta 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph mga2 mga2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph mga2 mga2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph mga2 mga2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0005581 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0000335 PMID:27053105 4896 2016-08-03 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0002400 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0007474 deletion 972 h- KanMX6, ade6-M216, ura4-D18, leu1-32 h+ mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33419777 4896 2021-02-02 (Fig. 1B, C Table 1) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0007474 deletion 972 h- KanMX6 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33419777 4896 2021-02-02 (Fig. 3H) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0007660 deletion 972 h- KanMX6, ade6-M216, ura4-D18, leu1-32 h+ mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33419777 4896 2021-02-02 (Fig. 2, Table 2) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0007660 deletion 972 h- KanMX6 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:33419777 4896 2021-02-02 (Fig. 3A-F) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0008362 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000125,FYECO:0000137 PMID:39652606 4896 2025-01-07 (Fig. 3) PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mga2 mga2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 low high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mga2 mga2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC26H5.05 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mga2 mga2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.08 FYPO:0001309 (-144)-(-142) Not assayed or wild type 972 h- Strain DY8531 (derivative of standard lab strain 972 h- engineered to feature the large inversion present in most other S. pombe strains (Hu et al. 2015)) SPBC409.08 SPBC409.08--144delGTT(5'-UTR) partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:30072377 4896 2018-11-26 (Fig. 3B, Fig. 4A,B) PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ale1 ale1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ale1 ale1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- ale1 ale1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ale1 ale1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16A3.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ale1 ale1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001045 Y26A,K30A,K34A Not assayed or wild type 972 h- pqr1 spx1-Y26A,K30A,K34A spx1-Y26A-K30A-K34A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 10B) PomBase SPAC6B12.07c FYPO:0001357 Y26A,K30A,K34A Not assayed or wild type 972 h- pqr1 spx1-Y26A,K30A,K34A spx1-Y26A-K30A-K34A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 10A) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006098 1-430,756-1372 Overexpression 972 h- fus1 fus1-N(431-755) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high high assayed_protein(PomBase:SPAC20G4.02c) PMID:36202103 4896 2022-11-10 (Fig. 1G) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0005404 1055-1064 Overexpression 972 h- ter1 ter1delta-1055-1064 partial_nucleotide_deletion ECO:0000337 PMID:26305931 4896 2016-07-15 PomBase SPBC29A3.04 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl8 rpl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.04 FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ rpl8 rpl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPBC29A3.04 FYPO:0001490 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl8 rpl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpl8 rpl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC29A3.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl8 rpl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29A3.04 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl8 rpl8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0004376 S2A,S4A,T77A,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Ectopic 972 h- atf1 atf1-10A/I atf1(10A/I) amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 PMID:38289024 4896 2024-03-23 (Figure 6B) PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0002336 S2A,S4A,T77A,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I Ectopic 972 h- atf1 atf1-10A/I atf1(10A/I) amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000004 PMID:38289024 4896 2024-03-21 (Figure 3D) PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 avl9 avl9delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 avl9 avl9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 avl9 avl9delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- avl9 avl9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 avl9 avl9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 avl9 avl9delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001407 C630S Overexpression 972 h- pyp2 pyp2-C630S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001122 C630S Overexpression 972 h- pyp2 pyp2-C630S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8649397 4896 2013-08-14 PomBase SPAC19D5.01 FYPO:0001492 C630S Overexpression 972 h- pyp2 pyp2-C630S amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:7937842 4896 2014-08-07 PomBase SPAC25G10.02 FYPO:0003769 wild type Overexpression 972 h- cce1 cce1+ wild_type ECO:0000059 PMID:12823554 4896 2014-09-02 PomBase SPCC18B5.03 FYPO:0001384 K596L Not assayed or wild type 972 h- wee1 wee1-K596L amino_acid_mutation ECO:0000112 PMID:1825699 4896 2013-02-14 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0009007 deletion 972 h- pdc202 pdc202delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0000245 deletion 972 h- pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 PMID:25102102 4896 2015-09-29 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pdc202 pdc202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pdc202 pdc202delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- pdc202 pdc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdc202 pdc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13A11.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pdc202 pdc202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC25H1.03 FYPO:0001645 F29R,H30R Not assayed or wild type 972 h- atg101 atg101-F29R,H30R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC25H1.03),assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:26030876 4896 2019-08-13 PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0005018 320-407 Not assayed or wild type 972 h- tbf1 tbf1-loop partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:38677290 4896 2024-12-13 Interestingly, although the internal loop region (spTbf1loop, residues 320- 407) could not bind S. pombe telomeric DNA alone, it enhanced the binding affinity of both spTbf1TRFH and spTbf1Myb-L (Figure 4F), indicative of important roles of spTbf1loop in spTbf1 recognition of telomeric DNA. Consistently, deletion of the loop region (spTbf1Dloop) significantly reduced the binding affinity of spTbf1 with S. pombe telomeric DNA (Figure 4F). PomBase SPBC649.05 FYPO:0003331 T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A,T78A cut12.T75AT78A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) plo1 decreased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001645 T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A,T78A cut12.T75AT78A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007475 T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A,T78A cut12.T75AT78A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007385 T75A,T78A Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75A,T78A cut12.T75AT78A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-07-20 (Fig. 2I) Fig3C double mutant cut12.T75A T78A binds dis2 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001696 F117G Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as1 orb5.as1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 medium PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 2B) orb5.as2 displayed moderate sensitivity to 30 mM of 3BrB-PP1, whereas orb5.as1 showed none PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001696 F117G Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as1 orb5.as1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000223 medium PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 2B) orb5.as2 displayed moderate sensitivity to 30 mM of 3BrB-PP1, whereas orb5.as1 showed none PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 S87A,T94A,S402A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S402A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 medium assayed_protein(PomBase:SPAC8E11.02c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0001645 S87A,T94A,S402A,S566A,S650A,S654A Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-S87A,T94A,S402A,S566A,S650A,S654A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 high assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 5) PomBase SPAC6F12.05c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP tnr3 tnr3+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsc1 rsc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000082 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0002386 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-23 Specifically, we assessed TF localization in cells lacking the RSC subunit Rsc1, the SWI/SNF ATP-dependent chromatin remodeler Snf22 and/or bearing a mutation in the ATPase domain of Ino80 (i.e., ino80K873A). In all cases, we observed that Php3 and Moc3 binding to cenH and dh regions were only marginally reduced but nevertheless not abolished (Supplementary Fig. 4f–i). PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0002386 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 Specifically, we assessed TF localization in cells lacking the RSC subunit Rsc1, the SWI/SNF ATP-dependent chromatin remodeler Snf22 and/or bearing a mutation in the ATPase domain of Ino80 (i.e., ino80K873A). In all cases, we observed that Php3 and Moc3 binding to cenH and dh regions were only marginally reduced but nevertheless not abolished (Supplementary Fig. 4f–i). PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0001355 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0004376 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000291 low PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1F, S1G) PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0008417 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000226 high PMID:39096900 4896 2025-06-12 (Fig. S6) PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0006995 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000049 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1B) PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0004742 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1C, S1D) PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0003555 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0000291 PMID:21215368 4896 2025-07-02 (Fig. S1E) PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0004325 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:37445861 4896 2024-04-16 (Fig. 1) PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000094 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000097 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18622392 4896 2015-10-26 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000102 deletion 972 h- rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph rsc1 rsc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4B4.03 FYPO:0000785 deletion 972 h- rsc1 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FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0001245 deletion 972 h- SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0009063 deletion 972 h- h- prototroph SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1604.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC1604.03c SPBC1604.03cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0003412 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:34731638 4896 2021-11-19 PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0004577 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 Intriguingly, while H3K9me2 levels were unaltered in spt16-1, H3K9me3 levels were reduced at several loci at the TEL1L subtelomeric region (i.e., SPAC212.09c, SPAC212.08c, and SPAC212.06c; compare Figure 4B with 4A) PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0006631 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPBP8B7.19) PMID:34731638 4896 2021-11-26 (Figures S2C-S2E) in chromatin/euchromatin PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0006631 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPBC609.05) PMID:34731638 4896 2021-11-26 (Figures S2C-S2E) in chromatin/euchromatin PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0002387 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:34731638 4896 2021-11-26 found reduced Swi6 binding in spt16-1 at subtelomeric genes close to the heterochromatin boundary (SPAC212.12, SPAC212.06c; Figure 4D). PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0007891 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-12-07 (Figure 2D) reduced heterochromatin spreading at mating-type and subtelomeric heterochromatin PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0007480 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-19 (Figure 2D) reduced heterochromatin spreading at mating-type and subtelomeric heterochromatin PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0005917 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:34731638 4896 2021-11-19 we observed derepression of several subtelomeric genes (Figures 2E and S2G). PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0005917 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2023-01-25 we observed derepression of several subtelomeric genes (Figures 2E and S2G). PomBase SPBP8B7.19 FYPO:0004742 unknown Knockdown 972 h- spt16 spt16-1 unknown ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-19 (Figure S2F) PomBase SPAC2H10.01 FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2H10.01 SPAC2H10.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2H10.01 SPAC2H10.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.01 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2H10.01 SPAC2H10.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.01 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2H10.01 SPAC2H10.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2H10.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC2H10.01 SPAC2H10.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 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SPBC11B10.09 FYPO:0001974 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:8887552 4896 2013-02-08 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0004166 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000422,FYECO:0000451 PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 5A) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001038 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000422,FYECO:0000451 medium assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 3A and B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008213 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000422,FYECO:0000451 PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 2J) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0008213 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000422,FYECO:0000451 PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 2I) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005704 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:10567589 4896 2019-02-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001927 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002807 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001400 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:2406029 4896 2014-09-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001399 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:2406029 4896 2014-09-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000776 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),residue(Y15) PMID:1703321 4896 2016-10-04 (Figure 4D) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001903 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:1549179 4896 2013-01-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002687 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:9487130 4896 2014-08-26 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001046 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 high PMID:37787465 4896 2024-04-22 Table 1 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001046 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000422,FYECO:0000451 low PMID:37787465 4896 2024-04-22 Table 1 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001046 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000422,FYECO:0000451,FYECO:0000452 medium PMID:37787465 4896 2024-04-22 Table 1 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001046 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000119,FYECO:0000137 medium PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 5E and F) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0006832 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:29813053 4896 2019-02-01 (Fig. 2) The start of septation scales with anaphase B progression and correlates linearly with the cell length. PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000088 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:2406029 4896 2014-09-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000088 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:8497322 4896 2016-09-20 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000088 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000088 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000088 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:12062100 4896 2021-09-23 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000088 C67Y Not assayed or wild type 972 h- cdc2 cdc2-3w cdc2.32|wee2-3 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SPAC1782.09c FYPO:0002538 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0000705 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c),assayed_using(PomBase:SPAC8E11.02c) PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004470 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0002535 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0001838 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0002536 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0003876 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0004469 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0003503 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC1782.09c FYPO:0002526 S396A,S408A,S467A,S468A,S493A,S513A Not assayed or wild type 972 h- clp1 clp1-6A-b clp1(6A)|clp1-6A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18951025 4896 2015-02-24 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000705 299-313 Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-deltaCD partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPAPYUG7.02c) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. 1) PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000655 61-688 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-LEM60 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 3) PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-sp3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-sp3 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10924454 4896 2015-12-09 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0007797 deletion 972 h- gls2 gls2delta deletion ECO:0005801 PMID:19605557 4896 2021-02-28 However, GII activity is significantly reduced in the microsomal fraction of ΔGIIΔ cells (Figure 2B), suggesting that GIIΔ is involved in ER localization of GII+ PomBase SPAC1002.03c FYPO:0001309 deletion 972 h- gls2 gls2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0007030 deletion 972 h- gls2 gls2delta deletion ECO:0000335 PMID:30389790 4896 2019-07-23 (Fig. S4) PomBase SPAC1002.03c FYPO:0006982 deletion 972 h- gls2 gls2delta deletion ECO:0001232 PMID:30389790 4896 2019-07-23 (Fig. 10) PomBase SPAC1002.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 PMID:30389790 4896 2019-08-01 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1002.03c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph gls2 gls2delta deletion ECO:0005638 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2F12.08c FYPO:0008182 G276R Overexpression 972 h- ceg1 pce1-G276R amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:24939935 4896 2024-02-27 (Fig. 4E) PomBase SPCC594.05c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 spf1 spf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC594.05c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 spf1 spf1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf1 spf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC594.05c FYPO:0002917 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000112 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3A) PomBase SPCC594.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0003352 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPCC594.05c FYPO:0000470 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0005580 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4A) PomBase SPCC594.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC146.09c) PMID:38181050 4896 2024-05-06 loss of most members of the COMPASS complex, including Set1, Spp1, Swd1, Swd3, Swd2, and Ash2 leads to a significantly decreased amount of Lsd1 protein (Fig 3A) PomBase SPCC594.05c FYPO:0001324 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC23E2.02) PMID:38181050 4896 2024-05-06 A similar pattern was observed in the Lsd2 samples, although the Lsd2 protein levels also decreased with shg1Δ (Fig 3B). PomBase SPCC594.05c FYPO:0001355 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000135,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPCC594.05c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0004689 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000231 medium PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3D) PomBase SPCC594.05c FYPO:0005917 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.07) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3E) PomBase SPCC594.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 spf1 spf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC594.05c FYPO:0002360 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(SO:0001898) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3C) PomBase SPCC594.05c FYPO:0000963 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 PMID:12589755 4896 2014-12-23 PomBase SPCC594.05c FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC594.05c FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC594.05c FYPO:0008252 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000231 PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 3B) PomBase SPCC594.05c FYPO:0001317 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0000112 assayed_transcript(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. S5) PomBase SPCC594.05c FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0004325 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000087 deletion 972 h- spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 PMID:26567340 4896 2015-12-14 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC594.05c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph spf1 spf1delta deletion 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to SPBs (Figure 5A). 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000438 PMID:38133430 4896 2023-12-26 (Fig. 5A) PomBase SPAC110.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- pss1 pss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:9524252 4896 2014-09-25 PomBase SPAC110.04c FYPO:0002187 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pss1 pss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC110.04c FYPO:0002482 deletion 972 h- pss1 pss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9524252 4896 2014-09-25 PomBase SPAC110.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- pss1 pss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC110.04c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pss1 pss1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC110.04c FYPO:0001090 deletion 972 h- pss1 pss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000117 PMID:9524252 4896 2014-09-25 PomBase SPAC110.04c FYPO:0003612 deletion 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assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 80 high assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 3) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0005029 I172T,K543E,I624T,E732G,A1022V,I1153V,H1163R Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 80 high assayed_using(PomBase:SPBC428.20c) PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 3) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0006593 I172T,K543E,I624T,E732G,A1022V,I1153V,H1163R Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0000274 I172T,K543E,I624T,E732G,A1022V,I1153V,H1163R Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0001489 I172T,K543E,I624T,E732G,A1022V,I1153V,H1163R Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 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type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:19942852 4896 2018-06-21 (Fig. 1D) PomBase SPAC6G9.06c FYPO:0003241 I172T,K543E,I624T,E732G,A1022V,I1153V,H1163R Not assayed or wild type 972 h- pcp1 pcp1-15 amino_acid_mutation ECO:0005638 complete PMID:19942852 4896 2018-06-21 PomBase SPAC18G6.02c FYPO:0002133 1-455 Not assayed or wild type 972 h- chp1 chp1-3/3 partial_amino_acid_deletion ECO:0001807 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:22727667 4896 2014-06-11 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0001117 749 nt promoter and transcription start site deletion Null 972 h- prt2 prt2delta-2 partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0002243 749 nt promoter and transcription start site deletion Null 972 h- prt2 prt2delta-2 partial_nucleotide_deletion ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-14 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0000825 749 nt promoter and 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h- ell1 ell1delta deletion ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC821.09) PMID:33533152 4896 2025-01-06 (Fig. 6B) PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0000650 deletion 972 h- ell1 ell1delta deletion ECO:0001232 PMID:30102332 4896 2019-04-29 (Figure 5) PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0001309 deletion 972 h- ell1 ell1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0006902 deletion 972 h- ell1 ell1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0005705 deletion 972 h- ell1 ell1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ell1 ell1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBP23A10.14c FYPO:0000674 deletion 972 h- ell1 ell1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29043956 4896 2019-05-31 PomBase SPBP23A10.14c 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2020-09-11 PomBase SPBC83.18c FYPO:0003776 T178D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-T178D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:32878942 4896 2020-10-07 (Fig. S3F) PomBase SPBC83.18c FYPO:0000674 T178D Not assayed or wild type 972 h- fic1 fic1-T178D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:37158439 4896 2023-05-21 (Figure S1) PomBase SPAC21E11.08 FYPO:0001122 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lcb2 lcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- lcb2 lcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC21E11.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lcb2 lcb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC21E11.08 FYPO:0002451 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 lcb2 lcb2delta deletion ECO:0001232 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uba1 uba1-L951D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.20) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC18B11.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC1259.15c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1604.21c FYPO:0002768 L951D Not assayed or wild type 972 h- uba1 uba1-L951D amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC211.07c) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC409.10 FYPO:0000747 unknown Not assayed or wild type 972 h- ade7 ade7- unknown ECO:0005638 PMID:17248775 4896 2016-12-20 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 D648A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-D648A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0002033 M82G,G168A Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-as3 fin1.as3 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000170,FYECO:0000244 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),residue(T75,T78) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 4A) HU arrest Fig4E synchronous culture PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0003306 M82G,G168A Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-as3 fin1.as3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 3a) PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0007385 M82G,G168A Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-as3 fin1.as3 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000244,FYECO:0000346 high assayed_using(PomBase:SPBC649.05),assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:23333317 4896 2020-08-03 (Fig. 4E) in absence of fin1 activity dis2 remains bound to cut 12 PomBase SPAC19E9.02 FYPO:0003481 M82G,G168A Not assayed or wild type 972 h- fin1 fin1-as3 fin1.as3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000244 PMID:22684255 4896 2020-12-23 (Figure 3A; Table 1) indicating that inhibition of Sid2 or Fin1 delayed the timing of mitotic commitment until a new size threshold for division was me PomBase SPBP8B7.28c FYPO:0007599 TetR-stc1delta(89-126) Not assayed or wild type 972 h- stc1 TetR-stc1-deltaZF2 TetR-stc1-deltaZF2(89-126) fusion_or_chimera ECO:0000049 PMID:23613586 4896 2020-12-16 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.07c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph aro3 aro3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP8A3.07c 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ade6-M210 aro3 aro3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000080 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 2) However, S. pombe is viable when Pro3 or Pro6 is changed to alanine in every other heptad, including the rump, in the context of the full-length CTD (Fig. 2), signifying that reduced proline content is tolerated and that Pro3 and Pro6 need not be present in consecutive heptads PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.02c),assayed_transcript(PomBase:SPAC23G3.03) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 7B) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 5B) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 9C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c),assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08),assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.03c),assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c),assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09),assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09),assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c),assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:33579781 4896 2022-11-15 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001357 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35012333 4896 2022-11-23 (Fig. 7A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001357 CTD-P6A(r2-r29-2) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-P6A(r2-r29-2) rpb1-CTD-P6.P6A|rpb1-P6-P6A|rpb1-P6-P6A(1-29) amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 9B) PomBase SPBC20F10.06 FYPO:0004318 W74A Not assayed or wild type 972 h- mad2 mad2-W74A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24161933 4896 2020-05-31 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0002133 deletion 972 h- thc1 thc1delta deletion ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2A9.10),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.25) PMID:37403782 4896 2023-07-10 Further supporting the idea that U6 complex formation is contingent on the presence of all three proteins, we observed a loss of snoZ30 binding to Bmc1 upon knockout of any member of the complex (Supplementary Figure S2A). PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0008110 deletion 972 h- thc1 thc1delta deletion ECO:0000337 PMID:37403782 4896 2023-07-06 reproducible decrease in modification at several other sites, most notably A64 (Figure 1C, D, Supplementary Figure S3). PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph thc1 thc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- thc1 thc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thc1 thc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC18B5.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 thc1 thc1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta 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h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC17G9.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1102 rpl1102delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC821.08c FYPO:0004198 wild type Knockdown 972 h- slp1 slp1+ slp1+(cohesin promoter)|slp1+(nmt41) wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:26527280 4896 2020-06-14 (Fig. S6D) PomBase SPAC821.08c FYPO:0001324 wild type Knockdown 972 h- slp1 slp1+ slp1+(cohesin promoter)|slp1+(nmt41) wild_type ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC821.08c) PMID:24161933 4896 2024-03-29 , Fig. S4 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21- unknown ECO:0005638 PMID:8290359 4896 2013-05-01 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000031 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 97 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003659 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003094 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003411 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. S10) PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003412 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003216 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 complete PMID:31278118 4896 2020-04-30 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002827 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17289569 4896 2020-03-12 pericentromeric repeats, the silent mat locus, telomeres, and rDNA loci were derepressed in strains lacking any individual core component of SHREC (Figure 5A). PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7) PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0004604 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003352 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000337 low PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000877 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:24013500 4896 2024-06-20 Similar results were obtained when comparing H3K9me2 levels at dg and dh repeats of the seb1-1 clr1D double mutant with the levels of the corresponding single mutants (Fig. 3C). T PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000470 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002836 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5E). Enhanced transcriptional-machinery occupancy at heterochromatic repeats in SHREC defective cells,..should result in elevated repeat transcripts ...corresponding increase in siRNA production. PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000049 PMID:17289569 4896 2020-03-12 (Figure 5B) we found increases in H3K14ac levels and greater Pol II occupancy at the reporter embedded within pericentromeric heterochromatin in....strains lacking SHREC components PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000966 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0006681 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000226 PMID:19111658 4896 2018-09-24 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0006300 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0004237 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19111658 4896 2025-07-02 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000825 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Northern blot (Supplementary Figure S1A). Compared to wild-type pho1 mRNA levels, a slight accumulation was detected for all strains. However, this is less pronounced than in clr3Δ, indicating that Clr3 is unlikely to entirely depend on Clr2 or other components of SHREC for recruitment to pho1. PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0005917 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7) PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 clr1 clr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002567 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000291 PMID:19111658 4896 2018-09-21 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 clr1 clr1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0007529 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0000226 PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 clr1 clr1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph clr1 clr1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- clr1 clr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr1 clr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2D10.17 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 clr1 clr1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000608 deletion 972 h- hus5 hus5delta deletion ECO:0001232 PMID:7768995 4896 2014-05-19 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hus5 hus5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000141 deletion 972 h- hus5 hus5delta deletion ECO:0001232 PMID:7768995 4896 2014-05-19 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0003209 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hus5 hus5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000142,FYECO:0000225 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.11) PMID:21850271 4896 2014-07-24 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000470 deletion 972 h- hus5 hus5delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002262 deletion 972 h- hus5 hus5delta deletion ECO:0001232 PMID:7768995 4896 2014-05-19 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002061 deletion 972 h- hus5 hus5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000093 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 hus5 hus5delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27558664 4896 2016-08-24 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC30D11.13 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph hus5 hus5delta deletion ECO:0005638 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2023-06-28 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0004325 deletion 972 h- pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0000086 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho8 pho8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:21850271 4896 2013-09-03 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- pho8 pho8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho8 pho8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC14F5.13c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pho8 pho8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1142.08 FYPO:0001645 1-150 Not assayed or wild type 972 h- fhl1 fhl1delta1-150 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.08),assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.11c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 The interaction between Fhl1 and Ifh1 was impaired in the mutant expressing Fhl1 without the N-terminal 150 amino acid residues (Fig. 4E), indicating that the Ifh1-FHl1 interaction depends on the forkhead-associated (FHA) domain of Fhl1. PomBase SPCC23B6.03c FYPO:0000705 1-2429 Not assayed or wild type 972 h- tel1 tel1(2430-2812) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:15964794 4896 2016-06-17 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000705 2889-3661 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-3 tra1delta2927-3699 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:34686329 4896 2023-09-01 (Figure 3D) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000705 2889-3661 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-3 tra1delta2927-3699 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 PMID:34686329 4896 2023-09-05 PomBase SPAC3A11.12c FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpt5 rpt5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3A11.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- rpt5 rpt5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC3A11.12c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpt5 rpt5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1D4.11c FYPO:0003412 lkh1::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 lkh1 lkh1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC644.04 FYPO:0003674 E260A Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-E260A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11139608 4896 2015-01-14 PomBase SPAC644.04 FYPO:0004299 E260A Not assayed or wild type 972 h- pct1 pct1-E260A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC644.04) PMID:11139608 4896 2015-01-14 PomBase SPAC23A1.19c FYPO:0001357 50-250 Overexpression 972 h- hrq1 hrq1-CDTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22064477 4896 2012-04-18 PomBase SPCC1795.01c FYPO:0005781 L216K Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 mad3 mad3-Dbox-mimic mad3-Dbox-mimic-(L/K) amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 low PMID:28366743 4896 2017-05-08 (Fig. 1B) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 D134R Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D134R cdc2-R134 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 D134R Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D134R cdc2-R134 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8437586 4896 2018-04-03 PomBase SPCC188.06c FYPO:0002061 K114R Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-K114R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7969124 4896 2014-06-13 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000581 deletion 972 h- mip1 mip1delta deletion ECO:0005638 PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0002430 deletion 972 h- mip1 mip1delta deletion ECO:0001232 PMID:10648609 4896 2015-03-30 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mip1 mip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mip1 mip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- mip1 mip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mip1 mip1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC962.01 FYPO:0008455 1079-1176 Not assayed or wild type 972 h- tcb1 tcb1deltaC2C partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 FYECO:0000466 high PMID:40629316 4896 2025-09-01 Furthermore, our domain analysis using truncation mutants manifest that the TM, SMP, and C2A domains of either E-Syts, as well as the C2C domain of Tcb1, are crucial for hypotonic PM expansion (Fig. 3E and Addi- tional file 1: Fig. S3C). PomBase SPAC24H6.09 FYPO:0000644 E318A,N505A Not assayed or wild type 972 h- gef1 gef1-EANA amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC24H6.09) PMID:29930085 4896 2018-07-23 (Figure S3) PomBase SPBC460.03 FYPO:0001592 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:20944394 4896 2012-10-15 PomBase SPBC460.03 FYPO:0001594 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:20944394 4896 2012-10-15 PomBase SPBC460.03 FYPO:0001591 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:20944394 4896 2012-10-15 PomBase SPBC460.03 FYPO:0001590 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:20944394 4896 2012-10-15 PomBase SPBC460.03 FYPO:0001593 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 PMID:20944394 4896 2012-10-15 PomBase SPBC460.03 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0002758 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24018691 4896 2013-10-04 PomBase SPBC460.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0002757 deletion 972 h- vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24018691 4896 2013-10-04 PomBase SPBC460.03 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC460.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph vba2 vba2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0003659 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad57 rad57delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0000181 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000049 PMID:17304215 4896 2009-02-10 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0003352 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0000185 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000049 PMID:17304215 4896 2009-02-10 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0000185 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0000470 deletion 972 h- h90 rad57 rad57delta deletion ECO:0000059 low PMID:18388861 4896 2024-07-12 The h90 rhp57D strain produces colonies with a mild defect in MT switching. Fig. 2C. Table 1 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0000470 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0005452 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph rad57 rad57delta 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PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Pdelta17 rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 As expected, mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 strains, which do not exhibit SSBs, are fully viable regardless of the mutant status. PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-M mat2delta mat3delta rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 (Table 1) PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad57 rad57delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- rad57 rad57delta deletion ECO:0005638 PMID:18231579 4896 2015-11-12 PomBase SPAC20H4.07 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rad57 rad57delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC146.03c FYPO:0000214 T19A,T51A,T86A Overexpression 972 h- cut3 cut3-T19A,T51A,T86A cut3-AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0001147 deletion 972 h- iph1 iph1delta deletion ECO:0005638 PMID:9450053 4896 2014-08-08 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0001986 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iph1 iph1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:27255861 4896 2016-08-08 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph iph1 iph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph iph1 iph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph iph1 iph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph iph1 iph1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0001453 deletion 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PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- iph1 iph1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iph1 iph1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- iph1 iph1delta deletion ECO:0005638 PMID:9450053 4896 2014-08-08 PomBase SPACUNK4.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 iph1 iph1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001164 N41A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-N41A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001526 N41A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-N41A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC4.04c FYPO:0001278 80-104 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D2 mcm2-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 PMID:9658174 4896 2012-08-09 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000838 80-104 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D2 mcm2-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000703 80-104 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D2 mcm2-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c),assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000703 80-104 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D2 mcm2-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPBC4.04c FYPO:0000703 80-104 Knockdown 972 h- mcm2 cdc19-D2 mcm2-D2 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:9658174 4896 2012-09-26 PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001370 wild type Overexpression 972 h- myo52 myo52+ wild_type ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.01) PMID:11112691 4896 2024-06-11 Mok1 was delocalised in myo52∆ (Fig. 8C) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001512 wild type Overexpression 972 h- myo52 myo52+ wild_type ECO:0001232 high PMID:11112691 4896 2024-06-11 cells overproducing Myo52 were less elongated and branched due to the failure of septa to properly cleave (Fig. 4B). PomBase SPCC1919.10c FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- myo52 myo52+ wild_type ECO:0001232 high PMID:11112691 4896 2024-06-11 Whereas Myo51 overproduction resulted in elongated cells with wispy, misoriented septal material (Fig. 4A) PomBase SPCC1919.10c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP myo52 myo52+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPBC337.08c FYPO:0000705 I44A Not assayed or wild type 972 h- ubi4 ubi4-I44A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC3G6.02),assayed_using(PomBase:SPBC337.08c) PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPBC337.08c FYPO:0000705 I44A Not assayed or wild type 972 h- ubi4 ubi4-I44A amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.12),assayed_using(PomBase:SPBC337.08c) PMID:25306921 4896 2015-07-20 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 222-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-222-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001492 222-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-222-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002060 222-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-222-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPCC188.03 FYPO:0000214 cnd3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPCC188.03 FYPO:0001991 cnd3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPCC188.03 FYPO:0002061 cnd3::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cnd3 cnd3::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:10485849 4896 2015-10-23 PomBase SPAC57A7.04c FYPO:0006788 Y264A Not assayed or wild type 972 h- pabp pabp-RRM3mut amino_acid_mutation ECO:0000337 medium assayed_enzyme(PomBase:SPCC31H12.08c) PMID:29932902 4896 2018-12-17 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0000446 D134R Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D134R cdc2-R134 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 5) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001490 D134R Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D134R cdc2-R134 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 4, Table 1) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002061 D134R Overexpression 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-D134R cdc2-R134 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:8437586 4896 2018-04-03 (Fig. 4, Table 1) PomBase SPBC19C2.09 FYPO:0001245 G851C Not assayed or wild type 972 h- sre1 sre1-R284P nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPBC651.07 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0007035 deletion 972 h- SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 1) PomBase SPBC651.07 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC651.07 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC651.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPBC651.07 SPBC651.07delta deletion 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4896 2012-01-01 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 I217A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-I217A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000705 I217A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-I217A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000088 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-mms70 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:9153313 4896 2019-08-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000267 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-mms70 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9153313 4896 2019-08-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000089 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-mms70 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9153313 4896 2019-08-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad3 rad3-mms70 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:9153313 4896 2019-08-28 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0000444 deletion 972 h- mcb1 mcb1delta deletion ECO:0000059 PMID:21813639 4896 2011-08-22 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0000062 deletion 972 h- mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 PMID:21813639 4896 2011-08-09 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0000314 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0002262 deletion 972 h- mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 PMID:21813639 4896 2011-08-09 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mcb1 mcb1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1687.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- mcb1 mcb1delta deletion ECO:0005638 PMID:21813639 4896 2014-01-06 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000427 D908A,D1127A Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-5 amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 D908A,D1127A Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-5 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0003412 D908A,D1127A Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-5 amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006518 D908A,D1127A Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0006660 D908A,D1127A Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC188.13c FYPO:0000091 D908A,D1127A Not assayed or wild type 972 h- dcr1 dcr1-5 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-02-03 PomBase SPCC645.05c FYPO:0002442 1-1393,S1444A Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 myo2 myo2-Ct-S144A myo2Ct-1-1393,S144A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.05c) PMID:15184401 4896 2019-12-14 (Fig. 4F) PomBase SPCC1235.15 FYPO:0005585 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 high PMID:28282432 4896 2024-08-20 (Fig. 4) PomBase SPCC1235.15 FYPO:0005585 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000004 medium PMID:28282432 4896 2024-08-20 (Fig. 4) PomBase SPCC1235.15 FYPO:0005585 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000049 PMID:26990381 4896 2020-04-09 analysis revealed that both strains had reduced whole-cell and lipid droplet TAG levels (Figure 3F,I). PomBase SPCC1235.15 FYPO:0003959 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0005801 high PMID:12963726 4896 2014-10-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0003962 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0005801 PMID:12963726 4896 2014-10-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0007342 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000049 PMID:26990381 4896 2020-04-09 analysis revealed that both strains had reduced whole-cell and lipid droplet TAG levels (Figure 3F,I). PomBase SPCC1235.15 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 dga1 dga1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0001309 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0002236 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0000335 PMID:12963726 4896 2014-10-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 dga1 dga1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph dga1 dga1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- dga1 dga1delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 1-506,R691Q,K692N,K693S,R694Q,K695S Overexpression 972 h- mid1 mid1-NLS*-Cter amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 95 high PMID:15572668 4896 2024-04-10 (Table 2) PomBase SPAC26A3.16 FYPO:0000620 wild type Overexpression 972 h- dsk2 dsk2+ wild_type ECO:0001232 15 PMID:9601094 4896 2019-10-30 (Fig. 3C) PomBase SPAC26A3.16 FYPO:0005960 wild type Overexpression 972 h- dsk2 dsk2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC26A3.16 FYPO:0000732 wild type Overexpression 972 h- dsk2 dsk2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15797925 4896 2017-03-23 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 F124FGVPLF Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-F46 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 L170LRGTPL Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-F39 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase 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2023-06-28 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph gcs1 gcs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gcs1 gcs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph gcs1 gcs1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- gcs1 gcs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcs1 gcs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F3.10c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gcs1 gcs1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.13c FYPO:0000082 I55P,A56I Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40385371 4896 2025-06-09 mob1-1 grew less well than wildtype at 32°C and 36°C and mob1-N1 grew less well than wildtype at 36°C (Figure 1B). PomBase SPBC428.13c FYPO:0000082 I55P,A56I Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC428.13c FYPO:0002049 I55P,A56I Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:40385371 4896 2025-06-09 At 36°C, mob1-1 cells were multinucleated with no septum present (Figure 1C), as has been previously reported (Hou et al., 2000). PomBase SPBC428.13c FYPO:0000086 I55P,A56I Not assayed or wild type 972 h- mob1 mob1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000160 high PMID:12354095 4896 2024-05-15 (Fig. 4B) PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc45 cdc45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0002379 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc45 cdc45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc45 cdc45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- cdc45 cdc45delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cdc45 cdc45delta deletion ECO:0001232 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PomBase SPBC1685.13 FYPO:0000929 deletion 972 h- fhn1 fhn1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.15) PMID:21900489 4896 2012-07-10 PomBase SPBC1685.13 FYPO:0007273 deletion 972 h- fhn1 fhn1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Fig. 2) increased cortical ER remodeling dynamics PomBase SPBC1685.13 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 fhn1 fhn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC1685.13 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph fhn1 fhn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.13 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph fhn1 fhn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1685.13 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph fhn1 fhn1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 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2026-01-04 We ex- pressed these mutant genes under the control of the nmt1 promoter in a spo4 mutant. As Fig. 2C shows, none of these mutant spo4 genes complement the sporulation defect of the spo4 mutant. PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0002222 K95A Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-K95A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:23370392 4896 2013-06-06 PomBase SPAC10F6.08c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 nht1 nht1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC10F6.08c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 nht1 nht1+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPNCRNA.1234 FYPO:0001355 deletion 972 h- SPNCRNA.1234 SPNCRNA.1234delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1234 FYPO:0009007 deletion 972 h- SPNCRNA.1234 SPNCRNA.1234delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1234 FYPO:0009008 deletion 972 h- SPNCRNA.1234 SPNCRNA.1234delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1234 FYPO:0009030 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SPCC24B10.19c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nts1 nts1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC24B10.19c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nts1 nts1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000337 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000223 complete high PMID:32848252 4896 2020-09-05 Extended Data Fig. 6 c,d PomBase SPCC320.13c FYPO:0005201 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000223 PMID:21965528 4896 2016-01-18 PomBase SPCC320.13c FYPO:0005206 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000219,FYECO:0000223 PMID:21965528 4896 2016-01-18 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000214 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- slp1-shutoff ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28825727 4896 2017-09-27 Supplementary Figs. 1b, 1f, 4a-c PomBase SPCC320.13c FYPO:0000214 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- slp1-shutoff ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:28825727 4896 2017-10-11 Supplementary Figs. 1b, 1f, 4a-c PomBase SPCC320.13c FYPO:0005442 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25778919 4896 2017-10-23 (Fig. 2C, 2D) PomBase SPCC320.13c FYPO:0006302 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- slp1-shutoff ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:28825727 4896 2017-09-27 Supplementary Figs. 1b, 1f, 4a-c PomBase SPCC320.13c FYPO:0007383 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c) PMID:22825872 4896 2020-05-31 Indeed, Ark1 and Mph1 are fully or partially required for the kinetochore enrichment of all other SAC proteins (Fig. 4A; supplementary material Figs S5-S10). PomBase SPCC320.13c FYPO:0007383 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cut7-446 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC106.01) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Fig. 2A) When proper chromosome attachment was prevented by a conditional mutation in kinesin-5 (cut7-446), Mph1 localized to kinetochores, but the enrichment was abrogated by chemical genetic inhibition of Ark1 with the small molecule 1NM-PP1 (Fig. 3A). PomBase SPCC320.13c FYPO:0007383 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Figure S8E and F) Indeed, Ark1 and Mph1 are fully or partially required for the kinetochore enrichment of all other SAC proteins (Fig. 4A; supplementary material Figs S5-S10). PomBase SPCC320.13c FYPO:0005366 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:21540296 4896 2016-05-24 PomBase SPCC320.13c FYPO:0005366 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04),residue(S10) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Figure S4B and C) PomBase SPCC320.13c FYPO:0005366 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04),residue(S10) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Figure S4B and C) PomBase SPCC320.13c FYPO:0005366 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c),residue(S10) PMID:22825872 4896 2020-05-31 (Figure S4B and C) PomBase SPCC320.13c FYPO:0003165 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 80 PMID:21540296 4896 2016-05-24 PomBase SPCC320.13c FYPO:0003165 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 PMID:21540296 4896 2016-05-24 PomBase SPCC320.13c FYPO:0003286 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23263988 4896 2014-04-04 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001382 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000223 assayed_enzyme(PomBase:SPCC320.13c) PMID:21965528 4896 2016-01-18 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001382 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000223 assayed_enzyme(PomBase:SPCC320.13c),assayed_substrate(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:21965528 4896 2016-01-18 PomBase SPCC320.13c FYPO:0005300 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC106.01) PMID:22825872 4896 2020-06-09 (Fig. 3B) Indeed, Ark1 and Mph1 are fully or partially required for the kinetochore enrichment of all other SAC proteins (Fig. 4A; supplementary material Figs S5-S10). PomBase SPCC320.13c FYPO:0005300 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 cut7-446 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22825872 4896 2020-06-10 (Fig. S9F) PomBase SPCC320.13c FYPO:0005300 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- nda3-KM311 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:22825872 4896 2020-06-11 PomBase SPCC320.13c FYPO:0000940 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000219,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:21965528 4896 2016-01-18 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC110.01) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.05c) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC15A10.15) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.07c) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.04) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC1B1.04c) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.09c) PMID:21712547 4896 2016-04-01 PomBase SPCC320.13c FYPO:0001838 L166A,S229A,Q28R,Q176R Not assayed or wild type 972 h- cdc25-22 ark1 ark1-as3 ark1-as amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000223 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assayed or wild type 972 h- sds22 sds22-L242R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15335873 4896 2015-01-15 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000158 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002061 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0002061 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000276 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 30 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0000276 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000104 15 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001383 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000104 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC18G6.15 FYPO:0001234 242-308 Overexpression 972 h- mal3 mal3(1-241) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC22G7.09c FYPO:0001355 nup45-GFP Not assayed or wild type 972 h- nup45 nup45-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:24637836 4896 2015-07-31 PomBase SPCC1322.13 FYPO:0000741 R490* Not assayed or wild type 972 h- ade6 ade6-L469 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000021 is_bearer_of(PATO:0001261) PMID:25352017 4896 2018-03-22 PomBase SPCC1322.13 FYPO:0001491 R490* Not assayed or wild type 972 h- ade6 ade6-L469 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:3221399 4896 2013-01-30 PomBase SPBC216.06c FYPO:0006555 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:20924116 4896 2018-05-14 ternary complex normally forms with Swi1-Swi3 and Mrc1 on DNA PomBase SPBC216.06c FYPO:0001645 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPBC216.06c) PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.06c FYPO:0006603 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 5) PomBase SPBC216.06c FYPO:0000655 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000963 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.06c FYPO:0008230 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 5) PomBase SPBC216.06c FYPO:0000085 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000085 E662K Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-E662K swi1-rtf3 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:11030618 4896 2024-06-13 (Fig. 6) PomBase SPCC1672.08c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tfa2 tfa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- tfa2 tfa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1672.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tfa2 tfa2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC694.06c FYPO:0003165 221-284 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1delta221-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 25 PMID:15471884 4896 2018-04-05 PomBase SPAC694.06c FYPO:0003081 221-284 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1delta221-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPAC694.06c FYPO:0006602 221-284 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1delta221-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:26201080 4896 2018-07-04 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000584 221-284 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1delta221-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPAC694.06c FYPO:0000088 221-284 Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1delta221-284 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:15471884 4896 2018-04-05 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 V326R Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-V326R amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPAC10F6.03c FYPO:0004481 unknown Not assayed or wild type 972 h- cts1 cts1-hmt6 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-01 To identify novel factors involved in the TORC1 pathway, we screened for mutants that showed temperature sensitivity for growth and were derepressed for sexual differentiation at the restrictive temperature, similar to tor2‐ts mutants. We introduced mutations randomly in homothallic wild‐type cells and isolated mutants that could grow at 25°C, but not at 34°C. From these isolated mutants, we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. We obtained eight mutants and designated them hmt, standing for hypermating and temperature‐sensitive growth. PomBase SPAC10F6.03c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cts1 cts1-hmt6 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPAC10F6.03c FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cts1 cts1-hmt6 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC4F10.07c) PMID:29330317 4896 2018-11-09 PomBase SPAC10F6.03c FYPO:0003031 unknown Not assayed or wild type 972 h- cts1 cts1-hmt6 unknown ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:29330317 4896 2018-11-09 we picked those that initiated sexual differentiation at 30°C under nutrient‐rich conditions. PomBase SPAC10F6.03c FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- cts1 cts1-hmt6 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:29330317 4896 2026-01-25 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001838 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08),residue(T415) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001645 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPBC216.07c) PMID:34499159 4896 2021-09-22 (Figure 4B) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001645 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11),assayed_protein(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0005258 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 1) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001147 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000015 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0004248 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.11) PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-26 (Figure 1) PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0001357 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPAC57A7.11 FYPO:0000111 R504A Not assayed or wild type 972 h- mip1 mip1-R504A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:34499159 4896 2021-09-22 PomBase SPBC29A3.14c FYPO:0002687 trt1-9xPK-tpz1-L499A Not assayed or wild type 972 h- tpz1delta trt1 trt1-PK-tpz1-L499A trt1-PK-tpz1-L449A fusion_or_chimera ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0002060 T15S,T112S Not assayed or wild type 972 h- mcm4 mcm4-2T2S mcm4-2T->2S amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11973289 4896 2012-11-15 PomBase SPBC660.13c FYPO:0000474 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC660.13c FYPO:0002044 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPBC660.13c FYPO:0000229 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0003165 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 30 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0001324 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000112 high assayed_protein(PomBase:SPBC660.13c) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPBC660.13c FYPO:0009109 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000434 low PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000487 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0001974 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000170 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0002096 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC660.13c FYPO:0001490 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0001706 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0002102 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000004 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0002899 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000211 assayed_protein(PomBase:SPCC1259.13) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC660.13c FYPO:0002099 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000088 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000170 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000088 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0000089 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000211 PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC660.13c FYPO:0000268 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0001234 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPBC660.13c FYPO:0003241 R339H Not assayed or wild type 972 h- ssb1 ssb1-R339H rad11A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:9111307 4896 2014-07-07 PomBase SPAC16.05c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC16.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0001407 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38051102 4896 2023-12-15 Although the growth defect of the Dsfp1 mutant was observed on glucose medium, it grew normally on medium containing glycerol as the carbon source (Fig. 1H), similar to the situation in budding yeast.27. ALSO Figure 4B for severity PomBase SPAC16.05c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0000835 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.08),assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.11c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 It was found, however, that the amount of the Ifh1-Fhl1 complex was reduced in the Dsfp1 mutant when compared to that in the wild-type strain. PomBase SPAC16.05c FYPO:0000835 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC16.05c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 Moreover, the nuclear signal of Ifh1 was also significantly reduced in the Dsfp1 mutant (Fig. 6F), though neither the protein level nor the mobility shift of Ifh1 was affected by the Dsfp1 mutation (Fig. 6G). PomBase SPAC16.05c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC16.05c FYPO:0001409 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 PMID:38051102 4896 2023-12-15 Although the growth defect of the Dsfp1 mutant was observed on glucose medium, it grew normally on medium containing glycerol as the carbon source (Fig. 1H), similar to the situation in budding yeast.27 PomBase SPAC16.05c FYPO:0003075 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 assayed_enzyme(PomBase:SPBC216.07c),assayed_substrate(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:38051102 4896 2023-12-15 TORC1 activity monitored by the Psk1 phosphorylation was comparable between wild-type and Dsfp1 cells before and after nitrogen starvation (Fig. 1F), further confirming that Sfp1 does not affect TORC1 activity. PomBase SPAC16.05c FYPO:0000703 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC1142.08),assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.11c) PMID:38051102 4896 2023-12-15 The Ifh1-Fhl1 association was detected both in the presence and absence of Sfp1, suggesting that Sfp1 is not required for their interaction (Fig. 4F). PomBase SPAC16.05c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0000111 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 low PMID:38051102 4896 2023-12-15 In contrast, the Dsfp1 mutant exhibited a modest growth defect as well as limited rapamycin sensitivity (Fig. 1G), consistent with the notion that Sfp1 is involved in cell proliferation regulated by TORC1. PomBase SPAC16.05c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sfp1 sfp1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC16.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- sfp1 sfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC16.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfp1 sfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC16.05c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sfp1 sfp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.12c FYPO:0001343 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(SO:0000624) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0001343 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(SO:0001997) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000122 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:29774234 4896 2018-05-25 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000705 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC365.06),assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000082 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:29774234 4896 2018-06-06 PomBase SPBC409.12c FYPO:0003803 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0003803 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1393.14) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0002019 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 medium PMID:29774234 4896 2018-05-25 PomBase SPBC409.12c FYPO:0004656 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0005402 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000337 medium PMID:29774234 4896 2018-05-25 PomBase SPBC409.12c FYPO:0001387 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:29774234 4896 2018-05-25 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000703 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC409.12c),assayed_using(PomBase:SPCC1393.14) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000703 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC409.12c),assayed_using(PomBase:SPCC1393.14) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0001357 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000085 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000266 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29774234 4896 2018-05-25 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000088 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000088 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0000089 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.12c FYPO:0005404 I226A,L227A,L229A Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-226 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 high PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0007811 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:34108240 4896 2021-06-25 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0003923 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0007255 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000260 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000614 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0007550 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000260 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0007814 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0000059 FYECO:0000005 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005704 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005704 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0007813 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005236 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPCC553.09c) PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0005236 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_protein(PomBase:SPBC25D12.03c) PMID:34108240 4896 2021-06-30 PomBase SPAC17D4.02 FYPO:0000088 S275D,S322D,S397D Not assayed or wild type 972 h- cdc45 cdc45-3D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:34108240 4896 2021-06-25 PomBase SPAC10F6.07c FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 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Meanwhile, when Ecl1-DD was expressed, the recovery was low, and the degree of recovery was significantly lower than that of Ecl1 and Ecl1-AA. This suggested that the activity or stability of the Ecl1-DD mutant protein, which mimics the phosphorylation of Thr7 and Ser22, was reduced compared with the wild-type Ecl1 protein. PomBase SPCC70.12c FYPO:0004085 T7A,S22A Overexpression 972 h- ecl1delta,ecl2delta,ecl3delta ecl1 ecl1-AA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39910760 4896 2025-02-13 In addition, Ecl1 fusion protein overexpression slowed the growth rate, similar to a previous report of Ecl1- overexpression (Ohtsuka et al., 2024a) (Figure 1c). PomBase SPAC29E6.08 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tbp1 tbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29E6.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- tbp1 tbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC29E6.08 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tbp1 tbp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H1.09c FYPO:0000584 deletion 972 h- avt3 avt3delta deletion ECO:0001232 PMID:19778961 4896 2015-05-14 PomBase SPAC3H1.09c FYPO:0001612 deletion 972 h- avt3 avt3delta deletion ECO:0000335 PMID:26083598 4896 2015-08-06 PomBase SPAC3H1.09c FYPO:0001611 deletion 972 h- avt3 avt3delta deletion ECO:0000335 PMID:26083598 4896 2015-08-06 PomBase SPAC3H1.09c FYPO:0001610 deletion 972 h- avt3 avt3delta deletion ECO:0000335 PMID:26083598 4896 2015-08-06 PomBase SPAC3H1.09c FYPO:0001355 deletion 972 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FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC18E5.01 SPBC18E5.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18E5.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC18E5.01 SPBC18E5.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18E5.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC18E5.01 SPBC18E5.01delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000088 Y42A Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-Y42A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20924116 4896 2018-05-14 PomBase SPAC18G6.10 FYPO:0000703 1-200,346-688 Not assayed or wild type 972 h- lem2 lem2-Ndelta200 lem2Ndelta200 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.10),assayed_using(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:29292846 4896 2019-09-25 (Fig. 2) PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0001927 E198A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-E198A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:8846774 4896 2013-10-29 PomBase SPAC14C4.13 FYPO:0000267 E198A Not assayed or wild type 972 h- rad17 rad17-E198A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:8846774 4896 2013-10-29 PomBase SPCC1620.06c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1620.06c SPCC1620.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1620.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- SPCC1620.06c SPCC1620.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1620.06c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1620.06c SPCC1620.06cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0001407 L63A,W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A,W104A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0002009 L63A,W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A,W104A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0003392 L63A,W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A,W104A amino_acid_mutation ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.07) PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0000246 L63A,W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A,W104A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000118,FYECO:0000126 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPCC16A11.07 FYPO:0001413 L63A,W104A Not assayed or wild type 972 h- coq10 coq10-L63A,W104A amino_acid_mutation ECO:0000335 PMID:19120452 4896 2014-05-19 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001384 E215K Overexpression 972 h- cdc2Hs leu1-32 his3-27 cdc2 cdc2-DL2 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:1533272 4896 2016-10-25 (Fig. 4) PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0005711 E215K Overexpression 972 h- cdc2Hs leu1-32 his3-27 cdc2 cdc2-DL2 amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09),assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:1533272 4896 2016-10-25 (Fig. 7) . PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0001838 E215K Overexpression 972 h- cdc2Hs leu1-32 his3-27 cdc2 cdc2-DL2 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000112,FYECO:0000126 assayed_enzyme(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:1533272 4896 2016-10-25 (Fig. 5) PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K126Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K126Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K126Q Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K126Q amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0001645 K252E Not assayed or wild type 972 h- est1 est1-K252E amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13),assayed_using(PomBase:SPCC188.07) PMID:27253066 4896 2016-07-18 PomBase SPAP7G5.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- per1 per1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAP7G5.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 per1 per1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAP7G5.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 per1 per1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1166 FYPO:0009019 deletion 972 h- prl6 prl6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1166 FYPO:0009038 deletion 972 h- prl6 prl6delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000411 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC11C11.08 FYPO:0000080 disruption Null 972 h- srp1 srp1::ura4 disruption ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9421507 4896 2015-09-30 PomBase SPCC162.01c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 snp27 snp27delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC162.01c FYPO:0002937 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snp27 snp27delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPCC162.01c FYPO:0001908 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snp27 snp27delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27172183 4896 2016-06-08 PomBase SPCC162.01c FYPO:0001309 deletion 972 h- snp27 snp27delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC162.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- snp27 snp27delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC162.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snp27 snp27delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC162.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 snp27 snp27delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.9001 FYPO:0002243 T(-38)G,A(-37)C,T(-36)G,A(-35)C,T(-34)G,A(-33)C Not assayed or wild type 972 h- prt2 prt2-TATA-box-mutant nucleotide_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-16 (Fig. 8c) PomBase SPAC144.18 FYPO:0003333 deletion 972 h- vrg4 vrg4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:27587357 4896 2017-10-30 (Fig. 1d) PomBase SPAC144.18 FYPO:0000951 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vrg4 vrg4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.18 FYPO:0002482 deletion 972 h- vrg4 vrg4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:27587357 4896 2017-10-20 (Fig. 1d) PomBase SPAC144.18 FYPO:0002061 deletion 972 h- vrg4 vrg4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC144.18 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vrg4 vrg4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC144.18 FYPO:0002061 deletion 972 h- vrg4 vrg4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:27587357 4896 2017-10-20 (Fig. 1) PomBase SPAC144.18 FYPO:0000647 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 vrg4 vrg4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1125 FYPO:0001214 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1125 SPNCRNA.1125+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1125 FYPO:0000115 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1125 SPNCRNA.1125+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000413 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC25H2.14 FYPO:0009032 deletion 972 h- mug16 mug16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC25H2.14 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph mug16 mug16delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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cdc48-353sup amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPBC14C8.01c) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure 4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0000833 E319A,G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353sup amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPCC5E4.04) PMID:35320724 4896 2022-03-26 (Figure S4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0001234 E319A,G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353sup amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPAC1565.08 FYPO:0002060 E319A,G332D Overexpression 972 h- cdc48 cdc48-353sup amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:35320724 4896 2022-03-25 (Figure 4) PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001493 GFP-nak1-orb6 Ectopic 972 h- nak1 nak1-orb6 fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000324 medium PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000833 GFP-nak1-orb6 Ectopic 972 h- nak1 nak1-orb6 fusion_or_chimera ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC17F3.02) PMID:20805322 4896 2024-03-29 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0000833 GFP-nak1-orb6 Ectopic 972 h- nak1 nak1-orb6 fusion_or_chimera ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC821.12) PMID:20805322 4896 2024-03-29 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002526 GFP-nak1-orb6 Ectopic 972 h- nak1 nak1-orb6 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0002526 GFP-nak1-orb6 Ectopic 972 h- nak1 nak1-orb6 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBC17F3.02 FYPO:0001492 GFP-nak1-orb6 Ectopic 972 h- nak1 nak1-orb6 fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:20805322 4896 2017-08-31 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000705 2843-3661 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-4 tra1delta2521-3699 partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 FYECO:0000137 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC23C11.01 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph ice2 ice2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ice2 ice2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.01 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ice2 ice2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ice2 ice2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.01 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph ice2 ice2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.01 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- 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SPAC23C11.01 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ice2 ice2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0000357 791-969 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaGAP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000039,FYECO:0000127 PMID:30279276 4896 2021-03-31 PomBase SPAC29A4.11 FYPO:0001867 791-969 Not assayed or wild type 972 h- rga3 rga3deltaGAP partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000127,FYECO:0000383 PMID:30279276 4896 2021-03-11 PomBase SPAC1834.01 FYPO:0001645 Q400A Not assayed or wild type 972 h- erf1 erf1-Q400A amino_acid_mutation ECO:0000059 high assayed_using(PomBase:SPAC1834.01),assayed_using(PomBase:SPCC584.04) PMID:19417105 4896 2016-10-30 (Supplemental Table S1). 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PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0001934 deletion 972 h- mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 high PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009100 deletion 972 h- 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SPBC2G2.07c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug178 mug178delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0008128 deletion 972 h- mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0001437 deletion 972 h- mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 but was not sensitive to antimycin A, showing that ATP synthase is not defective (Figure 7A-B) PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 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mug178 mug178delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug178 mug178delta deletion ECO:0005638 PMID:34634819 4896 2025-03-31 On the contrary, the deletion of mug178 yielded viable cells. PomBase SPBC2G2.07c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug178 mug178delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0004481 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33823662 4896 2021-04-16 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0000082 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126,FYECO:0000229 high PMID:23928301 4896 2013-08-28 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0000082 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 high PMID:23928301 4896 2013-08-28 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0003743 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:33823662 4896 2021-04-16 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002584 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 PMID:29954949 4896 2018-07-22 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002584 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(SO:0001036) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002584 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(SO:0000262) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0007610 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:33823662 4896 2021-04-27 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0001355 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23928301 4896 2013-08-28 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0001355 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23928301 4896 2013-08-28 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002587 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002587 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002590 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPMITTRNAGLU.01) PMID:29954949 4896 2018-07-22 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002590 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPMITTRNAALA.01) PMID:29954949 4896 2018-07-22 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002590 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(SO:0001036) 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amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33823662 4896 2021-04-27 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0006660 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000110 PMID:33823662 4896 2021-04-16 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002585 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000262) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0002580 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(SO:0000265) PMID:23928301 4896 2013-08-29 PomBase SPBC3D6.03c FYPO:0003896 A623V Not assayed or wild type 972 h- trz2 trz2-1 trz2-603 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:33823662 4896 2021-04-27 PomBase SPCC338.14 FYPO:0001934 deletion 972 h- ado1 ado1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPCC338.14 FYPO:0001407 deletion 972 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ECO:0000049 PMID:18723894 4896 2016-04-08 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000240 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea4 tea4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:19542312 4896 2021-10-12 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tea4 tea4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0006875 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005800 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005503 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000227 high assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15936270 4896 2020-06-12 In contrast, most of Δwsh3 cells showed highly concentrated Tea1-GFP signals at one end, while the other end contained significantly less Tea1-GFP dots (Figure 5A, right panel) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005503 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005503 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005503 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005503 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC530.04) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001018 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:15936270 4896 2020-06-12 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001018 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000310 90 PMID:27852900 4896 2018-04-16 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007242 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003209 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:15936270 4896 2020-06-12 Δwsh3 cells, the cell-end localization of Pom1 was lost and Pom1-GFP often accumulated in vesicle-like structures in the cytoplasm (Figure 5D) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002128 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:21703453 4896 2016-11-10 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000705 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06),assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0006010 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003327 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000016 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001407 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007450 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002556 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 low assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474789 4896 2017-04-26 (Fig. 2a, S3a) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002556 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.02) PMID:19474792 4896 2017-04-27 (Fig. 2a) and data not shown PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005801 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-07 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002021 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000324 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 5A) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003532 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 PMID:26525038 4896 2015-12-08 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002852 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:25837586 4896 2016-12-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0004978 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:23907979 4896 2022-07-01 In tea4D cells, Wsc1p-GFP localized mainly to the growing tip that was stained with Cfw (Fig. 3C). PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002870 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000339 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001390 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 7.5 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001019 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:15936270 4896 2020-06-12 Actin patches, which are localized to the growing tips of fission yeast cells [38], were detected mostly in one tip of the Δwsh3 cell (Figure 2C). PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001019 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003717 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001368 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000674 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000674 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25720772 4896 2016-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000899 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000644 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.08) PMID:18060866 4896 2012-04-27 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007451 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.06) PMID:19597328 4896 2024-11-27 During mitosis, the tip signal was detected on the most distant cell end relative to the asymmetric ring (arrow, Fig. 1B). Kin1-GFP was also detected at the division site in tea4Δ (arrowhead, Fig. 1B). We conclude that correct localization of Kin1-GFP does not require Tea4. PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002442 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.06) PMID:19597328 4896 2024-11-27 During mitosis, the tip signal was detected on the most distant cell end relative to the asymmetric ring (arrow, Fig. 1B). Kin1-GFP was also detected at the division site in tea4Δ (arrowhead, Fig. 1B). We conclude that correct localization of Kin1-GFP does not require Tea4. PomBase SPBC1706.01 FYPO:0008003 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0005828 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000703 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.12),assayed_using(PomBase:SPCC1223.06) PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007398 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 PMID:15936270 4896 2020-06-12 DNS PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 PMID:15936270 4896 2020-06-12 DNS PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 3B) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001357 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0003595 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 1.7 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000945 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000324 high PMID:39156640 4896 2025-03-03 (Fig. 5A) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002848 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 65 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 2B) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002848 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000235 65 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 2B) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007379 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 20 PMID:15936270 4896 2020-06-12 highly bent or branched morphology (Figure 2a) (penetrance from Figure 6B) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0007379 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 20 PMID:15936270 4896 2020-06-12 highly bent or branched morphology (Figure 2a) (penetrance from Figure 6B) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000013 deletion 972 h- cdc11-119 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 23 PMID:39509469 4896 2025-01-30 (Fig. 2C) PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000013 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000013 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:15809031 4896 2020-08-19 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 37.3 PMID:25210736 4896 2014-11-24 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tea4 tea4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0002104 deletion 972 h- tea4 tea4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:15936270 4896 2020-06-12 On the other hand, oxidative stress by hydrogen peroxide, which also induces Spc1 activation [34], did not significantly affect Δwsh3 cells (data not shown). PomBase SPAC1006.09 FYPO:0000711 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005580 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0000708 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0004172 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0004173 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002376 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9321395 4896 2019-10-26 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002376 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000207 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001885 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:23389634 4896 2013-08-01 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9321395 4896 2019-10-26 (Figure 5) PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002287 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001116 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0004038 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001387 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0000245 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002807 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0005477 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001281 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9321395 4896 2019-10-26 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0003162 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0000087 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0000112 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 PMID:9321395 4896 2019-10-26 (Figure 4) PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:1588914 4896 2017-05-31 Table 3 cells are 30-50% longer than wild type PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 medium PMID:3442828 4896 2013-02-18 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:3442828 4896 2013-02-18 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium PMID:3442828 4896 2013-02-18 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0001492 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:3442828 4896 2013-02-18 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- win1 win1-1 win1.1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000126 medium PMID:3442828 4896 2015-07-13 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000122 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 PMID:11029034 4896 2014-10-13 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005459 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005459 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:23188080 4896 2020-10-15 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003928 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:22093869 4896 2014-10-30 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003928 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:24847916 4896 2014-10-30 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003660 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:11029034 4896 2014-10-13 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004287 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004287 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000126 PMID:28292918 4896 2017-04-11 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004287 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 high PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005370 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:11226171 4896 2016-04-20 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003913 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 PMID:17724078 4896 2016-06-21 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004516 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000354 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003927 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:22093869 4896 2014-10-30 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003927 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:24847916 4896 2014-10-30 PomBase SPCC126.02c FYPO:0006321 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:29215009 4896 2018-01-10 PomBase SPCC126.02c FYPO:0006321 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:29215009 4896 2018-01-10 PomBase SPCC126.02c FYPO:0007532 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000581 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 low PMID:15197176 4896 2015-10-23 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005545 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 Interestingly, Tf clustering was impaired by pku70Δ and pku80Δ at a level similar to that observed in abp1Δ cells (Figure 2A). PomBase SPCC126.02c FYPO:0007270 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 Remarkably, the association of Tf elements with centromeres was significantly compromised in pkuΔ cells (P < 0.00001, Mann-Whitney U test; Figures 3D and 3E). PomBase SPCC126.02c FYPO:0004003 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29215009 4896 2018-01-05 PomBase SPCC126.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005372 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 low PMID:11226171 4896 2016-04-20 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004251 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:33568651 4896 2021-03-11 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004251 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:29215009 4896 2018-01-05 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001740 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 PMID:12628934 4896 2016-04-29 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005371 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 high PMID:11226171 4896 2016-04-20 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002573 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005402 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:12930956 4896 2016-05-06 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004557 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3E) PomBase SPCC126.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pku70 pku70delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003118 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001870 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 clustering and tethering of centromeres to the nuclear periphery were not affected in pku70Δ and pku80Δ cells, although Ku does localize at centromeres (Figures 1E, 3A, and 3B) PomBase SPCC126.02c FYPO:0002335 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figure S1C) PomBase SPCC126.02c FYPO:0003555 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005398 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005398 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000049 PMID:12628934 4896 2016-05-04 PomBase SPCC126.02c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pku70 pku70delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004229 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21931565 4896 2018-09-27 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004229 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0004229 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:14654689 4896 2016-05-17 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000969 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003906 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21931565 4896 2018-09-27 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000963 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000957 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000957 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000957 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12861005 4896 2016-05-04 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003183 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:17671430 4896 2014-03-04 PomBase SPCC126.02c FYPO:0007269 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 The FISH data revealed that telomere clustering was not affected by pku70Δ and pku80Δ, but telomere tethering to the nuclear periphery was significantly compromised by pkuΔ (P < 0.001, Mann-Whitney U test), suggesting that telomere clustering and tethering to the nuclear periphery are distinct processes (Figures S2A and S2B) PomBase SPCC126.02c FYPO:0007328 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPCC126.02c FYPO:0007711 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000354 PMID:33723569 4896 2021-03-31 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002887 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:18160711 4896 2016-06-29 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002887 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:15485922 4896 2016-05-17 PomBase SPCC126.02c FYPO:0005614 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC126.02c FYPO:0007254 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000059 PMID:33568651 4896 2021-03-09 replication dynamic analysis demonstrates that the priming strand is stable in the absence of Ku (previous work has shown resection is increased behind the arrested fork). Replication restart is slightly delayed, confirming previous work. Assayed by polymerase usage sequencing PomBase SPCC126.02c FYPO:0002687 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:14654689 4896 2016-05-17 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001357 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001357 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001420 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:11029034 4896 2014-10-13 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000085 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3E) PomBase SPCC126.02c FYPO:0004868 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPCC126.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0000089 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 low PMID:38718864 4896 2025-05-22 (Fig. 3E) PomBase SPCC126.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002239 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 PMID:17671430 4896 2014-03-04 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002239 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 low PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002239 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 PMID:24925530 4896 2017-02-15 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002239 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003929 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0005638 PMID:24847916 4896 2014-10-30 PomBase SPCC126.02c FYPO:0003106 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0000337 PMID:11029034 4896 2014-10-13 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC126.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pku70 pku70delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0005485 R396A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1-R396A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:35536002 4896 2022-10-12 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001327 R396A Overexpression 972 h- ∆asp1 asp1 asp1-R396A amino_acid_mutation ECO:0005801 high assayed_protein(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:35536002 4896 2022-10-19 (Fig. 12) PomBase SPCC1919.14c FYPO:0000046 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 bdp1 bdp1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPCC1919.14c FYPO:0001492 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 bdp1 bdp1+ wild_type ECO:0001232 low PMID:23695302 4896 2015-02-12 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0005883 deletion 972 h- h- 972 gsa1 gsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27005325 4896 2017-01-03 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph gsa1 gsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0000249 deletion 972 h- h- 972 gsa1 gsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:27005325 4896 2016-12-29 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph gsa1 gsa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3F10.04 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- 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2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0002701 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph omh5 omh5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- omh5 omh5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 omh5 omh5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 omh5 omh5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC32H8.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- omh5 omh5delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:19054127 4896 2013-09-04 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 E74R,R77E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E74R77RE amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 E74R,R77E Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-E74R77RE amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0000705 F19A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-F19A amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPAC19A8.12),assayed_using(PomBase:SPBC3B9.21) PMID:16341225 4896 2014-10-30 PomBase SPAC19A8.12 FYPO:0003941 F19A Not assayed or wild type 972 h- dcp2 dcp2-F19A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000038 PMID:16341225 4896 2014-10-30 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000729 Mid1(1-100)-Cdr2 fusion Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-cdr2 fusion_or_chimera ECO:0001232 medium PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 6H) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 Mid1(1-100)-Cdr2 fusion Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-cdr2 fusion_or_chimera ECO:0001232 10 PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 6E) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002999 Mid1(1-100)-Cdr2 fusion Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-cdr2 fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 6F and G) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0002253 Mid1(1-100)-Cdr2 fusion Not assayed or wild type 972 h- mid1 mid1-(1-100)-cdr2 fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:22427686 4896 2024-08-06 (Fig. 6E) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 T112A Not assayed or wild type 972 h- 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2017-03-08 PomBase SPAC6C3.05 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr meu43 meu43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC6C3.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 meu43 meu43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC6C3.05 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph meu43 meu43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6C3.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph meu43 meu43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6C3.05 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph meu43 meu43delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6C3.05 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph meu43 meu43delta deletion ECO:0005638 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PomBase SPCC736.14 FYPO:0007729 T279E,S293E,S300E,S551E,S556E,S590E Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6E dis16E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16920624 4896 2021-04-19 PomBase SPCC736.14 FYPO:0001861 T279E,S293E,S300E,S551E,S556E,S590E Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6E dis16E amino_acid_mutation ECO:0000340 FYECO:0000005 low PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2C) The loss rate in Dis16E was lower than Dis16A and slightly higher than that in the wild-type. (The Dis16E mutant appears to mimic at least partially the Cdc2-phosphorylated form of Dis1) PomBase SPCC736.14 FYPO:0002141 T279E,S293E,S300E,S551E,S556E,S590E Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6E dis16E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2A) PomBase SPCC736.14 FYPO:0004310 T279E,S293E,S300E,S551E,S556E,S590E Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6E dis16E amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:16920624 4896 2021-04-19 Measurements of the durations of phase 1 (prophase to metaphase), 2 (metaphase to anaphase), and 3 (anaphase B) on each of the 30 movies of Dis1WT, Dis16A, and Dis16E strains indicated that the timing of mitosis did not seem to be affected by any mutations because measured differences were within the boundaries of experimental error (Figure S1C) PomBase SPCC736.14 FYPO:0003349 T279E,S293E,S300E,S551E,S556E,S590E Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6E dis16E amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC15D4.01c) PMID:34080538 4896 2023-07-26 (Fig. 5) PomBase SPCC736.14 FYPO:0000091 T279E,S293E,S300E,S551E,S556E,S590E Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-6E dis16E amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:16920624 4896 2021-04-19 (Figure 2B) PomBase SPAC23H3.13c FYPO:0006296 K270N Not assayed or wild type 972 h- gpa2 gpa2-K270N amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:20139237 4896 2012-10-31 PomBase SPBC337.12 FYPO:0003230 wild type Knockdown 972 h- nmt41 promoter, AID degron tagged, 2xHA red5 red5+ SPBC337.12+ wild_type ECO:0000226 FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000267 PMID:24713849 4896 2014-08-14 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002960 wild type Knockdown 972 h- nmt41 promoter, AID degron tagged, 2xHA red5 red5+ SPBC337.12+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000106,FYECO:0000126,FYECO:0000267 PMID:24713849 4896 2014-08-08 PomBase SPBC337.12 FYPO:0002567 wild type Knockdown 972 h- nmt41 promoter, AID degron tagged, 2xHA red5 red5+ SPBC337.12+ wild_type 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PMID:18957202 4896 2020-04-07 silencing at the imr region in lid2-phd2 and lid2-phd3 mutants was significantly impaired while lid2-phd1 showed only a slight defect (Figure 7A). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000877 1352-1403 Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-phd3delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 Obvious reduction of H3K9 methylation was also observed in lid2-phd2 and lid2-phd3 mutants (Figure S9) PomBase SPBC19C7.10 FYPO:0007073 1-393 Not assayed or wild type 972 h- bqt4 bqt4-C394-432 bqt4C394-432 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 low assayed_protein(PomBase:SPBC19C7.10) PMID:37694715 4896 2023-11-15 The helix domain alone (Bqt4C394-432) showed weaker localization to the NE and was somewhat diffused to the membrane compartments in the cytoplasm; (Fig. 6A, Bqt4C394-432) PomBase SPBC215.15 FYPO:0002490 deletion 972 h- sec13 sec13delta deletion ECO:0001232 PMID:11821054 4896 2015-05-20 PomBase SPBC215.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- sec13 sec13delta deletion ECO:0005638 PMID:11821054 4896 2015-05-20 PomBase SPBC215.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6- sec13 sec13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0003165 G1326E 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:7865880 4896 2012-03-12 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000088 G1326E 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-12 PomBase SPAC31A2.05c FYPO:0000268 G1326E 972 h- mis4 mis4-242 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:7865880 4896 2012-03-12 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 E94EGVPPGLVPPGLVPTPGVPPGLVFHE Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K11A amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000941 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6F12.14) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC800.09) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1B9.02c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC1861.02) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c),assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC26H5.05) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000705 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08) PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000118 YQL508AAA Not assayed or wild type 972 h- leu1-32 his3-D1 ura4-D18 ade6-M216 plo1 plo1-YQL508AAA amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:12615979 4896 2014-03-04 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0002488 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000104,FYECO:0000332 high PMID:29319508 4896 2018-01-22 A phenotype in which a cell lyses, i.e. the plasma membrane ruptures and cytoplasm is lost, in presence of higher concentration of 2-deoxyglucose. PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001592 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000335 PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001140 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000335 PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0005288 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:27481777 4896 2016-08-04 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0005288 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000104 assayed_using(PomBase:SPCC191.11) PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001117 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001117 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1039.09) PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001117 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001489 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pas1 pas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001404 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pas1 pas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001000 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005580 PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001164 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16115814 4896 2015-01-08 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001315 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0001232 PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001310 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 PMID:23874875 4896 2014-10-01 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000064 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000016,FYECO:0000332 PMID:29319508 4896 2018-01-22 An increased resistance to cell lysis induced by the presence of higher concentration of 2-deoxyglucose in the vegetative growth phase of cell PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000064 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 high PMID:27481777 4896 2016-08-04 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000064 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 high PMID:27481777 4896 2016-08-09 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000072 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001029 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 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List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strainsFig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0001491 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC19E9.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- pas1 pas1delta deletion ECO:0005638 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000913 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003066 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003181 deletion 972 h- pat1-114 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0000337 PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000476 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003025 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:11447128 4896 2015-05-27 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002485 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0000059 PMID:25579976 4896 2016-08-01 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003179 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.13) PMID:8005432 4896 2014-08-05 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000485 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0000059 PMID:20123974 4896 2014-07-14 also ctp1,rec12,rad22,rti1,rad51,dmc1 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005577 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:21084840 4896 2016-09-03 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003537 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000581 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000581 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000581 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 low PMID:15238514 4896 2015-12-10 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000581 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000581 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005636 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 14 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:21920317 4896 2016-08-23 ( Figure 1B) PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005512 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:21920317 4896 2016-08-23 (Figure 1B) We found that virtually all rec12D cells (n = 240) eventually relocalized Ark1 to the spindle (Figure 1B), indicating that the SAC ultimately becomes satisfied in achiasmate meiosis. PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 75 PMID:25993311 4896 2017-04-11 Table2 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000223 86 PMID:25993311 4896 2017-04-11 Table2 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002151 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 78 PMID:25993311 4896 2017-04-11 Table2 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0006013 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005384 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 83 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Figure 1A) phase II (metaphase) was substantially extended PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002219 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 <98.2 PMID:21920317 4896 2016-08-23 (Fig. 1D) although sister kinetochore split, segregation ends up mostly normal PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002219 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:25579976 4896 2016-08-01 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000969 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 PMID:8005432 4896 2014-08-05 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000957 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 PMID:8005432 4896 2014-08-05 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003835 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:11447128 4896 2015-05-27 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003835 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:17632059 4896 2018-02-11 (Fig. S3) PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002094 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:11447128 4896 2015-05-27 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0004667 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 14 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Figure S3A) PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0004093 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:11447128 4896 2015-05-27 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003121 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:22582262 4896 2014-01-23 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002052 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:8005432 4896 2014-08-05 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000479 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:12665553 4896 2015-05-14 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0006014 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005634 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 1.8 PMID:21920317 4896 2016-08-23 (Fig. 1D) PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0005633 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 40 PMID:21920317 4896 2016-08-23 (Fig. 1D) PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0000678 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 PMID:11447128 4896 2015-05-27 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0005638 PMID:8005432 4896 2014-08-05 PomBase SPAC17A5.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec12 rec12delta rec12-169::kanMX6 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000452 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC664.01c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 We next examined Swi6 localization in the lid2-j mutant using N-terminal tagged GFP-Swi6. In WT vegetative cells, 3-4 GFP-Swi6 spots are observed. This is because the three centromeres cluster on the nuclear envelope in the vicinity of the spindle pole body whereas telomeres loosely cluster on the nuclear envelope, apart from centromeres. clr4 and clr8 mutants have a diffuse Swi6 localization due to the disruption of heterochromatin. To our surprise, we did not see the same GFP-Swi6 pattern in the lid2-j mutant as in clr8Δ. Rather, we found that 78% of the cells contain more than 5 GFP-Swi6 spots, with nearly 30% having more than 10 spots (Figure 6A). The abnormal distribution of Swi6 also can be observed in meiotic horsetail stage nuclei (Figure 6A). The aberrant Swi6 localization is not caused by defects in centromere or telomere clustering since the distribution of centromeres and telomeres, as marked by Cnp1-GFP or Taz1-GFP respectively, is unaffected in the lid2-j mutant (Figure S4). We further confirmed that telomeres cluster normally by visualizing their distribution in a lid2-j strain carrying mCherry-Swi6 and the telomere marker Taz1-GFP (Figure S4). These results suggest that heterochromatin is induced in euchromatic regions in lid2-j. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0004170 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 ChIP assays indicated that H3K9me2 methylation at the region was abolished, while H3K4me3 methylation was increased more than seven-fold (Figure S2) PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0003412 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:18957202 4896 2020-04-07 (Figure 5F) the point mutation resulted in a significant loss of silencing at the centromere otr region. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007345 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 About 50% (2665 out of 5241) of the genes in the genome were downregulated in mutant cells compared to WT (Figure 6C and Table S3), consistent with the formation of ectopic heterochromatin. PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0007337 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18957202 4896 2020-04-07 ChIP assays indicated that H3K9me2 methylation at the region was abolished, while H3K4me3 methylation was increased more than seven-fold (Figure S2) PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000703 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP19A11.06),assayed_using(PomBase:SPCC306.04c) PMID:18957202 4896 2020-04-07 the point mutation had little effect on the interaction of Lid2 with its interacting partners, such as Cul4 and Set1 (Figure S3 and S8). PomBase SPBP19A11.06 FYPO:0000703 H542A Not assayed or wild type 972 h- lid2 lid2-H542A lid2-H512A amino_acid_mutation ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPAC3A11.08),assayed_using(PomBase:SPBP19A11.06) PMID:18957202 4896 2020-04-07 the point mutation had little effect on the interaction of Lid2 with its interacting partners, such as Cul4 and Set1 (Figure S3 and S8). PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000151 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0001232 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eme1 eme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0003667 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC4G3.05c) PMID:11719193 4896 2015-03-30 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0003814 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 eme1 eme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000470 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0005318 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:27304859 4896 2018-03-01 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29898918 4896 2018-07-03 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 eme1 eme1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0002150 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000309 deletion 972 h- eme1 eme1delta deletion ECO:0001232 PMID:11719193 4896 2015-03-27 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 eme1 eme1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 eme1 eme1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 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prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph eme1 eme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1E7.06c 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Ectopic 972 h- byr2delta byr2 byr2-d7-S654A B2d7-S654A amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 FYECO:0000126 assayed_protein(PomBase:SPAC17A2.13c),assayed_protein(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:38913087 4896 2024-08-23 (Fig. 4) PomBase SPAC222.05c FYPO:0001934 deletion 972 h- mss1 mss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPAC222.05c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mss1 mss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.05c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mss1 mss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC222.05c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mss1 mss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC222.05c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph mss1 mss1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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mad3 mad3(1-281) mad3-deltaCterm partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC821.08c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-01 (Figure 3A) PomBase SPCC1795.01c FYPO:0001571 282-310 Not assayed or wild type 972 h- mad3 mad3(1-281) mad3-deltaCterm partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:28366743 4896 2020-06-01 (Figure 3A) PomBase SPBP8B7.25 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cyp4 cyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.25 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cyp4 cyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBP8B7.25 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cyp4 cyp4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP8B7.25 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph cyp4 cyp4delta deletion 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Also, consistent with the otr1R::ura4+ silencing data (Figure 3B), mutant Tas3-TAM proteins associated with the ura4+ insert at otr1R less efficiently than wild-type Tas3 (Figure 5D, compare lanes 3-6 with lane 2; and Figure 5E). In PomBase SPBC83.03c FYPO:0003411 L502E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L502E amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3) tas3-TAM Mutations Cause a Dramatic Loss of ura4+ Silencing at imr1 but Only a Modest Loss at otr1 PomBase SPBC83.03c FYPO:0004205 L502E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L502E amino_acid_mutation ECO:0006030 PMID:19394293 4896 2023-03-01 To determine the effect of tas3-TAM mutations on cen siRNAs levels, we performed northern blot analysis on RNAs isolated from wild-type, tas3D, and tas3-TAM mutant cells. We found a dramatic reduction in the levels of both total (Figure 4C) and Ago1-purified (Figure 4D) cen siRNAs in all tas3-TAM mutants compared to wild-type. PomBase SPBC83.03c FYPO:0004083 L502E Not assayed or wild type 972 h- tas3 tas3-L502E amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:19394293 4896 2023-03-01 (Figure 3) To rule out that the observed silencing defects were due to instability of the mutant Tas3 proteins, we examined the levels of wild-type and mutant Tas3 protein by western blotting and found that the mutant proteins were expressed to similar levels as the wild-type protein (Figure 3C). PomBase SPCC737.08 FYPO:0006781 L1335S Not assayed or wild type 972 h- mdn1 mdn1-L1335S amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27667686 4896 2018-12-03 PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0006442 A260V Not assayed or wild type 972 h- ofd1delta scp1 scp1-A260V amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:18503029 4896 2018-03-02 PomBase SPAC22A12.05 FYPO:0007326 D90G,R107C Not assayed or wild type 972 h- rpc11 rpc11-D90G,R107C amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:15632064 4896 2020-04-02 (Fig. 1) The data suggest that the mutants are not deficient in termination efficiency. PomBase SPAC22A12.05 FYPO:0007325 D90G,R107C Not assayed or wild type 972 h- rpc11 rpc11-D90G,R107C amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC57A10.10c) PMID:15632064 4896 2020-04-02 PomBase SPAC19D5.11c FYPO:0005634 unknown Not assayed or wild type 972 h- h+ cdc2-M35 mat3-M cen1-GFP ura4-D18 (haploid meiosis inducing) ctf8 ctf8- unknown ECO:0005638 high PMID:16325576 4896 2021-05-13 (Figure 1) PomBase SPAC31G5.12c FYPO:0000245 S59E,S60E,S61E Not assayed or wild type 972 h- maf1 maf1-3E amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:31833215 4896 2020-04-01 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0004259 deletion 972 h- rfc2 rfc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9862966 4896 2021-03-02 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0000229 deletion 972 h- rfc2 rfc2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 3 PMID:9862966 4896 2015-04-09 (Fig. 3C, D) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0000453 deletion 972 h- rfc2 rfc2delta deletion ECO:0005580 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2012-01-01 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0000703 P304A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-P304A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000705 1-338,F352A,V355A Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-C-AIM amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:32735772 4896 2020-08-06 (Figure 1C) PomBase SPAC6B12.08 FYPO:0000703 1-338,F352A,V355A Not assayed or wild type 972 h- epr1 epr1-C-AIM amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC6B12.08),assayed_using(PomBase:SPBC16G5.05c) PMID:32735772 4896 2020-08-07 (Figure 1C) AIM-mutated Epr1- C was pulled down as efficiently as wild-type Epr1-C by Scs2 but did not support the pull-down of Atg8 PLUS more experiments We hypothesized that the main role of Epr1 in ER-phagy is to mediate a connection between Atg8 and VAPs. requirement of Epr1 in ER-phagy can be by-passed by an artificial soluble tether that bridges an Atg8-VAP connection.Figure 4D). PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001355 M111V Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 medium PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000957 M111V Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0001357 M111V Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000085 M111V Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 low PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBC16A3.09c FYPO:0000088 M111V Not assayed or wild type 972 h- ufd1 ufd1-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000228 low PMID:22730331 4896 2016-08-17 PomBase SPBP8B7.14c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dpb2 dpb2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0005634 deletion 972 h- rec7 rec7delta deletion ECO:0001232 1.8 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Fig. 1D) PomBase SPCC1753.03c FYPO:0005633 deletion 972 h- rec7 rec7delta deletion ECO:0001232 40 PMID:21920317 4896 2016-08-24 (Fig. 1D) PomBase SPCC1753.03c FYPO:0000678 deletion 972 h- rec7 rec7delta deletion ECO:0001232 PMID:11156975 4896 2015-07-13 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- rec7 rec7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec7 rec7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1753.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rec7 rec7delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F6.16c 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SPBC11C11.03 FYPO:0005215 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:23427262 4896 2013-11-21 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0005215 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:23427262 4896 2013-11-21 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0002902 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC1685.15c),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 2C,D) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001645 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c),assayed_using(PomBase:SPBC11C11.03) PMID:23427262 4896 2013-11-19 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001846 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 medium PMID:23427262 4896 2013-11-19 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000228 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25472718 4896 2014-12-27 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000228 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23427262 4896 2013-11-19 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001387 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 2A) PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001387 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23427262 4896 2013-11-19 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0001399 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:23427262 4896 2013-11-19 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0002901 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC188.04c) PMID:23427262 4896 2013-11-21 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0002901 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.04c) PMID:23427262 4896 2013-11-21 PomBase SPBC11C11.03 FYPO:0000091 F420S Not assayed or wild type 972 h- ndc80 ndc80-NH12 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23427262 4896 2013-11-19 PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001669 G83A,G84A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(AAKGG) sde2(AAK) amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.18c) PMID:28947618 4896 2018-01-08 (Fig. 1B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0003244 G83A,G84A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(AAKGG) sde2(AAK) amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 does not complement sde2Δ, defective in telomeric silencing and genome stability PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0008118 G83A,G84A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(AAKGG) sde2(AAK) amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:36095128 4896 2023-08-30 (Figure 1) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 G83A,G84A Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(AAKGG) sde2(AAK) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2018-01-08 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0007884 F2R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F2R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_protein(PomBase:SPCC1840.10) PMID:33378677 4896 2021-11-17 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0000705 F2R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F2R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_protein(PomBase:SPCC1840.10) PMID:33378677 4896 2021-10-24 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002133 F2R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F2R amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0002134 F2R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F2R amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPCC1840.10),assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0005540 F2R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F2R amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:33378677 4896 2021-11-16 PomBase SPAC17G6.17 FYPO:0003107 F2R Not assayed or wild type 972 h- pof8 pof8-F2R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:33378677 4896 2021-10-24 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 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2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph rpl1502 rpl1502delta 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ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0001234 deletion 972 h- rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38295128 4896 2024-12-28 Consistent with a defect in translation due to loss of ribosomal protein paralogs, we find that each of four rplΔ mutants and three rpsΔ mutants has a substantially reduced growth rate (increased generation time) relative to that of the WT strain in YES media at 30 ̊C (Fig 7A and 7B and S1 Table). PomBase SPAC1783.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1783.08c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1502 rpl1502delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1A10.09 FYPO:0005343 S640D,S683D,S688D,S693D Not assayed or wild type 972 h- ase1 ase1-S640D,S683D,S688D,S693D ase1(4SD)|ase1-S>D amino_acid_mutation ECO:0001232 low PMID:28178520 4896 2018-07-26 (Figures S2A) PomBase SPAC1486.01 FYPO:0001164 K126R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K126R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC1486.01 FYPO:0002691 K126R Not assayed or wild type 972 h- sod2 sod2-K126R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPBC660.14 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mik1 mik1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.14 FYPO:0000080 deletion 972 h- mik1 mik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC660.14 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mik1 mik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.14 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mik1 mik1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC660.14 FYPO:0001929 deletion 972 h- mik1 mik1delta deletion ECO:0001232 PMID:1706223 4896 2014-01-10 PomBase SPBC660.14 FYPO:0001927 deletion 972 h- mik1 mik1delta deletion ECO:0001232 PMID:1549179 4896 2013-02-07 PomBase SPBC660.14 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ned8-AAKGG-sde2-C fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 (Fig. EV2B) processing defective, does not complement sde2Δ PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002411 wild type Overexpression 972 h- alp11 alp11+ wild_type ECO:0001232 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- alp11 alp11+ wild_type ECO:0005638 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPAC13D6.05 FYPO:0002004 wild type Overexpression 972 h- alp11 alp11+ wild_type ECO:0001232 PMID:10473641 4896 2015-03-26 PomBase SPCC18.06c FYPO:0002827 D53A Overexpression 972 h- caf1 caf1-D53A caf1-D50A amino_acid_mutation ECO:0000231 medium PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC18.06c FYPO:0002827 D53A Overexpression 972 h- caf1 caf1-D53A caf1-D50A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37279920 4896 2023-06-08 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002897 E472D Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-E472D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:23211746 4896 2013-11-21 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000089 E472D Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-E472D amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:23211746 4896 2013-11-18 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0004893 wild type Overexpression 972 h- bgs2 bgs2+ wild_type ECO:0005801 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0002161 wild type Overexpression 972 h- bgs2 bgs2+ wild_type ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0004892 wild type Overexpression 972 h- bgs2 bgs2+ wild_type ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0001075 wild type Overexpression 972 h- bgs2 bgs2+ wild_type ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0001420 wild type Overexpression 972 h- bgs2 bgs2+ wild_type ECO:0005638 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPAC24C9.07c FYPO:0002177 wild type Overexpression 972 h- bgs2 bgs2+ wild_type ECO:0001232 PMID:11069657 4896 2015-09-28 PomBase SPBC543.06c FYPO:0000313 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Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-1828 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000227 PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Figure 1B) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003003 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-1828 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000227 60 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Figure 1B) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003003 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-1828 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 6.2 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 (Figure 1B) PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0003003 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-1828 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000227 9 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:16394105 4896 2016-09-21 Supplemental data PomBase SPBC26H8.07c FYPO:0006339 unknown Not assayed or wild type 972 h- nda3 nda3-1828 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 60-70 PMID:33506191 4896 2021-02-03 (Fig. 1) PomBase SPBC11G11.04 FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs20 trs20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11G11.04 FYPO:0000310 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs20 trs20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11G11.04 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs20 trs20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC11G11.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- trs20 trs20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC11G11.04 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trs20 trs20delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007334 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000021,FYECO:0000370 PMID:34524082 4896 2021-11-03 (Fig. 4A) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005850 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(SO:0001899) PMID:34524082 4896 2021-11-03 (Fig. 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000231 low assayed_transcript(SO:0001898) PMID:34524082 4896 2021-11-03 (Fig. 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0003412 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000231 high assayed_transcript(PomBase:SPAC212.11) PMID:34524082 4896 2021-11-03 (Fig. 4D) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000876 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137 high PMID:34524082 4896 2021-11-03 Fig. 4E Both H3K9me2 and H3K9me3 were completely abolished in clr4-GS253 and clr4-3FA strains at centromeric dg/dh repeats, being indistinguishable from clr4Δ PomBase SPBC428.08c FYPO:0000883 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137 high PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004577 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000137 high PMID:34524082 4896 2021-11-04 (Fig. 4E) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005847 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_substrate(PR:000050218) PMID:34524082 4896 2021-11-08 (Figure 1, 3F) PomBase SPBC428.08c FYPO:0001645 F256A,F310A,F427A Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-3FA amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PR:000050220),assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPAC1B3.08 FYPO:0009094 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2015-01-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001384 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:7501024 4896 2014-01-09 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004054 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9585506 4896 2014-11-21 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003477 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000258 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0005478 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002130 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9614178 4896 2014-10-27 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002130 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173) PMID:8649397 4896 2013-07-24 PomBase SPBC409.07c FYPO:0006232 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9614178 4896 2014-10-27 PomBase SPBC409.07c FYPO:0006232 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173) PMID:8649397 4896 2013-07-24 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004660 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9154834 4896 2015-05-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002289 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9614178 4896 2014-10-27 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002289 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:7657164 4896 2015-05-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002289 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9585506 4896 2014-11-21 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004659 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 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deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000711 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005580 PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000082 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000080 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001407 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002813 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000166 PMID:7498541 4896 2013-10-21 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002827 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000049 low low PMID:15292231 4896 2024-03-14 (Fig. 3) Moreover, the ade6-off to ade6-on conversion in Δsty1 and Δwis1 mutants was significantly reduced relative to wild-type cells, indicating that sty1 and wis1 deletions enhanced stabilization of the epigenetic inheritance of the silent states (Fig. 3B). PomBase SPBC409.07c FYPO:0000303 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000230 PMID:8832415 4896 2015-01-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0006231 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000207 PMID:16278445 4896 2017-09-22 PomBase SPBC409.07c FYPO:0006230 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000078 PMID:16278445 4896 2017-09-22 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003964 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005801 PMID:14503856 4896 2014-12-02 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 high PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 PMID:9447985 4896 2014-12-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000708 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000470 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003650 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:8832415 4896 2015-01-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001283 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:8832415 4896 2015-01-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001324 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC3F6.03) PMID:15135546 4896 2014-11-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004173 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:15917811 4896 2016-06-14 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001838 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000826 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 high assayed_transcript(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:12050156 4896 2023-12-13 Both the basal and zinc-induced levels of zym1 transcripts were severely reduced in wis1Δ (Fig. 3C). PomBase SPBC409.07c FYPO:0000826 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000404 medium assayed_transcript(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:12050156 4896 2023-12-13 but this pathway is not obligatory for zinc perception because zinc induction was retained in Wis1 mutants albeit at reduced magnitude. PomBase SPBC409.07c FYPO:0002287 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC660.07) PMID:9974219 4896 2013-09-10 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003993 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002305 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000025,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:10428498 4896 2013-07-02 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002304 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:11350071 4896 2014-11-05 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002304 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC839.06) PMID:10428498 4896 2013-07-02 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002304 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:8824588 4896 2015-01-07 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002304 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000166,FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:7498541 4896 2013-10-21 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003034 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001152 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:9135083 4896 2013-03-13 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001152 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:8824587 4896 2014-02-26 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001117 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000201 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:7498541 4896 2013-10-21 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001128 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001355 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009007 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009007 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000420 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 low PMID:37787465 4896 2024-04-22 Table 1 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009011 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003532 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003532 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004333 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.09c) PMID:16278445 4896 2017-09-22 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001038 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000422,FYECO:0000451 medium assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37787465 4896 2024-04-22 (Fig. 4F and G) PomBase SPBC409.07c FYPO:0003991 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPBC409.07c FYPO:0006634 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:27746023 4896 2020-11-17 unlike WT cell elongation continued after actin depolymerization, (Figures 2A and 2B; Movie S1) conclusions. 1. the SAPK pathway is required for CRIB dispersal after LatA treatment. 2 the actin cytoskeleton per se is not required for stability of the Cdc42 polarity module at cell tips. 3. cell elongation can occur in the complete absence of the actin cytoskeleton. PomBase SPBC409.07c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009008 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009008 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009008 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009008 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0009008 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004163 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001387 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:1756736 4896 2013-02-15 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:9450957 4896 2014-12-09 PomBase SPBC409.07c FYPO:0005231 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000123,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004162 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003265 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9202173 4896 2024-08-20 (Fig. 7) PomBase SPBC409.07c FYPO:0001883 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 2D) PomBase SPBC409.07c FYPO:0001192 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001164 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22912829 4896 2014-06-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001164 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001164 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:16087744 4896 2016-06-30 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002940 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000833 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPCC1322.08) PMID:18272791 4896 2017-08-04 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004024 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:32071154 4896 2020-04-01 (Fig. 2B) PomBase SPBC409.07c FYPO:0001266 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:9135147 4896 2012-07-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0003992 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC821.10c) PMID:12359231 4896 2014-11-04 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004171 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.09) PMID:9372444 4896 2018-06-07 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001420 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:1756736 4896 2013-02-15 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001420 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 PMID:8557102 4896 2013-06-03 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001046 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000422,FYECO:0000451 medium PMID:37787465 4896 2024-04-22 Table 1 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000441 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000441 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000441 deletion 972 h- wis1 wis1delta deletion 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2024-07-02 Table 1. List of the 13 TAM-sensitive heterozygous strains/Fig. 2. Confirmation of the tamoxifen (TAM)-sensitive candidate strains by spotting assays PomBase SPAC1805.05 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph cki3 cki3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1805.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- cki3 cki3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1805.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cki3 cki3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- cki3 cki3delta deletion ECO:0005638 PMID:9651503 4896 2018-06-12 PomBase SPAC1805.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cki3 cki3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009066 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC11D3.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC11D3.01c SPAC11D3.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0001117 G511C,T512A Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 low assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S4B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003040 G511C,T512A Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1715) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 1B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0003700 G511C,T512A Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000337 high assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 1B) PomBase SPNCRNA.1715 FYPO:0000833 G511C,T512A Overexpression 972 h- mamRNA mamRNA-5'SSmut nucleotide_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4D) PomBase SPAC17G6.07c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 use1 use1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G6.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- use1 use1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G6.07c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 use1 use1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G6.07c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 use1 use1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30099677 4896 2018-09-20 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-E4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc4 cdc4-E4 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPBC16D10.04c FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- dna2 dna2+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:25203555 4896 2015-01-06 PomBase SPAC1006.09 FYPO:0002060 K1149R Overexpression 972 h- win1 win1-K1149R amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:9693384 4896 2014-01-09 PomBase SPCC1393.13 FYPO:0004303 D252A Overexpression 972 h- duf89 duf89-D252A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPCC1393.13) PMID:35314193 4896 2022-10-21 (Figures 1 and 3) PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000705 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0003803 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0003803 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0003803 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPCC188.07) PMID:34255844 4896 2021-07-23 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0001645 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_using(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002019 2-28 Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000185 E344K reported but E is 343 or 345 Not assayed or wild type 972 h- rad51 loh4-1 other ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC644.14c FYPO:0005452 E344K reported but E is 343 or 345 Not assayed or wild type 972 h- rad51 loh4-1 other ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001840 E344K reported but E is 343 or 345 Not assayed or wild type 972 h- rad51 loh4-1 other ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC644.14c FYPO:0000089 E344K reported but E is 343 or 345 Not assayed or wild type 972 h- rad51 loh4-1 other ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPBC1306.01c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gfm1 gfm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1306.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- gfm1 gfm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1306.01c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gfm1 gfm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 R212RGVPLR Overexpression 972 h- cdc1 cdc1-J22 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPNCRNA.244 FYPO:0004099 deletion 972 h- SPNCRNA.244 SPNCRNA.244delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:29735745 4896 2018-05-18 (Fig. S2D) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0006658 CTD-S2A(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S2A(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263,FYECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 1) PomBase SPAC26F1.06 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gpm1 gpm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC26F1.06 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ 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cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000276 I954T Knockdown 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 50 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0000674 I954T Knockdown 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0007114 I954T Knockdown 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000081 PMID:32441227 4896 2020-06-05 PomBase SPAC25G10.07c FYPO:0004367 I954T Knockdown 972 h- cut7 cut7-446 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000081 PMID:32441227 4896 2020-06-12 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0000825 (-1197)-(-1008) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 prt-1delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 Interestingly, elevated pho1 levels were observed in prt-1Δ, prt-2Δ, and prt-3Δ (Figure 3B, lanes 1- 4) suggesting that element(s) responsible for pho1 silencing are located within the 5′ part of prt. PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0008120 Tra1 G2623-K2676 replaced by Tra2 H2564-K2617 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sptra2 fusion_or_chimera ECO:0006030 FYECO:0000137 complete assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000781 Tra1 G2623-K2676 replaced by Tra2 H2564-K2617 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sptra2 fusion_or_chimera ECO:0000291 FYECO:0000126 low PMID:31748520 4896 2023-09-01 PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000703 Tra1 G2623-K2676 replaced by Tra2 H2564-K2617 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sptra2 fusion_or_chimera ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC1604.17c),assayed_protein(PomBase:SPBP16F5.03c) PMID:31748520 4896 2023-09-04 Importantly, quantitative MS analyses show that both Tra1-SpTra2 and Tra1-ScTra1 hybrid mutant proteins efficiently copurify with Tti2 (Supplementary Fig. 9b). PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000097 Tra1 G2623-K2676 replaced by Tra2 H2564-K2617 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sptra2 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:31748520 4896 2023-09-01 (Fig. 5d) PomBase SPBP16F5.03c FYPO:0000088 Tra1 G2623-K2676 replaced by Tra2 H2564-K2617 Not assayed or wild type 972 h- tra1 tra1-Sptra2 fusion_or_chimera ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:31748520 4896 2023-09-01 (Fig. 5d) Phenotypic analyses of tra1-Sptra2 and tra1-Sctra1 strains showed that tra1-Sptra2 mutants are sensitive to HU and caffeine, similar to tra1Δ mutants PomBase SPBC32H8.15 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32H8.15 SPBC32H8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.15 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph SPBC32H8.15 SPBC32H8.15delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32H8.15 FYPO:0000095 deletion 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2c) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000470 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0006423 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:14972679 4896 2021-02-15 Furthermore, no Rec8-specific fluorescence at all could be detected in 10% of the mutant binucleates. In contrast, the distribution of Rec8- GFP fluorescence in Δsgo2 mutant binucleates was indistinguishable from wild-type. PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0006423 deletion 972 h- mes1delta sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:19965387 4896 2018-03-22 (Fig. S3) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000581 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 48 PMID:26483559 4896 2016-07-11 (Fig. 9A) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0004394 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 30 PMID:14972679 4896 2021-02-15 (Figures 1A and 2) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002219 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 2a) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002219 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:25579976 4896 2016-08-01 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002094 deletion 972 h- nda3-K311, mat gene-induced haploid meiosis sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:34851403 4896 2023-06-10 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0006425 deletion 972 h- nda3-K311, mat gene-induced haploid meiosis sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 complete PMID:34851403 4896 2023-06-10 In cells lacking Sgo1 (sgo1Δ), which protects centromeric cohesin during anaphase, no separated kinetochore signals were observed (Fig. 3A,C), although sister chromatids frequently underwent equational segregation in the absence of chiasmata (Fig. S2B). PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0008078 deletion 972 h- nda3-K311, mat gene-induced haploid meiosis sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:34851403 4896 2023-08-17 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 PMID:14730319 4896 2021-02-16 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003182 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:16541025 4896 2021-03-15 (Supplementary Fig. 7) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003182 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:16169489 4896 2014-03-04 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003182 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 50 PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 2a) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003182 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 2a, 2b) As with sgo1D cells, swi6D cells undergo intact meiosis I but suffer a nondisjunction of sister chromatids in meiosis II PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0003182 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 3f). The assay of chromosome segregation further revealed that sgo1-VE cells provoke nondisjunction in meiosis II, similarly to swi6D cells PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0005648 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:16541025 4896 2021-03-15 (Supplementary Fig. 7). PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0005648 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0005638 PMID:14730319 4896 2021-02-16 (Fig. 2c) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0005634 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 >2 PMID:21920317 4896 2016-08-24 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0005634 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 PMID:26483559 4896 2016-07-11 (Fig. 9A) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0005633 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 25-30 PMID:21920317 4896 2016-08-24 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0005633 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 50 PMID:28497540 4896 2019-11-27 (Fig. 1C) PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgo1 sgo1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPSNRNA.01 FYPO:0002061 T3G,C6G Not assayed or wild type 972 h- snu1 snu1-U3G,C6G nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8665408 4896 2014-06-23 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC32A11.01 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph mug8 mug8delta deletion ECO:0005638 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assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:22669973 4896 2013-02-01 PomBase SPAC17G8.10c FYPO:0000940 L241A,V245A Not assayed or wild type 972 h- dma1 dma1-L241A,V245A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:22669973 4896 2013-01-24 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0000230 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 high high PMID:34613787 4896 2021-11-30 (Figure 2B) PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003338 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003444 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003838 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 30 PMID:34613787 4896 2021-12-01 (Figure 2B) PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0002656 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006307 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003339 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 low PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003014 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 Second, the normalized disassembly rate, which took the number of actin molecules in the ring into consideration, was 40% lower in the mutant than wild-type cells. PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001355 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001881 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003336 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC645.05c) PMID:34613787 4896 2021-12-01 In contrast, these myosins persisted at nearly their highest levels for an hour and the time course of the process was much more variable in the adf1-M3 mutant cells (Fig. 4C and D). In a few cofilin mutant cells, the myosins dwelled at the cell division site for more than 10 minutes after the completion of the ring constriction (Fig. 5A). PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0003336 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC4A8.05c) PMID:34613787 4896 2021-12-01 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004854 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 Therefore, mature rings of the mutant had on average about 1.9 times as much actin as wild-type cells PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004854 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 (Fig. 3C) The number of Cdc12-3GFP molecules in the contractile rings of adf1-M3 mutant cells was on average about twice that of wild-type cells and much more variable PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004854 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 (Fig. 3A-B and Table 2). Contractile rings of adf1-M3 mutant cells that were able to constrict had twice as many myosin molecules as the wild-type cells, translating to one myosin motor domain for every 70 nm of filament PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004854 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:34613787 4896 2021-12-01 (Fig. 3A-B and Table 2). Contractile rings of adf1-M3 mutant cells that were able to constrict had twice as many myosin molecules as the wild-type cells, translating to one myosin motor domain for every 70 nm of filament PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0007899 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:34613787 4896 2021-12-01 Contractile rings of adf1-M3 mutant cells accumulated actin twice as fast over a similar period of time as wild-type cells (Table 2). PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006305 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0004895 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0001904 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 10 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0005475 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPAC20G4.06c FYPO:0006308 E132A,K133A Not assayed or wild type 972 h- adf1 adf1-M3 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:22024167 4896 2017-12-20 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000705 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:35108037 4896 2022-02-07 (Fig 1E) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0004470 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:35108037 4896 2022-02-07 PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0004470 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP4H10.04) PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure 4B,D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001645 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000140 assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c),assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:35108037 4896 2022-02-14 Pxl1-P18A reduced binding to full-length Cdc15 compared to wild-type Pxl1 (Figure 3A) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001365 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:35108037 4896 2022-02-14 (Figure S3A) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002562 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S1D-E) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0007828 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35108037 4896 2022-02-14 (Figure S3A) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0000674 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002141 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0004675 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Fig. S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0003809 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000248 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002559 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPAC1F5.04c) PMID:35108037 4896 2022-02-14 (Figure S3B) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0006187 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:35108037 4896 2022-02-14 (Figure S3A) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001903 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2A-C) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0001357 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2D) PomBase SPBC4F6.12 FYPO:0002177 P18A Not assayed or wild type 972 h- pxl1 pxl1-P18A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:35108037 4896 2022-02-09 (Figure S2A-C) PomBase SPBC13E7.03c FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG 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2015-02-12 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 1-272,353-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27(273-352) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:15579205 4896 2015-02-12 PomBase SPCC320.10 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srp72 srp72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC320.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- srp72 srp72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC320.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 srp72 srp72delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC417.07c FYPO:0005697 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000285 complete PMID:19001497 4896 2016-10-02 (Fig. 1D, 1E) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005696 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PomBase SPCC417.07c FYPO:0004511 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 1E) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005707 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005708 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0002967 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC365.15) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0005709 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC417.07c) PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 2D-F) PomBase SPCC417.07c FYPO:0000089 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:31483748 4896 2019-11-08 (Figure 2A) PomBase SPCC417.07c FYPO:0002112 GLKLKCYFL267AAAAAAAAA Not assayed or wild type 972 h- mto1 mto1-9A2 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:19001497 4896 2016-09-27 (Fig. 1C) PomBase SPBC15D4.14 FYPO:0002430 deletion 972 h- taf51 taf51delta deletion ECO:0005638 PMID:11279037 4896 2015-11-18 PomBase SPBC15D4.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- taf51 taf51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC15D4.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 taf51 taf51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC15D4.14 FYPO:0002061 deletion 972 h- taf51 taf51delta deletion ECO:0005638 PMID:11279037 4896 2015-11-18 PomBase SPBC15D4.14 FYPO:0002451 deletion 972 h- h+ 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2014-03-07 PomBase SPAC56F8.14c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug115 mug115delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC56F8.14c FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph mug115 mug115delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.14c FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 mug115 mug115delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC56F8.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug115 mug115delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC56F8.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug115 mug115delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC56F8.14c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug115 mug115delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000620 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:12815070 4896 2019-11-28 Unlike classic “cut” mutants (Hirano et al. 1986), septation did not always follow on from the mitoticarrest. PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004481 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:15917811 4896 2016-06-14 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001683 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:12815070 4896 2019-11-28 plo1.ts2 strains entered mitosis but did not form spindles PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0000082 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:40161431 4896 2025-04-08 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0001382 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 We concluded that the Plo1-dependent kinase activity of both plo1.ts2 and plo1.ts19 was greatly reduced. PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0007257 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6G9.06c) PMID:22438582 4896 2020-02-21 (Figure 5F) PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000229 PMID:12815070 4896 2019-11-28 Both plo1.ts2 and plo1.ts19 conferred temperature sensitivity for growth on minimal medium PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0002061 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:12815070 4896 2019-11-28 ability to form colonies o nrich medium at 36°C was indistinguishable from that of wild-typec ells PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0003210 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:40161431 4896 2025-04-08 PomBase SPAC23C11.16 FYPO:0004083 E139K Not assayed or wild type 972 h- plo1 plo1-ts2 plo1.ts2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:12815070 4896 2019-11-28 Western blot analysis showed that Plo1 levels in plo1.ts2cellswerenotradicallydifferentfromwild-type PomBase SPNCRNA.1303 FYPO:0000799 II:63695..64021 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1303 SPNCRNA.1303(93-419) SPNCRNA.289OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1303 FYPO:0000088 II:63695..64021 Overexpression 972 h- SPNCRNA.1303 SPNCRNA.1303(93-419) SPNCRNA.289OE partial_nucleotide_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0001645 L305A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-L305A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.09c),assayed_using(PomBase:SPCC10H11.01) PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0003631 L305A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-L305A amino_acid_mutation ECO:0001807 PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPCC10H11.01 FYPO:0001355 L305A Not assayed or wild type 972 h- prp11 prp11-L305A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000229 PMID:22064476 4896 2014-08-14 PomBase SPBC582.03 FYPO:0003481 cdc13-RLuc Not assayed or wild type 972 h- cdc13 cdc13-RLuc fusion_or_chimera ECO:0001232 high PMID:33683349 4896 2021-03-19 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002061 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-205 unknown ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0001294 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-205 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0001368 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-205 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002060 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 mam2::LEU2 cdc11 cdc11-205 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:9649519 4896 2015-04-17 PomBase SPAC2F7.08c FYPO:0001122 wild type Overexpression 972 h- snf5 snf5+ wild_type ECO:0001232 PMID:22624651 4896 2012-06-18 PomBase SPBC19G7.05c FYPO:0003838 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs1 cps1-606 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15507118 4896 2016-04-07 PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 E50V Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-E50V amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0000964 deletion 972 h- pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 PMID:40193710 4896 2025-04-14 (Fig. 2A) PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pah1 pah1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph pah1 pah1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- pah1 pah1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pah1 pah1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC8E11.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pah1 pah1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000848 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0001232 FYECO:0000006,FYECO:0000103,FYECO:0000201 PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000080 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0005638 FYECO:0000201 PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0000337 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0000337 FYECO:0000006 assayed_using(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0001236 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:8119981 4896 2014-04-30 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000068 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0005638 PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC1805.17 FYPO:0000767 unknown Not assayed or wild type 972 h- crm1 crm1-119 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:2647765 4896 2013-01-25 PomBase SPAC20G8.01 FYPO:0000838 1-31,176-768 Not assayed or wild type 972 h- cdc17 cdc17-32-175 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.01) PMID:14752051 4896 2016-03-03 PomBase SPNCRNA.82 FYPO:0002061 G37A,C38A Not assayed or wild type 972 h- mrp1 mrp1-TOpt nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:8948095 4896 2014-08-11 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0000121 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 otg3 otg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 otg3 otg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0004806 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 otg3 otg3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0009060 deletion 972 h- otg3 otg3delta deletion ECO:0001232 PMID:31657618 4896 2023-06-22 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph otg3 otg3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC4C3.09 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- 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1D) PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001118 H637I Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-H637I amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0001122 H637I Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-H637I amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0002960 H637I Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-H637I amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0000833 H637I Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-H637I amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:21317872 4896 2017-06-09 PomBase SPAC1006.03c FYPO:0006080 H637I Not assayed or wild type 972 h- red1 red1-H637I amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1006.03c) PMID:21317872 4896 2016-10-21 PomBase SPAC4G9.20c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ymc1 ymc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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SPCC645.04 FYPO:0000703 S257A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-S257A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 S257A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-S257A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPBC21C3.18 FYPO:0000121 T264A Not assayed or wild type 972 h- spo4 spo4-T264A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11739743 4896 2026-01-04 We ex- pressed these mutant genes under the control of the nmt1 promoter in a spo4 mutant. As Fig. 2C shows, none of these mutant spo4 genes complement the sporulation defect of the spo4 mutant. PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ppk8 ppk8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk8 ppk8delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ppk8 ppk8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph ppk8 ppk8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- ppk8 ppk8delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ppk8 ppk8delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph 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FYECO:0000079,FYECO:0000137 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- ppk8 ppk8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk8 ppk8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22G7.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppk8 ppk8delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.09c FYPO:0000705 1-199,501-886 Not assayed or wild type 972 h- sog2 sog2-200-500 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBC17F3.02),assayed_using(PomBase:SPBC887.09c) PMID:23649273 4896 2013-05-08 PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001690 R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-R124L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-R124L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-R124L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-R124L amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 R124L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-R124L amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC3B9.15c FYPO:0001245 N408* Not assayed or wild type 972 h- scp1 scp1-408->stop scp1-408* partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC105.01c FYPO:0005947 deletion 972 h- kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:34349749 4896 2024-12-14 We found that neither osr2delta nor kha1delta was sensitive to K+ salts and that the phenotype of the corresponding double mutant was similar to that of the single cfr1delta mutant (Figure 2D). PomBase SPAC105.01c FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0003384 deletion 972 h- kha1 kha1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000103,FYECO:0000137 high PMID:30148840 4896 2018-08-31 PomBase SPAC105.01c FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph kha1 kha1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC105.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- kha1 kha1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC105.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kha1 kha1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC105.01c FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 kha1 kha1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC713.02c FYPO:0001424 ubp15-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp15 ubp15-NES fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPBC713.02c) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0005677 ubp15-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp15 ubp15-NES fusion_or_chimera ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0005674 ubp15-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp15 ubp15-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000044777) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPBC713.02c FYPO:0005674 ubp15-NES Not assayed or wild type 972 h- ubp15 ubp15-NES fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PR:000049732) PMID:27151298 4896 2016-09-28 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001125 F117G,M167F Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as8 orb5.as8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 PMID:23986474 4896 2022-11-11 rb5.as8 inhibition did not produce the ‘orb’ phenotype observed in the original orb5.ts mutants at the restrictive temperature (data not shown) PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001696 F117G,M167F Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as8 orb5.as8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000338 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 2B). The M167F mutation in either the orb5.as1 or orb5.as2 backbone generated the orb5.as8 and orb5.as9 alleles, which were more sensitive to analogue inhibition than the respective parental allele PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0001696 F117G,M167F Not assayed or wild type 972 h- cka1 orb5-as8 orb5.as8 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000223 high PMID:23986474 4896 2022-11-11 (Fig. 2B). The M167F mutation in either the orb5.as1 or orb5.as2 backbone generated the orb5.as8 and orb5.as9 alleles, which were more sensitive to analogue inhibition than the respective parental allele PomBase SPBC211.04c FYPO:0000705 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC211.04c),assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000774 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000778 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:21971174 4896 2012-07-16 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000776 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000085 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000085 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000089 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPBC211.04c FYPO:0000089 E824G,D825N Not assayed or wild type 972 h- mcm6 mcm6-S1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:21971174 4896 2012-03-07 PomBase SPCC1322.12c FYPO:0008202 586-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1(1-585) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 10 PMID:16360688 4896 2024-04-24 (Figure 1c) PomBase SPCC1322.12c FYPO:0007661 586-1044 Not assayed or wild type 972 h- bub1 bub1(1-585) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBP35G2.03c) PMID:16360688 4896 2024-04-24 , Sgo1 is seen as nuclear staining with punctate dots of fluorescence along the spindle (Figure 1D and [2, 9]). This localization is abolished in a bub1D background but preserved in the truncated mutants (Figure 1D), although the signal intensity was variable; in bub11-585, Sgo1 staining was as strong as in the wild-type, but it was weaker in bub11-179 and bub11-826 backgrounds. We conclude that the N terminus of Bub1 is sufficient to promote correct Sgo1 localization and function during MI. PomBase SPAC27E2.09 FYPO:0002446 1627-1740 Not assayed or wild type 972 h- mak2 mak2-deltapas partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:20919928 4896 2016-06-23 PomBase SPBC428.08c FYPO:0007376 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Notably, replacement of clr4+ with clr4F449Y or clr4I418P abolished the epigenetic inheritance of ade6+ silencing (Fig. 4b, right). (Fig. 4c, 4d) PomBase SPBC428.08c FYPO:0006993 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:28682306 4896 2025-10-23 lr4I418P had a milder silencing defect, consistent with partial loss of H3K9me3 in this mutant (Fig. 1d, e). (Fig. 1f, g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0002355 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3a) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004137 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3b-g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000883 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Furthermore, chromatin immu- noprecipitation followed by high throughput sequencing (ChIP–seq) or quantitative PCR (ChIP–qPCR) showed that while pericentromeric H3K9me2 levels were increased in clr4 mutants relative to clr4+ cells (Fig. 1c; Extended Data Fig. 2a, b)H3K9me3 was lost in clr4F449Y cells and reduced in clr4I418P cells (Fig. 1d; Extended Data Fig. 2c). PomBase SPBC428.08c FYPO:0005845 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3a) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004577 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Both H3K9me2 and me3 reads mapping specifically to unique sequences at the silent mating-type locus and telomeric DNA regions were drastically reduced (Extended Data Fig. 3b-g) PomBase SPBC428.08c FYPO:0000874 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:28682306 4896 2025-10-23 Furthermore, chromatin immu- noprecipitation followed by high throughput sequencing (ChIP–seq) or quantitative PCR (ChIP–qPCR) showed that while pericentromeric H3K9me2 levels were increased in clr4 mutants relative to clr4+ cells (Fig. 1c; Extended Data Fig. 2a, b) PomBase SPBC428.08c FYPO:0004380 I418P Not assayed or wild type 972 h- clr4 clr4-I418P clr4I418P amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:28682306 4896 2025-10-23 Furthermore, the pericentromeric recruitment of the RITS complex subunits Chp1 was increased in both clr4F449Y and clr4I418P cells, presumably owing to increased H3K9me2 (Fig. 2c; Extended Data Fig. 5a–c) PomBase SPCC1281.01 FYPO:0007114 unknown Not assayed or wild type 972 h- ags1 ags1-1224 unknown ECO:0001232 PMID:38442865 4896 2024-05-31 (Fig. 2A, B and C) PomBase SPBC119.01 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn3 rpn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.01 FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn3 rpn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC119.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- rpn3 rpn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC119.01 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpn3 rpn3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC126.04c FYPO:0002398 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgf73 sgf73delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC126.04c FYPO:0000164 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgf73 sgf73delta deletion ECO:0001232 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC126.04c FYPO:0001971 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgf73 sgf73delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC126.04c FYPO:0005053 deletion 972 h- sgf73 sgf73delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26443059 4896 2015-11-13 PomBase SPCC126.04c FYPO:0005053 deletion 972 h- sgf73 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assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPCC126.04c FYPO:0001645 deletion 972 h- sgf73 sgf73delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_using(PomBase:SPBC83.03c) PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPCC126.04c FYPO:0001645 deletion 972 h- sgf73 sgf73delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPAC18G6.02c),assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPCC126.04c FYPO:0001645 deletion 972 h- sgf73 sgf73delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low assayed_using(PomBase:SPBC83.03c),assayed_using(PomBase:SPCC736.11) PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPCC126.04c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph sgf73 sgf73delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC126.04c FYPO:0001253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sgf73 sgf73delta deletion ECO:0001232 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to Sty1 phosphorylation in Dpyp2 cells (Figures 2A and S3E). PomBase SPCC576.03c FYPO:0001102 wild type Overexpression 972 h- tpx1 tpx1+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PR:000028951) PMID:22245228 4896 2012-06-21 PomBase SPCC576.03c FYPO:0003692 wild type Overexpression 972 h- tpx1 tpx1+ wild_type ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:37572670 4896 2024-01-26 By contrast, overexpression of Tpx1 increased H2O2-induced Sty1 phosphorylation in wild-type cells and also restored some H2O2-inducibility to Sty1 phosphorylation in Dpyp2 cells (Figures 2A and S3E). PomBase SPAC15A10.02 FYPO:0001043 S217A,T218A,S220A,T221A,T283A Not assayed or wild type 972 h- taf12 taf12-5A amino_acid_mutation ECO:0000291 FYECO:0000127,FYECO:0000272 PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPAC15A10.02 FYPO:0001043 S217A,T218A,S220A,T221A,T283A Not assayed or wild type 972 h- taf12 taf12-5A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127,FYECO:0000272 PMID:29079657 4896 2019-02-07 PomBase SPAC15A10.02 FYPO:0002020 S217A,T218A,S220A,T221A,T283A Not assayed or wild type 972 h- taf12 taf12-5A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC15A10.02 FYPO:0002020 S217A,T218A,S220A,T221A,T283A Not assayed or wild type 972 h- taf12 taf12-5A amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32C12.02) PMID:29079657 4896 2019-04-04 PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0006108 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(928-1390)-fus1(1278-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(1/2FH1)-cdc12(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 5) PomBase SPAC20G4.02c FYPO:0000413 fus1delta::fus1(1-791)-cdc12(928-1390)-fus1(1278-1372) Not assayed or wild type 972 h- fus1 fus1(Nt)-cdc12(1/2FH1)-cdc12(FH2)-fus1(Ct) fusion_or_chimera ECO:0001232 low PMID:35673994 4896 2022-06-15 (Fig. 5) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0007405 S405A,T419A,T492A,S511A,S527A,S605A,S636A,S702A,S710A,S721A,S732A,S743A,S752A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:32101481 4896 2020-05-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0009061 S405A,T419A,T492A,S511A,S527A,S605A,S636A,S702A,S710A,S721A,S732A,S743A,S752A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22A amino_acid_mutation ECO:0000334 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36749320 4896 2023-03-15 (Figure 10) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0008075 S405A,T419A,T492A,S511A,S527A,S605A,S636A,S702A,S710A,S721A,S732A,S743A,S752A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22A amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC926.03) PMID:36749320 4896 2023-03-24 (Figure 10) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0006897 S405A,T419A,T492A,S511A,S527A,S605A,S636A,S702A,S710A,S721A,S732A,S743A,S752A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:32101481 4896 2020-05-27 Though the length of CR formation (node appearance to complete ring) was similar in wild type, cdc15-22A, and cdc15-22D, the periods of maturation (interval between CR formation and constriction initiation) and constriction (start to end of CR diameter decrease) were shorter in cdc15-22A and longer in cdc15-22D (Figure 4F). PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0001903 S405A,T419A,T492A,S511A,S527A,S605A,S636A,S702A,S710A,S721A,S732A,S743A,S752A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22A amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:32101481 4896 2020-05-27 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0002874 S405A,T419A,T492A,S511A,S527A,S605A,S636A,S702A,S710A,S721A,S732A,S743A,S752A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-22A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:32101481 4896 2020-06-05 PomBase SPBC530.08 FYPO:0001352 deletion 972 h- ntu2 ntu2delta deletion ECO:0001232 assayed_region(PomBase:SPAC1002.16c) PMID:40015273 4896 2025-03-19 (Figure 7) PomBase SPBC530.08 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- ntu2 ntu2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC530.08 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC530.08 FYPO:0001236 deletion 972 h- ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-10-17 PomBase SPBC530.08 FYPO:0001164 deletion 972 h- ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-10-17 PomBase SPBC530.08 FYPO:0001795 deletion 972 h- ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:22840777 4896 2012-11-26 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0005253 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC530.08 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000271 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC530.08 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC530.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- ntu2 ntu2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC530.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC530.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ntu2 ntu2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC3H5.05c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rps1401 rps1401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.05c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph rps1401 rps1401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.05c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph rps1401 rps1401delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC3H5.05c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph rps1401 rps1401delta deletion ECO:0005638 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low PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC36.04 FYPO:0002106 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cys11 cys11delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 high high PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC36.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- cys11 cys11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC36.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cys11 cys11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC36.04 FYPO:0002197 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 cys11 cys11delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC36.04 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cys11 cys11delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC365.06 FYPO:0000443 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC3D6.11c) PMID:39786922 4896 2025-02-03 (Fig. 2B and C) PomBase SPBC365.06 FYPO:0000705 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC30D11.13),assayed_protein(PomBase:SPBC365.06) PMID:21444718 4896 2023-03-24 We tested in vitro interaction between His6-SLD2 and recombinant wild-type GST-Ubc9 or GST-Ubc9H20D by GSH-Sepharose pulldown and Western analysis, revealing that GST-Ubc9H 2 0 D abolishes the interaction (Fig. 2A). PomBase SPBC365.06 FYPO:0005630 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0000112 high PMID:21444718 4896 2023-03-24 We next analyzed total SUMO conjugates in SUMOD81R cells by Western blotting for comparison with those in reference strains. Notably, in both SUMOD81R and pli1 cells, the wild-type pattern of SUMO conjugates was undetectable (Fig. 3E). In contrast, bulk SUMO conjugates were readily detected in cells lacking Nse2 SUMO ligase activity (nse2-SA) or the Ubc9:SLD2 complex (Fig. 3E, rad60E380R) PomBase SPBC365.06 FYPO:0007532 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:33159083 4896 2020-11-26 PomBase SPBC365.06 FYPO:0007537 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:33159083 4896 2020-12-01 PomBase SPBC365.06 FYPO:0001690 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 However, like pli1 cells, SUMOD81R mutants are not appreciably sensitive to genotoxins (Fig. 4A) PomBase SPBC365.06 FYPO:0000963 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-30 However, like pli1 cells, SUMOD81R mutants are not appreciably sensitive to genotoxins (Fig. 4A) PomBase SPBC365.06 FYPO:0000957 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2023-03-24 Strikingly, compared to SUMO , SUMOD81R cells exhibited nearly wild-type growth rates and sensitivity to genotoxins (Fig. 3D). PomBase SPBC365.06 FYPO:0006887 D81R Not assayed or wild type 972 h- pmt3 pmt3-D81R SUMO-D81R amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21444718 4896 2025-06-22 SUMOD81R is conjugation proficient as it produced a sumoylation pattern indistinguish- able from that of the wild type (Fig. 3C). PomBase SPBC18H10.04c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 sce3 sce3delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC18H10.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr sce3 sce3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC18H10.04c FYPO:0009007 deletion 972 h- sce3 sce3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000181,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC18H10.04c FYPO:0004557 deletion 972 h- sce3 sce3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC18H10.04c FYPO:0009008 deletion 972 h- sce3 sce3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPBC18H10.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sce3 sce3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 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methylation assay using recombinant Mlo3 carrying single- or double-mutant combinations showed that Clr4 methylates K167 of Mlo3 in vitro (Fig. 2B). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0004201 K165A,K167A Not assayed or wild type 972 h- mlo3 mlo3-KA mlo3-C3|mlo3KA amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21436456 4896 2024-01-15 Interestingly, mlo3-A caused a decrease in levels of centromeric siRNA as compared to WT (Fig. 2D). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003557 K165A,K167A Not assayed or wild type 972 h- mlo3 mlo3-KA mlo3-C3|mlo3KA amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21436456 4896 2024-01-15 Because clr4Δ and ago1Δ enhance antisense RNA levels when combined with a variant histone h2a.zΔ (10), we examined the mlo3-A mutant transcriptome with or without H2A.Z. Like clr4Δ and ago1Δ, mlo3-A also showed weak up- regulation of antisense RNAs (4.7% genes) (fig. S9). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003557 K165A,K167A Not assayed or wild type 972 h- mlo3 mlo3-KA mlo3-C3|mlo3KA amino_acid_mutation ECO:0000291 medium PMID:21436456 4896 2024-01-15 However, the mlo3-A h2a.zΔ double mutant showed a synergistic increase in antisense RNAs (18.6% of genes) (Fig. 3C and figs. S8 and S9)Because clr4Δ and ago1Δ enhance antisense RNA levels when combined with a variant histone h2a.zΔ (10), we examined the mlo3-A mutant transcriptome with or without H2A.Z. Like clr4Δ and ago1Δ, mlo3-A also showed weak up- regulation of antisense RNAs (4.7% genes) (fig. S9). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006811 K165A,K167A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3-KA mlo3-C3|mlo3KA amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000705 G8D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-G8D amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.08c),assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001274 G8D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-G8D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC19C2.09) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0000833 G8D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-G8D amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.07) PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC4B3.07 FYPO:0001245 G8D Not assayed or wild type 972 h- nro1 nro1-G8D amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:29083304 4896 2017-11-10 PomBase SPCC320.09 FYPO:0000741 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 hem15 hem15delta deletion 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2024-03-26 (Fig. S7) PomBase SPAC1420.01c FYPO:0001357 L520A Not assayed or wild type 972 h- mks1 mks1-L520A mks1-LA520.521AA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:38269097 4896 2024-03-27 (Figure 6) PomBase SPBC649.05 FYPO:0007183 T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75D,T78D cut12.T75DT78D amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) plo1 increased specific activity PomBase SPBC649.05 FYPO:0001571 T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75D,T78D cut12.T75DT78D amino_acid_mutation ECO:0006030 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16),assayed_using(PomBase:SPBC649.05) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPBC649.05 FYPO:0006824 T75D,T78D Not assayed or wild type 972 h- cut12 cut12-T75D,T78D cut12.T75DT78D amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 medium assayed_using(PomBase:SPAC23C11.16) PMID:23333317 4896 2020-08-25 (Fig. 5B) PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000705 I33R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-I33R amino_acid_mutation ECO:0000325 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 2C) PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0000703 I33R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-I33R amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPAC19G12.13c),assayed_protein(PomBase:SPAC6F6.16c) PMID:29160296 4896 2024-08-21 (Fig. 3E) PomBase SPCC1620.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- bet4 bet4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1620.05 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bet4 bet4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1620.05 FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 bet4 bet4delta deletion ECO:0001232 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pku80delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPBC543.03c FYPO:0007261 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0001232 high PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figures S2A, S2B). AND As previously shown, telomere tethering was significantly compromised in rap1Δ and bqt4Δ cells (Figure S2C; Chikashige et al., 2009). PomBase SPBC543.03c FYPO:0005545 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 Interestingly, Tf clustering was impaired by pku70Δ and pku80Δ at a level similar to that observed in abp1Δ cells (Figure 2A). PomBase SPBC543.03c FYPO:0007270 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 Remarkably, the association of Tf elements with centromeres was significantly compromised in pkuΔ cells (P < 0.00001, Mann-Whitney U test; Figures 3D and 3E). PomBase SPBC543.03c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0005407 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:12930956 4896 2016-05-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0005405 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:12930956 4896 2016-05-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0005405 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000170,FYECO:0000201 low PMID:12930956 4896 2016-05-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0005406 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 high PMID:12930956 4896 2016-05-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0002573 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0001232 PMID:25965521 4896 2016-07-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0004656 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:12930956 4896 2016-05-04 PomBase SPBC543.03c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pku80 pku80delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001870 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 clustering and tethering of centromeres to the nuclear periphery were not affected in pku70Δ and pku80Δ cells, although Ku does localize at centromeres (Figures 1E, 3A, and 3B) PomBase SPBC543.03c FYPO:0002335 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000049 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figure S1C) PomBase SPBC543.03c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pku80 pku80delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC543.03c FYPO:0002169 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0004229 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0004229 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0004229 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21931565 4896 2018-09-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000969 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000969 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000969 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 PMID:19150433 4896 2017-02-01 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001690 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21931565 4896 2018-09-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001164 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000963 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000963 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:23080121 4896 2013-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000957 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 PMID:25965521 4896 2016-08-05 PomBase SPBC543.03c FYPO:0007269 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0001232 PMID:23084836 4896 2020-02-27 (Figures S2A, S2B) PomBase SPBC543.03c FYPO:0002554 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c) PMID:21931565 4896 2018-09-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001317 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001923) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001317 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0000106 assayed_using(SO:0001925) PMID:22139915 4896 2012-11-06 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:17936710 4896 2016-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001357 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18854158 4896 2017-01-27 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001188 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0000089 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:12861005 4896 2016-05-04 PomBase SPBC543.03c FYPO:0002344 deletion 972 h- pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 PMID:17671430 4896 2014-03-04 PomBase SPBC543.03c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC543.03c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pku80 pku80delta deletion 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ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1289.02c),assayed_using(PomBase:SPBC146.07) PMID:9371883 4896 2014-06-30 PomBase SPAC23C11.08 FYPO:0007505 L12R Not assayed or wild type 972 h- php3 php3-L12R amino_acid_mutation ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 On the other hand, the global binding of Php3 at gene promoters, lncRNAs, and other ncRNAs, was reduced but not abolished in HFD mutant cells (Supplementary Fig. 5d, e, Supplemen- tary Data 4). PomBase SPAC23C11.08 FYPO:0002386 L12R Not assayed or wild type 972 h- php3 php3-L12R amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 Remarkably, we observed that in both mutants, the binding of PhpC subunits Php3 and Php5 at cenH and dh heterochromatic repeats was drastically reduced (Fig. 4e–g, Supplementary Fig. 5b)...... Indeed, site- specific ChIP-qPCR analysis revealed a ~ 90% reduction in Php3 and a ~ 80% reduction in Php5 in HFD mutants compared to WT (Fig. 4g, Supplementary Fig. 5b). PomBase SPAC23C11.08 FYPO:0000838 L12R Not assayed or wild type 972 h- php3 php3-L12R amino_acid_mutation ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 while the nuclear localization of both TFs was preserved (Fig. 4h, Supplementary Fig. 5c) PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002061 G64GRGTPG Not assayed or wild type 972 h- rfc2 rfc2-K18 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- 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SPAC11G7.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11G7.03 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph idh1 idh1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 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deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 high PMID:23365689 4896 2014-07-16 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 PMID:26891792 4896 2023-06-21 (Fig. 4) PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 low PMID:26891792 4896 2023-06-21 (Fig. 4) PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:25701403 4896 2015-03-27 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:25701403 4896 2015-03-27 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 PMID:25669599 4896 2016-01-25 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003559 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24059229 4896 2014-08-12 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003679 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24059229 4896 2014-08-12 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0000087 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low 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rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph rav1 rav1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- rav1 rav1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rav1 rav1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1105.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rav1 rav1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001550 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001534 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001546 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001355 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 low PMID:11886869 4896 2024-02-16 Δzhf strain were viable and showed only a minor reduction in growth rate under control conditions without any added heavy metal salts. PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0007041 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000345 PMID:31239353 4896 2019-08-09 (Figure 8) PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0006828 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000345 high PMID:29529046 4896 2019-02-03 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001551 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001547 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.06) PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0007047 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000173 PMID:31239353 4896 2019-08-01 (Figure 7) PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001199 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000126,FYECO:0000172 PMID:18637840 4896 2012-09-12 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001536 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001537 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001539 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001540 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001541 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001542 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001543 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001538 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001544 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000126,FYECO:0000173 PMID:18637840 4896 2012-09-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002343 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137 PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 PMID:11886869 4896 2024-02-16 In contrast to that, the zhf disruption was found to significantly protect cells from toxicity of Cd2+ ions, the third known substrate of CDF proteins. At the IC50 concentration for wild-type cells of 100 μM, Δzhf cells were inhibited by only 4% (±3%) (Fig. 1D). PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000763 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:11886869 4896 2024-02-16 To determine whether the main pathway for Cd2+ detoxification in S. pombe, the formation of phytochelatins, is required for the Δzhf-dependent protection, the zhf gene was disrupted in the Δpcs strain Sp27 (20). Toxicity assays showed that the protective effect was even more pronounced in this genetic background. PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002588 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 PMID:11886869 4896 2024-02-16 a pronounced protective effect of the Zhf inactivation could be detected also for Ni2+ PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001245 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 high PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001245 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:27053105 4896 2016-08-02 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001245 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 PMID:11886869 4896 2024-02-16 Similarly, the absence of a functional Zhf protein rendered the S. pombe cells Co2+-hypersensitive (Fig. 1C). At 1 mM Co2+ in EMM, wild-type cells showed 94% (±11%) of the optical density of untreated control cells, whereas Δzhf cells reached only 36% (±3.5%). PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002328 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000116 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:11886869 4896 2024-02-16 In the presence of elevated Zn2+ levels, however, they were severely growth-inhibited (Fig. 1, A and B). PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000116 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:18637840 4896 2012-09-12 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000116 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103 PMID:18637840 4896 2012-09-12 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0000116 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000404 high PMID:12050156 4896 2023-12-13 Most importantly, the zhfΔ strain was hypersensitive to zinc showing impaired growth on rich medium (YE5S) compared with the equivalent control strain and was unable to grow in medium supplemented with 20 μm ZnSO4 (Fig. 1C). PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001533 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000404 high PMID:12050156 4896 2023-12-13 Zhf Is Required for Growth on Low Zinc PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- zhf1 zhf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.14 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 zhf1 zhf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r8-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)3(S5A)11(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S5A(r8-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)3(S5A)11(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S5A(r8-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5)3(S5A)11(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4A) PomBase SPBC11G11.07 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP mtr10 mtr10+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC790.03 FYPO:0000703 1-199 Not assayed or wild type 972 h- rbd2 rbd2(200-251) rbd2C(200-251) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC1565.08),assayed_using(PomBase:SPCC790.03) PMID:27655872 4896 2016-12-04 (Fig. 6B) PomBase SPBC428.08c FYPO:0005554 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0004745 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006813 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0005843 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0001740 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006815 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0000966 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006681 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPBC428.08c FYPO:0006814 R406A,N409A,H410A Not assayed or wild type 972 h- mat2-3delta clr4 clr4-set amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPAC22A12.08c FYPO:0002111 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crd1 crd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- crd1 crd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22A12.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 crd1 crd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- crd1 crd1delta deletion ECO:0005638 PMID:29958934 4896 2021-04-12 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0006978 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001128 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001355 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0009007 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0003532 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0004344 deletion 972 h- Prototroph of ED668 cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000272,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0000245 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 cmk2 cmk2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0006237 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000207 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0006236 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000127 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0006236 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000078 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0006236 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000127 PMID:18065650 4896 2017-09-29 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001037 deletion 972 h- ura4-D18 cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:11886858 4896 2017-08-04 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001037 deletion 972 h- ura4-D18 cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:11886858 4896 2017-08-04 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001020 deletion 972 h- ura4-D18 cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 PMID:11886858 4896 2017-07-24 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001147 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 PMID:12589433 4896 2017-08-04 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.06c FYPO:0000095 deletion 972 h- cmk2 cmk2delta deletion ECO:0005638 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(Fig. 1B) PomBase SPAC1851.04c FYPO:0000470 deletion 972 h- ric1 ric1delta deletion ECO:0000059 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S3 PomBase SPAC1851.04c FYPO:0001838 deletion 972 h- ric1 ric1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24247430 4896 2015-02-16 PomBase SPAC1851.04c FYPO:0001838 deletion 972 h- ric1 ric1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:21035342 4896 2016-07-07 PomBase SPAC1851.04c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ric1 ric1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.04c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ric1 ric1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.04c FYPO:0009095 deletion 972 h- h- prototroph ric1 ric1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1851.04c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- 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SPAC3A11.08 FYPO:0008208 K680R Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-K680R amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC3A11.08) PMID:16127433 4896 2024-04-29 (Fig. 4B) PomBase SPAC3A11.08 FYPO:0004085 K680R Not assayed or wild type 972 h- cul4 cul4-K680R amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:31468675 4896 2019-09-25 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000151 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2017-12-11 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005400 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:12628934 4896 2016-05-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001931 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:1594599 4896 2013-02-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001933 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:1594599 4896 2013-02-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001933 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000260 PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001933 deletion 972 h- rad3 rad3delta 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deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19211838 4896 2017-02-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0006440 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c),assayed_substrate(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003486 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:22792081 4896 2014-07-02 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002538 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004188 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC645.07) PMID:24478458 4896 2016-08-26 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003109 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002678 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000268 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 2) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002678 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 2) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002898 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 2B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 2C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004550 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:15173168 4896 2018-04-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002471 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC9E9.08) PMID:10559981 4896 2018-10-22 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002471 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:26368543 4896 2015-10-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004262 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:21098122 4896 2015-01-07 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000705 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000170 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003814 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000211 PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000229 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000229 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:11715017 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000229 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000375 PMID:28775153 4896 2019-04-24 (Fig. 4B) DAPI staining. PomBase SPBC216.05 FYPO:0000229 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000229 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:17189249 4896 2013-05-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- cdc25-22 ura4- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170,FYECO:0000291 32 PMID:17531813 4896 2017-11-10 (Fig. 6B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 high PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 7B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000170 50 PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000170 75 PMID:9832516 4896 2019-10-30 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000260 30 PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003165 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 high PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001052 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000170 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. S12) PomBase SPBC216.05 FYPO:0006978 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 low PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003912 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000049 medium PMID:12628934 4896 2016-04-29 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004867 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 medium PMID:29851556 4896 2019-04-30 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004867 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-10-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002602 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 PMID:20661445 4896 2013-09-20 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002602 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:26368543 4896 2015-10-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002598 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 PMID:29851556 4896 2019-04-30 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004869 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002097 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:16618806 4896 2018-04-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002097 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:17189249 4896 2013-05-09 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004242 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19037101 4896 2015-01-08 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004244 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000211 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:19037101 4896 2015-01-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000835 deletion 972 h- cdc25-22 ura4- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170,FYECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPBC14C8.07c) PMID:17531813 4896 2017-11-10 (Fig. 6B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0004194 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003143 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 high assayed_using(PomBase:SPCC553.07c) PMID:12514100 4896 2014-03-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004193 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001324 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPBC660.13c) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002535 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005617 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002897 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001807 FYECO:0000211 high assayed_protein(PomBase:SPCC1259.13) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c),residue(S604) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPAC664.07c),residue(T412) PMID:21561865 4896 2018-05-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 high assayed_protein(PomBase:SPAC694.06c),residue(T645) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 high assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 1) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3A) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:26746798 4896 2017-10-20 (Fig. 3B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 low assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002098 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:17189249 4896 2013-05-09 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002470 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC342.05) PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002470 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC1259.13) PMID:15226425 4896 2015-09-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005577 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.03) PMID:21084840 4896 2016-07-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005034 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000458 assayed_protein(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 3B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0001838 deletion 972 h- cdc25-22 ura4- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170,FYECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:17531813 4896 2017-11-10 (Fig. 6B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0001838 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:10648611 4896 2016-02-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001645 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC660.13c),assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:22354040 4896 2016-09-03 (Fig. 7c) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003483 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-26 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001982 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000170 PMID:18093330 4896 2019-08-15 (Fig. 1) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002975 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC17H9.19c) PMID:16252005 4896 2014-12-12 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002975 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003142 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19750219 4896 2018-05-14 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003142 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003142 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPCC553.07c) PMID:12514100 4896 2014-03-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003034 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC644.14c) PMID:11073995 4896 2014-12-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0009109 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000434 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 2) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002536 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC1782.09c) PMID:22918952 4896 2013-09-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0006372 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2018-02-09 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003004 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 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deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000170 high PMID:18180284 4896 2015-11-27 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000972 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 medium PMID:12930957 4896 2016-02-29 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003580 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:24943839 4896 2014-08-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0007068 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000059 PMID:18093330 4896 2019-08-16 (Fig. 8) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002977 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002978 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC336.12c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 (Fig. 4) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002978 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC21B10.13c) PMID:24006488 4896 2013-12-05 (Fig. 4) PomBase SPBC216.05 FYPO:0004656 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC23B6.03c) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004672 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000305 PMID:1594599 4896 2016-02-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000245 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000090 low PMID:19197239 4896 2015-07-13 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000378 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000674 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:22292001 4896 2019-10-11 (Figure 5) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000674 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000674 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. S1C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003118 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003555 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000049 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004286 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000049 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPBC216.05 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001690 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:21098122 4896 2017-03-22 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001164 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:22292001 4896 2019-10-11 PomBase SPBC216.05 FYPO:0007074 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0010017 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0010017 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000170 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000478 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002043 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005181 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:17039252 4896 2016-01-18 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003075 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPAC694.06c) PMID:21099360 4896 2015-12-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001509 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.13) PMID:10683155 4896 2015-04-30 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002554 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC664.07c) PMID:12930957 4896 2016-02-29 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002966 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPACUNK4.14) PMID:24806815 4896 2014-06-27 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000838 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:10648611 4896 2016-02-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003576 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC126.02c) PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002887 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:18160711 4896 2016-06-29 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002887 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC6B1.09c) PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005614 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002099 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002099 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_using(PomBase:SPAC694.06c) PMID:14585996 4896 2018-03-21 PomBase SPBC216.05 FYPO:0005395 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12196391 4896 2016-05-04 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000776 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:9826747 4896 2016-04-13 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000703 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1952.07),assayed_using(PomBase:SPAC20G4.04c) PMID:9524127 4896 2019-04-28 (Fig. 3a) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003035 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC649.04) PMID:10954610 4896 2014-01-20 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000943 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:10888871 4896 2014-09-03 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002052 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000059 PMID:26201080 4896 2018-06-27 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002687 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPBC216.05 FYPO:0001357 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:39387272 4896 2024-12-17 (Fig. S1C) PomBase SPBC216.05 FYPO:0003538 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 PMID:29123917 4896 2017-12-11 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000398 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005580 PMID:29720710 4896 2018-08-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0003107 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 medium PMID:30796050 4896 2019-04-30 (Fig. S2) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0004434 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:18204818 4896 2015-02-24 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000277 high PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- h- prototroph rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000095 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000095 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PMID:37200372 4896 2023-07-06 (Fig. 7) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 PMID:11707530 4896 2014-10-16 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:24074952 4896 2014-02-18 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22095079 4896 2018-06-25 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:24192486 4896 2018-01-31 PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPBC216.05 FYPO:0000268 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 high PMID:19723888 4896 2019-07-26 (Fig. 1A) PomBase SPBC216.05 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FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15550243 4896 2024-03-18 (Fig. 4D) PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 PMID:12944481 4896 2014-10-13 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 PMID:10373582 4896 2014-08-07 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 high PMID:12196391 4896 2016-04-28 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 PMID:19546237 4896 2016-01-11 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:12944482 4896 2016-05-11 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 medium PMID:20140190 4896 2017-03-23 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002239 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0000337 PMID:11226171 4896 2016-04-18 PomBase SPBC216.05 FYPO:0001491 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002060 deletion 972 h- rad3 rad3delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPBC216.05 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad3 rad3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP8B7.14c FYPO:0001430 413-417 Not assayed or wild type 972 h- dpb2 dpb2-d1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:12925774 4896 2014-11-06 PomBase SPBP8B7.14c FYPO:0002061 413-417 Not assayed or wild type 972 h- dpb2 dpb2-d1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12925774 4896 2014-11-06 PomBase SPBP8B7.14c FYPO:0002060 413-417 Not assayed or wild type 972 h- dpb2 dpb2-d1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12925774 4896 2014-11-06 PomBase SPCC737.09c FYPO:0000096 K623M Not assayed or wild type 972 h- hmt1 hmt1-K623M amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:19054771 4896 2014-10-28 PomBase SPBC11B10.09 FYPO:0002085 S53T Not assayed or wild type 972 h- cdc2+ cdc2 cdc2-S53T amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:8437586 4896 2018-03-22 Table 1 PomBase SPBC685.09 FYPO:0000611 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:10655214 4896 2013-02-01 PomBase SPBC685.09 FYPO:0003004 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC685.09 FYPO:0000377 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 low PMID:16371652 4896 2015-12-15 PomBase SPBC685.09 FYPO:0001840 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10655214 4896 2013-02-01 PomBase SPBC685.09 FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:10655214 4896 2013-02-01 PomBase SPBC685.09 FYPO:0000963 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPBC685.09 FYPO:0001357 unknown Not assayed or wild type 972 h- orc2 orp2-2 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:18667534 4896 2018-04-20 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0005234 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:12604790 4896 2016-02-03 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0004918 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0000705 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC1347.10),assayed_using(PomBase:SPBC776.12c) PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0004387 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 high PMID:14766746 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0001645 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c),assayed_using(PomBase:SPBC1347.10) PMID:14766746 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0004385 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0000059 medium PMID:14766746 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0002061 1-294 Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-ND3 mcm10-295-593 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12604790 4896 2016-01-29 PomBase SPCC1672.06c FYPO:0001311 365-920 Overexpression 972 h- asp1 asp1(1-364) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 high PMID:27697865 4896 2018-04-03 PomBase SPCC297.04c FYPO:0006858 W88A Not assayed or wild type 972 h- set7 set7-W88A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30773398 4896 2019-04-13 (Figure S2) PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0008345 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 medium assayed_transcript(SO:0000269) PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Figure 4 C) As anticipated based on the conservation of Tan1 sequence and the Tan1 requirement for ac4C12 modification of tRNALeu and tRNASer within a CCG motif [35-38], purified tRNALeu(CAA) from S. pombe tan1Δ mutants lacks any detectable ac4C, compared to that in WT cells, but has similar levels of four control modifications (Fig 4A). PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:38295128 4896 2024-02-23 (Figure 4 B) S. pombe tan1Δ mutants are temperature sensitive due to decay of two tRNA species by the RTD pathway. PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000455 high PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Figure 4 B) S. pombe tan1Δ mutants are temperature sensitive due to decay of two tRNA species by the RTD pathway. PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000082 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 high PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Figure 4 B) S. pombe tan1Δ mutants are temperature sensitive due to decay of two tRNA species by the RTD pathway. PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0008342 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 medium assayed_transcript(SO:0000269) PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Figure 4 C) Consistent with the biology of Tan1 in S. cerevisiae, we find that S. pombe tan1Δ mutants are temperature sensitive due to decay of two tRNA species by the RTD pathway. PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0008342 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 medium assayed_transcript(PomBase:SPATRNALEU.03) PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Figure 4 C) Consistent with the biology of Tan1 in S. cerevisiae, we find that S. pombe tan1Δ mutants are temperature sensitive due to decay of two tRNA species by the RTD pathway. PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0008342 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 medium assayed_transcript(PomBase:SPATRNALEU.03) PMID:38295128 4896 2024-12-28 (Fig 6A and 6B) Relative tRNALeu(AAG) levels are reduced substantially in tan1Δ strains after growth at 39 ̊C (to 24% of WT) PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0008343 deletion 972 h- tan1 tan1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000126,FYECO:0000418 low assayed_using(PomBase:SPBC1105.02c) PMID:38295128 4896 2024-12-28 However, we find that although an S. pombe tan1Δ mutant activates the GAAC pathway, based on analysis of relative lys4+ mRNA levels, the activation is weak, and is only modestly reduced in a tan1Δ rpl502Δ strain (Fig 6C). PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25H2.10c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph tan1 tan1delta deletion ECO:0005638 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972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rik1 rik1::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000366,FYECO:0000370 high PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001931 C144A,K145A,G147A,V148A,K150A,T151A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S4 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001933 C144A,K145A,G147A,V148A,K150A,T151A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S4 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004254 C144A,K145A,G147A,V148A,K150A,T151A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S4 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000229 C144A,K145A,G147A,V148A,K150A,T151A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S4 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 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S405A,T419A,S490A,T492A,S511A,S527A,S605A,T635A,S636A,S666A,S668A,S693A,S702A,S710A,S719A,S721A,S724A,S732A,S743A,S752A,S763A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A,S848A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-31A amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36749320 4896 2023-02-24 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0009061 S405A,T419A,S490A,T492A,S511A,S527A,S605A,T635A,S636A,S666A,S668A,S693A,S702A,S710A,S719A,S721A,S724A,S732A,S743A,S752A,S763A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A,S848A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-31A amino_acid_mutation ECO:0000334 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36749320 4896 2023-03-15 (Figure 10) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0009059 S405A,T419A,S490A,T492A,S511A,S527A,S605A,T635A,S636A,S666A,S668A,S693A,S702A,S710A,S719A,S721A,S724A,S732A,S743A,S752A,S763A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A,S848A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-31A amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPBC83.18c) PMID:36749320 4896 2023-03-03 (Figure 10) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0009059 S405A,T419A,S490A,T492A,S511A,S527A,S605A,T635A,S636A,S666A,S668A,S693A,S702A,S710A,S719A,S721A,S724A,S732A,S743A,S752A,S763A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A,S848A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-31A amino_acid_mutation ECO:0001232 high assayed_protein(PomBase:SPAC926.03) PMID:36749320 4896 2023-03-03 (Figure 10) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0008075 S405A,T419A,S490A,T492A,S511A,S527A,S605A,T635A,S636A,S666A,S668A,S693A,S702A,S710A,S719A,S721A,S724A,S732A,S743A,S752A,S763A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A,S848A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-31A amino_acid_mutation ECO:0000334 high assayed_protein(PomBase:SPAC20G8.05c) PMID:36749320 4896 2023-03-24 (Figure 10) PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0006186 S405A,T419A,S490A,T492A,S511A,S527A,S605A,T635A,S636A,S666A,S668A,S693A,S702A,S710A,S719A,S721A,S724A,S732A,S743A,S752A,S763A,S774A,S785A,S786A,S813A,S821A,S831A,S836A,S840A,S848A Not assayed or wild type 972 h- cdc15 cdc15-31A amino_acid_mutation ECO:0001232 medium PMID:36749320 4896 2023-03-10 (Figure 4) PomBase SPAC3H5.06c FYPO:0002779 1-139 Overexpression 972 h- pol1 pol1-delta-BlockI-II partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8590799 4896 2016-07-22 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0003919 421-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-420) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001424 421-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-420) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:22427686 4896 2024-08-05 Table 1 PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0000339 421-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-420) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 64 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC4B3.15 FYPO:0001390 421-920 Overexpression 972 h- mid1 mid1-(1-420) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 57 PMID:22427686 4896 2024-08-05 (Fig. 1B, Table 1) PomBase SPCC1020.10 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0006549 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000242,FYECO:0000254 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 Adding rapamycin to oca2 or cha4 cells that were grown with ammonia led to a reduction of transcripts B and C and to an increase of transcript A, a profile closer to the one displayed by wt cells grown with this nitrogen source (see Fig. S2B in the supplemental material). This observation could thus explain the improved growth phenotype of oca2 and cha4 in the presence of the drug PomBase SPCC1020.10 FYPO:0005014 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000254 high assayed_region(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 In contrast, H4K12 acetylation was low in the oca2 strain for both nitro- gen sources (Fig. 4B, middle). PomBase SPCC1020.10 FYPO:0005014 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000254 assayed_region(PomBase:SPAC869.10c) PMID:20404084 4896 2025-09-23 Again, oca2 cells gave similar lower levels of H4K12 acetylation at this locus in both nitrogen sources (Fig. 4C, right). PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0006548 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 assayed_using(PomBase:SPAC869.10c) PMID:20404084 4896 2025-09-23 The expression of six genes was increased 1.5-fold (Fig. 2A), among them per1. AND We found that in an oca2 strain grown in EMM with ammonia, the levels of per1 and put4 transcripts were upregulated between 2- and 3-fold compared to a wt strain, confirming the expression- profiling analysis (Fig. 2B). PomBase SPCC1020.10 FYPO:0006548 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 assayed_using(PomBase:SPAP7G5.06) PMID:20404084 4896 2025-09-23 The expression of six genes was increased 1.5-fold (Fig. 2A), among them per1. AND We found that in an oca2 strain grown in EMM with ammonia, the levels of per1 and put4 transcripts were upregulated between 2- and 3-fold compared to a wt strain, confirming the expression- profiling analysis (Fig. 2B). PomBase SPCC1020.10 FYPO:0007506 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000254 assayed_region(PomBase:SPAP7G5.06),assayed_using(GO:0005665) PMID:20404084 4896 2025-09-23 The Pol II profile for chromatin from oca2 cells grown in ammonia was similar to that of wt cells grown in proline, with high levels of binding over the per1 coding and upstream re- gions (Fig. 4A, middle). oca2 cells grown in proline showed similar high levels of Pol II binding, particularly in the region 2 kb upstream of the AUG (probe 1). These results are con- sistent with the Northern blot data (Fig. 3A). PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000243 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000246 PMID:20404084 4896 2025-09-23 Interestingly, we found that the loss of oca2 leads to a slow-growth phenotype when cells are grown in minimal medium (EMM) with ammo- nia as the nitrogen source, but cells grow normally in proline or glutamate (Fig. 1B), suggesting that Oca2 has a role in the response to nitrogen availability similar to that of Npr1. PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000243 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000263 PMID:20404084 4896 2025-09-23 Interestingly, we found that the loss of oca2 leads to a slow-growth phenotype when cells are grown in minimal medium (EMM) with ammo- nia as the nitrogen source, but cells grow normally in proline or glutamate (Fig. 1B), suggesting that Oca2 has a role in the response to nitrogen availability similar to that of Npr1. PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000077 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000242,FYECO:0000254 PMID:20404084 4896 2025-09-23 In addition, oca2 cells are resistant to rapamycin in minimal medium with ammonia (even though growth is already slow), another similarity to S. cerevisiae Npr1 (40) (see Fig. S2A in the supplemental material). PomBase SPCC1020.10 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0001098 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000326 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000211 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0001234 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 high PMID:20404084 4896 2025-09-23 Interestingly, we found that the loss of oca2 leads to a slow-growth phenotype when cells are grown in minimal medium (EMM) with ammo- nia as the nitrogen source, but cells grow normally in proline or glutamate (Fig. 1B), suggesting that Oca2 has a role in the response to nitrogen availability similar to that of Npr1. PomBase SPCC1020.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- oca2 oca2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca2 oca2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1020.10 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 oca2 oca2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC890.02c FYPO:0001645 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPAC890.02c),assayed_using(PomBase:SPBC2F12.13) PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 4E) reduced by >70% PomBase SPAC890.02c FYPO:0000274 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:25472718 4896 2014-12-27 PomBase SPAC890.02c FYPO:0004307 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:25472718 4896 2017-10-28 (Fig. 5D) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000324 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 25 PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 3d) PomBase SPAC890.02c FYPO:0001905 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 4C,D) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002901 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC890.02c) PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 4A,B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0002901 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC895.07) PMID:25472718 4896 2014-12-27 (Fig. 4A,B) PomBase SPAC890.02c FYPO:0000069 L380A,L387A,L391A,L405A,L418A,L419A Not assayed or wild type 972 h- alp7 alp7-LA6 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 low PMID:25472718 4896 2017-10-28 (Fig. 3C) PomBase SPAC1782.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- nhp2 nhp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1782.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nhp2 nhp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1782.10c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nhp2 nhp2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002061 T316S Overexpression 972 h- dis2 dis2-T316S dis2-SPPR amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:7957097 4896 2015-12-04 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002700 T415E Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-T415E amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_enzyme(PomBase:SPCC4G3.08) PMID:22976295 4896 2015-10-27 data not shown PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002681 T415E Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-T415E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC13G6.07c),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPCC4G3.08 FYPO:0002681 T415E Not assayed or wild type 972 h- psk1 psk1-T415E amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.12),residue(S235),residue(S236) PMID:22976295 4896 2015-10-27 PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0000659 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A+CSD2A chp2-mut3 amino_acid_mutation ECO:0001807 assayed_protein(PomBase:SPBC16C6.10) PMID:37400983 4896 2023-09-08 Interestingly, when amino acid substitutions in the hinge and CSD were combined, the resulting Chp2 mutants (Chp2-mut3 and Chp3-mut5) no longer bound DNA (Fig. 3K and M, and Supplementary Fig. S2F) PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0004984 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A+CSD2A chp2-mut3 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:37400983 4896 2023-09-04 Chp2 mutants lacking DNA-binding activities associated with both the hinge and the N-terminus of CSD (mut 3 and mut 5) exhibited reduced heterochromatin association compared to wild-type Chp2 at representative heterochromatic regions (centromeric dg, the mating-type cenH, telomere and mat3M::ura4+), and the reduction was more severe for Chp2-mut3 compared to Chp2-mut5 (Fig. 6A). PomBase SPBC16C6.10 FYPO:0002827 K271A,R272A,R273A,R274A,R276A,K321A,K322A Not assayed or wild type 972 h- chp2 chp2-H5A+CSD2A chp2-mut3 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:37400983 4896 2023-09-04 |combined mutations of the hinge and one of the mutations in the N-terminus of CSD (mut3 and mut5) showed a silencing defect (Fig. 4C) PomBase SPBC428.16c FYPO:0001164 F43A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-F43A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001525 F43A Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-F43A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0002619 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0002620 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1739.01 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPCC1739.01 SPCC1739.01delta deletion ECO:0005638 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The 10 mutants with the lowest CoQ10 levels are listed in Table 1 PomBase SPAC9.12c FYPO:0000035 deletion 972 h- atp12 atp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000126 medium PMID:32896087 4896 2020-09-29 PomBase SPAC9.12c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph atp12 atp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.12c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph atp12 atp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.12c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph atp12 atp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.12c FYPO:0009036 deletion 972 h- h- prototroph atp12 atp12delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC9.12c FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph atp12 atp12delta deletion ECO:0005638 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2018-11-30 PomBase SPBC25H2.13c FYPO:0000703 cdc20-AID Knockdown 972 h- cdc25-22 cdc20 cdc20-AID fusion_or_chimera ECO:0000112 FYECO:0000291,FYECO:0000339 assayed_using(PomBase:SPAC227.16c),assayed_using(PomBase:SPBC725.13c) PMID:22718908 4896 2018-11-30 PomBase SPCC663.05c FYPO:0006993 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 high PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S7A) PomBase SPCC663.05c FYPO:0003412 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:21211723 4896 2024-01-16 asf1-1 alleviated silencing of the ura4+ inserted at the outer centromeric repeat region (otr1R::ura4+) and within a centromere-homologous (cenH) element at the silent mat locus (Kint2::ura4+), in a manner similar to HIRA null mutants (Figure 1C). PomBase SPCC663.05c FYPO:0002827 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 medium PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. S7B) PomBase SPCC663.05c FYPO:0003096 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Whereas asf1-1 cells showed slight reduction in levels of H3K9me, Swi6 and Chp2, the levels of these factors in hip1Δ appeared comparable to wild type (Figure 2A and 2B). PomBase SPCC663.05c FYPO:0000470 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21211723 4896 2024-01-16 asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F) PomBase SPCC663.05c FYPO:0000470 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 high PMID:21211723 4896 2024-01-17 Defective mating-type switching in heterochromatin mutants results in poor iodine staining of colonies, in contrast to the dark staining of wild-type colonies (Jia et al., 2004). asf1-1 and HIRA mutants were defective in mating-type switching, as indicated by the light iodine staining of the colonies (Figure 1F). PomBase SPCC663.05c FYPO:0008151 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 We observed nucleosome free regions at 5′ ends of genes followed by positioned nucleosomes in open reading frames (Figure S7A). Comparison of nucleosome occupancy across heterochromatin domains in asf1, clr3 or asf1clr3 mutant cells to wild-type cells identified several sites showing depletion of nucleosomes in mutant cells. PomBase SPCC663.05c FYPO:0005516 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 We observed nucleosome free regions at 5′ ends of genes followed by positioned nucleosomes in open reading frames (Figure S7A). Comparison of nucleosome occupancy across heterochromatin domains in asf1, clr3 or asf1clr3 mutant cells to wild-type cells identified several sites showing depletion of nucleosomes in mutant cells. PomBase SPCC663.05c FYPO:0003557 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Notably, asf1-1 produced a disproportionate increase in antisense transcripts - constituting a large proportion of probes upregulated. Detailed expression profiling of individual loci showed that the antisense transcripts upregulated in asf1-1 mutants were also upregulated in hip1Δ and alp13Δ cells (Figure 4A and 4B). PomBase SPCC663.05c FYPO:0007339 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000231 low PMID:21211723 4896 2024-01-17 Consistent with both TGS and cis-PTGS contributing to heterochromatin silencing, combining asf1-1 or hip1Δ with tas3Δ resulted in synergistic defects in heterochromatic silencing (Figure 3A). PomBase SPCC663.05c FYPO:0004347 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Based on the genetic analyses, it was possible that Asf1/HIRA facilitate histone deacetylation by Clr6. Asf1 co-immunoprecipitated with Clr6 complex subunits Alp13 and Clr6 (Figure 3B). Moreover, asf1-1 and hip1Δ exhibited a substantial increase in bulk H3K9ac levels, in a manner similar to alp13Δ (Figure 3C).). To confirm this further, we performed ChIP-chip analyses of H3K9ac. Both alp13Δ and asf1-1 mutants showed widespread increase in H3K9ac, as compared to the wild-type cells. Notably, although 30% of the probes in our microarray correspond to intergenic regions, nearly all probes affected by asf1-1 and alp13Δ reside in coding regions (Figure 3D and 3E). PomBase SPCC663.05c FYPO:0008150 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000291 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Interestingly, asf1-1, but not hip1Δ, also showed substantial increase in the levels of transcripts derived from intergenic portions of rDNA repeat loci (Figure S5B). PomBase SPCC663.05c FYPO:0005917 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 PMID:21211723 4896 2024-01-17 Moreover, asf1-1 and hip1Δ showed upregulation of sense and antisense transcripts corresponding to subtelomeric genes located within heterochromatic domains (Figure S5A). PomBase SPCC663.05c FYPO:0000963 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:21211723 4896 2024-01-17 However, both Asf1 and Clr6 complex-II mutants were not sensitive to hydoxyurea (Figure S6) PomBase SPCC663.05c FYPO:0000095 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21211723 4896 2024-01-17 more sensitive to bleomycin-induced damage, as indicated by the disappearance of full- length chromosome bands and the appearance of a smear of broken DNA fragments (Figure 4E). PomBase SPCC663.05c FYPO:0000085 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21211723 4896 2024-01-17 We also found that asf1-1 cells were hypersensitive to genotoxic agents such as bleomycin, camptothecin and methylmethane sulfonate (Figure S6) PomBase SPCC663.05c FYPO:0000089 C30F,D54N Not assayed or wild type 972 h- asf1 asf1-1 amino_acid_mutation ECO:0000059 PMID:21211723 4896 2024-01-17 We also found that asf1-1 cells were hypersensitive to genotoxic agents such as bleomycin, camptothecin and methylmethane sulfonate (Figure S6) PomBase SPBC428.16c FYPO:0001029 R8G,V17A,T109S,G177S Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-ROAD37-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-06 PomBase SPCC330.10 FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcm1 pcm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.10 FYPO:0000705 deletion 972 h- pcm1 pcm1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.10),assayed_using(PomBase:SPCC330.10) PMID:22508988 4896 2019-09-28 (Fig. 1a) PomBase SPCC330.10 FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ pcm1 pcm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. PomBase SPCC330.10 FYPO:0003529 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcm1 pcm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- pcm1 pcm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC330.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pcm1 pcm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC330.10 FYPO:0002061 deletion 972 h- pcm1 pcm1delta deletion ECO:0005638 PMID:17284461 4896 2012-06-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004500 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 medium PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004387 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 medium PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001355 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001355 L2V Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001355 L2V Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001355 L2V Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000969 L2V Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000963 L2V Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0004502 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005 PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000703 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0000279 FYECO:0000005 medium PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0000089 L2V Not assayed or wild type 972 h- pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:9563836 4896 2016-01-18 PomBase SPBC16D10.09 FYPO:0001492 L2V Not assayed or wild type 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 his3-D1 pcn1 pcn1-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 medium PMID:8663159 4896 2015-03-26 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000117 cdc8::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:1436080 4896 2012-04-26 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0000133 cdc8::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8::ura4+ disruption ECO:0001232 PMID:1436080 4896 2012-04-26 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001133 cdc8::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:1436080 4896 2012-07-10 PomBase SPAC27F1.02c FYPO:0001007 cdc8::ura4 Not assayed or wild type 972 h- cdc8 cdc8::ura4+ disruption ECO:0005638 PMID:1436080 4896 2012-07-10 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001931 E253A,F254A,R255A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S5 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0001933 E253A,F254A,R255A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S5 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0004254 E253A,F254A,R255A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S5 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000088 E253A,F254A,R255A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000267 E253A,F254A,R255A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC664.07c FYPO:0000268 E253A,F254A,R255A Not assayed or wild type 972 h- rad9 rad9-S5 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11058134 4896 2015-01-06 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ssa1 ssa1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0004180 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 PMID:24936793 4896 2014-12-18 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0004742 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 PMID:29866182 4896 2018-06-18 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0000962 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 PMID:33225241 4896 2020-12-17 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0007301 deletion 972 h- Rho1.C17R-GFP ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:32075773 4896 2020-03-27 (Fig. S2) PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0003153 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC926.04c) PMID:24146635 4896 2014-03-03 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0003153 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC830.07c) PMID:24146635 4896 2014-03-03 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0002013 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000170 PMID:33225241 4896 2021-01-28 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0001317 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.08c) PMID:33225241 4896 2020-12-17 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssa1 ssa1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC13G7.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ssa1 ssa1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.98 FYPO:0000825 G160T Not assayed or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G160T srp7-T-160 nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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SPCC1223.10c FYPO:0000705 1-157 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(158-251) EAF(158-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 assayed_using(PomBase:SPBP23A10.14c),assayed_using(PomBase:SPCC1223.10c) PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Table 3) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0002876 1-157 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(158-251) EAF(158-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 low PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 4) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000969 1-157 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(158-251) EAF(158-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 3e) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001689 1-157 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(158-251) EAF(158-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 3e) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0000957 1-157 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(158-251) EAF(158-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 3e) PomBase SPCC1223.10c FYPO:0001357 1-157 Not assayed or wild type 972 h- eaf1 eaf1(158-251) EAF(158-251aa) partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:29032152 4896 2018-11-02 (Fig. 3b) PomBase SPAC1F7.07c FYPO:0003335 wild type Overexpression 972 h- fip1 fip1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0001501 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23A1.20 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph new11 new11delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC821.08c FYPO:0004318 A131P,F132T Not assayed or wild type 972 h- slp1 slp1-mr63 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:28366743 4896 2020-06-04 (Fig. S1h) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000963 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000957 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 R125H,A170V Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E1 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000703 Y111N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-Y111N amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 Y111N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-Y111N amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 Y111N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-Y111N amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 Y111N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-Y111N amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 Y111N Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-Y111N amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1B) PomBase SPCC1620.02 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph wtf23 wtf23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph wtf23 wtf23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph wtf23 wtf23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph wtf23 wtf23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph wtf23 wtf23delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- wtf23 wtf23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wtf23 wtf23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1620.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 wtf23 wtf23delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.15c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.15c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.15c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.15c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.15c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.15c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC776.15c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph kgd2 kgd2delta deletion ECO:0005638 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FYPO:0005990 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:25736293 4896 2017-04-12 (Fig. 3B, Fig. S3B) abolished microtubule cortical anchoring PomBase SPBC216.02 FYPO:0007275 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 high high PMID:31582398 4896 2020-03-12 (Figure. 3C, D, E, F and Video 5) PomBase SPBC216.02 FYPO:0000928 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC458.04c) PMID:25736293 4896 2017-04-12 PomBase SPBC216.02 FYPO:0003066 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPBC216.02 FYPO:0003066 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:16303567 4896 2014-07-10 PomBase SPBC216.02 FYPO:0007168 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:16624923 4896 2019-11-19 cortical location/microtubules did not show a lateral interaction with the cell corte/Ninety-two percent of microtubules in num1D cells underwent catastrophe Figure 3.—Nuclear behavior in wild-type and num1D zygotes. Chromosomal DNA in zygotes (JY450 or JV627) was stained with Hoechst 33342 and monitored. The numbers on the left indicate time in minutes. Microtubules were visualized simultaneously by GFP-tagged a-tubulin. Stained DNA is shown in red, and GFP fluorescence in green. Bar, 5 mm. within 2 min of contacting the cell cortex (n 1⁄4 59). In contrast, 80% of microtubules that interacted with the cell cortex laterally in wild-type cells remained at the cell ends for .2 min (n 1⁄4 15). PomBase SPBC216.02 FYPO:0007164 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:16585273 4896 2019-11-19 PomBase SPBC216.02 FYPO:0007162 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:16585273 4896 2019-11-19 PomBase SPBC216.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0000760 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 PMID:16624923 4896 2019-11-19 PomBase SPBC216.02 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph num1 num1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC216.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0005638 PMID:16615890 4896 2014-07-14 PomBase SPBC216.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- num1 num1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC216.02 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 num1 num1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC216.02 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 num1 num1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC19G7.10c FYPO:0006001 308-754 Overexpression 972 h- pdc2 pdc2-delta308-754 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.10c) PMID:28031482 4896 2017-04-13 (Fig. 4H, right panel) PomBase SPBC947.10 FYPO:0001245 G1746A Not assayed or wild type 972 h- dsc1 dsc1-G1746A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28821619 4896 2017-09-22 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0005431 D25A Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0000049 PMID:12019258 4896 2016-06-17 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0001645 D25A Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07),assayed_using(PomBase:SPAC1556.01c) PMID:12861005 4896 2016-05-04 PomBase SPAC13C5.07 FYPO:0002887 D25A Not assayed or wild type 972 h- mre11 mre11-D25A amino_acid_mutation ECO:0000226 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC13C5.07) PMID:12861005 4896 2016-05-04 PomBase SPBC119.05c FYPO:0000705 1-120 Not assayed or wild type 972 h- lsb1 csh3deltaN partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.05c),assayed_using(PomBase:SPBC119.05c) PMID:26542710 4896 2016-01-06 PomBase SPAC1D4.10 FYPO:0000783 K208A,K209A,R210A,K211A Not assayed or wild type 972 h- trz1 trz1-208AAAA211 SpTrz1p208AAAA211 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC1D4.10) PMID:21208191 4896 2014-06-02 PomBase SPBC342.05 FYPO:0000268 1-534,Y651F Overexpression 972 h- crb2 crb2(BRCT,Y651F) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005638 PMID:14739927 4896 2016-01-15 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0000705 G344A Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A7 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0001645 G344A Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A7 amino_acid_mutation ECO:0000049 high assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC336.04) PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPAC27E2.05 FYPO:0002060 G344A Not assayed or wild type 972 h- cdc1 cdc1-A7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19686603 4896 2015-06-04 PomBase SPCC736.14 FYPO:0002956 520-882 Not assayed or wild type 972 h- dis1 dis1-Bam partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC736.14) PMID:9078390 4896 2018-10-14 (Fig. 2C) PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0003124 deletion 972 h- qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000301 low PMID:30715423 4896 2022-08-17 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0000080 deletion 972 h- qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006 high PMID:27168121 4896 2016-08-18 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0000565 deletion 972 h- qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000301 low PMID:30715423 4896 2022-08-17 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0001491 deletion 972 h- qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC2F3.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 qtr2 qtr2delta qtrtd1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC29A4.08c FYPO:0000705 1-164 Not assayed or wild type 972 h- prp19 prp19(165-488) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC29A4.08c),assayed_protein(PomBase:SPAC29A4.08c) PMID:15601865 4896 2023-07-03 As expected from the two-hybrid results, neither the U-box (His6-Prp19p 1-58) nor the C terminus containing the WD40 repeats (His6-Prp19p 165-503) was able to tetramerize (data not shown). PomBase SPAC977.10 FYPO:0001825 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0000335 PMID:1314171 4896 2012-11-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000207 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000206 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001164 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000208 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001583 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000166 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000126,FYECO:0000205 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC977.10 FYPO:0000852 unknown Not assayed or wild type 972 h- nhe1 sod2-1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000166 PMID:1314171 4896 2012-11-26 PomBase SPAC23E2.01 FYPO:0005487 239-254,C70S,C76S,C85S,C88S Not assayed or wild type 972 h- fep1 fep1-N238,4CS amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000335 PMID:27444384 4896 2016-08-08 PomBase SPCC622.09 FYPO:0001903 K34A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000260 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 5A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000085 K34A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 3A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000088 K34A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 3A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000089 K34A Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-K33A amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:31262821 4896 2025-10-27 (Fig. 3A) PomBase SPBC354.05c FYPO:0001668 523-793 Overexpression 972 h- sre2 sre2(1-522) sre2truncation_523-793 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:23729666 4896 2013-07-26 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002955 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0005638 high PMID:29167439 4896 2018-04-23 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002955 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0005638 PMID:31980821 4896 2020-06-22 As previously shown, we observed that telomere erosion and STEEx formation in ter1Δ cells correlates with defects to exit properly from G0 (22) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002955 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0005638 high PMID:31980821 4896 2020-06-22 Indeed, in bqt4Δ ter1Δ cells the percentage of cells that are unable to form a colony increased in correlation with the massive accumulation of STEEx at D1 and D3 of senescence PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0000705 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_protein(PomBase:SPBC2A9.10) PMID:35277511 4896 2022-05-24 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002702 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c) PMID:29422503 4896 2018-02-20 (Fig. 1C,D) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:29422503 4896 2018-02-20 (Fig. 1C,D) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000226 high assayed_using(PomBase:SPAC17G6.17) PMID:29422503 4896 2018-02-20 (Fig. 1C,D) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0001645 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC29A3.14c),assayed_using(PomBase:SPBC2D10.13) PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0007419 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:31980821 4896 2020-06-22 (Fig. 2D) althouh also the percentage of cells that contain a unique telomeric cluster in G0 after streaks 3 and 4 (Figure 2D). We found that telomere attrition observed in the absence of telomerase did not significantly impair telomere hyperclusterization in quiescence. However, telomere clusterization did not reach WT level in ter1Δ cells after 3 days in G0. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0002945 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 high assayed_using(SO:0001923) PMID:29167439 4896 2018-04-23 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0006507 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:29167439 4896 2018-04-23 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0007269 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:31980821 4896 2020-06-22 (Figure 2D) We found that telomere attrition observed in the absence of telomerase did not significantly impair telomere hyperclusterization in quiescence. However, telomere clusterization did not reach WT level in ter1Δ cells after 3 days in G0. PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0000703 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC17G6.17),assayed_protein(PomBase:SPBC2A9.10) PMID:35277511 4896 2022-05-24 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003107 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:18157152 4896 2015-10-06 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0007414 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:31980821 4896 2020-06-22 (Fig. 2B) PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0005404 deletion 972 h- ter1 ter1delta deletion ECO:0000337 PMID:26305931 4896 2016-07-15 PomBase SPBC119.02 FYPO:0002635 R90A Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-R90A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC1718.07c FYPO:0006809 1-33 Not assayed or wild type 972 h- zfs1 zfs1-delta34 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:30601114 4896 2019-01-11 (Figure 2B) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85D Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGDGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, protein unstable, complements partially sde2Δ PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ckb2 ckb2delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009094 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009093 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0001309 deletion 972 h- ckb2 ckb2delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC2G5.02c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph ckb2 ckb2delta 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assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaC60 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.01c),assayed_using(PomBase:SPBC409.23) PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 6B) PomBase SPAC14C4.01c FYPO:0001355 1-184 Not assayed or wild type 972 h- atg43 atg43-deltaC60 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 high PMID:33138913 4896 2021-01-11 (Figure 4C) PomBase SPAC343.14c FYPO:0002151 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif222 tif222delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- tif222 tif222delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC343.14c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 tif222 tif222delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC343.14c FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 tif222 tif222delta deletion 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FYECO:0000005,FYECO:0000126 low PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0003208 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC146.13c) PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0004967 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000112,FYECO:0000137 PMID:26345368 4896 2015-10-16 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002061 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:11260263 4896 2016-09-09 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002487 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001294 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002022 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0002442 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC146.13c) PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001357 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:11260263 4896 2016-09-09 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001357 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19808887 4896 2017-07-26 PomBase SPBC146.13c FYPO:0001214 S361A Not assayed or wild type 972 h- myo1 myo1-S361A myo1-S61A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 medium PMID:11260263 4896 2016-09-09 PomBase SPBC146.13c 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PomBase SPCC1235.12c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph mug146 mug146delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1235.12c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 mug146 mug146delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPCC1235.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- mug146 mug146delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1235.12c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug146 mug146delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1235.12c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mug146 mug146delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC188.06c FYPO:0001357 E277Q Not assayed or wild type 972 h- srp54 srp54-E277Q amino_acid_mutation ECO:0005638 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SPAC1006.06 FYPO:0001883 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 2D) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0006008 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PR:000050473) PMID:37039135 4896 2024-07-29 (Fig. 6D,S7F) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0008003 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC30B4.01c) PMID:34666001 4896 2022-06-30 (Figure 5) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0004422 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000078 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0004422 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000392 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0004422 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000025 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0003214 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0004154 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 7C) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001357 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 PMID:19189958 4896 2022-01-06 (Figure 1) PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001357 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 PMID:19189958 4896 2022-01-06 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001357 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 PMID:19189958 4896 2022-01-06 We also examined cell viability of stationary phase rgf2D and rgf21 cultures incubated for 4 days at 28°; both strains were found to be .90% viable during this period. PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001310 deletion 972 h- rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 PMID:19189958 4896 2022-01-06 90% viability ? We also examined cell viability of stationary phase rgf2D and rgf21 cultures incubated for 4 days at 28°; both strains were found to be .90% viable during this period. PomBase SPAC1006.06 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph rgf2 rgf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1006.06 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 rgf2 rgf2delta deletion ECO:0000336 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SPBP23A10.10 FYPO:0001407 wild type Overexpression 972 h- ppk32 ppk32+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:27191590 4896 2016-07-20 PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0001838 wild type Overexpression 972 h- ppk32 ppk32+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC31G5.12c) PMID:27191590 4896 2016-07-20 PomBase SPBP23A10.10 FYPO:0001838 wild type Overexpression 972 h- ppk32 ppk32+ wild_type ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:27191590 4896 2016-07-20 PomBase SPAC19B12.05c FYPO:0005041 L409A Not assayed or wild type 972 h- fcp1 fcp1-L409A amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:19026779 4896 2023-02-15 (Figure 4D) PomBase SPAC31G5.18c FYPO:0001355 K85N Not assayed or wild type 972 h- sde2 sde2(GGNGG) amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:28947618 4896 2017-12-25 normal processing, complements partially sde2Δ PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001045 CTD-T4A,S7A(r5-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-CTD-T4A,S7A(r5-r29) rpb1-CTD-T4A,S7A|rpb1-CTD-T4A,S7A(5-29) amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000137 PMID:29414789 4896 2018-08-16 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000029 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 30 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000029 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 25 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000427 deletion 972 h- mat1-M smt-0 yox1 yox1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 yox1 yox1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000141 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 24 PMID:30635289 4896 2019-02-07 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005314 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1834.04) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005314 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005314 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.11c) PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001122 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 low PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0003970 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 20 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009074 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005752 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000005 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0004153 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:23236291 4896 2016-07-07 (Figure 7A) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005301 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19714215 4896 2024-07-24 The cell cycle-regulated target genes bound by both Yox1p and Cdc10p tended to be more highly expressed in yox1D than in wild-type cells (Figure 3A,B). In yox1D cells, on the other hand, the Yox1p/Cdc10p targets showed little or no cell-cycle regulation, whereas the cell-cycle regulation of Ace2p targets was not affected (Figure 4A). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005506 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000291 PMID:23236291 4896 2016-07-08 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005507 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000291 PMID:23236291 4896 2016-07-08 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000972 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 22 PMID:25533348 4896 2015-11-03 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005026 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2024-07-23 Through the visual screen, we identified that three mutants, nrm1D, yox1D, and res2D, showed abnormal CENP-A distribution patterns (Figure 2A). In these mutants, Cnp1-GFP at centromeres tends to be brighter and also gives a high nucleoplasmic signal (Figure 2A), suggesting an increase in Cnp1-GFP levels. PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0006740 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC1952.05) PMID:31260531 4896 2020-01-01 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0006740 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC23G3.04) PMID:30134042 4896 2018-11-08 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000825 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000231 assayed_transcript(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2024-07-23 Deletion of nrm1 or yox1 resulted in a $5-6-fold increase in cnp1 mRNA levels, whereas res2 deletion led to a more modest twofold increase (Figure 3A). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000650 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 low PMID:19714215 4896 2024-07-24 The septation index was marginally higher in yox1D compared to wild-type cells (10.4% vs 9.4%), suggesting a slight delay in cytokinesis and/or cell separation. PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000239 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000049 PMID:26890608 4896 2016-03-03 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000239 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.05) PMID:19714215 4896 2024-07-24 The Yox1p/Cdc10p target genes showed consistently higher Pol II occupancy in yox1D than in wild-type cells (Figure 3C,D) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000228 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 3 PMID:30635289 4896 2024-07-23 Using DAPI staining, we observed that the MBF repressor mutant cells displayed lagging chromosomes, chromosome bridges, and also unequal nuclei segregation during mitosis (Figure 2C and Figure S4). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 yox1 yox1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001532 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000110 PMID:28903048 4896 2018-02-21 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001164 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:26890608 4896 2016-03-04 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0006158 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPAC7D4.07c) PMID:28640807 4896 2017-08-07 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001357 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 PMID:19714215 4896 2024-07-24 yox1D cells were viable and did not show any overall growth defect (Figure 4B). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002843 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.17) PMID:30635289 4896 2019-02-07 Through the visual screen, we identified that three mutants, nrm1D, yox1D, and res2D, showed abnormal CENP-A distribution patterns (Figure 2A). In these mutants, Cnp1-GFP at centromeres tends to be brighter and also gives a high nucleoplasmic signal (Figure 2A), suggesting an increase in Cnp1-GFP levels. PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009041 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001986 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 1) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009031 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000277 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002578 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005969 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009039 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0005266 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009040 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000415 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000069 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. S3) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0006930 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 yox1 yox1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000098 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 PMID:26891792 4896 2023-06-21 (Fig. 1) PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000102 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 PMID:26791325 4896 2016-01-21 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002640 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:22252817 4896 2013-10-07 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001245 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000311 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c 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SPBC21B10.13c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 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4896 2023-06-28 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001234 deletion 972 h- Prototroph of ED668 yox1 yox1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0001492 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0003481 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 PMID:19714215 4896 2024-07-24 The yox1D cells were about 14% longer on average than wild-type cells during septation (17.4 mm vs 15.3 mm) (Figure 4C). PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21B10.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 yox1 yox1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000082 R947H Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-B7 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0000133 R947H Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-B7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPCC1739.11c FYPO:0002967 R947H Not assayed or wild type 972 h- cdc11 cdc11-B7 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_protein(PomBase:SPCC1739.11c) PMID:40027523 4896 2025-03-24 PomBase SPBC31E1.03 FYPO:0001972 T209A Not assayed or wild type 972 h- hub1 hub1-4 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PomBase SPBC1778.02 FYPO:0000703 E490R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E490R amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC16A10.07c),assayed_using(PomBase:SPBC1778.02) PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC1778.02 FYPO:0002687 E490R Not assayed or wild type 972 h- rap1 rap1-E490R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:29149597 4896 2017-12-26 PomBase SPBC8D2.04 FYPO:0001645 K123R Not assayed or wild type 972 h- hht2 hht2-K122R amino_acid_mutation ECO:0006030 medium assayed_protein(PomBase:SPAC1071.09c),assayed_protein(PomBase:SPBC8D2.04) PMID:39878217 4896 2025-02-19 (Fig. 4C, 4D) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004248 411-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1A, 2B) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004248 411-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1A) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0000703 411-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC30D11.06c),assayed_using(PomBase:SPBP8B7.24c) PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 2) PomBase SPAC30D11.06c FYPO:0004247 411-426 Not assayed or wild type 972 h- hfl1 hfl1-1-410 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000341 PMID:30451685 4896 2018-12-10 (Figure 3—Figure supplement 1B) PomBase SPBC211.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- mtr3 mtr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC211.08c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtr3 mtr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC211.08c FYPO:0001511 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mtr3 mtr3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001001 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001283 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001283 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000998 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:22084378 4896 2015-02-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000998 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000999 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 PMID:22084378 4896 2015-02-13 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000999 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001178 Q169* Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-989 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:19366728 4896 2015-02-03 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000141 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0001232 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 Our analysis revealed that mutant strains display defects in the segregation, resolution and/or condensation of chromosomes during mitosis (Figure 6A), and mis-segregated the mini-chromosome Ch16 (a 530 kb derivative of chromosome 3; Niwa et al., 1986) at a signi®cantly higher rate than wild-type cells (Figure 6C). PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000082 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000082 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:12773392 4896 2024-02-20 and irreversible temperature-sensitive (Ts±) growth defects (Figure 5B±D). PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0005219 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC19C7.11) PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0005219 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC13F5.01c) PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0005219 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC26H5.06) PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0001355 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000337 high PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0003557 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC6B1.07) PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0003557 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPBC336.07) PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0003557 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000291 FYECO:0000005 medium assayed_using(PomBase:SPAC1783.05) PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0005310 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 The Dpst2 cells showed a signi®cant increase in acetylation of most lysine residues on H3 and H4 tails, except H4 Lys8. PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000892 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 The Dpst2 cells showed a signi®cant increase in acetylation of most lysine residues on H3 and H4 tails, except H4 Lys8. PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0007631 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 The Dpst2 cells showed a signi®cant increase in acetylation of most lysine residues on H3 and H4 tails, except H4 Lys8. PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0007632 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000112 PMID:12773392 4896 2024-02-20 The Dpst2 cells showed a signi®cant increase in acetylation of most lysine residues on H3 and H4 tails, except H4 Lys8. PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0001974 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0003010 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC1105.17) PMID:23028377 4896 2016-01-21 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:33511417 4896 2021-02-24 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0002061 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000969 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0001690 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-12 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000963 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000964 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 high PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Fig. 1) PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0001357 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0001357 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0001357 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:28218250 4896 2017-03-16 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0004325 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0006680 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000095 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000095 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0006931 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30647105 4896 2019-06-18 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000089 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:17450151 4896 2021-02-11 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000089 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000091 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0000268 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0005638 high PMID:12773392 4896 2024-02-20 sensitivity to DNA-damaging agents [such as UV, methyl methane- sulfonate (MMS) and bleomycin] (Figure 5B±D) PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23C11.15 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pst2 pst2delta pst2::ura4+ deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12C2.12c FYPO:0003407 wild type Overexpression 972 h- glo1 glo1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPBC12C2.12c FYPO:0003406 wild type Overexpression 972 h- glo1 glo1+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:24758716 4896 2014-05-29 PomBase SPCC962.02c FYPO:0004412 490-997 Not assayed or wild type 972 h- bir1 bir1-489 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC962.02c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000538 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000025 PMID:22768263 4896 2012-09-21 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0000538 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:22768263 4896 2012-09-21 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001355 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000025 PMID:22768263 4896 2012-09-21 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002148 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec3 sec3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001489 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000171 PMID:22768263 4896 2012-07-16 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001489 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000171 PMID:22768263 4896 2012-07-16 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0001489 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000025 PMID:22768263 4896 2012-07-16 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- sec3 sec3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC17G8.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sec3 sec3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.12 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gly1 gly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23H3.09c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 gly1 gly1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002029 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 medium PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 1C, Fig. 1D and Fig. 1E) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000078 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0000059 PMID:19373772 4896 2020-04-09 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0004340 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000126 PMID:37540145 4896 2023-08-14 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000906 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 medium PMID:36633091 4896 2023-02-02 (Fig. 5C) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000362 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:18088324 4896 2014-07-04 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000907 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 low PMID:36633091 4896 2023-02-07 (Fig. 5C) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0008067 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 ~15 PMID:37540145 4896 2023-08-18 (Figure 4G) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000251 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002780 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000273 PMID:31562247 4896 2021-01-19 As shown in Fig. 6, A and B, ROS production under glucose starvation was reduced, but not abolished, in the absence of Dnm1 because only 􏰆25% of dnm1􏰇 cells were DCDHF-DA- positive after glucose starvation. PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0007610 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 high PMID:35658118 4896 2023-12-28 (Figure 2c) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0006896 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:30649994 4896 2019-05-29 (Fig. 3E) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002009 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0000335 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0006895 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC216.02) PMID:30649994 4896 2019-05-29 (Fig. 3E) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003190 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 2C) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0008008 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 high PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 2D) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0009002 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:36633091 4896 2023-02-02 (Fig. 1A, 1B, S1A) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0001309 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-30 we have found that deletion of the fission genes dnm1 or fis1 caused a significant increase of longevity whereas the loss of the fusion GTPase Msp1 had no effect on lifespan (Fig. 5C). PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002071 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000103,FYECO:0000216 PMID:36633091 4896 2023-01-31 (Fig. 3B) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000056 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:36633091 4896 2023-02-02 (Fig. 1A, 1B, S1A) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000056 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:18088324 4896 2014-07-04 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000056 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000273 PMID:31562247 4896 2021-01-18 (Fig. 3a) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000056 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000057 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000058 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:19373772 4896 2020-04-09 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003807 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 ~85 PMID:37540145 4896 2023-08-17 (Figure 4F) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003807 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:15710398 4896 2023-08-17 the mitochondrial network appeared as highly interconnected tubules forming net-like structures (Fig. 5A). PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003807 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000079 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003807 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 48 PMID:35658118 4896 2023-12-15 Consistent with the finding reported previously by our group [8], mitochondria formed a highly branch network (47.8%) in dnm1Δ cells (Fig. 2A,B) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003809 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000248 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003808 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:19373772 4896 2014-09-30 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0008333 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 PMID:39379376 4896 2024-10-29 We then examined whether cytosolic ribosomes still tethered to mitochondria in Δdnm1 cells after prolonged glucose depletion. In situ cryo-ET imaging of Δdnm1 cells revealed that mitochondria remained elongated throughout glucose depletion (Fig. 4b). However, this morphological change did not prevent the tethering of cytosolic ribosomes to the OMM, with 98% of the imaged mitochondria (n = 100) being fully decorated with ribosomes at day 7 of glucose depletion (Fig. 4b, c, Supplementary Fig. 10 and Supplementary Movie 2). PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0001310 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 PMID:23521895 4896 2014-10-03 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000069 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:19373772 4896 2014-09-11 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dnm1 dnm1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0007611 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000273 PMID:31562247 4896 2021-01-19 Throughout the period of glucose starvation, mitochondria in dnm1􏰇 cells did not appear to fragment but shrunk over time (Fig. 3A). mitochondrion numbers remained largely unchanged during glucose starvation (Fig. 3B) PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12C2.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dnm1 dnm1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0005900 1-368 Not assayed or wild type 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:21642440 4896 2017-07-07 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0005980 1-368 Not assayed or wild type 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:21642440 4896 2017-07-07 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0003208 1-368 Not assayed or wild type 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC1919.10c) PMID:21642440 4896 2017-07-07 PomBase SPBC1778.06c FYPO:0000745 1-368 Not assayed or wild type 972 h- fim1 fim1-A2 fim1A2 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 high PMID:21642440 4896 2017-07-07 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PomBase SPCC4B3.20 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph cmc1 cmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC4B3.20 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph cmc1 cmc1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000078 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0008316 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000059 PMID:34119521 4896 2024-10-22 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU (Fig. 2, B-D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0001934 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 PMID:33049028 4896 2021-02-05 (Fig. 4) PomBase SPBC106.19 FYPO:0004594 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0001232 low PMID:28334955 4896 2017-03-29 Supp. Figure S3 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000046 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1A) PomBase SPBC106.19 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000251 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1A) PomBase SPBC106.19 FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 high PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000684 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1A) PomBase SPBC106.19 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.07) PMID:28334955 4896 2017-03-30 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:28334955 4896 2017-03-30 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:28334955 4896 2017-03-30 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:28334955 4896 2017-03-30 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:28334955 4896 2017-03-30 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.08) PMID:28334955 4896 2017-03-30 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003423 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Figure 2B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003423 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000291 high assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Figure 2B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003423 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPMIT.09) PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Figure 2B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003423 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPMIT.10) PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Figure 2B,8B,8C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0002056 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.07) PMID:33049028 4896 2021-02-05 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002056 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:33049028 4896 2021-02-05 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002056 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:33049028 4896 2021-02-05 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002056 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:33049028 4896 2021-02-05 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002056 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.04) PMID:33049028 4896 2021-02-05 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002056 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000059 PMID:33049028 4896 2021-02-05 PomBase SPBC106.19 FYPO:0007525 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.15c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU and reduced the association of Mti2 and Mti3 with mitoribosomes (Fig. 2, B-D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0007525 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:34119521 4896 2024-10-21 We consistently found that disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 resulted in dissociation of Mti2 and Mti3 from the mt-SSU and reduced the association of Mti2 and Mti3 with mitoribosomes (Fig. 2, B-D). PomBase SPBC106.19 FYPO:0007525 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.05) PMID:34119521 4896 2024-10-21 The association of cob1 and cox1 mRNAs with assembled mitoribosomes was reduced by ppr10 deletion, whereas their association with the mt-SSU was increased (Fig. 3). PomBase SPBC106.19 FYPO:0007525 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPMIT.01) PMID:34119521 4896 2024-10-21 The association of cob1 and cox1 mRNAs with assembled mitoribosomes was reduced by ppr10 deletion, whereas their association with the mt-SSU was increased (Fig. 3). PomBase SPBC106.19 FYPO:0003040 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:33049028 4896 2021-02-05 Further analysis revealed that the levels of intron-retaining cox1 and cob1 transcripts were increased in Δppr10 cells in the intron-containing background (Fig. 1A-C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003040 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:33049028 4896 2021-02-05 Further analysis revealed that the levels of intron-retaining cox1 and cob1 transcripts were increased in Δppr10 cells in the intron-containing background (Fig. 1A-C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003335 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000034,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-19 PomBase SPBC106.19 FYPO:0006597 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-26 PomBase SPBC106.19 FYPO:0006596 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-26 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPCC965.07c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC3E7.02c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC106.02c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.14) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC1486.01) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Fig. S2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Fig. S2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC688.04c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Fig. S2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPCC1281.07c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Fig. S2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPBC354.12) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Fig. S2) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 7C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0008043 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_protein(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Fig. 4) PomBase SPBC106.19 FYPO:0001130 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38272226 4896 2024-12-06 (Fig. 7B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003776 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-19 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPBC609.04) PMID:36174923 4896 2022-11-07 (Figure 1) PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPCC663.08c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPCC965.07c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 high assayed_transcript(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPBC106.02c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 assayed_transcript(PomBase:SPAC3C7.14c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 medium assayed_transcript(PomBase:SPAP8A3.04c) PMID:36174923 4896 2022-11-07 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000245 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 PMID:36174923 4896 2022-11-06 (Fig. 5) PomBase SPBC106.19 FYPO:0002582 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000291 PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Figure 2C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0005974 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB1E7.11c) PMID:28334955 4896 2017-03-30 (Fig. 9C) PomBase SPBC106.19 FYPO:0008315 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000059 PMID:34119521 4896 2024-10-22 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) a PomBase SPBC106.19 FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC2F7.15) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC4G9.17c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPAC4F8.02c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.03c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC1271.15c) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000833 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC18E5.13) PMID:34119521 4896 2024-10-21 Disruption of ppr10, mpa1, or the PPR motifs of Ppr10 did not impair the assembly of mitoribosomes or their subunits (Fig. 2, A-D) and did not affect the steady-state levels of the protein subunits of the mt-SSU and mt-LSU (Fig. 2E). PomBase SPBC106.19 FYPO:0000840 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:33049028 4896 2021-02-08 The results showed that in the intronless background, the cox1 and cob1 mRNAs were detected at similar levels in WT[Δi] and Δppr10[Δi] cells (Fig. 1E-G PomBase SPBC106.19 FYPO:0000840 deletion 972 h- intronless background mt[delta i] ppr10 ppr10delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:33049028 4896 2021-02-08 The results showed that in the intronless background, the cox1 and cob1 mRNAs were detected at similar levels in WT[Δi] and Δppr10[Δi] cells (Fig. 1E-G PomBase SPBC106.19 FYPO:0009068 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001103 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000440 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:28334955 4896 2017-03-29 (Fig. 1B) PomBase SPBC106.19 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000098 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0006836 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001214 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:29878109 4896 2018-06-22 PomBase SPBC106.19 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ppr10 ppr10delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002380 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:28334955 4896 2017-03-29 Supp. Figure S3 PomBase SPBC106.19 FYPO:0002106 deletion 972 h- ppr10 ppr10delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:28334955 4896 2017-03-29 Supp. Figure S3 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PomBase SPCC965.04c FYPO:0007737 deletion 972 h- yme1 yme1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2024-12-30 we detected a significant loss of ΔΨ in yta12Δ mutant and increased ΔΨ in yme1Δ cells, both results in consonance with our previous findings (Fig. 4C, Additional file 4: Fig. S1). PomBase SPCC965.04c FYPO:0008360 deletion 972 h- yme1 yme1delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000081 PMID:35820914 4896 2023-11-08 PomBase SPCC965.04c FYPO:0001309 deletion 972 h- yme1 yme1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000137 high PMID:35820914 4896 2023-11-08 Moreover, cells lacking the protease Yme1 displayed increased lifespan in a similar manner to mgr3Δ mutant, whereas the loss of the protease Yta12 resulted in a significant reduction of longevity (Fig. 3B). This increase in the respiratory activity was more evident for yme1Δ mutant in high glucose medium (Fig. 4B, left panel). PomBase SPCC965.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph yme1 yme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.04c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph yme1 yme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.04c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph yme1 yme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph yme1 yme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.04c FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph yme1 yme1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC965.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph yme1 yme1delta deletion ECO:0005638 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972 h- och1 och1delta deletion ECO:0005638 PMID:11231017 4896 2021-01-02 (Fig. 1) PomBase SPAC1006.05c FYPO:0003710 deletion 972 h- och1 och1delta deletion ECO:0000335 PMID:19202278 4896 2016-10-31 PomBase SPAC1006.05c FYPO:0001491 deletion 972 h- och1 och1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC1006.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- och1 och1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-09-06 PomBase SPAC1006.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- och1 och1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1006.05c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 och1 och1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002678 S469D,T473D Overexpression 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173,T171) PMID:12181336 4896 2020-11-18 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000705 S469D,T473D Overexpression 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),assayed_using(PomBase:SPBC409.07c) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 3) PomBase SPBC409.07c FYPO:0002827 S469D,T473D Overexpression 972 h- kΔ::ade6+ wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 PMID:38289024 4896 2024-03-21 (Figure 5B) Notably, cells expressing two copies, but not one copy, of wis1-DD showed severe gene silencing defects (Figure 5B and Figure 5—Figure supplement 1B), and consistently the mRNA levels of the kΔ::ade6+ increased dramatically in these cells (Figure 5C and Figure 5—Figure supplement 1C). PomBase SPBC409.07c FYPO:0003571 S469D,T473D Overexpression 972 h- kΔ::ade6+ wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:38289024 4896 2024-04-05 Consistently, ChIP- qPCR analyses showed that the abundance of both H3K9me3 and Swi6HP1 bound at the mat locus but not at pericentromere decreased dramatically in cells with two copies of wis1-DD (Figure 5F and Figure 5—Figure supplement 1F). PomBase SPBC409.07c FYPO:0003573 S469D,T473D Overexpression 972 h- kΔ::ade6+ wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:38289024 4896 2024-04-05 Consistently, ChIP- qPCR analyses showed that the abundance of both H3K9me3 and Swi6HP1 bound at the mat locus but not at pericentromere decreased dramatically in cells with two copies of wis1-DD (Figure 5F and Figure 5—Figure supplement 1F). PomBase SPBC409.07c FYPO:0001645 S469D,T473D Overexpression 972 h- kΔ::ade6+ wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000227 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_protein(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:38289024 4896 2024-04-05 Furthermore, in vitro pull-down assays demonstrated that the interaction between Atf1 and Swi6HP1 was also largely disrupted in wis1-DD mutants (Figure 5E and Figure 5—Figure supplement 1E). PomBase SPBC409.07c FYPO:0003075 S469D,T473D Overexpression 972 h- wis1 wis1-DD wis1DD amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c),residue(Y173,T171) PMID:12181336 4896 2020-11-18 (Fig. 3) PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6G9.01c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC6G9.01c SPAC6G9.01cdelta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBP35G2.03c FYPO:0007994 (sgo1-VE)-swi6(69-215) Not assayed or wild type 972 h- sgo1 sgo1-VE-CD fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:18716626 4896 2022-04-24 (Fig. 3f and Supplementary Fig. 8). The Sgo1-VE protein, when fused with CDand thereby localized to the centromere, can perform its full functionin protecting Rec8 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 Y251YRGTPY Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K35 amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPBC1347.10 FYPO:0003997 D588A Not assayed or wild type 972 h- cdc23 cdc23-D588A amino_acid_mutation ECO:0005801 high PMID:16720577 4896 2014-11-13 PomBase SPBC119.02 FYPO:0002768 D116A Not assayed or wild type 972 h- ubc4 ubc4-D116A amino_acid_mutation ECO:0005801 assayed_using(PomBase:SPBC119.02) PMID:23416107 4896 2013-10-08 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000470 disruption Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-1 disruption ECO:0000059 PMID:3481026 4896 2013-09-24 PomBase SPBC216.06c FYPO:0000470 disruption Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-1 disruption ECO:0000059 FYECO:0000005 medium PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6B) PomBase SPBC216.06c FYPO:0001357 disruption Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-1 disruption ECO:0005638 FYECO:0000006 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6D) PomBase SPBC216.06c FYPO:0001357 disruption Not assayed or wild type 972 h- swi1 swi1-1 disruption ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:30759238 4896 2024-06-25 (Fig. S6D) PomBase SPCC553.01c FYPO:0002474 621-715 Not assayed or wild type 972 h- dbl2 dbl2(1-620) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC553.01c) PMID:23628481 4896 2013-08-21 PomBase SPAC15E1.08 FYPO:0002667 K29A Not assayed or wild type 972 h- naa10 naa10-K29A amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000061 assayed_using(GO:0031415) PMID:23912279 4896 2013-09-11 PomBase SPCC663.03 FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0009076 deletion 972 h- h- prototroph pmd1 pmd1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC663.03 FYPO:0003678 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greatest temperature-sensitivity (Figure 1I). PomBase SPAC6F6.08c FYPO:0002002 P256S Not assayed or wild type 972 h- cdc16 cdc16-C1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:38989013 4896 2024-07-29 The phenotypes of the three mutants were comparable. At 25 ̊C, the percent of septated cells was 17-20 with none showing more than one septa and at 36 ̊C, all cells arrested with multiple septa and one or two nuclei (Figure 1H). 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consistent with the role of the SRR1-like domain even in the absence of exogenous DNA damage. PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000085 H148A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-H148A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 5e) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000088 H148A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-H148A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 5e) PomBase SPBC14C8.13 FYPO:0000089 H148A Not assayed or wild type 972 h- srr1 srr1-H148A amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:37237082 4896 2023-06-09 (Figure 5e) PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002159 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002159 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002021 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0006981 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002161 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001075 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0001400 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002380 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC1F7.04 FYPO:0002060 V39T Overexpression 972 h- rho1 rho1-V39T amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:9372443 4896 2020-07-16 PomBase SPAC23D3.17 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2012-06-29 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000614 wild type Overexpression 972 h- mcm4 mcm4+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:11973289 4896 2012-11-15 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000614 wild type Overexpression 972 h- mcm4 mcm4+ wild_type ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:9383050 4896 2012-06-29 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP mcm4 mcm4+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000012 wild type Overexpression 972 h- mcm4 mcm4+ wild_type ECO:0005580 PMID:8631307 4896 2012-03-14 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0000783 wild type Overexpression 972 h- mcm4 mcm4+ wild_type ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC16A11.17) PMID:8631307 4896 2012-03-16 PomBase SPCC16A11.17 FYPO:0001234 wild type Overexpression 972 h- mcm4 mcm4+ wild_type ECO:0005638 PMID:8631307 4896 2012-03-14 PomBase SPAC1F5.04c FYPO:0000161 unknown Not assayed or wild type 972 h- h90 ura1- leu1-32 ade6-M216 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prototroph SPBC21C3.06 SPBC21C3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.06 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPBC21C3.06 SPBC21C3.06delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC21C3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- SPBC21C3.06 SPBC21C3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC21C3.06 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC21C3.06 SPBC21C3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.06 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPBC21C3.06 SPBC21C3.06delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC887.14c FYPO:0004337 M1A Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-m1 pfh1-nuc amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC887.14c) PMID:18725402 4896 2025-04-14 (Fig. 2A) PomBase SPBC887.14c FYPO:0002061 M1A Ectopic 972 h- pfh1 pfh1-m1 pfh1-nuc amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:18725402 4896 2025-04-14 The pfh1-nuc allele (nuc) did not complement the pfh1D allele, indicating that the mitochondrial isoform of Pfh1p is essential (Table 2, line 4). PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000705 F12L Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-F12L cdc4-A2 amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.16c),assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:11087749 4896 2020-12-30 PomBase SPBC2D10.13 FYPO:0002687 wild type Overexpression 972 h- est1 est1+ wild_type ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:25131669 4896 2017-11-01 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0000031 deletion 972 h- mam2 mam2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 100 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0006534 deletion 972 h- mam2 mam2delta deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC646.12c) PMID:24147005 4896 2018-04-29 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0000569 deletion 972 h- h- mam2 mam2delta deletion ECO:0005638 PMID:1657593 4896 2011-09-23 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0001141 deletion 972 h- mam2 mam2delta deletion ECO:0000049 PMID:22500108 4896 2012-04-27 PomBase SPAC11H11.04 FYPO:0001141 deletion 972 h- mam2 mam2delta deletion ECO:0000049 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ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0001355 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0000288 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 low PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0000288 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0001317 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC776.13) PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0001317 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC306.03c) PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0001317 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPCC188.03) PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0001317 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0001317 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPBC1A4.03c) PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0000088 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC1071.06 FYPO:0000091 Q13* Endogenous 972 h- arp9 arp9-127 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:24362309 4896 2014-07-22 PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002869 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:27082518 4896 2016-07-22 (Fig. S6A) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0001586 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC18G6.03) PMID:27082518 4896 2016-07-22 (Fig. S6A) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0005551 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC821.09) PMID:27082518 4896 2016-07-19 (Fig. 7E) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0005552 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC19G7.05c) PMID:27082518 4896 2016-07-19 (Fig. 7E) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002087 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:27082518 4896 2016-07-16 (Fig. 7C,D) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0002088 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:27082518 4896 2016-07-16 (Fig. 7C,D) PomBase SPAC6G10.05c FYPO:0003213 unknown Not assayed or wild type 972 h- trs120 trs120-M1 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:41171630 4896 2025-12-11 (Table 2) PomBase SPAP8A3.08 FYPO:0000705 135-142 Not assayed or wild type 972 h- cdc4 cdc4-ND cdc4p(N) partial_amino_acid_deletion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC22E12.16c),assayed_using(PomBase:SPAP8A3.08) PMID:11087749 4896 2020-12-30 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000969 I484T Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000969 I484T Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000957 I484T Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0000957 I484T Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-2 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002102 I484T Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC1259.13 FYPO:0002102 I484T Not assayed or wild type 972 h- chk1 chk1-2 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:9135148 4896 2015-03-17 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000029 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 50 PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 4) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000029 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 35 PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 4) PomBase SPCC736.11 FYPO:0007645 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-02-11 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000427 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003625 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 ago1 ago1delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000137 medium PMID:25373780 4896 2014-08-25 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004746 deletion 972 h- REIIΔ mat2P::ura4+ ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000137 PMID:38285941 4896 2024-03-26 PomBase SPCC736.11 FYPO:0005554 deletion 972 h- mat2-3delta ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004745 deletion 972 h- mat2-3delta ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-01 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003097 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0006030 high PMID:21892171 4896 2024-01-16 More importantly, mlo3Δ restored H3K9me and Swi6 localization at otr1R::ura4+ and endogenous centromeric repeats in ago1Δ mutant (Fig. 1 c-d) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003744 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c),assayed_region(SO:0001898) PMID:14704433 4896 2024-01-18 Furthermore, deletion of ago1+, dcr1+, or rdp1+ abolished the association of Chp1-Flag and Tas3-TAP with otr1::ura4+, as well as with centromeric repeat sequences (Fig. 4, A and B). PomBase SPCC736.11 FYPO:0005850 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC428.08c) PMID:34010645 4896 2021-06-10 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003074 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC582.04c) PMID:22895252 4896 2015-05-20 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003074 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09) PMID:15615848 4896 2022-07-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002835 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 PMID:20211136 4896 2014-11-03 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002835 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000337 PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1E) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000250 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000246 medium PMID:20404084 4896 2025-09-23 Likewise, cells lacking Ago1 showed a moderately slow growth phenotype in proline but a severe growth defect in ammonia. PomBase SPCC736.11 FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004201 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002834 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 PMID:14704433 4896 2024-01-18 A tas3 deletion strain carrying the ura4+ reporter gene inserted at innermost (imr) or outermost (otr) centromeric repeats of chromosome 1 (imr1R::ura4+ and otr1R::ura4+, respectively) displayed a loss of silencing of both reporter genes (Fig. 2D) to an extent similar to that of the deletion of sir2, chp1, or ago1 (Fig. 2D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003411 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006993 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006993 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 high PMID:21892171 4896 2024-01-16 Whereas ago1Δ alleviated silencing of a ura4+ reporter inserted at an outer centromeric repeat region (otr1R::ura4+), simultaneous deletions of mlo3 and ago1 restored centromeric silencing (Fig. 1a). T PomBase SPCC736.11 FYPO:0006993 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 high PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 PMID:12193640 4896 2024-01-19 Two transgenes located centromere distal to the tRNA genes were de-repressed in ago1- , dcr1- , and rdp1- , but a transgene located within the central region remained silent. Similar results were obtained in all three mutant strains, as assayed by growth on medium lacking uracil and by Northern blots (Fig. 1, B) (21). PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001898) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0001899) PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 low assayed_transcript(SO:0001899) PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000377 high assayed_transcript(SO:0001899) PMID:37445861 4896 2024-04-18 (Fig. 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(SO:0001898) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(SO:0001899) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003412 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002827 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 low PMID:15475954 4896 2024-05-28 (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002827 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 PMID:15743828 4896 2024-02-29 Nonetheless, deletion of chp1+ or ago1+ only slightly alleviated silencing (20, 38), as revealed by the presence of pink colonies compared with the red, fully repressed colonies (Fig. 8A). PomBase SPCC736.11 FYPO:0002827 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000268,FYECO:0000370 high PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002827 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 low PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004604 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007224 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:40063661 4896 2025-06-06 (Fig. 2H) PomBase SPCC736.11 FYPO:0007009 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. 4) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 high PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4F) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 high PMID:25831549 4896 2024-06-26 (Fig. 7E) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 high PMID:20178743 4896 2024-11-19 (Fig. 5 and Fig. S5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000888 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 high PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0007531 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007531 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-26 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007213 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 low PMID:22144463 4896 2020-11-19 The loss of Dicer (Dcr1) or Argonaute (Ago1) caused only partial or no reduction in H3K9me at heterochromatin islands except island 5, which showed considerable reduction of H3K9me (fig. S4, A and B). . Moreover, de novo targeting of H3K9me to ssm4 and mei4 occurred even in the absence of Ago1, albeit at levels lower than those of the wild type (fig. S4C), suggesting that additional RNAi-independent mechanism(s) target heterochromatin to meiotic loci. W PomBase SPCC736.11 FYPO:0006269 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24493644 4896 2017-10-26 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004137 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003096 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193640 4896 2024-01-19 In contrast, levels of K9 were greatly reduced. PomBase SPCC736.11 FYPO:0003571 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 high PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000883 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 5A and B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0006599 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12193640 4896 2024-01-19 As expected, Swi6, which depends on histone modification for chromatin binding, was delocalized from the ura4+ transgenes (Fig. 3C). PomBase SPCC736.11 FYPO:0006599 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 in ago1 cells there is a loss of centromere-associated Chp1 and Tas3, as revealed by loss of costaining of Chp1-6xmyc (Fig. 5A) and Tas3-13xmyc (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006599 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 in ago1 cells there is a loss of centromere-associated Chp1 and Tas3, as revealed by loss of costaining of Chp1-6xmyc (Fig. 5A) and Tas3-13xmyc (Fig. 5B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003573 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. S5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003573 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000268 medium assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPCC11E10.08) PMID:18345014 4896 2024-08-14 (Fig. S5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09),assayed_region(SO:0001898) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 medium assayed_protein(PomBase:SPAC6F12.09),assayed_region(SO:0001899) PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002386 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c),assayed_region(SO:0001898) PMID:17310250 4896 2024-05-24 (Fig. 1D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0007322 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 5D, 5E) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003557 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 medium PMID:19693008 4896 2024-01-15 When Dpht1 was combined with mutant alleles of clr4 or rik1—components of the Clr4-containing methyltransferase complex (ClrC)7—the resultant double mutants showed severe growth defects and a large, synergistic increase in antisense RNAs at .20% of genes (Fig. 2a and Supplementary Figs 5 and 7a, b). Consistent with ClrC directly participating in antisense suppression, Rik1 was found at the convergent loci (Supplementary Fig. 7c). PomBase SPCC736.11 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009101 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0005262 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009096 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 PMID:16797182 4896 2017-12-08 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 high PMID:12193640 4896 2024-01-19 However, three major transcripts that hybridized to the repeats were found to accumulate at high levels in each of the RNAi mutants (Fig. 1C). PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 medium PMID:40063661 4896 2025-06-26 (Fig. S8D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.232) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPNCRNA.362) PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 PMID:27183912 4896 2016-08-09 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000220 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 high PMID:16762840 4896 2024-01-17 However, abundant transcripts corresponding to centromeric repeats and cenH are detectable in RNAi- defective Dago1 cells. We found that the levels of transcripts in Depe1Dago1 double mutant cells were significantly reduced (Figures 5A and 5B), indicating that Epe1 facilitates transcription of the heterochromatic repeats. PomBase SPCC736.11 FYPO:0008148 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 PMID:29914874 4896 2019-01-11 PomBase SPCC736.11 FYPO:0006548 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32415063 4896 2024-01-22 Cells lacking Ago1 showed a considerable increase in pho1 transcript levels as determined by northern blot analysis (Fig. 4e), but the observed effect was weaker than in pir2-1 or cwf10-1, suggesting that additional factors likely cooperate with Pir2- splicing machinery. PomBase SPCC736.11 FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002331 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 medium PMID:16931764 4896 2024-05-20 (Fig. 2C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0007337 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:12193640 4896 2024-01-19 dcr1- , rdp1- , and ago1- cells had increased levels of K4 in the centromeric region in comparison to actin controls (Fig. 3B). PomBase SPCC736.11 FYPO:0007468 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126,FYECO:0000127 assayed_region(PomBase:SPBC32H8.12c) PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 2E, 2F) PomBase SPCC736.11 FYPO:0001742 deletion 972 h- mat2-3delta ago1 ago1delta deletion ECO:0000337 PMID:30652128 4896 2019-01-25 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002664 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 PMID:22431512 4896 2013-09-19 PomBase SPCC736.11 FYPO:0005371 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0005995 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 medium assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1530) PMID:39358553 4896 2024-10-31 (Fig. 1A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004237 deletion 972 h- mat2-3delta ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2025-07-02 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001130 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000181 assayed_protein(PomBase:SPAC57A7.04c) PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. S8A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003033 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC30D10.18c) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003033 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC664.06) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003033 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC140.02) PMID:37913773 4896 2024-01-15 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000825 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(SO:0000286) PMID:21151114 4896 2013-08-23 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000825 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 low assayed_transcript(PomBase:SPAC14C4.07) PMID:23151475 4896 2025-06-20 (Fig. 3D) PomBase SPCC736.11 FYPO:0007320 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 15 high PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. 5A, 5B, 5E) PomBase SPCC736.11 FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000228 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 33 PMID:22268381 4896 2019-10-30 (Fig. 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006518 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1A) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006518 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ago1 ago1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC736.11 FYPO:0006518 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC736.11 FYPO:0006660 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004295 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004331 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 PMID:12193640 4896 2024-01-19 Two transgenes located centromere distal to the tRNA genes were de-repressed in ago1- , dcr1- , and rdp1- , but a transgene located within the central region remained silent. Similar results were obtained in all three mutant strains, as assayed by growth on medium lacking uracil and by Northern blots (Fig. 1, B) (21). PomBase SPCC736.11 FYPO:0002336 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000370 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0002336 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:26443059 4896 2015-11-02 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 ago1 ago1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPCC736.11 FYPO:0005866 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:40132111 4896 2025-08-12 (Fig. S2B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0005865 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0008364 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 PMID:31883795 4896 2025-02-24 (Fig. 5A and B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003747 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003747 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:22144463 4896 2020-11-19 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004378 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:15218150 4896 2024-05-02 (Fig. 1B) PomBase SPCC736.11 FYPO:0003576 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC18G6.02c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 Surprisingly, however, other foci of Chp1-6xmyc and Tas3- 13xmyc persisted in ago1Δ cells. Similar results were obtained in cells from which Dicer was deleted (Fig. 5A and B, right panels). PomBase SPCC736.11 FYPO:0003576 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC83.03c) PMID:15743828 4896 2024-02-29 Surprisingly, however, other foci of Chp1-6xmyc and Tas3- 13xmyc persisted in ago1Δ cells. Similar results were obtained in cells from which Dicer was deleted (Fig. 5A and B, right panels). PomBase SPCC736.11 FYPO:0004824 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000231 PMID:25417108 4896 2015-08-11 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001317 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:25428589 4896 2022-12-02 In addition, the transcript levels of tgp1þ, nc-tgp1, nc-1343, pho1þ and nc-pho1 were unaffected by loss of RNAi (for example, ago1D or dcr1D) or heterochromatin components (for example, clr4D or swi6D) (Fig. 5b; Supplementary Fig. 7a PomBase SPCC736.11 FYPO:0001317 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:25428589 4896 2022-12-02 In addition, the transcript levels of tgp1þ, nc-tgp1, nc-1343, pho1þ and nc-pho1 were unaffected by loss of RNAi (for example, ago1D or dcr1D) or heterochromatin components (for example, clr4D or swi6D) (Fig. 5b; Supplementary Fig. 7a PomBase SPCC736.11 FYPO:0006368 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000049 PMID:29214404 4896 2018-02-09 PomBase SPCC736.11 FYPO:0008414 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 PMID:40063661 4896 2025-06-09 (Fig. S7B, S7C) PomBase SPCC736.11 FYPO:0009032 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009079 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001450 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000077 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000242,FYECO:0000254 PMID:20404084 4896 2025-09-23 As with oca2 , cha4 and ago1 are resistant to rapamycin (see Fig. S2A in the supplemental material). PomBase SPCC736.11 FYPO:0005193 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000390 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004325 deletion 972 h- SP287 ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPCC736.11 FYPO:0004325 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. 2) PomBase SPCC736.11 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000841 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002328 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000079 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000142 medium PMID:37445861 4896 2024-04-17 (Fig. S3) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0000226 high PMID:26518661 4896 2019-07-25 (Figure 5) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0006030 high PMID:21892171 4896 2024-01-16 As expected, cells carrying ago1Δ or dcr1Δ showed severe sensitivity to TBZ, (Figure 1e) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:30810475 4896 2019-07-04 (Fig. 7) PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 high PMID:24240238 4896 2015-07-22 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:20018856 4896 2014-08-13 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 PMID:27183912 4896 2016-08-09 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000091 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000227 PMID:28231281 4896 2017-04-10 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0009064 deletion 972 h- h- prototroph ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000425 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0000022 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 medium PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPCC736.11 FYPO:0001234 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000254 high PMID:20404084 4896 2025-09-23 Likewise, cells lacking Ago1 showed a moderately slow growth phenotype in proline but a severe growth defect in ammonia. PomBase SPCC736.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC736.11 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ago1 ago1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0000044 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000291 FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0001665 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000335 FYECO:0000005,FYECO:0000310 PMID:8227198 4896 2020-10-22 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0005288 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000049 PMID:8001792 4896 2017-02-15 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0005288 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000049 PMID:16489217 4896 2017-09-28 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0005288 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000049 FYECO:0000162 high PMID:2157626 4896 2016-12-20 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0000825 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:2157626 4896 2016-12-21 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0000780 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:8001792 4896 2017-02-15 PomBase SPBC21C3.20c FYPO:0001865 T2979TT Not assayed or wild type 972 h- git1 git1-1 nucleotide_insertion ECO:0000291 FYECO:0000056,FYECO:0000162 assayed_using(PomBase:SPBC1198.14c) PMID:1849107 4896 2013-01-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000229 disruption Null 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0001232 FYECO:0000170 PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0001164 disruption Null 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0001232 PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0004662 disruption Null 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0000088 disruption Null 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPCC18B5.11c FYPO:0002177 disruption Null 972 h- cds1 cds1::ura4 disruption ECO:0001232 PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 R341A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R341A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 3) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 R341A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R341A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 low PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPAC977.10 FYPO:0001234 R341A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-R341A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000166 high PMID:30996236 4896 2019-05-16 (Fig. 2) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000082 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000082 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000082 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000082 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000082 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000674 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3A) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000964 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0001513 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000091 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000091 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000091 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000091 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0000091 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0005638 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 3B) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh1-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 55 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-TEV-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 48 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-2xGBP-mCherry-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 59 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 52 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 cnp1-GFP Not assayed or wild type 972 h- Padh11-GBP-mCherry-NLS cnp1 cnp1-GFP fusion_or_chimera ECO:0001232 51 PMID:34849791 4896 2022-03-30 (Figure 4) PomBase SPAC821.08c FYPO:0006927 deletion 972 h- ade6- leu1-32, ura4-D18 h+ slp1 slp1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30759079 4896 2019-06-11 Table 1 The nuclear envelope for all the mutants analysed is marked with Ish1-yEGFP integrated in the gene deletion locus. The the NC ratio of the control is reduced from 0.08 to 0.05. 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normally in glucose-rich media. However, while mts4L636P mutants show normal growth in glycerol respiratory media, the atp3R282C mutant exhibited very slow growth (Fig. 3A). PomBase SPBC1734.13 FYPO:0003881 R282C Not assayed or wild type 972 h- atp3 atp3-R282C atp3R282C amino_acid_mutation ECO:0000231 FYECO:0000137,FYECO:0000460,FYECO:0000467 high PMID:41068765 4896 2025-10-10 Figure 3C ρ0 growth assay in combination with Δαtp2 mutation. .....and the atg43-1 single mutant was petite- negative (Additional file 6: Fig. S2). PomBase SPBC409.09c FYPO:0001269 unknown Not assayed or wild type 972 h- mis13 mis13-1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBP4H10.06c) PMID:18362178 4896 2015-02-13 PomBase SPBC409.09c FYPO:0003241 unknown Not assayed or wild type 972 h- mis13 mis13-1 unknown ECO:0001232 PMID:15502821 4896 2015-01-22 PomBase SPAC56F8.02 FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph cmr2 cmr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.02 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr cmr2 cmr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 low PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPAC56F8.02 FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph cmr2 cmr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.02 FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph cmr2 cmr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC56F8.02 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or wild type 972 h- pIRT-2X rum1 rum1-T58A,T62A rum1-A58A62 amino_acid_mutation ECO:0000337 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09) PMID:9430640 4896 2021-04-06 (Fig. 5B) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0002033 T58A,T62A Not assayed or wild type 972 h- rum1 rum1-T58A,T62A rum1-A58A62 amino_acid_mutation ECO:0001807 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high assayed_using(PomBase:SPBC32F12.09),residue(A58 A62) PMID:9430640 4896 2021-04-07 (Fig. 7B) rum1 A58A62 mutant protein is unable to be phosphorylated by cdc2/cig1 PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0000158 T58A,T62A Not assayed or wild type 972 h- pIRT-2X rum1 rum1-T58A,T62A rum1-A58A62 amino_acid_mutation ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000126 high PMID:9430640 4896 2021-03-22 (Fig. 3C) PomBase SPBC32F12.09 FYPO:0001234 T58A,T62A Not assayed or wild type 972 h- leu1-32, pIRT-2X rum1 rum1-T58A,T62A rum1-A58A62 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 high PMID:9430640 4896 2021-03-22 (Fig. 3B) PomBase SPCC970.04c 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its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:22848669 4896 2024-06-27 On the effect of temperature, in the its8-1Dcis4 double mutants, these cells exhibited more marked temperature sensitivity than that of the its8-1 single mutants (Figure 5B), suggesting that there is a genetic interaction between Its8 and Cis4. PomBase SPBC839.08c FYPO:0001407 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC839.08c FYPO:0001407 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0008260 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPAC1705.03c) PMID:22848669 4896 2024-06-27 As expected, GFP-Ecm33 primarily localized to the ER and to the cell surface in the its8-1 mutant cells (Figure 4D, arrows), suggesting that the impairment of GPI anchor synthesis caused the defective attachment of GPI-anchor to the Ecm33 protein thereby resulting in the abnormal GFP-Ecm33 localization in the ER. PomBase SPBC839.08c FYPO:0000650 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0001470 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000404 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 The results showed that the addition of Zn2+ to the medium significantly rescued the high temperature-sensitive and FK506-sensitive phenotypes of the its8-1 mutant (Figure 5A) PomBase SPBC839.08c FYPO:0001966 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0004560 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0002720 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0000105 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0002641 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:17881729 4896 2015-12-10 PomBase SPBC839.08c FYPO:0000086 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 high PMID:22848669 4896 2024-06-27 The results showed that the addition of Zn2+ to the medium significantly rescued the high temperature-sensitive and FK506-sensitive phenotypes of the its8-1 mutant (Figure 5A) PomBase SPBC839.08c FYPO:0000086 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0001496 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPBC839.08c FYPO:0004559 P288S Not assayed or wild type 972 h- its8 its8-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:11297516 4896 2015-04-14 PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0008435 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000059 medium PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 3D) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002133 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 6F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002133 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 6G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002134 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 6E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001135 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001327 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 4E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0005120 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- pat1-as snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPBC216.02) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 5E, 5F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0005120 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- pat1-as snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000291 FYECO:0000244 assayed_transcript(PomBase:SPAC27D7.13c) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 5E, 5F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000703 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_protein(PomBase:SPCC736.12c) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6C) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0000703 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC27D7.03c),assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6D) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002357 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPAC23G3.06),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 6H) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0002357 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_protein(PomBase:SPBC2D10.10c),assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.21) PMID:40185772 4896 2025-04-18 (Fig. S6B) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001317 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3E) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003058 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPSNORNA.55) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. S3F) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0001357 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:40185772 4896 2025-05-02 (Fig. S3G) PomBase SPSNORNA.55 FYPO:0003720 C39T,G40A,A41G,C42T,T43C,A44G Not assayed or wild type 972 h- snR107 snR107-kloopmut nucleotide_mutation ECO:0000337 assayed_transcript(PomBase:SPRRNA.48) PMID:40185772 4896 2025-04-17 (Fig. 3C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0006521 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7A-B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001382 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0005801 FYECO:0000170 low assayed_enzyme(PomBase:SPCC18B5.11c) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001645 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPBC216.06c),assayed_protein(PomBase:SPBC30D10.04) PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 2A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000972 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0001232 15 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 6B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4B) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0003503 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000314 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 4C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0001357 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000069 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 7C) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000085 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000088 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC30D10.04 FYPO:0000089 D84H,F171L Not assayed or wild type 972 h- swi3 swi3-E31 amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:20967229 4896 2025-11-15 (Fig. 1A) PomBase SPBC4.07c FYPO:0004332 unknown Not assayed or wild type 972 h- rpt2 rpt2-ts unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 high assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:11683390 4896 2016-10-24 (Fig. 6) Cdc13YFP and Cdc2YFP remain associated with spindle, SPB. Cdc13 is not degraded by defective proteasome. Rpt1 is called Mts2 in this paper PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0003893 deletion 972 h- pol4 pol4delta deletion ECO:0000337 PMID:25106870 4896 2014-10-14 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0003928 deletion 972 h- pol4 pol4delta deletion ECO:0000059 PMID:22093869 4896 2014-10-30 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0005331 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta pol4 pol4delta deletion ECO:0000049 low PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0003927 deletion 972 h- pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 PMID:22093869 4896 2014-10-30 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pol4 pol4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0005329 deletion 972 h- swi10delta uve1delta mlh1delta pol4 pol4delta deletion ECO:0000049 PMID:20453833 4896 2016-03-31 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 pol4 pol4delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0003082 deletion 972 h- h90 pol4 pol4delta deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 PMID:16120966 4896 2019-01-10 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0000472 deletion 972 h- h90 pol4 pol4delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000005 PMID:16120966 4896 2019-01-10 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:28945192 4896 2017-10-10 PomBase SPAC2F7.06c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph pol4 pol4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC2F7.06c 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deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0005638 PMID:12132578 4896 2014-08-20 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0002141 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0005638 PMID:12132578 4896 2014-08-20 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0000426 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 PMID:10641037 4896 2021-12-18 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0007915 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 PMID:10641037 4896 2021-12-18 Because the same distribution pattern was observed when nmt-GFP-13g6 was expressedin the klp3 null allele (Figure 3B), we conclude that ER distribution is not affected by the disruption of klp3 in Fission yeast. PomBase SPAC1834.07 FYPO:0001164 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:12132578 4896 2014-08-20 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0007912 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 PMID:10641037 4896 2021-12-18 (Figure 3b) PomBase SPAC1834.07 FYPO:0006259 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 PMID:24239120 4896 2022-04-22 (Fig. 1) PomBase SPAC1834.07 FYPO:0005342 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 PMID:19686686 4896 2016-04-01 (Fig. 1e) PomBase SPAC1834.07 FYPO:0002716 deletion 972 h- klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 PMID:10641037 4896 2021-12-18 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph klp3 klp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph klp3 klp3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0009038 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FYECO:0000006,FYECO:0000126,FYECO:0000137 PMID:11018050 4896 2023-01-25 PomBase SPAC1834.07 FYPO:0001510 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 klp3 klp3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- 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growth rate (increased generation time) relative to that of the WT strain in YES media at 30 ̊C (Fig 7A and 7B and S1 Table). PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC31H12.04c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rpl1202 rpl1202delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23A1.19c FYPO:0000102 50-250 Not assayed or wild type 972 h- hrq1 hrq1-CDTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:22064477 4896 2012-04-16 PomBase SPAC23A1.19c FYPO:0001492 50-250 Not assayed or wild type 972 h- hrq1 hrq1-CDTdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:22064477 4896 2013-06-03 PomBase SPBPB2B2.10c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr gal7 gal7delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 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deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 nhx1 nhx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC139.03 FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 toe2 toe2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC139.03 FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 toe2 toe2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC139.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph toe2 toe2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC139.03 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph toe2 toe2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC139.03 FYPO:0007928 deletion 972 h- h- prototroph toe2 toe2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC139.03 FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph toe2 toe2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC139.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- toe2 toe2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC139.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 toe2 toe2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC139.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 toe2 toe2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000201 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000059 PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003659 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000337 PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007336 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 In contrast, sir2Δ L(BglII)::ade6+ cells formed white colonies, indicating loss of silencing of the reporter gene (Figure 2C). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004136 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:23771057 4896 2013-11-10 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002834 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:23771057 4896 2013-11-10 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002834 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:14704433 4896 2024-01-18 A tas3 deletion strain carrying the ura4+ reporter gene inserted at innermost (imr) or outermost (otr) centromeric repeats of chromosome 1 (imr1R::ura4+ and otr1R::ura4+, respectively) displayed a loss of silencing of both reporter genes (Fig. 2D) to an extent similar to that of the deletion of sir2, chp1, or ago1 (Fig. 2D) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003411 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 high PMID:12867036 4896 2024-02-03 Deletion of sir2+ caused derepression of ura4+ at both loci (Figure 2D). However, this effect was much stronger at the imr repeats than at the otr repeats. While sir2Δ cells carrying imr1R::ura4+ did not form colonies on FOA-containing plates, mutant cells carrying otr1R::ura4+ showed appreciable growth on FOA plates (Figure 2D). These results indicated that Sir2 was required for silencing at the S. pombe centromeric DNA regions. PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003411 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 6) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003411 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:29109278 4896 2017-12-04 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:12867036 4896 2024-02-03 Deletion of sir2+ caused derepression of ura4+ at both loci (Figure 2D). However, this effect was much stronger at the imr repeats than at the otr repeats. While sir2Δ cells carrying imr1R::ura4+ did not form colonies on FOA-containing plates, mutant cells carrying otr1R::ura4+ showed appreciable growth on FOA plates (Figure 2D). These results indicated that Sir2 was required for silencing at the S. pombe centromeric DNA regions. PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000005 low PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:25274039 4896 2014-11-10 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 high PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 3B) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003412 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 low PMID:31822915 4896 2020-01-06 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003216 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002827 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004604 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 high PMID:25245948 4896 2014-12-04 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003352 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000337 high PMID:29852001 4896 2024-07-10 (Fig. 3) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007009 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 PMID:20062003 4896 2019-07-26 (Fig. S1) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007213 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 high PMID:22144463 4896 2020-11-19 Deletion of sir2 encoding a nicotinamide adenine dinucleotide- dependent HDAC (3) caused defective H3K9me at the majority of islands (fig. S5A), but SHREC subunits were dispensable (fig. S5B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0008200 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 medium PMID:12867036 4896 2024-02-03 Consistent with its weaker effect on silencing of otr1R::ura4+, deletion of sir2+ had only a weak effect on methylation of this ura4+ reporter (Figure 3B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003096 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 low PMID:12867036 4896 2024-02-03 Consistent with its weaker effect on silencing of otr1R::ura4+, deletion of sir2+ had only a weak effect on methylation of this ura4+ reporter (Figure 3B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003571 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 high PMID:12867036 4896 2024-02-03 Histone H3-K9 methylation levels at Kint2::ura4+ and imr1R::ura4+ were strongly reduced in sir2Δ compared to sir2+ cells (32- and 13-fold, respectively) (Figure 3B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000470 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 We observed a strong reduction in staining of sir2Δ compared to sir2+ cells, which indicated a reduced rate of switching to the opposite mating type in sir2Δ cells (Figure 2E, column 1). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000470 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004491 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-03 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005167 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12867036 4896 2024-02-03 Moreover, the level of Swi6 associated with imr1R::ura4+ and otr1R::ura4+ reporters was reduced 8- and 3-fold, respectively, in sir2Δ compared to wild-type cells (Figure 3B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003573 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12867036 4896 2024-02-03 ChIP analysis showed that the level of Swi6 associated with Kint2::ura4+ was reduced 47-fold in sir2Δ compared to wild-type cells (Figure 3B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002386 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:12867036 4896 2024-02-03 Moreover, the level of Swi6 associated with imr1R::ura4+ and otr1R::ura4+ reporters was reduced 8- and 3-fold, respectively, in sir2Δ compared to wild-type cells (Figure 3B). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005939 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:28139976 4896 2017-02-21 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000636 deletion 972 h- Prototroph of ED668 sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000275 PMID:25452419 4896 2015-01-29 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000220 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 low PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000332 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000059 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006815 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 Compared to wild-type cells, in sir2Δ cells, acetylation of K9 was increased by 16-, 11-, and 7-fold at the ura4+ reporter inserted in the mating locus (Kint2::ura4+), the inner (imr1R::ura4+), and the outer centromeric repeats (otr1R::ura4+), respectively (Figure 3A). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000966 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 6) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007633 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 Compared to wild-type cells, in sir2Δ cells, acetylation of K9 was increased by 16-, 11-, and 7-fold at the ura4+ reporter inserted in the mating locus (Kint2::ura4+), the inner (imr1R::ura4+), and the outer centromeric repeats (otr1R::ura4+), respectively (Figure 3A). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005310 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004238 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000112 PMID:20299449 4896 2014-12-23 (Fig. 2A) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000893 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006681 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 Compared to wild-type cells, in sir2Δ cells, acetylation of K9 was increased by 16-, 11-, and 7-fold at the ura4+ reporter inserted in the mating locus (Kint2::ura4+), the inner (imr1R::ura4+), and the outer centromeric repeats (otr1R::ura4+), respectively (Figure 3A). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006814 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 low PMID:12867036 4896 2024-02-03 Compared to wild-type cells, in sir2Δ cells, acetylation of K9 was increased by 16-, 11-, and 7-fold at the ura4+ reporter inserted in the mating locus (Kint2::ura4+), the inner (imr1R::ura4+), and the outer centromeric repeats (otr1R::ura4+), respectively (Figure 3A). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006814 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:30573453 4896 2019-06-28 (Figure 6) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0004690 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:12867036 4896 2024-02-03 Compared to wild-type cells, in sir2Δ cells, acetylation of K9 was increased by 16-, 11-, and 7-fold at the ura4+ reporter inserted in the mating locus (Kint2::ura4+), the inner (imr1R::ura4+), and the outer centromeric repeats (otr1R::ura4+), respectively (Figure 3A). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002819 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:23771057 4896 2013-11-10 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000892 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000871 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000112 PMID:18344406 4896 2024-01-21 In the absence of Sir2, we observed elevated levels of histone H3 K9 and histone H4 K16, which was consistent with previous reports (17, 48). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007631 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007632 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000112 PMID:18344406 4896 2024-01-21 In the absence of Sir2, we observed elevated levels of histone H3 K9 and histone H4 K16, which was consistent with previous reports (17, 48). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007632 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005309 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:16079916 4896 2021-02-09 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002173 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007937 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000059 PMID:34464389 4896 2022-01-08 Based on DNA breakpoint junctions in genome sequence data (Fig 5B While wild-type cells showed a substantial increase of indels in aged cells, sir2Δ cells showed only a subtle increase PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001327 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPCC4B3.18) PMID:23091701 4896 2013-08-27 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005917 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0001232 assayed_transcript(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:34464389 4896 2022-01-08 (Figure 4B) Accordingly, our smFISH experiment showed that tlh2 was de-repressed in sir2 deletion cells PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005917 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC212.11) PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0005917 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 low assayed_using(PomBase:SPAC212.11),assayed_using(PomBase:SPBCPT2R1.08c) PMID:26744419 4896 2019-01-31 (Fig. 7) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001309 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000123 low PMID:34464389 4896 2022-01-08 (Figure 5A) Cells lacking Sir2 showed a subtle extension of chronological lifespan compared to wild-type, especially at later timepoints PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sir2 sir2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 medium PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000245 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 low PMID:17986764 4896 2014-10-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006670 deletion 972 h- REIIdelta sir2 sir2delta deletion ECO:0000059 PMID:12867036 4896 2024-02-03 We combined the sir2Δ mutant with REIIΔ and found that the sir2Δ REIIΔ double mutant had a strong haploid meiosis phenotype (Figure 2E). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002837 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 PMID:23771057 4896 2013-11-10 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 sir2 sir2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0006811 deletion 972 h- mat2-3delta sir2 sir2delta deletion ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000969 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001164 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000964 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:17446861 4896 2015-03-02 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002618 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:21670521 4896 2014-06-06 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0010017 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000112 PMID:31262821 4896 2025-11-17 (Fig. 4A) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000862 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001513 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000059 PMID:23771057 4896 2013-11-01 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003576 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000226 assayed_protein(PomBase:SPBC36.05c) PMID:38048463 4896 2024-03-20 (Fig. 4E) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001317 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 In contrast, deletion of TSA- insensitive sir2, which contributes to transcriptional silencing at constitutive heterochromatin, had no effect on pho1 expression (Figure 1B, lane 5). PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001317 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1271.09) PMID:29618061 4896 2024-01-24 No detectable increase in either tgp1 or nc-tgp1 was observed in sir2Δ, strains harbouring a clr6 mutation (Supplementary Figure S3A, lanes 6-8) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001317 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1698) PMID:29618061 4896 2024-01-24 No detectable increase in either tgp1 or nc-tgp1 was observed in sir2Δ, strains harbouring a clr6 mutation (Supplementary Figure S3A, lanes 6-8) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003503 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0001232 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007629 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126,FYECO:0000127 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1A) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0007629 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000104 PMID:27984744 4896 2021-07-14 (Fig. 1B) PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002617 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000091 deletion 972 h- sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102 PMID:26510788 4896 2015-12-07 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0002546 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase SPBC16D10.07c FYPO:0000115 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sir2 sir2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 low PMID:23861937 4896 2013-09-03 PomBase 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SPBC12D12.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 medium PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000082 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000080 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 high PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0006978 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000335 FYECO:0000137 medium PMID:31030285 4896 2019-07-12 (Fig. S1) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002679 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 high assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 2A) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001838 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPBC119.08) PMID:19037094 4896 2025-02-03 (Fig. 6D) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001838 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:20164182 4896 2020-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0004480 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000049 PMID:16928959 4896 2015-02-27 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0004479 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000049 FYECO:0000166 PMID:16928959 4896 2015-02-27 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000223 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0001232 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 1) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0003532 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0003532 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 PMID:20501954 4896 2014-08-08 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0005197 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000104 low assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0005197 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000104 low assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001038 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC119.08) PMID:9135147 4896 2012-07-10 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001489 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pck2 pck2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000118 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0001232 3 PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 1) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001037 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000166 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001037 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000214 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001037 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000214 PMID:20624220 4896 2015-09-29 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001020 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000261 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0003706 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9203581 4896 2015-05-05 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000961 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000025 PMID:11263963 4896 2024-04-16 (Fig. 3D) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000776 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07),residue(S546) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000776 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.15c) PMID:24928510 4896 2020-06-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:39540318 4896 2025-02-14 (Fig. 2B) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001357 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 PMID:11263963 4896 2024-04-16 (Fig. 3B and D) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009030 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0005969 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 PMID:34198697 4896 2024-07-03 (Figure 1B) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000725 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0007521 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0000112 high PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 2A) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000094 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:27168121 4896 2016-08-23 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002720 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 PMID:8943330 4896 2014-07-09 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002720 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 PMID:9199286 4896 2014-05-02 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002720 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 high PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 1C) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002720 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:14625898 4896 2014-05-15 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0003840 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000290 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000079 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 PMID:19037094 4896 2025-01-30 (Fig. 2D) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000105 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 medium PMID:19625445 4896 2020-11-13 (Fig. 1D) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 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(Fig. 4) PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137,FYECO:0000207 low PMID:15821139 4896 2023-03-03 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000111 deletion 972 h- h- prototroph pck2 pck2delta deletion ECO:0005638 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ctp1-SP1/SP2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000957 S114A,S165A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-SP1/SP2 amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC338.08 FYPO:0005614 S114A,S165A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-SP1/SP2 amino_acid_mutation ECO:0000279 assayed_using(PomBase:SPCC338.08) PMID:18378696 4896 2016-08-17 PomBase SPCC1020.04c FYPO:0002061 A63T Not assayed or wild type 972 h- rpb6 rpb6-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:10648612 4896 2022-04-13 PomBase SPCC1020.04c FYPO:0000084 A63T Not assayed or wild type 972 h- rpb6 rpb6-ts1 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000227 high PMID:10648612 4896 2022-04-13 PomBase SPBC409.12c FYPO:0001645 I177M,M180I Not assayed or wild type 972 h- stn1 stn1-1 amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC365.06),assayed_using(PomBase:SPBC409.12c) PMID:29774234 4896 2018-06-07 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 1-40 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-DF1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001492 1-40 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-DF1 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002060 1-40 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-DF1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPAC23D3.02 FYPO:0002060 D183DRGTPGVGTPD Overexpression 972 h- rfc2 rfc2-K26a amino_acid_insertion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:19664060 4896 2016-02-24 PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0001324 L565P Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-L565P amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000103 assayed_using(PomBase:SPCC338.17c) PMID:31072933 4896 2019-05-17 (Figure S7A) PomBase SPAC10F6.09c FYPO:0002061 L565P Not assayed or wild type 972 h- psm3 psm3-L565P amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:29735656 4896 2019-05-20 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001982 37-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-delta37-372 cdc27partial_delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:8887553 4896 2013-02-14 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001110 37-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-delta37-372 cdc27partial_delta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:8887553 4896 2013-02-08 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000839 37-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-delta37-372 cdc27partial_delta partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 PMID:8887553 4896 2013-02-08 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001949 wild type Overexpression 972 h- trp1322 trp1322+ wild_type ECO:0000049 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPCC1322.03 FYPO:0001460 wild type Overexpression 972 h- trp1322 trp1322+ wild_type ECO:0000049 FYECO:0000261 PMID:21811607 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0004637 242-351 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D6M partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 242-351 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-D6M partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPNCRNA.1712 FYPO:0001317 (-441)-(-252) Not assayed or wild type 972 h- nc-pho1 prt-4delta partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:29618061 4896 2024-01-24 No change in pho1 expression could be detected for either prt-4Δ or prt-5Δ (Figure 3B, lanes 5 and 6). PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0001966 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 sts6-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0002720 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 sts6-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000103,FYECO:0000201 high PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000104 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 sts6-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000113 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 sts6-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:9405296 4896 2018-06-07 PomBase SPBC12D12.04c FYPO:0000113 unknown Not assayed or wild type 972 h- pck2 sts6-8 unknown ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:1899230 4896 2012-12-10 PomBase SPAC3H5.07 FYPO:0003412 rpl702::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 rpl702 rpl702::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPAPYUG7.02c FYPO:0002290 S60A,S61A,S62A Not assayed or wild type 972 h- sin1 sin1-S60A,S61A,S62A amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPCC24B10.07) PMID:31477575 4896 2019-11-01 (Fig. S1) PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0000206 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000049 PMID:17538026 4896 2016-10-06 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0000670 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0001232 medium PMID:36108046 4896 2022-12-15 Consistent with this assumption, we found that dnt1Δ cells lost minichromosomes (Ch16, ade6-M216) at an elevated rate that is almost 100 times higher than that of the wild-type (Fig 1B), and displayed increased frequency of lagging chromosomes and chromosome mis-segregation at mitotic anaphase (Fig 1C). PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0003688 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC4C3.05c) PMID:17538026 4896 2016-10-06 (Fig. 4) PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0009053 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0003216 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000049 PMID:17538026 4896 2020-03-27 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0000835 deletion 972 h- nda3-KM311 dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000112 medium assayed_protein(PomBase:SPAC821.08c) PMID:36108046 4896 2022-12-15 Surprisingly, Slp1Cdc20 was slightly, but appreciably and reproducibly, less abundant (ranging from roughly 20% to 50% at different time points) in dnt1Δ cells than in wild-type cells (Fig 3B), suggesting Dnt1 may indeed positively regulate the levels of intact Slp1Cdc20. In addition, this regulation of Slp1Cdc20 stability by Dnt1 is Dma1-independent, as the dnt1Δ dma1Δ double mutant has a similar level and degradation profile of Slp1Cdc20 as dnt1Δ single mutant (S5 Fig). PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0002971 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0005727 deletion 972 h- nda3-KM311 dnt1 dnt1delta deletion ECO:0001232 PMID:36108046 4896 2022-12-15 inefficient anaphase initiation upon SAC inactivation/ persistent MCC-APC/C binding upon SAC activation The SAC was first robustly activated by the nda3-KM311 mutant then inactivated by shifting mitotically arrested cells back to permissive temperature(30˚C)/ We found that dnt1Δ cells retained high amounts of SPB-localized Cdc13-GFP and nuclear Cut2-GFP for much prolonged period compared to wild-type cells, almost to the same degree as previously identified SAC-inactivation defective mutant dis2Δ PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0005706 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0001232 PMID:36108046 4896 2023-01-20 but dnt1Δ cells stayed for extended length of time at anaphase B (Fig 1D-1F) PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0001327 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:24006256 4896 2014-02-13 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0002970 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0001038 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC11B10.09) PMID:24006256 4896 2014-02-13 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0002082 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC244.01c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0002973 deletion 972 h- dnt1 dnt1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC17G8.10c) PMID:22809626 4896 2013-12-03 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dnt1 dnt1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC25D12.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dnt1 dnt1delta 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partial_nucleotide_deletion ECO:0000291 FYECO:0000245 assayed_using(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:24210919 4896 2014-03-26 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000585 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20- unknown ECO:0001232 PMID:1417417 4896 2013-09-20 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20- unknown ECO:0001232 PMID:1417417 4896 2013-09-20 PomBase SPAC3H8.10 FYPO:0001399 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo20 spo20- unknown ECO:0001232 PMID:1417417 4896 2013-11-01 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000468 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 high PMID:11780129 4896 2024-04-12 we found that cohesin mutants (psc3-1T, psc3-2T, psc3-4T and rad21-K1) produced switching-defective colonies at a rate nearly 100-fold that of the wild type (Fig. 2a,b). PomBase SPCC338.17c FYPO:0000444 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0005580 FYECO:0000005 PMID:11359920 4896 2015-08-03 PomBase SPCC338.17c FYPO:0000459 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0001232 PMID:10779336 4896 2018-03-02 PomBase SPCC338.17c FYPO:0005045 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000227 PMID:19948483 4896 2022-07-28 (Fig. 3) PomBase SPCC338.17c FYPO:0004412 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPCC320.13c) PMID:11554922 4896 2015-08-14 PomBase SPCC338.17c FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 10 PMID:18414064 4896 2015-12-21 PomBase SPCC338.17c FYPO:0005579 unknown Not assayed or wild type 972 h- rad21 rad21-K1 unknown ECO:0001232 FYECO:0000005 35 PMID:12526748 4896 2020-03-25 (Figure 1e) PomBase SPCC338.17c 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SPAC22A12.16 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0009070 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 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4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph acl2 acl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- acl2 acl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acl2 acl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22A12.16 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 acl2 acl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.02c FYPO:0005362 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 PMID:21965289 4896 2024-12-05 Whereas cells lacking Nsk1 displayed no defect in kinetochore retrieval, cells lacking either Dis2 or Dam1 were substantially impaired (Figure 8D). PomBase SPBC776.02c FYPO:0000141 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 PMID:21965289 4896 2024-12-03 Nevertheless, we found that both Δnsk1 and Δdis2 cells missegregate chromosome 1, and that this is exacerbated in Δnsk1 Δdis2 double mutants (Figure 1C). PomBase SPBC776.02c FYPO:0006020 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30282034 4896 2020-10-31 PomBase SPBC776.02c FYPO:0006020 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12),occurs_at(SO:0002213) PMID:29899453 4896 2018-07-17 Extended Data Fig 10 PomBase SPBC776.02c FYPO:0005726 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000049 PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Fig. 2b, c) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001045 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005801 PMID:30355770 4896 2023-04-17 (Fig. 2A) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001045 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000137 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:32546512 4896 2022-10-20 (Figure 4) PomBase SPBC776.02c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009092 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009073 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0007562 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000374 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002577 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC23C4.19) PMID:29899453 4896 2018-07-03 Extended Data Fig 6a,b ChIP-qPCR analysis at the rps17a+ gene. Comparison of pSpt5:Spt5 ratio in the indicated strains upstream and downstream of the CPS at 30 °C (left) and comparison of the ratio between dis2+ and dis2-11 cells at 18 °C (right). Extended Data Fig 6a,b PomBase SPBC776.02c FYPO:0000708 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000103,FYECO:0000127 PMID:32361273 4896 2020-10-05 (Fig. 1) PomBase SPBC776.02c FYPO:0000470 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000049 PMID:29852001 4896 2024-07-09 Table S2 PomBase SPBC776.02c FYPO:0004161 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPAC222.09) PMID:30282034 4896 2020-10-31 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005801 medium PMID:8389306 4896 2016-06-20 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001757 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000112 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.02c) PMID:29899453 4896 2018-07-17 (Fig. 1d) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001645 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c),assayed_using(PomBase:SPCC1795.01c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 3C) PomBase SPBC776.02c FYPO:0005727 deletion 972 h- nda3-KM311 dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000059 high PMID:36006032 4896 2023-01-17 (Figure 1D) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0004080 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000112 PMID:24945319 4896 2014-11-26 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001840 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000059 1 PMID:21965289 4896 2024-12-05 Nevertheless, the chromosome loss rate was considerably worse in Δnsk1 Δmad2 cells than in Δnsk1 single mutant (Table 1). PomBase SPBC776.02c FYPO:0007534 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000112 PMID:30282034 4896 2020-10-31 PomBase SPBC776.02c FYPO:0007534 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000226 PMID:30282034 4896 2020-10-31 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000836 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC4F6.12) PMID:34133210 4896 2021-07-11 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001327 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001571 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC3D6.04c),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 3C) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001571 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.06),assayed_using(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:27618268 4896 2018-01-15 (Fig. 3C) PomBase SPBC776.02c FYPO:0006614 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000226 PMID:30282034 4896 2020-10-31 PomBase SPBC776.02c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000324 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 low PMID:25472718 4896 2017-10-26 (Fig. 1C-E) PomBase SPBC776.02c FYPO:0000324 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 10 PMID:21965289 4896 2024-12-03 We found that both Δnsk1 and Δdis2 cells are delayed in the timing of anaphase onset and that this effect is exacerbated in Δnsk1 Δdis2 double mutants (Figure 1D). PomBase SPBC776.02c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPBC776.02c FYPO:0008380 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0000112 PMID:38971312 4896 2025-02-13 (Fig. 5E) PomBase SPBC776.02c FYPO:0001357 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 PMID:32282918 4896 2022-11-22 (Figure 1) PomBase SPBC776.02c FYPO:0006873 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC31H12.05c) PMID:17895368 4896 2015-01-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0007933 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001097 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000251 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000088 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000170 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009082 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0005889 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0000115 deletion 972 h- h- prototroph dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 dis2 dis2delta bws1delta|deltaPP1 deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22H10.03c FYPO:0003412 kap114::Tn-seq Not assayed or wild type 972 h- mat1M-smt0 his2 leu1-32 ura4-DSE ade6-210 otr1R:ura4 + Spr156 kap114 kap114::Tn-seq disruption ECO:0000049 FYECO:0000005,FYECO:0000217,FYECO:0000263,FYECO:0000367,FYECO:0000370 medium PMID:32101745 4896 2020-08-04 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001934 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000072 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001934 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000252 PMID:35657410 4896 2025-03-30 However, DFO could not enables growth of Δppr2 cells on glycerol medium, which requires mitochondrial respiration, suggesting that DFO could not rescue of the respiratory growth defect of Δppr2 cells (Fig. 1d) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001934 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000340 PMID:35657410 4896 2025-03-31 However, DFO could not enables growth of Δppr2 cells on glycerol medium, which requires mitochondrial respiration, suggesting that DFO could not rescue of the respiratory growth defect of Δppr2 cells (Fig. 1d) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001375 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1783.07c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 3.7. Sty1 and Pap1 accumulate in the nucleus during the stationary phase in Δppr2 cells PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009078 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000427 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000432 high PMID:38499131 4896 2024-12-12 We observed reduced growth of the ppr2 deletion mutant on glycerol- and galactose-containing media compared to on the glucose-containing media (Fig. 1A). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000251 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 PMID:21727087 4896 2011-08-03 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009100 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 high PMID:38499131 4896 2024-12-12 We observed reduced growth of the ppr2 deletion mutant on glycerol- and galactose-containing media compared to on the glucose-containing media (Fig. 1A). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000684 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:38499131 4896 2024-12-12 We observed reduced growth of the ppr2 deletion mutant on glycerol- and galactose-containing media compared to on the glucose-containing media (Fig. 1A). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009091 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002924 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000236 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009099 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000250 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001176 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000144 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000342 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000432 high PMID:38499131 4896 2024-12-06 respiration deficient: Glycerol is a carbon source that can be metabolized only through oxidative phosphorylation, producing ATP through the electron transport chain in the mitochondria. . Like other respiration-deficient mutants, the reduced growth rate of the ppr2 mutant on this medium indicates that it is not able to effectively carry out this process. PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000342 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000138 high PMID:38499131 4896 2024-12-06 respiration deficient: Glycerol is a carbon source that can be metabolized only through oxidative phosphorylation, producing ATP through the electron transport chain in the mitochondria. . Like other respiration-deficient mutants, the reduced growth rate of the ppr2 mutant on this medium indicates that it is not able to effectively carry out this process. PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003915 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 . Interestingly, deletion of ppr2 increased Gpx1 in cytosolic, whereas decreased Gpx1 in the mitochondria (Fig. 2A). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000835 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000835 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001324 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC140.01) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Sdh2 and Hem15 were downregulated at the protein levels in Δppr2 cells (Fig. 1B) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001324 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC320.09) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Sdh2 and Hem15 were downregulated at the protein levels in Δppr2 cells (Fig. 1B) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPRRNA.01) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000826 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.05) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC140.01) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Sdh2 and Hem15 were downregulated at the protein levels in Δppr2 cells (Fig. 1B) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001117 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000137 low assayed_transcript(PomBase:SPCC320.09) PMID:38499131 4896 2024-12-06 The results in our qRT-PCR analysis on the genes of hem15 showed to be slightly down-regulated and the expression of sdh2 was not significantly altered by deletion of ppr2 (Fig. S1). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001355 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008128 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000430 high PMID:37859837 4896 2023-10-30 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0005258 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002006 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:35657410 4896 2025-03-30 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0004164 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000137 PMID:38499131 4896 2024-12-06 The levels of ROS in Ppr2-deficient cells were significantly higher compared to WT cells (Fig. 4A). The ppr2 deletion mutant was sensitive to H2O2 during the stationary phase, whereas WT retained tolerance to H2O2 (Fig. 4B). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008397 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005580 PMID:35657410 4896 2025-03-30 Increased lipid peroxidation was detected in Δppr2 cells PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008399 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000123 PMID:35657410 4896 2025-03-30 Increased lipid peroxidation was detected in Δppr2 cells PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC1105.14) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC1486.01) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003914 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPCC965.07c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0004456 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 3.7. Sty1 and Pap1 accumulate in the nucleus during the stationary phase in Δppr2 cells PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008043 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 In Δppr2 cells, Php4-GFP was localized in the nucleus at time points from 6 h to 36 h, in iron-replete conditions. In wild-type strains, Php4-GFP was exported from the nucleus, exhibiting fluorescence in the cytoplasm of cells from 6hto36h(Fig. 2). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC4F6.09) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.07c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC227.13c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.03c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC8D2.15) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC1683.09c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F8.02c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPBC16E9.01c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPCC1020.03) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC1F12.10c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000825 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPAC24C9.06c) PMID:35657410 4896 2025-03-29 (Table 2) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPBC1105.14) PMID:38499131 4896 2024-12-12 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPAC22H10.13) PMID:38499131 4896 2024-12-12 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003991 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_transcript(PomBase:SPCC965.07c) PMID:38499131 4896 2024-12-12 We found that Rsv2, Zym1 and Gst2 were upregulated both at the mRNA and protein levels in Δppr2 cells in exponential phase (6 h after incubation) (Fig. 5). The protein levels of Sod2 was increased in Δppr2 cells but their mRNA levels were unchanged (Fig. 5). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0006847 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000137 assayed_protein(PomBase:SPBC32F12.03c) PMID:38499131 4896 2024-12-06 . Interestingly, deletion of ppr2 increased Gpx1 in cytosolic, whereas decreased Gpx1 in the mitochondria (Fig. 2A). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000245 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 medium PMID:35657410 4896 2025-03-30 As shown in Fig. 1a, Δppr2 cells progressively lost viability during growth in YES medium (Fig. 1a) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.01) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.10) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.11) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.07) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC16G5.14c) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000840 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPMIT.09) PMID:21727087 4896 2012-07-17 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001357 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 PMID:27886462 4896 2016-12-01 (Figure 1A) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001310 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000340 PMID:35657410 4896 2025-03-30 We found that DFO significantly increases the viability of Δppr2 cells (Fig. 1c). (normal compared to WT) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001884 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009081 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000077 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0005968 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002767 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000360 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000327 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000268 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001034 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000830 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001098 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:19264558 4896 2013-09-24 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009067 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000424 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0007921 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000407 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0001701 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000322 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000096 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000097 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0009080 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008396 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000281 PMID:35657410 4896 2025-03-30 + Fe2(SO4)3 Deletion of ppr2 also increased the sensitivity of cells to ferrous iron (Fe2+) and ferric iron (Fe3+) (Fig. 1b). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008395 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000186 PMID:35657410 4896 2025-03-30 Deletion of ppr2 also increased the sensitivity of cells to ferrous iron (Fe2+) and ferric iron (Fe3+) (Fig. 1b). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0008395 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000281 PMID:35657410 4896 2025-07-03 + Fe2(SO4)3 Deletion of ppr2 also increased the sensitivity of cells to ferrous iron (Fe2+) and ferric iron (Fe3+) (Fig. 1b). PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:18665268 4896 2013-12-16 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000087 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:38499131 4896 2024-12-06 (Figure 4) PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0000089 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0005252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000142,FYECO:0000201 medium PMID:26628015 4896 2016-02-02 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph ppr2 ppr2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- ppr2 ppr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr2 ppr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC18H10.11c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ppr2 ppr2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000444 269-815,L268LKPSLAMVIIVS Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-102 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005580 FYECO:0000004 PMID:15915339 4896 2015-01-13 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0001355 269-815,L268LKPSLAMVIIVS Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-102 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high PMID:15915339 4896 2015-01-13 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0001355 269-815,L268LKPSLAMVIIVS Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-102 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:15915339 4896 2015-01-13 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000455 269-815,L268LKPSLAMVIIVS Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-102 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0000337 FYECO:0000004 PMID:15915339 4896 2015-01-13 PomBase SPAPB1E7.02c FYPO:0000839 269-815,L268LKPSLAMVIIVS Not assayed or wild type 972 h- mcl1 mcl1-102 amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:15915339 4896 2015-01-13 PomBase SPBC1711.14 FYPO:0002485 unknown Not assayed or wild type 972 h- rec15 rec15-124 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In combination with ccq1 deletion, telomeres become unprotected and cells survive by circularizing chromosomes. Telomerase recruitment to telomeres is increased since Rad3/Tel1-dependent phosphorylation of Ccq1 Thr93, essential for promoting Ccq1-Est1 interaction and telomerase recruitment, is increased in tpz1-[1-485] cells. 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2021-02-12 PomBase SPAC644.14c FYPO:0005452 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000049 PMID:19798055 4896 2017-03-02 PomBase SPAC644.14c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph rad51 rad51delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC644.14c FYPO:0007424 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000059 low PMID:34292936 4896 2021-08-11 PomBase SPAC644.14c FYPO:0007424 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000337 PMID:32355220 4896 2020-06-27 PomBase SPAC644.14c FYPO:0004251 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000226 PMID:28475874 4896 2017-06-22 PomBase SPAC644.14c FYPO:0004891 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0001232 assayed_using(PR:000027551) PMID:15226425 4896 2015-09-15 PomBase SPAC644.14c FYPO:0003445 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 high high PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 1B PomBase SPAC644.14c FYPO:0005627 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000082,FYECO:0000137,FYECO:0000142,FYECO:0000199,FYECO:0000224,FYECO:0000225,FYECO:0000226 high high PMID:26652183 4896 2016-08-17 Fig. 3F, Fig. S6 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001740 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000049 high PMID:37237082 4896 2023-06-13 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001740 deletion 972 h- mat2-3delta rad51 rad51delta deletion ECO:0000049 high PMID:30652128 4896 2019-01-30 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001740 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000337 PMID:23093942 4896 2014-07-21 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001742 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000059 high PMID:34292936 4896 2021-08-11 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001742 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000049 high PMID:37237082 4896 2023-06-13 PomBase SPAC644.14c FYPO:0001742 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0000337 PMID:27697832 4896 2016-11-02 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Fig. 2A. Further observation of the germinating spores showed that the mutated h90 cells elongated and eventually divided, but never formed visible colonies (data not shown). 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2024-07-12 rhp22AD, rhp51D and rhp54D mutants do not form colonies in the wild-type h90 strain, as already shown for rhp22AD, although they are viable in mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 backgrounds. PomBase SPAC644.14c FYPO:0003612 deletion 972 h- mat1-Pdelta17 rad51 rad51delta deletion ECO:0005638 PMID:18388861 4896 2024-07-12 rhp22AD, rhp51D and rhp54D mutants do not form colonies in the wild-type h90 strain, as already shown for rhp22AD, although they are viable in mat1-Msmt-0 and mat1-PD17 backgrounds. Fig. 2A PomBase SPAC644.14c FYPO:0001491 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPAC644.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC644.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 rad51 rad51delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC644.14c FYPO:0002060 deletion 972 h- rad51 rad51delta deletion ECO:0005638 PMID:12724426 4896 2013-05-02 PomBase SPBC1A4.03c FYPO:0002060 2-75,M1MPKKKRKV Not assayed or wild type 972 h- top2 top2-1-74/SV amino_acid_insertion_and_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 PMID:1332977 4896 2016-07-05 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0005366 deletion 972 h- duo1 duo1delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC589.08c) PMID:22375062 4896 2016-04-06 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion 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2023-06-28 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0003938 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0009077 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000428 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0005261 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000432 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC32F12.08c FYPO:0009028 deletion 972 h- h- prototroph duo1 duo1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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FYPO:0000703 1-700,951-1038 Not assayed or wild type 972 h- rng10 rng10(751-950) partial_amino_acid_deletion ECO:0006030 assayed_using(PomBase:SPAC688.07c),assayed_using(PomBase:SPBC23G7.08c) PMID:30840879 4896 2019-06-30 (Fig. 1F) PomBase SPBC428.16c FYPO:0001671 N153T Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-N153T rhb1-RD3R-4 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001571 N153T Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-N153T rhb1-RD3R-4 amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC216.07c),assayed_using(PomBase:SPBC428.16c) PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001164 N153T Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-N153T rhb1-RD3R-4 amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:16262791 4896 2012-09-07 PomBase SPBC428.16c FYPO:0001527 N153T Not assayed or wild type 972 h- rhb1 rhb1-N153T rhb1-RD3R-4 amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:16262791 4896 2012-09-27 PomBase 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or wild type 972 h- ura4-D18 leu1-32 ade6-704 srp7 srp7-G149A nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:1315954 4896 2014-06-09 PomBase SPBC29B5.01 FYPO:0000087 S2A,S4A,T77I,S140A,S152A,S172A,T204I,T216I,S226A,T249I,S438A Overexpression 972 h- atf1 atf1-11M-T77I atf1-11M|atf1.11M amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000078 PMID:28652406 4896 2020-04-06 the HA-Atf1.1M mutant was fully able to suppress the sensitivity to peroxides of strain Δatf1, expression of the HA-Atf1.10M and 11M mutants did not alleviate this phenotype (supplemental Fig. S1C). PomBase SPBC1539.08 FYPO:0006326 11-17 Not assayed or wild type 972 h- arf6 arf6-K11-F17 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC1539.08) PMID:34958661 4896 2022-06-30 The resulting arf6 alleles reduced node localization and instead enriched at the cytoplasm (Fig. S2, H and I) PomBase SPBC1539.08 FYPO:0006326 11-17 Not assayed or wild type 972 h- arf6 arf6-K11-F17 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC4B3.15) PMID:34958661 4896 2022-06-30 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005181 Q279A,LRQSS282AAAAA,R290A,RKK292AAA Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP301A10 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPBC428.18 FYPO:0005195 Q279A,LRQSS282AAAAA,R290A,RKK292AAA Not assayed or wild type 972 h- cdt1 cdt1-PIP301A10 amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC428.18) PMID:21493688 4896 2016-01-18 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0009053 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sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0009034 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000176 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0001103 deletion 972 h- sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 high PMID:19672306 4896 2013-12-18 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0006680 deletion 972 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prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0001214 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0000797 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sib2 sib2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- sib2 sib2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sib2 sib2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC23G3.03 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sib2 sib2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC977.10 FYPO:0002674 I371A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-I371A amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0001719 I371A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-I371A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 high PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC977.10 FYPO:0005889 I371A Not assayed or wild type 972 h- nhe1 nhe1-I371A amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 low PMID:29038548 4896 2018-10-30 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007721 I133A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-I133A stx8(I133A)|fsv1-I133A amino_acid_mutation ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0005489 I133A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-I133A stx8(I133A)|fsv1-I133A amino_acid_mutation ECO:0001232 high high assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 The mutant protein is observed at the vacuolar surface PomBase SPAC14C4.14 FYPO:0001984 Q200* Knockdown 972 h- atp1 atp1-A2313 atp1-A23.13 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 PMID:15282184 4896 2024-03-13 PomBase SPBC336.10c FYPO:0004487 wild type Overexpression 972 h- tif512 tif512+ wild_type ECO:0000337 assayed_using(PomBase:SPBC336.10c) PMID:18292091 4896 2015-03-02 PomBase SPBC409.07c FYPO:0004173 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002446 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC24B11.06c) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002287 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002287 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0002287 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPAC19D5.01) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC215.05) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0001116 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPCC757.07c) PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPBC409.07c FYPO:0000674 S469A,S471A,T473A Overexpression 972 h- wis1 wis1-AAA amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:9718372 4896 2014-02-20 PomBase SPAC110.02 FYPO:0000705 P84A,D85A,P87A Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-him amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPAC110.02),assayed_using(PomBase:SPBC428.17c) PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 4b) PomBase SPAC110.02 FYPO:0006598 P84A,D85A,P87A Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-him amino_acid_mutation ECO:0006030 high assayed_using(PomBase:SPAC23C4.03) PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. 2B) PomBase SPAC110.02 FYPO:0002093 P84A,D85A,P87A Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-him amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:28343969 4896 2018-06-25 (Fig. S4A) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000460 P84A,D85A,P87A Not 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P84A,D85A,P87A Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-him amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000006 medium PMID:28343969 4896 2018-06-24 (Fig. 2C, 2D, 2G) PomBase SPAC110.02 FYPO:0000091 P84A,D85A,P87A Not assayed or wild type 972 h- pds5 pds5-him amino_acid_mutation ECO:0005638 low PMID:28343969 4896 2018-06-25 PomBase SPCC553.01c FYPO:0000031 deletion 972 h- dbl2 dbl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 90 PMID:29259000 4896 2018-01-10 PomBase SPCC553.01c FYPO:0001946 deletion 972 h- dbl2 dbl2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005 3 PMID:27304859 4896 2018-03-01 PomBase SPCC553.01c FYPO:0000080 deletion 972 h- h- prototroph dbl2 dbl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000006,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.01c FYPO:0003743 deletion 972 h- h- prototroph dbl2 dbl2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC553.01c FYPO:0009075 deletion 972 h- h- prototroph dbl2 dbl2delta deletion 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2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001269 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC409.04c) PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001269 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC3G9.01) PMID:22065639 4896 2013-09-05 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001269 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAPB17E12.06) PMID:22711988 4896 2012-07-27 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001269 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.03) PMID:16855021 4896 2014-12-17 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001978 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17442892 4896 2014-12-19 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001270 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000082 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000102,FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0008165 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 medium assayed_protein(PomBase:SPCC1322.12c) PMID:22660415 4896 2016-07-19 (Fig. 1B) This Bub1 enrichment is diminished in the spc7-23 mutant at a restrictive temperature24 (Fig. 1b). PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002902 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1783.03) PMID:16855021 4896 2014-12-17 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001355 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0001272 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002638 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0000847 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPCC1020.02) PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002061 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Supplemental Figure 2B) PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002901 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC336.08) PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0002901 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC27F1.04c) PMID:17442892 4896 2014-12-18 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003305 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17442892 4896 2014-12-19 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0004236 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:17442892 4896 2014-12-19 PomBase SPCC1020.02 FYPO:0003241 T3887G,G4079T Not assayed or wild type 972 h- spc7 spc7-23 nucleotide_mutation ECO:0001232 PMID:24497846 4896 2014-03-25 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0000583 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo5 spo5-B37 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC29A10.02 FYPO:0000478 unknown Not assayed or wild type 972 h- spo5 spo5-B37 unknown ECO:0001232 PMID:3442824 4896 2013-02-05 PomBase SPBC1105.17 FYPO:0003241 P15A Not assayed or wild type 972 h- cnp1 cnp1-P15A amino_acid_mutation ECO:0001232 15.7 PMID:29194511 4896 2018-05-03 (Fig. 1b, C, 3H) PomBase SPBC582.03 FYPO:0000532 1-90 Overexpression 972 h- cdc13 cdc13delta90 cdc13-delta90 partial_amino_acid_deletion ECO:0005580 PMID:9034336 4896 2014-11-25 PomBase SPCC338.08 FYPO:0000658 R214A Not assayed or wild type 972 h- ctp1 ctp1-R214A amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:25580577 4896 2017-04-12 PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0002243 CTD-S5A(r5-r11),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-(S5A)7(S5)7(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0005801 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_enzyme(PomBase:SPBP4G3.02) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 2) PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0002050 wild type Overexpression 972 h- nuc2 nuc2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7622618 4896 2013-07-18 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001355 wild type Overexpression 972 h- nuc2 nuc2+ wild_type ECO:0005638 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001400 wild type Overexpression 972 h- nuc2 nuc2+ wild_type ECO:0001232 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0001399 wild type Overexpression 972 h- nuc2 nuc2+ wild_type ECO:0001232 PMID:7622618 4896 2013-03-13 PomBase SPAC17C9.01c FYPO:0002051 wild type Overexpression 972 h- nuc2 nuc2+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:7622618 4896 2013-07-18 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0006330 deletion 972 h- sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000248 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Figure 4, S4B). PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0007273 deletion 972 h- sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:32023460 4896 2020-02-22 (Fig. 2) increased cortical ER remodeling dynamics PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0007273 deletion 972 h- sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 PMID:32023460 4896 2024-03-29 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0000067 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000319 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0009084 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0007924 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0003656 deletion 972 h- h- prototroph sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0001777 deletion 972 h- sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 PMID:22869600 4896 2012-11-22 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC1A6.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 sle1 sle1delta SPAC1A6.07delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007725 E136A Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8-E136A stx8(E136A)|fsv1-E136A amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC6F12.03c) PMID:33788833 4896 2021-04-20 PomBase SPNCRNA.1415 FYPO:0009009 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1415 SPNCRNA.1415+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000331 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1415 FYPO:0005258 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1415 SPNCRNA.1415+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000004 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1415 FYPO:0009024 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1415 SPNCRNA.1415+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000416 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1415 FYPO:0009028 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1415 SPNCRNA.1415+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000246 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1415 FYPO:0001029 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1415 SPNCRNA.1415+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000408 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPNCRNA.1415 FYPO:0002578 wild type Overexpression 972 h- SPNCRNA.1415 SPNCRNA.1415+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000170 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0005282 488-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1delta488-560 lumenal_cnx1p partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:19606215 4896 2016-02-10 PomBase SPAC3C7.11c FYPO:0002060 488-560 Not assayed or wild type 972 h- cnx1 cnx1delta488-560 lumenal_cnx1p partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:7621821 4896 2014-08-04 PomBase SPBC1D7.05 FYPO:0000705 L46Q,R69C Not assayed or wild type 972 h- byr2 byr2-FBS-3 byr2FBS-3 amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(PomBase:SPAC1565.04c),assayed_using(PomBase:SPBC1D7.05) PMID:9315645 4896 2018-04-29 PomBase SPBC32H8.11 FYPO:0002817 unknown Not assayed or wild type 972 h- mei4 mei4- unknown ECO:0001232 PMID:3861929 4896 2014-04-04 PomBase SPBC1685.01 FYPO:0001117 A1014T Not assayed or wild type 972 h- pmp1 pmp1-M2 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPBC1685.01 FYPO:0001164 A1014T Not assayed or wild type 972 h- pmp1 pmp1-M2 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002021 Q61L Overexpression 972 h- cdc42 cdc42-Q61L amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPAC110.03 FYPO:0002060 Q61L Overexpression 972 h- cdc42 cdc42-Q61L amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:8846783 4896 2015-03-30 PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0008197 97-105 Not assayed or wild type 972 h- hva22 rop1delta97-105 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 high PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 5B) PomBase SPBC30D10.09c FYPO:0000843 97-105 Not assayed or wild type 972 h- hva22 rop1delta97-105 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000341 medium PMID:37553386 4896 2024-04-05 (Fig. 5A) PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000705 1-159,274-372 Overexpression 972 h- cdc27 cdc27(160-273) partial_amino_acid_deletion ECO:0000337 FYECO:0000005 assayed_using(PomBase:SPBC16D10.09),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:10698951 4896 2015-04-30 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0001418 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 orb11- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0002021 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 orb11- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPCC1840.02c FYPO:0004103 unknown Not assayed or wild type 972 h- bgs4 orb11- unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:8522609 4896 2014-12-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000103 PMID:29844133 4896 2018-07-03 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001407 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000126 PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27918601 4896 2017-03-08 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0004201 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 PMID:21436456 4896 2024-01-15 Indeed, mlo3Δ caused severe reduction in the levels of centromeric siRNAs (Fig. 1D). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006810 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000049 PMID:30652128 4896 2019-01-26 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000884 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000890 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001355 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 PMID:15990877 4896 2015-03-11 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003557 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.5580) PMID:21436456 4896 2024-01-15 Mlo3 is required for suppression of antisense RNAs targeted by Clr4 and by the exosome. (A) Strand-specific RTPCR of RNA isolated from WT and mlo3Δ PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003557 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.5527) PMID:21436456 4896 2024-01-15 Mlo3 is required for suppression of antisense RNAs targeted by Clr4 and by the exosome. (A) Strand-specific RTPCR of RNA isolated from WT and mlo3Δ PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003557 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000291 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.2244) PMID:21436456 4896 2024-01-15 Mlo3 is required for suppression of antisense RNAs targeted by Clr4 and by the exosome. (A) Strand-specific RTPCR of RNA isolated from WT and mlo3Δ PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0005522 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 PMID:21436456 4896 2024-01-15 However, mlo3Δ resulted in a considerable increase in the levels of centromeric repeat transcripts, although to a lesser extent than in clr4Δ (Fig. 1B). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000887 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001840 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000049 low PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006926 deletion 972 h- kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1A, 1B) PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006926 deletion 972 h- cdc25-22, kanr cut11+:GFP:ura4+ ura4-D18 leu1-32 ade6 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137,FYECO:0000229 PMID:28545058 4896 2019-06-20 (Fig. 1D) PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0005523 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 medium PMID:21436456 4896 2024-01-15 However, mlo3Δ resulted in a considerable increase in the levels of centromeric repeat transcripts, although to a lesser extent than in clr4Δ (Fig. 1B). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0005523 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 high PMID:21436456 4896 2024-01-15 However, mlo3Δ resulted in a considerable increase in the levels of centromeric repeat transcripts, although to a lesser extent than in clr4Δ (Fig. 1B). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000252 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006109 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000231 PMID:28404620 4896 2017-05-24 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001309 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000137 PMID:35820914 4896 2024-12-31 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006992 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000049 PMID:21892171 4896 2024-01-16 (Fig. 1a). PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000980 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006817 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003574 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0006816 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0003575 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000862 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 PMID:21436456 4896 2024-01-15 (Figure S3) mlo3∆ cells maintain H3K9me2 and Swi6 localization at centromeres, mating type locus and subtelomeric loci PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000863 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002359 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 PMID:21436456 4896 2024-01-15 (Figure S3) mlo3∆ cells maintain H3K9me2 and Swi6 localization at centromeres, mating type locus and subtelomeric loci PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001509 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0006030 assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:21436456 4896 2024-01-15 (Figure S3) mlo3∆ cells maintain H3K9me2 and Swi6 localization at centromeres, mating type locus and subtelomeric loci PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002389 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPBC28F2.12) PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001317 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC32H8.11) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001317 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC29A10.14) PMID:23658229 4896 2013-05-14 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000095 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000085 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000089 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002641 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:23738021 4896 2013-11-29 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000091 deletion 972 h- mat2-3delta mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:30652128 4896 2019-02-04 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210/M216 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000336 FYECO:0000005,FYECO:0000137 medium PMID:20537132 4896 2015-02-18 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0000268 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23173672 4896 2014-03-07 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002239 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0000337 medium PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002112 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mlo3 mlo3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000137 high low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC1D7.04 FYPO:0002060 deletion 972 h- mlo3 mlo3delta deletion ECO:0001232 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amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2300054 4896 2014-06-18 PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0000280 E229K Not assayed or wild type 972 h- byr1 byr1-E229K amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:2300054 4896 2014-06-18 PomBase SPAC1D4.13 FYPO:0002177 E229K Not assayed or wild type 972 h- byr1 byr1-E229K amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:2300054 4896 2014-06-18 PomBase SPCC1281.03c FYPO:0000096 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc4 emc4delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000137 low PMID:18684775 4896 2013-09-24 PomBase SPCC1281.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- emc4 emc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1281.03c FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc4 emc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1281.03c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 emc4 emc4delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0002780 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005580 PMID:18182845 4896 2013-10-10 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0002143 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005580 PMID:18182845 4896 2013-10-10 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0000636 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005638 PMID:16175211 4896 2014-11-06 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0003965 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005801 PMID:16175211 4896 2014-11-06 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0002014 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1683.10c) PMID:21531205 4896 2014-10-27 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0000825 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0000291 FYECO:0000186 assayed_using(PomBase:SPAC1F7.08) PMID:21531205 4896 2014-10-27 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0001309 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005638 PMID:33064911 4896 2020-10-27 PomBase SPBC26H8.06 FYPO:0001164 wild type Overexpression 972 h- grx4 grx4+ wild_type ECO:0005638 FYECO:0000126 PMID:15796926 4896 2014-08-06 PomBase SPCC297.04c FYPO:0006858 Y115A Not assayed or wild type 972 h- set7 set7-Y115A amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:30773398 4896 2019-04-13 (Figure S2) PomBase SPBC800.06 FYPO:0002420 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brx1 brx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.06 FYPO:0002423 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brx1 brx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC800.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- brx1 brx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC800.06 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 brx1 brx1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000468 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000337 medium PMID:35908934 4896 2025-03-27 (Fig. 2A, Fig. 4A) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000059 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shf1 shf1delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0002922 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000112 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Figure 2b) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0002922 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000112 PMID:38718864 4896 2025-07-08 (Fig. 8D, 8E) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000082 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7G) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0003912 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000049 85 PMID:38718864 4896 2025-07-08 HR frequency goes from 20% in WT to 3% in mutant (Fig. 7I) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0002355 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000226 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 5C) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shf1 shf1delta deletion ECO:0000221 FYECO:0000015 PMID:23950735 4896 2013-09-01 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000708 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2B) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0001324 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000112 low assayed_protein(PomBase:SPCC306.04c) PMID:25356590 4896 2024-06-28 (Fig. 4C) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0003573 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000226 high assayed_protein(PomBase:SPAC664.01c) PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 5B) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0001355 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005 low PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7G) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0001122 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0001232 high PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Fig. 1D) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0006299 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000049 PMID:17363370 4896 2021-09-13 (Figure 2d) Δrhp6 resulted in enhanced silencing of the otr1::ura4+, as shown by reduced growth on medium lacking uracil (Fig. 2D) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000238 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-28 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 shf1 shf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 high PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0006660 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 PMID:30116786 4896 2018-08-23 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0002336 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000049 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 6B) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0007553 deletion 972 h- mat1-M smt-0 shf1 shf1delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-11 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000969 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 2D) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0008364 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0000226 PMID:35908934 4896 2025-03-31 (Fig. 5D) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0006986 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 PMID:26518661 4896 2019-07-23 (Figure 2) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0004325 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 PMID:25483073 4896 2015-01-20 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000095 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-23 (Fig. 7G) PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0001701 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:21760946 4896 2013-12-19 PomBase SPAC22F8.12c FYPO:0000785 deletion 972 h- shf1 shf1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 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ECO:0001232 FYECO:0000127 28 PMID:29453312 4896 2018-03-22 ras1 mutant cells undergo precocious fusion resulting in cell lysis PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0006011 G17V Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-val17 ras1-G17V|ras1-V12|ras1-V17 amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:24147005 4896 2018-04-29 PomBase SPAC17H9.09c FYPO:0000022 G17V Not assayed or wild type 972 h- ras1 ras1-val17 ras1-G17V|ras1-V12|ras1-V17 amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000015 PMID:2107403 4896 2013-02-14 PomBase SPBC660.08 FYPO:0006295 deletion 972 h- atg38 atg38delta deletion ECO:0000112 FYECO:0000127 PMID:31941401 4896 2020-02-20 (Figure 1B) PomBase SPBC660.08 FYPO:0006295 deletion 972 h- atg38 atg38delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000127 PMID:31941401 4896 2020-02-25 (Figure 2A) PomBase SPBC660.08 FYPO:0006295 deletion 972 h- atg38 atg38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000127 PMID:31941401 4896 2020-02-25 PomBase SPBC660.08 FYPO:0000674 deletion 972 h- atg38 atg38delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000004,FYECO:0000137 PMID:31941401 4896 2020-02-21 (Fig. S2) PomBase SPBC660.08 FYPO:0006266 deletion 972 h- atg38 atg38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000137 PMID:31941401 4896 2020-02-21 (Fig. S2) PomBase SPBC660.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- atg38 atg38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg38 atg38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC660.08 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 atg38 atg38delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0003919 610-1101 Not assayed or wild type 972 h- gef2 gef2(1-609) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC12B10.10) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPAC31A2.16 FYPO:0003919 610-1101 Not assayed or wild type 972 h- gef2 gef2(1-609) partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC31A2.16) PMID:23966468 4896 2014-10-23 PomBase SPBC1539.04 FYPO:0003783 R208I,R210I Not assayed or wild type 972 h- tts1 tts1-2RI amino_acid_mutation ECO:0001232 PMID:25103238 4896 2014-09-04 PomBase SPBC1539.04 FYPO:0003778 R208I,R210I Not assayed or wild type 972 h- tts1 tts1-2RI amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC1539.04) PMID:25103238 4896 2014-09-03 PomBase SPBC776.10c FYPO:0001042 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog6 cog6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 low PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.10c FYPO:0000313 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog6 cog6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPBC776.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- cog6 cog6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPBC776.10c FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 cog6 cog6delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC584.02 FYPO:0001093 R19Q Not assayed or wild type 972 h- cuf2 cuf2-R19Q sms5-1 amino_acid_mutation ECO:0000226 assayed_using(PomBase:SPCC584.02) PMID:23628763 4896 2019-10-11 (Fig. 3c) PomBase SPCC584.02 FYPO:0003451 R19Q Not assayed or wild type 972 h- cuf2 cuf2-R19Q sms5-1 amino_acid_mutation ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPCC584.02) PMID:23628763 4896 2019-10-11 (Fig. 3c) PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0004604 L188R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-L188R amino_acid_mutation ECO:0000049 FYECO:0000005 low PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC19G12.13c FYPO:0002687 L188R Not assayed or wild type 972 h- poz1 poz1-L188R amino_acid_mutation ECO:0000337 PMID:24240238 4896 2015-07-29 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002446 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000223 assayed_using(PomBase:SPBC29B5.01) PMID:20075862 4896 2016-07-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0002376 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207,FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-11-01 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000998 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000127,FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27746023 4896 2020-11-17 . Although many mutants in the SAPK pathway have defects in mating and meiosis, this result may help to explain why sty1D and wis1D mutants in particular continue to elongate upon N starvation, unlike other mutants in the pathway PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001327 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0000112 FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPCC895.05) PMID:32915139 4896 2020-10-15 (Fig. 5c) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007527 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27746023 4896 2020-11-26 Movie S4. Sty1 activity is critical for maintaining a non-polarized Cdc42 module in N-starved quiescent cells. PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006634 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000338 PMID:27746023 4896 2020-11-17 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0000245 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000223 PMID:20075862 4896 2016-07-07 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0006724 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000207 assayed_using(PomBase:SPAC644.06c) PMID:28924043 4896 2018-11-02 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007451 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC22H10.07) PMID:27746023 4896 2020-11-17 (Figure 2C) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007451 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27746023 4896 2020-11-17 (Figure 2C) PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0007451 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000338 assayed_using(PomBase:SPAC110.03) PMID:27746023 4896 2020-11-17 Movie S4. Sty1 activity is critical for maintaining a non-polarized Cdc42 module in N-starved quiescent cells. PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0004513 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0001232 FYECO:0000248,FYECO:0000338 PMID:32915139 4896 2020-10-15 PomBase SPAC24B11.06c FYPO:0001408 T97A Not assayed or wild type 972 h- sty1 sty1-T97A as2-equivalent|sty1-as amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000223 PMID:20075862 4896 2016-07-07 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0000087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC27E2.14 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph SPAC27E2.14 SPAC27E2.14delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC11D3.13 FYPO:0000383 deletion 972 h- hsp3104 hsp3104delta deletion ECO:0000049 PMID:26624998 4896 2016-01-28 PomBase SPAC11D3.13 FYPO:0009052 deletion 972 h- h- prototroph hsp3104 hsp3104delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000263 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase 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PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4C) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0000826 CTD-S7E(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S7E(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000291 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPBC8E4.01c) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. 4A) PomBase SPBC28F2.12 FYPO:0001890 CTD-S7E(r5-r18),∆(r19-r29) Not assayed or wild type 972 h- rpb1 rpb1-S7E(CTD-18repeats) amino_acid_deletion_and_mutation ECO:0000231 FYECO:0000005,FYECO:0000263 assayed_transcript(PomBase:SPNCRNA.1712) PMID:26264592 4896 2024-02-27 (Fig. S2) PomBase SPBC19C2.02 FYPO:0001769 wild type Overexpression 972 h- pmt1 pmt1+ wild_type ECO:0000337 PMID:23074192 4896 2012-11-16 PomBase SPAC3A12.03c FYPO:0003358 wild type Overexpression 972 h- h- leu1-32 ura4-D18 pmd1::hisG bfr1::ura4+ DBAP meu34 meu34+ wild_type ECO:0005638 PMID:21340088 4896 2014-09-30 PomBase SPAC6F12.03c FYPO:0007725 188-224 Not assayed or wild type 972 h- fsv1 stx8delta188-224 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or wild type 972 h- htb1 htb1-E112K amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1A) PomBase SPCC622.09 FYPO:0003670 E113K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E112K amino_acid_mutation ECO:0005638 medium PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0002344 E113K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E112K amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000091 E113K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E112K amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPCC622.09 FYPO:0000268 E113K Not assayed or wild type 972 h- htb1 htb1-E112K amino_acid_mutation ECO:0005638 high PMID:38718864 4896 2025-05-21 (Fig. 1B) PomBase SPBC1734.02c FYPO:0000703 322-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-322-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC27E2.05),assayed_using(PomBase:SPBC1734.02c) PMID:12124382 4896 2015-05-11 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0001492 322-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-322-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPBC1734.02c FYPO:0002060 322-372 Not assayed or wild type 972 h- cdc27 cdc27-322-372 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:12124382 4896 2015-05-07 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0002019 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0000337 low PMID:20625380 4896 2014-08-19 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0009098 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000433 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0001453 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC1687.07 FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph SPAC1687.07 SPAC1687.07delta 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the absence of cdk11 had no effect (Figure 1F). 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type Overexpression 972 h- mph1 mph1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000079 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Fig. 1A) PomBase SPBC106.01 FYPO:0005735 wild type Overexpression 972 h- mph1 mph1+ wild_type ECO:0001232 FYECO:0000079 medium assayed_using(PomBase:SPBC776.02c) PMID:21664573 4896 2016-10-18 (Fig. 1A) PomBase SPBC106.01 FYPO:0002061 wild type Overexpression 972 h- mph1 mph1+ wild_type ECO:0005638 PMID:22184248 4896 2019-07-11 (Fig. 1a) PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0000763 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000175 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0009087 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0009043 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000207 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0009089 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000166,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC24H6.11c FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph vsb1 vsb1delta 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SPAC3C7.02c FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 pil2 pil2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC630.12 FYPO:0000311 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ted2 ted2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC630.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- ted2 ted2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPAC630.12 FYPO:0002061 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 ted2 ted2delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0005542 TTTT1065AAAA Overexpression 972 h- ter1 ter1-STEloop nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:26305931 4896 2016-07-20 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0004914 TTTT1065AAAA Overexpression 972 h- ter1 ter1-STEloop nucleotide_mutation ECO:0000059 PMID:26305931 4896 2016-07-15 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003803 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assayed_using(PomBase:SPNCRNA.214) PMID:26305931 4896 2016-07-20 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0005537 TTTT1065AAAA Overexpression 972 h- ter1 ter1-STEloop nucleotide_mutation ECO:0000112 PMID:26305931 4896 2016-07-20 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0005538 TTTT1065AAAA Overexpression 972 h- ter1 ter1-STEloop nucleotide_mutation ECO:0000112 PMID:26305931 4896 2016-07-20 PomBase SPNCRNA.214 FYPO:0003106 TTTT1065AAAA Overexpression 972 h- ter1 ter1-STEloop nucleotide_mutation ECO:0000337 PMID:26305931 4896 2016-07-15 PomBase SPAC22F3.12c FYPO:0003770 wild type Overexpression 972 h- rgs1 rgs1+ wild_type ECO:0000049 PMID:10417652 4896 2015-04-24 PomBase SPCC188.02 FYPO:0001645 G367V Not assayed or wild type 972 h- par1 par1-G367V amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.02c),assayed_using(PomBase:SPCC188.02) PMID:25487150 4896 2015-12-04 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0000251 deletion 972 h- H1::hygr mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000148 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0000684 deletion 972 h- H1::hygr mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000138 medium PMID:27887640 4896 2017-03-08 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007222 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000112 PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC23C11.08) PMID:39747188 4896 2025-06-23 we investigated the dis- tribution of Php3 and Moc3 in cells devoid of both Gcn5, a subunit of the SAGA complex, and Mst2, a MYST acetyltransferase. Interestingly, we found that in those cells, both TFs can still localize to cenH and dh heterochromatic repeat elements, albeit with a slight reduction (Sup- plementary Fig. 4d, e). PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0002386 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000226 low assayed_protein(PomBase:SPAC821.07c) PMID:39747188 4896 2025-06-23 we investigated the dis- tribution of Php3 and Moc3 in cells devoid of both Gcn5, a subunit of the SAGA complex, and Mst2, a MYST acetyltransferase. Interestingly, we found that in those cells, both TFs can still localize to cenH and dh heterochromatic repeat elements, albeit with a slight reduction (Sup- plementary Fig. 4d, e). PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004541 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004542 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000231 FYECO:0000005 PMID:34731638 4896 2021-11-24 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0000873 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000226 PMID:25774602 4896 2015-07-23 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004749 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000226 PMID:25774602 4896 2015-07-23 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0006518 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 low PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0004765 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000081,FYECO:0000102 PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 3c) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007553 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0001232 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007553 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 PMID:27738016 4896 2021-01-29 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007221 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000112 PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0007220 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000112 PMID:31260531 4896 2020-01-08 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0003362 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAC1486.01) PMID:21295010 4896 2014-05-12 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0003214 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPCC74.03c) PMID:28600551 4896 2018-10-25 (Fig. 2a) PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0002634 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000201 medium PMID:22806344 4896 2013-09-06 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0000088 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 mst2 mst2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000137 medium PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPAC17G8.13c FYPO:0002060 deletion 972 h- mst2 mst2delta deletion ECO:0001232 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2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.16 FYPO:0009071 deletion 972 h- h- prototroph dpc13 dpc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000431 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.16 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph dpc13 dpc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.16 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dpc13 dpc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.16 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph dpc13 dpc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.16 FYPO:0009088 deletion 972 h- h- prototroph dpc13 dpc13delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000167,FYECO:0000214 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAPB1A10.16 FYPO:0009090 deletion 972 h- h- prototroph dpc13 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deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20519959 4896 2021-10-13 PomBase SPAC694.06c FYPO:0007478 M755A,F758A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A amino_acid_mutation ECO:0000049 low PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4C, Fig. S4G) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007158 M755A,F758A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4B) PomBase SPAC694.06c FYPO:0007159 M755A,F758A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A amino_acid_mutation ECO:0006030 high PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4B) PomBase SPAC694.06c FYPO:0000963 M755A,F758A Not assayed or wild type 972 h- mrc1 mrc1-M755A,F758A amino_acid_mutation ECO:0005638 PMID:39094570 4896 2025-09-02 (Fig. 4C) PomBase SPCC1672.02c FYPO:0000655 I85V Not assayed or wild type 972 h- sap1 sap1-I85V amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_using(SO:0001864) PMID:8065904 4896 2014-08-22 PomBase SPAC3C7.08c FYPO:0001164 821-871 Not assayed or wild type 972 h- elf1 elf1-CDdelta partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 PMID:29844133 4896 2018-07-05 PomBase SPBC1685.01 FYPO:0001164 A1021T Not assayed or wild type 972 h- pmp1 pmp1-M3 nucleotide_mutation ECO:0005638 FYECO:0000102,FYECO:0000201 PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPBC1685.01 FYPO:0001317 A1021T Not assayed or wild type 972 h- pmp1 pmp1-M3 nucleotide_mutation ECO:0000291 assayed_using(PomBase:SPBC1685.01) PMID:12931193 4896 2013-05-07 PomBase SPBC19G7.13 FYPO:0008358 T104A Not assayed or wild type 972 h- tbf1 tbf1-T104A amino_acid_mutation ECO:0000059 assayed_protein(PomBase:SPBC19G7.13) PMID:38677290 4896 2024-12-13 Furthermore, we found that all S100A, T104A, and N107A mutant proteins formed aggregation easily during concentration in our purification process, indicating that these three mutations also resulted in protein instability of spTbf1TRFH PomBase SPNCRNA.934 FYPO:0006634 deletion 972 h- SPNCRNA.934 SPNCRNA.934delta deletion ECO:0001232 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wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0005580 PMID:10888871 4896 2014-09-02 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0003165 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 low PMID:7723827 4896 2015-09-29 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0002577 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPAC14C4.13) PMID:11313455 4896 2016-02-18 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0001838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000059 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8319772 4896 2016-07-22 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0002676 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000335 FYECO:0000004 PMID:6273154 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000950 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 PMID:7768995 4896 2014-05-19 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0002675 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000335 FYECO:0000004 PMID:6273154 4896 2013-09-05 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0004966 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000229 PMID:25492408 4896 2015-10-16 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000455 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 low PMID:18180284 4896 2015-11-27 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000972 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 medium PMID:18180284 4896 2015-11-19 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0001327 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPAPB2B4.03) PMID:8657126 4896 2014-06-11 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0004353 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0005801 FYECO:0000004 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:9572736 4896 2024-04-11 (Fig. 1C) PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000839 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000229 PMID:6943408 4896 2014-06-30 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0006286 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7796804 4896 2017-10-26 Fig 5C the cyclin cdc13 cdc2 complex are detected when cells are blocked at G1/S with cdc20-M45 mutant, complex precipitated with p13 beads PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0004083 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000112 FYECO:0000004,FYECO:0000229 assayed_using(PomBase:SPBC582.03) PMID:7796804 4896 2017-07-05 (Fig. 5B) PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPAC1B2.05) PMID:8838655 4896 2012-06-08 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000838 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004 assayed_using(PomBase:SPBC4.04c) PMID:10588642 4896 2012-09-05 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000776 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0000059 FYECO:0000005,FYECO:0000227 assayed_using(PomBase:SPAC3H5.06c) PMID:8319772 4896 2016-07-22 PomBase SPAC1F7.05 FYPO:0000776 unknown Not assayed or wild type 972 h- cdc22 cdc22-M45 unknown ECO:0005801 FYECO:0000005 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.03) PMID:9572736 4896 2024-04-11 (Fig. 1C) PomBase SPCC550.13 FYPO:0004918 177-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005801 assayed_enzyme(PomBase:SPBC776.12c),assayed_substrate(PomBase:SPBC4.04c) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0000705 177-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del1 partial_amino_acid_deletion ECO:0000112 assayed_using(PomBase:SPBC776.12c),assayed_using(PomBase:SPCC550.13) PMID:11402029 4896 2015-10-09 PomBase SPCC550.13 FYPO:0002061 177-545 Not assayed or wild type 972 h- dfp1 him1-Del1 partial_amino_acid_deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126 PMID:11402029 4896 2015-10-06 PomBase SPAC20G8.05c FYPO:0000161 wild type Overexpression 972 h- cdc15 cdc15+ wild_type ECO:0001232 PMID:7634333 4896 2015-03-06 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0000929 ppc89-GFP-(AGAGAG)-tea4 Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 ppc89-GFP-tea4 pcp89-tea4|tea4-pcp89 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPBC28E12.03) PMID:24554432 4896 2014-05-28 PomBase SPBC1706.01 FYPO:0004730 ppc89-GFP-(AGAGAG)-tea4 Not assayed or wild type 972 h- tea4delta tea4 ppc89-GFP-tea4 pcp89-tea4|tea4-pcp89 fusion fusion_or_chimera ECO:0001232 assayed_using(PomBase:SPAC2F7.03c) PMID:21703453 4896 2016-11-10 PomBase SPAC57A7.04c FYPO:0006789 F367A Not assayed or wild type 972 h- pabp pabp-RRM4mut amino_acid_mutation ECO:0000337 assayed_enzyme(PomBase:SPCC31H12.08c) PMID:29932902 4896 2018-12-17 PomBase SPAC23C11.11 FYPO:0000024 unknown 972 h- cka1 orb5-19 unknown ECO:0001232 FYECO:0000004,FYECO:0000126 PMID:19646873 4896 2012-02-21 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009097 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000414 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000708 deletion 972 h- h90 mag2-NATMX-rpt6 hid3 hid3delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000127 low PMID:28410370 4896 2017-04-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009007 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009007 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009011 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000334,FYECO:0000358 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000127 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000137 low PMID:40899782 4896 2025-09-11 Treatment with Golgicide A (GCA) resulted in increased GTs for all strains with spac17a5.16 being most profoundly affected (Fig. 4B). The median GT for spac17a5.16 increased by about 6 h compared to around 2 h for both BP90 and spap27g11.12.Again, the GT for spac17a5.16 under nontreated conditions was about 2 h longer than that for BP90. PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0002715 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion ECO:0001232 PMID:40899782 4896 2025-09-11 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000441 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000441 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000143,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000073 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000073 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000069,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000764 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000334,FYECO:0000364 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0002693 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0001453 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0001103 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0001583 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009083 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000211 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009085 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000725 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000211,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009046 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000078,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000077 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000242,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0009042 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000025,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0003383 deletion 972 h- h- prototroph hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000304 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000830 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000026,FYECO:0000137,FYECO:0000334 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0007926 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0007926 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000113,FYECO:0000137,FYECO:0000207 PMID:34984977 4896 2023-02-23 PomBase SPAP27G11.12 FYPO:0000099 deletion 972 h- hid3 hid3delta deletion FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000334,FYECO:0000408 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PomBase SPCC576.12c FYPO:0006238 deletion 972 h- mhf2 mhf2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPCC1235.07) PMID:36537249 4896 2023-04-06 PomBase SPCC576.12c FYPO:0006238 deletion 972 h- mhf2 mhf2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC409.04c) PMID:36537249 4896 2023-04-06 PomBase SPCC576.12c FYPO:0006238 deletion 972 h- mhf2 mhf2delta deletion ECO:0001232 assayed_protein(PomBase:SPBC11C11.03) PMID:36537249 4896 2023-04-06 PomBase SPCC576.12c FYPO:0005727 deletion 972 h- nda3-KM311 mhf2 mhf2delta deletion ECO:0000059 FYECO:0000006 low PMID:36537249 4896 2023-04-08 Intriguingly, similar to the percentage of mitotic WT cells, the percentage of mitotic mhf2Δ cells increased over time upon cold treatment, but to a lesser degree (Fig. 1A,B). PomBase SPCC576.12c FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph mhf2 mhf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.12c FYPO:0002484 deletion 972 h- mhf2 mhf2delta deletion ECO:0000059 PMID:22723423 4896 2013-08-12 PomBase SPCC576.12c FYPO:0001859 deletion 972 h- nda3-KM311 mhf2 mhf2delta deletion ECO:0005638 PMID:36537249 4896 2023-04-06 PomBase SPCC576.12c FYPO:0006280 deletion 972 h- mhf2 mhf2delta deletion ECO:0005638 PMID:28977643 4896 2017-11-09 PomBase SPCC576.12c FYPO:0004557 deletion 972 h- h- prototroph mhf2 mhf2delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC576.12c FYPO:0000228 deletion 972 h- mhf2 mhf2delta deletion ECO:0001232 PMID:36537249 4896 2023-04-06 PomBase SPCC576.12c FYPO:0006518 deletion 972 h- mat1-M smt-0 mhf2 mhf2delta deletion ECO:0005580 FYECO:0000005,FYECO:0000262 PMID:33260998 4896 2020-12-10 PomBase SPCC576.12c FYPO:0000245 deletion 972 h- h+ ade6- 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FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000409 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.19 FYPO:0009069 deletion 972 h- h- prototroph tom5 tom5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000126,FYECO:0000423 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.19 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph tom5 tom5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.19 FYPO:0007931 deletion 972 h- h- prototroph tom5 tom5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.19 FYPO:0000842 deletion 972 h- h- prototroph tom5 tom5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000212 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPBC19G7.19 FYPO:0000785 deletion 972 h- h- prototroph tom5 tom5delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPAC19D5.03 FYPO:0002861 H336L Not assayed or wild type 972 h- cid1 cid1-H336L amino_acid_mutation ECO:0005801 PMID:22608966 4896 2013-11-10 PomBase SPBC1709.08 FYPO:0006613 unknown Not assayed or wild type 972 h- cft1 cft1-665 unknown ECO:0000291 PMID:31615333 4896 2020-09-18 (Figure S3) PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0000957 S239F Not assayed or wild type 972 h- suc22 suc22-S239F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000135 PMID:38188419 4896 2024-08-05 (Fig. 1D) PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0000776 S239F Not assayed or wild type 972 h- suc22 suc22-S239F amino_acid_mutation ECO:0000112 assayed_protein(PomBase:SPCC18B5.11c),residue(T11) PMID:38188419 4896 2024-08-05 (Fig. 1F) PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0008295 S239F Not assayed or wild type 972 h- suc22 suc22-S239F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000135 high PMID:38188419 4896 2024-08-05 (Fig. 1D) PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0000088 S239F Not assayed or wild type 972 h- suc22 suc22-S239F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000135 high PMID:38188419 4896 2024-02-03 (Fig. 1A) PomBase SPBC25D12.04 FYPO:0000088 S239F Not assayed or wild type 972 h- suc22 suc22-S239F amino_acid_mutation ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000102,FYECO:0000119,FYECO:0000135 high PMID:38188419 4896 2024-08-05 (Fig. 1G) PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 H229A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-H229A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPCC550.05),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC645.04 FYPO:0000703 H229A Not assayed or wild type 972 h- nse3 nse3-H229A amino_acid_mutation ECO:0000049 assayed_using(PomBase:SPBC20F10.04c),assayed_using(PomBase:SPCC645.04) PMID:21364888 4896 2015-01-09 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007021 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007026 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0000335 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-07-30 yW formation was impaired in the Sp trm734△ mutant (44% of wild-type levels) and to a lesser extent in the Sp trm732△ mutant (73%) (Fig. 4F), consistent with the increased m1G levels (Table 3; Fig. 4A) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0004167 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000081,FYECO:0000138 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0009072 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000426 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007023 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0001309 deletion 972 h- h+ ade6- ura4-D18 leu1-32 trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000123,FYECO:0000137 PMID:34250083 4896 2021-08-11 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0000840 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPAC56E4.03) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7C) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0000840 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0000291 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPBC1105.02c) PMID:29596413 4896 2019-07-29 (Fig. 7C) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007018 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007019 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007020 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007017 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000126 assayed_using(PomBase:SPATRNAPHE.01) PMID:25404562 4896 2019-08-01 (Table 2) PomBase SPCC1494.07 FYPO:0009038 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000411 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0009035 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000329 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0007808 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000413 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0000104 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000257 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0000799 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000364 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0001719 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0009086 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000093,FYECO:0000137,FYECO:0000167 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0001457 deletion 972 h- h- prototroph trm732 trm732delta deletion ECO:0005638 FYECO:0000005,FYECO:0000137,FYECO:0000412 PMID:37787768 4896 2023-06-28 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- trm732 trm732delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:20473289 4896 2010-04-06 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0002060 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm732 trm732delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 PMID:23697806 4896 2012-01-01 PomBase SPCC1494.07 FYPO:0002177 deletion 972 h- h+ ura4-D18 leu1-32 ade6-M210 trm732 trm732delta deletion ECO:0001232 FYECO:0000005,FYECO:0000137 high PMID:23697806 4896 2012-01-01